View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9858_low_5 (Length: 464)

Name: NF9858_low_5
Description: NF9858
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9858_low_5
NF9858_low_5
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (30-429)||(22895147-22895546)
chr5 (30-429)||(23726957-23727356)
chr5 (30-446)||(13179839-13180256)
chr5 (30-417)||(23898628-23899015)
chr5 (30-429)||(25207029-25207428)
chr5 (30-429)||(25271185-25271584)
chr5 (38-429)||(11556074-11556465)
chr5 (30-429)||(33784202-33784601)
chr5 (30-429)||(33299256-33299655)
chr5 (38-429)||(22992171-22992562)
chr5 (30-429)||(23632690-23633089)
chr5 (30-429)||(24976564-24976963)
chr5 (1-429)||(6881033-6881460)
chr5 (30-417)||(28952818-28953204)
chr5 (37-429)||(24608965-24609357)
chr5 (30-426)||(30941353-30941749)
chr5 (1-411)||(32589269-32589678)
chr5 (30-429)||(18121456-18121855)
chr5 (34-417)||(9543755-9544137)
chr5 (1-427)||(2517787-2518211)
chr5 (30-429)||(15651784-15652182)
chr5 (30-417)||(15751881-15752267)
chr5 (30-427)||(8658516-8658912)
chr5 (1-429)||(18493762-18494189)
chr5 (1-429)||(34623239-34623665)
chr5 (30-417)||(33523136-33523522)
chr5 (30-427)||(31819444-31819840)
chr5 (34-427)||(33881848-33882240)
chr5 (30-427)||(30158762-30159158)
chr5 (30-427)||(37761716-37762112)
chr5 (30-429)||(13435692-13436090)
chr5 (30-417)||(30036178-30036564)
chr5 (34-429)||(37351691-37352085)
chr5 (30-429)||(18368553-18368951)
chr5 (32-427)||(30175210-30175604)
chr5 (30-427)||(3796275-3796671)
chr5 (30-429)||(43084994-43085385)
chr5 (30-429)||(24730689-24731087)
chr5 (30-417)||(37745372-37745758)
chr5 (30-429)||(31438177-31438575)
chr5 (30-417)||(28655997-28656385)
chr5 (30-404)||(37664527-37664900)
chr5 (30-410)||(9324223-9324602)
chr5 (30-410)||(26487133-26487512)
chr5 (30-427)||(13317849-13318245)
chr5 (30-427)||(12138904-12139300)
chr5 (30-429)||(41681425-41681821)
chr5 (152-426)||(5644543-5644816)
chr5 (153-427)||(40466695-40466968)
chr5 (157-429)||(11330374-11330645)
chr5 (139-340)||(13178630-13178831)
chr5 (1-87)||(40466600-40466686)
chr5 (30-94)||(5644815-5644879)
chr5 (1-100)||(11330640-11330740)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (30-429)||(21696299-21696698)
chr2 (30-429)||(34268033-34268432)
chr2 (30-429)||(23117507-23117906)
chr2 (98-429)||(27397068-27397399)
chr2 (30-429)||(28888965-28889364)
chr2 (30-429)||(27427583-27427983)
chr2 (1-429)||(34297882-34298309)
chr2 (30-427)||(37679009-37679405)
chr2 (30-427)||(37694274-37694670)
chr2 (30-429)||(20844626-20845025)
chr2 (30-416)||(31867924-31868305)
chr2 (30-417)||(37932122-37932508)
chr2 (1-417)||(19409567-19409981)
chr2 (30-414)||(13929722-13930105)
chr2 (30-417)||(12662214-12662601)
chr2 (1-411)||(253734-254143)
chr2 (30-417)||(3789188-3789575)
chr2 (30-417)||(16822449-16822835)
chr2 (30-417)||(16898645-16899031)
chr2 (30-429)||(37384388-37384786)
chr2 (30-429)||(39896802-39897200)
chr2 (30-427)||(21670284-21670680)
chr2 (30-417)||(32056497-32056883)
chr2 (112-429)||(19449604-19449922)
chr2 (30-429)||(27123233-27123631)
chr2 (30-427)||(22921255-22921651)
chr2 (30-429)||(12709735-12710133)
chr2 (1-427)||(34868369-34868794)
chr2 (30-427)||(31883006-31883402)
chr2 (30-429)||(11628296-11628694)
chr2 (30-429)||(34161574-34161972)
chr2 (1-427)||(37944947-37945372)
chr2 (1-427)||(12593549-12593976)
chr2 (1-429)||(40240256-40240685)
chr2 (153-427)||(16168213-16168486)
chr2 (153-427)||(27810438-27810711)
chr2 (153-417)||(39045116-39045379)
chr2 (153-427)||(9343221-9343494)
chr2 (153-429)||(27782956-27783231)
chr2 (139-340)||(3790466-3790667)
chr2 (1-87)||(9343126-9343212)
chr2 (1-87)||(16168495-16168581)
chr2 (1-87)||(27783240-27783326)
chr2 (1-87)||(27810720-27810806)
chr2 (1-87)||(39045020-39045106)
chr2 (1-58)||(19449500-19449557)
chr2 (30-58)||(27397432-27397460)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (30-429)||(16048044-16048443)
chr7 (30-414)||(26508714-26509098)
chr7 (30-429)||(5154794-5155193)
chr7 (30-429)||(2161283-2161681)
chr7 (30-429)||(16443010-16443409)
chr7 (30-429)||(5165095-5165494)
chr7 (30-429)||(11417808-11418207)
chr7 (30-429)||(16511454-16511853)
chr7 (30-426)||(10909955-10910351)
chr7 (1-427)||(26678082-26678506)
chr7 (1-427)||(26662890-26663314)
chr7 (30-429)||(2779955-2780353)
chr7 (112-429)||(10848316-10848633)
chr7 (30-414)||(31083629-31084012)
chr7 (30-429)||(31130627-31131026)
chr7 (30-429)||(45738012-45738410)
chr7 (1-427)||(26596389-26596814)
chr7 (30-411)||(31557410-31557790)
chr7 (30-429)||(26441976-26442374)
chr7 (30-411)||(22148617-22148998)
chr7 (1-427)||(24585512-24585938)
chr7 (1-429)||(5140312-5140741)
chr7 (30-427)||(45393953-45394347)
chr7 (30-427)||(26519541-26519937)
chr7 (32-427)||(11447622-11448017)
chr7 (30-429)||(4206107-4206505)
chr7 (30-410)||(26312869-26313248)
chr7 (153-427)||(4138374-4138647)
chr7 (153-427)||(16744649-16744922)
chr7 (153-426)||(39206293-39206565)
chr7 (139-429)||(3451962-3452252)
chr7 (158-427)||(26268219-26268487)
chr7 (292-411)||(22152844-22152963)
chr7 (292-411)||(22208759-22208878)
chr7 (1-87)||(16744554-16744640)
chr7 (1-87)||(39206198-39206284)
chr7 (30-87)||(4138308-4138365)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (30-429)||(16617653-16618053)
chr3 (30-429)||(22041104-22041504)
chr3 (30-429)||(5658809-5659208)
chr3 (30-429)||(29141940-29142339)
chr3 (30-417)||(4789817-4790204)
chr3 (30-429)||(35887435-35887834)
chr3 (30-429)||(18057943-18058342)
chr3 (1-429)||(11103519-11103946)
chr3 (30-417)||(15885903-15886290)
chr3 (30-429)||(19701092-19701491)
chr3 (30-429)||(4690350-4690749)
chr3 (38-429)||(4728301-4728692)
chr3 (38-429)||(6208570-6208961)
chr3 (30-429)||(8282646-8283045)
chr3 (30-417)||(16422894-16423281)
chr3 (30-429)||(15734302-15734701)
chr3 (30-429)||(22380766-22381165)
chr3 (30-429)||(18337299-18337698)
chr3 (30-414)||(28109127-28109510)
chr3 (30-429)||(5020408-5020807)
chr3 (30-429)||(31029430-31029828)
chr3 (30-417)||(24334885-24335271)
chr3 (98-429)||(15367940-15368272)
chr3 (31-429)||(4339864-4340261)
chr3 (1-427)||(5602447-5602873)
chr3 (30-417)||(32297340-32297727)
chr3 (30-429)||(18249415-18249813)
chr3 (30-427)||(28345870-28346266)
chr3 (30-429)||(18285543-18285941)
chr3 (30-429)||(18300844-18301242)
chr3 (30-429)||(48472607-48473005)
chr3 (30-427)||(31957620-31958016)
chr3 (30-429)||(16403956-16404354)
chr3 (1-417)||(17978086-17978501)
chr3 (30-417)||(18231901-18232287)
chr3 (30-429)||(20072710-20073108)
chr3 (1-429)||(20569991-20570418)
chr3 (30-429)||(21681417-21681815)
chr3 (30-429)||(32445827-32446225)
chr3 (30-416)||(8218335-8218720)
chr3 (34-429)||(4630456-4630850)
chr3 (30-429)||(22864028-22864426)
chr3 (30-429)||(22879087-22879485)
chr3 (1-429)||(10649767-10650192)
chr3 (30-410)||(17970044-17970423)
chr3 (30-429)||(4423593-4423991)
chr3 (32-427)||(51788721-51789116)
chr3 (30-417)||(5473676-5474052)
chr3 (1-351)||(16599388-16599737)
chr3 (35-427)||(6535912-6536303)
chr3 (30-429)||(28027968-28028359)
chr3 (91-429)||(10402849-10403186)
chr3 (1-340)||(7080015-7080353)
chr3 (153-427)||(5717754-5718027)
chr3 (153-427)||(5728664-5728937)
chr3 (153-427)||(5763431-5763704)
chr3 (152-417)||(5589642-5589906)
chr3 (30-272)||(35221712-35221950)
chr3 (153-417)||(47030165-47030428)
chr3 (153-427)||(29658254-29658527)
chr3 (1-87)||(5718036-5718122)
chr3 (1-87)||(5728946-5729032)
chr3 (1-87)||(5763336-5763422)
chr3 (4-87)||(29658162-29658245)
chr3 (1-87)||(47030437-47030523)
chr3 (33-94)||(5589582-5589643)
chr3 (364-429)||(7079903-7079968)
chr3 (30-58)||(15368305-15368333)
[»] chr4 (30 HSPs)
chr4 (30-429)||(24585493-24585892)
chr4 (30-429)||(15234563-15234962)
chr4 (30-429)||(14671734-14672133)
chr4 (98-429)||(15275816-15276147)
chr4 (1-427)||(5701275-5701700)
chr4 (30-427)||(54840137-54840533)
chr4 (30-429)||(36323460-36323858)
chr4 (30-429)||(36337669-36338067)
chr4 (30-429)||(18793766-18794164)
chr4 (1-427)||(40098727-40099152)
chr4 (1-429)||(39857359-39857786)
chr4 (30-429)||(14752639-14753037)
chr4 (98-429)||(15379428-15379759)
chr4 (30-417)||(31119633-31120019)
chr4 (34-429)||(6576580-6576975)
chr4 (30-429)||(24119385-24119784)
chr4 (30-429)||(14105288-14105686)
chr4 (30-417)||(21976460-21976846)
chr4 (30-429)||(17019773-17020161)
chr4 (32-427)||(30760510-30760905)
chr4 (32-427)||(33666925-33667320)
chr4 (34-429)||(5012625-5013021)
chr4 (30-429)||(34182084-34182478)
chr4 (96-427)||(27156516-27156845)
chr4 (217-429)||(1907012-1907224)
chr4 (30-344)||(24814424-24814737)
chr4 (153-427)||(20331681-20331954)
chr4 (30-169)||(1907228-1907367)
chr4 (139-340)||(24813628-24813829)
chr4 (1-87)||(20331586-20331672)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (30-429)||(20333539-20333938)
chr1 (30-429)||(16201153-16201552)
chr1 (30-429)||(14692039-14692438)
chr1 (30-429)||(14694721-14695120)
chr1 (30-429)||(14697405-14697804)
chr1 (30-429)||(14700086-14700485)
chr1 (31-429)||(20467521-20467919)
chr1 (1-427)||(51644961-51645386)
chr1 (30-417)||(21890872-21891259)
chr1 (32-429)||(10969380-10969777)
chr1 (34-416)||(28591831-28592212)
chr1 (30-427)||(41786457-41786853)
chr1 (30-429)||(28156442-28156840)
chr1 (1-429)||(3647884-3648318)
chr1 (32-414)||(10951844-10952226)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (1-429)||(27209610-27210038)
chr6 (1-429)||(27239190-27239618)
chr6 (1-429)||(16756532-16756960)
chr6 (31-429)||(22927945-22928343)
chr6 (30-403)||(26927489-26927862)
chr6 (30-429)||(15405620-15406019)
chr6 (30-429)||(15417407-15417806)
chr6 (30-414)||(27283451-27283827)
chr6 (30-429)||(24298849-24299249)
chr6 (30-429)||(24870419-24870818)
chr6 (30-429)||(27031732-27032131)
chr6 (31-408)||(20131252-20131623)
chr6 (31-408)||(22201247-22201618)
chr6 (30-429)||(27025853-27026252)
chr6 (30-429)||(13292034-13292434)
chr6 (30-429)||(33369520-33369918)
chr6 (30-429)||(29508132-29508530)
chr6 (30-429)||(26792527-26792925)
chr6 (30-429)||(27200908-27201306)
chr6 (30-429)||(27247927-27248325)
chr6 (34-429)||(29556267-29556661)
chr6 (34-427)||(13517288-13517680)
chr6 (34-429)||(4538853-4539247)
chr6 (30-411)||(27491868-27492248)
chr6 (30-429)||(26109491-26109890)
chr6 (34-429)||(16937100-16937494)
chr6 (30-429)||(27014435-27014833)
chr6 (30-429)||(28167205-28167603)
chr6 (30-417)||(30551070-30551456)
chr6 (30-411)||(29579763-29580143)
chr6 (30-429)||(4532005-4532403)
chr6 (30-429)||(27355173-27355571)
chr6 (38-415)||(28214193-28214569)
chr6 (30-404)||(26665727-26666100)
chr6 (30-404)||(26771698-26772071)
chr6 (30-417)||(14138501-14138877)
chr6 (30-427)||(27064214-27064600)
chr6 (30-429)||(16680870-16681268)
chr6 (30-429)||(8898765-8899165)
chr6 (30-427)||(4779624-4780020)
chr6 (30-429)||(4764473-4764861)
chr6 (31-367)||(20175335-20175666)
chr6 (31-367)||(22160325-22160656)
chr6 (153-427)||(34457699-34457972)
chr6 (139-414)||(27622905-27623172)
chr6 (1-87)||(34457604-34457690)
chr6 (30-110)||(27622563-27622643)
chr6 (30-82)||(4755772-4755824)
[»] chr8 (28 HSPs)
chr8 (30-417)||(21341271-21341658)
chr8 (30-429)||(22139626-22140025)
chr8 (30-417)||(18797433-18797820)
chr8 (30-429)||(15774286-15774685)
chr8 (30-417)||(14569879-14570266)
chr8 (30-429)||(16260650-16261049)
chr8 (30-426)||(19910268-19910664)
chr8 (30-417)||(27602014-27602401)
chr8 (30-429)||(33249075-33249474)
chr8 (30-429)||(2130369-2130768)
chr8 (30-429)||(19654427-19654826)
chr8 (30-429)||(19694828-19695227)
chr8 (30-429)||(31361267-31361666)
chr8 (98-429)||(22074081-22074412)
chr8 (30-429)||(18716194-18716592)
chr8 (30-415)||(12085814-12086198)
chr8 (30-427)||(29836063-29836459)
chr8 (30-427)||(31482957-31483353)
chr8 (30-429)||(33265458-33265856)
chr8 (35-427)||(44567720-44568113)
chr8 (30-416)||(9361355-9361739)
chr8 (32-427)||(19681196-19681591)
chr8 (153-427)||(28355161-28355434)
chr8 (153-410)||(19201592-19201848)
chr8 (30-251)||(22388969-22389190)
chr8 (139-340)||(15775281-15775482)
chr8 (1-87)||(19201497-19201583)
chr8 (1-87)||(28355066-28355152)
[»] scaffold0322 (3 HSPs)
scaffold0322 (30-416)||(12799-13185)
scaffold0322 (153-411)||(2410-2667)
scaffold0322 (2-87)||(2676-2761)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (30-429)||(3738-4137)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (30-429)||(24096-24495)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (30-417)||(8783-9170)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (31-426)||(34010-34405)
scaffold0143 (1-427)||(10655-11082)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (98-415)||(28043-28358)
scaffold0109 (30-58)||(28391-28419)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (30-429)||(12751-13149)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (30-427)||(8064-8460)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (112-429)||(25774-26091)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (30-427)||(2299-2696)
scaffold0159 (30-245)||(23719-23935)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (38-415)||(14691-15067)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (158-417)||(519-778)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (30-416)||(16324-16709)
[»] scaffold0685 (1 HSPs)
scaffold0685 (30-256)||(1186-1412)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (33-404)||(39734-40118)
[»] scaffold0477 (1 HSPs)
scaffold0477 (34-256)||(13102-13324)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (30-116)||(6850-6936)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22895546 - 22895147
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22895546 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 22895447  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22895446 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 22895347  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22895346 gcatgtatgaatgcttgcaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagtcattggagtattgggcacgtagtggctcgt 22895247  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  22895246 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctgggg 22895147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23727356 - 23726957
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  23727356 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 23727257  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  23727256 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 23727157  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23727156 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 23727057  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23727056 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 23726957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 30 - 446
Target Start/End: Original strand, 13179839 - 13180256
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13179839 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13179938  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13179939 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13180038  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13180039 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgt 13180138  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||    
T  13180139 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaactcgctgggg 13180238  T
Q  430 -taatgtcgtcattgatg 446  Q
     ||||| |||||||||||    
T  13180239 ataatgccgtcattgatg 13180256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 23899015 - 23898628
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23899015 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 23898916  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  23898915 tgagtattgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 23898816  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    |  || | | ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23898815 gtatgtacgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgt 23898716  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898715 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 23898628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25207428 - 25207029
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25207428 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 25207329  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25207328 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 25207229  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25207228 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 25207129  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25207128 gctacattacacattcctgggaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 25207029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 25271584 - 25271185
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25271584 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 25271485  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  25271484 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 25271385  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25271384 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacagagatagtcaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 25271285  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25271284 gctacattacacattcctgggaatcctctttggagataacgtcgtcgggagacgtatcagaaccagggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 25271185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 38 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11556465 - 11556074
Alignment:
Q  38 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 137  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||    
T  11556465 ataggttgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatt 11556366  T
Q  138 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  11556365 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 11556266  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11556265 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 11556166  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11556165 acgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 11556074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33784601 - 33784202
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33784601 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 33784502  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33784501 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 33784402  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33784401 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 33784302  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||   | ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33784301 gctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaagttgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 33784202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33299655 - 33299256
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  33299655 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 33299556  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  33299555 tgagtattgagttgagactgatgttgacatcggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 33299456  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33299455 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 33299356  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33299355 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggcggagggccggtagctatgcaacttgctgggg 33299256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 38 - 429
Target Start/End: Original strand, 22992171 - 22992562
Alignment:
Q  38 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 137  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||    
T  22992171 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 22992270  T
Q  138 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  22992271 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtat 22992370  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22992371 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 22992470  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22992471 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 22992562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23633089 - 23632690
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23633089 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 23632990  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  23632989 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 23632890  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  23632889 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgt 23632790  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  23632789 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctgggg 23632690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24976963 - 24976564
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  24976963 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 24976864  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24976863 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24976764  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24976763 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 24976664  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24976663 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctgggg 24976564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6881460 - 6881033
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6881460 aaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 6881361  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6881360 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaa 6881261  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  6881260 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 6881162  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6881161 atcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 6881062  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  6881061 agggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 6881033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 28952818 - 28953204
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  28952818 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaagatagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 28952917  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28952918 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 28953017  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953018 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 28953116  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28953117 gctatattacatattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgc 28953204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 37 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24609357 - 24608965
Alignment:
Q  37 tatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcat 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   ||||| || ||    
T  24609357 tatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgacctatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgacatgagtat 24609258  T
Q  137 tgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgca 236  Q
    ||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  24609257 tgaattgagacttgtattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgta 24609158  T
Q  237 tggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatat 336  Q
    || ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24609157 tgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtgctatat 24609058  T
Q  337 cacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24609057 tacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctgggg 24608965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 30941749 - 30941353
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  30941749 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 30941650  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||   |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  30941649 tgagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgtaatatgcatgaatgatagaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 30941550  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  30941549 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgt 30941450  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctg 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30941449 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctg 30941353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 32589269 - 32589678
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32589269 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 32589368  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| |  || || ||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32589369 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgaatatcgaattgggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaa 32589468  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| | | ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||| | || |||||||||    
T  32589469 atgcacgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgatcgttggcagtttgtaggcacgacttcgcgg-gaaagacaagac 32589567  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32589568 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctg 32589667  T
Q  401 agggcaggtag 411  Q
    |||||||||||    
T  32589668 agggcaggtag 32589678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 18121456 - 18121855
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18121456 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18121555  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | |||||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18121556 tgagcattgaattgagactgatgttgccattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18121655  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagaca-ttggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18121656 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacatttagagtattgggcacgtagtggctcg 18121754  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18121755 tgctatatcacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggg 18121854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 34 - 417
Target Start/End: Original strand, 9543755 - 9544137
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  9543755 aaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 9543854  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  9543855 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 9543954  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543955 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 9544053  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9544054 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgc 9544137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2518211 - 2517787
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2518211 aaacatattcactggggattagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatt-gaaaggtagaaattgaccgatattattgg 2518113  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  2518112 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaa 2518013  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  2518012 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 2517914  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  2517913 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccacggctg 2517814  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||||| || ||||| | |||||||    
T  2517813 agggcaggcaggtatgcaacttgctgg 2517787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 15651784 - 15652182
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15651784 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 15651883  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15651884 tgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15651983  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15651984 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 15652082  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15652083 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgatgtcgttgggagacgtgtcgaaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15652182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 15751881 - 15752267
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15751881 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 15751980  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15751981 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15752080  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15752081 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 15752179  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15752180 gctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 15752267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 8658516 - 8658912
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  8658516 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 8658615  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  8658616 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 8658715  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8658716 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtgttgggcacgtagtggctcgt 8658814  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  8658815 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgctgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgg 8658912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 18493762 - 18494189
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  18493762 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 18493861  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||| ||||||   || || || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18493862 ctcacaaggttttgatagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagttttattaa 18493961  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  18493962 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 18494060  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494061 atcagagtattgggcacatagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 18494160  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||  |||||||||| | |||||||||    
T  18494161 agggccagtagctatgcaacttgctgggg 18494189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34623665 - 34623239
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34623665 aaacatattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 34623567  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  34623566 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgggtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaa 34623467  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  34623466 atgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 34623368  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34623367 atcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctg 34623268  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
     |||||||||| ||||| | |||||||||    
T  34623267 ggggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 34623239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 33523522 - 33523136
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33523522 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 33523423  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33523422 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 33523323  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  33523322 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 33523224  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33523223 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 33523136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 31819444 - 31819840
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31819444 gacaaaatatagattgagattgacctgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31819543  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || ||| || |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31819544 tgagtatcgaattgggactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31819643  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |    
T  31819644 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcat 31819742  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31819743 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgg 31819840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 33882240 - 33881848
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||    
T  33882240 aaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgag 33882141  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
      |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  33882140 ttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 33882041  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33882040 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 33881942  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  33881941 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 33881848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30159158 - 30158762
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  30159158 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 30159059  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  30159058 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 30158959  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30158958 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 30158860  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||||    
T  30158859 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgaggataggtaggtatgcaacttgctgg 30158762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37762112 - 37761716
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37762112 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgataatattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37762013  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37762012 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 37761913  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||    
T  37761912 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagaatattgggcacgtagtggctcgt 37761814  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  37761813 gctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctgtgcaacttgctgg 37761716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 13435692 - 13436090
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13435692 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13435791  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13435792 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13435891  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13435892 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 13435990  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  13435991 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcattgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctgggg 13436090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 30036564 - 30036178
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  30036564 gacaaaatatagattgaggttgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 30036465  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  30036464 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 30036365  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30036364 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 30036266  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30036265 gctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 30036178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Original strand, 37351691 - 37352085
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  37351691 aaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggctcacaaggctttgacagagaacctgacatgag 37351790  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  37351791 tattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgttataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 37351890  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37351891 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcatttggtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 37351989  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  37351990 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 37352085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 18368553 - 18368951
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18368553 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18368652  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18368653 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18368752  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18368753 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 18368851  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||| ||| || || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  18368852 gctatattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 18368951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30175604 - 30175210
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || |||     
T  30175604 caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatg 30175505  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgc 231  Q
    ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| |||    
T  30175504 agttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtattacgcatgattgtgc 30175405  T
Q  232 gtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc 331  Q
     || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30175404 atgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgc 30175306  T
Q  332 tatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  30175305 tatattacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 30175210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 3796671 - 3796275
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||  |||||    
T  3796671 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagtttcgacagagaacctgaca 3796572  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||   ||||| |||||||||||||    
T  3796571 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggacgatataacagattcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattat 3796472  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3796471 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgt 3796373  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  3796372 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 3796275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 43085385 - 43084994
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  43085385 gacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 43085286  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  43085285 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 43085186  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43085185 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtaatggctcgt 43085087  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||       ||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  43085086 gctat-------attcttggaaatcctctctggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 43084994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24731087 - 24730689
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  24731087 gacaaaatatagattaagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgaca 24730988  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24730987 tgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24730888  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  24730887 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgt 24730789  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  24730788 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctgggg 24730689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 37745372 - 37745758
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37745372 gacagaatagagattgagattgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37745471  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| ||||||  ||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  37745472 tgagtattgaattgagaccgatgttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 37745571  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  37745572 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 37745670  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37745671 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 37745758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31438575 - 31438177
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  31438575 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgaca 31438476  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31438475 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcagcatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31438376  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31438375 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 31438277  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  31438276 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctgggg 31438177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28656385 - 28655997
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttga 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  28656385 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctga 28656286  T
Q  128 cataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatt 227  Q
    ||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  28656285 catgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatt 28656186  T
Q  228 atgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 327  Q
    |||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28656185 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 28656087  T
Q  328 gtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||    
T  28656086 gtgctatgttacacattcttggaaatcttctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagtcaaggctgagggcaggtaggtatgc 28655997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 404
Target Start/End: Original strand, 37664527 - 37664900
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37664527 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagagattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37664626  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| || ||| |||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  37664627 tgagtattgaattaagactgatgttgacattggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 37664726  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  37664727 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgt 37664825  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggg 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  37664826 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccaaggctgaggg 37664900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 9324602 - 9324223
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  9324602 gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgaca 9324503  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| |||||||||||||    
T  9324502 tgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattat 9324403  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9324402 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 9324304  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9324303 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 9324223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26487512 - 26487133
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  26487512 gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgaca 26487413  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| |||||||||||||    
T  26487412 tgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattat 26487313  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26487312 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 26487214  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487213 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 26487133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 13317849 - 13318245
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  13317849 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggtttcgacagagaacctgaca 13317948  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  ||||  ||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13317949 tgagttttgaactgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13318048  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  13318049 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgt 13318147  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  13318148 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 13318245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12139300 - 12138904
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  12139300 gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgaca 12139201  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | | ||| |||||||||||||    
T  12139200 tgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtatgtaatatgcatgattat 12139101  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12139100 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 12139002  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  12139001 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 12138904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 41681821 - 41681425
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||    
T  41681821 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagacattgaccgatattattggctcacaaggtttggacagagaacctgaca 41681722  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||     
T  41681721 tgagttttgaattgagactgatgttggtattggaaatacgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcgtgatta- 41681623  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
       |||||| |||  || || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41681622 ---tgcatgtatgaatgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagtcattagagtattgggcacgtagtggctcgt 41681527  T
Q  330 gctatatcacacattcttgg--aaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  41681526 gctatattacacattcttggaaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatgactgagggcaggtaactatgcaacttgctgg 41681427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 152 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 5644816 - 5644543
Alignment:
Q  152 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 251  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5644816 attgacattggaaatgcgatgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5644717  T
Q  252 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 351  Q
    |||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5644716 catgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 5644618  T
Q  352 atcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctg 426  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  5644617 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctg 5644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 40466695 - 40466968
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  40466695 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 40466794  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40466795 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 40466893  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  40466894 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 40466968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 157 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 11330645 - 11330374
Alignment:
Q  157 cattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 256  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  11330645 cattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 11330546  T
Q  257 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcct 356  Q
      ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11330545 ctgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagcggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 11330447  T
Q  357 ttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  11330446 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 11330374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 340
Target Start/End: Original strand, 13178630 - 13178831
Alignment:
Q  139 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  13178630 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 13178729  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13178730 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgctataac 13178828  T
Q  338 aca 340  Q
    |||    
T  13178829 aca 13178831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 40466600 - 40466686
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40466600 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 40466686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 5644879 - 5644815
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatat 94  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5644879 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatat 5644815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11330740 - 11330640
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnn-gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11330740 aaacatattcactggggattagtttgttttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatatcattg 11330641  T
Q  100 g 100  Q
    |    
T  11330640 g 11330640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 21696299 - 21696698
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  21696299 gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 21696398  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || |||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21696399 tgagtattgatttgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 21696498  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21696499 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 21696598  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    || |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21696599 gcaatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 21696698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 34268033 - 34268432
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  34268033 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 34268132  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  34268133 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 34268232  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34268233 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 34268332  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34268333 gctatgttacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 34268432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23117906 - 23117507
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  23117906 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcccaaggttttgacagagaacctgaca 23117807  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  23117806 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 23117707  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||| ||| |||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117706 gcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgtttgcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 23117607  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23117606 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggaggcgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 23117507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 98 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27397399 - 27397068
Alignment:
Q  98 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 197  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27397399 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttat 27397300  T
Q  198 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27397299 taaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgtagagacagacaa 27397200  T
Q  298 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27397199 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgg 27397100  T
Q  398 ctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27397099 ctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 27397068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28889364 - 28888965
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  28889364 gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccaaaattattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 28889265  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |   ||| |||||||||||||    
T  28889264 tgagtattgaattgagattgatgttaacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggtgtgtaatatgcatgattat 28889165  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28889164 gcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagatgttggagtattgggcatgtagtggctcgt 28889065  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28889064 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 28888965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 27427583 - 27427983
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  27427583 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 27427682  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  27427683 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcctgaatgatataacagtttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattat 27427782  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27427783 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 27427882  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  27427883 gctatattacacattcctggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcttatgcaacttgctggg 27427982  T
Q  429 g 429  Q
    |    
T  27427983 g 27427983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34298309 - 34297882
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  34298309 aaacatattcactggggattggtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactattgg 34298210  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  34298209 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagattgatgtcgacattggaaatgcaaaatgaatggatgatataacagtttcactaa 34298110  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  34298109 atgcatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 34298011  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298010 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 34297911  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  34297910 agggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 34297882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 37679009 - 37679405
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37679009 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37679108  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37679109 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 37679208  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37679209 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 37679307  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  37679308 gctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 37679405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 37694274 - 37694670
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37694274 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37694373  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37694374 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 37694473  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37694474 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 37694572  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  37694573 gctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 37694670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20845025 - 20844626
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   | ||    
T  20845025 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgtca 20844926  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  20844925 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcataggcacgtaatatgcatgattat 20844826  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20844825 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtaaacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattaggcacgtaatggctcgt 20844726  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20844725 gctatattacacattcctggaaatcatctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 20844626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 416
Target Start/End: Original strand, 31867924 - 31868305
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31867924 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggaagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31868023  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||     ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31868024 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaat-----atgcatggatgatataacagtctcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31868118  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868119 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 31868218  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  31868219 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtaggtatg 31868305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 37932508 - 37932122
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37932508 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37932409  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37932408 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattat 37932309  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  37932308 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagcattgggcacgtagtggctcgt 37932210  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37932209 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 37932122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Original strand, 19409567 - 19409981
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  19409567 aaacatattcactggggattagtttgtt-gacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 19409665  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  19409666 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaa 19409765  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  19409766 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 19409864  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19409865 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 19409964  T
Q  401 agggcaggtagctatgc 417  Q
    |||||||||||||||||    
T  19409965 agggcaggtagctatgc 19409981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 414
Target Start/End: Original strand, 13929722 - 13930105
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13929722 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13929821  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13929822 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13929921  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13929922 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 13930020  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930021 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 13930105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 12662601 - 12662214
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  12662601 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 12662502  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | |  ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  12662501 tgaatattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcaggggcacgtaatatgcatgattat 12662402  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12662401 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtaaacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 12662302  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12662301 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgc 12662214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 411
Target Start/End: Original strand, 253734 - 254143
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  253734 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 253833  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  253834 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaa 253933  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  253934 atgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 254032  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  254033 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctg 254132  T
Q  401 agggcaggtag 411  Q
    |||||||||||    
T  254133 agggcaggtag 254143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 3789575 - 3789188
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  3789575 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 3789476  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta-aatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  3789475 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgatta 3789376  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3789375 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 3789277  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3789276 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 3789188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 16822449 - 16822835
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16822449 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16822548  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16822549 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16822648  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16822649 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 16822747  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16822748 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 16822835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16899031 - 16898645
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16899031 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16898932  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16898931 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16898832  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16898831 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 16898733  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16898732 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 16898645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 37384786 - 37384388
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  37384786 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 37384687  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || |  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  37384686 tgagtatcggattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 37384587  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37384586 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 37384488  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||||||||| || | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  37384487 gctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 37384388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39897200 - 39896802
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  39897200 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 39897101  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  39897100 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 39897001  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||| | |   ||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  39897000 gcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgt 39896902  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  39896901 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 39896802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 21670284 - 21670680
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21670284 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 21670383  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| || ||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | |||||||| ||||    
T  21670384 tgagtattgaattaagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgcttat 21670483  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21670484 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 21670582  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  21670583 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 21670680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32056883 - 32056497
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  32056883 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 32056784  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  32056783 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 32056684  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32056683 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 32056585  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32056584 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 32056497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 112 - 429
Target Start/End: Original strand, 19449604 - 19449922
Alignment:
Q  112 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagca 211  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||  | |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19449604 ttgatagagaatttgacataggtatcaaattgagactgaaattgacattgaaaatgcaatatacatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggca 19449703  T
Q  212 cgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 311  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19449704 cgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 19449803  T
Q  312 gggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19449804 gggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttagaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggtag 19449903  T
Q  412 c-tatgcgatttgctgggg 429  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  19449904 catatgcaacttgctgggg 19449922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27123631 - 27123233
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27123631 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27123532  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27123531 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27123432  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27123431 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 27123333  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27123332 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 27123233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 22921255 - 22921651
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |  |  || ||    
T  22921255 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaatgacctgtca 22921354  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  22921355 tgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 22921454  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22921455 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 22921553  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  22921554 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 22921651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 12709735 - 12710133
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  12709735 gacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggcttacaaggttttgacagagaacctgaca 12709834  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  12709835 tgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 12709934  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  12709935 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggcccgt 12710033  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  12710034 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctgggg 12710133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34868794 - 34868369
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       | |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  34868794 aaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaaagtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 34868696  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34868695 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagattcattaa 34868596  T
Q  201 -atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaaga 299  Q
     ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||   ||| | | || ||||||||    
T  34868595 tatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtagacacgacttcacgggga-agacaaga 34868497  T
Q  300 cattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggct 399  Q
    |||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34868496 catcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggct 34868397  T
Q  400 gagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  34868396 gagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 34868369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 31883402 - 31883006
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||    
T  31883402 gacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtca 31883303  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  31883302 tgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 31883203  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31883202 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 31883104  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31883103 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgg 31883006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 11628296 - 11628694
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  11628296 gacaaaatataaactgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 11628395  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | |  ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| |||| ||||||||    
T  11628396 tgaatattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgtatgattat 11628495  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11628496 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 11628594  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  11628595 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 11628694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 34161972 - 34161574
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||  |||||    
T  34161972 gacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggttttgacagagaacctgaca 34161873  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  34161872 tgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 34161773  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34161772 gcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 34161674  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  34161673 gctatgttacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagagccaaggctgagggctggtaggtatgcaacttgctgggg 34161574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 37944947 - 37945372
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  37944947 aaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgactcgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 37945046  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||   || || || || || |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  37945047 ctcacaaggttttgacagagaacccgatatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaacgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaa 37945146  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  37945147 atgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgctggtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 37945245  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  37945246 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagatgtgtcggaaccatagctg 37945345  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  37945346 agggcaggtagatatgcaacttgctgg 37945372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 12593976 - 12593549
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcatt 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||    
T  12593976 aaacatattcactgggggttagtttgtttgacaaaatatagattgagtttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttatt 12593877  T
Q  99 ggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12593876 ggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttact 12593777  T
Q  199 aaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaag 298  Q
    ||||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||| |||| || |||||||||  |||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||    
T  12593776 aaatgcatgggcacgtaatacgcatgattatgcatgtatgaatgcctgtaatgcatgactgttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaag 12593678  T
Q  299 acattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggc 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593677 acattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggc 12593578  T
Q  399 tgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
     |||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  12593577 cgagggccggtaggtatgcaacttgctgg 12593549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 40240685 - 40240256
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcatt 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||    
T  40240685 aaacatattcactagggattagtttgtttgacaaaatatagattgagcttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttatt 40240586  T
Q  99 ggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40240585 ggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcatt 40240486  T
Q  199 aaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaag 298  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||    
T  40240485 aaaggcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaag 40240387  T
Q  299 acattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggc 398  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40240386 acgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggc 40240287  T
Q  399 tgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
     |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  40240286 cgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 40240256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 16168486 - 16168213
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16168486 ttgacattggaaatgcgatatgtatggatgatataacattttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16168387  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16168386 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16168288  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  16168287 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 16168213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27810711 - 27810438
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27810711 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27810612  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27810611 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27810513  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  27810512 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 27810438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Original strand, 39045116 - 39045379
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39045116 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39045215  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39045216 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 39045314  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  39045315 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgc 39045379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 9343221 - 9343494
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  9343221 ttgacattggaaatgcgatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 9343320  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9343321 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaaa 9343419  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  9343420 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 9343494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27783231 - 27782956
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  27783231 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 27783132  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27783131 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 27783033  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||| | ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  27783032 tcctctatggagatgatgtcgttggtagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 27782956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3790667 - 3790466
Alignment:
Q  139 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  3790667 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3790568  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3790567 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgctataac 3790469  T
Q  338 aca 340  Q
    |||    
T  3790468 aca 3790466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 9343126 - 9343212
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9343126 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 9343212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 16168581 - 16168495
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16168581 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16168495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27783326 - 27783240
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27783326 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27810806 - 27810720
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810806 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 27810720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 39045020 - 39045106
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39045020 aaacatattcactggggattagtttgttcgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39045106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 19449500 - 19449557
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgac 58  Q
    ||||| ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19449500 aaacacattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgac 19449557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27397460 - 27397432
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgac 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27397460 gacaaaatatagattgaaattgacttgac 27397432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16048443 - 16048044
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16048443 gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctaaca 16048344  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||| ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16048343 taagtattgaattgagactgatgttggcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 16048244  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
     | || ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16048243 acatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 16048144  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16048143 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataaagtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 16048044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 30 - 414
Target Start/End: Original strand, 26508714 - 26509098
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  26508714 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 26508813  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26508814 tgagtattgaattgagactgatgttgacattgggaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 26508913  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508914 gcatgtatgaatggttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 26509013  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    |||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26509014 gctacattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 26509098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5155193 - 5154794
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5155193 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5155094  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5155093 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 5154994  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154993 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 5154894  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5154893 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 5154794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2161681 - 2161283
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  2161681 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 2161582  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  2161581 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 2161482  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2161481 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 2161382  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  2161381 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggca-gtagctatgcaacttgctgggg 2161283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 16443010 - 16443409
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16443010 gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattaaccaacgttgttggctcacaagattttgacagagaacctgaca 16443109  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| | |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16443110 tgagtattgaattgagactaatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataaaagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 16443209  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16443210 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcatgtagtggctcgt 16443309  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16443310 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggagccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 16443409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5165494 - 5165095
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |    
T  5165494 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgata 5165395  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||| | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5165394 tgagtattaaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 5165295  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5165294 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 5165195  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  5165194 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 5165095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 11417808 - 11418207
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  11417808 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 11417907  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  11417908 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 11418007  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11418008 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 11418107  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11418108 gctatattacgcattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 11418207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 16511454 - 16511853
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16511454 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16511553  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16511554 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16511653  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  16511654 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatgactcgt 16511753  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  16511754 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctgggg 16511853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Original strand, 10909955 - 10910351
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  10909955 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 10910054  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  10910055 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgtatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 10910154  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10910155 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttcagcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 10910254  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctg 426  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10910255 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctg 10910351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 26678082 - 26678506
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26678082 aaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 26678180  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678181 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 26678280  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||    
T  26678281 atgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagac 26678379  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678380 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 26678479  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26678480 agggcaggtaggtatgcaacttgctgg 26678506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 26662890 - 26663314
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26662890 aaacatattcactggggattagtttgttgg-caaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 26662988  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26662989 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaa 26663088  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||    
T  26663089 atgcatgggcacgtgatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagac 26663187  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663188 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 26663287  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26663288 agggcaggtaggtatgcaacttgctgg 26663314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 2780353 - 2779955
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  2780353 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 2780254  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  2780253 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 2780154  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2780153 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 2780055  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  2780054 gctatattacacattcctggaaatcctctttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctgggg 2779955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 112 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10848633 - 10848316
Alignment:
Q  112 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagca 211  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  10848633 ttgacagagaatttgacaaaagtattggattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcagatgtatgggca 10848534  T
Q  212 cgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 311  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10848533 cgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 10848434  T
Q  312 gggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10848433 gggcacgtagtggctcgcgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatggctgagggcgggttg 10848334  T
Q  412 ctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  10848333 ctacgcgacttgctgggg 10848316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 414
Target Start/End: Original strand, 31083629 - 31084012
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  31083629 gacaaaatatagattgagattgatttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgataacattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 31083728  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31083729 tgagtgttgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31083828  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31083829 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 31083927  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31083928 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 31084012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31131026 - 31130627
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31131026 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtaaaatttgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31130927  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31130926 tgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31130827  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31130826 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 31130728  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaacc-atggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31130727 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccaatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggg 31130628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 45738410 - 45738012
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  45738410 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 45738311  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  45738310 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 45738211  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45738210 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 45738112  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  45738111 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaatttgctgggg 45738012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26596814 - 26596389
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26596814 aaacatattcactggggattagtttttt-gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 26596716  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26596715 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaa 26596616  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  26596615 atgcatgggtacgtaatatgcatgattatgtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 26596517  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaacc-atggct 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||    
T  26596516 attagagtattgggcacgtagtggctcatgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaatagct 26596417  T
Q  400 gagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  26596416 gagggcaggtagatatgcaacttgctgg 26596389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 411
Target Start/End: Original strand, 31557410 - 31557790
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31557410 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31557509  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     
T  31557510 tgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattac 31557609  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  31557610 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgt 31557708  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31557709 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatggcgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 31557790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26442374 - 26441976
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| |    
T  26442374 gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgata 26442275  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  26442274 tgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaaatgcatgggcacgtaatacgcatgattat 26442175  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26442174 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 26442076  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  26442075 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgcaacttgctgggg 26441976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 30 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22148998 - 22148617
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||| |||| || |||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  22148998 gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaatcgaccgatattatcggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 22148899  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || ||||| |||||| |||  || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  22148898 tgagtattgaattgagactgatgtttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataatagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgatta 22148799  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22148798 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 22148700  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22148699 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccctggctgagggcaggtag 22148617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 24585512 - 24585938
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24585512 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 24585611  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||| || |  || ||| ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24585612 ctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgagttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaa 24585711  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||    
T  24585712 atgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagac 24585810  T
Q  301 a-ttggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggct 399  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  24585811 atttagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagct 24585910  T
Q  400 gagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    || ||||||||| ||||| | |||||||    
T  24585911 gaaggcaggtagatatgcaacttgctgg 24585938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 5140312 - 5140741
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||    
T  5140312 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgatttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttatt 5140411  T
Q  99 ggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  5140412 ggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcatt 5140511  T
Q  199 aaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaag 298  Q
    ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||    
T  5140512 aaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaag 5140610  T
Q  299 acattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggc 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  5140611 acattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcattgggagacgtatcggaaccatggc 5140710  T
Q  399 tgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
     |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  5140711 cgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 5140741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 45394347 - 45393953
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||  |  |||||    
T  45394347 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaga--acctgaca 45394250  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  45394249 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 45394150  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |    
T  45394149 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcat 45394051  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45394050 gctatattacacattcttgggaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgg 45393953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 26519937 - 26519541
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26519937 gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaactgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 26519838  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || ||| || |||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26519837 tgagtatcgaattgggactgatgttgacattggaactgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 26519738  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  26519737 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgt 26519639  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  26519638 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 26519541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11448017 - 11447622
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |||     
T  11448017 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgtcatg 11447918  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  11447917 agtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggcacgtaatatgcatgatcatg 11447818  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  11447817 catgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtg 11447719  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  11447718 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 11447622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4206505 - 4206107
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4206505 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgtattgaaaggcagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4206406  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  4206405 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcactaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 4206306  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4206305 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttgggcacgtagtggctcgt 4206207  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  4206206 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgccggaaccatggccgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 4206107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 30 - 410
Target Start/End: Original strand, 26312869 - 26313248
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||  |||||    
T  26312869 gacaaaatataaattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgactcacaaggctttgacagagaacctgaca 26312968  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| || || ||||| || | | | ||||| |||||||||||||    
T  26312969 tgagtatcgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataaaagattcattaagtgcacgggtacgtaatatgcatgattat 26313068  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26313069 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcaagacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 26313167  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313168 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 26313248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 4138374 - 4138647
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  4138374 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 4138473  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4138474 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 4138572  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  4138573 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 4138647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 16744649 - 16744922
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  16744649 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 16744748  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16744749 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 16744847  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  16744848 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgacggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 16744922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 426
Target Start/End: Original strand, 39206293 - 39206565
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  39206293 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 39206392  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39206393 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 39206491  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctg 426  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  39206492 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctg 39206565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 139 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3452252 - 3451962
Alignment:
Q  139 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  3452252 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 3452153  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || || ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3452152 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agccaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 3452054  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  3452053 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtaccggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 3451962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 158 - 427
Target Start/End: Original strand, 26268219 - 26268487
Alignment:
Q  158 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  26268219 attggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcatgaatgattgaaatgcatga 26268318  T
Q  257 tggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcct 356  Q
    |||||| |||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26268319 tggttgacagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcct 26268417  T
Q  357 ttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  26268418 ctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgg-acctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 26268487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 292 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22152963 - 22152844
Alignment:
Q  292 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaa 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22152963 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22152864  T
Q  392 ccatggctgagggcaggtag 411  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22152863 ccctggctgagggcaggtag 22152844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 292 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22208878 - 22208759
Alignment:
Q  292 agacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaa 391  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22208878 agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaa 22208779  T
Q  392 ccatggctgagggcaggtag 411  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22208778 ccctggctgagggcaggtag 22208759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16744554 - 16744640
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744554 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 16744640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 39206198 - 39206284
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||| ||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39206198 aaacatattcactgggggttagtttgcttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 39206284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Original strand, 4138308 - 4138365
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4138308 gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 4138365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 16617653 - 16618053
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  16617653 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagagtttgacagagaacctgaca 16617752  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16617753 taagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattat 16617852  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16617853 gcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgt 16617952  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  16617953 gctatatcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggg 16618052  T
Q  429 g 429  Q
    |    
T  16618053 g 16618053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22041504 - 22041104
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  22041504 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagaatttgacagagaacctgaca 22041405  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22041404 taagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttatcaaatgtatggacacgtagtatgcatgattat 22041305  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22041304 gcatgtatgaatgcttgaaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtagctcgt 22041205  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagc-tatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  22041204 gctatatcacacattcttggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcgggtagcatatgcaacttgctggg 22041105  T
Q  429 g 429  Q
    |    
T  22041104 g 22041104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5659208 - 5658809
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5659208 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5659109  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  5659108 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 5659009  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5659008 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 5658909  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5658908 gctatattacaccttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 5658809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 29141940 - 29142339
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  29141940 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 29142039  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29142040 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaacgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 29142139  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142140 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 29142239  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29142240 gctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 29142339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 4789817 - 4790204
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  4789817 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 4789916  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4789917 taagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4790016  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4790017 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtaatggctcgt 4790116  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790117 gctatattacacattcctggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 4790204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 35887834 - 35887435
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  35887834 gacaaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 35887735  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  35887734 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 35887635  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35887634 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttgacagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattgaagtattgggcacgtagtggctcgt 35887535  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  35887534 gctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 35887435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18058342 - 18057943
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||   ||||    
T  18058342 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggtttggacagagaacccgaca 18058243  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18058242 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18058143  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18058142 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 18058043  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18058042 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 18057943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 11103519 - 11103946
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  11103519 aaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 11103618  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  11103619 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaa 11103718  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||    
T  11103719 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagac 11103817  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103818 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 11103917  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  11103918 agggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 11103946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 15885903 - 15886290
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15885903 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 15886002  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15886003 tgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15886102  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15886103 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 15886202  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15886203 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 15886290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19701491 - 19701092
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  19701491 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 19701392  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||    
T  19701391 tgagtatagaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatcaaatgcatgggcttgtaatatgcatgattat 19701292  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19701291 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcatagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 19701192  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  19701191 gctatattacacattcctggaaatcttctttggagataacgccattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctgggg 19701092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4690749 - 4690350
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4690749 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4690650  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4690649 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4690550  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4690549 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 4690450  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4690449 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 4690350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 38 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4728692 - 4728301
Alignment:
Q  38 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 137  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||    
T  4728692 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 4728593  T
Q  138 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  4728592 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtat 4728493  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4728492 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 4728393  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4728392 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 4728301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 38 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6208961 - 6208570
Alignment:
Q  38 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 137  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||    
T  6208961 ataggttgaaattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattataggctcacaaggttttgacagagaacccgacatgagtatt 6208862  T
Q  138 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  || ||    
T  6208861 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgtatgtat 6208762  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6208761 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 6208662  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6208661 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 6208570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 8282646 - 8283045
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  8282646 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 8282745  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || |||||  || || |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  8282746 tgagtattgaactgcgactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 8282845  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8282846 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 8282945  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8282946 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 8283045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 16423281 - 16422894
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  16423281 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 16423182  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16423181 tgagtattgaattgagactgatgttgatatcggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattatatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16423082  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16423081 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcggtttgtagacacagttccgcagagacagacaaggcactggagtattgggtacgtagtggctcgt 16422982  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16422981 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgc 16422894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 15734302 - 15734701
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15734302 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 15734401  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||  |||| || ||||||||| |||    
T  15734402 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcataggcacataatatgcatgactat 15734501  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| || |||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15734502 gcatgtatgaattcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgtagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 15734601  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15734602 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggttgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15734701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 22380766 - 22381165
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  22380766 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 22380865  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22380866 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 22380965  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22380966 gcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 22381065  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22381066 gctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 22381165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18337698 - 18337299
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18337698 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18337599  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18337598 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatacaacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18337499  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||| | |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18337498 gcatgtatgaatgctcgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacatagtttcgcagagacagacaggacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 18337399  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| | || ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  18337398 gctatattatactttcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccctggctgagggcaggtagctacgcaacttgctgggg 18337299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 414
Target Start/End: Original strand, 28109127 - 28109510
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  28109127 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 28109226  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  28109227 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatggttat 28109326  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| |||||||  ||||||||  ||| ||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28109327 gcatgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttagcagtttgtaggcacgacttcaccggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 28109425  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28109426 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 28109510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5020807 - 5020408
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5020807 gacaaaatatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5020708  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || |||||  |||||  ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5020707 tgagtattgaaatgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 5020608  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5020607 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 5020509  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  5020508 tgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctggg 5020409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 31029430 - 31029828
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31029430 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31029529  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31029530 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31029629  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31029630 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggtacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 31029728  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31029729 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 31029828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 24335271 - 24334885
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24335271 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgttgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 24335172  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24335171 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24335072  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24335071 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 24334973  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334972 gctatattacacattcttggaaatcctctttggggatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 24334885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 98 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15368272 - 15367940
Alignment:
Q  98 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 197  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15368272 tggctccccagatcttgacagagaatttgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttat 15368173  T
Q  198 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 297  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  15368172 cagatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacatagtttcccagagacagacaa 15368073  T
Q  298 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15368072 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgcgctacatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgg 15367973  T
Q  398 ctgagggcaggtagc-tatgcgatttgctgggg 429  Q
     ||||||| |||||| ||||| | |||||||||    
T  15367972 ttgagggcgggtagcatatgcaacttgctgggg 15367940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 31 - 429
Target Start/End: Original strand, 4339864 - 4340261
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  4339864 acaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacat 4339963  T
Q  131 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
     || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | || || ||||||||||||||    
T  4339964 gagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacataatatgcatgattatg 4340063  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4340064 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtg 4340162  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  4340163 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 4340261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 5602447 - 5602873
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5602447 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 5602546  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  5602547 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaa 5602646  T
Q  201 -atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaaga 299  Q
     ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||    
T  5602647 tatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaga 5602745  T
Q  300 cattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggct 399  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  5602746 catcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagct 5602845  T
Q  400 gagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5602846 gagggcaggtagatatgcaacttgctgg 5602873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 32297727 - 32297340
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||    
T  32297727 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgaca 32297628  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || ||||| ||||||  ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  32297627 tgagtattgaattgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 32297528  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32297527 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 32297429  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  32297428 tgctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgc 32297340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18249813 - 18249415
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18249813 gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgaaattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18249714  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18249713 tgagtactgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18249614  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18249613 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 18249515  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  18249514 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 18249415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 28346266 - 28345870
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||    
T  28346266 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtca 28346167  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  28346166 tgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 28346067  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28346066 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 28345968  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  28345967 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 28345870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 18285543 - 18285941
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18285543 gacaagatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18285642  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     
T  18285643 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattac 18285742  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18285743 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 18285841  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  18285842 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 18285941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 18300844 - 18301242
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18300844 gacaagatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18300943  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||     
T  18300944 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattac 18301043  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18301044 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 18301142  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  18301143 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 18301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 48473005 - 48472607
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  48473005 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 48472906  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  48472905 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 48472806  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  48472805 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 48472707  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  48472706 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 48472607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 31957620 - 31958016
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||    
T  31957620 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtca 31957719  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  31957720 tgagttttgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaattttattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 31957819  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31957820 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 31957918  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  31957919 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 31958016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 16403956 - 16404354
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16403956 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16404055  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16404056 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16404155  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16404156 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 16404254  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  16404255 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 16404354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 417
Target Start/End: Original strand, 17978086 - 17978501
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |        |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  17978086 aaacatattcactggggattggtttgttttacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattgg 17978185  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    ||| |||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  17978186 ctcgcaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaactgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaa 17978285  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || | |||||||    
T  17978286 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-aaacaagac 17978384  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17978385 atcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctg 17978484  T
Q  401 agggcaggtagctatgc 417  Q
    |||||||||||||||||    
T  17978485 agggcaggtagctatgc 17978501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18232287 - 18231901
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18232287 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18232188  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  18232187 tgagtactgaattgagactgacgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 18232088  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18232087 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 18231989  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18231988 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 18231901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20073108 - 20072710
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  20073108 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 20073009  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20073008 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 20072909  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||    || | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20072908 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacatcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 20072810  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20072809 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 20072710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 20569991 - 20570418
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20569991 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 20570090  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  20570091 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcgttaa 20570190  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | |  |||||||||    
T  20570191 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcac-gggggagacaagac 20570289  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20570290 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccg 20570389  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| | ||||| ||||  | |||||||||    
T  20570390 aggaccggtaggtatgtaacttgctgggg 20570418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 21681815 - 21681417
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21681815 gacaaaatatagattgagattgacttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 21681716  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21681715 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 21681616  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21681615 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 21681517  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  21681516 gctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 21681417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 32446225 - 32445827
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||| ||||||  |||||    
T  32446225 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaatcgaccgatactaatggctcacaaggttttgatagagaacctgaca 32446126  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  32446125 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatagatgacataacagttttattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattat 32446026  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32446025 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 32445927  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  32445926 gctatgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 32445827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 8218720 - 8218335
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  8218720 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 8218621  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  8218620 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 8218521  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| | ||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||    
T  8218520 gcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaggcgttagagtattgggcacgtggtggctcgt 8218422  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8218421 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatg 8218335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4630850 - 4630456
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  4630850 aaatatagattgagattgacttgacattgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 4630751  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  4630750 tatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 4630651  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630650 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 4630552  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    | | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  4630551 tgttacacattcttggaaatcctctttggtgatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcatgtagctatgcaacttgctgggg 4630456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 22864028 - 22864426
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  22864028 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaaca 22864127  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
      || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  22864128 cgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 22864227  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22864228 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgt 22864326  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22864327 gctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 22864426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 22879087 - 22879485
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  22879087 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctaaca 22879186  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
      || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  22879187 cgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaggttcatcaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 22879286  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   |||   | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22879287 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgt 22879385  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  22879386 gctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 22879485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10650192 - 10649767
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcatt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||    
T  10650192 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagatt----tgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttatt 10650097  T
Q  99 ggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatt 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||  || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||    
T  10650096 ggcttacaaggttttgacagagaacctgacacgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcatt 10649997  T
Q  199 aaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaag 298  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||    
T  10649996 aaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaag 10649898  T
Q  299 acattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggc 398  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10649897 acatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggc 10649798  T
Q  399 tgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  10649797 tgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 10649767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 410
Target Start/End: Original strand, 17970044 - 17970423
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  17970044 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 17970143  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||    
T  17970144 tgagttttgaattgagactgatattgttattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaagtgcatgggtacgtaatatgcatgattat 17970243  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17970244 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcactttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 17970342  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17970343 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacatattggaaccatggctgagggcaggta 17970423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4423991 - 4423593
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4423991 gacaaaatatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4423892  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  | ||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4423891 tgagtatcgaattgagactgatgtcgacattggacatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4423792  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||| ||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4423791 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttataggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 4423693  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  4423692 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 4423593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 51789116 - 51788721
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  51789116 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatg 51789017  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta-aatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||  ||| ||| | ||||| |||||||||||||     
T  51789016 agtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattagtatgcatgggtacgtaatatgcatgattata 51788917  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  51788916 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtg 51788818  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  51788817 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 51788721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 5474052 - 5473676
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  5474052 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgacagatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 5473953  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||           
T  5473952 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca------- 5473860  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5473859 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 5473764  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5473763 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgc 5473676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16599737 - 16599388
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16599737 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 16599638  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16599637 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaa 16599538  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  16599537 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 16599439  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 351  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16599438 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaa 16599388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 427
Target Start/End: Original strand, 6535912 - 6536303
Alignment:
Q  35 aatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataa 132  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||| |   |||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |    
T  6535912 aatatagattgaggttgacttgacgtcgatttagtttgaaatg---aaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatga 6536008  T
Q  133 gcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgc 231  Q
    | ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  6536009 gtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgc 6536108  T
Q  232 gtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgc 331  Q
     || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  6536109 atgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgc 6536207  T
Q  332 tatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  6536208 tatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgg 6536303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28028359 - 28027968
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  28028359 gacaaaatatagattgagatcgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 28028260  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||       ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28028259 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatg-------taacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 28028167  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||    ||| | | || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  28028166 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcatgacttcacgggga-agacaagacattagagtaatgggcaagtagtggctcgt 28028068  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||| || ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  28028067 gctacattacacattcttggaaatcctcttcggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtaggtatgcaacttgctgggg 28027968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 91 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10403186 - 10402849
Alignment:
Q  91 atatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataaca 190  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10403186 atattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataaca 10403087  T
Q  191 gttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagaga 290  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | ||    
T  10403086 gtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga 10402987  T
Q  291 cagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcgga 390  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10402986 -agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcgga 10402888  T
Q  391 accatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  10402887 accatggccgggggccggtaggtatgtaacttgctgggg 10402849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 7080353 - 7080015
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||| |||||    
T  7080353 aaacatattcactggggattggtttttttgacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgatcgatattattgg 7080254  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||    
T  7080253 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacaatttcattaa 7080154  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  7080153 atgcatgggcacgtaataggcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgaccgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 7080055  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcaca 340  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7080054 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctataacaca 7080015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5718027 - 5717754
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5718027 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5717928  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5717927 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5717829  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5717828 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 5717754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5728937 - 5728664
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5728937 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5728838  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5728837 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5728739  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5728738 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 5728664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 5763431 - 5763704
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  5763431 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 5763530  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| | ||| | | || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5763531 atgactgttggcagtttgtaggcacggcttcacgggga-aggcaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 5763629  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5763630 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 5763704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 417
Target Start/End: Original strand, 5589642 - 5589906
Alignment:
Q  152 attgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatg 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  5589642 attgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatg 5589741  T
Q  252 catgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaa 351  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5589742 catgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtgctatattacacattcttggaa 5589840  T
Q  352 atcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5589841 atcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtaggtatgc 5589906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35221950 - 35221712
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  35221950 gacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattt----tgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcataagattttgacagagaacctgaca 35221855  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35221854 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcactatgcacggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 35221755  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgta 272  Q
    || || ||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||||    
T  35221754 gcatgtatgaatgcttgtaacgcatgactgttggcagtttgta 35221712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 153 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 47030428 - 47030165
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  47030428 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatatagcagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 47030329  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47030328 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 47030230  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    |||| |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47030229 tcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgcatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 47030165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 29658254 - 29658527
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  29658254 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatgtaacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 29658353  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| | |   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29658354 atgactgttggcagtttgtaggcgcgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattcttggaaa 29658452  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29658453 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgttggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 29658527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 5718122 - 5718036
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5718122 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5718036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 5729032 - 5728946
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5729032 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5728946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 5763336 - 5763422
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5763336 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 5763422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 87
Target Start/End: Original strand, 29658162 - 29658245
Alignment:
Q  4 catattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29658162 catattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 29658245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 47030523 - 47030437
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47030523 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattga 47030437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 94
Target Start/End: Original strand, 5589582 - 5589643
Alignment:
Q  33 aaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatat 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  5589582 aaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatat 5589643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 364 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 7079968 - 7079903
Alignment:
Q  364 gataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  7079968 gataacgtcgttgggagacgtgtcggaaccaaggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 7079903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15368333 - 15368305
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgac 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15368333 gacaaaatatagattgaaattgacttgac 15368305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 30)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 24585493 - 24585892
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24585493 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaaatgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 24585592  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24585593 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24585692  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24585693 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 24585792  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  24585793 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctgggg 24585892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15234962 - 15234563
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15234962 gacaaaatgtagattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaaggcagagattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacatgaca 15234863  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  15234862 tgagtattgaattgagactgatgctgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacatggtatgcatgattat 15234763  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234762 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 15234663  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15234662 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15234563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14672133 - 14671734
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14672133 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14672034  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14672033 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14671934  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14671933 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgttggcgatttgtggacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 14671834  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14671833 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 14671734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 98 - 429
Target Start/End: Original strand, 15275816 - 15276147
Alignment:
Q  98 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 197  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||| ||||||||    
T  15275816 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgcaacatgtataggtggtataatagttttat 15275915  T
Q  198 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15275916 taaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 15276015  T
Q  298 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15276016 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgttgttgggagacgtatcggaaccatgg 15276115  T
Q  398 ctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15276116 ctgagggcaggtagctatgcgacttgctgggg 15276147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 5701700 - 5701275
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5701700 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 5701601  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5701600 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaa 5701501  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  5701500 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 5701402  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5701401 atcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctg 5701302  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  5701301 agggcaggtaggtatgcaacttgctgg 5701275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 54840533 - 54840137
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  54840533 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 54840434  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54840433 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgtatgggcacgtaatatgcatgattat 54840334  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54840333 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattggattattgggcacgtagtggctcgt 54840235  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  54840234 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgg 54840137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 36323460 - 36323858
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||    
T  36323460 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgaca 36323559  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  36323560 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattat 36323659  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36323660 gcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgt 36323758  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  36323759 gctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctgggg 36323858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 36337669 - 36338067
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||    
T  36337669 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgaca 36337768  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  36337769 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatgtgcatgattat 36337868  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36337869 gcatgcatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgt 36337967  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||    
T  36337968 gctatattacacattcttggaaatcctccttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggcatgcaacttgctgggg 36338067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 18793766 - 18794164
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18793766 gacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18793865  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18793866 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18793965  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18793966 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 18794064  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  18794065 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 18794164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Original strand, 40098727 - 40099152
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40098727 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattgg 40098826  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  40098827 ctcataaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaa 40098926  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| | ||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  40098927 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 40099025  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40099026 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctg 40099125  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  40099126 agggcaggtagatatgcaacttgctgg 40099152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39857786 - 39857359
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  39857786 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 39857687  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  39857686 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaa 39857587  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  39857586 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 39857488  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857487 attagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaattcttctgtggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 39857388  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  39857387 agggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 39857359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 14752639 - 14753037
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  14752639 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 14752738  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14752739 tgagtattgaattgagactgatgttgatattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14752838  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14752839 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 14752937  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  14752938 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 14753037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 98 - 429
Target Start/End: Original strand, 15379428 - 15379759
Alignment:
Q  98 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 197  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  15379428 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtattgaatcgagactataattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttat 15379527  T
Q  198 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 297  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15379528 taaatgtatggacacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaacgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 15379627  T
Q  298 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatgg 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15379628 gacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatgg 15379727  T
Q  398 ctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15379728 ctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15379759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 31119633 - 31120019
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31119633 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtaaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31119732  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  31119733 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 31119832  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31119833 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 31119931  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31119932 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 31120019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 6576975 - 6576580
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  6576975 aaatatggattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatactaatggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 6576876  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  6576875 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 6576776  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   |||   | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576775 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 6576677  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcct-ttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||    
T  6576676 tattacacattcttggaaatcctcttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaagtatgcaacttgctgggg 6576580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24119784 - 24119385
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||  |||||    
T  24119784 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggtcttgacagagaacctgaca 24119685  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24119684 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24119585  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24119584 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 24119486  T
Q  330 gctatatcacacattcttgg-aaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| ||||| | ||||||||    
T  24119485 gctatattacacattctcggaaaatcctctttggagatgacatcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccagtagatatgcaacttgctggg 24119386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14105686 - 14105288
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  14105686 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 14105587  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14105586 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14105487  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  || |||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14105486 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtgggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 14105388  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||  | |||||||||    
T  14105387 gctatattacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggtcggtaggtatgtaacttgctgggg 14105288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 21976846 - 21976460
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21976846 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 21976747  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21976746 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 21976647  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21976646 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 21976548  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21976547 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 21976460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 17020161 - 17019773
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  17020161 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 17020062  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||           | ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17020061 tgagtattgagttgagactgatgttgaca-----------acatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 17019973  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17019972 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgt 17019873  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  17019872 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctgggg 17019773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 30760905 - 30760510
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  30760905 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatg 30760806  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||     
T  30760805 agtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattata 30760706  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  30760705 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtg 30760607  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  30760606 ctatattacacattcttggaaatcctttttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 30760510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 427
Target Start/End: Original strand, 33666925 - 33667320
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  33666925 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatg 33667024  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||     
T  33667025 agtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattata 33667124  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  33667125 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtg 33667223  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  33667224 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 33667320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 5013021 - 5012625
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||    
T  5013021 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttaaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagaggacctgacatgag 5012922  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttta-ttaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcg 232  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||     
T  5012921 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcatttaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgca 5012822  T
Q  233 tgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt-gggcacgtagtggctcgtgc 331  Q
    || ||| ||||||| ||||| |||   |||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  5012821 tgtatgaatgcttgtaatgcgtgactattggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtgttggggcacgtagtggctcgtgc 5012723  T
Q  332 tatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  5012722 tatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 5012625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 34182084 - 34182478
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  34182084 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 34182183  T
Q  130 taagcattgatttgagattga-aattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | ||  |||| |||||| |||   |||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  34182184 tgagtgttgaattgagactgatgtttgacattgga-----aatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 34182278  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| || |||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  34182279 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcaattcgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcg 34182377  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34182378 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctggg 34182477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 96 - 427
Target Start/End: Original strand, 27156516 - 27156845
Alignment:
Q  96 attggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt 195  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  27156516 attggctcacagg-ttttgacagagaacctgacatgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattc 27156614  T
Q  196 attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagac 295  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| ||||    
T  27156615 attaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agac 27156713  T
Q  296 aagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccat 395  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  27156714 aagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccat 27156813  T
Q  396 ggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  27156814 agctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 27156845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 217 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 1907224 - 1907012
Alignment:
Q  217 tatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggca 316  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1907224 tatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggtagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggca 1907125  T
Q  317 cgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1907124 cgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcattgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatg 1907025  T
Q  417 cgatttgctgggg 429  Q
    | | |||||||||    
T  1907024 caacttgctgggg 1907012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 344
Target Start/End: Original strand, 24814424 - 24814737
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |||| |||  |||||    
T  24814424 gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctgacaaggttttaacagggaacctgaca 24814523  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24814524 tgagtattgaatggagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24814623  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24814624 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 24814722  T
Q  330 gctatatcacacatt 344  Q
    ||||||| |||||||    
T  24814723 gctatattacacatt 24814737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 20331681 - 20331954
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  20331681 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 20331780  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20331781 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 20331879  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  20331880 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 20331954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1907367 - 1907228
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  1907367 gacaaaatatagattcaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctgaca 1907268  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgca 169  Q
    |||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1907267 taagtattgaattgagattgatgttgacattggaaatgca 1907228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 139 - 340
Target Start/End: Original strand, 24813628 - 24813829
Alignment:
Q  139 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  24813628 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 24813727  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||   | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24813728 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcatgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgctataac 24813826  T
Q  338 aca 340  Q
    |||    
T  24813827 aca 24813829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 20331586 - 20331672
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20331586 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 20331672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 20333539 - 20333938
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  20333539 gacaaaatgtagattgagattgacttgaagtcgatttggtttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 20333638  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |  | ||||| || ||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20333639 tgggtattgaattcagactgatgctgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 20333738  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20333739 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 20333838  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20333839 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 20333938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 16201153 - 16201552
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||    
T  16201153 gacaaaatatagattgaagttgactggacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcaatattattggctcacaagattttgatagagaacccgaca 16201252  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  16201253 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttatcaaatgtatgggtacgtaatatgcatgattat 16201352  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16201353 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcat 16201452  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16201453 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacaccgttgggagacgtatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 16201552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 14692039 - 14692438
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14692039 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14692138  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14692139 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14692238  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14692239 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 14692338  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  14692339 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctgggg 14692438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 14694721 - 14695120
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14694721 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14694820  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14694821 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14694920  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14694921 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 14695020  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  14695021 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctgggg 14695120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 14697405 - 14697804
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14697405 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14697504  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14697505 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14697604  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14697605 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 14697704  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  14697705 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctgggg 14697804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 14700086 - 14700485
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14700086 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtaggaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14700185  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14700186 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14700285  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14700286 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatggctgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 14700385  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  14700386 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagagcaggtagctatgcaacttgctgggg 14700485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20467919 - 20467521
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 130  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20467919 acaaaatatagattgaaactgacttgacgtggatttgatttgaaaggtagaaattgaccagtattattggctcacaagattttgacagagaacctgacat 20467820  T
Q  131 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
     || ||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20467819 gagtattgaattgagactgatgctgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatg 20467720  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20467719 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagcttgtagacaccgtttcgtagagacagacaaggcattggagtattggccacgtagtggctcgtg 20467620  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  20467619 ctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacatatcggaaccatggctgagggtaggtagctatgtaacttgctgggg 20467521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 51645386 - 51644961
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  51645386 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggcagaaattgaccgatattattgg 51645287  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51645286 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaa 51645187  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||    
T  51645186 atgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagac 51645088  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51645087 atcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaatcctctttgaagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 51644988  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||    
T  51644987 agggcaggtagctatgcaacttgctgg 51644961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 21890872 - 21891259
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||   ||||    
T  21890872 gacaaagtatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggcacacaaggttttgacagagaacccgaca 21890971  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21890972 tgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 21891071  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| |||| || |||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  21891072 gcatgtatgaatgcctgtaatgcacgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacatacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 21891171  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891172 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 21891259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 32 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10969777 - 10969380
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||     
T  10969777 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacggagaacctgacatg 10969678  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||| | ||||||||||||||    
T  10969677 agtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgcaatatgcatgattatg 10969578  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10969577 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtgactcgtg 10969479  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  10969478 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgccacttgctgggg 10969380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28592212 - 28591831
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  28592212 aaatatagattgagattgacttaacattgattcgatttgaaaggtagaaattgaccgatactattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 28592113  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28592112 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattatgcat 28592013  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28592012 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagtggctcgtgcta 28591914  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28591913 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggctggtaggtatg 28591831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 41786457 - 41786853
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  41786457 gacaaaatatagattgagattggcttgacgtcgatttgatttgaaaggcggaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 41786556  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  41786557 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 41786656  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  41786657 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgtcagagtattgggcacgtagtggctcgt 41786755  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  41786756 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 41786853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28156840 - 28156442
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  28156840 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 28156741  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28156740 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 28156641  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28156640 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 28156542  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28156541 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 28156442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 3648318 - 3647884
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga--ccaatatcatt 98  Q
    |||||||||||||| |||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  || | |||    
T  3648318 aaacatattcactgaggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgagactgatgttatt 3648219  T
Q  99 ggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgt-----atggatgatataacagtt 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||    
T  3648218 ggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgatatgcatggatgatataacagtt 3648119  T
Q  194 ttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacag 293  Q
    | |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||    
T  3648118 tcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-ag 3648020  T
Q  294 acaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaacc 393  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3648019 acaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaacc 3647920  T
Q  394 atggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  3647919 atggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctgggg 3647884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 10952226 - 10951844
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  || |||     
T  10952226 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaagttgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgtcatg 10952127  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    ||  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  10952126 agttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatg 10952027  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||  | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10952026 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgactttacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtg 10951928  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10951927 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacggctgagggcaggtagcta 10951844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27210038 - 27209610
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27210038 aaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgg 27209939  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209938 ctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 27209839  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27209838 atgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagac 27209739  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209738 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 27209639  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27209638 agggcaggtagctatgcaacttgctgggg 27209610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Original strand, 27239190 - 27239618
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27239190 aaacatattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgaaactgacttgacgtcgattcaatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgg 27239289  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239290 ctcataaggttttgacagagaacatgacataagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 27239389  T
Q  201 atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagac 300  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27239390 atgcatgggcacgtagtatgcatggttatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagatagacaagac 27239489  T
Q  301 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239490 attggagtattgggcacgtagtggctcgtgctagattacatattccagtaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctg 27239589  T
Q  401 agggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27239590 agggcaggtagctatgcaacttgctgggg 27239618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16756960 - 16756532
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  16756960 aaacagattcactggggattagtttttttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaacgtagaaattgaccgatattattgg 16756861  T
Q  101 ctcacaagattttgacag-agaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttatta 199  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||  |||||| || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16756860 ctcacaaggttt-gacaggagaacctgacatgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcatta 16756762  T
Q  200 aatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaaga 299  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16756761 aatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaaga 16756662  T
Q  300 cattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggct 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16756661 cattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggct 16756562  T
Q  400 gagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16756561 gagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 16756532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 31 - 429
Target Start/End: Original strand, 22927945 - 22928343
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  22927945 acaaaatataggttgaaattgacttgatgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacat 22928044  T
Q  131 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
     || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22928045 gagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatg 22928144  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| |||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22928145 catgtatgaatgcttgtgatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgtg 22928244  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22928245 ctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacatcgttgggagatgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 22928343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 30 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26927862 - 26927489
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26927862 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 26927763  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26927762 tgagtattgaattgagactgatgttgtcattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 26927663  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927662 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 26927563  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagg 403  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26927562 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtatcggaaccaaggctgagg 26927489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 15405620 - 15406019
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15405620 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 15405719  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  15405720 tgagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattat 15405819  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15405820 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 15405919  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15405920 gctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15406019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 15417407 - 15417806
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  15417407 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 15417506  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  15417507 tgagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcgtgggcacgtaatatgcatgattat 15417606  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15417607 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 15417706  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15417707 gctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 15417806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 414
Target Start/End: Original strand, 27283451 - 27283827
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27283451 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattgactcacaagattttgacagagaacctgaca 27283550  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27283551 tgagtattgaattgagattgatgttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 27283650  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283651 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttttgaagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 27283750  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    |||| ||||        | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  27283751 gctacatca--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccggaaccatggctgagggtagatagcta 27283827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 24298849 - 24299249
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  24298849 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattaaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 24298948  T
Q  130 taagc-attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | ||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  24298949 tgagttattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 24299048  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  24299049 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcg 24299148  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24299149 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggg 24299248  T
Q  429 g 429  Q
    |    
T  24299249 g 24299249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24870818 - 24870419
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  24870818 gacaaagtatagattgaaattgacttgacgttgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 24870719  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24870718 tgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 24870619  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24870618 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 24870519  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24870518 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 24870419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27032131 - 27031732
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27032131 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27032032  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27032031 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27031932  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||| ||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27031931 gcatgtatgaatgtttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagcattgggcacgtaatggctcgt 27031832  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  27031831 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagttatgcaacttgctgggg 27031732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 20131623 - 20131252
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20131623 acaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgaca 20131524  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20131523 taagcattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 20131424  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20131423 gcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgt 20131331  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagg 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20131330 gctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagg 20131252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 408
Target Start/End: Original strand, 22201247 - 22201618
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt-gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22201247 acaaaatacagattgatattgacttgacattgatttgatttgaaaggtagaaatttgaccaataacattggctcacaagattttgacagagaacttgaca 22201346  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22201347 taagcattgaattgagacagatgttgacattggaaatgcaacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtagtatgcatgattat 22201446  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||       |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22201447 gcatgtatggatgcttgaaatgcatgatggttggcaatttgta-agacagtttc------tcagacaagacatcggagtgttgggcacgtagtggctcgt 22201539  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagg 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22201540 gctatatcacacattcctggaaatcctctttggagatatcgtcgttgggagacgtatcgaaaccatggctgagggcagg 22201618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27026252 - 27025853
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  27026252 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 27026153  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| | |  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27026152 tgagtattgaattgagactaatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27026053  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    |  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27026052 gtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacaaagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 27025953  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  27025952 gctatattacacattcctgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagttatgcaacttgctgggg 27025853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 13292034 - 13292434
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  13292034 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 13292133  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13292134 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 13292233  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    |  || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13292234 gtatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacaatttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 13292333  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag-ctatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||    
T  13292334 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagtctatgcaacttgctggg 13292433  T
Q  429 g 429  Q
    |    
T  13292434 g 13292434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 33369520 - 33369918
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33369520 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 33369619  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33369620 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 33369719  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33369720 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 33369818  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  33369819 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 33369918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29508530 - 29508132
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  29508530 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 29508431  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  29508430 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcataattat 29508331  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29508330 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacggaga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 29508232  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  29508231 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgtaacttgctgggg 29508132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 26792925 - 26792527
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  26792925 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggcttacaaggttttgacagagaacctgaca 26792826  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26792825 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatattcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 26792726  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26792725 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 26792627  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  26792626 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagacgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 26792527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27201306 - 27200908
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27201306 gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27201207  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  27201206 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 27201107  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  27201106 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcga 27201008  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27201007 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 27200908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 27247927 - 27248325
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27247927 gacaaaatatagattgagattgacctgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27248026  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  27248027 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 27248126  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  27248127 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcga 27248225  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27248226 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 27248325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 29556661 - 29556267
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  29556661 aaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 29556562  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  29556561 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 29556462  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29556461 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 29556363  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||    
T  29556362 tattacacattcttggaaatcctttttgaagatgacgccgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcagataggcatgcaacttgctgggg 29556267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 34 - 427
Target Start/End: Original strand, 13517288 - 13517680
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| || |  || ||| ||    
T  13517288 aaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaaggacctgtcatgag 13517387  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
      |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  13517388 ttttgaattgagactgatattgatattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 13517487  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13517488 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacgttagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 13517586  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  13517587 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggacctaggctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 13517680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Original strand, 4538853 - 4539247
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  4538853 aaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgag 4538952  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  4538953 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 4539052  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539053 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 4539151  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4539152 tattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 4539247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 27492248 - 27491868
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27492248 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27492149  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27492148 tgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27492049  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  27492048 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtagctcgt 27491950  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  27491949 gctatattacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggaccatggctgagggcaggtag 27491868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 26109491 - 26109890
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26109491 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 26109590  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26109591 tgagttttgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacgatttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattat 26109690  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26109691 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacgagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 26109789  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcg-ttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26109790 gctatgttacaccttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgtttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctggg 26109889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 429
Target Start/End: Original strand, 16937100 - 16937494
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  16937100 aaatatagattgagattgacttgacatcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgag 16937199  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  16937200 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 16937299  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16937300 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 16937398  T
Q  334 tatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| ||||||||| ||| || || | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||    
T  16937399 tattacacattctcggagattctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtgacttgctgggg 16937494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 27014833 - 27014435
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27014833 gacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27014734  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27014733 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcagtatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27014634  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27014633 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 27014535  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  27014534 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcgactcgctgggg 27014435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 28167603 - 28167205
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  28167603 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 28167504  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  28167503 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 28167404  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28167403 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 28167305  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28167304 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 28167205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 30551070 - 30551456
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  30551070 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagataaaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 30551169  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  30551170 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 30551269  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30551270 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagatatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 30551368  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30551369 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagctatgc 30551456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29580143 - 29579763
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  29580143 gacaaaatacagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 29580044  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  29580043 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 29579944  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  29579943 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggcccgt 29579845  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  29579844 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtag 29579763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4532403 - 4532005
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4532403 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4532304  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  4532303 tgagtgttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 4532204  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  4532203 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcga 4532105  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4532104 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggctggtagctatgcaacttgctgggg 4532005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 27355173 - 27355571
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27355173 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcaaaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27355272  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27355273 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27355372  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  27355373 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 27355471  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  27355472 gctatattacacattcttggaaatcctctatggagatgacgtcgttgggggacgtatcggagccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 27355571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28214569 - 28214193
Alignment:
Q  38 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 137  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || |||    
T  28214569 atagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatt 28214470  T
Q  138 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  28214469 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 28214370  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28214369 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 28214271  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28214270 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 28214193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 404
Target Start/End: Original strand, 26665727 - 26666100
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26665727 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 26665826  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26665827 tgagtattgaattgagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 26665926  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26665927 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 26666025  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggg 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  26666026 gctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgaggg 26666100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 30 - 404
Target Start/End: Original strand, 26771698 - 26772071
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  26771698 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaagttagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 26771797  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26771798 tgagtattgaattgagactgatgttgacgttggaaatgtgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 26771897  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26771898 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 26771996  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggg 404  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  26771997 gctatatgacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgaggg 26772071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 14138501 - 14138877
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  14138501 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 14138600  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||           
T  14138601 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgca------- 14138693  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14138694 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 14138789  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14138790 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgc 14138877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 27064600 - 27064214
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27064600 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaactgaaaggcagaaattgaccgataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27064501  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||           
T  27064500 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcatgtaatatgca------- 27064408  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
       || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27064407 ---tgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 27064312  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||    
T  27064311 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggctgagggcaggcaagtatgcgacttgctgg 27064214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16681268 - 16680870
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |    
T  16681268 gacaaaatatagattgagattgacttgacatcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgata 16681169  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16681168 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16681069  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  16681068 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacatagtggctcgt 16680970  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||||    
T  16680969 gctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgggg 16680870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 8898765 - 8899165
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttga 127  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||  || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  8898765 gacaaaatataggttgagattgacttgacatcgatttggtttgaaaggtagaaattaagactgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctga 8898864  T
Q  128 cataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatt 227  Q
    ||| || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  8898865 catgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatt 8898964  T
Q  228 atgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctc 327  Q
    |||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8898965 atgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctc 8899063  T
Q  328 gtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| | ||||||||| ||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||  | |||||||    
T  8899064 gtgctatgttacacattctcggagatcctctatggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatgtaacttgctgg 8899163  T
Q  428 gg 429  Q
    ||    
T  8899164 gg 8899165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 4780020 - 4779624
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  4780020 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 4779921  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4779920 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacggtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 4779821  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  || | ||||||||||||||||||||    
T  4779820 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagaattttgggcacgtagtggctcgt 4779722  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  4779721 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcgggacctaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 4779624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4764861 - 4764473
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  4764861 gacaaaatatagattgagattgacttaacgtcgattcgaattgaaaggcagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 4764762  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||         
T  4764761 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattgaaaatgcaatatacacggaggatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgt---- 4764666  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
          ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4764665 ------atgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 4764573  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  4764572 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 4764473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20175666 - 20175335
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgac 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  20175666 acaaaatacagattgaaattgacttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtc 20175567  T
Q  129 ataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    |||  |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  20175566 atagacattgaattgagatagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgatta 20175467  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20175466 tgcatgtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcg 20175374  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagata 367  Q
    |||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  20175373 tgctacgtcacacattcctgggaatcctctttggagata 20175335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 367
Target Start/End: Original strand, 22160325 - 22160656
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaatt--gaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgac 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| |    
T  22160325 acaaaatacagattgaaattgacttgacattgatctgatttggaaggtagaaattttgaccaataacattggctcacaaggctttgacagagaaattgtc 22160424  T
Q  129 ataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    |||  |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  22160425 atagacattgaattgagatagatattgacattgggaatgcaaaatgcatggatgatataatagttttattaaatgcatgggcacatagtatgcatgatta 22160524  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || | | |||||||||||||| ||||||||| | |||||| | |||||||        ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  22160525 tgcatgtacgaatgcttgaaatgcacgatggttggtaatttgta-agacagttt------ttcagacgagacatcggagtattgagcacgtagtggctcg 22160617  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagata 367  Q
    |||||  |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  22160618 tgctacgtcacacattcctgggaatcctctttggagata 22160656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 34457699 - 34457972
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| || ||    
T  34457699 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaacgc 34457798  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34457799 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacatagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 34457897  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  34457898 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 34457972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 414
Target Start/End: Original strand, 27622905 - 27623172
Alignment:
Q  139 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| || ||    
T  27622905 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgtat 27623004  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27623005 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctacatc 27623103  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagcta 414  Q
    |        | |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||    
T  27623104 a--------tagaaatcctctttggagataacgccgttgggagacgtaccagaaccatggctgagggtagatagcta 27623172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 34457604 - 34457690
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34457604 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 34457690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 110
Target Start/End: Original strand, 27622563 - 27622643
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagat 110  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27622563 gacaaaatatatattgaaagtgacttgacgtcgatttaatttgaaaagtagaaattgaccaatattattggctcacaagat 27622643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 4755772 - 4755824
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaa 82  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  4755772 gacaaaatatagattgaggttgacttgacgtcgacttgaattgaaaggtagaa 4755824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 28)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 21341271 - 21341658
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  21341271 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 21341370  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || | ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21341371 tgagtactgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 21341470  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341471 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 21341570  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341571 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 21341658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 22140025 - 22139626
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  22140025 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgtcagagaacctgaca 22139926  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22139925 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgacataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 22139826  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22139825 gcgtgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgt 22139726  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  22139725 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatacaacttgctgggg 22139626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 18797820 - 18797433
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||||    
T  18797820 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcaatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattgttggcttacaaggttttgacagagaacctgaca 18797721  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    |||| ||||| |||| | |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18797720 taagtattgaattgaaactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatggatggtataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18797621  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797620 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 18797521  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797520 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 18797433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15774685 - 15774286
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  15774685 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcaattcgatttgaaaggtagaaattgaccaataacattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 15774586  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15774585 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgacatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 15774486  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15774485 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagctggtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 15774386  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  15774385 gctacattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 15774286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 14570266 - 14569879
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  14570266 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 14570167  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14570166 tgagtattgagttgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 14570067  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14570066 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgattgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacacagtggctcgt 14569967  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569966 gctatactacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 14569879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16261049 - 16260650
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16261049 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgactaatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16260950  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16260949 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacggtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 16260850  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260849 gcatgtatgaatgcttgttatgcatgactgttggcagtttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 16260750  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16260749 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 16260650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 426
Target Start/End: Original strand, 19910268 - 19910664
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  19910268 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgatcgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 19910367  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19910368 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 19910467  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  19910468 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacacagtggctcgt 19910567  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctg 426  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19910568 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctg 19910664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 27602014 - 27602401
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  27602014 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 27602113  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27602114 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 27602213  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||||    
T  27602214 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacgcagtttcgcagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcggtggctcgt 27602313  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602314 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagctgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 27602401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33249474 - 33249075
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  33249474 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 33249375  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || |||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  33249374 tgagtattgaactgagactgatgttgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 33249275  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33249274 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacaaacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 33249175  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33249174 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccaaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 33249075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 2130369 - 2130768
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  2130369 gacaaagtataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgacattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 2130468  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  2130469 tgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 2130568  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  | ||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2130569 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgctggcgatttgtagacacaattccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtagtggctcgt 2130668  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  2130669 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcagatagctatgcaacttgctgggg 2130768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 19654427 - 19654826
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  19654427 gacaaaatataggttgaaattgacttgacgtcggtttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaagattttgatagagaacctaaca 19654526  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19654527 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaattcaatatgcatggatgatatgacagtttcatcaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 19654626  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19654627 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttgacagttggtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 19654726  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19654727 gctatattacacattcctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacttatcggaaccatgactgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 19654826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 19695227 - 19694828
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  19695227 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 19695128  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  19695127 tgagtattgaattgagactgatattgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacaatttcattaaatgcatggacacgtaatatgcatgattat 19695028  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  19695027 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccgcagagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 19694928  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19694927 gttatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgagagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 19694828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 31361666 - 31361267
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  31361666 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattgttggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 31361567  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaatt-gacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || |||||  |||||  ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  31361566 tgagtattgaaatgagacggatgtttgatattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgatta 31361467  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31361466 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcg 31361368  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctggg 428  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  31361367 tgctatattacacattctcggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctggg 31361268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 98 - 429
Target Start/End: Original strand, 22074081 - 22074412
Alignment:
Q  98 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 197  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||| | || || | |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  22074081 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacataggtatcgaatcgagactgtaattgacattggaaatgcaacatgtatgggtggtataatagttttat 22074180  T
Q  198 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 297  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074181 taaatgtatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 22074280  T
Q  298 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatgg 397  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  22074281 gacattggaatattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctctttggatataacgtcgttgggagacgtatcgggaccatgg 22074380  T
Q  398 ctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22074381 ctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 22074412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 18716592 - 18716194
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  18716592 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 18716493  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18716492 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaagtgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 18716393  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18716392 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 18716294  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18716293 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 18716194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 415
Target Start/End: Original strand, 12085814 - 12086198
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||    
T  12085814 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacaaagaacctgaca 12085913  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  | || |||||| |||  ||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  12085914 tgagtttcgaattgagactgatgttgatgttggaaatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 12086013  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12086014 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 12086112  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 415  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12086113 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 12086198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 29836459 - 29836063
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  29836459 gacaaagtatagattgagattgacttaacgttgattcgatttgaaaggtagaaattgaccggtattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 29836360  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  29836359 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgagcacgtaatatgcatgattat 29836260  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29836259 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 29836161  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  29836160 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgg 29836063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 31482957 - 31483353
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||  |||||    
T  31482957 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaagttttgacagagaacctgaca 31483056  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | |||||||||||||    
T  31483057 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcactgtgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattat 31483156  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  || |||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31483157 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgtcggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 31483255  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31483256 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaatttgctgg 31483353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 33265856 - 33265458
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  33265856 gacaaaatatagattgagattgacttgacgccgatttaaattgaaaagtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 33265757  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  33265756 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatggatggacacgtaatatgcatgattat 33265657  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33265656 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 33265558  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  33265557 gctatattacacattcttggaaatcctctttggaaatgacgtcgttgggagacgtattggaaccatggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgggg 33265458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 44568113 - 44567720
Alignment:
Q  35 aatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagc 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||     
T  44568113 aatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagt 44568014  T
Q  135 attgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
    ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||||| |    
T  44568013 attgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattatgcat 44567914  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgcta 333  Q
    | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||    
T  44567913 gtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagaatattgggcacgtagcggctcgcgcta 44567815  T
Q  334 tatcacaca-ttcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  44567814 tattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggctgaggacaggtagctatgcaacttgctgg 44567720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 9361739 - 9361355
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  9361739 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 9361640  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  9361639 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 9361540  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9361539 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 9361441  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9361440 gctatattacacattcttgaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggggacgtatcgg-accatagctgagggccggtaggtatg 9361355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19681591 - 19681196
Alignment:
Q  32 caaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacata 131  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||     
T  19681591 caaaatgtagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgacatg 19681492  T
Q  132 agcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
    || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||     
T  19681491 agtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgattata 19681392  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||    
T  19681391 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagatcattgggcacgtagtggctcgtg 19681293  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| | |||||||    
T  19681292 ctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggagccaaggctgagggcaggcaggtatgcaacttgctgg 19681196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 153 - 427
Target Start/End: Original strand, 28355161 - 28355434
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  28355161 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaacgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 28355260  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28355261 atgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 28355359  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  28355360 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 28355434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 153 - 410
Target Start/End: Original strand, 19201592 - 19201848
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  19201592 ttgacattggaaatgcgatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggtacgcaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 19201691  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||||||||||  ||||  ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19201692 atgactgttggcagtttgtaagcacaacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 19201790  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggta 410  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  19201791 tcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccacagctgagggcaggta 19201848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Original strand, 22388969 - 22389190
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  22388969 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 22389068  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  | |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22389069 tgagtattgaattgagactgatgtcgacattggaaatgcaacatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 22389168  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatg 251  Q
    || || ||| ||||||| ||||    
T  22389169 gcatgtatgaatgcttgtaatg 22389190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 139 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15775482 - 15775281
Alignment:
Q  139 atttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagtttt-attaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    |||||| | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || | ||||||   || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  15775482 atttgacactgacattgatattggaaatgcaacatgtatggatggtataacaatttttatcagatgtatagacatgtaatatgcatgatcatgcatgcat 15775383  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||| | | || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15775382 gaatgattgaaatgcatgatggttgacagtttgtagacacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtggtggctcgtgctataac 15775284  T
Q  338 aca 340  Q
    |||    
T  15775283 aca 15775281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 19201497 - 19201583
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19201497 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 19201583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 28355066 - 28355152
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    ||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355066 aaacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 28355152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13185 - 12799
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13185 gacaaaatgtaaattgaaactgacttgacgtcgatttgatttgaaagataaaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaacctgaca 13086  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||  |||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13085 tgagtattgggttgaaactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatgggtgatataacagttttatcaaatgtatgggcacgtagtatgcatgattat 12986  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12985 gcatgtatgaatgcttgtaatgtatgactgttggcagttagtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 12886  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    |||| || |||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12885 gctacattacacatccctggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccacggccgagggcaggtagctatg 12799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 153 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2667 - 2410
Alignment:
Q  153 ttgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgc 252  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||   ||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  2667 ttgacattggaaatgcaatatgcatggttgatataacagtttcattaaatgcatggatacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgc 2568  T
Q  253 atgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaa 352  Q
    ||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2567 atgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagcattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacattcttggaaa 2469  T
Q  353 tcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    |||| ||||||||| || | |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  2468 tcctctttggagatgacgttgttgggagacgtgtcggaaccaaagctgagggcaggtag 2410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 2761 - 2676
Alignment:
Q  2 aacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattga 87  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2761 aacatattcactggggattagtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttggtttgaaaggtagaaattga 2676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 3738 - 4137
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  3738 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttggcagagaacctgaca 3837  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  3838 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcgatatgcgtggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 3937  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3938 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgcagtggctcgt 4037  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  4038 gctatattacacattcttggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctaagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 4137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Original strand, 24096 - 24495
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  24096 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaagtagaaattgaccgatgttattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 24195  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  24196 tgagtattgagttgagactgatattgacattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagttttattaaatgcatgggcatgtaatatgcatgattat 24295  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||  | ||||  ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  24296 gcatgtatgaatgcttgtaatgcacgactgctggcgatttgtagacgcagttccgcggagacagacaagacactggagtattgggcacgtaatggctcgt 24395  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24396 gctatattacacattcctggaaattctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctgggg 24495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 30 - 417
Target Start/End: Original strand, 8783 - 9170
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||    
T  8783 gacaaagtataaattgagattgaattgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgaca 8882  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||| | |||||| ||| ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  8883 tgagtattaaattgagactgatattgacattgatgatgcgatatgcatggatgatataacagttttattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 8982  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8983 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 9082  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9083 gctatattacacattcctggacatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatggctgagggcaggtagccatgc 9170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 34010
Alignment:
Q  31 acaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacat 130  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||   |||||    
T  34405 acaaaatataggttgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacccgacat 34306  T
Q  131 aagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatg 230  Q
     || ||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34305 gagtattgagttgagactgttgttgatattggaaatgcaatatgcatgaatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatg 34206  T
Q  231 cgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtg 330  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34205 catgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgatttgtagacacagttccacagagacagacaagacactggagtgttgggcacgcagtggctcgtg 34106  T
Q  331 ctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctg 426  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34105 ctatattacacattcctggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcgggaccatggctgagggcaggtagctatgcaacttgctg 34010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 11082 - 10655
Alignment:
Q  1 aaacatattcactggggattagnnnnnnngacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattgg 100  Q
    |||||||||||||||||||| |       ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  11082 aaacatattcactggggattggtttgtttgacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgactgatattattgg 10983  T
Q  101 ctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa 200  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  10982 ctcacaaggttttgacagagaacctgacatgagtattgaattgagactgatattgttattggaaatgtaatatgcatggatgatataacagattcattaa 10883  T
Q  201 -atgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaaga 299  Q
     ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||   ||| ||| || ||||||||    
T  10882 tatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaagcacgacttcacaggga-agacaaga 10784  T
Q  300 cattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacaca-ttcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggc 398  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  10783 cattagaatattgggcacgtagtggctcgtgctatattacacatttcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtttcggaaccatggc 10684  T
Q  399 tgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  10683 tgaggacaggtagctatgcaacttgctgg 10655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 98 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 28358 - 28043
Alignment:
Q  98 tggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttat 197  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||| | | || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28358 tggctcaccaggtcttgacagagaatttgacacaggtatcgaattgagactgaaattgacatgggaaatgcaacatgtatggatggtataacagttttat 28259  T
Q  198 taaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaa 297  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28258 taaatgtatgggcacgtagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgctgagacagacaa 28159  T
Q  298 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatgg 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28158 gacattggagtattgggcacgtagtggctcgt--tatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatgg 28061  T
Q  398 ctgagggcaggtagctat 415  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28060 ctgagggcaggtagctat 28043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 28419 - 28391
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgac 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28419 gacaaaatatagattgaaattgacttgac 28391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 30 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 13149 - 12751
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  13149 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 13050  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13049 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 12950  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||   ||| | | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12949 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacattagagtattgggcacgtagtggctcgt 12851  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  12850 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcgggacctaggctgagggccggtagctatgcaacttgctgggg 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 8064 - 8460
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  8064 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 8163  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  8164 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacaatttcattaaatgcatgggtacgtaatatgcatgattat 8263  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8264 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 8362  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  8363 gctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcagaaccaaggctgagggcaggtaggtatgcaacttgctgg 8460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 112 - 429
Target Start/End: Original strand, 25774 - 26091
Alignment:
Q  112 ttgacagagaatttgacataagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagca 211  Q
    |||||||||||||||||||| | || || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  25774 ttgacagagaatttgacataggtatcgaattgagactgaaattgacattggaaatgaaagatgtatgggtggtataatagttttatcaaatgtatgggca 25873  T
Q  212 cgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtatt 311  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  25874 catagtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacacacaaaacattggactatt 25973  T
Q  312 gggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25974 gggcacgtagtggctcatgctatatcacacattcttggaaatcctctttggagataacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtag 26073  T
Q  412 ctatgcgatttgctgggg 429  Q
    ||| || | |||||||||    
T  26074 ctaagcaacttgctgggg 26091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 30 - 427
Target Start/End: Original strand, 2299 - 2696
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  2299 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 2398  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  2399 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgatta 2498  T
Q  229 tgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcg 328  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2499 tgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcg 2597  T
Q  329 tgctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgcgatttgctgg 427  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  2598 tgctatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtgtcggaaccatagctgagggcaggtagatatgcaacttgctgg 2696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 245
Target Start/End: Original strand, 23719 - 23935
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  23719 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgattcgatttgaaagatagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 23818  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaa-atgtatgagcacgtagtatgcatgatta 228  Q
    | || ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  23819 tgagtattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagattcattaatatgcatgggtacgtaatatgcatgatta 23918  T
Q  229 tgcgtgcatggatgctt 245  Q
    ||| || ||| ||||||    
T  23919 tgcatgtatgaatgctt 23935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 15067 - 14691
Alignment:
Q  38 atagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataagcatt 137  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| || |||    
T  15067 atagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggatcacaaggctttgacagagaacctgacatgagtatt 14968  T
Q  138 gatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcat 237  Q
    || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  14967 gaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcatgtat 14868  T
Q  238 ggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatc 337  Q
    | ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14867 gaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaagacatcagagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatt 14769  T
Q  338 acacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14768 acacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctat 14691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 158 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 519
Alignment:
Q  158 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  778 attggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgggcactttgtatgcatgattatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgat 679  T
Q  258 ggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgtgctatatcacacattcttggaaatcctt 357  Q
     || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||     
T  678 tgtgggcagcttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtgtctcgtgctatattacacattcccggaaatcctc 579  T
Q  358 tttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatgc 417  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  578 tttggagataacgtcgttgggagacgtatcagaaccatggttgagggcaggtagctatgc 519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 30 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 16709 - 16324
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16709 gacaaaatatagattgagattgacttggcgtcgatttgaattgaaaggcagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 16610  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | || || || |||||| |||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |    
T  16609 tgagtatcgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcacggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattgt 16510  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcagtttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagtattgggcacgtagtggctcgt 329  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| |||   ||| | | || |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16509 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcattttgtaggcacgacttcacgggga-agacaaaacatcagagtattgggcacgtagtggctcgt 16411  T
Q  330 gctatatcacacattcttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgagggcaggtagctatg 416  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16410 gttatattacacattcttggaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggccgagggccggtaggtatg 16324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0685 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0685
Description:

Target: scaffold0685; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 256
Target Start/End: Original strand, 1186 - 1412
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  1186 gacaaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgaattgaaaggtagaaattgaccgatattattggctcacaaggttttgacagagaacctgaca 1285  T
Q  130 taagcattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattat 229  Q
    | ||  |||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1286 tgagttttgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagtttcattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattat 1385  T
Q  230 gcgtgcatggatgcttgaaatgcatga 256  Q
    || || ||| ||||||| |||||||||    
T  1386 gcatgtatgaatgcttgtaatgcatga 1412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 404
Target Start/End: Original strand, 39734 - 40118
Alignment:
Q  33 aaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggt-agaaatt-gaccaatatcattgg-ctcacaagattttgacagagaatttgaca 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||    
T  39734 aaaatatagattgagattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggttagaaatttgaccgatattattggtctcacaaggttttgacagagaacccgaca 39833  T
Q  130 taagca-ttgatttgagattgaaattgacattggaaat-gcaatatgtatgga-tgatataacagtttta-ttaaatgtat-gagcacgtagtatgcatg 224  Q
    | || | |||| |||||| |||  |||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| || | ||||||| ||||||||    
T  39834 tgagtaattgaattgagactgatgttgacattggaaatagcaacatgcatggaatgatataacagtttcaattaaatgcattgggcacgtaatatgcatg 39933  T
Q  225 attatgcgtgcatggatgcttgaaatgcatgatggttggcag-tttgtagacacagtttcgcagagacagacaagacattggagta-ttgggca-cgtag 321  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||  ||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || ||    
T  39934 attatgcatgtatgaatgcttgtaatgcatgactgttggcgtatttgtagacacagttctgcagagacagacaagacactggagtggttgggcaacgcag 40033  T
Q  322 tggctcgtgctatatcacacatt--cttggaaatcctttttggagataacatcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggg 404  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40034 tggctcgtgctatattacacatttcctggaaaatcctctttggagatgacgtcgttgggagacgtatcggaaccatggctgaggg 40118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0477 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0477
Description:

Target: scaffold0477; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 256
Target Start/End: Original strand, 13102 - 13324
Alignment:
Q  34 aaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgacagagaatttgacataag 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| | |||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  13102 aaatatagattgagattgacttggcgtcgatttggtttgaaaggtagaaattgattgatattattggattacaaggctttgacagagaacctgacatgag 13201  T
Q  134 cattgatttgagattgaaattgacattggaaatgcaatatgtatggatgatataacagttttattaaatgtatgagcacgtagtatgcatgattatgcgt 233  Q
     ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  13202 tattgaattgagactgatgttgacattggaaatgcaatatgcatggatgatataacagttccattaaatgcatgggcacgtaatatgcatgattatgcat 13301  T
Q  234 gcatggatgcttgaaatgcatga 256  Q
    | ||| ||||||| |||||||||    
T  13302 gtatgaatgcttgtaatgcatga 13324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 6936 - 6850
Alignment:
Q  30 gacaaaatatagattgaaattgacttgacgtcgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatatcattggctcacaagattttgac 116  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6936 gacaaagtatagattgagattgacttgacgctgatttgatttgaaaggtagaaattgaccaatattattggctcacaaggttttgac 6850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University