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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9869_high_9 (Length: 430)

Name: NF9869_high_9
Description: NF9869
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9869_high_9
NF9869_high_9
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (18-192)||(26071040-26071213)
chr4 (17-128)||(24221783-24221894)
chr4 (17-128)||(23185418-23185529)
chr4 (17-128)||(26688362-26688473)
chr4 (18-128)||(23722888-23722998)
chr4 (18-128)||(27925732-27925842)
chr4 (18-128)||(42547054-42547165)
chr4 (17-114)||(16822108-16822204)
chr4 (17-128)||(30543674-30543784)
chr4 (17-128)||(39068571-39068682)
chr4 (17-128)||(41477474-41477586)
chr4 (17-128)||(9958356-9958467)
chr4 (256-294)||(26071277-26071315)
chr4 (73-139)||(54578518-54578584)
chr4 (17-126)||(35668138-35668247)
chr4 (22-114)||(11818768-11818860)
chr4 (52-128)||(33615448-33615524)
chr4 (98-139)||(15329398-15329439)
chr4 (24-56)||(890978-891010)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (18-192)||(22342870-22343044)
chr8 (18-192)||(22354530-22354704)
chr8 (18-192)||(15004205-15004368)
chr8 (18-111)||(31628139-31628232)
chr8 (18-125)||(232566-232673)
chr8 (18-125)||(708977-709084)
chr8 (18-125)||(746189-746296)
chr8 (18-125)||(870084-870191)
chr8 (18-121)||(33365581-33365684)
chr8 (20-106)||(30233434-30233520)
chr8 (17-128)||(24617314-24617425)
chr8 (17-128)||(44172703-44172814)
chr8 (256-294)||(15004432-15004470)
chr8 (256-294)||(22342768-22342806)
chr8 (18-133)||(27822589-27822704)
chr8 (17-128)||(39330566-39330677)
chr8 (77-128)||(43799735-43799786)
chr8 (256-294)||(22354428-22354466)
chr8 (66-139)||(36700429-36700502)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (22-192)||(1672489-1672659)
chr3 (22-192)||(44269831-44270001)
chr3 (18-133)||(4773880-4773995)
chr3 (18-128)||(39084781-39084891)
chr3 (18-128)||(48432587-48432697)
chr3 (18-139)||(45222382-45222503)
chr3 (18-128)||(12025620-12025730)
chr3 (17-125)||(41237199-41237307)
chr3 (18-128)||(8262585-8262695)
chr3 (17-117)||(52965739-52965839)
chr3 (36-139)||(15042593-15042696)
chr3 (17-128)||(46552202-46552313)
chr3 (256-294)||(44270065-44270103)
chr3 (17-109)||(39069197-39069289)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (18-192)||(10461489-10461662)
chr7 (18-128)||(36107109-36107219)
chr7 (18-128)||(40210586-40210696)
chr7 (22-128)||(24954303-24954409)
chr7 (18-128)||(33439065-33439175)
chr7 (18-128)||(41986769-41986879)
chr7 (108-192)||(13071133-13071216)
chr7 (17-139)||(26624314-26624436)
chr7 (18-139)||(32538042-32538163)
chr7 (18-139)||(37633057-37633178)
chr7 (28-139)||(25981067-25981178)
chr7 (256-294)||(13071280-13071318)
chr7 (24-106)||(49105873-49105955)
chr7 (256-294)||(10461387-10461425)
chr7 (18-60)||(28363182-28363224)
chr7 (18-60)||(44959230-44959272)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (18-128)||(396892-397002)
[»] chr5 (10 HSPs)
chr5 (18-133)||(23928379-23928494)
chr5 (18-128)||(9889224-9889334)
chr5 (18-139)||(40484323-40484443)
chr5 (17-128)||(6011174-6011285)
chr5 (22-128)||(14633802-14633908)
chr5 (18-128)||(29289883-29289993)
chr5 (27-116)||(34696335-34696424)
chr5 (18-125)||(35667876-35667983)
chr5 (18-95)||(12854199-12854276)
chr5 (76-128)||(7945654-7945706)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (18-133)||(14795993-14796108)
chr1 (18-133)||(14804867-14804982)
chr1 (18-128)||(8059591-8059701)
chr1 (18-125)||(21969305-21969412)
chr1 (30-128)||(40710132-40710230)
chr1 (17-139)||(32829395-32829517)
chr1 (17-128)||(1246826-1246937)
chr1 (17-128)||(7145551-7145662)
chr1 (22-128)||(31199991-31200097)
chr1 (18-115)||(19584471-19584568)
chr1 (32-124)||(28250964-28251056)
chr1 (17-128)||(28881945-28882055)
chr1 (18-125)||(50050340-50050447)
chr1 (18-134)||(38036470-38036586)
chr1 (71-139)||(43312812-43312880)
chr1 (18-125)||(51250671-51250778)
chr1 (32-127)||(42666692-42666786)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (22-133)||(8769985-8770096)
chr6 (18-133)||(30125765-30125880)
chr6 (18-133)||(3100588-3100703)
chr6 (17-125)||(9605976-9606084)
chr6 (17-128)||(31261122-31261232)
chr6 (18-128)||(18999842-18999952)
chr6 (18-134)||(31834520-31834636)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (18-128)||(34899220-34899330)
chr2 (17-128)||(20565336-20565447)
chr2 (18-133)||(22416500-22416615)
chr2 (17-139)||(18765137-18765259)
chr2 (18-128)||(30357413-30357523)
chr2 (17-124)||(13369778-13369885)
chr2 (17-128)||(36441306-36441417)
chr2 (18-128)||(8423835-8423945)
chr2 (22-139)||(17473675-17473790)
chr2 (17-128)||(17206233-17206344)
chr2 (18-60)||(8371573-8371615)
chr2 (24-133)||(37576024-37576133)
chr2 (18-62)||(10789089-10789133)
chr2 (18-128)||(27451672-27451782)
chr2 (33-128)||(20464466-20464561)
chr2 (22-126)||(18890616-18890720)
[»] scaffold0688 (2 HSPs)
scaffold0688 (17-128)||(2729-2840)
scaffold0688 (17-125)||(4399-4507)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 26071040 - 26071213
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26071040 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactattgggccggtttgggtaaacccactaatttccgggttggattgggttgggta 26071139  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26071140 gtgggttacccgaattaatttttgcttc-ttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 26071213  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24221894 - 24221783
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24221894 aatagggtactccggtttgagtgaggtaaaataaccactcgttatactattgggtaggtttgggcaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 24221795  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  24221794 aatgggttaccc 24221783  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23185529 - 23185418
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23185529 aataggatactccggtttgggtgaggtaaaataaccacatgttatactattgggcgggtttggacaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 23185430  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  23185429 aatgggttaccc 23185418  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 26688473 - 26688362
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| |||||  |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  26688473 aataggatactccggtttgagtgaggtaaaataaccacccgttatactattgggtgggtttgggcaaatccactaatttttgggttgggttggattgggt 26688374  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | | ||||||||    
T  26688373 aataggttaccc 26688362  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 23722888 - 23722998
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||| | ||||||  |||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  23722888 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgagcaaacccattaatttccggtttggtttgggttaggta 23722987  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  23722988 gtgggttaccc 23722998  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27925842 - 27925732
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||  |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27925842 atagggtacttcggtttgggttagttaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttggacaaactcactaattttcggtttggtttgggttgggta 27925743  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  27925742 gtgggttaccc 27925732  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 42547054 - 42547165
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccaccc-gttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||| |  ||||  |||||||| |||||| |||||||  || |||| |||||||||||    
T  42547054 atagggtactccggtttgggttagataaaatatccaccccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttctggtttggtttgggttgggt 42547153  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    ||||||||||||    
T  42547154 agtgggttaccc 42547165  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16822204 - 16822108
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||| |||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16822204 aatagggtactccggtttgggtgagg-aaaataaccacccgttatactattgggtgggtttggacaaacccactaatttttgggttgggttggattgg 16822108  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 30543674 - 30543784
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||| |||||  |||||||   |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30543674 aatagggtactccggtttggatgaggtaaaataaccatccgttatactattgggtgggtttggacgaaccc-ataatttttgggttgggttggattgggt 30543772  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  30543773 aatgggttaccc 30543784  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 39068682 - 39068571
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| |   ||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||    
T  39068682 aataaggttctccggtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatactattgagtgtgtttgggcaaacccactgagttttgggttgggttggattgggt 39068583  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  39068582 aatgggttaccc 39068571  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 41477474 - 41477586
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaact-gttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttggg 115  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||| |||  ||||   |||||||| ||| || |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  41477474 aatagggtactccgatttgggtaaggtaaaataaccacccgttatactatttggatgggtttgggcaaatccactaatttttgggttgtgttggattggg 41477573  T
Q  116 tagtgggttaccc 128  Q
    || ||||||||||    
T  41477574 taatgggttaccc 41477586  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 9958356 - 9958467
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||  || ||||   |||||||  |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  9958356 aatagggttcttcggtttcggtgaggtaaaataaccacccgttattctattggataggtttggacaaacccactaagttttgggttgggttggattgggt 9958455  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | || |||||||    
T  9958456 aatgagttaccc 9958467  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 26071277 - 26071315
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26071277 ctcaaaaagcgcatcatcttaaattagctaaagtcttgg 26071315  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 54578584 - 54578518
Alignment:
Q  73 ggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  54578584 ggtttgggcaaacccactagttttcggtttggtttgggttgggtagtgggttagccaaattattttt 54578518  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 35668138 - 35668247
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||   |||  |||| ||| |||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||    
T  35668138 aatagggtactccagtttaggtgaggtaaaataatcactggttatactattgggtgggtttggacaaacccactaatttttgggttgggttgaattgcgt 35668237  T
Q  117 agtgggttac 126  Q
    | ||||||||    
T  35668238 aatgggttac 35668247  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11818860 - 11818768
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgg 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| | | |||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||    
T  11818860 ggtactctggtttgggtgaggtaaagtaatcacccgttacattattgggttggtttggataaacccactaatttccggtttggattgggttgg 11818768  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 128
Target Start/End: Original strand, 33615448 - 33615524
Alignment:
Q  52 cacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttaccc 128  Q
    ||||||||| ||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  33615448 cacccgttatactattgtgtgggtttgggaaaaccctctaatttttgggttgggttggattaggtaatgggttaccc 33615524  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 139
Target Start/End: Original strand, 15329398 - 15329439
Alignment:
Q  98 gggttgggttgggttgggtagtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15329398 gggttgggttgggttgagtagtgggttacccaaattattttt 15329439  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 24 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 891010 - 890978
Alignment:
Q  24 tactccggtttgggtgaggtaaaatgtccaccc 56  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  891010 tacttcggtttgggtgaggtaaaatgtccaccc 890978  T

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Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22343044 - 22342870
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22343044 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatatccacccgttaaactattgggccagtttgggtaagcccactaatttctgggttgggttgggttgggta 22342945  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22342944 gtgggttacccgaattaatttttgcttctttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 22342870  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22354704 - 22354530
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22354704 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatatccacccgttaaactattgggccagtttgggtaagcccactaatttctgggttgggttgggttgggta 22354605  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354604 gtgggttacccgaattaatttttgcttctttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 22354530  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 15004205 - 15004368
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |          ||||||||||    
T  15004205 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatatccacccgttaaactattgggctggtttgggtaaacccactaatttcc----------gggttgggta 15004294  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004295 gtgggttacccgaattaatttttgcttc-ttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 15004368  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 31628232 - 31628139
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggt 111  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31628232 ataggatactccagtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttgggttgggt 31628139  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 232673 - 232566
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  232673 atagagtactccggtttgggttaggttaaatatccacccgttaaattaatgggtgcatttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 232574  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  232573 gtgggtta 232566  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 709084 - 708977
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  709084 atagagtactccggtttgggttaggttaaatatccacccgttaaattaatgggtgcatttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 708985  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  708984 gtgggtta 708977  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 746296 - 746189
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  746296 atagagtactccggtttgggttaggttaaatatccacccgttaaattaatgggtgcatttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 746197  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  746196 gtgggtta 746189  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 870191 - 870084
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  ||||    |||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  870191 atagagtactccggtttgggttaggttaaatatccacccgttaaattaatgggtgcatttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 870092  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  870091 gtgggtta 870084  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33365684 - 33365581
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  33365684 atagggtactccggtttggattaggtaaaatattcacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacctactaatttccggtttggtttgggttgggta 33365585  T
Q  118 gtgg 121  Q
    ||||    
T  33365584 gtgg 33365581  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 30233520 - 30233434
Alignment:
Q  20 agggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||   || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30233520 agggtactccggttaaggtgaggtaaaataatcatccgttatactattggaccggtttgggtaaacccactaattttcggtttgggt 30233434  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 24617425 - 24617314
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||   |||| ||| ||| |  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24617425 aatagggtacttcggtttgggtgagataaaataaccatttgttatactattgagtgggtttgggcaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 24617326  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | |||| |||||    
T  24617325 aatgggctaccc 24617314  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 44172814 - 44172703
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||  ||||||||  | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  44172814 aataaggtacttccgtttgggtgaggtaaaataaccacttgttatactattgggtgggtttgggcgagcccactaatttttgggttgggttggattgggt 44172715  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  44172714 aatgggttaccc 44172703  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 15004432 - 15004470
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15004432 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 15004470  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22342806 - 22342768
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22342806 ctcaaaaagcgcaacatcttaaattagctaaagtcttgg 22342768  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 27822589 - 27822704
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||| | |  ||||  |||||||  |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||    
T  27822589 atagggtacttcagtttggttgagataaaatgtccacccattatattaatgggtgggtttggacaaacccactagttttcggtttggtttgggttggtta 27822688  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    || | |||||| ||||    
T  27822689 gtagattacccaaatt 27822704  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 39330566 - 39330677
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||  ||||| |||| ||| ||||   |||||||  |||||| |||||||| | ||||| |||| |||| |    
T  39330566 aatagggtactccgatttagatgaggtaaaataaccacctgttatactattggatgggtttggacaaacccactaatttttgtgttggattggattggat 39330665  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  39330666 aatgggttaccc 39330677  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 128
Target Start/End: Original strand, 43799735 - 43799786
Alignment:
Q  77 tgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttaccc 128  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43799735 tgggcaaacccactaatttttgggttgggttggattgggtaatgggttaccc 43799786  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22354466 - 22354428
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22354466 ctcaaaaagtgcatcatcttaaattagctaaagtcttgg 22354428  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 36700429 - 36700502
Alignment:
Q  66 ttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||  || |||||||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||    
T  36700429 ttgggctggtttgggcaaacccactaatttatggtttgggttgagttaggtagtgggttatccaaattattttt 36700502  T

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Target: chr3 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1672659 - 1672489
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1672659 ggtactccggtttgggtgagataaaatgtccatccgttaaactattgggccggtttgggtaaacccactaatttccgggttggattgggttgggtagtgg 1672560  T
Q  122 gttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672559 gttacccgaattaatttttgcttctttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 1672489  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 192
Target Start/End: Original strand, 44269831 - 44270001
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  44269831 ggtactccggtttgggtgagataaaatgtccacccgttaaactattggaccggtttgggtaaacccactaatttccgggttggattgggttgggtagtgg 44269930  T
Q  122 gttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44269931 gttacccgaattaatttttgcttttttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 44270001  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 4773880 - 4773995
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  4773880 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 4773979  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  4773980 gtgggttacccaaatt 4773995  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 39084781 - 39084891
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||   |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  39084781 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatggatgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 39084880  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  39084881 gtgggttaccc 39084891  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 48432587 - 48432697
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  48432587 ataggatactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggttttggttgggta 48432686  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  48432687 gtgggttaccc 48432697  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 45222382 - 45222503
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |  |||   |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |    
T  45222382 atagggtaccccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccattatattaatggatgggtttgggaaaacccactagttttcggtttggtttgggttgggca 45222481  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  45222482 gtgggttacccaaattattttt 45222503  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 12025620 - 12025730
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  12025620 atagggtactccggtttgggttaagtaaaatatacacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccagtttggtttgggttgggta 12025719  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  12025720 gtgggttaccc 12025730  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 41237307 - 41237199
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||  || | ||| |||||  |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41237307 aatagggtacttcgatttgggtgaggtaaaataaccacttgtcatactattgggtgggtttgggcaatcccactaatttttgggttgggttggattgggt 41237208  T
Q  117 agtgggtta 125  Q
    | |||||||    
T  41237207 aatgggtta 41237199  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 8262585 - 8262695
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||   || || ||| ||  ||| |  |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||    
T  8262585 atagggtgctccagtttgggtgaggtaaaataaacatccattataccattgtgttggtttgggcaaacccgttaatttctgggttgggttggattgggta 8262684  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
     ||||||||||    
T  8262685 atgggttaccc 8262695  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 52965839 - 52965739
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||  |||||||  |||||| ||  |||| | |||||||| | ||||||    
T  52965839 aatagggtactccgatttgggtgaggtaaaatacccacccgatatactattgggtgggtttggacaaacccactggtttttgagttgggttagattgggt 52965740  T
Q  117 a 117  Q
    |    
T  52965739 a 52965739  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 15042696 - 15042593
Alignment:
Q  36 ggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttacccgaattaa 135  Q
    |||||||||||||  ||| || ||| ||| ||| ||||||||||| |||||| || | ||  || |||| |||||||||||||||| |||||| |||||     
T  15042696 ggtgaggtaaaataaccatccattacactattgagccggtttgggcaaacccactgaattctggtttggattgggttgggtagtggtttacccaaattat 15042597  T
Q  136 tttt 139  Q
    ||||    
T  15042596 tttt 15042593  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 46552313 - 46552202
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||||||  ||| || ||| ||  |||||  |||||||  |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  46552313 aataaggtactctggtttgggtaaggtaaaataaccatccattataccattgggtgggtttggacaaaccaactaatttttgggttgggttggattgggt 46552214  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | |||| |||||    
T  46552213 aatgggataccc 46552202  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 44270065 - 44270103
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44270065 ctcaaaaagtgcatcatcttaaattagctaaagtcttgg 44270103  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 39069197 - 39069289
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgg 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||| ||| ||  ||||||| |||| | || ||||| ||| ||||||||    
T  39069197 aatagggtacttcggtttgggtgaggtaagataaccactcgttatactattgagcgagtttgggcaaactcactgatttttggggtgggttgg 39069289  T

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Target: chr7 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10461662 - 10461489
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10461662 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccatccgttaaactattgggccggtttgggtaaacccactaatttccgagttgggttgggttgggta 10461563  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10461562 gtgggttactcgaattaatttttgcttc-ttttttttgtagtattaaaccaaatgacaagtcaccataatttttt 10461489  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 36107109 - 36107219
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||    
T  36107109 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttggata 36107208  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  36107209 gtgggttaccc 36107219  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40210696 - 40210586
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40210696 atagggtactccggtttgggtttggtaaaatattcacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgggttgggta 40210597  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  40210596 gtgggttaccc 40210586  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 24954303 - 24954409
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  24954303 ggtactccggtttggattaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggtagtgg 24954402  T
Q  122 gttaccc 128  Q
    |||||||    
T  24954403 gttaccc 24954409  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33439175 - 33439065
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| || |||| ||| |||| |||| |||||||    
T  33439175 ataggatactccggtttgggtttggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactcatttccggtttggtttggattgggta 33439076  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  33439075 gtgggttaccc 33439065  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 41986769 - 41986879
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  41986769 ataggatactctagtttgggttaggtaaaatatccgcccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgagttgggta 41986868  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  41986869 gtgggttaccc 41986879  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 13071133 - 13071216
Alignment:
Q  108 gggttgggtagtgggttacccgaattaatttttgcttcnnnnnnnnngtagtattaaaccaaatgacaagtcatcataatttttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13071133 gggttgggtagtgggttacccgaattaatttttgcttc-ttttttttgcagtattaaaccaaattacaagtcatcataatttttt 13071216  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 26624314 - 26624436
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||   |||  |||| ||| |||||   |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||  |    
T  26624314 aatagggtacttcggtttggatgaggtaaaataatcacgggttatactattgggtgagtttgggtaaacccactaatttttgggttgggttggattgatt 26624413  T
Q  117 agtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    | |||||||||||| ||| ||||    
T  26624414 aatgggttacccgacttattttt 26624436  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 32538042 - 32538163
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |  ||||   ||||||  ||| || ||| ||||||| |||  || | |||||||    
T  32538042 atagggtactccggtttgagtgaggtaaaatgtccacccattatattaatgggtgagtttggacaaatccactagttttcggtttgttttagattgggta 32538141  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  32538142 gtgggttacccaaattaatttt 32538163  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37633178 - 37633057
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |  ||||   ||||||  |||||| ||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  37633178 atagggtattccggtttgggtgaggtagaatgtccacctattatattaatgggtgagtttggacaaacccactagttttcggtttggttttggttgggta 37633079  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  37633078 gtgggttacccaaattattttt 37633057  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Original strand, 25981067 - 25981178
Alignment:
Q  28 ccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttacc 127  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| |||| | | ||||| ||||||| | |||||| |||||||  || ||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  25981067 ccggtttgggtgaagtaaaataaccacctgttatattattgggtcggtttgagcaaacccactaatttctggtttgagttggattgggtggtgggttacc 25981166  T
Q  128 cgaattaatttt 139  Q
    | ||||| ||||    
T  25981167 caaattattttt 25981178  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Original strand, 13071280 - 13071318
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13071280 ctcaaaaagcgcaacatcttaaattagctaaagtcttgg 13071318  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 49105955 - 49105873
Alignment:
Q  24 tactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggt 106  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||  |||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  49105955 tactccagtttgggtgaggtaaaataaccaccagttatactattgggtgggtttgggcaaacccattaatttttgggttgggt 49105873  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10461425 - 10461387
Alignment:
Q  256 ctcaaaaagcgcagcatcttaaattagctaaagtcttgg 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  10461425 ctcaaaaagcgcaacatcttaaattagctagagtcttgg 10461387  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 28363182 - 28363224
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgtta 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28363182 ataggatactccggtttgggtgagataaaacgtccacccgtta 28363224  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Original strand, 44959230 - 44959272
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgtta 60  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44959230 ataggatactccggtttgggtgaggtaaaacgtccacctgtta 44959272  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 396892 - 397002
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  396892 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgggttgggta 396991  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  396992 gtgggttaccc 397002  T

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Target: chr5 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 10)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23928494 - 23928379
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23928494 atagggtattccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgggttgggta 23928395  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  23928394 gtgggttacccaaatt 23928379  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9889334 - 9889224
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  9889334 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 9889235  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  9889234 gtgggttaccc 9889224  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Original strand, 40484323 - 40484443
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||  |||||||| |||||  ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  40484323 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccatt-aattaatgggtgggtttgggcaaaccaactagttttcggtttggtttgggttgggta 40484421  T
Q  118 gtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  40484422 gtgggttacccaaattattttt 40484443  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 6011285 - 6011174
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||  |||||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6011285 aataaggtactttggtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatattattgggtgggtttgggcaaacctactaatttttgggttgggttggattgggt 6011186  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  6011185 aatgggttaccc 6011174  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 14633802 - 14633908
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |  ||||  ||| |||| ||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  14633802 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccatccattatattaatgggtgggtatgggcaaatccactaattttcggtttggtttgggttggatagtgg 14633901  T
Q  122 gttaccc 128  Q
     ||||||    
T  14633902 attaccc 14633908  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29289993 - 29289883
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||| | ||||||||||| |   |||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  29289993 atagagtactccggtttaggttagataaaatattcacccgttaaattaacgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgagttgggta 29289894  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  29289893 gtgggttaccc 29289883  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 116
Target Start/End: Original strand, 34696335 - 34696424
Alignment:
Q  27 tccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||  |||||||  |||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  34696335 tccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttatattaataggtgggtttggacaaacccactagtttccggtttgggttgggttgggt 34696424  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35667983 - 35667876
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| | |  ||||  ||| |||  |||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||     
T  35667983 atagagtactgcggtttgggtgaggtaaaatgttcatccgttatattactgggtgggtctggacaaacccactagttttcggtttggtttgggttgggtg 35667884  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  35667883 gtgggtta 35667876  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 95
Target Start/End: Original strand, 12854199 - 12854276
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattt 95  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| || ||  | |||||| ||||||||||||||    
T  12854199 ataggatactccggtttaggtgaggtaaaataaccacccgttatactatttggtggatttgggcaaacccgctaattt 12854276  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7945706 - 7945654
Alignment:
Q  76 ttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttaccc 128  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7945706 ttgggcaaacccactagtttttgggttgggttggattgggtagtgggttaccc 7945654  T

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Target: chr1 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14796108 - 14795993
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  14796108 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 14796009  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14796008 gtgggttacccaaatt 14795993  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14804982 - 14804867
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  14804982 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 14804883  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14804882 gtgggttacccaaatt 14804867  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8059701 - 8059591
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||    
T  8059701 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttgatttgggttgggta 8059602  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  8059601 gtgggttaccc 8059591  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21969412 - 21969305
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| ||| || ||||||||||| |||| || |||||||||    
T  21969412 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaatccactaattttcggtttggtttcggttgggta 21969313  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  21969312 gtgggtta 21969305  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 40710230 - 40710132
Alignment:
Q  30 ggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttaccc 128  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40710230 ggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgggttgggtagtgggttaccc 40710132  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 32829395 - 32829517
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||  |||||||  ||| || |||||||| |||||||||| | ||||||    
T  32829395 aataggctactccggtttgggtgaggtaaaataaccactcgttatactattgggtgggtttggacaaatccactaatttttgggttgggttagattgggt 32829494  T
Q  117 agtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    | |||||||||||| ||| ||||    
T  32829495 aatgggttacccgacttattttt 32829517  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1246937 - 1246826
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||  | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1246937 aatagtgtacttcggtttaggtgagataaaataaccacccgttatactattgggtggatttgggcaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 1246838  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  1246837 aatgggttaccc 1246826  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 7145551 - 7145662
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||  | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7145551 aatagtgtacttcggtttaggtgagataaaataaccacccgttatactattgggtggatttgggcaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 7145650  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  7145651 aatgggttaccc 7145662  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 22 - 128
Target Start/End: Original strand, 31199991 - 31200097
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |  ||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  31199991 ggtattccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttagattaatgggtgggtttggacaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggtagtgg 31200090  T
Q  122 gttaccc 128  Q
    |||||||    
T  31200091 gttaccc 31200097  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 115
Target Start/End: Original strand, 19584471 - 19584568
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttggg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || |  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  19584471 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgagtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttggg 19584568  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 28250964 - 28251056
Alignment:
Q  32 tttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggtt 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||    
T  28250964 tttgggtgaggtaaaataaccacccgttatactattgggtgggtttgggcaaaccctctaatttttgggttgggttggattggataatgggtt 28251056  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 28881945 - 28882055
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||  |||||||| |||||| |||||  | |||||| ||||| ||||||    
T  28881945 aataggatactccggtttgggtgaggtaaaataatcacccg-tatactattgggtgggtttgggcaaacccactaatacttgggttgagttggattgggt 28882043  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  28882044 aatgggttaccc 28882055  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 50050447 - 50050340
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||   ||||||  |||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  50050447 ataggatattccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgagtttggacaaacccactaatttccggttttgtttgggttgggta 50050348  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  50050347 gtgggtta 50050340  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 38036586 - 38036470
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |  |||    ||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||     
T  38036586 ataggatacttcggtttgggtgaggtaaaacgtccacctgttatattaatggatgagtttgggcaaacccactagttttcggtttggtttgcgttgggtt 38036487  T
Q  118 gtgggttacccgaatta 134  Q
    ||||||||||| |||||    
T  38036486 gtgggttacccaaatta 38036470  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 139
Target Start/End: Original strand, 43312812 - 43312880
Alignment:
Q  71 ccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  43312812 ccggtttaggtaaacctactaattttttggttgggttggattgggtagtgggttacccaaattattttt 43312880  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 125
Target Start/End: Original strand, 51250671 - 51250778
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||||||| |  ||||   |||| || |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||    
T  51250671 atagggtactccgatttgggttaggtaaaatattcatccgttaaattaatgggtgagtttaggcaaacccactaattttcggtttggtttgggctggata 51250770  T
Q  118 gtgggtta 125  Q
    ||||||||    
T  51250771 gtgggtta 51250778  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 127
Target Start/End: Original strand, 42666692 - 42666786
Alignment:
Q  32 tttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttacc 127  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||   |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  42666692 tttgggtgaggtaaaataaccacc-gttataatattggatgggtttggacaaacccactaatttttgggttgggttggattgggtaatgggttacc 42666786  T

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Target: chr6 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 133
Target Start/End: Original strand, 8769985 - 8770096
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8769985 ggtactccggtttgggtttggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaattttcggtttggtttgggttgggtagtgg 8770084  T
Q  122 gttacccgaatt 133  Q
    ||||||| ||||    
T  8770085 gttacccaaatt 8770096  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30125880 - 30125765
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| |||||||  || |||| ||||||||||||    
T  30125880 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttctggtttggtttgggttgggta 30125781  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  30125780 gtgggttacccaaatt 30125765  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 3100588 - 3100703
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |  ||||  |||| ||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||    
T  3100588 atagggtactccggtttggattaggtaaaatatccacccgttaaattaatgggtgggttcgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttggata 3100687  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  3100688 gtgggttacccaaatt 3100703  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Original strand, 9605976 - 9606084
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||| ||| |||||  |||||||| ||| |  || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  9605976 aatagggtactcaggtttgggtgaggtaaaataaccatctgttatactattgggtgggtttgggcaaatcgactgatttttgggttgggttggattgggt 9606075  T
Q  117 agtgggtta 125  Q
    | |||||||    
T  9606076 aatgggtta 9606084  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 31261122 - 31261232
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||| |  |||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||| |    
T  31261122 aatatggtacttcggtttgggtaaggtaaa-taaccacccgttatactattgggtaggtttgggcaaacccacaaatttttgggttgggttggattggat 31261220  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  31261221 aatgggttaccc 31261232  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 18999952 - 18999842
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||   ||| |||| |||||| ||| | | ||| |||| ||| |||||||     
T  18999952 atagagtactctggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttatattattggatgggtctgggcaaacccactagtgtccggtttggtttgagttgggtg 18999853  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  18999852 gtgggttaccc 18999842  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 31834636 - 31834520
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||    ||||||| |||||| ||| ||| ||| || | || ||||||||     
T  31834636 ataggatactccgatttggatgaggtaaaatgtccatccgttaaattaatggatgagtttgggcaaacccactagtttccggtttagcttcggttgggtt 31834537  T
Q  118 gtgggttacccgaatta 134  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31834536 gtgggttacccaaatta 31834520  T

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Target: chr2 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 34899220 - 34899330
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  34899220 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccatccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 34899319  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  34899320 gtgggttaccc 34899330  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20565447 - 20565336
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  20565447 aatagggtactccagtttgggtggggtaaaataaccacccgttatactattgggtgggtttgggcaaacccactaatttttgggttaggttggattgggt 20565348  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  20565347 aatgggttaccc 20565336  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 133
Target Start/End: Original strand, 22416500 - 22416615
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |  ||||  |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22416500 atagggtactccggtttgggtttggtcaaatatccacccgttaaattaatgggtgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttgggta 22416599  T
Q  118 gtgggttacccgaatt 133  Q
    ||||||||||| ||||    
T  22416600 gtgggttacccaaatt 22416615  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 139
Target Start/End: Original strand, 18765137 - 18765259
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||  |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||| | ||| ||    
T  18765137 aatatggtactccggtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatactattgggtgggtttgggcaaacccactaatttttgggttgagttagattgagt 18765236  T
Q  117 agtgggttacccgaattaatttt 139  Q
    | |||||||||||| ||| ||||    
T  18765237 aatgggttacccgacttattttt 18765259  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30357523 - 30357413
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  |||   |||||||| |||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| |     
T  30357523 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaattaatggatgggtttgggcaaacccactaatttccggtttggtttgggttggatg 30357424  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  30357423 gtgggttaccc 30357413  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13369885 - 13369778
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||  ||||| ||| |||||  ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13369885 aatagggtacttcggtttgggtgaagtaaaataaccatacgttatactattgggtgggtttggataaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 13369786  T
Q  117 agtgggtt 124  Q
    | ||||||    
T  13369785 aatgggtt 13369778  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 36441306 - 36441417
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||  ||||| || |||| |  |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  36441306 aataaggtactccggtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatactattgggtgggtttaggcaaactcattaatttttaggttgggttggattgggt 36441405  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||| ||||||    
T  36441406 aatggattaccc 36441417  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 8423945 - 8423835
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  ||||  ||| |||  |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| |     
T  8423945 atagagtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccatccgttatattactgggtgggtctggacaaacccactagttttcggtttggtttgggttggatg 8423846  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    |||||||||||    
T  8423845 gtgggttaccc 8423835  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 139
Target Start/End: Original strand, 17473675 - 17473790
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |  ||||   |||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  17473675 ggtaccccggtttcggtgaggtaa--tgtccacccgttatattaatgggtgagtttgggtaaactcactaattttcggtttggtttggattgggtagtgg 17473772  T
Q  122 gttacccgaattaatttt 139  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  17473773 gttacccaaattattttt 17473790  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17206344 - 17206233
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   || |||||| ||| ||| |   ||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17206344 aatagagtactccagtttgggtgaggtaaaataatcatccgttatactattgagtgagtttgggcaaactcactaatttttgggttgggttggattgggt 17206245  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  17206244 aatgggttaccc 17206233  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 8371615 - 8371573
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgtta 60  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8371615 atagagtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgtta 8371573  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37576133 - 37576024
Alignment:
Q  24 tactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |  |||   |||||||  ||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  37576133 tactccggtttgggttaggtaaaatattcacccgttaaattaatggatgggtttggacaaacccattaatttccggtttggtttgggttgggtagtgggt 37576034  T
Q  124 tacccgaatt 133  Q
     |||| ||||    
T  37576033 cacccaaatt 37576024  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 10789133 - 10789089
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10789133 atagggtactccggtttgggttaggtaaaatatccacccgttaaa 10789089  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 27451782 - 27451672
Alignment:
Q  18 atagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggta 117  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |  ||||  |||||||| |||| | ||| ||||||| |||| ||| |||||||     
T  27451782 ataggatactccagtttgggtgaggtaaaacgtccacccattatattaatgggtgggtttgggaaaactcactagttttcggtttggtttgagttgggtt 27451683  T
Q  118 gtgggttaccc 128  Q
    ||| |||||||    
T  27451682 gtgagttaccc 27451672  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20464561 - 20464466
Alignment:
Q  33 ttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgggttaccc 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||  | |||||| ||| || ||||||||  ||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  20464561 ttgggtgaggtaaaataaccacccgttatactattgggtggatttgggaaaatccactaattttttggttgggttggattgagtaatgagttaccc 20464466  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 18890616 - 18890720
Alignment:
Q  22 ggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggtagtgg 121  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| || ||  | |||||  ||||||  |||||||  ||||||||||| ||| ||| |||    
T  18890616 ggtacttcagtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatactatttggtggatttggacaaacccattaatttttcggttgggttggattgagtaatgg 18890715  T
Q  122 gttac 126  Q
    |||||    
T  18890716 gttac 18890720  T

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Target: scaffold0688 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0688
Description:

Target: scaffold0688; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 2840 - 2729
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2840 aatagggtacttcagtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatattattgggtgggtttggacaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 2741  T
Q  117 agtgggttaccc 128  Q
    | ||||||||||    
T  2740 aatgggttaccc 2729  T

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Target: scaffold0688; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 4507 - 4399
Alignment:
Q  17 aatagggtactccggtttgggtgaggtaaaatgtccacccgttaaactgttgggccggtttgggtaaacccgctaattttcgggttgggttgggttgggt 116  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||||  |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  4507 aatagggtacttcagtttgggtgaggtaaaataaccacccgttatattattgggtgggtttggccaaacccactaatttttgggttgggttggattgggt 4408  T
Q  117 agtgggtta 125  Q
    | |||||||    
T  4407 aatgggtta 4399  T

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