View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_11 (Length: 515)

Name: NF9913A_low_11
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_11
NF9913A_low_11
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (26-513)||(37261304-37261789)
chr5 (26-513)||(25542526-25543023)
chr5 (26-515)||(14192545-14193044)
chr5 (30-514)||(17871375-17871868)
chr5 (26-515)||(3689964-3690463)
chr5 (26-515)||(3876324-3876823)
chr5 (26-513)||(27881073-27881570)
chr5 (26-513)||(39883172-39883669)
chr5 (26-515)||(37372923-37373422)
chr5 (26-515)||(8428318-8428806)
chr5 (26-301)||(30346362-30346637)
chr5 (26-291)||(10025199-10025464)
chr5 (26-301)||(24629686-24629954)
chr5 (376-515)||(24629954-24630093)
chr5 (376-515)||(30346637-30346776)
chr5 (376-515)||(10025050-10025189)
chr5 (480-513)||(6089199-6089232)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (26-515)||(10038627-10039116)
chr3 (26-515)||(10110587-10111086)
chr3 (26-513)||(13530028-13530525)
chr3 (26-515)||(10000394-10000893)
chr3 (26-515)||(10968515-10969013)
chr3 (26-515)||(50410159-50410654)
chr3 (26-515)||(32758-33257)
chr3 (26-515)||(10237543-10238040)
chr3 (26-511)||(11368638-11369125)
chr3 (92-511)||(11362249-11362681)
chr3 (247-515)||(52918053-52918330)
chr3 (335-515)||(46913058-46913238)
chr3 (26-206)||(52918332-52918512)
chr3 (356-515)||(47692956-47693115)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (26-510)||(186546-187040)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (26-513)||(5828288-5828785)
chr7 (26-513)||(21069795-21070292)
chr7 (26-515)||(9000878-9001377)
chr7 (26-515)||(7036707-7037206)
chr7 (30-514)||(22843792-22844285)
chr7 (26-515)||(12780881-12781381)
chr7 (94-515)||(12785790-12786210)
chr7 (26-301)||(42232210-42232486)
chr7 (376-515)||(42232071-42232210)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (26-513)||(36207204-36207701)
chr1 (26-515)||(2452850-2453349)
chr1 (26-515)||(16042012-16042511)
chr1 (37-515)||(2329156-2329641)
chr1 (26-515)||(37389885-37390384)
chr1 (26-505)||(48775068-48775557)
chr1 (30-515)||(6310731-6311227)
chr1 (126-515)||(18148675-18149074)
chr1 (26-382)||(48233498-48233864)
chr1 (26-301)||(52500795-52501063)
chr1 (335-511)||(48238529-48238705)
chr1 (376-515)||(52500656-52500795)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (26-515)||(2201912-2202411)
chr6 (71-513)||(10187533-10187985)
chr6 (30-514)||(30881315-30881808)
chr6 (26-513)||(18344114-18344611)
chr6 (136-515)||(15333630-15334019)
chr6 (212-515)||(29639947-29640260)
chr6 (26-266)||(12517520-12517760)
chr6 (212-515)||(31510118-31510431)
chr6 (368-515)||(12517375-12517522)
chr6 (59-204)||(18814054-18814199)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (26-515)||(1860664-1861163)
chr4 (26-515)||(35855894-35856393)
chr4 (26-515)||(49710160-49710658)
chr4 (35-515)||(38518083-38518573)
chr4 (26-417)||(13337320-13337721)
chr4 (94-515)||(49786640-49787060)
chr4 (26-335)||(617957-618266)
chr4 (26-301)||(55558856-55559131)
chr4 (376-515)||(55559131-55559270)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (26-515)||(24268803-24269302)
chr2 (26-515)||(27509361-27509860)
chr2 (35-515)||(24245812-24246302)
chr2 (26-510)||(27192481-27192975)
chr2 (26-510)||(27842295-27842789)
chr2 (26-515)||(21395357-21395856)
chr2 (61-513)||(17683597-17684059)
chr2 (94-515)||(28665984-28666404)
chr2 (94-515)||(37824818-37825238)
chr2 (95-515)||(41919986-41920405)
chr2 (26-298)||(35609867-35610139)
chr2 (335-515)||(35609672-35609852)
chr2 (33-184)||(3642920-3643071)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (26-515)||(18993-19491)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (26-513)||(17610-18099)
[»] chr8 (7 HSPs)
chr8 (26-515)||(21113477-21113976)
chr8 (26-515)||(25218298-25218797)
chr8 (26-515)||(25208780-25209264)
chr8 (26-515)||(7821825-7822324)
chr8 (114-515)||(30307164-30307575)
chr8 (335-514)||(31978579-31978758)
chr8 (26-110)||(30325877-30325961)
[»] scaffold0073 (3 HSPs)
scaffold0073 (26-515)||(31920-32418)
scaffold0073 (26-262)||(1-237)
scaffold0073 (299-515)||(19444-19670)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (35-515)||(314-804)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (26-515)||(4993-5491)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (26-515)||(321069-321568)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (26-511)||(182802-183297)
scaffold0003 (26-511)||(165521-166019)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (94-515)||(987-1418)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (94-515)||(48748-49168)
[»] scaffold0118 (2 HSPs)
scaffold0118 (26-301)||(28452-28727)
scaffold0118 (376-513)||(28727-28864)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (93-331)||(39937-40175)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (307-515)||(16671-16889)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (26-178)||(14010-14162)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (411-515)||(30-134)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (447-513)||(1637-1703)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 405; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 37261789 - 37261304
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37261789 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcctgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgtctcgatcaattcatcaaa 37261690  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  37261689 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 37261590  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  37261589 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgcttatattggacacaacaa--c 37261492  T
Q  326 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 425  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37261491 cgttgatgtctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgag 37261392  T
Q  426 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37261391 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 37261304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 25542526 - 25543023
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25542526 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgtggcagaatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 25542625  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  25542626 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcaaagcagaaagaaattgctaactttggcaag 25542725  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  25542726 tggatactctcaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaata 25542825  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25542826 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 25542925  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542926 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 25543023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 14192545 - 14193044
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||  |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  14192545 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcatgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaattaattcattaaa 14192644  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| || |    
T  14192645 gatatgggcttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaagaaattgctaattttgacaag 14192744  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192745 tggatactctcaattggagacggcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 14192844  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  14192845 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaa 14192944  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192945 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 14193044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 514
Target Start/End: Original strand, 17871375 - 17871868
Alignment:
Q  30 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 129  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17871375 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 17871474  T
Q  130 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 229  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  17871475 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 17871574  T
Q  230 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 329  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17871575 tactctcaattagagaaggcaacggcgcttcggatg-agatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 17871673  T
Q  330 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 419  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  17871674 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattct 17871773  T
Q  420 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 514  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17871774 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3690463 - 3689964
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690463 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3690364  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3690363 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3690264  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||     
T  3690263 tggatactctcaattggagacggcaacgacacttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 3690164  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  3690163 cgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttga 3690064  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3690063 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattct 3689964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 3876324 - 3876823
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3876324 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 3876423  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3876424 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 3876523  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| || |||||||||     
T  3876524 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 3876623  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || | ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||    
T  3876624 cgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataacattggggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttga 3876723  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3876724 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtggagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattct 3876823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 27881570 - 27881073
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27881570 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcatcaaa 27881471  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27881470 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttaccgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacatgcagagcaggtagaaattgctaattttggcaag 27881371  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| | | ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27881370 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgacaatggtgaaataaaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatc 27881271  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27881270 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27881171  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27881170 ttcagctgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaatt 27881073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 39883669 - 39883172
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39883669 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 39883570  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  39883569 gatattggcttattgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 39883470  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39883469 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 39883370  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  39883369 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 39883270  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  39883269 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaatt 39883172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 37373422 - 37372923
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||||||||| |||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  37373422 gaatcacagtagttttaggtggtgattttaagcagatattgcctgttgtctgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcgtcggtcaattcgtcaaa 37373323  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37373322 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37373223  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  37373222 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatc 37373123  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37373122 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 37373023  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  37373022 ttcagttgagcatgttaaccaatttatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattct 37372923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 8428318 - 8428806
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  8428318 gaatggcagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 8428417  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8428418 gatatgggcttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 8428506  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8428507 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 8428606  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  8428607 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttga 8428706  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  8428707 ttcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattct 8428806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Original strand, 30346362 - 30346637
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30346362 gaatgacaatagttttaggtggtgatgtcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 30346461  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30346462 gatatgtgcttattttaatgtgttaagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 30346561  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  30346562 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 30346637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 10025464 - 10025199
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10025464 gaatgacaatagttttaggtggtgatattaggcagatattgcctgctgtccgaaaaggaacgaggcaatatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10025365  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10025364 gatatgtgcttattttgatgtgttgagacttactgttaatatgagactgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10025265  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatt 291  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  10025264 tggatactctgaattagagacggtaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatt 10025199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Original strand, 24629686 - 24629954
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24629686 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 24629785  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||       ||||| |||| |    
T  24629786 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaag 24629878  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  24629879 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 24629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Original strand, 24629954 - 24630093
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24629954 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 24630053  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24630054 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 24630093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Original strand, 30346637 - 30346776
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30346637 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 30346736  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30346737 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 30346776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10025189 - 10025050
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  10025189 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagta 10025090  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10025089 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 10025050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 480 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6089232 - 6089199
Alignment:
Q  480 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089232 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 6089199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 402; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10039116 - 10038627
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039116 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaagaagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10039017  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10039016 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaag 10038917  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  10038916 tggatactctcaattgaagacggcaacgacgctttagatgagaatggtgaaacgaaggtataaattttcgaagatttgcttatatcagacacaacaaatc 10038817  T
Q  326 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 425  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10038816 tgttgatgtctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgag 10038717  T
Q  426 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10038716 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctctcattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 10038627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10111086 - 10110587
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10111086 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10110987  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10110986 gatatgagcttattttaatgtgttaatgcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctacagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10110887  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10110886 tggatactatgaattggagacggcaacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatc 10110787  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10110786 tgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10110687  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10110686 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10110587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13530525 - 13530028
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13530525 gaatgacagtagttttagctggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgaggcacgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaca 13530426  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13530425 gatatgggcttattgtaatgtgtagaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 13530326  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13530325 tatatactctcaattggagacggcaacgacgcatcaggtgagaatggtgaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatc 13530226  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13530225 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttca 13530126  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13530125 ttcagttgagcattttaacgaatatatgatgtcactgagtccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaatt 13530028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10000893 - 10000394
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10000893 gaatgacaatagttttaggtggggatttcaggcagatgttgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10000794  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| |    
T  10000793 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgttaattttggcaag 10000694  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10000693 tggatactatgaattggagacggcaacaacgcttcggaggagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatc 10000594  T
Q  326 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||          | |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  10000593 tgttgatatcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttga 10000494  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10000493 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 10968515 - 10969013
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||| | || ||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968515 gaatgacagtagttttagatggtgatttcaggcagatattgtctgtagtccgaaacggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 10968614  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10968615 gatatgggtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcagtacctatagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 10968714  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10968715 tggacactctcaattggagatggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctg-agatttgctgatatcggacacaacaaatc 10968813  T
Q  326 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||          | ||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10968814 cgttgatgccacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaacttcgtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10968913  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10968914 ttcagtttagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattct 10969013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 50410654 - 50410159
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| ||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50410654 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatactgcctgttgtccgtaaagcaacgaggcacgatatttttgatgcctcaatcaattcatcaaa 50410555  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  50410554 gatattggcttattctaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaag 50410455  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||    ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50410454 tggatactctcaattagagacggtaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaag----aaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 50410359  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    || ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  50410358 cgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgacccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 50410259  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50410258 ttcagtcgagcatgttaacaaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattct 50410159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33257 - 32758
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||  |||||| | |  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  33257 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcatgttgtccgaggaggaacgacgccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 33158  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  33157 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 33058  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  33057 tggatactctcaattagagacggcaacaatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatc 32958  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32957 cgttgatgtcacttatggactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 32858  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32857 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 32758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 10238040 - 10237543
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10238040 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 10237941  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  10237940 gatatgggcttattttaatgtgttaaggcttactgttaatataagattggatgcatctttggtacctgctgagcagaaagaaattgctaattttggcaag 10237841  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  | |||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  10237840 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcgga-gggaatggtgaaataacggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatc 10237742  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10237741 tgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 10237642  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10237641 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaagagta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattct 10237543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11369125 - 11368638
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11369125 gaatgacagtagttttaagtggtgatttcaggcatatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 11369026  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||||||||| |    
T  11369025 gatatggacttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagaaggaagaaactgataattttggcaag 11368926  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||         ||||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11368925 tggataccctcaattggagaggacaac---------gatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatc 11368835  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgct-atttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttg 414  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  11368834 cgttgatgtcactcatagactttgtatatcccgatttgaatgataacattggtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttg 11368735  T
Q  415 attcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 511  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11368734 attcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaa 11368638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 92 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 11362681 - 11362249
Alignment:
Q  92 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  11362681 aggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacc 11362582  T
Q  192 tgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgg--atactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaa 289  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |||    
T  11362581 tgcagagcaagaataaactgctaattttggcaagtggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaa 11362482  T
Q  290 tttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatt 379  Q
    || |||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||          |||||| |||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  11362481 ttcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatt 11362382  T
Q  380 tttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaata-gtattt 478  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||    
T  11362381 tttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagattttttt 11362282  T
Q  479 aagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 511  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11362281 aagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaa 11362249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 247 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52918330 - 52918053
Alignment:
Q  247 ggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------t 336  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||   || ||||||||||||||| ||||||| |          |    
T  52918330 ggcaacgacgcttcggatgggaatggtgaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagact 52918232  T
Q  337 ttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatga 436  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  52918231 tcgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacga 52918132  T
Q  437 atatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52918131 atatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattct 52918053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 335 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 46913238 - 46913058
Alignment:
Q  335 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 434  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  46913238 ctttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 46913139  T
Q  435 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  46913138 gaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattct 46913058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52918512 - 52918332
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52918512 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtagtccgaaaaggatcgagggaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 52918413  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaaga 206  Q
    |||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  52918412 gatacgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagtaggaaga 52918332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 356 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 47693115 - 47692956
Alignment:
Q  356 tgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgatt 455  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  47693115 tgataaccttggtgacccacaattttcccaagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaatt 47693016  T
Q  456 ccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  47693015 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattct 47692956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 312; Significance: 1e-176; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 26 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 187040 - 186546
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  187040 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaagcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcaccaatcaattcatcaaa 186941  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||  || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  186940 gatatgggcttattgtaatgttttaaggcctactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 186841  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  186840 tggatactctcaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatc 186741  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  186740 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttga 186641  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa 510  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186640 ttcagctgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa 186546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 5828288 - 5828785
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5828288 gaatgatattagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 5828387  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5828388 gatatgggtttattttaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5828487  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5828488 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 5828587  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
      |||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5828588 ttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttga 5828687  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
     |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5828688 ctcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaatt 5828785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 21069795 - 21070292
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  21069795 gaatcacagtagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 21069894  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||| ||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |    
T  21069895 gatatgggtttattgtaatgtatcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttgacaag 21069994  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21069995 tggatactctcaattggagacggcaacgacgtttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatc 21070094  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21070095 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 21070194  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21070195 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcctggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaatt 21070292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 9000878 - 9001377
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9000878 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 9000977  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9000978 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcatagcaggaagaaattgctaattttggcaag 9001077  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9001078 tggatactctcaattggatacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatc 9001177  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||| |||||  || ||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  9001178 cgttgatgtctcttatagactttgtttatcccgatctgattgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttga 9001277  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9001278 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 9001377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7037206 - 7036707
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7037206 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7037107  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  7037106 gatataggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 7037007  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  7037006 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatc 7036907  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7036906 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 7036807  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7036806 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 7036707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 30 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22844285 - 22843792
Alignment:
Q  30 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 129  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22844285 gacaaaagttttaggtggtgatttcatgcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 22844186  T
Q  130 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 229  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  22844185 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgtagagcaggaataaattgctaattttggcaattgga 22844086  T
Q  230 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 329  Q
    |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  22844085 tactcttaattagagaaggcaacgtcgcttcggatg-agatggtgaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgtt 22843987  T
Q  330 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 419  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  22843986 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattct 22843887  T
Q  420 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 514  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22843886 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 12780881 - 12781381
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| || |||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12780881 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatgttgcctgtagtccaaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 12780980  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  12780981 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgtagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 12781080  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12781081 tggatactctcaattggagacgacaatgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatc 12781180  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12781181 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 12781280  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattc 514  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  12781281 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattc 12781380  T
Q  515 t 515  Q
    |    
T  12781381 t 12781381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 515
Target Start/End: Original strand, 12785790 - 12786210
Alignment:
Q  94 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  12785790 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 12785878  T
Q  194 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  12785879 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 12785978  T
Q  294 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 383  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  12785979 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 12786078  T
Q  384 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 483  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  12786079 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 12786178  T
Q  484 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  12786179 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattct 12786210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42232486 - 42232210
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagtttt-atgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaa 124  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42232486 gaatgacaatagtttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaa 42232387  T
Q  125 agatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcat 224  Q
    ||||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||     
T  42232386 agatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagtagaaagaaattgctaattttggcaa 42232287  T
Q  225 gtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 301  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  42232286 gtggatactctgaattggagacggcaacaacggttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 42232210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 42232210 - 42232071
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42232210 tatttttccaagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 42232111  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  42232110 tttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattct 42232071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 36207701 - 36207204
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36207701 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcagacagatattgcctgttgtctgaaaaggaaagaggcaggatattattgatgcctcaatcaattcatcaaa 36207602  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  36207601 gatatgagtttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggttcatcttcggtacctgcaaagcaggaagaaattgataattttggcaag 36207502  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  36207501 tggatactctcaattgaagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaattgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatc 36207402  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36207401 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattga 36207302  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36207301 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaatt 36207204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 2452850 - 2453349
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2452850 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggaagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcttcaatcaattcatcaaa 2452949  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |    
T  2452950 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcatgaagaaattgctaattttgacaag 2453049  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2453050 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatc 2453149  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  2453150 cgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttta 2453249  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2453250 ttgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattct 2453349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16042511 - 16042012
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  |  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  16042511 gaatgacagtagttttacgtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtcctaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 16042412  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16042411 gatattggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcagcttcggtacatgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 16042312  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16042311 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 16042212  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16042211 cgttgatgtcgcttatagactttgtgtatcccaatctgaatgataaccttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 16042112  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16042111 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 16042012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 37 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 2329641 - 2329156
Alignment:
Q  37 gttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggctt 136  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | || |||||| |  ||| ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2329641 gttttaggtggtgatttcaggcagatactacctgttgtccgtgaagcaacgaggcacgatattgttaatgccttaatcaattcatcaaagatatgggctt 2329542  T
Q  137 attgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctc 236  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2329541 attgtaatatgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcctcttcgttacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactctc 2329442  T
Q  237 aattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtct 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2329441 aattagagacggcaacgacgcttcggatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtca 2329342  T
Q  337 tt-------gtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcata 429  Q
     |       ||||||||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||     
T  2329341 cttatagacgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatg 2329242  T
Q  430 ttaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2329241 ttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattct 2329156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 37389885 - 37390384
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  37389885 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggctggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 37389984  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37389985 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 37390084  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37390085 tggatattctcaattggagacggcaaagatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 37390184  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37390185 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 37390284  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37390285 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 37390384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 26 - 505
Target Start/End: Original strand, 48775068 - 48775557
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||  | ||||||   |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48775068 gaatgacggtagttttaggtggtgatttcagacaaatattgtatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48775167  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
     ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  48775168 tatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatcagattgggtgcatcttcgggacctacagagcagaaagaaactgctaattttggcaag 48775267  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  48775268 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatt 48775367  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    | |||||||          |||||| |||||  ||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  48775368 ctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataacattggtgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttga 48775467  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcggg 505  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48775468 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcggg 48775557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 30 - 515
Target Start/End: Original strand, 6310731 - 6311227
Alignment:
Q  30 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||| ||  |||||  |||   |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  6310731 gacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaatgaggcctgatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagata 6310830  T
Q  130 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 229  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6310831 tgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtgga 6310930  T
Q  230 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 329  Q
    || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6310931 tagtctccattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgtt 6311030  T
Q  330 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 419  Q
    |||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6311031 gatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattca 6311130  T
Q  420 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  6311131 gttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattct 6311227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 126 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 18149074 - 18148675
Alignment:
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  18149074 gatatggacttattttaatgtgttaaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 18148975  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18148974 tggatactctgaattggagacggcaataacgcttcgaaggagaatggtgaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatc 18148875  T
Q  326 cgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     |||||||||          ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18148874 tgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18148775  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18148774 ttcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattct 18148675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 48233864 - 48233498
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233864 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 48233765  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| | ||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  48233764 gatatgtgtttattgtaatttgttgaggcttactgttgatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 48233665  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    || |||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  48233664 tgaatactctcaacttgagacgacaacgacgcttcagatgagaatggggaaatgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaatc 48233565  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctattttt 382  Q
    || ||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  48233564 cgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctattttt 48233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 52501063 - 52500795
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52501063 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 52500964  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||       ||||| |||| |    
T  52500963 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaaga-------aatttcggcaag 52500871  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 301  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  52500870 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggttaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 52500795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 335 - 511
Target Start/End: Original strand, 48238529 - 48238705
Alignment:
Q  335 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 434  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  48238529 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaac 48238628  T
Q  435 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 511  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238629 gaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 48238705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 52500795 - 52500656
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52500795 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 52500696  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52500695 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 52500656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 2201912 - 2202411
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2201912 gaatgacagtagttttaggtggtgacttcaggcagatattgcccattgtccgaaaaggatcgaggcaggatattgttgatgcctcgatcaattcatcaaa 2202011  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2202012 gatataggcatattgtaatgtgtcgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacttgcagagcatgaagaaattgctaattttggcaag 2202111  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2202112 tggatactctcaattggagaaggcaacgacgcttcaaatgagaatggtgaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatc 2202211  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  2202212 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaa 2202311  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2202312 ttcagtagaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattct 2202411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 71 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10187985 - 10187533
Alignment:
Q  71 ttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgag 170  Q
    ||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10187985 ttgtccgaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttattgttaatatgag 10187886  T
Q  171 attaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaat 270  Q
    ||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10187885 attgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaattttcgcacgtggatgctctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaat 10187786  T
Q  271 ggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgata 360  Q
    ||| ||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||    
T  10187785 ggtaaaatgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgata 10187686  T
Q  361 accttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccagg 460  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10187685 accttggtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccagg 10187586  T
Q  461 tgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187585 tgaagagaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 10187533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 30 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 30881808 - 30881315
Alignment:
Q  30 gacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagata 129  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  || |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30881808 gacaaaagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgtcatccgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcagttcatcaaagata 30881709  T
Q  130 tgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtgga 229  Q
    || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  30881708 tgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatctttggtacctgcagagcaggaataaattgctaattttggcaaatgga 30881609  T
Q  230 tactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 329  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30881608 tactctcaattagagaaggcaacggcgcttcggatg-agatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgtt 30881510  T
Q  330 gatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattca 419  Q
    |||||          | |||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||     
T  30881509 gatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattct 30881410  T
Q  420 gttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 514  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30881409 gttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18344611 - 18344114
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18344611 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaatttatcaaa 18344512  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  18344511 gatatgggcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctacagagcaggaagaaattcctaattttgacaag 18344412  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344411 tgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 18344312  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||| ||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  18344311 cgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttga 18344212  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18344211 ttcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaatt 18344114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 136 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 15334019 - 15333630
Alignment:
Q  136 tattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactct 235  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15334019 tattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcgatacctgcagagcaagaagaaattgctaattttggcaagtggatactct 15333920  T
Q  236 caattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt- 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||| | ||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||     
T  15333919 caattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatagtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtc 15333820  T
Q  335 ---------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 425  Q
             ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15333819 actaatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgag 15333720  T
Q  426 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15333719 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattct 15333630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 212 - 515
Target Start/End: Original strand, 29639947 - 29640260
Alignment:
Q  212 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatc 311  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  29639947 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatc 29640046  T
Q  312 ggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactc 401  Q
       ||||||||||| |||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  29640047 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactc 29640146  T
Q  402 gcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgat 501  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  29640147 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 29640246  T
Q  502 cgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||||    
T  29640247 cgggtgaaaattct 29640260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 26 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12517760 - 12517520
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  12517760 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcagttaattcgtcaaa 12517661  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12517660 gatatgggcttattgtaatgtgttgaagcttactgttaatatgagattgggtgcatcttctgttcctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 12517561  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatga 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  12517560 tggatactctcaattggagacgacaacgacacttcggatga 12517520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 212 - 515
Target Start/End: Original strand, 31510118 - 31510431
Alignment:
Q  212 ctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatc 311  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| |||||    
T  31510118 ctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgtttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatc 31510217  T
Q  312 ggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactc 401  Q
       ||||||||||| |||||||||          ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31510218 aaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataaccttggtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactc 31510317  T
Q  402 gcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgat 501  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | |||    
T  31510318 gcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctaattctatttttagat 31510417  T
Q  502 cgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||||    
T  31510418 cgggtgaaaattct 31510431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 368 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 12517522 - 12517375
Alignment:
Q  368 tgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 467  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12517522 tgaccagctatttttccaagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagag 12517423  T
Q  468 aaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  12517422 aaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattct 12517375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18814199 - 18814054
Alignment:
Q  59 agatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttac 158  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18814199 agatattgcatgttgtccgaaaaggaacgagacatgatattgttgatcccttaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttac 18814100  T
Q  159 tgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaa 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  18814099 tgttaatatgagattgggtgcatcgttggtacctgtagagcaggaa 18814054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1861163 - 1860664
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  1861163 gaatgacaatagtgtaaggtggtgatttcaggcaaatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcattaaa 1861064  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  1861063 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 1860964  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1860963 tggatactctgaattggagacgacaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 1860864  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1860863 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 1860764  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1860763 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattct 1860664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35856393 - 35855894
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  35856393 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 35856294  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  35856293 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 35856194  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35856193 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 35856094  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  35856093 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 35855994  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35855993 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 35855894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 49710658 - 49710160
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||  |||||| |||   |||||||||||||||||  ||||||| | |||    
T  49710658 gaatgacaatagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgttcgaggaggaacgaggccagatattgttgatgcctccgtcaattcgttaaa 49710559  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  49710558 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagaacagaaagaaattgctaattttggcaag 49710459  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49710458 tggatactctcaattggacacggcaacgatgcttcggatgaaaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 49710359  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    | |||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  49710358 c-ttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 49710260  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49710259 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 49710160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 35 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38518573 - 38518083
Alignment:
Q  35 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 134  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||  | |||||||||  |||||| ||   |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  38518573 tagttttaggtggtgattttaggcagatattaactgttgtctgaggaggaacgagaccggatattgttaatgcctcggtcaattcgtcaaagatatgggc 38518474  T
Q  135 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 234  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38518473 ttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactc 38518374  T
Q  235 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38518373 tcaattggagacggcaacgatgctttgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgt 38518274  T
Q  335 ----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttga 424  Q
              ||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  38518273 cacttatagactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattga 38518174  T
Q  425 gcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  38518173 gcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 38518083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 13337721 - 13337320
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  13337721 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 13337622  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||||   ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13337621 gatatgatattattgtaatgtgttgaggtttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 13337522  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13337521 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 13337422  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||| ||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  13337421 cgtttatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttga 13337322  T
Q  416 tt 417  Q
    ||    
T  13337321 tt 13337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 94 - 515
Target Start/End: Original strand, 49786640 - 49787060
Alignment:
Q  94 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  49786640 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 49786728  T
Q  194 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  49786729 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 49786828  T
Q  294 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 383  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  49786829 tgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 49786928  T
Q  384 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 483  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49786929 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaacct 49787028  T
Q  484 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  49787029 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattct 49787060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 335
Target Start/End: Original strand, 617957 - 618266
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617957 gaatgacaatagctttaggtggtgatttcaagcagatattgcatgttgtctgaaaaggaacgaggcatgatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 618056  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||  || |    
T  618057 gatataggcttattgtaatttgttgaggctaactgttaatatgagattgagtgcatctttggtatctgcagagcaggaagaaattcctaattttaacaag 618156  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  618157 tgaatactctcaattggagacgacaacgaagcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 618256  T
Q  326 cgttgatgtc 335  Q
    |||| |||||    
T  618257 cgttcatgtc 618266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Original strand, 55558856 - 55559131
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55558856 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcagtatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 55558955  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  55558956 gatatgtgcttattttaatgtgttgagacttactgttaatatgagattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 55559055  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  55559056 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 55559131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 376 - 515
Target Start/End: Original strand, 55559131 - 55559270
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55559131 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 55559230  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55559231 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 55559270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 24268803 - 24269302
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24268803 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 24268902  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  24268903 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttattgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 24269002  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24269003 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 24269102  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24269103 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 24269202  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24269203 ttcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 24269302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 27509860 - 27509361
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509860 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccaaaaaggaacgagacaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27509761  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27509760 gatatgggcttattgtaatgtattgaggcttactgttaatataagattgggtgcatctttgctacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 27509661  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||| ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  27509660 tagatactctcaattggagacagcaacgacgcttcagatgagaatggtgagatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaatt 27509561  T
Q  326 cgttgat----------gtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||          | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  27509560 cgttgatatcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttga 27509461  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509460 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 27509361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 35 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 24246302 - 24245812
Alignment:
Q  35 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaa-ggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 133  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246302 tagttttaggtggtgatttaaggcagatattgcatgttgtccgaaaaaggaatgatgcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatggg 24246203  T
Q  134 cttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatact 233  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24246202 cttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagatt-ggtgaatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatgttggcatgtggattct 24246104  T
Q  234 ctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatg 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  24246103 ctcaattggagacggcaacgacgctttggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatg 24246004  T
Q  334 t----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttg 423  Q
    |          | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24246003 tcacttatagaccttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttg 24245904  T
Q  424 agcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24245903 agcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27192975 - 27192481
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192975 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27192876  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27192875 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27192776  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192775 tggatactctcaactggtgacggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 27192676  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27192675 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27192576  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27192575 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaa 27192481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27842789 - 27842295
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842789 gaatgacaatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 27842690  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||| || ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  27842689 gatatgggcttattgtaatttgttgaggctgattgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgtagagcaggaagaaattcataattttgacaag 27842590  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842589 tggatactctcaactggtgacggcaacgacgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 27842490  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  27842489 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 27842390  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa 510  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27842389 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaa 27842295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 21395856 - 21395357
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  21395856 gaatgaccgtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctccgtcaattcgtcaaa 21395757  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  21395756 gttatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagatcaggaagaaattgctaatttcggcaag 21395657  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21395656 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 21395557  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21395556 cgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 21395457  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21395456 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 21395357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 61 - 513
Target Start/End: Original strand, 17683597 - 17684059
Alignment:
Q  61 atattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactg 160  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  17683597 atattgcttgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttaaggcttattg 17683696  T
Q  161 ttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttc 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683697 ttaatatgagattgggtgcatcttcgatacctgtagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttc 17683796  T
Q  261 ggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaat 350  Q
     ||||| |||||| ||| ||||||| ||||| | ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  ||    
T  17683797 agatgagaatggtaaaatgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgat 17683896  T
Q  351 ttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcac 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  17683897 ttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcac 17683996  T
Q  451 tgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17683997 tgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaatt 17684059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 515
Target Start/End: Original strand, 28665984 - 28666404
Alignment:
Q  94 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  28665984 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 28666072  T
Q  194 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  28666073 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 28666172  T
Q  294 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 383  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  28666173 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 28666272  T
Q  384 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 483  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  28666273 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 28666372  T
Q  484 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  28666373 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattct 28666404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 94 - 515
Target Start/End: Original strand, 37824818 - 37825238
Alignment:
Q  94 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  37824818 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 37824906  T
Q  194 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  37824907 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 37825006  T
Q  294 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 383  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || | |||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  37825007 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccaactatttttc 37825106  T
Q  384 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 483  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  37825107 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 37825206  T
Q  484 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  37825207 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattct 37825238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 95 - 515
Target Start/End: Original strand, 41919986 - 41920405
Alignment:
Q  95 atattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgc 194  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||| ||||| ||     
T  41919986 atattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatctttggtacctgt 41920074  T
Q  195 agagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttcc 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |     
T  41920075 agagcaggaagaaattgataatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcct 41920174  T
Q  295 gaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttcc 384  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41920175 gaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttcc 41920274  T
Q  385 aagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctc 484  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| |||| |||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  41920275 aagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtgaagataaagagtatttaacctc 41920374  T
Q  485 tgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41920375 tgattctatttttagatcgggtgaaaattct 41920405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35610139 - 35609867
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  35610139 gaatgacagttgttttaggtggtgatttcaggcatatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccccaatcaattcattaaa 35610040  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35610039 gatatggacttattataatgtgttgaggcttactgttaatatgacattgggtgcatcttcggtacctttagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 35609940  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaag 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  35609939 tggatactctcaattggagacggcaacgaagtttcggatcagaatggtgaaatgaaggtagaaatttctgaag 35609867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 335 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 35609852 - 35609672
Alignment:
Q  335 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 434  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||     
T  35609852 ctttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagtatgttaac 35609753  T
Q  435 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  35609752 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattct 35609672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 3643071 - 3642920
Alignment:
Q  33 aatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 132  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3643071 aatagttttaggtggtgatttcaggtagatattgcctgttgcccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgg 3642972  T
Q  133 gcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatctt 184  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3642971 gcttattgtaatttgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctt 3642920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19491 - 18993
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19491 gaatgacaatagttttaggtggtaatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 19392  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |    
T  19391 gatatgggcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcagagcagaaagaaattgctaa-tttggcaag 19293  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19292 gggatactttgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaata 19193  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19192 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 19093  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19092 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattct 18993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 513
Target Start/End: Original strand, 17610 - 18099
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17610 gaatgacaagagttttatgtggtgatttcaggcagctattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 17709  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  17710 gatatgggctt-ttgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttagcaag 17808  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809 tggatactctcaattggagacagcaacgaagcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 17908  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||       |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17909 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgatccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 18001  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18002 tttagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaatt 18099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 7)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 21113477 - 21113976
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21113477 gaatgacaatagttttaggtggtgatatcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaca 21113576  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  21113577 gatatgtgcttattttaatgtgttgacgcttactgttaatatgcgattgggtgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 21113676  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21113677 tggatactctgaattggagacggcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatc 21113776  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
     ||||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  21113777 tgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttga 21113876  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21113877 ttcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattct 21113976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 25218298 - 25218797
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25218298 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25218397  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25218398 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 25218497  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25218498 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatc 25218597  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25218598 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 25218697  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25218698 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 25218797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 25208780 - 25209264
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25208780 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctgttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 25208879  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||| |    
T  25208880 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttaatgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggacgaaattactaatttttgcaag 25208979  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||    
T  25208980 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatc 25209079  T
Q  326 cgttgatgtctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgag 425  Q
    ||||||||||  |   |||  | | || |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25209080 cgttgatgtcact---tat--agactttaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgag 25209174  T
Q  426 catattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  25209175 catgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattct 25209264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 7822324 - 7821825
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  |  |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7822324 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccgattattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaa 7822225  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| | | |    
T  7822224 gatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgagtgcatcttcggtacctgtagagcaggaagaaattgcgaatttttgtaag 7822125  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7822124 tggatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatc 7822025  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7822024 cgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 7821925  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7821924 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattct 7821825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 114 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 30307575 - 30307164
Alignment:
Q  114 caattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  30307575 caattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagtgggaagaaattgct 30307476  T
Q  214 aattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcgg 313  Q
    |||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||    
T  30307475 aatttttgcaagtagatactctcaattggagacgacaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcgg 30307376  T
Q  314 acacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgc 403  Q
    |||||||||||||||||||||          ||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30307375 acacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgc 30307276  T
Q  404 gccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcg 503  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| | |||||    
T  30307275 accaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcg 30307176  T
Q  504 ggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||    
T  30307175 ggtgaaaattct 30307164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 335 - 514
Target Start/End: Original strand, 31978579 - 31978758
Alignment:
Q  335 ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 434  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||     
T  31978579 ctttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaac 31978678  T
Q  435 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 514  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31978679 aaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggggaaaattc 31978758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 30325961 - 30325877
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctc 110  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  30325961 gaatgacagtagttttaggttgtgattttaggcagatattgcctattgtccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgcctc 30325877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 3)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32418 - 31920
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  32418 gaatgacagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgacgaggaacgaggccagatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaa 32319  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32318 gatatgtgcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaag 32219  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32218 tggatactctcaattggatacggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatc 32119  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          ||||||||||||  || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||    
T  32118 cgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaagaaagggg-atacttgcaccaacgcttga 32020  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32019 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatgttgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 31920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 237 - 1
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  || || ||  |||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||||| |||||    
T  237 gaatgacagtagttttaggtggtgattttaggcagatattgccttttttccgaggaggaacgaggccggatattgttgatgtctcggtcaattcgtcaaa 138  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
     |||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  137 tatattggcttattgtaatgttttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaagaagaaattgctaatttttgcaag 38  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37 tggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 299 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 19444
Alignment:
Q  299 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaaga 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||          |||||||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 19571  T
Q  389 aaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgat 488  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19570 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 19471  T
Q  489 tctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19470 tctgtttgtagatcgggtgaaaattct 19444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 35 - 515
Target Start/End: Original strand, 314 - 804
Alignment:
Q  35 tagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggc 134  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||  |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  314 tagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaggaggaacaaggccggatattgttgatgcctcaatcaattcgtcaaagatatgggc 413  T
Q  135 ttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactc 234  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  414 ttattgtaatgtgttgaggcttactattaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaattttggcaagtggatactc 513  T
Q  235 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  514 tcaattggagacggcaacgacgcttcggatgagaatgatgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgt 613  T
Q  335 ----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttga 424  Q
              ||||||||||||  || | |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  614 cacttataaactttgtgtatcccgatctaaatgataaccttggtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 713  T
Q  425 gcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  714 gcatgttaatgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaaaagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattct 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 4993 - 5491
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||  ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  4993 gaatgacaatagttttagatggtgattttaggcagatattgcctattgttcgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcataaaa 5092  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5093 gatatgtgcttattttaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgggtgcatctttgatacctgcaaagcagaaagaaattgctaattttggcaag 5192  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5193 tggatactctgacttggagacgacaacagcgcttcagatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 5292  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
      |||||||          |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5293 tattgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgacccgcta-ttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttga 5391  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5392 ttcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 5491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 26 - 515
Target Start/End: Original strand, 321069 - 321568
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  321069 gaatgacaagagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgccttaatcaattcatcaac 321168  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  321169 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacttttaatatgagattgggtgcatcttcggtacctgcagagcaggaagaaattgctaatttttgcaag 321268  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  321269 tggatattctcaatttgagacggcaattatgcttcggttgataatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatc 321368  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||| |||||||  || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  321369 cgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttga 321468  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  321469 ttcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatttcaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattct 321568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 26 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 183297 - 182802
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  183297 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaatgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 183198  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  183197 gatatggccttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgatattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaggaagaaactgctaattttggcaag 183098  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatc 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||     
T  183097 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaatt 182998  T
Q  326 cgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttga 415  Q
    |||||||||          |||||| |||||  |||||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  182997 cgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttgaatgatatcattggtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttga 182898  T
Q  416 ttcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 511  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  182897 ttcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtgaagagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaa 182802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 26 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 166019 - 165521
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166019 gaatgatagtagttttaggtggtgatttcaggcagatattgtctgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 165920  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |    
T  165919 gatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttacagttaatatgagattgggtgcatcttcgggacctgcagagcaagaataaactgctaattttggcaag 165820  T
Q  226 tgg--atactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatttgctcatatcggacacaacaaa 323  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  165819 tggatatactctcaattggagacgacaacgacgcttcgaatgagaatggtgaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaa 165720  T
Q  324 tccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacactt 413  Q
    | |||||||||          |||||| |||||  |||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  165719 ttcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataacattggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgctt 165620  T
Q  414 gattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaata-gtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaa 511  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  165619 gattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtgaagagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaa 165521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 94 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 1418 - 987
Alignment:
Q  94 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 193  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||    
T  1418 gatattatttatgcatcaatcaattcatcaaagatatgagcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgggattgggtgcatcttaggtacatg 1319  T
Q  194 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 293  Q
     | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  1318 tatagcaggaagaaatttctaattttggcaagtggatactctcaattggagacgacaacgactcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 1219  T
Q  294 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 383  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1218 tgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttc 1119  T
Q  384 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 483  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1118 caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagtgaagagaaagagtatttaagct 1019  T
Q  484 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  1018 ctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattct 987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 175; Significance: 5e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 94 - 515
Target Start/End: Original strand, 48748 - 49168
Alignment:
Q  94 gatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtg 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||| |||  ||||||||| ||           ||| | |||||||||||||| |     
T  48748 gatattgttgatgcctcggtcaattcgtcaaagatatggacttattgtaatgttttgaggcttgct-----------attggatgcatcttcggtaccta 48836  T
Q  194 cagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttc 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| |    
T  48837 cagagcaggaagaaattgctaatttttgcaagtggatactctcaattggagacggcaacgatgcttcgggtgacaatggtgaaatgaaggtagaaattcc 48936  T
Q  294 cgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgt----------ctttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttc 383  Q
     ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||          || |||||||||  || |||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  48937 tgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccaactatttttc 49036  T
Q  384 caagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagct 483  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  49037 caagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtgaagagaaagagtatttaacct 49136  T
Q  484 ctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  49137 ctgattctatttttagatcaggtgaaaattct 49168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28727
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452 gaatgacaatagtttaaggtggtgatatcaggcagatattgcatgttgtccgaaaaggaacgaggcaggatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 28551  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgtgcagagcaggaagaaattgctaattttggcatg 225  Q
    |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28552 gatatgtgcttattttaatgagttgagacttactgttaatatgagattggatgcatctttggtacctgcagagcagaaagaaattgctaattttggcaag 28651  T
Q  226 tggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaatttccgaagatt 301  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  28652 tggatactctgaattgaagacagcaacaacgcttcggatgagaatggtgaaatgaaggtagaaattcctgaagatt 28727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 376 - 513
Target Start/End: Original strand, 28727 - 28864
Alignment:
Q  376 tatttttccaagaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagta 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28727 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagta 28826  T
Q  476 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28827 tttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaatt 28864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 93 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40175 - 39937
Alignment:
Q  93 ggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaagatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtgcatcttcggtacgt 192  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  40175 ggatattgttgatgcctcagtcaattcgtcaaagatatgggcttattgtaatgtgttgaggcttactgttaatatgagattgtgtgcatcttcggtacct 40076  T
Q  193 gcagagcaggaagaaattgctaattttggcatgtggatactctcaattggagacggcaacgacgcttcggatgaaaatggtgaaacgaaggtataaattt 292  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||     
T  40075 acagagcaggaagaaattgctaactttggcaagtgaatactctcaattggagatggcaacgatgcttcggatgagaatggtgaaataaaggtagaaattc 39976  T
Q  293 ccgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 331  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39975 ttgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 307 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16889 - 16671
Alignment:
Q  307 atatcggacacaacaaatccgttgatgtc----------tttgtgtatccaaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 16790  T
Q  397 tactcgcgccaacacttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttg 496  Q
    ||||||| ||||| ||| ||| ||| ||| || |||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||     
T  16789 tactcgcaccaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttt 16690  T
Q  497 tcgatcgggtgaaaattct 515  Q
    || |||| | |||||||||    
T  16689 tcaatcgagcgaaaattct 16671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 178
Target Start/End: Original strand, 14010 - 14162
Alignment:
Q  26 gaatgacaatagttttatgtggtgatttcaggaagatattgcccgttgtctgaaaaggaactaggtaggatattgttgatgcctcaatcaattcatcaaa 125  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14010 gaatgataatagttttaggtggtgatttcaggcagatattgcctgttgtccgaaaaggaacgaggcaagatattgttgatgcatcaatcaattcatcaaa 14109  T
Q  126 gatatgggcttattgttatgcgttgaggcttactgttaatatgagattaggtg 178  Q
     ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14110 tatatgggcttattttaatatgttgaggcttactattaatatgagattgggtg 14162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 411 - 515
Target Start/End: Original strand, 30 - 134
Alignment:
Q  411 cttgattcagttgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaa 510  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30 cttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgggtgaaa 129  T
Q  511 attct 515  Q
    |||||    
T  130 attct 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 447 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1637
Alignment:
Q  447 tcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 513  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1703 tcactgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaatt 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University