View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9857_low_9 (Length: 510)

Name: NF9857_low_9
Description: NF9857
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9857_low_9
NF9857_low_9
[»] chr6 (56 HSPs)
chr6 (6-490)||(27283400-27283883)
chr6 (6-485)||(27209574-27210061)
chr6 (6-485)||(27239167-27239654)
chr6 (58-485)||(26927427-26927862)
chr6 (12-485)||(16756496-16756977)
chr6 (6-486)||(22927890-22928380)
chr6 (6-458)||(15405568-15406028)
chr6 (6-458)||(15417355-15417815)
chr6 (6-485)||(24298800-24299285)
chr6 (58-466)||(24870402-24870818)
chr6 (6-485)||(13291982-13292470)
chr6 (6-480)||(27025822-27026303)
chr6 (12-480)||(27031701-27032177)
chr6 (6-485)||(29508096-29508583)
chr6 (58-485)||(33369520-33369954)
chr6 (6-485)||(29556231-29556719)
chr6 (59-427)||(20131253-20131623)
chr6 (59-427)||(22201247-22201617)
chr6 (19-487)||(30551032-30551506)
chr6 (6-460)||(27200897-27201358)
chr6 (6-460)||(27247875-27248336)
chr6 (167-490)||(27622905-27623228)
chr6 (6-487)||(13517230-13517720)
chr6 (12-487)||(29579707-29580188)
chr6 (6-492)||(26109437-26109933)
chr6 (14-485)||(26792491-26792966)
chr6 (19-487)||(27491811-27492286)
chr6 (6-487)||(4538795-4539285)
chr6 (58-510)||(27355173-27355632)
chr6 (6-466)||(28167188-28167657)
chr6 (58-487)||(4531967-4532403)
chr6 (62-487)||(16937100-16937532)
chr6 (12-485)||(27014399-27014880)
chr6 (6-490)||(28214138-28214631)
chr6 (6-487)||(26665674-26666163)
chr6 (6-487)||(26771645-26772134)
chr6 (58-487)||(27064174-27064600)
chr6 (6-487)||(16680832-16681321)
chr6 (58-485)||(14138501-14138925)
chr6 (58-487)||(4779584-4780020)
chr6 (58-460)||(8898765-8899176)
chr6 (58-460)||(4764462-4764861)
chr6 (59-362)||(20175368-20175666)
chr6 (59-362)||(22160325-22160623)
chr6 (181-487)||(34457699-34458012)
chr6 (6-115)||(34457581-34457690)
chr6 (1-138)||(27622504-27622643)
chr6 (1-39)||(27622169-27622207)
chr6 (1-39)||(27622388-27622426)
chr6 (58-110)||(4755772-4755824)
chr6 (1-39)||(27622060-27622098)
chr6 (1-35)||(27622285-27622319)
chr6 (1-35)||(27622337-27622371)
chr6 (6-50)||(14138443-14138487)
chr6 (6-50)||(27064636-27064680)
chr6 (6-50)||(33369462-33369506)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (6-490)||(26508662-26509154)
chr7 (4-466)||(16048027-16048495)
chr7 (14-485)||(2161247-2161725)
chr7 (58-485)||(5154758-5155193)
chr7 (6-486)||(16442959-16443446)
chr7 (58-485)||(11417808-11418243)
chr7 (58-485)||(5165059-5165494)
chr7 (58-486)||(16511454-16511890)
chr7 (6-487)||(26678059-26678546)
chr7 (6-487)||(26662867-26663354)
chr7 (58-485)||(10909955-10910390)
chr7 (6-485)||(2779919-2780406)
chr7 (6-487)||(31557356-31557847)
chr7 (6-487)||(31083577-31084066)
chr7 (6-487)||(26596349-26596837)
chr7 (6-487)||(26441938-26442425)
chr7 (19-460)||(31130616-31131064)
chr7 (140-466)||(10848299-10848633)
chr7 (6-487)||(26519501-26519988)
chr7 (6-485)||(22148563-22149049)
chr7 (6-487)||(11447582-11448070)
chr7 (12-487)||(45393913-45394394)
chr7 (6-466)||(45737995-45738467)
chr7 (58-487)||(4206069-4206505)
chr7 (6-487)||(24585489-24585978)
chr7 (6-452)||(5140289-5140744)
chr7 (6-487)||(26312818-26313306)
chr7 (181-487)||(16744649-16744962)
chr7 (181-487)||(4138374-4138687)
chr7 (181-466)||(39206293-39206585)
chr7 (167-485)||(3451926-3452252)
chr7 (186-487)||(26268219-26268527)
chr7 (6-115)||(16744531-16744640)
chr7 (320-485)||(22152790-22152963)
chr7 (320-485)||(22208705-22208878)
chr7 (6-115)||(4138256-4138365)
chr7 (6-115)||(39206175-39206284)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (6-486)||(21696249-21696735)
chr2 (6-480)||(34267981-34268463)
chr2 (58-485)||(23117471-23117906)
chr2 (6-487)||(37932072-37932557)
chr2 (126-486)||(27397031-27397399)
chr2 (6-487)||(37678958-37679445)
chr2 (6-487)||(37694223-37694710)
chr2 (6-485)||(28888929-28889414)
chr2 (58-466)||(27427583-27428000)
chr2 (6-475)||(34297856-34298332)
chr2 (12-487)||(3789138-3789621)
chr2 (6-487)||(19409544-19410031)
chr2 (58-487)||(13929722-13930158)
chr2 (58-485)||(20844590-20845025)
chr2 (19-487)||(16822411-16822885)
chr2 (19-487)||(16898595-16899069)
chr2 (6-487)||(253711-254199)
chr2 (58-485)||(31867924-31868354)
chr2 (19-487)||(32056447-32056921)
chr2 (6-487)||(21670233-21670720)
chr2 (6-466)||(37384371-37384838)
chr2 (6-487)||(39896764-39897251)
chr2 (12-485)||(12662165-12662646)
chr2 (140-466)||(19449604-19449939)
chr2 (6-487)||(34868329-34868817)
chr2 (6-466)||(27123216-27123684)
chr2 (6-487)||(37944924-37945412)
chr2 (6-487)||(34161536-34162025)
chr2 (6-487)||(12593509-12593999)
chr2 (6-487)||(22921204-22921691)
chr2 (6-466)||(31882987-31883453)
chr2 (6-487)||(11628245-11628732)
chr2 (6-485)||(12709682-12710169)
chr2 (6-460)||(40240245-40240708)
chr2 (181-487)||(16168173-16168486)
chr2 (181-487)||(27810398-27810711)
chr2 (181-487)||(9343221-9343534)
chr2 (181-487)||(39045116-39045430)
chr2 (181-487)||(27782918-27783231)
chr2 (167-361)||(3790473-3790667)
chr2 (6-115)||(9343103-9343212)
chr2 (6-115)||(16168495-16168604)
chr2 (6-115)||(27783240-27783349)
chr2 (6-115)||(27810720-27810829)
chr2 (6-115)||(39044997-39045106)
chr2 (14-86)||(19449485-19449557)
chr2 (6-86)||(27397432-27397510)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (58-478)||(22895118-22895546)
chr5 (58-485)||(23726921-23727356)
chr5 (58-480)||(25206998-25207428)
chr5 (58-480)||(25271154-25271584)
chr5 (6-486)||(23898578-23899066)
chr5 (12-485)||(33784166-33784648)
chr5 (66-480)||(11556043-11556465)
chr5 (24-480)||(23632659-23633123)
chr5 (58-452)||(13179839-13180241)
chr5 (4-487)||(6880995-6881485)
chr5 (12-485)||(24976528-24977008)
chr5 (58-485)||(33299220-33299655)
chr5 (6-487)||(28952767-28953254)
chr5 (19-487)||(15751843-15752317)
chr5 (66-480)||(22992171-22992593)
chr5 (12-485)||(24608929-24609410)
chr5 (6-487)||(32589246-32589734)
chr5 (6-480)||(18121403-18121886)
chr5 (6-485)||(2517749-2518234)
chr5 (19-487)||(33523086-33523560)
chr5 (6-485)||(9543697-9544185)
chr5 (58-487)||(43084956-43085385)
chr5 (19-487)||(31819406-31819880)
chr5 (6-487)||(18493739-18494227)
chr5 (14-487)||(30036128-30036607)
chr5 (58-485)||(30941314-30941749)
chr5 (6-487)||(33881808-33882298)
chr5 (58-485)||(15651784-15652218)
chr5 (6-487)||(34623201-34623688)
chr5 (19-487)||(30158722-30159196)
chr5 (6-487)||(37761676-37762163)
chr5 (6-466)||(8658465-8658931)
chr5 (6-487)||(3796235-3796724)
chr5 (6-487)||(30175170-30175657)
chr5 (6-460)||(37745319-37745781)
chr5 (58-487)||(13435692-13436128)
chr5 (6-487)||(37351633-37352123)
chr5 (58-487)||(18368553-18368989)
chr5 (6-485)||(31438141-31438626)
chr5 (6-485)||(24730653-24731140)
chr5 (6-487)||(28655947-28656438)
chr5 (6-485)||(37664476-37664961)
chr5 (6-487)||(26487075-26487563)
chr5 (6-487)||(9324165-9324653)
chr5 (6-487)||(13317798-13318285)
chr5 (6-487)||(12138864-12139351)
chr5 (6-466)||(41681408-41681874)
chr5 (181-487)||(40466695-40467008)
chr5 (180-487)||(5644502-5644816)
chr5 (185-487)||(11330336-11330645)
chr5 (167-361)||(13178630-13178824)
chr5 (6-115)||(40466577-40466686)
chr5 (6-122)||(5644815-5644930)
chr5 (6-128)||(11330640-11330763)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (14-486)||(24585449-24585929)
chr4 (13-486)||(15234526-15235005)
chr4 (6-487)||(54840097-54840583)
chr4 (58-466)||(14671717-14672133)
chr4 (6-466)||(5701256-5701723)
chr4 (19-487)||(31119595-31120069)
chr4 (6-485)||(36323409-36323894)
chr4 (6-485)||(36337618-36338103)
chr4 (126-466)||(15275816-15276164)
chr4 (6-487)||(40098704-40099192)
chr4 (6-485)||(14752586-14753073)
chr4 (19-487)||(21976410-21976884)
chr4 (6-466)||(39857342-39857809)
chr4 (6-487)||(14105250-14105737)
chr4 (58-460)||(18793766-18794175)
chr4 (126-466)||(15379428-15379776)
chr4 (6-485)||(17019737-17020213)
chr4 (6-485)||(24119349-24119837)
chr4 (6-485)||(6576544-6577036)
chr4 (6-487)||(33666872-33667360)
chr4 (6-487)||(30760470-30760958)
chr4 (62-481)||(5012593-5013021)
chr4 (58-486)||(34182084-34182515)
chr4 (124-487)||(27156516-27156885)
chr4 (58-361)||(24814424-24814726)
chr4 (245-486)||(1906975-1907224)
chr4 (181-487)||(20331681-20331994)
chr4 (6-197)||(1907228-1907418)
chr4 (167-361)||(24813628-24813822)
chr4 (6-115)||(20331563-20331672)
[»] chr3 (72 HSPs)
chr3 (6-480)||(16617602-16618084)
chr3 (6-466)||(22041087-22041555)
chr3 (6-485)||(5658773-5659260)
chr3 (6-486)||(19701055-19701543)
chr3 (58-485)||(29141940-29142375)
chr3 (58-485)||(4789817-4790252)
chr3 (58-485)||(35887399-35887834)
chr3 (14-480)||(18337268-18337739)
chr3 (6-485)||(11103496-11103982)
chr3 (6-485)||(18057907-18058394)
chr3 (12-486)||(16422845-16423326)
chr3 (58-486)||(15885903-15886339)
chr3 (58-485)||(22380766-22381201)
chr3 (58-480)||(8282646-8283076)
chr3 (6-487)||(28109074-28109564)
chr3 (66-485)||(4728265-4728692)
chr3 (66-485)||(6208534-6208961)
chr3 (58-486)||(4690313-4690749)
chr3 (6-458)||(15734250-15734710)
chr3 (19-487)||(24334835-24335309)
chr3 (6-487)||(17978063-17978551)
chr3 (6-485)||(31029375-31029864)
chr3 (58-487)||(5020370-5020807)
chr3 (126-486)||(15367903-15368272)
chr3 (58-487)||(32297290-32297727)
chr3 (12-487)||(5602430-5602913)
chr3 (6-487)||(18231851-18232338)
chr3 (59-485)||(4339864-4340297)
chr3 (6-487)||(20569968-20570456)
chr3 (6-485)||(18285489-18285977)
chr3 (6-487)||(18249377-18249864)
chr3 (58-485)||(18300844-18301278)
chr3 (6-466)||(48472590-48473059)
chr3 (58-487)||(28345830-28346266)
chr3 (12-487)||(22863981-22864464)
chr3 (12-487)||(22879040-22879523)
chr3 (6-466)||(20072693-20073162)
chr3 (6-460)||(21681406-21681868)
chr3 (58-485)||(32445791-32446225)
chr3 (6-485)||(4630420-4630908)
chr3 (58-510)||(16403956-16404415)
chr3 (6-487)||(17969989-17970481)
chr3 (6-487)||(51788681-51789169)
chr3 (6-460)||(31957569-31958029)
chr3 (6-487)||(10649730-10650215)
chr3 (58-487)||(8218284-8218720)
chr3 (6-485)||(4423557-4424044)
chr3 (6-361)||(16599406-16599760)
chr3 (6-361)||(7080022-7080376)
chr3 (58-485)||(5473628-5474052)
chr3 (6-487)||(6535856-6536343)
chr3 (58-487)||(28027930-28028359)
chr3 (13-300)||(35221712-35221995)
chr3 (119-487)||(10402811-10403186)
chr3 (181-487)||(5717714-5718027)
chr3 (181-487)||(5728624-5728937)
chr3 (181-487)||(5763431-5763744)
chr3 (180-487)||(5589642-5589956)
chr3 (181-487)||(29658254-29658567)
chr3 (181-487)||(47030114-47030428)
chr3 (6-115)||(5718036-5718145)
chr3 (6-115)||(5728946-5729055)
chr3 (6-115)||(5763313-5763422)
chr3 (371-485)||(7079867-7079981)
chr3 (58-115)||(29658188-29658245)
chr3 (28-115)||(47030437-47030524)
chr3 (6-122)||(5589528-5589643)
chr3 (13-86)||(15368305-15368379)
chr3 (6-50)||(8218747-8218791)
chr3 (6-50)||(9526987-9527031)
chr3 (6-50)||(10403195-10403239)
chr3 (6-50)||(28028377-28028421)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (6-480)||(20333487-20333969)
chr1 (58-480)||(16201153-16201583)
chr1 (59-486)||(20467484-20467919)
chr1 (6-485)||(14691990-14692474)
chr1 (6-485)||(14694672-14695156)
chr1 (6-485)||(14697356-14697840)
chr1 (6-475)||(14700037-14700511)
chr1 (6-487)||(51644921-51645409)
chr1 (12-486)||(21890827-21891308)
chr1 (12-485)||(41786411-41786891)
chr1 (6-485)||(10969344-10969830)
chr1 (12-466)||(28156425-28156888)
chr1 (62-487)||(28591780-28592212)
chr1 (6-487)||(10951791-10952279)
chr1 (6-487)||(3647846-3648341)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (58-480)||(22139595-22140025)
chr8 (58-480)||(21341271-21341702)
chr8 (58-485)||(15774250-15774685)
chr8 (6-480)||(14569836-14570318)
chr8 (58-466)||(18797404-18797820)
chr8 (12-486)||(16260613-16261096)
chr8 (6-485)||(2130318-2130804)
chr8 (58-485)||(33249039-33249474)
chr8 (58-486)||(19694791-19695227)
chr8 (58-485)||(27602014-27602449)
chr8 (58-486)||(19654427-19654863)
chr8 (58-458)||(19910268-19910676)
chr8 (6-487)||(29836023-29836512)
chr8 (6-466)||(18716177-18716646)
chr8 (126-466)||(22074081-22074429)
chr8 (6-490)||(12085760-12086253)
chr8 (58-449)||(31361267-31361666)
chr8 (6-487)||(31482908-31483393)
chr8 (6-487)||(44567680-44568169)
chr8 (58-487)||(33265420-33265856)
chr8 (6-487)||(19681156-19681644)
chr8 (6-487)||(9361304-9361793)
chr8 (58-279)||(22388969-22389190)
chr8 (181-487)||(28355161-28355474)
chr8 (181-487)||(19201592-19201906)
chr8 (167-361)||(15775288-15775482)
chr8 (6-115)||(28355043-28355152)
chr8 (6-115)||(19201474-19201583)
[»] scaffold0322 (3 HSPs)
scaffold0322 (58-466)||(12769-13185)
scaffold0322 (181-487)||(2354-2667)
scaffold0322 (6-115)||(2676-2785)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (6-485)||(3683-4173)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (58-485)||(24096-24531)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (59-485)||(33971-34405)
scaffold0143 (6-487)||(10615-11105)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (58-480)||(8783-9214)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (126-486)||(27992-28358)
scaffold0109 (6-86)||(28391-28469)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (6-485)||(12715-13203)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (6-466)||(8013-8479)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (140-466)||(25774-26108)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (186-489)||(467-778)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (58-487)||(2299-2736)
scaffold0159 (58-273)||(23719-23935)
scaffold0159 (410-487)||(18505-18582)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (6-490)||(14636-15129)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (58-487)||(16273-16709)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (19-284)||(1148-1412)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (61-485)||(39734-40181)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (6-284)||(13044-13324)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (12-144)||(6850-6982)
scaffold0089 (419-485)||(6741-6807)
[»] scaffold0748 (5 HSPs)
scaffold0748 (1-39)||(1314-1352)
scaffold0748 (1-39)||(1422-1460)
scaffold0748 (1-39)||(1530-1568)
scaffold0748 (1-39)||(1638-1676)
scaffold0748 (1-39)||(1746-1784)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 56)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Original strand, 27283400 - 27283883
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283400 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 27283498  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27283499 tagaaattgaccaatattattgactcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 27283598  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27283599 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 27283698  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 405  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283699 agttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 27283798  T
Q  406 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 490  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283799 ccggaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttactggggatagaattctggaagacccgactggggataacgccgttatg 27283883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27210061 - 27209574
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27210061 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttgaaagg 27209962  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27209961 tagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 27209862  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27209861 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 27209762  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27209761 agtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgg 27209662  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27209661 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27209574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 27239167 - 27239654
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27239167 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttgaaagg 27239266  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27239267 tagaaattgaccaatattattggctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 27239366  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27239367 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 27239466  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27239467 agtttcgcagagatagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgg 27239566  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27239567 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27239654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26927862 - 26927427
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26927862 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 26927763  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26927762 tgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 26927663  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927662 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 26927563  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  26927562 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgaggatagatagctaatcaactcgctgggg 26927463  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  26927462 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 26927427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 16756977 - 16756496
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16756977 gccacttgaccaagcagaaacagattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaacgtagaaa 16756878  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacag-agaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16756877 ttgaccgatattattggctcacaaggttt-gacaggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaatatgcatggatg 16756779  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16756778 atataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttt 16756679  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16756678 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagac 16756579  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  16756578 gtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 16756496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 486
Target Start/End: Original strand, 22927890 - 22928380
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnng--acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22927890 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttacaaaatataggttgaaattgacttgatgtcgatttgatttgaaa 22927989  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  22927990 ggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 22928089  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||    
T  22928090 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttggcgatttgtagac 22928189  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  22928190 acaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacatcgtt 22928289  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  22928290 gggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactagggataatgccgt 22928380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 458
Target Start/End: Original strand, 15405568 - 15406028
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405568 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 15405667  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15405668 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcat 15405767  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  15405768 gaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacac 15405867  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15405868 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 15405967  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 458  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15405968 gagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15406028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 458
Target Start/End: Original strand, 15417355 - 15417815
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15417355 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 15417454  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||    
T  15417455 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcat 15417554  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  15417555 gaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacac 15417654  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15417655 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 15417754  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 458  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15417755 gagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15417815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 24298800 - 24299285
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24298800 gaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcggtttgatttgaaagg 24298896  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagc-attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24298897 tagaaattaaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagttattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgca 24298996  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  24298997 tgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagaca 24299096  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24299097 cagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 24299196  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24299197 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24299285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24870818 - 24870402
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  24870818 gacaaagtatagattgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 24870719  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24870718 tgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24870619  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24870618 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 24870519  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  24870518 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 24870419  T
Q  450 atagaatcttggaagac 466  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24870418 atagaatctcggaagac 24870402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 13291982 - 13292470
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13291982 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 13292081  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  13292082 tagaaattgaccaacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcat 13292181  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  13292182 gaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacac 13292281  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13292282 aatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 13292381  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag-ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    | |||||| ||| |||| |||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  13292382 gggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 13292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27026303 - 27025822
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026303 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 27026205  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  27026204 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactaatgttgacattggaaatgcaacatgcat 27026105  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||     
T  27026104 gaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacaa 27026005  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27026004 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 27025905  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  27025904 gagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataa 27025822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 27032177 - 27031701
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27032177 gccacttgaccgaacagaaacaaattcagaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 27032078  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  27032077 ttgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatga 27031978  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| || |    
T  27031977 tataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattcc 27031878  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27031877 gcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacg 27031778  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||    
T  27031777 tatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggataggatctcggaagactctactgggaataa 27031701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29508583 - 29508096
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29508583 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 29508484  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  29508483 gtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 29508384  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  29508383 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 29508284  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29508283 cgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 29508185  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  29508184 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccg 29508096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 33369520 - 33369954
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33369520 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 33369619  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33369620 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 33369719  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33369720 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 33369818  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  33369819 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 33369918  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33369919 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 33369954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 29556719 - 29556231
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29556719 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaa 29556620  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||     
T  29556619 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgc 29556520  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  29556519 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 29556420  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||| |||| |||| ||||||||    
T  29556419 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttgaagatgacgccgtt 29556321  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  29556320 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 29556231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20131623 - 20131253
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20131623 acaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgaca 20131524  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20131523 taagcattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 20131424  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20131423 gcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgt 20131331  T
Q  358 gctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 427  Q
    |||| ||||        | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20131330 gctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 20131253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 59 - 427
Target Start/End: Original strand, 22201247 - 22201617
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22201247 acaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgaca 22201346  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22201347 taagcattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 22201446  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22201447 gcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgt 22201539  T
Q  358 gctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcag 427  Q
    |||| ||||        | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22201540 gctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcag 22201617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 30551032 - 30551506
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||      
T  30551032 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactg 30551130  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30551131 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 30551230  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  30551231 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 30551330  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  30551331 -agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgga 30551429  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30551430 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 30551506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27201358 - 27200897
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27201358 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaagg 27201259  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27201258 tagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 27201159  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  27201158 ggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 27201059  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27201058 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 27200960  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27200959 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27200897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Original strand, 27247875 - 27248336
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27247875 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaagg 27247974  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27247975 tagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 27248074  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  27248075 ggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 27248174  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||        | || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27248175 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgagctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 27248273  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27248274 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 27248336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 167 - 490
Target Start/End: Original strand, 27622905 - 27623228
Alignment:
Q  167 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| || ||    
T  27622905 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtat 27623004  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 365  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623005 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 27623103  T
Q  366 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 465  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623104 atagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaaga 27623203  T
Q  466 cccgactggggataacgccgttatg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27623204 cccgactggggataacgccgttatg 27623228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 13517230 - 13517720
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517230 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 13517329  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13517330 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcaatatgt 13517429  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  13517430 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 13517529  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13517530 acgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 13517628  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  13517629 gggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 13517720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 29580188 - 29579707
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29580188 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatacagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaa 29580090  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  29580089 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatga 29579990  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||    
T  29579989 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttc 29579890  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
     | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  29579889 acgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacg 29579791  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    || |||||||||||| |||||| | ||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  29579790 tatcggaaccatggccgagggccggtaggtgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggagaatgccgtt 29579707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 492
Target Start/End: Original strand, 26109437 - 26109933
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26109437 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 26109536  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  ||||||||| ||||||||||||     
T  26109537 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgc 26109636  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  26109637 acggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 26109736  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccg-t 394  Q
    ||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| || |    
T  26109737 acgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 26109835  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgat 492  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| |||||| ||||    
T  26109836 tgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgttgtgat 26109933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 26792966 - 26792491
Alignment:
Q  14 cactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 113  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26792966 cacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttt---gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaatt 26792870  T
Q  114 gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 213  Q
    |||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26792869 gactgatattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatattcatggatgata 26792770  T
Q  214 taacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 313  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| |    
T  26792769 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcac 26792670  T
Q  314 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 405  Q
     | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26792669 gggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgta 26792571  T
Q  406 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
      |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  26792570 ttggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 26792491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27492286 - 27491811
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27492286 gaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccg 27492188  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27492187 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 27492088  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  27492087 gtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 27491988  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||     
T  27491987 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggg 27491889  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||  || ||||| |||||||||    
T  27491888 accatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgtt 27491811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 4538795 - 4539285
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||          ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4538795 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaa 4538894  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  4538895 ggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 4538994  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  4538995 atggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 4539094  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4539095 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 4539193  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| ||||||    
T  4539194 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgtt 4539285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 510
Target Start/End: Original strand, 27355173 - 27355632
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27355173 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27355272  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27355273 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27355372  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27355373 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 27355471  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  27355472 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 27355571  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctggg 510  Q
    |||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||||    
T  27355572 atagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctggg 27355632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28167657 - 28167188
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28167657 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 28167558  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  28167557 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 28167458  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  28167457 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 28167358  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28167357 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 28167259  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28167258 gggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagac 28167188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4532403 - 4531967
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4532403 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4532304  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  4532303 tgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 4532204  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  4532203 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcga 4532105  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  4532104 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctgggg 4532005  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||||    
T  4532004 atagaatcttgagagactttactggggataatgccgtt 4531967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 62 - 487
Target Start/End: Original strand, 16937100 - 16937532
Alignment:
Q  62 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  16937100 aaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 16937199  T
Q  162 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 261  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16937200 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 16937299  T
Q  262 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937300 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16937398  T
Q  362 catcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatag 453  Q
     || | |        || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||    |||||||||||||||    
T  16937399 tattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctggggatag 16937498  T
Q  454 aatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    | |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  16937499 agtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 16937532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 27014880 - 27014399
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||    
T  27014880 gccacttgaccaaacagaaacatattcacgggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaaggcagaa 27014781  T
Q  111 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  27014780 attgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcagtatgcacggatg 27014681  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  27014680 atataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 27014581  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    | | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27014580 cacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagac 27014482  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  27014481 gtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 27014399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 28214631 - 28214138
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||          ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28214631 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaa 28214532  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  28214531 ggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 28214432  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  28214431 atggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 28214332  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  28214331 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 28214233  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  28214232 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 28214138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 26665674 - 26666163
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26665674 gaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 26665773  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
     |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| |    
T  26665774 ttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgca 26665873  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||    
T  26665874 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggca 26665973  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26665974 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 26666072  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26666073 ggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26666163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 26771645 - 26772134
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26771645 gaactagccacctgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 26771744  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
     |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| |    
T  26771745 ttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgca 26771844  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||    
T  26771845 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggca 26771944  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26771945 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 26772043  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||  ||| |||  |||||||||  |  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26772044 ggagacgtttcgggacctaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26772134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27064600 - 27064174
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27064600 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27064501  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||           
T  27064500 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgca------- 27064408  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27064407 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 27064312  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |  ||  | ||||||||| |    
T  27064311 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctggag 27064212  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27064211 atagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 27064174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16681321 - 16680832
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16681321 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaag 16681222  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || || || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  16681221 gcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 16681122  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  16681121 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 16681022  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  16681021 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttg 16680923  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  16680922 ggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 16680832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 14138501 - 14138925
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  14138501 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 14138600  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||           
T  14138601 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca------- 14138693  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14138694 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 14138789  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  14138790 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctgggg 14138889  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14138890 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 14138925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4780020 - 4779584
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  4780020 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 4779921  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4779920 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4779821  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  4779820 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgt 4779722  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |    
T  4779721 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggag 4779622  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  4779621 atagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 4779584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 460
Target Start/End: Original strand, 8898765 - 8899176
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttga 155  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8898765 gacaaaatataggttgagattgacttgacatcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctga 8898864  T
Q  156 cataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatt 255  Q
    ||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  8898865 catgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatt 8898964  T
Q  256 atgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 355  Q
    |||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8898965 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 8899063  T
Q  356 gtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgg 447  Q
    ||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||    
T  8899064 gtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgg 8899163  T
Q  448 ggatagaatcttg 460  Q
    ||||||| |||||    
T  8899164 ggatagagtcttg 8899176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 58 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4764861 - 4764462
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4764861 gacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4764762  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||           
T  4764761 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca------- 4764669  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4764668 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 4764573  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  4764572 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 4764473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20175666 - 20175368
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgac 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  20175666 acaaaatacagattgaaattgacttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtc 20175567  T
Q  157 ataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    |||  |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  20175566 atagacattgaattgagatagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgatta 20175467  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20175466 tgcatgtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcg 20175374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 59 - 362
Target Start/End: Original strand, 22160325 - 22160623
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgac 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  22160325 acaaaatacagattgaaattgacttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtc 22160424  T
Q  157 ataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    |||  |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22160425 atagacattgaattgagatagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgatta 22160524  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22160525 tgcatgtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcg 22160617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34458012
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || | |        ||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagagtcttggaagacctgact 34457997  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  34457998 ggggaaaatgccgtt 34458012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 34457581 - 34457690
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457581 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 34457680  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  34457681 tagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 27622504 - 27622643
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgact-ggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatt 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||        ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  27622504 ggatcgaacttgccacttgaccagaaagaaagaaattgacgaggggattggtttgttttgacaaaatatatattgaaagtgacttgacgtcgatttaatt 27622603  T
Q  99 tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 138  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27622604 tgaaaagtagaaattgaccaatattattggctcacaagat 27622643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 27622169 - 27622207
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622169 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 27622207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 27622388 - 27622426
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622388 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 27622426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 110
Target Start/End: Original strand, 4755772 - 4755824
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4755772 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 27622060 - 27622098
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27622060 ggatcgaacctgccactcgaccaaatagaaacaaattga 27622098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 27622285 - 27622319
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaa 35  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27622285 ggatcgaacttgccacttgaccaaacagaaacaaa 27622319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 27622337 - 27622371
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaa 35  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27622337 ggatcgaacttgccactcgaccagacagaaacaaa 27622371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 14138443 - 14138487
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14138443 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 14138487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 27064680 - 27064636
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27064680 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 27064636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Original strand, 33369462 - 33369506
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  33369462 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 33369506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Original strand, 26508662 - 26509154
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508662 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 26508761  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  26508762 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattgggaatgcaatatgtat 26508861  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26508862 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 26508961  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26508962 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgg 26509061  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 490  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509062 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaatcaacttgctgggggtagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 26509154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16048495 - 16048027
Alignment:
Q  4 tcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16048495 tcgaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattaggtttt--gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaa 16048398  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||||||     
T  16048397 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctaacataagtattgaattgagactgatgttggcattggaaatgcaatatgc 16048298  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||    
T  16048297 atggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatacatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcagtttgtagac 16048198  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||| | ||||    
T  16048197 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataaagtcgtt 16048098  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16048097 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 16048027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2161725 - 2161247
Alignment:
Q  14 cactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 113  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161725 cacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattggtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 2161626  T
Q  114 gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2161625 gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgata 2161526  T
Q  214 taacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 313  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  2161525 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcagctggtagacacagtttcgc 2161426  T
Q  314 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||     
T  2161425 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtg 2161326  T
Q  406 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  2161325 tcggaaccatggctgagggcag-tagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 2161247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5155193 - 5154758
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5155193 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5155094  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5155093 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 5154994  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154993 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 5154894  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  5154893 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 5154794  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5154793 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5154758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 6 - 486
Target Start/End: Original strand, 16442959 - 16443446
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16442959 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcaatggggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 16443057  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| | |   ||| ||||||||||||||||||||    
T  16443058 tagaaattaaccaacgttgttggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactaatgctgatattggaaatgcaatatgtat 16443157  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16443158 ggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 16443257  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16443258 agtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgg 16443357  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  16443358 gagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgt 16443446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 11417808 - 11418243
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  11417808 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 11417907  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11417908 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 11418007  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11418008 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 11418107  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  11418108 gctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 11418207  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  11418208 atagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 11418243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5165494 - 5165059
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |    
T  5165494 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgata 5165395  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5165394 tgagtattaaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 5165295  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165294 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 5165195  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  5165194 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 5165095  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||| |||||| |||| | ||| ||||||| ||||    
T  5165094 atagagtcttgggagactctactagggataatgccg 5165059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 58 - 486
Target Start/End: Original strand, 16511454 - 16511890
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16511454 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16511553  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16511554 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16511653  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  16511654 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgt 16511753  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  16511754 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctgggg 16511853  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  16511854 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 16511890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 26678059 - 26678546
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678059 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 26678157  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26678158 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 26678257  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  26678258 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcat 26678357  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26678358 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 26678456  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26678457 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 26678546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 26662867 - 26663354
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26662867 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 26662965  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26662966 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 26663065  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||     
T  26663066 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcat 26663165  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26663166 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 26663264  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26663265 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 26663354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 10909955 - 10910390
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  10909955 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 10910054  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  10910055 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 10910154  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10910155 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 10910254  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  10910255 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgagg 10910354  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  10910355 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 10910390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2780406 - 2779919
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2780406 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 2780307  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  2780306 gcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 2780207  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  2780206 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 2780107  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2780106 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttgaagatgacgccgttg 2780008  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2780007 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2779919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 31557356 - 31557847
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31557356 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaa 31557455  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  31557456 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 31557555  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  31557556 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 31557655  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||        | || | ||||||||||||||||||  || ||||    
T  31557656 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatggcgtcgtt 31557754  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  31557755 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtaaacaacttgcttggggatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 31557847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 31083577 - 31084066
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| | ||||       ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  31083577 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggaggttggtttggttgacaaaatatagattgagattgatttgacatcgatttgaattgaaagg 31083676  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31083677 tagaaattgactgataacattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtgttgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgcat 31083776  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||    
T  31083777 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcac 31083876  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31083877 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 31083975  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  31083976 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 31084066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26596837 - 26596349
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26596837 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 26596739  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  26596738 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcat 26596639  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  26596638 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 26596539  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26596538 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 26596440  T
Q  398 gagacgtaccggaacc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26596439 gagacgtgtcggaaccaatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 26596349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26442425 - 26441938
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26442425 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaagg 26442327  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| || || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  26442326 tagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgatatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcat 26442227  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  26442226 ggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 26442127  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  26442126 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgg 26442028  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  26442027 gagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 26441938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 31131064 - 31130616
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |     
T  31131064 gaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtaaaatttgatcg 31130966  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31130965 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataaca 31130866  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | ||    
T  31130865 gttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga 31130766  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||    
T  31130765 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattgga 31130667  T
Q  411 acc-atggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  31130666 accaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttg 31130616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 140 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 10848633 - 10848299
Alignment:
Q  140 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagca 239  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  10848633 ttgacagagaatttgacaaaagtattggattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggca 10848534  T
Q  240 cgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 339  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10848533 cgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 10848434  T
Q  340 gggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 431  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||        | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |    
T  10848433 gggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttg 10848334  T
Q  432 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10848333 ctacgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 10848299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26519988 - 26519501
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26519988 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaagg 26519890  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || ||| || |||  |||||||||||| ||| ||||| ||    
T  26519889 tagaaactgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactgatgttgacattggaactgcgatatgcat 26519790  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  26519789 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 26519690  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26519689 gacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 26519591  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  26519590 gagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 26519501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22149049 - 22148563
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22149049 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaagg 22148951  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgta 204  Q
     |||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  || |||||||||||||| ||||| |    
T  22148950 cagaaatcgaccgatattatcggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtttgacattggaaatgcgatatgca 22148851  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  22148850 tggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 22148751  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22148750 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 22148652  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22148651 ggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22148563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11448070 - 11447582
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11448070 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 11447972  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  || ||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  11447971 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgtcatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 11447872  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  11447871 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 11447772  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  11447771 cgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 11447673  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  11447672 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 11447582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 45394394 - 45393913
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||        |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  45394394 gccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaa 45394295  T
Q  111 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  45394294 attgaccgatattattggctcacaaggttttgacaga--acctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatg 45394197  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  45394196 atataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 45394097  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    | | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| |        || | | |||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  45394096 cacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttgggaatcctctttggagatgacgtcgttgagagac 45393998  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  45393997 gtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 45393913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45738467 - 45737995
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg-----nnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45738467 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 45738368  T
Q  101 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaata 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  45738367 aaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaata 45738268  T
Q  201 tgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 300  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  45738267 tgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgta 45738168  T
Q  301 gacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgcc 392  Q
    | |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |    
T  45738167 ggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtc 45738069  T
Q  393 gttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    ||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45738068 gttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctggggatagaatcttgggagac 45737995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 4206505 - 4206069
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4206505 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4206406  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  4206405 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 4206306  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4206305 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgt 4206207  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  4206206 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 4206107  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  4206106 atagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 4206069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 24585489 - 24585978
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585489 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 24585588  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24585589 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcat 24585688  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||    
T  24585689 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcac 24585788  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
       ||  | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24585789 gactttacgggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 24585887  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  24585888 ggagacgtgtcggaaccatagctgaaggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 24585978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 452
Target Start/End: Original strand, 5140289 - 5140744
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5140289 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgatttgaaagg 5140388  T
Q  106 tagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||     
T  5140389 tagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgc 5140488  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  5140489 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 5140588  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| | ||    
T  5140589 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcatt 5140687  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggata 452  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||    
T  5140688 gggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggata 5140744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 26312818 - 26313306
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26312818 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 26312916  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |     
T  26312917 tagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcac 26313016  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| ||     
T  26313017 ggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaa 26313116  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26313117 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 26313215  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  26313216 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 26313306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744962
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16744947  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  16744948 ggggaaaatgccgtt 16744962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138687
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccact 4138672  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| |||||||||    
T  4138673 ggggaaaacgccgtt 4138687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 181 - 466
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206585
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgaggatagaatcttgggagac 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 167 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 3452252 - 3451926
Alignment:
Q  167 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  3452252 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3452153  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 365  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  3452152 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 3452054  T
Q  366 ata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatc 457  Q
    | |        |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  3452053 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatc 3451954  T
Q  458 ttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    | ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  3451953 tcggaagactctactgggaataatgccg 3451926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 186 - 487
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268527
Alignment:
Q  186 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 284  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  285 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 376  Q
    |||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26268417  T
Q  377 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 476  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||    
T  26268418 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactgggg 26268516  T
Q  477 ataacgccgtt 487  Q
    | |||||||||    
T  26268517 aaaacgccgtt 26268527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 16744531 - 16744640
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744531 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 16744630  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  16744631 tagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152790
Alignment:
Q  320 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  412 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22152790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 320 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208705
Alignment:
Q  320 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaa 411  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  412 ccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    || ||||||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||| |||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtaggcatgcaactggctggggataggatctcggaagactctactgggaataatgccg 22208705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 4138256 - 4138365
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4138256 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaagg 4138355  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  4138356 tagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 39206175 - 39206284
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206175 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 39206274  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  39206275 tagaaattga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 6 - 486
Target Start/End: Original strand, 21696249 - 21696735
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696249 gaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcgctggggattagctttt--gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 21696346  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  21696347 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgagtattgatttgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtat 21696446  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21696447 ggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 21696546  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696547 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcaatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgccgttgg 21696646  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  21696647 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 21696735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 34267981 - 34268463
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34267981 gaactagccacttgaccaaacagaaacaaattcacagggtattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 34268080  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  34268081 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 34268180  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34268181 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 34268280  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34268281 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgg 34268380  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  34268381 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataa 34268463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 23117906 - 23117471
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  23117906 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcccaaggttttgacagagaacctgaca 23117807  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  23117806 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 23117707  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||| ||| |||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117706 gcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 23117607  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23117606 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 23117507  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  23117506 atagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 23117471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 37932557 - 37932072
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37932557 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttt---gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 37932461  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||    
T  37932460 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcat 37932361  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  37932360 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 37932261  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37932260 gacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 37932162  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37932161 gagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 37932072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 126 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 27397399 - 27397031
Alignment:
Q  126 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 225  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27397399 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttat 27397300  T
Q  226 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27397299 taaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaa 27397200  T
Q  326 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatgg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27397199 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgg 27397100  T
Q  418 ctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  27397099 ctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgccgt 27397031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 37678958 - 37679445
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37678958 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 37679056  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37679057 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 37679156  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  37679157 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 37679256  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  37679257 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgg 37679355  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37679356 gagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 37694223 - 37694710
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37694223 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 37694321  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37694322 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 37694421  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  37694422 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 37694521  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  37694522 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgg 37694620  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37694621 gagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37694710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 28889414 - 28888929
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28889414 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattg--ttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 28889317  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  28889316 tagaaactgaccaaaattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgttaacattggaaatgcaatatgtat 28889217  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  28889216 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcgatttgtagacac 28889117  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28889116 agtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 28889017  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  28889016 gagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 28888929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 466
Target Start/End: Original strand, 27427583 - 27428000
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  27427583 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 27427682  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  27427683 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattat 27427782  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27427783 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 27427882  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaat-caacttgctggg 448  Q
    |||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  27427883 gctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaacttgctggg 27427982  T
Q  449 gatagaatcttggaagac 466  Q
    || ||||||| |||||||    
T  27427983 gacagaatctcggaagac 27428000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 34298332 - 34297856
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34298332 gaactagccactagaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 34298233  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||    
T  34298232 cagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgtcgacattggaaatgcaaaatgaat 34298133  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  34298132 ggatgatataacagtttcactaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 34298033  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34298032 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 34297934  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 475  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  34297933 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggg 34297856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3789621 - 3789138
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789621 gccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 3789522  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3789521 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatga 3789422  T
Q  212 tataacagttttatta-aatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    |||||||| || ||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  3789421 tataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 3789322  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    | | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3789321 cacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagac 3789223  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3789222 gtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 3789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 19409544 - 19410031
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19409544 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgatttgaattgaaagg 19409642  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  19409643 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 19409742  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  19409743 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcac 19409842  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  19409843 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgg 19409941  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19409942 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccactggggaaaacgccgtt 19410031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Original strand, 13929722 - 13930158
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13929722 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13929821  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13929822 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13929921  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13929922 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 13930020  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  13930021 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggag 13930120  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  13930121 atagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgtt 13930158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 20845025 - 20844590
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   | ||    
T  20845025 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgtca 20844926  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  20844925 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatgattat 20844826  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20844825 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatggctcgt 20844726  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  20844725 gctatattacacattcctggaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 20844626  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  20844625 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 20844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 16822411 - 16822885
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  16822411 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactg 16822509  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16822510 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 16822609  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  16822610 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 16822709  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  16822710 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgga 16822808  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16822809 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 16822885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16899069 - 16898595
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  16899069 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactg 16898971  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16898970 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 16898871  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  16898870 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 16898771  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  16898770 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgga 16898672  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16898671 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 16898595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 253711 - 254199
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  253711 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 253810  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  253811 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 253910  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  253911 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 254010  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  254011 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 254109  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  254110 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 254199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 31867924 - 31868354
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31867924 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31868023  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31868024 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat-----atgcatggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31868118  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868119 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 31868218  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||| ||   |||||| |||||    
T  31868219 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatgaaacttgatgggg 31868318  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31868319 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31868354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32056921 - 32056447
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  32056921 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactg 32056823  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32056822 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 32056723  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  32056722 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 32056623  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||    
T  32056622 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcgga 32056524  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32056523 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 32056447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 21670233 - 21670720
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21670233 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 21670331  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  21670332 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 21670431  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  21670432 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 21670531  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21670532 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 21670630  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  21670631 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaacgccgtt 21670720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37384838 - 37384371
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37384838 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgatttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 37384739  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || |  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  37384738 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcggattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 37384639  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  37384638 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 37384539  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| ||||||| ||| ||||||    
T  37384538 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgg 37384440  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37384439 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 37384371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 39897251 - 39896764
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39897251 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 39897153  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  39897152 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 39897053  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||| | |    
T  39897052 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcgc 39896953  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39896952 gacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 39896854  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  39896853 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 39896764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12662646 - 12662165
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662646 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatta-ttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 12662548  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| |  ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12662547 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgaatattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatga 12662448  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||||||| |    
T  12662447 tataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaaacacagttcc 12662348  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12662347 acagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacg 12662248  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| || ||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  12662247 tatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgcttgaggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 12662165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 140 - 466
Target Start/End: Original strand, 19449604 - 19449939
Alignment:
Q  140 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagca 239  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19449604 ttgatagagaatttgacataggtatcaaattgagactgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggca 19449703  T
Q  240 cgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 339  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19449704 cgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 19449803  T
Q  340 gggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 431  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  19449804 gggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtag 19449903  T
Q  432 c-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19449904 catatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 19449939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 34868817 - 34868329
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34868817 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaaagtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 34868719  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34868718 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 34868619  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34868618 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagaca 34868519  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34868518 cgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 34868420  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  34868419 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 34868329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 27123684 - 27123216
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27123684 gaactagccacttgactaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 27123585  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  27123584 gcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 27123485  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  27123484 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 27123385  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27123384 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 27123286  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    ||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27123285 ggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 27123216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 37944924 - 37945412
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37944924 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactcgacgtcgatttgaattgaaagg 37945023  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || || || || || |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| |     
T  37945024 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaacgcaatatgcac 37945123  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||| |||    
T  37945124 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagtttgtaggcac 37945223  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37945224 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 37945322  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  37945323 gagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 37945412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 34162025 - 34161536
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  34162025 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaag 34161926  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |    
T  34161925 gtagaaattgaccgatattattgactcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgca 34161826  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  34161825 tggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 34161726  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34161725 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 34161627  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  34161626 ggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34161536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12593999 - 12593509
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593999 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttagtttgtttgacaaaatatagattgagtttgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 12593900  T
Q  106 tagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||     
T  12593899 tagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgc 12593800  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| |    
T  12593799 atggatgatataacagttttactaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggc 12593700  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  12593699 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgtt 12593601  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  12593600 gggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 12593509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 22921204 - 22921691
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22921204 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 22921302  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |  |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22921303 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaatgacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcat 22921402  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  22921403 ggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 22921502  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22921503 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 22921601  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  22921602 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 22921691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31883453 - 31882987
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31883453 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgaattgaaagg 31883355  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31883354 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcat 31883255  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31883254 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 31883155  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31883154 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 31883056  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31883055 gagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 31882987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 11628245 - 11628732
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||       ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11628245 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgtt-gacaaaatataaactgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaagg 11628343  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |  ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  11628344 cagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 11628443  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| |||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  11628444 ggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 11628543  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11628544 gacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 11628642  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  11628643 gagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 11628732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 12709682 - 12710169
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  12709682 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaag 12709781  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |    
T  12709782 gtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgca 12709881  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  12709882 tggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 12709981  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  12709982 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 12710080  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  12710081 ggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 12710169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 40240708 - 40240245
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240708 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttgtttgacaaaatatagattgagcttgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 40240609  T
Q  106 tagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||     
T  40240608 tagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgc 40240509  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  40240508 atggatgatataacagtttcattaaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 40240409  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  40240408 acgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgtt 40240310  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  40240309 gggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 40240245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168173
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 16168188  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  16168187 ggggaaaatgccgtt 16168173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810398
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 27810413  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  27810412 ggggaaaatgccgtt 27810398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343534
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        ||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 9343519  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  9343520 ggggaaaatgccgtt 9343534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045430
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | ||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 471  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaactttgctggagatagaatcttggaagacctgac 39045414  T
Q  472 tggggataacgccgtt 487  Q
    |||||| || ||||||    
T  39045415 tggggaaaatgccgtt 39045430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782918
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||| ||||||| | | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccact 27782933  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||| | |||||||||    
T  27782932 gggaaaaacgccgtt 27782918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3790667 - 3790473
Alignment:
Q  167 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  3790667 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3790568  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3790567 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 3790473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 9343103 - 9343212
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343103 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 9343202  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  9343203 tagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16168604 - 16168495
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168604 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 16168505  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  16168504 tagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27783349 - 27783240
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783349 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 27783250  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  27783249 tagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 27810829 - 27810720
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810829 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 27810730  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  27810729 tagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 39044997 - 39045106
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39044997 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttcgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 39045096  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  39045097 tagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 19449485 - 19449557
Alignment:
Q  14 cactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgac 86  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19449485 cacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 19449557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27397510 - 27397432
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgac 86  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | |       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397510 gaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggaatagttttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgac 27397432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 58 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 22895546 - 22895118
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22895546 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 22895447  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22895446 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 22895347  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22895346 gcatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgt 22895247  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22895246 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctgggg 22895147  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggat 478  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  22895146 atagaatctcggaagactctactggggat 22895118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 23727356 - 23726921
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  23727356 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 23727257  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  23727256 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 23727157  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727156 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 23727057  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  23727056 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 23726957  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  23726956 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 23726921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25207428 - 25206998
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25207428 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 25207329  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25207328 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 25207229  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207228 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 25207129  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    ||||||        || | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  25207128 gctacattacacattcctgggaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 25207029  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  25207028 atagaatctcggaagactctactgaggataa 25206998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 25271584 - 25271154
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25271584 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 25271485  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25271484 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 25271385  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25271384 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 25271285  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    ||||||        || | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  25271284 gctacattacacattcctgggaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 25271185  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  25271184 atagaatctcggaagactctactgaggataa 25271154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 6 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23899066 - 23898578
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23899066 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 23898968  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  23898967 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcat 23898868  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || | | ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  23898867 ggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtacgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacac 23898768  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23898767 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgg 23898668  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  23898667 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgt 23898578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33784648 - 33784166
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33784648 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaa 33784549  T
Q  111 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33784548 attgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatg 33784449  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  33784448 atataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttt 33784349  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33784348 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagac 33784249  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||| ||| |||   | ||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33784248 gtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 33784166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 66 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 11556465 - 11556043
Alignment:
Q  66 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 165  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||    
T  11556465 ataggttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatt 11556366  T
Q  166 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  11556365 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 11556266  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-- 363  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  11556265 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 11556166  T
Q  364 ------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatc 457  Q
          || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  11556165 acgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtc 11556066  T
Q  458 ttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||| |||| | |||||| ||||    
T  11556065 ttgggagactctactgggaataa 11556043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 23633123 - 23632659
Alignment:
Q  24 aacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatc 123  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23633123 aacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatatt 23633024  T
Q  124 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 223  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  23633023 gttggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttc 23632924  T
Q  224 attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagac 323  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23632923 attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagac 23632824  T
Q  324 aagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccat 415  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  23632823 aagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccat 23632724  T
Q  416 ggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  23632723 ggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 23632659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 58 - 452
Target Start/End: Original strand, 13179839 - 13180241
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13179839 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13179938  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13179939 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13180038  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13180039 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgt 13180138  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  13180139 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctgggg 13180238  T
Q  450 ata 452  Q
    |||    
T  13180239 ata 13180241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 4 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 6881485 - 6880995
Alignment:
Q  4 tcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6881485 tcgaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 6881386  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||     
T  6881385 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgc 6881286  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  6881285 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 6881186  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  6881185 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 6881087  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||    
T  6881086 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataacgccgtt 6880995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24977008 - 24976528
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24977008 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattg-tttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 24976910  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  24976909 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatga 24976810  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||      
T  24976809 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttct 24976710  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  24976709 gcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacg 24976610  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24976609 tatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24976528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33299655 - 33299220
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  33299655 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 33299556  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33299555 tgagtattgagttgagactgatgttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 33299456  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299455 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 33299356  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||  ||| |||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  33299355 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctgggg 33299256  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||| | || |||| | |||||| |||| ||||    
T  33299255 atagaatatcgggagactctactgggaataatgccg 33299220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 28952767 - 28953254
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28952767 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaga 28952865  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  28952866 tagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 28952965  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  28952966 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 28953065  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat--cata------gaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||       ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28953066 gacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacatattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 28953164  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||||||||    
T  28953165 gagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggacagaatctcggaagactttactggggaaaacgccgtt 28953254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 15751843 - 15752317
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  15751843 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccg 15751941  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15751942 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 15752041  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  15752042 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 15752141  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15752142 -agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcgga 15752240  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15752241 accatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 15752317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 66 - 480
Target Start/End: Original strand, 22992171 - 22992593
Alignment:
Q  66 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 165  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||    
T  22992171 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 22992270  T
Q  166 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  22992271 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtat 22992370  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-- 363  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  22992371 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 22992470  T
Q  364 ------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatc 457  Q
          || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22992471 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatc 22992570  T
Q  458 ttggaagacccgactggggataa 480  Q
    | || |||| | |||||| ||||    
T  22992571 tcgggagactctactgggaataa 22992593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24609410 - 24608929
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||        || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24609410 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgaaaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 24609311  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24609310 ttgacctatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagacttgtattgacattggaaatgcaatatgcatgaatga 24609211  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| |    
T  24609210 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcc 24609111  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  24609110 gcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacg 24609011  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24609010 tatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24608929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 32589246 - 32589734
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589246 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 32589345  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |  || || ||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  32589346 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatatcgaattgggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 32589445  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  32589446 ggatgatataacagtttcattaaatgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcac 32589545  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  32589546 gacttcgc-gggaaagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgg 32589644  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  32589645 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttgggagacctgactggggagaacgccgtt 32589734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 18121403 - 18121886
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||        |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18121403 gaactagccacttgaccaaacagaaacaggttcactggggattggttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 18121502  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |    
T  18121503 gtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagcattgaattgagactgatgttgccattggaaatgcaatatgca 18121602  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  18121603 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 18121702  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    |   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18121703 cgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 18121801  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||||    
T  18121802 gggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataa 18121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 2518234 - 2517749
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2518234 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatt-gaaagg 2518136  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  2518135 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 2518036  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  2518035 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 2517936  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2517935 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 2517837  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  2517836 gagacgtaccggagccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 2517749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 33523560 - 33523086
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  33523560 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactg 33523462  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33523461 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 33523362  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  33523361 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 33523262  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  33523261 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgga 33523163  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33523162 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 33523086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 9543697 - 9544185
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9543697 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 9543796  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||     
T  9543797 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgc 9543896  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  9543897 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 9543996  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9543997 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 9544095  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  9544096 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 9544185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 43085385 - 43084956
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  43085385 gacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 43085286  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  43085285 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 43085186  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43085185 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgt 43085087  T
Q  358 gctaca-tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaat 456  Q
    |||| | || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |    
T  43085086 gctatattcttggaaatcctctctggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagt 43084987  T
Q  457 cttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  43084986 cttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 43084956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 31819406 - 31819880
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31819406 gaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacctgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccg 31819504  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || ||| || |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31819505 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataaca 31819604  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  31819605 gtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 31819704  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  31819705 -agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgga 31819803  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31819804 accatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 31819880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 18493739 - 18494227
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18493739 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 18493838  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||||   || || || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  18493839 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgatagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 18493938  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  18493939 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 18494038  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18494039 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 18494137  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||||    
T  18494138 gagacgtatcggaaccatggctgagggccagtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctaccggggaaaacgccgtt 18494227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30036607 - 30036128
Alignment:
Q  14 cactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 113  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  30036607 cacttgaccaaatagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaatt 30036509  T
Q  114 gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 213  Q
    ||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30036508 gaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgata 30036409  T
Q  214 taacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 313  Q
    ||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| |    
T  30036408 taacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcac 30036309  T
Q  314 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 405  Q
     | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  30036308 gggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgta 30036210  T
Q  406 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30036209 tcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 30036128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 30941749 - 30941314
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  30941749 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 30941650  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||   |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  30941649 tgagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 30941550  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  30941549 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgt 30941450  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  30941449 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgagg 30941350  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  30941349 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 30941314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 33882298 - 33881808
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33882298 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 33882199  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33882198 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcaatatgt 33882099  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  33882098 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 33881999  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33881998 acgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 33881900  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  33881899 gggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 33881808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 15651784 - 15652218
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15651784 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 15651883  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15651884 tgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15651983  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15651984 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 15652082  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| | | |||||||||||||  || ||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15652083 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15652182  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  15652183 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 15652218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 34623688 - 34623201
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34623688 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 34623590  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  34623589 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgggtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 34623490  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  34623489 ggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 34623390  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  34623389 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 34623291  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  34623290 gagacgtatcggagccaaggctgggggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 34623201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30159196 - 30158722
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  30159196 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccg 30159098  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30159097 atattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 30158998  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | ||||    
T  30158997 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga 30158898  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||    
T  30158897 -agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcaga 30158799  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||| ||||||||  || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  30158798 accaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacttgactggggaaaatgccgtt 30158722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 37762163 - 37761676
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37762163 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 37762065  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  37762064 tagaaattgaccgataatattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 37761965  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  37761964 ggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 37761865  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  37761864 gacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgg 37761766  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  37761765 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 37761676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Original strand, 8658465 - 8658931
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8658465 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 8658563  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  8658564 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 8658663  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  8658664 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 8658763  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| || |||    
T  8658764 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgctgg 8658862  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  8658863 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatctcggaagac 8658931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3796724 - 3796235
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3796724 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 3796625  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  3796624 gtagaaattgaccgatattattggctcacaaagtttcgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 3796525  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  3796524 tggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 3796425  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3796424 cgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 3796326  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  3796325 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 3796235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30175657 - 30175170
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30175657 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 30175559  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  30175558 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcat 30175459  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  30175458 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 30175359  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  30175358 gactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgg 30175260  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  30175259 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 30175170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Original strand, 37745319 - 37745781
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37745319 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgctttgacagaatagagattgagattgacttgacgtcgacttgaattgaaag 37745418  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||  ||  |||||||||||||||  ||||| |    
T  37745419 gtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagaccgatgttgacattggaaatgtgatatgca 37745518  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  37745519 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 37745618  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37745619 cgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 37745717  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  37745718 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatcttg 37745781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Original strand, 13435692 - 13436128
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13435692 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13435791  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13435792 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13435891  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13435892 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 13435990  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | || ||| |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||    
T  13435991 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctgggg 13436090  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  13436091 atagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 13436128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 37351633 - 37352123
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||          ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  37351633 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaa 37351732  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||     
T  37351733 ggtagaaattgattgatattattggctcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgc 37351832  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |    
T  37351833 atggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttggtaggc 37351932  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37351933 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 37352031  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |  ||||   ||||||||||| ||||||    
T  37352032 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgagagactttactggggataatgccgtt 37352123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Original strand, 18368553 - 18368989
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18368553 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18368652  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18368653 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18368752  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18368753 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 18368851  T
Q  358 gctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| || | |        || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||    
T  18368852 gctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 18368951  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||  ||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  18368952 atagagccttgagagactccactggggaaaacgccgtt 18368989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 31438626 - 31438141
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31438626 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaagg 31438528  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||  ||| |     
T  31438527 tagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcagcatgcac 31438428  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31438427 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 31438328  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31438327 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 31438229  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  31438228 gagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 31438141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24731140 - 24730653
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  24731140 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattaagattgacttaacgttgattcgatttgaaag 24731041  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |    
T  24731040 gtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgca 24730941  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  24730940 tggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 24730841  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24730840 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 24730742  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  24730741 ggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 24730653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28656438 - 28655947
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28656438 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaag 28656339  T
Q  105 gtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatg 202  Q
    |||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  28656338 gtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatg 28656239  T
Q  203 tatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtaga 302  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||     
T  28656238 catggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagg 28656139  T
Q  303 cacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgt 394  Q
    |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||| ||||||||||| ||| |||    
T  28656138 cacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgt 28656040  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||| ||||  || |||||||||||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  28656039 tgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgcaccttgctggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 28655947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 37664476 - 37664961
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37664476 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaagg 37664574  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| || ||| |||  |||||||||||||||  ||||| ||    
T  37664575 tagagattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattaagactgatgttgacattggaaatgtgatatgcat 37664674  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  37664675 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 37664774  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  37664775 gacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 37664873  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||  |  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||| |||||||    
T  37664874 gagacgtttcggaaccaaggctgagggtgggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggaaaacgccg 37664961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 26487563 - 26487075
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26487563 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 26487465  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |     
T  26487464 tagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcac 26487365  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  26487364 ggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 26487265  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26487264 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 26487166  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  26487165 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 26487075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9324653 - 9324165
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9324653 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggagattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 9324555  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |     
T  9324554 tagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcac 9324455  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  9324454 ggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 9324355  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  9324354 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 9324256  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  9324255 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 9324165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 13317798 - 13318285
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13317798 gaactagccacttgaccaaacatgaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaagg 13317896  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  ||||  ||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  13317897 tagaaattgaccggtattattggctcacaaggtttcgacagagaacctgacatgagttttgaactgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcat 13317996  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  13317997 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 13318096  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  13318097 gacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 13318195  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||| |||  ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  13318196 gagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 13318285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12139351 - 12138864
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12139351 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 12139253  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |     
T  12139252 tagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcac 12139153  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||| || || ||||| || | | | | ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  12139152 ggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 12139053  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12139052 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 12138954  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  12138953 gagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 12138864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 41681874 - 41681408
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaa-ttgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681874 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 41681775  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    | ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||  ||||||||| | ||||| |    
T  41681774 gcagacattgaccgatattattggctcacaaggtttggacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttggtattggaaatacgatatgca 41681675  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    |||||| |||  || || ||||||  ||||||||||||||| ||    
T  41681674 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgatta----tgcatgtatgaatgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggca 41681579  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacat----cat------agaaatcctctttggagataacgccgt 394  Q
    |   ||| | | || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||      | ||||||||||||||||| ||| |||    
T  41681578 cgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaaaatcctctttggagatgacgtcgt 41681480  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41681479 tgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 41681408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40467008
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 40466993  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  40466994 ggggaaaatgccgtt 40467008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 180 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644502
Alignment:
Q  180 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 279  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  280 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 371  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  372 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 471  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||  || |||||||||  || | | ||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgtagacagaatcttgagaggctccac 5644518  T
Q  472 tggggataacgccgtt 487  Q
    |||||| |||||||||    
T  5644517 tggggaaaacgccgtt 5644502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 185 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330336
Alignment:
Q  185 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 284  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  285 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcct 376  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |        || | ||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  377 ctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggg 476  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagacctgactgggg 11330347  T
Q  477 ataacgccgtt 487  Q
    | || ||||||    
T  11330346 aaaatgccgtt 11330336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 361
Target Start/End: Original strand, 13178630 - 13178824
Alignment:
Q  167 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  13178630 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 13178729  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13178730 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 13178824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 40466577 - 40466686
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466577 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 40466676  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  40466677 tagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 5644930 - 5644815
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5644930 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgct-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 5644832  T
Q  106 tagaaattgaccaatat 122  Q
    |||||||||||| ||||    
T  5644831 tagaaattgaccgatat 5644815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11330763 - 11330640
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  11330763 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaag 11330664  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattgg 128  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  11330663 gcagaaattgaccgatatcattgg 11330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Original strand, 24585449 - 24585929
Alignment:
Q  14 cactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 113  Q
    |||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24585449 cacttgaccgaatagaaacaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaaat 24585548  T
Q  114 gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24585549 gaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgata 24585648  T
Q  214 taacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 313  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24585649 taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgc 24585748  T
Q  314 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  24585749 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgta 24585848  T
Q  406 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| |||||    
T  24585849 tcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccgt 24585929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15235005 - 15234526
Alignment:
Q  13 ccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |       |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  15235005 ccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagttttt--gacaaaatgtagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggcagagat 15234908  T
Q  113 tgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15234907 tgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacatgacatgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgat 15234808  T
Q  213 ataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  15234807 ataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtgggcagcttgtagacacagtttcg 15234708  T
Q  313 cagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgt 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15234707 cagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgt 15234608  T
Q  405 accggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  15234607 atcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgt 15234526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 54840583 - 54840097
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  54840583 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttt--gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcaattcgatttgaaagg 54840486  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  54840485 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 54840386  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  54840385 ggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 54840286  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  54840285 gacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 54840187  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54840186 gagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 54840097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 58 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14672133 - 14671717
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14672133 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14672034  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14672033 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14671934  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14671933 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 14671834  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  14671833 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 14671734  T
Q  450 atagaatcttggaagac 466  Q
    ||||||||| |||||||    
T  14671733 atagaatctcggaagac 14671717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5701723 - 5701256
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5701723 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 5701624  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  5701623 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 5701524  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  5701523 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 5701424  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5701423 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 5701325  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5701324 gagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 5701256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Original strand, 31119595 - 31120069
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  31119595 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactg 31119693  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31119694 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 31119793  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  31119794 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 31119893  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  31119894 -agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgga 31119992  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31119993 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 31120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 36323409 - 36323894
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36323409 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 36323507  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  36323508 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 36323607  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  36323608 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 36323707  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  36323708 gacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgg 36323806  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36323807 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36323894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 36337618 - 36338103
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36337618 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 36337716  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  36337717 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 36337816  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  36337817 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattatgcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 36337916  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  36337917 gacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgg 36338015  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  36338016 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 36338103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 126 - 466
Target Start/End: Original strand, 15275816 - 15276164
Alignment:
Q  126 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 225  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||    
T  15275816 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttat 15275915  T
Q  226 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275916 taaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 15276015  T
Q  326 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatgg 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15276016 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatgg 15276115  T
Q  418 ctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||| ||||||  | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15276116 ctgagggcaggtagctatgcgacttgctggggacagaatctcggaagac 15276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 40098704 - 40099192
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40098704 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 40098803  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| ||    
T  40098804 tagaaattgaccgatattattggctcataaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcgatatgcat 40098903  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||    
T  40098904 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtattttgtaggcac 40099003  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  40099004 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 40099102  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  40099103 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 40099192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 14752586 - 14753073
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14752586 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaag 14752685  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |    
T  14752686 gcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgca 14752785  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  14752786 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 14752885  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  14752886 cgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 14752984  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  14752985 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 14753073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 21976884 - 21976410
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||      
T  21976884 gaccaaacagaaacacattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactg 21976786  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21976785 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 21976686  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  21976685 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 21976586  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||    
T  21976585 -agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgga 21976487  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21976486 accatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 21976410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 39857809 - 39857342
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39857809 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 39857710  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  39857709 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 39857610  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  39857609 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 39857510  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||| || ||| ||||||| ||| ||||||    
T  39857509 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgg 39857411  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39857410 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 39857342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 14105737 - 14105250
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14105737 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 14105639  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||    
T  14105638 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcat 14105539  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  || |||| ||||||| |||    
T  14105538 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcac 14105439  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  14105438 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgg 14105340  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  14105339 gagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 14105250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 58 - 460
Target Start/End: Original strand, 18793766 - 18794175
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18793766 gacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18793865  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18793866 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18793965  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18793966 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 18794064  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||    
T  18794065 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 18794164  T
Q  450 atagaatcttg 460  Q
    ||||| |||||    
T  18794165 atagagtcttg 18794175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 126 - 466
Target Start/End: Original strand, 15379428 - 15379776
Alignment:
Q  126 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 225  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  15379428 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtattgaatcgagactataattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttat 15379527  T
Q  226 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 325  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15379528 taaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 15379627  T
Q  326 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatgg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  15379628 gacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatgg 15379727  T
Q  418 ctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379728 ctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 15379776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17020213 - 17019737
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17020213 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaag 17020114  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  ||||||           | ||| ||    
T  17020113 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgaca-----------acatgcat 17020025  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  17020024 gaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacac 17019925  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17019924 agttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 17019825  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  17019824 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 17019737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 24119837 - 24119349
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaa-ttgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24119837 gaactagccacttgaccgaatagaaacaaaattcactggggattggtttgtttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaag 24119738  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  24119737 gtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgca 24119638  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  24119637 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 24119538  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata---------gaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |          ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  24119537 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggaaaatcctctttggagatgacatcgtt 24119439  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||||||||   ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24119438 gggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24119349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6577036 - 6576544
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg-----nnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttg 100  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||            ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  6577036 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttttgaccaaatatggattgagattgacttgacgtcgatttgaattg 6576937  T
Q  101 aaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaata 200  Q
    ||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||    
T  6576936 aaaggcagaaattgaccgatactaatggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgata 6576837  T
Q  201 tgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 300  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  6576836 tgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgta 6576737  T
Q  301 gacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctc-tttggagataacgc 391  Q
    | |||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||| ||||||||| |||     
T  6576736 ggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctcttttggagatgacgt 6576638  T
Q  392 cgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||    
T  6576637 cgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccactggggataatgccg 6576544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 33666872 - 33667360
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33666872 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 33666970  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  33666971 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 33667070  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  33667071 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 33667170  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33667171 cgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 33667269  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  33667270 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 33667360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 30760958 - 30760470
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30760958 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 30760860  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  30760859 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 30760760  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  30760759 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 30760660  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  30760659 cgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctttttggagatgacgtcgttg 30760561  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  30760560 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 30760470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 62 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 5013021 - 5012593
Alignment:
Q  62 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||    
T  5013021 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttaaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagaggacctgacatgag 5012922  T
Q  162 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttta-ttaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcg 260  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||     
T  5012921 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgca 5012822  T
Q  261 tgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt-gggcacgtagtggctcgtgc 359  Q
    || ||| ||||||| ||||| |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  5012821 tgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgc 5012723  T
Q  360 taca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggat 451  Q
    || |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  5012722 tatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggat 5012623  T
Q  452 agaatcttggaagacccgactggggataac 481  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5012622 agaatcttgagagacccgactggggataac 5012593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 58 - 486
Target Start/End: Original strand, 34182084 - 34182515
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  34182084 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 34182183  T
Q  158 taagcattgatttgagattga-aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    | ||  |||| |||||| |||   |||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  34182184 tgagtgttgaattgagactgatgtttgacattgga-----aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 34182278  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34182279 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcg 34182377  T
Q  357 tgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 448  Q
    ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  34182378 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggg 34182477  T
Q  449 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||| |||||| |||| | |||||| |||| |||||    
T  34182478 gatagagtcttgggagactctactgggaataatgccgt 34182515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 124 - 487
Target Start/End: Original strand, 27156516 - 27156885
Alignment:
Q  124 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 223  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  27156516 attggctcacagg-ttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattc 27156614  T
Q  224 attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagac 323  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| ||||    
T  27156615 attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agac 27156713  T
Q  324 aagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccat 415  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  27156714 aagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccat 27156813  T
Q  416 ggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
     ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  27156814 agctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 27156885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 361
Target Start/End: Original strand, 24814424 - 24814726
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||  |||||    
T  24814424 gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctgacaaggttttaacagggaacctgaca 24814523  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24814524 tgagtattgaatggagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24814623  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24814624 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 24814722  T
Q  358 gcta 361  Q
    ||||    
T  24814723 gcta 24814726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 245 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 1907224 - 1906975
Alignment:
Q  245 tatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggca 344  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907224 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggca 1907125  T
Q  345 cgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaat 436  Q
    ||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||      
T  1907124 cgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatg 1907025  T
Q  437 caacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||    
T  1907024 caacttgctggggatagaatctcggaaggctctactggggataatgccgt 1906975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331994
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 20331979  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  20331980 ggggaaaatgccgtt 20331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1907418 - 1907228
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||| |       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907418 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactagggattagtttttt-gacaaaatatagattcaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 1907320  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgca 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1907319 tagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctgacataagtattgaattgagattgatgttgacattggaaatgca 1907228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 361
Target Start/End: Original strand, 24813628 - 24813822
Alignment:
Q  167 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  24813628 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 24813727  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24813728 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 24813822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 20331563 - 20331672
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331563 gaactagccacttaaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 20331662  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  20331663 tagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 72)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 16617602 - 16618084
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16617602 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaagg 16617700  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  16617701 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagagtttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtat 16617800  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16617801 ggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 16617900  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16617901 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgg 16618000  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||    
T  16618001 gagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataa 16618084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22041555 - 22041087
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22041555 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaagg 22041457  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22041456 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagaatttgacagagaacctgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtat 22041357  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22041356 ggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 22041257  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||        | ||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22041256 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgg 22041157  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041156 gagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22041087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5659260 - 5658773
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5659260 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 5659161  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  5659160 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 5659061  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||    
T  5659060 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacac 5658961  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5658960 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacaccttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 5658861  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  5658860 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 5658773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 6 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19701543 - 19701055
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| | |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19701543 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcactggggaatagtttttatgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 19701444  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  19701443 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatagaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 19701344  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19701343 ggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacac 19701244  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19701243 agtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcttctttggagataacgccattgg 19701144  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  19701143 gagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgt 19701055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 29141940 - 29142375
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  29141940 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 29142039  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29142040 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 29142139  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142140 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 29142239  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  29142240 gctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 29142339  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  29142340 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 29142375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 4789817 - 4790252
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  4789817 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 4789916  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4789917 taagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4790016  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4790017 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgt 4790116  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||    
T  4790117 gctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaagg 4790216  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4790217 atagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 4790252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 35887834 - 35887399
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35887834 gacaaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 35887735  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  35887734 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 35887635  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35887634 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgt 35887535  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  35887534 gctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 35887435  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  35887434 atagagtcttgggagactctactgggaataatgccg 35887399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 18337739 - 18337268
Alignment:
Q  14 cactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18337739 cactcgaccaaacagaaacaaattcacaggggattagtttt---gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt 18337643  T
Q  114 gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgata 213  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18337642 gaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgata 18337543  T
Q  214 taacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgc 313  Q
     |||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  18337542 caacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgc 18337443  T
Q  314 agagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgta 405  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  18337442 agagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtg 18337343  T
Q  406 ccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
     ||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||    
T  18337342 tcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctggggatagaatcttgggagactctactgggaataa 18337268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 11103496 - 11103982
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11103496 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 11103595  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  11103596 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 11103695  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11103696 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 11103795  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  11103796 agtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 11103894  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  11103895 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 11103982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 18058394 - 18057907
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18058394 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaagg 18058295  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  18058294 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggtttggacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcat 18058195  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  18058194 gaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacac 18058095  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18058094 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 18057995  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  18057994 gagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 18057907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16423326 - 16422845
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16423326 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 16423228  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16423227 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgatatcggaaatgcaatatgcatggatga 16423128  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |    
T  16423127 tataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcggtttgtagacacagttcc 16423028  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16423027 gcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacg 16422928  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||    
T  16422927 tatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgcaggggatagaatctcggaagactctactggggataatgccgt 16422845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 58 - 486
Target Start/End: Original strand, 15885903 - 15886339
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15885903 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 15886002  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15886003 tgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15886102  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15886103 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 15886202  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  15886203 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctgggg 15886302  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  15886303 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 15886339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 22380766 - 22381201
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  22380766 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 22380865  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22380866 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 22380965  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22380966 gcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 22381065  T
Q  358 gctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| || |||        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22381066 gctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 22381165  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  22381166 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 22381201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Original strand, 8282646 - 8283076
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  8282646 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 8282745  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || |||||  || || |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  8282746 tgagtattgaactgcgactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 8282845  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8282846 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 8282945  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  8282946 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 8283045  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  8283046 atagaatctcggaagactctactgggtataa 8283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 28109074 - 28109564
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28109074 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgggggttggtttgttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttggtttgaaag 28109173  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  28109174 gtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 28109273  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || ||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  28109274 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttagcagtttgtaggca 28109373  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  28109374 cgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 28109472  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagaccc-gactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  28109473 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttggaaaaccctgactggggaaaacgccgtt 28109564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 66 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4728692 - 4728265
Alignment:
Q  66 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 165  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||    
T  4728692 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 4728593  T
Q  166 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  4728592 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtat 4728493  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-- 363  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  4728492 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 4728393  T
Q  364 ------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatc 457  Q
          || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4728392 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatc 4728293  T
Q  458 ttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  4728292 ttgggagactctactgggaataatgccg 4728265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 66 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6208961 - 6208534
Alignment:
Q  66 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 165  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||    
T  6208961 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 6208862  T
Q  166 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  6208861 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtat 6208762  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca-- 363  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  6208761 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 6208662  T
Q  364 ------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatc 457  Q
          || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6208661 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatc 6208562  T
Q  458 ttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  6208561 ttgggagactctactgggaataatgccg 6208534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 4690749 - 4690313
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4690749 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4690650  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4690649 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4690550  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4690549 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 4690450  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  4690449 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 4690350  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    ||||||||| || |||| | |||||| |||| |||||    
T  4690349 atagaatctcgggagactctactgggaataatgccgt 4690313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 458
Target Start/End: Original strand, 15734250 - 15734710
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734250 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 15734349  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  15734350 tagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcat 15734449  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| || ||||||||| ||||| || ||| || |||| |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  15734450 gaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactatgcatgtatgaattcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacac 15734549  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15734550 agtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 15734649  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatct 458  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15734650 gagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatct 15734710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 24335309 - 24334835
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||     
T  24335309 gaccaaacagaaacacattcaatggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccg 24335211  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24335210 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 24335111  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
     ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | ||    
T  24335110 atttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga 24335011  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  24335010 -agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcgga 24334912  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24334911 accatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagaccccactggggaaaacgccgtt 24334835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 17978063 - 17978551
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17978063 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaagg 17978162  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||    
T  17978163 tagaaattgactgatattattggctcgcaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaactgcaatatgcat 17978262  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  17978263 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 17978362  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17978363 gacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 17978461  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17978462 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 17978551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 31029375 - 31029864
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31029375 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaa 31029474  T
Q  103 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatg 202  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  31029475 aggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatg 31029574  T
Q  203 tatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtaga 302  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||     
T  31029575 cacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagg 31029674  T
Q  303 cacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgt 394  Q
     ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  31029675 tacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgt 31029773  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  31029774 tgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 31029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5020807 - 5020370
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5020807 gacaaaatatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5020708  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    | || |||||  |||||  ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5020707 tgagtattgaaatgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 5020608  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5020607 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 5020509  T
Q  357 tgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 448  Q
    ||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  5020508 tgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggg 5020409  T
Q  449 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  5020408 gatagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 5020370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 126 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15368272 - 15367903
Alignment:
Q  126 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 225  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15368272 tggctccccagatcttgacagagaatttgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttat 15368173  T
Q  226 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 325  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15368172 cagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaa 15368073  T
Q  326 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatgg 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  15368072 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgg 15367973  T
Q  418 ctgagggcagatagc-taatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
     ||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  15367972 ttgagggcgggtagcatatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctgctggggataatgccgt 15367903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 32297727 - 32297290
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  32297727 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 32297628  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    | || ||||| ||||||  ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  32297627 tgagtattgaattgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 32297528  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32297527 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 32297429  T
Q  357 tgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 448  Q
    ||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||  ||||| |||||     
T  32297428 tgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaactcgctgga 32297329  T
Q  449 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  32297328 gatagaatcttggaagacctgactggggaaaatgccgtt 32297290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 487
Target Start/End: Original strand, 5602430 - 5602913
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5602430 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaa 5602529  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5602530 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatga 5602629  T
Q  212 tataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    |||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  5602630 tataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 5602729  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    | | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5602730 cacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagac 5602828  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  5602829 gtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 5602913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18232338 - 18231851
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18232338 gaactagccacttgaccaaacgggaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 18232240  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  18232239 taaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactgacgttgacattggaaatgcaatatgcat 18232140  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  18232139 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 18232040  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18232039 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 18231941  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18231940 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatcttggaagacccgaccggggaaaacgccgtt 18231851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 59 - 485
Target Start/End: Original strand, 4339864 - 4340297
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 158  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  4339864 acaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacat 4339963  T
Q  159 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 258  Q
     || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||||||||||||    
T  4339964 gagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatg 4340063  T
Q  259 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 358  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4340064 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtg 4340162  T
Q  359 ctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggga 450  Q
    ||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  4340163 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggga 4340262  T
Q  451 tagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  4340263 tagaatcttgggagactctactggggataatgccg 4340297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 20569968 - 20570456
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20569968 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaagg 20570067  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||    
T  20570068 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcat 20570167  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  20570168 ggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 20570267  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20570268 gacttcac-gggggagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgg 20570366  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | | ||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  20570367 gagacgtatcggaaccatggccgaggaccggtaggtatgtaacttgctggggatagaatcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 20570456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 18285489 - 18285977
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||          ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18285489 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgttttttttttgacaagatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 18285588  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||     
T  18285589 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgc 18285688  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  18285689 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattacgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 18285788  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18285789 acgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 18285887  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  18285888 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 18285977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18249864 - 18249377
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18249864 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcaccggggattggtttttt-gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgaattgaaagg 18249766  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18249765 tagaaattgaccgaaattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtactgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtat 18249666  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  18249665 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 18249566  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  18249565 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgg 18249467  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  18249466 gggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 18249377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 18300844 - 18301278
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18300844 gacaagatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18300943  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     
T  18300944 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattac 18301043  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18301044 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 18301142  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  18301143 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 18301242  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  18301243 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 18301278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 48473059 - 48472590
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48473059 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 48472960  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  48472959 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 48472860  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  48472859 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 48472760  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  48472759 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 48472661  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472660 gggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 48472590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28346266 - 28345830
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||    
T  28346266 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtca 28346167  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  28346166 tgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 28346067  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28346066 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 28345968  T
Q  358 gcta--------catcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    ||||        | || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| |    
T  28345967 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggag 28345868  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  28345867 atagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 28345830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 487
Target Start/End: Original strand, 22863981 - 22864464
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22863981 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaa 22864080  T
Q  111 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||  || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22864081 attgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatg 22864180  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    ||||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  22864181 atataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 22864280  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    |   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  22864281 catgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagac 22864379  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  22864380 gtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22864464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 487
Target Start/End: Original strand, 22879040 - 22879523
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22879040 gccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaa 22879139  T
Q  111 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||  || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22879140 attgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaacacgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatg 22879239  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    ||||||||| || || ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||    
T  22879240 atataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactt 22879339  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    |   | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  22879340 catgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagac 22879438  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||    
T  22879439 gtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgggagactttactggggaaaacgccgtt 22879523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20073162 - 20072693
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20073162 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 20073063  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  20073062 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 20072963  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  20072962 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 20072863  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  20072862 acgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 20072764  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20072763 gggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 20072693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 21681868 - 21681406
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  21681868 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttgacattgatttgaattgaaag 21681769  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21681768 gcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgca 21681669  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  21681668 tggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 21681569  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||    
T  21681568 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttg 21681470  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||    
T  21681469 ggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttg 21681406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 32446225 - 32445791
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||  |||||    
T  32446225 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgaccgatactaatggctcacaaggttttgatagagaacctgaca 32446126  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  32446125 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattat 32446026  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32446025 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 32445927  T
Q  358 gc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    ||     ||||   || | |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  32445926 gctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 32445827  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  32445826 atagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 32445791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4630908 - 4630420
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  4630908 gaactagccacttgaccaatcagaaacatattcactggggattggtttttatttgaccaaatatagattgagattgacttgacattgatttgaattgaaa 4630809  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  4630808 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 4630709  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  4630708 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 4630609  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc-----taca---tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     ||||   || | |||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  4630608 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgtt 4630510  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  4630509 gggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 4630420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 58 - 510
Target Start/End: Original strand, 16403956 - 16404415
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16403956 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16404055  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16404056 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16404155  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16404156 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 16404254  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  16404255 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 16404354  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatgatgtccatctcattgctggg 510  Q
    |||||||||||  |||||  || ||||| ||||||||| || ||  ||||||| |||||||    
T  16404355 atagaatcttgagagacctcaccggggaaaacgccgttgtgctgggcatctcagtgctggg 16404415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 17969989 - 17970481
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17969989 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaa 17970088  T
Q  103 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatg 202  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17970089 aagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcaatatg 17970188  T
Q  203 tatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtaga 302  Q
     | ||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| |||||||     
T  17970189 cacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtagg 17970288  T
Q  303 cacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgt 394  Q
    |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  17970289 cacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgt 17970387  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  17970388 tgggagacatattggaaccatggctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 17970481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 51789169 - 51788681
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51789169 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 51789071  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  51789070 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 51788971  T
Q  206 ggatgatataacagttttatta-aatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  51788970 ggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 51788871  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  51788870 cgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 51788772  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  51788771 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 51788681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 460
Target Start/End: Original strand, 31957569 - 31958029
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31957569 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 31957667  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31957668 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcat 31957767  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  31957768 ggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 31957867  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| |||  |||||    
T  31957868 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgg 31957966  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttg 460  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31957967 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttg 31958029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10650215 - 10649730
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  10650215 gaactagccacttggccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagatt----tgacgtcgatttgatttgaaagg 10650120  T
Q  106 tagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||  |  || | ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  10650119 tagaaattgagactgatgttattggcttacaaggttttgacagagaacctgacacgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 10650020  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  10650019 atggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 10649920  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10649919 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 10649821  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  10649820 gggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttggaaga-cttactggggaaaacgccgtt 10649730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 8218720 - 8218284
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  8218720 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 8218621  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  8218620 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 8218521  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  8218520 gcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtggctcgt 8218422  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||||| |    
T  8218421 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctggag 8218322  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  8218321 atagagtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 8218284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 4424044 - 4423557
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  4424044 gaactagccacttgaccaaacggaaacatattcactggggattggtttttattgacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaag 4423945  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  | ||||||||| ||||| |||| |    
T  4423944 gtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgtcgacattggacatgcagtatgca 4423845  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||| ||    
T  4423844 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggca 4423745  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4423744 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 4423646  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  4423645 ggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 4423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16599760 - 16599406
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16599760 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 16599661  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  16599660 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 16599561  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||    
T  16599560 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcac 16599461  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
       ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599460 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16599406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7080376 - 7080022
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7080376 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 7080277  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |     
T  7080276 cagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcac 7080177  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||    
T  7080176 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcaattcgtaggcac 7080077  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
       ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7080076 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 7080022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5474052 - 5473628
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5474052 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacagatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5473953  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||           
T  5473952 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca------- 5473860  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5473859 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 5473764  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||    
T  5473763 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctgggg 5473664  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  5473663 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 5473628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 6535856 - 6536343
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  6535856 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttattgg-cacaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttagtttgaaatg 6535954  T
Q  106 tagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
       |||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  6535955 ---aaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 6536051  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtaga 302  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||     
T  6536052 atggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagg 6536151  T
Q  303 cacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgt 394  Q
    |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| |||    
T  6536152 cacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgt 6536250  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  6536251 tgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 6536343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28028359 - 28027930
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  28028359 gacaaaatatagattgagatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 28028260  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||       ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28028259 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 28028167  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  28028166 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgt 28028068  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    ||||||        || | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||    
T  28028067 gctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctgggg 28027968  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  28027967 atagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 28027930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35221995 - 35221712
Alignment:
Q  13 ccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaat 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||| |       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  35221995 ccacttgaccgaacagaaacaaattcactggagattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattt----tgaaaggtagaaat 35221900  T
Q  113 tgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgat 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  35221899 tgaccaatatcattggctcataagattttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcactatgcacggatgat 35221800  T
Q  213 ataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  35221799 ataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 119 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10403186 - 10402811
Alignment:
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10403186 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataaca 10403087  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 318  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | ||    
T  10403086 gtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga 10402987  T
Q  319 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccgga 410  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  10402986 -agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcgga 10402888  T
Q  411 accatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| | |||| | ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||||||    
T  10402887 accatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagaccccaccggggaaaacgccgtt 10402811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717714
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5717729  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  5717728 ggggaaaatgccgtt 5717714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728624
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5728639  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  5728638 ggggaaaatgccgtt 5728624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763744
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 5763729  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  5763730 ggggaaaatgccgtt 5763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 180 - 487
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589956
Alignment:
Q  180 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  280 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaa 371  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  372 atcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgac 471  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgcaacttgctagagatagaatcttggaagacctgac 5589940  T
Q  472 tggggataacgccgtt 487  Q
    |||||| || ||||||    
T  5589941 tggggaaaatgccgtt 5589956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658567
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-------cat-catagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||| | | ||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 29658552  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  29658553 ggggaaaatgccgtt 29658567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030114
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaac-ttgctggggatagaatcttggaagacccgac 471  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactttgctggagatagaatcttggaagactccac 47030130  T
Q  472 tggggataacgccgtt 487  Q
    |||||| |||||||||    
T  47030129 tggggaaaacgccgtt 47030114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5718145 - 5718036
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5718145 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 5718046  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  5718045 tagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5729055 - 5728946
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5729055 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 5728956  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  5728955 tagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 5763313 - 5763422
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5763313 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 5763412  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  5763413 tagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 371 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 7079981 - 7079867
Alignment:
Q  371 aatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccga 470  Q
    |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  7079981 aatcttctctggggataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactcta 7079882  T
Q  471 ctggggataacgccg 485  Q
    ||||| |||| ||||    
T  7079881 ctgggaataatgccg 7079867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 115
Target Start/End: Original strand, 29658188 - 29658245
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 115  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658188 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 47030524 - 47030437
Alignment:
Q  28 gaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 115  Q
    |||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47030524 gaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 122
Target Start/End: Original strand, 5589528 - 5589643
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |       || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5589528 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcattggggattagtttgtt-gaaaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 5589626  T
Q  106 tagaaattgaccaatat 122  Q
     ||||||||||| ||||    
T  5589627 cagaaattgaccgatat 5589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 15368379 - 15368305
Alignment:
Q  13 ccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgac 86  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15368379 ccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 15368305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 8218791 - 8218747
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8218791 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 8218747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 9527031 - 9526987
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9527031 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 9526987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 10403239 - 10403195
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  10403239 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 10403195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28028421 - 28028377
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattgg 50  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28028421 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgg 28028377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Original strand, 20333487 - 20333969
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||||| |       |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20333487 gaactagccactagaccgaacagaaacaaattcattggggattagtttttttgacaaaatgtagattgagattgacttgaagtcgatttggtttgaaagg 20333586  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||||| || ||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  20333587 tagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgacatgggtattgaattcagactgatgctgacattggaaatgcaatatgtat 20333686  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20333687 ggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacac 20333786  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20333787 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgg 20333886  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||    
T  20333887 gagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcagaagactctgctggggataa 20333969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Original strand, 16201153 - 16201583
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  16201153 gacaaaatatagattgaagttgactggacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcaatattattggctcacaagattttgatagagaacccgaca 16201252  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16201253 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattat 16201352  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16201353 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcat 16201452  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  16201453 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 16201552  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
     |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  16201553 gtagaatctcggaagactctactggggataa 16201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 59 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20467919 - 20467484
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 158  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20467919 acaaaatatagattgaaactgacttgacgtggatttgatttgaaaggtagaaattgaccagtattattggctcacaagattttgacagagaacctgacat 20467820  T
Q  159 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 258  Q
     || ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20467819 gagtattgaattgagactgatgctgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatg 20467720  T
Q  259 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 358  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20467719 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtg 20467620  T
Q  359 ctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggga 450  Q
    ||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||   |||||||||||||    
T  20467619 ctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctgggga 20467520  T
Q  451 tagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  20467519 tagaatctcggaagactctgctggggataatgccgt 20467484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 14691990 - 14692474
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691990 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 14692086  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  14692087 taggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 14692186  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14692187 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacac 14692286  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14692287 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 14692386  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14692387 gagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14692474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 14694672 - 14695156
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14694672 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 14694768  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  14694769 taggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 14694868  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14694869 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacac 14694968  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14694969 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 14695068  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14695069 gagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14695156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 14697356 - 14697840
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697356 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 14697452  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  14697453 taggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 14697552  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14697553 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacac 14697652  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14697653 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 14697752  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  14697753 gagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 14697840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 475
Target Start/End: Original strand, 14700037 - 14700511
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700037 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggat---cttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 14700133  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  14700134 taggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 14700233  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  14700234 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacac 14700333  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14700334 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 14700433  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggg 475  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||    
T  14700434 gagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactggg 14700511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 51645409 - 51644921
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51645409 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaagg 51645310  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  51645309 cagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgtat 51645210  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  51645209 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcac 51645110  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  51645109 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgg 51645011  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  51645010 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 51644921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 486
Target Start/End: Original strand, 21890827 - 21891308
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21890827 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattg-tttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 21890925  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  21890926 ttgaccgatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatga 21891025  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| || |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| |    
T  21891026 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcc 21891125  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21891126 gcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacg 21891225  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  21891226 tatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcatcttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 21891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Original strand, 41786411 - 41786891
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41786411 gccacttgaccaaacggaaacatattcaccggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattggcttgacgtcgatttgatttgaaaggcggaaa 41786510  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatga 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  41786511 ttgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatga 41786610  T
Q  212 tataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttc 311  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |||    
T  41786611 tataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttc 41786710  T
Q  312 gcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacg 403  Q
     | | || ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41786711 acgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacg 41786809  T
Q  404 taccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    || |||||||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    
T  41786810 tatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttgaaagactttactggggataatgccg 41786891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 10969830 - 10969344
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969830 gaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 10969732  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  10969731 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 10969632  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  10969631 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 10969532  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10969531 cgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 10969433  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||| ||||    
T  10969432 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctggggatagaatcttgagagactttactggggataatgccg 10969344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28156888 - 28156425
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaga 109  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  28156888 gccacttgaccaaacggaaacatattgactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaga 28156789  T
Q  110 aattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggat 209  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  28156788 aattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggat 28156689  T
Q  210 gatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtt 309  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |    
T  28156688 gatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgact 28156589  T
Q  310 tcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggaga 401  Q
    || | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28156588 tcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaga 28156490  T
Q  402 cgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28156489 cgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 28156425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 62 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 28592212 - 28591780
Alignment:
Q  62 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 161  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  28592212 aaatatagattgagattgacttaacattgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 28592113  T
Q  162 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 261  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28592112 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcat 28592013  T
Q  262 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28592012 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgcta 28591914  T
Q  362 ca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatag 453  Q
     |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||||||| |||||||    
T  28591913 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatgtaacttgctagggatag 28591814  T
Q  454 aatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    | |||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  28591813 agtcttgagagactccactggggaaaacgccgtt 28591780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 10952279 - 10951791
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10952279 gaactagccacttgaccagacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 10952181  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  10952180 tagaagttgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcat 10952081  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  10952080 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggca 10951981  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10951980 cgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 10951882  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  10951881 ggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagctaaacaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 10951791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 3648341 - 3647846
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3648341 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactgaggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 3648242  T
Q  106 tagaaattga--ccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgc-----aa 198  Q
    ||||||||||  |  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||      |    
T  3648241 tagaaattgagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatga 3648142  T
Q  199 tatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttg 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  3648141 tatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttg 3648042  T
Q  299 tagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacg 390  Q
    ||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | | |        || ||||||| ||||||| |||    
T  3648041 taggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacg 3647943  T
Q  391 ccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  3647942 tcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 3647846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 22140025 - 22139595
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  22140025 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgtcagagaacctgaca 22139926  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22139925 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 22139826  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22139825 gcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgt 22139726  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  22139725 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctgggg 22139626  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    | ||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  22139625 acagaatctcggaagactctactggggataa 22139595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Original strand, 21341271 - 21341702
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21341271 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 21341370  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21341371 tgagtactgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 21341470  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341471 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 21341570  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggg 448  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| || |    
T  21341571 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgcttgag 21341670  T
Q  449 gatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  21341671 gatagaatctcggaagactctactgggaataa 21341702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 15774685 - 15774250
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15774685 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 15774586  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15774585 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15774486  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15774485 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 15774386  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    ||||||        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  15774385 gctacattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 15774286  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  15774285 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 15774250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 6 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 14570318 - 14569836
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14570318 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttttgacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 14570219  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||    
T  14570218 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcat 14570119  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14570118 gaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcgatttgtagacac 14570019  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14570018 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgtgctatactacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 14569919  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  14569918 gagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaactcgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataa 14569836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18797820 - 18797404
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  18797820 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggcttacaaggttttgacagagaacctgaca 18797721  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    |||| ||||| |||| | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18797720 taagtattgaattgaaactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18797621  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797620 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 18797521  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||    
T  18797520 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaagg 18797421  T
Q  450 atagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||||| ||||    
T  18797420 atagaatcttgggagac 18797404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16261096 - 16260613
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261096 gccacttgaccaaacagaaacagattcattggggattggttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 16260997  T
Q  111 attgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatg 210  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16260996 attgactaatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatg 16260897  T
Q  211 atataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagttt 310  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  16260896 atataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttc 16260797  T
Q  311 cgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagac 402  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |        || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16260796 cgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagac 16260697  T
Q  403 gtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
     || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  16260696 ttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaaggctctactgggaataatgccgt 16260613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 2130318 - 2130804
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||| |       |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2130318 gaactagccacttgaccgaacagaaacaaattcacaggggattagtttttt-gacaaagtataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 2130416  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  2130417 tagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcat 2130516  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  2130517 gaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacac 2130616  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2130617 aattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 2130716  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  2130717 gagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 2130804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 33249474 - 33249039
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  33249474 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 33249375  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33249374 tgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 33249275  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33249274 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 33249175  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  33249174 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 33249075  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  33249074 atagaatcttggaagactctactgggaataatgccg 33249039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19695227 - 19694791
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  19695227 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 19695128  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  19695127 tgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattat 19695028  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19695027 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 19694928  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    | || |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  19694927 gttatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 19694828  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| |||||    
T  19694827 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccgt 19694791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 27602014 - 27602449
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27602014 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27602113  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27602114 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27602213  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  27602214 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgt 27602313  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  ||    
T  27602314 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctaagg 27602413  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  27602414 atagaatcttgggagactctactgggaataatgccg 27602449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 486
Target Start/End: Original strand, 19654427 - 19654863
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  19654427 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctaaca 19654526  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19654527 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 19654626  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19654627 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 19654726  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  19654727 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 19654826  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||| |||| |||||    
T  19654827 atagaatctcggaaggctctactgggaataatgccgt 19654863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 58 - 458
Target Start/End: Original strand, 19910268 - 19910676
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  19910268 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 19910367  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19910368 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 19910467  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  19910468 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgt 19910567  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||    
T  19910568 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgagg 19910667  T
Q  450 atagaatct 458  Q
    |||||||||    
T  19910668 atagaatct 19910676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 29836512 - 29836023
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaag 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||        |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  29836512 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttttgacaaagtatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaag 29836413  T
Q  105 gtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgta 204  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |    
T  29836412 gtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgca 29836313  T
Q  205 tggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
     ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  29836312 cggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 29836213  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  29836212 cgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 29836114  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29836113 ggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacccgactggggaaaacgccgtt 29836023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18716646 - 18716177
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18716646 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 18716547  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| |||||     
T  18716546 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaagtgcgatatgc 18716447  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  18716446 gtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 18716347  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  18716346 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 18716248  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18716247 gggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatcttgggagac 18716177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 126 - 466
Target Start/End: Original strand, 22074081 - 22074429
Alignment:
Q  126 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 225  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22074081 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaatcgagactgtaattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttat 22074180  T
Q  226 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 325  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074181 taaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 22074280  T
Q  326 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatgg 417  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||        | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||    
T  22074281 gacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatgg 22074380  T
Q  418 ctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074381 ctgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagac 22074429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Original strand, 12085760 - 12086253
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12085760 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttgttctgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 12085859  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| ||  | || |||||| |||  ||||  |||||||||| |||||     
T  12085860 ggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgacatgagtttcgaattgagactgatgttgatgttggaaatgcgatatgc 12085959  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  12085960 atggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 12086059  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12086060 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 12086158  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  12086159 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 12086253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 58 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 31361666 - 31361267
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31361666 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31361567  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    | || |||||  |||||  ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  31361566 tgagtattgaaatgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 31361467  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31361466 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 31361368  T
Q  357 tgctacatcata--------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 448  Q
    ||||| || | |        |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||    
T  31361367 tgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggg 31361268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Original strand, 31482908 - 31483393
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31482908 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggatgggtttt---gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 31483004  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| | || ||    
T  31483005 tagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcactgtgcat 31483104  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||    
T  31483105 ggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcac 31483204  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  31483205 gacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 31483303  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  31483304 gagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 31483393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 44568169 - 44567680
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44568169 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-cataatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 44568071  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  44568070 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 44567971  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  44567970 ggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 44567871  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    |   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||| |         || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  44567870 cgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 44567772  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  44567771 gggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 44567680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 33265856 - 33265420
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33265856 gacaaaatatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 33265757  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  33265756 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattat 33265657  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33265656 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 33265558  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  33265557 gctatattacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 33265458  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||||  ||||   |||||||| |||||||||    
T  33265457 atagaatcttgagagactttactggggaaaacgccgtt 33265420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 19681644 - 19681156
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19681644 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgttgg-caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 19681546  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  19681545 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 19681446  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||| | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||    
T  19681445 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatacatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggca 19681346  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttg 396  Q
    |   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19681345 cgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttg 19681247  T
Q  397 ggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||  || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  19681246 ggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 19681156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 9361793 - 9361304
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9361793 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 9361694  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  9361693 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 9361594  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  9361593 acggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 9361494  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || |  ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9361493 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgtt 9361395  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||| |||||| ||| ||||| ||||||||| | ||| ||   |||| |||||||||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  9361394 gggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatgtaactggctggggatagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 9361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 58 - 279
Target Start/End: Original strand, 22388969 - 22389190
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  22388969 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 22389068  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22389069 tgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 22389168  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatg 279  Q
    || || ||| ||||||| ||||    
T  22389169 gcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355474
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |        ||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 28355459  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  28355460 ggggaaaatgccgtt 28355474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201906
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggggatagaatcttggaagacccgac 471  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggtaactaaacaacttgcttggggatagaatcttgagagactccac 19201890  T
Q  472 tggggataacgccgtt 487  Q
     ||||| |||||||||    
T  19201891 cggggaaaacgccgtt 19201906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15775482 - 15775288
Alignment:
Q  167 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 265  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  15775482 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 15775383  T
Q  266 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 361  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15775382 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgcta 15775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 28355043 - 28355152
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355043 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 28355142  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  28355143 tagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Original strand, 19201474 - 19201583
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201474 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 19201573  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  19201574 tagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 58 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 13185 - 12769
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13185 gacaaaatgtaaattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaagataaaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 13086  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||  |||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13085 tgagtattgggttgaaactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 12986  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12985 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 12886  T
Q  358 gctacat--------catagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||||||        | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||   |||||| || ||    
T  12885 gctacattacacatccctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatgaaacttgttgcgg 12786  T
Q  450 atagaatcttggaagac 466  Q
    ||||||||| |||||||    
T  12785 atagaatctcggaagac 12769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 181 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2354
Alignment:
Q  181 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 280  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  281 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaa 372  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |        || | ||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  373 tcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgact 472  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtagatatacaacttgctggagatagaatcttggaagacctgact 2369  T
Q  473 ggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| || ||||||    
T  2368 ggggaaaatgccgtt 2354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2785 - 2676
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2785 gaactagccacttgaccaaacaggaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaagg 2686  T
Q  106 tagaaattga 115  Q
    ||||||||||    
T  2685 tagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Original strand, 3683 - 4173
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn---gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3683 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggttttttatttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaa 3782  T
Q  103 aggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatg 202  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  3783 aggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttggcagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatg 3882  T
Q  203 tatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtaga 302  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||    
T  3883 cgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaga 3982  T
Q  303 cacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgt 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |        || | || ||||||||||||||| ||| |||    
T  3983 cacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgtgctatattacacattcttggacatcctctttggagatgacgtcgt 4082  T
Q  395 tgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  4083 tgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 4173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 58 - 485
Target Start/End: Original strand, 24096 - 24531
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24096 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 24195  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  24196 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattat 24295  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  | ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24296 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 24395  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    |||| |        || | ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  24396 gctatattacacattcctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 24495  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  24496 atagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 24531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 59 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 33971
Alignment:
Q  59 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 158  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  34405 acaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacat 34306  T
Q  159 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 258  Q
     || ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34305 gagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatg 34206  T
Q  259 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 358  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34205 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtg 34106  T
Q  359 ctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggga 450  Q
    ||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||    
T  34105 ctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgagga 34006  T
Q  451 tagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||| || |||| | |||||| |||| ||||    
T  34005 tagaatctcgggagactctactgggaataatgccg 33971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 6 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 11105 - 10615
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11105 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 11006  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| ||    
T  11005 tagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattgttattggaaatgtaatatgcat 10906  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagaca 304  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  10905 ggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagca 10806  T
Q  305 cagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca---------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    |   ||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |         || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  10805 cgacttcacaggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 10707  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  10706 gggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctggaaatagaatcttggaagactttactggggaaaacgccgtt 10615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 58 - 480
Target Start/End: Original strand, 8783 - 9214
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  8783 gacaaagtataaattgagattgaattgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 8882  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || ||| | |||||| ||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  8883 tgagtattaaattgagactgatattgacattgatgatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 8982  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8983 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 9082  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgc-tggg 448  Q
    |||| |        || | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||| || |    
T  9083 gctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgcaacttgcttgag 9182  T
Q  449 gatagaatcttggaagacccgactggggataa 480  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||| ||||    
T  9183 gatagaatctcggaagactctactgggaataa 9214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 126 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 28358 - 27992
Alignment:
Q  126 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 225  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | | || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28358 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacacaggtatcgaattgagactgaaattgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttat 28259  T
Q  226 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 325  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28258 taaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaa 28159  T
Q  326 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta-ca-----tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggct 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||     || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28158 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgttatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggct 28059  T
Q  420 gagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgt 486  Q
    |||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||| |||||    
T  28058 gagggcaggtagctatataacttgctggggatagaatctcggaagactccgctggggataatgccgt 27992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 28469 - 28391
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgac 86  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28469 gaactagccacttgaccaaacagaaacacattcactggggattagttttt--gacaaaatatagattgaaattgacttgac 28391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13203 - 12715
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||         ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13203 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattggtttgtttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaa 13104  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  13103 ggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 13004  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |    
T  13003 atggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggc 12904  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  12903 acgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 12805  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    |||||||||  ||| |||  |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||| ||||    
T  12804 gggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggggatagagtcttgggagactctactgggaataatgccg 12715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 466
Target Start/End: Original strand, 8013 - 8479
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg 105  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8013 gaactagccacttgaccgaacagaaacatattcacaggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagg 8111  T
Q  106 tagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtat 205  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  8112 tagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcat 8211  T
Q  206 ggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacac 305  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  8212 ggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcac 8311  T
Q  306 agtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgg 397  Q
       ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8312 gacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgg 8410  T
Q  398 gagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8411 gagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggagatagaatcttggaagac 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 140 - 466
Target Start/End: Original strand, 25774 - 26108
Alignment:
Q  140 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagca 239  Q
    |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  25774 ttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggca 25873  T
Q  240 cgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 339  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  25874 catagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactatt 25973  T
Q  340 gggcacgtagtggctcgtgctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatag 431  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||        | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25974 gggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 26073  T
Q  432 ctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagac 466  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26074 ctaagcaacttgctggggaaagaatctcggaagac 26108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 186 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 467
Alignment:
Q  186 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  286 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatcata--------gaaatcctc 377  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |        |||||||||    
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  378 tttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactgggga 477  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgcaacctgctggggatagaatctcggaagactctgctgggga 479  T
Q  478 taacgccgttat 489  Q
    ||| ||||||||    
T  478 taatgccgttat 467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2736
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  2299 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 2398  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  2399 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgatta 2498  T
Q  257 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 356  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2499 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 2597  T
Q  357 tgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggg 448  Q
    ||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||     
T  2598 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgga 2697  T
Q  449 gatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  2698 gatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 2736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 58 - 273
Target Start/End: Original strand, 23719 - 23935
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23719 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 23818  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgatta 256  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  23819 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgatta 23918  T
Q  257 tgcgtgcatggatgctt 273  Q
    ||| || ||| ||||||    
T  23919 tgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 18582 - 18505
Alignment:
Q  410 aaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||| |||||||||    
T  18582 aaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggagatagaatcttgagaggctccactggggaaaacgccgtt 18505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 6 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15129 - 14636
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||          ||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15129 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaacatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaa 15030  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  15029 ggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 14930  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagac 303  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |    
T  14929 atggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggc 14830  T
Q  304 acagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgtt 395  Q
    ||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |        || | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14829 acgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtt 14731  T
Q  396 gggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccgttatg 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||  || |||||| ||||| |   |||||||| ||||||||||||    
T  14730 gggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatacaacttgctggaaattgaatctcggaaggctttactggggaaaacgccgttatg 14636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 58 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 16709 - 16273
Alignment:
Q  58 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16709 gacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16610  T
Q  158 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 257  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16609 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgt 16510  T
Q  258 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 357  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16509 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 16411  T
Q  358 gctaca--------tcatagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggcagatagctaatcaacttgctgggg 449  Q
    | || |        || | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||| ||   |||| |||||||    
T  16410 gttatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaactggctgggg 16311  T
Q  450 atagaatcttggaagacccgactggggataacgccgtt 487  Q
    ||||| |||||  |||| | || ||||| |||||||||    
T  16310 atagagtcttgagagactccaccggggaaaacgccgtt 16273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 284
Target Start/End: Original strand, 1148 - 1412
Alignment:
Q  19 gaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacca 118  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  1148 gaccgaacagaaacatattcactggggattggtttgtt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccg 1246  T
Q  119 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 218  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1247 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataaca 1346  T
Q  219 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 284  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  1347 gtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 485
Target Start/End: Original strand, 39734 - 40181
Alignment:
Q  61 aaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagg-tagaaa-ttgaccaatatcattgg-ctcacaagattttgacagagaatttgaca 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||    
T  39734 aaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggttagaaatttgaccgatattattggtctcacaaggttttgacagagaacccgaca 39833  T
Q  158 taag-cattgatttgagattgaaattgacattggaaat-gcaatatgtatgg-atgatataacagttt-tattaaatgta-tgagcacgtagtatgcatg 252  Q
    | ||  ||||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||||| | || ||||||| ||||||||    
T  39834 tgagtaattgaattgagactgatgttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaatatgcatg 39933  T
Q  253 attatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggc-agtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagt-attgggc-acgtag 349  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||    
T  39934 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggcaacgcag 40033  T
Q  350 tggctcgtgctacatcata----------gaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctga-gggcagatagctaat-c 437  Q
    |||||||||||| || | |           ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||| |    
T  40034 tggctcgtgctatattacacatttcctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggggcaggtagttaatgc 40133  T
Q  438 aacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  40134 aacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 40181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 284
Target Start/End: Original strand, 13044 - 13324
Alignment:
Q  6 gaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnn--gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaa 103  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||          ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13044 gaactagccacttgaccaaacagaaacatattcactggggattgagttttgtttgacgaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaa 13143  T
Q  104 ggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt 203  Q
    ||||||||||||   |||| ||||| | |||||  ||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||     
T  13144 ggtagaaattgattgatattattggattacaaggctttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgc 13243  T
Q  204 atggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 284  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  13244 atggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 6982 - 6850
Alignment:
Q  12 gccactcgaccaaacagaaacaaattgactggggattggnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||        |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6982 gccacttgaccaaacagaaacagattcactggggattgttttttttgacaaagtatagattgagattgacttgacgctgatttgatttgaaaggtagaaa 6883  T
Q  112 ttgaccaatatcattggctcacaagattttgac 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6882 ttgaccaatattattggctcacaaggttttgac 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 419 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6741
Alignment:
Q  419 tgagggcagatagctaatcaacttgctggggatagaatcttggaagacccgactggggataacgccg 485  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||    
T  6807 tgagggcaggtagctatgcaacttgctggggatagaatctcggaagactctactgggaataatgccg 6741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 5)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1352
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1314 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 1352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 1422 - 1460
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1422 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 1530 - 1568
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1530 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 1568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 1638 - 1676
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1638 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 1676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 1746 - 1784
Alignment:
Q  1 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1746 ggatcgaacttgccactcgaccaaacagaaacaaattga 1784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University