View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9869_high_25 (Length: 236)

Name: NF9869_high_25
Description: NF9869
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9869_high_25
NF9869_high_25
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (8-223)||(123369-123584)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (8-223)||(9582893-9583108)
chr7 (8-223)||(16119849-16120064)
chr7 (8-219)||(23515067-23515278)
chr7 (8-223)||(14551098-14551314)
chr7 (8-223)||(8717865-8718080)
chr7 (8-223)||(13673856-13674071)
chr7 (8-223)||(18593352-18593567)
chr7 (8-223)||(18618117-18618332)
chr7 (15-223)||(4312564-4312772)
chr7 (15-223)||(538755-538964)
chr7 (15-223)||(12567020-12567229)
chr7 (15-223)||(20108375-20108584)
chr7 (16-223)||(12548805-12549012)
chr7 (15-223)||(8780936-8781146)
chr7 (15-221)||(9003958-9004165)
chr7 (16-222)||(48801777-48801983)
chr7 (18-223)||(9264939-9265145)
chr7 (15-223)||(13657873-13658081)
chr7 (15-223)||(11921307-11921512)
chr7 (15-223)||(16532100-16532311)
chr7 (15-223)||(16633351-16633562)
chr7 (15-223)||(16465616-16465821)
chr7 (154-223)||(4461242-4461311)
chr7 (167-223)||(825783-825839)
chr7 (167-223)||(14221718-14221774)
chr7 (167-223)||(15916776-15916832)
chr7 (167-223)||(18287761-18287817)
chr7 (167-223)||(27291496-27291552)
chr7 (160-223)||(15206584-15206647)
chr7 (165-223)||(5397273-5397331)
chr7 (174-223)||(15065935-15065984)
chr7 (170-223)||(9194544-9194597)
chr7 (167-219)||(6713072-6713124)
chr7 (127-222)||(4791383-4791478)
chr7 (167-222)||(15348532-15348587)
chr7 (15-96)||(15065779-15065858)
chr7 (15-96)||(18287612-18287691)
chr7 (167-207)||(15522517-15522557)
chr7 (15-96)||(825634-825713)
chr7 (15-96)||(5397126-5397205)
chr7 (15-55)||(4461412-4461451)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (8-223)||(15699555-15699770)
chr6 (8-223)||(22165549-22165764)
chr6 (8-223)||(22243812-22244027)
chr6 (8-223)||(22061503-22061718)
chr6 (15-223)||(24855245-24855453)
chr6 (8-223)||(22767116-22767331)
chr6 (8-223)||(20170242-20170458)
chr6 (15-223)||(18448140-18448349)
chr6 (15-223)||(23023093-23023302)
chr6 (23-223)||(18854026-18854226)
chr6 (15-219)||(20107784-20107989)
chr6 (15-223)||(25625691-25625899)
chr6 (18-223)||(2181063-2181269)
chr6 (15-223)||(25631269-25631477)
chr6 (15-223)||(21560554-21560762)
chr6 (15-223)||(25963248-25963457)
chr6 (15-223)||(25967895-25968104)
chr6 (16-223)||(29595697-29595904)
chr6 (20-223)||(30671807-30672011)
chr6 (15-197)||(19585568-19585750)
chr6 (9-112)||(20016339-20016443)
chr6 (154-223)||(18184874-18184943)
chr6 (166-223)||(35270971-35271028)
chr6 (167-223)||(29686601-29686657)
chr6 (160-223)||(18731868-18731931)
chr6 (160-223)||(20218981-20219044)
chr6 (160-223)||(22113006-22113069)
chr6 (15-223)||(11203856-11204060)
chr6 (167-219)||(23517835-23517887)
chr6 (15-55)||(29686449-29686489)
chr6 (15-94)||(35270850-35270927)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (8-223)||(20595831-20596046)
chr5 (8-223)||(20602117-20602332)
chr5 (8-223)||(20608408-20608623)
chr5 (8-223)||(15735534-15735749)
chr5 (8-194)||(23710705-23710892)
chr5 (8-223)||(23748051-23748266)
chr5 (8-223)||(18072900-18073115)
chr5 (8-223)||(24953174-24953389)
chr5 (15-223)||(24940540-24940749)
chr5 (16-205)||(20622170-20622359)
chr5 (15-223)||(23600636-23600845)
chr5 (15-223)||(24219752-24219961)
chr5 (8-223)||(20790714-20790929)
chr5 (15-219)||(20444843-20445048)
chr5 (29-223)||(21387410-21387605)
chr5 (19-223)||(20916456-20916660)
chr5 (15-184)||(22948518-22948688)
chr5 (16-146)||(20575510-20575640)
chr5 (167-223)||(22317513-22317569)
chr5 (167-223)||(25006808-25006864)
chr5 (167-223)||(30759655-30759711)
chr5 (160-223)||(18484212-18484275)
chr5 (173-223)||(25116171-25116221)
chr5 (167-223)||(26847803-26847859)
chr5 (178-223)||(25175261-25175306)
chr5 (167-219)||(22855723-22855775)
chr5 (15-96)||(22317639-22317719)
chr5 (178-222)||(27270563-27270607)
chr5 (15-96)||(22855572-22855651)
chr5 (16-96)||(25006934-25007012)
chr5 (15-93)||(30759784-30759860)
chr5 (174-222)||(17412736-17412784)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (8-223)||(11496614-11496829)
chr4 (8-223)||(13822913-13823128)
chr4 (14-223)||(42709731-42709940)
chr4 (9-223)||(15254349-15254563)
chr4 (16-223)||(10630758-10630965)
chr4 (15-223)||(3354646-3354855)
chr4 (16-223)||(18291945-18292153)
chr4 (15-223)||(18081459-18081669)
chr4 (16-223)||(17484910-17485118)
chr4 (15-223)||(45234232-45234441)
chr4 (16-223)||(56580539-56580748)
chr4 (16-223)||(38426745-38426938)
chr4 (18-223)||(8092427-8092634)
chr4 (15-223)||(14653998-14654203)
chr4 (167-221)||(15865647-15865701)
chr4 (167-223)||(10650547-10650603)
chr4 (167-223)||(15260109-15260165)
chr4 (167-223)||(16682913-16682969)
chr4 (172-223)||(15409534-15409585)
chr4 (167-223)||(9488878-9488934)
chr4 (174-222)||(17296250-17296298)
chr4 (17-96)||(15260235-15260312)
chr4 (15-55)||(12515042-12515081)
chr4 (15-54)||(15409380-15409418)
chr4 (15-96)||(16682762-16682841)
[»] chr3 (51 HSPs)
chr3 (8-223)||(10602472-10602687)
chr3 (8-223)||(13504881-13505096)
chr3 (8-223)||(11947407-11947622)
chr3 (8-223)||(16448760-16448975)
chr3 (8-223)||(9360971-9361186)
chr3 (8-223)||(16373565-16373780)
chr3 (8-223)||(7600355-7600570)
chr3 (8-223)||(15556942-15557157)
chr3 (8-223)||(12187076-12187291)
chr3 (8-223)||(37942378-37942593)
chr3 (16-222)||(12193491-12193697)
chr3 (8-223)||(10147011-10147226)
chr3 (8-223)||(15645001-15645216)
chr3 (8-223)||(10160173-10160388)
chr3 (8-222)||(13187418-13187632)
chr3 (8-219)||(6814868-6815079)
chr3 (16-222)||(3245589-3245795)
chr3 (16-223)||(2721305-2721511)
chr3 (15-223)||(4382751-4382961)
chr3 (16-223)||(13001425-13001634)
chr3 (15-223)||(10546936-10547148)
chr3 (15-223)||(20156515-20156722)
chr3 (15-223)||(1992803-1993011)
chr3 (15-223)||(13097711-13097919)
chr3 (15-223)||(13690608-13690816)
chr3 (15-223)||(11398215-11398424)
chr3 (15-223)||(14348588-14348797)
chr3 (18-223)||(22637702-22637908)
chr3 (16-223)||(3279191-3279399)
chr3 (18-223)||(17387839-17388045)
chr3 (15-223)||(12160207-12160416)
chr3 (8-215)||(17045697-17045902)
chr3 (8-215)||(17047857-17048062)
chr3 (8-106)||(16655798-16655897)
chr3 (167-223)||(27356728-27356784)
chr3 (166-223)||(13601220-13601277)
chr3 (15-223)||(20225754-20225960)
chr3 (167-223)||(3339226-3339282)
chr3 (15-223)||(12776534-12776739)
chr3 (167-223)||(13136210-13136266)
chr3 (167-223)||(20584262-20584318)
chr3 (172-223)||(15946773-15946824)
chr3 (165-223)||(14445768-14445826)
chr3 (167-223)||(15619283-15619339)
chr3 (167-223)||(13195458-13195514)
chr3 (168-223)||(8686387-8686442)
chr3 (172-223)||(13068306-13068357)
chr3 (8-55)||(13601062-13601108)
chr3 (15-96)||(15946619-15946698)
chr3 (15-96)||(3339352-3339431)
chr3 (16-96)||(14445891-14445969)
[»] chr2 (38 HSPs)
chr2 (8-223)||(22665062-22665277)
chr2 (8-223)||(117543-117758)
chr2 (8-223)||(22044660-22044875)
chr2 (8-223)||(25357511-25357726)
chr2 (15-223)||(11615-11823)
chr2 (8-223)||(16775651-16775866)
chr2 (8-223)||(17590407-17590622)
chr2 (8-223)||(24795285-24795500)
chr2 (15-223)||(25144757-25144966)
chr2 (8-223)||(27627580-27627796)
chr2 (16-223)||(5500265-5500473)
chr2 (15-223)||(25804267-25804475)
chr2 (16-223)||(23798922-23799129)
chr2 (17-218)||(25370890-25371091)
chr2 (15-223)||(23643950-23644160)
chr2 (15-150)||(24502168-24502304)
chr2 (69-223)||(24178193-24178348)
chr2 (135-223)||(24506777-24506865)
chr2 (167-223)||(23159385-23159441)
chr2 (167-223)||(23570642-23570698)
chr2 (167-223)||(27631655-27631711)
chr2 (167-223)||(27768816-27768872)
chr2 (172-223)||(24171510-24171561)
chr2 (154-219)||(24321314-24321380)
chr2 (154-223)||(25337651-25337720)
chr2 (167-223)||(23257570-23257625)
chr2 (15-96)||(27631506-27631585)
chr2 (167-222)||(24019068-24019123)
chr2 (15-55)||(15532753-15532792)
chr2 (15-55)||(24019228-24019267)
chr2 (162-204)||(23648123-23648165)
chr2 (15-96)||(23159511-23159590)
chr2 (15-96)||(23570768-23570847)
chr2 (177-222)||(29955868-29955913)
chr2 (178-222)||(19805618-19805662)
chr2 (174-222)||(21512567-21512615)
chr2 (15-55)||(23647980-23648019)
chr2 (15-55)||(25582938-25582977)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (8-223)||(15678-15893)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (8-223)||(27046874-27047089)
chr1 (8-223)||(17094601-17094816)
chr1 (8-223)||(21798662-21798878)
chr1 (8-223)||(20237456-20237671)
chr1 (18-219)||(8653126-8653327)
chr1 (15-223)||(52938621-52938830)
chr1 (15-223)||(3989944-3990154)
chr1 (22-223)||(19364043-19364244)
chr1 (135-223)||(14070632-14070720)
chr1 (165-219)||(19875648-19875702)
chr1 (160-223)||(21784472-21784535)
chr1 (160-223)||(4027832-4027895)
chr1 (160-223)||(8947515-8947578)
chr1 (167-220)||(16382578-16382631)
chr1 (16-96)||(21784598-21784677)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (8-223)||(21382093-21382309)
chr8 (8-223)||(21098794-21099009)
chr8 (8-223)||(21104115-21104330)
chr8 (8-223)||(23911441-23911655)
chr8 (8-223)||(8314467-8314683)
chr8 (8-223)||(8322846-8323062)
chr8 (15-223)||(21843524-21843733)
chr8 (15-223)||(21939996-21940206)
chr8 (15-223)||(20038981-20039189)
chr8 (16-223)||(23454945-23455154)
chr8 (15-223)||(16418620-16418830)
chr8 (16-223)||(17620755-17620961)
chr8 (44-223)||(24034049-24034230)
chr8 (16-212)||(14352181-14352378)
chr8 (34-223)||(21538573-21538765)
chr8 (112-223)||(20712537-20712649)
chr8 (15-84)||(20712470-20712539)
chr8 (167-223)||(11346953-11347009)
chr8 (167-223)||(19767684-19767740)
chr8 (167-223)||(22370102-22370158)
chr8 (172-223)||(20002279-20002330)
chr8 (167-223)||(22033555-22033611)
chr8 (167-223)||(22099655-22099711)
chr8 (167-223)||(22102552-22102608)
chr8 (172-223)||(21831181-21831232)
chr8 (172-223)||(22817755-22817806)
chr8 (174-222)||(18572977-18573025)
chr8 (15-96)||(22102403-22102482)
chr8 (15-96)||(11347079-11347158)
chr8 (15-96)||(22369953-22370032)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (8-223)||(1038-1253)
scaffold0404 (160-223)||(3461-3524)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (8-223)||(615-831)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (15-223)||(220-428)
[»] scaffold0825 (1 HSPs)
scaffold0825 (18-223)||(2852-3058)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (15-223)||(251870-252079)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (23-223)||(11064-11264)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (15-223)||(2287-2496)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (15-223)||(831-1041)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (16-223)||(14662-14869)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (18-223)||(482-687)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (16-223)||(120954-121162)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (15-223)||(7941-8149)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (15-223)||(1108-1318)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (15-223)||(58628-58838)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (15-223)||(97726-97936)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (15-223)||(510-718)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (65-223)||(164403-164562)
scaffold0011 (154-222)||(172248-172316)
scaffold0011 (160-223)||(161995-162058)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (18-223)||(13002-13207)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (105-223)||(10206-10325)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (18-223)||(35104-35307)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (76-223)||(8720-8869)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (62-221)||(12450-12609)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (62-221)||(232789-232948)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (17-219)||(37722-37922)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (15-223)||(5090-5295)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (122-223)||(38508-38610)
scaffold0096 (39-93)||(38625-38679)
[»] scaffold1095 (1 HSPs)
scaffold1095 (15-82)||(2859-2926)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (15-223)||(2612-2818)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (160-223)||(42237-42300)
scaffold0056 (15-96)||(42095-42174)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (160-223)||(50506-50569)
scaffold0035 (15-96)||(50632-50711)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (165-223)||(912-970)
[»] scaffold1225 (1 HSPs)
scaffold1225 (8-223)||(1688-1902)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (172-223)||(12743-12794)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (15-219)||(22159-22360)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (167-223)||(10720-10776)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (167-223)||(54849-54905)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (160-223)||(37743-37806)
scaffold0116 (16-96)||(37869-37948)
[»] scaffold0094 (2 HSPs)
scaffold0094 (167-222)||(1193-1248)
scaffold0094 (15-55)||(1041-1080)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (160-223)||(22756-22818)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (173-223)||(72572-72622)
scaffold0037 (173-223)||(84762-84812)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (160-223)||(45228-45291)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (178-223)||(18218-18263)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (15-55)||(5830-5869)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (167-207)||(83174-83214)


Alignment Details
Target: scaffold0029 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 123369 - 123584
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  123369 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 123468  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  123469 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 123568  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  123569 gtgggggagtttgatg 123584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 9582893 - 9583108
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582893 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 9582992  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9582993 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9583092  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  9583093 gtgggggagtttgatg 9583108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16120064 - 16119849
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16120064 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16119965  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16119964 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgtttgtgctactatgtatatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16119865  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  16119864 gtgggggagtttgatg 16119849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 23515067 - 23515278
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515067 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23515166  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23515167 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23515266  T
Q  208 gtgggggagttt 219  Q
    ||||||||||||    
T  23515267 gtgggggagttt 23515278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 14551098 - 14551314
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaa-attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551098 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 14551197  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14551198 gcccttgaggggacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 14551297  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  14551298 tgtgggggagtttgatg 14551314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 8717865 - 8718080
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8717865 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 8717964  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8717965 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 8718064  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  8718065 gtgggggagtttgatg 8718080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 13673856 - 13674071
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13673856 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaaaaaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13673955  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13673956 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13674055  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  13674056 atgggggagtttgatg 13674071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18593567 - 18593352
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18593567 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18593468  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18593467 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18593368  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  18593367 atgggggagtttgatg 18593352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 18618117 - 18618332
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18618117 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagattccaagaaatacttgagtttgtaattagtgtacattttggatttaag 18618216  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18618217 cccttgaggagacatgtactttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 18618316  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  18618317 atgggggagtttgatg 18618332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 4312564 - 4312772
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  4312564 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 4312663  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4312664 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 4312763  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  4312764 agtttgatg 4312772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 538964 - 538755
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaa-tgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| || |||||     
T  538964 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaaacccttc 538865  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  538864 aggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 538765  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  538764 gagtttgatg 538755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 12567020 - 12567229
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  12567020 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 12567119  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  | || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12567120 ggagacatgagttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgttctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtgggg 12567219  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  12567220 gagtttgatg 12567229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 20108375 - 20108584
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  20108375 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 20108474  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||    || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20108475 ggagacatcagttttaattgaattctcatatgataaccttgttttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggg 20108574  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  20108575 gagtttgatg 20108584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12549012 - 12548805
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||    
T  12549012 acacacacactcacttgaagcttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtggacgcttgaaattgaagcccttgag 12548913  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12548912 gagacatgt-atttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttgggg 12548814  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  12548813 agtttgatg 12548805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8781146 - 8780936
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  8781146 cacacacacactaccttgaaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcctttga 8781047  T
Q  115 ggagacat--gtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||  ||  |||||||||||||||||||| ||    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8781046 ggagacataagttttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 8780947  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  8780946 ggagtttgatg 8780936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 9003958 - 9004165
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  9003958 cacacatacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagatcacaagaaatgcttgagtttgtaattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 9004057  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9004058 ggagacataagttttaattgaattgtcatatgataaacttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtgggg 9004157  T
Q  214 gagtttga 221  Q
    ||||||||    
T  9004158 gagtttga 9004165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48801983 - 48801777
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  48801983 acacacatactcactttttacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaattaaagcctttgag 48801884  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||| |||    |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48801883 gagacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctactatgtgtatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 48801785  T
Q  215 agtttgat 222  Q
    ||||||||    
T  48801784 agtttgat 48801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9265145 - 9264939
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  9265145 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 9265046  T
Q  118 gacatgtg-ctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    |||||  |  ||| |||||||||||||||| ||    || || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9265045 gacataagttttttattgaattgtcatatgttaatcttgcttatgctgctatgtttatgccttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 9264946  T
Q  217 tttgatg 223  Q
    |||||||    
T  9264945 tttgatg 9264939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 13657873 - 13658081
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13657873 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggtggaaaagggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13657972  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||    ||    |||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13657973 ggagatatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttacgctaccatgttgatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 13658072  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  13658073 agtttgatg 13658081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11921512 - 11921307
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  11921512 cacacacacactcacttaggactagattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgcgtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 11921413  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||   || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11921412 aggagacgtgtgctttaatgtaattgtcatgtga---aaatgtta-tgctaccatgtttatgacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 11921317  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  11921316 gagtttgatg 11921307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 16532100 - 16532311
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 112  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16532100 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16532199  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    | |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16532200 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16532299  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  16532300 gggagtttgatg 16532311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16633562 - 16633351
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattg-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa-gccctt 112  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  || | | | || ||| ||    
T  16633562 cacacacacactcaattaagacttgattgattgggttgaaaaaaggttataagaaatacttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaatgccttt 16633463  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgg 211  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    | |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16633462 gaggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgaaaatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgg 16633363  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  16633362 gggagtttgatg 16633351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16465821 - 16465616
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccctt- 112  Q
    |||||||||||||||||   ||| || || ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||     
T  16465821 cacacacacactcacttaggactagactgatgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttt 16465722  T
Q  113 gaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||| |||| ||||||  | |||||||  || ||      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16465721 gaggagacgtgtgttttaatgtatttgtcatgagaaatg-----ttatgctactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 16465627  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  16465626 ggagtttgatg 16465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 4461311 - 4461242
Alignment:
Q  154 tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4461311 tgtttatgctgccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 4461242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 825783 - 825839
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  825783 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 825839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14221774 - 14221718
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14221774 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14221718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15916832 - 15916776
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916832 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15916776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 18287761 - 18287817
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287761 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18287817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 27291496 - 27291552
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291496 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27291552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15206647 - 15206584
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206647 tgctgctatgtctatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 5397273 - 5397331
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5397273 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 5397331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 223
Target Start/End: Original strand, 15065935 - 15065984
Alignment:
Q  174 tgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065935 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15065984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9194597 - 9194544
Alignment:
Q  170 tttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9194597 tttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatgggggagtttgatg 9194544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6713124 - 6713072
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  6713124 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtataggggagttt 6713072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4791478 - 4791383
Alignment:
Q  127 tttaattgaattgtcatatgatataactgtttgt-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||| || | || ||| | ||| | |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4791478 tttaattgaattgtcatatgtta-atctttttattgctgccatgtctatgcattctgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 4791383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Original strand, 15348532 - 15348587
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15348532 atgtttatgccttttacttgaggacaaacaaagattcaagtttggggaagtttgat 15348587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 15065779 - 15065858
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15065779 cacacacacactcacttgagatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15065858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 18287612 - 18287691
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18287612 cacacagacactcacttgaaatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 18287691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Original strand, 15522517 - 15522557
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15522517 atgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagt 15522557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 825634 - 825713
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  825634 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 825713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 5397126 - 5397205
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  5397126 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 5397205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 4461451 - 4461412
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4461451 cacacacacactcacttgagacttg-ttgttgggttgaata 4461412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 15699555 - 15699770
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699555 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15699654  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15699655 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15699754  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  15699755 gtgggggagtttgatg 15699770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22165764 - 22165549
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22165764 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22165665  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22165664 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22165565  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  22165564 gtgggggagtttgatg 22165549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 22243812 - 22244027
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22243812 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22243911  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22243912 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22244011  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  22244012 gtgggggagtttgatg 22244027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22061718 - 22061503
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061718 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22061619  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22061618 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22061519  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  22061518 atgggggagtttgatg 22061503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24855453 - 24855245
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24855453 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttg 24855354  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24855353 aggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24855255  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  24855254 gagtttgatg 24855245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22767331 - 22767116
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22767331 tggacttcacacacactctcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 22767232  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22767231 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgttactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 22767133  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  22767132 tatgggggagtttgatg 22767116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 20170242 - 20170458
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20170242 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 20170341  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatat-aactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20170342 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20170440  T
Q  206 gtgtgggggagtttgatg 223  Q
    || |||||||||||||||    
T  20170441 gtatgggggagtttgatg 20170458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 18448140 - 18448349
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  18448140 cacacacacagtcacttgaaacttgactgttgggatgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 18448239  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18448240 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccaagtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 18448339  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  18448340 gagtttgatg 18448349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 23023093 - 23023302
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  23023093 cacacgcacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 23023192  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgt-ttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23023193 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttatgctaccatgtttaagacttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23023292  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  23023293 gagtttgatg 23023302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Original strand, 18854026 - 18854226
Alignment:
Q  23 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  18854026 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgctggaaattaaagcccttgaggagacat 18854125  T
Q  123 gtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18854126 gtgtattaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggggagtttgat 18854225  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  18854226 g 18854226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20107989 - 20107784
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  20107989 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagcctttga 20107890  T
Q  115 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20107889 ggagacataagttttcaattgaattgtcatatg-tttatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 20107791  T
Q  213 ggagttt 219  Q
    |||||||    
T  20107790 ggagttt 20107784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 25625691 - 25625899
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||| |    
T  25625691 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttaa 25625790  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  25625791 ggagacatatgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttacaccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtatggggg 25625890  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  25625891 agtttgatg 25625899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 2181063 - 2181269
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |  | |  |||||||||||||||||    
T  2181063 acacacactcacttgaaacttggttgttgagttgaataaggattacgagaaatgcttaagtttgtgattaatgtgcgctcgaaatttaagcccttgagga 2181162  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2181163 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 2181262  T
Q  217 tttgatg 223  Q
    |||||||    
T  2181263 tttgatg 2181269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25631477 - 25631269
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  25631477 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 25631378  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
     |||| ||  | ||||||||||||||||||| |||    |||||  |||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25631377 agagatataagttttaattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctaccatgtttatgcatttttcctgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25631279  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  25631278 gagtttgatg 25631269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21560762 - 21560554
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  21560762 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 21560663  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||    ||    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21560662 ggagacatgtgttttaattaaattgacatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 21560563  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  21560562 agtttgatg 21560554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 25963248 - 25963457
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25963248 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25963347  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||     |||||||||||||||||||| ||   | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25963348 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25963447  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  25963448 gagtttgatg 25963457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 25967895 - 25968104
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| ||||    
T  25967895 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattaaaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagcctttga 25967994  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||     |||||||||||||||||||| ||   | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25967995 ggagacacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25968094  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  25968095 gagtttgatg 25968104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 29595697 - 29595904
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||  ||| ||||||||| |    
T  29595697 acacacacagtcatttgaaacttgattattgggttgaaaaaggattacaagaaatgtttgagttttttattagtgtacacttgaaattaaagcccttggg 29595796  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29595797 gagacatgtgttttaattaaatcgtcatgtgataatcttatttatgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgaggga 29595896  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  29595897 gtttgatg 29595904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30672011 - 30671807
Alignment:
Q  20 acacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggaga 119  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||| ||| |    
T  30672011 acacactcaattagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttggggaaa 30671912  T
Q  120 catgtgctttaattgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtt 218  Q
    ||     |||||||||||||||||||| ||   | || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30671911 cacaaattttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgctactatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtt 30671812  T
Q  219 tgatg 223  Q
    |||||    
T  30671811 tgatg 30671807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19585750 - 19585568
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||  ||||| || |    
T  19585750 cacatacacactcacttaaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgtgtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcctttta 19585651  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtt-tgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaa 197  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||    |||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19585650 ggagacatgagttttaattgtattgtcatatg-taatcttgttctatgctgctatgtatatgccttttgcttgaggacaagaaa 19585568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20016443 - 20016339
Alignment:
Q  9 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaag 107  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  20016443 ggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttggatagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgcaattagtgtacattttgggatttaag 20016344  T
Q  108 ccctt 112  Q
    |||||    
T  20016343 ccctt 20016339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18184943 - 18184874
Alignment:
Q  154 tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18184943 tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 18184874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 35270971 - 35271028
Alignment:
Q  166 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35270971 tatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggtgtttgatg 35271028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 29686601 - 29686657
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29686601 atgtttatgcctcttgcttgaggacaagaaaagattcaagtatgggagagtttgatg 29686657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 18731868 - 18731931
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18731868 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagctaagattcaagtgtggaggagtttgatg 18731931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20219044 - 20218981
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20219044 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 20218981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22113069 - 22113006
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113069 tgctgctatgtttatgccttttgcttgaagagaagcaaagattcatgtgtgggggagtttgatg 22113006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 11203856 - 11204060
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  || ||| |||||||||||   ||  | |  |||  |    
T  11203856 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttttgaatagtgtacatt---gaaatgaaacctcaa 11203951  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||   |||| |||||||||||||||  ||   || ||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  11203952 ggagacataaacttttattgaattgtcatatattaatccttttgttgctgccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatatttaagtgtggggg 11204051  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  11204052 agtttgatg 11204060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23517887 - 23517835
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23517887 atgtgtatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtatgggggagttt 23517835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 29686449 - 29686489
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29686449 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaata 29686489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 35270850 - 35270927
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca 94  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  35270850 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-ttacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtaca 35270927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20596046 - 20595831
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20596046 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20595947  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20595946 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20595847  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  20595846 gtgggggagtttgatg 20595831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20602332 - 20602117
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20602332 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20602233  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20602232 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20602133  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  20602132 gtgggggagtttgatg 20602117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20608623 - 20608408
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20608623 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 20608524  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20608523 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataaccgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20608424  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  20608423 gtgggggagtttgatg 20608408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 15735534 - 15735749
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15735534 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacacttgggatttaag 15735633  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15735634 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15735733  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  15735734 gtgggggagtttgatg 15735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23710892 - 23710705
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710892 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttaaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23710793  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaag 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710792 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaag 23710705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 23748051 - 23748266
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23748051 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 23748150  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23748151 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23748250  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  23748251 atgggggagtttgatg 23748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 18072900 - 18073115
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18072900 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 18072999  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18073000 gcccttgaggagacatgtgctttaattg-attgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 18073098  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  18073099 tatgggggagtttgatg 18073115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24953389 - 24953174
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24953389 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 24953290  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24953289 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttataccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 24953191  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  24953190 tatgggggagtttgatg 24953174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 24940540 - 24940749
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24940540 cacacactcactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtttacattttgggatttaagcccttg 24940639  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24940640 aggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 24940739  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  24940740 gagtttgatg 24940749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 205
Target Start/End: Original strand, 20622170 - 20622359
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622170 acacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 20622269  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaa 205  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20622270 gagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaattgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaa 20622359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23600845 - 23600636
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||    
T  23600845 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttga 23600746  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgt-ttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23600745 ggagacatgtgttctaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 23600646  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    || |||||||    
T  23600645 gaatttgatg 23600636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 24219752 - 24219961
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  24219752 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 24219851  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24219852 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaagtgtgggg 24219951  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  24219952 gagtttgatg 24219961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20790929 - 20790714
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20790929 tggacttcacacacacactcgcttgaaacttgattgttaggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 20790830  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20790829 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 20790731  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  20790730 tatgggggagtttgatg 20790714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20445048 - 20444843
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  20445048 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 20444949  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20444948 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattattttgtgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaatcaaagattcaagtgtgggg 20444849  T
Q  214 gagttt 219  Q
    ||||||    
T  20444848 gagttt 20444843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 223
Target Start/End: Original strand, 21387410 - 21387605
Alignment:
Q  29 cttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | ||||||||||||  | ||    
T  21387410 cttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatgaaagtctttgaggagacataagttt 21387509  T
Q  129 t-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    | ||||||||||||||||| ||    ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387510 tcaattgaattgtcatatgttagtcttgtgtgtgctgctatgtttatgcatttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21387605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20916660 - 20916456
Alignment:
Q  19 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||||||    
T  20916660 cacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagttcgtgattagtgtacggttgaaataaaagcctttgaggag 20916561  T
Q  119 acatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtt 218  Q
    ||||| | ||| ||| ||||||| ||||  ||     ||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||    
T  20916560 acatgagttttgatttaattgtcctatgtaatcttattttatgcagctatgtctatgccttttgcttgaggacaaccaaaaattcatgtgtaggggagtt 20916461  T
Q  219 tgatg 223  Q
    |||||    
T  20916460 tgatg 20916456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 22948518 - 22948688
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| ||||    
T  22948518 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttga 22948617  T
Q  115 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgct 184  Q
    | | ||||  |  |||||||||||||||||||| ||    ||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  22948618 gaaaacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcgtgtttatgctgccatgtttatgccttttgct 22948688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 146
Target Start/End: Original strand, 20575510 - 20575640
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  20575510 acacacgcactcacttgaaacttgattgtcgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 20575609  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatg 146  Q
    |||||||| | ||| ||||||||| ||||||    
T  20575610 gagacatgagttttgattgaattgccatatg 20575640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22317569 - 22317513
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22317569 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22317513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25006864 - 25006808
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006864 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25006808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30759711 - 30759655
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759711 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 30759655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18484275 - 18484212
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18484275 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgttggggagtttgatg 18484212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25116221 - 25116171
Alignment:
Q  173 atgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25116221 atgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25116171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 26847803 - 26847859
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26847803 atgtctatgccttttggttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 26847859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25175306 - 25175261
Alignment:
Q  178 ttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175306 ttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 25175261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 219
Target Start/End: Original strand, 22855723 - 22855775
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22855723 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 22855775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22317719 - 22317639
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22317719 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22317639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 222
Target Start/End: Original strand, 27270563 - 27270607
Alignment:
Q  178 ttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  27270563 ttttgcttgaggacaagcaatgattcaagtgtgggggagtttgat 27270607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 22855572 - 22855651
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22855572 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-ttacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22855651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 25007012 - 25006934
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  || |||||||||||||||    
T  25007012 acacacacactcacttgaaatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttatgattagtgtacatt 25006934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 30759860 - 30759784
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 93  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30759860 cacacacacactcacttgagatttg-ttgttgggttgaat-aagtttacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtac 30759784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Original strand, 17412736 - 17412784
Alignment:
Q  174 tgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||||||||||    
T  17412736 tgccttttgcttgacgacaaacaatgattcaagtatgggggagtttgat 17412784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11496829 - 11496614
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11496829 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11496730  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11496729 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 11496630  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  11496629 gtgggggagtttgatg 11496614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 13822913 - 13823128
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13822913 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13823012  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13823013 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13823112  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  13823113 gtgggggagtttgatg 13823128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42709940 - 42709731
Alignment:
Q  14 tcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42709940 tcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaagcccttg 42709841  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42709840 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 42709741  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  42709740 gagtttgatg 42709731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 223
Target Start/End: Original strand, 15254349 - 15254563
Alignment:
Q  9 ggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagc 108  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15254349 ggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttggatttaaac 15254448  T
Q  109 ccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtg 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15254449 ccttaaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgcaactacgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtg 15254548  T
Q  209 tgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||    
T  15254549 tgggggagtttgatg 15254563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 10630758 - 10630965
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||    
T  10630758 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaatttaagcccttgag 10630857  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgt-ttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10630858 gagacatgtgctttaattaaattgtcatatgata-atatgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 10630956  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  10630957 agtttgatg 10630965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 3354646 - 3354855
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  3354646 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 3354745  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  3354746 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaactattcaagtgtgggg 3354845  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  3354846 gagtttgatg 3354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 18291945 - 18292153
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  18291945 acacacacgctcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgactttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 18292044  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18292045 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgcctttttcttgtggacaagcaaagattcaagtgtggggg 18292144  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  18292145 agtttgatg 18292153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18081669 - 18081459
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  18081669 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 18081570  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtt-tgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18081569 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 18081470  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  18081469 ggagtttgatg 18081459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17485118 - 17484910
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  |||||| ||||    
T  17485118 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcccctgag 17485019  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||| |||||    || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17485018 gagacataagttttaattaaattgtcatgtgataatcttgttttatgctaccatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 17484919  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  17484918 agtttgatg 17484910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45234441 - 45234232
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  45234441 cacacacacactcacttgaaacttgatagttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaataaaagcctttga 45234342  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    || ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  45234341 ggagacattagttttaatttaattgtcatatgataatcttgttttatgccaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtctgggg 45234242  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  45234241 gagtttgatg 45234232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56580748 - 56580539
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  56580748 acacacacactcacttaagacttgatttatgggttgaaaaatgattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 56580649  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56580648 ggagacatgtgctttaatttaattgtcagatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 56580549  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  56580548 gagtttgatg 56580539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 38426745 - 38426938
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  38426745 acacacacactcacttgaaacttgattgttggcttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 38426844  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||             || ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38426845 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgata------------atatta--tttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 38426930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8092634 - 8092427
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| || | ||    
T  8092634 acacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttaatga 8092535  T
Q  118 gacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||  | ||| | |||||||||| |||  ||    |||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  |    
T  8092534 gacataagttttcagttgaattgtcgtatattaatcttgtttattgttactatgtttatgtctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggaaa 8092435  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  8092434 gtttgatg 8092427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14654203 - 14653998
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||  | | | || ||    |    
T  14654203 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt--gaaatgaaacctcgaa 14654108  T
Q  115 ggagacatgtgc-tttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||  || |||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14654107 ggagacataagcttttatttgaattgtcatat-attaatctttttgttgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14654009  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  14654008 ggagtttgatg 14653998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 221
Target Start/End: Original strand, 15865647 - 15865701
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15865647 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 15865701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 10650547 - 10650603
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10650547 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 10650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15260165 - 15260109
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15260165 atgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15260109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 16682913 - 16682969
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16682913 atgtctatgccttttgcttgatgacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 16682969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 15409534 - 15409585
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  15409534 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattctagtgtgggggagtttgatg 15409585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9488934 - 9488878
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9488934 atgttcatgccttttgcttgaggacaagcaaagattgaagtatgggggagtttgatg 9488878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17296298 - 17296250
Alignment:
Q  174 tgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17296298 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcatgggggagtttgat 17296250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15260312 - 15260235
Alignment:
Q  17 cacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15260312 cacacacactcacttgaaatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15260235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 12515042 - 12515081
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12515042 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 12515081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 54
Target Start/End: Original strand, 15409380 - 15409418
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaat 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15409380 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaat 15409418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 16682762 - 16682841
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||   ||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16682762 cacacacacactcacttaagacttg-ttgtttggttgaataagt-ttacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 16682841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 51)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10602687 - 10602472
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602687 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 10602588  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10602587 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 10602488  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  10602487 gtgggggagtttgatg 10602472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13505096 - 13504881
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13505096 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 13504997  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13504996 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 13504897  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  13504896 gtgggggagtttgatg 13504881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 11947407 - 11947622
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11947407 tggacttcacacacacactcatttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 11947506  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11947507 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagtaaagattcaagt 11947606  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  11947607 gtgggggagtttgatg 11947622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16448975 - 16448760
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16448975 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 16448876  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16448875 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16448776  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  16448775 atgggggagtttgatg 16448760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9361186 - 9360971
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9361186 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttggaatttaag 9361087  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9361086 cccttgaggagacatgtcctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 9360987  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  9360986 atgggggagtttgatg 9360971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16373780 - 16373565
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16373780 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16373681  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16373680 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 16373582  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  16373581 tatgggggagtttgatg 16373565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 7600355 - 7600570
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7600355 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 7600454  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7600455 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 7600554  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  7600555 atgggggagtttgatg 7600570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15557157 - 15556942
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15557157 tggacttcatacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 15557058  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15557057 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagt 15556958  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  15556957 gtgggggagtttgatg 15556942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12187291 - 12187076
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12187291 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 12187192  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12187191 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 12187093  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  12187092 tatgggggagtttgatg 12187076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 37942378 - 37942593
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37942378 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaggaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 37942477  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37942478 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 37942576  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  37942577 tatgggggagtttgatg 37942593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12193697 - 12193491
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12193697 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaagcccttga 12193598  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  12193597 ggagacatgtgctttaatt-aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaggtatggggg 12193499  T
Q  215 agtttgat 222  Q
    ||||||||    
T  12193498 agtttgat 12193491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 10147011 - 10147226
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10147011 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 10147110  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10147111 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagactcaag 10147209  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  10147210 tatgggggagtttgatg 10147226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 15645001 - 15645216
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15645001 tggacttcacacacacactcacttgaaacttaattgttgggtagaataaagatttcaagaaacacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 15645100  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15645101 gcccttgaggagacatgtgctttaattg-attgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 15645199  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  15645200 tatgggggagtttgatg 15645216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10160388 - 10160173
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  10160388 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 10160289  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10160288 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcattcgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 10160190  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  10160189 tatgggggagtttgatg 10160173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13187632 - 13187418
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  13187632 tggacttcacacacacactcacttgaaactcgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggattaaa 13187533  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13187532 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 13187434  T
Q  207 tgtgggggagtttgat 222  Q
    | ||||||||||||||    
T  13187433 tatgggggagtttgat 13187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Original strand, 6814868 - 6815079
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  6814868 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttat 6814967  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6814968 gcccttgaggagacatgtgctttaatt-aactgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 6815066  T
Q  207 tgtgggggagttt 219  Q
    | || ||||||||    
T  6815067 tatgagggagttt 6815079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3245795 - 3245589
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  3245795 acacacatactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 3245696  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3245695 gagacataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 3245596  T
Q  216 gtttgat 222  Q
    |||||||    
T  3245595 gtttgat 3245589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 2721305 - 2721511
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |  ||||| |||||    
T  2721305 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttgag 2721404  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||| |||    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2721405 gagacataagttttaattgaattgtcatattataatcttgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgt-gggga 2721503  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  2721504 gtttgatg 2721511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 4382751 - 4382961
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  4382751 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 4382850  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtt-tgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4382851 aggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttctatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 4382950  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  4382951 ggagtttgatg 4382961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13001634 - 13001425
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||    
T  13001634 acacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttga 13001535  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13001534 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 13001435  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  13001434 gagtttgatg 13001425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10547148 - 10546936
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaa--attacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |    
T  10547148 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctt 10547049  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgata-taactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| || |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10547048 tgaggagacatgtgcttcgaattaattgtcatatgataatatcgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtg 10546949  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  10546948 ggggagtttgatg 10546936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20156722 - 20156515
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||  ||||| ||||    
T  20156722 cacacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagtttacaagaaatgcttgagcttgtgattagtgtaaaattgaaataaaagcctttga 20156623  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20156622 ggagacatgagttttaatttaattgtcatatgat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgcattttgcttgaggacaag-caagattcaagtgtgggg 20156525  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  20156524 gagtttgatg 20156515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 1992803 - 1993011
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  1992803 cacacacacactcacttgaaatttgattgttgagttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 1992902  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | | |    
T  1992903 ggagacataagttttaatttaattgtcatatgataatcttgtttatgctactatgtttatgccttttgcttgagcataagcaaagattcaagtgggagag 1993002  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  1993003 agtttgatg 1993011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 13097711 - 13097919
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13097711 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtgtacacttgaaattaaagcctttga 13097810  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13097811 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaaatgtggggg 13097910  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  13097911 agtttgatg 13097919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 13690608 - 13690816
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| ||||    
T  13690608 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttgtgattagtggacacttgaaattaaagcctttga 13690707  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||   |||    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  13690708 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatgaaataatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgatgacaactaaagattcaagtgtggggg 13690807  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  13690808 agtttgatg 13690816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 11398215 - 11398424
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||   ||  ||||| ||||    
T  11398215 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttatgattagtgtacgctttaaataaaagcctttga 11398314  T
Q  115 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
     |||||||  | ||| |||||||||||| |||| ||    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11398315 agagacataagttttcaattgaattgtcgtatgttaatcttgtttatgctgctatatttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggg 11398414  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  11398415 gagtttgatg 11398424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14348797 - 14348588
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  14348797 cacacacacactcacttagaacttgattgtttggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 14348698  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    |||||||   | |||||||||||||||||||| ||   | || || || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14348697 ggagacacaagttttaattgaattgtcatatgttaagtcttgcttatgttaccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 14348598  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  14348597 gagtttgatg 14348588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 22637702 - 22637908
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||  ||| | |||||||    
T  22637702 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaattgcttaagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagtctttgagga 22637801  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    | |||  | |||||||||||||||||||||||    || ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22637802 ggcataagttttaattgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttgagcacaagtaaagattcaagtgtaggggag 22637901  T
Q  217 tttgatg 223  Q
    |||||||    
T  22637902 tttgatg 22637908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 3279191 - 3279399
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  ||  ||| | |||||    
T  3279191 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgttcgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagtctttgag 3279290  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||   | ||||||| |||||||||||| | |  | ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3279291 gagacacaagttttaatttaattgtcatatgttaagtattgtttatgttgctatgtctatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtgtggggg 3279390  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  3279391 agtttgatg 3279399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 17387839 - 17388045
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    |||  ||  ||||| |||||||    
T  17387839 acacacactcactttaaacttgattgttgggttgaataaagatttcaagaattgcttgagtttgtgattagtgtgtgcttgaaataaaagcctttgagga 17387938  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    || ||  | |||||||||||||||| ||||||    || ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17387939 gatataagttttaattgaattgtcacatgataatcttgttttatgctaccatgttgatgccttttgcttaaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 17388038  T
Q  217 tttgatg 223  Q
    |||||||    
T  17388039 tttgatg 17388045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12160416 - 12160207
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||  ||  || |  |||    
T  12160416 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaa-aagaattacaagaaatgcttgagttttttattagtgtactctttgaaataaaaacatttg 12160318  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     ||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12160317 aggagacatgttctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgccaccatgtttatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 12160218  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  12160217 ggagtttgatg 12160207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 17045697 - 17045902
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17045697 tggacttcacacacacactcacttggaatttg-ttgttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17045793  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    || ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17045794 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17045893  T
Q  207 tgtggggga 215  Q
    |||||||||    
T  17045894 tgtggggga 17045902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 215
Target Start/End: Original strand, 17047857 - 17048062
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    | ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  17047857 tggacttcacacacacactcacttggaatttg-ttgttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aag 17047953  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    || ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17047954 cctttgaggagacataagtttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttatgctactatttttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 17048053  T
Q  207 tgtggggga 215  Q
    |||||||||    
T  17048054 tgtggggga 17048062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 106
Target Start/End: Original strand, 16655798 - 16655897
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16655798 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 16655897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27356784 - 27356728
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356784 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27356728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 223
Target Start/End: Original strand, 13601220 - 13601277
Alignment:
Q  166 tatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601220 tatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13601277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20225960 - 20225754
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    | ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||    
T  20225960 cacacacacacttacttgaaacttg-ttgctgggttgaataggt-tcacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacacttgaaata-aagcctttga 20225864  T
Q  115 ggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||  | ||| |||||  |||||||||| ||    | ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  20225863 ggagacataagtttttaattgttttgtcatatgttaatcttatttatgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaaacaaagatttaagtatgggg 20225764  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  20225763 gagtttgatg 20225754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3339282 - 3339226
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339282 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 3339226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12776739 - 12776534
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||   ||  | |  ||| ||    
T  12776739 cacacacacactcacttgagacttg-ttgttgggttgaat-aagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt---gaaatgaaacctcga 12776645  T
Q  115 -ggagacatgtgc-tttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
     ||||||||  || |||| ||||||||||||||  ||   || ||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12776644 gggagacataagcttttatttgaattgtcatatattaatccttttgttgctgccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 12776545  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  12776544 ggagtttgatg 12776534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13136266 - 13136210
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13136266 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 20584262 - 20584318
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584262 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20584318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 15946773 - 15946824
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946773 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 15946824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14445826 - 14445768
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14445826 ctatgtctatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 14445768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15619339 - 15619283
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15619339 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggcagtttgatg 15619283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13195514 - 13195458
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13195514 atgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgtgggagtttgatg 13195458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8686442 - 8686387
Alignment:
Q  168 tgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8686442 tgtttatgctttttgtttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 8686387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 13068306 - 13068357
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13068306 tatgtcttttggttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 13068357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 55
Target Start/End: Original strand, 13601062 - 13601108
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13601062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 13601108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 15946619 - 15946698
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15946619 cacacacacactcacttgagatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 15946698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 3339431 - 3339352
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  3339431 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 3339352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 14445969 - 14445891
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  14445969 acacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 14445891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 38)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 22665062 - 22665277
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22665062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22665161  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22665162 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22665261  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  22665262 gtgggggagtttgatg 22665277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 117543 - 117758
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117543 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 117642  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  117643 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatatgcaagt 117742  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  117743 gtgggggagtttgatg 117758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22044875 - 22044660
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044875 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 22044776  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22044775 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 22044676  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  22044675 atgggggagtttgatg 22044660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 25357511 - 25357726
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357511 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 25357610  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25357611 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 25357710  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  25357711 atgggggagtttgatg 25357726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11823 - 11615
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11823 cacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 11724  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  11723 ggagatatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgagctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagaggcaagtgtggggg 11624  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  11623 agtttgatg 11615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 16775651 - 16775866
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16775651 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 16775750  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16775751 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 16775850  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  16775851 atgggggagtttgatg 16775866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 17590407 - 17590622
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17590407 tggacttcacatacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaatagagatttccagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17590506  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17590507 cccttgaggagacatgtgctttaatttaattgtcatttgatttaactgttgctgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17590606  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  17590607 atgggggagtttgatg 17590622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24795500 - 24795285
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795500 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 24795401  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |  || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24795400 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatggtactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 24795301  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  24795300 atgggggagtttgatg 24795285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25144966 - 25144757
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  25144966 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttga 25144867  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25144866 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 25144767  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  25144766 gagtttgatg 25144757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 27627580 - 27627796
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttg-ggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  27627580 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattaatgtacattttaggatttaa 27627679  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27627680 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgattcaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 27627779  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  27627780 tatgggggagtttgatg 27627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5500473 - 5500265
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  5500473 acacacacactcacttgaaacttgattgttgagttgaataaggtttacgtgaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattgaagcccttgag 5500374  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5500373 gagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 5500274  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  5500273 agtttgatg 5500265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25804475 - 25804267
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||   |  ||||| ||||    
T  25804475 cacacgcacactcacttgaaatttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacgcttgaattaaaagcctttga 25804376  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||| ||||  | |||||||||||||||||||| ||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25804375 ggatacataagttttaattgaattgtcatatgttaatcttgtttgtgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 25804276  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  25804275 agtttgatg 25804267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23799129 - 23798922
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||    
T  23799129 acacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggatacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgag 23799030  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  23799029 gagacatgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatgtttatgccttttgcttgaggataatcaaagattcaagtgtggggga 23798930  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  23798929 gtttgatg 23798922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25371091 - 25370890
Alignment:
Q  17 cacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 116  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  ||| ||||| ||||||    
T  25371091 cacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaagattataagaaatgcttgagtttgtaattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagg 25370992  T
Q  117 agacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||   ||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25370991 agacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttattgttactatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggga 25370893  T
Q  216 gtt 218  Q
    |||    
T  25370892 gtt 25370890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 23643950 - 23644160
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacat-ttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||    
T  23643950 cacacacgcacccacttaagacttgattgtagggttgaaaaaggattacaggaaatgcttgagtttgtgattagtgtactccttgaaataaaagcctttg 23644049  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    | |||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23644050 aggagacacgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 23644149  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  23644150 ggagtttgatg 23644160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 150
Target Start/End: Original strand, 24502168 - 24502304
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||    
T  24502168 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcatttga 24502267  T
Q  115 ggagacatgtg-ctttaattgaattgtcatatgatat 150  Q
    ||||||||  |  ||||||||||||||||||| ||||    
T  24502268 ggagacataagtttttaattgaattgtcatattatat 24502304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 69 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24178348 - 24178193
Alignment:
Q  69 atgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctacta 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||    ||||| |||| |||    
T  24178348 atgcttgagtttgtgattagtgtacgtttgaaataaaagcttttgaggagacataagtttttaattaaattgtcatatgataatcttgtttatgctgcta 24178249  T
Q  168 tgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24178248 tgtttatgccttttgtttgaagacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24178193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 24506777 - 24506865
Alignment:
Q  135 aattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24506777 aattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatgtcttttgcttgaggacaataaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24506865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23159441 - 23159385
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159441 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23159385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23570698 - 23570642
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570698 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 23570642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 27631655 - 27631711
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631655 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27631711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 27768872 - 27768816
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768872 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 27768816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 24171510 - 24171561
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24171510 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24171561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 219
Target Start/End: Original strand, 24321314 - 24321380
Alignment:
Q  154 tgtttgtgctacta-tgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24321314 tgtttatgctactaatgtttacgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagttt 24321380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 25337720 - 25337651
Alignment:
Q  154 tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  25337720 tgtttatgctgctatatttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggaatttgatg 25337651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23257625 - 23257570
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  23257625 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtat-ggggagtttgatg 23257570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 27631506 - 27631585
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27631506 cacacacacactcacttgaaatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 27631585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24019123 - 24019068
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24019123 atgtttatgtcttttgtttgaggacaaaaaaagattcaagtatgggggaatttgat 24019068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 15532753 - 15532792
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15532753 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 15532792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 24019267 - 24019228
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24019267 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 24019228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 204
Target Start/End: Original strand, 23648123 - 23648165
Alignment:
Q  162 ctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattca 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23648123 ctactatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattca 23648165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23159590 - 23159511
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  23159590 cacacacacactcacttgagatttg-ttgttgggttgaat-aagtttacaaggaatacttcaagttgtgattagtgtacatt 23159511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23570847 - 23570768
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  23570847 cacacacacactcacttgagatttg-ttgttgggttgaat-aagtttacaaggaatacttcaagttgtgattagtgtacatt 23570768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 177 - 222
Target Start/End: Original strand, 29955868 - 29955913
Alignment:
Q  177 cttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  29955868 cttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatcgggaagtttgat 29955913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19805662 - 19805618
Alignment:
Q  178 ttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||    
T  19805662 ttttgcttgaggacaagcaatggttctagtgtgggggagtttgat 19805618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21512615 - 21512567
Alignment:
Q  174 tgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||    
T  21512615 tgccttttgcttgaggacaagcaaggattcaagcatgggggaatttgat 21512567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 23647980 - 23648019
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23647980 cacacacacactcacttgagacttg-ttgttgggttgaata 23648019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25582977 - 25582938
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25582977 cacacacacactcacttgaaatttg-ttgttgggttgaata 25582938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 15678 - 15893
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15678 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgagatttaag 15777  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15778 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgataaaactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 15877  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  15878 gtgggggagtttgatg 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 27046874 - 27047089
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046874 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 27046973  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27046974 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgatataactgttggagctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 27047073  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  27047074 gtgggggagtttgatg 27047089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17094816 - 17094601
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17094816 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaagatttcaagaaatgcttaagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 17094717  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17094716 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatttgaattaactattgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 17094617  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  17094616 gtgggggagtttgatg 17094601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21798878 - 21798662
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21798878 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaaaatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21798779  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21798778 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21798679  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  21798678 tatgggggagtttgatg 21798662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 20237456 - 20237671
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20237456 tggacttcacacaaacactcacttaaagcttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtggttagtgtacatttgggatttaag 20237555  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20237556 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattatttgtgctactgcatttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 20237655  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  20237656 gtgggggagtttgatg 20237671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 8653126 - 8653327
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||||| |||||||    
T  8653126 acacacacacacttagaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcctttgagga 8653225  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| |||    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8653226 gacatgagttttgattgaattgtcatat-ataatcttgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggag 8653324  T
Q  217 ttt 219  Q
    |||    
T  8653325 ttt 8653327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 52938830 - 52938621
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  52938830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 52938731  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52938730 ggagacatgtgatttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgattatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 52938631  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  52938630 gagtttgatg 52938621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 3989944 - 3990154
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||||| |||    
T  3989944 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgcactctttgaaataaaagcctttg 3990043  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  3990044 acgagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggg 3990143  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  3990144 ggagtttgatg 3990154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 223
Target Start/End: Original strand, 19364043 - 19364244
Alignment:
Q  22 acactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagaca 121  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| |||||||||||    
T  19364043 acactcacttagaactggattgttgggttgaataaagactacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttgaggagaca 19364142  T
Q  122 tgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    || | ||| ||||||||||||||||  ||     ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19364143 tgagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctgctatgtctatgcattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 19364242  T
Q  222 tg 223  Q
    ||    
T  19364243 tg 19364244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 14070632 - 14070720
Alignment:
Q  135 aattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14070632 aattgtcatttgatttaactgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 14070720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19875702 - 19875648
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagttt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19875702 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagttt 19875648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21784535 - 21784472
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21784535 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagtgtgggggagtttgatg 21784472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 4027832 - 4027895
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4027832 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagggtgggggagtttgatg 4027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8947578 - 8947515
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8947578 tgctgctatgtctatgtcttttccttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8947515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16382631 - 16382578
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttg 220  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16382631 atgtttattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttg 16382578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 21784677 - 21784598
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  21784677 acacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataaagttcacaagaaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 21784598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 21382093 - 21382309
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382093 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21382192  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattg-aattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21382193 cccttgaggagacatgtgctttaattgaaattgtcatttgatataactgttagtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 21382292  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  21382293 tatgggggagtttgatg 21382309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21099009 - 21098794
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21099009 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21098910  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21098909 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21098810  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  21098809 gtgggggagtttgatg 21098794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21104330 - 21104115
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21104330 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcattgggttgaataaaaatgacaagaaatgcttgaatttgtgattagtgtacatttgggatttaag 21104231  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21104230 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgataaaattgtttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 21104131  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  21104130 gtgggggagtttgatg 21104115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 23911441 - 23911655
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23911441 tggacttcacacacacactcacttgaaatttgatc-ttgggttgaataaaaattacaagaaatgtttaagtttgtgattagtgtacatctgggatttaag 23911539  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23911540 cccttgaggagacatgtgctttaatcgaattgtcatttgatataactattggtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagt 23911639  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  23911640 atgggggagtttgatg 23911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 8314467 - 8314683
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8314467 tggacttcacacacacactcacttaaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 8314566  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8314567 cccttgaggagacatgtgctttaaatttaattgtcatttgatttaaatgttgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8314666  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | |||||||||||||||    
T  8314667 tatgggggagtttgatg 8314683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 8323062 - 8322846
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacattt-gggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8323062 tggacttcacacacacactcacttgaaacttgatcgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacattttgggatttaa 8322963  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8322962 gcccttgaggagacatgtgctttaattaatttgtcatttgatttaactgtcgatgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaag 8322863  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    | || ||||||||||||    
T  8322862 tatgagggagtttgatg 8322846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21843733 - 21843524
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||    
T  21843733 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattactgtacgcttgaaatttaagcccttga 21843634  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgt-ttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21843633 ggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 21843534  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  21843533 gagtttgatg 21843524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21940206 - 21939996
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  21940206 cacacacacactcacttcagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaatgaaagcctttg 21940107  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21940106 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 21940007  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  21940006 ggagtttgatg 21939996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20039189 - 20038981
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  20039189 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatacttgagtttgtgattattgtacatttgaaattaaagcctttga 20039090  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
     |||||||||   ||| || || |||||| ||||     ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20039089 agagacatgtatcttagttaaaatgtcatgtgatgatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 20038990  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  20038989 agtttgatg 20038981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 23454945 - 23455154
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||||| |||||    
T  23454945 acacacacactcacttgaaacttgattgttggattgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaatgaaagcctttgag 23455044  T
Q  116 gagacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgt-gggg 213  Q
    |||||||    ||| |||||||||||||||||  |    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23455045 gagacataaattttcaattgaattgtcatatgtgagtcttgtttatgctactatgtttatgccttttgctcgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 23455144  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  23455145 gagtttgatg 23455154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16418830 - 16418620
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  16418830 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 16418731  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||     ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16418730 aggagacatgtgttttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgagaacaagcaaagattcaagtgtggg 16418631  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  16418630 ggagtttgatg 16418620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 17620755 - 17620961
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||| ||||| |||||    
T  17620755 acacacacactcacttgaaacttgattgttgg-ttgaaaaaggattacaaagaatgcttgagtttatgattagggtacacttgaaattaaagcctttgag 17620853  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    ||    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17620854 gagacatgtgttttaattaaattgtcatgaagtaatcttgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaattcaagtgtggggga 17620953  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  17620954 gtttgatg 17620961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 223
Target Start/End: Original strand, 24034049 - 24034230
Alignment:
Q  44 ttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgcttt-aattgaattgtca 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||  ||| ||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  24034049 ttgggttgaataaagattacaagaaatgcttgagtttgtgatcagtgtacgcttgaaattaaagcctttgaggagacataagttttcaattgaattgtca 24034148  T
Q  143 tatgatataact-gtttgt-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||  || | || |||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034149 tatatta-atctcgtttattgctactatgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 24034230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14352378 - 14352181
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||  |||  ||  |||||   |||    
T  14352378 acacacacactcacttgagacttgattgttgggttgaataaagattacaaagaatgcttgagttagtaattagtgtacgcttgaaataaaagcctcggag 14352279  T
Q  116 gagacatgtgctttaa-ttgaattgtcatatgatataac-tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||| || || | ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14352278 gagacatgagttttaattttaattgtcatataat-tatcttgtttatgctaccatgtttatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 14352181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 223
Target Start/End: Original strand, 21538573 - 21538765
Alignment:
Q  34 aacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgat--tagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||  ||||||||  |||  ||| ||| | ||||||||||||  | |||||    
T  21538573 aacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaaccctggagtttgtgattatagtgtacgattgaaattaaagtctttgaggagacataagttttaa 21538672  T
Q  132 ttgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  21538673 ttgaattgtcatatgataatcttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaaaatttaagtgtgggggattttgatg 21538765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 223
Target Start/End: Original strand, 20712537 - 20712649
Alignment:
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtg 210  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  20712537 tgaggagacatgtgctttgattaaattgtcatatgataatgttgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagatttaagtgta 20712636  T
Q  211 ggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||    
T  20712637 ggggagtttgatg 20712649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 84
Target Start/End: Original strand, 20712470 - 20712539
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtga 84  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  20712470 cacacacacactcatttgagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgattgagtttgtga 20712539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11347009 - 11346953
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11347009 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 11346953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 19767684 - 19767740
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19767684 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 19767740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 22370102 - 22370158
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370102 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22370158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 20002279 - 20002330
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002279 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 20002330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22033611 - 22033555
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033611 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22033555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22099711 - 22099655
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099711 atgtctatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22099655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 22102552 - 22102608
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22102552 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtaggggagtttgatg 22102608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 21831181 - 21831232
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831181 tatgtcttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 21831232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 22817755 - 22817806
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22817755 tatgtcttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22817806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18573025 - 18572977
Alignment:
Q  174 tgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18573025 tgccttttgcttaaggacaagaaaaaattcaagtatgggggagtttgat 18572977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 22102403 - 22102482
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22102403 cacacacgcactcacttgaaatttg-ttgtcgggttgaataagt-ttacaaggaatgcttgaagttgtgattagtgtacatt 22102482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11347158 - 11347079
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  11347158 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 11347079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 22369953 - 22370032
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  22369953 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 22370032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 1038 - 1253
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1038 tggacttcacacatacactcacttgaaacttgattgttgggtagaataaagatttcaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 1137  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  1138 cccttgaggagacatgtgctttaattaaattgtcatttgatttaactgctgatgctactacgtttatgccttttgcttgaggaaaagcaaagattcaagt 1237  T
Q  208 gtgggggagtttgatg 223  Q
     |||||||||||||||    
T  1238 atgggggagtttgatg 1253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 3461 - 3524
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3461 tgctactacgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgatg 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 831 - 615
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaa-cttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  831 tggacttcacacacacactcacttaaaaacttgatcgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaa 732  T
Q  107 gcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaag 206  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  731 tcccttgaggagacttgtgctttaatcgaattgtgatttgataaaattgtttgtgctaccatatttatgctttttgctttaggacaagcaaagattcaag 632  T
Q  207 tgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||    
T  631 tgtgggggagtttgatg 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 220 - 428
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||    
T  220 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaagaaatgcttcagtttgtgattagtgtacgctttaaattaaagcccttga 319  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  320 ggagacatgtattttaattaaattgtcatacgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggg 419  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  420 agtttgatg 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3058 - 2852
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||    
T  3058 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacacatgaaattaaagcccttaagga 2959  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggag 216  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  2958 gacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgtgggag 2859  T
Q  217 tttgatg 223  Q
    |||||||    
T  2858 tttgatg 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 252079 - 251870
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||| ||||||||||    
T  252079 cacacacacactcacttggaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgactagtgtacgcttgaaattaaagcccttga 251980  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  251979 ggagacatgtgttttaattaaattgtcaaatgataatattgttttgtgctaccatgtttatgccatttgcttgaggacaagtaaagattcaagtgtgggg 251880  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  251879 gagtttgatg 251870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Original strand, 11064 - 11264
Alignment:
Q  23 cactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacat 122  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||||    
T  11064 cactcacttgaaacttaatttttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacgcttaaaattaaagcccttgaggagacat 11163  T
Q  123 gtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11164 gtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 11263  T
Q  223 g 223  Q
    |    
T  11264 g 11264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2287
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  2496 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaagattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactcttgaaataaaagcctttga 2397  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactg-tttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2396 ggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtatgggg 2297  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  2296 gagtttgatg 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 831 - 1041
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac-atttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  831 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttg 930  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgat-ataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  931 aggagacatgtgctttaatttaattgtcatatgataatgttaatttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1030  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  1031 ggagtttgatg 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14869 - 14662
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||  ||| |||||||||||    
T  14869 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggtttcataaggtttacaagaaatgcttgagtttatgaataatgtacgcttgaaattaaagcccttgag 14770  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  14769 gagacatgtgttttaattaaattttcatatgataatattgtttatgctaccatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtatggggga 14670  T
Q  216 gtttgatg 223  Q
    ||||||||    
T  14669 gtttgatg 14662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Original strand, 482 - 687
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||  |||||||    
T  482 acacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaataaagattacaaaaaatggttgagtttgtgattagtgtacacttgaaataaaagcttttgagga 581  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagt 217  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||||    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  582 gacattaattttaattgaattgtcatatgataatcttgtttatgctgctatgtttatacattttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagt 681  T
Q  218 ttgatg 223  Q
    ||||||    
T  682 ttgatg 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 120954 - 121162
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgag 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||    
T  120954 acacacacacacacttggaacttggttgttgggttgaataaggtttacaagaaatacttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaattaaagcccttgag 121053  T
Q  116 gagacatgtgctttaattgaattgtcatat-gatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||  | |||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  121054 gagacatgtgtttcaattaaattgtcatataaaaatattattttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggggg 121153  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  121154 agtttgatg 121162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 7941 - 8149
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||    
T  7941 cacacacacactcatttgaaacttgattgttgggttgaaaaaggattacaagaaatgctcgagtttgtgattagtgtacatttgaaattaaagcctttga 8040  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
     |||||||||| |||| || || |||||| | ||     ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  8041 agagacatgtgttttagttaaaatgtcatgtaatgatcttgtttatgctaccgtgtttatgccttttgcttgaagacaagcaaagattcaagtgtggggg 8140  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  8141 agtttgatg 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 1108 - 1318
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||||| |||    
T  1108 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattaatgtactctttgaaataaaagcctttg 1207  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||    | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1208 aggggacatgtgccttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 1307  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  1308 ggagtttgatg 1318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 58838 - 58628
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 113  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  58838 cacacacacactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatggttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 58739  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    | |||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58738 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 58639  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  58638 ggagtttgatg 58628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 97936 - 97726
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttg 113  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||  |||    
T  97936 cacacacatactcacttaagacttgattgttgggttgaaaaaggattataagaaatgcttgagtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcatttg 97837  T
Q  114 aggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    | |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  97836 aggagacatgtgctttaatgtaattgtcatatgataatgttattttatgctaccatgtttatgccttttgctttaggacaagcaaagattcaagtgtggg 97737  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  97736 ggagtttgatg 97726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 510
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||| ||||    
T  718 cacacacacactcacttagaacttgattgttgggttgaataaaggttacaagaaatgtttgagtttgtgattagtgtacgcttgaaataaaagcctttga 619  T
Q  115 ggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggg 214  Q
    ||||| ||  | ||| ||||||||||||||||  ||     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    
T  618 ggagatataagttttgattgaattgtcatatgtaatcttgttttatgctactatatttatgccttttgcttgaggacaaacaaagattcaagtatggggg 519  T
Q  215 agtttgatg 223  Q
    |||||||||    
T  518 agtttgatg 510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 164562 - 164403
Alignment:
Q  65 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgttt-gtgct 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||   ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||||| |||||    
T  164562 agaaatgcttgagtttgtgattagtgtgcgctttaaattgaagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgttttgtgct 164463  T
Q  164 actatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  164462 accatgtttatgccttttgcttgaggataagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 164403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 222
Target Start/End: Original strand, 172248 - 172316
Alignment:
Q  154 tgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  172248 tgtttatgctgctatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgat 172316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 161995 - 162058
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  161995 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 162058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13002
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagga 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||  ||  ||||| ||||| |    
T  13207 acacgcactcacttgaaacttgattcttgggtttaataaagattacaagaaatgcttgagtatggtattagtgtacgcatgaaataaaagcctttgagaa 13108  T
Q  118 gacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagt 217  Q
    |||||  | |||||||||||| | ||||||||    || || ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13107 gacataagttttaattgaattattatatgataatcttggttatgctactatgtttatgcctcttacttgaggacaagcaaagattcaagtgtggcggagt 13008  T
Q  218 ttgatg 223  Q
    ||||||    
T  13007 ttgatg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10325 - 10206
Alignment:
Q  105 aagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgt-ttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattc 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10325 aagcccttgaggagacatgtgttttaattaaattgtcatatgataatattgtcttgtgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaagattc 10226  T
Q  204 aagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10225 aagtttgggggagtttgatg 10206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35307 - 35104
Alignment:
Q  18 acacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaa------ttacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagccct 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||      |||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||||| |    
T  35307 acacacactcatttgaaacttcattgttgggttgaaaaaaaaaaaagattaccaagaatgcttgagtttgtgattactgtacacttgaaattaaagcctt 35208  T
Q  112 tgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgg 211  Q
      |||||||||||| |||| |||||||||||| |        ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35207 aaaggagacatgtgttttagttgaattgtcatct--------tgtttatgctaccatgtttatgccttttgcttgaggacaaggaaagattcaagtgtgg 35116  T
Q  212 gggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||    
T  35115 gggagtttgatg 35104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Original strand, 8720 - 8869
Alignment:
Q  76 agtttgtgattagtgtaca-tttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgttta 173  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||  |||||| |||||||    
T  8720 agtttgtgattagtgtactctttgaaataaaagcctttgaggagacatgtgctttgatttaattgtcatatgataatgttgttttatgctaccatgttta 8819  T
Q  174 tgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8820 tgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 8869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Original strand, 12450 - 12609
Alignment:
Q  62 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgt- 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||   |||||| |     
T  12450 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttatt 12548  T
Q  161 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12549 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 12609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 232948 - 232789
Alignment:
Q  62 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgaggagacatgtgctttaattgaattgtcatatgatataactgtttgt- 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| | |||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||   |||||| |     
T  232948 acaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtatgcttgaaataaaagtctttgaggagacatgaattttgattgaattgtcatat-ataatcctgtttatt 232850  T
Q  161 gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttga 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  232849 gctactatgtttatgcctttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttga 232789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 37722 - 37922
Alignment:
Q  17 cacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttgagg 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |  |||| ||| |||||  |||||||||||||||| |||  ||| ||||| ||||||    
T  37722 cacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaataggt-tcgcaaggaatacttgatgttgtgattagtgtacacttgaaatt-aagcctttgagg 37818  T
Q  117 agacatgtgcttt-aattgaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggggga 215  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||||||||  ||    ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37819 agacataagattttaattgaattgtcatattttaattttgtttatgttgctatgtttatggcttttgcttgagggcaagaaaagattcaagtgtggggga 37918  T
Q  216 gttt 219  Q
    ||||    
T  37919 gttt 37922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 5090 - 5295
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||  | | | || || | ||    
T  5090 cacacacacactcacttgagactt-attgttgggttgaataggt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt--gaaatgaaaccttaga 5185  T
Q  115 ggagacatgtgctttaatt-gaattgtcatatgatataactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggg 213  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||| |||   | ||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5186 ggagacataagcttttatttgaattgtcatatgttatcttttttattgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggg 5285  T
Q  214 gagtttgatg 223  Q
    ||||||||||    
T  5286 gagtttgatg 5295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 38610 - 38508
Alignment:
Q  122 tgtgctttaattgaattgtcatatgata-taactgtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttg 220  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38610 tgtgttttaattaaattgtcatatgataatatttttttgtgctaccatgtttatgctttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttg 38511  T
Q  221 atg 223  Q
    |||    
T  38510 atg 38508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38679 - 38625
Alignment:
Q  39 gattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtac 93  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38679 gattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgtgattaatgtac 38625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1095 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1095
Description:

Target: scaffold1095; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Original strand, 2859 - 2926
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  2859 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaggtttacaagaaatgcttgagtttgt 2926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 223
Target Start/End: Original strand, 2612 - 2818
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||  | | | || || |  |    
T  2612 cacacacacactcacttaagacatg-ttgttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt--gaaatgaaaccttgaa 2708  T
Q  115 ggagacatgtgctttaatt-gaattgtcatatgatataactgtttgt-gctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||  || | || ||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2709 ggagacataagcttttatttgaattgtcatatatta-atctttttgttgctgccatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 2807  T
Q  213 ggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||    
T  2808 ggagtttgatg 2818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 42237 - 42300
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42237 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 42300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 42095 - 42174
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  42095 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 42174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 50569 - 50506
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50569 tgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 50506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 50711 - 50632
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  50711 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-tcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 50632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 223
Target Start/End: Original strand, 912 - 970
Alignment:
Q  165 ctatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 ctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1225 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1225
Description:

Target: scaffold1225; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Original strand, 1688 - 1902
Alignment:
Q  8 tggacatcacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaag 107  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  | | ||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||  ||  ||     
T  1688 tggacttcacacacacacttacttgaaacttg-ttgttggattgaatagga-tcacaaggaatgcttgaagttatgattagtgtacacttgaaataaaa- 1784  T
Q  108 cccttgaggagacatgtgc-tttaattgaattgtcatatgatataact--gtttgtgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattca 204  Q
    || ||||||||||||  |  |||||| | ||||||||||  || | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  1785 cctttgaggagacataagtatttaatcgtattgtcatatatta-atcttggtttatgctgctatatttatgccttttgcttgagaacaatcaaagattca 1883  T
Q  205 agtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1884 agtgtgggggagtttgatg 1902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 12743 - 12794
Alignment:
Q  172 tatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12743 tatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 12794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22360 - 22159
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatttgggatttaagcccttga 114  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||   ||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||  | | | || || |  |    
T  22360 cacacacacactcacttaagacttg-ttgttgggttgaataagt-ttacaaagaatacttgaagttgtgattagtgtacatt--gaaataaaaccttaaa 22265  T
Q  115 ggagacatgtgc-tttaattgaattgtcatatgatataactgtttg-tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtggg 212  Q
    || |||||  || |||| |||||||||||||| ||  | || |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22264 ggggacataagcttttacttgaattgtcatat-attaatctttttgttgctgctatgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtggg 22166  T
Q  213 ggagttt 219  Q
    |||||||    
T  22165 ggagttt 22159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Original strand, 10720 - 10776
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10720 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattaaagtgtgggggagtttgatg 10776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 54905 - 54849
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54905 atgtctatgccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagcgtgggggagtttgatg 54849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 37806 - 37743
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37806 tgctgctatgtctattccttttgcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggaatttgatg 37743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 37948 - 37869
Alignment:
Q  16 acacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaataaaaattacaagaaatgcttgagtttgtgattagtgtacatt 96  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  37948 acacacacactcacttaagacttgat-gttgggttgaataaagttcacaaggaatacttgaagttgtgattagtgtacatt 37869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1248
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgat 222  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1193 atgtttatgccttttgcttgtggacaagcaaagattcaagtatgggggagtttgat 1248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Original strand, 1041 - 1080
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1041 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 1080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Original strand, 22756 - 22818
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22756 tgctgctatgtctatgccttt-gcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 22818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 72622 - 72572
Alignment:
Q  173 atgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  72622 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 72572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 84812 - 84762
Alignment:
Q  173 atgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  84812 atgccttttgcttgaggaaaagtaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 84762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45291 - 45228
Alignment:
Q  160 tgctactatgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45291 tgctgctatgtctatgtcttttgcttgagaacaagcaaagattcaggtgtgggggagtttgatg 45228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 223
Target Start/End: Original strand, 18218 - 18263
Alignment:
Q  178 ttttgcttgaggacaagaaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18218 tttttcttgaggacaagcaaagattcaagtgtgggggagtttgatg 18263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 5869 - 5830
Alignment:
Q  15 cacacacacactcacttgaaacttgattgttgggttgaata 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5869 cacacacacactcacttgaaacttg-ttgttgggttgaata 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 83214 - 83174
Alignment:
Q  167 atgtttatgccttttgcttgaggacaagaaaagattcaagt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  83214 atgtttatgccttttgcttgaggacaagcaaatattcaagt 83174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University