View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9856_low_17 (Length: 353)

Name: NF9856_low_17
Description: NF9856
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9856_low_17
NF9856_low_17
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (23-329)||(20333663-20333977)
chr1 (4-332)||(16201258-16201594)
chr1 (23-330)||(20467481-20467796)
chr1 (4-325)||(14692144-14692473)
chr1 (4-325)||(14694826-14695155)
chr1 (4-325)||(14697510-14697839)
chr1 (4-325)||(14700191-14700520)
chr1 (24-331)||(21890997-21891312)
chr1 (4-318)||(51644931-51645252)
chr1 (4-295)||(28591813-28592111)
chr1 (4-325)||(41786562-41786890)
chr1 (4-325)||(10969345-10969674)
chr1 (22-325)||(28156407-28156717)
chr1 (5-299)||(10951820-10952122)
chr1 (39-295)||(3647879-3648142)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (10-330)||(27397028-27397356)
chr2 (4-332)||(21696404-21696740)
chr2 (4-324)||(34268138-34268466)
chr2 (10-322)||(19449633-19449954)
chr2 (4-325)||(23117472-23117801)
chr2 (4-325)||(28888930-28889259)
chr2 (4-325)||(20844591-20844920)
chr2 (4-325)||(27427688-27428018)
chr2 (4-325)||(34297847-34298175)
chr2 (38-325)||(31868058-31868353)
chr2 (22-325)||(12662166-12662478)
chr2 (4-299)||(19409700-19410002)
chr2 (22-325)||(37384353-37384663)
chr2 (4-299)||(37679114-37679416)
chr2 (4-299)||(37694379-37694681)
chr2 (22-299)||(13929845-13930129)
chr2 (4-299)||(16822554-16822856)
chr2 (4-299)||(16898624-16898926)
chr2 (4-299)||(37932101-37932403)
chr2 (5-299)||(22921361-22921662)
chr2 (22-299)||(16168202-16168486)
chr2 (5-325)||(12709841-12710168)
chr2 (5-325)||(31882969-31883296)
chr2 (4-299)||(11628401-11628703)
chr2 (4-299)||(32056476-32056778)
chr2 (4-318)||(39896774-39897095)
chr2 (22-299)||(27810427-27810711)
chr2 (22-325)||(27123198-27123508)
chr2 (22-299)||(253886-254170)
chr2 (22-299)||(21670407-21670691)
chr2 (4-299)||(3789167-3789470)
chr2 (4-299)||(34161565-34161867)
chr2 (22-299)||(9343221-9343505)
chr2 (22-299)||(39045116-39045401)
chr2 (4-318)||(34868339-34868661)
chr2 (22-299)||(27782947-27783231)
chr2 (4-299)||(12593538-12593840)
chr2 (22-299)||(37945099-37945383)
chr2 (4-295)||(40240251-40240549)
chr2 (8-202)||(3790473-3790667)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (4-297)||(27283556-27283849)
chr6 (4-325)||(27209575-27209904)
chr6 (4-325)||(27239324-27239653)
chr6 (24-325)||(16756497-16756806)
chr6 (4-325)||(22928049-22928378)
chr6 (4-325)||(24298955-24299284)
chr6 (4-325)||(26927428-26927757)
chr6 (4-325)||(24870384-24870713)
chr6 (22-323)||(15405743-15406052)
chr6 (22-323)||(15417530-15417839)
chr6 (22-325)||(33369643-33369953)
chr6 (4-324)||(27031698-27032026)
chr6 (8-321)||(27622905-27623218)
chr6 (22-325)||(27025818-27026129)
chr6 (4-325)||(13292139-13292469)
chr6 (4-325)||(4538954-4539282)
chr6 (4-325)||(29556232-29556560)
chr6 (22-321)||(29508101-29508407)
chr6 (4-325)||(26792492-26792820)
chr6 (1-291)||(20131229-20131521)
chr6 (1-291)||(22201349-22201641)
chr6 (22-325)||(27014400-27014710)
chr6 (4-299)||(27200899-27201201)
chr6 (4-299)||(27248032-27248334)
chr6 (5-299)||(13517390-13517691)
chr6 (4-318)||(28214151-28214472)
chr6 (5-325)||(26109597-26109925)
chr6 (4-299)||(30551175-30551477)
chr6 (22-299)||(27355296-27355580)
chr6 (22-299)||(29579736-29580020)
chr6 (22-325)||(28167170-28167480)
chr6 (5-325)||(4531970-4532297)
chr6 (5-299)||(27491840-27492142)
chr6 (4-318)||(26665832-26666153)
chr6 (4-318)||(26771803-26772124)
chr6 (22-295)||(8898890-8899170)
chr6 (22-295)||(34457699-34457979)
chr6 (22-325)||(14138624-14138924)
chr6 (4-295)||(16937201-16937499)
chr6 (22-295)||(16680865-16681145)
chr6 (22-318)||(4779594-4779897)
chr6 (3-203)||(20175368-20175561)
chr6 (3-203)||(22160430-22160623)
chr6 (22-299)||(4764464-4764738)
chr6 (4-299)||(27064203-27064495)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (27-332)||(22895105-22895418)
chr5 (4-325)||(23726922-23727251)
chr5 (4-332)||(23898573-23898910)
chr5 (4-325)||(33784167-33784496)
chr5 (27-323)||(25206996-25207300)
chr5 (27-323)||(25271152-25271456)
chr5 (4-323)||(11556041-11556368)
chr5 (4-322)||(22992268-22992594)
chr5 (4-293)||(13179944-13180241)
chr5 (4-324)||(23632656-23632984)
chr5 (21-325)||(24608930-24609242)
chr5 (4-325)||(24976529-24976858)
chr5 (4-325)||(33299221-33299550)
chr5 (4-325)||(9543856-9544184)
chr5 (4-321)||(6881002-6881326)
chr5 (1-323)||(18121558-18121888)
chr5 (22-325)||(30941315-30941626)
chr5 (4-318)||(28952923-28953244)
chr5 (5-325)||(15651890-15652217)
chr5 (4-325)||(37351792-37352120)
chr5 (4-295)||(43084989-43085280)
chr5 (4-299)||(15751986-15752288)
chr5 (4-325)||(30158725-30159053)
chr5 (22-299)||(18493914-18494198)
chr5 (5-299)||(33881837-33882138)
chr5 (4-325)||(2517750-2518078)
chr5 (22-299)||(32589421-32589705)
chr5 (4-299)||(30036157-30036459)
chr5 (4-299)||(33523115-33523417)
chr5 (22-299)||(37745495-37745779)
chr5 (4-308)||(8658621-8658932)
chr5 (5-325)||(24730654-24730981)
chr5 (22-299)||(31819567-31819851)
chr5 (22-318)||(37761686-37761989)
chr5 (22-325)||(31438142-31438452)
chr5 (4-299)||(34623230-34623532)
chr5 (5-299)||(30175199-30175500)
chr5 (22-299)||(40466695-40466979)
chr5 (21-287)||(5644543-5644816)
chr5 (4-299)||(28655976-28656278)
chr5 (22-299)||(13435815-13436099)
chr5 (22-299)||(37664650-37664934)
chr5 (4-295)||(18368658-18368956)
chr5 (4-318)||(3796245-3796566)
chr5 (26-295)||(11330369-11330645)
chr5 (27-318)||(13317977-13318275)
chr5 (27-325)||(41681390-41681693)
chr5 (22-299)||(9324194-9324479)
chr5 (22-299)||(26487104-26487389)
chr5 (22-318)||(12138874-12139177)
chr5 (8-202)||(13178630-13178824)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (27-332)||(16443138-16443451)
chr7 (4-330)||(16048004-16048338)
chr7 (4-325)||(5154759-5155088)
chr7 (4-321)||(26508819-26509144)
chr7 (22-330)||(10848276-10848592)
chr7 (4-325)||(2161248-2161576)
chr7 (4-325)||(11417913-11418242)
chr7 (4-332)||(16511559-16511895)
chr7 (10-325)||(5165060-5165383)
chr7 (4-325)||(10910060-10910389)
chr7 (4-325)||(2779920-2780248)
chr7 (4-299)||(26678215-26678517)
chr7 (4-299)||(26663023-26663325)
chr7 (22-325)||(22148564-22148874)
chr7 (5-299)||(31130618-31130920)
chr7 (5-299)||(31083735-31084037)
chr7 (22-318)||(45393923-45394226)
chr7 (4-299)||(26441967-26442269)
chr7 (22-299)||(4138374-4138658)
chr7 (22-325)||(39206293-39206603)
chr7 (22-325)||(45737977-45738287)
chr7 (5-318)||(31557516-31557837)
chr7 (22-299)||(16744649-16744933)
chr7 (8-325)||(3451927-3452252)
chr7 (22-318)||(26519511-26519814)
chr7 (4-299)||(26596378-26596681)
chr7 (4-299)||(4206098-4206400)
chr7 (4-293)||(5140448-5140744)
chr7 (5-299)||(24585647-24585949)
chr7 (4-318)||(11447592-11447914)
chr7 (22-299)||(26312992-26313277)
chr7 (27-318)||(26268219-26268517)
chr7 (161-325)||(22152791-22152963)
chr7 (161-325)||(22208706-22208878)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (27-330)||(15234523-15234834)
chr4 (10-322)||(15275859-15276179)
chr4 (4-332)||(24585598-24585934)
chr4 (20-330)||(15379481-15379799)
chr4 (4-325)||(14671699-14672028)
chr4 (86-332)||(1906970-1907224)
chr4 (49-325)||(17019738-17020022)
chr4 (4-325)||(36323565-36323893)
chr4 (4-325)||(36337774-36338102)
chr4 (4-325)||(6576545-6576874)
chr4 (4-325)||(14752744-14753072)
chr4 (22-299)||(54840126-54840410)
chr4 (4-325)||(24119350-24119679)
chr4 (22-325)||(39857324-39857634)
chr4 (4-325)||(5701238-5701566)
chr4 (22-299)||(27156572-27156856)
chr4 (4-299)||(31119738-31120040)
chr4 (4-295)||(18793871-18794169)
chr4 (4-299)||(21976439-21976741)
chr4 (22-299)||(20331681-20331965)
chr4 (4-299)||(40098861-40099163)
chr4 (4-295)||(14105283-14105581)
chr4 (38-332)||(34182219-34182520)
chr4 (4-299)||(5012616-5012920)
chr4 (22-202)||(24814547-24814726)
chr4 (4-318)||(33667028-33667350)
chr4 (4-318)||(30760480-30760802)
chr4 (8-202)||(24813628-24813822)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (10-330)||(27989-28315)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (4-330)||(15367900-15368235)
chr3 (4-324)||(16617758-16618087)
chr3 (4-325)||(5658774-5659103)
chr3 (4-322)||(22041072-22041399)
chr3 (4-325)||(29142045-29142374)
chr3 (22-332)||(19701050-19701368)
chr3 (4-325)||(35887400-35887729)
chr3 (4-325)||(18057908-18058237)
chr3 (4-325)||(22380871-22381200)
chr3 (4-332)||(16422840-16423176)
chr3 (22-332)||(15886026-15886344)
chr3 (4-325)||(4789922-4790251)
chr3 (22-323)||(8282769-8283078)
chr3 (22-325)||(11103671-11103981)
chr3 (4-325)||(4728266-4728595)
chr3 (4-325)||(6208535-6208864)
chr3 (4-332)||(4690308-4690644)
chr3 (4-323)||(18337266-18337593)
chr3 (4-325)||(15734407-15734736)
chr3 (22-299)||(5020399-5020683)
chr3 (4-325)||(31029535-31029863)
chr3 (22-325)||(4630421-4630731)
chr3 (4-325)||(18285648-18285976)
chr3 (4-325)||(18300949-18301277)
chr3 (4-299)||(24334864-24335166)
chr3 (22-299)||(32297319-32297603)
chr3 (4-308)||(10649749-10650060)
chr3 (4-325)||(32445792-32446120)
chr3 (5-299)||(28345859-28346160)
chr3 (4-325)||(4339968-4340296)
chr3 (4-299)||(28109232-28109534)
chr3 (22-295)||(18249410-18249690)
chr3 (5-299)||(31957726-31958027)
chr3 (22-299)||(5717743-5718027)
chr3 (22-299)||(5728653-5728937)
chr3 (22-299)||(5763431-5763715)
chr3 (4-318)||(6536011-6536333)
chr3 (4-299)||(17978220-17978522)
chr3 (4-295)||(21681412-21681710)
chr3 (22-325)||(48472572-48472882)
chr3 (24-325)||(4423558-4423866)
chr3 (22-299)||(16404079-16404363)
chr3 (22-299)||(18231880-18232164)
chr3 (22-325)||(20072675-20072985)
chr3 (4-299)||(22864133-22864435)
chr3 (4-299)||(22879192-22879494)
chr3 (21-299)||(5589642-5589927)
chr3 (4-299)||(5602581-5602884)
chr3 (4-295)||(10402844-10403142)
chr3 (4-299)||(20570125-20570427)
chr3 (22-325)||(5473629-5473929)
chr3 (22-299)||(29658254-29658538)
chr3 (22-318)||(47030124-47030428)
chr3 (4-295)||(8218317-8218615)
chr3 (5-299)||(17970150-17970452)
chr3 (22-202)||(16599406-16599585)
chr3 (4-318)||(51788691-51789013)
chr3 (22-202)||(7080022-7080201)
chr3 (4-299)||(28027959-28028254)
chr3 (27-141)||(35221712-35221826)
chr3 (212-325)||(7079868-7079981)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (27-325)||(472-778)
[»] chr8 (27 HSPs)
chr8 (20-330)||(22074134-22074452)
chr8 (22-324)||(21341394-21341705)
chr8 (4-323)||(22139593-22139920)
chr8 (4-325)||(15774251-15774580)
chr8 (4-323)||(14569834-14570161)
chr8 (4-331)||(16260609-16260944)
chr8 (22-325)||(18797386-18797697)
chr8 (4-325)||(2130474-2130803)
chr8 (4-332)||(19694786-19695122)
chr8 (22-325)||(33249040-33249351)
chr8 (4-325)||(19910373-19910702)
chr8 (4-331)||(19654532-19654867)
chr8 (4-325)||(27602119-27602448)
chr8 (22-290)||(31361267-31361542)
chr8 (22-299)||(29836052-29836336)
chr8 (4-325)||(18716159-18716487)
chr8 (4-299)||(33265449-33265751)
chr8 (28-318)||(12085943-12086240)
chr8 (22-299)||(28355161-28355445)
chr8 (4-318)||(31483062-31483383)
chr8 (4-318)||(44567690-44568013)
chr8 (22-299)||(19201592-19201877)
chr8 (4-318)||(19681166-19681488)
chr8 (22-202)||(9361437-9361616)
chr8 (8-202)||(15775288-15775482)
chr8 (24-120)||(22389094-22389190)
chr8 (211-295)||(9361337-9361420)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (22-332)||(12743-13062)
scaffold0322 (22-299)||(2383-2667)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (10-322)||(25803-26123)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (4-325)||(3843-4172)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (4-325)||(24201-24530)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (10-324)||(8894-9217)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (22-325)||(33972-34283)
scaffold0143 (4-318)||(10625-10948)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (4-325)||(12716-13044)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (4-318)||(14649-14970)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (4-325)||(8169-8497)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (4-299)||(2404-2707)
scaffold0159 (4-114)||(23824-23935)
scaffold0159 (251-299)||(18534-18582)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (22-295)||(16306-16586)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (4-325)||(39840-40180)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (5-125)||(1292-1412)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (4-125)||(13203-13324)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (260-325)||(6742-6807)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 23 - 329
Target Start/End: Original strand, 20333663 - 20333977
Alignment:
Q  23 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20333663 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20333762  T
Q  123 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 214  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  20333763 tgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaat 20333862  T
Q  215 cctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctg 314  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20333863 cctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctg 20333962  T
Q  315 gggataatgccatca 329  Q
    |||||||||||||||    
T  20333963 gggataatgccatca 20333977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 16201258 - 16201594
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  16201258 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 16201357  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16201358 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcatgctat 16201457  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16201458 attacacattcctggaaatcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggggtaga 16201557  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  16201558 atctcggaagactctactggggataatgtcgtcattg 16201594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 23 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20467796 - 20467481
Alignment:
Q  23 tgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgca 122  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  20467796 tgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgca 20467697  T
Q  123 tgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaat 214  Q
    |||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |        || | |||||    
T  20467696 tgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaat 20467597  T
Q  215 cctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctg 314  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20467596 cctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctg 20467497  T
Q  315 gggataatgccatcat 330  Q
    ||||||||||| ||||    
T  20467496 gggataatgccgtcat 20467481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 14692144 - 14692473
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14692144 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14692243  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14692244 tatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14692343  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14692344 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggataga 14692443  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  14692444 atctcgggagactctactgggaataatgcc 14692473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 14694826 - 14695155
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14694826 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14694925  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14694926 tatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14695025  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14695026 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggataga 14695125  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  14695126 atctcgggagactctactgggaataatgcc 14695155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 14697510 - 14697839
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14697510 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14697609  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14697610 tatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14697709  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697710 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggataga 14697809  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  14697810 atctcgggagactctactgggaataatgcc 14697839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 14700191 - 14700520
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14700191 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14700290  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14700291 tatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14700390  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700391 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggataga 14700490  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||| ||||    
T  14700491 atctcgggagactctactgggaatactgcc 14700520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 24 - 331
Target Start/End: Original strand, 21890997 - 21891312
Alignment:
Q  24 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 123  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||     
T  21890997 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcac 21891096  T
Q  124 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 215  Q
    ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||||    
T  21891097 gactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 21891196  T
Q  216 ctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgg 315  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21891197 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 21891296  T
Q  316 ggataatgccatcatt 331  Q
    | |||||||| |||||    
T  21891297 gaataatgccgtcatt 21891312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 51645252 - 51644931
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  51645252 attgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 51645153  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  51645152 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 51645054  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51645053 attacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagataga 51644954  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  51644953 atcttggaagactttactgggga 51644931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28592111 - 28591813
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28592111 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatg 28592012  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  28592011 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctat 28591913  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  28591912 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgtaacttgctagggataga 28591813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 41786562 - 41786890
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  41786562 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 41786661  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  41786662 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 41786760  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  41786761 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagataga 41786860  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||   |||||| | ||||||||||||||    
T  41786861 atcttgaaagactttactggggataatgcc 41786890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10969674 - 10969345
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||||||| |    
T  10969674 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcat 10969575  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10969574 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgcta 10969476  T
Q  203 catcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10969475 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatag 10969376  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||    ||||| | ||||||||||||||    
T  10969375 aatcttgagagactttactggggataatgcc 10969345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28156717 - 28156407
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28156717 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28156618  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28156617 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28156519  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  28156518 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 28156419  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||  ||||||||    
T  28156418 ggaaataatgcc 28156407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 10952122 - 10951820
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  10952122 ttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 10952023  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10952022 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 10951924  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  10951923 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagataga 10951824  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  10951823 atct 10951820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3648142 - 3647879
Alignment:
Q  39 atatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagttt 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3648142 atatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagttt 3648043  T
Q  139 gtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataac 230  Q
    |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||    
T  3648042 gtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgac 3647944  T
Q  231 accgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3647943 gtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggataga 3647879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 27397356 - 27397028
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  27397356 ttgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaa 27397257  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca-- 207  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  27397256 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcaca 27397157  T
Q  208 ------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctca 301  Q
          | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27397156 cattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcg 27397057  T
Q  302 gaagactctgctggggataatgccatcat 330  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  27397056 gaagactccgctggggataatgccgtcat 27397028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 21696404 - 21696740
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    |||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21696404 attgatttgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 21696503  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc--- 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  21696504 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaat 21696603  T
Q  201 --taca---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
      ||||   || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696604 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 21696703  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  21696704 atctcggaaggctctactggggataatgccgtcattg 21696740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Original strand, 34268138 - 34268466
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34268138 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 34268237  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc--- 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  34268238 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 34268337  T
Q  201 --taca---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
      ||||   || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34268338 gttacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 34268437  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgc 324  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34268438 atctcggaagactctactggggataatgc 34268466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 10 - 322
Target Start/End: Original strand, 19449633 - 19449954
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  19449633 ttgagactgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaa 19449732  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca-- 207  Q
    |||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      
T  19449733 tgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcaca 19449832  T
Q  208 ------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagc-tatgcaacttgctggggatagaatctc 300  Q
          |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19449833 cattcttagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctc 19449932  T
Q  301 agaagactctgctggggataat 322  Q
     |||||||| ||||| ||||||    
T  19449933 ggaagactccgctggagataat 19449954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23117801 - 23117472
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23117801 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 23117702  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||| ||| |||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23117701 tatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 23117602  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117601 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 23117502  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  23117501 atcttgggagactctactgggaataatgcc 23117472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28889259 - 28888930
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||||||||| ||    
T  28889259 attgaattgagattgatgttaacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatg 28889160  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28889159 tatgaatgcttgttatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctat 28889060  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28889059 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 28888960  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  28888959 atctcgggagactctactgggaataatgcc 28888930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20844920 - 20844591
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20844920 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatgattatgcatg 20844821  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  20844820 tatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatggctcgtgctat 20844721  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20844720 attacacattcctggaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 20844621  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  20844620 atctcggaagactctactgggaataatgcc 20844591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 27427688 - 27428018
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  27427688 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatg 27427787  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  27427788 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 27427887  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagc-tatgcaacttgctggggatag 294  Q
    |        || | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  27427888 attacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaacttgctggggacag 27427987  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||    
T  27427988 aatctcggaagactatactgggaataatgcc 27428018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34298175 - 34297847
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  34298175 attgaattgagattgatgtcgacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 34298076  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34298075 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 34297977  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34297976 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 34297877  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  34297876 atctcggaagactctactgggaaaaatgcc 34297847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 38 - 325
Target Start/End: Original strand, 31868058 - 31868353
Alignment:
Q  38 aatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  31868058 aatatgcatggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattt 31868157  T
Q  138 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  31868158 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatga 31868257  T
Q  230 caccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |  ||||||||| |||||||| |||  || ||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  31868258 cgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaacttgatggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 31868353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12662478 - 12662166
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12662478 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12662379  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  12662378 atgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 12662279  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctcagaagactctgc 312  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  12662278 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 12662179  T
Q  313 tggggataatgcc 325  Q
    |||| ||||||||    
T  12662178 tgggaataatgcc 12662166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 19409700 - 19410002
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19409700 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 19409799  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  19409800 tatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 19409898  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19409899 attacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 19409998  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  19409999 atct 19410002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 37384663 - 37384353
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37384663 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37384564  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  37384563 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 37384465  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    || ||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37384464 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 37384365  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    | | ||||||||    
T  37384364 gagaataatgcc 37384353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 37679114 - 37679416
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37679114 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 37679213  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37679214 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 37679312  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37679313 attacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagataga 37679412  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  37679413 atct 37679416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 37694379 - 37694681
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37694379 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 37694478  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37694479 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 37694577  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37694578 attacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagataga 37694677  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  37694678 atct 37694681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 13929845 - 13930129
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13929845 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13929944  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13929945 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13930043  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  13930044 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatct 13930129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 16822554 - 16822856
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16822554 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 16822653  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16822654 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 16822752  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16822753 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 16822852  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  16822853 atct 16822856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16898926 - 16898624
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16898926 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 16898827  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16898826 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 16898728  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16898727 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 16898628  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  16898627 atct 16898624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37932403 - 37932101
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37932403 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatg 37932304  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  37932303 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctat 37932205  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37932204 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 37932105  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  37932104 atct 37932101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 22921361 - 22921662
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  22921361 ttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 22921460  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22921461 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 22921559  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22921560 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaa 22921659  T
Q  297 tct 299  Q
    |||    
T  22921660 tct 22921662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168202
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 16168202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 12709841 - 12710168
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  12709841 ttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 12709940  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  12709941 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctata 12710039  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12710040 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaa 12710139  T
Q  297 tctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||    ||||| | ||||||||||||||    
T  12710140 tcttgagagactttactggggataatgcc 12710168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31883296 - 31882969
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  31883296 ttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 31883197  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31883196 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 31883098  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31883097 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaa 31882998  T
Q  297 tctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||  ||||||| | | ||||| ||||||    
T  31882997 tcttggaagactttaccggggacaatgcc 31882969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 11628401 - 11628703
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||| ||    
T  11628401 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatg 11628500  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11628501 tatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 11628599  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11628600 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 11628699  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  11628700 atct 11628703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32056778 - 32056476
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32056778 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 32056679  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  32056678 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 32056580  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  |||||||||  || |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32056579 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 32056480  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  32056479 atct 32056476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 39897095 - 39896774
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  39897095 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 39896996  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||| | |   ||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||     
T  39896995 tatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctat 39896897  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39896896 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 39896797  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  39896796 atcttggaagactttactgggga 39896774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810427
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 27810427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27123508 - 27123198
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27123508 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27123409  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27123408 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27123310  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  27123309 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27123210  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||  ||||||||    
T  27123209 ggaaataatgcc 27123198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 253886 - 254170
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  253886 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 253985  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  253986 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 254084  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  254085 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatct 254170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 21670407 - 21670691
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21670407 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21670506  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21670507 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 21670605  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21670606 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 21670691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 3789470 - 3789167
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  3789470 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 3789371  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789370 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 3789272  T
Q  203 catcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3789271 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatag 3789172  T
Q  295 aatct 299  Q
    |||||    
T  3789171 aatct 3789167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34161867 - 34161565
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  34161867 attgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 34161768  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc--- 200  Q
     ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  34161767 tatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 34161669  T
Q  201 --taca---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
      ||||   || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| || ||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34161668 gttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggataga 34161569  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  34161568 atct 34161565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343505
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | ||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 9343505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045401
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaac-ttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatct 39045401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34868661 - 34868339
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  34868661 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 34868562  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34868561 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 34868463  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  34868462 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatag 34868363  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  34868362 aatcttggaagactttactgggga 34868339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782947
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||| ||||||| |   |||||| || ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatct 27782947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 12593840 - 12593538
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  12593840 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatg 12593741  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12593740 tatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 12593642  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
     | | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12593641 gttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagataga 12593542  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  12593541 atct 12593538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 37945099 - 37945383
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||    
T  37945099 ttgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgc 37945198  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37945199 atgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37945297  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||  || |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37945298 tcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 37945383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40240549 - 40240251
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  40240549 attgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 40240450  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40240449 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 40240351  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
     | | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  40240350 gttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 40240251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3790667 - 3790473
Alignment:
Q  8 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 106  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  3790667 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3790568  T
Q  107 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790567 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 4 - 297
Target Start/End: Original strand, 27283556 - 27283849
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27283556 attgaattgagattgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 27283655  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283656 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 27283755  T
Q  204 atcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  27283756 atcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaat 27283849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27209904 - 27209575
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  27209904 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatg 27209805  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27209804 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctag 27209705  T
Q  204 at--cata------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    ||  ||||       ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209704 attacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 27209605  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  27209604 atcttgggagactctactgggaataatgcc 27209575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 27239324 - 27239653
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  27239324 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatg 27239423  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27239424 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctag 27239523  T
Q  204 at--cata------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    ||  ||||       ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239524 attacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 27239623  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  27239624 atcttgggagactctactgggaataatgcc 27239653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 24 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16756806 - 16756497
Alignment:
Q  24 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  16756806 gacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 16756707  T
Q  124 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatc 215  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||    
T  16756706 gactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatc 16756607  T
Q  216 ctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgg 315  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16756606 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgg 16756507  T
Q  316 ggataatgcc 325  Q
    | ||||||||    
T  16756506 gaataatgcc 16756497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 22928049 - 22928378
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22928049 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 22928148  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22928149 tatgaatgcttgtgatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 22928248  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928249 attacacattcctggaaatcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 22928348  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  22928349 atctcggaagactctactagggataatgcc 22928378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 24298955 - 24299284
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24298955 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 24299054  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  24299055 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctat 24299154  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299155 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 24299254  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24299255 atctcggaagactctactgggaataatgcc 24299284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26927757 - 26927428
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26927757 attgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 26927658  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26927657 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26927558  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  26927557 attacacattcttggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctggggataga 26927458  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  26927457 atctcgggagactctactgggaataatgcc 26927428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24870713 - 24870384
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24870713 attgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 24870614  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24870613 tatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 24870514  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24870513 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 24870414  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  24870413 atctcggaagactctactgagaataatgcc 24870384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 15405743 - 15406052
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15405743 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15405842  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  15405843 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15405942  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  15405943 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggaaactctact 15406042  T
Q  314 ggggataatg 323  Q
    ||| ||||||    
T  15406043 gggaataatg 15406052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 15417530 - 15417839
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15417530 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15417629  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  15417630 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 15417729  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  15417730 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggaaactctact 15417829  T
Q  314 ggggataatg 323  Q
    ||| ||||||    
T  15417830 gggaataatg 15417839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Original strand, 33369643 - 33369953
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33369643 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33369742  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  33369743 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 33369841  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33369842 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 33369941  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  33369942 gggaataatgcc 33369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27032026 - 27031698
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27032026 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 27031927  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  27031926 tatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctat 27031827  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  27031826 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagg 27031727  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgc 324  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  27031726 atctcggaagactctactgggaataatgc 27031698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 321
Target Start/End: Original strand, 27622905 - 27623218
Alignment:
Q  8 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 106  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| || ||    
T  27622905 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtat 27623004  T
Q  107 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 206  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623005 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 27623103  T
Q  207 atagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaaga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27623104 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 27623203  T
Q  307 ctctgctggggataa 321  Q
    | |  ||||||||||    
T  27623204 cccgactggggataa 27623218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27026129 - 27025818
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||    
T  27026129 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgc 27026030  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  |||    
T  27026029 atgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaa 27025930  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  27025929 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 27025830  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  27025829 gggaataatgcc 27025818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 13292139 - 13292469
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  13292139 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 13292238  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13292239 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 13292338  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtag-ctatgcaacttgctggggatag 294  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| |||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13292339 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatag 13292438  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  13292439 aatcttgggagactctactgggaataatgcc 13292469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 4538954 - 4539282
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4538954 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 4539053  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  4539054 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 4539152  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539153 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 4539252  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||   ||||| | ||||||||||||||    
T  4539253 atctcgagagactttactggggataatgcc 4539282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 29556560 - 29556232
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29556560 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 29556461  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29556460 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 29556362  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||||||||||||    
T  29556361 attacacattcttggaaatcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggataga 29556262  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  29556261 atctcggaagactctactgggaataatgcc 29556232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29508407 - 29508101
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29508407 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29508308  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29508307 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29508209  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  29508208 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 29508109  T
Q  314 ggggataa 321  Q
    ||| ||||    
T  29508108 gggaataa 29508101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26792820 - 26792492
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26792820 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 26792721  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26792720 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26792622  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26792621 attacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 26792522  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||    ||||| | ||||||||||||||    
T  26792521 atcttgagagactttactggggataatgcc 26792492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20131521 - 20131229
Alignment:
Q  1 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgc 100  Q
    |||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20131521 agcattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgc 20131422  T
Q  101 gtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20131421 atgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgc 20131329  T
Q  201 tacatca--------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggta-ggtagctatgcaacttgctgggga 291  Q
    || ||||        | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  20131328 tatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagggtagttatgcaacttactgggga 20131229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 22201349 - 22201641
Alignment:
Q  1 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgc 100  Q
    |||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22201349 agcattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgc 22201448  T
Q  101 gtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22201449 atgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgtgc 22201541  T
Q  201 tacatca--------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggta-ggtagctatgcaacttgctgggga 291  Q
    || ||||        | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||||||    
T  22201542 tatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagggtagttatgcaacttactgggga 22201641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27014710 - 27014400
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27014710 ttgacattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27014611  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27014610 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27014512  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27014511 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctact 27014412  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  27014411 gggaataatgcc 27014400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27201201 - 27200899
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  27201201 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 27201102  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta- 202  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27201101 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctat 27201003  T
Q  203 -------catcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
           | || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27201002 attacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 27200903  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  27200902 atct 27200899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 27248032 - 27248334
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  27248032 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 27248131  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta- 202  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27248132 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctat 27248230  T
Q  203 -------catcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
           | || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27248231 attacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 27248330  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  27248331 atct 27248334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 13517390 - 13517691
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  13517390 ttgaattgagactgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 13517489  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13517490 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 13517588  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  13517589 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaa 13517688  T
Q  297 tct 299  Q
    |||    
T  13517689 tct 13517691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 28214472 - 28214151
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28214472 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 28214373  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28214372 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 28214274  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||    
T  28214273 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattga 28214174  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||| |||| || | |||||||    
T  28214173 atctcggaaggctttactgggga 28214151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 26109597 - 26109925
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  26109597 ttgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgt 26109696  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-- 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||      
T  26109697 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatg 26109795  T
Q  203 ------catcatagaaatcctctttggagataacaccgtt-gggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
          | || | |||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26109796 ttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 26109895  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||   ||||| | ||||||||||||||    
T  26109896 atctcgagagactttactggggataatgcc 26109925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 30551175 - 30551477
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30551175 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 30551274  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  30551275 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 30551373  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30551374 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 30551473  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  30551474 atct 30551477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 27355296 - 27355580
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27355296 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27355395  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27355396 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27355494  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27355495 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 27355580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29580020 - 29579736
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29580020 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29579921  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | ||||    
T  29579920 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaa 29579822  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  29579821 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatct 29579736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28167480 - 28167170
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28167480 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28167381  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28167380 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28167282  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |     
T  28167281 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctacc 28167182  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  28167181 gggaataatgcc 28167170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4532297 - 4531970
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  4532297 ttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 4532198  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  4532197 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctata 4532099  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4532098 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctggggatagaa 4531999  T
Q  297 tctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||    ||||| | ||||||||||||||    
T  4531998 tcttgagagactttactggggataatgcc 4531970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27492142 - 27491840
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  27492142 ttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 27492043  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-- 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||      
T  27492042 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctata 27491944  T
Q  203 ------catcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggataga 295  Q
          | || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  27491943 ttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggataga 27491844  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  27491843 atct 27491840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 26665832 - 26666153
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26665832 attgaattgagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 26665931  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26665932 tatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26666030  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
T  26666031 atgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagataga 26666130  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  26666131 atcttggaagactttactgggga 26666153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 26771803 - 26772124
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26771803 attgaattgagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 26771902  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26771903 tatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26772001  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||    
T  26772002 atgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagataga 26772101  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  26772102 atcttggaagactttactgggga 26772124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 8898890 - 8899170
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8898890 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8898989  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || |    
T  8898990 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 8899088  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8899089 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 8899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34457979
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | ||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagataga 34457979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Original strand, 14138624 - 14138924
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  14138624 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 14138713  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  14138714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 14138812  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14138813 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 14138912  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  14138913 gggaataatgcc 14138924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 16937201 - 16937499
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16937201 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 16937300  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  16937301 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 16937399  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        || || |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  16937400 attacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctggggataga 16937499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16681145 - 16680865
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16681145 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16681046  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |        || |    
T  16681045 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggaga 16680947  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16680946 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 16680865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4779897 - 4779594
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4779897 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4779798  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4779797 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4779699  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  4779698 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 4779599  T
Q  314 gggga 318  Q
    |||||    
T  4779598 gggga 4779594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20175561 - 20175368
Alignment:
Q  3 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  20175561 cattgaattgagatagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcat 20175462  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20175461 gtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgcta 20175369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 22160430 - 22160623
Alignment:
Q  3 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |    
T  22160430 cattgaattgagatagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgattatgcat 22160529  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22160530 gtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcgtgcta 22160622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4764738 - 4764464
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    ||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  4764738 ttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 4764649  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  4764648 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4764550  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4764549 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 4764464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27064495 - 27064203
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||          ||    
T  27064495 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgca----------tg 27064406  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27064405 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 27064307  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||    
T  27064306 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctggagataga 27064207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22895418 - 22895105
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  22895418 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgcaatgcatgac 22895319  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  22895318 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 22895219  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  22895218 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggga 22895119  T
Q  319 taatgccatcattg 332  Q
    | ||||||||||||    
T  22895118 tgatgccatcattg 22895105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23727251 - 23726922
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23727251 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 23727152  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23727151 tatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 23727052  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727051 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 23726952  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  23726951 atctcgggagactctactgggaataatgcc 23726922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23898910 - 23898573
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  23898910 attgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 23898811  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     | | ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  23898810 tacgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 23898711  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatag 294  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23898710 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatag 23898611  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23898610 aatctcggaagactctactggggataatgccgtcattg 23898573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33784496 - 33784167
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33784496 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 33784397  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33784396 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 33784297  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||   ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33784296 attacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 33784197  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  33784196 atctcgggagactctactgggaataatgcc 33784167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25207300 - 25206996
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  25207300 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25207201  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||    
T  25207200 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25207101  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  25207100 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25207001  T
Q  319 taatg 323  Q
    |||||    
T  25207000 taatg 25206996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 27 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 25271456 - 25271152
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  25271456 attggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 25271357  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | | |||||||    
T  25271356 tgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctgggaatcctc 25271257  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||||||  ||| ||||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||    
T  25271256 tttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgagga 25271157  T
Q  319 taatg 323  Q
    |||||    
T  25271156 taatg 25271152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11556368 - 11556041
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11556368 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 11556269  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11556268 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 11556169  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11556168 attacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 11556069  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatg 323  Q
     |||  | ||||||| ||||| ||||||    
T  11556068 gtcttgggagactctactgggaataatg 11556041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Original strand, 22992268 - 22992594
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  22992268 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 22992367  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22992368 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 22992467  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22992468 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 22992567  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataat 322  Q
    ||||| | ||||||| ||||| |||||    
T  22992568 atctcgggagactctactgggaataat 22992594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 13179944 - 13180241
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13179944 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 13180043  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13180044 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 13180143  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggata 293  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13180144 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23632984 - 23632656
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  23632984 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 23632885  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||     
T  23632884 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctat 23632785  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  23632784 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggataga 23632685  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgc 324  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  23632684 atctcggaagactctactgggaataatgc 23632656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24609242 - 24608930
Alignment:
Q  21 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  24609242 attgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 24609143  T
Q  121 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 212  Q
    || ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||    
T  24609142 cacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaa 24609043  T
Q  213 atcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgc 312  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  24609042 atcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctac 24608943  T
Q  313 tggggataatgcc 325  Q
    |||| ||||||||    
T  24608942 tgggaataatgcc 24608930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24976858 - 24976529
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24976858 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 24976759  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  24976758 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctat 24976659  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24976658 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataga 24976559  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24976558 atctcggaagactctactgggaataatgcc 24976529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33299550 - 33299221
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33299550 attgagttgagactgatgttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 33299451  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33299450 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 33299351  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299350 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 33299251  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    || || | ||||||| ||||| ||||||||    
T  33299250 atatcgggagactctactgggaataatgcc 33299221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 9543856 - 9544184
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  9543856 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 9543955  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  9543956 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 9544054  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9544055 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggataga 9544154  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  9544155 atctcggaagactctactgggaataatgcc 9544184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 6881326 - 6881002
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6881326 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 6881227  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6881226 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 6881128  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6881127 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 6881028  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataa 321  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  6881027 atctcggaagactctactgggaataa 6881002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 18121558 - 18121888
Alignment:
Q  1 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgc 100  Q
    |||||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18121558 agcattgaattgagactgatgttgccattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgc 18121657  T
Q  101 gtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtg 199  Q
     || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18121658 atgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtg 18121756  T
Q  200 ctacatca--------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctgggga 291  Q
    ||| ||||        | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121757 ctatatcacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggga 18121856  T
Q  292 tagaatctcagaagactctgctggggataatg 323  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||    
T  18121857 tagaatctcgggagactctactgggaataatg 18121888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30941626 - 30941315
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  30941626 ttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 30941527  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | ||||    
T  30941526 atgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 30941427  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  30941426 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 30941327  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  30941326 gggaataatgcc 30941315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 28952923 - 28953244
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28952923 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 28953022  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28953023 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 28953121  T
Q  204 at--cata------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    ||  ||||       ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28953122 attacatattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacaga 28953221  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||| ||||||| | |||||||    
T  28953222 atctcggaagactttactgggga 28953244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Original strand, 15651890 - 15652217
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  15651890 ttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 15651989  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15651990 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 15652088  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| |   ||||||||| ||| ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15652089 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 15652188  T
Q  297 tctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  15652189 tctcgggagactctactgggaataatgcc 15652217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 37351792 - 37352120
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  37351792 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 37351891  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37351892 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 37351990  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351991 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 37352090  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||   ||||| | ||||||||||||||    
T  37352091 atctcgagagactttactggggataatgcc 37352120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 43085280 - 43084989
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  43085280 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 43085181  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  43085180 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 43085082  T
Q  204 a-tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    | || | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43085081 attcttggaaatcctctctggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 43084989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 15751986 - 15752288
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15751986 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 15752085  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  15752086 tatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 15752184  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15752185 attacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 15752284  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  15752285 atct 15752288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30159053 - 30158725
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30159053 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 30158954  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  30158953 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 30158855  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30158854 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagataga 30158755  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  |||||||   ||||||| ||||||    
T  30158754 atcttggaagacttgactggggaaaatgcc 30158725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 18493914 - 18494198
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18493914 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18494013  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  18494014 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 18494112  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494113 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatct 18494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33882138 - 33881837
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  33882138 ttgaattgagactgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 33882039  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33882038 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 33881940  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  || |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33881939 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaa 33881840  T
Q  297 tct 299  Q
    |||    
T  33881839 tct 33881837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2518078 - 2517750
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2518078 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 2517979  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2517978 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 2517880  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  2517879 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagataga 2517780  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||   |||||| | ||||||||||||||    
T  2517779 atcttgaaagactttactggggataatgcc 2517750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 32589421 - 32589705
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32589421 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32589520  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||   ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  32589521 atgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 32589619  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32589620 tcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatct 32589705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30036459 - 30036157
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  30036459 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 30036360  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  30036359 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 30036261  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30036260 attacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 30036161  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  30036160 atct 30036157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33523417 - 33523115
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33523417 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 33523318  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33523317 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 33523219  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33523218 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 33523119  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  33523118 atct 33523115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 37745495 - 37745779
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37745495 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37745594  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | ||||    
T  37745595 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaa 37745693  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37745694 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatct 37745779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Original strand, 8658621 - 8658932
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  8658621 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 8658720  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  8658721 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctat 8658819  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  8658820 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaataga 8658919  T
Q  296 atctcagaagact 308  Q
    ||||| |||||||    
T  8658920 atctcggaagact 8658932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24730981 - 24730654
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  24730981 ttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 24730882  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24730881 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctata 24730783  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24730782 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaa 24730683  T
Q  297 tctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||    ||||| | ||||||||||||||    
T  24730682 tcttgagagactttactggggataatgcc 24730654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 31819567 - 31819851
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31819567 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31819666  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |        || | ||||    
T  31819667 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaa 31819765  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31819766 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatct 31819851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37761989 - 37761686
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37761989 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37761890  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37761889 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37761791  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  37761790 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 37761691  T
Q  314 gggga 318  Q
    |||||    
T  37761690 gggga 37761686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31438452 - 31438142
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31438452 ttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31438353  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  31438352 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 31438254  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||    
T  31438253 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttact 31438154  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||||||||||||    
T  31438153 ggggataatgcc 31438142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34623532 - 34623230
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  34623532 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 34623433  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34623432 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 34623334  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34623333 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 34623234  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  34623233 atct 34623230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 30175500 - 30175199
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| ||     
T  30175500 ttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgt 30175401  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30175400 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 30175302  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  30175301 ttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaa 30175202  T
Q  297 tct 299  Q
    |||    
T  30175201 tct 30175199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40466979
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 40466979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644543
Alignment:
Q  21 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 120  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  121 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 212  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  213 atcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctg 287  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctg 5644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28656278 - 28655976
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28656278 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 28656179  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc--- 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       
T  28656178 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 28656080  T
Q  201 --taca---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
      ||||   || | |||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||  || || |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28656079 gttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggataga 28655980  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  28655979 atct 28655976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 13435815 - 13436099
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  13435815 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 13435914  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  13435915 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 13436013  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| || ||| || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13436014 tcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 13436099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 37664650 - 37664934
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  37664650 ttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 37664749  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  37664750 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 37664848  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37664849 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatct 37664934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 18368658 - 18368956
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18368658 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 18368757  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18368758 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18368856  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        || || |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18368857 attacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 18368956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3796566 - 3796245
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| ||    
T  3796566 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatg 3796467  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  3796466 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctat 3796368  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  3796367 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagataga 3796268  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  3796267 atcttggaagactttactgggga 3796245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330369
Alignment:
Q  26 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 125  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  126 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 217  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  218 ctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 11330369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 13317977 - 13318275
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  13317977 attggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 13318076  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 218  Q
     ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  13318077 tgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctc 13318175  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||||||    
T  13318176 tttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggga 13318275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 41681693 - 41681390
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| || ||| |||     || ||||||     
T  41681693 attggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgattatgcatgtatgaatgt----aacgcatgac 41681598  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaaatcc 216  Q
     ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||      | ||||||    
T  41681597 tgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcc 41681499  T
Q  217 tctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggg 316  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  41681498 tctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgag 41681399  T
Q  317 gataatgcc 325  Q
     ||||||||    
T  41681398 aataatgcc 41681390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9324479 - 9324194
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9324479 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9324380  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  9324379 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 9324281  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  9324280 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 9324194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26487389 - 26487104
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26487389 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26487290  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  26487289 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26487191  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26487190 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 26487104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12139177 - 12138874
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | | ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  12139177 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 12139078  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  12139077 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 12138979  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  12138978 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 12138879  T
Q  314 gggga 318  Q
    |||||    
T  12138878 gggga 12138874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 13178630 - 13178824
Alignment:
Q  8 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 106  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  13178630 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 13178729  T
Q  107 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178730 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 16443138 - 16443451
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||     
T  16443138 attggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgac 16443237  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  16443238 tgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 16443337  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16443338 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 16443437  T
Q  319 taatgccatcattg 332  Q
    ||||||| ||||||    
T  16443438 taatgccgtcattg 16443451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16048338 - 16048004
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  16048338 attgaattgagactgatgttggcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatg 16048239  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16048238 tatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 16048139  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16048138 attacacattcctggaaatcctctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 16048039  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcat 330  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16048038 atctcggaagactctgttggggataatgccgtcat 16048004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5155088 - 5154759
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5155088 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 5154989  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5154988 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 5154889  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154888 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 5154789  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  5154788 atctcgggagactctactgggaataatgcc 5154759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 321
Target Start/End: Original strand, 26508819 - 26509144
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26508819 attgaattgagactgatgttgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 26508918  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508919 tatgaatggttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 26509018  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  26509019 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtaga 26509118  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataa 321  Q
    ||||  |||||| |  ||||||||||    
T  26509119 atcttggaagacccgactggggataa 26509144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 10848592 - 10848276
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  10848592 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 10848493  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaa 213  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||        | ||||    
T  10848492 atgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaa 10848393  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10848392 tcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttgctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagactctgct 10848293  T
Q  314 ggggataatgccatcat 330  Q
    || ||||||||| ||||    
T  10848292 ggagataatgccgtcat 10848276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2161576 - 2161248
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2161576 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 2161477  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2161476 tatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 2161377  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||  ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2161376 attacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggca-gtagctatgcaacttgctggggataga 2161278  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  2161277 atctcgggagactctactgggaataatgcc 2161248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 11417913 - 11418242
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11417913 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 11418012  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  11418013 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 11418112  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418113 attacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 11418212  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  11418213 atcttgggagactctactgggaataatgcc 11418242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 16511559 - 16511895
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16511559 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 16511658  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||     
T  16511659 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgtgctat 16511758  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16511759 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataga 16511858  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  16511859 atctcggaagactctactgggaataatgccgtcattg 16511895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5165383 - 5165060
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |    
T  5165383 ttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 5165284  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca----- 204  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         
T  5165283 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattaca 5165184  T
Q  205 ---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctca 301  Q
       || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  5165183 cattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttg 5165084  T
Q  302 gaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    | ||||||| || |||||||||||    
T  5165083 ggagactctactagggataatgcc 5165060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 10910060 - 10910389
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10910060 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 10910159  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  10910160 tatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 10910259  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10910260 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggataga 10910359  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  10910360 atctcgggagactctactgggaataatgcc 10910389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2780248 - 2779920
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2780248 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 2780149  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  2780148 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 2780050  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2780049 attacacattcctggaaatcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggataga 2779950  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  2779949 atctcggaagactctactgggaataatgcc 2779920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 26678215 - 26678517
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||    
T  26678215 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatg 26678314  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26678315 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26678413  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26678414 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagataga 26678513  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  26678514 atct 26678517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 26663023 - 26663325
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| ||    
T  26663023 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatg 26663122  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26663123 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26663221  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  26663222 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagataga 26663321  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  26663322 atct 26663325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22148874 - 22148564
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  22148874 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 22148775  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  22148774 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 22148676  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  22148675 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctact 22148576  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  22148575 gggaataatgcc 22148564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31130920 - 31130618
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  31130920 ttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 31130821  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31130820 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 31130722  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaacc-atggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130721 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 31130622  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  31130621 atct 31130618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 31083735 - 31084037
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  31083735 ttgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 31083834  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31083835 atgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 31083933  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggataga 295  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  31083934 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggataga 31084033  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  31084034 atct 31084037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45394226 - 45393923
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  45394226 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45394127  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |        || | | ||    
T  45394126 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaa 45394028  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  45394027 tcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 45393928  T
Q  314 gggga 318  Q
    |||||    
T  45393927 gggga 45393923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26442269 - 26441967
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| ||    
T  26442269 attgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatg 26442170  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  26442169 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 26442071  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26442070 attacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggataga 26441971  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  26441970 atct 26441967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138658
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatct 4138658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206603
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatcttgggagactctact 39206591  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||  ||||||||    
T  39206592 ggaaataatgcc 39206603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 45738287 - 45737977
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  45738287 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 45738188  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  45738187 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 45738089  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  45738088 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatcttgggagactctact 45737989  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||  ||||||||    
T  45737988 ggaaataatgcc 45737977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 318
Target Start/End: Original strand, 31557516 - 31557837
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||     
T  31557516 ttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgt 31557615  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-- 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||      
T  31557616 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctata 31557714  T
Q  203 ------catcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggataga 295  Q
          | || | ||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  31557715 ttacaccttcttggaaatcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggataga 31557814  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  31557815 atcttggaagactttactgggga 31557837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744933
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||  ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 16744933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 3452252 - 3451927
Alignment:
Q  8 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 106  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  3452252 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3452153  T
Q  107 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 206  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3452152 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 3452054  T
Q  207 ata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatc 298  Q
    | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3452053 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatc 3451954  T
Q  299 tcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3451953 tcggaagactctactgggaataatgcc 3451927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26519814 - 26519511
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26519814 ttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26519715  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  26519714 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26519616  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||    
T  26519615 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttact 26519516  T
Q  314 gggga 318  Q
    |||||    
T  26519515 gggga 26519511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 26596681 - 26596378
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  ||    
T  26596681 attgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatg 26596582  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26596581 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctat 26596483  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaacc-atggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||| || | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  26596482 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatag 26596383  T
Q  295 aatct 299  Q
    |||||    
T  26596382 aatct 26596378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4206400 - 4206098
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  4206400 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 4206301  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4206300 tatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctat 4206202  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||  |||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4206201 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 4206102  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  4206101 atct 4206098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Original strand, 5140448 - 5140744
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  5140448 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 5140547  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5140548 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 5140646  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggata 293  Q
     | | |        || ||||||| ||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  5140647 gttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 24585647 - 24585949
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| ||     
T  24585647 ttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgt 24585746  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
    ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24585747 atgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 24585845  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24585846 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagataga 24585945  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  24585946 atct 24585949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11447914 - 11447592
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |    
T  11447914 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcat 11447815  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11447814 gtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 11447716  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  11447715 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatag 11447616  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  11447615 aatcttggaagactttactgggga 11447592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 26312992 - 26313277
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  26312992 ttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 26313091  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||   |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  26313092 atgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 26313190  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26313191 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 26313277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 318
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268517
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 125  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  126 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 217  Q
    |||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26268417  T
Q  218 ctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggg 317  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||||||    
T  26268418 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggg 26268516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152791
Alignment:
Q  161 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaa 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  253 ccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    || ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgcc 22152791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208706
Alignment:
Q  161 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaa 252  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  253 ccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    || ||| |||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgcc 22208706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 27 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15234834 - 15234523
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  15234834 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 15234735  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc 218  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||    
T  15234734 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctc 15234635  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15234634 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 15234535  T
Q  319 taatgccatcat 330  Q
    ||||||| ||||    
T  15234534 taatgccgtcat 15234523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 322
Target Start/End: Original strand, 15275859 - 15276179
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  15275859 ttgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaa 15275958  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca-- 207  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  15275959 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcaca 15276058  T
Q  208 ------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctca 301  Q
          | |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||     
T  15276059 cattcttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcg 15276158  T
Q  302 gaagactctgctggggataat 322  Q
    |||||||| ||| | ||||||    
T  15276159 gaagactccgctagagataat 15276179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Original strand, 24585598 - 24585934
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24585598 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 24585697  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24585698 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 24585797  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24585798 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggataga 24585897  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  24585898 atctcgggagactctactgggaataatgccgtcattg 24585934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Original strand, 15379481 - 15379799
Alignment:
Q  20 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||| |||    
T  15379481 aattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaat 15379580  T
Q  120 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------taga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||    
T  15379581 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgga 15379680  T
Q  212 aatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctg 311  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15379681 aatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctg 15379780  T
Q  312 ctggggataatgccatcat 330  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  15379781 ctggagataatgccgtcat 15379799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14672028 - 14671699
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14672028 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14671929  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  14671928 tatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 14671829  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14671828 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 14671729  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||    
T  14671728 atctcggaagactctactaggaataatgcc 14671699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1907224 - 1906970
Alignment:
Q  86 tatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggca 185  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907224 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggca 1907125  T
Q  186 cgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatg 277  Q
    ||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1907124 cgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatg 1907025  T
Q  278 caacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  1907024 caacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgtcattg 1906970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17020022 - 17019738
Alignment:
Q  49 atgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacag 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  17020022 atgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacag 17019923  T
Q  149 tttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttggga 240  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  17019922 ttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttggga 17019823  T
Q  241 ggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17019822 gacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 17019738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 36323565 - 36323893
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  36323565 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatg 36323664  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  36323665 catgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctat 36323763  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36323764 attacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggataga 36323863  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36323864 atctcggaagactctactgggaataatgcc 36323893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 36337774 - 36338102
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  36337774 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatg 36337873  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
    |||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  36337874 catgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctat 36337972  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36337973 attacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggataga 36338072  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36338073 atctcggaagactctactgggaataatgcc 36338102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6576874 - 6576545
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  6576874 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 6576775  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6576774 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 6576676  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctc-tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
    |        || | ||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  6576675 attacacattcttggaaatcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatag 6576576  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  6576575 aatctcggaagactccactggggataatgcc 6576545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 14752744 - 14753072
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14752744 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14752843  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14752844 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14752942  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14752943 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 14753042  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  14753043 atctcggaagactctactgggaataatgcc 14753072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 54840410 - 54840126
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  54840410 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 54840311  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  54840310 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 54840212  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54840211 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatct 54840126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24119679 - 24119350
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24119679 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 24119580  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24119579 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 24119481  T
Q  204 atcata---------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
    || | |          ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||| || ||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  24119480 attacacattctcggaaaatcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatag 24119381  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24119380 aatctcggaagactctactgggaataatgcc 24119350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39857634 - 39857324
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39857634 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39857535  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||     
T  39857534 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaat 39857436  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    || ||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  39857435 tcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 39857336  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    | | ||||||||    
T  39857335 gagaataatgcc 39857324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5701566 - 5701238
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5701566 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 5701467  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  5701466 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 5701368  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5701367 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagataga 5701268  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  ||||||| | | ||||| ||||||    
T  5701267 atcttggaagactttaccggggacaatgcc 5701238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 27156572 - 27156856
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27156572 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27156671  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27156672 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27156770  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27156771 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 27156856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 31119738 - 31120040
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31119738 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 31119837  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31119838 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 31119936  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31119937 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 31120036  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  31120037 atct 31120040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Original strand, 18793871 - 18794169
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18793871 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 18793970  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18793971 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18794069  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18794070 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 18794169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 21976741 - 21976439
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21976741 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 21976642  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21976641 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 21976543  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21976542 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 21976443  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  21976442 atct 21976439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331965
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 20331965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 40098861 - 40099163
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40098861 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 40098960  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40098961 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 40099059  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  40099060 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagataga 40099159  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  40099160 atct 40099163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14105581 - 14105283
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14105581 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14105482  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  || |||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14105481 tatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14105383  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14105382 attacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggataga 14105283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 332
Target Start/End: Original strand, 34182219 - 34182520
Alignment:
Q  38 aatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtt 137  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  34182219 aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaatt 34182318  T
Q  138 tgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataa 229  Q
     |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |    
T  34182319 cgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatga 34182417  T
Q  230 caccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgccatca 329  Q
    |  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  34182418 cgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgtca 34182517  T
Q  330 ttg 332  Q
    |||    
T  34182518 ttg 34182520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5012920 - 5012616
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt-aaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  5012920 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 5012821  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattggg-cacgtagtggctcgtgct 201  Q
    | ||| ||||||| ||||| |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5012820 gtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgct 5012722  T
Q  202 acatcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggata 293  Q
    | || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5012721 atattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggata 5012622  T
Q  294 gaatct 299  Q
    ||||||    
T  5012621 gaatct 5012616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Original strand, 24814547 - 24814726
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  24814547 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 24814646  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24814647 atgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 33667028 - 33667350
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | |    
T  33667028 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacat 33667127  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33667128 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 33667226  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  33667227 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatag 33667326  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  33667327 aatcttggaagactttactgggga 33667350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30760802 - 30760480
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | |    
T  30760802 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacat 30760703  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30760702 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 30760604  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  30760603 tattacacattcttggaaatcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatag 30760504  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  30760503 aatcttggaagactttactgggga 30760480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Original strand, 24813628 - 24813822
Alignment:
Q  8 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 106  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  24813628 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 24813727  T
Q  107 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813728 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 28315 - 27989
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  28315 ttgagactgaaattgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaa 28216  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca---- 204  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||        
T  28215 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacaca 28116  T
Q  205 -tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcaga 303  Q
     || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  28115 ttcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcgga 28016  T
Q  304 agactctgctggggataatgccatcat 330  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28015 agactccgctggggataatgccgtcat 27989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 4 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 15368235 - 15367900
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15368235 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatg 15368136  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15368135 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctac 15368036  T
Q  204 atca--------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagc-tatgcaacttgctggggatag 294  Q
    ||||        | |||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15368035 atcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatag 15367936  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgccatcat 330  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15367935 aatctcggaagactctgctggggataatgccgtcat 15367900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 324
Target Start/End: Original strand, 16617758 - 16618087
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  16617758 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatg 16617857  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16617858 tatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctat 16617957  T
Q  204 atca--------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagc-tatgcaacttgctggggatag 294  Q
    ||||        | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16617958 atcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatag 16618057  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataatgc 324  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16618058 aatctcggaagactccgctggggataatgc 16618087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5659103 - 5658774
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5659103 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 5659004  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta- 202  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5659003 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 5658904  T
Q  203 -------catcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
           | || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5658903 attacaccttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 5658804  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  5658803 atctcgggagactctactgggaataatgcc 5658774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 22041399 - 22041072
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  22041399 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatg 22041300  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22041299 tatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctat 22041200  T
Q  204 atca--------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagc-tatgcaacttgctggggatag 294  Q
    ||||        | ||||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22041199 atcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatag 22041100  T
Q  295 aatctcagaagactctgctggggataat 322  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  22041099 aatctcggaagactccgctggagataat 22041072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 29142045 - 29142374
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  29142045 attgagttgagactgatgttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 29142144  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29142145 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 29142244  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142245 attacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 29142344  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  29142345 atctcgggagactctactgggaataatgcc 29142374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 22 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19701368 - 19701050
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  19701368 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 19701269  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19701268 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 19701169  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    || |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19701168 tcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 19701069  T
Q  314 ggggataatgccatcattg 332  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  19701068 ggggataatgccgtcattg 19701050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35887729 - 35887400
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  35887729 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 35887630  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  35887629 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 35887530  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || |  ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35887529 attacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 35887430  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
     |||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  35887429 gtcttgggagactctactgggaataatgcc 35887400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18058237 - 18057908
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18058237 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 18058138  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18058137 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18058038  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18058037 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 18057938  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  18057937 atctcgggagactctactgggaataatgcc 18057908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 22380871 - 22381200
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  22380871 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 22380970  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22380971 tatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 22381070  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || |||        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22381071 attatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 22381170  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  22381171 atctcgggagactctactgggaataatgcc 22381200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16423176 - 16422840
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16423176 attgaattgagactgatgttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 16423077  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  16423076 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctat 16422977  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16422976 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggataga 16422877  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16422876 atctcggaagactctactggggataatgccgtcattg 16422840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 332
Target Start/End: Original strand, 15886026 - 15886344
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  15886026 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 15886125  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | ||||    
T  15886126 atgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaa 15886225  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  15886226 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctact 15886325  T
Q  314 ggggataatgccatcattg 332  Q
    ||| |||||||| ||||||    
T  15886326 gggaataatgccgtcattg 15886344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 4789922 - 4790251
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4789922 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 4790021  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  4790022 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 4790121  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4790122 attacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggataga 4790221  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4790222 atcttgggagactctactgggaataatgcc 4790251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 323
Target Start/End: Original strand, 8282769 - 8283078
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  8282769 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 8282868  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  8282869 atgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 8282968  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  8282969 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 8283068  T
Q  314 ggggataatg 323  Q
    ||| ||||||    
T  8283069 gggtataatg 8283078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Original strand, 11103671 - 11103981
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  11103671 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 11103770  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  11103771 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 11103869  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  11103870 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 11103969  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  11103970 gggaataatgcc 11103981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4728595 - 4728266
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4728595 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 4728496  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4728495 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 4728396  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4728395 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 4728296  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4728295 atcttgggagactctactgggaataatgcc 4728266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6208864 - 6208535
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||    
T  6208864 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatg 6208765  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6208764 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 6208665  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6208664 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 6208565  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  6208564 atcttgggagactctactgggaataatgcc 6208535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4690644 - 4690308
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  4690644 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 4690545  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  4690544 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctat 4690445  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4690444 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 4690345  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  4690344 atctcgggagactctactgggaataatgccgtcattg 4690308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18337593 - 18337266
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18337593 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 18337494  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18337493 tatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18337394  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || |||        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18337393 attatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggataga 18337294  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatg 323  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||    
T  18337293 atcttgggagactctactgggaataatg 18337266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 15734407 - 15734736
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||| ||    
T  15734407 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatg 15734506  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| || |||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15734507 tatgaattcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 15734606  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734607 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 15734706  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||  ||||||||    
T  15734707 atctcgggagactctactggaaataatgcc 15734736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5020683 - 5020399
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5020683 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5020584  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5020583 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 5020485  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5020484 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggggatagaatct 5020399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 31029535 - 31029863
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  31029535 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 31029634  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31029635 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 31029733  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31029734 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 31029833  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  31029834 atctcggaagactctactgggaataatgcc 31029863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4630731 - 4630421
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4630731 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4630632  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  4630631 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 4630533  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||| ||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4630532 tcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctact 4630433  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  4630432 gggaataatgcc 4630421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 18285648 - 18285976
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||    
T  18285648 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatg 18285747  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18285748 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18285846  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18285847 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 18285946  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18285947 atctcggaagactctactgggaataatgcc 18285976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 18300949 - 18301277
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || ||    
T  18300949 attgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatg 18301048  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18301049 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18301147  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18301148 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 18301247  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  18301248 atctcggaagactctactgggaataatgcc 18301277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24335166 - 24334864
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24335166 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 24335067  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  24335066 tatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 24334968  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24334967 attacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 24334868  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  24334867 atct 24334864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32297603 - 32297319
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  32297603 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 32297504  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || |    
T  32297503 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaga 32297405  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32297404 tcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctggagatagaatct 32297319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10650060 - 10649749
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10650060 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 10649961  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10649960 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 10649862  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10649861 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 10649762  T
Q  296 atctcagaagact 308  Q
    ||||  |||||||    
T  10649761 atcttggaagact 10649749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32446120 - 32445792
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  32446120 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 32446021  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc--- 200  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||       
T  32446020 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 32445922  T
Q  201 --taca---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
      ||||   || | |||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32445921 gttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 32445822  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  32445821 atcttgggagactctactgggaataatgcc 32445792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28346160 - 28345859
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  28346160 ttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 28346061  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-- 202  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  28346060 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 28345962  T
Q  203 ------catcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
          | || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28345961 ttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaa 28345862  T
Q  297 tct 299  Q
    |||    
T  28345861 tct 28345859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 4339968 - 4340296
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||||||||||||| ||    
T  4339968 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatgcatg 4340067  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  4340068 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 4340166  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4340167 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 4340266  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||||||||||||    
T  4340267 atcttgggagactctactggggataatgcc 4340296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 28109232 - 28109534
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||    
T  28109232 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatg 28109331  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  28109332 tatgaatgcttgtgatgcatgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 28109430  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  28109431 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagataga 28109530  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  28109531 atct 28109534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18249690 - 18249410
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18249690 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18249591  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18249590 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18249492  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  18249491 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 18249410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 31957726 - 31958027
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  31957726 ttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 31957825  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31957826 atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 31957924  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaa 296  Q
            || | |||||||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  31957925 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaa 31958024  T
Q  297 tct 299  Q
    |||    
T  31958025 tct 31958027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717743
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5717743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728653
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5728653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763715
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 5763715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 6536011 - 6536333
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  6536011 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 6536110  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6536111 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgcta 6536209  T
Q  203 catcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     || | |        ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6536210 tattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatag 6536309  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  6536310 aatcttggaagactttactgggga 6536333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 17978220 - 17978522
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  17978220 attgaattgagactgatgttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 17978319  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17978320 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 17978418  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17978419 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggataga 17978518  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  17978519 atct 17978522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21681710 - 21681412
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21681710 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 21681611  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  21681610 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 21681512  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21681511 attacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 21681412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 48472882 - 48472572
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  48472882 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 48472783  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  48472782 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 48472684  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  48472683 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 48472584  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||  ||||||||    
T  48472583 ggaaataatgcc 48472572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 4423866 - 4423558
Alignment:
Q  24 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcat 123  Q
    ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||    
T  4423866 gacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcat 4423767  T
Q  124 gatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatc 215  Q
    ||  ||||||| ||| ||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||||    
T  4423766 gactgttggcattttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatc 4423668  T
Q  216 ctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgg 315  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||| | ||||    
T  4423667 ctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactgg 4423568  T
Q  316 ggataatgcc 325  Q
    ||||||||||    
T  4423567 ggataatgcc 4423558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 16404079 - 16404363
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16404079 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16404178  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16404179 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16404277  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||| | ||||||||| ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16404278 tcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatct 16404363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18232164 - 18231880
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18232164 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18232065  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18232064 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 18231966  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18231965 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatct 18231880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20072985 - 20072675
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20072985 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20072886  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  20072885 atgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20072787  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  20072786 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctact 20072687  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||  ||||||||    
T  20072686 ggaaataatgcc 20072675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 22864133 - 22864435
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  22864133 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 22864232  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22864233 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 22864331  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22864332 attacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 22864431  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  22864432 atct 22864435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 22879192 - 22879494
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  22879192 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 22879291  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22879292 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 22879390  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22879391 attacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 22879490  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  22879491 atct 22879494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589927
Alignment:
Q  21 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  121 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 212  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  213 atcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatct 5589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 5602581 - 5602884
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  5602581 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 5602680  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5602681 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 5602779  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5602780 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatag 5602879  T
Q  295 aatct 299  Q
    |||||    
T  5602880 aatct 5602884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10403142 - 10402844
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  10403142 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 10403043  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  10403042 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 10402944  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
     | | |        || ||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  | |||  ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10402943 gttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggataga 10402844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 20570125 - 20570427
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  20570125 attgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 20570224  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20570225 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 20570323  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||   ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20570324 attacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggataga 20570423  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  20570424 atct 20570427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 5473929 - 5473629
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||           ||| ||||||| |||||    
T  5473929 ttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt----------atgaatgcttgtaatgc 5473840  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  5473839 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5473741  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5473740 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctact 5473641  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  5473640 gggaataatgcc 5473629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658538
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| | |||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 29658538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030124
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaac-ttgctggggatagaatctcagaagactctgc 312  Q
    ||||||||| |||| ||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||  |    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  313 tgggga 318  Q
    ||||||    
T  47030129 tgggga 47030124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8218615 - 8218317
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8218615 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 8218516  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8218515 tatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtggctcgtgctat 8218417  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  8218416 attacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggagataga 8218317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 299
Target Start/End: Original strand, 17970150 - 17970452
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  17970150 ttgaattgagactgatattgttattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgt 17970249  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca 204  Q
    ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17970250 atgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctata 17970348  T
Q  205 --------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggataga 295  Q
            || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  17970349 ttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggataga 17970448  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  17970449 atct 17970452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 16599585 - 16599406
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16599585 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16599486  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    ||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599485 atgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 51789013 - 51788691
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta-aatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | |    
T  51789013 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacat 51788914  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51788913 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 51788815  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  51788814 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatag 51788715  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  51788714 aatcttggaagactttactgggga 51788691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 7080201 - 7080022
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  7080201 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 7080102  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    ||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080101 atgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28028254 - 28027959
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||       ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  28028254 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 28028162  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28028161 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgtgctac 28028063  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28028062 attacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctggggataga 28027963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 35221826 - 35221712
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||     
T  35221826 attggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgac 35221727  T
Q  127 ggttggcagtttgta 141  Q
     ||||||||||||||    
T  35221726 tgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 212 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079868
Alignment:
Q  212 aatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctg 311  Q
    |||| ||| ||| ||||||  ||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  312 ctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||    
T  7079881 ctgggaataatgcc 7079868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 27 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 472
Alignment:
Q  27 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  127 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 218  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||||||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  219 tttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  319 taatgcc 325  Q
    |||||||    
T  478 taatgcc 472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 27)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 330
Target Start/End: Original strand, 22074134 - 22074452
Alignment:
Q  20 aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaat 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||    
T  22074134 aattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaat 22074233  T
Q  120 gcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------taga 211  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||    
T  22074234 gcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttgga 22074333  T
Q  212 aatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctg 311  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22074334 aatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctg 22074433  T
Q  312 ctggggataatgccatcat 330  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  22074434 ctggagataatgccgtcat 22074452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Original strand, 21341394 - 21341705
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  21341394 ttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 21341493  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  21341494 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 21341593  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctcagaagactctgc 312  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |    
T  21341594 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctac 21341693  T
Q  313 tggggataatgc 324  Q
    |||| |||||||    
T  21341694 tgggaataatgc 21341705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22139920 - 22139593
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22139920 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcgtg 22139821  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22139820 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 22139721  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  22139720 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggacaga 22139621  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatg 323  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  22139620 atctcggaagactctactggggataatg 22139593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15774580 - 15774251
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  15774580 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 15774481  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15774480 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 15774381  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15774380 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 15774281  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  15774280 atctcggaagactctactgggaataatgcc 15774251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14570161 - 14569834
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14570161 attgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14570062  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  14570061 tatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctat 14569962  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14569961 actacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggataga 14569862  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatg 323  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  14569861 atctcggaagactctactgggaataatg 14569834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16260944 - 16260609
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  16260944 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 16260845  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16260844 tatgaatgcttgttatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 16260745  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260744 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 16260645  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcatt 331  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  16260644 atctcggaaggctctactgggaataatgccgtcatt 16260609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18797697 - 18797386
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  18797697 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 18797598  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  18797597 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 18797498  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||| | ||    
T  18797497 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggatagaatcttgggagactttact 18797398  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  18797397 gggaataatgcc 18797386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 2130474 - 2130803
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  2130474 attgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 2130573  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2130574 tatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 2130673  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2130674 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggataga 2130773  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  2130774 atctcggaagactctactgggaataatgcc 2130803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19695122 - 19694786
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  19695122 attgaattgagactgatattgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattatgcatg 19695023  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  19695022 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgttat 19694923  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694922 attacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 19694823  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcattg 332  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  19694822 atctcggaagactctactgggaataatgccgtcattg 19694786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33249351 - 33249040
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  33249351 ttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 33249252  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  33249251 atgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 33249152  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  33249151 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactctact 33249052  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  33249051 gggaataatgcc 33249040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 19910373 - 19910702
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19910373 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 19910472  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  19910473 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgtgctat 19910572  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19910573 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggataga 19910672  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | | ||||| ||||| ||||||||    
T  19910673 atctcgggaaactctactgggaataatgcc 19910702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Original strand, 19654532 - 19654867
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19654532 attgaattgagactgatgttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 19654631  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  19654632 tatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 19654731  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19654732 attacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 19654831  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgccatcatt 331  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  19654832 atctcggaaggctctactgggaataatgccgtcatt 19654867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 27602119 - 27602448
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  27602119 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 27602218  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||     
T  27602219 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctat 27602318  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27602319 attacacattcttggaaatcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaaggataga 27602418  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  27602419 atcttgggagactctactgggaataatgcc 27602448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31361542 - 31361267
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  31361542 ttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 31361443  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  31361442 atgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaa 31361344  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctgggg 290  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31361343 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 31361267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29836336 - 29836052
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29836336 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29836237  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  29836236 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 29836138  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29836137 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatct 29836052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18716487 - 18716159
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  18716487 attgaattgagactgatgttgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 18716388  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  18716387 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 18716289  T
Q  204 atcata--------gaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    || | |        |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18716288 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 18716189  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  | ||||||| ||||  ||||||||    
T  18716188 atcttgggagactctactggaaataatgcc 18716159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33265751 - 33265449
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||    
T  33265751 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattatgcatg 33265652  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  33265651 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 33265553  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33265552 attacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggataga 33265453  T
Q  296 atct 299  Q
    ||||    
T  33265452 atct 33265449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 318
Target Start/End: Original strand, 12085943 - 12086240
Alignment:
Q  28 ttggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatg 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||      
T  12085943 ttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgact 12086042  T
Q  128 gttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctct 219  Q
    ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||    
T  12086043 gttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctct 12086141  T
Q  220 ttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||| || | |||||||    
T  12086142 ttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactgggga 12086240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355445
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 28355445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Original strand, 31483062 - 31483383
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| ||    
T  31483062 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatg 31483161  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  31483162 tatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 31483260  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  31483261 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagataga 31483360  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||  ||||||| | |||||||    
T  31483361 atcttggaagactttactgggga 31483383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 44568013 - 44567690
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  44568013 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 44567914  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  44567913 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgcta 44567815  T
Q  203 ca---------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggata 293  Q
     |         || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  44567814 tattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaata 44567715  T
Q  294 gaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||    
T  44567714 gaatcttggaagactttactgggga 44567690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201877
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||  | |||||| ||||| |||  |||||||| ||||||||||||||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatct 19201877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19681488 - 19681166
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | |    
T  19681488 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacat 19681389  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19681388 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgcta 19681290  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  19681289 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatag 19681190  T
Q  295 aatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    |||||  ||||||| | |||||||    
T  19681189 aatcttggaagactttactgggga 19681166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9361616 - 9361437
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9361616 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9361517  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9361516 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 9361437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15775482 - 15775288
Alignment:
Q  8 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 106  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  15775482 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 15775383  T
Q  107 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775382 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 120
Target Start/End: Original strand, 22389094 - 22389190
Alignment:
Q  24 gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  22389094 gacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 9361420 - 9361337
Alignment:
Q  211 aaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||| ||||| | ||||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  9361420 aaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggataga 9361337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 22 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12743
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||     
T  13062 ttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgt 12963  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--------catagaaa 213  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | | ||||    
T  12962 atgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacatccctggaaa 12863  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  12862 tcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcggatagaatctcggaagactctgct 12763  T
Q  314 -ggggataatgccatcattg 332  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  12762 gggggataatgccgtcattg 12743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2383
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||||||  | |||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatct 2383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 322
Target Start/End: Original strand, 25803 - 26123
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |    
T  25803 ttgagactgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggcacatagtatgcatgattatgcatgtatgaa 25902  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca-- 207  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||      
T  25903 tgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactattgggcacgtagtggctcatgctatatcaca 26002  T
Q  208 ------tagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctca 301  Q
          | |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  26003 cattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaagcaacttgctggggaaagaatctcg 26102  T
Q  302 gaagactctgctggggataat 322  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  26103 gaagactccgctggagataat 26123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 3843 - 4172
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3843 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 3942  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  3943 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctat 4042  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | || ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4043 attacacattcttggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 4142  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4143 atctcgggagactctactgggaataatgcc 4172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 24201 - 24530
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  24201 attgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattatgcatg 24300  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||| ||  | ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24301 tatgaatgcttgtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctat 24400  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24401 attacacattcctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggataga 24500  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  24501 atctcggaagactctactgggaataatgcc 24530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 324
Target Start/End: Original strand, 8894 - 9217
Alignment:
Q  10 ttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatgga 109  Q
    |||||| ||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |    
T  8894 ttgagactgatattgacattgatgatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaa 8993  T
Q  110 tgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca----- 204  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |         
T  8994 tgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattaca 9093  T
Q  205 ---tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgc-tggggatagaatctc 300  Q
       || | || ||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9094 cattcctggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgaggatagaatctc 9193  T
Q  301 agaagactctgctggggataatgc 324  Q
     ||||||||| ||||| |||||||    
T  9194 ggaagactctactgggaataatgc 9217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34283 - 33972
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  34283 ttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 34184  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | ||||    
T  34183 atgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaa 34084  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgct 313  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||    
T  34083 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgaggatagaatctcgggagactctact 33984  T
Q  314 ggggataatgcc 325  Q
    ||| ||||||||    
T  33983 gggaataatgcc 33972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 10948 - 10625
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  10948 attgaattgagactgatattgttattggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 10849  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||   ||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  10848 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgcta 10750  T
Q  203 ca---------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggata 293  Q
     |         || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||    
T  10749 tattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaata 10650  T
Q  294 gaatctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||    
T  10649 gaatcttggaagactttactgggga 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13044 - 12716
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13044 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 12945  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  12944 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 12846  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||  || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12845 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggataga 12746  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
     |||  | ||||||| ||||| ||||||||    
T  12745 gtcttgggagactctactgggaataatgcc 12716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 14970 - 14649
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14970 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 14871  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  14870 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 14772  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  || ||    
T  14771 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattga 14672  T
Q  296 atctcagaagactctgctgggga 318  Q
    ||||| |||| || | |||||||    
T  14671 atctcggaaggctttactgggga 14649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 8169 - 8497
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  8169 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatg 8268  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctac 203  Q
     ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  8269 tatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctat 8367  T
Q  204 a--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8368 attacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagataga 8467  T
Q  296 atctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    ||||  ||||||| | | ||||| ||||||    
T  8468 atcttggaagactttaccggggacaatgcc 8497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 299
Target Start/End: Original strand, 2404 - 2707
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  2404 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 2503  T
Q  103 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 202  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2504 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 2602  T
Q  203 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatag 294  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2603 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatag 2702  T
Q  295 aatct 299  Q
    |||||    
T  2703 aatct 2707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Original strand, 23824 - 23935
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 102  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  23824 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 23923  T
Q  103 gcatggatgctt 114  Q
    | ||| ||||||    
T  23924 gtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18534
Alignment:
Q  251 aaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 299  Q
    |||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatct 18534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16586 - 16306
Alignment:
Q  22 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 121  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| || ||| ||||||| |||||    
T  16586 ttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16487  T
Q  122 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 213  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |        || | ||||    
T  16486 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgttatattacacattcttggaaa 16388  T
Q  214 tcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggtaggtagctatgcaacttgctggggataga 295  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16387 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctggggataga 16306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 325
Target Start/End: Original strand, 39840 - 40180
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaat-gcaatatgtatgga-tgatataacagtttta-ttaaatgtat-gagcacgtagtatgcatgattatg 99  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||| ||||||||||||||    
T  39840 attgaattgagactgatgttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaatatgcatgattatg 39939  T
Q  100 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagta-ttgggca-cgtagtggctc 196  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||||    
T  39940 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggcaacgcagtggctc 40039  T
Q  197 gtgctacatcataga----------aatcctctttggagataacaccgttgggaggcgtatcggaaccatggttgagggt-aggtagcta-tgcaacttg 284  Q
    |||||| || | | |          |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| || |||||||||    
T  40040 gtgctatattacacatttcctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgcaacttg 40139  T
Q  285 ctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  40140 ctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 40180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 125
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1412
Alignment:
Q  5 ttgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgc 104  Q
    |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  1292 ttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgt 1391  T
Q  105 atggatgcttgaaatgcatga 125  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  1392 atgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 125
Target Start/End: Original strand, 13203 - 13324
Alignment:
Q  4 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtg 103  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  13203 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatg 13302  T
Q  104 catggatgcttgaaatgcatga 125  Q
     ||| ||||||| |||||||||    
T  13303 tatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6742
Alignment:
Q  260 tgagggtaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataatgcc 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgcc 6742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University