View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9868_low_4 (Length: 621)

Name: NF9868_low_4
Description: NF9868
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9868_low_4
NF9868_low_4
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (172-359)||(30486208-30486396)
chr2 (174-364)||(20552931-20553122)
chr2 (172-359)||(31390010-31390198)
chr2 (174-364)||(31438646-31438837)
chr2 (170-362)||(22567598-22567791)
chr2 (170-362)||(561515-561708)
chr2 (173-359)||(22887749-22887936)
chr2 (174-359)||(44587902-44588088)
chr2 (172-360)||(26387063-26387252)
chr2 (172-361)||(34442531-34442719)
chr2 (172-370)||(27856385-27856584)
chr2 (177-362)||(4381798-4381984)
chr2 (172-360)||(22068319-22068507)
chr2 (173-359)||(32360869-32361056)
chr2 (173-335)||(1859161-1859323)
chr2 (177-362)||(3668110-3668295)
chr2 (198-361)||(28600991-28601154)
chr2 (173-359)||(6580188-6580372)
chr2 (172-361)||(32860100-32860289)
chr2 (201-367)||(2898098-2898265)
chr2 (172-358)||(4022480-4022666)
chr2 (172-351)||(38590883-38591062)
chr2 (198-360)||(35851749-35851913)
chr2 (174-353)||(43637165-43637343)
chr2 (200-361)||(5093538-5093699)
chr2 (174-361)||(8969405-8969591)
chr2 (176-358)||(13574031-13574211)
chr2 (205-358)||(27584769-27584922)
chr2 (173-301)||(26891722-26891850)
chr2 (171-322)||(11021260-11021410)
chr2 (171-361)||(25782831-25783018)
chr2 (198-314)||(38296201-38296317)
chr2 (200-327)||(5881243-5881374)
chr2 (204-330)||(29102313-29102439)
chr2 (218-307)||(15079012-15079100)
chr2 (173-314)||(34123071-34123211)
chr2 (173-365)||(39531823-39532014)
chr2 (38-141)||(23502206-23502308)
chr2 (201-321)||(25772137-25772258)
chr2 (218-323)||(10820528-10820631)
chr2 (225-332)||(15146683-15146789)
chr2 (310-359)||(26891683-26891732)
chr2 (177-359)||(31782565-31782749)
chr2 (172-233)||(44854467-44854528)
chr2 (175-233)||(29771417-29771476)
chr2 (172-264)||(20252738-20252832)
chr2 (174-252)||(44854310-44854387)
chr2 (172-224)||(45261901-45261954)
chr2 (176-264)||(16807319-16807409)
chr2 (176-264)||(16846600-16846690)
chr2 (200-234)||(43993180-43993214)
chr2 (180-213)||(28277517-28277550)
chr2 (205-261)||(30217662-30217719)
chr2 (172-233)||(20363912-20363969)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (163-369)||(29591178-29591385)
chr4 (168-369)||(7768932-7769134)
chr4 (172-364)||(16536046-16536239)
chr4 (172-361)||(43202382-43202571)
chr4 (173-364)||(4089141-4089333)
chr4 (172-359)||(43944505-43944692)
chr4 (174-359)||(54897308-54897494)
chr4 (177-362)||(50619089-50619274)
chr4 (170-359)||(789530-789720)
chr4 (453-604)||(24158371-24158522)
chr4 (173-359)||(4268822-4269009)
chr4 (173-361)||(18067877-18068066)
chr4 (174-361)||(32217045-32217232)
chr4 (172-359)||(12356242-12356430)
chr4 (204-366)||(36395129-36395292)
chr4 (174-357)||(54655879-54656062)
chr4 (171-359)||(15186240-15186423)
chr4 (170-330)||(47231902-47232062)
chr4 (175-357)||(19503107-19503289)
chr4 (170-359)||(6164090-6164279)
chr4 (198-332)||(24679671-24679804)
chr4 (172-330)||(37987934-37988091)
chr4 (172-360)||(33108672-33108860)
chr4 (174-358)||(28755621-28755803)
chr4 (38-145)||(24158145-24158252)
chr4 (171-329)||(52533816-52533974)
chr4 (173-362)||(55882683-55882871)
chr4 (173-330)||(42898774-42898933)
chr4 (174-364)||(32202476-32202666)
chr4 (172-333)||(46148939-46149098)
chr4 (198-359)||(54945780-54945940)
chr4 (172-359)||(5091612-5091798)
chr4 (205-362)||(4220226-4220383)
chr4 (174-327)||(3783534-3783687)
chr4 (198-335)||(30154188-30154324)
chr4 (179-357)||(39843912-39844086)
chr4 (158-301)||(46688264-46688412)
chr4 (201-350)||(53655887-53656037)
chr4 (226-370)||(31517217-31517362)
chr4 (173-316)||(49915158-49915301)
chr4 (174-301)||(54054548-54054675)
chr4 (201-329)||(31680494-31680622)
chr4 (224-327)||(30387167-30387270)
chr4 (238-359)||(39877247-39877371)
chr4 (171-335)||(41265456-41265619)
chr4 (202-301)||(42815137-42815237)
chr4 (234-360)||(16820912-16821039)
chr4 (201-332)||(50603254-50603386)
chr4 (205-333)||(52697083-52697210)
chr4 (173-264)||(50167590-50167679)
chr4 (218-330)||(53268764-53268875)
chr4 (199-332)||(1432576-1432703)
chr4 (249-330)||(8133782-8133862)
chr4 (253-361)||(53003954-53004063)
chr4 (44-143)||(5590689-5590788)
chr4 (44-143)||(48127582-48127681)
chr4 (204-314)||(17344705-17344814)
chr4 (172-360)||(11893400-11893590)
chr4 (171-362)||(34151118-34151310)
chr4 (310-371)||(46688212-46688274)
chr4 (173-353)||(10110007-10110189)
chr4 (171-213)||(12701917-12701959)
chr4 (563-603)||(5590425-5590465)
chr4 (563-603)||(48127905-48127945)
chr4 (180-211)||(36395248-36395279)
chr4 (174-233)||(39877554-39877612)
chr4 (170-224)||(22225882-22225936)
chr4 (177-213)||(25532957-25532993)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (172-360)||(27988499-27988687)
chr8 (172-360)||(28045801-28045989)
chr8 (172-335)||(33357154-33357317)
chr8 (174-359)||(34228682-34228868)
chr8 (175-359)||(16888544-16888728)
chr8 (174-364)||(30675568-30675758)
chr8 (171-360)||(168463-168653)
chr8 (164-364)||(13643002-13643202)
chr8 (164-364)||(13743427-13743627)
chr8 (173-359)||(11112638-11112825)
chr8 (173-361)||(36730444-36730631)
chr8 (174-360)||(2805259-2805446)
chr8 (176-359)||(20831553-20831737)
chr8 (170-361)||(29444138-29444330)
chr8 (172-362)||(4537741-4537932)
chr8 (174-359)||(16394061-16394247)
chr8 (173-359)||(43119216-43119402)
chr8 (172-345)||(16785085-16785257)
chr8 (175-333)||(21595848-21596005)
chr8 (207-359)||(7304518-7304671)
chr8 (206-357)||(16890482-16890634)
chr8 (188-328)||(42035013-42035153)
chr8 (198-356)||(28626792-28626950)
chr8 (193-363)||(9253899-9254068)
chr8 (172-361)||(4648193-4648382)
chr8 (163-360)||(9063051-9063248)
chr8 (204-364)||(32113938-32114100)
chr8 (173-333)||(12203854-12204013)
chr8 (173-333)||(12448282-12448441)
chr8 (174-329)||(37373206-37373360)
chr8 (202-359)||(9537824-9537982)
chr8 (172-359)||(40831279-40831463)
chr8 (173-335)||(3930258-3930419)
chr8 (204-317)||(10870382-10870495)
chr8 (237-357)||(39406905-39407024)
chr8 (174-359)||(29235235-29235421)
chr8 (172-277)||(9278210-9278315)
chr8 (239-359)||(24843280-24843400)
chr8 (203-321)||(42433583-42433700)
chr8 (196-362)||(22956728-22956895)
chr8 (172-277)||(10618016-10618121)
chr8 (174-251)||(12652630-12652707)
chr8 (208-301)||(34192809-34192902)
chr8 (174-345)||(39751485-39751658)
chr8 (172-296)||(17467601-17467725)
chr8 (225-307)||(22451835-22451916)
chr8 (165-368)||(42655268-42655472)
chr8 (267-336)||(14191034-14191103)
chr8 (228-306)||(30933376-30933453)
chr8 (174-241)||(36923782-36923849)
chr8 (175-363)||(43714184-43714373)
chr8 (292-364)||(2490152-2490225)
chr8 (174-233)||(29566700-29566760)
chr8 (171-264)||(4811554-4811649)
chr8 (172-234)||(2490315-2490377)
chr8 (301-361)||(10618125-10618186)
chr8 (198-239)||(35695570-35695611)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (174-362)||(392096-392285)
chr6 (166-370)||(3515758-3515963)
chr6 (171-362)||(32929505-32929697)
chr6 (172-362)||(23402136-23402327)
chr6 (174-359)||(12145117-12145303)
chr6 (471-604)||(33435843-33435976)
chr6 (177-360)||(32985192-32985376)
chr6 (172-370)||(4215693-4215892)
chr6 (173-361)||(27433491-27433680)
chr6 (176-332)||(2350654-2350810)
chr6 (172-328)||(7851191-7851347)
chr6 (170-359)||(18276612-18276804)
chr6 (173-335)||(29451140-29451301)
chr6 (198-362)||(26467121-26467286)
chr6 (174-359)||(35043890-35044074)
chr6 (174-362)||(13416957-13417148)
chr6 (171-355)||(3026013-3026196)
chr6 (204-362)||(25165410-25165569)
chr6 (172-301)||(20897946-20898075)
chr6 (172-333)||(1391205-1391365)
chr6 (160-360)||(12525705-12525906)
chr6 (174-362)||(29978233-29978420)
chr6 (200-335)||(1840272-1840407)
chr6 (174-360)||(2580952-2581139)
chr6 (164-365)||(28225211-28225412)
chr6 (174-360)||(21878352-21878533)
chr6 (38-145)||(33435613-33435719)
chr6 (172-291)||(34396596-34396715)
chr6 (173-359)||(31280320-31280501)
chr6 (199-351)||(11115106-11115256)
chr6 (193-317)||(23629619-23629743)
chr6 (193-301)||(34477609-34477717)
chr6 (206-333)||(34851876-34852003)
chr6 (176-332)||(9660988-9661144)
chr6 (216-329)||(961051-961164)
chr6 (171-335)||(5323397-5323561)
chr6 (166-273)||(13529447-13529554)
chr6 (171-360)||(34706717-34706908)
chr6 (284-335)||(22417303-22417354)
chr6 (172-244)||(14559920-14559992)
chr6 (174-233)||(34712252-34712312)
chr6 (171-213)||(29716726-29716768)
chr6 (360-394)||(33435744-33435778)
chr6 (513-545)||(33435810-33435842)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (453-604)||(51826885-51827036)
chr3 (171-361)||(52520678-52520869)
chr3 (170-362)||(18014668-18014861)
chr3 (173-365)||(49893330-49893523)
chr3 (173-359)||(272219-272406)
chr3 (174-362)||(4168183-4168372)
chr3 (174-364)||(43786871-43787062)
chr3 (174-363)||(39074419-39074608)
chr3 (170-359)||(46352630-46352820)
chr3 (172-360)||(858587-858776)
chr3 (453-604)||(48648724-48648875)
chr3 (174-361)||(48725271-48725459)
chr3 (172-361)||(40362578-40362768)
chr3 (177-359)||(41553940-41554122)
chr3 (174-359)||(10617284-10617469)
chr3 (175-362)||(42964246-42964434)
chr3 (204-347)||(2505379-2505523)
chr3 (174-356)||(20923992-20924173)
chr3 (174-334)||(28139309-28139469)
chr3 (163-335)||(53489849-53490023)
chr3 (193-358)||(49529269-49529436)
chr3 (173-335)||(41304004-41304164)
chr3 (38-145)||(48648492-48648599)
chr3 (174-359)||(52246582-52246768)
chr3 (200-360)||(43269738-43269899)
chr3 (191-359)||(7468428-7468595)
chr3 (174-359)||(2119431-2119614)
chr3 (198-322)||(22248910-22249034)
chr3 (182-360)||(2938039-2938217)
chr3 (199-353)||(42548120-42548274)
chr3 (177-333)||(50359213-50359368)
chr3 (180-362)||(50395560-50395742)
chr3 (231-359)||(6842676-6842805)
chr3 (172-360)||(11308210-11308398)
chr3 (206-362)||(41993617-41993773)
chr3 (172-363)||(13159895-13160086)
chr3 (172-332)||(50298973-50299133)
chr3 (174-335)||(38852216-38852378)
chr3 (198-358)||(24488390-24488551)
chr3 (38-145)||(51827158-51827258)
chr3 (206-327)||(29241669-29241790)
chr3 (226-332)||(33140937-33141043)
chr3 (249-359)||(52552549-52552658)
chr3 (212-332)||(31514829-31514948)
chr3 (198-255)||(2391631-2391688)
chr3 (198-255)||(2393392-2393449)
chr3 (44-143)||(11651593-11651692)
chr3 (174-253)||(23925280-23925359)
chr3 (172-259)||(52718166-52718252)
chr3 (207-335)||(53054834-53054964)
chr3 (174-234)||(2362801-2362861)
chr3 (174-254)||(51818981-51819061)
chr3 (222-301)||(2362880-2362958)
chr3 (174-264)||(27994395-27994486)
chr3 (561-603)||(11651919-11651961)
chr3 (218-305)||(21010041-21010124)
chr3 (473-501)||(11651880-11651908)
chr3 (513-545)||(51827031-51827063)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (172-362)||(12218434-12218624)
chr7 (170-359)||(29993487-29993677)
chr7 (172-359)||(24798403-24798590)
chr7 (172-362)||(34333282-34333472)
chr7 (174-359)||(24438477-24438663)
chr7 (164-359)||(4628556-4628752)
chr7 (174-360)||(34606261-34606448)
chr7 (172-335)||(18485959-18486122)
chr7 (453-604)||(31953689-31953840)
chr7 (198-362)||(30810679-30810844)
chr7 (175-330)||(28587911-28588065)
chr7 (174-365)||(13064870-13065061)
chr7 (200-335)||(23363192-23363327)
chr7 (205-360)||(47083086-47083241)
chr7 (173-359)||(5239284-5239471)
chr7 (198-360)||(42044293-42044455)
chr7 (177-358)||(11686324-11686507)
chr7 (175-354)||(47656981-47657158)
chr7 (174-333)||(43594063-43594222)
chr7 (173-335)||(47839492-47839653)
chr7 (38-143)||(31953959-31954064)
chr7 (172-358)||(5729344-5729531)
chr7 (201-359)||(525076-525234)
chr7 (174-328)||(8754617-8754771)
chr7 (165-335)||(7689225-7689395)
chr7 (173-298)||(27456175-27456299)
chr7 (206-362)||(18117175-18117331)
chr7 (203-335)||(45045799-45045931)
chr7 (174-335)||(1736980-1737140)
chr7 (170-301)||(34546373-34546504)
chr7 (178-334)||(46716642-46716798)
chr7 (177-335)||(28262034-28262187)
chr7 (201-335)||(33636479-33636613)
chr7 (224-362)||(37674103-37674240)
chr7 (204-328)||(29835735-29835860)
chr7 (173-298)||(37631604-37631729)
chr7 (174-307)||(18469993-18470126)
chr7 (219-359)||(22739868-22740010)
chr7 (206-335)||(23357735-23357861)
chr7 (201-362)||(4087650-4087810)
chr7 (200-322)||(4100563-4100684)
chr7 (176-362)||(19434495-19434682)
chr7 (196-305)||(36437399-36437507)
chr7 (171-243)||(22973595-22973667)
chr7 (218-305)||(18220726-18220812)
chr7 (44-143)||(31954876-31954975)
chr7 (249-312)||(47118037-47118100)
chr7 (174-229)||(47118095-47118150)
chr7 (198-264)||(18220627-18220693)
chr7 (172-360)||(34556891-34557078)
chr7 (174-360)||(6819916-6820100)
chr7 (205-264)||(18220534-18220593)
chr7 (170-264)||(5785460-5785556)
chr7 (563-603)||(31954614-31954654)
chr7 (188-361)||(38128305-38128480)
chr7 (205-264)||(3021922-3021981)
chr7 (172-233)||(6097334-6097396)
chr7 (360-394)||(31953899-31953933)
chr7 (172-233)||(32805536-32805598)
chr7 (220-281)||(38022571-38022632)
chr7 (177-233)||(30924117-30924174)
chr7 (236-316)||(13556474-13556553)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (163-362)||(6107-6307)
[»] chr1 (66 HSPs)
chr1 (171-362)||(51065745-51065937)
chr1 (173-362)||(29657770-29657960)
chr1 (170-361)||(47009989-47010181)
chr1 (174-364)||(5694321-5694512)
chr1 (170-362)||(18043158-18043351)
chr1 (172-362)||(42769987-42770178)
chr1 (172-363)||(15227737-15227929)
chr1 (174-359)||(24178463-24178649)
chr1 (171-360)||(12072061-12072251)
chr1 (173-335)||(45431278-45431439)
chr1 (174-358)||(38162850-38163035)
chr1 (174-363)||(3097659-3097846)
chr1 (168-367)||(17333276-17333473)
chr1 (174-360)||(3784712-3784899)
chr1 (174-359)||(30294381-30294567)
chr1 (172-361)||(14350277-14350465)
chr1 (176-333)||(36446352-36446508)
chr1 (172-359)||(9266728-9266916)
chr1 (173-358)||(13961211-13961396)
chr1 (161-332)||(6770324-6770495)
chr1 (172-362)||(43286720-43286913)
chr1 (176-361)||(38701935-38702117)
chr1 (171-336)||(51368809-51368974)
chr1 (177-359)||(48383111-48383294)
chr1 (172-333)||(29683193-29683355)
chr1 (177-365)||(45449238-45449426)
chr1 (173-360)||(19031814-19032002)
chr1 (207-362)||(50128169-50128325)
chr1 (176-365)||(23473458-23473648)
chr1 (173-334)||(48071482-48071642)
chr1 (173-301)||(29210412-29210540)
chr1 (171-334)||(12306915-12307077)
chr1 (172-335)||(35985646-35985808)
chr1 (169-369)||(30657603-30657798)
chr1 (204-362)||(8472911-8473070)
chr1 (172-335)||(41730303-41730469)
chr1 (201-322)||(38335196-38335317)
chr1 (172-329)||(52749600-52749757)
chr1 (172-335)||(47532696-47532857)
chr1 (202-283)||(15282591-15282672)
chr1 (198-359)||(30217784-30217946)
chr1 (172-359)||(28725905-28726094)
chr1 (174-353)||(39081803-39081980)
chr1 (220-323)||(37503260-37503362)
chr1 (269-335)||(19010712-19010778)
chr1 (218-328)||(37315300-37315409)
chr1 (176-297)||(39497309-39497430)
chr1 (174-359)||(38595752-38595939)
chr1 (168-264)||(39912375-39912471)
chr1 (200-275)||(26228219-26228294)
chr1 (225-335)||(52431632-52431742)
chr1 (174-289)||(28481844-28481954)
chr1 (167-264)||(35700746-35700841)
chr1 (175-244)||(19011112-19011180)
chr1 (174-361)||(52702144-52702332)
chr1 (177-303)||(14881036-14881149)
chr1 (201-264)||(3838873-3838936)
chr1 (199-254)||(10976008-10976063)
chr1 (44-143)||(50271442-50271541)
chr1 (199-264)||(49867454-49867520)
chr1 (563-603)||(50271200-50271240)
chr1 (288-359)||(23789496-23789567)
chr1 (273-361)||(11796969-11797056)
chr1 (232-264)||(19011063-19011095)
chr1 (173-353)||(27456955-27457138)
chr1 (473-501)||(50271253-50271281)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (174-360)||(34650832-34651018)
chr5 (171-360)||(13661805-13661995)
chr5 (171-361)||(35132519-35132709)
chr5 (174-362)||(35504238-35504426)
chr5 (174-365)||(11957961-11958153)
chr5 (163-375)||(8787328-8787541)
chr5 (172-359)||(10054353-10054540)
chr5 (174-353)||(6283562-6283742)
chr5 (174-359)||(21547394-21547579)
chr5 (174-335)||(12506296-12506457)
chr5 (174-301)||(10069969-10070095)
chr5 (207-361)||(40564402-40564557)
chr5 (170-306)||(13470147-13470283)
chr5 (202-327)||(9721640-9721765)
chr5 (193-359)||(40057326-40057493)
chr5 (177-335)||(11846075-11846233)
chr5 (172-322)||(39069379-39069526)
chr5 (172-301)||(19647717-19647846)
chr5 (201-325)||(39066970-39067095)
chr5 (201-333)||(19436865-19436995)
chr5 (175-353)||(20175228-20175406)
chr5 (171-332)||(31909629-31909784)
chr5 (173-332)||(10955950-10956109)
chr5 (175-282)||(2619635-2619742)
chr5 (232-361)||(4268620-4268749)
chr5 (172-286)||(4837256-4837369)
chr5 (201-264)||(6284822-6284885)
chr5 (44-143)||(22799419-22799518)
chr5 (44-145)||(19366220-19366321)
chr5 (44-143)||(41045679-41045778)
chr5 (170-227)||(21944994-21945051)
chr5 (563-603)||(22799154-22799194)
chr5 (564-603)||(31082229-31082268)
chr5 (172-353)||(14214055-14214238)
chr5 (174-361)||(40608533-40608722)
chr5 (218-271)||(5302368-5302422)
chr5 (221-322)||(22973732-22973832)
chr5 (473-501)||(31082282-31082310)
chr5 (172-200)||(40056705-40056733)
chr5 (563-603)||(41046004-41046044)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (172-335)||(22959-23122)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (172-332)||(68318-68478)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (173-361)||(53683-53872)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (174-365)||(14896-15088)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (172-335)||(116202-116365)
[»] scaffold1152 (1 HSPs)
scaffold1152 (173-359)||(677-863)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (174-334)||(50548-50708)
scaffold0045 (201-358)||(53358-53505)
[»] scaffold0524 (1 HSPs)
scaffold0524 (174-335)||(825-986)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (173-301)||(11029-11155)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (164-365)||(25709-25910)
[»] scaffold1266 (1 HSPs)
scaffold1266 (173-332)||(292-450)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (172-329)||(95616-95772)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (235-359)||(10771-10896)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (198-361)||(69250-69413)
scaffold0050 (200-364)||(33678-33841)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (193-301)||(7956-8064)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (193-301)||(7307-7415)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (172-363)||(146902-147093)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (168-329)||(17502-17660)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (207-359)||(40952-41105)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (193-333)||(19612-19752)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (246-359)||(233925-234039)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (205-264)||(5070-5129)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (202-307)||(74526-74632)
[»] scaffold1128 (1 HSPs)
scaffold1128 (218-264)||(1415-1461)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Original strand, 30486208 - 30486396
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30486208 aagggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 30486307  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  30486308 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 30486396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 20552931 - 20553122
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  20552931 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 20553030  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20553031 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttatt 20553122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Original strand, 31390010 - 31390198
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  31390010 aagggaaatgctaactggtgcctccggggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataa 31390109  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  31390110 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgctccgggggcaccgattagcaggaccc 31390198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 31438646 - 31438837
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  31438646 gggaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 31438745  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  31438746 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggacccttatt 31438837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 170 - 362
Target Start/End: Original strand, 22567598 - 22567791
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22567598 aaaagggaaatgctaactgatgcccctaagacactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttat 22567697  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  22567698 aataaagtcaaaaataatttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgctccaggggcaccggttagcaggaccctta 22567791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 170 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 561708 - 561515
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  561708 aaaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 561609  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || || |||||||||||||||||| ||||    
T  561608 aataaagtcaaaatcagtttccttttataataataattctcttttatggtatgcttaatcagtaccccggaggcaccggttagcaggactctta 561515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 22887749 - 22887936
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  22887749 agggaaatgctaaccgatgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 22887848  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  22887849 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccgattagcatgaccc 22887936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 44587902 - 44588088
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  44587902 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataata 44588001  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  44588002 aagtaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacaagtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 44588088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26387252 - 26387063
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  26387252 aagggaaatgctaactggtgcctccgaagtacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 26387153  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc-tgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26387152 taaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttgggggcaccggttaacaggaccct 26387063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34442719 - 34442531
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  34442719 aagggaaatgctaaccggtgccccg-gggcacatgttaaggatatgaaaaagaagattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 34442621  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34442620 taaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcatcggttagcaggaccctt 34442531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27856584 - 27856385
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  27856584 aagggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 27856485  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttattaaaatt 370  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27856484 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggacccttcttataatt 27856385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 177 - 362
Target Start/End: Original strand, 4381798 - 4381984
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  4381798 aaatgctaaccggtgcccccggtgcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 4381897  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  4381898 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgccccgggagcactggttagcaggaccctta 4381984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 22068507 - 22068319
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||   ||||    
T  22068507 aagggaaatgctaacaagtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaagggaattatatagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataa 22068409  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  22068408 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccgattagcaggaccct 22068319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32361056 - 32360869
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  | |||||||   |||||    
T  32361056 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatataattaattgataat 32360957  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  32360956 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 32360869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Original strand, 1859161 - 1859323
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  1859161 agggaaatgctaactggtgcccccggggtaatggttaaggatataaaaaaagaaattgtatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 1859260  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1859261 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 1859323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 177 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3668295 - 3668110
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  3668295 aaatgctaaccggtgccccc-ggacactggttaagggtatggaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatg 3668197  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||    
T  3668196 tcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgtttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaagaccctta 3668110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 361
Target Start/End: Original strand, 28600991 - 28601154
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28600991 gggcactggttaaggatatgaaaaagggaattataaagtagtta-tgcattgaaattgtataattaattgataataaagttaaaaacagtttctttttat 28601089  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28601090 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcactgggagcaccggttagcaggaccctt 28601154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 6580188 - 6580372
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  6580188 agggaaatgctaaccagtgccccgggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 6580287  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||   |||||||||||||||    
T  6580288 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggg--gcggttagcaggaccc 6580372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 172 - 361
Target Start/End: Original strand, 32860100 - 32860289
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  32860100 aagggaaatgttaaccggtgccccgggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 32860199  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| || | |||| ||||||||||    
T  32860200 taaagtcaaaaacagtttccttttat-gtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccggggacagctgttaacaggaccctt 32860289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 201 - 367
Target Start/End: Original strand, 2898098 - 2898265
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |    
T  2898098 cactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttctatcat 2898197  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttattaaa 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2898198 aataattctcttttatggtatgtttaatcagtgtcccggaggcaccggttagcaggaccataattaaa 2898265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4022666 - 4022480
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  4022666 aagggaaatgctaactggtgcccacgggatactgattaagaatatgaaaaaagaaatta-atagtagttaatgtattgaaattctgtaattaatttataa 4022568  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4022567 taaagtcagaaacagtttccttttatgataataatttccttttatgatatgtttaaccagtgtcccgggggcaccggttagcaggacc 4022480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38591062 - 38590883
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||    
T  38591062 aagggaaatgctaaccggtgtccctggggcactggttaagaatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaattgataa 38590963  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttag 351  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||  | ||||||||||||    
T  38590962 taaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgaggcaccggttag 38590883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 198 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 35851913 - 35851749
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  35851913 gggcaccggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttcattttat 35851814  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct--gggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35851813 ggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgcctcggggggcaccggttagcaggaccct 35851749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 353
Target Start/End: Original strand, 43637165 - 43637343
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  43637165 gggaaatgctaaccggtgccccgaga-cactggttaaggatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43637263  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagca 353  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  43637264 aagtcaaaaacaatttctttttatggtaataatttccttttacagtatgtttaacccgtgctccggggcaccggttagca 43637343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5093699 - 5093538
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||     
T  5093699 gcactagttaaggatatgaaaaaggaaattaaatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcaatttccttttatga 5093600  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  5093599 taataatttccttttatggtatgtttaactagtgccccggggcaccggttaacaggaccctt 5093538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8969591 - 8969405
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||    
T  8969591 gggaaatgctaaccagtgcccc--gggcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtaattaatttataata 8969494  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  8969493 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttccttttatagtatgcttaactagtgcccctggggcaccggttagcagtaccctt 8969405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 13574211 - 13574031
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13574211 gaaatgctaacaggtgccct--gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaaatatataaaaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaa 13574114  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||    | |||||||||||||||||    
T  13574113 gtcaaaaacagtttctttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccctaagacaccggttagcaggacc 13574031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 205 - 358
Target Start/End: Original strand, 27584769 - 27584922
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  27584769 ggttaaggatatgaaaagggaaattatatagtagttaaagcattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaagcagtttccttttatggtaata 27584868  T
Q  305 attctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  27584869 attctcattcatggtatacttaaccagtgcccggaagcagcggttagcaggacc 27584922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 26891850 - 26891722
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  26891850 agggaaatgctaaccggtgcccccgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 26891751  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26891750 aaagtcaaaaatagtttccttttatggta 26891722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 171 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11021410 - 11021260
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  | |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  11021410 aaagggaaatgttaactggtgcctcg-gagcactgattaaagatatgaaaaaagaaattatatggtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatatata 11021312  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatg 322  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11021311 ataaagtcaaaaacagttttcttttgtggtaataattcccttttatggtatg 11021260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25783018 - 25782831
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  25783018 aaaggaaaatgctaaccggtgccccaaga-cactagttaagaatatgaaaaaggaaattatatagt---taatgcattgaaattgtgtaattattttata 25782923  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| || |||||||| | ||||||    
T  25782922 ataaagtcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggggacatcggttagccgaaccctt 25782831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 314
Target Start/End: Original strand, 38296201 - 38296317
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38296201 gggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 38296300  T
Q  298 ggtaataattctctttt 314  Q
    |||||||||| ||||||    
T  38296301 ggtaataattttctttt 38296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 327
Target Start/End: Original strand, 5881243 - 5881374
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtat----tgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcctttt 295  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5881243 gcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaagagtttcctttt 5881342  T
Q  296 atggtaataattctcttttatggtatgtttaa 327  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5881343 atgataataattatcttttatggtatgcttaa 5881374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 29102439 - 29102313
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  29102439 tggttaagaatatcaaaaagaaaattatatagcggttaatacattgaaattttataattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatagtaat 29102340  T
Q  304 aattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  29102339 aattatcttttatgatatgtttaacca 29102313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 218 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15079100 - 15079012
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15079100 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaatttccttttatgataataatt 15079012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34123211 - 34123071
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| || |||  ||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||  |||||     
T  34123211 agggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttgagcatactaaaaaagaaattatataatagttaatgctttgaatttgtgtaattaatttataa- 34123113  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctctttt 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34123112 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtcataattttctttt 34123071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 173 - 365
Target Start/End: Original strand, 39531823 - 39532014
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||| ||| |||| || || ||| ||||| |||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||     
T  39531823 agggaaatgttaaatggtccctccggggtactgggtaaacatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa- 39531921  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    | ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||  | |||| |||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  39531922 agagtcaaaaccagttttcttttatggtaat-attttctttttcgatatgcttaaccagtgtctcagaggcaccggttagcatgacccatatta 39532014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23502308 - 23502206
Alignment:
Q  38 ttacgcattcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 137  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23502308 ttactcattcttcattttgttccaatgc-aagagccaaccttttttagttgtagataacaactcgttttctataagcctcattttttcttcttcttaatc 23502210  T
Q  138 ttat 141  Q
    ||||    
T  23502209 ttat 23502206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 321
Target Start/End: Original strand, 25772137 - 25772258
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatag-tagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||| |  || |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||     
T  25772137 cactagttaagaatatgaaaaaggaaattataaaaataattaatgcaatgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttccctttatga 25772236  T
Q  300 taataattctcttttatggtat 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  25772237 taataattcccttttatggtat 25772258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 323
Target Start/End: Original strand, 10820528 - 10820631
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatg 317  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  10820528 aaaaaagaaattataaaatagttaatacattgagattgt-taattaatttataa-aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttg 10820625  T
Q  318 gtatgt 323  Q
    ||||||    
T  10820626 gtatgt 10820631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 332
Target Start/End: Original strand, 15146683 - 15146789
Alignment:
Q  225 aaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtt 324  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||    
T  15146683 aaattatataatagttaatacattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaataatttccttttatgataataattttcctttttggtatgtt 15146781  T
Q  325 taaccagt 332  Q
    ||||||||    
T  15146782 taaccagt 15146789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26891732 - 26891683
Alignment:
Q  310 cttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26891732 cttttatggtatgcttaactagtgtctgggggcaccggttagcaggaccc 26891683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31782749 - 31782565
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaag-gaaattatatagtagttaatgtattgaaa-ttgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| || ||||||| |||| ||||||| | ||||  |    
T  31782749 aaatgctaaccggtgtccccggggcacggattaaggataataaaaagagaaattatatattaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaata 31782650  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||| || || | || | ||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31782649 agtcaacaaaactt-ctttttatggtaaaaatttcctttttttgtatgcttaacccgtgcctcgggggcaccggttagcatgaccc 31782565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44854528 - 44854467
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatat 233  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  44854528 aagggaaatgctaaccggtactcccggggcactggttaaggataataaaaaggaaattatat 44854467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 233
Target Start/End: Original strand, 29771417 - 29771476
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatat 233  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29771417 ggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatat 29771476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 264
Target Start/End: Original strand, 20252738 - 20252832
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaa-aaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  20252738 aagggaaatgctaactggtgcctccgtgacactggttaaagatgtcaagaaaggaaattatattgtagttattgcattgaaaactgtgtaattaa 20252832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 252
Target Start/End: Original strand, 44854310 - 44854387
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaa 252  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||| || |||||||    
T  44854310 gggaaatgctaaccggtgcccccgggtc-ctggttaaggataataaaaaggaaattatatattaattattgcattgaaa 44854387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 45261901 - 45261954
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccc-cagggcactggttaaggatatgaaaaagg 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  45261901 aagggaaatgctaaccggtgccccccagggcactggttaaggataataaaaagg 45261954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16807409 - 16807319
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatg-aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  16807409 gaaatgctaaccggtgcctccgaggcattggttaaggatgtttaaaaagaaaattatatagtagttattgcattgaaaactgtgtaattaa 16807319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16846690 - 16846600
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatg-aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  16846690 gaaatgctaaccggtgcctccgaggcattggttaaggatgtttaaaaagaaaattatatagtagttattgcattgaaaactgtgtaattaa 16846600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 234
Target Start/End: Original strand, 43993180 - 43993214
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43993180 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 43993214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 213
Target Start/End: Original strand, 28277517 - 28277550
Alignment:
Q  180 tgctaactggtgcccccagggcactggttaagga 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28277517 tgctaactggtgcccccggggcactggttaagga 28277550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 30217719 - 30217662
Alignment:
Q  205 ggttaaggata-tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaat 261  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  30217719 ggttaaggatactaaaaaagaaaattatatagtatttattgcattgaaattgtgtaat 30217662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Original strand, 20363912 - 20363969
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatat 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  20363912 aagggaaatgctaactagtgcccccgtgacactggttaagga----aaaaaggaaattatat 20363969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 8e-78; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 163 - 369
Target Start/End: Original strand, 29591178 - 29591385
Alignment:
Q  163 aattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29591178 aattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaagaatatgaataaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtactt 29591277  T
Q  263 aaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29591278 aatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaactagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 29591377  T
Q  362 attaaaat 369  Q
    ||||||||    
T  29591378 attaaaat 29591385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 168 - 369
Target Start/End: Original strand, 7768932 - 7769134
Alignment:
Q  168 ttaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaact 267  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  7768932 ttaaaagggaaatgctaatcggtacccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattt 7769031  T
Q  268 ataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttattaa 366  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7769032 ataataatgttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggcatacttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccctttttaa 7769131  T
Q  367 aat 369  Q
    |||    
T  7769132 aat 7769134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 172 - 364
Target Start/End: Original strand, 16536046 - 16536239
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  16536046 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcacggattaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 16536145  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536146 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtattcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttatt 16536239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 172 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43202571 - 43202382
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  43202571 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa 43202472  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43202471 taatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtaagcttaaccagtgcccgggggcaccggttagcaggaccctt 43202382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 173 - 364
Target Start/End: Original strand, 4089141 - 4089333
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  4089141 agggaaatgctaaccggtgcccctggggcactgattaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 4089240  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4089241 aatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcaccagttagcaggacccttatt 4089333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Original strand, 43944505 - 43944692
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  43944505 aagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 43944604  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  43944605 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttgtatggtatgcttaaccagtgcccgagggcaccggttagcaagaccc 43944692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 54897308 - 54897494
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  54897308 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgagaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 54897407  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  54897408 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccggttagcaggaccc 54897494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 177 - 362
Target Start/End: Original strand, 50619089 - 50619274
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  50619089 aaatgctaactggtgctcccggggcactgattaagaatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtacttaatttataataaag 50619188  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  50619189 taaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccaggggcaccggttagcgggaccctta 50619274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 789720 - 789530
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  789720 aaaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 789621  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||    
T  789620 aataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtagcccagaggcaccggttagcgggaccc 789530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 453 - 604
Target Start/End: Original strand, 24158371 - 24158522
Alignment:
Q  453 catggcaagtcagctataaatattgaggacatggaattcataacaacaa-gttctgtttaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttctt 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24158371 catggcaagtcagctgtaaatattgaggacatgaaattcataacaacaaagttctgttcaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttctt 24158470  T
Q  552 gtattatcgctgatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaata 604  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24158471 -tattatcgctgatgaatggaagtgatgttctacttgttcaacaagttcaata 24158522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4269009 - 4268822
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||    
T  4269009 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataat 4268910  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  4268909 aatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccc 4268822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18068066 - 18067877
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  18068066 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcat 18067967  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccag-tgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  18067966 aatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccctt 18067877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 361
Target Start/End: Original strand, 32217045 - 32217232
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  32217045 gggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32217144  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  32217145 aagtcaaaaacagttt-tttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccggaggcaccggttaacaggaccctt 32217232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Original strand, 12356242 - 12356430
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||  |||||    
T  12356242 aagggaaatgctaaccggtgcccctgagatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattatataattaatttataa 12356341  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12356342 taaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtgttccgggggcaccggttagcaggaccc 12356430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 204 - 366
Target Start/End: Original strand, 36395129 - 36395292
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||    
T  36395129 tggttaaaaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatgataat 36395228  T
Q  304 aattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttattaa 366  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36395229 aattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccagttagcaggacccttattaa 36395292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54656062 - 54655879
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54656062 gggaaatgttaactggtgttccgggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 54655963  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggac 357  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  54655962 aagtcaaaaacaattttcttttaggataataattctctcttatgatatgcttaaccagtgtcccggggcaccggttagcaggac 54655879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 359
Target Start/End: Original strand, 15186240 - 15186423
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  15186240 aaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttata 15186339  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||      ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  15186340 ataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatgg------taaccagtgccccgggggcaccggttaacaggaccc 15186423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 47232062 - 47231902
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||    
T  47232062 aaaagggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgat 47231963  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47231962 aataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacca 47231902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 175 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 19503289 - 19503107
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19503289 ggaaatgctaaccggtgctccc-gggtactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa 19503191  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc-tgggggcaccggttagcaggac 357  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  19503190 agtcaaaaacagtttccttttattgtaataattcccttttatggtatgcttaactagtaccttgggggcatcggttagcgggac 19503107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Original strand, 6164090 - 6164279
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  6164090 aaaagggaaatgataaccggtgctcttggggcactggttaaggatatcaaaa-gaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 6164188  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || | || ||||||||||||||||||    
T  6164189 aataaagcaaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtaccccgaggacaccggttagcaggaccc 6164279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24679804 - 24679671
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24679804 gggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacaatttcc-tttat 24679706  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24679705 ggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagt 24679671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 330
Target Start/End: Original strand, 37987934 - 37988091
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||| || |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37987934 aagggaaatgttaaccggtgctcc-agggtaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa 37988032  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37988033 taatgttaaaaacagtttccttttattgtaataattctcttttatagtatgcttaacca 37988091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33108860 - 33108672
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||   ||||    
T  33108860 aagggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaag-atatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaatagtataattaattgataa 33108762  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  33108761 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 33108672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 358
Target Start/End: Original strand, 28755621 - 28755803
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  28755621 gggaaatgctaaccggtgtccc-agggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 28755719  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||  ||||  | | |||||||||||||||||    
T  28755720 aagttagaaacagtttccttttatgataatacttc-cttttatagtatgcttaacccatgccccgagacaccggttagcaggacc 28755803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 24158145 - 24158252
Alignment:
Q  38 ttacgcattcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24158145 ttacgcattcttcattttgttccaatgccaagagccgatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 24158244  T
Q  138 ttatgcta 145  Q
    ||||||||    
T  24158245 ttatgcta 24158252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 171 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 52533974 - 52533816
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||   |||    
T  52533974 aaagggaaatgttaaccggtgcctccaggacactggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcactgaaattgaataattaattgata 52533875  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacc 329  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52533874 ataaagtcgaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 52533816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 362
Target Start/End: Original strand, 55882683 - 55882871
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||| | || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  55882683 agggaaatgctaaccggtgtctccggggcactcgttaaggatatgaaaaaa-aaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 55882781  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  55882782 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa-aattcacttttatggtatacttaacccgtgcctcgggggcaccggttagtaggaccctta 55882871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42898933 - 42898774
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||| |||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  42898933 agggaaatgttaatcggtgcttccagggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 42898834  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttcctttta--tggtaataattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42898833 aaagtcaaaaatagtttctttttatgtggtaataattctcttttatggtatgcttaacca 42898774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 32202666 - 32202476
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  32202666 gggaaatgttaaccggtgtccccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 32202567  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||| || || ||  | |||||| |||| |||||||||||||    
T  32202566 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataattc-cttttatgatatgcttaatcaatgtcccagaggcaccagttaacaggacccttatt 32202476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 172 - 333
Target Start/End: Original strand, 46148939 - 46149098
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  46148939 aagggaaatgctaaccggtgcccc--gggcatttgataagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatacattgaaattgtgtaattaatttataa 46149036  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46149037 taaagtcaaaaacaatttctttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 46149098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 198 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 54945940 - 54945780
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  54945940 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttcgttttat 54945841  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||   ||  ||||||||||||||||||    
T  54945840 ggt-ataattcctttttatggtatacttaaccagtgctccggaacaccggttagcaggaccc 54945780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5091798 - 5091612
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  5091798 aagggaaatactaaccggtactcccggggcactggttaagaatatgaaaaataaaattatataataattaatatattaaaattgtgtaattaatttataa 5091699  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  5091698 taaagtcataaacagtttccttttatagtaataattcccttttat-gtatgcttaaccagtgtccgggagcaccggttagcaggaccc 5091612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 205 - 362
Target Start/End: Original strand, 4220226 - 4220383
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  4220226 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaattttcttttat-gtaata 4220324  T
Q  305 attctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||| | |  |||||||||||||| ||||||||    
T  4220325 attcccttttatggtatgcttaacatgtgctccgtaggcaccggttagcatgaccctta 4220383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3783687 - 3783534
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||   ||||||    
T  3783687 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcaccggttaaacatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtttaattaattgataata 3783588  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaa 327  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  3783587 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaa 3783534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 198 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30154324 - 30154188
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  30154324 gggcactagttaag-atatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaaaacaatttccttatat 30154226  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  30154225 gataataattctcttttatggtgtgcttaaccagtgcc 30154188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 179 - 357
Target Start/End: Original strand, 39843912 - 39844086
Alignment:
Q  179 atgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagtt 278  Q
    |||||||  ||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||     
T  39843912 atgctaatcggtgccttcagagcattggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtc 39844011  T
Q  279 aaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggac 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    ||||  |||||| |||||||||||||    
T  39844012 aaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttagggtatgcttaa----tgccccggggcatcggttagcaggac 39844086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 158 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 46688412 - 46688264
Alignment:
Q  158 gatacaattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaa-----ggaaattatatagtagttaatgtattgaaa 252  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     | |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  46688412 gatataattattataagggaaatgctaactggtgcccccgaggcactggttaaggatatgaaaaattaaagaaaattatacagtagttaatgcattgaaa 46688313  T
Q  253 ttgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  46688312 ttgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatggta 46688264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 201 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 53656037 - 53655887
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||  |||||||||    
T  53656037 cacttgttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaataattttattttatggt 53655938  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggtta 350  Q
    |||||||   |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  53655937 aataatttcattttatggtatgcttaatcagtgcctcggaggcaccggtta 53655887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 31517217 - 31517362
Alignment:
Q  226 aattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagt-ttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtt 324  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||| | | ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31517217 aattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaagtcaaaaataatgttttttttatggtaataattctcttatatggtatgct 31517316  T
Q  325 taaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacccttattaaaatt 370  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31517317 taaccagtgcctgggggcaccgattagaaggacccttattaaaatt 31517362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 173 - 316
Target Start/End: Original strand, 49915158 - 49915301
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||| ||| || |||||  | |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  49915158 agggaaatgcaaaccggcgcccctggtgcactgattaaggatatgaaaaagaaatttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 49915257  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttat 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  49915258 aaagtaaaaaacagtttccttttataataataatttccttttat 49915301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Original strand, 54054548 - 54054675
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||    
T  54054548 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggatatgaaaaaagaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataata 54054647  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  54054648 aagtcaaaaacaatttccttttatggta 54054675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 201 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31680622 - 31680494
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31680622 cactggttaagggtatgaaaaagaaagttacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatttccttttatggt 31680523  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaacc 329  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  31680522 aataattcatttttatgatatgtttaacc 31680494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 30387270 - 30387167
Alignment:
Q  224 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgt 323  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||     
T  30387270 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatgatatgc 30387171  T
Q  324 ttaa 327  Q
    ||||    
T  30387170 ttaa 30387167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 238 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 39877371 - 39877247
Alignment:
Q  238 gttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatgg--tatgtttaaccagtg-c 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |    
T  39877371 gttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattctcttttatggtatatgcttaaccagtgcc 39877272  T
Q  335 ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    | || ||||| ||||||||||||||    
T  39877271 ccggaggcacgggttagcaggaccc 39877247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 335
Target Start/End: Original strand, 41265456 - 41265619
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||||||||| |||  |||| |||| || |||| |||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||    
T  41265456 aaagggaaatgttaatcggtgtccccgggacactagttaagcatactaaaatgaaaattatatagtagttaatgcagtgaaattgtgtaattaatttata 41265555  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    | ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41265556 aaaaa-tcaaaaacagttttcttttattgtaataattttcttttttggtatgtttaaccagtgcc 41265619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 202 - 301
Target Start/End: Original strand, 42815137 - 42815237
Alignment:
Q  202 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttc-cttttatggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42815137 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatcatagttaatgtattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttctcttttatggt 42815236  T
Q  301 a 301  Q
    |    
T  42815237 a 42815237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 360
Target Start/End: Original strand, 16820912 - 16821039
Alignment:
Q  234 agtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    |||| |||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  16820912 agtaattaatgcattgaaattctgtaattaacttataataaagtcatacgcagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtg 16821011  T
Q  334 -cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
     || ||||||||||||||||||||||||    
T  16821012 ccccgggggcaccggttagcaggaccct 16821039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Original strand, 50603254 - 50603386
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacag-tttccttttatgg 299  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||  |||||||     
T  50603254 cactggttaagggtgtggaaaaggaaattgtataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttttttttatga 50603353  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  50603354 taataattctcttttatggtatgcttaaccagt 50603386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 333
Target Start/End: Original strand, 52697083 - 52697210
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 304  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||| ||  ||||||||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||    
T  52697083 ggttaaggatatgaaaaacaaaattatatagtagttaatacattaaaattatataat-aatttataataaagtcaaaaataattttcctttattgtaata 52697181  T
Q  305 attctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  52697182 attctcttttatgatatgtttaacgagtg 52697210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 264
Target Start/End: Original strand, 50167590 - 50167679
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||||| ||||  | | ||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50167590 agggaaatgctaaccggtgttctcggggcactggttaaagatatgaaaaagaaaat--tatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa 50167679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 330
Target Start/End: Original strand, 53268764 - 53268875
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatg 317  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||| |||||| ||    
T  53268764 aaaaaagaaattatatattagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacaattttcttttataataataattttcttttttg 53268862  T
Q  318 gtatgtttaacca 330  Q
    ||||| |||||||    
T  53268863 gtatgcttaacca 53268875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1432703 - 1432576
Alignment:
Q  199 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||      | |||||| ||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  1432703 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaat------acattgtg-aattaatttataataaaataaaaaacagttt-cttttatg 1432612  T
Q  299 gtaat--aattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
     ||||  |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  1432611 ataataaaattctcttttataatatgcttaaccagt 1432576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 249 - 330
Target Start/End: Original strand, 8133782 - 8133862
Alignment:
Q  249 gaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8133782 gaaaatgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagttttcttttatggtaataattatcttttat-gtatgtttaacca 8133862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 53004063 - 53003954
Alignment:
Q  253 ttgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttag 351  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||   |||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||    
T  53004063 ttgtgtaattaatgtataataaagtcaaaaataatttccttttaaaataataattctcttttatgatatgcttaatcagtgtccccgggacaccggttag 53003964  T
Q  352 caggaccctt 361  Q
    ||||||||||    
T  53003963 caggaccctt 53003954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5590788 - 5590689
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| | || || | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5590788 attcttcattttgttccaatgccaagattcaaccttttctatttgcatatgataactcgttttctataagctccattatttcttcttcttaatcttatgc 5590689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 48127582 - 48127681
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| | || || | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  48127582 attcttcattttgttccaatgccaagattcaaccttttctatttgcatatgataactcgttttctataagctccattatttcttcttcttaatcttatgc 48127681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17344814 - 17344705
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    |||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17344814 tggttaagtataataaaaatgaaattatataatagttaatgcatttaaattatataattaaattataa-aaatttaaaaaaagtttctttttatggtaat 17344716  T
Q  304 aattctctttt 314  Q
    || | ||||||    
T  17344715 aactttctttt 17344705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11893590 - 11893400
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||| | ||||||| ||||    
T  11893590 aagggaaatgctaacaggtgcccccagggcactgtttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgaattgaaaattatttaattaatctat 11893491  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||  |||| || || |  ||| ||||||| ||| || |||  |||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  11893490 aaataagtcaacaa-aacttcattttatgataaaaatttccttttttttgtatgcttaaccagtgccccggagcaccggttagcatgaccct 11893400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 362
Target Start/End: Original strand, 34151118 - 34151310
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaa-ttatatagtagttaatgtattgaaa-ttgtgtaattaaacta 268  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  || ||| || ||||||| |||| ||||||| | |    
T  34151118 aaaggaaaatgctaaccgatgccccg-gggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatcca 34151216  T
Q  269 taataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatg-gtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||  |||| || || | |||| ||||||||||| |||| |||||| |  ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34151217 taaataagtcaacaaaactttc-ttttatggtaagaattttcttttttttgtatgcttaacccgtgcccgggagcaccggttagcatgaccctta 34151310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 310 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46688274 - 46688212
Alignment:
Q  310 cttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacccttattaaaattg 371  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  46688274 cttttatggtatgcttaaccagtgctctgggggcaccggttagcagaacctttattataattg 46688212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 10110189 - 10110007
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg---aaattgtgtaattaaacta 268  Q
    |||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || ||||   ||||||| ||||||| |||    
T  10110189 agggaaatgctaaccggtgcctccgggacactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaaaattgtttaattaatcta 10110090  T
Q  269 taataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagca 353  Q
    |||  |||| || || | ||| |||||||||||| |||  |||||| | ||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  10110089 taaataagtcaacaaaacttt-cttttatggtaagaatcttctttttttgtatgcttaacccgtgcc-cggggcaccggttagca 10110007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12701959 - 12701917
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaagga 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12701959 aaagggaaatgttaactggtgcccccggggcactggttaagga 12701917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 563 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 5590465 - 5590425
Alignment:
Q  563 gatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5590465 gatgaattgaagtgttgttctacttgttcaacaagttcaat 5590425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 563 - 603
Target Start/End: Original strand, 48127905 - 48127945
Alignment:
Q  563 gatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48127905 gatgaattgaagtgttgttctacttgttcaacaagttcaat 48127945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 36395279 - 36395248
Alignment:
Q  180 tgctaactggtgcccccagggcactggttaag 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36395279 tgctaactggtgcccccagggcactggttaag 36395248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39877612 - 39877554
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatat 233  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39877612 gggaaatgttaaccggtaccccc-gggcactggttaacgatatgaaaaagaaaattatat 39877554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22225936 - 22225882
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagg 224  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||||||    
T  22225936 aaaagcgaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggataataaaaagg 22225882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 213
Target Start/End: Original strand, 25532957 - 25532993
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaagga 213  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25532957 aaatgttaaccggtgcccccagggcactggttaagga 25532993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27988687 - 27988499
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  27988687 aagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 27988588  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27988587 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggttagcaggaccct 27988499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28045989 - 28045801
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  28045989 aagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 28045890  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28045889 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggttagcaggaccct 28045801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33357317 - 33357154
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  33357317 aagggaaatgctaactggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 33357218  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33357217 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaactagtgcc 33357154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 34228682 - 34228868
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  34228682 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 34228781  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  34228782 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 34228868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 175 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16888728 - 16888544
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16888728 ggaaatgctaaccggtgccccc-gggcacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 16888630  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  16888629 agtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttgtggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16888544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30675758 - 30675568
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  30675758 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 30675659  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30675658 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaggacctttatt 30675568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 171 - 360
Target Start/End: Original strand, 168463 - 168653
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  168463 aaagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 168562  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  168563 ataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattccattttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccct 168653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 13643002 - 13643202
Alignment:
Q  164 attattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatta 263  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13643002 attatttaaaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaatta 13643101  T
Q  264 aactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |  ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13643102 atttataataaagtcaaaaa-aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccctta 13643200  T
Q  363 tt 364  Q
    ||    
T  13643201 tt 13643202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 164 - 364
Target Start/End: Original strand, 13743427 - 13743627
Alignment:
Q  164 attattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatta 263  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13743427 attatttaaaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatacgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaatta 13743526  T
Q  264 aactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |  ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13743527 atttataataaagtcaaaaa-aaattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccctaggagcaccggttagcaggaccctta 13743625  T
Q  363 tt 364  Q
    ||    
T  13743626 tt 13743627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 11112638 - 11112825
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  11112638 agggaaatgctaactggtgcatccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 11112737  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11112738 aaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcacttttatggtatgcttaacctgtgccctgggggcactggttagcaggaccc 11112825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 173 - 361
Target Start/End: Original strand, 36730444 - 36730631
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  36730444 aggggaatgctaactggtgcccc-aggacactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 36730542  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||  | |||||||||||||  |||||||    
T  36730543 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatagtatgcttaacctgtgccccgtggcaccggttagccagaccctt 36730631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2805446 - 2805259
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2805446 gggaaatgttaaccagtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaacctataata 2805347  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  2805346 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagccggaccct 2805259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20831737 - 20831553
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  20831737 gaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtataattaatttataataaa 20831638  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||||    
T  20831637 gtcaaaagcagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgctcccgggacaccggttagcaggaccc 20831553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29444330 - 29444138
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||    
T  29444330 aaaaggaaaatgttaaccggtgctcccggggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaacgcattgaaattgtgtaattaatttat 29444231  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||    
T  29444230 aataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgtcccggaggcaccgattaacaggaccctt 29444138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4537932 - 4537741
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||    
T  4537932 aagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaataggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattgataa 4537833  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  4537832 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgccccagaggcaccggttagcaggaccctta 4537741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16394247 - 16394061
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||||||    
T  16394247 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataata 16394148  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  16394147 aagtcaaaaacagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccc 16394061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 43119216 - 43119402
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  43119216 agggaaatgctaaccggtgccctcggggcactgattaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 43119315  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||    
T  43119316 aaagtcaaaaacagttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaaccaatggcccggggcaccggttagcaggaccc 43119402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 345
Target Start/End: Original strand, 16785085 - 16785257
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16785085 aagggaaatgctaaccggtgctcc-agggcactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagcagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa 16785183  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcacc 345  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||    
T  16785184 taaagtcaaaaacagtttccttttataataataattctcttttatggtatgattaacccgtgcccaggggcacc 16785257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 333
Target Start/End: Original strand, 21595848 - 21596005
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21595848 ggaaatgctaaccggtgccccc-gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataggagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 21595946  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21595947 tgtcaaaaacagtttccttttatggtattaattcccttttatggtatgcttaaccagtg 21596005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 7304671 - 7304518
Alignment:
Q  207 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataat 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  7304671 ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgaaaataat 7304572  T
Q  307 tctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  7304571 tctcttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagtaggaccc 7304518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 206 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16890634 - 16890482
Alignment:
Q  206 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16890634 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataa 16890535  T
Q  306 ttctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggac 357  Q
    |||  |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16890534 ttcctttttatggtatgcttaaccggtgcctccggggcaccggttagcaggac 16890482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 188 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42035153 - 42035013
Alignment:
Q  188 ggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagt 287  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  42035153 ggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaat 42035054  T
Q  288 ttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaac 328  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42035053 tttcttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 42035013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 356
Target Start/End: Original strand, 28626792 - 28626950
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28626792 gggcaccggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaaaacagtttctttttat 28626891  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcagga 356  Q
    | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  28626892 gataataattcccttttatggtatgcttaatcagtgtccgggagcaccggttagcagga 28626950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9254068 - 9253899
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  9254068 ccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatt-aatgataataaagtcaaaaacagtttcct 9253970  T
Q  293 tttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  9253969 tttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgtcccaggggcaccggttagca-gacccttat 9253899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 361
Target Start/End: Original strand, 4648193 - 4648382
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  4648193 aagggaaatgctaaccggtgtcccg-gggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa 4648291  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||    
T  4648292 taatgtcaaaaacagtttcttttgatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagtatcttgggagcaccggttagcatgaccctt 4648382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 9063248 - 9063051
Alignment:
Q  163 aattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatt 262  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  9063248 aattagtataagggaaatgctaaccggtgtcccg-gagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtgcaatt 9063150  T
Q  263 aaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  9063149 aatttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttgtgatatgcttaaccagtgccccggaagcaccggttagcaggaccct 9063051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 204 - 364
Target Start/End: Original strand, 32113938 - 32114100
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagttt-ccttttatggtaa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  32113938 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtaaaaaacagtttcccttttatgataa 32114037  T
Q  303 taattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||||||||||    
T  32114038 taattcccttttatagtatgtttaaccagtgctccagagccaccggttagcaggacccttatt 32114100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 333
Target Start/End: Original strand, 12203854 - 12204013
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  12203854 agggaaatgctaaccggtgccccc-gggtaccggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 12203952  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  12203953 aatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtg 12204013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 333
Target Start/End: Original strand, 12448282 - 12448441
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  12448282 agggaaatgctaaccggtgccccc-gggtaccggttaagggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 12448380  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  12448381 aatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgctgaaccagtg 12448441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 329
Target Start/End: Original strand, 37373206 - 37373360
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  37373206 gggaaatgctaaccggtgccccc-ggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 37373304  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacc 329  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  37373305 aagtcgaaaacagttttcttttatggtaataattccctttcatggtatgcttaacc 37373360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9537982 - 9537824
Alignment:
Q  202 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||  |||||| |||||| |||    
T  9537982 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaattcaaaaggagtttctttttatagta 9537883  T
Q  302 ataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||    
T  9537882 ataatttccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttagcaggaccc 9537824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Original strand, 40831279 - 40831463
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||  ||||||    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  40831279 aagggaaatgctaaccagtgccc----ggcactggttaaagatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataa 40831374  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  40831375 taaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattttcttttatagtatgcataatctgtaccctggagacaccggttagcaggaccc 40831463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3930419 - 3930258
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||||    
T  3930419 agggaaatgctaatcggtgccccc-gggcactagttaataatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgcattgaagttgtgtaattaattgataat 3930321  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  3930320 aaagtcaaaaacagtttccttttttgataataatttccttttatgatatgcttaaccagtgcc 3930258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 317
Target Start/End: Original strand, 10870382 - 10870495
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10870382 tggttaatgatataaaaaagaaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggtaat 10870481  T
Q  304 aattctcttttatg 317  Q
    ||||| ||||||||    
T  10870482 aattcccttttatg 10870495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 237 - 357
Target Start/End: Original strand, 39406905 - 39407024
Alignment:
Q  237 agttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct 336  Q
    ||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||     
T  39406905 agttaatgcgttaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaactagtgcc- 39407003  T
Q  337 gggggcaccggttagcaggac 357  Q
      |||||||||||||||||||    
T  39407004 ccgggcaccggttagcaggac 39407024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 29235235 - 29235421
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| | ||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  |||||||    
T  29235235 gggaaatgctaaccggtgttcccggagcattgattaaggatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaatttgtgtaattaatttataata 29235334  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || | ||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||| | ||| |||||||||| || |||  |||||||||||| |||||    
T  29235335 aaatcaaaaataggttccttttatgataataatttccttttataggatgcttaaccagtgtcccgggaacaccggttagcatgaccc 29235421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 277
Target Start/End: Original strand, 9278210 - 9278315
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  9278210 aagggaaatgctaactggtgcctcagggacactcgttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 9278309  T
Q  272 taaagt 277  Q
    ||||||    
T  9278310 taaagt 9278315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 239 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24843400 - 24843280
Alignment:
Q  239 ttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgg 338  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||    ||    
T  24843400 ttaatctattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaatcagtttccttttatgacaataattctcttttatggtatgcttaatcagtattcgg 24843301  T
Q  339 gggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  24843300 gagcaccggttagcaggaccc 24843280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 203 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 42433700 - 42433583
Alignment:
Q  203 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaa 302  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42433700 ctggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaacagttttcttttatggtaa 42433602  T
Q  303 taattctcttttatggtat 321  Q
    |||||  ||||| ||||||    
T  42433601 taatttccttttttggtat 42433583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 362
Target Start/End: Original strand, 22956728 - 22956895
Alignment:
Q  196 cagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcctttt 295  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| | |||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||    
T  22956728 cagggcactggttaagagtataaaaaaggaa-tcatatggtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttcctttt 22956826  T
Q  296 atggtaataatt--ctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||| ||||  || |||||||||||||||||  |||||| |  | ||||||||| |||||||||||    
T  22956827 atggtaaaaattcccttttttatggtatgtttaataagtgcccgaagacaccggttaacaggaccctta 22956895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 277
Target Start/End: Original strand, 10618016 - 10618121
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||   ||||    
T  10618016 aaggaaaatgctaaccggtgcctctagggcacaggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcaattaaattgtgtaattaattgataa 10618115  T
Q  272 taaagt 277  Q
    ||||||    
T  10618116 taaagt 10618121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Original strand, 12652630 - 12652707
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaa 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12652630 gggaaatgctaaccggtgcccctggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaa 12652707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 301
Target Start/End: Original strand, 34192809 - 34192902
Alignment:
Q  208 taaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||  ||||||||||    
T  34192809 taagaatatgaaaaaggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaataattttattttatggta 34192902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39751658 - 39751485
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatatagtagttaatgtatt-gaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||| || |||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  39751658 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaggaaaattatatattatttattgcattaaaaattgtttaattaatctataa 39751559  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcacc 345  Q
      |||| || || |  ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39751558 ataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcctcgggggcacc 39751485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 296
Target Start/End: Original strand, 17467601 - 17467725
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  17467601 aaggaaaatgctaaccggtacccccgaaacactagttaatgatatgaaaaaggaaattatgcagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 17467700  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttcctttta 296  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||    
T  17467701 taaaatcaaaaacaatttcctttta 17467725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 225 - 307
Target Start/End: Original strand, 22451835 - 22451916
Alignment:
Q  225 aaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatt 307  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22451835 aaattatatagcagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaaaaatagcttccttttatggtaataatt 22451916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 42655472 - 42655268
Alignment:
Q  165 ttattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaatt 262  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||| || |||| ||||||| |||||    
T  42655472 ttattaaaagggaaatgctaagtggtgcctccggagcacttgttaaggataatgaaaaggtaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaatt 42655373  T
Q  263 aaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    || | ||||  |||| || || |  ||| ||||||  ||| ||||  ||||| | ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  42655372 aatccataaataagtcaacaa-aacttcattttataataagaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgccctggggcaccggttagcatgaccctta 42655274  T
Q  363 ttaaaa 368  Q
    ||||||    
T  42655273 ttaaaa 42655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14191103 - 14191034
Alignment:
Q  267 tataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct 336  Q
    ||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14191103 tataataaaatcaaaaacagttttattttatgataataattctcttttatagtatttttaaccagtgcct 14191034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 228 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30933453 - 30933376
Alignment:
Q  228 ttatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataat 306  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||| | |||||||    
T  30933453 ttatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagttaaaaacatttttcttttacgataataat 30933376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36923849 - 36923782
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtta 241  Q
    ||||||| ||||| | |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36923849 gggaaatactaaccgctgcctccgaggcactgattaaggatatgaaaaaggaaattatataatagtta 36923782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43714373 - 43714184
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||     
T  43714373 ggaaacgctaaccggtgcccccggggcactggtt-aggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaa 43714275  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
     |||| || || |  ||||||||||||||| ||||   |||| | ||||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  43714274 taagtcaacaa-aacttccttttatggtaaaaatttattttttttgtatgcttaaccagtgcccccgggacaccggttagcatgacccttat 43714184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2490225 - 2490152
Alignment:
Q  292 ttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2490225 ttttatggtaaaaatttcctttttttgtatgcttaacccgtgcctcgggggcaccggttagcatgacccttatt 2490152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 233
Target Start/End: Original strand, 29566700 - 29566760
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatat 233  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  29566700 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggataataaaaagggaaattatat 29566760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 264
Target Start/End: Original strand, 4811554 - 4811649
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggata-tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||||| ||| | |||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||    
T  4811554 aaagggaaatgctaatcggtgcctcaagggcaccggttaagaatactaaaaaagaaaattatatagtaattattgcattgaaaattgtataattaa 4811649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2490377 - 2490315
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  2490377 aagggaaatgctaaccggtgcctccggggcacaggttaaggataataaaaagggaaatatata 2490315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Original strand, 10618125 - 10618186
Alignment:
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctg-ggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10618125 aataattaccttttatggtatgcttaacccgtgtctccggggcaccggttagcaggaccctt 10618186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 239
Target Start/End: Original strand, 35695570 - 35695611
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagt 239  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35695570 gggcactgattaaggatataaaaaatgaaattatatagtagt 35695611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 174 - 362
Target Start/End: Original strand, 392096 - 392285
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  392096 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 392195  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  392196 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctta 392285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 166 - 370
Target Start/End: Original strand, 3515758 - 3515963
Alignment:
Q  166 tattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaa 265  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  3515758 tatttaaagggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 3515857  T
Q  266 ctataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
     |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3515858 ttataataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacctgtgccccaggggcaccggttagcaggacccatatt 3515957  T
Q  365 aaaatt 370  Q
     |||||    
T  3515958 taaatt 3515963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 171 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 32929697 - 32929505
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  32929697 aaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcaatggttaagggtatgaaaaaggaaattatatattaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 32929598  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32929597 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctta 32929505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Original strand, 23402136 - 23402327
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  23402136 aagggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataa 23402235  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  23402236 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccctta 23402327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12145303 - 12145117
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  12145303 gggaaatgctaaccggtgcccccagtgcacttgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12145204  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  12145203 aagtcaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatagtatgcttaaccagtgctccggaggcaccggttagcaggaccc 12145117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 471 - 604
Target Start/End: Original strand, 33435843 - 33435976
Alignment:
Q  471 aatattgaggacatggaattcataacaacaagttctgtttaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttcttgtattatcgctgatgaatg 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33435843 aatattgaggacatggaattcataacaacaagttatgtttgacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttcttgtattatcgctgatgaatg 33435942  T
Q  571 gaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaata 604  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33435943 gaagtgttgttctacttgttcaacaagttcaata 33435976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 177 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 32985376 - 32985192
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||| ||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32985376 aaatgcaaaccggtgccctcggggcattggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaag 32985277  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  32985276 tcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagaaccct 32985192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 370
Target Start/End: Original strand, 4215693 - 4215892
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  4215693 aagggaaatgttaaccggtgcccccggggcactggttaagagtatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 4215792  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttattaaaatt 370  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4215793 taatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcatcggttagcaggacccttcttataatt 4215892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 361
Target Start/End: Original strand, 27433491 - 27433680
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  27433491 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcat 27433590  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccag-tgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  27433591 aatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccctt 27433680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 176 - 332
Target Start/End: Original strand, 2350654 - 2350810
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2350654 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaa 2350753  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  2350754 gtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagt 2350810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 172 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 7851347 - 7851191
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  7851347 aagggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa 7851248  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaac 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  7851247 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaac 7851191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18276804 - 18276612
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||    
T  18276804 aaaagggaaatgttaactggtgcccct-gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaatttgtgtaattaatttat 18276706  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatgg---tatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  18276705 aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtattatgcttaaccagtgcccctggggcaccggttagcaggaccc 18276612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29451301 - 29451140
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29451301 agggaaatgctaactggtgcctcc-gggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaattataat 29451203  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  29451202 aaagtcaaacacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacccgtgcc 29451140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 26467286 - 26467121
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26467286 gggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaatagtttccttttat 26467187  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  26467186 ggtaataattcccttttatggtatgtctaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccctta 26467121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 35043890 - 35044074
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||    
T  35043890 gggaaatgctaactggtgtccacgggacactggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgta-ttaatttataata 35043988  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||    
T  35043989 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccggggcaccggttaacatgaccc 35044074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13417148 - 13416957
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa---actata 270  Q
    |||||||| |||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |  |||    
T  13417148 gggaaatgttaaccgataccctcagggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 13417049  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  13417048 ataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttataatatgcttaaccagtgcccggaggcaccggttagctggaccctta 13416957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 171 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3026196 - 3026013
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||    
T  3026196 aaagggaaatgctaactggtgcccc--gggcactggttaagggtatgaaaaatgaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttata 3026099  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcagg 355  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||||    
T  3026098 ataatgtcaaaaacagttttcttttatcgtaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgtcccgagggcaccggttagcagg 3026013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25165569 - 25165410
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  25165569 tggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataat 25165470  T
Q  304 aattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25165469 aattctcttttacgatatgcttaaccaatgccctgggagcaccggttagcaggaccctta 25165410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 172 - 301
Target Start/End: Original strand, 20897946 - 20898075
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  20897946 aagggaaatgctaaccggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 20898045  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  20898046 taaagtcagaaacagtttccttttatggta 20898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 1391365 - 1391205
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  1391365 aagggaaatgctaaccggtgctccg-gggtactgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataa 1391267  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1391266 taaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtg 1391205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 160 - 360
Target Start/End: Original strand, 12525705 - 12525906
Alignment:
Q  160 tacaattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgta 259  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  12525705 tacaataatttaaagggaaatgctaaccggtgcctccggggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaaatgtgta 12525804  T
Q  260 attaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggc-accggttagcaggacc 358  Q
    |||||  |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||   |||  ||||||||||||||||    
T  12525805 attaatttataataatgtcaaacacagtttcattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaactagtgccccagggataccggttagcaggacc 12525904  T
Q  359 ct 360  Q
    ||    
T  12525905 ct 12525906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 362
Target Start/End: Original strand, 29978233 - 29978420
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |  |||||||    
T  29978233 gggaaatgctaaccggtgcctcc-ggacactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgtattgaaattatgtaatatatttataata 29978331  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  ||  |||||||||||||||||||||    
T  29978332 aagtcaaaaacagtttaattttatggtaataattcccttttatgatatgcttaaccagcgccctggaacaccggttagcaggaccctta 29978420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1840407 - 1840272
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1840407 gcactggttaaggatataaaaaaagaaattatataataattaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttcctttcatgg 1840308  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  1840307 taataattcccttttatgatatgtttaaccagtgcc 1840272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 2580952 - 2581139
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||||    || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  2580952 gggaaatgctaaccggtgcccttgaggtactggttaatgatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 2581051  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||    
T  2581052 aagtcaaaaataatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaataccccgggagcaccggttagcaggaccct 2581139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 28225211 - 28225412
Alignment:
Q  164 attattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatta 263  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28225211 attattatatgggaaatgctaactggtgcctctgggatacgggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaatta 28225309  T
Q  264 aactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| || |  ||||| |||||| ||||||||||    
T  28225310 atttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttagtaggaccctta 28225409  T
Q  363 tta 365  Q
    |||    
T  28225410 tta 28225412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 21878533 - 21878352
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||    
T  21878533 gggaaatgctaaccggtgcctcccgggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatttaattaatttataata 21878434  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||| ||  ||  |||||||||||||||||||    
T  21878433 aagtcaaaaacagtttctttttatggtaataattccct------gtatgtttaaccagtgccccaggaacaccggttagcaggaccct 21878352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 33435613 - 33435719
Alignment:
Q  38 ttacgcattcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33435613 ttacgcattcttcattttattccaatgccaagagccaatcgtttctatctacagata-caactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 33435711  T
Q  138 ttatgcta 145  Q
    ||||||||    
T  33435712 ttatgcta 33435719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 34396715 - 34396596
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  34396715 aagggaaatgctaaccggtgcccccaggacacaggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 34396616  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttcc 291  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  34396615 taaagtcaaaaacagtttcc 34396596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 31280320 - 31280501
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||| |||  ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||    
T  31280320 agggaaatgctaaccggtgctcccgaggcactgattaagagaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataat 31280419  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || || |||||| |||||||||||| ||||||||||     ||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31280420 aatgtcaaaaacggtttccttttatagtaataattc-----tatggtatgcttaacgagtgcccggaggcaccggttagcaggaccc 31280501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11115256 - 11115106
Alignment:
Q  199 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  11115256 ggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataa--tcaaaaatagttttcttttatg 11115159  T
Q  299 gtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttag 351  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  11115158 gtaataattcccttttatgatatgtttaaccagtgccccgggacaccggttag 11115106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23629743 - 23629619
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23629743 ccccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattactttataataaagtcaaaaacaatttcct 23629644  T
Q  293 tttatggtaataattctcttttatg 317  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||    
T  23629643 tttatgacaataattttcttttatg 23629619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34477717 - 34477609
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||    
T  34477717 cccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcct 34477618  T
Q  293 tttatggta 301  Q
    |||||||||    
T  34477617 tttatggta 34477609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 206 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34852003 - 34851876
Alignment:
Q  206 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  34852003 gttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttataataaagtcaaaaataatttccttttatagtaataa 34851904  T
Q  306 ttctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  34851903 ttctcttttataatatgcttaaccagtg 34851876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 332
Target Start/End: Original strand, 9660988 - 9661144
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||| ||||||| |  |||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||    
T  9660988 gaaatgctaaccggtgccctcgtggcaccagttaaggatatgaaaaaagaaattacataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttaaaataaa 9661087  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||    
T  9661088 gttaaaagcagtttccttttatggtaataattccattttataatatgtttaatcagt 9661144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 216 - 329
Target Start/End: Original strand, 961051 - 961164
Alignment:
Q  216 tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctctttta 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  961051 tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacaatttccttttatgataataattctctttta 961150  T
Q  316 tggtatgtttaacc 329  Q
    ||||||| ||||||    
T  961151 tggtatgcttaacc 961164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 335
Target Start/End: Original strand, 5323397 - 5323561
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||   ||||||   | |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||  ||||    
T  5323397 aaagggaaatgctaatcagtgccctatgagcactgattaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaaagcattaaaattatgtaattaatttata 5323496  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||    
T  5323497 ataaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcgtaaccggtgcc 5323561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 273
Target Start/End: Original strand, 13529447 - 13529554
Alignment:
Q  166 tattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaa 265  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13529447 tattaatagggaaatgctaacttgtgccttcggggcactggttaaggatgtgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaat 13529546  T
Q  266 ctataata 273  Q
     |||||||    
T  13529547 ttataata 13529554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 360
Target Start/End: Original strand, 34706717 - 34706908
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaacta 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | |    
T  34706717 aaagggaaatgctaaccggtgccccgggggcaccggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatcca 34706816  T
Q  269 taataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||  |||| || || |  ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  34706817 taaataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaagaccct 34706908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 335
Target Start/End: Original strand, 22417303 - 22417354
Alignment:
Q  284 cagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22417303 cagtttccttttatgctaataattctcttttatggtatgcttaatcagtgcc 22417354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 244
Target Start/End: Original strand, 14559920 - 14559992
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatg 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  14559920 aagggaaatgctaaccggtgccttcggggaactgattaaagatatgaaaaaagaaaatatataatagttaatg 14559992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34712312 - 34712252
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatat 233  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  34712312 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatat 34712252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Original strand, 29716726 - 29716768
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaagga 213  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  29716726 aaagggaaatgttaactagtgcccccggggcactggttaagga 29716768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 33435744 - 33435778
Alignment:
Q  360 ttattaaaattgccttctttgtttttctactattt 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33435744 ttattaaaatggccttctttgtttttctactattt 33435778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 545
Target Start/End: Original strand, 33435810 - 33435842
Alignment:
Q  513 caatttaaaaaacaatttggcataaatcatggc 545  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33435810 caatttaaaaaataatttggcataaatcatggc 33435842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 453 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 51827036 - 51826885
Alignment:
Q  453 catggcaagtcagctataaatattgaggacatggaattcataacaacaagttctgtttaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttcttg 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51827036 catggcaagtcagctataaatattgaggacatggaattcataacaacaagttctgtttaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatgaccttcttg 51826937  T
Q  553 tattatcgctgatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaata 604  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51826936 tattatcgctgatgattggaagtgcttttctacttgttcaacaagttcaata 51826885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 171 - 361
Target Start/End: Original strand, 52520678 - 52520869
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  52520678 aaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 52520777  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  52520778 ataatgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 52520869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 170 - 362
Target Start/End: Original strand, 18014668 - 18014861
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18014668 aaaagggaaatgctaactggtgcccccggggcactgattaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactat 18014767  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18014768 aataaagttaaaaacagtttccttttatgataataatttccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccagttagcaagaccctta 18014861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 173 - 365
Target Start/End: Original strand, 49893330 - 49893523
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  49893330 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataat 49893429  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  49893430 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgccccgggggcaccggttagccggacccatatta 49893523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 272219 - 272406
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  272219 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 272318  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  272319 aaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcggtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 272406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 174 - 362
Target Start/End: Original strand, 4168183 - 4168372
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4168183 gggaaatgctaaccggtgcctccggggaactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataata 4168282  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  4168283 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtaccccgggggcaccggttagcaggaccctta 4168372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 43786871 - 43787062
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  43786871 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 43786970  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43786971 atatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggacccttatt 43787062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 174 - 363
Target Start/End: Original strand, 39074419 - 39074608
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  39074419 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 39074518  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
    | | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39074519 atg-tcaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggacccttat 39074608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Original strand, 46352630 - 46352820
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||    
T  46352630 aaaagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatacagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgat 46352729  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  46352730 aataaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccc 46352820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Original strand, 858587 - 858776
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  858587 aagggaaatgcaaaccggtgcccccagtgcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 858686  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  858687 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagccggaccct 858776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 453 - 604
Target Start/End: Original strand, 48648724 - 48648875
Alignment:
Q  453 catggcaagtcagctataaatattgaggacatggaattcataacaacaa-gttctgtttaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttctt 551  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48648724 catggcaagtcagctgtaaatattgaggacatgaaattcataacaacaaagttctgttcaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttctt 48648823  T
Q  552 gtattatcgctgatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaata 604  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48648824 -tattatcgctgatgaatggaagtgatgttctacttgttcaacaagttcaata 48648875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 361
Target Start/End: Original strand, 48725271 - 48725459
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  48725271 gggaaatgctaaccggtgccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 48725370  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||  ||| ||||||||||||||||    
T  48725371 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggaccacgggttagcaggaccctt 48725459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 172 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40362768 - 40362578
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   ||||    
T  40362768 aagggaaatgctaacccgtgcctccggggcactgattaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaattgataa 40362669  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||    
T  40362668 taaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggtaccgattagcaggaccctt 40362578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41554122 - 41553940
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  41554122 aaatgctaactggtgccccg-gtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 41554024  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||  ||||| |||| |||||||    
T  41554023 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattattttttatggtatgcttaacaagtgccctgggaacaccgattagtaggaccc 41553940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10617469 - 10617284
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  10617469 gggaaatgttaaccggtgccccc-ggacactgattaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 10617371  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10617370 aagtcaaaaacaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 10617284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 175 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42964434 - 42964246
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    ||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42964434 ggaaatgttaactggtgcttccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattttatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 42964335  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  42964334 agtcaaaaacagttttcttttatagtaataattcacttttatgatatgcttaaccagtgtctcagggacaccggttagcaggaccctta 42964246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Original strand, 2505379 - 2505523
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2505379 tggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaattgtgtaattaattcataataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaat 2505478  T
Q  304 aattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccgg 347  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2505479 aattcccttttatggtatgtttaaccagtgccctgggggcaccgg 2505523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 356
Target Start/End: Original strand, 20923992 - 20924173
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  20923992 gggaaatgctaaccggtgcttccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaattcattgaaattgtgtaattaatttataata 20924091  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcagga 356  Q
    |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||  | ||||||||||||||||    
T  20924092 atatcaaaaacagtttccttttaaggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtgtcct--gagcaccggttagcagga 20924173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 334
Target Start/End: Original strand, 28139309 - 28139469
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  28139309 gggaaatgctaactggtgcccccaagacactggttaaggatatgaaaaaagaaattaaatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 28139408  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc 334  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  28139409 aagtcaaaagcagattccttttatggtaataattcccttttatggtatacttaaacagtgc 28139469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 163 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53490023 - 53489849
Alignment:
Q  163 aattattaaaagggaaatgctaactggtgccccca--gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaa 260  Q
    ||||||| || ||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  53490023 aattatttaatgggaaatgctaatcggtgcccccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaa 53489924  T
Q  261 ttaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  53489923 ttaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataataattctattttatggtatgcttaaccaatgcc 53489849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 193 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 49529436 - 49529269
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata---gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagttt 289  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||    
T  49529436 ccccggggcactgattaaggatatgaaaaagaaaattatatactagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacatttt 49529337  T
Q  290 ccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  49529336 ccttttatggtaataatttccttttatggtatgtttaaccagtgcc-gggggcaccggttagcaagacc 49529269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Original strand, 41304004 - 41304164
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||   |||||    
T  41304004 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcagtggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaat--tgtaattaattgataat 41304101  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  41304102 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccaatgcc 41304164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 48648492 - 48648599
Alignment:
Q  38 ttacgcattcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48648492 ttacgcattcttcattttgttccaatgccaagagccgatcgtttctatctatagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 48648591  T
Q  138 ttatgcta 145  Q
    ||||||||    
T  48648592 ttatgcta 48648599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 52246582 - 52246768
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  52246582 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagttgttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 52246681  T
Q  274 aagttaaaaac-agtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||||| | |||  |||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  52246682 aagtcaaaaacaattttttttttatagtaataatttccttttatggtatgcttaactagtgcccgagagcaccagttagcaggaccc 52246768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 200 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 43269899 - 43269738
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |    
T  43269899 gcactggttaaggatatgaaaagggaaattacatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaaatcaaacacagtttccttttatag 43269800  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  43269799 taataattatcctttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 43269738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 359
Target Start/End: Original strand, 7468428 - 7468595
Alignment:
Q  191 gcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttc 290  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||     
T  7468428 gcccccgggacactggttaaggaaatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagtttt 7468527  T
Q  291 cttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||| |||| |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  7468528 cttttatgataataa-tcccttttatggtatgcttaatcagtgccccggagcaccggttagcaggaccc 7468595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 2119431 - 2119614
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| |||| |||| || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||    
T  2119431 gggaaatgttaaccggtgtcctcgaggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgagtaattaatttataata 2119530  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||  |||||||||||||    
T  2119531 aagtcaaaaacaatttccttttat-gtaataattc-cttttatggtatgtttacccaatacgtggggacactcgttagcaggaccc 2119614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 198 - 322
Target Start/End: Original strand, 22248910 - 22249034
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22248910 gggcactagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttattgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcaaaaacagttttcttttat 22249009  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatg 322  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||    
T  22249010 ggtaataattcccttttatagtatg 22249034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2938217 - 2938039
Alignment:
Q  182 ctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaa 281  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||| |||    
T  2938217 ctaactggtgcccct-gggtactggttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtgattaatttataataaagtcaaa 2938119  T
Q  282 aacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  2938118 aacaatttcattttatggtaataattcacttttatggtatgcttaacgagtaccccgagggcaccggttagcaggaccct 2938039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 353
Target Start/End: Original strand, 42548120 - 42548274
Alignment:
Q  199 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatg 298  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| |||||||    
T  42548120 ggcactgcttaaagatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaataatttcattttatg 42548219  T
Q  299 gtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagca 353  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  42548220 gtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggacaccggttagca 42548274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 50359368 - 50359213
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  50359368 aaatgctaactggtgccccgtgg-cactggttaaggttaagaaaaaaaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgggtaattaatatataataaag 50359270  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  50359269 tcaaaaacagttttcttttgtggtaataattatcttctatggtatgcttaaccagtg 50359213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50395742 - 50395560
Alignment:
Q  180 tgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagtta 279  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| |     
T  50395742 tgctaaccggtgcccccgggacactggttagggatatgaaaaagaaaattatacagtagttaatgcatagaaattgtgtaattaattgataataaag-tc 50395644  T
Q  280 aaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | | || | ||||| |||||||||||||||    
T  50395643 aaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatgattaatcagtacaccggagacaccgattagcaggaccctta 50395560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 231 - 359
Target Start/End: Original strand, 6842676 - 6842805
Alignment:
Q  231 tatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  6842676 tataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaacca 6842775  T
Q  331 gtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  6842776 gtgccccgggggcagcggttagcaggaccc 6842805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 11308398 - 11308210
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||   ||||    
T  11308398 aagggaaatgctaaccggtgtttccgggacactgattaaggatgtgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaataatgtaattaattgataa 11308299  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  11308298 taaaatcaaaaatagtttccttttatggtaataattc-cttttatggtatgcttaaccaatgccccaggggcaccgattagcaggaccct 11308210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 41993773 - 41993617
Alignment:
Q  206 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  41993773 gttaagtatattaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttat-ataataa 41993675  T
Q  306 ttctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||  |||   ||||||||||||||| |||||||    
T  41993674 ttctcttttatggtatgcttaactagtaccctaaaggcaccggttagcagaaccctta 41993617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 363
Target Start/End: Original strand, 13159895 - 13160086
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||    
T  13159895 aagggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataa 13159994  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||   |||||||||||| |||| ||||  |   | |||||||||||||| ||||||||    
T  13159995 taaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagtatccacgagcaccggttagcagaacccttat 13160086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 50299133 - 50298973
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| || |||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||    
T  50299133 aaggaaaatgttaactggtgtccccaaggtactgattaaagatataaaaaggaaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtaattaatttataa 50299034  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  50299033 taaagtcaaaaacagtttctttttatgataataattcactcttatggtatacttaaccagt 50298973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 38852216 - 38852378
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagt---taatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||||||||||| |||  |||| || || | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  38852216 gggaaatgctaaccggt--ccccgggacattcgttaaggatataaaaaatgaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttata 38852313  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38852314 ataaagtcaaaaacagttttattttatgataataattcacttttatggtatgtttaacccgtgcc 38852378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 358
Target Start/End: Original strand, 24488390 - 24488551
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||   |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  24488390 gggcactggttaagaatgtaaaaaaggaaattatataatagttaatgcatggaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagtttctttttat 24488489  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  24488490 ggtaataattctcttttatgatatgctgaactagtgctccgggagcaccggttaacaggacc 24488551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 51827258 - 51827158
Alignment:
Q  38 ttacgcattcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51827258 ttacgcattcttcattttgttcca------agagccaatcgtttttatctacagataacaactcgttt-ctataaccctcattttttcttcttcttaatc 51827166  T
Q  138 ttatgcta 145  Q
    ||||||||    
T  51827165 ttatgcta 51827158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 327
Target Start/End: Original strand, 29241669 - 29241790
Alignment:
Q  206 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  29241669 gttaaggatatgaaaatggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacagattctttttatgataataa 29241768  T
Q  306 ttctcttttatggtatgtttaa 327  Q
    |||  |||||| ||||| ||||    
T  29241769 ttccgttttatagtatgcttaa 29241790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 332
Target Start/End: Original strand, 33140937 - 33141043
Alignment:
Q  226 aattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgttt 325  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  33140937 aattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaagcagttttcttttatggtaataattcccttttatgatatgctt 33141036  T
Q  326 aaccagt 332  Q
    || ||||    
T  33141037 aatcagt 33141043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 249 - 359
Target Start/End: Original strand, 52552549 - 52552658
Alignment:
Q  249 gaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggt 348  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| || ||||    
T  52552549 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtatc-ttttatggtaataattctcttttatggtatatttaaccagtgtccggggacatcggt 52552647  T
Q  349 tagcaggaccc 359  Q
    ||||| |||||    
T  52552648 tagcatgaccc 52552658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 212 - 332
Target Start/End: Original strand, 31514829 - 31514948
Alignment:
Q  212 gatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctct 311  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||  |||||| |||||||||  ||    
T  31514829 gatatgaaaaataaaattatatagtagttaatgtattaaaattgtgtaattaatttataataaaatcaaaaacaattt-tttttatagtaataatttcct 31514927  T
Q  312 tttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||| ||||  |||||||||    
T  31514928 tttatagtatacttaaccagt 31514948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 255
Target Start/End: Original strand, 2391631 - 2391688
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattg 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2391631 gggcactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2391688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 255
Target Start/End: Original strand, 2393392 - 2393449
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattg 255  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2393392 gggcactggttaaggataagaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattg 2393449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 11651593 - 11651692
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  11651593 attcttcattttgttccaatgccaagattcaaccttttctatttgcagatgataactcgttttctataagctccattatttcttcttcttaatcttatgc 11651692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 253
Target Start/End: Original strand, 23925280 - 23925359
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaat 253  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  23925280 gggaaatgctaactggtacccccggggaactggttaagaatataaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattaaaat 23925359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 259
Target Start/End: Original strand, 52718166 - 52718252
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgta 259  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  52718166 aagggaaatactaatcggtgctccc-ggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattaaaattgtgta 52718252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 335
Target Start/End: Original strand, 53054834 - 53054964
Alignment:
Q  207 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtt---aatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||| ||   |||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||| | |||||   ||||    
T  53054834 ttaatgatatgaataatgaaattatatagtaattcttaatgcattgagattgtgtaatttatctataataaagccaaaaatagtt-cattttacaataat 53054932  T
Q  304 aattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  53054933 aattctcttttatagtatgtttaaccaatgcc 53054964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 234
Target Start/End: Original strand, 2362801 - 2362861
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 234  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2362801 gggaaatgctaaccggtgctcccggtgcaatggttaaggatatgaaaaaggaaattatata 2362861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 51819061 - 51818981
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaatt 254  Q
    ||||||||||||||| |||| |  |||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  51819061 gggaaatgctaactgatgcctctggggcactgattaaggatactaaaaagaaaattatttagtagttattgtattgaaatt 51818981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 301
Target Start/End: Original strand, 2362880 - 2362958
Alignment:
Q  222 aggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  2362880 aggaaattatata-tagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataataaaatcaaaaacagttttcttttatggta 2362958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27994486 - 27994395
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  27994486 gggaaatgttaaccgatgcccccggggcactggttaaggatactaaaaaagaaattttatagtaattaatgtagtgaaaattatgtaattaa 27994395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 561 - 603
Target Start/End: Original strand, 11651919 - 11651961
Alignment:
Q  561 ctgatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651919 ctgatgaattgaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 11651961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 305
Target Start/End: Original strand, 21010041 - 21010124
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  21010041 aaaaaggaaattatatagtagttaa--cattgaaattgtataattaatttataa-aaagtcaaaaa-agtttctttttatggtaataa 21010124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 501
Target Start/End: Original strand, 11651880 - 11651908
Alignment:
Q  473 tattgaggacatggaattcataacaacaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11651880 tattgaggacatggaattcataacaacaa 11651908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 513 - 545
Target Start/End: Complemental strand, 51827063 - 51827031
Alignment:
Q  513 caatttaaaaaacaatttggcataaatcatggc 545  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51827063 caatttaaaaaataatttggcataaatcatggc 51827031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12218624 - 12218434
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  12218624 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggataagtatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 12218525  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12218524 taaaataaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgccccgggacaccggttagcaggaccctta 12218434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 170 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29993677 - 29993487
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  29993677 aaaagggaaatgctaacgggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 29993578  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||| |||||||||||||||    
T  29993577 aataaagtcaaaatcaatttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgtcccggaggcatcggttagcaggaccc 29993487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24798590 - 24798403
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  24798590 aagggaaatgctaaccggtgccccc-gggcacttgttgaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 24798492  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  24798491 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatagtatgcttaaccagtgccccgggggcaccagttagcaggaccc 24798403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Original strand, 34333282 - 34333472
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  34333282 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 34333381  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  34333382 taatg-tcaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccctta 34333472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Original strand, 24438477 - 24438663
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  24438477 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactagttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 24438576  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24438577 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccc 24438663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 164 - 359
Target Start/End: Original strand, 4628556 - 4628752
Alignment:
Q  164 attattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatta 263  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  4628556 attaataaaagggaaatgctaaccgatgcccctggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtttaatta 4628655  T
Q  264 aactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc-tgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4628656 atttataataaagtcagaaacagtttacttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccttaggggcaccggttagcaggaccc 4628752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 34606261 - 34606448
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||    
T  34606261 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgaaattaatttataata 34606360  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  34606361 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataattaccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggagcaccggttagcaggaccct 34606448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 18485959 - 18486122
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18485959 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatattgaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaattaatttataa 18486058  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||| |||||    
T  18486059 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaacccgtgcc 18486122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 453 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 31953840 - 31953689
Alignment:
Q  453 catggcaagtcagctataaatattgaggacatggaattcataacaacaagttctgtttaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggccttcttg 552  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31953840 catgacaagtcagctgtaaatattgaggacatgaaattcataacaagaagttatgttcaacaatttaaaaaacaatttggcataaatcatggcattcttg 31953741  T
Q  553 tattatcgctgatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaata 604  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  31953740 tattatcgctgatgaatggaagtcttgttctacttgttcaacaagttcaata 31953689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 198 - 362
Target Start/End: Original strand, 30810679 - 30810844
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30810679 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttat 30810778  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  30810779 ggtaataattttcttttatggtatgtttaaccaatgccccaggggtaccggttagtaggaccctta 30810844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 175 - 330
Target Start/End: Original strand, 28587911 - 28588065
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28587911 ggaaatgctaaccggtgccccc-ggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtcaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 28588009  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacca 330  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28588010 agtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacca 28588065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 13065061 - 13064870
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||| |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  13065061 gggaaatgctaaccggtgcccac--ggtattggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatatttaatgtattgaatttgtgtaattaatttataata 13064964  T
Q  274 aagt-taaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13064963 aagtcaaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctctaggggcaccggttagcagaacccttatta 13064870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23363327 - 23363192
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23363327 gcactcgttaaggataagaaaaaggaaattgtatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 23363228  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23363227 taatatttctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 23363192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 360
Target Start/End: Original strand, 47083086 - 47083241
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47083086 ggttaaggatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaattgataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaata 47083185  T
Q  305 attctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||    
T  47083186 attcccttttatgatatgtttaaccaatgctccggggcaccggttagtagaaccct 47083241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 5239284 - 5239471
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  5239284 agggaaatgctaaccggtgcctccggagcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 5239383  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  5239384 aatgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacttgtgcccccggggcactggttagcaggaccc 5239471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 198 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42044455 - 42044293
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    |||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  42044455 gggcaccggttaaaggtatgaaaaaagaaattatatagtagttaatagattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagttttcttttat 42044356  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  42044355 ggtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtgccccggggcaccggttagcatgaccct 42044293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 177 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 11686507 - 11686324
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    ||||||||||||||||  || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11686507 aaatgctaactggtgcttccgggatactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11686408  T
Q  277 ttaaaaacag--tttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    | ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  11686407 tcaaaaacagtttttttttttatggtaataattctcttttatgatatgcttaacctgtacccggaggcaccggttagcaggacc 11686324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 175 - 354
Target Start/End: Original strand, 47656981 - 47657158
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47656981 ggaaatgctaaccggtgcttcgggggcactggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 47657080  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcag 354  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||    
T  47657081 agttaaaagcagttt--ttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaatcagtgcctcgaagcaccggttagcag 47657158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 43594222 - 43594063
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  43594222 gggaaatgctaaccggtgtccccggaacactggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtataattaatttataata 43594123  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43594122 aagtcaaaaacagtttcctcttatgataataattctcttttatggtatgcttaaccagtg 43594063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Original strand, 47839492 - 47839653
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  47839492 agggaaatgctaaccggtgtcccg-gggtactggttaaggatatgaaaaaggaatttatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataat 47839590  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  47839591 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgaataaccagtgcc 47839653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31954064 - 31953959
Alignment:
Q  38 ttacgcattcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31954064 ttacgcattcttcattttgttccaatgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataatcctcattttttcttcttcttaatc 31953965  T
Q  138 ttatgc 143  Q
    ||||||    
T  31953964 ttatgc 31953959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 172 - 358
Target Start/End: Original strand, 5729344 - 5729531
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||   ||||    
T  5729344 aagggaaatgttaaccggtgttcccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataa 5729443  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  5729444 taaagtcaaaaataattttcttttatagtaataattctcttttatggcatgcttaaccagtgcctcggaggcacaggttagcaggacc 5729531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 201 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 525234 - 525076
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  525234 cactggttaaagatatgaaaaagaaaagtatacagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaaatcaaaaacagtttccttttatggt 525135  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||    
T  525134 aataattctcttttatgatatgtttaaccagtactccggagcaccggttagcaggaccc 525076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8754771 - 8754617
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  8754771 gggaaatgctaaccggtgccctgggagcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 8754672  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaac 328  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  8754671 aagtcaaaaacagttttgttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaac 8754617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 165 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7689395 - 7689225
Alignment:
Q  165 ttattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||| | |  || ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7689395 ttatttaaagggaaatgttaaccggtgtctctgggacactgattaaggatataaaaaaggaaattttacagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaa 7689296  T
Q  265 actataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
      ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7689295 tttataataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctcttttatggtatacttaaccagtgcc 7689225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27456299 - 27456175
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  27456299 agggaaatgctaactggtgccccc-gggcactggttaaggatatggaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 27456201  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatg 298  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||    
T  27456200 aaagtcaaaagcagtttccttttatg 27456175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 206 - 362
Target Start/End: Original strand, 18117175 - 18117331
Alignment:
Q  206 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||    
T  18117175 gttaagtatatgaaagaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttttttttatagtaataa 18117274  T
Q  306 ttctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||   |||||||||||| ||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||    
T  18117275 tttcattttatggtatgcttaaccagtgccctggagcaccagttagtaggaccctta 18117331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Original strand, 45045799 - 45045931
Alignment:
Q  203 ctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaa 302  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  45045799 ctggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataatgtcaaaaacagtttccttttatgataa 45045898  T
Q  303 taattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  45045899 taattcccttttatggtatgcttaaccagtgcc 45045931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 1736980 - 1737140
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||    
T  1736980 gggaaatgctaaccggtgcttctggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaatagtgtaattaattgataata 1737079  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  1737080 aagttaaaaacattttccatttatgataataattc-attttatggtatgcttaaccagtgcc 1737140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 170 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34546504 - 34546373
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  34546504 aaaagggaaatgctaaccgatgcccccgaggtaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 34546405  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34546404 agtaaagtcaaaaacagtttacttttatggta 34546373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 178 - 334
Target Start/End: Original strand, 46716642 - 46716798
Alignment:
Q  178 aatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagt 277  Q
    ||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  46716642 aatgctaactggtgccctcggagcattggttaaagatataaaaaaggaaattatataatacttaatgcactgaaattatgtaattaatttataataaagt 46716741  T
Q  278 taaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc 334  Q
     ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  46716742 caaaaatattttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaaccggtgc 46716798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 28262034 - 28262187
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||   ||||||||     
T  28262034 aaatgctaaccggtgcctccgggtcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagtta-----ttgaaattatgtaattaattgataataaaa 28262128  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  28262129 tcaaaaacagtttccttttatagtaataattcttttttatggtatgcttaaccaatgcc 28262187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 201 - 335
Target Start/End: Original strand, 33636479 - 33636613
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    
T  33636479 cactagttaagaatatgaaaaagaaaattatataataattaattcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtaaaaaatagtttatttttatggt 33636578  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33636579 aataattctattttatggtatgcttaaccagtgcc 33636613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 224 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 37674240 - 37674103
Alignment:
Q  224 gaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgt 323  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  | || | ||||||||||||     
T  37674240 gaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgatataattttttttttatggtatgc 37674141  T
Q  324 ttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  37674140 ttaaccagtgtc-cggggcaccggttagcaggaccctta 37674103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 204 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29835860 - 29835735
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacag-tttccttttatggtaa 302  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  29835860 tggttaaagatatgaaaaaggaagttatatactagttaatgtattaaaattgcgtaattaatttgtaataaagttaaaaacagttttttttttatggtaa 29835761  T
Q  303 taattctcttttatggtatgtttaac 328  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||    
T  29835760 taattctattttatggtatgcttaac 29835735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37631729 - 37631604
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||| |||| |||||  || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||    
T  37631729 agggaaatgttaaccggtgcttccggggcacgggttaaggatataaaaaaggaaattatataataattaatgcattaaaattatgtaattaatttataat 37631630  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatg 298  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  37631629 aaaatcaaaaacagtttccttttatg 37631604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18470126 - 18469993
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccaggg-cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||  ||| |     
T  18470126 gggaaatgctaaccggtgcccccgggggcaccggttaagcatactaaaaaggaaattatatagcagttaatacattgaaattgtgtaattaatttatga- 18470028  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataatt 307  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18470027 aaagtcaaaaacagttacattttatggtaataatt 18469993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 359
Target Start/End: Original strand, 22739868 - 22740010
Alignment:
Q  219 aaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat-aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatg 317  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |     
T  22739868 aaaaggaaagtatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataaaaaaaattaaaaacagttttcttttatggtaataattttattttttt 22739967  T
Q  318 gtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| ||| | |||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  22739968 gtatgcttagctagtgcctccggggtaccggttagcatgaccc 22740010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 206 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23357861 - 23357735
Alignment:
Q  206 gttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |   || |||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23357861 gttaaggatatgaaaaagaaaattgtatagtagttaatgcatttca---gtataattaatttataaaaaagtcaaaaacagtttccatttatgataataa 23357765  T
Q  306 ttctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  23357764 ttctcttctatgatatgcttaaccagtgcc 23357735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 362
Target Start/End: Original strand, 4087650 - 4087810
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagtt--aaaaacagtttccttttatg 298  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    | ||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  4087650 cactggttaagcatactaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatagtgtgattaa---tttataaagtttcaaaaacagttt-cttttatg 4087745  T
Q  299 gtaat--aattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||  ||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| |||||| || ||||||||    
T  4087746 gtaataaaattc-cttttttggtatgtttaactagtgtctgggagcatcggttaacatgaccctta 4087810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 200 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4100684 - 4100563
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||  |||||| || | |||||||||||   ||||||     
T  4100684 gcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattaaaattatgttattaatttataatcaaatcaaaaacagttt-tatttatga 4100586  T
Q  300 taataattctcttttatggtatg 322  Q
    |||||||||  |||||| |||||    
T  4100585 taataattcatttttatagtatg 4100563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 362
Target Start/End: Original strand, 19434495 - 19434682
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatatagtagttaatgtattgaaa-ttgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| || ||||||| |||| ||||||| | ||||      
T  19434495 gaaatgttaaccggtgcctccggggcactgattaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataaat 19434594  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||| || || | || ||||||||||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  19434595 aagtcaacaaaactt-ccttttatggtaagaattttctttttttgtatgcttaaccagtgcccgggggcaccggtcagcatgaccctta 19434682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 305
Target Start/End: Original strand, 36437399 - 36437507
Alignment:
Q  196 cagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcctttt 295  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  36437399 cagggtactggttaaggatactaaaaaggtaattatatagtaggtaattcattgaaattgtttaattaatttataa-aaagtcaaaaatagttttctttt 36437497  T
Q  296 atggtaataa 305  Q
    ||| ||||||    
T  36437498 atgataataa 36437507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 243
Target Start/End: Original strand, 22973595 - 22973667
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaat 243  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22973595 aaagagaaatgctaactagtgcctccggggcactggttaatgatataaaaaaagaaattatatagtagttaat 22973667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18220812 - 18220726
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| || |  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18220812 aaaaaggaaattatatagtaattaatgtatagaaattgtgtaattaatttataa-aatggcaaaaatagttttcttttatggtaataa 18220726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 31954975 - 31954876
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31954975 attcttcattttgttccaatgccaagattcaaccttttctatttgcagatgataactcgttttccataagctccattatttcttcttcttaatcttatgc 31954876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 47118100 - 47118037
Alignment:
Q  249 gaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctctt 312  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47118100 gaaattgtgtaattaatttataataaagtcaagagcagtttccttttatggtaataattctctt 47118037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 47118150 - 47118095
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaatt 229  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47118150 gggaaatgctaactggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaatt 47118095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18220693 - 18220627
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18220693 gggcgctggttaagaatactaaaaaggaaattatatagtaattactgtattgaaattgtgtaattaa 18220627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34557078 - 34556891
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactat 269  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | ||    
T  34557078 aagggaaatgctaactggtg-ccccggggcattggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccat 34556980  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||  |||| || || | ||| |||||| ||||| ||||  ||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  34556979 aaataagtcaacaaaacttt-cttttagggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgcc-cggggcaccggttagcatgaccct 34556891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Original strand, 6819916 - 6820100
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa-actataa 271  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||  |||    
T  6819916 gggaaatgctaactggtgcccttggggctttggttaaggatgttaaaaa-gaaattatacagtagttattgtatagaaaactgtgtaattaatac--taa 6820012  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
     ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  ||||| | | ||  ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  6820013 aaaagtcaaaaa-tgtttcattttatggtaataattaccttttttagcatccttaaccagtgccctagggcaccggttagcatgaccct 6820100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18220593 - 18220534
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  18220593 ggttaaggatactaaaaagaaaattatatagtaattaatgtattaaaattgtgtaattaa 18220534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 264
Target Start/End: Original strand, 5785460 - 5785556
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggata-tgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| | |||| |||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  5785460 aaaagggaaatgttaaccggtgtccctagggcaccgattaaagatactaaaaaaggaaattttatagtaattaatgtagtgaaaattgtgtaattaa 5785556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 31954654 - 31954614
Alignment:
Q  563 gatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31954654 gatgaattgaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 31954614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 361
Target Start/End: Original strand, 38128305 - 38128480
Alignment:
Q  188 ggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaagg-aaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaaca 285  Q
    ||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| || || |    
T  38128305 ggtgcccccgggacaccggttaaggataataaaaaggaaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatctataaataagtcaacaa-a 38128403  T
Q  286 gtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
      ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  38128404 acttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccctt 38128480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 264
Target Start/End: Original strand, 3021922 - 3021981
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  3021922 ggttaagcatattaaaaaggaaattatatactagttaatacattgaaattgtataattaa 3021981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Original strand, 6097334 - 6097396
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatat 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  6097334 aagggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatat 6097396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 31953933 - 31953899
Alignment:
Q  360 ttattaaaattgccttctttgtttttctactattt 394  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31953933 ttattaaaatggccttctttgtttttctactattt 31953899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Original strand, 32805536 - 32805598
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatat 233  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  32805536 aagggaaatgctaaccggtgttcccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatat 32805598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 38022632 - 38022571
Alignment:
Q  220 aaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataataaagttaaa 281  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  38022632 aaagaaaattatatagtagttattgtattgaaaattgtataattaatctataa-aaagttaaa 38022571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30924174 - 30924117
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatat 233  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||    
T  30924174 aaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggataataaaaagggaaattatat 30924117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 316
Target Start/End: Original strand, 13556474 - 13556553
Alignment:
Q  236 tagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttat 316  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||| | || ||||||||||||||||  |||||||    
T  13556474 tagtcaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aaagtcaataacaatatctttttatggtaataatttccttttat 13556553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 163 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 6307 - 6107
Alignment:
Q  163 aattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatt 262  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6307 aattgttaaaaaggaaatgctaaccggtgcccctggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattggaattgtgtaatt 6208  T
Q  263 aaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6207 aaattataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatccccttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 6108  T
Q  362 a 362  Q
    |    
T  6107 a 6107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 66)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 171 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 51065937 - 51065745
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  51065937 aaagggaaatgctaaccggtgtccccgggacactggttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttata 51065838  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51065837 ataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggaccctta 51065745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 173 - 362
Target Start/End: Original strand, 29657770 - 29657960
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||    
T  29657770 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataat 29657869  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29657870 aaagtcaaaaacagtttccttttttggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccctgggggcaccggttagcaggaccctta 29657960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 8e-69
Query Start/End: Original strand, 170 - 361
Target Start/End: Original strand, 47009989 - 47010181
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||  |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  47009989 aaaagggaaatgctaatcggtgcatccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttat 47010088  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  47010089 aataaattcaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgctccaggggcaccggttagcaggaccctt 47010181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 5694321 - 5694512
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  5694321 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggatataaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 5694420  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5694421 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgctccgggggcaccggttagcaggacccttatt 5694512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 170 - 362
Target Start/End: Original strand, 18043158 - 18043351
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||    
T  18043158 aaaagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttat 18043257  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18043258 aataatgtcaaaaacagttttcttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccctta 18043351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 42770178 - 42769987
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  42770178 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaatggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 42770079  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  42770078 taatatcaaaaacagtttccttttatggtaataattctattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagaaccctta 42769987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 172 - 363
Target Start/End: Original strand, 15227737 - 15227929
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  15227737 aagggaaatgctaaccggtaccccgggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 15227836  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  15227837 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcaagacccttat 15227929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24178649 - 24178463
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24178649 gggaaatgctaaccgatgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatctataata 24178550  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  24178549 aagtcaaaagcagtttccttttatggtaataatttcattttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagccggaccc 24178463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 12072251 - 12072061
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||    
T  12072251 aaaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcaccggttaaggatatgaaaaaggaaattatgtagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 12072152  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  12072151 ataaagtcaaaaacagttttcttttatggtaataattcctttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcagcaccct 12072061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 335
Target Start/End: Original strand, 45431278 - 45431439
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  45431278 agggaaatgctaaccggtgcccccagggc-ctgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataat 45431376  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  45431377 aaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattctcttttatgatatacttaaccagtgcc 45431439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 174 - 358
Target Start/End: Original strand, 38162850 - 38163035
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  38162850 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 38162949  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38162950 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgccccgggggcaccggttagcaggacc 38163035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 174 - 363
Target Start/End: Original strand, 3097659 - 3097846
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||    
T  3097659 gggaaatgctaattggtgcccccggagtcctggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataata 3097758  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  3097759 aagtcaaaaacagttttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaaccagtac--ggggacaccggttagcaggacccttat 3097846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 168 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17333473 - 17333276
Alignment:
Q  168 ttaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaact 267  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       
T  17333473 ttaaatgggaaatgctaaccggtgccccc-gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattc 17333375  T
Q  268 ataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttattaa 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||   ||||||| || || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17333374 ataataaagtcaaaaacagtttccttttatgataatacttcccttttatggta--cttaaccaatgccccggaggcaccggttagcaggaccctttttaa 17333277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3784899 - 3784712
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  3784899 gggaaatgcaaatcggtgcccccagtgcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataata 3784800  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3784799 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataatttccttttatggtatgcttaacccgtgtcccgggggcaccggttagccggaccct 3784712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30294567 - 30294381
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||  |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  30294567 gggaaatgctaatcggtgtccccggagcattggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 30294468  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    | || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  30294467 atgtcaaaaacagtttctttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaacctgtgctccggggacaccggttagcaggaccc 30294381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 172 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 14350465 - 14350277
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  14350465 aagggaaatgctaaccggtgcccccggagcaccggttaagggtatgaaaaaggaaattatattgtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataa 14350366  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14350365 taatgtcaaaaacaatttccttttatggtaataattc-ccttaatggtatgcttaaccagtgccccggggcaccggttagcaggaccctt 14350277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 176 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36446508 - 36446352
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  36446508 gaaatgttaactggtgcccccgaggcactggttaagaatat-aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaa 36446410  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36446409 gtcaaaaacagtttccttttatagtaataattcccttttatggtatgtttaaccagtg 36446352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 9266916 - 9266728
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  9266916 aagggaaatgttaaccggtgtccccgcggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtatttaatgcattgaaattgtgtaattaattcataa 9266817  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||    
T  9266816 taaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcgcttttatggtatacttaaccagtgctccagaagcaccggttagcaggaccc 9266728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 173 - 358
Target Start/End: Original strand, 13961211 - 13961396
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||    
T  13961211 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcacgggttaaggatataaaaaaa-aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataat 13961309  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||    
T  13961310 aaagtcaaaaacagtttcattttatggtaataattttcttttatggtatgcttaaccagtgctccaagggcaccggttagcaggacc 13961396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 161 - 332
Target Start/End: Original strand, 6770324 - 6770495
Alignment:
Q  161 acaattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaa 260  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||||| |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6770324 acaataatttaaagggaatggctaaccggtgcctccggggcactaattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaa 6770423  T
Q  261 ttaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  6770424 ttaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttatgataataattcccttttatgatatgcttaaccagt 6770495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 172 - 362
Target Start/End: Original strand, 43286720 - 43286913
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| |||||||||| | || |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||  |||||    
T  43286720 aaggaaaatgctaaccgatgtccctgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgttttgaaattatgtaattaatttataa 43286819  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ct--gggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  43286820 taaagtcaaaaatagtttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgtgcttcgggggcatcggttagcaggaccctta 43286913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38702117 - 38701935
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||     
T  38702117 gaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaactatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataat 38702018  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  38702017 gtcaaaaacagttttcttttatggtaataattc----ttatggtatgcttaaccagtgccccgagggcaccggttagcaggaccctt 38701935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 171 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 51368974 - 51368809
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||    
T  51368974 aaagggaaatgctaaccggtacctccagggtactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtagttaatttata 51368875  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct 336  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  51368874 ataatgtcaaaaatagtttccttttatagtaataattccattttatggtatgcttaaccagtgcct 51368809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48383294 - 48383111
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||    
T  48383294 aaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggatgtgaaaaagaaaattatatgaaagttaatgtattgaaataatgtaattaattgataataaag 48383195  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  48383194 tcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccaatgcctcaggggcactggttagcaggaccc 48383111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 172 - 333
Target Start/End: Original strand, 29683193 - 29683355
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaa-aggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||    
T  29683193 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaagatataaaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaatcgtataattaatttata 29683292  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29683293 ataaagtcaaaaacagtttcattttatagtaataattcacttttatggtatgcttaaccagtg 29683355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45449426 - 45449238
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45449426 aaatgctaactgatgccccg-gggtattggttaaagatataaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaatagtgtaattaaattataataaag 45449328  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45449327 tcaaaagcagtttccttttatggtaataattgccttttatggtatgtttaaccagtgccccaggggcatcggttagcaggaccctaatta 45449238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19032002 - 19031814
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||    
T  19032002 agggaaatgctaaccggtgctccgggggcattagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaaaacattgaaattgtgtaattaatttataat 19031903  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||  || || | |||||||||||||||||||    
T  19031902 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaacccgtaccccggagacaccggttagcaggaccct 19031814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 207 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50128325 - 50128169
Alignment:
Q  207 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataat 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  50128325 ttaaggatatgaaaaagaaaattacatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagttaaaagcagtttcattttatggtaataat 50128226  T
Q  307 tctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |   |||||||||||||||||||||    
T  50128225 tctcttttatggtatgcttaaccagtgtcccagaaacaccggttagcaggaccctta 50128169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 176 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23473648 - 23473458
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  23473648 gaaatgctaactgatgcccctggggcattggttaaggatatgaaaaaggagattatatagcagttaatgtattgaaattgtataattaatttataataaa 23473549  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23473548 gtttaaagcagtttccttttatggtaataatttctttttataatatgcttaacctgtgctccgagggtaccggttagcaggacccatatta 23473458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 334
Target Start/End: Original strand, 48071482 - 48071642
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| | ||| ||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  48071482 agggaaatgctaaccgatgctccg-gggtactggttaaggatatgtaaaaggaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 48071580  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  48071581 aaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattatcttttatagtatgcttaaccggtgc 48071642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 29210412 - 29210540
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  29210412 agggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataat 29210511  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    || || |||||||||||||||||||||||    
T  29210512 aatgtcaaaaacagtttccttttatggta 29210540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 334
Target Start/End: Original strand, 12306915 - 12307077
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  |||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  12306915 aaagggaaatgctaaccggtgcctctggggctctagttaatgatacgaaaaagaaaattatat-gtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttata 12307013  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc 334  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12307014 ataaagtcaaaaacagattccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgc 12307077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35985808 - 35985646
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  35985808 aagggaaatgttaaccggtgccccg-gatcactgtttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 35985710  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||    
T  35985709 taaagtgaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatagtatacttaaccagtgcc 35985646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 9e-44
Query Start/End: Original strand, 169 - 369
Target Start/End: Original strand, 30657603 - 30657798
Alignment:
Q  169 taaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaacta 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  30657603 taaaagggaaatgctaaccggtgctcccggggcactagttaagcatatgaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaattta 30657702  T
Q  269 taataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggacccttattaaa 367  Q
    ||||||||| ||||||||      |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  || || ||||||| |||||||||||| || ||||    
T  30657703 taataaagtcaaaaacag------tttatgataataattcccttttatggtatgcttaaccagtaccccggaggcaccgattagcaggacccataataaa 30657796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 204 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 8473070 - 8472911
Alignment:
Q  204 tggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||    
T  8473070 tggttaaggatataaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttcattttataataat 8472971  T
Q  304 aattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| || | ||  ||||||||||||||||||||    
T  8472970 aattctcttttatggtatacttaaccagtgtcccgaggataccggttagcaggaccctta 8472911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 41730303 - 41730469
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagt---taatgtattgaaattgtgtaattaaacta 268  Q
    |||||||||  |||| ||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||  ||    
T  41730303 aagggaaatcttaaccggtgccccaggggcacgggttaagaatatgaaaaaagaaattatatagtagtaattaatgcattgaaattgtttaattaattta 41730402  T
Q  269 taataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41730403 taataaagtcaaaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgcttaacaagtgcc 41730469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 322
Target Start/End: Original strand, 38335196 - 38335317
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  38335196 cactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgtaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgat 38335295  T
Q  301 aataattctcttttatggtatg 322  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  38335296 aataattcacttttatggtatg 38335317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 329
Target Start/End: Original strand, 52749600 - 52749757
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| | |  || | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||  || ||    
T  52749600 aagggaaatgctaaccgatatccgcggggcattggttaaagatatgaaaaaggaaattatataatagttaatgtattgaaattgtatactaaatttacaa 52749699  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacc 329  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52749700 taaagttaaaaacaatttttttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacc 52749757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 47532857 - 47532696
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||| | || | | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  47532857 aagggaaatgctaaccggtgtctccggagtactg-ttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatt-aatgataa 47532760  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  47532759 taaagtcaaaaataatttccttttataataataattcccttttatggtatgcttaaccaatgcc 47532696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15282672 - 15282591
Alignment:
Q  202 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  15282672 actggttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatatattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaa 15282591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 359
Target Start/End: Original strand, 30217784 - 30217946
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaa--ggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcctttt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || ||||| | ||||||||||| ||| ||||| | |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  30217784 gggcactggctaaggatatgaaaaaaagggaattagagagtagttaatgcatttaaattatttaattaatttataataaagtcaaaaatagttttctttt 30217883  T
Q  296 atggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||  | |||||| |||||||||||||    
T  30217884 atggtaataatttctttttatggtatgcttaa-cagtgccccgaggcacctgttagcaggaccc 30217946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28726094 - 28725905
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | ||    
T  28726094 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaaaggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccat 28725995  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||  |||| || || |  ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  28725994 aaataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttccttttttcgtatgcttaaccagtgccccggggacaccggttagcaagaccc 28725905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 353
Target Start/End: Original strand, 39081803 - 39081980
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| |    
T  39081803 gggaaatgctaaccggtgttcc--gggcactggttaagcatactaaaaatgaaattatatactagttaatgtattgaaattttataattaatttataa-a 39081899  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagca 353  Q
    |  |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |  |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  39081900 atattaaaagcagtttcattttatgataataattttcttttttaatatgcttaatcagtacctcgggggtaccggttagca 39081980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 220 - 323
Target Start/End: Original strand, 37503260 - 37503362
Alignment:
Q  220 aaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||| | ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  37503260 aaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aaaatcaaaaatattttccttttatggtaacaattgtcttttttggt 37503358  T
Q  320 atgt 323  Q
    ||||    
T  37503359 atgt 37503362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19010778 - 19010712
Alignment:
Q  269 taataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19010778 taataaagtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgattaaccagtgcc 19010712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37315409 - 37315300
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||   |||| ||    
T  37315409 aaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataa-aaagtcaaagacagttttcttttatgctaataatttctttttttg 37315311  T
Q  318 gtatgtttaac 328  Q
    ||||| |||||    
T  37315310 gtatgcttaac 37315300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 297
Target Start/End: Original strand, 39497309 - 39497430
Alignment:
Q  176 gaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    ||||||||||||| |   ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||  |||||||||    
T  39497309 gaaatgctaactgatattcccagagcattgattaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattaaaattatataattaatttataataaa 39497408  T
Q  276 gttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    || ||||| | ||| |||||||    
T  39497409 gtcaaaaataattttcttttat 39497430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 38595939 - 38595752
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  38595939 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 38595840  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
      |||| || || |  ||||||||||||||| |||| |||||| | | ||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  38595839 ataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaattttctttttttgcatgcttaaccagtgccccggaggcaccggttagcatgaccc 38595752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39912471 - 39912375
Alignment:
Q  168 ttaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||||| |||| || || | | |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39912471 ttaaaagggaaatgttaaccggcgcactcggggcactgattaaggatataaaaagggaaattatatactagttaatgcattgaaattgtgtgattaa 39912375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 275
Target Start/End: Original strand, 26228219 - 26228294
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaa 275  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  26228219 gcactggttaaggagataaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataataaa 26228294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 52431632 - 52431742
Alignment:
Q  225 aaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttctcttttatggtatgt 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || |||| || ||| ||||||||||||||| |||  |||| |||||||     
T  52431632 aaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa-aatgtcaaaagcaattttcttttatggtaataatttcctttttttggtatgc 52431730  T
Q  324 ttaaccagtgcc 335  Q
    ||||||||||||    
T  52431731 ttaaccagtgcc 52431742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 289
Target Start/End: Original strand, 28481844 - 28481954
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||    
T  28481844 gggaaatgctaaccggtgcctcttgggccctggttaaggatatgaaaaaggaaattatacag----taatgcattaaaattgtgtaattaatttataata 28481939  T
Q  274 aagttaaaaacagttt 289  Q
    ||  ||||||||||||    
T  28481940 aa-ataaaaacagttt 28481954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 35700841 - 35700746
Alignment:
Q  167 attaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||  ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35700841 attataagggaaatgttaactggtgtccc--ggatactggttaaggatactaaaaaggaaattatacagtagttaatacattgaaattgtgtaattaa 35700746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19011180 - 19011112
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatg 244  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19011180 ggaaatgctaaccggtgtcccg-gggcacgggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatg 19011112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 52702332 - 52702144
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  52702332 gggaaatgctaaccggtgctcccggggcactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 52702233  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
      |||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||||| ||||| || |||||| || ||| |||||||    
T  52702232 ataagtcaaaaa-aacttcattttatggtaataatttcctttttttgtatgcttaaccaatgcctcggagcaccgatttgcatgaccctt 52702144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 14881149 - 14881036
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||             |||| |||||||  ||||||||||    
T  14881149 aaatgttaactggtgcccccgtgatactggttaaggatatgaaaaaggaaattatataatagt-------------ttgtataattaatttataataaag 14881063  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaat 303  Q
    | |||||||||||||||||||||||||    
T  14881062 tcaaaaacagtttccttttatggtaat 14881036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3838936 - 3838873
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  3838936 cactggttaagcatactaaaaaggaaattatataatagttaatgcattaaaattgtgtaattaa 3838873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10976063 - 10976008
Alignment:
Q  199 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaatt 254  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10976063 ggcacttgttaaggatatgaaaaaggagattatatagtagttaatgcattaaaatt 10976008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50271541 - 50271442
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||   ||||||| | ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||    
T  50271541 attcttcattttattccaatgccaagattcaacattttctatttgcagatgataactcgttttctataagctccattatttcatcttcttaatcttatgc 50271442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Original strand, 49867454 - 49867520
Alignment:
Q  199 ggcactggttaaggatatgaaaaaggaaa-ttatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49867454 ggcactggttaatgatactaaaaaagaaagttatatagtaattaatgttttgaaattgtgtaattaa 49867520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 563 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 50271240 - 50271200
Alignment:
Q  563 gatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50271240 gatgaattgaagtgttgttctacttgttcaacaagttcaat 50271200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23789567 - 23789496
Alignment:
Q  288 ttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||| | ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  23789567 ttccttttatggtaagaatttgttttttttgtatgtttaaccaatgcccgggggcactggttagcatgaccc 23789496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 273 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 11797056 - 11796969
Alignment:
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||  ||||| ||||||   || |||||||||||| |||||||    
T  11797056 aaagttaaaaa-agtttcgttttatggtaataacttccttttttggtatccttaactagtgccccaggacaccggttagcatgaccctt 11796969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 232 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19011095 - 19011063
Alignment:
Q  232 atagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19011095 atagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaa 19011063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 27457138 - 27456955
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaag-gaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||| ||||  |||||| ||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | |||    
T  27457138 agggaaatgctaatcggtgcccccggggcaagggttaaagataataaaaagtgaaattatatgttaattagtgcattgaaaattgtttaattaatccata 27457039  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctc-ttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagca 353  Q
    |  |||| || || |  ||||||||||||||| |||| || |||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||    
T  27457038 aataagtcaacaa-aacttccttttatggtaaaaattttcttttttttgtatgcttaacgagtgcctcgggggcaccagttagca 27456955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 50271281 - 50271253
Alignment:
Q  473 tattgaggacatggaattcataacaacaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50271281 tattgaggacatggaattcataacaacaa 50271253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 174 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34651018 - 34650832
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  34651018 gggaaatgctaaccggtgccccc-gggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 34650920  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34650919 atgtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccgggggcaccggttagcaggaccct 34650832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 171 - 360
Target Start/End: Original strand, 13661805 - 13661995
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||    
T  13661805 aaagggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgata 13661904  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccct 360  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13661905 ataaagtcagaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgcttaacccgtgccccggaggcaccggttagcaggaccct 13661995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 171 - 361
Target Start/End: Original strand, 35132519 - 35132709
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||    
T  35132519 aaagggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttata 35132618  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  35132619 ataaagtcaaaaacagttttc-tttatggtaataattctcttttatggtatgcttaaccaatgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 35132709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 174 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 35504426 - 35504238
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  35504426 gggaaatgctaaccggtgcccccgggacactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 35504327  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    | || |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  35504326 atgtcaaaaacagttcccttttatggcaataattcccttttatggtatgcttaacccgtgtccgggggcaccggttagcaggaccctta 35504238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 174 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 11958153 - 11957961
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||    
T  11958153 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcaatgaaattgtgtaattaattgataata 11958054  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958053 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggcatgcttaaccagtgccccaggggcaccggttagcaggacccttatta 11957961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 163 - 375
Target Start/End: Original strand, 8787328 - 8787541
Alignment:
Q  163 aattattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatt 262  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8787328 aatttttataagggaaatgctaaccggtgtccccggggcattggttaagggtatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatt 8787427  T
Q  263 aaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||  ||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  8787428 aatttataataatatcaaaaacagtttccttttatgataataattccattttatggtatgcttaacctgtgccccgggggcaccggttagcaggaccctt 8787527  T
Q  362 attaaaattgcctt 375  Q
     ||| |||||||||    
T  8787528 tttataattgcctt 8787541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 172 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 10054540 - 10054353
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  10054540 aagggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 10054441  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  10054440 taatg-tcaaaacagtttccttttatggtaataattcctttttatggtatgtttaacccgtgccccgggggtaccggttagcaggaccc 10054353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 353
Target Start/End: Original strand, 6283562 - 6283742
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  6283562 gggaaatgctaaccggtgcctccggggcactagttaaagatatgaaaaagaaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 6283661  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagca 353  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6283662 aagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcatttttatggtatgcttaaccagtgccctaggggcaccggttagca 6283742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21547579 - 21547394
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  21547579 gggaaatgctaaccggtgtcccc-gggcatcggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 21547481  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || || | ||||||||||||||||||    
T  21547480 aagtcaaaaacagtttcattttaagttaataattctcatttatggtatgcttaaccagtaccccggagacaccggttagcaggaccc 21547394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 12506296 - 12506457
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||||| |  | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  12506296 gggaaatgctaaccggtgcctctggagcactcgttaagagtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 12506395  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12506396 atgtcaaaaacagtttccttttatagtaataattctcttttatggaatgcttaaccagtgcc 12506457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 174 - 301
Target Start/End: Original strand, 10069969 - 10070095
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  10069969 gggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaatt-aatgataata 10070067  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10070068 aagtcaaaaacagtttctttttatggta 10070095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 207 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40564557 - 40564402
Alignment:
Q  207 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataat 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||    
T  40564557 ttaaggatttgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatttttttttatggtaataat 40564458  T
Q  307 tctcttttatggtatgtttaaccagt-gcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |  ||   |||||||||||||||||||||||    
T  40564457 tctcttttatggtatgcttaaccaataccccaagggcaccggttagcaggaccctt 40564402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 306
Target Start/End: Original strand, 13470147 - 13470283
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  |||    
T  13470147 aaaagggaaatgctaaccggtgcctatggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaataatatagtagtcaatgcattgaaattgtataattaatttat 13470246  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataat 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13470247 aataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataat 13470283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 9721765 - 9721640
Alignment:
Q  202 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  9721765 actggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtttaattaatttataataaagtcaaaaacagttttcttttatgata 9721666  T
Q  302 ataattctcttttatggtatgtttaa 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9721665 ataattcccttttatggtatgtttaa 9721640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 193 - 359
Target Start/End: Original strand, 40057326 - 40057493
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||  ||||||||| | |||| |||||| ||    
T  40057326 ccccagggcaccgattaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttagtgcattgaaatagtataattaatttataataaaatcaaaagcagttttct 40057425  T
Q  293 tttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40057426 tttatagtaatatttcccttttatgatgtgtttaaccagtgacctcgaggcaccggttagcaggaccc 40057493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 177 - 335
Target Start/End: Original strand, 11846075 - 11846233
Alignment:
Q  177 aaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaag 276  Q
    |||||||||  |||| |||| || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11846075 aaatgctaagcggtgtccccgggacactagctaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataataaag 11846174  T
Q  277 ttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11846175 tcaaaagtagtttccttttatggtaataaatcccttttatagtatgcttaaccagtgcc 11846233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 322
Target Start/End: Original strand, 39069379 - 39069526
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||   |||||    
T  39069379 aagggaaatgctaaccggtgcttccagggcactggttaagggtatgaaaa-ggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaatta---tataa 39069474  T
Q  272 taa-agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatg 322  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39069475 taattgtgaaaaacaatttccttttatggtaataattctcttttatgatatg 39069526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19647846 - 19647717
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| |||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   ||||    
T  19647846 aaggaaaatgctaaccggtatctccggggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaattgataa 19647747  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19647746 taaagtcataaacagtttccttttatggta 19647717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39067095 - 39066970
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagt-agttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  39067095 cactggttaaggatatgaaaaaagaaattatataattagttaatatattgaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaaacaatatccttttatgg 39066996  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgttt 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  39066995 taataattctcttttatgttatgttt 39066970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 201 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19436995 - 19436865
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  19436995 cactcgttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtggttaaagcattgaaattgtataattaatttat-ataaagttaaaaatagttt-tttttatggt 19436898  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19436897 aataattctcttttatggtatgtttcaccagtg 19436865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 175 - 353
Target Start/End: Original strand, 20175228 - 20175406
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    |||||||||||| |||| | ||  | ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20175228 ggaaatgctaaccggtgtctccgagacactggttaaaaatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataa 20175327  T
Q  275 agttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagca 353  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||   ||| ||||||||||||    
T  20175328 agtcaaaaacaattttcttttatgataataattcccttttataatatgcttaactagtgctctgggacaccggttagca 20175406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 171 - 332
Target Start/End: Original strand, 31909629 - 31909784
Alignment:
Q  171 aaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactata 270  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || ||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  31909629 aaagggaaatgttaaccggtgcctcc-ggatactggttaaggatattaaaagggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattgatttata 31909727  T
Q  271 ataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||||| |||||||||||||     || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31909728 ataaagtcaaaaacagtttcc-----tgataataattttcttttatggtatgcttaaccagt 31909784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Original strand, 10955950 - 10956109
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatga-aaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  | |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||    
T  10955950 agggaaatgctaactgttgcctccggggcactggttaagcataccataaaagggaattataaagtagttaatgcattgaaattgt-taattaatttataa 10956048  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  10956049 caaagtcaaaaacaatttccttttatggtaataatttccttttatgatatgcttaaccagt 10956109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 175 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 2619742 - 2619635
Alignment:
Q  175 ggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataa 274  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2619742 ggaaatgctaactggtgtctccgggacacttgttaaggatatgaaaaagaaaattatttagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaatttataataa 2619643  T
Q  275 agttaaaa 282  Q
    ||||||||    
T  2619642 agttaaaa 2619635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 232 - 361
Target Start/End: Original strand, 4268620 - 4268749
Alignment:
Q  232 atagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccag 331  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  4268620 atagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttataaaaaa-taaaaaacagtttccttttatggtaataattttcttttttggtatgcttaacccg 4268718  T
Q  332 tg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    || || ||||||||||||||| | |||||||    
T  4268719 tgtccagggggcaccggttagtatgaccctt 4268749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 286
Target Start/End: Original strand, 4837256 - 4837369
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  4837256 aagggaaatgttaaccggtgccccg-gggcaccggttaagaatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatgcattgaaattgtgtaattaatttataa 4837354  T
Q  272 taaagttaaaaacag 286  Q
    |||||| ||| ||||    
T  4837355 taaagtcaaatacag 4837369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Original strand, 6284822 - 6284885
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6284822 cactggttaaggatactaaaaaggaaattatatagtaattaatgtattgaaattgtataattaa 6284885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 22799518 - 22799419
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| | ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  22799518 attcttcattttgttccaatgccaagattcaaccttttctatttgcagatgataactcgttttctataagctccattatttctttttcttaatcttatgc 22799419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19366321 - 19366220
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||   ||||||| |  |||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19366321 attcttcattttgttccaatgccaagattcaactttttctatttggagatgataactcgttttctataagctccattatttcttcttcttaatcttatgc 19366222  T
Q  144 ta 145  Q
    ||    
T  19366221 ta 19366220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 143
Target Start/End: Original strand, 41045679 - 41045778
Alignment:
Q  44 attcttcattttgttccattgccaagagccaatcgtttctatctacagataacaactcgttttctataaccctcattttttcttcttcttaatcttatgc 143  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||| | ||||| | ||||| |||||||||| |  |||| | ||||||||||||||||||||    
T  41045679 attcttcattttgttccaatgccaagattcaaccttttctatttgcagatgataactcattttctataagctccattatatcttcttcttaatcttatgc 41045778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21945051 - 21944994
Alignment:
Q  170 aaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaa 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21945051 aaaagggaaatgctaaccggtgcctccggggcactggttaaggataataaaaaggaaa 21944994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 22799194 - 22799154
Alignment:
Q  563 gatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22799194 gatgaattgaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 22799154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 564 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 31082268 - 31082229
Alignment:
Q  564 atgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31082268 atgaattgaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 31082229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 14214238 - 14214055
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactat 269  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | ||    
T  14214238 aagggaaatgttaaccggtgctcccgaggcacaggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccat 14214139  T
Q  270 aataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagca 353  Q
    ||  |||| || || |  ||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  14214138 aaataagtcaacaa-aacttccttttatggtaagaatttcctttttttgtatgcttaaccggtgtcccgggggcaccggttagca 14214055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 40608722 - 40608533
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggat-atgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||  || ||| || |||| ||||||| ||||||| | ||||    
T  40608722 gggaaatgctaaccggtgctcccgggacactggttaaggataataaaaagggaaattatatgttaattattgcattgaaaattgtttaattaatccataa 40608623  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataa-ttctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    ||||  | || | |  ||||||||||||||| || |||  |||| | |||||||||||||||| | || |||||||| ||| || |||||||    
T  40608622 taaa--tcaacaaaacttccttttatggtaagaatttccttttttttgtatgtttaaccagtgtcatgagggcaccgtttaacatgaccctt 40608533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5302422 - 5302368
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattg-aaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  5302422 aaaaaagaaattatataatagttattgtattgaaaattgtgtaattaatctataa 5302368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 221 - 322
Target Start/End: Original strand, 22973732 - 22973832
Alignment:
Q  221 aaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggta 320  Q
    |||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||  |||| |||||||||||||| |||||| | || ||| |||||    
T  22973732 aaggaagttatatagtaactaatgaattaaaattgtgtaattaatttatca-aaagtataaaagagtttccttttatgataataaatttcatttttggta 22973830  T
Q  321 tg 322  Q
    ||    
T  22973831 tg 22973832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 31082310 - 31082282
Alignment:
Q  473 tattgaggacatggaattcataacaacaa 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31082310 tattgaggacatggaattcataacaacaa 31082282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 200
Target Start/End: Original strand, 40056705 - 40056733
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccaggg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40056705 aagggaaatgctaactggtgcccccaggg 40056733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 563 - 603
Target Start/End: Original strand, 41046004 - 41046044
Alignment:
Q  563 gatgaatggaagtgctgttctacttgttcaacaagttcaat 603  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  41046004 gatgaattgaagtgttgttctacttgttcaataagttcaat 41046044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 22959 - 23122
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||    
T  22959 aagggaaatgctaaccggtgcccccggagcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtaattaatacattgaaattgtgtaattaatttataa 23058  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23059 taaagtcaaaaacagtttccttttatgttaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 23122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 172 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 68478 - 68318
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||    
T  68478 aagggaaatgctaactggtgcccccggggcactggttaaggatatgaaaaatgaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaaataaattataa 68379  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  68378 taaagttaaaatcagtttccttttaaggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagt 68318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 118; Significance: 7e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 7e-60
Query Start/End: Original strand, 173 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 53872 - 53683
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| ||    
T  53872 agggaaatgctaaccggtgcccccggggcactggttaagggtatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattaaaattgtgtaattaatttatcat 53773  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccag-tgcctgggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    || || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  53772 aatgtcaaaaatagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacccgttccccgggggcaccggttagcaagaccctt 53683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 109; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 365
Target Start/End: Original strand, 14896 - 15088
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||    
T  14896 gggaaatgctaaccggtgtccccggggcactggttaaagatataaaaaaagaaattatatagtagttaatgcactgaaattgtgtagttaatttataata 14995  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacccttatta 365  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  14996 aagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccttttatggtatgcttaaccagtgccccggaggcactggttaacaggacccatatta 15088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 108; Significance: 6e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 116202 - 116365
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||    
T  116202 aaggaaaatgctaaccggtgcccccggggcacaggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataa 116301  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  116302 taaagtcagaaacagtttccttttatgataataattcccttttatggtatgtttaacccgtgcc 116365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1152 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1152
Description:

Target: scaffold1152; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 359
Target Start/End: Original strand, 677 - 863
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||    
T  677 agggaaatgctaatcggtgcccccagagcacgggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatccattgaaattgtgtaattaatttataat 776  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |  |  |||||||||||||| |||||||    
T  777 aaagtcaaaaactgttttcttttatggtgataattctcttttatggtatgcttaactaatagcccggggcaccggttagtaggaccc 863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 334
Target Start/End: Original strand, 50548 - 50708
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||    
T  50548 gggaaatgttaaccggtgcctccggggcactggttaaagatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgttttgaaattgtataattaatttataata 50647  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc 334  Q
    |||| |||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50648 aagtcaaaatcaattttcttttatgataataattctcttttatagtatgtttaaccagtgc 50708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 201 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 53505 - 53358
Alignment:
Q  201 cactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| ||           |    
T  53505 cactggttaaggatataaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtataattaatttataataaagtcaaaaacaatt-----------t 53417  T
Q  301 aataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggacc 358  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||||||||    
T  53416 aataattctcttttatggtatgcttaactagtgccccggaggcaccggttagcaggacc 53358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0524 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0524
Description:

Target: scaffold0524; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 825 - 986
Alignment:
Q  174 gggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataata 273  Q
    ||||||||||| | |||||  || | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  825 gggaaatgctagccggtgcttccggagcactagttaaggatatgaaaaagaaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataata 924  T
Q  274 aagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcc 335  Q
    |||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  925 aagtcaaaatcaatttccttttatagtaataattctcttttatggtatgcttaaccagtgcc 986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 11155 - 11029
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11155 agggaaatgctaactggtgcccc--ggacactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatattagttaatgcattgaaattgtgtaattaaactataat 11058  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggta 301  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11057 aaagtcaaaaacagtttcattttatggta 11029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 95; Significance: 4e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 164 - 365
Target Start/End: Original strand, 25709 - 25910
Alignment:
Q  164 attattaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaatta 263  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25709 attattatatgggaaatgctaactggtgcctctgggatacgggttaaggatatgaaaaaggaa-ttatatagtaattaatgtattgaaattgtgtaatta 25807  T
Q  264 aactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccctta 362  Q
    |  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| || |  ||||| |||||| ||||||||||    
T  25808 atttataataaagtcaaaaacaattttcttttatggtaataattcccttttatggtatccttaaacagtgacccgaaggcacaggttagtaggaccctta 25907  T
Q  363 tta 365  Q
    |||    
T  25908 tta 25910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1266 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1266
Description:

Target: scaffold1266; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 173 - 332
Target Start/End: Original strand, 292 - 450
Alignment:
Q  173 agggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataat 272  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||    
T  292 agggaaatcctaaccggtgcccc-agggcactggttaagcatatgaaaaagaaaattatataatagttaatgcattgaaattgtgtaataaatttataat 390  T
Q  273 aaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagt 332  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  391 aaagtcaaaaacagtttccttctacggtaataattctcttttatgatatgattaatcagt 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 172 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 95772 - 95616
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    |||| |||||||||| |||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||  |||||    
T  95772 aaggaaaatgctaaccggtgcccccgaggtactggttaagaatatgaaaaaggaaattatataataattaatgaattgaaattatgtaattaatttataa 95673  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacc 329  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  95672 taaag-tcaaaacagttttcttttatggtaataattcccttttatggtatgtttaacc 95616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 235 - 359
Target Start/End: Original strand, 10771 - 10896
Alignment:
Q  235 gtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc 334  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  10771 gtagttaatgcattgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaaacagtttccttttatggtaataattcccatttatggtatgcttaaccagtgc 10870  T
Q  335 ct-gggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    || ||||||| |||||||||||||||    
T  10871 ctcgggggcagcggttagcaggaccc 10896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 198 - 361
Target Start/End: Original strand, 69250 - 69413
Alignment:
Q  198 gggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttat 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||  |||||     
T  69250 gggcactcgttaaggatatgaaaaagtaaattatatagtagttaatacattaaaattatgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttttttttaa 69349  T
Q  298 ggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcct-gggggcaccggttagcaggaccctt 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  69350 ggtaataatt-tcttttatggtatgcttaaccagtgcctcgggagcaccggttagaaggaccctt 69413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33841 - 33678
Alignment:
Q  200 gcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatgg 299  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||     
T  33841 gcacttgttaagtatattaaaatggaaattatataatagttaatacattgaaattgtgtaattaatttataa-aagataaaaaatagttttcttttatgc 33743  T
Q  300 taataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacccttatt 364  Q
    |||||||| ||| || || |||| ||||| |||| || ||   ||||||||||| ||||||||||    
T  33742 taataattttctcttttgatatgcttaactagtgtcttggaataccggttagcatgacccttatt 33678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 8064 - 7956
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||    
T  8064 cccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcct 7965  T
Q  293 tttatggta 301  Q
    |||||||||    
T  7964 tttatggta 7956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 81; Significance: 8e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 8e-38
Query Start/End: Original strand, 193 - 301
Target Start/End: Original strand, 7307 - 7415
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||||    
T  7307 cccccgggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgcattgaaattgtgtaattaattgataataaagtcagaaacagtttcct 7406  T
Q  293 tttatggta 301  Q
    |||||||||    
T  7407 tttatggta 7415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 172 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 147093 - 146902
Alignment:
Q  172 aagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||    
T  147093 aagggaaatgctaaccggtgctcctggggttctagttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatacattgaaattgtgtaattaattgataa 146994  T
Q  272 taaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgcctgggggcaccggttagcaggacccttat 363  Q
    |||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||   |||||||||||| |||| ||||  |   | |||||||||||||| ||||||||    
T  146993 taaagtcaaaaacagttttctattacggtaataatttctttttatggtatgcttaatcagtatccacgagcaccggttagcagaacccttat 146902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17660 - 17502
Alignment:
Q  168 ttaaaagggaaatgctaactggtgcccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaact 267  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  |    
T  17660 ttaaaagggaaatgctaac-cgtgtcccga-ggcactgtttacggatatgaaaaagaaaattatatagtagctaatgcattgaaattgtg-aattaattt 17564  T
Q  268 ataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaacc 329  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17563 ataataaagtcaaaaacagttttcttttatgataataattcctttttatggtatgtttaacc 17502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 40952 - 41105
Alignment:
Q  207 ttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataat 306  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40952 ttaagaatatgaaaaatgaaattatataatagttaatgcattgaaattatgtaattaatttataatgaagtcaaaaacagtttccttttatgataataat 41051  T
Q  307 tctcttttatggtatgtttaaccagtg-cctgggggcaccggttagcaggaccc 359  Q
    |  |||||||| |||| |||||||||| || || | |||||||| |||||||||    
T  41052 ttccttttatgatatgcttaaccagtgtcccggagacaccggttggcaggaccc 41105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 73; Significance: 5e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 193 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 19752 - 19612
Alignment:
Q  193 ccccagggcactggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttcct 292  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19752 ccccagggcatgggttaagcatatgaaaaaagaaattatataataattaatgcattgaaattgtgtaatgaatttataataaagtcaaaaacagtttcct 19653  T
Q  293 tttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtg 333  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  19652 tttacgataatagttctcttttatgatatgattaatcagtg 19612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 359
Target Start/End: Original strand, 233925 - 234039
Alignment:
Q  246 attgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggtaataattctcttttatggtatgtttaaccagtgc-ctgggggcac 344  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||| || | | ||||||||    
T  233925 attgaaattgtgtaattaatttataataaagtcaaaagcagtttccttttatgaaaataatttccttttatggtatgtttaaccggtactccgggggcac 234024  T
Q  345 cggttagcaggaccc 359  Q
    |||||||||||||||    
T  234025 cggttagcaggaccc 234039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0533 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 264
Target Start/End: Original strand, 5070 - 5129
Alignment:
Q  205 ggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5070 ggttaagaatattaaaaaaaaaattatatagtagttaatttattgaaattgtgtaattaa 5129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 74632 - 74526
Alignment:
Q  202 actggttaaggatatgaaaaaggaaattatatagtag-ttaatgtattgaaattgtgtaattaaactataataaagttaaaaacagtttccttttatggt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||   |||||||| | |||||||  || ||||||||||    
T  74632 actgattaaagatatgaaaaaaaaaattatatagtaaattaatgtagtgaaattgtataattaattgataataaattaaaaaacaaatttcttttatggt 74533  T
Q  301 aataatt 307  Q
    |||||||    
T  74532 aataatt 74526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1128 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1128
Description:

Target: scaffold1128; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 264
Target Start/End: Original strand, 1415 - 1461
Alignment:
Q  218 aaaaaggaaattatatagtagttaatgtattgaaattgtgtaattaa 264  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  1415 aaaaaagaaattatataatagttattgcattgaaattgtgtaattaa 1461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University