View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9889_high_10 (Length: 375)

Name: NF9889_high_10
Description: NF9889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9889_high_10
NF9889_high_10
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (166-374)||(11602290-11602498)
chr4 (166-375)||(35402970-35403180)
chr4 (166-375)||(42981232-42981442)
chr4 (166-375)||(54386761-54386963)
chr4 (166-375)||(49523746-49523954)
chr4 (166-375)||(41761029-41761239)
chr4 (177-375)||(2692588-2692777)
chr4 (166-374)||(41782134-41782343)
chr4 (166-375)||(51012538-51012749)
chr4 (166-375)||(43520050-43520260)
chr4 (21-162)||(11602082-11602223)
chr4 (166-372)||(11255235-11255444)
chr4 (166-371)||(48646053-48646249)
chr4 (21-162)||(49523538-49523679)
chr4 (15-162)||(11255511-11255658)
chr4 (33-162)||(43519854-43519983)
chr4 (28-162)||(41781933-41782067)
chr4 (168-332)||(52867502-52867669)
chr4 (28-162)||(41761306-41761439)
chr4 (48-162)||(48646316-48646430)
chr4 (28-158)||(52867742-52867872)
chr4 (33-154)||(2692830-2692951)
chr4 (33-162)||(35403239-35403368)
chr4 (272-375)||(319964-320066)
chr4 (272-375)||(4172804-4172906)
chr4 (272-375)||(33265305-33265407)
chr4 (33-162)||(42981036-42981165)
chr4 (28-162)||(54386560-54386694)
chr4 (272-375)||(43507948-43508050)
chr4 (106-162)||(320171-320227)
chr4 (106-162)||(4173011-4173067)
chr4 (106-162)||(33265144-33265200)
chr4 (110-162)||(43507791-43507843)
chr4 (33-119)||(51012351-51012437)
chr4 (341-375)||(11640838-11640872)
[»] chr7 (45 HSPs)
chr7 (166-373)||(37792338-37792545)
chr7 (166-372)||(48851628-48851838)
chr7 (166-375)||(23905554-23905764)
chr7 (200-374)||(38473427-38473600)
chr7 (176-375)||(6604146-6604347)
chr7 (166-375)||(27665348-27665557)
chr7 (166-375)||(35692652-35692862)
chr7 (183-375)||(39858544-39858737)
chr7 (183-375)||(13168712-13168905)
chr7 (166-375)||(37114830-37115032)
chr7 (166-369)||(46438818-46439022)
chr7 (166-339)||(30939747-30939921)
chr7 (185-374)||(34776264-34776454)
chr7 (23-162)||(23905831-23905970)
chr7 (272-375)||(38550572-38550675)
chr7 (166-375)||(66693-66902)
chr7 (272-375)||(29995818-29995921)
chr7 (23-162)||(30939988-30940127)
chr7 (272-375)||(47385512-47385615)
chr7 (272-374)||(22154619-22154721)
chr7 (272-374)||(22210534-22210636)
chr7 (33-162)||(29996073-29996202)
chr7 (33-162)||(35692929-35693058)
chr7 (230-375)||(45360014-45360159)
chr7 (18-162)||(46439089-46439233)
chr7 (15-162)||(38473697-38473844)
chr7 (176-375)||(24227723-24227924)
chr7 (33-162)||(48851905-48852034)
chr7 (33-160)||(27665626-27665753)
chr7 (15-146)||(37795765-37795896)
chr7 (77-162)||(6604007-6604092)
chr7 (17-162)||(37115099-37115244)
chr7 (77-162)||(39858798-39858883)
chr7 (21-162)||(47385782-47385923)
chr7 (15-161)||(45359744-45359889)
chr7 (166-261)||(29995910-29996006)
chr7 (106-162)||(35402891-35402947)
chr7 (48-146)||(37795437-37795535)
chr7 (77-161)||(13168566-13168650)
chr7 (77-157)||(34776499-34776579)
chr7 (280-375)||(35402662-35402756)
chr7 (77-162)||(24227978-24228063)
chr7 (106-162)||(66570-66626)
chr7 (166-228)||(47385652-47385715)
chr7 (183-228)||(45359951-45359997)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (166-375)||(42942406-42942616)
chr8 (166-375)||(41041886-41042096)
chr8 (166-375)||(38547838-38548049)
chr8 (166-375)||(8609109-8609319)
chr8 (166-374)||(13283008-13283217)
chr8 (166-375)||(33708112-33708322)
chr8 (166-375)||(7744433-7744635)
chr8 (166-375)||(13107675-13107886)
chr8 (166-370)||(13485416-13485620)
chr8 (166-375)||(27691786-27691988)
chr8 (186-375)||(40338982-40339172)
chr8 (166-334)||(5037071-5037240)
chr8 (169-375)||(9672477-9672678)
chr8 (272-375)||(22272978-22273081)
chr8 (21-162)||(5036863-5037004)
chr8 (21-162)||(40339259-40339400)
chr8 (21-162)||(42942198-42942339)
chr8 (33-162)||(33708389-33708518)
chr8 (15-158)||(41825233-41825376)
chr8 (28-162)||(9672748-9672882)
chr8 (304-374)||(26239745-26239815)
chr8 (33-162)||(13485680-13485809)
chr8 (33-162)||(27691590-27691719)
chr8 (166-261)||(22272893-22272989)
chr8 (272-375)||(29237914-29238016)
chr8 (21-124)||(38547639-38547742)
chr8 (48-162)||(22272712-22272826)
chr8 (21-162)||(41042163-41042304)
chr8 (33-162)||(26239986-26240115)
chr8 (272-375)||(35510136-35510238)
chr8 (289-375)||(41824973-41825059)
chr8 (272-375)||(15307013-15307114)
chr8 (272-375)||(15487382-15487483)
chr8 (272-374)||(33761762-33761863)
chr8 (106-162)||(35509975-35510031)
chr8 (272-371)||(600931-601029)
chr8 (166-228)||(41825118-41825181)
chr8 (177-238)||(26239850-26239912)
chr8 (28-124)||(13282816-13282912)
chr8 (106-162)||(29237754-29237810)
chr8 (106-162)||(33761989-33762045)
chr8 (79-162)||(7744702-7744785)
chr8 (106-162)||(601134-601190)
chr8 (21-124)||(8609415-8609518)
chr8 (304-375)||(27405445-27405515)
[»] chr5 (26 HSPs)
chr5 (166-375)||(8540282-8540493)
chr5 (166-375)||(32135136-32135346)
chr5 (166-375)||(28820992-28821202)
chr5 (166-371)||(21841613-21841819)
chr5 (166-375)||(24540493-24540703)
chr5 (183-375)||(12800557-12800750)
chr5 (166-375)||(7268455-7268667)
chr5 (183-375)||(12737734-12737927)
chr5 (206-375)||(30464939-30465108)
chr5 (183-375)||(2180404-2180596)
chr5 (33-162)||(2853888-2854017)
chr5 (272-375)||(2853570-2853673)
chr5 (33-162)||(24540770-24540899)
chr5 (33-162)||(30467848-30467977)
chr5 (15-162)||(2180197-2180343)
chr5 (168-259)||(18624418-18624510)
chr5 (166-263)||(2853723-2853821)
chr5 (21-134)||(28820798-28820911)
chr5 (21-124)||(17574731-17574834)
chr5 (77-162)||(12737588-12737673)
chr5 (77-162)||(12800411-12800496)
chr5 (21-124)||(7268256-7268359)
chr5 (33-162)||(18624579-18624708)
chr5 (304-375)||(42472785-42472855)
chr5 (77-124)||(21841470-21841517)
chr5 (106-162)||(42472990-42473046)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (166-375)||(26224855-26225065)
chr1 (166-375)||(3012755-3012964)
chr1 (166-375)||(51895467-51895677)
chr1 (166-375)||(4855268-4855480)
chr1 (166-375)||(34777439-34777651)
chr1 (176-375)||(6818018-6818218)
chr1 (166-375)||(33600454-33600663)
chr1 (176-375)||(31237808-31238008)
chr1 (176-375)||(2870221-2870421)
chr1 (168-375)||(15105068-15105268)
chr1 (166-375)||(27087895-27088110)
chr1 (166-375)||(46582890-46583092)
chr1 (166-375)||(52642938-52643138)
chr1 (48-162)||(46583160-46583274)
chr1 (21-162)||(3013031-3013172)
chr1 (183-366)||(50555414-50555602)
chr1 (21-161)||(33600731-33600871)
chr1 (33-162)||(2870015-2870144)
chr1 (33-159)||(45046064-45046190)
chr1 (28-162)||(52643205-52643339)
chr1 (166-324)||(45045834-45045994)
chr1 (272-374)||(8168634-8168735)
chr1 (33-162)||(31238063-31238192)
chr1 (15-162)||(15104852-15104999)
chr1 (21-162)||(37344756-37344899)
chr1 (15-124)||(27087690-27087799)
chr1 (48-162)||(51895744-51895858)
chr1 (21-162)||(25277936-25278079)
chr1 (33-124)||(4855576-4855667)
chr1 (166-263)||(37344966-37345064)
chr1 (106-162)||(8168840-8168896)
chr1 (91-162)||(6818272-6818343)
chr1 (21-124)||(34777746-34777849)
chr1 (34-124)||(26225160-26225250)
chr1 (166-258)||(25277776-25277869)
chr1 (77-162)||(50555663-50555748)
chr1 (106-162)||(20944372-20944428)
chr1 (77-152)||(35009302-35009377)
chr1 (91-161)||(42559474-42559544)
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (166-375)||(41978360-41978570)
chr3 (166-375)||(42280128-42280330)
chr3 (166-374)||(17515942-17516151)
chr3 (166-375)||(23292471-23292682)
chr3 (166-375)||(43765752-43765963)
chr3 (166-375)||(44275518-44275728)
chr3 (166-375)||(30599509-30599711)
chr3 (166-375)||(51685232-51685433)
chr3 (172-375)||(27898416-27898620)
chr3 (166-375)||(7884195-7884405)
chr3 (166-375)||(21349326-21349536)
chr3 (166-375)||(48830126-48830328)
chr3 (166-375)||(2660845-2661056)
chr3 (166-375)||(46198353-46198562)
chr3 (183-375)||(2377645-2377838)
chr3 (166-367)||(53190172-53190376)
chr3 (272-375)||(46113206-46113309)
chr3 (166-375)||(35905027-35905244)
chr3 (21-162)||(46198144-46198285)
chr3 (166-375)||(44794839-44795041)
chr3 (166-375)||(2225474-2225685)
chr3 (28-162)||(44275795-44275929)
chr3 (21-162)||(17515734-17515875)
chr3 (166-371)||(54899049-54899251)
chr3 (28-162)||(48830395-48830529)
chr3 (168-375)||(610234-610436)
chr3 (35-162)||(44794645-44794772)
chr3 (28-162)||(51685031-51685165)
chr3 (33-162)||(2660649-2660778)
chr3 (50-162)||(23292749-23292861)
chr3 (21-162)||(21349118-21349259)
chr3 (77-162)||(27898670-27898755)
chr3 (28-131)||(610031-610134)
chr3 (21-124)||(2225781-2225884)
chr3 (272-375)||(38192575-38192677)
chr3 (272-375)||(46309731-46309833)
chr3 (33-162)||(42279932-42280061)
chr3 (272-375)||(46609840-46609942)
chr3 (272-375)||(53093315-53093417)
chr3 (33-162)||(2377456-2377584)
chr3 (77-158)||(43765600-43765681)
chr3 (21-162)||(46112900-46113041)
chr3 (177-315)||(24845515-24845656)
chr3 (106-162)||(38192782-38192838)
chr3 (21-124)||(54898850-54898953)
chr3 (28-124)||(41978168-41978264)
chr3 (106-162)||(53093545-53093601)
chr3 (33-124)||(7884501-7884592)
chr3 (21-124)||(35905340-35905443)
chr3 (106-162)||(46309570-46309626)
chr3 (168-238)||(46113110-46113179)
chr3 (338-375)||(24845666-24845705)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (166-375)||(17696838-17697048)
chr2 (166-375)||(39455791-39456000)
chr2 (166-375)||(40560856-40561066)
chr2 (183-375)||(19907581-19907774)
chr2 (166-375)||(6798139-6798347)
chr2 (166-375)||(44709059-44709269)
chr2 (167-375)||(16763573-16763787)
chr2 (183-375)||(39664083-39664277)
chr2 (169-375)||(42518535-42518743)
chr2 (166-375)||(14388404-14388606)
chr2 (21-162)||(2767358-2767498)
chr2 (21-162)||(44709336-44709477)
chr2 (17-162)||(17696626-17696771)
chr2 (15-162)||(39455577-39455724)
chr2 (15-161)||(14388674-14388819)
chr2 (48-162)||(40560674-40560789)
chr2 (166-263)||(2767565-2767663)
chr2 (77-162)||(19907835-19907920)
chr2 (304-375)||(2767684-2767755)
chr2 (273-375)||(6784591-6784692)
chr2 (77-162)||(39664338-39664423)
chr2 (79-162)||(6797989-6798072)
chr2 (280-375)||(24206843-24206937)
chr2 (77-162)||(42518813-42518898)
chr2 (33-161)||(37645912-37646040)
chr2 (184-234)||(37646079-37646129)
chr2 (272-313)||(37646100-37646141)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (166-375)||(6900106-6900308)
chr6 (166-375)||(32438382-32438593)
chr6 (166-375)||(7050379-7050581)
chr6 (170-375)||(20524002-20524209)
chr6 (176-375)||(11355831-11356031)
chr6 (166-374)||(10569021-10569223)
chr6 (272-375)||(7372284-7372387)
chr6 (48-162)||(7372539-7372653)
chr6 (28-161)||(6899905-6900038)
chr6 (77-162)||(11355692-11355777)
chr6 (21-162)||(20523790-20523931)
chr6 (169-261)||(7372376-7372469)
chr6 (177-346)||(21091574-21091736)
chr6 (48-161)||(7050198-7050311)
chr6 (21-162)||(32517291-32517434)
chr6 (311-375)||(18644031-18644095)
chr6 (166-251)||(18643950-18644036)
chr6 (166-263)||(32517501-32517599)
chr6 (25-124)||(32438691-32438790)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (166-375)||(3916-4126)
scaffold0058 (166-375)||(5088-5298)
scaffold0058 (77-162)||(3764-3849)
scaffold0058 (77-162)||(4936-5021)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (168-375)||(107887-108087)
scaffold0004 (48-162)||(108156-108270)
[»] scaffold0564 (2 HSPs)
scaffold0564 (166-375)||(8882-9091)
scaffold0564 (28-162)||(8681-8815)
[»] scaffold0345 (2 HSPs)
scaffold0345 (176-375)||(184-384)
scaffold0345 (77-162)||(45-130)
[»] scaffold1454 (1 HSPs)
scaffold1454 (28-124)||(1685-1781)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 374
Target Start/End: Original strand, 11602290 - 11602498
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcn 265  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  11602290 taattaatgatttttgcacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgataacttgatggatatgtaatgttct 11602389  T
Q  266 nnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttt 365  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11602390 ttttttggctaagaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttt 11602489  T
Q  366 tactttgtt 374  Q
    |||||||||    
T  11602490 tactttgtt 11602498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35403180 - 35402970
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  35403180 taattaatgttttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 35403081  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  35403080 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcgtttacttt 35402981  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  35402980 ttactttgttc 35402970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 42981232 - 42981442
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  42981232 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggacatgtaattacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 42981331  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  42981332 tttttttgactatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 42981431  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  42981432 ttactttgttc 42981442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 54386761 - 54386963
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||| ||||     
T  54386761 taattaatgctttttggacttgtttaatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtagtgtta 54386852  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54386853 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 54386952  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  54386953 ttactttgttc 54386963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 49523746 - 49523954
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  49523746 taattaatgttttttggacttgt--agtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 49523843  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  49523844 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtgtttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 49523943  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  49523944 ttactttgttc 49523954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41761239 - 41761029
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttgg-atatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||     
T  41761239 taattaatgttttttggacttgttttgtttatgcttttttgcatatgtaatcacttgagaacatcaaatgatttgatgacttgatagctatgtaatgtta 41761140  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           |  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41761139 tttttttgattatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttt 41761040  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  41761039 ttactttgttc 41761029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2692777 - 2692588
Alignment:
Q  177 ttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggcta 276  Q
    |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||| ||||       ||| |    
T  2692777 ttttggactagtttaattaatgctttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaa-gttctttttttggcca 2692687  T
Q  277 tgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2692686 tgtaatgacttatgaacatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttc 2692588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 374
Target Start/End: Original strand, 41782134 - 41782343
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||||| ||||||||     
T  41782134 taattattgctttttagacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaataacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatggctacgtaatgtta 41782233  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41782234 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatagtgtgcatatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 41782333  T
Q  365 ttactttgtt 374  Q
    ||||||||||    
T  41782334 ttactttgtt 41782343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 51012538 - 51012749
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||   || || | |||||||||||||||||||     
T  51012538 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatcttttgatgatttgatggctatgtaatgtta 51012637  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51012638 ttttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactt 51012737  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  51012738 tttactttgttc 51012749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 43520050 - 43520260
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttg-gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  43520050 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttagatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 43520149  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43520150 tttttttggctatgtaatgactcatgagcatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 43520249  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  43520250 ttactttgttc 43520260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 11602082 - 11602223
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  11602082 agaggatcagttcttttaaacaacaggcataaacaaacaccagtgaagggtccgactccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatc 11602181  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  11602182 caaattacgggtcatctccttctaatcaaccccaatacatgg 11602223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11255444 - 11255235
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttg-gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||     
T  11255444 taattaatgctttttggacttgtttagtttatactttttttgatatgtaatcacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 11255345  T
Q  265 nnnnnnn--ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttact 362  Q
             | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11255344 tttttttttgcctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttact 11255245  T
Q  363 ttttactttg 372  Q
    ||||||||||    
T  11255244 ttttactttg 11255235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48646249 - 48646053
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||     
T  48646249 taattaatgctttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtagtgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgtta 48646158  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48646157 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtc--tctttttacaatcaaagtatttgtcttttacttt 48646060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 49523538 - 49523679
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| || ||| |||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  49523538 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacatcaatgaggggtcctactccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatc 49523637  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  49523638 caaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 49523679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11255658 - 11255511
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||||| || | ||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  11255658 gacatgagaggaccactgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactcaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcatggagttattagagttc 11255559  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11255558 caaattcaaattacgggtcatcagcttctactcaaccccaatacatgg 11255511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 43519854 - 43519983
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| | | ||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43519854 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccacttaggggtcttgctccactagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggt 43519953  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43519954 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 43519983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 41781933 - 41782067
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41781933 cagtgatttcaaatgacaggcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaatta 41782032  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  41782033 cgggtcatccacttctactcaaccctaatacatgg 41782067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52867669 - 52867502
Alignment:
Q  168 attaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgt--tc 264  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||  |     
T  52867669 attaatgctttttggacttgtttagtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgcaatgttatt 52867570  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtc 332  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52867569 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtc 52867502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41761439 - 41761306
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41761439 cagtgatttcaaataacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaa-tccaactgctcctgaagttattagagttccaaatccaaatta 41761341  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||  |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41761340 cggaccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 41761306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48646430 - 48646316
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||| |||||| || |||||||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  48646430 cataatcaaacatcattgaagggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattgtgggccatctgcttctactc 48646331  T
Q  148 aaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||    
T  48646330 aaccccaatacatgg 48646316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52867872 - 52867742
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||    
T  52867872 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggaattattagagtttcaaatccaagtta 52867773  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatac 158  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  52867772 cgggccatccgcttctactcaaccccaatac 52867742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2692951 - 2692830
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||||    |||| |||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  2692951 atttcaaatgacaagcttaaacaaacaccactgaggggtcctgctccaaaaaatccaactactcctagagttatttgagttccaaattcaaattacgggc 2692852  T
Q  133 catctgcttttactcaacccca 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  2692851 catctgcttctactcaacccca 2692830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35403368 - 35403239
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  35403368 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccagatccaaattacgggc 35403269  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| || |||||| ||||||||||    
T  35403268 catccgcttctaatcaaccgcaatacatgg 35403239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 320066 - 319964
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  320066 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 319968  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  319967 gttc 319964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4172906 - 4172804
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  4172906 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 4172808  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  4172807 gttc 4172804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 33265305 - 33265407
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33265305 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 33265403  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  33265404 gttc 33265407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 42981036 - 42981165
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaaggg-tctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacggg 131  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  42981036 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccgttgaggggttctg-ctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagttccaaatccaaattacagg 42981134  T
Q  132 tcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
     |||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  42981135 acatccgcttctactcaaccccaaaacatgg 42981165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 54386560 - 54386694
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||    |||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  54386560 cagtgatttcgaatgacagacataaacaagcaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaattgctcctggagttattagagtttcaaatccaaattg 54386659  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  54386660 cgagtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 54386694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 43507948 - 43508050
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43507948 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttaggatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 43508046  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  43508047 gttc 43508050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 320227 - 320171
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  320227 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgg 320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 4173067 - 4173011
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  4173067 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgg 4173011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Original strand, 33265144 - 33265200
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  33265144 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgg 33265200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Original strand, 43507791 - 43507843
Alignment:
Q  110 agttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43507791 agttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 43507843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 119
Target Start/End: Original strand, 51012351 - 51012437
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaat 119  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| || ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  51012351 atttcaaatgacatgcataaacaaacatcactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagctattagagttccaaat 51012437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 341 - 375
Target Start/End: Original strand, 11640838 - 11640872
Alignment:
Q  341 atcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11640838 atcaaagtgtatgttttttactttttactttgttc 11640872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 45)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 166 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37792545 - 37792338
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcn 265  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||     
T  37792545 taattaatgctttttggacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgatgacttaatgactatgtaatgttct 37792446  T
Q  266 nnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttt 365  Q
          ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||    
T  37792445 ttttttggctatgtaattacttatgaacatcaaatgtatgacatatgatggtaagcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtctttgacttttactttt 37792346  T
Q  366 tactttgt 373  Q
    ||||||||    
T  37792345 tactttgt 37792338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 48851838 - 48851628
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc- 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  48851838 taattaatgttttttggacttgtttaatttatgttttttagatatataatgacttaagaacatcaaatgacttgatgacttgatggctatgtaatgttct 48851739  T
Q  265 ---nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttac 361  Q
               |||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  48851738 tttttttttttgctatgtaaagacttatgaacatcaaatgtataacttctgatggtatgcaaatgtatgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttac 48851639  T
Q  362 tttttactttg 372  Q
    |||||||||||    
T  48851638 tttttactttg 48851628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23905764 - 23905554
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||  ||||||| ||| ||||||||     
T  23905764 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatggtttgatggcttgatgactacgtaatgtta 23905665  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  23905664 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttttcttttacttt 23905565  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  23905564 ttactttgttc 23905554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38473600 - 38473427
Alignment:
Q  200 tttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaa 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38473600 tttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaa 38473501  T
Q  300 tgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38473500 tatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgt-ttttactttttactttgtt 38473427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 6604146 - 6604347
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnng-g 273  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||          |    
T  6604146 tttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttggtggctatgtaatgttaattttttttg 6604245  T
Q  274 ctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6604246 ctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgt 6604345  T
Q  374 tc 375  Q
    ||    
T  6604346 tc 6604347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27665557 - 27665348
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttgga-tatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  27665557 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttgaatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtt- 27665459  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           || |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27665458 attttttggttatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgcctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 27665359  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  27665358 ttactttgttc 27665348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35692862 - 35692652
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| || || |||||||| |||| |||||||     
T  35692862 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcacatgattttatgacttgatgactatttaatgtta 35692763  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  35692762 tttttttgtctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttgcttt 35692663  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||| ||||    
T  35692662 ttacttcgttc 35692652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39858737 - 39858544
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        ||||| | ||    
T  39858737 acttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctaagtaa 39858638  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39858637 tgacttatgaacatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttc 39858544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 13168712 - 13168905
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  13168712 acttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 13168811  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  13168812 tgacttatgaacatcaaatatatgatttataatgatatgcaaatgtctgtatttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttattttgttc 13168905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37115032 - 37114830
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        |||| ||||||||||||     
T  37115032 taattaatgcttattggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt--------gatgactatgtaatgtta 37114941  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  37114940 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttacttt 37114841  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  37114840 ttactttgttc 37114830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 166 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 46439022 - 46438818
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||     
T  46439022 taattaatgatttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggttatgtaatgtta 46438923  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  46438922 tttttttggctatgtaatcacttatgaacattaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtccgtctttctataatcaaagtgtttgtcttctacttt 46438823  T
Q  365 ttact 369  Q
    |||||    
T  46438822 ttact 46438818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 30939921 - 30939747
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  30939921 taattaatactttttgaacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 30939822  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttac 339  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  30939821 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttac 30939747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 185 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34776454 - 34776264
Alignment:
Q  185 ttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaatg 283  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||        ||||||| ||||    
T  34776454 ttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaatg 34776355  T
Q  284 acttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34776354 acttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatctgagtgtctgtcttttagtttttactttgtt 34776264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23905970 - 23905831
Alignment:
Q  23 aggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattca 122  Q
    |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23905970 aggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatcca 23905871  T
Q  123 aattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23905870 aattacgggtcatccgcttctactcaacctcaatacatgg 23905831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38550675 - 38550572
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38550675 ggctatgtaatgacttatgaaaattaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttatttt 38550576  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  38550575 gttc 38550572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 66693 - 66902
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt- 263  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  66693 taattaatgctttttgaacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttaatgacttgatgactatgtaatgttg 66792  T
Q  264 cnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| |||||| | ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  66793 ttttttttggctatgtaatgacttattaacatcaaatat-tgac-tatgatataatgcaaatgcctttctttttataatcaaagtgtctgtcttttactt 66890  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  66891 tttactttgttc 66902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29995921 - 29995818
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29995921 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttacttt 29995822  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  29995821 gttc 29995818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 23 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30940127 - 30939988
Alignment:
Q  23 aggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattca 122  Q
    |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  30940127 aggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccgctgaggggtcttgctccacaaaatccaactgctcctggagttattacagttccaaatcca 30940028  T
Q  123 aattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30940027 aattatgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 30939988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47385615 - 47385512
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47385615 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtatcagttatgatggtatgtaaatgtctgtctttttacaatcaatgtgtctgtcttttactttttacttt 47385516  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  47385515 gttc 47385512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Original strand, 22154619 - 22154721
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22154619 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttacttt 22154718  T
Q  372 gtt 374  Q
    |||    
T  22154719 gtt 22154721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Original strand, 22210534 - 22210636
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22210534 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagagtctgtcttttactttttacttt 22210633  T
Q  372 gtt 374  Q
    |||    
T  22210634 gtt 22210636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29996202 - 29996073
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29996202 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaggatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggt 29996103  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29996102 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 29996073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35693058 - 35692929
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  35693058 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaagggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagccctaaatccaaattacgggt 35692959  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35692958 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 35692929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Original strand, 45360014 - 45360159
Alignment:
Q  230 aaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtct 329  Q
    |||||| || || |||||||| ||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  45360014 aaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtct 45360113  T
Q  330 gtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  45360114 gtctttttataatcaaagtgtttatcttttagtttttactttgttc 45360159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 46439233 - 46439089
Alignment:
Q  18 atcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaa 117  Q
    |||||||||  ||| ||||||||  |||  ||||||||||||||| | | |||||    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  46439233 atcagaggactagtgatttcaaacgacatgcataaacaaacaccattaaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcttggagttgttagagttccaa 46439134  T
Q  118 attcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46439133 atccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 46439089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38473844 - 38473697
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  38473844 gacatgagaggactagtgatttcaaatgacacgcataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatacaactgctcatagagttattagagttc 38473745  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
     ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38473744 taaatcaaaattacgggtcatccgcttttactcaaccccaatacatgg 38473697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24227924 - 24227723
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggct 275  Q
    ||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||| || || |||| ||||| ||||||||||        ||||    
T  24227924 tttttggactagtttaattaatgttttttggatatgtaattccttaagaatatcgaatgatttgatgactttatggcaatgtaatgttatttttttggct 24227825  T
Q  276 atgaaatgactt--atgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgt 373  Q
    ||| ||||| ||  ||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24227824 atgtaatgaattttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatacaaatgtctgtctttttgtaatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgt 24227725  T
Q  374 tc 375  Q
    ||    
T  24227724 tc 24227723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48852034 - 48851905
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||| |    |||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48852034 atttcaaatgacagacataaacaaacactactgaggggccctgctccacaaagtccaactgcttctggagttattagagttccaaatccaaattacgggt 48851935  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48851934 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 48851905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27665753 - 27665626
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggt-ctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacggg 131  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  27665753 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggttctgct-ccacaagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgag 27665655  T
Q  132 tcatctgcttttactcaaccccaatacat 160  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  27665654 tcatccgcttctactcaaccccaatacat 27665626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37795896 - 37795765
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| ||| || |||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||| | ||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  37795896 gacatgagaagaccagtgatttcaaataacatgcataaacaaacatcagtgcaaggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttc 37795797  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttact 146  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  37795796 caaatccaaattacgggccatccgcttctact 37795765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 6604007 - 6604092
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  6604007 tccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacgagtcatccgcttctactcaacctcaatacatgg 6604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 37115244 - 37115099
Alignment:
Q  17 catcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttcca 116  Q
    |||||||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  37115244 catcagaggaccagtgatttcaaatggcatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactactcctggagttattagagttcca 37115145  T
Q  117 aattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||| ||||||||  | |||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  37115144 aatccaaattacatgccatccgcttctactcaaccataatacatgg 37115099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39858883 - 39858798
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39858883 tccacaaaattcaactgctcatagagttattagatttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 39858798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 47385923 - 47385782
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||     
T  47385923 agaggaccagtgattttaaatgacaggcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcttagagttaccagagttccaaatc 47385824  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||    
T  47385823 caaattacgggtcatccgcttctacccaactccaatacatgg 47385782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 45359744 - 45359889
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||| |||  |||||||||||| || ||| ||  ||| | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||    
T  45359744 gacatgagaggacctgtgatttcaaatgacatgcataaacaaacatcactgagggtcctgct-ccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttc 45359842  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
    |||||  |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  45359843 caaatcgaaattacgggccatccgcttatactcaaccccaatacatg 45359889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 29996006 - 29995910
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttg-gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatg 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  29996006 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttagatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatg 29995910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 35402947 - 35402891
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35402947 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 35402891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37795535 - 37795437
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttact 146  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||    
T  37795535 cataaacaaacatcagtgcaaggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctact 37795437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 161
Target Start/End: Original strand, 13168566 - 13168650
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
    |||||||||| || |||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13168566 tccacaaaattcaactgcttctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatg 13168650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34776579 - 34776499
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaata 157  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  34776579 tccacaaaattcaactgctcctagagttattagaattccaaatccaaattacggatcatccgcttctactcaaccccaata 34776499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35402756 - 35402662
Alignment:
Q  280 aatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  35402756 aatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttatcttttacattttactttgttc 35402662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24228063 - 24227978
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||  |||  |||||||||||||||||||    
T  24228063 tccacaaaatccaactgctcctggagttattagatttccaaatccaaattatgggcaatcctcttccactcaaccccaatacatgg 24227978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Original strand, 66570 - 66626
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  66570 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 66626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47385715 - 47385652
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacat 228  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  47385715 taattaatactttttggacttgtttaattaatgcttttttggatatgtaatgacttgagaacat 47385652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 183 - 228
Target Start/End: Original strand, 45359951 - 45359997
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45359951 acttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacat 45359997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 42942406 - 42942616
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  42942406 taattaatgctttttggacttgtttagtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 42942505  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  42942506 tttttctggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtatgtcttttacttt 42942605  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  42942606 ttactttgttc 42942616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41042096 - 41041886
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  41042096 taattaatgccttttagacttgtttagtttatgctttttaggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtaa 41041997  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41041996 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcagatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 41041897  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  41041896 ttactttgttc 41041886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 38547838 - 38548049
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  38547838 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 38547937  T
Q  265 nnnnnnng-gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
             |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38547938 tttttttttgctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactt 38548037  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  38548038 tttactttgttc 38548049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8609319 - 8609109
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  8609319 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 8609220  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| | |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8609219 ttttttgggctatgtagtgacttatgaacatcaaatagatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 8609120  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  8609119 ttactttgttc 8609109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 374
Target Start/End: Original strand, 13283008 - 13283217
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||     
T  13283008 taattgatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatttta 13283107  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13283108 tttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 13283207  T
Q  365 ttactttgtt 374  Q
    ||||||||||    
T  13283208 ttactttgtt 13283217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33708322 - 33708112
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  33708322 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 33708223  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  33708222 tttttttgcctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctatcttttacttt 33708123  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  33708122 ttactttgttc 33708112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7744635 - 7744433
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttg-gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||     
T  7744635 taattaatgctttttggacttgtttaatttatgtttttttagatatgcaatgacttaagaacatcaaat--------aacttgatggctatgtaatgtta 7744544  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7744543 tttttttggctatgtaatggcttatgaacatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 7744444  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  7744443 ttactttgttc 7744433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13107886 - 13107675
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgct-ttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  13107886 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgctcttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttaatgacttgatgactatgtaatgtta 13107787  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| | |||||| |||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  13107786 ttttttttggctatgtagtgacttttgaacatcaaatatatgacttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactt 13107687  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  13107686 tttactttgttc 13107675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13485620 - 13485416
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  13485620 taattaatgctttttgtacttgtttagtttatgcttttctggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatcacttgatggctatgtaatgtta 13485521  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  13485520 tttttttggctatgtaatcacttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgt-tttttataatcaaagtgtttgtcttctacttt 13485422  T
Q  365 ttactt 370  Q
    ||||||    
T  13485421 ttactt 13485416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 27691786 - 27691988
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        |||| ||||||||||||     
T  27691786 taattaatgctttttggacttatttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt--------gatgactatgtaatgtta 27691877  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27691878 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttacttt 27691977  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  27691978 ttactttgttc 27691988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 186 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40339172 - 40338982
Alignment:
Q  186 tgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaatga 284  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||||        ||||||| ||| |    
T  40339172 tgtttattttatgcttttttggatatgtgatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggttatataatgttatttttttggctatgtaatta 40339073  T
Q  285 cttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
     ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40339072 attatgaacatcaaatatatgagttatgatggtatgcaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttc 40338982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 334
Target Start/End: Original strand, 5037071 - 5037240
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  5037071 taattaatgtttttttgacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 5037170  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtctt 334  Q
           ||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5037171 tttttttggctatgtagtgacttataaacatcaaatatatgacttatgatggtatacaaatgtctgtctt 5037240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 169 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9672678 - 9672477
Alignment:
Q  169 ttaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnn 267  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||        
T  9672678 ttaatgctttttggacttgtttaatttatgtttttttggatatgtaatgactcaagaacattaaatgactt--------gatggctatgtaatgttattt 9672587  T
Q  268 nnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaa---atgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
        ||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | |||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9672586 ttttggctatgtaatgatttatgaacatcaaatatat-atttatgatgatatgcaacaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtctgtcttttacttt 9672488  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    ||| |||||||    
T  9672487 ttagtttgttc 9672477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 22272978 - 22273081
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22272978 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaattgcctgtctctttataatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 22273077  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  22273078 gttc 22273081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 5036863 - 5037004
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||     
T  5036863 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgttcctggaattattagagttccaaatc 5036962  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5036963 caaattacgagtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 5037004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 40339400 - 40339259
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| || |||   ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| |||||     
T  40339400 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgagggatcttgctccacaaaatccaactggtcctggagttattagagtttcaaatc 40339301  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  40339300 caaattacgggtcatccgcttcaactcaaccccaatacatgg 40339259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 42942198 - 42942339
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42942198 agaggaccagtaatttcaaatggcatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatt 42942297  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||    
T  42942298 caaattacgggccatccgcttctactcaatctcaatacatgg 42942339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33708518 - 33708389
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  33708518 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccactagatccaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacggat 33708419  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  33708418 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 33708389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 41825376 - 41825233
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||| | |||| ||||||||| ||| ||||||||||||  || ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  41825376 gacatgagagaaccagtgatttcaaatgacatacataaacaaacttcactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttc 41825277  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatac 158  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  41825276 caaatccaaattgcggggcatccgcttctactcaaccccaatac 41825233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9672882 - 9672748
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9672882 cagtgatttcaaatgacaggcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcctagagttattagagttccaaatccaaatta 9672783  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  9672782 cgggtcatccgcttctacacaacctcaatacatgg 9672748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 304 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26239815 - 26239745
Alignment:
Q  304 tgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26239815 tgacttatgatggtatgcaaatgtctttctttttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 26239745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 13485809 - 13485680
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| || ||    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13485809 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgagggatcctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagtttcaaatccaaattacgggt 13485710  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  13485709 catccgcttctacttaaccccaatacatgg 13485680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 27691590 - 27691719
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| | ||| |||||    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  27691590 atttctaatgacatacataaacaaacactactgaggggtcatgctccacaagatccaactgctcttggggttattagaatttcaaatccaaattacgggt 27691689  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27691690 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 27691719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 261
Target Start/End: Original strand, 22272893 - 22272989
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatg 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  22272893 taattaatgctttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatg 22272989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 29237914 - 29238016
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29237914 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttacttt 29238012  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  29238013 gttc 29238016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 38547639 - 38547742
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  38547639 agaggaccagtgatttcaaatgacatacataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcttggagttattagagttccaaatc 38547738  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  38547739 caaa 38547742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 22272712 - 22272826
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    |||||||||||||||  || |||||    |||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22272712 cataaacaaacaccaccgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctcctagagttattagagttccaaatccaaattatgggtcatccgcttctactc 22272811  T
Q  148 aaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||    
T  22272812 aaccccaatacatgg 22272826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 41042304 - 41042163
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||     
T  41042304 agaggaccagtgatttcaaatgatatgcataaacaaacaccactgaggggtcatgctccacaaaatccaactgcttccggagttattagagttccaaatc 41042205  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||  ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  41042204 caaattataggtcatccgcttctactcaacctcaatacatgg 41042163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26240115 - 26239986
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggt--ctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgg 130  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||||||  ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  26240115 atttcaaatgacaggcataaacaaacaccact-aagggttcctgcttc-acaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgtgg 26240018  T
Q  131 gtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26240017 gccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 26239986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 35510136 - 35510238
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  35510136 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 35510234  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  35510235 gttc 35510238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41825059 - 41824973
Alignment:
Q  289 tgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41825059 tgaacattaaatgcatgatttatgatggtatgcaaatgtctggctttttacaatcacagtgtatatcttttactttttactttgttc 41824973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 15307013 - 15307114
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15307013 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttac-ttttacttt 15307110  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  15307111 gttc 15307114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 15487382 - 15487483
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15487382 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttac-ttttacttt 15487479  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  15487480 gttc 15487483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33761863 - 33761762
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||| | ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33761863 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtccttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 33761765  T
Q  372 gtt 374  Q
    |||    
T  33761764 gtt 33761762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Original strand, 35509975 - 35510031
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35509975 ttagagttccaaattcaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 35510031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 601029 - 600931
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  601029 ggctatgtaataacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttctcttttactttttacttt 600931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 166 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41825181 - 41825118
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgct-ttttggatatgtaatgacttaagaacat 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41825181 taattaatgttttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaaaaacat 41825118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26239912 - 26239850
Alignment:
Q  177 ttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgactt 238  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26239912 ttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt 26239850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 13282816 - 13282912
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13282816 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcgtggagttattagagttctaaatccaaa 13282912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Original strand, 29237754 - 29237810
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29237754 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 29237810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 33762045 - 33761989
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  33762045 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatgg 33761989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7744785 - 7744702
Alignment:
Q  79 cacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||    
T  7744785 cacaaaatccaactgcttcttgagttattagagttccaaatccaaattgcgggccatccgcttctactccaccctaatacatgg 7744702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 601190 - 601134
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  601190 ttagagttccaaatccaaattacgggacatccacttctactcaaccccaatacatgg 601134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 8609518 - 8609415
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||| |||||     
T  8609518 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaattgctccgggagttattagagtttcaaatc 8609419  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  8609418 caaa 8609415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27405515 - 27405445
Alignment:
Q  304 tgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  27405515 tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtctttta-ttttttctttgttc 27405445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 26)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 8540282 - 8540493
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||     
T  8540282 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgattgctatgtaatgtta 8540381  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8540382 ttttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactt 8540481  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  8540482 tttactttgttc 8540493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32135346 - 32135136
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  32135346 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaatatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtaa 32135247  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32135246 tttttttggctatgtaatgacttatggacatcaaatatatgacttaggatgttatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttacttt 32135147  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  32135146 ttactttgttc 32135136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 28820992 - 28821202
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| || || |||||||| ||||||||||||     
T  28820992 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacctcaaatgattttatgacttgatgcctatgtaatgtta 28821091  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  28821092 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatatctgtctttttataatcaaaatgtttgtcttttacttt 28821191  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  28821192 ttactttgttc 28821202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 371
Target Start/End: Original strand, 21841613 - 21841819
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  21841613 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttt 21841712  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
            ||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21841713 ttttttttgctatgttgtgatttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 21841812  T
Q  365 ttacttt 371  Q
    |||||||    
T  21841813 ttacttt 21841819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24540703 - 24540493
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  24540703 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtgatcacttaataacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 24540604  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24540603 tttttatggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtatgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 24540504  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  24540503 ttactttgttc 24540493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 12800557 - 12800750
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  12800557 acttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 12800656  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12800657 tgacttatgaacatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttc 12800750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 7268455 - 7268667
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  7268455 taattaatattttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttt 7268554  T
Q  265 nnnnnnng--gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttact 362  Q
              |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7268555 ttttttttttgctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgtaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttact 7268654  T
Q  363 ttttactttgttc 375  Q
    |||||||||||||    
T  7268655 ttttactttgttc 7268667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 12737734 - 12737927
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||||||        ||||||| ||    
T  12737734 acttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgacggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 12737833  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12737834 tgacttatgaacatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataattaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttc 12737927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30465108 - 30464939
Alignment:
Q  206 gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtg 305  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || || || |||| ||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  30465108 gatatgtaatcacttaagaacatcaaacgatttgatgactttatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatg 30465009  T
Q  306 acttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30465008 acttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgcatgtcttttactttttactttgttc 30464939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 2180404 - 2180596
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgctttttg-gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        |||||||  |    
T  2180404 acttgtttagtttatgctttttttgatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttatggctatgtta 2180503  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2180504 tgacttatgaacatcaaagatatgatttatgatggtatgcaaa-gtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttc 2180596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 2854017 - 2853888
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2854017 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggt 2853918  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||    
T  2853917 catccgcttctactcaaccctaatacatgg 2853888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2853673 - 2853570
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2853673 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgataatatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttacttt 2853574  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  2853573 gttc 2853570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 24540899 - 24540770
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24540899 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaagatccaacaactcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggt 24540800  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24540799 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 24540770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 30467977 - 30467848
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| || ||| ||||||   ||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30467977 atttcaaatgacatgcataaacaaacatcattgaggggtcttgctccacaaaatctaactactcctagagttattagagttccaaatccaaattacgggt 30467878  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30467877 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 30467848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 2180197 - 2180343
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||| |||  |||||||||||| || | |||||||  | |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||     
T  2180197 gacatgagaggacctgtgatttcaaatgacatgcataaacaaacatcact-aagggtcctactccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttt 2180295  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2180296 caaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 2180343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18624510 - 18624418
Alignment:
Q  168 attaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaa 259  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  18624510 attaatgctttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgatgacttgatagctatgtaa 18624418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 2853821 - 2853723
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| |||||||    
T  2853821 taattaatgttttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatataatgtt 2853723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 134
Target Start/End: Original strand, 28820798 - 28820911
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||  ||||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28820798 agaggaccagtgattttaaatgacatgcataaacaaacacgactgaagggtcctgctccacaaaatccaacttctcctggagttattaaagttccaaatt 28820897  T
Q  121 caaattacgggtca 134  Q
    ||||||||||||||    
T  28820898 caaattacgggtca 28820911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 17574731 - 17574834
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17574731 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatc 17574830  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  17574831 caaa 17574834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 12737588 - 12737673
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  12737588 tccacaaaattcaactgctcctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccgcaatacatgg 12737673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 12800411 - 12800496
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  12800411 tccacaaaattcaactgctcctagagttattagatttccaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaaccgcaatacatgg 12800496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 7268256 - 7268359
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  7268256 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttccaaata 7268355  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  7268356 caaa 7268359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 18624708 - 18624579
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||||    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||     
T  18624708 atttcaaatgacaggcataaacaaacacaactgaggggtcatgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttctaaatccaaattacgggc 18624609  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||   || ||| ||||||||||| ||||    
T  18624608 catccatttctacacaaccccaatagatgg 18624579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42472855 - 42472785
Alignment:
Q  304 tgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  42472855 tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtctttta-ttttttctttgttc 42472785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 124
Target Start/End: Original strand, 21841470 - 21841517
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21841470 tccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa 21841517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42473046 - 42472990
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  42473046 ttagagttccaaatccaatttacgggccatccgcttctactcaaccgcagtacatgg 42472990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26225065 - 26224855
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  26225065 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 26224966  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           |||||||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26224965 tttttttggctatgtggtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 26224866  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  26224865 ttactttgttc 26224855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3012964 - 3012755
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttgga-tatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||| || || | |||||||||||||||||||     
T  3012964 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttgaatatgtaatcacttaagaatatcaaatgatttgatgatttgatggctatgtaatgtta 3012865  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3012864 tttttttg-ctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttacttt 3012766  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  3012765 ttactttgttc 3012755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51895677 - 51895467
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||| || ||||     
T  51895677 taattaatgcttattggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatatattgtta 51895578  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  51895577 tttttttggctatgtaatgacttatgaacataaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatttcttttacttt 51895478  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  51895477 ttactttgttc 51895467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4855480 - 4855268
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  4855480 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttt 4855381  T
Q  265 nnnnnnng--gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttact 362  Q
           |  |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  4855380 tttttttgttgctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaattgtctgtcttttact 4855281  T
Q  363 ttttactttgttc 375  Q
    |||||||||||||    
T  4855280 ttttactttgttc 4855268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34777651 - 34777439
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  34777651 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 34777552  T
Q  265 nnnnnnng--gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttact 362  Q
              |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  34777551 ttttttttttgctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttact 34777452  T
Q  363 ttttactttgttc 375  Q
    |||||||||||||    
T  34777451 ttttactttgttc 34777439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6818218 - 6818018
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggc 274  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||        |||    
T  6818218 tttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttggtggctatgtaatgttatttttttggc 6818119  T
Q  275 tatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6818118 tatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcacatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtctttcactttttactttgtt 6818019  T
Q  375 c 375  Q
    |    
T  6818018 c 6818018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33600663 - 33600454
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  33600663 taattaatgctttttgaacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaaacacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttg 33600564  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           || |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  33600563 tttttttggttatgtaatgacttattaacatcaaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaattgtttgtcttttacttt 33600465  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  33600464 ttactttgttc 33600454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31238008 - 31237808
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggc 274  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        |||    
T  31238008 tttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggc 31237909  T
Q  275 tatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31237908 tatgttttgatttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttatagtcaaagtgaatgtcttttactttttactttgtt 31237809  T
Q  375 c 375  Q
    |    
T  31237808 c 31237808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 2870221 - 2870421
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggc 274  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||         ||    
T  2870221 tttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacataagaacatcaaatgatttgctgacttgatggctatgtaatgttattttttttgc 2870320  T
Q  275 tatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2870321 tatgtgatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgcatgtcttttactttttactttgtt 2870420  T
Q  375 c 375  Q
    |    
T  2870421 c 2870421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Original strand, 15105068 - 15105268
Alignment:
Q  168 attaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnn 266  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||        ||||||||| |||       
T  15105068 attaatgctttttgggcttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgacttgata--------gctatgtaacgttatt 15105159  T
Q  267 nnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttt 366  Q
         ||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15105160 tttttggctatataatgacttatgaacatcaaatatatgactcatgatggtatgcgaatgtctgtctttttgcaatcaaagtgtatgtcttttacttttt 15105259  T
Q  367 actttgttc 375  Q
    |||||||||    
T  15105260 actttgttc 15105268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 27087895 - 27088110
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  27087895 taattaatattttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 27087994  T
Q  265 nnnnnnn----ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtc-ttcttacaatcaaagtgtatgtctttt 359  Q
               ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||| || ||| ||||||||||| ||||||||    
T  27087995 tttttttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatatgtgtcttttttataatcaaagtgtctgtctttt 27088094  T
Q  360 actttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||    
T  27088095 actttttactttgttc 27088110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46583092 - 46582890
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        |||||||||||||||||     
T  46583092 taattaatgttttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt--------gatggctatgtaatgtta 46583001  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| |||| || ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46583000 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatattacttatgatggtatgaaaatatcagtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttt 46582901  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  46582900 ttactttgttc 46582890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52643138 - 52642938
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttag-acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||        ||||||||| |||||||    
T  52643138 taattaatgtttttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacgtcaaatgactt--------gatggctatataatgtt 52643047  T
Q  264 cnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| |  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  52643046 -attttttggctatgtaatgacttatgaacatcagatgtatgacttatgatggtttgcaaatattcgtctttttacaatcaaagtg--tgtcttttactt 52642950  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  52642949 tttactttgttc 52642938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 46583274 - 46583160
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||    
T  46583274 cataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgtttctactc 46583175  T
Q  148 aaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||    
T  46583174 aaccccaatacatgg 46583160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 3013172 - 3013031
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||||||   |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3013172 agaggaccagtgatttcaaatggcatgcataaacaaacaccactgaggggtcttgctccacaaaattcaattgctcctggagttattagagttccaaatc 3013073  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3013072 caaattacgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 3013031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 50555602 - 50555414
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnng----gctat 277  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||             | |||    
T  50555602 acttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttattttttttttttgatat 50555503  T
Q  278 gaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttt 366  Q
    | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50555502 gtaatgacttatgaacatcaaatatatgatttatgatggcatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagttttt 50555414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 33600871 - 33600731
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||     
T  33600871 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccaataaggggtcctgctccacaaaatccaactgctccgggagttattagagttccaaatc 33600772  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
    |||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  33600771 caaattacaggtcatccacttctactcaaccccaatacatg 33600731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 2870015 - 2870144
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggt-ctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacggg 131  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2870015 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccattgaggggttctgcttc-acaagatccaactgctcctggagttattagagttcaaaatccaaattacggg 2870113  T
Q  132 tcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  2870114 tcatccggttctactcaaccccaatacatgg 2870144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45046190 - 45046064
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45046190 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatctaaattacgggt 45046091  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaataca 159  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  45046090 catccgcttctactcaactccaataca 45046064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 52643339 - 52643205
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  52643339 cagtgatttcgaatgacaagcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatctaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattg 52643240  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
      ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52643239 ttggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 52643205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45045994 - 45045834
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgc-tttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt- 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||| ||||||||||||     
T  45045994 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcgtttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatgactatgtaatgtta 45045895  T
Q  264 cnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaa 324  Q
            ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||    
T  45045894 ttttttttggctatgtaatggcttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatacaaa 45045834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8168735 - 8168634
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8168735 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 8168637  T
Q  372 gtt 374  Q
    |||    
T  8168636 gtt 8168634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 31238192 - 31238063
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| | || ||| ||||||   ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  31238192 atttcaaatgacatgcataaacaaaaatcactgaggggtcttgctccacaaaatccaactgcttctagagttattagacttccaaatctaaattacgggc 31238093  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31238092 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 31238063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 15104852 - 15104999
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||| | |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  15104852 gacatgagagaaccagtgatttcaaatgacaggcataaacaaacaccactgaggggtcatgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttc 15104951  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
     |||| ||||||||||| ||||  ||| ||| |||| |||||| ||||    
T  15104952 taaatccaaattacgggacatccacttctacacaactccaatagatgg 15104999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 37344756 - 37344899
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaaggg-tctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaat 119  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| | ||| ||| ||    ||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||    
T  37344756 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacactactgagggggtcctgctccacaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaat 37344855  T
Q  120 tcaaattacgggtcatctgcttttactc-aaccccaatacatgg 162  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  37344856 ccaaattacgggtcatccgcttctactcaaaccccaatacatgg 37344899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 27087690 - 27087799
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggt-ctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagtt 113  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27087690 gacatgagaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaagggtactgct-ccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtt 27087788  T
Q  114 ccaaattcaaa 124  Q
     ||||| ||||    
T  27087789 tcaaatccaaa 27087799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 51895858 - 51895744
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||| |||||    
T  51895858 cataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgtttctggagttattagagttcaaaatccaaattatgggtcatccgcttctactc 51895759  T
Q  148 aaccccaatacatgg 162  Q
    ||||  |||||||||    
T  51895758 aaccataatacatgg 51895744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 25278079 - 25277936
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggt--ctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaa 118  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||   ||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||    
T  25278079 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacactactgagggggtcctgcttc-acaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaa 25277981  T
Q  119 ttcaaattacgggtcatctgcttttactc-aaccccaatacatgg 162  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  25277980 tccaaattacgggtcatccgcttctactcaaaccccaatacatgg 25277936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 4855667 - 4855576
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  4855667 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa 4855576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Original strand, 37344966 - 37345064
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||    
T  37344966 taattaaagctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttaatgactatgtaatgtt 37345064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 8168896 - 8168840
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  8168896 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatgg 8168840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 6818343 - 6818272
Alignment:
Q  91 ctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6818343 ctgctcctagagttattagagtttcaaacccaaattacgagtcatctgcttctacttaaccccaatacatgg 6818272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34777849 - 34777746
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||     
T  34777849 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttgcaaatc 34777750  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  34777749 caaa 34777746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26225250 - 26225160
Alignment:
Q  34 tttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26225250 tttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgatgggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa 26225160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25277869 - 25277776
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgta 258  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||| || || |||| ||| |||||||    
T  25277869 taattaaagctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttaatgactatgta 25277776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 50555748 - 50555663
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||| ||| |||||    
T  50555748 tccacaaaattcaactgctcctagagttattagagtttcaaatccaaattaagggtcatccgtttctactcaaccctaatgcatgg 50555663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20944428 - 20944372
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  20944428 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgg 20944372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 152
Target Start/End: Original strand, 35009302 - 35009377
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccc 152  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||||| |||  ||| | |||||||||||||    
T  35009302 tccacaaaatccaactgcttttggagttgttagagtaccatatccaaattatgggaaatccggttttactcaaccc 35009377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 42559544 - 42559474
Alignment:
Q  91 ctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || |||||| ||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||    
T  42559544 ctgctcttggagttattcgagtaacatattcaagttatgggtcatccgattctactcaaccccaattcatg 42559474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 41978360 - 41978570
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||||||     
T  41978360 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgcaatgttt 41978459  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
            |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  41978460 ttttttttgctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 41978559  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  41978560 ttactttgttc 41978570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 42280128 - 42280330
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttttgga-tatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||     
T  42280128 taattaatgcttttttgacttgtttaatttatgctttttggaatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgtt- 42280218  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttac-tt 363  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42280219 attttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 42280318  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  42280319 tttactttgttc 42280330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 374
Target Start/End: Original strand, 17515942 - 17516151
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  17515942 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttctggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 17516041  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  17516042 tttttttggctatgtaatcacttatgtacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtatctgtcttttacttt 17516141  T
Q  365 ttactttgtt 374  Q
    ||||||||||    
T  17516142 ttactttgtt 17516151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23292682 - 23292471
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaa-cattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || || ||||||||| | |||||||||    
T  23292682 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaaacatcaaatgatttgatgacttgatggttttgtaatgtt 23292583  T
Q  264 cnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            | ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23292582 atttttttgactatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatgtcttttactt 23292483  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  23292482 tttactttgttc 23292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 43765752 - 43765963
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  43765752 taattaatgttttttggacttatttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 43765851  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43765852 ttttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactt 43765951  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  43765952 tttactttgttc 43765963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44275728 - 44275518
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||     
T  44275728 taatcaatgctttttagacttatttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaaggtta 44275629  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  44275628 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgactgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttaattt 44275529  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  44275528 ttactttgttc 44275518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30599711 - 30599509
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||     
T  30599711 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgtta 30599620  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30599619 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttt 30599520  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  30599519 ttactttgttc 30599509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 51685232 - 51685433
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||     
T  51685232 taattaatgttttttggacttgtttaatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgtt- 51685322  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51685323 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtatgacttatgatggtttgcaaatgtccgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttacttt 51685422  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  51685423 ttactttgttc 51685433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27898620 - 27898416
Alignment:
Q  172 atgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnn 270  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||           
T  27898620 atgttttttgaacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttt 27898521  T
Q  271 nggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactt 370  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27898520 tggctatgtaataacttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactt 27898421  T
Q  371 tgttc 375  Q
    |||||    
T  27898420 tgttc 27898416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7884405 - 7884195
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  7884405 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 7884306  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           |||||||   |||||||||||||| |||| | |||||||||||| || |||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  7884305 tttttttggctatgtggtgacttatgaacattaaatatatgacttatgatggtaggcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatcttttacttt 7884206  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  7884205 ttactttgttc 7884195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 21349326 - 21349536
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||     
T  21349326 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtattcacataagaacatcaaatgatttgttgacttgatggctatgtaatgtta 21349425  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21349426 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtctatctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttt 21349525  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  21349526 ttactttgttc 21349536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48830328 - 48830126
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||| |||||||||||     
T  48830328 taattaatgttttttgaacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggttatgtaatgtta 48830237  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48830236 attttttggctatgtaatggcttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatacaaatgtctgtctttttacaatcaaagtatatgtcttttacttt 48830137  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  48830136 ttactttgttc 48830126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 2660845 - 2661056
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||  ||||||| ||||||||||||     
T  2660845 taattaatgttttttggacttgtttagtttacgcttttttggataagtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgtcttgatgactatgtaatgtta 2660944  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2660945 ttttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactt 2661044  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  2661045 tttactttgttc 2661056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 46198353 - 46198562
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||||     
T  46198353 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggttatataatgtt- 46198451  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  46198452 attttttggctatgtaatatcttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 46198551  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  46198552 ttactttgttc 46198562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Original strand, 2377645 - 2377838
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  2377645 acttgtttagtttatacttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctatgtaa 2377744  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2377745 tgacttatgaacatcaaatatatgatttatgatgatatgcaaatatttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttagtttttactttgttc 2377838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53190376 - 53190172
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatg--t 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||  |    
T  53190376 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttt 53190277  T
Q  263 tcnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttact 362  Q
    |         |||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||| | |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  53190276 ttttttttttgctatgtagtgacttataaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatatgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttact 53190177  T
Q  363 tttta 367  Q
    |||||    
T  53190176 tttta 53190172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 46113206 - 46113309
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46113206 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtatgacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttactttttacttt 46113305  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  46113306 gttc 46113309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35905244 - 35905027
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatg--- 261  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||       
T  35905244 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgattttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 35905145  T
Q  262 -ttcnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttat---gcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtctt 357  Q
     ||         |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    ||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  35905144 ttttatttttttgctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtattcatcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtctt 35905045  T
Q  358 ttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35905044 ttactttttactttgttc 35905027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 46198144 - 46198285
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||  | |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  46198144 agaggatcagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcatactccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatc 46198243  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  46198244 caaattacgggtcatccacttctactcaaccccaatacatgg 46198285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 44794839 - 44795041
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| ||        |||| ||||||||||||     
T  44794839 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatataatcacttaagaacatcaaatgattt--------gatgactatgtaatgtta 44794930  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  44794931 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtccgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 44795030  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  44795031 ttactttgttc 44795041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2225685 - 2225474
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||     
T  2225685 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgattttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgaattgatggctatgtaatgtta 2225586  T
Q  265 nnnnnnng---gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttac 361  Q
               |||||  | ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2225585 ttttattttttgctatttagtgacttatgaacatcaaatatatgactt--gatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttac 2225488  T
Q  362 tttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||    
T  2225487 tttttactttgttc 2225474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44275929 - 44275795
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44275929 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcatggagttattagagttccaaattcaaatta 44275830  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  44275829 cgggtcatccgcttctacttaaccccaatacatgg 44275795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 17515734 - 17515875
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||     
T  17515734 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagtttcaaatc 17515833  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17515834 caaattccgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 17515875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 371
Target Start/End: Original strand, 54899049 - 54899251
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        |||||||||||||||||     
T  54899049 taattaattttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt--------gatggctatgtaatgtta 54899140  T
Q  265 nnnnnnn----ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtctttta 360  Q
               ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  54899141 tttttttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtctttta 54899240  T
Q  361 ctttttacttt 371  Q
    |||||||||||    
T  54899241 ctttttacttt 54899251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 48830529 - 48830395
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||     
T  48830529 cagtgatttcaaatgacaggcataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttctggagttattagagttccaaattcaaattg 48830430  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48830429 cggatcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 48830395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Original strand, 610234 - 610436
Alignment:
Q  168 attaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnn 266  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||        |||| |||||| |||||       
T  610234 attaatgctttttggacatgtttactttatgcttttttggatgtgtaatgacttatgaacatcaaatgactt--------gatgactatgtgatgttata 610325  T
Q  267 nnnnnggctatgaaatgacttat--gaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
          |||||| |||||||||   ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  610326 ttttttgctatgtaatgacttacacgaacatcaaatgtatgacttatgattatatgcaaatgtctgcttttttacaatcaaagtgtctgtcttttacttt 610425  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  610426 ttactttgttc 610436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 162
Target Start/End: Original strand, 44794645 - 44794772
Alignment:
Q  35 ttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtca 134  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  44794645 ttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaatttcaaatccaaattacgggtca 44794744  T
Q  135 tctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  44794745 tccgcttctactcaaccccaatacatgg 44794772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 51685031 - 51685165
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| | | |||||    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51685031 cagtgatttcgaatgacaagcataaacaaacaccactaaggggtcctgctccacaacatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaatta 51685130  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  51685131 cgggccatccgcttctactcaaccccaatacatgg 51685165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 2660649 - 2660778
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  2660649 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccacttaggggtcctgctccacaagatccaactgctcttggagttattagaattctaaatccaaattacgggt 2660748  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2660749 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 2660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23292861 - 23292749
Alignment:
Q  50 taaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaa 149  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  23292861 taaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttcaaaatccaaattacaggtcatccgcttctactcaa 23292762  T
Q  150 ccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||    
T  23292761 ccccaatacatgg 23292749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 21349118 - 21349259
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||| || ||||| ||| |    |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  21349118 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaatactagtgaggggccctgctccacaaaatccaattgctcctggagttagtagagttccaaatc 21349217  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  21349218 caaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgg 21349259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 27898755 - 27898670
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  27898755 tccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattaggggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 27898670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 131
Target Start/End: Original strand, 610031 - 610134
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  610031 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaatta 610130  T
Q  128 cggg 131  Q
    ||||    
T  610131 cggg 610134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2225884 - 2225781
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  2225884 agaggatcagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatc 2225785  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  2225784 caaa 2225781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38192677 - 38192575
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| | | |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  38192677 ggctatgtaatgacttattaacatcaaatat-tgacttatgatataacgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 38192579  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  38192578 gttc 38192575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Original strand, 46309731 - 46309833
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  46309731 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 46309829  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  46309830 gttc 46309833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 42279932 - 42280061
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||  || |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  42279932 atttcaaatgacaggcataaacaaacaccaccgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattgcgagc 42280031  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  42280032 catccacttccactcaaccccaatacatgg 42280061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46609942 - 46609840
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  46609942 ggctatgtaatgacttattaacattgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacattttacttt 46609844  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  46609843 gttc 46609840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53093417 - 53093315
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  53093417 ggctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtatttgtcttttacattttacttt 53093319  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  53093318 gttc 53093315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 2377456 - 2377584
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||| || ||| ||  ||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||     
T  2377456 atttcaaatgacatgcataaacaaacatcactgagggtcctg-ttccacaaaattcaactgctcctagagttattacagtttcaaatccaaattatgggc 2377554  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2377555 catccgcttctactcaaccccaatacatgg 2377584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 158
Target Start/End: Original strand, 43765600 - 43765681
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatac 158  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||    
T  43765600 tccacaaaatccaactgctgctggagttattagagttcaaaatccaaattacgggccatccgcttctactcaagcccaatac 43765681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 46112900 - 46113041
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||   |||||||||||| |  ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  46112900 agaggaccagtgatttcaaatgacagacataaacaaacaccactgagtggtcctcttccacaaaatcaaattgctactggaattattagagttccaaatc 46112999  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||  |||  ||| ||  ||||||||||||||||    
T  46113000 caaattacgggctatccacttctatacaaccccaatacatgg 46113041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 315
Target Start/End: Original strand, 24845515 - 24845656
Alignment:
Q  177 ttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatg----acttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnng 272  Q
    |||| ||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||    |||| || |||||||| |||||||||||||       |    
T  24845515 ttttggacttgtttaaattaggcattttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtaagactt-atgacttgatgtctatgtaatgttctttttttg 24845613  T
Q  273 gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatg 315  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24845614 gctatgtaatgactaatgaacatcaaatgtatgacttatgatg 24845656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 38192838 - 38192782
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38192838 ttagagtttcaaattcaaattacgggccatctgcttctactcaaccccaatacatgg 38192782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Original strand, 54898850 - 54898953
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  54898850 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattaaagttccaaatc 54898949  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  54898950 caaa 54898953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 41978168 - 41978264
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41978168 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa 41978264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 53093601 - 53093545
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  53093601 ttagagttccaaatccaaattacgggtcatccacttctactcaaccccaatacatgg 53093545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7884592 - 7884501
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7884592 atttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaa 7884501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35905443 - 35905340
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| | | |||||     |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  35905443 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactcaggggtcctgcaccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatc 35905344  T
Q  121 caaa 124  Q
    ||||    
T  35905343 caaa 35905340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 106 - 162
Target Start/End: Original strand, 46309570 - 46309626
Alignment:
Q  106 ttagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  46309570 ttagagttccaaatccaaattacgggccatccacttctactcaaccccaatacatgg 46309626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 238
Target Start/End: Original strand, 46113110 - 46113179
Alignment:
Q  168 attaatgttttttagacttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatgactt 238  Q
    |||||||  |||| || ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46113110 attaatgccttttggaattgtttaatttatgcttttag-atatgtaatgacttgagaacattaaatgactt 46113179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 338 - 375
Target Start/End: Original strand, 24845666 - 24845705
Alignment:
Q  338 acaatcaaagtgtatgtc--ttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24845666 acaatcaaagtgtatgtcttttttactttttactttgttc 24845705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 17696838 - 17697048
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||     
T  17696838 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatcatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 17696937  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  17696938 tttttttggctatgtaatcacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatatctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttctacttt 17697037  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  17697038 ttactttgttc 17697048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 39455791 - 39456000
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  39455791 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 39455890  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  39455891 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaagtatatgacttatgatggtatacaaatgtctgtctttttataatcaaagt-tctgtcttttacttt 39455989  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  39455990 ttactttgttc 39456000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 40560856 - 40561066
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||| || || ||||||| |||||||||||||     
T  40560856 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacctaagaacatcaaatgatttgatgacttgatagctatgtaatgtta 40560955  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  40560956 tttttttggctatgtaattactgatgaacatcaaatatatgatttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtatggcttttacttt 40561055  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  40561056 ttactttgttc 40561066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19907774 - 19907581
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggctatgaaa 281  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||        ||||| | ||    
T  19907774 acttgtttagtttatgcttttttggatatgtgatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttttttggctaagtaa 19907675  T
Q  282 tgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19907674 tgacttatgaacatcaaatatatgatttataatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttc 19907581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 6798139 - 6798347
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | || || | || |||||||| | |||||     
T  6798139 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaattatttgatgattt-atggctatttcatgtt- 6798236  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6798237 attgtttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatataacttatgatgatatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 6798336  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  6798337 ttactttgttc 6798347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44709269 - 44709059
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt--ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| |    
T  44709269 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgctttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgacggctatgtaatgat 44709170  T
Q  264 cnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            | ||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  44709169 -tttttttgtctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgtcttatgatggtatgcaaatgtctgcatttttataatcaaagtgtctgtctttgactt 44709071  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  44709070 tttactttgttc 44709059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 375
Target Start/End: Original strand, 16763573 - 16763787
Alignment:
Q  167 aattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatg---- 261  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||        
T  16763573 aattaatgttttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatggcttgatggctatgtaatgttat 16763672  T
Q  262 -ttcnnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtctttta 360  Q
     ||        ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  16763673 tttttttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctatctttta 16763772  T
Q  361 ctttttactttgttc 375  Q
    ||||||||| |||||    
T  16763773 ctttttactctgttc 16763787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 183 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39664277 - 39664083
Alignment:
Q  183 acttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnn-ggctatgaa 280  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||         ||||||| |    
T  39664277 acttgtttagtttatgcttttttggatatataatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgttattttttttggctatgta 39664178  T
Q  281 atgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39664177 atgacttatgaacatcaaatatatgatttatgatggtatgcagatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttagtttttactttgttc 39664083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42518743 - 42518535
Alignment:
Q  169 ttaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnn 267  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || | |||||  | ||||||||||        
T  42518743 ttaatgttttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattttatgatttgataacaatgtaatgttattt 42518644  T
Q  268 nnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttt 366  Q
         ||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42518643 tttttggctatgtaaagacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgcctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttatttttt 42518544  T
Q  367 actttgttc 375  Q
    |||||||||    
T  42518543 actttgttc 42518535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14388606 - 14388404
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||        |||||||||||||||||     
T  14388606 taattaatgctttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgattt--------gatggctatgtaatgtta 14388515  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           |||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  14388514 tttttttggctttgtaatgacttgtgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtttttttataatcaaagtgtctatcttttacttt 14388415  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  14388414 ttactttgttc 14388404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 2767358 - 2767498
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||  | ||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  2767358 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctactccgcaaaatccaactgctcctagagttattagagttcc-aatt 2767456  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2767457 caaattacgggtcatatgcttctactcaaccccaatacatgg 2767498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 44709477 - 44709336
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||     
T  44709477 agaggaccagtgattacaaatgacatgcataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaactccaactgctcttggagttattagagttctaaatc 44709378  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44709377 taaattacgggtcatccgcttttactcaaccccaatacatgg 44709336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Original strand, 17696626 - 17696771
Alignment:
Q  17 catcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttcca 116  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||    ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17696626 catcagaggactagtgatttcaaataacatgcataaacaaacaccactgagggatcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttgttagagttcca 17696725  T
Q  117 aattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||| |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17696726 aatccaaattacaggacatctgcttctactcaatcccaatacatgg 17696771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 162
Target Start/End: Original strand, 39455577 - 39455724
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||| |||  |||||||| ||| || ||| |||||  | | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39455577 gacatgagaggaccagtgattttaaatgacatgcataaacatacatcactgaggggtcctacttcacaaaatccaattgctcttggagttattagagttc 39455676  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  39455677 caaatccaaattaggggtcatccgcttctactctaccccaatacatgg 39455724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14388819 - 14388674
Alignment:
Q  15 gacatcagaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttc 114  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||  |||  ||||||||||||| | ||| ||||| | | |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||     
T  14388819 gacatgagaggaccagtgatttcaaacgacatgcataaacaaacacaactgaggggtcggct-ccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttt 14388721  T
Q  115 caaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  14388720 caaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaactccaatacatg 14388674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Original strand, 40560674 - 40560789
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  40560674 cataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctagagttattagagttccaaatctaaattacgggtcatccgcttctactc 40560773  T
Q  148 aa-ccccaatacatgg 162  Q
    || |||||||||||||    
T  40560774 aacccccaatacatgg 40560789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Original strand, 2767565 - 2767663
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  2767565 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatgactatgtaatgtt 2767663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19907920 - 19907835
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19907920 tccacaaaattcaactgctcatagagttattagatttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 19907835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 2767684 - 2767755
Alignment:
Q  304 tgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  2767684 tgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagagtttgtcttttactttttactttgttc 2767755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 273 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6784692 - 6784591
Alignment:
Q  273 gctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttg 372  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6784692 gctatgtaatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttacttttgactttg 6784594  T
Q  373 ttc 375  Q
    |||    
T  6784593 ttc 6784591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 39664423 - 39664338
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  39664423 tccacaaaattcaactgctcctagagttattagagttccaaatccaaattacaggtcatccgcttctactcaacccctatacatgg 39664338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 162
Target Start/End: Original strand, 6797989 - 6798072
Alignment:
Q  79 cacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6797989 cacaaaatccaactgctcctgaagttattagagttccaaatccaaattttggatcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 6798072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24206937 - 24206843
Alignment:
Q  280 aatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24206937 aatgacttattaacatcgaatat-tgacttatgatataatgcaaatgtttgtctttttataatcaaattgtttgtcttttactttttactttgttc 24206843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 42518898 - 42518813
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||  |||||||||||||||||||    
T  42518898 tccacgaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgagacatccacttcaactcaaccccaatacatgg 42518813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 161
Target Start/End: Original strand, 37645912 - 37646040
Alignment:
Q  33 atttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggt 132  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||  ||||   ||| ||||||||||  || || |||||||||||||||| || || ||| |||| |||    
T  37645912 atttcaaatgacatgcataaacaaacactagtgagtggtcatgttctacaaaatccaattgttcctggagttattagagtttcatatccaagttactggt 37646011  T
Q  133 catctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  37646012 catccgcttctacttaaccccaatacatg 37646040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 234
Target Start/End: Original strand, 37646079 - 37646129
Alignment:
Q  184 cttgtttactttatgctttttggatatgtaatgacttaagaacattaaatg 234  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  37646079 cttgtttaaattatgctttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatg 37646129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 313
Target Start/End: Original strand, 37646100 - 37646141
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatga 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37646100 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtaagacttatga 37646141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 6900106 - 6900308
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||| ||||||||     
T  6900106 taattaatgttttttggacttgtttaatttatacttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctacgtaatgtta 6900197  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6900198 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatgtatgacttataatggtatgcaaatgtctgtccttttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 6900297  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  6900298 ttactttgttc 6900308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32438593 - 32438382
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  32438593 taattaatgttttttggagttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 32438494  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  32438493 ttttttttggctatgtagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactt 32438394  T
Q  364 tttactttgttc 375  Q
    ||||||||||||    
T  32438393 tttactttgttc 32438382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 7050379 - 7050581
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||     
T  7050379 taattaatgctttttggacttgtttaatttatgtttttttggatatataatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgtta 7050470  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7050471 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttacaatcaaagtgtttgtcttttacttt 7050570  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  7050571 ttactttgttc 7050581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 170 - 375
Target Start/End: Original strand, 20524002 - 20524209
Alignment:
Q  170 taatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnn 268  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | |||||| || || |||||||||||||||||||||         
T  20524002 taatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcccttaagaacgtcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgttatttt 20524101  T
Q  269 nnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttta 367  Q
        ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20524102 ttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttttta 20524201  T
Q  368 ctttgttc 375  Q
    ||||||||    
T  20524202 ctttgttc 20524209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 11355831 - 11356031
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggc 274  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |        |||    
T  11355831 tttttggagttgtttagtgtatgcttttttggatttgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgatatttgtttggc 11355930  T
Q  275 tatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11355931 tatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgactaatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgtt 11356030  T
Q  375 c 375  Q
    |    
T  11356031 c 11356031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 374
Target Start/End: Original strand, 10569021 - 10569223
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||     
T  10569021 taattaatgctttttggacttgtttaatttatgcttttttggatatgtaatgacttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgtta 10569112  T
Q  265 nnnnnnn-ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactt 363  Q
            ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10569113 ttttttttggctatgtaatgagttatgaacatcaaatatatgacttatgatgatatgcaaatgtctatctttttacaatcaaagtgtctgttttttactt 10569212  T
Q  364 tttactttgtt 374  Q
    |||||||||||    
T  10569213 tttactttgtt 10569223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 272 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7372387 - 7372284
Alignment:
Q  272 ggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttacttt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7372387 ggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtatgaaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttacttt 7372288  T
Q  372 gttc 375  Q
    ||||    
T  7372287 gttc 7372284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 7372653 - 7372539
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  7372653 cataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggagttattagagttccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactc 7372554  T
Q  148 aaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||    
T  7372553 aaccccaatacatgg 7372539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 6899905 - 6900038
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  6899905 cagtgatttcaaatgacaggcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgcttttggagttattagagttccaaatccaaattg 6900004  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatg 161  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6900005 tgggccatctgcttctactcaaccccaatacatg 6900038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 11355692 - 11355777
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  11355692 tccacaaaaaccaaccgctcctagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 11355777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 20523790 - 20523931
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaatt 120  Q
    |||||| |||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| | |||    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||     
T  20523790 agaggaccagtgatttcaaatgtcatgcataaacaaacaccactgaggtgtcctgctccacaaaatccaactgctccatgagttattagacttccaaatc 20523889  T
Q  121 caaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20523890 caaattatgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 20523931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7372469 - 7372376
Alignment:
Q  169 ttaatgttttttagacttgtttactttatgctttttgga-tatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatg 261  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7372469 ttaatgctttttggacttgtttagtttatgcttttttgaatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatg 7372376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21091736 - 21091574
Alignment:
Q  177 ttttagacttgtttactttatgctttttg-gatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggct 275  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||        ||||||||| ||||||||       ||||    
T  21091736 ttttggacttgtttaatttatgttttttttgatatgtaatgatttaagaacatcaaatgactt--------gatggctatctaatgttctttttttggct 21091645  T
Q  276 atgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaa 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21091644 atgtaatgacttatgaacatcaaatttatgacttatgaaaatatgcaaatgtctgtatttttacattcaaa 21091574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 161
Target Start/End: Original strand, 7050198 - 7050311
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||| ||||  |||||| || |||||| |||| |||||    
T  7050198 cataaacaaacaccattgaggggtcctgctccacaaaatccaactggtcctcgagttattagagtttcaaacccaaattgcgagtcatccgcttctactc 7050297  T
Q  148 aaccccaatacatg 161  Q
    ||||||||||||||    
T  7050298 aaccccaatacatg 7050311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 162
Target Start/End: Original strand, 32517291 - 32517434
Alignment:
Q  21 agaggatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggt--ctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaa 118  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||| | ||| |||   ||| ||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||    
T  32517291 agaggaccagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacactactgagggggtcctgcttc-acaaaatccaactgcccctagagttattagagtttcaaa 32517389  T
Q  119 ttcaaattacgggtcatctgcttttactc-aaccccaatacatgg 162  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  32517390 tccaaattacgggtcatccgcttctactcaaaccccaatacatgg 32517434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 18644031 - 18644095
Alignment:
Q  311 tgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgttc 375  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18644031 tgatggtatgcaaatgtgtgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttactttttactttgttc 18644095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 251
Target Start/End: Original strand, 18643950 - 18644036
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatgg 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||| | || || |||||||||    
T  18643950 taattaatgttttttggacttgtttagtttatgtttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaataatttgatgacttgatgg 18644036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 263
Target Start/End: Original strand, 32517501 - 32517599
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgctttt-tggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgtt 263  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| || || |||| ||| ||||||||||||    
T  32517501 taattaaagctttttggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcatttaagaacatcaaatgatttgatgacttaatgactatgtaatgtt 32517599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32438790 - 32438691
Alignment:
Q  25 gatcagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    ||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32438790 gatcagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaattcaactgctcctggagttattagagtttcaaatccaaa 32438691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 3916 - 4126
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||     
T  3916 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatttta 4015  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  4016 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttacttt 4115  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  4116 ttactttgttc 4126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5298
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||| ||     
T  5088 taattaatgctttttggacttgtttagtttacgcttttttggatatgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatttta 5187  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  5188 tttttttggctatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatggtataaaaatgtctgtcttttgataatcaaagtgtctgtcttttacttt 5287  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  5288 ttactttgttc 5298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 3764 - 3849
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3764 tccacaagatctaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 3849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 4936 - 5021
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4936 tccacaagatctaactgctcttggagttattagaattccaaatccaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 5021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 168 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 108087 - 107887
Alignment:
Q  168 attaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnn 266  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||        |||||||||||||||||       
T  108087 attaatgctttttggacttgtttaatttatgtttttttggatatgtaatgacttaagaatatcaaatgactt--------gatggctatgtaatgttatt 107996  T
Q  267 nnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttttt 366  Q
         ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  107995 tttttggctatgtaatgacatatgaacatcaaatgtatgacttatgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttttt 107896  T
Q  367 actttgttc 375  Q
    |||||||||    
T  107895 actttgttc 107887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 108270 - 108156
Alignment:
Q  48 cataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactc 147  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||  || |    
T  108270 cataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatccaactgctcctggatttattagagttccaaatccaaatttcgggtcatccacttccacac 108171  T
Q  148 aaccccaatacatgg 162  Q
    |||||||||||||||    
T  108170 aaccccaatacatgg 108156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0564
Description:

Target: scaffold0564; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 375
Target Start/End: Original strand, 8882 - 9091
Alignment:
Q  166 taattaatgttttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttc 264  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  8882 taattaatgtttttcggacttgtttagtttatgcttttttggatatgtaatcacttacgaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgtta 8981  T
Q  265 nnnnnnnggctatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttacttt 364  Q
           | ||||  | ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  8982 tttttttg-ctatatagtgacttatgaacatcaaatatatgacttatgatagtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtctgtcttttacttt 9080  T
Q  365 ttactttgttc 375  Q
    |||||||||||    
T  9081 ttactttgttc 9091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0564; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 162
Target Start/End: Original strand, 8681 - 8815
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtctgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaatta 127  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8681 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcctgctccacaaaatacaactgctcatagagttattagagttccaaattcaaatta 8780  T
Q  128 cgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8781 cgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 8815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 176 - 375
Target Start/End: Original strand, 184 - 384
Alignment:
Q  176 tttttagacttgtttactttatgcttttt-ggatatgtaatgacttaagaacattaaatgacttcataacttgatggctatgtaatgttcnnnnnnnggc 274  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||| |        |||    
T  184 tttttggagttgtttagtgtatgcttttttggatttgtaatcacttaagaacatcaaatgatttgatgacttgatggctatgtaatgatatttgtttggc 283  T
Q  275 tatgaaatgacttatgaacatcaaatgtgtgacttatgatgttatgcaaatgtctgtcttcttacaatcaaagtgtatgtcttttactttttactttgtt 374  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  284 tatgtaatgacttatgaacatcaaatatatgactcctgatggtatgcaaatgtctgtctttttataatcaaagtgtttgtcttttactttttactttgtt 383  T
Q  375 c 375  Q
    |    
T  384 c 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 162
Target Start/End: Original strand, 45 - 130
Alignment:
Q  77 tccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatctgcttttactcaaccccaatacatgg 162  Q
    ||||||||| ||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45 tccacaaaaaccaaccgctcctagagttattagagttccaaattcaaattacgggtcatccgcttctactcaaccccaatacatgg 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1454 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1454
Description:

Target: scaffold1454; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 1685 - 1781
Alignment:
Q  28 cagttatttcaaataacaaacataaacaaacaccagtgaagggtc-tgattccacaaaatccatctgctcttggagttattagagttccaaattcaaa 124  Q
    |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||| || ||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  1685 cagtgatttcaaatgacatgcataaacaaacaccactgaggggtcatgcttc-acaaaatccaactgctcctaaagttattagagtttcaaatccaaa 1781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University