View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9863_low_13 (Length: 418)

Name: NF9863_low_13
Description: NF9863
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9863_low_13
NF9863_low_13
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (14-401)||(19920335-19920724)
chr1 (193-391)||(39277593-39277791)
chr1 (197-391)||(30049930-30050124)
chr1 (193-398)||(45822798-45823002)
chr1 (183-312)||(28990535-28990664)
chr1 (183-396)||(10394283-10394496)
chr1 (195-391)||(28990312-28990507)
chr1 (204-391)||(7714194-7714381)
chr1 (183-311)||(39277820-39277948)
chr1 (183-311)||(45823025-45823153)
chr1 (183-398)||(52285203-52285418)
chr1 (204-391)||(16958864-16959047)
chr1 (183-312)||(10394131-10394260)
chr1 (183-311)||(47422099-47422227)
chr1 (183-311)||(36076886-36077014)
chr1 (193-312)||(27334356-27334475)
chr1 (193-366)||(47421902-47422075)
chr1 (208-371)||(15158349-15158511)
chr1 (207-312)||(52285079-52285183)
chr1 (183-311)||(30050153-30050281)
chr1 (227-371)||(10719502-10719646)
chr1 (227-390)||(35814247-35814409)
chr1 (208-312)||(16959075-16959179)
chr1 (183-312)||(49186001-49186130)
chr1 (183-371)||(36077031-36077220)
chr1 (208-311)||(7714410-7714510)
chr1 (227-312)||(10719401-10719486)
chr1 (227-312)||(35814133-35814218)
chr1 (324-371)||(45822960-45823007)
chr1 (362-399)||(15158470-15158507)
chr1 (334-371)||(52285198-52285235)
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (183-391)||(11047136-11047344)
chr3 (193-398)||(52856987-52857192)
chr3 (193-371)||(49220260-49220438)
chr3 (220-391)||(46453032-46453203)
chr3 (204-371)||(31071093-31071259)
chr3 (227-390)||(26246913-26247076)
chr3 (227-389)||(4953284-4953446)
chr3 (183-398)||(28253593-28253806)
chr3 (195-371)||(26988818-26988994)
chr3 (185-311)||(28253446-28253572)
chr3 (227-390)||(43464857-43465020)
chr3 (183-312)||(31070950-31071078)
chr3 (195-312)||(49220127-49220244)
chr3 (197-312)||(18733957-18734071)
chr3 (234-390)||(24244624-24244779)
chr3 (227-312)||(13301884-13301969)
chr3 (227-312)||(13312540-13312625)
chr3 (204-310)||(11046990-11047095)
chr3 (227-311)||(26247108-26247192)
chr3 (227-311)||(46452920-46453004)
chr3 (227-312)||(52857213-52857298)
chr3 (227-312)||(43465049-43465134)
chr3 (227-312)||(24244510-24244595)
chr3 (227-311)||(4953169-4953253)
chr3 (227-312)||(6276103-6276188)
chr3 (205-268)||(18734149-18734212)
chr3 (324-371)||(52857150-52857197)
chr3 (183-235)||(11046928-11046980)
chr3 (324-371)||(18734086-18734133)
chr3 (341-390)||(6276206-6276255)
chr3 (231-311)||(6276284-6276364)
chr3 (362-398)||(43464960-43464996)
chr3 (362-398)||(46453057-46453093)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (183-398)||(4132988-4133203)
chr7 (183-391)||(43392299-43392507)
chr7 (183-311)||(6000480-6000608)
chr7 (227-399)||(26041657-26041828)
chr7 (204-371)||(6000625-6000792)
chr7 (197-391)||(18417375-18417568)
chr7 (183-371)||(8462848-8463036)
chr7 (205-312)||(37691718-37691825)
chr7 (227-390)||(30283963-30284124)
chr7 (204-312)||(32871631-32871740)
chr7 (227-371)||(472744-472888)
chr7 (227-371)||(24846289-24846433)
chr7 (227-363)||(24485722-24485857)
chr7 (227-312)||(8463052-8463137)
chr7 (183-311)||(32389680-32389809)
chr7 (261-391)||(37691853-37691983)
chr7 (227-312)||(472643-472728)
chr7 (227-312)||(26041552-26041637)
chr7 (227-312)||(30284153-30284238)
chr7 (185-312)||(7685218-7685343)
chr7 (219-310)||(16963451-16963542)
chr7 (324-399)||(16963354-16963429)
chr7 (197-273)||(32871883-32871960)
chr7 (184-248)||(16833457-16833521)
chr7 (197-281)||(25731933-25732017)
chr7 (227-312)||(16962889-16962974)
chr7 (227-311)||(24846450-24846534)
chr7 (183-310)||(4132836-4132963)
chr7 (327-398)||(32871761-32871832)
chr7 (227-311)||(24485614-24485698)
chr7 (237-297)||(32389602-32389662)
chr7 (324-371)||(4132983-4133030)
chr7 (324-371)||(16833591-16833638)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (183-398)||(17254597-17254812)
chr4 (195-398)||(24039400-24039603)
chr4 (183-367)||(36215650-36215834)
chr4 (227-398)||(51399261-51399432)
chr4 (197-371)||(29430083-29430257)
chr4 (184-312)||(1113212-1113340)
chr4 (197-312)||(55620208-55620323)
chr4 (197-312)||(55627512-55627627)
chr4 (227-399)||(44304132-44304304)
chr4 (184-310)||(8607778-8607904)
chr4 (183-312)||(24039251-24039380)
chr4 (220-398)||(35016840-35017018)
chr4 (183-371)||(1113356-1113543)
chr4 (227-390)||(14251241-14251404)
chr4 (183-357)||(48018611-48018785)
chr4 (227-357)||(49905773-49905903)
chr4 (197-312)||(29429954-29430067)
chr4 (198-311)||(51024464-51024576)
chr4 (227-312)||(44304027-44304112)
chr4 (227-312)||(14251433-14251518)
chr4 (233-312)||(35016741-35016820)
chr4 (227-312)||(51399453-51399538)
chr4 (204-311)||(55561041-55561148)
chr4 (218-312)||(36215854-36215948)
chr4 (296-398)||(51024598-51024700)
chr4 (183-371)||(43099330-43099513)
chr4 (324-371)||(51399390-51399437)
chr4 (231-312)||(49905934-49906015)
chr4 (342-398)||(17728805-17728861)
chr4 (243-311)||(55561222-55561290)
chr4 (324-371)||(17254592-17254639)
chr4 (324-371)||(17728800-17728847)
chr4 (342-391)||(8607934-8607983)
chr4 (229-310)||(17254490-17254571)
chr4 (334-371)||(35016835-35016872)
chr4 (342-371)||(51024593-51024622)
chr4 (256-312)||(17728728-17728784)
chr4 (362-398)||(29430088-29430124)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (204-398)||(36194778-36194972)
chr8 (227-399)||(10134653-10134825)
chr8 (197-391)||(12654716-12654910)
chr8 (227-398)||(21015083-21015254)
chr8 (183-391)||(31933274-31933481)
chr8 (183-312)||(13557377-13557505)
chr8 (183-391)||(13557141-13557348)
chr8 (204-312)||(12654938-12655046)
chr8 (183-371)||(18847368-18847555)
chr8 (204-312)||(36194649-36194757)
chr8 (197-312)||(31933508-31933623)
chr8 (227-312)||(10134845-10134930)
chr8 (227-371)||(40832181-40832327)
chr8 (195-312)||(18847571-18847688)
chr8 (227-312)||(40832343-40832428)
chr8 (227-312)||(21014977-21015062)
chr8 (324-371)||(21015078-21015125)
chr8 (213-311)||(15271742-15271839)
chr8 (362-399)||(31933420-31933457)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (227-397)||(14662514-14662684)
chr5 (227-398)||(35463714-35463885)
chr5 (204-398)||(18968531-18968723)
chr5 (227-390)||(18508681-18508844)
chr5 (185-363)||(9989959-9990136)
chr5 (197-312)||(8417574-8417689)
chr5 (259-391)||(8417717-8417849)
chr5 (227-312)||(1983486-1983571)
chr5 (227-312)||(17115556-17115641)
chr5 (206-312)||(36207413-36207519)
chr5 (227-312)||(35463607-35463692)
chr5 (184-311)||(9990161-9990292)
chr5 (227-312)||(14662408-14662492)
chr5 (204-281)||(18968770-18968847)
chr5 (324-371)||(35463709-35463756)
chr5 (227-312)||(18508569-18508654)
chr5 (351-399)||(17115488-17115536)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (183-398)||(12702078-12702292)
chr2 (227-390)||(25945871-25946034)
chr2 (235-390)||(36065267-36065422)
chr2 (204-391)||(2217764-2217952)
chr2 (183-312)||(12701928-12702057)
chr2 (183-312)||(12261061-12261190)
chr2 (237-390)||(16203499-16203652)
chr2 (183-312)||(21304329-21304457)
chr2 (227-371)||(38978794-38978937)
chr2 (227-312)||(10373252-10373337)
chr2 (234-371)||(16581389-16581527)
chr2 (227-312)||(16203680-16203765)
chr2 (227-312)||(36065451-36065536)
chr2 (233-390)||(10373066-10373223)
chr2 (221-312)||(25946063-25946154)
chr2 (342-398)||(12260984-12261040)
chr2 (263-308)||(45115029-45115074)
chr2 (204-248)||(2217644-2217688)
chr2 (209-281)||(3568531-3568603)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (227-390)||(26008-26171)
scaffold0220 (227-312)||(26200-26285)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (227-390)||(959168-959330)
chr6 (193-398)||(1211405-1211611)
chr6 (196-311)||(1211633-1211748)
chr6 (231-311)||(959058-959138)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (185-396)||(25405-25617)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (205-309)||(233672-233776)
scaffold0009 (205-279)||(233556-233630)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (14-93)||(14829-14908)
scaffold0075 (100-128)||(13916-13944)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 401
Target Start/End: Original strand, 19920335 - 19920724
Alignment:
Q  14 atcaggatgtagtcatatagatatgatagggtgacatttagaatggttgttaagtcattattttcaatagtatactcattcattatactctagtccagtt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920335 atcaggatgtagtcatatagatatgatagggtgacatttagaatggttgttaagtcattattctcaatagtatactcattcattatactctagtccagtt 19920434  T
Q  114 tgaagatatgagacgcagtcacaattttctttgtaccaacttaacagaacataatgagt--nnnnnnnnnngcttaaatattcaattggtctcttaactt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||  ||||||| || ||||||||    
T  19920435 tgaagatatgagacgcagtcacaattttctttgtaccaacttaacagaacataatgagtaaaaaaaaataggcttaaatgctcaattgatcccttaactt 19920534  T
Q  212 gatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19920535 gatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaagatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttggtctcttatgttaatttaatt 19920634  T
Q  312 cnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggatac 401  Q
    |       ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920635 caaaaaaacgttaagtttagggaccaaacaaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggatac 19920724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 193 - 391
Target Start/End: Original strand, 39277593 - 39277791
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39277593 tcaattggtcccttaacttaatttcaagtatcagtttggtcccataagtaataaaaagtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttggt 39277692  T
Q  293 ctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    |  |||||||||||||||||       ||| ||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39277693 cctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagttgagggaccaaattaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagt 39277791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 391
Target Start/End: Original strand, 30049930 - 30050124
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  30049930 ttggtcccttaactttatttcaagtatcggtttggtctcatatgtaataaaaagtccgtttgagtcccttaactttatttaaagtatcagtttggtcttt 30050029  T
Q  297 tctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    ||||||||||||||||       ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30050030 tctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggatcaaactaatactaattaaataagataagggaccaaactaatactaattaaataagt 30050124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 45822798 - 45823002
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  45822798 tcaattggtcccttaacttaatttcaagtatcaatttggtcccataagtaataaaaagtccgtttaggttccttaactttatttaaagtatcagcttagt 45822897  T
Q  293 ctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtc 392  Q
    |  |||||||||||||||||        || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  45822898 cctttctgttaatttaattcaaaaaat-gttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagtt 45822996  T
Q  393 aaggga 398  Q
    ||||||    
T  45822997 aaggga 45823002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28990664 - 28990535
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  28990664 gcttaaatattcaattggtcccttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaacttcatttaaagta 28990565  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28990564 tcagtttggtcctttctgttaatttaattc 28990535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 183 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10394496 - 10394283
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10394496 gcttaaatgctcaattggttccttaacttgatttcaagtattgttttggtcccataaatattaaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagta 10394397  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||       ||| ||||||| | | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  10394396 tcggtttggtcccttttgttaatttaattcaaaaaatcgttaagtttacggatcaaattaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatattaat 10394297  T
Q  383 taaataagtcaagg 396  Q
    ||||||||| ||||    
T  10394296 taaataagttaagg 10394283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 195 - 391
Target Start/End: Original strand, 28990312 - 28990507
Alignment:
Q  195 aattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtct 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||     
T  28990312 aattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgcttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtctggtcc 28990411  T
Q  295 cttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
     || ||||||||||||||       ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28990412 tttttgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaact-atactaattaaataagt 28990507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 204 - 391
Target Start/End: Original strand, 7714194 - 7714381
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  7714194 cttaacttgattttaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagtctgtctaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttggtcctttctgtta 7714293  T
Q  304 atttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    |||||||||       ||| || |||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  7714294 atttaattcaataaaacgttaattttaaggaccaaactaatactaattaaataagctaagggactaaaataatactaattaaataagt 7714381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 39277948 - 39277820
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39277948 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagtccgtttaggtcccttaactttatttaaagta 39277849  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  39277848 tcggtttggtcctttctgttaatttaatt 39277820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45823153 - 45823025
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45823153 gcttaaatgttcaattgatcccttaacttgatttcaaatattggtttggtcccataagtaataaaaagtccgtttaggtcccttaactttatttaaagta 45823054  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  45823053 tcggtttggtcctttctgttaatttaatt 45823025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 183 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 52285418 - 52285203
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  52285418 gcttaaatgttcttttggtcccttaacttgattttaagtatcaatttggtcctataagtaataaaaggtctgtttaggtcccttaactttatttaaagta 52285319  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||         || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |    
T  52285318 tccgtttggtcatttctgttaatttaatttaaaaaattgttaagtttagggaacaaactaatactaattaaataagctaagagaccaaactaatactaat 52285219  T
Q  383 taaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||| ||||||    
T  52285218 taaataagttaaggga 52285203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 391
Target Start/End: Original strand, 16958864 - 16959047
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    ||||||||    
T  16958864 cttaacttgatttcaagtgtcggtttggtcccataaataataaaaggtccatttaggtcccttaactttatttaaattatcagtttgg----ttctgtta 16958959  T
Q  304 atttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    |||||||||       ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16958960 atttaattcaaaaaagcgttaagtttagggactaaactaatactaattaaataaaataagggacaaaactaatactattaaaataagt 16959047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 10394131 - 10394260
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||     
T  10394131 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggttcgtttagatcccttaactttatttaaagta 10394230  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  10394231 tcggtttggtcctttctgttaatttaattc 10394260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47422227 - 47422099
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  47422227 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataagaggtctgtttaggtcccttaactttatttaaagta 47422128  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    || ||||||||  ||||||||||||||||    
T  47422127 tcggtttggtcatttctgttaatttaatt 47422099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 36076886 - 36077014
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||     
T  36076886 gcttaaatgtttaattgttcccttaacttgatttcaagtatcggcttgatcccataagtaataaaaggttcgtttaggtcccttaactttatttaaagta 36076985  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||    
T  36076986 tcggtttggtctcttctgttaatataatt 36077014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 193 - 312
Target Start/End: Original strand, 27334356 - 27334475
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  27334356 tcaattagtcccttaacttgatttcaagtatcgatttggtctcataagtaataaaagatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtaatggtttggt 27334455  T
Q  293 ctcttctgttaatttaattc 312  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  27334456 cccttctgttaatttaattc 27334475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 193 - 366
Target Start/End: Original strand, 47421902 - 47422075
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  47421902 tcaattggtcccttaacttgatttcaaatatcggtttggtcccataagtaataaaatgtctgtttaggtcccttaactttatttaaattatcagtttggt 47422001  T
Q  293 ctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaaggga 366  Q
    |  || |||||||||  |||       ||| |||| |||| | ||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  47422002 cctttatgttaatttgtttcaaaaaaacgttaagtgtagggatcaaactactactaattaaataagttaaggga 47422075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 371
Target Start/End: Original strand, 15158349 - 15158511
Alignment:
Q  208 acttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaattt 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  15158349 acttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggttcgtttaggtcccttaaatttatttcaagtatcggtttggtccgttctattaattt 15158448  T
Q  308 aattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||        || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15158449 aattcaaaaaat-gttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggatcaaa 15158511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 312
Target Start/End: Original strand, 52285079 - 52285183
Alignment:
Q  207 aacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatt 306  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  52285079 aacttaattttaagtattggtttggtctcataagtaataaaaagtccgtttaggt-ccttaactttatttaaagtatcagtttgatcctttctgttaatt 52285177  T
Q  307 taattc 312  Q
    ||||||    
T  52285178 taattc 52285183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30050281 - 30050153
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||  ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||     
T  30050281 gcttaaatgttcttttggtccattaacttgatttcaagtatcggtttggtcgcacaagtaataaaaagtccgattatgtctcttaactttatttaaagta 30050182  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  30050181 tcaatttggtcatttctgttaatttaatt 30050153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10719646 - 10719502
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||        || |||    
T  10719646 tttggttccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaatgttaag 10719547  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  10719546 tttagggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaa 10719502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35814409 - 35814247
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||        | | |||    
T  35814409 tttggtcccttaagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttgatcctttctgataatttaatt-aaaaaaacattaag 35814311  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||    
T  35814310 tttagggaccaaactaatattaattaaataagttaagggagaaaactaataccaattaaataag 35814247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16959179 - 16959075
Alignment:
Q  208 acttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaattt 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  || ||| |||||    
T  16959179 acttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaattatgtttaggtcccttaactttatttaaagcatcagtttgatcctttatgtcaattt 16959080  T
Q  308 aattc 312  Q
    |||||    
T  16959079 aattc 16959075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 49186001 - 49186130
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  49186001 gcttaaatgctcaattagttccttaacttgatttcaagtatcagtttggtcttataagtaataaaaggtccgtttacgtcctttaactttatttaaagta 49186100  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||    
T  49186101 atggtttggtcacttctgttaatttaattc 49186130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36077220 - 36077031
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  || |||||||| | |||||||||||||||||     
T  36077220 gcttaaatgctcaattagttccttaacttgatttcaagtatcggtttgctcccataagtaataaaaggtctgtttaggttcattaactttatttaaagta 36077121  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt-cnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
        ||| ||| ||| ||||| |||||||         ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36077120 atgtttttgtcccttatgttattttaattaaaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaattaagttaagggaccaaa 36077031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7714510 - 7714410
Alignment:
Q  208 acttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaattt 307  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||    
T  7714510 actttatttcaaatatcggtttagtctcat--gtaataaaaagtccgtttaggtcccttaagtttatttaaa-tatcagtttggtcctttctgttaattt 7714414  T
Q  308 aatt 311  Q
    ||||    
T  7714413 aatt 7714410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 10719401 - 10719486
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  || ||||||||||||||    
T  10719401 tttggtcccataaataataaaaggtccgttttggccccttaactttattaaaagtatcggtttggtcctttttgttaatttaattc 10719486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 35814133 - 35814218
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| | ||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  35814133 tttggttccataagtaataaaaggtccgttttgctcccttaactttagtgaaagtgtcggtttggtcctttctattaatttaattc 35814218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 45822960 - 45823007
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45822960 aagttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 45823007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 399
Target Start/End: Original strand, 15158470 - 15158507
Alignment:
Q  362 agggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  15158470 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggat 15158507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52285235 - 52285198
Alignment:
Q  334 accaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52285235 accaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 52285198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11047344 - 11047136
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11047344 gcttaaatgttcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagta 11047245  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |    
T  11047244 ttagtttggtcatttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagctaagggaccaaattaatactaat 11047145  T
Q  383 taaataagt 391  Q
    |||||||||    
T  11047144 taaataagt 11047136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 52856987 - 52857192
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  52856987 tcaattggtcccttaacttaatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttagataccttaactttatttaaagtatcggtttggt 52857086  T
Q  293 ctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtc 392  Q
    |  |||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  52857087 cctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagtt 52857186  T
Q  393 aaggga 398  Q
    ||||||    
T  52857187 aaggga 52857192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 49220438 - 49220260
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  49220438 tcaattggtcccttaacttaatttcaagtatcggtttggtcccataaataataaaaagtctgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagcttggt 49220339  T
Q  293 ctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |  |||||||||||||||||       ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49220338 cctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 49220260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 220 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 46453203 - 46453032
Alignment:
Q  220 gtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnn 319  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  || ||||||||||||||           
T  46453203 gtattgttttggtctcataagtaataaaaagtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttagtcctttatgttaatttaattcaaaaaaa 46453104  T
Q  320 cgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46453103 cgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagt 46453032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 204 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31071259 - 31071093
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  31071259 cttaacttgatttcaagtatcggtttgatcccataaataataaaaggtctgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttggtcatttctgtta 31071160  T
Q  304 atttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||||||       ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31071159 atttaattcaaaaaagcgttaagtttagg-accaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 31071093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 26246913 - 26247076
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  26246913 tttggtcccgtaagtaataaaatgtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 26247012  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26247013 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaaaggaccaaactaatactaattaaataag 26247076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 227 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4953446 - 4953284
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||| ||||| |||||||       ||| |||    
T  4953446 tttggtcccataagtaataaaaagtctgtttaagtcccttaactttatttaaagtgtcggtttggtcctttccgttaacttaattcaaaaaaacgttaag 4953347  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataa 389  Q
    |||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  4953346 tttagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggatcaaactaatactaattaaataa 4953284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 28253806 - 28253593
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  28253806 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggattggtcccataaataataaaaggtctgattaagtcccttaactttatttaaagta 28253707  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||||         | ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||  |    
T  28253706 tcagtttgatcatttctgttaatttaattcaaaaaaa-tttaagtttagggatcaaactaatact-attaaataagataagggaccaaaataatactgat 28253609  T
Q  383 taaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||| ||||||    
T  28253608 taaataagttaaggga 28253593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 371
Target Start/End: Original strand, 26988818 - 26988994
Alignment:
Q  195 aattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtct 294  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||     
T  26988818 aattggtcccttaactttatttcaagtatcagttttgtcccataagtaataaaatgtccttttaggtcccttaactttatttaaagtatgggtttggtcc 26988917  T
Q  295 cttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||| ||||||||||||        ||| || |||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26988918 cttcagttaatttaatttaaaaaaacgttaaatttagggaccaaattaatactaattaaataagttaagggatcaaa 26988994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 185 - 311
Target Start/End: Original strand, 28253446 - 28253572
Alignment:
Q  185 ttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttc 284  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  28253446 ttaaatgttcaattggtcccttaacatgatttcaagtatcagattggtcccaaaagtaataaaaagttcgtttaagtcccttaactttatttcaagtatc 28253545  T
Q  285 agtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
     |||||||| |||||||||||||||||    
T  28253546 ggtttggtcccttctgttaatttaatt 28253572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 43464857 - 43465020
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnnc-gtgaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | ||  |||||||||||||||||         || ||    
T  43464857 tttggtcccataagtaataaaaggtccggttaggtcccttaactatatttaaagtatcggtt-gatcctttctgttaatttaattcaaaaaaaatgttaa 43464955  T
Q  326 gtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43464956 gtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataag 43465020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 31070950 - 31071078
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  31070950 gcttaaatgttcttttggtcccttaacttgattttaagtatcagtttggtcccataagtaataaaagatccgtttaagtcccttaactttattt-aagta 31071048  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||||||||||  || |||||||| |||||    
T  31071049 tcagtttggtcctttttgttaattcaattc 31071078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Original strand, 49220127 - 49220244
Alignment:
Q  195 aattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtct 294  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||      
T  49220127 aattggtcccttaacttgattttaagtatcggtttagtcccataaataataaaaagtccgtttaggtcctttaactttatttaaattatcggtttggtgc 49220226  T
Q  295 cttctgttaatttaattc 312  Q
     |||||||||||||||||    
T  49220227 tttctgttaatttaattc 49220244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Original strand, 18733957 - 18734071
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||   |    
T  18733957 ttggtctcttaacttgatttcaagtatcagtttggtcccataa-tagtaaaaagtctgtttaagtcccttaactttatttaaagtatcagtttcgttctt 18734055  T
Q  297 tctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  18734056 tctgttaatttaattc 18734071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 234 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 24244779 - 24244624
Alignment:
Q  234 ccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttagga 333  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||        | | |||||||||     
T  24244779 ccataagtaataaaaggtccgtttagatcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcatttctgttaatttaatt-taaaaaacattaagtttaggg 24244681  T
Q  334 accaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24244680 accaaattaatactaattaaataagttaaggcaccaaactaatactaattaaataag 24244624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13301969 - 13301884
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13301969 tttggtcccgtaagtaataaaagatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattc 13301884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13312625 - 13312540
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13312625 tttggtcccgtaagtaataaaagatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattc 13312540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 204 - 310
Target Start/End: Original strand, 11046990 - 11047095
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||| | |||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||    
T  11046990 cttaacttgatttcatgtatcggtttggtcccataagaaataaaaggtccctttaggt-ctttaactttatttcaagtatcggtttggtcccttctgtta 11047088  T
Q  304 atttaat 310  Q
    |||||||    
T  11047089 atttaat 11047095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26247192 - 26247108
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26247192 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggtctcttaactttattgaaagtatcagtttggtcctttctgttaatttaatt 26247108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 46452920 - 46453004
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46452920 tttggtcccttaagtaataaaaggtccgttttgatcccttaactttatttaaagtaacagtttggtcccttctgttaatttaatt 46453004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 52857298 - 52857213
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52857298 tttggtcccttaaataaaaaaaagttcgtttaggtcccttaactttatttaaagtaacggtttggtcccttctgttaatttaattc 52857213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43465134 - 43465049
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  43465134 tttggtcccataagtaataaaatgtccgttttggtccattaactttattgaaattatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 43465049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 24244510 - 24244595
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  || | ||||||||||||    
T  24244510 tttgatcccataagtaataaaagatctgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttatattaatttaattc 24244595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 4953169 - 4953253
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||  || |||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||    
T  4953169 tttggtcccttaagtaataaaaggtccaatttggtcccttaactttatttaaagtaatggtttggtcccttctgttaatttaatt 4953253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 6276103 - 6276188
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||    
T  6276103 tttgatccaataagtaataaaaggtccgtttagatcccaaaactttatttaaagtatcagtttgatcctttcggttaatttaattc 6276188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18734212 - 18734149
Alignment:
Q  205 ttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaa 268  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  18734212 ttaactttattttaagtatcggcttggtcccttaagtaataaaaagtctgtttaggtcccttaa 18734149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 52857150 - 52857197
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52857150 aagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 52857197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 235
Target Start/End: Original strand, 11046928 - 11046980
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtccc 235  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  11046928 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcatgtatcggtttggtccc 11046980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18734133 - 18734086
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18734133 aagtttagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 18734086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 390
Target Start/End: Original strand, 6276206 - 6276255
Alignment:
Q  341 aaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  6276206 aaatactaattaaataagttaagggatcaaactaatgttaattaaataag 6276255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 6276364 - 6276284
Alignment:
Q  231 gtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    |||||| || ||||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  6276364 gtcccacaattaataaaatgtctgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttgatcatttctgttgatttaatt 6276284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 398
Target Start/End: Original strand, 43464960 - 43464996
Alignment:
Q  362 agggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  43464960 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 43464996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 46453093 - 46453057
Alignment:
Q  362 agggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46453093 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 46453057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 4133203 - 4132988
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4133203 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtattggtttgatctcataagtaataaaatgtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtg 4133104  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||       ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  4133103 tcagtttggtcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttatggaccaaactaatactaattaaaaaagttaagggaccaaactaatactaat 4133004  T
Q  383 taaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||| ||||||    
T  4133003 taaataagttaaggga 4132988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 183 - 391
Target Start/End: Original strand, 43392299 - 43392507
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43392299 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataaatattaaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaaata 43392398  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||        || ||||||| | | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  43392399 tcggtttggtcccttttgttaatttaattcaaaaaaatgttaagtttacggaacaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaat 43392498  T
Q  383 taaataagt 391  Q
    |||||||||    
T  43392499 taaataagt 43392507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Original strand, 6000480 - 6000608
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  6000480 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagtccatttaggtcccttaactttatttaaagta 6000579  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6000580 tcagtttggtcctttctgttaatttaatt 6000608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 26041828 - 26041657
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||||       ||| |||    
T  26041828 tttggtcctataagtaataaaaggtttgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatct-ttatgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 26041730  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  26041729 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggat 26041657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6000792 - 6000625
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    ||||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| |||    
T  6000792 cttaatttaatttcaagtatcagtttggtcctataagtaataaaaagtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatccgttaggtcctttctctta 6000693  T
Q  304 atttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||||||       ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6000692 atttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaatggaccaaa 6000625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 197 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18417568 - 18417375
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  18417568 ttggtcccttaactttatttcaagtatcggtttgatcctataaataataaaaggtccatttaggtcccttaactttatttaaagtatcaatttggtcctt 18417469  T
Q  297 tctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    ||  |||||||||||        ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  18417468 tccattaatttaatttaaaaaaacgttaagtttagggactaaactaatactaattaaataagttaaggg-tcaaactaatactaattaaataagt 18417375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 8462848 - 8463036
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||| ||| |||||||  || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||     
T  8462848 gcttgaatgttcaatttatcccttaacttgatttcaaatatcagtttggtcccataaataataaaatgtctgtttaggtcctttaactttatttaaagta 8462947  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |  ||||| ||  |||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  8462948 ttggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaaaagaccaaa 8463036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 205 - 312
Target Start/End: Original strand, 37691718 - 37691825
Alignment:
Q  205 ttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaa 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  37691718 ttaacttgatttcaagtatcggtttgattccataagtaataaaaagtccgattaagtcccttaattttatttaaagtatcactttggtcttttctgttaa 37691817  T
Q  305 tttaattc 312  Q
    ||||||||    
T  37691818 tttaattc 37691825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 30283963 - 30284124
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||  || ||||||||||||||       ||| |||    
T  30283963 tttggtctcataagtaataaaaggtccgtttag-tcccttaacttcatttaaagtatcggtttgatcctttttgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 30284061  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30284062 tttagggaccaaacta-tactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataag 30284124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 204 - 312
Target Start/End: Original strand, 32871631 - 32871740
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaa-tccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtt 302  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||   || ||||    
T  32871631 cttaacttgattttaagtattggtttggtcccataaataataaaaaaatctgtttaggtcccttaactttatttaaagtatgagtttggttctttatgtt 32871730  T
Q  303 aatttaattc 312  Q
    ||||||||||    
T  32871731 aatttaattc 32871740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 472888 - 472744
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||       ||| ||     
T  472888 tttggtcccataagtaatgaactgtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaac 472789  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  472788 tttagggaccaaactaatactaattaaataagataagggaccaaa 472744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 24846289 - 24846433
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  || |||||||||||||        ||| |||    
T  24846289 tttggtctcataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttgatcatttatgttaatttaattaaaaaaaacgttaag 24846388  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  24846389 tttatgaaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaa 24846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24485857 - 24485722
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||         || |||    
T  24485857 tttggtcccataagtaataaaaagtccgtttaagtcccttaactttatttaaagtgtcggtttggtcctttctattaatttaatt-aaaaaaatgttaag 24485759  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaag 363  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24485758 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaag 24485722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8463137 - 8463052
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8463137 tttgatcccttaaataataaaaattccgtttagatcccttaactttatttaaagtaacagtttggtctcttctgttaatttaattc 8463052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 32389809 - 32389680
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaactt-gatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagt 281  Q
    |||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32389809 gcttaaatgttcaattggtcctttgactttgatttcaagtatcagtttggtccaataagtaataaaatgtctgtttaagtcccttaactttatttaaagt 32389710  T
Q  282 ttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
     |||||||| ||  || |||||||||||||    
T  32389709 atcagtttgatcctttttgttaatttaatt 32389680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37691983 - 37691853
Alignment:
Q  261 tcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaatt 360  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||        || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |    
T  37691983 tcccttaactttatttaaagtatcagtttggtcctttcagttaatttaattcaaaaaaatgttaagtttaaggaccaaactaatactaattaaataagat 37691884  T
Q  361 aagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37691883 aagagaccaaactaatactaattaaataagt 37691853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 472643 - 472728
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  472643 tttggtctcataagtaataaaaggtgcgtttaggtcccttaactttattgaaagtatcagtttggtcctttctgttaatttaattc 472728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 26041552 - 26041637
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  26041552 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 26041637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30284238 - 30284153
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  30284238 tttggtctcataagtaataaaatgtccgtttaggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcatttctgttaatttaattc 30284153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 312
Target Start/End: Original strand, 7685218 - 7685343
Alignment:
Q  185 ttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttc 284  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||||||| |||    
T  7685218 ttaaatatttaattggtcccttaatttgatttcaagtatcggtttaatcttataagtaataaaatatctgtttaagttccataactttatttaaag-ttc 7685316  T
Q  285 agtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7685317 ggtttgatct-ttctgttaatttaattc 7685343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16963542 - 16963451
Alignment:
Q  219 agtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaat 310  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  16963542 agtattgctttgttcccataagtaataaaatgtccattttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcttttctgttaatttaat 16963451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 324 - 399
Target Start/End: Original strand, 16963354 - 16963429
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  16963354 aagtttaaggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagagaagggat 16963429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 197 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32871960 - 32871883
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaat-aaaaaatccgtttaggtcccttaacttta 273  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32871960 ttggtctcttaatttgatttcaagtatcgatttggtcccataaataataaaaaaatccgtttaggtcacttaatttta 32871883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 16833457 - 16833521
Alignment:
Q  184 cttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaa 248  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16833457 cttaaatgtttaattgatcccttaacttgatttcaagtattggtttggtcctataagtaataaaa 16833521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 281
Target Start/End: Original strand, 25731933 - 25732017
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagt 281  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||| |||| ||||    
T  25731933 ttggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttagtcccataagtaataaaaggtctgcttagatcccttaacttgatttcaagt 25732017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 16962889 - 16962974
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |   || ||||||||||||||    
T  16962889 tttggtctcataagtaataaaaggtccgtttaggtccattaactttatttaaagtatcattttgattctttatgttaatttaattc 16962974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24846534 - 24846450
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||||  |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||    
T  24846534 tttggttccataaataataaaaggtccgttttagtcccttaactttattgaaagtattggtttggtcctttctgttaatttaatt 24846450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 310
Target Start/End: Original strand, 4132836 - 4132963
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||| || |||  |  | ||| ||||||||||||||  |   ||| |||||||||||||||||| ||||     
T  4132836 gcttaaatgttgaattggtcccttaacttgattttaattatcaggctagtctcataagtaataaaaggtttattttggtcccttaactttatttcaagta 4132935  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaat 310  Q
    || ||||| || ||| ||||||||||||    
T  4132936 tcggtttgatcccttatgttaatttaat 4132963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 32871832 - 32871761
Alignment:
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  32871832 tttagggactaaactaatactaattaaataagataagagaccaaactaatactaatgaaataagttaaggga 32871761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 311
Target Start/End: Original strand, 24485614 - 24485698
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| |||||||||||    
T  24485614 tttggtcctttaagtaataaaatgtccgatttagtcccttaactttatttaaagtaatggtttggtcccttctattaatttaatt 24485698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 297
Target Start/End: Original strand, 32389602 - 32389662
Alignment:
Q  237 taagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctctt 297  Q
    ||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  32389602 taagtaataaaaggttcgtttaagtcccttaactttatttaaagtaacggtttggtctctt 32389662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4133030 - 4132983
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4133030 aagttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 4132983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16833638 - 16833591
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16833638 aagtttagggaccaaactaataccaattaaataagttaagggaccaaa 16833591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 183 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17254812 - 17254597
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17254812 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtattggtttgatctcataagtaataaaatgtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtg 17254713  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||       ||| || |||| | ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  17254712 tcagtttggtcttttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaaatttatggaccaaactaatactaattaaaaaagttaagggaccaaactaatactaat 17254613  T
Q  383 taaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17254612 taaataagttaaggga 17254597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 195 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 24039603 - 24039400
Alignment:
Q  195 aattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtct 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  ||     
T  24039603 aattggtcccttaacttgatttcaagtattggtttggtctcataagtaataaaaggttcgtttaggtcccttaactttattttaagtatcggtttaatca 24039504  T
Q  295 cttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaa 394  Q
     || ||||||||||||||       ||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||    
T  24039503 tttatgttaatttaattcaaaaaagcgttaagtttagggacgaaactaatactaattaaataagttaagggaccaatctaacactaattaaataagttaa 24039404  T
Q  395 ggga 398  Q
    ||||    
T  24039403 ggga 24039400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 183 - 367
Target Start/End: Original strand, 36215650 - 36215834
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  36215650 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttaatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttagattccttaactttatttaaagta 36215749  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggac 367  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||||       ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36215750 tcggtttggtcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagataccaaactaatactaattaaataagttaagggac 36215834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 398
Target Start/End: Original strand, 51399261 - 51399432
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||        || ||     
T  51399261 tttggtcccataagtaataaaaagtctgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattcaaaaaaaagttaaa 51399360  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  51399361 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 51399432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29430257 - 29430083
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||  |    
T  29430257 ttggtcccttaacttgattttaagtattggtttggtcccataagtaataaaaggtatgtttagatcccttaattttatttaaagtatcagttcggtcctt 29430158  T
Q  297 tctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29430157 tctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 29430083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 312
Target Start/End: Original strand, 1113212 - 1113340
Alignment:
Q  184 cttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagttt 283  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1113212 cttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcgggttggtcccataagtaataaaaagtctgtttaggtcccttaactttatttaaagtat 1113311  T
Q  284 cagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1113312 cagtttggtcgtttctgttaatttaattc 1113340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Original strand, 55620208 - 55620323
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  55620208 ttggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagtctgtttaggtcccttaactttattaaaagtatcagtttggtcctt 55620307  T
Q  297 tctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  55620308 tctgttaatttaattc 55620323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Original strand, 55627512 - 55627627
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |    
T  55627512 ttggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagtctgtttaggtcccttaactttattaaaagtatcagtttggtcctt 55627611  T
Q  297 tctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  55627612 tctgttaatttaattc 55627627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 44304304 - 44304132
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  || ||||||||||||||        || |||    
T  44304304 tttggtgccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttatgttaatttaattcaaaaaaatgttaag 44304205  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    |||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  44304204 tttaaggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggat 44304132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 310
Target Start/End: Original strand, 8607778 - 8607904
Alignment:
Q  184 cttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagttt 283  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  8607778 cttaaatgctcaattggtctcttaacttgatttcaagtatcggtttgatcccataagtaataaaaggtccgtttaagtcccttaactttatttaaagtat 8607877  T
Q  284 cagtttggtctcttctgttaatttaat 310  Q
    | ||||| ||  |||||||||||||||    
T  8607878 cggtttgatcctttctgttaatttaat 8607904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 24039251 - 24039380
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  24039251 gcttaaatgttcaattgatcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagttcgtttaggtcctttaattttatttaaagta 24039350  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    || ||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  24039351 tcggtttgatcttttctattaatttaattc 24039380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 220 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35017018 - 35016840
Alignment:
Q  220 gtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnn 319  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||           
T  35017018 gtattgctttggtcccataaataattaaaggtccatttaggtctcttaactttatttaaagtatcagtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaa 35016919  T
Q  320 cgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    ||| || |||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35016918 cgttaaatttagggatcaaactaatactaattaaataagttaagagaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 35016840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1113543 - 1113356
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  || |||||||||||||||||| |||||||||     
T  1113543 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtattgatttggtcccataaatattaaaaggtctgtttaggtcccttaacttcatttaaagta 1113444  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||        || ||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  1113443 tcggtttggtcccttttgttaatttaattcaaaaaacggt-aagtttacggaccaaactaatactaattaaataagttaaaggatcaaa 1113356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 14251241 - 14251404
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||        || |||    
T  14251241 tttggtcctctaagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctattaatttaattcaaaaaaatgttaag 14251340  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||  ||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14251341 tttagcgaccaaattaatactaattgaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataag 14251404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 357
Target Start/End: Original strand, 48018611 - 48018785
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||     
T  48018611 gcttaaatgctcaattggtctcttaacttgatttaaaatatcggtttggtcccaaaagtaataaaatatctgtttagatcccttaattttatttaaagta 48018710  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataa 357  Q
    ||  |||| ||  |||| ||||||||||||        || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  48018711 tcgatttgatcatttctattaatttaattcaaaaaaatgttaagtttaaggaccaaactaatactaattaaataa 48018785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 227 - 357
Target Start/End: Original strand, 49905773 - 49905903
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||        ||| |||    
T  49905773 tttggtctcataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcatttctgttaatttaattaaaaaaaacgttaag 49905872  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataa 357  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49905873 tttagggaccaaactaatactaattaaataa 49905903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Original strand, 29429954 - 29430067
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  29429954 ttggtcccttaacttgatttcaaatatcggtttggtcc--taagtaagaaaaagtccgtttagatcccctaactttatttaaagtatcaatttggtcttt 29430051  T
Q  297 tctgttaatttaattc 312  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29430052 tctcttaatttaattc 29430067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 311
Target Start/End: Original strand, 51024464 - 51024576
Alignment:
Q  198 tggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctctt 297  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||    
T  51024464 tggtcccttaact-gatttcaagtattgatttggtcccataagtaataaaagtttcgtttaagttccttaacattatttaaagtatcagtttagtccttt 51024562  T
Q  298 ctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||||||||||    
T  51024563 ctgttaatttaatt 51024576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 44304027 - 44304112
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  44304027 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 44304112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14251518 - 14251433
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14251518 tttggtcccataagtaataaaaggtccgtattggtcctttaactttattgaaagtatcagtttggtcctttctgttaatttaattc 14251433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 312
Target Start/End: Original strand, 35016741 - 35016820
Alignment:
Q  233 cccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  35016741 cccataagtaataaaaagtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttcggttaatttaattc 35016820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51399538 - 51399453
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51399538 tttggtcccttaagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttagttaaagtaacggtttggtcccttatgttaatttaattc 51399453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 311
Target Start/End: Original strand, 55561041 - 55561148
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    ||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||||||| |  | | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||    
T  55561041 cttaacttgatttcaaacatcagtttggttccataagtaataaaaagtttgctaaggtctcttaactttatttaaagtatcagttttgttatttctgtta 55561140  T
Q  304 atttaatt 311  Q
    ||||||||    
T  55561141 atttaatt 55561148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36215948 - 36215854
Alignment:
Q  218 aagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||||||  ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36215948 aagtatttatttggtcccttaaataataaaaagtccgtttagttcgcttaactttattgaaagtaacgatttggtcccttctgttaatttaattc 36215854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 51024700 - 51024598
Alignment:
Q  296 ttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaag 395  Q
    |||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||    
T  51024700 ttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagctaagagaccaacctaatactaattaaataaattaag 51024601  T
Q  396 gga 398  Q
    |||    
T  51024600 gga 51024598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 43099330 - 43099513
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||     ||| || ||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  43099330 gcttaaatgctcaattggtctcttaa-----ttttaaatatcggtttgattccataagtaataaaaggtccgtttaggt-ccttaactttatttaaagta 43099423  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnnc-gtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||  |||||||  |||| || ||||||||        | || ||||||||| |  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43099424 tcgttttggtcatttctattgatttaattaaaaaaaactgttaagtttagggattaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 43099513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Original strand, 51399390 - 51399437
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51399390 aagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 51399437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49906015 - 49905934
Alignment:
Q  231 gtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||||||||||| ||| | || ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  49906015 gtcccataagtaataaaatgtccgttttgaccccttaactttattaaaactatcggtttgatcctttctgttaatttaattc 49905934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 17728861 - 17728805
Alignment:
Q  342 aatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||    
T  17728861 aatattaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattatataaattaaggga 17728805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55561290 - 55561222
Alignment:
Q  243 ataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| || | |||||||||||    
T  55561290 ataaaatatctgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggttttatcttttttattaatttaatt 55561222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17254639 - 17254592
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17254639 aagttaagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 17254592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17728847 - 17728800
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17728847 aagttaagggaccaaactaatactaattatataaattaagggaccaaa 17728800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8607983 - 8607934
Alignment:
Q  342 aatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8607983 aatactgattaaataagttaatggatcaaactaatactaattaaataagt 8607934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 310
Target Start/End: Original strand, 17254490 - 17254571
Alignment:
Q  229 tggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaat 310  Q
    ||||| ||||||||||||||  |   ||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| || ||| ||||||||||||    
T  17254490 tggtctcataagtaataaaatgtttattttggtcccttaactttatttcaagtatcggtttgatcccttatgttaatttaat 17254571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35016872 - 35016835
Alignment:
Q  334 accaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35016872 accaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 35016835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 51024622 - 51024593
Alignment:
Q  342 aatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51024622 aatactaattaaataaattaagggaccaaa 51024593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 17728728 - 17728784
Alignment:
Q  256 ttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||||    
T  17728728 ttaggtcccttaattttatttaaggtatcagtttggtcatttctatttatttaattc 17728784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 362 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 29430124 - 29430088
Alignment:
Q  362 agggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29430124 agggaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 29430088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 36194972 - 36194778
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  36194972 cttaacttgattttaagtatcggtttggtcccataaataatcaaaaatccgtttaggtcctttaactttatttaaagtatcagtttggtcctttctgtta 36194873  T
Q  304 atttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    ||||| |||       ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  36194872 atttagttcaaaaatacgttaagtttagggatcaaactaatactaattaaataagttaagggatcaaaccaatactaattaaataagttaaggga 36194778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 227 - 399
Target Start/End: Original strand, 10134653 - 10134825
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  10134653 tttggtcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 10134752  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  10134753 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggat 10134825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 391
Target Start/End: Original strand, 12654716 - 12654910
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  12654716 ttggtcccttaactttatttcaagtgtcggtttggtcccataaataataaaaggtccatttagtttccttaactttatttaaagtatcagtttggtcctt 12654815  T
Q  297 tctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    ||||||||||||||||       ||| ||||||||| || |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12654816 tctgttaatttaattcaaaaaagcgttaagtttagggactaaagtaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagt 12654910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 21015254 - 21015083
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||||       ||| |||    
T  21015254 tttggtcccataagtaataaaaagtctgtttgggtcccttaactttatttaaagtatcggtttggtcctttcttttaatttaattcaaaaaaacgttaag 21015155  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21015154 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 21015083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 183 - 391
Target Start/End: Original strand, 31933274 - 31933481
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||     
T  31933274 gcttaaatgttcttttggtcccttaatttgattttaagtattggtttggtcccataagtaataaaaggtctatttagatcccttaactttatttaaagta 31933373  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||         || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  31933374 tcactttggtcctttctgttaatttaatt-aaaaaaatgttaagtttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagggattaaactaatactaat 31933472  T
Q  383 taaataagt 391  Q
    |||||||||    
T  31933473 taaataagt 31933481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13557505 - 13557377
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  13557505 gcttaaatgttcaactggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaacttcatttaaagta 13557406  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  13557405 tc-gtttggtcttttatgttaatttaattc 13557377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 391
Target Start/End: Original strand, 13557141 - 13557348
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||     
T  13557141 gcttaaatgttcaatcggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggttcgtttaggtcccataactttatt-aaagta 13557239  T
Q  283 tcagtttggtc-tcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactag 381  Q
    || || || || | || ||||||||||||||       ||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||     
T  13557240 tcggtctgatccttttttgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagagaccaaattaatactaattaaataagttaagggaccaaact-atactaa 13557338  T
Q  382 ttaaataagt 391  Q
    ||||||||||    
T  13557339 ttaaataagt 13557348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 204 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12655046 - 12654938
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||| |    
T  12655046 cttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaagttccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatctgtttggtcctttatgtca 12654947  T
Q  304 atttaattc 312  Q
    |||||||||    
T  12654946 atttaattc 12654938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 371
Target Start/End: Original strand, 18847368 - 18847555
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18847368 gcttaaatgctcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcgatt-ggtctcataagtaataaaaggtttgtttatgtcccttaactttatttaaagta 18847466  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    || |||||||| ||| ||||||||||||||       ||| ||| |||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18847467 tcggtttggtcccttatgttaatttaattcaaaaaaccgttaagcttaaagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 18847555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 312
Target Start/End: Original strand, 36194649 - 36194757
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| |||    
T  36194649 cttaacttgatttcaagtatcgttttggtcccataagtaataaaaagtctgtttagatcccttaactttatttaaagtatcagtttgatcctttctatta 36194748  T
Q  304 atttaattc 312  Q
    |||||||||    
T  36194749 atttaattc 36194757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31933623 - 31933508
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||| |||||||  |    
T  31933623 ttggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaagtccatttagatccgctaactttatttaaagtatcaatttggtcctt 31933524  T
Q  297 tctgttaatttaattc 312  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31933523 tctcttaatttaattc 31933508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10134930 - 10134845
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  10134930 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 10134845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Original strand, 40832181 - 40832327
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc--nnnnnnncgtga 324  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||  || ||||||||||||||         ||| |    
T  40832181 tttgatcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaattttatttaaagtatcggtttgatcctttatgttaatttaattcaaaaaaaaacgtta 40832280  T
Q  325 agtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  40832281 agtttagggaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaa 40832327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18847688 - 18847571
Alignment:
Q  195 aattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtct 294  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||| ||  | ||||||||     
T  18847688 aattagtcccttaacttgatttcaagtatcagttttgtcccataagtaataaaaagtctatttaagtcccttaactttgtttaaggtaacggtttggtcc 18847589  T
Q  295 cttctgttaatttaattc 312  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  18847588 cttatgttaattcaattc 18847571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40832428 - 40832343
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  40832428 tttggtcccataagtaataaaagatccgttttgtccccttaactttattaaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 40832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 21014977 - 21015062
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||  ||||||||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21014977 tttggtcctttaagtaataaaaggtttgttttggtcccttaactttatttaaagtaacggtttggtcccttctgttaatttaattc 21015062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21015125 - 21015078
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21015125 aagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 21015078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15271839 - 15271742
Alignment:
Q  213 atttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||| |||||||||| | || ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  15271839 atttcaaatatcgatttggtcacataagtaataaaaaatctatttaggtctcctaattttatttaaaatatc-gtttgatctcttcggttagtttaatt 15271742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 362 - 399
Target Start/End: Original strand, 31933420 - 31933457
Alignment:
Q  362 agggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31933420 agggaccaaactaatactaattaaataagttaagggat 31933457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 227 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 14662684 - 14662514
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  14662684 tttggtcccataagtaataaaaaaaccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 14662585  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggg 397  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14662584 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaagtaaccaaactaatactaattaaataagttaaggg 14662514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 35463885 - 35463714
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||        || ||     
T  35463885 tttggtcccataagtaataaaaagtctgtttcggtcccttaactttatttaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattcaaaaaaatgttaaa 35463786  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35463785 tttagggaccaaactaatactaattaaataagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaaggga 35463714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 398
Target Start/End: Original strand, 18968531 - 18968723
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||     
T  18968531 cttaacttgatttcaagtattggtttggtttcataatcaataaaagatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttggtcccttttgttg 18968630  T
Q  304 atttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||||||||       ||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18968631 atttaattcaaaaaaacgttaagttta-gaaccaagctaatactaattaaataagttaagggaac-aactaatactaattaaatcagttaaggga 18968723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18508844 - 18508681
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||       ||| |||    
T  18508844 tttggtcccataaataataaaaagtctgtttaggttccttaactttatttaaagtatcggtttgatcttttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 18508745  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  18508744 tttagaaatcaaactaatactaattaaataagttaaaagaccaaactagtactaattaaataag 18508681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 185 - 363
Target Start/End: Original strand, 9989959 - 9990136
Alignment:
Q  185 ttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttc 284  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9989959 ttaaatgttcaattggtcccttaacttgattttaagaatcggtttggtcc-ataattaataaaaggtatgtttaggtcccttaactttatttaaagtatc 9990057  T
Q  285 agtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaag 363  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||       ||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  9990058 ggtttgatcccttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggaccaaattaatactaattaaataagttaag 9990136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 197 - 312
Target Start/End: Original strand, 8417574 - 8417689
Alignment:
Q  197 ttggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctct 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |    
T  8417574 ttggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttgatctcacaagtaataaaagttccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtctggtcatt 8417673  T
Q  297 tctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||    
T  8417674 tctgttaatttaattc 8417689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8417849 - 8417717
Alignment:
Q  259 ggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaa 358  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||       ||| ||||||||| || |||| || |||||||||||||     
T  8417849 ggtcccttaattttatttaaagtattagtttggtcctttcagttaatttaattcaaaaaagcgttaagtttagggactaaactaaaactaattaaataag 8417750  T
Q  359 ttaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8417749 ttaaaggaccaaactaatactaattaaataagt 8417717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1983571 - 1983486
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  1983571 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggccccttaactttattaaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 1983486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17115641 - 17115556
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17115641 tttggtcccataagtaataaaaggttcgttttggtcccttaacttgattgaaagtatcagtttggtcctttctgttaatttaattc 17115556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 206 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36207519 - 36207413
Alignment:
Q  206 taacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaat 305  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||| || |||| |||  ||| ||||||    
T  36207519 taacttgatttcaagtaccggtttgatcacataagtaataaaaaattcgttaagatccgttaattttatttaaagtatcggtttagtcctttcggttaat 36207420  T
Q  306 ttaattc 312  Q
    |||||||    
T  36207419 ttaattc 36207413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 35463607 - 35463692
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  35463607 tttgatcccttaagtaataaaatgtctgttttggtcccttaactttagttaaagtaacggtttggtcccttctgttaatttaattc 35463692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9990292 - 9990161
Alignment:
Q  184 cttaaatattcaattggtctcttaactt----gatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaa 279  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||    ||||| ||||||  ||||| |  ||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9990292 cttaaatgttcaattagtcccttaacttcattgattttaagtatcagtttgatttcataaataatgaaagatctgtttaggtcccttaactttatttaaa 9990193  T
Q  280 gtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    || || | ||||||  || |||||||||||||    
T  9990192 gtatcggattggtcctttatgttaatttaatt 9990161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 14662408 - 14662492
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||  | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14662408 tttggtcccttaagtaataaaaggttcgttttggtcc-ttaactttatttaaagtaacggtttggtcccttctattaatttaattc 14662492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18968847 - 18968770
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagt 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |  |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18968847 cttaacttgatttcaagtatcggtttgatcccataaataataaaaggtatgtttggatcccttaactttatataaagt 18968770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35463756 - 35463709
Alignment:
Q  324 aagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35463756 aagttaaggaaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaa 35463709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Original strand, 18508569 - 18508654
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||| ||||| ||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  18508569 tttgatcccataagtaataaaaggtccattttggttccttagctttattgaaagtattggtttggtcctttctgttaatttaattc 18508654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 399
Target Start/End: Original strand, 17115488 - 17115536
Alignment:
Q  351 taaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaagggat 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  17115488 taaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataagataagggat 17115536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 183 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12702292 - 12702078
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  12702292 gcttaaatgctcaattagtcccttaacttgatatcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaaata 12702193  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagt 382  Q
    || || |||||  || ||||||||| ||||       ||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  12702192 tcggtctggtcctttttgttaatttcattcaaaaaaacgttaagtttagagaccaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaact-atactaat 12702094  T
Q  383 taaataagtcaaggga 398  Q
    ||||||||| ||||||    
T  12702093 taaataagttaaggga 12702078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 25945871 - 25946034
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||       ||| |||    
T  25945871 tttggtcccataagtaataaaagatctgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttgatcctttcagttaatttaattcaaaaaaacgttaag 25945970  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25945971 tttagggaccaaactaatattaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataag 25946034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 390
Target Start/End: Original strand, 36065267 - 36065422
Alignment:
Q  235 cataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaa 334  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||       ||| ||||||||| |    
T  36065267 cataagtaataaaagatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaagtttaggga 36065366  T
Q  335 ccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36065367 ccaaacttatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataag 36065422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 204 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2217952 - 2217764
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgtta 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||  ||||||||    
T  2217952 cttaacttgatttcaagtaatggtttggtcccataagtaataaaatgtccgtttatgtcccttaactttatttaaagtatcaatttgatcatttctgtta 2217853  T
Q  304 attt-aattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagt 391  Q
    |||| |||||       ||| ||||||| | | ||||| ||||||||| ||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  2217852 attttaattcaaaaaaacgttaagtttaaggagcaaactaatactaataaaataagctaagagatcaaactaatactaattaaataagt 2217764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 12701928 - 12702057
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  12701928 gcttaaatgctcaattggtcctttaacttgatttcaagtatcggtttggtcccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaacttcatttaaagta 12702027  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    |  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  12702028 ttggtttggtcctttctgttaatttaattc 12702057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12261190 - 12261061
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  12261190 gcttaaatgttcaattggtcccttaacttgatttcaagtatcggtttggtcacataagcaataaaaggtccgtttagctcccttaactttatttaaagtg 12261091  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    || | ||||||  |||| ||||||||||||    
T  12261090 tcggcttggtcctttcttttaatttaattc 12261061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 390
Target Start/End: Original strand, 16203499 - 16203652
Alignment:
Q  237 taagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaacc 336  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||| ||||||||||||       ||| ||||||||| |||    
T  16203499 taagtaataaaaggtccgtttaagtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcatttctattaatttaattcaaaaaaacgttaagtttagggacc 16203598  T
Q  337 aaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16203599 aaattaatactaattaaataagttaaaggaccaaactaatactaattaaataag 16203652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Original strand, 21304329 - 21304457
Alignment:
Q  183 gcttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtt 282  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||||||||||||||| |     
T  21304329 gcttaaatgctcaattgatcccttaacttgatttcaaatatcggtttggtcccataagtaataaaatgttcgtttagatcgcttaactttatttaaa-ta 21304427  T
Q  283 tcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  21304428 tcagtttagtcctttctgttaatttaattc 21304457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 38978937 - 38978794
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||        || | |    
T  38978937 tttggtcccatatgtaataaaaagttcgtttgggtcccttaactttatttaaagtatcagtttggtcctttctgttaatttaattcaaaaaaa-gttagg 38978839  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38978838 tttagggatcaaactaatactaattaaataagttaacggaccaaa 38978794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10373337 - 10373252
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  10373337 tttggtcccctaagtaataaaagatccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 10373252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 234 - 371
Target Start/End: Original strand, 16581389 - 16581527
Alignment:
Q  234 ccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc-nnnnnnncgtgaagtttagg 332  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||         || |||||||||    
T  16581389 ccataagtaataaaaggtccgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaaatgttaagtttagg 16581488  T
Q  333 aaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaa 371  Q
     ||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16581489 gaccaaactaatactaattaaataagataagggatcaaa 16581527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16203765 - 16203680
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  16203765 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattc 16203680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36065536 - 36065451
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  36065536 tttggtctcataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 36065451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 233 - 390
Target Start/End: Original strand, 10373066 - 10373223
Alignment:
Q  233 cccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttagg 332  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| ||  ||||||| |||||||||| |   |||| ||  ||||||| |||||||||       |||  |||||| |    
T  10373066 cccataaataataaaagatctgtttatgtggcttaactgtatttaaagtattgttttgatcctttctgttgatttaattcaaaaaaacgttgagtttaag 10373165  T
Q  333 aaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
     | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10373166 gatcaaactaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatactaattaaataag 10373223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25946154 - 25946063
Alignment:
Q  221 tattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||  ||| |||||||||||||    
T  25946154 tattgctttggttccataagtaataaaaggtctgttttggtcccttaactttatagaaagtattggtttggtcctttcggttaatttaattc 25946063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 398
Target Start/End: Original strand, 12260984 - 12261040
Alignment:
Q  342 aatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataagtcaaggga 398  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  12260984 aatattaattaaacaagttaagggaccaaactaaaactaattaaataagttaaggga 12261040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 308
Target Start/End: Original strand, 45115029 - 45115074
Alignment:
Q  263 ccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaattta 308  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  45115029 ccttaactttatttaaagtatcggtttgatcttttctgttaattta 45115074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 248
Target Start/End: Original strand, 2217644 - 2217688
Alignment:
Q  204 cttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaa 248  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2217644 cttaacttgatttcagatatcggtttggttccataagtaataaaa 2217688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 3568603 - 3568531
Alignment:
Q  209 cttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagt 281  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| |||| ||   |||||||||||| ||||    
T  3568603 cttgatttcaagtatcggtttgatcccataaataataaaaggtccatttaagtttattaactttattttaagt 3568531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Original strand, 26008 - 26171
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  26008 tttggtcccataagtaataaaaagtttgtttaagtcccttaactttatttaaagtatcggtttgatcctttctgttaatttaattcaaaaaaacgttaag 26107  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26108 tttagggaccaaactaatactaattaaataaattaagggacaaaactaatactaattaaataag 26171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 227 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26285 - 26200
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  26285 tttggtcccataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttggtcctttctgttaatttaattc 26200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 227 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 959330 - 959168
Alignment:
Q  227 tttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaag 326  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||||||||||        ||| |||    
T  959330 tttggtcccataagtaataaaaggttcgtttaggtcccttaactttatttaaagtatcagtttaatcctttctgttaatttaatt-aaaaaaacgttaag 959232  T
Q  327 tttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  959231 tttagggaccaaattaatactaattaaataagttaagggaccaaactaatattaattaaataag 959168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 398
Target Start/End: Original strand, 1211405 - 1211611
Alignment:
Q  193 tcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggt 292  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||    
T  1211405 tcaattgatcccttaacttgatttgaagtatcagtttgatcccatatgtaataaaaggtccgtttaggtcatttaattttatttaaagtatcggtttggt 1211504  T
Q  293 ctcttctgttaatttaatt--cnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagttaaataag 390  Q
    | ||| |||||||||||||          ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| | |||||||||    
T  1211505 cccttttgttaatttaattaaaaaaaaaacgttaagtttaggtaccaaactaatactaattaaataagttaaatgaccaaactagtac-aattaaataag 1211603  T
Q  391 tcaaggga 398  Q
    | ||||||    
T  1211604 ttaaggga 1211611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1211748 - 1211633
Alignment:
Q  196 attggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctc 295  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |  || |||||      
T  1211748 attggtcccttaacttgatttcaagtatctgtttggtctcataagtaataaaagatctgtttagatcccttaactttatttaaagtattggtatggtcca 1211649  T
Q  296 ttctgttaatttaatt 311  Q
    || |||||||||||||    
T  1211648 ttttgttaatttaatt 1211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 311
Target Start/End: Original strand, 959058 - 959138
Alignment:
Q  231 gtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaatttaatt 311  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||||||||    
T  959058 gtcccataagtaataaaaggtccgttttggtcccttaactttattgaaagtatcggtttgatcctttctcttgatttaatt 959138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 185 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 25617 - 25405
Alignment:
Q  185 ttaaatattcaattggtctcttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcc-cttaactttatttaaagttt 283  Q
    ||||||| |||||||||  | ||| ||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |||||||| |    
T  25617 ttaaatactcaattggttccataaattgatttcaagtatcagtttgatctcataagtaataaatgatccgtttaggtccttttaactttgtttaaagtat 25518  T
Q  284 cagtttggtctcttctgttaatttaattcnnnnnnncgtgaagtttaggaaccaaacaaatactaattaaataaattaagggaccaaactaatactagtt 383  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||        | | || |||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||    
T  25517 cggtttgatcccttctgttaatttaattaaaaaaaacattaaatttagggatcaaactaatattaattaaataagttaagggaccaaacttataataatt 25418  T
Q  384 aaataagtcaagg 396  Q
    |||||||| ||||    
T  25417 aaataagttaagg 25405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 233776 - 233672
Alignment:
Q  205 ttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaagtttcagtttggtctcttctgttaa 304  Q
    |||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||    
T  233776 ttaacttgatttcaatcttcggtttggttccataagtaataaaagatccgtttagatcccttaactttatttaaagtatcagtttggttttttctattaa 233677  T
Q  305 tttaa 309  Q
    |||||    
T  233676 tttaa 233672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 279
Target Start/End: Original strand, 233556 - 233630
Alignment:
Q  205 ttaacttgatttcaagtattggtttggtcccataagtaataaaaaatccgtttaggtcccttaactttatttaaa 279  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  233556 ttaacttgatttcaagtatcggtttagttctataagtaataaaagatccgtttagatcccttaactttatttaaa 233630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 14908 - 14829
Alignment:
Q  14 atcaggatgtagtcatatagatatgatagggtgacatttagaatggttgttaagtcattattttcaatagtatactcatt 93  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  14908 atcaggatgtggtcatgtagatatgatatggtgagatttagaatggttgttaagtaattattctcaatagtatagtcatt 14829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 128
Target Start/End: Original strand, 13916 - 13944
Alignment:
Q  100 actctagtccagtttgaagatatgagacg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13916 actctagtccagtttgaagatatgagacg 13944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University