View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9847_low_2 (Length: 465)

Name: NF9847_low_2
Description: NF9847
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9847_low_2
NF9847_low_2
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (22-453)||(26484745-26485176)
chr7 (22-453)||(2775410-2775841)
chr7 (22-453)||(39210684-39211115)
chr7 (1-453)||(16449659-16450111)
chr7 (22-453)||(2108666-2109097)
chr7 (22-453)||(16041374-16041805)
chr7 (106-446)||(4200682-4201022)
chr7 (106-453)||(26682661-26683008)
chr7 (22-446)||(31088132-31088556)
chr7 (28-445)||(45733517-45733934)
chr7 (54-453)||(5128075-5128474)
chr7 (41-453)||(11424437-11424849)
chr7 (54-453)||(2154656-2155055)
chr7 (54-453)||(10916529-10916928)
chr7 (54-421)||(16518109-16518476)
chr7 (54-421)||(16503073-16503440)
chr7 (59-453)||(26435345-26435739)
chr7 (59-386)||(26274822-26275149)
chr7 (59-386)||(31564118-31564445)
chr7 (59-453)||(3445394-3445788)
chr7 (59-453)||(5147001-5147395)
chr7 (59-386)||(11441660-11441987)
chr7 (59-386)||(24592269-24592596)
chr7 (59-386)||(26319597-26319924)
chr7 (59-386)||(26537598-26537925)
chr7 (59-453)||(16736121-16736515)
chr7 (59-453)||(16751175-16751569)
chr7 (59-453)||(17523620-17524014)
chr7 (59-453)||(17529201-17529595)
chr7 (59-419)||(4144818-4145178)
chr7 (59-386)||(26669642-26669969)
chr7 (59-386)||(31125008-31125335)
chr7 (59-386)||(9618739-9619066)
chr7 (59-386)||(45387431-45387758)
chr7 (22-453)||(18540850-18541281)
chr7 (103-453)||(5159651-5160001)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (22-453)||(2433-2864)
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (22-453)||(14143003-14143434)
chr6 (22-453)||(26787991-26788422)
chr6 (22-453)||(27196364-27196795)
chr6 (22-453)||(27252445-27252876)
chr6 (22-453)||(13521791-13522222)
chr6 (22-453)||(22456661-22457083)
chr6 (22-446)||(33373981-33374405)
chr6 (22-453)||(27290088-27290519)
chr6 (22-445)||(8892037-8892459)
chr6 (22-445)||(8903272-8903694)
chr6 (22-446)||(28162704-28163128)
chr6 (54-421)||(22934630-22934997)
chr6 (54-421)||(23857075-23857442)
chr6 (59-453)||(29549559-29549953)
chr6 (54-453)||(24304336-24304735)
chr6 (54-453)||(26989080-26989479)
chr6 (54-453)||(27272298-27272697)
chr6 (59-453)||(16749938-16750332)
chr6 (54-453)||(13298669-13299068)
chr6 (54-421)||(24863796-24864163)
chr6 (54-421)||(26918459-26918826)
chr6 (59-453)||(15424035-15424429)
chr6 (59-453)||(4545493-4545887)
chr6 (59-453)||(4773090-4773484)
chr6 (59-453)||(27007811-27008205)
chr6 (59-453)||(27359710-27360104)
chr6 (59-453)||(27450053-27450447)
chr6 (181-453)||(17092158-17092430)
chr6 (59-453)||(4757848-4758242)
chr6 (59-386)||(30557801-30558128)
chr6 (59-453)||(16674223-16674617)
chr6 (22-204)||(22477240-22477422)
chr6 (67-453)||(34463064-34463450)
chr6 (61-386)||(29573099-29573424)
chr6 (59-386)||(4525370-4525697)
chr6 (59-443)||(26116138-26116522)
chr6 (59-453)||(16943745-16944139)
chr6 (59-453)||(27485213-27485607)
chr6 (59-453)||(28207538-28207932)
chr6 (59-453)||(29501499-29501893)
chr6 (59-386)||(3696165-3696492)
chr6 (59-386)||(4723919-4724246)
chr6 (54-296)||(27000152-27000394)
chr6 (59-386)||(27044471-27044799)
chr6 (64-398)||(20160790-20161124)
chr6 (64-398)||(22171707-22172041)
chr6 (115-348)||(17025417-17025650)
chr6 (59-453)||(26777328-26777727)
chr6 (160-332)||(27629539-27629711)
chr6 (300-391)||(27019461-27019552)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (22-453)||(31033933-31034364)
chr3 (22-453)||(32292763-32293194)
chr3 (22-453)||(16626322-16626753)
chr3 (22-453)||(18530399-18530830)
chr3 (22-453)||(5652398-5652829)
chr3 (22-445)||(4625955-4626378)
chr3 (59-445)||(5713275-5713661)
chr3 (59-445)||(5724185-5724571)
chr3 (59-445)||(5767797-5768183)
chr3 (54-453)||(18051305-18051704)
chr3 (22-445)||(17993608-17994031)
chr3 (54-453)||(15740910-15741309)
chr3 (59-398)||(5756954-5757292)
chr3 (54-453)||(8296015-8296414)
chr3 (54-453)||(15892522-15892921)
chr3 (54-453)||(6192359-6192758)
chr3 (54-453)||(8301083-8301482)
chr3 (54-453)||(18330712-18331111)
chr3 (59-453)||(29148571-29148965)
chr3 (54-453)||(4796469-4796868)
chr3 (103-453)||(7073304-7073654)
chr3 (59-386)||(4416967-4417294)
chr3 (60-453)||(35880815-35881208)
chr3 (54-386)||(22387461-22387793)
chr3 (59-453)||(18292169-18292563)
chr3 (59-453)||(48465975-48466369)
chr3 (54-453)||(4721674-4722073)
chr3 (59-386)||(28115837-28116164)
chr3 (59-453)||(10396181-10396575)
chr3 (59-453)||(18276868-18277262)
chr3 (59-453)||(18307470-18307864)
chr3 (59-453)||(51782071-51782465)
chr3 (61-453)||(8211788-8212180)
chr3 (59-453)||(6542278-6542672)
chr3 (59-453)||(11110165-11110559)
chr3 (59-453)||(21674741-21675135)
chr3 (59-453)||(24328207-24328601)
chr3 (59-453)||(36996893-36997287)
chr3 (115-386)||(29664853-29665124)
chr3 (115-453)||(20576663-20577001)
chr3 (103-453)||(28021367-28021717)
chr3 (61-386)||(22870739-22871064)
chr3 (61-386)||(22885798-22886123)
chr3 (59-386)||(4346570-4346897)
chr3 (59-453)||(5013760-5014154)
chr3 (59-453)||(5609138-5609532)
chr3 (59-386)||(5467033-5467360)
chr3 (59-453)||(5596173-5596567)
chr3 (59-453)||(18242787-18243181)
chr3 (59-453)||(28339350-28339744)
chr3 (59-386)||(7996610-7996937)
chr3 (59-386)||(10643118-10643445)
chr3 (59-386)||(47023501-47023828)
chr3 (59-453)||(17984772-17985166)
chr3 (103-453)||(20066135-20066485)
chr3 (59-453)||(31964289-31964683)
chr3 (59-348)||(51797160-51797450)
chr3 (59-386)||(18225239-18225566)
chr3 (103-453)||(32439246-32439596)
chr3 (59-348)||(50133992-50134281)
chr3 (88-188)||(4893287-4893387)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (22-453)||(20340110-20340541)
chr1 (22-453)||(28151911-28152342)
chr1 (22-453)||(16207806-16208237)
chr1 (22-453)||(20461130-20461561)
chr1 (61-453)||(51638306-51638698)
chr1 (59-386)||(10962756-10963083)
chr1 (59-453)||(28585067-28585461)
chr1 (59-453)||(41793083-41793477)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (22-453)||(33877306-33877737)
chr5 (22-453)||(22888529-22888960)
chr5 (22-453)||(29888754-29889185)
chr5 (22-453)||(25199088-25199519)
chr5 (22-445)||(11325853-11326276)
chr5 (25-453)||(23892268-23892696)
chr5 (22-446)||(13184327-13184751)
chr5 (22-446)||(13440173-13440597)
chr5 (59-446)||(9548222-9548609)
chr5 (54-453)||(30934724-30935123)
chr5 (54-453)||(23752122-23752521)
chr5 (54-453)||(24687829-24688228)
chr5 (54-453)||(22998786-22999185)
chr5 (54-453)||(24970109-24970508)
chr5 (54-453)||(23717660-23718059)
chr5 (54-453)||(11549445-11549844)
chr5 (54-453)||(33777578-33777977)
chr5 (59-453)||(15658432-15658826)
chr5 (59-453)||(31431536-31431930)
chr5 (59-453)||(43078348-43078742)
chr5 (59-453)||(37671155-37671549)
chr5 (59-386)||(28649331-28649658)
chr5 (59-453)||(12132251-12132645)
chr5 (59-453)||(18500402-18500796)
chr5 (59-449)||(30168565-30168955)
chr5 (59-453)||(31826079-31826473)
chr5 (59-386)||(9317547-9317874)
chr5 (59-386)||(33516452-33516779)
chr5 (59-453)||(2511147-2511541)
chr5 (103-453)||(13324501-13324851)
chr5 (59-453)||(30029511-30029905)
chr5 (59-453)||(32599144-32599538)
chr5 (59-386)||(30152114-30152441)
chr5 (115-451)||(40473223-40473559)
chr5 (59-386)||(29966805-29967132)
chr5 (59-386)||(37770726-37771053)
chr5 (59-453)||(6874401-6874795)
chr5 (115-453)||(24681592-24681930)
chr5 (115-453)||(24724119-24724457)
chr5 (59-453)||(37358315-37358709)
chr5 (59-386)||(18375151-18375478)
chr5 (59-386)||(26480488-26480814)
chr5 (59-386)||(37755076-37755403)
chr5 (59-453)||(3789637-3790031)
chr5 (59-386)||(5638006-5638333)
chr5 (59-386)||(15758596-15758923)
chr5 (59-386)||(34616614-34616941)
chr5 (59-453)||(41674805-41675199)
chr5 (59-386)||(8665214-8665541)
chr5 (59-453)||(28959458-28959852)
chr5 (103-453)||(33292665-33293015)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (22-453)||(21702928-21703359)
chr2 (1-453)||(19456185-19456637)
chr2 (22-453)||(27118734-27119165)
chr2 (59-453)||(22925792-22926186)
chr2 (22-453)||(16163645-16164079)
chr2 (22-452)||(34303068-34303498)
chr2 (22-445)||(3784700-3785123)
chr2 (22-445)||(34157057-34157479)
chr2 (22-446)||(31891099-31891523)
chr2 (54-453)||(27434208-27434607)
chr2 (42-275)||(27393035-27393268)
chr2 (115-386)||(9349813-9350084)
chr2 (54-453)||(28882292-28882691)
chr2 (59-453)||(20838001-20838395)
chr2 (59-386)||(40233594-40233921)
chr2 (54-453)||(12655620-12656019)
chr2 (54-421)||(23128362-23128729)
chr2 (103-453)||(32049925-32050275)
chr2 (115-453)||(12586949-12587287)
chr2 (59-453)||(34286437-34286831)
chr2 (59-453)||(34291497-34291891)
chr2 (59-386)||(16829169-16829496)
chr2 (59-386)||(16891985-16892312)
chr2 (115-453)||(13936308-13936646)
chr2 (115-453)||(27777361-27777699)
chr2 (115-453)||(27817119-27817457)
chr2 (59-453)||(37375244-37375638)
chr2 (59-386)||(19416330-19416657)
chr2 (59-453)||(39890157-39890551)
chr2 (59-386)||(11635017-11635344)
chr2 (59-386)||(11641206-11641533)
chr2 (59-386)||(34861763-34862090)
chr2 (59-386)||(37685740-37686067)
chr2 (59-386)||(37701005-37701332)
chr2 (59-453)||(260517-260911)
chr2 (115-453)||(12716366-12716704)
chr2 (115-453)||(27803846-27804184)
chr2 (115-453)||(39051586-39051924)
chr2 (59-386)||(31876364-31876691)
chr2 (103-386)||(37925620-37925903)
chr2 (59-386)||(21677013-21677340)
chr2 (59-225)||(34279532-34279698)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (59-453)||(18710673-18711067)
chr8 (22-453)||(44563151-44563580)
chr8 (22-453)||(19658774-19659204)
chr8 (42-453)||(22080612-22081023)
chr8 (22-453)||(33244715-33245146)
chr8 (25-453)||(16283502-16283930)
chr8 (54-453)||(27608639-27609038)
chr8 (54-453)||(16277636-16278035)
chr8 (54-421)||(19688180-19688547)
chr8 (54-453)||(14557706-14558105)
chr8 (54-453)||(2136993-2137392)
chr8 (59-453)||(3329241-3329635)
chr8 (59-453)||(29829409-29829803)
chr8 (22-386)||(9354672-9355037)
chr8 (59-453)||(12092458-12092852)
chr8 (59-453)||(19674528-19674922)
chr8 (59-453)||(31489484-31489878)
chr8 (59-386)||(19208161-19208488)
chr8 (61-386)||(19286551-19286876)
chr8 (59-386)||(28361756-28362083)
chr8 (59-453)||(33258810-33259204)
chr8 (134-391)||(189256-189513)
chr8 (59-386)||(31354611-31354938)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (22-453)||(1900322-1900753)
chr4 (22-453)||(15284703-15285134)
chr4 (1-453)||(15227914-15228366)
chr4 (42-453)||(15391113-15391524)
chr4 (22-445)||(24460388-24460811)
chr4 (22-453)||(14235300-14235731)
chr4 (54-453)||(17014097-17014496)
chr4 (54-453)||(24592089-24592488)
chr4 (54-453)||(14665115-14665514)
chr4 (59-453)||(36344290-36344684)
chr4 (59-453)||(14763079-14763473)
chr4 (59-386)||(27163159-27163486)
chr4 (59-453)||(6569955-6570349)
chr4 (59-386)||(5005975-5006302)
chr4 (59-453)||(18800388-18800782)
chr4 (115-453)||(21969859-21970197)
chr4 (59-386)||(40105480-40105807)
chr4 (59-386)||(31126360-31126687)
chr4 (103-453)||(33673573-33673923)
chr4 (59-386)||(14098643-14098970)
chr4 (115-386)||(39850796-39851067)
chr4 (59-453)||(30753856-30754250)
chr4 (61-386)||(54833491-54833816)
chr4 (103-453)||(24112808-24113158)
chr4 (103-453)||(34188735-34189085)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (61-453)||(21650-22042)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (22-314)||(20438-20729)
scaffold0124 (59-453)||(30539-30933)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (42-314)||(1832-2103)
scaffold0415 (59-453)||(6099-6495)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (118-453)||(393-728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (54-453)||(46760-47159)
scaffold0089 (54-451)||(39846-40243)
scaffold0089 (54-453)||(29845-30244)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (1-255)||(1-255)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (54-453)||(27374-27773)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (59-453)||(9653-10047)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (54-348)||(9-303)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (59-386)||(7081-7408)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (59-453)||(8036-8430)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (59-386)||(14772-15099)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (59-453)||(25976-26371)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (59-453)||(8841-9235)
scaffold0159 (59-453)||(20102-20496)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (109-368)||(46659-46927)
[»] scaffold2173 (1 HSPs)
scaffold2173 (160-332)||(277-449)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 26484745 - 26485176
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  26484745 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 26484844  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26484845 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 26484944  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  26484945 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 26485044  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26485045 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 26485144  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26485145 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 26485176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 2775410 - 2775841
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  2775410 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 2775509  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2775510 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 2775609  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  2775610 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 2775709  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  2775710 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctataatcctttgggttgct 2775809  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2775810 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 2775841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 39211115 - 39210684
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| ||||   ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  39211115 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 39211016  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39211015 tccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 39210916  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  39210915 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 39210816  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39210815 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 39210716  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39210715 gtgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 39210684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16450111 - 16449659
Alignment:
Q  1 ccaatgccatatgccgcttgcctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttcc 100  Q
    ||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | ||||||||||| || |    
T  16450111 ccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttc 16450012  T
Q  101 attctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  16450011 gttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaggg 16449912  T
Q  201 aaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 300  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16449911 aaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccaga 16449812  T
Q  301 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtt 400  Q
    || || ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16449811 ctggacgtccgtaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgct 16449712  T
Q  401 tctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16449711 tccgtaatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcttgatg 16449659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2109097 - 2108666
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  2109097 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 2108998  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2108997 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 2108898  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||    
T  2108897 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactggacgtccgtaatgttaca 2108798  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  2108797 actcctctggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 2108698  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  2108697 acgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 2108666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 16041374 - 16041805
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  16041374 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatt 16041473  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  16041474 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaa 16041573  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  16041574 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatacgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgca 16041673  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  16041674 actcctctggtgcctctacacatcaagctatgtcaagcctctctgtttaatcacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcttttgggttgct 16041773  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16041774 acgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 16041805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 106 - 446
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4201022
Alignment:
Q  106 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  206 taacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 305  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  306 tgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgt 405  Q
     ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4200882 cgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgt 4200981  T
Q  406 aatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  4200982 aatcctttgggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 4201022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 106 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682661
Alignment:
Q  106 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || || |||||  |||||||||| |    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  206 taacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 305  Q
    | || |||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T
Q  306 tgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgt 405  Q
     ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26682808 cgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgt 26682709  T
Q  406 aatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26682708 aatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 26682661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31088556 - 31088132
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  31088556 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 31088457  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  31088456 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 31088357  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  31088356 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 31088257  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| |  ||||||||    
T  31088256 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatcctcggggttgct 31088157  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  31088156 acgttgttcagaatgacatccagag 31088132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 445
Target Start/End: Original strand, 45733517 - 45733934
Alignment:
Q  28 actctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatc 127  Q
    |||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  45733517 actctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 45733616  T
Q  128 aaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccc 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  45733617 aaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccc 45733716  T
Q  228 tcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcct 327  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||    
T  45733717 tcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcct 45733816  T
Q  328 ctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttg 427  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| |||||    
T  45733817 ctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttg 45733916  T
Q  428 ttcaaaacgacatccaga 445  Q
    |||| || ||||||||||    
T  45733917 ttcagaatgacatccaga 45733934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 5128075 - 5128474
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  5128075 aaccagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgag 5128174  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |    
T  5128175 ggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaa 5128274  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||  | | |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  5128275 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccataacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtg 5128374  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  5128375 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 5128474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 41 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11424849 - 11424437
Alignment:
Q  41 gagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctggg 140  Q
    ||||||| |||  |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||    
T  11424849 gagggcattgcacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctggg 11424750  T
Q  141 tcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgac 240  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  11424749 tcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgac 11424650  T
Q  241 aaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactac 340  Q
    || |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||    
T  11424649 aatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctac 11424550  T
Q  341 acatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacat 440  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||    
T  11424549 acatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacat 11424450  T
Q  441 ccagagcttgatg 453  Q
    ||| |||||||||    
T  11424449 ccaaagcttgatg 11424437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 2154656 - 2155055
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||     
T  2154656 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgag 2154755  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  2154756 ggatgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 2154855  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  2154856 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 2154955  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2154956 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 2155055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 10916928 - 10916529
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  10916928 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 10916829  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  10916828 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 10916729  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  10916728 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 10916629  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
      |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  10916628 taaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 10916529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16518476 - 16518109
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  16518476 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 16518377  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  16518376 gggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 16518277  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  16518276 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 16518177  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||| ||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  16518176 caaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 16518109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 16503440 - 16503073
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  16503440 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 16503341  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  16503340 gggtgctatgttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 16503241  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  16503240 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 16503141  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||| ||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  16503140 caaagcttctttgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 16503073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 26435345 - 26435739
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  26435345 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 26435444  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  26435445 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 26435544  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  26435545 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 26435644  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||| | || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26435645 cttctctgttcagccatgatcatgccgagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 26435739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26275149 - 26274822
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  26275149 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatg 26275050  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  26275049 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 26274950  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  26274949 gccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 26274850  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26274849 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26274822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31564445 - 31564118
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  31564445 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 31564346  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  31564345 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 31564246  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  31564245 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 31564146  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  31564145 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 31564118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 3445394 - 3445788
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  3445394 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 3445493  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  3445494 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 3445593  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  3445594 gctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 3445693  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3445694 cttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 3445788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5147395 - 5147001
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5147395 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5147296  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  5147295 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 5147196  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  5147195 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 5147096  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5147095 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 5147001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 11441660 - 11441987
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  11441660 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 11441759  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  11441760 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 11441859  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  11441860 gccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 11441959  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  11441960 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 11441987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24592596 - 24592269
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  24592596 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 24592497  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24592496 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcac 24592397  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||    
T  24592396 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaag 24592297  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  24592296 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 24592269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26319924 - 26319597
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  26319924 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 26319825  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  26319824 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 26319725  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  26319724 gccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 26319625  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26319624 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26319597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26537925 - 26537598
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  26537925 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 26537826  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  26537825 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcat 26537726  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  26537725 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 26537626  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  26537625 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 26537598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16736515 - 16736121
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||    
T  16736515 gacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 16736416  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||     
T  16736415 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcat 16736316  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  16736315 gccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 16736216  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16736215 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16736121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16751569 - 16751175
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||    
T  16751569 gacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 16751470  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||     
T  16751469 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcat 16751370  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  16751369 gccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 16751270  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16751269 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16751175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 17523620 - 17524014
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||    
T  17523620 gacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 17523719  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||     
T  17523720 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcat 17523819  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  17523820 gccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 17523919  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17523920 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 17524014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17529595 - 17529201
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||| ||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||    
T  17529595 gacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 17529496  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||||||     
T  17529495 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcat 17529396  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || || ||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  17529395 gccgccgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 17529296  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17529295 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 17529201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 4145178 - 4144818
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  4145178 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 4145079  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  4145078 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 4144979  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  4144978 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 4144879  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttg 419  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||||||    
T  4144878 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttg 4144818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26669969 - 26669642
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || ||||||| || || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  26669969 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 26669870  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  26669869 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 26669770  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  26669769 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 26669670  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26669669 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26669642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 31125008 - 31125335
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || ||    
T  31125008 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtg 31125107  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  31125108 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 31125207  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  31125208 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 31125307  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  31125308 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 31125335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 9618739 - 9619066
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  9618739 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 9618838  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  9618839 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 9618938  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  9618939 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacccctacacatcaagctgtgcaaag 9619038  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||| ||||||||    
T  9619039 cttctctgttcagccatgagcatgccaa 9619066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 45387431 - 45387758
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  45387431 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 45387530  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  45387531 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 45387630  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  45387631 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 45387730  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||    ||||||||||||||    
T  45387731 cttctctgttcagtcatgatcatgccaa 45387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 18540850 - 18541281
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||  |  | || ||||| || ||||  ||||| || |||||||| |    
T  18540850 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgact 18540949  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18540950 tccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaa 18541049  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||| || |||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   || |||||||| ||| |||||    
T  18541050 tgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgca 18541149  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| | | |||| |||||| |||     
T  18541150 actcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgaatgccaagaatgttcccgcaatcctttgggctgcc 18541249  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
      || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  18541250 atgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 18541281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 5159651 - 5160001
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||  | || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |    
T  5159651 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 5159750  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||| | ||||| ||||| || |||||| ||| ||| || | ||||   ||    
T  5159751 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgagatatgtgaagaggttcccatgct 5159850  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |    
T  5159851 ggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccgctccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcc 5159950  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  5159951 cgcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 5160001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2864 - 2433
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  2864 ctcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 2765  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2764 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 2665  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  2664 tatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttaca 2565  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  2564 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttact 2465  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2464 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 2433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14143434 - 14143003
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  14143434 ctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 14143335  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14143334 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 14143235  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  14143234 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 14143135  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14143134 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 14143035  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14143034 gcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 14143003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 26787991 - 26788422
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  26787991 ctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 26788090  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26788091 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 26788190  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  26788191 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 26788290  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26788291 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 26788390  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26788391 gcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 26788422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 27196364 - 27196795
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  27196364 ctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 27196463  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27196464 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 27196563  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  27196564 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 27196663  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27196664 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 27196763  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27196764 gcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 27196795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27252876 - 27252445
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  27252876 ctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 27252777  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27252776 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 27252677  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  27252676 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 27252577  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  27252576 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 27252477  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27252476 gcgttgtttaaaatgacatccagagcttgatg 27252445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13522222 - 13521791
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13522222 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 13522123  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13522122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 13522023  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  13522022 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttaca 13521923  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  13521922 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgtt 13521823  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13521822 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 13521791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22457083 - 22456661
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  22457083 ctcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatt 22456984  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22456983 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataa 22456884  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22456883 tttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgca 22456784  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    |||||||||         ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22456783 actcctctg---------cacatcaagctatgcaaagcttctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttctgtaatcctttgggttgct 22456693  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22456692 acgttgttcaaaacgacatccagagattgatg 22456661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 33374405 - 33373981
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33374405 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 33374306  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  33374305 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataa 33374206  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  33374205 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 33374106  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  33374105 actcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccacgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 33374006  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  33374005 acgttgttcagaatgacatccagag 33373981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27290519 - 27290088
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||  ||||| || |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27290519 ctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatt 27290420  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290419 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaa 27290320  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    |||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||    
T  27290319 tgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgaggtatatgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgca 27290220  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  27290219 actcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 27290120  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
        ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27290119 atactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27290088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 8892459 - 8892037
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  8892459 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 8892360  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  8892359 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 8892261  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  8892260 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 8892161  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  8892160 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 8892061  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  8892060 acgttgttcagaatgacatccaga 8892037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 8903694 - 8903272
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  8903694 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 8903595  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  8903594 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 8903496  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  8903495 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 8903396  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  8903395 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 8903296  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  8903295 acgttgttcagaatgacatccaga 8903272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Original strand, 28162704 - 28163128
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||| | || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  28162704 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 28162803  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  28162804 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 28162903  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  28162904 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 28163003  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  28163004 actcctctggtgccactacacatcgggttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 28163103  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
     || |||||| || |||||||||||    
T  28163104 acggtgttcagaatgacatccagag 28163128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 22934997 - 22934630
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  22934997 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 22934898  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  22934897 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 22934798  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | ||    
T  22934797 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtg 22934698  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  22934697 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 22934630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23857442 - 23857075
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  23857442 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 23857343  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  23857342 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 23857243  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | ||    
T  23857242 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcctctacacatcaagctgtg 23857143  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  23857142 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 23857075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 29549559 - 29549953
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  29549559 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 29549658  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  29549659 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 29549758  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||||||||| || || | |||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  29549759 gccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 29549858  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29549859 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 29549953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24304735 - 24304336
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24304735 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgag 24304636  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24304635 gggtgctatgatttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 24304536  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  24304535 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 24304436  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   |||||| |||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24304435 caaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 24304336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 26989080 - 26989479
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  26989080 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 26989179  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || || |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  26989180 gggtgctatgctttgaagtatatcgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 26989279  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||    
T  26989280 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtg 26989379  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26989380 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 26989479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27272697 - 27272298
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||||| |||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27272697 aaccagacagggtaagcccccacctgatccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgag 27272598  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |    
T  27272597 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaa 27272498  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||| |||||||| ||    
T  27272497 atcatgctgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggtagctcctagacttgatgtccgtaacgttgtaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtg 27272398  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  || |||||| |||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27272397 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctttattgttcaagatgacatccagagcttgatg 27272298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 16749938 - 16750332
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  16749938 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtg 16750037  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  16750038 ctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 16750137  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||||||   ||| |||    
T  16750138 gccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgcccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagcggtgcaaag 16750237  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16750238 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16750332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13299068 - 13298669
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||     
T  13299068 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgag 13298969  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    ||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  13298968 ggatgctacactttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 13298869  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  13298868 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 13298769  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| ||||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13298768 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttggtatactgttcaaaatgacatccagagcttgatg 13298669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 24863796 - 24864163
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  24863796 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 24863895  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24863896 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 24863995  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||    
T  24863996 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtg 24864095  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | || ||||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  24864096 caaatcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 24864163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 26918459 - 26918826
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  26918459 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 26918558  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  26918559 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaa 26918658  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  26918659 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 26918758  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  26918759 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 26918826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15424429 - 15424035
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| || ||    
T  15424429 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtg 15424330  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  15424329 ctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 15424230  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || ||||| || |||||  | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  15424229 gccgctgtaaatatgatcaaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 15424130  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||| | |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15424129 cttctctgttcagccatgatcatgccgagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 15424035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4545887 - 4545493
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  4545887 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 4545788  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  4545787 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcat 4545688  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  4545687 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 4545588  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4545587 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 4545493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 4773090 - 4773484
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  4773090 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 4773189  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  4773190 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 4773289  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||    
T  4773290 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaag 4773389  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4773390 cctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 4773484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 27007811 - 27008205
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  27007811 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 27007910  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  27007911 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 27008010  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | | ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  27008011 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 27008110  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27008111 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 27008205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27360104 - 27359710
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  27360104 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatg 27360005  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  27360004 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 27359905  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  27359904 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 27359805  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27359804 cctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 27359710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27450447 - 27450053
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  27450447 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatg 27450348  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  27450347 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 27450248  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  27450247 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 27450148  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27450147 cctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 27450053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 181 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17092430 - 17092158
Alignment:
Q  181 aagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagg 280  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| || || || ||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  17092430 aagaagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgagg 17092331  T
Q  281 tatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatca 380  Q
    ||| |||||||||| ||  |||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  17092330 tatgtgaggaagctaccaaacttgatgtccgcagtgttgcaactcctctggtgcctctaaacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatca 17092231  T
Q  381 tgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |  || ||||||| |||  ||| || ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17092230 tagcagttgcccataatacttccgtgatcctttgggttgctacattgttcaaaatgacatccagggcttgatg 17092158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 4757848 - 4758242
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  4757848 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatg 4757947  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  4757948 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 4758047  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  || |||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  4758048 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 4758147  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4758148 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 4758242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30558128 - 30557801
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  30558128 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 30558029  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  30558028 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 30557929  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  30557928 gccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 30557829  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  30557828 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 30557801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 16674223 - 16674617
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  16674223 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 16674322  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  16674323 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 16674422  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  16674423 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 16674522  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||| ||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16674523 cttctctattcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 16674617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22477422 - 22477240
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   | ||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  22477422 ctcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatt 22477323  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaag 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22477322 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcatagaccaaggaaag 22477240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34463450 - 34463064
Alignment:
Q  67 aagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctt 166  Q
    |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |||||||    
T  34463450 aagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctt 34463351  T
Q  167 tgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgt 266  Q
    |||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||    
T  34463350 tgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgt 34463251  T
Q  267 gaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctg 366  Q
    ||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||    
T  34463250 gaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctg 34463151  T
Q  367 tttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34463150 ttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 34463064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Original strand, 29573099 - 29573424
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || |    
T  29573099 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgtt 29573198  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  29573199 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 29573298  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||     
T  29573299 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagct 29573398  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||    
T  29573399 tctctgttcaatcatgatcatgccaa 29573424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 4525370 - 4525697
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  4525370 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 4525469  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  4525470 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcat 4525569  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  4525570 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 4525669  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  4525670 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 4525697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 26116522 - 26116138
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  26116522 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 26116423  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  26116422 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 26116323  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||    
T  26116322 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaag 26116223  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatcca 443  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||||||    
T  26116222 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatcca 26116138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16944139 - 16943745
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||    
T  16944139 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtg 16944040  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  16944039 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 16943940  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  16943939 gccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 16943840  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  16943839 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 16943745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 27485213 - 27485607
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || ||    
T  27485213 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtg 27485312  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  27485313 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 27485412  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  27485413 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 27485512  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27485513 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27485607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 28207538 - 28207932
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||| ||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || ||    
T  28207538 gacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtg 28207637  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  28207638 ttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 28207737  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  28207738 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 28207837  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28207838 cttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 28207932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 29501499 - 29501893
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  29501499 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 29501598  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  29501599 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 29501698  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||    
T  29501699 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaag 29501798  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  29501799 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcctgatg 29501893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 3696165 - 3696492
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  3696165 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 3696264  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  3696265 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 3696364  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  3696365 gccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgatgaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 3696464  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   ||| |||||||||||    
T  3696465 cttctctgttcagccacgatcatgccaa 3696492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4724246 - 4723919
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||| ||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  4724246 gacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 4724147  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  4724146 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcat 4724047  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  4724046 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 4723947  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  4723946 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 4723919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 296
Target Start/End: Original strand, 27000152 - 27000394
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  27000152 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 27000251  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  27000252 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaa 27000351  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 296  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  27000352 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 27044471 - 27044799
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  27044471 gacagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 27044570  T
Q  159 ct-atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatca 257  Q
     | |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||    
T  27044571 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatca 27044670  T
Q  258 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaa 357  Q
     || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| ||    
T  27044671 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaa 27044770  T
Q  358 gcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    || ||||||||   |||||||||||||||    
T  27044771 gcttctctgttcagccatgatcatgccaa 27044799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 398
Target Start/End: Original strand, 20160790 - 20161124
Alignment:
Q  64 ggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 163  Q
    ||||||||  ||||| || |||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20160790 ggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatg 20160889  T
Q  164 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 263  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||     
T  20160890 ctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgt 20160989  T
Q  264 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 363  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||| || || || || |  |||| | ||||||| |||||  ||||| | | |||||||||     
T  20160990 tgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgacgttcgcaacatcgtgactcatttggtaccgctacatgtcaagctctaccaagcctcg 20161089  T
Q  364 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 398  Q
     |||||  |||||| |||| || |||||| |||||    
T  20161090 ttgtttagccatgaccatgtcagttgcccggaatg 20161124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 64 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 22172041 - 22171707
Alignment:
Q  64 ggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatg 163  Q
    ||||||||  ||||| || |||| |||||||| |||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  22172041 ggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatg 22171942  T
Q  164 ctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgc 263  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||  ||||| | ||| | ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||     
T  22171941 ctttgaagtatattgtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgt 22171842  T
Q  264 tgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctct 363  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||||| || || || || |  |||| | ||||||| |||||  ||||| | | |||||||||     
T  22171841 tgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgacgttcgcaacatcgtgactcatttggtaccgctacatgtcaagctctaccaagcctcg 22171742  T
Q  364 ctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 398  Q
     |||||  |||||| |||| || |||||| |||||    
T  22171741 ttgtttagccatgaccatgtcagttgcccggaatg 22171707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 348
Target Start/End: Original strand, 17025417 - 17025650
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  17025417 tgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 17025516  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  17025517 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 17025616  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaag 348  Q
      | |||||||||||||| || || |||||||||    
T  17025617 cgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaag 17025650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26777727 - 26777328
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  26777727 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 26777628  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  26777627 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 26777528  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtac-----cactacacatcaagttatg 353  Q
    || |||||||| ||||| || || | |||||||  |||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| |     | || ||| ||||| | ||    
T  26777527 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgctctgcacgtcaagctgtg 26777428  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  26777427 caaagcctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 26777328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27629711 - 27629539
Alignment:
Q  160 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 259  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||  | || |    
T  27629711 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 27629612  T
Q  260 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggt 332  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  27629611 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcgcccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggt 27629539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 391
Target Start/End: Original strand, 27019461 - 27019552
Alignment:
Q  300 acttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcc 391  Q
    |||||||||||||||  | |||||||| ||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  27019461 acttgatgtccgtaacgtcgcaactcccctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 27019552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31034364 - 31033933
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| || |||| ||||| || ||||  ||||||||||| |||||||    
T  31034364 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 31034265  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31034264 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 31034165  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  31034164 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 31034065  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  31034064 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 31033965  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31033964 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 31033933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 32292763 - 32293194
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| ||| |  ||||| || |||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  32292763 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatt 32292862  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32292863 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 32292962  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  32292963 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 32293062  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32293063 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 32293162  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32293163 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 32293194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16626753 - 16626322
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16626753 ctccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 16626654  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  16626653 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 16626554  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||    
T  16626553 cgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacgttgca 16626454  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||    
T  16626453 actcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgcttccataatcctttgggttgct 16626354  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626353 acgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 16626322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 18530399 - 18530830
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18530399 ctcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 18530498  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  18530499 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 18530598  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  18530599 cgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgagggagctcccagacttaatgttcgtaatgttgca 18530698  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  18530699 actcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgcttccgtaatcctttgggttgct 18530798  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
      ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18530799 atgttgttcaaaatgacatccagggcttgatg 18530830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 5652398 - 5652829
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  5652398 ctcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 5652497  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  5652498 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 5652597  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || || |||||  |||||    
T  5652598 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgca 5652697  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  5652698 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 5652797  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  5652798 acgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 5652829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Original strand, 4625955 - 4626378
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  4625955 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 4626054  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  4626055 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 4626154  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  4626155 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 4626254  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  4626255 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccgagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 4626354  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  4626355 acgttgttcagaatgacatccaga 4626378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 445
Target Start/End: Original strand, 5713275 - 5713661
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5713275 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5713374  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  5713375 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcac 5713474  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5713475 gctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaag 5713574  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  5713575 cctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 5713661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 445
Target Start/End: Original strand, 5724185 - 5724571
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5724185 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5724284  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  5724285 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcac 5724384  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5724385 gctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaag 5724484  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  5724485 cctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 5724571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 59 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 5768183 - 5767797
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5768183 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5768084  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  5768083 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcac 5767984  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5767983 gctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaag 5767884  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  5767883 cctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccaga 5767797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 18051305 - 18051704
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||   || || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||     
T  18051305 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 18051404  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  18051405 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 18051504  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  18051505 atcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctatg 18051604  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |   |||||| | |||||||| |||||||||    
T  18051605 caaagcttctctgtttagccatgatcatgtcaattgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatg 18051704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 17994031 - 17993608
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||    
T  17994031 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatt 17993932  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  17993931 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 17993832  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  17993831 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 17993732  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| || ||||||||    
T  17993731 actcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatccttggggttgct 17993632  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  17993631 acgttgttcagaatgacatccaga 17993608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15741309 - 15740910
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  15741309 aaccagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgag 15741210  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  15741209 ggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 15741110  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  15741109 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtg 15741010  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15741009 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 15740910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 59 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 5757292 - 5756954
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5757292 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5757193  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  5757192 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcac 5757093  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5757092 gctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcgagttatgccaag 5756993  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatg 398  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||    
T  5756992 cctctctgtttga-catgatcatgccagtttgccagaatg 5756954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 8296015 - 8296414
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||| |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8296015 aaccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgag 8296114  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  8296115 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 8296214  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  8296215 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 8296314  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8296315 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 8296414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15892921 - 15892522
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  15892921 aaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 15892822  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  15892821 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 15892722  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  15892721 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 15892622  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  | ||||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  15892621 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgcctttgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 15892522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 6192359 - 6192758
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||  | ||||||| || |||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  6192359 aaccagacagggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgag 6192458  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  6192459 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 6192558  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  6192559 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 6192658  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6192659 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 6192758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 8301482 - 8301083
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||     
T  8301482 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagag 8301383  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  8301382 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 8301283  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  8301282 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 8301183  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8301182 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaaaatgacatccaaagcttgatg 8301083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 18330712 - 18331111
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  18330712 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 18330811  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  18330812 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 18330911  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  18330912 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtg 18331011  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||| |||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  18331012 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttaggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 18331111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29148965 - 29148571
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  29148965 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 29148866  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  29148865 ctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 29148766  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  29148765 gccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcacaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 29148666  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  29148665 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 29148571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 4796868 - 4796469
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  4796868 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 4796769  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  4796768 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaa 4796669  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  4796668 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 4796569  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4796568 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgttatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 4796469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 7073304 - 7073654
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||    
T  7073304 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaa 7073403  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    || ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || | ||||||||||||  ||||    
T  7073404 agctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 7073503  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||  |     
T  7073504 tgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctagaatgcctt 7073603  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||| | |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7073604 cgtaaccctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 7073654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 4416967 - 4417294
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || ||    
T  4416967 gacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 4417066  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  4417067 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 4417166  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  4417167 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 4417266  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  4417267 cctctctgttcagccatgatcatgccaa 4417294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 60 - 453
Target Start/End: Original strand, 35880815 - 35881208
Alignment:
Q  60 acagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgc 159  Q
    ||||||||||||| ||||| || || ||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||| || |||    
T  35880815 acagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgc 35880914  T
Q  160 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 259  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  35880915 tatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatg 35881014  T
Q  260 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagc 359  Q
    | |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||    
T  35881015 ccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagc 35881114  T
Q  360 ctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35881115 ttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 35881208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22387793 - 22387461
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  22387793 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 22387694  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  22387693 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 22387594  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||| | ||    
T  22387593 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcttatacacaacaagctgtg 22387494  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  22387493 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 22387461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18292563 - 18292169
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  18292563 gacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 18292464  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  18292463 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcat 18292364  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  18292363 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagttgtgcaaag 18292264  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18292263 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18292169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 48465975 - 48466369
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  48465975 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 48466074  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  48466075 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 48466174  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  48466175 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 48466274  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48466275 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 48466369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 4721674 - 4722073
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||| || |||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  4721674 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 4721773  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||  ||||||| || || ||||| || |||||| | ||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  4721774 gggtgctacactttgaagtatatcgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 4721873  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || | |||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  4721874 atcatgccgttgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactcgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 4721973  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  4721974 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 4722073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28116164 - 28115837
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||| | || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  28116164 gacagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 28116065  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  28116064 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 28115965  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  28115964 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 28115865  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  28115864 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 28115837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 10396181 - 10396575
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  10396181 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 10396280  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  10396281 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 10396380  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||  | |||||||||||| | ||| |||    
T  10396381 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacatcgcaactcctctggtgtctctacacatcaagctgtgcaaag 10396480  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||  |||||||||| |||||||||    
T  10396481 cctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaggacgacatccaaagcttgatg 10396575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18277262 - 18276868
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  18277262 gacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 18277163  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  18277162 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcat 18277063  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  18277062 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 18276963  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18276962 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18276868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18307864 - 18307470
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  18307864 gacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 18307765  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  18307764 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcat 18307665  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  18307664 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 18307565  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18307564 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18307470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 51782071 - 51782465
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  51782071 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 51782170  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  51782171 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 51782270  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  51782271 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 51782370  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51782371 cttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 51782465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 61 - 453
Target Start/End: Original strand, 8211788 - 8212180
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  8211788 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 8211887  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  8211888 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgc 8211987  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||  | ||| ||||     
T  8211988 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaagct 8212087  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8212088 tctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgatgttcaagacgacatccaaagcttgatg 8212180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 6542672 - 6542278
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  6542672 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 6542573  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  6542572 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcat 6542473  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | | ||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  6542472 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 6542373  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  6542372 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatg 6542278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 11110559 - 11110165
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  11110559 gacagggtaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 11110460  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  11110459 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 11110360  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| |||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  11110359 gccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 11110260  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| | |||||||    
T  11110259 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaaacttgatg 11110165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 21674741 - 21675135
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  21674741 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 21674840  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||  || |||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  21674841 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 21674940  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  21674941 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 21675040  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21675041 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 21675135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 24328207 - 24328601
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  24328207 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 24328306  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  24328307 ttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 24328406  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  24328407 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 24328506  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||| | |||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  24328507 cttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 24328601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36997287 - 36996893
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  36997287 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 36997188  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || |||||     
T  36997187 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcat 36997088  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  36997087 gccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 36996988  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36996987 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 36996893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 115 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29665124 - 29664853
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  29665124 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 29665025  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  29665024 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 29664925  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  29664924 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 29664853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20577001 - 20576663
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  20577001 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 20576902  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  20576901 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 20576802  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  20576801 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 20576702  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  20576701 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 20576663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 28021367 - 28021717
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||| |||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| |    
T  28021367 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28021466  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    || | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||    
T  28021467 agctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 28021566  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |     
T  28021567 tgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctt 28021666  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||| | |||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28021667 cgtaatcctctgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 28021717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22871064 - 22870739
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  22871064 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 22870965  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22870964 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 22870865  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| ||||     
T  22870864 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagct 22870765  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||   |||||||||||||||    
T  22870764 tctctgttcagccatgatcatgccaa 22870739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22886123 - 22885798
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    ||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  22886123 cagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 22886024  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  22886023 atgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 22885924  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| ||||     
T  22885923 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagct 22885824  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||   |||||||||||||||    
T  22885823 tctctgttcagccatgatcatgccaa 22885798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4346897 - 4346570
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  4346897 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 4346798  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||||     
T  4346797 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcat 4346698  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  4346697 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 4346598  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  4346597 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 4346570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 5013760 - 5014154
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  5013760 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 5013859  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  5013860 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 5013959  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  5013960 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 5014059  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  5014060 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 5014154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5609532 - 5609138
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||| ||    
T  5609532 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtg 5609433  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  5609432 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 5609333  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  5609332 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 5609233  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5609232 cttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 5609138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 5467033 - 5467360
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5467033 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5467132  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  5467133 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 5467232  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  5467233 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 5467332  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  5467333 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 5467360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 5596567 - 5596173
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5596567 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5596468  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  5596467 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 5596368  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||    
T  5596367 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaag 5596268  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5596267 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 5596173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 18242787 - 18243181
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || ||    
T  18242787 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtg 18242886  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  18242887 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 18242986  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  18242987 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 18243086  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  18243087 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagtttgatg 18243181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 28339350 - 28339744
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| || ||    
T  28339350 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtg 28339449  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  28339450 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 28339549  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  28339550 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 28339649  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  28339650 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 28339744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 7996610 - 7996937
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  7996610 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 7996709  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  7996710 ttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 7996809  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  7996810 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 7996909  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||    ||||||||||||||    
T  7996910 cttctctgttcagtcatgatcatgccaa 7996937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 10643118 - 10643445
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  10643118 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 10643217  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     |||||||||||||| || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  10643218 ttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 10643317  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  10643318 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 10643417  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||    ||||||||||||||    
T  10643418 cttctctgttcagtcatgatcatgccaa 10643445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 47023501 - 47023828
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  47023501 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 47023600  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  47023601 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 47023700  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| |  || |||    
T  47023701 gccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgcgcaaag 47023800  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  47023801 cttctctgtttaatcatgatcatgccaa 47023828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 17985166 - 17984772
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  17985166 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatg 17985067  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  17985066 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 17984967  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || || |||||| | ||  |||    
T  17984966 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcatatcaagctgtgtaaag 17984867  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||    |||||||||||||| || | || |||  |  |||||| | ||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17984866 cttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctctgggttgccatattgttcaagacgacatccaaagcttgatg 17984772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 20066135 - 20066485
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |    
T  20066135 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 20066234  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | |||||  ||    
T  20066235 agttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccgtgct 20066334  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||   | |||| |||||||| |    
T  20066335 ggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtaccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgttgaatgccaagaatgttcc 20066434  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     | |||| ||||||||||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  20066435 cgcaatcctttgggttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 20066485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31964683 - 31964289
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  31964683 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 31964584  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  31964583 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 31964484  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  31964483 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 31964384  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | || |||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  31964383 cttccctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 31964289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 348
Target Start/End: Original strand, 51797160 - 51797450
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctccca-gtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggat 157  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||||||| || | |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || |    
T  51797160 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 51797259  T
Q  158 gctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatca 257  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||  | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  51797260 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatca 51797359  T
Q  258 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaag 348  Q
     || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || |||||||||    
T  51797360 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaag 51797450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 18225239 - 18225566
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  18225239 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 18225338  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  18225339 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 18225438  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  | ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||| |||    
T  18225439 gccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctgcacatcaagctgtgcaaag 18225538  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  18225539 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 18225566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 32439246 - 32439596
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |    
T  32439246 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 32439345  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   ||    
T  32439346 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgct 32439445  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |    
T  32439446 ggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaggctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcc 32439545  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     | |||| ||||||||||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  32439546 cgcaatcctttgggttgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 32439596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50134281 - 50133992
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  50134281 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 50134182  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  50134181 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 50134082  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaag 348  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || |||||||||    
T  50134081 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaag 50133992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 188
Target Start/End: Original strand, 4893287 - 4893387
Alignment:
Q  88 cctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 187  Q
    ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||    
T  4893287 cctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 4893386  T
Q  188 t 188  Q
    |    
T  4893387 t 4893387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 20340541 - 20340110
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| |  |||| |||||||||||||  ||||| || |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  20340541 ctcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 20340442  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340441 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 20340342  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||    
T  20340341 tatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgacgtccgtaatgttaca 20340242  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20340241 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgtttctgtaatcctttgggttact 20340142  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340141 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 20340110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 28151911 - 28152342
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||| |||||  ||||| ||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||| |||||||    
T  28151911 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatt 28152010  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28152011 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 28152110  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  28152111 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttaca 28152210  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  28152211 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 28152310  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28152311 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 28152342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16208237 - 16207806
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||| || ||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16208237 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 16208138  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16208137 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaa 16208038  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16208037 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagctcccagacttgatgttcgtaatgttgca 16207938  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||    
T  16207937 actcctttggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccgtaatcctttggggtgct 16207838  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
      || |||||||| |||||||| |||||||||    
T  16207837 atgtcgttcaaaatgacatccaaagcttgatg 16207806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 20461130 - 20461561
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20461130 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 20461229  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || ||||| || |     
T  20461230 ttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatat 20461329  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||    
T  20461330 cgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatatgagcaagctcgcagacttgatgttcgtaacattgca 20461429  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||    
T  20461430 actcctctggtgccactacacatcaagctatgtcaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgtccagaatgctttcgtaatcctttgggttgct 20461529  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461530 acgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 20461561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 61 - 453
Target Start/End: Original strand, 51638306 - 51638698
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    ||||| |||||| ||||| |  |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  51638306 cagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 51638405  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  51638406 atgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgc 51638505  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||||     
T  51638506 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaagct 51638605  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  51638606 tctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatg 51638698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 10962756 - 10963083
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  10962756 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtg 10962855  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  10962856 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 10962955  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  10962956 gccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 10963055  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  10963056 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 10963083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 28585067 - 28585461
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||    
T  28585067 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtg 28585166  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  28585167 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 28585266  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  28585267 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 28585366  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  28585367 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 28585461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 41793477 - 41793083
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  41793477 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 41793378  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  41793377 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 41793278  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  41793277 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 41793178  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41793177 cttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 41793083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 33877306 - 33877737
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33877306 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 33877405  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33877406 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 33877505  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||    
T  33877506 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacatccgtaatgttaca 33877605  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |    
T  33877606 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgaccatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgtt 33877705  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33877706 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 33877737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 22888529 - 22888960
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22888529 ctcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 22888628  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22888629 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaa 22888728  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||    
T  22888729 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcctagactcgatgttcgtaacattgca 22888828  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |    
T  22888829 actcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaaacctctttgtttgaccatgatcatgctagttgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgtt 22888928  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22888929 acgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 22888960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 29889185 - 29888754
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||    
T  29889185 ctcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatt 29889086  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29889085 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaa 29888986  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29888985 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtgtatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgca 29888886  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||    
T  29888885 actcctctggtaccactacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccgtgatcatgccaattgcccagattgctttcgtaatcctttgggttgct 29888786  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
      | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29888785 atgctgttcaaaatgacatccagagcttgatg 29888754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 25199088 - 25199519
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  25199088 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatt 25199187  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25199188 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaa 25199287  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  25199288 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgagaaagcccccagacttgatgttcgtaatgttgca 25199387  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||    
T  25199388 actcctctggtgcctttacacatcaagctatgccaagcctttttgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttctgtaatccttcggggtgct 25199487  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  25199488 acgtcgttcaagatgacatccagagcttgatg 25199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Original strand, 11325853 - 11326276
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||    
T  11325853 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatt 11325952  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11325953 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaa 11326052  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  11326053 cgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 11326152  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  11326153 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 11326252  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  11326253 acgttgttcagaatgacatccaga 11326276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 23892268 - 23892696
Alignment:
Q  25 ccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttcc 124  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||    
T  23892268 ccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttcc 23892367  T
Q  125 atcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892368 atcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgt 23892467  T
Q  225 ccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaact 324  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23892468 ccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgcaact 23892567  T
Q  325 cctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcg 424  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  |  |||||| |||||| |||| |     
T  23892568 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttaaccatgatcatgccaactgcccaggatgccttcgtaatcctttggggtgctact 23892667  T
Q  425 ttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  23892668 tcgttcaaaatgacatccaaagcttgatg 23892696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13184751 - 13184327
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13184751 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 13184652  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  13184651 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 13184552  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  13184551 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 13184452  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13184451 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 13184352  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
    |||||||||| || |||||||||||    
T  13184351 gcgttgttcagaatgacatccagag 13184327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 13440597 - 13440173
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  13440597 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 13440498  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  13440497 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 13440398  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  13440397 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 13440298  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  13440297 actcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaagcctttctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 13440198  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  13440197 acgttgttcagaatgacatccagag 13440173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 59 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 9548609 - 9548222
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  9548609 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 9548510  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  9548509 ctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 9548410  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  9548409 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcgagttatgccaag 9548310  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  9548309 cctctctgtttgaccatgattatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagag 9548222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 30934724 - 30935123
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  30934724 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 30934823  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  30934824 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 30934923  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||  | ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  30934924 atcatgccgctgtatatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtg 30935023  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |   |||||| | |||||||| |||||||||    
T  30935024 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacaccgttcaagatgacatccaaagcttgatg 30935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23752521 - 23752122
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  23752521 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgag 23752422  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  23752421 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaa 23752322  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  23752321 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 23752222  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23752221 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 23752122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24688228 - 24687829
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  24688228 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgag 24688129  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24688128 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 24688029  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  24688028 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 24687929  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||  |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24687928 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccatgtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 24687829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22999185 - 22998786
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||     
T  22999185 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgag 22999086  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  22999085 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 22998986  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    | || || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  22998985 accatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 22998886  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  22998885 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 22998786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 24970109 - 24970508
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  24970109 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 24970208  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24970209 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 24970308  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| |||||||| || |||||  | |||  ||||||||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  24970309 atcatgctgctgtaaatatgatcaaagtacgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtg 24970408  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24970409 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 24970508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 23718059 - 23717660
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  23718059 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 23717960  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  23717959 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaa 23717860  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  23717859 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 23717760  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  23717759 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 23717660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 11549445 - 11549844
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  11549445 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 11549544  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  11549545 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 11549644  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  11549645 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 11549744  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  11549745 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 11549844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 33777578 - 33777977
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  33777578 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 33777677  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  33777678 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaa 33777777  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| ||  ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  33777778 atcatgccactgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 33777877  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||| ||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  33777878 caaagcttctctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 33777977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15658826 - 15658432
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  15658826 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 15658727  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  15658726 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 15658627  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||  | | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  15658626 gccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcgaag 15658527  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15658526 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 15658432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 31431536 - 31431930
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||||    
T  31431536 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatg 31431635  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  31431636 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 31431735  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  31431736 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 31431835  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31431836 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31431930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 43078348 - 43078742
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  43078348 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 43078447  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  43078448 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 43078547  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  43078548 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 43078647  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43078648 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 43078742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 37671549 - 37671155
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  37671549 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 37671450  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  37671449 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 37671350  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||   | |||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  37671349 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgtcgcccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 37671250  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  37671249 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagtttgatg 37671155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 28649331 - 28649658
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  28649331 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 28649430  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  28649431 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 28649530  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  28649531 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 28649630  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  28649631 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 28649658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 12132251 - 12132645
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  12132251 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 12132350  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  12132351 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 12132450  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  12132451 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 12132550  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || | || |||| || || ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12132551 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaagacatccaaagcttgatg 12132645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18500796 - 18500402
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  18500796 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 18500697  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  18500696 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 18500597  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  18500596 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 18500497  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  18500496 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 18500402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 449
Target Start/End: Original strand, 30168565 - 30168955
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  30168565 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 30168664  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || |||||     
T  30168665 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 30168764  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||| ||| ||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  30168765 gccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaagaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 30168864  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagctt 449  Q
    | ||||||||  | ||||||||||| || || |  | |||| || || ||| ||||||||| |  | ||||||| |||||||||| |||||    
T  30168865 cttctctgttcaatcatgatcatgctaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgttatgctgttcaagacgacatccaaagctt 30168955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31826473 - 31826079
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  31826473 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 31826374  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  31826373 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 31826274  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  31826273 gccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaaactcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctttggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 31826174  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31826173 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccaagctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31826079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 9317547 - 9317874
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  9317547 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 9317646  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  9317647 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 9317746  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  9317747 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 9317846  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  9317847 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 9317874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 33516452 - 33516779
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  33516452 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 33516551  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  33516552 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 33516651  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  33516652 gccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 33516751  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  33516752 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 33516779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 2511147 - 2511541
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  2511147 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 2511246  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  2511247 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 2511346  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  2511347 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 2511446  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2511447 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 2511541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13324851 - 13324501
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||    
T  13324851 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 13324752  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    || | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||    
T  13324751 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 13324652  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
    ||||||||| ||  | ||||| |||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||    
T  13324651 tgatgtccgcaacgtcgcaacccctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctc 13324552  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13324551 cgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 13324501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 30029511 - 30029905
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||    
T  30029511 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtg 30029610  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  30029611 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 30029710  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  30029711 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 30029810  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||||  || ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  30029811 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccacgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 30029905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 32599538 - 32599144
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  32599538 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtg 32599439  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||     
T  32599438 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcat 32599339  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||| ||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||    
T  32599338 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaag 32599239  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32599238 cctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 32599144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 30152114 - 30152441
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  30152114 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 30152213  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  30152214 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 30152313  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||    
T  30152314 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaag 30152413  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  30152414 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 30152441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 115 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 40473559 - 40473223
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  40473559 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 40473460  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  40473459 agaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 40473360  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| || | || |||| || || ||| ||||    
T  40473359 cgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgaccatgccaagtgtctaggatgtctccgtgatcctttg 40473260  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttga 451  Q
    ||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||    
T  40473259 ggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttga 40473223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29967132 - 29966805
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||    
T  29967132 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtg 29967033  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  29967032 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 29966933  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  29966932 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 29966833  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  29966832 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 29966805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37771053 - 37770726
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  37771053 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 37770954  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || ||  |||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  37770953 ttatgctttgaagtatatcatgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcat 37770854  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | |||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||    
T  37770853 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtccgcaatgttgctactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaag 37770754  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||| ||||   |||||||||||||||    
T  37770753 cttctttgttcagccatgatcatgccaa 37770726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 6874401 - 6874795
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  6874401 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 6874500  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||| ||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  6874501 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 6874600  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  6874601 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 6874700  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6874701 cttctctgttcaaccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 6874795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 24681592 - 24681930
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  24681592 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24681691  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  24681692 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 24681791  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
    | | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  24681792 tgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 24681891  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24681892 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 24724119 - 24724457
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  24724119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 24724218  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  24724219 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 24724318  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
    | | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  24724319 tgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 24724418  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24724419 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 24724457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 37358709 - 37358315
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || ||    
T  37358709 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtg 37358610  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  37358609 ttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 37358510  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  37358509 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 37358410  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  37358409 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagattgatg 37358315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18375478 - 18375151
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  18375478 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 18375379  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  18375378 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 18375279  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| |||||||| || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  18375278 gccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 18375179  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  18375178 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 18375151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 26480488 - 26480814
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  26480488 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 26480587  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  26480588 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 26480687  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  26480688 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaact-ctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 26480786  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  26480787 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 26480814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 37755076 - 37755403
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||| ||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  37755076 gacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 37755175  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  37755176 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 37755275  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||| | ||| |||    
T  37755276 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagctgtgcaaag 37755375  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  37755376 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 37755403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 3789637 - 3790031
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  3789637 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 3789736  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  3789737 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 3789836  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||| || || || ||||||||| | ||| |||    
T  3789837 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctagtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 3789936  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3789937 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 3790031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 5638006 - 5638333
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  5638006 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 5638105  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  5638106 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 5638205  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || | |||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  5638206 gccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 5638305  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  5638306 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 5638333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15758923 - 15758596
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  15758923 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 15758824  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  15758823 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 15758724  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  15758723 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 15758624  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | || |||||   |||||| ||||||||    
T  15758623 cttccctgttcagccatgagcatgccaa 15758596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 34616614 - 34616941
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  34616614 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 34616713  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  34616714 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 34616813  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||    
T  34616814 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaag 34616913  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  34616914 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 34616941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 41674805 - 41675199
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || ||    
T  41674805 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtg 41674904  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
    ||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || || |||||     
T  41674905 ctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcat 41675004  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   || |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||    
T  41675005 gctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaag 41675104  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41675105 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 41675199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8665541 - 8665214
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  8665541 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 8665442  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  8665441 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcat 8665342  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  8665341 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 8665242  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | || |||||   |||||| ||||||||    
T  8665241 cttccctgttcagccatgagcatgccaa 8665214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 28959852 - 28959458
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  28959852 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 28959753  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  28959752 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 28959653  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || ||||| || ||||| || || | ||||||  ||||  ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || || ||| ||||| | ||| |||    
T  28959652 gccgctgtaaatatgatcgaagtgtgtgaggagactcctagacttgatgtccacaatgttgccactcctctggtgcctctgcacgtcaagctgtgcaaag 28959553  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| |||||| |||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28959552 cctctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggctgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 28959458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 33292665 - 33293015
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |    
T  33292665 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 33292764  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| | ||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   ||    
T  33292765 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgct 33292864  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |    
T  33292865 ggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcc 33292964  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     | || | |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  33292965 cgcaaccctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 33293015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 21703359 - 21702928
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21703359 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 21703260  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  21703259 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaa 21703160  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  21703159 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcgtaacattgca 21703060  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  21703059 actcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctctgtttaaccacgatcataccaattgcccagaatgcttccgtaatcctttgggttgct 21702960  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21702959 acgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 21702928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19456637 - 19456185
Alignment:
Q  1 ccaatgccatatgccgcttgcctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttcc 100  Q
    ||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  19456637 ccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttcc 19456538  T
Q  101 attctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||    
T  19456537 gttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaagg 19456438  T
Q  201 aaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 300  Q
    ||| || || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19456437 aaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccaga 19456338  T
Q  301 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtt 400  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  19456337 cttgacgttcgtaacattgcaactcctctagtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccggaatgct 19456238  T
Q  401 tctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  19456237 tctgtaatcctttgggttgctacgttgttcaaaatgatatccagagtttgatg 19456185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 27118734 - 27119165
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  27118734 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 27118833  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  27118834 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 27118933  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||  |||| ||||||    
T  27118934 cgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgtttgtaacattgca 27119033  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  27119034 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 27119133  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  27119134 acgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 27119165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22926186 - 22925792
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  22926186 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 22926087  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||||    
T  22926086 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcac 22925987  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22925986 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaag 22925887  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22925886 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaattctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 22925792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 16163645 - 16164079
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  16163645 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 16163744  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  16163745 tccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 16163844  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  16163845 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 16163944  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag---cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggtt 418  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||    
T  16163945 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattatgtaatcctttgggtt 16164044  T
Q  419 gctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16164045 gctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 16164079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 22 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 34303498 - 34303068
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  34303498 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 34303399  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  34303398 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 34303299  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  34303298 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccgtaatgttgca 34303199  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||   |  ||||| || ||||||||    
T  34303198 actcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctccttgtttgacaatgatcatgccaattgcccaaaatgccgccataatccttggggttgct 34303099  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgat 452  Q
     ||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  34303098 acgttgttcagaatgacatccagagcctgat 34303068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Original strand, 3784700 - 3785123
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  3784700 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 3784799  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  3784800 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 3784899  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  3784900 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 3784999  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  3785000 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 3785099  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  3785100 acgttgttcagaatgacatccaga 3785123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Original strand, 34157057 - 34157479
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  34157057 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 34157156  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  34157157 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 34157255  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  34157256 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 34157355  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  34157356 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 34157455  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  34157456 acgttgttcagaatgacatccaga 34157479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 31891523 - 31891099
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||    
T  31891523 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatt 31891424  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    | |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || ||| |||| ||    
T  31891423 ttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataa 31891324  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  31891323 cgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 31891224  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  31891223 actcctctggtgccaccacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 31891124  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagag 446  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  31891123 acgttgttcagaatgacatccagag 31891099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27434607 - 27434208
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  27434607 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 27434508  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  27434507 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 27434408  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  27434407 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 27434308  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27434307 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 27434208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 275
Target Start/End: Original strand, 27393035 - 27393268
Alignment:
Q  42 agggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 141  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  27393035 agggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 27393134  T
Q  142 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgaca 241  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27393135 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 27393234  T
Q  242 accctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 275  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27393235 atcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgat 27393268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 115 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9350084 - 9349813
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||    
T  9350084 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 9349985  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9349984 agaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggtcttgacgtccgtaa 9349885  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | || |||| |||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  9349884 tgttacaacccctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 9349813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 28882292 - 28882691
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  28882292 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 28882391  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  28882392 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 28882491  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  28882492 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 28882591  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  28882592 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 28882691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 20838001 - 20838395
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||   || ||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||    
T  20838001 gacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtg 20838100  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  20838101 ctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 20838200  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || ||||| ||  |||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  20838201 gccgctgtaaatttgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacatcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 20838300  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  20838301 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 20838395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 40233594 - 40233921
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40233594 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 40233693  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  40233694 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 40233793  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||  | ||| |||    
T  40233794 gccgctgtgaaaatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaaactgtgcaaag 40233893  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  40233894 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 40233921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 12655620 - 12656019
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  12655620 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 12655719  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  12655720 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 12655819  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || || || || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  12655820 atcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 12655919  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || ||   |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  12655920 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggataccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 12656019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 23128729 - 23128362
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  23128729 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgag 23128630  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  23128629 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 23128530  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||| |||| |  |||||||||||| | ||    
T  23128529 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctttggtgcttctacacatcaagctgtg 23128430  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  23128429 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 23128362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 32049925 - 32050275
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||    
T  32049925 tctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 32050024  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    || | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||| |||  ||||    
T  32050025 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagttcctagact 32050124  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
    ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| || |  | |||| ||    
T  32050125 tgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctc 32050224  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     || ||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32050225 cgtgatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 32050275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 12586949 - 12587287
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||    
T  12586949 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 12587048  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  12587049 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 12587148  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  12587149 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 12587248  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  12587249 ggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 12587287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 34286437 - 34286831
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  34286437 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtg 34286536  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  34286537 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 34286636  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| || | ||||   || |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  34286637 gctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 34286736  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34286737 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 34286831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 34291497 - 34291891
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  34291497 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtg 34291596  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  34291597 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 34291696  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| || | ||||   || |||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  34291697 gctgccgtgaatatgatcgagatatgtgaagaggttcccatgctggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 34291796  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34291797 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 34291891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16829496 - 16829169
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  16829496 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 16829397  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  16829396 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 16829297  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  16829296 gccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 16829197  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16829196 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 16829169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 16891985 - 16892312
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  16891985 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 16892084  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  16892085 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 16892184  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  16892185 gccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 16892284  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  16892285 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 16892312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 13936646 - 13936308
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||    
T  13936646 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttg 13936547  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  13936546 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 13936447  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || |  ||| ||||    
T  13936446 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaaatgtctaggatgcctccgcgatcctttg 13936347  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13936346 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 13936308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 27777361 - 27777699
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  27777361 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27777460  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27777461 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 27777560  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  27777561 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 27777660  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27777661 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27777699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 27817119 - 27817457
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  27817119 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27817218  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27817219 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 27817318  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  27817319 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 27817418  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27817419 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 37375244 - 37375638
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  37375244 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 37375343  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||     
T  37375344 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 37375443  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | || |||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||  | ||| |||    
T  37375444 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtggggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaaactgtgcaaag 37375543  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   |||||| |||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  37375544 cttctctgttcagccatgaacatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 37375638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19416657 - 19416330
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  19416657 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 19416558  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     |||||||||||||| || |||||||| |||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || |||||     
T  19416557 ttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcat 19416458  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  19416457 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 19416358  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  19416357 cttctctgtttaatcatgatcatgccaa 19416330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 39890157 - 39890551
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||    |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  39890157 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 39890256  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     |||||| |||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  39890257 ttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 39890356  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  39890357 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 39890456  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  39890457 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgttgttcaagacgacatccaaggcttgatg 39890551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11635344 - 11635017
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || ||    
T  11635344 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtg 11635245  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||     
T  11635244 ttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcat 11635145  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  11635144 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 11635045  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  11635044 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 11635017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11641533 - 11641206
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || ||    
T  11641533 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtg 11641434  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||     
T  11641433 ttatgctttgaagtacatcgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcat 11641334  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || |  |||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  11641333 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 11641234  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  11641233 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 11641206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 34861763 - 34862090
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  34861763 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 34861862  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  34861863 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 34861962  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  34861963 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactagatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 34862062  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  34862063 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 34862090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37686067 - 37685740
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  37686067 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 37685968  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||     
T  37685967 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcat 37685868  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  37685867 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 37685768  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37685767 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 37685740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 37701332 - 37701005
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  37701332 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 37701233  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||| |||| |||||     
T  37701232 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcat 37701133  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  37701132 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 37701033  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37701032 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 37701005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 260911 - 260517
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  260911 gacagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 260812  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||     
T  260811 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcat 260712  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || |  ||||||| |||  ||||||||||||| ||  | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  260711 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgcgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgtaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 260612  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||| ||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  260611 cttctctgttcagccacgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 260517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12716704 - 12716366
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  12716704 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 12716605  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  12716604 agaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 12716505  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
    | | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||| |||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  12716504 tgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgagcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 12716405  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12716404 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 12716366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 27803846 - 27804184
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  27803846 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 27803945  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||| ||| ||    
T  27803946 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgaccgcaa 27804045  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  27804046 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 27804145  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27804146 ggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27804184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 39051924 - 39051586
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  39051924 tgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 39051825  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  39051824 agaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 39051725  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
    | | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| |||||| |   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||    
T  39051724 tgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgatcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttg 39051625  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||   | ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  39051624 ggttgccatgctgttcaagacaacatccaaagcttgatg 39051586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 31876364 - 31876691
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||    
T  31876364 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtg 31876463  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  31876464 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 31876563  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  31876564 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 31876663  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
      ||||||||  | ||||||||||||||    
T  31876664 tttctctgttcaatcatgatcatgccaa 31876691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 103 - 386
Target Start/End: Original strand, 37925620 - 37925903
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| |    
T  37925620 tctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 37925719  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    || | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||    
T  37925720 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagact 37925819  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  37925820 tgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcaatcatgatcatgccaa 37925903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21677340 - 21677013
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  21677340 gacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 21677241  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  21677240 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 21677141  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||    
T  21677140 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaag 21677041  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||   |||||||||||||||    
T  21677040 cttctctgttcagccatgatcatgccaa 21677013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 34279532 - 34279698
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  34279532 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 34279631  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtc 225  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  34279632 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtc 34279698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 18710673 - 18711067
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||||| || |||   ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18710673 gacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatg 18710772  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18710773 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcac 18710872  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18710873 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgacgtccgtaatgttacaactcctctggtgccactacacatcaagttatgccaag 18710972  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18710973 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgctgcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 18711067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 44563151 - 44563580
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  44563151 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 44563250  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  44563251 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt-aaaaaactcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataa 44563349  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  || ||    
T  44563350 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttaca 44563448  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44563449 actcctctggtgccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgccaagaatgattctgtaatcctttgggttgct 44563548  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44563549 gcgttgttcaaaatgacatccagagcttgatg 44563580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 19659204 - 19658774
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||  |||| |||||||||||||  ||||| |  ||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  19659204 ctcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 19659105  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  19659104 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 19659006  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  || || |||||  |||||    
T  19659005 cgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagaccggacgttcgtaacgttgca 19658906  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  19658905 actcctctggtgccactacccatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 19658806  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  19658805 acgttgttcaaaatgacatccagagcctgatg 19658774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 42 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 22081023 - 22080612
Alignment:
Q  42 agggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 141  Q
    ||||||||||  |||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  22081023 agggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 22080924  T
Q  142 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgaca 241  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22080923 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 22080824  T
Q  242 accctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactaca 341  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||| |||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22080823 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagactcatgaagaagttcccagtcttgacgttcgtaatgttgcaactcctctggtaccgctaca 22080724  T
Q  342 catcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatc 441  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || || |||    
T  22080723 catcaagctatgccaagcctccttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatc 22080624  T
Q  442 cagagcttgatg 453  Q
    |||||| |||||    
T  22080623 cagagcctgatg 22080612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 33244715 - 33245146
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||  |||| |||||||||||||  ||||| |  ||| |||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33244715 ctcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 33244814  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  33244815 tccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 33244914  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||  || ||  ||||  |||||    
T  33244915 cgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctctcagaccggacgtttgtaacgttgca 33245014  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  33245015 actcctatggtgccactacacatcaaattatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 33245114  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  33245115 acgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 33245146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 25 - 453
Target Start/End: Original strand, 16283502 - 16283930
Alignment:
Q  25 ccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttcc 124  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || |||||||| ||||||||||    
T  16283502 ccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttcc 16283601  T
Q  125 atcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgt 224  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16283602 atcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgt 16283701  T
Q  225 ccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaact 324  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||| |  |||||    
T  16283702 cccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaagtatgtgaggaagctcctagacttgttgtccgtaatgtcacaact 16283801  T
Q  325 cctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcg 424  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||| ||||| || |||  |  |||||| |||||||||||       
T  16283802 cctctggtgcctctacacatcaagctatgcaaagcttctctgtttagccatgatcataccatttgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctata 16283901  T
Q  425 ttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16283902 ctgttcaagatgacatccaaagcttgatg 16283930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 27609038 - 27608639
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  27609038 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 27608939  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  27608938 ggatgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 27608839  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || |||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  27608838 atcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 27608739  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| || || ||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27608738 caaagcttccctattcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctttactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 27608639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 16277636 - 16278035
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  16277636 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 16277735  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  16277736 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 16277835  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || || || || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  16277836 atcatgccgccgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 16277935  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||| ||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16277936 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgagttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 16278035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 421
Target Start/End: Original strand, 19688180 - 19688547
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  19688180 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgag 19688279  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  19688280 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 19688379  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  19688380 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgcgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 19688479  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    
T  19688480 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgct 19688547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 14557706 - 14558105
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  14557706 aaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 14557805  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |    
T  14557806 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaa 14557905  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| ||  |||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  14557906 atcatgccgctgtaaatgtgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 14558005  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||    |||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14558006 caaagcttctctgttcagtcatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 14558105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 2137392 - 2136993
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  2137392 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgag 2137293  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| |||||||| |    
T  2137292 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 2137193  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || | || |||| |||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  2137192 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagcatgtgagaaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 2137093  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  2137092 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 2136993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 3329635 - 3329241
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  3329635 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 3329536  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||| || | ||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  3329535 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 3329436  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||  ||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  3329435 gccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 3329336  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  3329335 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 3329241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 29829409 - 29829803
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || ||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  29829409 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 29829508  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  29829509 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 29829608  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  29829609 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 29829708  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29829709 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 29829803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 386
Target Start/End: Original strand, 9354672 - 9355037
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  9354672 ctcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 9354771  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt-gaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaaca 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||  || || |||||  |||||||||| || || |||||||| |    
T  9354772 tccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaata 9354871  T
Q  221 atgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgc 320  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||||||||||| ||  | ||    
T  9354872 atgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaacgtcgc 9354971  T
Q  321 aactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  9354972 aactcctctggtgcctttacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 9355037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 12092852 - 12092458
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  12092852 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 12092753  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  12092752 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 12092653  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  12092652 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatattgtcactcctctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 12092553  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12092552 cttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 12092458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 19674528 - 19674922
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||| ||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||  | ||    
T  19674528 gacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtg 19674627  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  19674628 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 19674727  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  19674728 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 19674827  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19674828 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 19674922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 31489878 - 31489484
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  31489878 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 31489779  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  31489778 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 31489679  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  31489678 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 31489579  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || | || |||  ||||  ||| |||||| ||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  31489578 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgggatcctttgggctgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 31489484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19208488 - 19208161
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  19208488 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 19208389  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  19208388 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 19208289  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  19208288 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 19208189  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  19208188 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 19208161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Original strand, 19286551 - 19286876
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  19286551 cagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 19286650  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  19286651 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 19286750  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||     
T  19286751 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagct 19286850  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||   |||||||||||||||    
T  19286851 tctctgttcagccatgatcatgccaa 19286876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28362083 - 28361756
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  28362083 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 28361984  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  28361983 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 28361884  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  28361883 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 28361784  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  28361783 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 28361756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 33258810 - 33259204
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||| || ||    
T  33258810 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtg 33258909  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  33258910 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 33259009  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || | |||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  33259010 gccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 33259109  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||  | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||||||||   | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  33259110 cttctctgttcaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacattcaaagcttgatg 33259204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 134 - 391
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189513
Alignment:
Q  134 ctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  234 ccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggta 333  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||||     
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtg 189455  T
Q  334 ccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcc 391  Q
    || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  189456 cctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcc 189513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 31354611 - 31354938
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || | |||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  31354611 gacagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 31354710  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  31354711 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 31354810  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  31354811 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 31354910  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | || |||||   |||||| ||||||||    
T  31354911 cttccctgttcagccatgagcatgccaa 31354938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Original strand, 1900322 - 1900753
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||| || |||||  ||||| || |||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||    
T  1900322 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatt 1900421  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  1900422 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataa 1900521  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||    
T  1900522 tgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgca 1900621  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||  ||||  |||||||||||    
T  1900622 actcctctggtgcctctacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgaccatgccagttgcccagaatgattccataatactttgggttgct 1900721  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1900722 acgttgttcaaaatgaaatccagagcttgatg 1900753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15285134 - 15284703
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  15285134 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatt 15285035  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  15285034 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 15284935  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  15284934 cgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgaggtatgtgaggaagctcccagacttgacgttcgtaacattgca 15284835  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||||| |||||||||||    
T  15284834 actcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccagttgcccgaaatgcttccgtaatcctttgggttgct 15284735  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     |||||||||||| |||||| |||| ||||||    
T  15284734 acgttgttcaaaatgacatctagagtttgatg 15284703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 15227914 - 15228366
Alignment:
Q  1 ccaatgccatatgccgcttgcctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttcc 100  Q
    ||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||  ||||||||||   |||| ||||||| |||||  ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  15227914 ccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttcc 15228013  T
Q  101 attctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  15228014 gttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaggg 15228113  T
Q  201 aaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccgga 300  Q
    ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||    
T  15228114 aaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggggtatatgagatagctcccaga 15228213  T
Q  301 cttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtt 400  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15228214 cttgatgttcgtaacgttgcaactcctctggtgccactacacatcaagctatgccaagcctctttgtttgaccatgatcatgccaattgtccagaatgct 15228313  T
Q  401 tctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    || |||||| ||| ||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15228314 tccgtaatcctttaggttgccacgttgttcgaaatgacatccagagcttgatg 15228366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 42 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 15391524 - 15391113
Alignment:
Q  42 agggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 141  Q
    ||||||||||  |||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  15391524 agggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggc 15391425  T
Q  142 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgaca 241  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15391424 catgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgaca 15391325  T
Q  242 accctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactaca 341  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||| |||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15391324 atcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagagtcatgaagaagttcccagtcttgacatccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctaca 15391225  T
Q  342 catcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatc 441  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || || |||    
T  15391224 catcaagctatgccaagcctccttgtttgaccataatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgatatc 15391125  T
Q  442 cagagcttgatg 453  Q
    |||||| |||||    
T  15391124 cagagcctgatg 15391113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 24460811 - 24460388
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || | | ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  24460811 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 24460712  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || || |||||  |||||||||| || || |||||||| ||    
T  24460711 tccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataa 24460612  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
     |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||   || ||  ||||  |||||    
T  24460611 cgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatgaggaagctcccagatcggacgtttgtaacgttgca 24460512  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||| || ||||||||    
T  24460511 actcctctggtgccactacacatcgagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccagttgcccagaatgcttccataatccttggggttgct 24460412  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccaga 445  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  24460411 acgttgttcagaatgacatccaga 24460388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14235731 - 14235300
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||   |||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  14235731 ctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatt 14235632  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14235631 tccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaa 14235532  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgca 321  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||| | ||||| || |||||  ||||     
T  14235531 tgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagacctatgaagaagctcccagtcttgacgttcgtaacgttgcg 14235432  T
Q  322 actcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgct 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||  ||| || |||||  ||  ||||| ||| || ||||    
T  14235431 actcctctggtaccactacacatcaagctatgccaagcttccttgtttgaccatgaccatgccgtttgtccggaatgcctccataatcctttaggctgct 14235332  T
Q  422 gcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  14235331 acgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 14235300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 17014097 - 17014496
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  17014097 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 17014196  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  17014197 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 17014296  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  17014297 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 17014396  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  17014397 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 17014496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 24592488 - 24592089
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  24592488 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 24592389  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  24592388 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccca 24592289  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  24592288 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 24592189  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |   ||||| ||||||||||| |  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  24592188 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcataatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 24592089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 14665115 - 14665514
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  14665115 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 14665214  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  14665215 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 14665314  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  14665315 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 14665414  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  14665415 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 14665514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 36344684 - 36344290
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  36344684 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 36344585  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||     
T  36344584 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 36344485  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||    
T  36344484 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaag 36344385  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  36344384 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 36344290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 14763473 - 14763079
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  14763473 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 14763374  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  14763373 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcat 14763274  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  14763273 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 14763174  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  14763173 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcttttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 14763079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27163486 - 27163159
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  27163486 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 27163387  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     |||||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  27163386 ttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 27163287  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  27163286 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtacctctacatatcaagttgtgcaaag 27163187  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  27163186 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 27163159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 6569955 - 6570349
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  6569955 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtg 6570054  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  6570055 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcat 6570154  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  6570155 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 6570254  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||| ||||||| || | || |||  || |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  6570255 cttctctgttcagccatgattatgccaagtgtctaggatgcctccgtaatcctttgggttgccatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 6570349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 5005975 - 5006302
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  5005975 gacaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 5006074  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||||| ||||||     
T  5006075 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcat 5006174  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||    
T  5006175 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacattaagctgtgcaaag 5006274  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||    
T  5006275 cctctctgttcagccatgatcatgccaa 5006302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18800782 - 18800388
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  18800782 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 18800683  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  18800682 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 18800583  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  18800582 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 18800483  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18800482 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 18800388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 453
Target Start/End: Original strand, 21969859 - 21970197
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | |||||||    
T  21969859 tgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttg 21969958  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | | |||||||| |||  ||||||||||||| ||    
T  21969959 agaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtgaggaagttcctagacttgatgtccgcaa 21970058  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttg 414  Q
      | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||||||||||||| || |  | |||| || || ||| ||||    
T  21970059 cgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgtttaatcatgatcatgccaagtgtctgggatgtctccgtgatcctttg 21970158  T
Q  415 ggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    |||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21970159 ggttgctatactgttcaagacgacatccaaagcttgatg 21970197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40105807 - 40105480
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  40105807 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 40105708  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  40105707 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 40105608  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  40105607 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 40105508  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||| | ||||||||||||||    
T  40105507 cttctctgtttaatcatgatcatgccaa 40105480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 31126687 - 31126360
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| |  |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  31126687 gacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 31126588  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  31126587 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 31126488  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  31126487 gccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 31126388  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  31126387 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 31126360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 33673923 - 33673573
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || ||||    
T  33673923 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaa 33673824  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    || | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||| |||  ||||    
T  33673823 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagttcctagact 33673724  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
    ||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||    
T  33673723 tgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctc 33673624  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33673623 cgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 33673573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Original strand, 14098643 - 14098970
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  14098643 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 14098742  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||     
T  14098743 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 14098842  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  14098843 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 14098942  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  14098943 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 14098970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 115 - 386
Target Start/End: Original strand, 39850796 - 39851067
Alignment:
Q  115 tgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttg 214  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| || || ||||||||||| || || |||||||||||| || | || |||||| | |||||||    
T  39850796 tgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttg 39850895  T
Q  215 agaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  39850896 agaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaa 39850995  T
Q  315 tattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
      | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  39850996 cgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagcttctctgttcagccatgatcatgccaa 39851067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 30753856 - 30754250
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  30753856 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 30753955  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || |||||     
T  30753956 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcat 30754055  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  30754056 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 30754155  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30754156 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 30754250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 61 - 386
Target Start/End: Original strand, 54833491 - 54833816
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    |||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || || |    
T  54833491 cagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgtt 54833590  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || || ||||| ||    
T  54833591 atgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgc 54833690  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
     |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||     
T  54833691 cgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaagct 54833790  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    ||||||||   |||||||||||||||    
T  54833791 tctctgttcagccatgatcatgccaa 54833816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Original strand, 24112808 - 24113158
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |    
T  24112808 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 24112907  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   ||    
T  24112908 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgct 24113007  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||| |    
T  24113008 ggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttattgtttgaacatgatcatgctaagtgccaagaatgttcc 24113107  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     | |||| |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  24113108 cgcaatcctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 24113158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 103 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 34189085 - 34188735
Alignment:
Q  103 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaa 202  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||| || || ||||||||| | || ||||| || |||||||| ||  | ||||| |    
T  34189085 tctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagcttatagatcaaggga 34188986  T
Q  203 agttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggact 302  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || | ||||   ||    
T  34188985 agttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgagatatgtgaagaggttcccatgct 34188886  T
Q  303 tgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttc 402  Q
     |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| |   ||||||| |||||||||||  | |||| |||||||| |    
T  34188885 ggatgtccgcaatgttgcaactcctctggtgccactccatatcaagttgtgccaagctttgttgtttgaacatgatcatgctgagtgccaagaatgttcc 34188786  T
Q  403 tgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
     | || | |||||| |||   || || ||||||||  ||||||||||||||    
T  34188785 cgcaaccctttgggctgccatgtcgtccaaaacgatgtccagagcttgatg 34188735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 61 - 453
Target Start/End: Original strand, 21650 - 22042
Alignment:
Q  61 cagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgct 160  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |    
T  21650 cagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgtt 21749  T
Q  161 atgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgc 260  Q
    | |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21750 acgctttgaagtagattgtaaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgc 21849  T
Q  261 tgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcc 360  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21850 tgctgtgaacatgatcgagacttatgaaaaagttcccggtcttgatgtccgtaatgttgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagcc 21949  T
Q  361 tctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  21950 tccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgccgccataatccttggggttgctacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 20438 - 20729
Alignment:
Q  22 ctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatt 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20438 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 20537  T
Q  122 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaa 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||    
T  20538 tccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaa 20636  T
Q  222 tgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  20637 tgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaa 20729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 30539 - 30933
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  30539 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 30638  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  30639 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 30738  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  30739 gccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgtaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 30838  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  30839 cttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaagacatccaaagcttgatg 30933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1832
Alignment:
Q  42 agggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 141  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  142 catgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgaca 241  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaaggaaa-ttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  242 accctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaa 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagactcgatgttcgtaa 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 6099 - 6495
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttc-catcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggat 157  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||| || |    
T  6099 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 6198  T
Q  158 gctatgcttt-gaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatc 256  Q
    | |||||||| ||| || || ||||||||||||||| | || |||||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  6199 gttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatc 6298  T
Q  257 acgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgcca 356  Q
    | || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |    
T  6299 atgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactgaatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaa 6398  T
Q  357 agcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||| ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  6399 agcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 6495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 118 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 393
Alignment:
Q  118 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgaga 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  218 acaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatat 317  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||| | ||||| ||||||||| |    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtccgtaatgt 529  T
Q  318 tgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggt 417  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |  ||||| || ||||    
T  528 tgcaactcctctggtaccgctacacatcaagctatgccaagtctccttgtttgaccatgatcatgccaattgcccataatgccgccataatccttggggt 429  T
Q  418 tgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    || | ||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  428 tgttacgttgttcagaatgacatccagagcctgatg 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 47159 - 46760
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  47159 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 47060  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  47059 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 46960  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  46959 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaatgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 46860  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||  ||||||||    
T  46859 caaagcttctctgtttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctacactgttcaagatgacatccaaggcttgatg 46760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 40243 - 39846
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  40243 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 40144  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || |||||| |||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  40143 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 40044  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  40043 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgttgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtg 39944  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttga 451  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||    
T  39943 caaagcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagatgacatccaaagcttga 39846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 29845 - 30244
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||     
T  29845 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgag 29944  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  29945 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaa 30044  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||   ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||    
T  30045 atcatgccactgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcttagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcccctacacatcaagctgtg 30144  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||||||   ||||||||| ||||| |||| || |||  |  | |||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  30145 caaagcttctctgttcagccatgatcacgccaagtgcctaggatgccttcggaatcctttgggttgctttactgttcaagatgacatccaaagcttgatg 30244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 1
Alignment:
Q  1 ccaatgccatatgccgcttgcctcccgactctacttctttgagggcactgctgaacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttcc 100  Q
    ||||||| ||||||||  |  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||| || |||||||| |||| ||||    
T  255 ccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttcc 156  T
Q  101 attctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaagg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||    
T  155 gttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaggg 56  T
Q  201 aaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaat 255  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  55 aaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 136; Significance: 9e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 54 - 453
Target Start/End: Original strand, 27374 - 27773
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||     
T  27374 aaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgag 27473  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || |||||||||||||| || || ||||||||||| ||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  27474 gggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 27573  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatg 353  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  27574 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtctgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtg 27673  T
Q  354 ccaagcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | |||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||| || |||  |  |||||| |||||||||||    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  27674 caaagcttctctatttagccatgatcatgccaagtgcctaggatgccttcgtaatcctttgggttgctatactgttcaagaggacatccaaagcttgatg 27773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 9653 - 10047
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| || ||    
T  9653 gacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtg 9752  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  9753 ttatgctttgaagtatattgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 9852  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  9853 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 9952  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||| ||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  9953 cctttctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttaggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 10047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 303 - 9
Alignment:
Q  54 aacctgacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaa 153  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||  |||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||     
T  303 aaccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgag 204  T
Q  154 ggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccga 253  Q
    || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  203 gggtgctacgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaa 104  T
Q  254 atcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaag 348  Q
    |||| || ||||| || ||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  103 atcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccgtaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaag 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 7408 - 7081
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  7408 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 7309  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  7308 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 7209  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||    
T  7208 gccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtacctctacacatcaagctgtgcaaag 7109  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  7108 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 7081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 8036 - 8430
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||| ||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||||| || ||    
T  8036 gacaaggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtg 8135  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||     
T  8136 ttatgctttgaagtatattgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcat 8235  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| || || || |||||| ||||| |||    
T  8236 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaatgttgccactcccctggtgcctctgcatatcaagctatgcaaag 8335  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||| ||| || | || |||  || || ||  ||||||||||   | ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8336 cttctctgttcagccatgatcatgacaagtgtctaggatgcctccgtgattctttgggttgccatgctgttcaagacgacatccaaagcttgatg 8430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 15099 - 14772
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| ||||| || ||    
T  15099 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtg 15000  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||     
T  14999 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcat 14900  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || ||||||||  |||| || || | ||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||    
T  14899 gccgctgtgaatgtgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacacatcaagctgtgcaaag 14800  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaa 386  Q
    | ||||||||  | ||||||||||||||    
T  14799 cttctctgttcaatcatgatcatgccaa 14772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 26371 - 25976
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctccca-gtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggat 157  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||||| | | |||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  26371 gacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggt 26272  T
Q  158 gctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatca 257  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  26271 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatca 26172  T
Q  258 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaa 357  Q
     || |||||||| ||||| ||  | | ||| ||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| ||    
T  26171 tgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagacttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctacatatcaagttgtgcaaa 26072  T
Q  358 gcctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    || ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  ||||| ||| ||||||||| |    ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  26071 gcttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctctgtgatcctttgggttgttatactgttcaagaggacatccaaagcttgatg 25976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 9235 - 8841
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  9235 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 9136  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  9135 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcat 9036  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  9035 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 8936  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  8935 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 8841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 453
Target Start/End: Original strand, 20102 - 20496
Alignment:
Q  59 gacagggcaagccctcacctaattcgttgcctcccagtttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatg 158  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || |||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  20102 gacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtg 20201  T
Q  159 ctatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcac 258  Q
     ||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| || |||||     
T  20202 ttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcat 20301  T
Q  259 gctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaag 358  Q
    || |||||||| ||||| || || | ||||||||||||  | ||||||||||| ||  | |||||||||||||| || || ||||||||| | ||| |||    
T  20302 gccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtccgcaacgtcgcaactcctctggtgcctctgcacatcaagctgtgcaaag 20401  T
Q  359 cctctctgtttgaccatgatcatgccaattgcccagaatgtttctgtaatcgtttgggttgctgcgttgttcaaaacgacatccagagcttgatg 453  Q
    | ||||||||   ||||||||||||||| || | || |||  || || ||| ||||||||||   | ||||| | |||||||||| |||||||||    
T  20402 cttctctgttcagccatgatcatgccaagtgtctaggatgcctccgtgatcctttgggttgccatgctgttcgagacgacatccaaagcttgatg 20496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 109 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 46927 - 46659
Alignment:
Q  109 ctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtc--atg-atgtcgaaggatgc-tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaa- 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||| || ||| ||||||||||| || || ||||||||||||||| | ||||||||     
T  46927 ctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcgaatggatgtcgaggggtgcgtatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaaa 46828  T
Q  204 gttaactttt-gagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag-gtatatgagg-aagctcccg-g 299  Q
    |   |||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||| | |  |||  ||||| |||||||   |    
T  46827 gcggactttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgaatcaaagtacgtgagggaagctcctaag 46728  T
Q  300 acttgatgtccgtaatattgcaactcctctggtaccactacacatcaagttatgccaagcctctctgtt 368  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  46727 acttgatgtccgtaacatcacaactcctctggtgcctctacacatcaagttgtgcaaagcttctctgtt 46659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2173 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold2173
Description:

Target: scaffold2173; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 332
Target Start/End: Original strand, 277 - 449
Alignment:
Q  160 tatgctttgaaatacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtccttgacaaccctcttccgaatcacg 259  Q
    |||||||| || || |||||  ||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||  | || |    
T  277 tatgctttaaagtatattgtccagaggcttattgaccaaggaaagctgacttttgagaacagtactcctcatgtccttgataaccctcttccagaccatg 376  T
Q  260 ctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttgatgtccgtaatattgcaactcctctggt 332  Q
    |||| || ||||||||||| |  ||||| ||||| |||  ||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  377 ctgcagtaaacatgattgaagcgtatgaagaagcacccaaactagatgtccgtaatgttgcgactcctttggt 449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University