View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9869_low_19 (Length: 407)

Name: NF9869_low_19
Description: NF9869
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9869_low_19
NF9869_low_19
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (64-392)||(33698617-33698946)
chr2 (64-392)||(33681560-33681889)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (64-392)||(14087750-14088078)
chr6 (63-392)||(14092282-14092611)
[»] chr7 (5 HSPs)
chr7 (62-394)||(9950086-9950418)
chr7 (64-392)||(9955077-9955404)
chr7 (64-376)||(32213563-32213868)
chr7 (146-255)||(32213147-32213256)
chr7 (305-376)||(32213273-32213343)
[»] chr1 (2 HSPs)
chr1 (67-392)||(46453879-46454204)
chr1 (64-392)||(46461277-46461604)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (76-392)||(24876511-24876826)
chr8 (64-392)||(24881013-24881323)
chr8 (348-392)||(24886348-24886392)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (304-392)||(9360932-9361019)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Original strand, 33698617 - 33698946
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698617 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 33698716  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaa-tttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698717 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaattttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagt 33698816  T
Q  263 tttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698817 tttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatt 33698916  T
Q  363 tattgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698917 tattgttctagctacattcgtgttcaactt 33698946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Original strand, 33681560 - 33681889
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33681560 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgaaaaggaatgtttactctaggataag 33681659  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaa-tttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagt 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681660 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaattttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagt 33681759  T
Q  263 tttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681760 tttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatt 33681859  T
Q  363 tattgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681860 tattgttctagctacattcgtgttcaactt 33681889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14088078 - 14087750
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14088078 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 14087979  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087978 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaattattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 14087879  T
Q  264 ttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaattt 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087878 ttgtaatttagatatcacaataaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaattt 14087779  T
Q  364 attgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14087778 attgttctaactacattcgtgttcaactt 14087750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 63 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14092611 - 14092282
Alignment:
Q  63 ctgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataa 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14092611 ctgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaaatgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataa 14092512  T
Q  163 gagtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagt 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14092511 gagtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattattataaaatgtttaggagt 14092412  T
Q  263 tttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatt 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14092411 tttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttatttattagaagttcatctttctttttagacattttttcatacaaatt 14092312  T
Q  363 tattgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14092311 tattgttctaactacattcgtgttcaactt 14092282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 5)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 62 - 394
Target Start/End: Original strand, 9950086 - 9950418
Alignment:
Q  62 tctgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggata 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9950086 tctgtgagaataagtgaaatatttagtgtttattaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgtaaaggaatgtttactctaggata 9950185  T
Q  162 agagtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaa-tttttagcatgtacattactataaaatgtttagga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9950186 agagtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaattttttagcatgtacattactataaaatgtttagga 9950285  T
Q  261 gttttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaa 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9950286 gttttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacatagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagaca-tttttcatacaaa 9950384  T
Q  361 tttattgttctagctacattcgtgttcaacttga 394  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9950385 tttattgttctaactacattcgtgttcaacttga 9950418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Original strand, 9955077 - 9955404
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  9955077 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttagtaaatatggaataatttaaagatggaaagtgcaaagaataatgtaaatgaatgtttactctaggatagg 9955176  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955177 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaaatattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 9955276  T
Q  264 ttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaattt 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9955277 ttgtaatttagatatcacaaaaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcacctttcttcttagaca-tttttcatacaaattt 9955375  T
Q  364 attgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955376 attgttctagctacattcgtgttcaactt 9955404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 64 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 32213868 - 32213563
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||| | |||||    
T  32213868 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatttaaagatggaaagtgtaaagaataatgcaaagg------tactctggaataag 32213775  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  32213774 agtaataataggaaggagagtacatcagagatttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagaatgtacgttactataaaatgttcagaagtt 32213675  T
Q  264 ttgtaatttagatatcacaac-aaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatt 362  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  32213674 ttgtattttagatatcacaacaaaaacaaatagagtgtaa-caagtgagtttattaattagaagtttatctttcttcttagaca-tttttcatacaagtt 32213577  T
Q  363 tattgttctagcta 376  Q
    ||||||||||||||    
T  32213576 tattgttctagcta 32213563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 255
Target Start/End: Original strand, 32213147 - 32213256
Alignment:
Q  146 tgtttactctaggataagagtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattact 245  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32213147 tgtttaccctggaataagagtaataataggaaggagggtacatcataggattataattgtttgaagtattgttcactcaatttttaggatgtacgttact 32213246  T
Q  246 ataaaatgtt 255  Q
    ||||||||||    
T  32213247 ataaaatgtt 32213256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 305 - 376
Target Start/End: Original strand, 32213273 - 32213343
Alignment:
Q  305 aagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatttattgttctagcta 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32213273 aagtgagtttattaattagaagttcatttttcttcttagaca-tttttcatacaagtttattgttctagcta 32213343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 67 - 392
Target Start/End: Original strand, 46453879 - 46454204
Alignment:
Q  67 gagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataagagt 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46453879 gagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatagaaagagcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataagagt 46453978  T
Q  167 aataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagttttg 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46453979 aataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattattataaaatgtttaggagttttg 46454078  T
Q  267 taatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatttatt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46454079 taatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttatttattagaagttcatctttctttttagacattttttcatacaaatttatt 46454178  T
Q  367 gttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  46454179 gttctaactacattcgtgttcaactt 46454204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Original strand, 46461277 - 46461604
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46461277 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 46461376  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  46461377 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaggtattgttcactcaatttttagcatgtaggttactataaaatgttaaggagtt 46461476  T
Q  264 ttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaattt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  46461477 ttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttacaca-tttttcatacaaattt 46461575  T
Q  364 attgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46461576 attgttctagctacattcatgttcaactt 46461604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 76 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24876826 - 24876511
Alignment:
Q  76 tgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataagagtaataatagg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24876826 tgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaaatgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataagagtaataatagg 24876727  T
Q  176 atggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagttttgtaatttaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24876726 atggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatatacattactataaaatgtttaggagttttgtaatttaga 24876627  T
Q  276 tatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatttattgttctagct 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24876626 tatcacaacaaaacaaatagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacat-ttttcatacaaatttattgttctagct 24876528  T
Q  376 acattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||||||||||    
T  24876527 acattcgtgttcaactt 24876511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 64 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24881323 - 24881013
Alignment:
Q  64 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataatgcaaaggaatgtttactctaggataag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24881323 tgtgagaataagtgaaatatttagtgtttactaaatatggaataatctaaagatggaaagtgcaaagaataacgcaaaggaatgtttactctaggataag 24881224  T
Q  164 agtaataataggatggagagtacatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattactataaaatgtttaggagtt 263  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
T  24881223 agtaataataggatggaaagtatatgagaggtttataattgtttgaagtattgttcactcaatttttagcatgtacattacta----------------- 24881141  T
Q  264 ttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaataaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaattt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24881140 ttgtaatttagatatcacaacaaaacaagtagagtgtaacaaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagaca-tttttcatacaaattt 24881042  T
Q  364 attgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24881041 attgttctagctacattcgtgttcaactt 24881013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 348 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24886392 - 24886348
Alignment:
Q  348 tttttcatacaaatttattgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24886392 tttttcatacaaatttattgttctagctacattcgtgttcaactt 24886348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 304 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9361019 - 9360932
Alignment:
Q  304 aaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacattttttcatacaaatttattgttctagctacattcgtgttcaactt 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9361019 aaagtgaatttattaattagaagttcatctttcttcttagacat-ttttcatacaaatttattgttctagctacattcatgttcaactt 9360932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University