View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9876_low_19 (Length: 253)

Name: NF9876_low_19
Description: NF9876
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9876_low_19
NF9876_low_19
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (19-232)||(8630640-8630853)
chr7 (44-234)||(22649701-22649891)
chr7 (44-236)||(30181029-30181221)
chr7 (43-234)||(20346486-20346677)
chr7 (44-234)||(24792339-24792529)
chr7 (45-234)||(7164184-7164373)
chr7 (44-234)||(12101185-12101375)
chr7 (44-234)||(33359097-33359287)
chr7 (44-234)||(42965003-42965193)
chr7 (44-234)||(43067980-43068170)
chr7 (46-234)||(3511324-3511512)
chr7 (46-234)||(5280861-5281049)
chr7 (47-230)||(4477332-4477515)
chr7 (44-234)||(933284-933474)
chr7 (44-234)||(42204153-42204344)
chr7 (44-230)||(6394750-6394936)
chr7 (50-234)||(43156718-43156902)
chr7 (48-234)||(1803029-1803215)
chr7 (44-234)||(15655911-15656101)
chr7 (44-234)||(25748486-25748676)
chr7 (44-237)||(4347272-4347465)
chr7 (44-234)||(12097597-12097787)
chr7 (44-234)||(32041541-32041731)
chr7 (44-234)||(33846536-33846721)
chr7 (46-234)||(9452591-9452779)
chr7 (44-234)||(36890837-36891026)
chr7 (48-234)||(38866547-38866733)
chr7 (47-234)||(42673467-42673650)
chr7 (45-234)||(46134311-46134500)
chr7 (46-234)||(46891346-46891535)
chr7 (45-232)||(17753600-17753787)
chr7 (80-234)||(48865665-48865822)
chr7 (80-233)||(16894515-16894668)
chr7 (44-190)||(19828269-19828415)
chr7 (44-234)||(43021587-43021773)
chr7 (47-188)||(37005864-37006005)
chr7 (44-134)||(37704979-37705069)
chr7 (44-180)||(43405019-43405155)
chr7 (50-139)||(27691428-27691517)
chr7 (44-195)||(36849583-36849734)
chr7 (48-188)||(15655465-15655605)
chr7 (44-180)||(30075292-30075425)
chr7 (112-179)||(20163886-20163953)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (44-234)||(14422703-14422893)
chr8 (48-234)||(10836772-10836958)
chr8 (44-234)||(18594537-18594727)
chr8 (44-234)||(39206586-39206776)
chr8 (44-234)||(29938061-29938251)
chr8 (46-234)||(13110406-13110594)
chr8 (47-234)||(144397-144584)
chr8 (48-234)||(2042541-2042727)
chr8 (44-234)||(24113183-24113373)
chr8 (44-234)||(35118048-35118238)
chr8 (49-234)||(34679474-34679659)
chr8 (43-230)||(34842386-34842573)
chr8 (44-234)||(22260647-22260837)
chr8 (44-234)||(33278400-33278590)
chr8 (44-230)||(39218777-39218963)
chr8 (44-234)||(4035847-4036037)
chr8 (44-234)||(38167172-38167362)
chr8 (44-234)||(6144290-6144480)
chr8 (46-228)||(34998919-34999101)
chr8 (45-234)||(7791412-7791601)
chr8 (47-234)||(41575516-41575703)
chr8 (48-234)||(7774768-7774954)
chr8 (50-234)||(44804961-44805145)
chr8 (44-230)||(5320564-5320750)
chr8 (46-234)||(28639280-28639470)
chr8 (44-234)||(7811995-7812185)
chr8 (46-234)||(8021721-8021901)
chr8 (44-200)||(33287076-33287232)
chr8 (44-200)||(40117903-40118059)
chr8 (44-234)||(36491157-36491347)
chr8 (48-183)||(26783801-26783936)
chr8 (48-234)||(42571598-42571781)
chr8 (47-227)||(66203-66384)
chr8 (123-234)||(9807339-9807450)
chr8 (44-188)||(2322075-2322219)
chr8 (49-172)||(5005171-5005294)
chr8 (46-131)||(9806875-9806960)
chr8 (46-188)||(39220258-39220400)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (44-234)||(26704356-26704546)
chr6 (44-234)||(26946893-26947083)
chr6 (44-234)||(2837545-2837735)
chr6 (44-234)||(6086616-6086806)
chr6 (44-234)||(3347540-3347730)
chr6 (44-234)||(21893455-21893645)
chr6 (48-234)||(30691855-30692041)
chr6 (45-234)||(3955783-3955972)
chr6 (44-231)||(9459563-9459750)
chr6 (46-234)||(17261090-17261278)
chr6 (44-234)||(20726791-20726977)
chr6 (44-234)||(16307025-16307215)
chr6 (44-234)||(18613538-18613728)
chr6 (47-230)||(34887313-34887496)
chr6 (54-234)||(1153603-1153783)
chr6 (44-234)||(11167240-11167430)
chr6 (48-234)||(30698946-30699132)
chr6 (44-230)||(35198284-35198469)
chr6 (46-234)||(28199525-28199714)
chr6 (44-207)||(52836-52999)
chr6 (114-234)||(33464399-33464519)
chr6 (137-234)||(53001-53098)
chr6 (46-122)||(33463703-33463779)
[»] chr5 (29 HSPs)
chr5 (44-234)||(1579037-1579227)
chr5 (44-234)||(1605588-1605778)
chr5 (44-234)||(9008074-9008264)
chr5 (44-234)||(27420859-27421049)
chr5 (44-232)||(27679188-27679376)
chr5 (44-234)||(4120938-4121128)
chr5 (46-234)||(16069356-16069544)
chr5 (47-234)||(24105688-24105875)
chr5 (48-234)||(16737464-16737650)
chr5 (44-234)||(33491213-33491403)
chr5 (49-234)||(3386503-3386688)
chr5 (44-236)||(20992161-20992353)
chr5 (44-230)||(5202973-5203159)
chr5 (44-234)||(8374356-8374545)
chr5 (46-234)||(3921584-3921772)
chr5 (44-232)||(19358527-19358715)
chr5 (47-234)||(31883148-31883335)
chr5 (44-234)||(33991141-33991331)
chr5 (50-234)||(1165618-1165802)
chr5 (44-234)||(35782661-35782851)
chr5 (44-234)||(38598467-38598657)
chr5 (48-230)||(31410481-31410663)
chr5 (80-234)||(26602959-26603113)
chr5 (88-234)||(27025001-27025147)
chr5 (44-178)||(20992354-20992492)
chr5 (51-184)||(33284642-33284775)
chr5 (193-234)||(35420441-35420482)
chr5 (72-179)||(31638174-31638281)
chr5 (109-162)||(41818552-41818605)
[»] chr4 (62 HSPs)
chr4 (44-234)||(38055155-38055345)
chr4 (44-234)||(6611365-6611555)
chr4 (48-234)||(15241033-15241219)
chr4 (44-234)||(23776464-23776654)
chr4 (45-234)||(1756769-1756958)
chr4 (46-234)||(20877047-20877235)
chr4 (43-234)||(11639583-11639774)
chr4 (44-234)||(19913635-19913825)
chr4 (44-234)||(27488653-27488843)
chr4 (44-234)||(50055106-50055296)
chr4 (44-234)||(54189543-54189733)
chr4 (44-234)||(37464719-37464909)
chr4 (44-234)||(45424539-45424729)
chr4 (44-234)||(53717469-53717659)
chr4 (46-234)||(31969681-31969869)
chr4 (44-234)||(14987790-14987980)
chr4 (44-234)||(23704214-23704404)
chr4 (44-234)||(28032717-28032907)
chr4 (44-234)||(44784922-44785112)
chr4 (44-234)||(50353799-50353989)
chr4 (46-234)||(8591097-8591285)
chr4 (43-234)||(40428725-40428916)
chr4 (44-234)||(2481413-2481603)
chr4 (44-230)||(37968766-37968952)
chr4 (45-234)||(54412627-54412816)
chr4 (46-234)||(1617084-1617272)
chr4 (47-234)||(19164978-19165164)
chr4 (46-234)||(30423570-30423757)
chr4 (46-234)||(35490778-35490966)
chr4 (44-232)||(48909844-48910032)
chr4 (46-234)||(52139203-52139391)
chr4 (44-234)||(6688632-6688816)
chr4 (47-234)||(16700782-16700969)
chr4 (44-234)||(47632032-47632223)
chr4 (47-234)||(53875658-53875845)
chr4 (44-234)||(8932183-8932373)
chr4 (44-234)||(15669181-15669371)
chr4 (47-234)||(43289965-43290152)
chr4 (44-234)||(27536109-27536295)
chr4 (45-234)||(44375844-44376033)
chr4 (44-234)||(44379192-44379382)
chr4 (61-234)||(33703856-33704029)
chr4 (49-217)||(28360433-28360602)
chr4 (44-234)||(53353053-53353251)
chr4 (50-232)||(27583639-27583821)
chr4 (61-234)||(38071328-38071498)
chr4 (50-234)||(40680043-40680227)
chr4 (47-234)||(30171581-30171768)
chr4 (44-195)||(50053441-50053592)
chr4 (44-234)||(55344830-55345020)
chr4 (72-236)||(16703847-16704011)
chr4 (123-232)||(23269053-23269162)
chr4 (46-131)||(23265865-23265950)
chr4 (44-188)||(44548192-44548337)
chr4 (112-188)||(51780769-51780845)
chr4 (164-234)||(53408137-53408208)
chr4 (83-188)||(17493370-17493475)
chr4 (192-234)||(23261891-23261933)
chr4 (148-234)||(9595907-9595982)
chr4 (137-190)||(55344724-55344777)
chr4 (44-91)||(9595983-9596029)
chr4 (202-234)||(50055301-50055333)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (44-234)||(22968-23158)
[»] chr3 (38 HSPs)
chr3 (44-234)||(15520145-15520335)
chr3 (44-234)||(25999383-25999573)
chr3 (44-234)||(37698146-37698336)
chr3 (44-234)||(42307908-42308098)
chr3 (45-234)||(38856089-38856278)
chr3 (44-234)||(8042602-8042792)
chr3 (46-234)||(32244117-32244305)
chr3 (44-234)||(22174993-22175183)
chr3 (44-234)||(46452165-46452355)
chr3 (49-233)||(21581042-21581226)
chr3 (44-234)||(20842351-20842541)
chr3 (44-234)||(29445483-29445673)
chr3 (44-234)||(50528924-50529114)
chr3 (44-234)||(12117661-12117851)
chr3 (44-234)||(25494288-25494478)
chr3 (44-234)||(54870177-54870367)
chr3 (46-234)||(32359256-32359444)
chr3 (44-234)||(15520631-15520821)
chr3 (44-234)||(20699144-20699334)
chr3 (44-232)||(24835704-24835892)
chr3 (44-234)||(35226442-35226632)
chr3 (44-234)||(38933941-38934130)
chr3 (44-230)||(54534335-54534519)
chr3 (49-234)||(44609336-44609521)
chr3 (61-234)||(42104974-42105147)
chr3 (44-234)||(34700336-34700526)
chr3 (44-233)||(26122809-26122998)
chr3 (44-220)||(2895180-2895356)
chr3 (72-234)||(44688784-44688945)
chr3 (43-201)||(35643211-35643369)
chr3 (49-234)||(48925006-48925189)
chr3 (94-234)||(16354391-16354531)
chr3 (49-183)||(50529827-50529961)
chr3 (44-234)||(53028220-53028402)
chr3 (72-236)||(12915930-12916093)
chr3 (44-177)||(49128044-49128177)
chr3 (163-234)||(24366143-24366214)
chr3 (170-234)||(13696914-13696978)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (44-234)||(41928512-41928702)
chr1 (44-232)||(1168501-1168689)
chr1 (44-234)||(2347654-2347845)
chr1 (44-234)||(16052094-16052284)
chr1 (44-234)||(25897372-25897562)
chr1 (44-234)||(33510482-33510672)
chr1 (44-234)||(39260363-39260553)
chr1 (45-234)||(26663257-26663446)
chr1 (49-234)||(29078519-29078704)
chr1 (46-234)||(19715178-19715366)
chr1 (44-224)||(29288147-29288327)
chr1 (44-236)||(32671577-32671769)
chr1 (44-234)||(20089469-20089659)
chr1 (44-234)||(26580287-26580477)
chr1 (44-234)||(52753164-52753354)
chr1 (49-234)||(38829072-38829257)
chr1 (47-234)||(43905655-43905842)
chr1 (44-234)||(1940764-1940954)
chr1 (44-234)||(42370812-42371002)
chr1 (44-234)||(52696789-52696979)
chr1 (44-232)||(970543-970733)
chr1 (44-234)||(1170461-1170651)
chr1 (46-232)||(8079728-8079914)
chr1 (44-234)||(40092489-40092679)
chr1 (47-233)||(49146173-49146359)
chr1 (47-234)||(8120870-8121057)
chr1 (44-234)||(12682818-12683008)
chr1 (44-234)||(13996740-13996930)
chr1 (45-234)||(5215384-5215573)
chr1 (46-233)||(46760966-46761153)
chr1 (46-230)||(2473722-2473906)
chr1 (45-232)||(6765458-6765645)
chr1 (44-234)||(17591689-17591876)
chr1 (44-234)||(15203110-15203300)
chr1 (44-234)||(23498458-23498648)
chr1 (44-234)||(51359234-51359423)
chr1 (46-234)||(7145207-7145395)
chr1 (80-234)||(40149497-40149651)
chr1 (47-230)||(46409436-46409621)
chr1 (44-234)||(15554169-15554351)
chr1 (62-234)||(17587522-17587694)
chr1 (48-234)||(15717787-15717972)
chr1 (44-211)||(29695673-29695841)
chr1 (47-234)||(38171833-38172007)
chr1 (44-175)||(52086265-52086396)
chr1 (61-188)||(23322903-23323030)
chr1 (44-117)||(5675103-5675176)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (43-234)||(3707-3898)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (44-234)||(36703-36893)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (44-234)||(26323203-26323393)
chr2 (44-234)||(31517232-31517422)
chr2 (44-231)||(1108278-1108464)
chr2 (48-234)||(3873261-3873447)
chr2 (44-234)||(33906064-33906254)
chr2 (44-227)||(6174852-6175035)
chr2 (44-234)||(4232159-4232349)
chr2 (44-234)||(18806901-18807091)
chr2 (44-234)||(5733397-5733587)
chr2 (44-234)||(39635450-39635640)
chr2 (46-234)||(4016039-4016227)
chr2 (47-234)||(42937720-42937908)
chr2 (44-234)||(2178786-2178976)
chr2 (46-234)||(28329856-28330042)
chr2 (61-234)||(19383952-19384125)
chr2 (44-232)||(30270698-30270886)
chr2 (47-233)||(1482921-1483106)
chr2 (44-234)||(19901155-19901344)
chr2 (45-195)||(30420223-30420373)
chr2 (47-234)||(16588793-16588980)
chr2 (46-234)||(850997-851185)
chr2 (50-234)||(16066311-16066495)
chr2 (61-234)||(429831-430004)
chr2 (43-234)||(44947566-44947750)
chr2 (44-178)||(42446642-42446776)
chr2 (44-195)||(22101203-22101353)
chr2 (94-186)||(3585338-3585430)
chr2 (203-236)||(30420194-30420227)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (44-234)||(23-213)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (44-234)||(10236-10426)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (46-234)||(145262-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (45-234)||(312-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (46-234)||(23-212)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Original strand, 8630640 - 8630853
Alignment:
Q  19 gcacaagctaaaatgatatatatcagccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8630640 gcacaagctaaaatgatatatatcagccccgtttggatttgtttattttgaggttatgtgggttgatctactcccataagcctttttaaaggtgttcggg 8630739  T
Q  119 taaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagctt 218  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8630740 taaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagctt 8630839  T
Q  219 atgaatttatgtaa 232  Q
    ||||||||||||||    
T  8630840 atgaatttatgtaa 8630853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22649891 - 22649701
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22649891 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 22649792  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22649791 aatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 22649701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30181221 - 30181029
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  30181221 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 30181122  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccc 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  30181121 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacccc 30181029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 20346486 - 20346677
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  20346486 agccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatca 20346585  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20346586 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgaaacc 20346677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24792529 - 24792339
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24792529 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 24792430  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24792429 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 24792339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 7164184 - 7164373
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7164184 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 7164283  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7164284 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 7164373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12101375 - 12101185
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12101375 gccccatttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 12101276  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12101275 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctatggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 12101185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33359287 - 33359097
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33359287 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33359188  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33359187 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33359097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42965193 - 42965003
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42965193 gccccttttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 42965094  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42965093 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 42965003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43068170 - 43067980
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43068170 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 43068071  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43068070 agtttcataagcttcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 43067980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 3511324 - 3511512
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  3511324 cccgtttggattgtcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatagataaaaatagcttatcatag 3511423  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3511424 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 3511512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 5280861 - 5281049
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5280861 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattcacataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 5280960  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5280961 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 5281049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4477515 - 4477332
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  4477515 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatggt 4477416  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4477415 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 4477332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 933284 - 933474
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  933284 gccctgtttgaattggcttattttgagctcatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 933383  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  933384 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 933474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 42204153 - 42204344
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttt-taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  42204153 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatca 42204252  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42204253 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacc 42204344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 6394750 - 6394936
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6394750 gccccgtttagattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 6394849  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6394850 ggtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 6394936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Original strand, 43156718 - 43156902
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttc 149  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43156718 tttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 43156817  T
Q  150 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43156818 ataagctgtttatggcaaatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagaacttatgaatttatgtaacc 43156902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 1803029 - 1803215
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1803029 cgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 1803128  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1803129 tcataagctgcttatacgatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 1803215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 15655911 - 15656101
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  15655911 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 15656010  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15656011 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 15656101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 25748486 - 25748676
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||| |  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25748486 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatattagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25748585  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25748586 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 25748676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 237
Target Start/End: Original strand, 4347272 - 4347465
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  4347272 gccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgggcttatctactcccataaacttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaccat 4347371  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccct 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4347372 agtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctcgagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccct 4347465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12097787 - 12097597
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12097787 gccccatttggattggcttaagttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 12097688  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12097687 agtttcataagctacttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 12097597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 32041541 - 32041731
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32041541 gccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 32041640  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32041641 agtttcataagctgcttatgtcatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacc 32041731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33846721 - 33846536
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33846721 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33846622  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33846621 agtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagctta-----gggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33846536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 9452591 - 9452779
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  9452591 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctattctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatag 9452690  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9452691 tttcataagctgtctatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 9452779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36891026 - 36890837
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36891026 gccccgtttggattgacttattt-gagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 36890928  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36890927 agtttcataagttgcttatgccatatttcaataagcctaagttttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 36890837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 38866547 - 38866733
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    ||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38866547 cgtttggatcgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataattttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 38866646  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38866647 tcataagctgtttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacc 38866733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 42673467 - 42673650
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |  ||||||||||    
T  42673467 ccgtttggattgacttatttggagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaa----aacagcttatcatagt 42673562  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42673563 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 42673650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46134500 - 46134311
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  46134500 ccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagtttatctactcctataactctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttattata 46134401  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46134400 gtttcataagctgtttacgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttattaatttatgtaacc 46134311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46891535 - 46891346
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  46891535 cccgtttggattggcttattttgagcttatataggcttatctactcctataaaccttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttgtcata 46891436  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  46891435 gttttataagctgcttatgtcatattttaattagcctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacc 46891346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 17753600 - 17753787
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  17753600 ccccgtttggattagcttattttgagcttatacaagcttatctactcctataagccttttagaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttaacata 17753699  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17753700 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttacccttcaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 17753787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 80 - 234
Target Start/End: Original strand, 48865665 - 48865822
Alignment:
Q  80 gcttatctactcctataagcctttt---taaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 176  Q
    ||||||||||| | |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48865665 gcttatctacttccataagccttttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaata 48865764  T
Q  177 agcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48865765 agcctaaattttcagcttaacatcaggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 48865822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 80 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16894668 - 16894515
Alignment:
Q  80 gcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 179  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894668 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtatttgggtaaacaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 16894569  T
Q  180 ctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 233  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16894568 ctaaattttcagcttacccttcaacttaacagggagcttatgaatttatgtaac 16894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 19828269 - 19828415
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  19828269 gccccgtttgaattggcttattttgagtttatgttggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaatagcttatcat 19828368  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 190  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19828369 agtttcataaattgcttatgccatattttaataagccaaaattttca 19828415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43021773 - 43021587
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  43021773 gccccatttggattggcttattttaagtttatgtggacttatctacttcaataagtctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaataacttattat 43021674  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    |  | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43021673 agtttcataagctgcttatggcatatt----tcggtctaaattttcagcttactctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 43021587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37006005 - 37005864
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| || |    
T  37006005 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgagtttatctacttctataagtttttttaaaggcgtttgggtaaatcagtaaaaatagcttatcgtaat 37005906  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  37005905 ttcataagctgcttatgctatattttaataaggctaattttt 37005864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 134
Target Start/End: Original strand, 37704979 - 37705069
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 134  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37704979 gccccgtttgggttgacttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaata 37705069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Original strand, 43405019 - 43405155
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  43405019 gccccgtttgaattgacttattttaagcttatgttggcttatctactcctataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcgt 43405118  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 180  Q
    | ||||||||| || || | | |||||||||||||||    
T  43405119 aatttcataagttgtttctactatattttaataagcc 43405155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 27691517 - 27691428
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttta 139  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27691517 tttgaattggtttattttgaatttatatgggcttatctactcccataaatctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatatttta 27691428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 36849734 - 36849583
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||   || ||||||||| || ||||||   ||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |  ||||||     
T  36849734 gccccgtttggattgacttattcgaagcttatgtgggtttgtctactaacatatgtttttttaaaggtgtttggataaatcaataaaatcagcttatcac 36849635  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaactta 195  Q
    | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  36849634 aatttcataaactgtttatgtcatattttaataagctcaaattttaaactta 36849583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15655605 - 15655465
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| ||||| | |  ||||||| |||| ||||||   ||||| |||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||  ||| || | ||    
T  15655605 cgtttggattggcttattctaaacttatgtgagcttgtctactaacataagtctttttaaaactatttggataaatcaataaaaatagcttaccacaatt 15655506  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
    | |||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||||||    
T  15655505 ttataaactgcttataccaaattttaataagctcaaatttt 15655465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30075425 - 30075292
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||| | |||||||||   ||||||| ||| | |   |||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  30075425 gccccgtttggattgacttattttaagcttatgtgagtttatctactaacataagccctttcagatacgtttgggtaaataa-taaaaatagcttat-at 30075328  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcc 180  Q
    | |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  30075327 a-tttcataaaccgcttataccatattttaataagcc 30075292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 179
Target Start/End: Original strand, 20163886 - 20163953
Alignment:
Q  112 gtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 179  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20163886 gtttgggtgaattaattaaaatagcttatcacagtttcataagctgcttatagcatattttaacaagc 20163953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 14422703 - 14422893
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14422703 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 14422802  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14422803 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 14422893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10836958 - 10836772
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10836958 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtt 10836859  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10836858 tcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 10836772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 18594537 - 18594727
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18594537 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 18594636  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18594637 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 18594727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 39206586 - 39206776
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39206586 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 39206685  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39206686 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 39206776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 29938061 - 29938251
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  29938061 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcat 29938160  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29938161 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 29938251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 13110406 - 13110594
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13110406 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatatgcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 13110505  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  13110506 tttaataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgagtttatgtaacc 13110594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 144397 - 144584
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  144397 ccgtttggattgacttattttgagcatatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagtttatcatagt 144496  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  144497 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 144584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2042727 - 2042541
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  2042727 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagtt 2042628  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2042627 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 2042541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24113373 - 24113183
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  24113373 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaccctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagattatcat 24113274  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24113273 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 24113183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35118238 - 35118048
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35118238 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35118139  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35118138 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 35118048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34679659 - 34679474
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34679659 gtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagttt 34679560  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34679559 cataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacc 34679474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 43 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34842573 - 34842386
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34842573 agccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatca 34842474  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  34842473 tagtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaatttccagcttacccaccgtcttaacaaggagcttattaatttatgt 34842386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22260837 - 22260647
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  22260837 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagtctttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatcct 22260738  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22260737 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 22260647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 33278400 - 33278590
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33278400 gccccgtttggattggcttattttgagtttatatggacttatctactttcataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 33278499  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33278500 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33278590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 39218777 - 39218963
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39218777 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatggtttatcat 39218876  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39218877 agcttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctgatgaatttatgt 39218963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 4035847 - 4036037
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  4035847 gccccgtttggattggtttatttttagcttatatgggcttatctactcccataagttttattaaaggtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcat 4035946  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4035947 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4036037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38167362 - 38167172
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  38167362 gccctgtttggattggcctattttgagtttatgtgggcttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaactagtttatcat 38167263  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38167262 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 38167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6144480 - 6144290
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6144480 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccatatgcctttttaacagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6144381  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6144380 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 6144290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34999101 - 34998919
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  34999101 cccgtatggattggcttattttgagcttatacgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcttag 34999002  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34999001 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttgccctccggcttaacaaggagcttatgaatttat 34998919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 7791412 - 7791601
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7791412 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 7791511  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7791512 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 7791601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 41575516 - 41575703
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||    
T  41575516 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtagacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaattgcttatcatagt 41575615  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41575616 ttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 41575703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 7774768 - 7774954
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7774768 cgtttagattggcttattttgagcttatgcgggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcatagtt 7774867  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7774868 tcataagctgcttatgtcatattttattaagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 7774954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44805145 - 44804961
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttc 149  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44805145 tttgaattggcttattttgagcttatgtaggtttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttagataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 44805046  T
Q  150 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44805045 ataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 44804961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 5320564 - 5320750
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5320564 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaagttgttttggtaaataaataaaaataatttatcat 5320663  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5320664 agtttcataagttgcttatgtcatgtttcaataagcctaaattttcaacttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 5320750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 28639280 - 28639470
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctata----agcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatc 141  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28639280 cccgtttgaattggcttattttaagcttatgtgagcttatctactcctatatacaagcttttttaaaggtgttttggtaaataaataaaaatagtttatc 28639379  T
Q  142 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  28639380 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacatagagcttatga--ttatgtaacc 28639470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 7811995 - 7812185
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7811995 gccccgttttgattggcttattttgagtttatgtgagtttatctacttccattagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 7812094  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7812095 agtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 7812185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 8021721 - 8021901
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8021721 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 8021820  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  8021821 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttca--------tccggcttaacaaggagcttatgagtttatataacc 8021901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 33287232 - 33287076
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33287232 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcccatatgcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 33287133  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33287132 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctc 33287076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 40118059 - 40117903
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40118059 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 40117960  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40117959 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagcttaccctc 40117903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 36491157 - 36491347
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  36491157 gccccatttggattggcttattttaagcttatgtgggattatctaatcgcataagtctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 36491256  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36491257 agtttcataacttgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 36491347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 48 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26783936 - 26783801
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  26783936 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 26783837  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26783836 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 26783801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 42571598 - 42571781
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  42571598 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaat-aataaaaatagcttatcatagtt 42571696  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  42571697 tcataagctgcttatgtcatatttcaat--gcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaaggaacttatgaatttatgcaacc 42571781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 66384 - 66203
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||| ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  66384 ccgtttagattggcttattttgagtttctgtaggcttatctattcccatatgtctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaataacttataatagt 66285  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccc-tccggcttaacaaagagcttatgaattta 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  66284 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagtttaaattttcagcttaccctttcggcttaacaaggagcttatgaattta 66203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Original strand, 9807339 - 9807450
Alignment:
Q  123 taaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatga 222  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9807339 taaataaaaatagcttatcatagcttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatga 9807438  T
Q  223 atttatgtaacc 234  Q
    ||||||| ||||    
T  9807439 atttatgaaacc 9807450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 2322219 - 2322075
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| |||| |||  |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||     
T  2322219 gccccgtttggattggcttattcggagcttatatggatttatctactaacataagcttttttaaaggtgtttgggtaaatcaataaaaacagcttatcac 2322120  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
    | |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  2322119 aatttcataagctgcttatatcatattttgataagcctaaatttt 2322075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 172
Target Start/End: Original strand, 5005171 - 5005294
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||  || | |    
T  5005171 gtttggattggcttatcttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggcgtttgggtaaatcaataaaaatagcttatgctactct 5005270  T
Q  149 cataagctgcttatgccatatttt 172  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    
T  5005271 cataaactgcttatgctatatttt 5005294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 131
Target Start/End: Original strand, 9806875 - 9806960
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 131  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9806875 cccgtttggattgacttattttgagtttatatgtgcttatctactcccatatgcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaa 9806960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 188
Target Start/End: Original strand, 39220258 - 39220400
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| |||| ||  |||||||||  | ||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||   |     
T  39220258 cccgtttgaattgacttattttgagcttatatgaacttatctacatccatatgtctttttaaaggtgtttgagtaaatcaataaaaatagcttattccaa 39220357  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||    
T  39220358 tttcataagctgctcatactatattttaataagctcaaatttt 39220400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26704546 - 26704356
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26704546 gccccgtttggattggtttattttgagcttacgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 26704447  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26704446 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 26704356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26947083 - 26946893
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  26947083 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 26946984  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26946983 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 26946893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 2837545 - 2837735
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2837545 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 2837644  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2837645 agtttcatgagctgctcatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 2837735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6086806 - 6086616
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6086806 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6086707  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6086706 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 6086616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3347730 - 3347540
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  3347730 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcat 3347631  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3347630 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 3347540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 21893455 - 21893645
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||    
T  21893455 gccccgtttggatcgatttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaatatataaaaatagcttatcat 21893554  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21893555 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 21893645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 30691855 - 30692041
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30691855 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30691954  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30691955 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 30692041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3955972 - 3955783
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3955972 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 3955873  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3955872 gtttcataaactgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 3955783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 9459563 - 9459750
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9459563 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagcttatctatttccataagcctttttaaaggtatttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 9459662  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9459663 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgta 9459750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17261278 - 17261090
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||     
T  17261278 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttctaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttataatat 17261179  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17261178 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacc 17261090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 20726791 - 20726977
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||    
T  20726791 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa----taaaaataacttatcat 20726886  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20726887 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 20726977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16307215 - 16307025
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    
T  16307215 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttggataaataaataaaaacagcttatcat 16307116  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16307115 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 16307025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 18613538 - 18613728
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  18613538 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgcggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 18613637  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18613638 agttccataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 18613728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34887496 - 34887313
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  34887496 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctcctcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 34887397  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34887396 ttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagctaatgaatttatgt 34887313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 54 - 234
Target Start/End: Original strand, 1153603 - 1153783
Alignment:
Q  54 gattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataa 153  Q
    |||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  1153603 gattggcttattttaagcttatgttggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagattatcatagtttcataa 1153702  T
Q  154 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  1153703 gctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggtgcttatgtatttatgtaacc 1153783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 11167240 - 11167430
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| || |   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11167240 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgtgcttatttattttcataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 11167339  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11167340 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccaccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 11167430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30699132 - 30698946
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||  ||||| |||| ||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30699132 cgtttggattgacttattatgagtttatgtgagcttatttatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 30699033  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30699032 ttattagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaatgagcttatgaatttatgtaacc 30698946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 35198284 - 35198469
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35198284 gccccgtttgaattggcttattttgaacttatgtgggcttatctacttccataagc-tttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35198382  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  35198383 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagtttactctccggcttaacaaggaacttatgaatttatgt 35198469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28199714 - 28199525
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatc---tactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28199714 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 28199616  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28199615 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 28199525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 207
Target Start/End: Original strand, 52836 - 52999
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52836 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 52935  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggctta 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  52936 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggctta 52999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 234
Target Start/End: Original strand, 33464399 - 33464519
Alignment:
Q  114 ttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaag 213  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  33464399 ttgggtaaataagtaaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaagg 33464498  T
Q  214 agcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33464499 agcttatgaatttatgtaacc 33464519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 234
Target Start/End: Original strand, 53001 - 53098
Alignment:
Q  137 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53001 ttatcatagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 53098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 122
Target Start/End: Original strand, 33463703 - 33463779
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33463703 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaa 33463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 29)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 1579037 - 1579227
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1579037 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 1579136  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1579137 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 1579227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1605778 - 1605588
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1605778 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 1605679  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1605678 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 1605588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9008264 - 9008074
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9008264 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 9008165  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9008164 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 9008074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 27420859 - 27421049
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27420859 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcat 27420958  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27420959 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 27421049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27679376 - 27679188
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27679376 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 27679277  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27679276 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 27679188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 4120938 - 4121128
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4120938 gccccgtttggaatggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcccttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaataatttatcat 4121037  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4121038 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4121128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 16069356 - 16069544
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  16069356 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatag 16069455  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16069456 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 16069544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24105875 - 24105688
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24105875 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 24105776  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24105775 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattatcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 24105688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16737650 - 16737464
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16737650 cgtttgaattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtt 16737551  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16737550 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 16737464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33491403 - 33491213
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33491403 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33491304  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33491303 agtttcataagctgcttttgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33491213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3386688 - 3386503
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3386688 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 3386589  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  3386588 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcctatgaatttatgtaacc 3386503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20992353 - 20992161
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  20992353 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtggtcttatctactcctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcatatcat 20992254  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccc 236  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20992253 agtttcataagctgattatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccc 20992161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Original strand, 5202973 - 5203159
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5202973 gccccgtttggattgacttattttgagtttatgttggtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 5203072  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5203073 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 5203159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8374545 - 8374356
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8374545 gccccgtttggattgccttattttaagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 8374446  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8374445 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatg-atttatgtaacc 8374356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 3921584 - 3921772
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3921584 cccgtttggattgatttattttgagtttatatgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 3921683  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3921684 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaaaaaggagcttatgaatttatgtaacc 3921772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 19358527 - 19358715
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19358527 gccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 19358626  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19358627 agtttcataagctgcttatgccatattttagtaagcctaaattttcagcttaccctccaacttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 19358715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 31883148 - 31883335
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31883148 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctactctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 31883247  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31883248 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 31883335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 33991141 - 33991331
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33991141 gccccgtttgaattgacttattttgagtttatgtggacttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33991240  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33991241 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33991331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1165802 - 1165618
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttc 149  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1165802 tttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 1165703  T
Q  150 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1165702 ataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 1165618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35782851 - 35782661
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35782851 gccccgtttggattgccttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 35782752  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccg-gcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35782751 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcctaccctccgtgctta-caaggagcttatgaatttatgtaacc 35782661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38598657 - 38598467
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  38598657 gcccggtttggattggcttactttgaacttatgtgagcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcat 38598558  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38598557 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 38598467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 48 - 230
Target Start/End: Original strand, 31410481 - 31410663
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  31410481 cgtttggattgatttattttgagtttatatgggtttatctacccccataagtctttttaaaggtgtttgagtaaacaaataaaaatagcttatcatagtt 31410580  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  31410581 ttataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgt 31410663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 80 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26603113 - 26602959
Alignment:
Q  80 gcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 179  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26603113 gcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataaactgcttatgccatattttaataagc 26603014  T
Q  180 ctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
     ||| ||||||  |||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26603013 ataatttttcagtttactctctggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 26602959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 88 - 234
Target Start/End: Original strand, 27025001 - 27025147
Alignment:
Q  88 actcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattt 187  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27025001 actcccataagactttttaaagatgttcgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgccattttttaataagcctaaattt 27025100  T
Q  188 tcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  27025101 tcagcttaccctccggcttaacaaggagtttataaatttatgtaacc 27025147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20992492 - 20992354
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgt----gggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttta 139  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  20992492 gccctgtttggattggcttattttgagcttatgtacatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcata 20992393  T
Q  140 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992392 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataag 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 51 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33284775 - 33284642
Alignment:
Q  51 ttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttca 150  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  33284775 ttggattgacttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttaagtaaataaataaaaatagcttatcatagtttta 33284676  T
Q  151 taagctgcttatgccatattttaataagcctaaa 184  Q
    ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33284675 taaactgcttataccatatttcaataagcctaaa 33284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35420482 - 35420441
Alignment:
Q  193 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35420482 ttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 35420441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 179
Target Start/End: Original strand, 31638174 - 31638281
Alignment:
Q  72 ttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt 171  Q
    ||||||| ||||| |||||   |||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  |||||| | ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  31638174 ttatgtgagcttacctactaacataagcctttgtaaaagtgtttggataaatcgataaaaataacttatcacaattttataagcttcttatgtcatattt 31638273  T
Q  172 taataagc 179  Q
    ||||||||    
T  31638274 taataagc 31638281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 109 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41818605 - 41818552
Alignment:
Q  109 ggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttat 162  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||    
T  41818605 ggtgtttaggtaaattaataaaaatagcttatcatatttttataagctgcttat 41818552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 62)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 38055155 - 38055345
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38055155 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 38055254  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38055255 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttactctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 38055345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6611555 - 6611365
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6611555 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6611456  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6611455 agtttcataagctgtttatgtcatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 6611365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15241219 - 15241033
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15241219 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagtt 15241120  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15241119 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 15241033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23776654 - 23776464
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23776654 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 23776555  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23776554 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggatcttatgaatttatgtaacc 23776464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1756958 - 1756769
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1756958 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 1756859  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1756858 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 1756769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 20877047 - 20877235
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20877047 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 20877146  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  20877147 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttacgtaacc 20877235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11639774 - 11639583
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11639774 agccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 11639675  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11639674 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 11639583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19913825 - 19913635
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||    
T  19913825 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaattaaaacagcttatcat 19913726  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19913725 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 19913635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27488843 - 27488653
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27488843 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatctgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 27488744  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488743 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 27488653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50055296 - 50055106
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  50055296 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcat 50055197  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50055196 ggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 50055106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 54189543 - 54189733
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54189543 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 54189642  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54189643 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 54189733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 37464719 - 37464909
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37464719 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcat 37464818  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37464819 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttaccctccggtttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 37464909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45424729 - 45424539
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45424729 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgttggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 45424630  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45424629 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 45424539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53717659 - 53717469
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  53717659 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 53717560  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53717559 agtttcataagctgcttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 53717469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 31969681 - 31969869
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31969681 cccgtttgaattgatttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 31969780  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31969781 tttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 31969869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 14987790 - 14987980
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14987790 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatatactcccataagccattttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 14987889  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14987890 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcttgcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacc 14987980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23704404 - 23704214
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23704404 gccctgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcacataagccttttgaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 23704305  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23704304 agtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 23704214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28032907 - 28032717
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28032907 gccctgtttagattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 28032808  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28032807 agtatcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 28032717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44785112 - 44784922
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  44785112 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttgtaaaagtgtttgggtaaacaaataaaaatagcttatcat 44785013  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44785012 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaactttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacc 44784922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 50353799 - 50353989
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  50353799 gccccgtttggattggcttattttgagcttctgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatgat 50353898  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50353899 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaatttttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 50353989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8591285 - 8591097
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8591285 cccgtttgacttggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttctataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8591186  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8591185 tttcataagctgcttatgccatatgttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 8591097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40428916 - 40428725
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  40428916 agccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 40428817  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40428816 tagtttcataagctgcttataccatattttgataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 40428725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2481603 - 2481413
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  2481603 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 2481504  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2481503 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagccaaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 2481413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37968952 - 37968766
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37968952 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 37968853  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37968852 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgt 37968766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 54412627 - 54412816
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  54412627 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 54412726  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  54412727 gtttcataagctgcttatgtcatattctaataagtctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacc 54412816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 1617084 - 1617272
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1617084 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatag 1617183  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1617184 tttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 1617272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19165164 - 19164978
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagccttttt-aaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19165164 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 19165065  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19165064 tttcataagctgcttatgccata-tttaataagcctaaattttcagcttaccct-cggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 19164978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30423757 - 30423570
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30423757 cccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 30423658  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30423657 tttcataagctgcttatgccatatttcaataagcataaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagctta-gaatttatgtaacc 30423570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35490966 - 35490778
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  35490966 cccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatccactctcataagcttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatag 35490867  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35490866 tttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 35490778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 48909844 - 48910032
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  48909844 gccctgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 48909943  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48909944 agtttcataagctgcttatgccatattttaacaaacctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 48910032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 52139203 - 52139391
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52139203 cccgtttggattggcttattttgaacttatgtgggtttatctatttctataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 52139302  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52139303 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 52139391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6688816 - 6688632
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6688816 gccccgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 6688717  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6688716 agttt------ctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 6688632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 16700782 - 16700969
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  16700782 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagt 16700881  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16700882 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctagcttaacaaggagcttataaatttatgtaacc 16700969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 47632032 - 47632223
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaa-ggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  47632032 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtggacttatctactctcataaacctttttaaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttctca 47632131  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47632132 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 47632223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 53875658 - 53875845
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  53875658 ccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatatactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 53875757  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  53875758 tttataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacc 53875845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8932373 - 8932183
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| | |    
T  8932373 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttaacgt 8932274  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8932273 agtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttacccttcagcttaacaaggaacttatgaatttatgtaacc 8932183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 15669181 - 15669371
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  15669181 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctaatcacataagactttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 15669280  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15669281 agtttcataagctgcttatgtcatactttaataagcctaaattttcagcttaccgtccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 15669371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43290152 - 43289965
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43290152 ccgtttggattggcttattttgagcttttatgtgcttatctactcacataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43290053  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  43290052 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacc 43289965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27536295 - 27536109
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27536295 gccccgtttggattggcttattttgagcttatacgggctta----ctcccataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 27536200  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27536199 agtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 27536109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 44375844 - 44376033
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44375844 ccccgtttggattggcttattttaagcttatgtgggcttatctattccaatagccatttttataggtgttcgggtaaataaataaaaatagtttatcata 44375943  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44375944 gtttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaaaaaagagcttatgaatttatgtaacc 44376033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44379382 - 44379192
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||| | |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44379382 gccctgtttggattgacttattttgagtttatataggcttatctacttccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 44379283  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44379282 agtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacc 44379192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Original strand, 33703856 - 33704029
Alignment:
Q  61 ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctt 160  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33703856 ttattttgagcttatgtgagtttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcatagtttcataagctgctt 33703955  T
Q  161 atgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33703956 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33704029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 28360433 - 28360602
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28360433 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttttctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 28360532  T
Q  149 cataagctgcttatgcca-tattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagct 217  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  28360533 tataagctgcttatgccattatttttataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagct 28360602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 53353053 - 53353251
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgag----gttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatttta 139  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||     |||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  53353053 gccccgtttggattggcttattttgagcttaattatatgggcttatctactcccatatgtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagctta 53353152  T
Q  140 tcatagtttcataagctgcttatgccatatttta----ataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  53353153 tcatagtttcataagctgcttatgccatattttaatatataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatggatttatgtaacc 53353251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27583821 - 27583639
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttc 149  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |    
T  27583821 tttggattgacttattttgagcttatgtaggcttatctactcccataagcttttttaaagatgtttggataaataaataaaaataacttatcatagttgc 27583722  T
Q  150 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27583721 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 27583639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38071498 - 38071328
Alignment:
Q  61 ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38071498 ttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataatcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 38071399  T
Q  161 atgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38071398 atgccatattttaataagcctgaattttcagtttac---ggggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 38071328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40680227 - 40680043
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttc 149  Q
    |||||||||  |||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40680227 tttggattgacttattttgaatttatgtgagcttatctacttccataagtctttttaaaggtatttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttc 40680128  T
Q  150 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  40680127 ataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatttttagcttacccttcggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 40680043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 30171581 - 30171768
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30171581 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatcttattccataagcttttttaaaggtgtttggataaataaatgaaaatagcttatcatagt 30171680  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30171681 ttcataagctgcttataccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccttccggtttaacaaggagcttatgaatttatttaacc 30171768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 50053441 - 50053592
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  50053441 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatggacttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggcaaataaataaaaatagcttatcat 50053540  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaactta 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  50053541 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagtctaaattttcatctta 50053592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 55345020 - 55344830
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  55345020 gccccgtttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactctcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 55344921  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    | || ||| || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55344920 atttgcatgagttgtttataccatattttaataagccaaaattttcagcttaccatccggtttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 55344830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 16703847 - 16704011
Alignment:
Q  72 ttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt 171  Q
    |||||||  |||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16703847 ttatgtgaacttatctacttccataagcttttttaaagttgtttgaataaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt 16703946  T
Q  172 taataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccc 236  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16703947 taataagcctaaattttcagtttatcctccggcttaacaaggagcctataaatttatgtaacccc 16704011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23269162 - 23269053
Alignment:
Q  123 taaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatga 222  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23269162 taaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatga 23269063  T
Q  223 atttatgtaa 232  Q
    ||||||||||    
T  23269062 atttatgtaa 23269053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 23265950 - 23265865
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 131  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23265950 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcggataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaa 23265865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 44548337 - 44548192
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggt-ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  44548337 gccccgtttgaattggccttatttggagcttatgtgggcttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttggataaatcaataaaaacatcttatca 44548238  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
     | ||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  44548237 caattttataagttgtttatgccctattttattaagcccaaatttt 44548192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 51780845 - 51780769
Alignment:
Q  112 gtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51780845 gtttggataaatcaataaaaatagcttatcataatttcataagctgcttatgccatattttaataagcccaaatttt 51780769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 164 - 234
Target Start/End: Original strand, 53408137 - 53408208
Alignment:
Q  164 ccatattttaataagcctaaattttcaacttaccct-ccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53408137 ccatattttattaagcctaaattttcagcttacccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 53408208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 188
Target Start/End: Original strand, 17493370 - 17493475
Alignment:
Q  83 tatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagccta 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  17493370 tatctactcctataagcatttttaagggcgtttgagtaaatcaataaaaatatcttattctaattttataagctgcttataccatgttttaataagctca 17493469  T
Q  183 aatttt 188  Q
    ||||||    
T  17493470 aatttt 17493475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23261933 - 23261891
Alignment:
Q  192 cttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23261933 cttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 23261891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 148 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9595982 - 9595907
Alignment:
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |           |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9595982 tcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaact-----------ctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 9595907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 55344777 - 55344724
Alignment:
Q  137 ttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttca 190  Q
    |||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55344777 ttatcatattttcatgagttgtttatgccatattttaataagccaaaattttca 55344724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9596029 - 9595983
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactc 91  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9596029 gccccgtttggattggcttattt-gagtttatgtgggcttatctactc 9595983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 234
Target Start/End: Original strand, 50055301 - 50055333
Alignment:
Q  202 ggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50055301 ggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 50055333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23158 - 22968
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23158 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 23059  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23058 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 22968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 38)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15520335 - 15520145
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15520335 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcat 15520236  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15520235 cgtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 15520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 25999383 - 25999573
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25999383 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25999482  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25999483 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 25999573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37698336 - 37698146
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37698336 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 37698237  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37698236 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 37698146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42308098 - 42307908
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42308098 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggcgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 42307999  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42307998 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 42307908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 38856089 - 38856278
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  38856089 ccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 38856188  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38856189 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 38856278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 8042602 - 8042792
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8042602 gccccgtttggatgggcttattttgagcttatgtgagcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataagtaaaaatagtttatcat 8042701  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8042702 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 8042792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 32244117 - 32244305
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32244117 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatag 32244216  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32244217 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 32244305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22175183 - 22174993
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  22175183 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 22175084  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22175083 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 22174993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46452355 - 46452165
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46452355 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 46452256  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46452255 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctcaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 46452165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 49 - 233
Target Start/End: Original strand, 21581042 - 21581226
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21581042 gtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagttt 21581141  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21581142 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 21581226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20842541 - 20842351
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  20842541 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacaacttatcat 20842442  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20842441 agtttcataagctgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 20842351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 29445483 - 29445673
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29445483 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 29445582  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29445583 agtttcataagctgtttatgccctattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 29445673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 50528924 - 50529114
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  50528924 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 50529023  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50529024 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacc 50529114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12117851 - 12117661
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12117851 gccccgtttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 12117752  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12117751 agtttcataagttgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 12117661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25494478 - 25494288
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25494478 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggtttatctattcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25494379  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25494378 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacc 25494288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 54870367 - 54870177
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54870367 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 54870268  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54870267 cgtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 54870177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 32359256 - 32359444
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32359256 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctatttccataagcttttataaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagtttatcatag 32359355  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32359356 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 32359444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 15520631 - 15520821
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  15520631 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 15520730  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15520731 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttttgtaacc 15520821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 20699144 - 20699334
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  20699144 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 20699243  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20699244 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttaggaatttttgtaacc 20699334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24835892 - 24835704
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  24835892 gccccgtttggattgatttattttgagcttatatagacttatcaactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttattat 24835793  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24835792 agtttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 24835704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 35226442 - 35226632
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||    
T  35226442 gccctgtttggattggcctattttgagcttatgtgggcttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaatcagcttatcat 35226541  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35226542 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcctaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 35226632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 38933941 - 38934130
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  38933941 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 38934039  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38934040 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagtctaaatttccagtttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 38934130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54534519 - 54534335
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  54534519 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 54534420  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
     |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54534419 ggttt-ataagctgcttatgccata-ttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgt 54534335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44609521 - 44609336
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  44609521 gtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctacttgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcatagttt 44609422  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44609421 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacc 44609336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42105147 - 42104974
Alignment:
Q  61 ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctt 160  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42105147 ttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataaacatttttaaaggtgtttggataaaaaaataaaaatagtttatcatagtttcataagctgctt 42105048  T
Q  161 atgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42105047 atgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctcatgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 42104974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 34700336 - 34700526
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  34700336 gccccgtttagattggtttattttgagcttatgtgggtttatttacttccataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagcttatcat 34700435  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||    
T  34700436 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaagaagcttatgaatttatataacc 34700526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 26122809 - 26122998
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  26122809 gcccagtttggattggcttattttgagcttatgtgggtttatctattcccatgagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 26122908  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  26122909 agtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttatcctccggcttaacaagtagcttatgaatttacgtaac 26122998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 220
Target Start/End: Original strand, 2895180 - 2895356
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  2895180 gccccatttgaattgacttattttgagcttatgtgggtttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaaattatcat 2895279  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttat 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2895280 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttat 2895356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 44688784 - 44688945
Alignment:
Q  72 ttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt 171  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44688784 ttatgtgggtttatctacttccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagtttcataagctgcttatg-catattt 44688882  T
Q  172 taataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  44688883 taataagcttaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgcaacc 44688945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 43 - 201
Target Start/End: Original strand, 35643211 - 35643369
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35643211 agccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgaacttatctacttccataagcctttttaaaggtgcttgggtaaataaataaaaatagcttatca 35643310  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35643311 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttgagcttaccctcc 35643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 48925189 - 48925006
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48925189 gtttggattggcttatttagagtttatatgggtttatctacttccataagcttttttaaaagt--ttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagttt 48925092  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48925091 cataagctgtttatgtcatattttaataagtctaaatttttagcttatcctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 48925006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Original strand, 16354391 - 16354531
Alignment:
Q  94 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaact 193  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16354391 ataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataacttatcatagtttcataagctgctaatgccatgttttaataagcctaaattttcagct 16354490  T
Q  194 taccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16354491 tatcctcctgcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 16354531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 50529961 - 50529827
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  50529961 gtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 50529862  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaa 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50529861 cataagctgcttatgccatattttaatgagcctaa 50529827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 53028220 - 53028402
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||        |||||||||||||||  |||||||    
T  53028220 gccctgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagtctttttagaggt--------aaataaataaaaatagcttatcat 53028311  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53028312 attttcataaactgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 53028402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 236
Target Start/End: Original strand, 12915930 - 12916093
Alignment:
Q  72 ttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattt 171  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  12915930 ttatgtgggcttatttactcc-ataaatctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcataatttcataaactgcttatgtcatattt 12916028  T
Q  172 taataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccc 236  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12916029 aaataagcttaagttttcagcttaccctccggtttaagaaagagtttatgaatttatgtaacccc 12916093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 177
Target Start/End: Original strand, 49128044 - 49128177
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||| |    
T  49128044 gccccgtttggattgacttattttaaacttatgtgggcttatctactcctataagtctttttaaagatgtttgggtaaatcaataaaaataacttatcgt 49128143  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataa 177  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49128144 aatttcataagctgcttatgctatattttaataa 49128177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Original strand, 24366143 - 24366214
Alignment:
Q  163 gccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24366143 gccatattttaataagcataaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 24366214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 234
Target Start/End: Original strand, 13696914 - 13696978
Alignment:
Q  170 tttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13696914 tttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttgtgtaacc 13696978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41928702 - 41928512
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41928702 gccccgtttggattggcttattttgaacttatgtggacttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 41928603  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41928602 agtttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 41928512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Original strand, 1168501 - 1168689
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1168501 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 1168600  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1168601 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 1168689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 2347654 - 2347845
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2347654 gccccgtttggatttgtttattttgagtttatgcgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 2347753  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccata-ttttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2347754 agtttcataagctgcttatgtcatatttttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaatgagcttatgaatttatgtaacc 2347845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 16052094 - 16052284
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16052094 gccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgggcttatctacttccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 16052193  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16052194 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 16052284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 25897372 - 25897562
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25897372 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcatatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 25897471  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25897472 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 25897562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 33510482 - 33510672
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33510482 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagtttatcat 33510581  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33510582 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 33510672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 39260553 - 39260363
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39260553 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 39260454  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39260453 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 39260363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 26663257 - 26663446
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  26663257 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcata 26663356  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26663357 gtttcataagctgtttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 26663446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Original strand, 29078519 - 29078704
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29078519 gtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 29078618  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29078619 cataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 29078704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19715366 - 19715178
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
T  19715366 cccgtttggattggtttattttgagcttatgtgagcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcattg 19715267  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19715266 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 19715178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Original strand, 29288147 - 29288327
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29288147 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 29288246  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  29288247 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaat 29288327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Original strand, 32671577 - 32671769
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32671577 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtggatttatctactcccataagcctttttaaagatgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 32671676  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccc 236  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32671677 agtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccc 32671769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 20089469 - 20089659
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  20089469 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttaggtaaataaataaaaatagcttatcat 20089568  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20089569 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 20089659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26580477 - 26580287
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  26580477 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctattcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaagtaaataaaaatagcttatcat 26580378  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26580377 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 26580287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52753354 - 52753164
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  52753354 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 52753255  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52753254 agtttcataagctacttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccatctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 52753164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 49 - 234
Target Start/End: Original strand, 38829072 - 38829257
Alignment:
Q  49 gtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagttt 148  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  38829072 gtttggattggcttattttgagcttatgtcggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagttt 38829171  T
Q  149 cataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38829172 cataagctgcttgtgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 38829257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 43905655 - 43905842
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43905655 ccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 43905754  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  43905755 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatttttagtttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttacgtaacc 43905842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1940954 - 1940764
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1940954 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 1940855  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1940854 agtttcataagttgtttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 1940764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 42371002 - 42370812
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  42371002 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgagcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaaaaacttatcat 42370903  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42370902 agtttcataagctgcttgtgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 42370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 52696789 - 52696979
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||    
T  52696789 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcgcataagcctttttgaaggtgtttgggtaaataaacaaaaacagcttatcat 52696888  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52696889 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 52696979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 970733 - 970543
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatc-- 141  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||      
T  970733 gccccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcat 970634  T
Q  142 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  970633 atagtttcataagctgcttatgccatattttaataaacctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 970543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1170651 - 1170461
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  1170651 gccccgtttggattggcttattttgagcttttgtgggcttatctacttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 1170552  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1170551 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccatccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacc 1170461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 46 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8079914 - 8079728
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8079914 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 8079815  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8079814 tttcataagctacttatgccatattttaataagcctaagttttcagcttaccctctggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 8079728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 40092489 - 40092679
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40092489 gccctgtttggattgacttattttgagcttatatgagcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatatcttatcat 40092588  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40092589 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttatcttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 40092679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 233
Target Start/End: Original strand, 49146173 - 49146359
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  49146173 ccgtttggattggtttattttgagcttatgtggatttatatactcccataagtttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaatagcttatcatagt 49146272  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49146273 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcatcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 49146359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 8120870 - 8121057
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  8120870 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtggacttatctactcgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagtttatcatagt 8120969  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8120970 ttcataagctgcttatgtcatattttaataagcttaaattttcagtttaccttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 8121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 12682818 - 12683008
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12682818 gccctgtttggattgacttattttgagtttatgtgggcttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 12682917  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12682918 agtttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaatctttagcttaccctccggcttaacaagaagcttatgaatttatgtaacc 12683008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13996930 - 13996740
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||    
T  13996930 gccctgtttggattggcttattttgaaattatgtgggtttatctactcccataagcctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttataat 13996831  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13996830 ggtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacc 13996740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Original strand, 5215384 - 5215573
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  5215384 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactttcataagcctttttaaagatgtttgggtaaataagtaaaaatagcttatcata 5215483  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5215484 gtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaacttccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 5215573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 233
Target Start/End: Original strand, 46760966 - 46761153
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46760966 cccgtttggattgacttattttgaacttatatgagcttatctacttgcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 46761065  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46761066 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 46761153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 230
Target Start/End: Original strand, 2473722 - 2473906
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  2473722 cccgtttggatcggtttattttgagcttatgtgggcttatctacgcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattatag 2473821  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2473822 tttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcctaaattttcagcttaccctcctacttaacaaggagcttatgaatttatgt 2473906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 6765458 - 6765645
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6765458 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgaatttatctacttttataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcata 6765557  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6765558 ttttcatgagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagtttatgaatttatgtaa 6765645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 17591689 - 17591876
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  17591689 gccccgtttggattggcttatt--gagcttatgtgg-cttatctactcccataagccttttcaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 17591785  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17591786 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaatttccagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 17591876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 15203110 - 15203300
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  15203110 gccccgtttgaattgacttattttaagcttttgtgggtttatctactcccataagcctttttaaaggtgttagggtaaataaataaaaatagcttatcat 15203209  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203210 agtttcataagctgtttatgccatatttcaataagcctaaattttcagccaaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 15203300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 23498458 - 23498648
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23498458 gccctgtttgaattggcttattttaagcttatgtgggcttatctacttccacaagcctttttcaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagttcatcat 23498557  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23498558 agtttcataagttgcttatatcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 23498648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51359423 - 51359234
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  51359423 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgcgggcttatttactgccataagccttcttaaaggt-tttgggtaaataattaaaaatagcttatcat 51359325  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51359324 agtttcataaggtgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagtttatgaatttatgtaacc 51359234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 7145207 - 7145395
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttatttt-gaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  7145207 cccgtttggattgacttatttttgagcttatgtgtatttatctactcccataagcctttttaaaagtgtt-gggtaaataaacaaaaatagtttatcata 7145305  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7145306 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 7145395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 80 - 234
Target Start/End: Original strand, 40149497 - 40149651
Alignment:
Q  80 gcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagc 179  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40149497 gcttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaataatttatcatagttttataagctgcttatgtcatattttaataagc 40149596  T
Q  180 ctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40149597 ctaaattttcagtttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 40149651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 230
Target Start/End: Original strand, 46409436 - 46409621
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46409436 ccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatctaatctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagt 46409535  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggc--ttaacaaagagcttatgaatttatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  46409536 ttcataagctgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcttacccttcgacaattaacaaggagcttatgaatttatgt 46409621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15554351 - 15554169
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  15554351 gccccgtttggattggcttaagttgagcttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatag-----cat 15554257  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
       ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15554256 ---ttcataaactgctgatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 15554169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17587694 - 17587522
Alignment:
Q  62 tattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctta 161  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17587694 tattttgagcttatgtgagcttatctattcgcataagcctttttaaaggtgtttggctaaataaataaaaacagcttatcatattttcataagctgctta 17587595  T
Q  162 tgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17587594 tgccatattttaataagcctaaattttcagcttacactctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 17587522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Original strand, 15717787 - 15717972
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||    
T  15717787 cgtttggattgacttattttgagtttatgttggcctatctaatttcataagcctttttaaaggtgtttgagtaaataaataaaaatagctt-tcatagtt 15717885  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15717886 tcataagctgcttatgccataatttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgattttatgtaacc 15717972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 211
Target Start/End: Original strand, 29695673 - 29695841
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataa-gcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29695673 gccctgtttggattggcttattttgagcttacgtgggcttatctactcccataatttttttttaaaggtgtttggataaataaataaaaataatttatca 29695772  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaa 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29695773 tagtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaa 29695841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 38171833 - 38172007
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||| ||||  |||||||||  |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  38171833 ccgtttgcattgacttattttgaatttatgtgaacttatctactcacataaacctttttaaaggtgtttggataaataaataaaaacagtttatcatagt 38171932  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||              ||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  38171933 ttcataagctgcttatg-------------tgcctaaattttcagcttatcctccggcttaagaatgagcttatgaatttatgtaacc 38172007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 175
Target Start/End: Original strand, 52086265 - 52086396
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| || ||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||    
T  52086265 gccctgtttggattgacttattttaagcttatgtgggtttatctgctcccataaacctttttaaaggtgtttgggtaaatcagtaaaaataacttatcat 52086364  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaat 175  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52086365 aatttcataagctgcttatgccataatttaat 52086396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 23323030 - 23322903
Alignment:
Q  61 ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctt 160  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23323030 ttattttgagcttatataggcttatctactcccataaactttttttaaggcgtttgaataaatcaataaaaatagtttatcataatttcataagctgctt 23322931  T
Q  161 atgccatattttaataagcctaaatttt 188  Q
    ||| |||| ||||||||||  |||||||    
T  23322930 atgtcatactttaataagcgcaaatttt 23322903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 5675103 - 5675176
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgg 117  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||   |||||| |||| |||| |||||||    
T  5675103 gccccgtttggattggcttattttaagcttatgttagcttatctactaacataagctttttgaaagatgtttgg 5675176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 3707 - 3898
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  3707 agccccgtttggattggtttattttgaacttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 3806  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3807 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 3898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 36703 - 36893
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36703 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcatttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 36802  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36803 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 36893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26323393 - 26323203
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  26323393 gccccgtttggattggtttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagtctttttaaagatgtttggataaataaataaaaatagcttatcat 26323294  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26323293 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 26323203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31517422 - 31517232
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  31517422 gccccgtttggattggcttattttgagcttatttgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 31517323  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31517322 agtttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaatttatgtaacc 31517232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 231
Target Start/End: Original strand, 1108278 - 1108464
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1108278 gccccgtttggat-ggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 1108376  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgta 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1108377 agtttcataagttgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgta 1108464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 48 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3873447 - 3873261
Alignment:
Q  48 cgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtt 147  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3873447 cgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcatagtt 3873348  T
Q  148 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3873347 tcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatataacc 3873261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33906254 - 33906064
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33906254 gccctgtttggattgacttattttgaacttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 33906155  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  33906154 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaagaaggagcttatgaatttatgtaacc 33906064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 44 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6175035 - 6174852
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6175035 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagcttatatactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 6174936  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaattta 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6174935 agtttcataagctgcttatgtcatatttcattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaattta 6174852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4232349 - 4232159
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4232349 gccccgtttggattggcttattttgtgcttatgtgggcttatctacttccataagtctttttaaatgtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 4232250  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4232249 agtttcataagctgcttatgccatattttcacaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 4232159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18807091 - 18806901
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18807091 gccccgtttggattggcttattttgagcttatatgagcttatctactctcataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 18806992  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18806991 agtttcataagctgcttatgctatattttaataagcctaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 18806901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 5733397 - 5733587
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  5733397 gccccatttagattggtttattttgagcttatgtgggcttatctactcccatcagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaacaacttatcat 5733496  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5733497 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgcaacc 5733587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 39635450 - 39635640
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  39635450 gccccgtttggattagcttattttgagcttatgtggacttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaatatagcttatcat 39635549  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39635550 agtttcataagctgcttatgtcatattttattaagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaacgagcttatcaatttatgtaacc 39635640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 4016039 - 4016227
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  4016039 cccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtgaataaataaaaataacgtatcatag 4016138  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4016139 tttcataagctgcttatgccatattttaacaagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 4016227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Original strand, 42937720 - 42937908
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42937720 ccgtttggattggcttattttgagcttatgtgagtttatctatttccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagt 42937819  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaat-aagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42937820 ttcataagctgcttatgccatattttaataaagcctaaattttcagcttaccctccgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 42937908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2178976 - 2178786
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  2178976 gccccgtttggattgatttattttaagtttatgtggacttatctattcgcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaacagcttatcat 2178877  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2178876 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 2178786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28330042 - 28329856
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28330042 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtgggcttatctacacccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 28329943  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28329942 tttcataaactgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccct--agcttaacaaggagcatatgaatttatgtaacc 28329856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19384125 - 19383952
Alignment:
Q  61 ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctt 160  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  19384125 ttattttgagtttatatgagcttatctattctcataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcatagtttcataagttgttt 19384026  T
Q  161 atgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19384025 atgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 19383952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30270886 - 30270698
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||||||    
T  30270886 gccccgtttggattggcttattttaagcttatatgagtttatctactcccataagcctttttaaaagtgtttggataaataaaataaaatagtttatcat 30270787  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaa 232  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30270786 agtttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaa 30270698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1483106 - 1482921
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||    
T  1483106 ccgttttgattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcc-ataagcttttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttattattgt 1483008  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1483007 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagtttacccttcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaac 1482921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19901344 - 19901155
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  19901344 gccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttctctacttccataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataa-taaaaatagcttatcat 19901246  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19901245 agtttcataaactgcttatgccatatttcaataagcctaaattttcagcccacccttcggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 19901155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30420373 - 30420223
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30420373 ccccgtttggattggcttattttgagcttatgtgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcata 30420274  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaactta 195  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30420273 ggttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagctta 30420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16588980 - 16588793
Alignment:
Q  47 ccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagt 146  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  16588980 ccgtttggattggcttattttgtgtttatgtgggcttatctactttcataagtctttttaaagaagtttgggtaaataaataaaaatagcttattatagt 16588881  T
Q  147 ttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  16588880 ttcataagctgcttatgccatattttcataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaataaggagcttatgaattaatgtaacc 16588793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Original strand, 850997 - 851185
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||     
T  850997 cccgtttggatttgcttattttaagcttatgtaggcttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaatagagcttatcataa 851096  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  851097 ttttataagctgcttatgccatattttaataagcttaaatttttagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 851185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16066495 - 16066311
Alignment:
Q  50 tttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttc 149  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16066495 tttgaattggcttattttgagcttatgtgggcttatctgctttcataagtcttttttaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatagtttc 16066396  T
Q  150 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16066395 ataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctctgatttaataaggagcttatgaatttatgtaacc 16066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Original strand, 429831 - 430004
Alignment:
Q  61 ttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgctt 160  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  429831 ttattttgaatttatgtggatttatctactctcataagcctttttaaaagtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcataatttcataagttgctt 429930  T
Q  161 atgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  429931 atgcgatattttaataagcctaaattttcaacttacaattcgacttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 430004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44947750 - 44947566
Alignment:
Q  43 agccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||| |||| ||||| |||||||||  ||||||| | ||||||| | | |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  44947750 agccccatttgtattggcttattttgatcttatgtgagtttatctagtgccataagcatttttaaaagtgtttggataaataaataaaaatagtttatca 44947651  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  44947650 tagtttcataagctgcttatgccatattt-------gctaaattttcagtttaccctccggcttaacaagaagtttatgaatttatgtaacc 44947566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42446776 - 42446642
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |  ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  ||||||     
T  42446776 gccccgtttggattggcttattcggagtttatgcgaacttatctactaacataagcctttttaaaggtgtttaggtaaatcaataaaaacaacttatcac 42446677  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataag 178  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42446676 aatttcataagctgcttatgccatattttaataag 42446642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22101353 - 22101203
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||  ||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |  ||||||     
T  22101353 gccccgtttgaattgggttattcagaatttatgtggt-ttatctactaacataagcctttttaaaggtatttgtataaatcaataaaaacaacttatcac 22101255  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaactta 195  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22101254 aatttcataagctgcttatgtcatattttaataagcccaaattttgaactta 22101203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 3585338 - 3585430
Alignment:
Q  94 ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaatt 186  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3585338 ataaaccttattaaatgtgttttggtaaattaataaaaacaatttatcacaatttcataagctgcttatgccatattttaataagcctgaatt 3585430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30420227 - 30420194
Alignment:
Q  203 gcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacccc 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30420227 gcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacccc 30420194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 23
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  213 gccccgtttgtattggcttaagttgagtttatatgggcttatctactcccataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcat 114  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  113 agtttcataagctgcttatgccatattttaataatcctaaattttcagcttaccctctggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 23  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 10236 - 10426
Alignment:
Q  44 gccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcat 143  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10236 gccccgtttggattgacttattttgagcttatatgggtttatctactctcataagccttcttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagtttatcat 10335  T
Q  144 agtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10336 agtttcataagctgcttataccatattttaataagcctaaattttcagcttaccctccagcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 10426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 145450 - 145262
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcatag 145  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  145450 cccgtttggattgacttattttgagtttatgtggacttatctactcccataagcttttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatcatag 145351  T
Q  146 tttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  145350 tttcataagctgcttatgtcatattttaataagcctaaattttcagcttacccttcggcttaacaaggagcttataaatttatgtaacc 145262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 312
Alignment:
Q  45 ccccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatctactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatcata 144  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  501 ccccgtttggattggcttattttgagtttatgtgagtttatctactcccataagtctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagattatcata 402  T
Q  145 gtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  401 gtttcataagctgcttatgtcatatttcaataagcttaaactttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 46 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 23
Alignment:
Q  46 cccgtttggattggtttattttgaggttatgtgggcttatc---tactcctataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatattttatca 142  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  212 cccgtttggattgacttattttgagcttatgtggacttatcatctactcc-ataagcctttttaaaggtgtttgggtaaataaataaaaatagcttatca 114  T
Q  143 tagtttcataagctgcttatgccatattttaataagcctaaattttcaacttaccctccggcttaacaaagagcttatgaatttatgtaacc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  113 tagtttcatatgctgcttatgccat-tttcaataagcctaaattttcagcttaccctccggcttaacaaggagcttatgaatttatgtaacc 23  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University