View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9876_low_1 (Length: 597)

Name: NF9876_low_1
Description: NF9876
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9876_low_1
NF9876_low_1
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (10-578)||(33574525-33575103)
chr5 (10-579)||(15532431-15533009)
chr5 (10-579)||(15542613-15543191)
chr5 (10-527)||(26712634-26713150)
chr5 (10-527)||(26982372-26982888)
chr5 (25-527)||(34405301-34405802)
chr5 (41-527)||(22159212-22159698)
chr5 (25-527)||(14616720-14617221)
chr5 (156-470)||(11989166-11989480)
chr5 (126-517)||(7650243-7650632)
chr5 (299-404)||(23993447-23993552)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (10-580)||(22626540-22627121)
chr3 (10-580)||(11138798-11139378)
chr3 (10-527)||(39563802-39564314)
chr3 (132-527)||(13979050-13979440)
chr3 (94-516)||(35365901-35366319)
chr3 (25-172)||(1096863-1097009)
chr3 (154-516)||(47411772-47412125)
chr3 (25-209)||(31878278-31878463)
chr3 (465-518)||(46731386-46731439)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (10-578)||(12171419-12171997)
chr4 (25-527)||(647495-647996)
chr4 (54-527)||(26062985-26063457)
chr4 (25-527)||(650767-651269)
chr4 (149-527)||(26060163-26060541)
chr4 (149-527)||(2541461-2541838)
chr4 (301-471)||(16926976-16927144)
chr4 (299-340)||(13978982-13979023)
chr4 (299-340)||(56089543-56089584)
[»] chr6 (22 HSPs)
chr6 (10-580)||(13017419-13017998)
chr6 (16-578)||(22247002-22247573)
chr6 (24-578)||(22221175-22221738)
chr6 (25-527)||(14790071-14790572)
chr6 (39-527)||(14795113-14795600)
chr6 (25-527)||(1837926-1838428)
chr6 (25-527)||(32704546-32705046)
chr6 (25-527)||(19664956-19665457)
chr6 (21-478)||(32426817-32427271)
chr6 (149-510)||(20527472-20527832)
chr6 (151-511)||(16883254-16883613)
chr6 (25-396)||(15534541-15534912)
chr6 (206-527)||(12983670-12983994)
chr6 (224-527)||(12980783-12981089)
chr6 (388-510)||(15538036-15538158)
chr6 (106-518)||(7769689-7770112)
chr6 (25-230)||(15537736-15537940)
chr6 (474-580)||(30978441-30978557)
chr6 (21-135)||(32426634-32426748)
chr6 (440-527)||(15534923-15535010)
chr6 (280-346)||(15537971-15538037)
chr6 (299-340)||(2330478-2330519)
[»] chr2 (9 HSPs)
chr2 (10-579)||(31527826-31528404)
chr2 (10-578)||(31625984-31626563)
chr2 (27-527)||(40017432-40017930)
chr2 (25-527)||(13709524-13710024)
chr2 (21-527)||(36326369-36326880)
chr2 (224-527)||(16294550-16294852)
chr2 (168-518)||(23673645-23673995)
chr2 (25-527)||(32575978-32576478)
chr2 (359-420)||(8426783-8426844)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (10-580)||(23759838-23760417)
chr7 (10-527)||(11278929-11279445)
chr7 (12-526)||(33312442-33312947)
chr7 (10-527)||(294301-294818)
chr7 (121-527)||(46846604-46847007)
chr7 (25-527)||(6966600-6967101)
chr7 (25-527)||(17863386-17863887)
chr7 (39-527)||(17866645-17867132)
chr7 (25-527)||(24782858-24783362)
chr7 (149-512)||(36843244-36843607)
chr7 (132-526)||(36222601-36222993)
chr7 (183-527)||(23107597-23107941)
chr7 (149-527)||(9765373-9765746)
chr7 (106-527)||(3862190-3862607)
chr7 (149-347)||(23313673-23313871)
chr7 (25-295)||(35773054-35773324)
chr7 (408-517)||(23313562-23313671)
chr7 (299-468)||(2719269-2719438)
chr7 (425-466)||(27796686-27796727)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (10-527)||(7284-7801)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (10-527)||(2128-2647)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (10-519)||(2903-3416)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (21-527)||(32506146-32506650)
chr1 (69-527)||(13492759-13493216)
chr1 (83-527)||(27282399-27282842)
chr1 (69-518)||(13495484-13495932)
chr1 (158-527)||(34065929-34066298)
chr1 (25-510)||(16190487-16190969)
chr1 (73-527)||(1936128-1936580)
chr1 (232-507)||(22104683-22104956)
chr1 (152-527)||(23990380-23990754)
chr1 (314-527)||(39545983-39546196)
chr1 (188-527)||(21152871-21153209)
chr1 (313-527)||(22453427-22453641)
chr1 (188-518)||(22456792-22457123)
chr1 (288-527)||(15297047-15297286)
chr1 (25-263)||(10759574-10759811)
chr1 (483-527)||(10764829-10764873)
chr1 (376-456)||(4204975-4205055)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (259-578)||(24414-24743)
[»] scaffold0440 (2 HSPs)
scaffold0440 (317-578)||(9606-9877)
scaffold0440 (10-172)||(9446-9608)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (69-527)||(12575591-12576048)
chr8 (149-527)||(13096606-13096975)
chr8 (180-520)||(44007909-44008247)
chr8 (340-512)||(41779048-41779213)
chr8 (178-263)||(41779232-41779317)
chr8 (380-424)||(14418355-14418399)
chr8 (299-347)||(13331937-13331985)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (149-512)||(6117-6479)
[»] scaffold0665 (1 HSPs)
scaffold0665 (25-462)||(1-437)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (380-424)||(319-363)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (299-340)||(7086-7127)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 488; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 488; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 578
Target Start/End: Original strand, 33574525 - 33575103
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574525 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 33574624  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574625 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 33574724  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574725 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 33574824  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33574825 aaattgaatgaccactaaccctaacttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 33574924  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33574925 agggattaacattcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagatcaagagattgggt 33575024  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33575025 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtaattaggagtgcaaattaccataggagagctt 33575103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 15533009 - 15532431
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15533009 ggagcagagacttggagatctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatggatgaatccgttttcttatgttagttagcttatact 15532910  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532909 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 15532810  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15532809 aaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 15532710  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15532709 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 15532610  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15532609 agggattaacgttcg-ttaatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 15532511  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttt 579  Q
    |||||||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15532510 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagcttt 15532431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 15543191 - 15542613
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15543191 ggagcagagacttggagatctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatgtatgaatccgttttcttatgttagttagcttatact 15543092  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15543091 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcatgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 15542992  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15542991 aaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 15542892  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15542891 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 15542792  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15542791 agggattaacgttcg-ttaatacctccattggtttcgaattcacttaagagatcaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 15542693  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttt 579  Q
    |||||||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15542692 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagcttt 15542613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26713150 - 26712634
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713150 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 26713051  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26713050 ttagctatgagtaactaatt---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacgg-aaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 26712955  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712954 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 26712855  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagataga---tcattattaggttatga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26712854 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatga 26712755  T
Q  407 tatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattg 506  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26712754 catagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 26712655  T
Q  507 ggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26712654 ggtagaattactaagttaatc 26712634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26982888 - 26982372
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982888 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 26982789  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982788 ttagctatgagtaactaatt---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacgg-aaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 26982693  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26982692 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 26982593  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagataga---tcattattaggttatga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26982592 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcatcattattaggttatga 26982493  T
Q  407 tatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattg 506  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26982492 catagggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattg 26982393  T
Q  507 ggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26982392 ggtagaattactaagttaatc 26982372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Original strand, 34405301 - 34405802
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  34405301 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 34405400  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  34405401 taatctctttatggttcag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 34405499  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  34405500 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 34405599  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34405600 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgagatagggattaacgttct 34405699  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  34405700 tttaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcgaggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 34405799  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  34405800 atc 34405802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 41 - 527
Target Start/End: Original strand, 22159212 - 22159698
Alignment:
Q  41 catcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggtt 140  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||    
T  22159212 catcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaactaatctctttgtggtt 22159311  T
Q  141 aattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtg 240  Q
     |   | |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  22159312 gagaat-gagatgaatccgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtg 22159410  T
Q  241 tttaatgccttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttta 339  Q
    |||||||| || ||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  22159411 tttaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatacaaattgatgttagagattgaatgaccattaaccctggcttttg 22159510  T
Q  340 actctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaat 439  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  22159511 actctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaaactagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaat 22159610  T
Q  440 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  22159611 ggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgtggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatc 22159698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 14617221 - 14616720
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  14617221 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaac 14617122  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |    
T  14617121 taatctctttctggttaag-cttgagatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtctagttttaa 14617023  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  14617022 ttcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaatactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccac 14616923  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||      
T  14616922 taaccatggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatatggattaacgtttt 14616823  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  14616822 gttaaaacctccaacggtttcgaattcactcaagagattaagggcttgtcacttgcggggagaattataggtcaagagattgggtagaattactttgtta 14616723  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  14616722 atc 14616720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 156 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11989480 - 11989166
Alignment:
Q  156 tctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgt 255  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| || |||    
T  11989480 tctgatgtaattttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgctttttgt 11989381  T
Q  256 atgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaa 355  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||     
T  11989380 atgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttcgcttttgactctgatctaggtat 11989281  T
Q  356 taggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcactt 455  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11989280 taggtttaacctatgtaatcaagttagagatagatcattattaggttttaacatagagattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaattcactt 11989181  T
Q  456 aaaagattaaggggt 470  Q
    || ||||||||||||    
T  11989180 aagagattaaggggt 11989166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 126 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 7650632 - 7650243
Alignment:
Q  126 aattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttat 225  Q
    |||||| ||||||||||  || ||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||      || |||||||||||| |||| |||||    
T  7650632 aattctcttgtggttaag-ctcgagatgaatttgatgtaattttatgg-aaccctaatttgttgaact------aatatcaatgaaagtctagtctttat 7650541  T
Q  226 tcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccact 325  Q
    ||||  ||| || |||||||||  || ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  7650540 tcatgttactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaataaccact 7650441  T
Q  326 aaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcatta---------ttaggttatgatatagggatt 416  Q
    ||||   |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| |||||||||    
T  7650440 aacc---gcttttgactcagaactaggtaataagtttaacctaaaaaatcaagctagagatagatcattattaggttatttaggttatgacatagggatt 7650344  T
Q  417 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 516  Q
    ||| |||  |||| |||||||  | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7650343 aaccttctattaaaacctccagcgatttcgaattcactcaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtaaagagattgagtagaatta 7650244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 23993552 - 23993447
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattatta 398  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| | |||||  |||| |||| | ||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  23993552 attgatcttagaacttgaatgaccactagccatgacttttgaatctgatctaggaaatatggttaacctaagaaattaagctagagatagacaattatta 23993453  T
Q  399 ggttat 404  Q
    ||||||    
T  23993452 ggttat 23993447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 487; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 22627121 - 22626540
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627121 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 22627022  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22627021 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 22626922  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22626921 aaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 22626822  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagat-agatcattattaggttatgata 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22626821 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagataagatcattattaggttatgata 22626722  T
Q  409 tagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattggg 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  22626721 tagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgga 22626622  T
Q  509 tagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctttg 580  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22626621 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttg 22626540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 11139378 - 11138798
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatccttttt-cttatgttagttagcttatac 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11139378 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatccttttttcttatgttagttatcttatac 11139279  T
Q  109 tttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 208  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139278 tttagctttgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 11139179  T
Q  209 gaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcata 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11139178 gaaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtatgtttatgataaactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcata 11139079  T
Q  309 gaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgata 408  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11139078 gaaattgaatggccactaaccctggcttttaactctgaaata-gtaataggtttaacctcagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgata 11138980  T
Q  409 tagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattggg 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  11138979 tagggattaacgttcgtttaatacctcctatggtttcgaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgga 11138880  T
Q  509 tagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctttg 580  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11138879 tagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttg 11138798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 39564314 - 39563802
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564314 ggagcagagacttggagatatggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 39564215  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39564214 ttagctatgagtaactaatt---ttgtggttaattcctgagataaatctgatgtaatcctacga-aaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatg 39564119  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39564118 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcattgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 39564019  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39564018 aaattgaatgaccactaaccctgacttttaa-tctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 39563920  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39563919 agggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 39563820  T
Q  510 agaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||||||||||||    
T  39563819 agaattactaagttaatc 39563802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 132 - 527
Target Start/End: Original strand, 13979050 - 13979440
Alignment:
Q  132 tttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatac 231  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| ||||||     
T  13979050 tttgtggttaagactt-agacgaatctgaggtaatcttatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttaaatgaaagtttagtcttttttcatat 13979148  T
Q  232 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 331  Q
    ||| || |||||||||  ||  ||||   ||| || ||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  13979149 tactttttgtttaatgtttttcgtat---tatcatcgactactgaccctagctttatgaa-atgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactgaccct 13979244  T
Q  332 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaata 431  Q
    | ||||  |||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13979245 gactttcgactctgaactaggtaatagttttaacttaagtaatcaagttggagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaata 13979344  T
Q  432 cctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||| || | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  13979345 cctcgaacgatttcgaattcacttaagagattaagaggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagggattggatagagttactaagttaatc 13979440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 94 - 516
Target Start/End: Original strand, 35365901 - 35366319
Alignment:
Q  94 ttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgt-tgaac 192  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    |||| ||| |  ||| || ||||||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||    
T  35365901 ttagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctccttgtagttgagactt-ag-tgaatctgatgtaactctatggaaa-cctaatttgtatgaac 35365997  T
Q  193 tcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaat 292  Q
    ||  ||||| || ||||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||||||||   | | ||||||||| || ||||| || | ||||| |  |||||    
T  35365998 tctcttgaatattaatgaaagactagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttgttt-tatgtttattattgactactagcactagcatcgtgaat 35366095  T
Q  293 atgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatca 392  Q
     |||| ||||||| || || |||||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  |    
T  35366096 gtgcaaattgatcttaaaacttgaatgaccactagccttggcttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaa 35366195  T
Q  393 ttattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattct 492  Q
    |||||||| |||||   | |||||||||  |  |||| ||||||||  || | |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  35366196 ttattaggctatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaagagtcttgaattcacttaagagattaagggattgtcactcgcggagagagttct 35366295  T
Q  493 aggttaagagattgggtagaatta 516  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  35366296 aggtcaagagattgagtagaatta 35366319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1097009 - 1096863
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1097009 agatctggtgggcaaccatcacaactcatagtcaatcatccattacatgtatgaatcctttttcttatgttagttaacttatactttagctatgagtaac 1096910  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatg 172  Q
    |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  1096909 taattcctttgtggttaa-gcttgacatgaatctgatataattctatg 1096863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 154 - 516
Target Start/End: Original strand, 47411772 - 47412125
Alignment:
Q  154 aatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgt-tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgcctta 252  Q
    |||||||||||||  ||||| || |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||   |     
T  47411772 aatctgatgtaattttatggaaa-cctaatatgtatgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatattaccttgtgtttaatgttgtt 47411869  T
Q  253 tgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattagg 352  Q
    ||||||||||| || ||||| || | ||| |||  |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||  ||||    
T  47411870 tgtatgtttattattgactactagcactaacttcttgaatatgaaaattgatcttagaacttgaatgatcactagtcctgccttttgactctgatctagg 47411969  T
Q  353 taataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattca 452  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||| || |||   || |||||||   |  |||| | ||| ||| ||  ||||||||    
T  47411970 taataggtttaacctaagtaattaagttagagatagaaaattattagattgtgactcagagattaacagactgttaaaatctctaatagtcccgaattca 47412069  T
Q  453 cttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 516  Q
    ||||| |||        ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  47412070 cttaagaga--------ttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgagtagaatta 47412125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31878463 - 31878278
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  31878463 agatctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgttagttattttgtactttagctatgagtaac 31878364  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcc--taatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    ||||   ||| ||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||  ||||||||  ||||||||| || |||||||    
T  31878363 taatctctttatggttgagactt-agatgaatctgatataatcttatgagaaccctgtaatttgtcaaactcctttaaatatcaatg 31878278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 465 - 518
Target Start/End: Original strand, 46731386 - 46731439
Alignment:
Q  465 aggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattact 518  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||    
T  46731386 aggggttgttacttgcggggagaactccaggtcaagagattgggtagagttact 46731439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 468; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 578
Target Start/End: Original strand, 12171419 - 12171997
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12171419 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtaaatcatccgtcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttctact 12171518  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171519 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaatttctgagatgaatctgatgtaaccctattggaacccaaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 12171618  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171619 aaagtttagtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 12171718  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171719 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaattcttaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 12171818  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12171819 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattgtaggtcaagagattgggt 12171918  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    |||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12171919 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattaccataggcgagctt 12171997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 647996 - 647495
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  647996 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 647897  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  647896 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 647798  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| ||||    
T  647797 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggccac 647698  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  647697 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 647598  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  647597 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 647498  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  647497 atc 647495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 54 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 26063457 - 26062985
Alignment:
Q  54 agtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatg 153  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |  || ||||||    
T  26063457 agtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaactaatttctttgtggttgagact-gagatg 26063359  T
Q  154 aatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttat 253  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |    
T  26063358 aatctaatgtaatcatatgggaaccctgatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgcttttt 26063259  T
Q  254 gtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattagg 352  Q
    |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  26063258 gtattgtttatcatcgactaataaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctagg 26063159  T
Q  353 taataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattca 452  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  26063158 taataggtt-aacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatatggataaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattca 26063060  T
Q  453 cttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  26063059 cttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatc 26062985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 651269 - 650767
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  651269 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatcccatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 651170  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcc-taatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttt 223  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||     
T  651169 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaacccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagtttta 651071  T
Q  224 attcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 323  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || |  |  |||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||| |||    
T  651070 attcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgtttcctaaccctaactttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatggcca 650971  T
Q  324 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttc 423  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  650970 ctaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 650871  T
Q  424 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 523  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  650870 ttttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtt 650771  T
Q  524 aatc 527  Q
    ||||    
T  650770 aatc 650767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 149 - 527
Target Start/End: Original strand, 26060163 - 26060541
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    |||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  26060163 agatgaatatgatataattgtatgagaatcctagtttgttgaactcttttgaatatcaataaaagtctagattttattcatattactttatgtttaatgc 26060262  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 348  Q
     || ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||      
T  26060263 tttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttcatgaatatacaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccatgacttttgactctgatc 26060362  T
Q  349 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 448  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||    
T  26060363 taggtaatatgtttaacttaagtaatcaagctagagatagaccattattaggttatgacatagggattaacgttctattaaaacctccaacggtttcgaa 26060462  T
Q  449 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  26060463 ttcacttaagacattaaggggttgttatttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtagagttactttgttaatc 26060541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 149 - 527
Target Start/End: Original strand, 2541461 - 2541838
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  2541461 agatgaatctaatgtaatcttatgggaactctaatttgttgaattcctttcat-atcaataaaagtctagtttttattcatattatcttgtgtttaatga 2541559  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 348  Q
     ||  |||||||||| || |||||  |  |||||||| || | | ||||   ||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||     
T  2541560 ttttcgtatgtttattattgactacaagtcctagcttgataagtttgcaggctgatcttagaacttgattgaccactaacaccggcttttaactctgaac 2541659  T
Q  349 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 448  Q
    |||||   | ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||| |||| ||||||||| |||    
T  2541660 taggtggaatgtttaacctaagtaattaagctagagatagacaattattaggttatgatatagggattaacggactgttaaaaccttcaatggttttgaa 2541759  T
Q  449 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||| |||| ||||||| || |||| | || || | |||||| ||||| |||||||||| || |||||||  |||||||    
T  2541760 ttcatttaagagattaatggattgttatttccgagaagaattttaggtcaagagattggataaaattactttgttaatc 2541838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16927144 - 16926976
Alignment:
Q  301 tgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattagg 400  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| || ||| |  |||| |||| | ||||||| |||||| ||  |||||||  |  |||||||||    
T  16927144 tgatcttagaacttaaatgaccactagccatggctttgaa-tcttatctaggaaatatggttaacctaagtaattaaattagagatgaacaattattagg 16927046  T
Q  401 ttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggtt 471  Q
    ||||||| ||| |||||||   |  |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  16927045 ttatgatctagagattaacaaactattaaaacctccaacggtt-ctaattcacttaagagattaaggggtt 16926976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 340
Target Start/End: Original strand, 13978982 - 13979023
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 340  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13978982 attgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 13979023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 56089584 - 56089543
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 340  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56089584 attgatcttaggaattgaatgaccactaaccctagcttttaa 56089543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 458; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 458; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 13017998 - 13017419
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13017998 ggagcagagacttggagatctggttggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttgtgttagttagcttatacg 13017899  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13017898 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatg 13017799  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13017798 aaagtttagtttttattcatattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 13017699  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13017698 aaattgaatgaccactaaccctggctcttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatat 13017599  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13017598 agggattaacgttcg-ttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 13017500  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctttg 580  Q
    |||||||||||||||||||||          |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13017499 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcatatttaggagtgcaaattaccataggagagctttg 13017419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 578
Target Start/End: Original strand, 22247002 - 22247573
Alignment:
Q  16 gagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagct 115  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22247002 gagacttagagatccggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcattcttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttcgct 22247101  T
Q  116 atgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22247102 atgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtt 22247200  T
Q  216 tagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattg 315  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22247201 tggtttttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattg 22247300  T
Q  316 aatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggat 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22247301 aatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggat 22247400  T
Q  416 taacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatt 515  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22247401 taacgtttgtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatt 22247500  T
Q  516 actaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    |||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22247501 actaagttaatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagctt 22247573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 24 - 578
Target Start/End: Original strand, 22221175 - 22221738
Alignment:
Q  24 gagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaa 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22221175 gagatccggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcattcttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttcgctatgagtaa 22221274  T
Q  124 ctaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttt 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221275 ctaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgg-aaccctaatttgttgaactcttttgaacatcaatgaaagtttagttttt 22221373  T
Q  224 attcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22221374 attcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 22221473  T
Q  324 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttc 423  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  22221474 ctaaccctggcttttaaatctaaaaaaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatatggattaacgttt 22221573  T
Q  424 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 523  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22221574 gtttaattcctctaatggtttcgaattcacttgagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 22221673  T
Q  524 aatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    |||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22221674 aatccgtcgtgatactaaataatcattgattgtatttaagagtgcaaattaccataggagagctt 22221738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Original strand, 14790071 - 14790572
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  14790071 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 14790170  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  14790171 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 14790269  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  14790270 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 14790369  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14790370 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 14790469  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  14790470 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 14790569  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  14790570 atc 14790572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 39 - 527
Target Start/End: Original strand, 14795113 - 14795600
Alignment:
Q  39 accatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtgg 138  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||   ||  |||    
T  14795113 accatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatctcttcatgg 14795212  T
Q  139 ttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttg 238  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||     
T  14795213 ttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattacttta 14795311  T
Q  239 tgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttt 338  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14795312 tgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggctttt 14795411  T
Q  339 aactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaa 438  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14795412 gactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaa 14795511  T
Q  439 tggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14795512 cggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 14795600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Original strand, 1837926 - 1838428
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  1837926 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaaaccttatttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaac 1838025  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  1838026 taatctctttgtggttgagact-gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttattgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 1838124  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 323  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  1838125 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgacca 1838224  T
Q  324 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttc 423  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1838225 ctaaccctgacttttgactctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgtta 1838324  T
Q  424 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 523  Q
      |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  |||    
T  1838325 tgttaaaatctccaatggtttcaaattcacttaagagattaaggagttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtagagttactttgtt 1838424  T
Q  524 aatc 527  Q
    ||||    
T  1838425 aatc 1838428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32705046 - 32704546
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  32705046 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 32704947  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  32704946 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 32704848  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
     ||| | ||| || |||||||||  || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  32704847 gtca-attactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 32704749  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  32704748 taaccctggcttttgactctgatctaagtaataagtttaacctaagtaatcaagatagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 32704649  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  32704648 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctatttcaagagattgggtagaattactctgtta 32704549  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  32704548 atc 32704546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19665457 - 19664956
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  19665457 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttatatatgagtaac 19665358  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  19665357 taatctctttgtggttgagact-gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 19665259  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 323  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||    
T  19665258 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatca 19665159  T
Q  324 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttc 423  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19665158 ctaaccctgacttttaattctgatctaggtaataggtttaacctaagtaatcaagatagagatagatca-tattaggttatgacatagggattaacgttc 19665060  T
Q  424 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 523  Q
      |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||  |||    
T  19665059 tattaaaatctccaatgatttcgaattcacttaagagattaaggggatgttacttgcggggagaactctaggtcaagatattgggtagagttactttgtt 19664960  T
Q  524 aatc 527  Q
    ||||    
T  19664959 aatc 19664956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 21 - 478
Target Start/End: Original strand, 32426817 - 32427271
Alignment:
Q  21 ttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgag 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  32426817 ttggagatctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctaggag 32426916  T
Q  121 taactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32426917 taactaattcttttgtggttaag-cttgagatgaatatgatataatcctatgagaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtt 32427015  T
Q  221 tttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 320  Q
    || ||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||| | ||||||| |||||| || |||||| || |||| |||| |||||||||    
T  32427016 ttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgaccactaaccctggctttaggagtatgcaaatcgatcttagagattgaatga 32427115  T
Q  321 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 420  Q
    |||||||| |||| |||| |  ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  32427116 ccactaactctggattttga--ctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaatctagagatagatcattattatgttatgacatagggattaaca 32427213  T
Q  421 ttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcactt 478  Q
    |||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32427214 ttctgttaatacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcactt 32427271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 149 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20527832 - 20527472
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||| || | ||||||||    
T  20527832 agatgaatctgatgtaattttatgggaaccttaatgtgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctaatctttattcatattactttatatttaatgc 20527733  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 348  Q
     || ||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  20527732 tttttgtatgtttatcatcgactcctaaccctagctttatgaatatgcaaattgattttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgaac 20527633  T
Q  349 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 448  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||    
T  20527632 taggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcaaa 20527533  T
Q  449 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggta 510  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20527532 ttcacttaagagattaa-gggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggta 20527472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 151 - 511
Target Start/End: Original strand, 16883254 - 16883613
Alignment:
Q  151 atgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgcct 250  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| || | |||||||| |    
T  16883254 atgaatctgatgtaattttatgagaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatctttaatgctt 16883353  T
Q  251 tatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaatta 350  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||    
T  16883354 tttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctcacttttgactctgaacta 16883453  T
Q  351 ggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaatt 450  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||    
T  16883454 ggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtgatg-catagggattaatgttctgttaaaacctccaacggttttgaatt 16883552  T
Q  451 cacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtag 511  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16883553 cacataagagattaaggggttgccacttgtggggagaattctaggtcaagagattgggtag 16883613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 396
Target Start/End: Original strand, 15534541 - 15534912
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   |||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15534541 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatatatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagatatgagtaac 15534640  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15534641 taatctctttgtggttgaga-ttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctagttttta 15534739  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 323  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||| ||||||    
T  15534740 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgaaaattgatgttagagattgagtgacca 15534839  T
Q  324 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattat 396  Q
    |||| | || |||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15534840 ctaaacttgacttttaactctgatcttggtaataggtttaacataagtaatcaagctagtgatagatcattat 15534912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 8e-72
Query Start/End: Original strand, 206 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12983994 - 12983670
Alignment:
Q  206 aatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata--gactattaaccctagc-tttatgaatatgcatattg 302  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||  || || || | ||||| ||| |||||||||| | ||    
T  12983994 aatggaagtctagttttaattcatattaccttgtgtttaatgctgtctgtatgtttattatattgagtactagcactagcgtttttgaatatgcaaactg 12983895  T
Q  303 atcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggtt 402  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  12983894 atcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggtt 12983795  T
Q  403 atgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagag 502  Q
    |||| | | |||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  12983794 atgacacatggattaacggactgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagag 12983695  T
Q  503 attgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||||||||||  |||||||    
T  12983694 attgggtagaattactttgttaatc 12983670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 224 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12981089 - 12980783
Alignment:
Q  224 attcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata--gactattaaccctagc-tttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||| |||  ||||| || | ||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| ||||||||    
T  12981089 attcatattaccttgtgtttaatgttgtctgtatgtttattatattgactactagcactagcgtttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatga 12980990  T
Q  321 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 420  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||   | |||||||||    
T  12980989 ccactagccctgacttttgactctgatctaggtaatatgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaagtattaggttatgactcatggattaacg 12980890  T
Q  421 ttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaa 520  Q
      |  |||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  12980889 gactgttaaaacctccaacaatttcgaattcacttaagagattaagcggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtagaattacttt 12980790  T
Q  521 gttaatc 527  Q
    |||||||    
T  12980789 gttaatc 12980783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 388 - 510
Target Start/End: Original strand, 15538036 - 15538158
Alignment:
Q  388 gatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggaga 487  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15538036 gatcattattaagttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggtgttgttacttgcggggaga 15538135  T
Q  488 attctaggttaagagattgggta 510  Q
    | ||||||| |||||||||||||    
T  15538136 actctaggtcaagagattgggta 15538158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 7770112 - 7769689
Alignment:
Q  106 tactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaat-cctaatttgt-tgaactcctttgaaca 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||    |||||||| |  ||| |||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  7770112 tactttatctatgagtaactaatctccttgtggttgagactt-agatgaatctgatgtaattccatg--aatacctaatttgtatgaactcccttgaata 7770016  T
Q  204 tcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattga 303  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| || | ||||| |  ||||| || | ||| |    
T  7770015 tcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttgtgtttaatgacatatgtatgtttatgattaactactagcactagcatcttgaatgtgtaaattta 7769917  T
Q  304 tc--atagaaattgaatgaccactaac----cctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattatt 397  Q
    ||  |||||| |||||||||||||| |    | |||||||| | |||||  |||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||    
T  7769916 tcttatagaacttgaatgaccactagccatgcatggcttttgaatctgatctaggaaatatgtttaacctaagtaattaagttagagatagacaattatt 7769817  T
Q  398 aggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaat---tcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaatt---- 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |  |||| |||||||| | ||||||||   ||||| || |||||||||||||  ||||||| | |||||||        
T  7769816 aggttatgatttagggattaacggactgttaaaacctccaaagatttcgaattcatcactgaagagattaaggggttagcacttgcagagagaattatag 7769717  T
Q  491 ctaggttaagagattgggtagaattact 518  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||    
T  7769716 ctaggtcaaaagattgagtagaattact 7769689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Original strand, 15537736 - 15537940
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | |||||||||||    |||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  15537736 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatctaatacatgtatgactccttgtttttatgtgagttatcttgtacattagatatgagtaac 15537835  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||    
T  15537836 taatctctttgtggttgagact-gagatgaatttgatgtaatcatatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatgtcaatgaaagtctaattttta 15537934  T
Q  225 ttcata 230  Q
    ||||||    
T  15537935 ttcata 15537940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 474 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 30978557 - 30978441
Alignment:
Q  474 cacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaatt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30978557 cacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaatt 30978458  T
Q  564 gccataggagagctttg 580  Q
     ||||||||||||||||    
T  30978457 accataggagagctttg 30978441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 135
Target Start/End: Original strand, 32426634 - 32426748
Alignment:
Q  21 ttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgag 120  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  32426634 ttggagatctggtgagcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctaggag 32426733  T
Q  121 taactaattcttttg 135  Q
    |||||||||||||||    
T  32426734 taactaattcttttg 32426748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 440 - 527
Target Start/End: Original strand, 15534923 - 15535010
Alignment:
Q  440 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||  |||||||    
T  15534923 ggtttcgaattcacttaagagattaagaggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattggttagagttactttgttaatc 15535010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 280 - 346
Target Start/End: Original strand, 15537971 - 15538037
Alignment:
Q  280 tagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctga 346  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15537971 tagttttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgatcactaacccttgcttttaactctga 15538037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 340
Target Start/End: Original strand, 2330478 - 2330519
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  2330478 attgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttttaa 2330519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 457; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 579
Target Start/End: Original strand, 31527826 - 31528404
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31527826 ggagcagagacttggagatctggtggggaaccatcaaaactaagagtcaatcttccttcacatgtatgaatccgttttcttatgttagttagcttatact 31527925  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31527926 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 31528025  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31528026 aaagtttagtttttattcttattactttgtgcttaatgccttatgtacgtttatgatagactattaaccctagcgttatgaatatgcatattgatcatag 31528125  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31528126 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 31528225  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31528226 agggattaacgttcg-ttaatacctccattggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggt 31528324  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagcttt 579  Q
    |||||||||||||||||| ||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31528325 agaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccacaggagagcttt 31528404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 578
Target Start/End: Original strand, 31625984 - 31626563
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31625984 ggagcagatacttggagatctggtgggcaaccatcaaaactatgagtcaatcatcctttacatgtacgaatcatttttcttatgtgagttagcttatact 31626083  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||     
T  31626084 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatacata 31626183  T
Q  210 aaagtttagtttt--tattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcat 307  Q
        | || |  |  |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  31626184 ttgatgtaatcctactattcatattaccctgtgtttaatgttttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatacatattgattat 31626283  T
Q  308 agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgat 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  31626284 agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttataac 31626383  T
Q  408 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 507  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31626384 ataaggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgg 31626483  T
Q  508 gtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    |||||||||||||||||||| ||          |||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31626484 gtagaattactaagttaatctgtcgtgaaactaaataataattgattg-aattaggagtgcaaattaccataggagagctt 31626563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 27 - 527
Target Start/End: Original strand, 40017432 - 40017930
Alignment:
Q  27 atctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaacta 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40017432 atctggtggacaaccatcaaaactcatagtcagtcatccattacatgtatgaatccttcttcctatgttagttagcttatactttaactatgagtaacta 40017531  T
Q  127 attcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttatt 226  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40017532 attcttttgtggttaag-cttgagatgaatatgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttatt 40017630  T
Q  227 catactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccacta 326  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  40017631 catattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactgaccctatctttatgaatatgcaaattgatcgtagagattgaatgaccactg 40017730  T
Q  327 accctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtt 426  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||    
T  40017731 accctggcttttgactttgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggtcatgacatatgaattaacgttcttt 40017830  T
Q  427 taatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaat 526  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||| |||||||    
T  40017831 taatacctccaacagtttcgaattcacttaagagaataa-gggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaggattggggagaagtactgagttaat 40017929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Original strand, 13709524 - 13710024
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13709524 agatctggtgggcaaccatcaaaactaatagtcaatcatccattacatgtatgaatccttattcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 13709623  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |   ||| |||||||||||| || |||| |    
T  13709624 taattctcttgtggttaattct-gagatgaatctgatgtaatcctatgtgaaccctaatttgttgaacttcaa-gaatatcaatgaaagtctaattttaa 13709721  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||    
T  13709722 ttcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgtaaattgatcttagagattgaatgaccac 13709821  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  13709822 taaccctggattttgactctgacctaggtgataagtttaacccaagtaatcaagctagatatagatcattattaggttatgacatagggattaacgtttt 13709921  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
     |||| |||||||| | ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||  ||||    
T  13709922 gttaaaacctccaacgatttcgaattcactaaagagattatggggttgtcacttgaggggagaattatgggtcaagagatcgggtagaattactttgtta 13710021  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  13710022 atc 13710024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 527
Target Start/End: Original strand, 36326369 - 36326880
Alignment:
Q  21 ttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatg----aatcctttttcttatgttagttagcttatactttagcta 116  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||    ||||||| || ||| |||||||| ||| ||||||| |||    
T  36326369 ttggagatctgatggccaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatcaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttatcta 36326468  T
Q  117 tgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagttt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  36326469 tgagtaactaattcttttgtggttaa-gcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcatttgaatatcaatgaaagtct 36326567  T
Q  217 agtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattga 316  Q
    |||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  36326568 agttttaattcatattactttatgtttaatgctttttg--tgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattga 36326665  T
Q  317 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  36326666 atgaccactaaccctggcttttgactttgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggctatgacacagggatt 36326765  T
Q  417 aacgttcgtttaatacctccaatggtttc----gaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga 512  Q
    |||||||  |||||||||||||  |||||     ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36326766 aacgttctgttaatacctccaacagtttcaaattaattcacttaagagattaaggagttgtcacttgcagggagaattctaggtcaagagattgggtaga 36326865  T
Q  513 attactaagttaatc 527  Q
    ||||||  |||||||    
T  36326866 attactttgttaatc 36326880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 224 - 527
Target Start/End: Original strand, 16294550 - 16294852
Alignment:
Q  224 attcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 323  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16294550 attcatattaccttgtgtttaatgctttgtgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgacca 16294649  T
Q  324 ctaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttc 423  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16294650 ctaactctggcttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc 16294749  T
Q  424 gtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtt 523  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16294750 -tttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagtt 16294848  T
Q  524 aatc 527  Q
    ||||    
T  16294849 aatc 16294852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 168 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 23673995 - 23673645
Alignment:
Q  168 ctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata 267  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| ||     
T  23673995 ctatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatc 23673896  T
Q  268 gactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacct 367  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||    
T  23673895 gactactaaccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactatccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacct 23673796  T
Q  368 tagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaagg 467  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23673795 aagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaactgtttcgaattcacttaagagattaagg 23673696  T
Q  468 ggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattact 518  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23673695 ggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattact 23673645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32576478 - 32575978
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||||| |||| | |||||||||||| | ||||| ||||||   || ||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||    
T  32576478 agatctagtgggagaccatcaaaactcacagtcagtcatccaatacttgtatgaatccttgtttttatgttagttatcttctactttagctatcaataac 32576379  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||||||||| |  ||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  32576378 taatctctttgtggttgagactt-agatgaatatgatgtaatcctataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtcttta 32576280  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    | |||| ||| || |||| ||||| || || |||||||| || ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||    
T  32576279 tccatattactttttgtt-aatgctttttgcatgtttatcattgactactgatcctaactttatgaatatgcaaattgatcgtatagattgaatgatcac 32576181  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    | |||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  32576180 tgaccctgtcttttgactatgaactaggtaatatgtttaacctaaataatcaagctaaagatagatctttattaggttacgacatagggattaacgttct 32576081  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  32576080 tttaatacctccaacaatttcgaattcagtcaagagattaaggggttgtcacttgtggggagaattctaggtcaagggatttggtagagttactaagtta 32575981  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  32575980 atc 32575978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Original strand, 8426783 - 8426844
Alignment:
Q  359 gtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 420  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8426783 gtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgatttagggattaacg 8426844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 446; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 580
Target Start/End: Complemental strand, 23760417 - 23759838
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760417 ggagcagagacttggagatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacttgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 23760318  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23760317 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacattaatg 23760218  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  23760217 aaagtttagtttttattcatattactttgtgcttagtaccttatgtacgtttatgatagactattaatcctagcgtcgtgaatatgcatattgatcatag 23760118  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760117 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactccgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 23760018  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23760017 agggattaacgttcg-ttaatacctccaatggttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctagggcaagagattgggt 23759919  T
Q  510 agaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctttg 580  Q
    |||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23759918 agaattactaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgatcgtatttaggagtgcaaattaccataggagagctttg 23759838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 394; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Original strand, 11278929 - 11279445
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11278929 ggagcagagacttggagatctggtgggcaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcatttttcttatgttagttagcttatact 11279028  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11279029 ttacctatgagtaactaattcttttgtggttaattcgtgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatg 11279128  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11279129 aaagtttagtctttattcatattaccttgtgcttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaacatgcatattgatcatag 11279228  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11279229 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 11279328  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11279329 agagattaacgttc-attaatacctccaacggtttcagattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaatcctaggtcaagagattgggt 11279427  T
Q  510 agaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11279428 agaattactaagttaatc 11279445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 526
Target Start/End: Original strand, 33312442 - 33312947
Alignment:
Q  12 agcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatacttt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||    
T  33312442 agcagagacttggagatatggtgggaaaccatcgaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttctta---------gcttatacttt 33312532  T
Q  112 agctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  33312533 agctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactccattgaacattaatgaa 33312632  T
Q  212 agtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaa 311  Q
    | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33312633 aatttagtctttattcatattaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaa 33312732  T
Q  312 attgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatag 411  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  33312733 attgaatgaccactaaccctgacttttaactctgaactaggtaatatgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatat 33312832  T
Q  412 ggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtag 511  Q
    |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33312833 ggattaacgttcttttaatacctccgccggtttcgaattcatttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaaagattgggtag 33312932  T
Q  512 aattactaagttaat 526  Q
    |||||||||||||||    
T  33312933 aattactaagttaat 33312947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Original strand, 294301 - 294818
Alignment:
Q  10 ggagcagagactt-ggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatac 108  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  294301 ggagcagagactttggagatctggtgagcaaccatcaaaactaatagtcaatcatccattacatgtatgaatctttcttcttatgttagttagcttatac 294400  T
Q  109 tttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  294401 tttagctatgagtaactaattctcttgtggttaatcct-gagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaat 294499  T
Q  209 gaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcata 308  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||| || |||||||||| |  ||||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  294500 gaaagtataattttaattcatattactttatgtttaatgcttattgtatgtttatcatgaactattaactctagttttatgaatatgcaaattgatctta 294599  T
Q  309 gaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgata 408  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  294600 gagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgaca 294699  T
Q  409 tagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattggg 508  Q
    ||||||||||||||   |||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||    
T  294700 tagggattaacgttttgttaaaacatccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttatggggagaattctagttcaagagattggg 294799  T
Q  509 tagaattactaagttaatc 527  Q
    || |||||||  |||||||    
T  294800 tataattactttgttaatc 294818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 121 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 46847007 - 46846604
Alignment:
Q  121 taactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  46847007 taactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaaccctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtttagtc 46846908  T
Q  221 tttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatga 320  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46846907 tttattcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactattaaccctagctt---gaacatgcatattgatcatggaaattgaatga 46846811  T
Q  321 ccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacg 420  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46846810 tcactaaccctgacttttaactctgaactaagtaataggtttaacctaagtaatcaagttagagatagattattattaggttatgacatagggattaacg 46846711  T
Q  421 ttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaa 520  Q
     || ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||     
T  46846710 atcttttaaaacctccaacgttttcgaattcagttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattattag 46846611  T
Q  521 gttaatc 527  Q
    |||||||    
T  46846610 gttaatc 46846604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Original strand, 6966600 - 6967101
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  6966600 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 6966699  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  6966700 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 6966798  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  6966799 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatattcaaactgatcttagagattaaatgaccac 6966898  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6966899 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 6966998  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6966999 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactttgtta 6967098  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  6967099 atc 6967101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17863887 - 17863386
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  17863887 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 17863788  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  17863787 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 17863689  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||    
T  17863688 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccac 17863589  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  17863588 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 17863489  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  17863488 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgtta 17863389  T
Q  525 atc 527  Q
    |||    
T  17863388 atc 17863386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 39 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 17867132 - 17866645
Alignment:
Q  39 accatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtgg 138  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||||||   ||| |||    
T  17867132 accatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaactaatctctttatgg 17867033  T
Q  139 ttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttg 238  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||     
T  17867032 ttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaattcatattacttta 17866934  T
Q  239 tgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggctttt 338  Q
    ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17866933 tgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgaccactaaccctggctttt 17866834  T
Q  339 aactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaa 438  Q
     |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17866833 gactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaa 17866734  T
Q  439 tggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17866733 cggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 17866645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 25 - 527
Target Start/End: Original strand, 24782858 - 24783362
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  24782858 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtactttagttatgagtaac 24782957  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  24782958 taatctttttgtggttaag-cttaagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccgtagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaa 24783056  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    | |||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  24783057 tccatattactttatgtttgatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccatagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccac 24783156  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacct---tagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgt 421  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24783157 taaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaataatcaagctagagatatatcattattaggttatgacatagggattaacgt 24783256  T
Q  422 tcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaag 521  Q
    ||  |||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  24783257 tctgttaaaatctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtataattactttg 24783356  T
Q  522 ttaatc 527  Q
    ||||||    
T  24783357 ttaatc 24783362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 149 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 36843607 - 36843244
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36843607 agatgaatttgatgtaatcttgtgggaactctaatttgttgaactc-tttgaatgtcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgtttaatgc 36843509  T
Q  249 cttatgtat-gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 347  Q
     || | ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  36843508 tttttatattgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatgttagagattgaatgaccactaatcctggcttttgactctgat 36843409  T
Q  348 ttaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcga 447  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  36843408 ctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaatggtttcga 36843309  T
Q  448 attcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga 512  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36843308 attcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaactctaggtcaagagattgggtaga 36843244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 132 - 526
Target Start/End: Complemental strand, 36222993 - 36222601
Alignment:
Q  132 tttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatca------atgaaagtttagttttta- 224  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||      ||||||||||||| ||||     
T  36222993 tttgtggtta-ttcctgaggtgaatctgatgtaa-cctatgggaatcctaatttgttgaactc-tttgaatatcatattcaatgaaagtttagtctttaa 36222897  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36222896 ttcatattaccttgtgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactagccctagctttatgaacatgcatattgatcatggaaattgaatgaccac 36222797  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  36222796 taaccctcgcttttaactctgaactagctaatagatttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttc- 36222698  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagtta 524  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  36222697 ttaaatacttccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcact-----ggagaattctaggtcaagagattaggtaaaattactaagtta 36222603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 183 - 527
Target Start/End: Original strand, 23107597 - 23107941
Alignment:
Q  183 tttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctag 282  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  23107597 tttgttgaactcctttgaatttcaatgaaagtttagtctttattcatattactttttgtttaatgctttttgcatgtttatcatcgactattaaccctaa 23107696  T
Q  283 ctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctag 382  Q
    | ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  23107697 cgttatgaatatgcaaattgatagtagagattgaatgaccactgacccagacttttgactctgaactaggtaataggtttaacctaagtaatcaagttag 23107796  T
Q  383 agatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcgg 482  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23107797 agatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaatacctcaaacaatttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgg 23107896  T
Q  483 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||| ||| | |||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  23107897 ggagaattatagctcaaggaattgggtagagttactaagttaatc 23107941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 149 - 527
Target Start/End: Original strand, 9765373 - 9765746
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  9765373 agatgaatatgatgtaatcctatgagaaccctaatttgttgaacttctttgaatatgaataaaagtctagtttttattcatattactttatgtttaatgc 9765472  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 348  Q
     || || |||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||      ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||       
T  9765473 gttttgcatgtttaccatcgactattaaccctagctttatggatatgcaaattgatcg-----attgaatgaccactaaccctgacttttgactctggtc 9765567  T
Q  349 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 448  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||   |||| ||||| ||||||||||||    
T  9765568 taggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatgattattaggttatgacataaggactaatgttttgttaaaacctctaatggtttcgaa 9765667  T
Q  449 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||| ||||||||||  | | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  9765668 ttcacttaagagattaagggtattttacttgcagggagaattataggtcaagagattgggtagagttactttgttaatc 9765746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 3862607 - 3862190
Alignment:
Q  106 tactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||   ||||| ||| |  ||| || ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  3862607 tactttagctatgggtaactaatctctttgtagttgagactt-agttgaatctaatgtaatcttatgagaaccctaatttgttgaactcctttaaatatc 3862509  T
Q  206 aatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatc 305  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  | ||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |||       || ||| |||| | || ||    
T  3862508 aatgaaagtctagtttttatttatatcatcttgtttttaatgctttgtgtatgtttattattgactactagccc-------ataaatttgcagactggtc 3862416  T
Q  306 atagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatg 405  Q
     ||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |  ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3862415 ttagaacttaattgaccactaaccctggctttaaactctgaactaggtggtgtgtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatg 3862316  T
Q  406 atatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaa----gattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaaga 501  Q
    ||||||||||||| |  || |||| || |||||  |||| |||||||||||| |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3862315 atatagggattaaaggacggttaaaacttccaacagttttgaattcacttaagacattaattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaaga 3862216  T
Q  502 gattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||||||  |||||||    
T  3862215 gattgggtagaattactttgttaatc 3862190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23313871 - 23313673
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||| || ||||||||||    
T  23313871 agatgaatccgatgtaatcttatgggaactctaatttgttaaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtctttattcatgttactttatgtttaatgc 23313772  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 347  Q
     || ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23313771 tttttgtatgtttatcatcgactacaaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccttggcttttgactctgaa 23313673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 35773324 - 35773054
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  35773324 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgtgagttatcttgtacgttagatatgagtaac 35773225  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||||||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||  |||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35773224 taatctgtttgtggttgagact-gagatgaatcttatgtaatcctataagaactctaatttgttgaactcatttgaatgtcaatgaaagtttagttttta 35773126  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgta-tgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatg 295  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35773125 ttcatattactttgtgttaaatgctttttgtattgtttatcatcaactactaaccctaactttatgaatatg 35773054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 23313671 - 23313562
Alignment:
Q  408 atagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 507  Q
    |||||| |||||||||  |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23313671 ataggggttaacgttctgttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggtttccacttgcggggagaattctaggccaagagattgg 23313572  T
Q  508 gtagaattac 517  Q
    ||||| ||||    
T  23313571 gtagagttac 23313562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 468
Target Start/End: Original strand, 2719269 - 2719438
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattatta 398  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |  ||| | |||||  || |||||  | ||||| | | |||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  2719269 attgatcatagaatttgaatgactactagccctagtgtttgaatctgatctaagtaatccgattaacttaattaattaagctagagatagacaattgtta 2719368  T
Q  399 ggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 468  Q
     |||||||| ||  |||||||| ||  | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2719369 agttatgatttatagattaacgatctataaaaacctccaacggttttgaattcacttaagagattaaggg 2719438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 466
Target Start/End: Original strand, 27796686 - 27796727
Alignment:
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaag 466  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27796686 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaag 27796727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7801 - 7284
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7801 ggagcagagacttggagatccggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctctacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 7702  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7701 ttagttatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacataaatg 7602  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7601 aaagtttagtttttattcatattactttgagtttaatgctttatgtatgtttatcatcgactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 7502  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7501 aatttgattgaccactaaccctggctttttactcagaactaggtaataggtttaacctaagtaataaagctagagatagatcattattaggttatgacat 7402  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |    
T  7401 agggattaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaagtcaagagattgaat 7302  T
Q  510 agaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7301 agaattactaagttaatc 7284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 527
Target Start/End: Original strand, 2128 - 2647
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2128 ggagcagagacttggggatctggtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatcctttctcttatgttagttaacttatact 2227  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2228 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctaagatgaatctgatgtaatcctacgggaaccctaatttgttgaactcctttgaacttcaatg 2327  T
Q  210 aaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 309  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 aaagtttagtctttattcatattactttgtgtttaatgctttatgtatgtttatcatcaactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatag 2427  T
Q  310 aaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatat 409  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2428 aaaataaatgaccactaaccctggctttttactctgaactaggtaataggtttgacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacat 2527  T
Q  410 agggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggt 509  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  2528 agggatcaacgttcttttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagatttaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgagt 2627  T
Q  510 aga--attactaagttaatc 527  Q
    |||  |||||||||||||||    
T  2628 agaatattactaagttaatc 2647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 3416 - 2903
Alignment:
Q  10 ggagcagagac-ttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatac 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3416 ggagcagagaccttggagatctggtgggcaaccatcaaaactaagagtcaatcatcctttacatgtatgaatccttcttcttatgttagttagcttatac 3317  T
Q  109 tttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||  | |||    
T  3316 tttagctatgagtaactaattcttttgtggtta-ttcctgagatgaatcttatgtaatcttatggaaatcctaatttgttgaactcatttgaatttaaat 3218  T
Q  209 gaaagtttagtttttattcatactacct---tgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcttt-atgaatatgcatattgat 304  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||| |   |||||||||||  || ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3217 gaaagtttagtctttactcatattacttctttgtgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagcttttatgaatatgcaaattgat 3118  T
Q  305 catagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttat 404  Q
    || |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3117 cacagaatttgaatgaacactaaccatggctttcaactctgaactaggtaatacgtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattat 3018  T
Q  405 gatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagat 504  Q
    || | | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3017 gacacaaggattaacgttcttttaatacctccaatagttttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagat 2918  T
Q  505 tgggtagaattacta 519  Q
    | |||||||||||||    
T  2917 ttggtagaattacta 2903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 21 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 32506650 - 32506146
Alignment:
Q  21 ttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgag 120  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  32506650 ttggagatctggtgggcaaccatcaaaactcatagtcaatcatccaatacacgtatgaatccttgtttttacgttagttatcttgtactttagctatgag 32506551  T
Q  121 taactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactccttt--gaacatcaatgaaagtttag 218  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||    
T  32506550 taactaattcttttgtgattaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctagtttgttgaactcctttttgaatatcaatgaaagtctag 32506452  T
Q  219 tttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaat 318  Q
    |||| |   ||| ||| || |||||||||  || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||    
T  32506451 ttttaa---atattactttatgtttaatgttttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaatcgatcttagagattgaat 32506355  T
Q  319 gaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaa 418  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32506354 gaccactaaccctgacttttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagataggtcattattaggttatgacatagggattaa 32506255  T
Q  419 cgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattact 518  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32506254 cgttctgttaatacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattact 32506155  T
Q  519 aagttaatc 527  Q
      |||||||    
T  32506154 ttgttaatc 32506146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 69 - 527
Target Start/End: Original strand, 13492759 - 13493216
Alignment:
Q  69 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcc 168  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||||  ||||||||| ||||   |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||     
T  13492759 acatgtatgaatccttgtttttatgtgagttttcttgtactttatttatgagtaattaatctctttgtggttaaa-cttgagataaatttgatgtaatct 13492857  T
Q  169 tatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatag 268  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |    
T  13492858 tatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 13492957  T
Q  269 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctt 368  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  13492958 actactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgatctaggtaataagtttaaccta 13493057  T
Q  369 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13493058 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggg 13493157  T
Q  469 gttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13493158 gttgtcacatgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 13493216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 27282842 - 27282399
Alignment:
Q  83 tttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaa 182  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27282842 ttttttttatgtgagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctctttgtggttaatcct-gagatgaatctgatataatcctatgggaaccctaa 27282744  T
Q  183 tttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctag 282  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||| | || ||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  27282743 tttgttgaacacctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatcctttttgtatctttatcatcgactactaaccctag 27282644  T
Q  283 ctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctag 382  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  27282643 ctttatgaatatgaaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctggattttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctag 27282544  T
Q  383 agatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcgg 482  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27282543 agatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttcttttaaaacctccaacgattttgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcgg 27282444  T
Q  483 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27282443 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 27282399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 69 - 518
Target Start/End: Original strand, 13495484 - 13495932
Alignment:
Q  69 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcc 168  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||  ||| |||||||| ||||||||||||||   |||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||    
T  13495484 acatgtatgaatccttgtttttatgtgagttgtcttgtactttagttatgagtaactaatctctttgtggttaaa-cttgagataaatatgatgtaatcc 13495582  T
Q  169 tatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatag 268  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |    
T  13495583 tatgggaaccctagtttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcg 13495682  T
Q  269 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctt 368  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||     
T  13495683 actactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctagcttttgactctgatctaggtaataagtttaaccta 13495782  T
Q  369 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13495783 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgctaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaaggg 13495882  T
Q  469 gttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattact 518  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  13495883 gttgtcacttgcgggtagaattctaggtcaagagattggatataattact 13495932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 158 - 527
Target Start/End: Original strand, 34065929 - 34066298
Alignment:
Q  158 tgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtat 257  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||     
T  34065929 tgatgtaatcttatgggaatcctaatttgttgaacttttttgaatatcaatgaaaatctagttttaattcatattacgttatgtttaatgctttttgtac 34066028  T
Q  258 gtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaata 357  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  34066029 gtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccctggcttttgactctgacctaggtaata 34066128  T
Q  358 ggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaa 457  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  34066129 agtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgacatagagattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaa 34066228  T
Q  458 aagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  34066229 gagattaaggggttgtcacttgcggagagaattcaaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 34066298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16190969 - 16190487
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  16190969 agatctggtgggcaaccatcaaaattcatagtcaatcatccaatacatgtatgaatccttgtttttatgttagttatcgtttactttagctataagtaac 16190870  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactccttt-----gaacatcaatgaaagtttagt 219  Q
    ||||   ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||     ||| |||||||||||| ||||    
T  16190869 taatctatttgtggttgagtctt-agatgaatctgatgtaatcttataggaaccctaatttgttgaactcctttaatttgaatatcaatgaaagtctagt 16190771  T
Q  220 ttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatg 319  Q
    ||| ||| ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||    
T  16190770 tttaatttatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgactactaaccttagctttatgaatatgcaaattgatcctagagattggatg 16190671  T
Q  320 accactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaac 419  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||         
T  16190670 accactaaccttggcttttaactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagttagagatagatcaatattaggttatgacataggga----- 16190576  T
Q  420 gttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaag----attaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggta 510  Q
          |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16190575 ------ttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagattaattaaggggttgtcactcgtggggagaattatgggtcaagagattgggta 16190487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 73 - 527
Target Start/End: Original strand, 1936128 - 1936580
Alignment:
Q  73 gtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatg 172  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1936128 gtatgaatccttgtttctatggtagttatcttgtactttagctatgagtaactaatctctttgtggttgagactt-agatgaatctcatgtaatcttatg 1936226  T
Q  173 ggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagacta 272  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  1936227 ggaaccataatttgttgaactcctttgaatatcaatggaagtctagttttaattcatattactttatgtttaatgctttttgtatgtttatcatcgacta 1936326  T
Q  273 ttaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagta 372  Q
     |||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||  | | |||   |||||||| ||||||||| ||||    
T  1936327 ctaaccctaactttatgaatatgaaaattgatcttagagattaaatgaccactaaccatggctttcgaatttgatccaggtaataagtttaacctaagta 1936426  T
Q  373 atcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttg 472  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  1936427 atcatgctagagatagatcattattaggttatgacatagggaataacattcttttaaaacct-caaacgtttcaaattcacttaagagattaagggattg 1936525  T
Q  473 tcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    | |||||||||||||| | ||  | |||||||| |||||| |||||  |||||||    
T  1936526 ttacttgcggggagaactataaatcaagagatttggtagagttactttgttaatc 1936580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 232 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 22104956 - 22104683
Alignment:
Q  232 taccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccct 331  Q
    ||||||||||||||||  || |||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22104956 taccttgtgtttaatgttttgtgtaggtttatcatcgactactaactctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaattct 22104857  T
Q  332 ggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaata 431  Q
    || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22104856 ggtttttaactctgaactatgtaataggtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttc-tttaata 22104758  T
Q  432 cctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgg 507  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22104757 cctccaacgattttgaattcacttaagagattaa-ggtctgtcacttacggggagaattctaggtcaagagattgg 22104683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 152 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 23990754 - 23990380
Alignment:
Q  152 tgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgcctt 251  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||||| ||||| | ||  || | || ||||  ||    
T  23990754 tgaatctgatttaatcttatgggaacactaatttgttgaactcctctgaatatttaagaaagtctagttttaattcacattatattatcttcaatgtttt 23990655  T
Q  252 atgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatc--at--agaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 347  Q
     ||||||||||| || ||||| |||     |||||||||||||||| |||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  23990654 ttgtatgtttatcattgactactaa-----gctttatgaatatgcaaattgatctaattaagagattgaatgaccactaaccctggcttttgactctgat 23990560  T
Q  348 ttaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcga 447  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  23990559 ctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagattgatcattattaggttatgacatagggattaacgttctgttaaaacctccaacggtttcga 23990460  T
Q  448 attcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  23990459 attcacttaagagtttaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagtgattgggtagaattactttgttaatc 23990380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 314 - 527
Target Start/End: Original strand, 39545983 - 39546196
Alignment:
Q  314 tgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatataggg 413  Q
    |||||||| ||||||  ||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39545983 tgaatgacaactaacaatggattttgactctgatctaggtaataagtttaacttaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacataggg 39546082  T
Q  414 attaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaa 513  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  39546083 attaacgttctattaaaacctccaacgatttcgaattcacttaagagattaaggggttgttacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagag 39546182  T
Q  514 ttactaagttaatc 527  Q
    |||||  |||||||    
T  39546183 ttactttgttaatc 39546196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 188 - 527
Target Start/End: Original strand, 21152871 - 21153209
Alignment:
Q  188 tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagcttta 287  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||||||   | | |||||||||||| ||||| || | ||||| |      
T  21152871 tgaactcccttgaatatcaatgaaagtctagttta-attcatatttccttctgtttaatgttgtttatatgtttatgattgactactagcactagcatct 21152969  T
Q  288 tgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagata 387  Q
    ||||| || | ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21152970 tgaatgtgtaaattgaacttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgatctagggaatatatttaacctaagtaattaagctagagata 21153069  T
Q  388 gatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggaga 487  Q
    ||   ||||||||||||||| ||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21153070 gacagttattaggttatgatttagggattaacggactattaaaacctccaaaggtttcaaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagaga 21153169  T
Q  488 attctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  21153170 attctaggtcaagagattgagtagaattactgtgttaatc 21153209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 313 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22453641 - 22453427
Alignment:
Q  313 ttgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagg 412  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||   | |    
T  22453641 ttgaatgaccactagccctggcttttgactctgatttaggtaataggtttaacctaagtaattaagctagagatagaaaattattaggttatgactcatg 22453542  T
Q  413 gattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga 512  Q
    ||||||||  |  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22453541 gattaacggactgttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggagagaattctaggtcaagagattgggtaga 22453442  T
Q  513 attactaagttaatc 527  Q
    ||||||  |||||||    
T  22453441 attactttgttaatc 22453427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 188 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 22457123 - 22456792
Alignment:
Q  188 tgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgata--gactattaaccctagc-t 284  Q
    |||||||| |||||  | |||| |||| ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||   | ||||||||||| |||  ||||| || | ||||| |    
T  22457123 tgaactcccttgaattttaatggaagtctagttttaattcatattacctt-tgttcaatgttgtttgtatgtttattatattgactactagcactagcgt 22457025  T
Q  285 ttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagag 384  Q
    || |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22457024 ttttgaatatgcaaactgatcttagaacttgaatgaccactagccctgacttttgactctgttttaggtaataggtttaacctaagtaattaagcaagag 22456925  T
Q  385 atagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcgggg 484  Q
    |||||  |||||||||||||||   | |||||||||  |  |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |    
T  22456924 atagaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaacagtttcgaattcacttaagagattaa-gagttgtcacttgcggag 22456826  T
Q  485 agaattctaggttaagagattgggtagaattact 518  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22456825 agaattctaggtcaagagattgggtagaattact 22456792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 288 - 527
Target Start/End: Original strand, 15297047 - 15297286
Alignment:
Q  288 tgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagata 387  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| | |||||  |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  15297047 tgaatatgcaaattgatcttagaacttgaatgaccactagctctggcttttgaatctgatctaggtaatagttttaacctaagtaattaagttagagata 15297146  T
Q  388 gatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggaga 487  Q
    ||  |||||||||||||||   | |||||||||  |  |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||    
T  15297147 gaaaattattaggttatgactcatggattaacggactgttaaaacctccaacagtttcaaattcacttaagagatttaagggttgtcacttgcagagaga 15297246  T
Q  488 attctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15297247 attctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 15297286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 263
Target Start/End: Original strand, 10759574 - 10759811
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   |||| |||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  10759574 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatatatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 10759673  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  10759674 taatctctttatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 10759772  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttat 263  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || |||||||||||    
T  10759773 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttat 10759811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 483 - 527
Target Start/End: Original strand, 10764829 - 10764873
Alignment:
Q  483 ggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10764829 ggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactttgttaatc 10764873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 376 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 4205055 - 4204975
Alignment:
Q  376 aagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcactta 456  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||  | ||||||||||||  |  |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4205055 aagctagagatagacaattgctaggttatagtttagggattaacggactattaaaacctccaacggtttcgaattcactta 4204975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 259 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 24743 - 24414
Alignment:
Q  259 tttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaatag 358  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24743 tttatgatagactattaaccatagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaaccaggtaatag 24644  T
Q  359 gtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaa 458  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  24643 gtttaacctaagtaatcaagctagagatatatcattattaggttatgatatagggattaacgtttatttaattcctccaatggtttcgaattcacataag 24544  T
Q  459 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatccgt----------aataatcattgattgtat 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||| |||||||    
T  24543 agattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaattactaagttaatccgtcgtgatactaaataatcatttattgtat 24444  T
Q  549 ttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24443 ttaggagtgcaaattaccataggagagctt 24414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 317 - 578
Target Start/End: Original strand, 9606 - 9877
Alignment:
Q  317 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggatt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9606 atgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctaagtaatcaagctaaagatagatcattattaggttatgatatagggatt 9705  T
Q  417 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaatta 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9706 aacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaagagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtagaatta 9805  T
Q  517 ctaagttaatccgt----------aataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 578  Q
    ||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9806 ctaagttaatccgtcgtgaaactaaataatcattgattgtatttaggagtgcaaattgccataggagagctt 9877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0440; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 172
Target Start/End: Original strand, 9446 - 9608
Alignment:
Q  10 ggagcagagacttggagatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 109  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9446 ggagtagagacttagagatctagtgggaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatact 9545  T
Q  110 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatg 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9546 ttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcctgagatgaatctgatgtaatcctatg 9608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 69 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12576048 - 12575591
Alignment:
Q  69 acatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaactaattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcc 168  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||   ||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  12576048 acatgtatgaatcattgtttttatgttagttatcttgtactttagcgatgagtaactaatctctttgtggttgagactt-agatgaatctgatgtaatcc 12575950  T
Q  169 tatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatag 268  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || || || ||||| ||||| ||      
T  12575949 tataggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagtttttattcatattactttgtgttcaacgctttttgtatctttatcatca 12575850  T
Q  269 actattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaacctt 368  Q
    || | || ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||   |||||||||||||||| |     
T  12575849 acaactagccctaactttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgactactaaccttggcttttgactttgatcaaggtaataggtttaacata 12575750  T
Q  369 agtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggg 468  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  12575749 agtaatcaagttagagatagatcattattaggttatgatataaggattaacgtattgttaaaacctccaatggtttctaattcacttaagagattaa-gg 12575651  T
Q  469 gttgtcacttgcggggagaattctagg-ttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  12575650 gttgttacttgcggggagaattctaggtttaagagattaggtagaattactttgttaatc 12575591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 149 - 527
Target Start/End: Original strand, 13096606 - 13096975
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||          |||||||||    
T  13096606 agatgaacctgatgtaatcctatgggaaccctgatttattgaactcctttgaatatcaatgaaagtctagttttaattgat----------gtttaatgc 13096695  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaac-cctggc-ttttaactctga 346  Q
     || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13096696 ttt-tgtatgtttatcatcgactactatccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgatcactaactcctggccttttaactctga 13096794  T
Q  347 attaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcg 446  Q
      ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||| | ||||||     
T  13096795 cctaggtaataagtttaagctaagtaatcaagctagagatagatcattattagattatgacatagggatttacgttctgttaaaacctcccacggtttca 13096894  T
Q  447 aattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaagttaatc 527  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13096895 aattcacttaagacattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggccaagagattgggtagaattactttgttaatc 13096975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 180 - 520
Target Start/End: Original strand, 44007909 - 44008247
Alignment:
Q  180 taatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| || |||  | |||||||||| || | ||||||||| || ||||||| ||||    
T  44007909 taatttgttgaactcctttgaatttcaattaaagtttagtctttattcttattactctttgtttaatgcttttt-tatgtttatcatcgactattgaccc 44008007  T
Q  280 tagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagc 379  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||| || ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  44008008 tagctttatgaaaatgcaaattgaccgtagagattgaatgaacactgactctggcttttgattctgaactaggtaataagtttaacctaactaatcaagc 44008107  T
Q  380 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttg 479  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  44008108 tagaaatagatcattgttaggttacgacacagggattaacgttcttttaatacctccaacgatttcaaattcacttatgagattaaggagttgtcacttg 44008207  T
Q  480 cggggagaattctaggttaagagattgggtagaattactaa 520  Q
    | |||||||||||||||  || |||| |||||| |||||||    
T  44008208 c-gggagaattctaggtcgagggatttggtagagttactaa 44008247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 340 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 41779213 - 41779048
Alignment:
Q  340 actctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaat 439  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||       ||||| |     |    
T  41779213 actctgaactaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattgac------ataataac-atttt 41779121  T
Q  440 ggtttcgaattcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga 512  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41779120 ggttttgaattcacttaagatattaaggggttgccacttgcggggagaattctaggtcaagagattgggtaga 41779048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 41779317 - 41779232
Alignment:
Q  178 cctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttat 263  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||  ||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  41779317 cctaatttgttgaactcctttaaatatcaatgaaagtttagtctttatccatgttactttatgtttaatgctttttgtatgtttat 41779232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 424
Target Start/End: Original strand, 14418355 - 14418399
Alignment:
Q  380 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14418355 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgttcg 14418399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 347
Target Start/End: Original strand, 13331937 - 13331985
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaa 347  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  13331937 attgatcttaggaattgaatgactactaaccctagcttttaattctgaa 13331985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 149 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 6479 - 6117
Alignment:
Q  149 agatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagtttttattcatactaccttgtgtttaatgc 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||  ||| || ||||||||||    
T  6479 agatgaatctgatgtaatcttatgggaaccttaatttgttgaactcctttgaatatcaatgaaagtc-agtgtttattcatgttactttatgtttaatgc 6381  T
Q  249 cttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaactctgaat 348  Q
     || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  6380 tttttgtatgtttatcatcgactactaaccctagctttatgaatatgcaaattgatcttagagattgaatgaccactaaccctgacttttgactctgaac 6281  T
Q  349 taggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcgtttaatacctccaatggtttcgaa 448  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||| |||    
T  6280 taggtaataagtttaatctaagtaatcaacctagagatagatcattattaggttatgacatagggtttaacgttctgttaaaacctccaatgattttgaa 6181  T
Q  449 ttcacttaaaagattaaggggttgtcacttgcggggagaattctaggttaagagattgggtaga 512  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6180 ttcacttaagagattaaggggttgccacttgcggggagaattctagatcaagagattgggtaga 6117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0665 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0665
Description:

Target: scaffold0665; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 437 - 1
Alignment:
Q  25 agatctggtggaaaaccatcaaaactaagagtcaatcatccttcacatgtatgaatcctttttcttatgttagttagcttatactttagctatgagtaac 124  Q
    |||| |||||| | ||||||| |||| | ||||||| ||||   ||||||||||||||||  | |||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||    
T  437 agatttggtgggagaccatcacaactcatagtcaattatccaatacatgtatgaatccttgattttatgtgagttatcttgtactgtagttatgagtaac 338  T
Q  125 taattcttttgtggttaattcttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaatcctaatttgttgaactcctttgaacatcaatgaaagtttagttttta 224  Q
    ||||   ||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |    
T  337 taatctcttcatggttaag-cttgagatgaatctgatgtaatcctatgggaaccctaatttgttgaactcctttgaatatcattgaaagtctagttttaa 239  T
Q  225 ttcatactaccttgtgtttaatgccttatgtatgtttatgatagactattaaccctagctttatgaatatgcatattgatcatagaaattgaatgaccac 324  Q
    |||||| ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||    
T  238 ttcatattactttatgttttatgctttttgtatgtttatcattgactactaaccctagctttatgaatatgcaaactgatcttagagattaaatgactac 139  T
Q  325 taaccctggcttttaactctgaattaggtaataggtttaaccttagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  138 taaccctggtttttgactctgatctaggtaataagtttaacctaagtaatcaagctagagatagatcattattaggttatgacatagggattaacgttct 39  T
Q  425 tttaatacctccaatggtttcgaattcacttaaaagat 462  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38 tttaaaacctccaacggtttcgaattcacttaagagat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 380 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 319
Alignment:
Q  380 tagagatagatcattattaggttatgatatagggattaacgttcg 424  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  363 tagagatagatcattattagattatgatatagggattaacgttcg 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 340
Target Start/End: Original strand, 7086 - 7127
Alignment:
Q  299 attgatcatagaaattgaatgaccactaaccctggcttttaa 340  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  7086 attgatcttagaaattgaatgactactaaccctagcttttaa 7127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University