View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9869_low_30 (Length: 316)

Name: NF9869_low_30
Description: NF9869
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9869_low_30
NF9869_low_30
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (1-309)||(18761981-18762285)
chr4 (1-309)||(24641349-24641655)
chr4 (1-309)||(27657682-27657988)
chr4 (5-248)||(451673-451912)
chr4 (5-248)||(30935995-30936234)
chr4 (1-248)||(10750068-10750310)
chr4 (1-248)||(10963837-10964079)
chr4 (5-248)||(21997513-21997752)
chr4 (1-163)||(24026938-24027100)
chr4 (1-220)||(55754728-55754943)
chr4 (1-248)||(36019433-36019675)
chr4 (1-161)||(17919294-17919454)
chr4 (1-163)||(19953855-19954017)
chr4 (3-163)||(40469494-40469654)
chr4 (1-159)||(16257112-16257270)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (5-309)||(9907076-9907377)
chr2 (1-309)||(27222421-27222726)
chr2 (1-309)||(35254033-35254339)
chr2 (1-309)||(35264642-35264948)
chr2 (1-248)||(11404357-11404604)
chr2 (1-248)||(40223396-40223639)
chr2 (1-163)||(29245393-29245555)
chr2 (1-163)||(43083835-43083997)
chr2 (1-248)||(43346462-43346705)
chr2 (5-248)||(9772247-9772489)
chr2 (1-161)||(24337276-24337436)
chr2 (1-248)||(10268046-10268288)
chr2 (1-248)||(10278623-10278865)
chr2 (19-248)||(34803301-34803526)
chr2 (1-158)||(4211085-4211242)
chr2 (1-159)||(22959215-22959373)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (1-309)||(46494-46799)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (1-309)||(38195790-38196095)
chr3 (5-309)||(12248345-12248646)
chr3 (1-309)||(39373119-39373425)
chr3 (1-309)||(28323713-28324019)
chr3 (5-294)||(23758314-23758600)
chr3 (1-248)||(13382165-13382409)
chr3 (1-248)||(13392759-13393003)
chr3 (1-240)||(8775794-8776028)
chr3 (1-248)||(4744819-4745062)
chr3 (1-248)||(5511775-5512018)
chr3 (1-248)||(5546517-5546760)
chr3 (1-163)||(37867664-37867826)
chr3 (1-163)||(37876182-37876344)
chr3 (1-162)||(16390437-16390598)
chr3 (1-238)||(18485129-18485361)
chr3 (1-248)||(5875158-5875401)
chr3 (1-162)||(19779600-19779761)
chr3 (1-161)||(6219550-6219710)
chr3 (1-248)||(24660997-24661239)
chr3 (1-248)||(24392968-24393211)
chr3 (1-248)||(5626873-5627115)
chr3 (1-248)||(12295716-12295958)
chr3 (1-248)||(41684756-41684998)
chr3 (1-248)||(16477358-16477603)
chr3 (1-165)||(6499876-6500040)
chr3 (1-165)||(9992806-9992970)
chr3 (79-299)||(10654248-10654462)
chr3 (1-159)||(20682629-20682787)
chr3 (1-159)||(14466815-14466973)
chr3 (1-184)||(29470680-29470863)
chr3 (1-159)||(13122889-13123047)
chr3 (5-83)||(10635936-10636014)
chr3 (233-300)||(6500112-6500180)
chr3 (229-300)||(9993040-9993112)
chr3 (269-300)||(37876014-37876045)
[»] chr7 (25 HSPs)
chr7 (5-309)||(466557-466857)
chr7 (1-309)||(11006233-11006540)
chr7 (1-240)||(1988657-1988891)
chr7 (1-164)||(21001968-21002131)
chr7 (1-163)||(5686723-5686885)
chr7 (1-163)||(9434427-9434589)
chr7 (1-248)||(11097117-11097364)
chr7 (1-240)||(42866947-42867181)
chr7 (1-163)||(6876803-6876965)
chr7 (1-165)||(19992976-19993140)
chr7 (5-248)||(2715201-2715440)
chr7 (1-248)||(9086337-9086580)
chr7 (1-248)||(26399656-26399899)
chr7 (1-248)||(8011647-8011892)
chr7 (1-248)||(24735834-24736076)
chr7 (1-248)||(26698689-26698932)
chr7 (1-248)||(40051664-40051906)
chr7 (1-161)||(22090372-22090532)
chr7 (1-159)||(4213219-4213377)
chr7 (1-159)||(17959635-17959793)
chr7 (1-157)||(8618587-8618743)
chr7 (1-159)||(168090-168248)
chr7 (1-160)||(15887206-15887365)
chr7 (269-301)||(9434279-9434311)
chr7 (269-301)||(21002246-21002278)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-309)||(13687510-13687816)
chr8 (1-248)||(15766093-15766339)
chr8 (1-248)||(15790230-15790476)
chr8 (1-240)||(36079044-36079278)
chr8 (1-248)||(209099-209342)
chr8 (1-248)||(722722-722965)
chr8 (1-248)||(29077811-29078054)
chr8 (1-248)||(32087215-32087458)
chr8 (1-248)||(36294030-36294273)
chr8 (1-248)||(242914-243156)
chr8 (1-248)||(796284-796526)
chr8 (1-163)||(19129938-19130100)
chr8 (1-163)||(26112468-26112630)
chr8 (1-248)||(3358151-3358393)
chr8 (1-248)||(9342236-9342478)
chr8 (73-309)||(44482164-44482398)
chr8 (1-159)||(6152292-6152450)
chr8 (1-160)||(19226134-19226293)
chr8 (1-160)||(30324174-30324333)
chr8 (1-105)||(44482387-44482491)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (1-309)||(35400055-35400361)
chr1 (1-309)||(35647580-35647886)
chr1 (1-309)||(3172601-3172908)
chr1 (1-163)||(4168401-4168563)
chr1 (1-163)||(19180085-19180247)
chr1 (1-240)||(47617449-47617682)
chr1 (1-240)||(5834278-5834512)
chr1 (5-248)||(12731552-12731791)
chr1 (5-248)||(12742145-12742384)
chr1 (1-248)||(51655387-51655629)
chr1 (1-248)||(38096126-38096371)
chr1 (1-248)||(7508343-7508585)
chr1 (1-248)||(36245943-36246185)
chr1 (1-161)||(5649269-5649429)
chr1 (1-161)||(21864824-21864984)
chr1 (1-184)||(153163-153346)
chr1 (1-159)||(12622689-12622847)
chr1 (256-309)||(5834228-5834280)
chr1 (256-309)||(47617680-47617734)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (1-164)||(9122025-9122188)
chr6 (1-248)||(17983630-17983877)
chr6 (1-163)||(25590360-25590522)
chr6 (1-248)||(12856018-12856261)
chr6 (1-248)||(3662413-3662656)
chr6 (1-248)||(25788797-25789040)
chr6 (1-248)||(26865861-26866104)
chr6 (1-248)||(26026489-26026731)
chr6 (1-248)||(27342797-27343039)
chr6 (1-248)||(27403537-27403779)
chr6 (1-165)||(27373931-27374095)
chr6 (1-165)||(27464284-27464448)
chr6 (1-248)||(12726329-12726576)
chr6 (1-248)||(16931463-16931706)
chr6 (73-309)||(4631895-4632129)
chr6 (73-309)||(27385421-27385655)
chr6 (73-309)||(27475834-27476068)
chr6 (73-309)||(32310648-32310882)
chr6 (1-159)||(34816667-34816825)
chr6 (1-157)||(32971370-32971526)
chr6 (75-163)||(7669378-7669466)
chr6 (1-105)||(27385644-27385748)
chr6 (1-105)||(27476057-27476161)
chr6 (1-160)||(12359298-12359457)
chr6 (1-105)||(4632118-4632222)
chr6 (1-105)||(32310555-32310659)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (3-309)||(3438-3748)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (1-163)||(5291675-5291837)
chr5 (1-248)||(9345574-9345817)
chr5 (1-248)||(14559085-14559328)
chr5 (1-248)||(23371543-23371786)
chr5 (1-248)||(23706390-23706633)
chr5 (1-163)||(27604554-27604716)
chr5 (1-248)||(30228473-30228716)
chr5 (1-248)||(36583526-36583769)
chr5 (1-248)||(42052402-42052645)
chr5 (1-240)||(35225096-35225330)
chr5 (1-248)||(24589081-24589324)
chr5 (1-248)||(15768374-15768619)
chr5 (1-165)||(31447518-31447682)
chr5 (1-248)||(6985332-6985574)
chr5 (1-248)||(14039631-14039873)
chr5 (1-248)||(22685037-22685279)
chr5 (1-248)||(23305880-23306122)
chr5 (1-248)||(27469595-27469837)
chr5 (1-248)||(37730975-37731222)
chr5 (5-248)||(15994310-15994549)
chr5 (1-248)||(24817869-24818111)
chr5 (1-248)||(39491915-39492157)
chr5 (1-248)||(17728510-17728757)
chr5 (1-248)||(31358127-31358374)
chr5 (1-161)||(40400001-40400161)
chr5 (1-220)||(17616653-17616868)
chr5 (1-248)||(27043234-27043479)
chr5 (1-162)||(39361282-39361443)
chr5 (1-248)||(14448055-14448296)
chr5 (5-248)||(31843003-31843242)
chr5 (73-309)||(36697301-36697535)
chr5 (1-159)||(22156086-22156244)
chr5 (18-177)||(1110282-1110441)
chr5 (1-177)||(20796655-20796831)
chr5 (1-105)||(36697208-36697312)
chr5 (256-309)||(35225328-35225380)
chr5 (269-301)||(23371828-23371860)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (1-248)||(32234-32477)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (1-163)||(267-429)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (73-309)||(2303-2537)
scaffold0454 (1-105)||(2526-2630)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-164)||(52486-52649)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (73-295)||(23666-23894)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-68)||(3552-3619)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (1-177)||(3253-3429)
scaffold0398 (86-177)||(11593-11684)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (73-177)||(2861-2965)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (93-160)||(23758-23825)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 18761981 - 18762285
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18761981 ctttctatccagaagaggaatacatcacatgggctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 18762080  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||| ||||||||||||    
T  18762081 tgaacaaatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttactcttgttctgtgta 18762175  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaa 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18762176 gttttatctttgtaccttaaccttcc-ttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctctattcttttaactctaatgatatttattgtttttaa 18762274  T
Q  299 tgtcctatgct 309  Q
    |||||||||||    
T  18762275 tgtcctatgct 18762285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24641655 - 24641349
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24641655 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 24641556  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  24641555 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 24641461  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24641460 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 24641361  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  24641360 atgtcatatgct 24641349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27657988 - 27657682
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27657988 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaaaaagaaaga 27657889  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  27657888 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 27657794  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27657793 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgttttta 27657694  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  27657693 atgtcatatgct 27657682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 451912 - 451673
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  451912 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 451813  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  451812 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 451717  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  451716 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 451673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 30935995 - 30936234
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  30935995 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 30936094  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  30936095 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 30936190  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30936191 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 30936234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 10750068 - 10750310
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10750068 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 10750167  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  10750168 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 10750263  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10750264 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 10750310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 10963837 - 10964079
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  10963837 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 10963936  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  10963937 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtctaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 10964032  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10964033 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 10964079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21997752 - 21997513
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  21997752 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 21997653  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  21997652 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 21997557  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21997556 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 21997513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 24026938 - 24027100
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24026938 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaagaagaagga 24027037  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24027038 tgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 24027100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 55754728 - 55754943
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  55754728 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 55754827  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  55754828 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 55754923  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaa 220  Q
    | | | ||||||||||||||    
T  55754924 gctgtgtctttgtatcttaa 55754943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36019675 - 36019433
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36019675 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 36019576  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  36019575 tgatcagatcaagtatctcttagaacaattgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 36019480  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36019479 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 36019433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17919454 - 17919294
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  17919454 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaagaagaagga 17919355  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17919354 tgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagaaagcccaaccttagttgcacacc 17919294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 19953855 - 19954017
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  19953855 ctttctacccagaagaatagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaataagggaaaaggatgagctactcaagaagaagga 19953954  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19953955 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagtccaaccttagttgcacaccca 19954017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 40469494 - 40469654
Alignment:
Q  3 ttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatg 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40469494 ttctatctagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaaggatg 40469593  T
Q  103 agcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40469594 agcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 40469654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16257270 - 16257112
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  16257270 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctactcaaaaagaagga 16257171  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16257170 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 16257112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Original strand, 9907076 - 9907377
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9907076 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaggatgat 9907175  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  9907176 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagtaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 9907271  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt-taaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcc 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  9907272 tgtctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttattgtttttaatgtct 9907371  T
Q  304 tatgct 309  Q
    ||||||    
T  9907372 tatgct 9907377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27222726 - 27222421
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27222726 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 27222627  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  27222626 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 27222532  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaa 298  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27222531 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttattgattttaa 27222432  T
Q  299 tgtcctatgct 309  Q
    |||| ||||||    
T  27222431 tgtcatatgct 27222421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35254339 - 35254033
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35254339 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 35254240  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  35254239 tgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 35254145  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35254144 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 35254045  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  35254044 atgtcatatgct 35254033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 35264948 - 35264642
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35264948 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 35264849  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  35264848 tgaacagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 35264754  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35264753 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 35264654  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  35264653 atgtcatatgct 35264642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 11404357 - 11404604
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11404357 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 11404456  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  11404457 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttacttttgttcttagta 11404556  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11404557 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 11404604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40223639 - 40223396
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40223639 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 40223540  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  40223539 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagta 40223444  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | ||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  40223443 gctttgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 40223396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 29245555 - 29245393
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29245555 ctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 29245456  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29245455 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 29245393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43083997 - 43083835
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43083997 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 43083898  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43083897 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 43083835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 43346705 - 43346462
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  43346705 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 43346606  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  43346605 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 43346510  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  43346509 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 43346462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 9772247 - 9772489
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  9772247 ctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 9772346  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||    
T  9772347 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgttt-ttttttacttttgttcttcgtagctt 9772445  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9772446 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 9772489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 24337276 - 24337436
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24337276 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctactcaagaagaagga 24337375  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24337376 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 24337436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10268288 - 10268046
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  10268288 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaaaaagga 10268189  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  10268188 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 10268093  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10268092 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 10268046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10278865 - 10278623
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| |||| |||||    
T  10278865 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaaaaagga 10278766  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  10278765 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 10278670  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  10278669 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 10278623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 248
Target Start/End: Original strand, 34803301 - 34803526
Alignment:
Q  19 agtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatct 118  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||||    
T  34803301 agtacatcacaagggttgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgaactacttcagaagaaggatgatcagatcaagtatct 34803400  T
Q  119 cttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatctt 218  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  34803401 cttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctttgtctttgtatctt 34803496  T
Q  219 aaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    || ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  34803497 aatctttctttatatatattatcattgttt 34803526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4211242 - 4211085
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4211242 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 4211143  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcac 158  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4211142 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcac 4211085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 22959215 - 22959373
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  22959215 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctactcaaaaagaagga 22959314  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22959315 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22959373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 46494 - 46799
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  46494 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 46593  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  46594 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 46688  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaa 298  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46689 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttattgattttaa 46788  T
Q  299 tgtcctatgct 309  Q
    |||| ||||||    
T  46789 tgtcatatgct 46799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 38196095 - 38195790
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38196095 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 38195996  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  38195995 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 38195901  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaa 298  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38195900 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttaactctaatgatatttattgattttaa 38195801  T
Q  299 tgtcctatgct 309  Q
    |||| ||||||    
T  38195800 tgtcatatgct 38195790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Original strand, 12248345 - 12248646
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12248345 ctatccagaagaagaatacatcacaagggctgctagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaggatgat 12248444  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  12248445 cagatcaagcatctcttagaacagttgtttaagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 12248540  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattg-ttttaaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcc 303  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  12248541 tatctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttttaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattgtttttaatgtct 12248640  T
Q  304 tatgct 309  Q
    ||||||    
T  12248641 tatgct 12248646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 39373425 - 39373119
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  39373425 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 39373326  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  39373325 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 39373231  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39373230 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 39373131  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  39373130 atgtcatatgct 39373119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 28323713 - 28324019
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28323713 ctttctatcctgaagaagagtatatctcaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 28323812  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  28323813 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 28323907  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28323908 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 28324007  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  28324008 atgtcatatgct 28324019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23758600 - 23758314
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  23758600 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaggatgat 23758501  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  23758500 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactaacttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 23758405  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt-taaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgttt 294  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23758404 tgtctttgtatcttaacctttatttataaatattatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattctgataatatttattgttt 23758314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 13382165 - 13382409
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13382165 ctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 13382264  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||    
T  13382265 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgt---ttttttacttttgttcttagta 13382361  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13382362 gctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 13382409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 13392759 - 13393003
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13392759 ctttctatccagaggaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 13392858  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||  |||    
T  13392859 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttgt---ttttttacttttgttcttagta 13392955  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13392956 gctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 13393003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8776028 - 8775794
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8776028 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 8775929  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  8775928 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 8775834  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  8775833 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 8775794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4745062 - 4744819
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4745062 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 4744963  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  4744962 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 4744867  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4744866 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 4744819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5512018 - 5511775
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5512018 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 5511919  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  5511918 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 5511823  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5511822 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5511775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5546517 - 5546760
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5546517 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 5546616  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  5546617 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 5546712  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5546713 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5546760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37867826 - 37867664
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37867826 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 37867727  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37867726 tgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37867664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37876344 - 37876182
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37876344 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 37876245  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876244 tgagcaaattaagtatcttttggaatagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 37876182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 16390437 - 16390598
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16390437 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcagccagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 16390536  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16390537 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 16390598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18485361 - 18485129
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18485361 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 18485262  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  18485261 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 18485167  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatatt 238  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18485166 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatatt 18485129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5875158 - 5875401
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5875158 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacaaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 5875257  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  5875258 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 5875353  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5875354 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 5875401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19779761 - 19779600
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19779761 ctttctatccagaagaagagtacatcataagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 19779662  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19779661 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 19779600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 6219550 - 6219710
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  6219550 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagcagaagga 6219649  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6219650 tgaacaaattaagtatctcttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 6219710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24661239 - 24660997
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24661239 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 24661140  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  24661139 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 24661044  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24661043 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 24660997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 24392968 - 24393211
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24392968 ctttctattcagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 24393067  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||  |||    
T  24393068 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgt---ttttttacttttgttcttcgta 24393164  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24393165 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 24393211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 5626873 - 5627115
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5626873 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 5626972  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  5626973 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 5627068  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  5627069 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 5627115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 12295716 - 12295958
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12295716 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 12295815  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  12295816 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 12295911  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12295912 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 12295958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41684998 - 41684756
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41684998 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 41684899  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  41684898 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 41684803  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  41684802 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 41684756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16477603 - 16477358
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16477603 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 16477504  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  16477503 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 16477408  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctt--tataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  16477407 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatatattatcattgttt 16477358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 6499876 - 6500040
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6499876 ctttctatcaagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 6499975  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 165  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499976 tgatcagatcaagtatcttttggaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 6500040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 9992806 - 9992970
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9992806 ctttctatcccgaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 9992905  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 165  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9992906 tgatcatatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 9992970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 299
Target Start/End: Original strand, 10654248 - 10654462
Alignment:
Q  79 atgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttc 178  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  10654248 atgagctacttcagaagaaagatgatcaaatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg---- 10654343  T
Q  179 ttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt-taaatcatatgttctattcttttaactct 277  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||  |||||||  |||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10654344 -tttttacttttgttctctgtagctttgcctttgta--ttatactttctttataaatatcatcattgtttataaatcatatgttctatacttttaattct 10654440  T
Q  278 gatgatatttattgtttttaat 299  Q
    ||| ||||||| ||||||||||    
T  10654441 gataatatttactgtttttaat 10654462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 20682629 - 20682787
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  20682629 ctttctatacagaagaagagtacatcacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaagaagaagga 20682728  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20682729 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 20682787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 14466973 - 14466815
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  14466973 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 14466874  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  14466873 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 14466815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 29470680 - 29470863
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| ||||||||||    
T  29470680 ctttctatccagaagatgaggacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaagga 29470779  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttctttttt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  29470780 tgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgtttatttttt 29470863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13123047 - 13122889
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| ||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  13123047 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcattctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 13122948  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13122947 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 13122889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 83
Target Start/End: Original strand, 10635936 - 10636014
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgag 83  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||| |||||||||    
T  10635936 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaaatgagagaaaaggatgag 10636014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 300
Target Start/End: Original strand, 6500112 - 6500180
Alignment:
Q  233 aatattatcattgttt-taaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatg 300  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6500112 aatattatcattgtttctgaaaaatatgttctacagttttaactctgatgatgtttattgtttttaatg 6500180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 300
Target Start/End: Original strand, 9993040 - 9993112
Alignment:
Q  229 tataaatattatcattgttt-taaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatg 300  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||  ||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9993040 tataaatattatcattatttctgaaaaatatgttctacagttttaactctaatgatatttattgtttttaatg 9993112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 269 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37876045 - 37876014
Alignment:
Q  269 tttaactctgatgatatttattgtttttaatg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37876045 tttaactctgatgatatttattgtttttaatg 37876014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 25)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 309
Target Start/End: Original strand, 466557 - 466857
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  466557 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 466656  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||  |||| ||    
T  466657 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttcttagtagctt 466751  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt-taaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcc 303  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  466752 tctctttgtatcttaacctttctttataaatattatcattgtttataactcatatgttctatacttttaattctgataatatttattgtttttaatgtct 466851  T
Q  304 tatgct 309  Q
    ||||||    
T  466852 tatgct 466857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 11006540 - 11006233
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  11006540 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 11006441  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  11006440 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 11006346  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta--ttcttttaactctgatgatatttattgttttt 296  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11006345 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatatttattgatttt 11006246  T
Q  297 aatgtcctatgct 309  Q
    |||||| ||||||    
T  11006245 aatgtcatatgct 11006233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1988891 - 1988657
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1988891 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 1988792  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  1988791 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 1988697  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1988696 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 1988657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 21001968 - 21002131
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21001968 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 21002067  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21002068 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 21002131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5686885 - 5686723
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5686885 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 5686786  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5686785 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5686723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 9434589 - 9434427
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9434589 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 9434490  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9434489 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 9434427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11097364 - 11097117
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaag-ggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  11097364 ctttctatccagaagaagagtacatcactagtggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagg 11097265  T
Q  100 atgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgt 199  Q
    |||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  11097264 atgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt-ttttttacttttgttcttagt 11097166  T
Q  200 agttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    || | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  11097165 agctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 11097117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 42867181 - 42866947
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  42867181 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 42867082  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  42867081 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 42866987  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  42866986 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 42866947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 6876803 - 6876965
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6876803 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 6876902  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876903 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 6876965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 19992976 - 19993140
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  19992976 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcatgctggattcaaaagaagaatgagagaaaaggatgagttacttaagaagaagga 19993075  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19993076 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 19993140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 2715201 - 2715440
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||     
T  2715201 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcaaaagaaggatgat 2715300  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| |     
T  2715301 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctg 2715396  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2715397 tgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 2715440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9086580 - 9086337
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9086580 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 9086481  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  9086480 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 9086385  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9086384 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 9086337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26399656 - 26399899
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26399656 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 26399755  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  26399756 tgatcagatcaagtatctcttagaactgttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 26399851  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26399852 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26399899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 8011647 - 8011892
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  8011647 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 8011746  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  8011747 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 8011842  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctt--tataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  8011843 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 8011892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24736076 - 24735834
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24736076 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 24735977  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  24735976 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 24735881  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24735880 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 24735834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 26698689 - 26698932
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26698689 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 26698788  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  26698789 tgatcagatcaagtatctcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacatccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 26698884  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26698885 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26698932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 40051664 - 40051906
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40051664 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaataatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 40051763  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  40051764 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 40051859  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40051860 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 40051906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 22090532 - 22090372
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  22090532 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaaccagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 22090433  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22090432 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 22090372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4213377 - 4213219
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  4213377 ctttctatccagaagaagagtacattacaagggcatcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaatgatgagctactcaagaagaagga 4213278  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4213277 tgagaaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 4213219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 17959635 - 17959793
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  17959635 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 17959734  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17959735 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 17959793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8618743 - 8618587
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  8618743 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaataagaatgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 8618644  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgca 157  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8618643 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 8618587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 168248 - 168090
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  168248 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctactcaaaaagaagga 168149  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  168148 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 168090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 15887206 - 15887365
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   || | || | |||| ||||||| ||    
T  15887206 ctttttatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactgagagcacagaaagaacaacttcagaagaatga 15887305  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 160  Q
    ||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15887306 tgagcaggttaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 15887365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9434311 - 9434279
Alignment:
Q  269 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgt 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9434311 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgt 9434279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 301
Target Start/End: Original strand, 21002246 - 21002278
Alignment:
Q  269 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgt 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21002246 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgt 21002278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 13687510 - 13687816
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  13687510 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 13687609  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  13687610 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 13687704  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13687705 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 13687804  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  13687805 atgtcatatgct 13687816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 15766093 - 15766339
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15766093 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaagaatgagctactttagaagaagga 15766192  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  15766193 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt-ttttttacttttgttcttagta 15766291  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15766292 gctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 15766339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 15790230 - 15790476
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15790230 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactttagaagaagga 15790329  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| |  || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  15790330 tgatcggatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt-ttttttacttttgttcttagta 15790428  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15790429 gctttgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 15790476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 36079278 - 36079044
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  36079278 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 36079179  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  36079178 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 36079084  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36079083 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 36079044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 209099 - 209342
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  209099 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 209198  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  209199 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 209294  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  209295 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 209342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 722722 - 722965
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  722722 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 722821  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  722822 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 722917  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  722918 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 722965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29078054 - 29077811
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29078054 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 29077955  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  29077954 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 29077859  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29077858 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 29077811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 32087215 - 32087458
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32087215 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 32087314  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  32087315 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 32087410  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32087411 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 32087458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36294273 - 36294030
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36294273 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 36294174  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  36294173 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttctcagta 36294078  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  36294077 gctgtgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 36294030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 243156 - 242914
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  243156 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 243057  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||  |||    
T  243056 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt----tttacttt-gttcttagta 242962  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  242961 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 242914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 796526 - 796284
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  796526 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 796427  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||  |||    
T  796426 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt----tttacttt-gttcttagta 796332  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  796331 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 796284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19130100 - 19129938
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19130100 ctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgcaagaattcatgttgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 19130001  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19130000 tcagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19129938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 26112630 - 26112468
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  26112630 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagcagaagga 26112531  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26112530 tgaacaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 26112468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 3358151 - 3358393
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3358151 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 3358250  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  3358251 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 3358346  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
      | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3358347 tctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 3358393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9342478 - 9342236
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9342478 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 9342379  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||||||||||||  |||    
T  9342378 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagc----atattttttacttttgttcttcgta 9342283  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9342282 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 9342236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 44482398 - 44482164
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44482398 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagctgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 44482299  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  44482298 tgttc-----ttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttt 44482204  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  44482203 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 44482164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6152450 - 6152292
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||||| || |||||| |    
T  6152450 ctttctatcgagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagaa 6152351  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  6152350 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 6152292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19226293 - 19226134
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   || | || | |||| ||||||||||    
T  19226293 ctttctatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactgagagcacagaaagaacaacttcagaagaagga 19226194  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 160  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19226193 tgagcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 19226134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 30324174 - 30324333
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || |||||| | ||||||||  ||||||   ||  ||| | |||| ||||||||||    
T  30324174 ctttttatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagagtgagagcacagactgaacaacttcagaagaagga 30324273  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 160  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  30324274 tgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 30324333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 44482491 - 44482387
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  44482491 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 44482392  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  44482391 tgagc 44482387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 35400055 - 35400361
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35400055 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 35400154  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  35400155 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 35400249  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35400250 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 35400349  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  35400350 atgtcatatgct 35400361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Original strand, 35647580 - 35647886
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35647580 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 35647679  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  35647680 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 35647774  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta-ttcttttaactctgatgatatttattgttttta 297  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35647775 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctattttttttaactctaatgatatttattgatttta 35647874  T
Q  298 atgtcctatgct 309  Q
    ||||| ||||||    
T  35647875 atgtcatatgct 35647886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3172908 - 3172601
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3172908 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaaaaagaaaga 3172809  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  3172808 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 3172714  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttcta--ttcttttaactctgatgatatttattgttttt 296  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3172713 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattatcattgtttctgaaatattatgttctatttttttttaactctaatgatatttattgttttt 3172614  T
Q  297 aatgtcctatgct 309  Q
    |||||| ||||||    
T  3172613 aatgtcatatgct 3172601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4168563 - 4168401
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4168563 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 4168464  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4168463 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 4168401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19180247 - 19180085
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19180247 ctttctatctagaagaagagtatattacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 19180148  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19180147 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 19180085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 47617449 - 47617682
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  47617449 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 47617548  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||    
T  47617549 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg------ttttacttttgttctgtgta 47617642  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  47617643 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 47617682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 5834512 - 5834278
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5834512 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 5834413  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  5834412 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 5834318  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5834317 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 5834278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12731791 - 12731552
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  12731791 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 12731692  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  12731691 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 12731596  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12731595 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 12731552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12742384 - 12742145
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  12742384 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 12742285  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  12742284 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 12742189  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12742188 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 12742145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 51655387 - 51655629
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  51655387 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 51655486  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  51655487 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 51655582  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  51655583 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 51655629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38096371 - 38096126
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  38096371 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcaaaagaagga 38096272  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  38096271 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 38096176  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctt--tataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  38096175 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 38096126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7508585 - 7508343
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7508585 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 7508486  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  7508485 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 7508390  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  7508389 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 7508343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 36245943 - 36246185
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36245943 ctttctatccataagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 36246042  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  36246043 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 36246138  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36246139 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 36246185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 5649269 - 5649429
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  5649269 ctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctactcaataagaagga 5649368  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5649369 tgagcagattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacacc 5649429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21864984 - 21864824
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  21864984 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggcaacaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 21864885  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21864884 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcacacc 21864824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Original strand, 153163 - 153346
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  ||| |||| | |||| ||||||||||    
T  153163 ctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaagaatgaacaacttcagaagaagga 153262  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttctttttt 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  153263 tgagcaaattaagtatctattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgtttatttttt 153346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 12622689 - 12622847
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |  |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||    
T  12622689 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctggatacaaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaaaaagaagga 12622788  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12622789 cgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 12622847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 5834280 - 5834228
Alignment:
Q  256 tatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  5834280 tatgttctatt-ttttaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 5834228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 47617680 - 47617734
Alignment:
Q  256 tatgttctattctttt-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  47617680 tatgttctattttttttaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 47617734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 9122025 - 9122188
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9122025 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 9122124  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9122125 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 9122188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 17983630 - 17983877
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17983630 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 17983729  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  17983730 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttttttttttacttttgttcttagta 17983829  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17983830 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 17983877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 25590522 - 25590360
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25590522 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgaacttcttaagaagaagga 25590423  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25590422 tgagcaaattaagtacctcttagaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 25590360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12856261 - 12856018
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12856261 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 12856162  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  12856161 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagta 12856066  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | ||| |||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  12856065 gctttgtctttgtatcttaatccttctttatatatattatcattgttt 12856018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3662656 - 3662413
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3662656 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 3662557  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  3662556 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 3662461  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3662460 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 3662413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25789040 - 25788797
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25789040 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 25788941  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  25788940 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 25788845  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25788844 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 25788797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26866104 - 26865861
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26866104 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 26866005  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  26866004 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagta 26865909  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26865908 gctatgtccttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 26865861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26026731 - 26026489
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26026731 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 26026632  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  26026631 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 26026536  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26026535 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 26026489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27343039 - 27342797
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27343039 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 27342940  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  27342939 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 27342844  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27342843 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 27342797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27403779 - 27403537
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27403779 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 27403680  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  27403679 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 27403584  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27403583 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 27403537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27374095 - 27373931
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27374095 ctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 27373996  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 165  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373995 tgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 27373931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27464448 - 27464284
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27464448 ctttctatctagaagaagagtatatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 27464349  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 165  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27464348 tgatcaaattaagtaccttttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 27464284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 12726329 - 12726576
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  12726329 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 12726428  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  12726429 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 12726524  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaa-ccttc---ctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||||    
T  12726525 gctgtgtccttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 12726576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16931706 - 16931463
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931706 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 16931607  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  16931606 tgatcagatcaagtatctcttagaacagtngtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 16931511  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatat-tatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  16931510 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatatatatcattgttt 16931463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4632129 - 4631895
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4632129 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 4632030  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  4632029 tgttc-----ttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttt 4631935  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  4631934 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 4631895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27385655 - 27385421
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27385655 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 27385556  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  27385555 tgttt-----ttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttcttt 27385461  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27385460 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 27385421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27476068 - 27475834
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27476068 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 27475969  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    |||||     |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  27475968 tgttt-----ttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcaatgtttctgaaatattatgctcttttcttt 27475874  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27475873 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 27475834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Original strand, 32310648 - 32310882
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32310648 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 32310747  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  32310748 tgttc-----ttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttt 32310842  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  32310843 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 32310882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 34816667 - 34816825
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  34816667 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctactcaaaaagaagga 34816766  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  34816767 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 34816825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 32971370 - 32971526
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  32971370 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaatgatgagctactcaaaaagaagga 32971469  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgca 157  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  32971470 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgca 32971526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 163
Target Start/End: Original strand, 7669378 - 7669466
Alignment:
Q  75 aaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7669378 aaggatgagctactcaagaagaaggatgagcaaatcaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 7669466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27385748 - 27385644
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  27385748 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 27385649  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  27385648 tgagc 27385644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 27476161 - 27476057
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  27476161 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 27476062  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  27476061 tgagc 27476057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12359457 - 12359298
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||   |||||||||  ||||| || || ||| | ||||| ||  ||||||  ||| ||||   |||| ||||||||||    
T  12359457 ctttctatccagaagatgattacacttcaagggctgatagaattcaagcagggctgaaaagcagattgagagcaaagaatgaagaacttcagaagaagga 12359358  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 160  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12359357 tgatcagattaaatatctattggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 12359298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 4632222 - 4632118
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  4632222 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 4632123  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  4632122 tgagc 4632118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 32310555 - 32310659
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  32310555 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 32310654  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  32310655 tgagc 32310659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 309
Target Start/End: Original strand, 3438 - 3748
Alignment:
Q  3 ttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatg 102  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||   | || || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3438 ttctacccagaggaagaatacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataagagaaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaggatg 3537  T
Q  103 agcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagc--ttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    | || || |  |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||  |||    
T  3538 atcagatcagatatctcttagagcagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaattctagctttttttttttttttacttttgttcttagta 3637  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaa 298  Q
    | |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3638 gctttatccttgtatcttaactcttctttataaatattatcattgtttattaaatcatatgttctatacttttaattctgatgatatttattgtttttaa 3737  T
Q  299 tgtcctatgct 309  Q
    |||| ||||||    
T  3738 tgtcttatgct 3748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 5291837 - 5291675
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5291837 ctttctatccagaagaagagtacattataagggctgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 5291738  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5291737 tgagcaaattaagtatctcttggaatagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 5291675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 9345574 - 9345817
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9345574 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactttagaagaagga 9345673  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  9345674 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 9345769  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  9345770 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 9345817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14559328 - 14559085
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14559328 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 14559229  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  14559228 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttctcagta 14559133  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14559132 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 14559085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 23371543 - 23371786
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23371543 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 23371642  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  23371643 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 23371738  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23371739 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 23371786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 23706390 - 23706633
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23706390 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 23706489  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  23706490 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 23706585  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23706586 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 23706633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27604716 - 27604554
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27604716 ctttctatccagaagaagagtacatcacaaggactgcaagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 27604617  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27604616 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccca 27604554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30228716 - 30228473
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30228716 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 30228617  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  30228616 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 30228521  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30228520 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 30228473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36583769 - 36583526
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  36583769 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 36583670  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  36583669 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 36583574  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36583573 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 36583526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 42052402 - 42052645
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  42052402 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 42052501  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  42052502 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 42052597  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42052598 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 42052645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 35225096 - 35225330
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||  |  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  35225096 ctttctatcctgaagaagagtatatcacaagagctgcaaggattcatgctgggcatgtaagaagaatgagggaaaaggatgagctacttaagaagaaaga 35225195  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||    
T  35225196 tgaacagatcaagtatctcttagaacagctgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg-----tttttacttttgttctgtgta 35225290  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattat 240  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35225291 gtcttatctttgtaccttaaccttcatttataaatattat 35225330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24589324 - 24589081
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24589324 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgaggtaaaaggatgagctacttcagaagaagga 24589225  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  24589224 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 24589129  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24589128 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 24589081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 15768374 - 15768619
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15768374 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 15768473  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  15768474 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 15768569  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctt--tataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  15768570 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 15768619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 31447518 - 31447682
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31447518 ctttctatccagaagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctgggtttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 31447617  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 165  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31447618 tgagcaaattaagtatattttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaac 31447682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 6985332 - 6985574
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6985332 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 6985431  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  6985432 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 6985527  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6985528 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 6985574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 14039631 - 14039873
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14039631 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 14039730  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  14039731 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 14039826  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14039827 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 14039873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 22685037 - 22685279
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22685037 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 22685136  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  22685137 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 22685232  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22685233 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 22685279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 23305880 - 23306122
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23305880 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 23305979  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  23305980 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 23306075  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  23306076 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 23306122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 27469595 - 27469837
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27469595 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 27469694  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  27469695 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 27469790  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27469791 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 27469837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37731222 - 37730975
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37731222 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 37731123  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  37731122 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 37731027  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaa-ccttc---ctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||||    
T  37731026 gctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 37730975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15994549 - 15994310
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || || |||||||||||| ||||||| |||||     
T  15994549 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaatgatgagctacttcagaagaaagatgat 15994450  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  15994449 cagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 15994354  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15994353 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 15994310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24818111 - 24817869
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24818111 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatataaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 24818012  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  24818011 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 24817916  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24817915 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 24817869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39492157 - 39491915
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39492157 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgaggaaaaaggatgagctacttcagaagaagga 39492058  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  39492057 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttcgta 39491962  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39491961 gctgtgtccttgtatcttaatctt-ctttatatatattatcattgttt 39491915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 17728510 - 17728757
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17728510 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 17728609  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  17728610 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 17728705  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaa-ccttc---ctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||||    
T  17728706 gctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 17728757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Original strand, 31358127 - 31358374
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31358127 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 31358226  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  31358227 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 31358322  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaa-ccttc---ctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| |||||   || |||| |||||||||||||||    
T  31358323 gctgtgtctttgtatcttaatccttctttctatatatatattatcattgttt 31358374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 40400001 - 40400161
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40400001 ctttctatccagaagaagaatacattacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttaagaagaagga 40400100  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacc 161  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  40400101 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccctagttgcacacc 40400161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Original strand, 17616653 - 17616868
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  17616653 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatacaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 17616752  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  17616753 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 17616848  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaa 220  Q
    | | | ||||||||||||||    
T  17616849 gctgtgtctttgtatcttaa 17616868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27043479 - 27043234
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27043479 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 27043380  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||  |||    
T  27043379 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactccaacttg----ttttttacttttgttcttagta 27043284  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctt--tataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||    
T  27043283 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttctatatatattatcattgttt 27043234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 39361282 - 39361443
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  39361282 ctttctacccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaattcatgctgggtataaaagaagaatgagggaaaaggatgagctactcaagaagaatga 39361381  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccc 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39361382 tgagcaaattaagtatcttttggaacagatgtacaagcaagcccaaccttagttgcacaccc 39361443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14448296 - 14448055
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14448296 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcagaagaagga 14448197  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  14448196 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttctcagta 14448101  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||| |   ||| || |||| |||||||||||||||    
T  14448100 gctgtgtctttgtatcct--tctttctatatatatattatcattgttt 14448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 248
Target Start/End: Original strand, 31843003 - 31843242
Alignment:
Q  5 ctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||| |   | || || ||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  31843003 ctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaattcatgctgggcataaaaggaaattaagggaaaaggatgagctacttcagaagaaagatgat 31843102  T
Q  105 caaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgtagttt 204  Q
    || || |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  31843103 cagatcaagtatttcttagaatagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaacactagcttg----ttttttacttttgttcttagtagctt 31843198  T
Q  205 tatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  31843199 tgtctttgtatcttaacctttctttatatatattatcattgttt 31843242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Original strand, 36697301 - 36697535
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36697301 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 36697400  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  36697401 tgttc-----ttacttttgttctgtgtagttttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttt 36697495  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  36697496 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 36697535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 22156086 - 22156244
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  22156086 ctttctatccagaagaagagtacatctcaagggcaacaagaattcatgctgggtacaaaagaagattgagggaaaaagatgagctactcaaaaagaagga 22156185  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcaca 159  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22156186 tgagcaaatcaagtatctattggaacagatgtacaagcaaacccaaccttagttgcaca 22156244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1110441 - 1110282
Alignment:
Q  18 gagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatc 117  Q
    ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1110441 gagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcaaattaagtatc 1110342  T
Q  118 tcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 177  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  1110341 tattggaacagttgtataagcaagccaaaccttagttgcacacccaatttttgcttgttt 1110282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 20796655 - 20796831
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||  |||  ||||| || || ||||| ||||||||  ||||||  |||||||| | |||| ||||||||||    
T  20796655 ctttctatccagaagatgagtacatttcaagaactgttagaattcaagccgggttgaaaagaagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaagga 20796754  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 177  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  20796755 tgagcagattaaatatcttttggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgttt 20796831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 36697208 - 36697312
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  36697208 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 36697307  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  36697308 tgagc 36697312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 309
Target Start/End: Original strand, 35225328 - 35225380
Alignment:
Q  256 tatgttctattcttttaactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  35225328 tatgttctatt-ttttaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 35225380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 301
Target Start/End: Original strand, 23371828 - 23371860
Alignment:
Q  269 tttaactctgatgatatttattgtttttaatgt 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23371828 tttaactctgatgatatttactgtttttaatgt 23371860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32477 - 32234
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||| | ||||||||    
T  32477 ctttctatccagaagaagagtacatcactagggctgctagaattcaggctggatttaaacgaagaatgagggaaaaggatgagctacttcaaaagaagga 32378  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgtttcttttttacttttgttctgtgta 200  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  32377 tgatcagatcaagtatctcttagaacagttgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttg----ttttttacttttgttcttagta 32282  T
Q  201 gttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt 248  Q
    | | | |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32281 gctgtgtctttgtatcttaatctttctttatatatattatcattgttt 32234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 429 - 267
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  429 ctttctatccataagaagagtacattacaagggctgctagaattcatgctggatttaaaagaagaatgagagaaaaggatgagctacttcagaagaagga 330  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacaccca 163  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  329 tgagcaaattaagtaccttttggaacaaatgtataagcaagccaaaccttagttgcacaccca 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2537 - 2303
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2537 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacttctcttagaacagttgaagaagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 2438  T
Q  173 tgtttcttttttacttttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgtt--ttaaatcatatgttctattcttt 270  Q
    ||     || |||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||| ||||||    
T  2437 tg-----ttcttacttttgttctgtgttagtttatccttgtaccttaacctttctttataaatattatcattgtttctgaaatattatgctcttttcttt 2343  T
Q  271 t-aactctgatgatatttattgtttttaatgtcctatgct 309  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2342 taaactctaatgatatttattgattttaatgtcatatgct 2303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 2630 - 2526
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||| || | | | ||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  2630 ctttctatccagaggcagaatacatcacaagagctgcaagaatttatgctgggcataagaggaagttaagagagaaggaagaactacttcagaagaagga 2531  T
Q  101 tgagc 105  Q
    |||||    
T  2530 tgagc 2526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 52486 - 52649
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||| | |||| ||||||||||    
T  52486 ctttctatccagaagatgagtacatttcaaggactgctagaattcatgctgggttgaaaagtagactgagagcaaaggatgaacaacttcagaagaagga 52585  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaa 164  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  52586 tgagcaaattaagtatctattggaacagatgtataagcaagtcaaaccttagttgcacacccaa 52649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23894 - 23666
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||   ||||||| || ||| |  | || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23894 agaaggatgagctacttcagaagaaggatgaacagattagacatctcttagagcagttaaagaaacaagcccaaccttagttgcacacccaatactagct 23795  T
Q  173 tgtttcttttttactt----ttgttctgtgtagttttatctttgtatcttaaccttcctttataaatattatcattgttt--taaatcatatgttctatt 266  Q
    ||||| ||||||  ||    ||| | |  |||| |||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  23794 tgttttttttttttttaactttgcttttagtagctttatccttgtaacttaactcttctttataaatattatcattgtttgttaaatcatatgttctata 23695  T
Q  267 cttttaactctgatgatatttattgtttt 295  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  23694 cttttacttctgataatatttattgtttt 23666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 3619 - 3552
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatg 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3619 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagagctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatg 3552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 3253 - 3429
Alignment:
Q  1 ctttctatccagaagaagagtacatcacaagggctgcaagaatacatgctgggtttaaaagaaggatgagagagaaggatgagctacttaagaagaagga 100  Q
    |||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||  ||||| || |||||| | ||||||||  | ||||   || |||| | |||| ||||||||||    
T  3253 ctttttatccagaagatgattacatttcaagagctgatagaattcaagctgggctgaaaagaagactaagagcacagaatgaacaacttcagaagaagga 3352  T
Q  101 tgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 177  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  3353 tgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgttt 3429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 177
Target Start/End: Original strand, 11593 - 11684
Alignment:
Q  86 acttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagcttgttt 177  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  11593 acttcagaagaaggatgagcagattaaatatctattggaacagatgtataagctagccaaaccttagttgcacacccaaatgttgcttgttt 11684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 73 - 177
Target Start/End: Original strand, 2861 - 2965
Alignment:
Q  73 agaaggatgagctacttaagaagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacacccaactctagct 172  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| | | |||    
T  2861 agaaggatgaacaacttcagaagaaggatgagcagattaaatatctactggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacacccaattgttgct 2960  T
Q  173 tgttt 177  Q
    |||||    
T  2961 tgttt 2965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23825 - 23758
Alignment:
Q  93 aagaaggatgagcaaattaagtatctcttggaacagatgtataagcaagcccaaccttagttgcacac 160  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23825 aagaaggatgagcagattaaatatcttttggaacagatgtctaagctagccaaaccttagttgcacac 23758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University