View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_149 (Length: 290)

Name: NF9913A_low_149
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_149
NF9913A_low_149
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-273)||(8710409-8710682)
chr7 (1-274)||(18587364-18587638)
chr7 (1-273)||(13688845-13689118)
chr7 (1-273)||(11234406-11234679)
chr7 (1-273)||(14335200-14335473)
chr7 (1-273)||(15158250-15158523)
chr7 (1-273)||(44788544-44788817)
chr7 (3-273)||(17703650-17703921)
chr7 (1-273)||(18180547-18180820)
chr7 (1-273)||(11550295-11550568)
chr7 (1-273)||(14957358-14957631)
chr7 (1-273)||(9591172-9591441)
chr7 (52-273)||(8200852-8201074)
chr7 (1-273)||(12690306-12690578)
chr7 (106-273)||(10873494-10873662)
chr7 (3-273)||(15146118-15146389)
chr7 (18-243)||(14042529-14042755)
chr7 (18-243)||(14352559-14352785)
chr7 (3-111)||(16726636-16726744)
chr7 (15-270)||(13024153-13024409)
chr7 (7-270)||(18051130-18051394)
chr7 (7-270)||(16947649-16947913)
chr7 (7-270)||(21755220-21755484)
chr7 (7-270)||(26091975-26092239)
chr7 (29-270)||(15627331-15627573)
chr7 (7-269)||(26115767-26116030)
chr7 (7-267)||(40924994-40925255)
chr7 (7-270)||(12459436-12459700)
chr7 (7-270)||(49155109-49155373)
chr7 (99-270)||(19149819-19149991)
chr7 (99-270)||(20749218-20749390)
chr7 (7-270)||(11385606-11385870)
chr7 (7-270)||(13676259-13676523)
chr7 (99-270)||(14261515-14261686)
chr7 (7-270)||(15099780-15100044)
chr7 (7-145)||(13965845-13965983)
chr7 (227-273)||(14149856-14149902)
chr7 (99-160)||(14140598-14140659)
chr7 (99-270)||(14283643-14283815)
chr7 (7-160)||(12798678-12798831)
chr7 (7-160)||(15343350-15343503)
chr7 (104-193)||(12204074-12204164)
chr7 (1-38)||(11984032-11984069)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (1-273)||(2872131-2872404)
chr6 (1-273)||(16574569-16574842)
chr6 (1-273)||(16620538-16620811)
chr6 (1-273)||(24293111-24293384)
chr6 (1-273)||(29589768-29590041)
chr6 (3-273)||(27559300-27559571)
chr6 (1-274)||(28312308-28312582)
chr6 (1-274)||(27190114-27190388)
chr6 (1-274)||(27258852-27259126)
chr6 (1-274)||(28260526-28260800)
chr6 (1-274)||(28285116-28285390)
chr6 (1-274)||(28339275-28339549)
chr6 (1-273)||(25115231-25115504)
chr6 (3-273)||(16924971-16925242)
chr6 (1-279)||(5836557-5836836)
chr6 (3-273)||(19867366-19867637)
chr6 (3-273)||(22436548-22436819)
chr6 (29-273)||(18405301-18405546)
chr6 (18-279)||(23081096-23081358)
chr6 (167-273)||(22827851-22827957)
chr6 (14-273)||(18182709-18182969)
chr6 (14-254)||(23085167-23085408)
chr6 (7-270)||(30678359-30678623)
chr6 (7-270)||(10466183-10466447)
chr6 (7-270)||(19455705-19455969)
chr6 (29-270)||(34642943-34643185)
chr6 (7-270)||(18797372-18797636)
chr6 (7-160)||(19437795-19437948)
chr6 (1-86)||(22829715-22829800)
chr6 (7-160)||(15462129-15462282)
chr6 (7-145)||(19465976-19466114)
chr6 (7-159)||(21474394-21474546)
chr6 (100-270)||(21567419-21567590)
chr6 (7-269)||(24367083-24367346)
chr6 (7-193)||(25770603-25770790)
chr6 (179-273)||(20135653-20135747)
chr6 (179-273)||(22197122-22197216)
chr6 (7-160)||(19486629-19486782)
chr6 (99-144)||(14377343-14377388)
chr6 (103-160)||(20010885-20010942)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (1-273)||(22330253-22330526)
chr5 (1-273)||(14997105-14997378)
chr5 (1-273)||(29473439-29473712)
chr5 (1-273)||(37288862-37289135)
chr5 (1-273)||(19772707-19772980)
chr5 (1-273)||(27682766-27683039)
chr5 (1-273)||(16359249-16359522)
chr5 (1-273)||(22350666-22350939)
chr5 (1-273)||(27521153-27521426)
chr5 (1-273)||(34569241-34569514)
chr5 (1-273)||(27613103-27613376)
chr5 (1-273)||(27665856-27666129)
chr5 (1-273)||(40711527-40711800)
chr5 (1-273)||(41773589-41773862)
chr5 (1-273)||(18781861-18782134)
chr5 (1-273)||(21882521-21882794)
chr5 (1-273)||(22137415-22137688)
chr5 (2-273)||(20803344-20803616)
chr5 (45-273)||(21342824-21343053)
chr5 (3-273)||(25429168-25429439)
chr5 (18-273)||(26736110-26736366)
chr5 (5-165)||(23460827-23460987)
chr5 (18-273)||(23473942-23474198)
chr5 (1-120)||(23525952-23526071)
chr5 (84-273)||(21336743-21336933)
chr5 (14-160)||(21631778-21631924)
chr5 (7-270)||(23078277-23078541)
chr5 (7-267)||(14884363-14884624)
chr5 (7-270)||(20824185-20824449)
chr5 (167-240)||(23525867-23525940)
chr5 (117-269)||(20311601-20311754)
chr5 (7-270)||(22505411-22505675)
chr5 (7-270)||(20778645-20778909)
chr5 (7-270)||(23563540-23563804)
chr5 (105-270)||(17266804-17266970)
chr5 (36-264)||(21409890-21410119)
chr5 (7-243)||(21983549-21983786)
chr5 (7-267)||(25850807-25851068)
chr5 (99-273)||(22464679-22464854)
chr5 (7-145)||(20345140-20345278)
chr5 (14-270)||(28892321-28892578)
chr5 (7-193)||(21561397-21561584)
chr5 (18-64)||(21332369-21332415)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-273)||(23958562-23958835)
chr4 (1-273)||(8050547-8050820)
chr4 (1-273)||(14300903-14301176)
chr4 (1-273)||(19634951-19635224)
chr4 (1-273)||(27714151-27714424)
chr4 (1-273)||(12479415-12479688)
chr4 (1-273)||(16233916-16234189)
chr4 (1-273)||(40475855-40476128)
chr4 (1-273)||(18224370-18224643)
chr4 (1-273)||(19775717-19775990)
chr4 (1-273)||(8389227-8389500)
chr4 (1-273)||(17092073-17092346)
chr4 (1-273)||(16250774-16251047)
chr4 (1-273)||(14683382-14683655)
chr4 (3-247)||(16350480-16350725)
chr4 (3-273)||(15144818-15145088)
chr4 (1-273)||(14162285-14162558)
chr4 (14-273)||(14696916-14697176)
chr4 (18-273)||(15976-16232)
chr4 (1-154)||(13513285-13513438)
chr4 (84-273)||(14188321-14188511)
chr4 (7-270)||(29450727-29450991)
chr4 (7-270)||(3261984-3262248)
chr4 (135-273)||(16219045-16219184)
chr4 (135-273)||(16222365-16222504)
chr4 (7-270)||(51603982-51604246)
chr4 (7-269)||(44659056-44659319)
chr4 (7-270)||(15073177-15073441)
chr4 (7-160)||(53750660-53750813)
chr4 (7-160)||(16154711-16154864)
chr4 (7-270)||(27903203-27903467)
chr4 (7-160)||(20892960-20893113)
chr4 (7-160)||(16150565-16150718)
chr4 (7-270)||(11204422-11204686)
chr4 (1-55)||(18604743-18604797)
chr4 (99-160)||(14993649-14993710)
chr4 (99-270)||(15354322-15354494)
chr4 (7-64)||(7357292-7357349)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-273)||(15713479-15713752)
chr3 (1-273)||(10008034-10008307)
chr3 (1-273)||(10908644-10908917)
chr3 (1-273)||(15345668-15345941)
chr3 (1-273)||(12889143-12889416)
chr3 (1-273)||(13255124-13255397)
chr3 (1-273)||(26790836-26791109)
chr3 (1-274)||(15586815-15587089)
chr3 (1-273)||(43165109-43165382)
chr3 (1-273)||(48427881-48428154)
chr3 (1-274)||(16754124-16754398)
chr3 (1-269)||(15358521-15358790)
chr3 (1-273)||(15399940-15400213)
chr3 (1-273)||(16638207-16638480)
chr3 (1-273)||(20059477-20059750)
chr3 (3-273)||(16804372-16804643)
chr3 (1-274)||(6603169-6603442)
chr3 (1-274)||(53382441-53382715)
chr3 (1-273)||(3688377-3688650)
chr3 (1-273)||(5422353-5422626)
chr3 (1-273)||(15065505-15065778)
chr3 (1-273)||(24185624-24185897)
chr3 (3-270)||(14873993-14874261)
chr3 (1-273)||(16694598-16694871)
chr3 (18-273)||(15262064-15262320)
chr3 (5-273)||(14578835-14579104)
chr3 (18-273)||(12843543-12843799)
chr3 (84-273)||(17492285-17492475)
chr3 (7-270)||(47126391-47126655)
chr3 (7-270)||(10408415-10408679)
chr3 (7-270)||(13944471-13944735)
chr3 (7-267)||(28756769-28757030)
chr3 (198-273)||(26190937-26191012)
chr3 (104-193)||(15013284-15013374)
chr3 (7-270)||(8744808-8745072)
chr3 (7-270)||(10417463-10417727)
chr3 (9-270)||(12272785-12273047)
chr3 (7-220)||(17188871-17189085)
chr3 (7-267)||(24189754-24190015)
chr3 (7-270)||(17494093-17494358)
chr3 (1-86)||(23079440-23079525)
chr3 (7-270)||(12509901-12510165)
chr3 (99-267)||(14575436-14575605)
chr3 (99-270)||(11958691-11958863)
chr3 (7-270)||(12180791-12181055)
chr3 (99-198)||(12858005-12858105)
chr3 (99-270)||(14291042-14291214)
chr3 (99-270)||(16378444-16378616)
chr3 (7-160)||(16327127-16327280)
chr3 (7-156)||(11949343-11949492)
chr3 (14-270)||(16825706-16825963)
chr3 (7-270)||(16831946-16832210)
chr3 (7-160)||(31692603-31692756)
chr3 (7-160)||(31941461-31941614)
chr3 (99-270)||(12358037-12358209)
chr3 (7-141)||(13317952-13318086)
chr3 (3-49)||(11861033-11861079)
chr3 (7-160)||(15230161-15230314)
chr3 (7-160)||(15236029-15236182)
chr3 (99-160)||(18131856-18131917)
chr3 (173-270)||(13318087-13318184)
[»] chr2 (37 HSPs)
chr2 (1-273)||(27373715-27373988)
chr2 (1-273)||(10871296-10871569)
chr2 (1-273)||(24712480-24712753)
chr2 (1-273)||(27220462-27220735)
chr2 (1-273)||(9338028-9338301)
chr2 (1-273)||(9486662-9486935)
chr2 (1-273)||(11351435-11351708)
chr2 (1-273)||(16983686-16983959)
chr2 (1-273)||(17001446-17001719)
chr2 (1-273)||(22323066-22323339)
chr2 (1-273)||(24264816-24265089)
chr2 (1-273)||(44383294-44383567)
chr2 (1-273)||(24874474-24874747)
chr2 (1-273)||(21142765-21143038)
chr2 (1-273)||(24657382-24657655)
chr2 (1-273)||(45673736-45674009)
chr2 (3-264)||(21322992-21323254)
chr2 (3-273)||(24705208-24705479)
chr2 (1-273)||(24677933-24678206)
chr2 (3-273)||(23029187-23029458)
chr2 (1-273)||(23204760-23205033)
chr2 (3-273)||(23074309-23074580)
chr2 (1-273)||(23105452-23105725)
chr2 (97-273)||(41606207-41606382)
chr2 (3-165)||(22742692-22742854)
chr2 (3-273)||(22733500-22733771)
chr2 (14-269)||(24817577-24817833)
chr2 (3-160)||(23064973-23065130)
chr2 (7-270)||(19716747-19717011)
chr2 (97-270)||(12576802-12576976)
chr2 (7-270)||(23113172-23113436)
chr2 (29-258)||(30208672-30208902)
chr2 (7-270)||(23097748-23098012)
chr2 (7-241)||(20848067-20848302)
chr2 (36-264)||(19817302-19817531)
chr2 (7-270)||(23274042-23274306)
chr2 (1-55)||(23676583-23676637)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-273)||(33388285-33388558)
chr1 (3-273)||(17042273-17042544)
chr1 (1-273)||(16347851-16348124)
chr1 (1-273)||(21833132-21833405)
chr1 (1-273)||(51330748-51331021)
chr1 (1-274)||(19109197-19109471)
chr1 (1-274)||(41350924-41351198)
chr1 (3-264)||(20081634-20081896)
chr1 (1-273)||(24785113-24785386)
chr1 (1-249)||(21842066-21842315)
chr1 (3-193)||(22496514-22496705)
chr1 (14-273)||(16378924-16379184)
chr1 (1-136)||(21228812-21228947)
chr1 (194-273)||(21233181-21233260)
chr1 (18-160)||(21751991-21752133)
chr1 (7-267)||(31537259-31537520)
chr1 (7-270)||(38910088-38910352)
chr1 (7-270)||(52988605-52988869)
chr1 (7-270)||(20297245-20297509)
chr1 (7-270)||(48425737-48426001)
chr1 (7-270)||(24096877-24097141)
chr1 (7-269)||(37679914-37680177)
chr1 (172-273)||(429585-429686)
chr1 (7-270)||(21739298-21739562)
chr1 (7-160)||(20074971-20075124)
chr1 (206-273)||(22502751-22502818)
chr1 (99-270)||(12200382-12200554)
chr1 (99-270)||(22016099-22016271)
chr1 (99-160)||(21742906-21742967)
chr1 (172-273)||(21751767-21751868)
chr1 (99-242)||(19857166-19857310)
chr1 (99-270)||(20854114-20854286)
chr1 (3-64)||(22401632-22401693)
chr1 (99-270)||(20833254-20833426)
chr1 (99-160)||(18710360-18710421)
chr1 (3-42)||(22435991-22436030)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-273)||(3268-3541)
scaffold0044 (3-273)||(17004-17275)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (1-273)||(22117802-22118075)
chr8 (1-273)||(18859458-18859731)
chr8 (1-273)||(22126586-22126859)
chr8 (1-273)||(30310771-30311044)
chr8 (1-273)||(32603026-32603299)
chr8 (1-273)||(17671649-17671922)
chr8 (1-273)||(20015890-20016163)
chr8 (1-273)||(19115281-19115554)
chr8 (1-273)||(22129244-22129517)
chr8 (3-273)||(22030984-22031255)
chr8 (3-273)||(19980848-19981119)
chr8 (1-274)||(19481699-19481973)
chr8 (1-273)||(22042708-22042981)
chr8 (1-273)||(15536264-15536537)
chr8 (3-273)||(21164167-21164438)
chr8 (1-273)||(21391488-21391761)
chr8 (1-273)||(21780814-21781087)
chr8 (1-257)||(21253842-21254099)
chr8 (18-273)||(22523427-22523683)
chr8 (18-273)||(21785999-21786255)
chr8 (18-273)||(22989926-22990182)
chr8 (29-273)||(22421547-22421792)
chr8 (14-273)||(22375094-22375353)
chr8 (44-273)||(22246103-22246333)
chr8 (44-226)||(22245685-22245868)
chr8 (7-270)||(16268857-16269121)
chr8 (7-270)||(28983795-28984059)
chr8 (7-270)||(28989014-28989278)
chr8 (7-193)||(31414165-31414352)
chr8 (7-160)||(21928423-21928576)
chr8 (7-270)||(22053747-22054011)
chr8 (7-270)||(22027913-22028177)
chr8 (99-193)||(19985141-19985236)
chr8 (29-267)||(27357423-27357662)
chr8 (7-193)||(29301059-29301246)
chr8 (99-160)||(22373864-22373925)
chr8 (110-163)||(20391078-20391131)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-273)||(10212-10485)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (3-273)||(36342-36613)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (3-273)||(17255-17526)
scaffold0017 (3-258)||(195027-195283)
scaffold0017 (45-269)||(24154-24379)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (1-273)||(22091-22364)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (3-273)||(1221-1492)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (1-273)||(14268-14541)
scaffold0010 (18-273)||(4759-5015)
scaffold0010 (7-270)||(39526-39790)
scaffold0010 (99-270)||(44712-44884)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (3-273)||(29117-29388)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-273)||(40999-41272)
scaffold0109 (1-273)||(13311-13584)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (1-273)||(10425-10698)
scaffold0080 (1-273)||(31727-32000)
scaffold0080 (1-273)||(13080-13353)
scaffold0080 (1-273)||(37193-37466)
scaffold0080 (1-273)||(54481-54754)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (1-273)||(11313-11586)
scaffold0028 (1-273)||(17781-18054)
scaffold0028 (122-273)||(53571-53723)
scaffold0028 (1-126)||(54996-55121)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (3-279)||(10347-10624)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-273)||(8102-8375)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (3-273)||(37009-37280)
scaffold0042 (14-270)||(26199-26456)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (1-269)||(667-936)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (3-257)||(1-256)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (3-265)||(50534-50797)
scaffold0102 (7-270)||(42545-42809)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (3-273)||(11545-11816)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (3-273)||(21448-21719)
scaffold0081 (3-273)||(36872-37143)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (3-273)||(34904-35174)
scaffold0022 (18-273)||(41476-41732)
scaffold0022 (18-273)||(75196-75452)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (1-249)||(7966-8217)
scaffold0130 (104-193)||(4179-4269)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (18-273)||(18494-18750)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (1-212)||(7141-7353)
[»] scaffold0993 (2 HSPs)
scaffold0993 (3-273)||(826-1097)
scaffold0993 (221-273)||(726-778)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (1-273)||(2450-2723)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (3-273)||(13928-14199)
scaffold0120 (18-93)||(11289-11364)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-273)||(11067-11340)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (18-273)||(10630-10886)
scaffold0476 (7-270)||(738-1002)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (1-273)||(24899-25172)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (18-273)||(23737-23993)
scaffold0011 (7-270)||(151414-151678)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (1-165)||(956-1120)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (18-273)||(8067-8323)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (3-272)||(567-837)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (18-273)||(4278-4534)
scaffold0621 (18-134)||(1-117)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (3-177)||(30763-30938)
scaffold0023 (84-273)||(151925-152115)
scaffold0023 (7-230)||(47176-47399)
scaffold0023 (215-273)||(1907-1965)
scaffold0023 (7-160)||(164594-164747)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-160)||(424266-424425)
scaffold0003 (7-160)||(203339-203492)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (18-258)||(57818-58059)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (18-273)||(55674-55930)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (18-273)||(495864-496120)
scaffold0001 (14-263)||(441507-441757)
scaffold0001 (7-268)||(514546-514808)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-273)||(8794-9064)
scaffold0358 (206-273)||(17990-18057)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (29-273)||(6717-6962)
scaffold0270 (29-273)||(13847-14092)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (14-273)||(13679-13939)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (31-273)||(14483-14726)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (7-273)||(111100-111367)
scaffold0040 (14-279)||(17716-17982)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (3-157)||(1-155)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (29-273)||(104071-104316)
[»] scaffold0324 (2 HSPs)
scaffold0324 (18-241)||(1865-2089)
scaffold0324 (172-273)||(12573-12674)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (18-273)||(24149-24405)
scaffold0243 (7-270)||(9965-10229)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (103-273)||(12507-12678)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (1-273)||(40694-40965)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (97-273)||(3445-3622)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (14-269)||(5961-6217)
scaffold0074 (101-270)||(14970-15140)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-198)||(8329-8527)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (18-273)||(4427-4683)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (3-264)||(17538-17799)
scaffold0114 (99-270)||(39905-40077)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (29-273)||(216635-216880)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (14-269)||(9551-9807)
scaffold0018 (14-270)||(23498-23755)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (3-129)||(15768-15894)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (14-270)||(15179-15436)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (103-273)||(15266-15437)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-132)||(48651-48782)
scaffold0007 (117-193)||(83824-83901)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-156)||(14873-15028)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (29-270)||(4935-5177)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (3-121)||(2861-2979)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (18-191)||(7943-8117)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (198-273)||(15379-15454)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (7-270)||(11656-11920)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (7-270)||(5042-5306)
scaffold0348 (99-160)||(17769-17830)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (18-148)||(3521-3651)
scaffold0278 (144-283)||(1286-1426)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (6-193)||(1923-2111)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (7-270)||(308-572)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (99-270)||(53708-53880)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (99-270)||(1168-1340)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (7-270)||(251469-251733)
scaffold0009 (1-55)||(230039-230093)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (172-273)||(864-965)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (7-267)||(41585-41846)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (7-267)||(94087-94348)
scaffold0029 (99-270)||(115409-115581)
[»] scaffold1530 (1 HSPs)
scaffold1530 (7-270)||(430-694)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (7-270)||(1504-1768)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (7-266)||(48-308)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (7-270)||(7591-7855)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (7-270)||(60586-60850)
scaffold0046 (7-145)||(70081-70219)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (7-193)||(29451-29638)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (7-193)||(11884-12071)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (104-241)||(21475-21613)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (29-158)||(41323-41452)
scaffold0035 (99-230)||(5692-5824)
scaffold0035 (181-270)||(5598-5687)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (7-270)||(5338-5602)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (99-270)||(772-944)
scaffold0222 (7-270)||(20661-20925)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (99-270)||(25959-26131)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (99-270)||(3455-3627)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (218-273)||(8146-8201)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (7-193)||(12651-12838)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (7-160)||(67301-67454)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (7-193)||(1465-1652)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (7-270)||(967-1231)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (7-193)||(28478-28665)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-270)||(29781-30045)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (7-270)||(29471-29735)
scaffold0067 (99-270)||(49465-49637)
scaffold0067 (99-270)||(58499-58671)
scaffold0067 (99-270)||(64887-65059)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (99-270)||(63804-63976)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (99-270)||(65583-65755)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (7-270)||(98776-99040)
scaffold0020 (14-193)||(175912-176092)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (7-270)||(325554-325818)
scaffold0004 (7-243)||(200661-200898)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (7-158)||(1681-1832)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (7-193)||(43612-43799)
scaffold0104 (118-158)||(25176-25216)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (99-165)||(4589-4655)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (8-160)||(6451-6603)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (7-160)||(1047-1200)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (7-270)||(263073-263337)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (99-230)||(1100-1232)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (99-270)||(2718-2890)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (7-270)||(8461-8725)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (84-160)||(5560-5636)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (7-270)||(49952-50216)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (7-270)||(110457-110721)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (7-193)||(4282-4469)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (7-160)||(6996-7149)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (99-160)||(8747-8808)
scaffold0235 (99-160)||(18961-19022)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (220-273)||(673-726)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (99-160)||(21809-21870)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (7-160)||(2145-2298)
scaffold0034 (99-270)||(70219-70391)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (7-270)||(5028-5292)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (99-242)||(36814-36958)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (99-270)||(21969-22141)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (29-160)||(20743-20874)
scaffold0261 (103-160)||(12637-12694)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (104-193)||(11754-11844)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (7-160)||(9979-10132)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (7-160)||(5402-5555)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (99-160)||(54005-54066)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (99-270)||(119-291)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (99-193)||(30611-30706)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (1-48)||(171188-171235)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (6-160)||(9419-9573)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (99-160)||(49162-49223)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (215-273)||(6489-6547)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (99-160)||(10935-10996)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8710682 - 8710409
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8710682 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 8710583  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8710582 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 8710483  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8710482 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 8710409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18587364 - 18587638
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18587364 gctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 18587463  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18587464 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 18587563  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18587564 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 18587638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13689118 - 13688845
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13689118 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtc 13689019  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689018 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 13688919  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13688918 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 13688845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 11234406 - 11234679
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  11234406 gctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttc 11234505  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11234506 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 11234605  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11234606 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 11234679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14335473 - 14335200
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14335473 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 14335374  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335373 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 14335274  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14335273 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 14335200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15158250 - 15158523
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15158250 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 15158349  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158350 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15158449  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15158450 ttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 15158523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 44788544 - 44788817
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  44788544 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatc 44788643  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788644 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 44788743  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44788744 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 44788817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 17703650 - 17703921
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17703650 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 17703749  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17703750 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 17703849  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17703850 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagaatacaa 17703921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18180820 - 18180547
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||    
T  18180820 gctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatc 18180721  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180720 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 18180621  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18180620 tttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 18180547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 11550295 - 11550568
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11550295 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtc 11550394  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  11550395 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 11550494  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11550495 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaa 11550568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14957631 - 14957358
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14957631 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 14957532  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14957531 tgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 14957432  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14957431 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaattggttggagtacaa 14957358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9591441 - 9591172
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9591441 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtc 9591342  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9591341 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgat 9591242  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9591241 tttgaaatggatttagtt----tacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaa 9591172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 52 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8201074 - 8200852
Alignment:
Q  52 attgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 151  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8201074 attgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgac 8200975  T
Q  152 tacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctg 250  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8200974 tacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttg 8200875  T
Q  251 ggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  8200874 ggtatgaactggttagagtacaa 8200852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12690578 - 12690306
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12690578 gctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 12690480  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12690479 tgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 12690380  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12690379 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaa 12690306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873494
Alignment:
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttga 10873563  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10873562 aatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 10873494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 15146118 - 15146389
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| |||||| |    
T  15146118 tatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcgg 15146217  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  15146218 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgttcgaaatgtcctttatctatgtttgatcttgattt 15146317  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||||||||||||    
T  15146318 tgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatagttggtatgaactggttagagtacaa 15146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14042755 - 14042529
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |  ||  |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||    
T  14042755 cctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagaga 14042656  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || || ||    
T  14042655 tggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggt 14042556  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgt 243  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||    
T  14042555 ttgtttaccttttagtggtatggatgt 14042529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14352785 - 14352559
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |  ||  |||||||||| | ||||  |||| ||||||||||    
T  14352785 cctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtcaaatataaatggagaga 14352686  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || || ||    
T  14352685 tggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgtgtgttcaagatgtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgacttggt 14352586  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgt 243  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||    
T  14352585 ttgtttaccttttagtggtatggatgt 14352559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 111
Target Start/End: Original strand, 16726636 - 16726744
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16726636 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 16726735  T
Q  103 atatgaatg 111  Q
    |||||||||    
T  16726736 atatgaatg 16726744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13024409 - 13024153
Alignment:
Q  15 actccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggag 114  Q
    ||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||  ||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||    
T  13024409 actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggag 13024310  T
Q  115 agatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggattt 213  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||     | || ||    
T  13024309 aaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccgttgtctatgtttggtagggattttttggtcgactt 13024210  T
Q  214 agtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    ||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13024209 agtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 13024153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 18051130 - 18051394
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| |||||||||    
T  18051130 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgattgtgtctgata 18051228  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | ||||| ||    
T  18051229 tgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 18051328  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | | |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  18051329 agtagatttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 18051394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 16947649 - 16947913
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  16947649 ttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 16947748  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | || || | |    
T  16947749 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgta 16947848  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||  | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16947849 gtcgacttagtttgcttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 16947913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 21755484 - 21755220
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  21755484 ttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 21755385  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    | | || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | |||  |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  21755384 ggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgaggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtg 21755285  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  21755284 gttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaattggttagagta 21755220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 26091975 - 26092239
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  26091975 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 26092074  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  26092075 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 26092174  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  26092175 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 26092239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15627573 - 15627331
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||||| ||||   ||||||||  || |||||| |||||    
T  15627573 tattattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcctatgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaa 15627474  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || | | | |  ||| ||||| | ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| | | ||    
T  15627473 actccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtctaaggtgttctttgccgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgcatt 15627374  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  15627373 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagta 15627331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 26115767 - 26116030
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  26115767 ttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 26115866  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  26115867 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 26115966  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  26115967 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 26116030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 40924994 - 40925255
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  40924994 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatat 40925093  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | || ||||||||| | ||||| |      
T  40925094 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtg 40925193  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  40925194 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 40925255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12459700 - 12459436
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  12459700 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 12459601  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| || |||||||||||| | || || |      
T  12459600 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttatctatgtttggtagagactttgtg 12459501  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  12459500 gttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 12459436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 49155373 - 49155109
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  49155373 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatat 49155274  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | |||||||||||| | ||||| |      
T  49155273 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagagattttgtg 49155174  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || ||||| ||||| || || ||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  49155173 attgatttggtttgcctgccgttgacgggtatggatgttatttttggtatgaattggttagagta 49155109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19149991 - 19149819
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  19149991 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 19149892  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19149891 actttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 19149819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20749390 - 20749218
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20749390 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 20749291  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| |  || |||| ||| | |||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  20749290 actttgaagtcaatctagtatgtttgcctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 20749218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 11385606 - 11385870
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||| | | |||||    
T  11385606 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattgtatttgata 11385704  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  11385705 tgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 11385804  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  11385805 ggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 11385870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13676523 - 13676259
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  13676523 ttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 13676424  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  13676423 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 13676324  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  13676323 gtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 13676259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 14261515 - 14261686
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14261515 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 14261614  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | ||| |||| ||||| || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  14261615 aatt-gaagtcgatctagtatgtctgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 14261686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 15099780 - 15100044
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  15099780 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatat 15099879  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||  ||||||||||||||| | || || |||    
T  15099880 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaa 15099979  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||    
T  15099980 gtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactagttagagta 15100044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Original strand, 13965845 - 13965983
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  13965845 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 13965944  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 145  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13965945 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 13965983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Original strand, 14149856 - 14149902
Alignment:
Q  227 ttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14149856 ttgaacggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 14149902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 14140659 - 14140598
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14140659 tctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 14140598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 14283643 - 14283815
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  14283643 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 14283742  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  14283743 attttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 14283815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 12798678 - 12798831
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  12798678 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 12798777  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| ||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  12798778 gaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctct 12798831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15343503 - 15343350
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  15343503 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 15343405  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  15343404 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtaaagtaactacttctct 15343350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Original strand, 12204074 - 12204164
Alignment:
Q  104 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  12204074 tatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 12204164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 11984069 - 11984032
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgat 38  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11984069 gctatattaataatactcctttagttgctattattgat 11984032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 2872131 - 2872404
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2872131 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 2872230  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872231 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 2872330  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2872331 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 2872404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16574842 - 16574569
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16574842 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 16574743  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574742 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16574643  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16574642 ttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 16574569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16620538 - 16620811
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16620538 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 16620637  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620638 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16620737  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16620738 ttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 16620811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24293111 - 24293384
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24293111 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 24293210  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293211 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24293310  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24293311 ttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 24293384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 29589768 - 29590041
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29589768 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 29589867  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589868 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 29589967  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29589968 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 29590041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 27559300 - 27559571
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27559300 tatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 27559399  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559400 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 27559499  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27559500 tgaaatggatttagtttgtctacttttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 27559571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28312582 - 28312308
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28312582 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 28312483  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgta-tcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312482 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 28312383  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  28312382 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaat 28312308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27190388 - 27190114
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27190388 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtc 27190289  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27190288 agatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgat 27190189  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27190188 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 27190114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 27258852 - 27259126
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||| |||||    
T  27258852 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgagttgtc 27258951  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27258952 agatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgat 27259051  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27259052 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 27259126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 28260526 - 28260800
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28260526 gctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 28260625  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260626 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 28260725  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28260726 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaat 28260800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 28285390 - 28285116
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28285390 gctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 28285291  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285290 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 28285191  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28285190 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaat 28285116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 28339275 - 28339549
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28339275 gctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 28339374  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339375 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 28339474  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28339475 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttaaagtacaat 28339549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25115504 - 25115231
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25115504 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtc 25115405  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115404 tgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 25115305  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25115304 tttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 25115231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 16924971 - 16925242
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16924971 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 16925070  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16925071 atatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttttctatgtttggtcgtgattt 16925170  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || || || |||||||||||||||||||||||    
T  16925171 tgaaatggatttagtttgtttgcctttgagtggtatggacgtcatccttggtatgaattggttagagtacaa 16925242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 5836557 - 5836836
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5836557 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtc 5836656  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5836657 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactaccactctagtatgtttgaaatgtcctttttctatgtttggtcgtgat 5836756  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatgatgt 279  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  5836757 tttgaaatggatttagtttgtctccctttgagcggtatggatgttattcttggtaggaattggttagagtacaatcatgt 5836836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19867637 - 19867366
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||| | |||||     
T  19867637 tatattgataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtctt 19867538  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19867537 atatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 19867438  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19867437 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 19867366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22436819 - 22436548
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22436819 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 22436720  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22436719 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgttctttgtctatgtttggtcgtgattt 22436620  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || ||| | |||||  | |||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22436619 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatgggcgtcattcttggtatgaattggttagagtacaa 22436548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 18405301 - 18405546
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || || |||| | |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18405301 tattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 18405400  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  18405401 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcccttgtctatgtttgattgtgattttgaaattaatttggtttgtctgcctt 18405500  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18405501 tgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 18405546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23081358 - 23081096
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||| ||| | ||||  |||| ||||||||||    
T  23081358 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagaga 23081259  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || || ||    
T  23081258 tggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattatgaaattgacttggt 23081159  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatgatgt 279  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23081158 ttgtttacctttgattggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgt 23081096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Original strand, 22827851 - 22827957
Alignment:
Q  167 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttag 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22827851 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattgcttag 22827950  T
Q  267 agtacaa 273  Q
    |||||||    
T  22827951 agtacaa 22827957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 18182709 - 18182969
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||   |||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  18182709 tactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatgga 18182808  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||     
T  18182809 gagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcatttgtctatgcttggtcgagattttgaaattgata 18182908  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
       ||||| |||||||| | || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18182909 cgttttgtttacctttgtgtggaatggatgtaatccttggtatgaattggttagagtacaa 18182969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 254
Target Start/End: Original strand, 23085167 - 23085408
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   | || | || |||||  |||||||||  | ||||   ||||||||||    
T  23085167 tactcctttagtttctattattgaaactggtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatgga 23085266  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  23085267 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgaaattgatt 23085366  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggta 254  Q
    | |||||| | |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  23085367 tggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggta 23085408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 30678359 - 30678623
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||    || |||| |||||  |||||||||| | ||||   |||    
T  30678359 ttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcatgtat 30678458  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    | |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | | |||| ||| | ||||| ||||||||||| || || |||    
T  30678459 ggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctgaagtgttcgttgtcgatgtttggtcgagactttgaa 30678558  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||| ||| | |||||||| || |||||||| || || |||||||||||||| |||||    
T  30678559 gttgatttagtctgttttcctttgagtggaatggatgtaatacttggtatgaattggttggagta 30678623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 10466183 - 10466447
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  10466183 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 10466282  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||  || |||||||||||| | || || |      
T  10466283 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtctgttatctatgtttggtagggactttgtg 10466382  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||    
T  10466383 gttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggataaattggttagagta 10466447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 19455969 - 19455705
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  19455969 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 19455870  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||| | ||||||||||||||| | || || |||    
T  19455869 gaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaa 19455770  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  19455769 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 19455705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 270
Target Start/End: Original strand, 34642943 - 34643185
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatggagagatggttgtcga 127  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || || |||| || ||   ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  34642943 tattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttga 34643041  T
Q  128 aactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacct 226  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| | ||  |||||||  |||||    
T  34643042 aactccggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtagggattttgaagtagacctagtttgcttacct 34643141  T
Q  227 ttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    ||||  || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  34643142 ttgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagta 34643185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18797636 - 18797372
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||| |||||| | ||||| |    
T  18797636 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgaca 18797538  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| || |  ||||  | |||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  18797537 tgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgaggtttcctatatctatgtttggtagggattttga 18797438  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||| ||| ||||  |||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  18797437 ggtagacttagtgtgtttaccgctgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 18797372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19437948 - 19437795
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  ||| |||| | | | ||||||||    
T  19437948 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtatctgatat 19437849  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19437848 gaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19437795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 22829715 - 22829800
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttg 86  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  22829715 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgcgttattgctttcgattgtgtttctgctttg 22829800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15462282 - 15462129
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||| | |||||||    
T  15462282 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgata 15462184  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15462183 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 15462129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19466114 - 19465976
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  19466114 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 19466015  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 145  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19466014 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 19465976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21474546 - 21474394
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  21474546 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 21474447  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctc 159  Q
    |||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  21474446 gaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 21474394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 270
Target Start/End: Original strand, 21567419 - 21567590
Alignment:
Q  100 ctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 198  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||    
T  21567419 ctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagaga 21567518  T
Q  199 tttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    ||| |   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | |||||||||    
T  21567519 ttttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgtcatttttggaatgaactagttagagta 21567590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24367346 - 24367083
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | |   |||||||  ||| | ||||||||    
T  24367346 ttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatctgatat 24367247  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||| ||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | ||||| |||||| | ||||| |      
T  24367246 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatctttggtagagattttgtg 24367147  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    || |||||||||||||| || || |  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  24367146 attgatttagtttgtctgccgttcacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 24367083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25770790 - 25770603
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| |||| || |||||  |||||||| ||||   | || |||| || ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  25770790 ttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtctggttatgtctgatat 25770691  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25770690 gaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 25770603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20135747 - 20135653
Alignment:
Q  179 ttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||| | | ||||||||||||    
T  20135747 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaa 20135653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 273
Target Start/End: Original strand, 22197122 - 22197216
Alignment:
Q  179 ttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||| | | ||||||||||||    
T  22197122 ttgtctatgtttggccgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatggactagttagagtacaa 22197216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 19486629 - 19486782
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| |   ||||   |||    
T  19486629 ttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggtcatgtcaagtat 19486728  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    || | |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  19486729 gagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctct 19486782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 144
Target Start/End: Original strand, 14377343 - 14377388
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 144  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14377343 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtt 14377388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 20010885 - 20010942
Alignment:
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20010885 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 20010942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22330253 - 22330526
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22330253 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 22330352  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330353 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22330452  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22330453 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 22330526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 14997105 - 14997378
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14997105 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 14997204  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997205 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 14997304  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14997305 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 14997378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 29473439 - 29473712
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29473439 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 29473538  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473539 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 29473638  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29473639 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 29473712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 37288862 - 37289135
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37288862 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttc 37288961  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37288962 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctttgtttggtcgtgat 37289061  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37289062 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 37289135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19772980 - 19772707
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19772980 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 19772881  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772880 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 19772781  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19772780 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatcctgggtatgaactggttagagtacaa 19772707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 27682766 - 27683039
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27682766 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtt 27682865  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682866 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27682965  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27682966 ttcgaaatggatttagtgtgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactgtttagagtacaa 27683039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16359522 - 16359249
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16359522 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 16359423  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359422 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16359323  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16359322 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 16359249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22350939 - 22350666
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350939 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 22350840  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22350839 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgat 22350740  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22350739 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 22350666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27521426 - 27521153
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  27521426 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtc 27521327  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521326 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27521227  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27521226 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 27521153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 34569514 - 34569241
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34569514 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 34569415  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569414 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 34569315  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  34569314 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 34569241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27613376 - 27613103
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27613376 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 27613277  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27613276 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27613177  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27613176 tttgaaatggatttagtttgtctacccttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 27613103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 27665856 - 27666129
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27665856 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 27665955  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665956 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27666055  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27666056 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 27666129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40711800 - 40711527
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  40711800 gctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 40711701  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711700 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 40711601  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  40711600 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 40711527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41773862 - 41773589
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41773862 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 41773763  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41773762 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtactttgtctatgtttggtcgcgat 41773663  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41773662 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 41773589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18782134 - 18781861
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18782134 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 18782035  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782034 tgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 18781935  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781934 tttgaaatggattaagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 18781861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21882794 - 21882521
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  21882794 gctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgctatgtc 21882695  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21882694 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 21882595  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21882594 tttgagatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaa 21882521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22137688 - 22137415
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22137688 gctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 22137589  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22137588 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgat 22137489  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22137488 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 22137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20803616 - 20803344
Alignment:
Q  2 ctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtct 101  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20803616 ctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtct 20803517  T
Q  102 gatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803516 gatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatt 20803417  T
Q  201 tcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20803416 ttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaagtggttagagtacaa 20803344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 45 - 273
Target Start/End: Original strand, 21342824 - 21343053
Alignment:
Q  45 gctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 144  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342824 gctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 21342923  T
Q  145 cggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  21342924 cggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtataccattgaacggtatggatgt 21343023  T
Q  244 gattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21343024 gattctgggtatgaattggttagagtacaa 21343053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25429439 - 25429168
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || | || | |||  |||||||||| | ||| ||    
T  25429439 tatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgggtcttgttatgtttg 25429340  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25429339 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattt 25429240  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25429239 tgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 25429168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 26736110 - 26736366
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  26736110 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 26736209  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  26736210 tggttgtcgaaactccaactaagggtttggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgatttggt 26736309  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  26736310 ttgtttacctttgagtggtatggatgtgatccttggaatgaactggttagagtacaa 26736366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23460987 - 23460827
Alignment:
Q  5 tattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgat 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460987 tattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgat 23460888  T
Q  105 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23460887 atgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 23460827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23474198 - 23473942
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  | || |||  |||||  |||||||| | | || |  |||||||||||||||    
T  23474198 cctttagttgctattattgataccggtgctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagaga 23474099  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  23474098 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtattaaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggt 23473999  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||||||||    
T  23473998 ttgtttacctttgagtggaatggacgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 23473942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23526071 - 23525952
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  23526071 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtc 23525972  T
Q  101 tgatatgaatggagagatgg 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23525971 tgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Original strand, 21336743 - 21336933
Alignment:
Q  84 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 182  Q
    |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || | || || ||||| |||||    
T  21336743 ttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggtttggtgactacttctcgtgtgtgtttaagatgtcttttgt 21336842  T
Q  183 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| || || | |||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  21336843 ctatgtttggtcgcgattttgaaattgacttggattgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 21336933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 160
Target Start/End: Original strand, 21631778 - 21631924
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||     
T  21631778 tactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggg 21631877  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631878 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 23078277 - 23078541
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  23078277 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 23078376  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | || || | |    
T  23078377 gaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgta 23078476  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| || ||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  23078477 gttgatctaatttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 23078541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 14884363 - 14884624
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| ||||||||||    
T  14884363 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtctgatat 14884462  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  14884463 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 14884562  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  14884563 attgatttagtttgtcttccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 14884624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20824449 - 20824185
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||| | |||||||    
T  20824449 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtct-gattatatctgata 20824351  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  20824350 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcga 20824251  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  20824250 ggtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20824185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23525940 - 23525867
Alignment:
Q  167 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23525940 ttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgga 23525867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 20311754 - 20311601
Alignment:
Q  117 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttag 215  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| | | |||| ||||    
T  20311754 atggttgtcgaaaccccaactaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgcagtggacttag 20311655  T
Q  216 tttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    | ||| |  | ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  20311654 tctgtttgtcgttgagtggtatggatgtgatactaggtatgaactggttggagt 20311601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22505675 - 22505411
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||| ||||    
T  22505675 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatat 22505576  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||  | | ||||| |      
T  22505575 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttcatagagattttgtg 22505476  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     |||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  22505475 gtggatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagta 22505411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20778909 - 20778645
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||  | ||  ||||| ||   | | ||||||||    
T  20778909 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatat 20778810  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||     
T  20778809 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgag 20778710  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  20778709 gtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20778645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 23563540 - 23563804
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  23563540 ttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctgatat 23563639  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||| | ||||||||||||||| | || || |||    
T  23563640 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaa 23563739  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  23563740 gtcgacttagtttgtttaccattgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 23563804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 270
Target Start/End: Original strand, 17266804 - 17266970
Alignment:
Q  105 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcg 203  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | ||||| |    
T  17266804 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttg 17266903  T
Q  204 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  17266904 aagtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 17266970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21410119 - 21409890
Alignment:
Q  36 gatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 135  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||    || |||||||| |  |||||||||| | ||||   ||| ||||| || |||||||||||||| || |    
T  21410119 gatactggtgctacatattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctattaatggggaaatggttgtcgaaaccccgg 21410020  T
Q  136 ctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgg 234  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| | | |||| ||||| ||| | || ||||  ||    
T  21410019 ctaaggcttcggtgactagttctctagtatgcttgaagtgtcctttgttgatgtttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgactgg 21409920  T
Q  235 tatggatgtgattctgggtatgaattggtt 264  Q
     |||||||| || || |||||||| |||||    
T  21409919 gatggatgtaatactaggtatgaactggtt 21409890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 21983549 - 21983786
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||   |||    
T  21983549 ttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtat 21983648  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||| |||    
T  21983649 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtttatgtttggtagagattttgaa 21983748  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 243  Q
     | ||| |||| ||| | || ||||  |||||||||||    
T  21983749 gttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgt 21983786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25851068 - 25850807
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  25851068 ttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 25850969  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  25850968 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 25850869  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    || |||||||||||||| || ||||  |||||| |||| ||| | || ||||||||||||||    
T  25850868 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatgaatgttatttttggaatgaattggttaga 25850807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22464854 - 22464679
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  22464854 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 22464755  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  22464754 attttgaggtcgacttagtatgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagtacaa 22464679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 20345278 - 20345140
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  20345278 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 20345179  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 145  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20345178 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 20345140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 28892321 - 28892578
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatatgaatgg 112  Q
    |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||| | ||||||||||| ||    
T  28892321 tactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgatatgaaagg 28892419  T
Q  113 agagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggat 211  Q
    ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| | ||     
T  28892420 agaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaagtcgac 28892519  T
Q  212 ttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  28892520 ttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgtcatcttcgggatgaattggttagagta 28892578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 21561397 - 21561584
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | || ||||  | ||  || ||| | | | ||||   |||    
T  21561397 ttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttatgtcaagtat 21561496  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  21561497 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 21561584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 64
Target Start/End: Original strand, 21332369 - 21332415
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgc 64  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21332369 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgc 21332415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23958835 - 23958562
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23958835 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 23958736  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958735 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 23958636  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23958635 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 23958562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 8050547 - 8050820
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8050547 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 8050646  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8050647 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgat 8050746  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8050747 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 8050820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 14300903 - 14301176
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14300903 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 14301002  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14301003 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatatttggtcgtgat 14301102  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14301103 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 14301176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19635224 - 19634951
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19635224 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 19635125  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19635124 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgttcggtcgtgat 19635025  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19635024 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 19634951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27714424 - 27714151
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27714424 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 27714325  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27714324 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgat 27714225  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27714224 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 27714151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12479688 - 12479415
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12479688 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 12479589  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479588 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 12479489  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12479488 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 12479415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16233916 - 16234189
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16233916 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 16234015  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234016 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16234115  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16234116 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 16234189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 40476128 - 40475855
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40476128 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 40476029  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476028 tgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 40475929  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40475928 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 40475855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 18224370 - 18224643
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18224370 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 18224469  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224470 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 18224569  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18224570 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgttattttgggtatgaattggttagagtacaa 18224643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 19775717 - 19775990
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19775717 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 19775816  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775817 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 19775916  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19775917 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 19775990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8389500 - 8389227
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8389500 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 8389401  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389400 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttcactcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 8389301  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  8389300 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggaatgaactggttagagtacaa 8389227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17092073 - 17092346
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  17092073 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtc 17092172  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092173 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 17092272  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17092273 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 17092346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16250774 - 16251047
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16250774 gctatattaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtc 16250873  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16250874 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16250973  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16250974 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtataaattggttagagtacaa 16251047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14683655 - 14683382
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14683655 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 14683556  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  14683555 tgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 14683456  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14683455 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcagtatggatgtgattctgggaatgaattggttggagtacaa 14683382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Original strand, 16350480 - 16350725
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16350480 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcgg 16350579  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16350580 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtctggtcgtgattt 16350679  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 247  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350680 cgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgatt 16350725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 15144818 - 15145088
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  15144818 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 15144917  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144918 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 15145017  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||    
T  15145018 tgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaa 15145088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14162558 - 14162285
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||  | || |||| |||||  |||| ||||| | ||||    
T  14162558 gctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtc 14162459  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | || ||  |||||||||||||||| || |||||||    
T  14162458 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcctttgtctatgtatgatcgtgat 14162359  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14162358 tttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 14162285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14697176 - 14696916
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  14697176 tactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 14697077  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  14697076 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgcttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatt 14696977  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  14696976 tagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 14696916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 15976 - 16232
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  | || |||| | |||  |||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  15976 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagaga 16075  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||    
T  16076 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggt 16175  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||    
T  16176 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaa 16232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13513438 - 13513285
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13513438 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgggtcttgatttgtc 13513339  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513338 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14188511 - 14188321
Alignment:
Q  84 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgt 182  Q
    |||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  14188511 ttgggtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgt 14188412  T
Q  183 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14188411 ctttgtttgatcgtgattttgaaatggatttagtttgtttacctttgagtggaatgaatgtgattcttggtatgaactggttagagtacaa 14188321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 29450727 - 29450991
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  29450727 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 29450826  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  29450827 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 29450926  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29450927 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 29450991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 3261984 - 3262248
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  3261984 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 3262083  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  3262084 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 3262183  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  3262184 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 3262248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16219184 - 16219045
Alignment:
Q  135 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcg 233  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  16219184 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16219085  T
Q  234 gtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  16219084 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 16219045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16222504 - 16222365
Alignment:
Q  135 gctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcg 233  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |    
T  16222504 gctaagggttcaataactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttggtttgtttacctttgagtg 16222405  T
Q  234 gtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  16222404 gaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 16222365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 51603982 - 51604246
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || |||| || ||   ||||| |||||| |||||||||    
T  51603982 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgata 51604080  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | ||||| ||    
T  51604081 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 51604180  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  51604181 agtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 51604246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Original strand, 44659056 - 44659319
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  44659056 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 44659155  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  44659156 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 44659255  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  44659256 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 44659319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15073441 - 15073177
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||    ||  |||| ||| | | | ||||||||    
T  15073441 ttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctctggttatatctgatat 15073342  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgt-atcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||||||||||||||||||| | || || |||    
T  15073341 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtcagtttgagttgtcctttgtctatgtttggtagagactttgaa 15073242  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| | || ||||| || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  15073241 gttgatcttgtatgtctgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagta 15073177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 53750660 - 53750813
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || |||| || ||   ||||| |||||| |||||||||    
T  53750660 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgata 53750758  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53750759 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 53750813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16154864 - 16154711
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||| | | | ||||||||||    
T  16154864 ttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtgtctgatat 16154765  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16154764 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27903467 - 27903203
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||| | |||||||    
T  27903467 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtct-gattatatctgata 27903369  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||    
T  27903368 tgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttga 27903269  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  27903268 ggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgaatgttattttagggatgaattggttagagta 27903203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 20893113 - 20892960
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  20893113 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 20893015  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20893014 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20892960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16150718 - 16150565
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  16150718 ttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtttctgatat 16150619  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16150618 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 16150565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 11204422 - 11204686
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  || ||| | ||| | |||| |||    
T  11204422 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgtatctggtat 11204521  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   ||||||   |||||||||||| | ||||| |      
T  11204522 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctaaatctatgtttggtagagattttgtg 11204621  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  11204622 gttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 11204686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 18604743 - 18604797
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattg 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  18604743 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 14993649 - 14993710
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  14993649 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctct 14993710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 15354322 - 15354494
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || | | | | |||||  ||||||||||||||| | |    
T  15354322 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagag 15354421  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | ||  || | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||||    
T  15354422 actttaaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactgattagagta 15354494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 7357349 - 7357292
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgc 64  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7357349 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgc 7357292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15713479 - 15713752
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15713479 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 15713578  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713579 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15713678  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15713679 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 15713752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10008307 - 10008034
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10008307 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 10008208  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10008207 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgcgat 10008108  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10008107 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 10008034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10908917 - 10908644
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10908917 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 10908818  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10908817 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtcat 10908718  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  10908717 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 10908644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15345668 - 15345941
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15345668 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 15345767  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345768 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15345867  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15345868 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtaaggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 15345941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12889416 - 12889143
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12889416 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 12889317  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889316 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 12889217  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12889216 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 12889143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13255397 - 13255124
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13255397 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 13255298  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255297 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 13255198  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13255197 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 13255124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 26790836 - 26791109
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26790836 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtc 26790935  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790936 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 26791035  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26791036 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 26791109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 15586815 - 15587089
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15586815 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 15586914  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586915 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15587014  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15587015 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgaatggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 15587089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43165382 - 43165109
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43165382 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 43165283  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165282 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 43165183  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  43165182 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 43165109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 48428154 - 48427881
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  48428154 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 48428055  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428054 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 48427955  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  48427954 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 48427881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 16754124 - 16754398
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16754124 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 16754223  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16754224 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctctgtctatgtttggtcgtgat 16754323  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16754324 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 16754398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15358790 - 15358521
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15358790 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 15358691  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358690 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15358591  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15358590 tttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactagttagagt 15358521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 15399940 - 15400213
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15399940 gctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 15400039  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400040 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15400139  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15400140 tttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaactggttagagtacaa 15400213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16638480 - 16638207
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16638480 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 16638381  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638380 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16638281  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16638280 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 16638207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 20059477 - 20059750
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  20059477 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 20059576  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059577 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 20059676  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20059677 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 20059750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 16804372 - 16804643
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16804372 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttg 16804471  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16804472 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgcttgcgatgtcttctgtctatgtttggtcgtgattt 16804571  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804572 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 16804643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 6603442 - 6603169
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6603442 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 6603343  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603342 tgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 6603243  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6603242 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt-gagtacaat 6603169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 53382441 - 53382715
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53382441 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 53382540  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382541 tgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 53382640  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  53382641 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttggagtacaat 53382715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3688650 - 3688377
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3688650 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 3688551  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688550 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 3688451  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  3688450 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttacagtacaa 3688377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 5422353 - 5422626
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  5422353 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtc 5422452  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5422453 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcttttgtctatgtttggtcgtgat 5422552  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  5422553 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 5422626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15065778 - 15065505
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  15065778 gctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtc 15065679  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15065678 tgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtttgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 15065579  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15065578 tttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaa 15065505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24185897 - 24185624
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185897 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 24185798  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24185797 tgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgcgttgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24185698  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24185697 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaa 24185624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 14873993 - 14874261
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  14873993 tatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtcta 14874092  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  14874093 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaaagttctttgtctatgtttggtcgtgattt 14874192  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14874193 tgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgtatgtgattctgggtatgaactggttcgagta 14874261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16694871 - 16694598
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16694871 gctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgggtcttgatttgtc 16694772  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16694771 tgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16694672  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16694671 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatttaattatgggtatgaattggttagagtacaa 16694598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15262320 - 15262064
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  15262320 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 15262221  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  15262220 tggttgtcgaaactccagctaatggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggt 15262121  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || || ||| |||| ||||||||||||||    
T  15262120 ttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtgtgaactggttagagtacaa 15262064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 273
Target Start/End: Original strand, 14578835 - 14579104
Alignment:
Q  5 tattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgat 104  Q
    |||| ||||||| |||| ||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||    ||||  ||    
T  14578835 tattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaat 14578934  T
Q  105 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14578935 atgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtaactacttctatagtatgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttg 14579034  T
Q  204 aaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14579035 aaattgatttggtttgtttgcctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaa 14579104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 12843543 - 12843799
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||| ||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  12843543 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 12843642  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || || ||    
T  12843643 tgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtttatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggt 12843742  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12843743 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaa 12843799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17492475 - 17492285
Alignment:
Q  84 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 182  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | || || |||||| ||||    
T  17492475 ttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcccttgt 17492376  T
Q  183 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17492375 ttatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 17492285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 47126655 - 47126391
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  47126655 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatat 47126556  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| | |    
T  47126555 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgta 47126456  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47126455 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 47126391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 10408679 - 10408415
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  10408679 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 10408580  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  10408579 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtgtgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 10408480  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10408479 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 10408415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13944735 - 13944471
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || |||| || ||   ||||| |||||| |||||||||    
T  13944735 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactgggt-ttgattgtgtctgata 13944637  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | ||||| ||    
T  13944636 tggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 13944537  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  13944536 agtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 13944471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28757030 - 28756769
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  28757030 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 28756931  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaaa-tgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | |  |   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  28756930 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctacggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 28756831  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  28756830 attgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 28756769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 26190937 - 26191012
Alignment:
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26190937 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaa 26191012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Original strand, 15013284 - 15013374
Alignment:
Q  104 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15013284 tatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 15013374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 8744808 - 8745072
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| |||||||||    
T  8744808 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgggt-ttgattgtgtctgata 8744906  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | ||||| ||    
T  8744907 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtagagattttga 8745006  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | | || ||||||||| | ||  |||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  8745007 agtagacttagtttgtttgccgctgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 8745072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 10417463 - 10417727
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || || | ||||||||||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||| | |||||||    
T  10417463 ttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtct-gattgtatctgata 10417561  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  10417562 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtgactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagatttcga 10417661  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  10417662 ggtcgacttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 10417727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272785
Alignment:
Q  9 aataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatga 108  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   | |||| ||  | ||  |||||||| | | | ||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  109 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaat 207  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || ||| |    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaagt 12272848  T
Q  208 ggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     ||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  12272847 cgatctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 12272785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17189085 - 17188871
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || || | |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  17189085 ttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggt-ttgattgtatctgata 17188987  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  17188986 tggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 17188887  T
Q  205 aatggatttagtttgt 220  Q
    | | || |||||||||    
T  17188886 agtagacttagtttgt 17188871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24190015 - 24189754
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  24190015 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattgggt-ttgattgtatctgata 24189917  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  24189916 tgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 24189817  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
      | || ||||||| | ||||  |||  || |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  24189816 ggtagacttagtttttttaccgctgacgggaatggatgttatttttggaatgaattggttaga 24189754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17494358 - 17494093
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  17494358 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtatctgatat 17494259  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaa-ctccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | || || ||    
T  17494258 gaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttga 17494159  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | | || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  17494158 agtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatgtatgttatttttgggatgaactggttagagta 17494093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Original strand, 23079440 - 23079525
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttg 86  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  23079440 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttg 23079525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 12509901 - 12510165
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  12509901 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 12510000  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||  ||| |  || |||||||| || |  |||   |||| | | |||||||||||| | ||||| |      
T  12510001 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgtttggggtgtcttatatctatgtttggtagagattttgtg 12510100  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  12510101 gttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagagta 12510165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14575605 - 14575436
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14575605 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 14575506  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    | || ||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||    
T  14575505 actttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttggaatgaactggttaga 14575436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 11958691 - 11958863
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | |    
T  11958691 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagag 11958790  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || |   | |||||||||||| |  | |||   ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  11958791 actttgtggttgatttagtttgtttgtcgttgtcgggtatggatgttattttcggtatgaattggttagagta 11958863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12181055 - 12180791
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  ||||||||   | | ||| ||||    
T  12181055 ttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtatctaatat 12180956  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |  || |||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  12180955 gaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtccaagatgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 12180856  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||| | |||| ||||  ||||||| ||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  12180855 gtcgacttagtttctttaccgttgacgggtatggttgttatctttgggatgaactggttagagta 12180791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 198
Target Start/End: Original strand, 12858005 - 12858105
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| |||    
T  12858005 tctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagtg 12858104  T
Q  198 a 198  Q
    |    
T  12858105 a 12858105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 14291042 - 14291214
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  14291042 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 14291141  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | ||| | || ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  14291142 actttgaagtcgatcttgtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 14291214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 16378444 - 16378616
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| | |    
T  16378444 tctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgaggtgtccaatatctatgtttggtagag 16378543  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16378544 attttgaggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 16378616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 16327127 - 16327280
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  16327127 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 16327225  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  16327226 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 16327280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 11949343 - 11949492
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  11949343 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtctggttgtatctgatat 11949442  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 156  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11949443 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 11949492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 16825706 - 16825963
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||||| |||    
T  16825706 tactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaagga 16825805  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||  ||||| | || || ||| | |||     
T  16825806 taaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctataattggtagagactttgaagtcgatc 16825905  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | |||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  16825906 ttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 16825963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 16831946 - 16832210
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  16831946 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 16832044  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  16832045 tgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 16832144  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || |||||||||||||||||    
T  16832145 ggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagta 16832210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 31692603 - 31692756
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  | |||||| | | | ||||||||    
T  31692603 ttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgtatctgatat 31692702  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  31692703 gaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctct 31692756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31941614 - 31941461
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  31941614 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 31941515  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||    
T  31941514 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctct 31941461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 12358037 - 12358209
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  12358037 tctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 12358136  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | || ||||||||| || | ||||  ||||||||||| ||| | |  ||||| |||||||||||    
T  12358137 actttgaagtcgacttagtttgtttagcgttgacgggtatggatgttatttttgcgatgaactggttagagta 12358209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 13317952 - 13318086
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  ||||| ||||||| | |||||||    
T  13317952 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg-cttgattgtatctgata 13318050  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagg 141  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  13318051 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 11861079 - 11861033
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctac 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11861079 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15230314 - 15230161
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  | || | ||  | ||  |||||||| | | ||||   |||    
T  15230314 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtat 15230215  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15230214 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 15230161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15236182 - 15236029
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  | || | ||  | ||  |||||||| | | ||||   |||    
T  15236182 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgtcaagtat 15236083  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  15236082 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 15236029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 18131856 - 18131917
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18131856 tctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 18131917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 270
Target Start/End: Original strand, 13318087 - 13318184
Alignment:
Q  173 tgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||  | ||| | || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  13318087 tgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaggttgatcttgtatgtctaccgttgatgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 13318184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 37)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27373988 - 27373715
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27373988 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 27373889  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373888 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27373789  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27373788 ttcgaaatggatttagtttgcctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 27373715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10871569 - 10871296
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10871569 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 10871470  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10871469 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcgtttgtctatgtttggtcgtgat 10871370  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10871369 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 10871296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24712753 - 24712480
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24712753 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 24712654  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712653 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24712554  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24712553 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 24712480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 27220735 - 27220462
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27220735 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 27220636  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220635 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 27220536  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27220535 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 27220462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9338301 - 9338028
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9338301 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 9338202  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338201 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 9338102  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9338101 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 9338028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9486935 - 9486662
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9486935 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 9486836  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486835 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 9486736  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  9486735 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 9486662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 11351435 - 11351708
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  11351435 gctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtc 11351534  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351535 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 11351634  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351635 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 11351708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16983959 - 16983686
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16983959 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 16983860  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983859 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16983760  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16983759 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 16983686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17001719 - 17001446
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  17001719 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatc 17001620  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001619 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 17001520  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17001519 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 17001446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22323066 - 22323339
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22323066 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 22323165  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323166 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22323265  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  22323266 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttaggtatgaactggttagagtacaa 22323339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24265089 - 24264816
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24265089 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 24264990  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24264989 tgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtttatgtttggtcgtgat 24264890  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24264889 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 24264816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 44383294 - 44383567
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44383294 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtc 44383393  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383394 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 44383493  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  44383494 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 44383567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24874474 - 24874747
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24874474 gctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 24874573  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24874574 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttcggtgactacttctctcgtatgtttcaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24874673  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24874674 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 24874747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21142765 - 21143038
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21142765 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtc 21142864  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21142865 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 21142964  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21142965 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaactggttagagtacaa 21143038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24657382 - 24657655
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24657382 gctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttggatcttgatttgtc 24657481  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24657482 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24657581  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  24657582 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttgatatgaattgggtagagtacaa 24657655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 45673736 - 45674009
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  45673736 gctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgattgtgattctgctttgggtcttgttttgtc 45673835  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45673836 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcttttgtctatgtttggtcgtgat 45673935  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45673936 tttgaaatgaatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 45674009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 21322992 - 21323254
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21322992 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 21323091  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323092 atatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 21323191  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 264  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21323192 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaattggtt 21323254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 24705208 - 24705479
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24705208 tatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 24705307  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24705308 atatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtaactacttctctcgtatgtttgagatgccctttgtctatgtttggtcgtgattt 24705407  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24705408 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtattaatatgattcttggtatgaattggttagagtacaa 24705479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24678206 - 24677933
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  24678206 gctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgctaggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtc 24678107  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24678106 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24678007  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24678006 tttgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 24677933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 23029187 - 23029458
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  23029187 tatattaataatactcccttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctg 23029286  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23029287 atatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 23029386  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23029387 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 23029458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23205033 - 23204760
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||  || |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23205033 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgggtcttgatgtgtc 23204934  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23204933 tgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgctcgcgatgtcctttgtctatggatggtcgtgat 23204834  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204833 tttgtaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 23204760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 23074580 - 23074309
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| |  ||  |||||||||| | ||||||    
T  23074580 tatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctg 23074481  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23074480 atatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcttgattt 23074381  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23074380 tgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaattggttagagtacaa 23074309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 23105452 - 23105725
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| | |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  23105452 gctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 23105551  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23105552 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgat 23105651  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  23105652 tttgagatggatttagtttgtctacctttgatcggtatggatgtgtttctgggtatgaactggttggaatacaa 23105725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Original strand, 41606207 - 41606382
Alignment:
Q  97 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41606207 tgtctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctt-gtctatgtttggtcg 41606304  T
Q  196 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41606305 tgatttcgaaatggatttagtttgtctatctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 41606382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 165
Target Start/End: Original strand, 22742692 - 22742854
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  22742692 tatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 22742791  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22742792 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 22742854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 22733500 - 22733771
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||| |||||||| || || |||| | |||  ||||||||||   ||||||    
T  22733500 tatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctg 22733599  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22733600 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtataagatgtcccttgtctatgtttgatcgtgattt 22733699  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
      | || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  22733700 tcagattgatttggtttgtctagctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgacctggttagagtacaa 22733771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 24817577 - 24817833
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||    ||||  |||||||||||    
T  24817577 tactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatgga 24817676  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||    
T  24817677 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatt 24817776  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    | |||||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24817777 tggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagt 24817833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 3 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23065130 - 23064973
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| |  ||  |||||||||| | ||||||    
T  23065130 tatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgggtcttgctatgtctg 23065031  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23065030 atatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 19716747 - 19717011
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | | | | |||||| |    
T  19716747 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgattt 19716846  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  19716847 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgaa 19716946  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  19716947 gtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 19717011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12576976 - 12576802
Alignment:
Q  97 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcg 195  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||  |||||  | |||||||||||| |    
T  12576976 tgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttgcttgaggtgtccaatttctatgtttggtag 12576877  T
Q  196 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     ||||| ||| | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  12576876 agattttgaagtagacttagtgtgtttaccgttgacggggatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 12576802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23113436 - 23113172
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||   |||    
T  23113436 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataaattgggtctggttatgtcaagtat 23113337  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    || |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||    
T  23113336 gagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagattttgaa 23113237  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  23113236 gttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatctttgggatgaactggttagagta 23113172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 30208672 - 30208902
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    || |||||||| |  |||||||||| | ||||   |||||| || || ||||||||||||    
T  30208672 tattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcgtctatgaaaggggaaatggttgtcgaa 30208771  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    || || || |||||||||||||||| || ||| || | ||| || ||||||||||| ||||||| | | ||||| | | |||| ||||| ||| | || |    
T  30208772 accccggcaaagggttcggtgactaattttctagtgtgcttaaagtgtcctttgtcgatgtttgatagagattttgcagtggacttagtctgtttgccat 30208871  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 258  Q
    |||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  30208872 tgagtgggatggatgtgatactaggtatgaa 30208902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 23097748 - 23098012
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||||| | | |  |||| ||    
T  23097748 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggttgtaactgacat 23097847  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  23097848 gaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 23097947  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| ||| |||||||    
T  23097948 gtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggtatggatgtcatttttggaatgaactgggtagagta 23098012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20848302 - 20848067
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  20848302 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 20848203  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  20848202 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 20848103  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggat 241  Q
    || |||||||||||||| || ||||  |||||||||    
T  20848102 attgatttagtttgtctgccgttgatgggtatggat 20848067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19817531 - 19817302
Alignment:
Q  36 gatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccag 135  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||    || |||||||| |  || ||||||| | ||||   || ||||||  | ||||||||| |||  || |    
T  19817531 gatactggtgctacacattgctttattgctgcggattgtgtttcgaaattaggtcttgttatgtcatctacgaatgggcaaatggttgtcaaaaacccgg 19817432  T
Q  136 ctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||| || |||||| | ||||| | | |||| ||||| ||| | || ||||| ||    
T  19817431 ctaagggttcggtgactacttctctagtatgcttgaagtttcctttgtcgatatttggtagagattttgcagtggacttagtctgtttgccgttgagtgg 19817332  T
Q  235 tatggatgtgattctgggtatgaattggtt 264  Q
     ||||||||||| || |||||||| |||||    
T  19817331 gatggatgtgatactaggtatgaactggtt 19817302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 23274306 - 23274042
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || || | |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  23274306 ttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 23274207  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  23274206 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 23274107  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||| | |||||||||||    
T  23274106 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatggactggttagagta 23274042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 23676637 - 23676583
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattg 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  23676637 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 33388285 - 33388558
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33388285 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 33388384  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388385 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 33388484  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33388485 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 33388558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 17042273 - 17042544
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  17042273 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggccttgatttgtctg 17042372  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042373 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 17042472  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042473 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 17042544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 16347851 - 16348124
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16347851 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 16347950  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347951 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 16348050  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16348051 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 16348124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21833405 - 21833132
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21833405 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 21833306  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21833305 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtctgtttgaaatgtcctttatctatgtttggtcgtgat 21833206  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21833205 ttcaaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 21833132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 51330748 - 51331021
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  51330748 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 51330847  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330848 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 51330947  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  51330948 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 51331021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19109471 - 19109197
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |  || |||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  19109471 gctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtc 19109372  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19109371 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcatgat 19109272  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19109271 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 19109197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 41350924 - 41351198
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41350924 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 41351023  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41351024 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgat 41351123  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41351124 tttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 41351198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 20081634 - 20081896
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  20081634 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 20081733  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20081734 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 20081833  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 264  Q
     || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20081834 tgagatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggtt 20081896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24785113 - 24785386
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||    
T  24785113 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatc 24785212  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24785213 tgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 24785312  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24785313 tttgaaatggatctggtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattatgggtatgaattggttagagtacaa 24785386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21842315 - 21842066
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21842315 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtc 21842216  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21842215 tgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcatttgtctatgtttggtcgtgat 21842116  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 249  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21842115 tttgaaatggatttagtttgtctgcctttgagcggtatggatgtgattct 21842066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 193
Target Start/End: Original strand, 22496514 - 22496705
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  22496514 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctg 22496613  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22496614 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 22496705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16379184 - 16378924
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  ||||||| || | ||||  |||||||||||    
T  16379184 tactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatgga 16379085  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  16379084 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgagattgatt 16378985  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16378984 tggtttgtttacctttgagcggaatggatgtaatcctgggtatgaattggttagagtacaa 16378924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Original strand, 21228812 - 21228947
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21228812 gctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtc 21228911  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228912 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 273
Target Start/End: Original strand, 21233181 - 21233260
Alignment:
Q  194 cgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233181 cgtgattttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 21233260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21752133 - 21751991
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | ||||| ||||||||| |||||    
T  21752133 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatgaagaga 21752034  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21752033 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21751991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 31537259 - 31537520
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| ||||||||||    
T  31537259 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtgtctgatat 31537358  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  31537359 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 31537458  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  31537459 attgatttagtttgtctaccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 31537520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 38910088 - 38910352
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  38910088 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 38910187  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  38910188 gaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 38910287  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38910288 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 38910352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 52988869 - 52988605
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  52988869 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 52988770  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  52988769 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 52988670  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  52988669 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 52988605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20297509 - 20297245
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  20297509 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 20297410  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||   |||||| | | |||||||||| | ||||| |      
T  20297409 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatttatgtttggtagagattttgtg 20297310  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  20297309 gttgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatctttggaatgaattggttagagta 20297245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 48426001 - 48425737
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  48426001 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 48425902  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  48425901 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 48425802  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  48425801 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 48425737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 24096877 - 24097141
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||| ||||    
T  24096877 ttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctaatat 24096976  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | || || | |    
T  24096977 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgta 24097076  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||    
T  24097077 gtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttagaatgaattggttagagta 24097141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 37680177 - 37679914
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  37680177 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatat 37680078  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  37680077 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 37679978  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  37679977 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagt 37679914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 273
Target Start/End: Original strand, 429585 - 429686
Alignment:
Q  172 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 271  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  429585 atgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatac 429684  T
Q  272 aa 273  Q
    ||    
T  429685 aa 429686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 21739298 - 21739562
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  21739298 ttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcttgttttatctgatat 21739397  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  21739398 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagagactttgaa 21739497  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| |||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  21739498 gtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 21739562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 20074971 - 20075124
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  20074971 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 20075070  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20075071 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 20075124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Original strand, 22502751 - 22502818
Alignment:
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  22502751 atggatttagtttgtctacctttgagcggaatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 22502818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12200554 - 12200382
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | |||||||||||| | |    
T  12200554 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatctatgtttggtagag 12200455  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| |  || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12200454 attttgtgattgatttagtgtgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 12200382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 22016099 - 22016271
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  22016099 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 22016198  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | ||  |||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  22016199 actttgaagtcgacctagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 22016271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 21742906 - 21742967
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21742906 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctct 21742967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21751868 - 21751767
Alignment:
Q  172 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || || || | ||||||||||    
T  21751868 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatcaactcgttagagtac 21751769  T
Q  272 aa 273  Q
    ||    
T  21751768 aa 21751767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19857310 - 19857166
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  19857310 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgcctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 19857211  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 242  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  19857210 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgactggtatggatg 19857166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 20854114 - 20854286
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20854114 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20854213  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  20854214 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgttgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 20854286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22401693 - 22401632
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgc 64  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  22401693 tatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgc 22401632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 20833254 - 20833426
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  20833254 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 20833353  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  20833354 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 20833426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18710421 - 18710360
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18710421 tctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 18710360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 42
Target Start/End: Original strand, 22435991 - 22436030
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactg 42  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22435991 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 22436030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3541 - 3268
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3541 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtc 3442  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3441 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 3342  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3341 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 17275 - 17004
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17275 tatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 17176  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17175 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctctcgtatgtttaagatgccctttatctatgtttagtcgtgattt 17076  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17075 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 17004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22117802 - 22118075
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22117802 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 22117901  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117902 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22118001  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22118002 ttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 22118075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18859731 - 18859458
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18859731 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 18859632  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859631 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 18859532  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18859531 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggaagtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 18859458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22126586 - 22126859
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22126586 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 22126685  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126686 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgattacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22126785  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22126786 ttcgaaatggatttagtttgtctacctctgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 22126859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 30310771 - 30311044
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30310771 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 30310870  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310871 tgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 30310970  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310971 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 30311044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32603299 - 32603026
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32603299 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 32603200  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32603199 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggttgtgat 32603100  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603099 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 32603026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 17671649 - 17671922
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17671649 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 17671748  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671749 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 17671848  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17671849 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 17671922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 20015890 - 20016163
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20015890 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 20015989  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20015990 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 20016089  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20016090 tttgaaatgggtttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 20016163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19115554 - 19115281
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19115554 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 19115455  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115454 tgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 19115355  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19115354 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 19115281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 22129244 - 22129517
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22129244 gctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 22129343  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129344 tgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22129443  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22129444 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 22129517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22031255 - 22030984
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22031255 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 22031156  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22031155 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcatgattt 22031056  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22031055 cgaaatggatttagtttgtctacatttaagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaa 22030984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19981119 - 19980848
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  19981119 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 19981020  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981019 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 19980920  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19980919 tgagatggatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 19980848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 19481699 - 19481973
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19481699 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtc 19481798  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19481799 tgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgcttacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttagtcgtgat 19481898  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaat 274  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19481899 tttgaaatggatttagtttgcctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaat 19481973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22042981 - 22042708
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | || || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22042981 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttc 22042882  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042881 tgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22042782  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22042781 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgaacggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagaatacaa 22042708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15536537 - 15536264
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  15536537 gctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgggtcttgatttgtc 15536438  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttga-aatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15536437 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttacgttgtcctttgtctatatttggtcgtgat 15536338  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15536337 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatgaatgtgattttgggtacgaattggttagagtacaa 15536264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 21164167 - 21164438
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  21164167 tatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgctacgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctg 21164266  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21164267 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 21164366  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21164367 cgagatggacttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21164438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21391488 - 21391761
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  21391488 gctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 21391587  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21391588 tgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgat 21391687  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21391688 tttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21391761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 21780814 - 21781087
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  21780814 gctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 21780913  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21780914 tgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgat 21781013  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21781014 tttgagatggatttagtttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21781087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21254099 - 21253842
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  21254099 gctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 21254000  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21253999 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgat 21253900  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 257  Q
    || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  21253899 tttgagatggatttggtttgtctacctttgagtggtatgcatgtgattcttggtatga 21253842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22523683 - 22523427
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  22523683 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 22523584  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||    
T  22523583 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttttctatgtttggtcttgattttgaaattgatttggt 22523484  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  22523483 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 22523427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786255
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| |    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatggatttagt 21786198  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21786199 ttttctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 21786255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22990182 - 22989926
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  | || |||| ||| |  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  22990182 cctttagttgctattattgatactagtgctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 22990083  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||    
T  22990082 tggttgtcgaaactccagcgaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgtcccttgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgacttggt 22989983  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  22989982 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 22989926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 22421547 - 22421792
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22421547 tattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 22421646  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||    
T  22421647 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctt 22421746  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||| | ||||| ||||||    
T  22421747 tgagtggtatggatgtaattcttggcatgaactagttagtgtacaa 22421792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 22375094 - 22375353
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  22375094 tactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 22375193  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | || || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||    
T  22375194 gagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc-cgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtagagattttgaaattgatt 22375292  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  22375293 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 22375353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 273
Target Start/End: Original strand, 22246103 - 22246333
Alignment:
Q  44 tgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggt 143  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22246103 tgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggt 22246202  T
Q  144 tcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 242  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||||| |  |||||||    
T  22246203 tcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacctttgagtgaaatggatg 22246302  T
Q  243 tgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||    
T  22246303 taatccttggtatgaattggttagagtacaa 22246333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 226
Target Start/End: Original strand, 22245685 - 22245868
Alignment:
Q  44 tgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggt 143  Q
    |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22245685 tgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggt 22245784  T
Q  144 tcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacct 226  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||    
T  22245785 tcggtgactacttctcttgtgtgcttaatatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattaatttggtttgtttacct 22245868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 16268857 - 16269121
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  16268857 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatat 16268956  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  | | ||   |||||| | |||||||||||| | |||||||      
T  16268957 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagatttcgtg 16269056  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||||| || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  16269057 gttgatttagtttgtctgccgttgtcgggtatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 16269121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28984059 - 28983795
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  28984059 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatat 28983960  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  28983959 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 28983860  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28983859 attgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28983795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28989278 - 28989014
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  28989278 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatat 28989179  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  28989178 gaaaggagaaatggttgttgatactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 28989079  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  28989078 attgacttggtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 28989014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 31414165 - 31414352
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||    || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  31414165 ttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 31414264  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31414265 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggt 31414352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21928576 - 21928423
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  21928576 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatat 21928477  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21928476 gaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 21928423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22054011 - 22053747
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||||| |||| | |||||||    
T  22054011 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtct-gattgtatctgata 22053913  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | |||  ||||||   |||||||||||| | || || |     
T  22053912 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgaggtgtcctacatctatgtttggtagagactttgt 22053813  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  22053812 ggttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 22053747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 22027913 - 22028177
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||| | | ||| ||| ||||    
T  22027913 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttttatcttatat 22028012  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||     
T  22028013 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgag 22028112  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||| ||| | || ||||  |||||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  22028113 gtcgacttagtatgtttgccgttgacgggtatgaatgttatttttgggatgaattggttagagta 22028177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19985236 - 19985141
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  19985236 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 19985141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27357662 - 27357423
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  27357662 tattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 27357563  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |   | |||||||||||||| || |    
T  27357562 actccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtggttgatttagtttgtctgccgt 27357463  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    ||   ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  27357462 tgtcgggtatggatgttatttttggaatgaattggttaga 27357423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 29301059 - 29301246
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  ||||||||   | | ||||||||    
T  29301059 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatat 29301158  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | |||  ||||| |||||||||||||||    
T  29301159 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgagttgtccgttgtctatgtttggt 29301246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 22373925 - 22373864
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22373925 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 22373864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 20391131 - 20391078
Alignment:
Q  110 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgt 163  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20391131 tggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgt 20391078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10212
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10485 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 10386  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10385 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 10286  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10285 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 10212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 36613 - 36342
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36613 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 36514  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36513 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 36414  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36413 tgaaatggatctagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaa 36342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 17255 - 17526
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17255 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 17354  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17355 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattt 17454  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17455 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgatatggatgtgattcttggtatgaattggttagagtacaa 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 258
Target Start/End: Original strand, 195027 - 195283
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  195027 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 195126  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  195127 atatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggacgtgattt 195226  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 258  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  195227 cgagatggatttagtttctctacctttgagcggtgtggatgtgattctgggtatgaa 195283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24379 - 24154
Alignment:
Q  45 gctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtt 144  Q
    |||||||||||||||||||   | || |||||||| |  |||| ||||| | ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  24379 gctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatcttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggtt 24280  T
Q  145 cggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 243  Q
    | |||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| | | ||||  |||| ||| |  | ||||| || ||||||||    
T  24279 cagtgactacttctctagtatgcctgaagtgtcctttgtcgatgtttggtagagattttgtagtggacctagtctgtttgtcgttgagtgggatggatgt 24180  T
Q  244 gattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||    
T  24179 gatactaggtatgaactggttggagt 24154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22364 - 22091
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22364 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 22265  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 22165  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22164 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagtggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 22091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 1221 - 1492
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1221 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgggtcttgatttttctg 1320  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 1420  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1421 tgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttacagtacaa 1492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14541 - 14268
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  14541 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtc 14442  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgta-tcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14441 tggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatttttgcgatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 14342  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14341 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 14268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4759
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |||| |||||  |||||| ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  5015 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttctaagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagaga 4916  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || | || || ||||||||||||| |||||||||  || || ||||| || |||||    
T  4915 tggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtgtgtttaacatgtcctttgtctttgtttggtcaagagtttgaaattgacttagt 4816  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4815 ttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagtacaa 4759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 39526 - 39790
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  39526 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 39625  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  39626 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 39725  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  39726 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttagagta 39790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 44712 - 44884
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  44712 tctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 44811  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| | |||||||||    
T  44812 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactagttagagta 44884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29388
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29117 tatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttatctg 29216  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29217 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcgtgattt 29316  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29317 tgaaatggatttagtttgtctacatttgagcggtatggatgtgattctggatatgaattggttagagtacaa 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41272 - 40999
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| || || | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  41272 gctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtc 41173  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41172 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 41073  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  41072 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattttgggtatgaactggttagagtacaa 40999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13311 - 13584
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13311 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtc 13410  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| || ||| |||||||||||    
T  13411 tgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttatcaatggttggtcgtgat 13510  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13511 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcgttatggatgtgattttgggtatgaattggttagagtacaa 13584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 10425 - 10698
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10425 gctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 10524  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10525 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttaactatgtttggtcgtgat 10624  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10625 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaa 10698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 32000 - 31727
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||     
T  32000 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtt 31901  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31900 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 31801  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31800 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaa 31727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 13080 - 13353
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13080 gctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 13179  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||  |||||||||||||||||    
T  13180 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcgatgtcctttaactatgtttggtcgtgat 13279  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13280 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaa 13353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37466 - 37193
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||     
T  37466 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtt 37367  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37366 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctctcttatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 37267  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37266 tttgatatggatttagtttgtctacctttgagcggtttggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaa 37193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 54754 - 54481
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |  || |||| | |||  |||||||||    ||||    
T  54754 gctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttttcatgtc 54655  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  54654 taatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttttctatgtttgatcgtgat 54555  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  54554 tttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 54481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11586 - 11313
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  11586 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtc 11487  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11486 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 11387  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11386 tttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 11313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18054 - 17781
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18054 gctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtc 17955  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17954 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 17855  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17854 tttgaaatggatttggtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttagagtacaa 17781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 122 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 53723 - 53571
Alignment:
Q  122 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgt 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53723 tgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattttgaaatggatttggtttgt 53624  T
Q  221 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53623 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggagtacaa 53571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 55121 - 54996
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  55121 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtc 55022  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  55021 tgatatgaatggagagatggttgtcg 54996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 279
Target Start/End: Original strand, 10347 - 10624
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  || ||||||    
T  10347 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctacatatgtctg 10446  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10447 gtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 10546  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatgatgt 279  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10547 tgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtaattctgggtatgaattggttagagtacaatcatgt 10624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8375 - 8102
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  8375 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtc 8276  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  8275 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgcattgtccgttgtctatgtttggtcgtgat 8176  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8175 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttggagtacaa 8102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 37009 - 37280
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37009 tatattgatcatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctg 37108  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37109 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgatatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 37208  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  37209 caagatggacttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 37280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26456 - 26199
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| || ||||||||||   | || |||| |||||  |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  26456 tactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatgga 26357  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26356 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtcgagactttgaaattgatt 26257  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | |||||| | |||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  26256 tggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagta 26199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 667 - 936
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  667 gctatactaataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 766  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  767 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctctcgtatgatagaaatgtcctttatatatgtttggtcgtgat 866  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  867 tttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 256 - 1
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  256 tatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 157  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  156 atatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttggtcatgattt 57  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 257  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56 tgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Original strand, 50534 - 50797
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||| | ||||||    
T  50534 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggtcttgttatgtctg 50633  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50634 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcatatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 50733  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtta 265  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50734 tgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaactggtta 50797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 42809 - 42545
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||| | | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  42809 ttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 42710  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  42709 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 42610  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  42609 gtcgacttagtttgtttaccattgacaggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 42545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 11545 - 11816
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11545 tatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 11644  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11645 atatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactacttgtctcgtatgtttgagatgtcctttatctatgtttagtcgtgattt 11744  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11745 tgaaatgaatttagtttgtctacccttgagcggtatggatgtgattatgggtatgaattggttagagtacaa 11816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21719 - 21448
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  21719 tatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 21620  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21619 atttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgattt 21520  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  21519 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaa 21448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37143 - 36872
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  | |||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37143 tatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtgctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 37044  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37043 atttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttatctcgtatgtttgaaatttcctttgtctatgtttggtcgtgattt 36944  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||    
T  36943 cgagatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgcgtatgaactggttggaatacaa 36872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Original strand, 34904 - 35174
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  34904 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctg 35003  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35004 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 35103  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||    
T  35104 tgaaatggatttagtttgtctacctttaagcggtatggatgtga-tctgggtataaactggttggaatacaa 35174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41732 - 41476
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | |||   |||||||| ||||||    
T  41732 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagaga 41633  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  41632 tggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagt 41533  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||    
T  41532 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaa 41476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 75452 - 75196
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | |||   |||||||| ||||||    
T  75452 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtaaaatatgaatagagaga 75353  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  75352 tggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttagt 75253  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||    
T  75252 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttgatatgaatttgttagagtacaa 75196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Original strand, 7966 - 8217
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| || || || |||||| |||||||||||||||||||    
T  7966 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtc 8065  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctc--gtatctt-gaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| || |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8066 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctctctcgtatgtttgcgatgttctttgtctatgtttggtcgtg 8165  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8166 attttgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattct 8217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Original strand, 4179 - 4269
Alignment:
Q  104 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || | || || |||||  |||||||||||||||    
T  4179 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgtttaagatgtcaattgtctatgtttggt 4269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18750 - 18494
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18750 cctttagttgatattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagaga 18651  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||    
T  18650 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgattttgaaattgatttggt 18551  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  18550 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 18494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7353 - 7141
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  7353 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtc 7254  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  7253 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctgagattggtcgtgat 7154  T
Q  200 ttcgaaatggatt 212  Q
    || ||||||||||    
T  7153 tttgaaatggatt 7141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 1097 - 826
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1097 tatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctg 998  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  997 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctgtcgtatgcttaaagtgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 898  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || || || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  897 tgagattgaattggtttgtttacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 778 - 726
Alignment:
Q  221 ctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  778 ctacgtttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 2450 - 2723
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |  || |||| | |||  |||||||||| | ||||    
T  2450 gctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtc 2549  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2550 tgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgat 2649  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || || ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  2650 tttgagatagatttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 2723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14199 - 13928
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || || |||| | |||  |||||||||| | ||||||    
T  14199 tatataaatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctg 14100  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||| |||||||||| |||| |||||| ||    
T  14099 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtatgtttaagatgttctttgtctatttttgatcgtgactt 14000  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  13999 tgagattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11289
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttg 93  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| | |||  ||||||||||    
T  11364 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttg 11289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 134; Significance: 9e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 11067 - 11340
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  11067 gctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 11166  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  11167 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgat 11266  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  11267 tttgagatggatttggtttgtctacctttcagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 11340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10886 - 10630
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||   | || |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  10886 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 10787  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10786 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgagatgtccattgtctatgtttggtcgtgattttgaaattgatttagt 10687  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  10686 ttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 10630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 738 - 1002
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  738 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 836  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  837 tgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgtttgaggtgtcctctatctatgtttggtagggattttga 936  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || |||||||||||||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  937 ggtagacttagtttgtctaccgttgacgggaatggatgtcatttttgggatgaattggttagagta 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 24899 - 25172
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  || |||| | |||  |  |||||||   ||||    
T  24899 gctatattgacaatacgcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtc 24998  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | || || ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24999 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgtgtgtttaagatgtcctttatctatgtttgatcgtgat 25098  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  25099 tttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaactagttagagtacaa 25172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 23737 - 23993
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  23737 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 23836  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  23837 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggt 23936  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  23937 ttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 23993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 151678 - 151414
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | | | | ||| ||||    
T  151678 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatat 151579  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | ||  | |||    
T  151578 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagagacattgaa 151479  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||  ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  151478 gtcgacttagtttgtttacagttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 151414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 956 - 1120
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  956 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtc 1055  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 165  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1056 tgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 8323 - 8067
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||| | ||   | ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8323 cctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagaga 8224  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  |||| ||    
T  8223 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattcatttggt 8124  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8123 ttgtctaccgttgagtgctatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 8067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 272
Target Start/End: Original strand, 567 - 837
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||||    
T  567 tatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgggtcttgtcatgtctg 666  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || | || || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  667 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattt 766  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtaca 272  Q
     || || ||| | |||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  767 tgagattgatatggtttgtttacctttgggtggtatggatgtgattatgggtatgaactggttagagtaca 837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4534 - 4278
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  4534 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 4435  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||    
T  4434 tggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagatcgatttggt 4335  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||    
T  4334 ttgtttacctttgagtggtatgaatgtgattcttggcaaaaattggttagagtacaa 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 117 - 1
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  117 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 18  T
Q  118 tggttgtcgaaactcca 134  Q
    |||||||||||||||||    
T  17 tggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Original strand, 30763 - 30938
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  30763 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctg 30862  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcc 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30863 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcc 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 152115 - 151925
Alignment:
Q  84 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgt 182  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||    
T  152115 ttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgt 152016  T
Q  183 ctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||| ||||||||| || || ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  152015 ctatgtttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttaccttttagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 151925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 230
Target Start/End: Original strand, 47176 - 47399
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| ||| |||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||  | ||||| ||||    
T  47176 ttaatagtacacctttagttactattattgattctggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatat 47275  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || | || ||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  47276 gaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaaggtgtcttttgtctatgtttgatcgtgattttgaa 47374  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttga 230  Q
    || ||||| ||||||||||||||||    
T  47375 attgatttggtttgtctacctttga 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 1907 - 1965
Alignment:
Q  215 gtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  1907 gtttgtttccctttgagtggtatggatgtaatccagggtatgaattggttagagtacaa 1965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 164594 - 164747
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | |||||||     
T  164594 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttatatctgataa 164693  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  164694 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctct 164747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 424425 - 424266
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  424425 gctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtc 424326  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  424325 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 203492 - 203339
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  ||| || ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  203492 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggt-ttgattgtatctgata 203394  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  203393 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 203339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 18 - 258
Target Start/End: Original strand, 57818 - 58059
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || |||| |||||  || ||||||| | ||||  ||||||||||| |||    
T  57818 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaaga 57917  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  57918 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggt 58017  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaa 258  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  58018 ttgtttacctttgagcggaatggatgtgatccttggtatgaa 58059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 55674 - 55930
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||  | || |||| | |||  |||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  55674 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagaga 55773  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||    
T  55774 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgatttctaaattgatttggt 55873  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||    
T  55874 ttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttaaagtacaa 55930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 496120 - 495864
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  | || |||| ||| |  |||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  496120 cctttagttgctattattgatactagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 496021  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||    
T  496020 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtttttaagatgttctttgtctatgtttggtcgagatttttaaattgatttggt 495921  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  495920 ttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 495864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 441757 - 441507
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  441757 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatgga 441658  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||| | |||||  | || ||||    
T  441657 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagatttttagattgatt 441558  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggt 263  Q
    | |||||| | |||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  441557 tggtttgtttgccttagagtggaatggatgtaattcttggtatgaattggt 441507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 268
Target Start/End: Original strand, 514546 - 514808
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  514546 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 514645  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  514646 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 514745  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagag 268  Q
     | |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  514746 gttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttggaatgaattggttagag 514808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 9064 - 8794
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |   | |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  9064 gctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacacatt---ttattgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 8968  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| | |||||    
T  8967 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttcagtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgattgtgat 8868  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  8867 tttgagatggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 8794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18057 - 17990
Alignment:
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  18057 atggatttagtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaactggttggaatacaa 17990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6962 - 6717
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6962 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 6863  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||    
T  6862 actccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctt 6763  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  6762 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 6717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14092 - 13847
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14092 tattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaa 13993  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||| ||||||    
T  13992 actccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgacttggtttgtttacctt 13893  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  13892 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 13847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Original strand, 13679 - 13939
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||  | || |||| |||||  |||||||||| | ||||  |||||||||||    
T  13679 tactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatgga 13778  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |  || | |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  13779 gagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgtgtgattaagatgtccattgtctatgtttggtcgagattttaaaattgatt 13878  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  13879 tagtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 13939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 273
Target Start/End: Original strand, 14483 - 14726
Alignment:
Q  31 ttattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaac 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  | || |||| | |||  |||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14483 ttattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaac 14582  T
Q  131 tccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14583 tccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtatttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagattttgaaattgatttggtttgtttacctttg 14682  T
Q  230 agcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || ||||| || || || || ||||| ||||||||||||||    
T  14683 agtggaatggaagtaatccttggaatgaactggttagagtacaa 14726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 273
Target Start/End: Original strand, 111100 - 111367
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | ||||  ||||    
T  111100 ttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtcaaatat 111199  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || | || || ||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  111200 gaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgtgtgtttaagatgccctttgtttatgtttgatcgtgattttgaa 111299  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  111300 attgacttggtttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 111367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17982 - 17716
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||  ||||  |||||||||  | ||||  ||||||||||     
T  17982 tactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggg 17883  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  17882 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttggtcgagactttgaaattgatt 17783  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaatgatgt 279  Q
    | |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  17782 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaatcatgt 17716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 1
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  155 tatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctg 56  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 104316 - 104071
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||  | || |||| ||||| |||||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  104316 tattattgataatggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaa 104217  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||    
T  104216 actccagctaagggttaggtaactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgaaattgacttggtttgtttacctt 104117  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| || |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  104116 tgagtggcatggatgtaatcatgggtatgaactggttagagtacaa 104071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2089 - 1865
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| || || |||| | |||  |||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  2089 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagaga 1990  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||| | ||    
T  1989 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttgagattgatatggt 1890  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggat 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  1889 ttgtttacctttgagcggtatggat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 273
Target Start/End: Original strand, 12573 - 12674
Alignment:
Q  172 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| || ||| | ||||||||||||    
T  12573 atgtcctttgtctatgtttgatcgtaattttgaaattgatttggtttgcttacctttgagtggtatggatataattcttggcatgcactggttagagtac 12672  T
Q  272 aa 273  Q
    ||    
T  12673 aa 12674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Original strand, 24149 - 24405
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  || ||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  24149 cctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttaggtcttgctatgtcaaatatgaatggagaga 24248  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgt-atcttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    || ||||| ||    
T  24249 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgcgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtgattttaggattgatttggt 24348  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24349 ttgtttacctttgagtggtatggatgtgattcttggcatgaactggttagagtacaa 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10229
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || | || || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  9965 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 10064  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| |||||||||||| || | || || |||    
T  10065 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttagtagagactttgaa 10164  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  10165 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 10229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12507
Alignment:
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatgtttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 12579  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     || || ||| | |||||  | |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12578 tgagattgatatggtttgcttgcctttgagtggtatggacgtcattcttggtctgaattggttagagtacaa 12507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 40694 - 40965
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||| || ||| ||| |||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || || |||| | |||  |||||||||| | ||||    
T  40694 gctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtc 40793  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  40794 taatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaatatgtcctt--tctatgtttgatcctgat 40891  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    || || || ||| | |||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40892 tttgagattgatatggtttgtttacctttgagtggtatggatttaattcttggtatgaactggttagagtacaa 40965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 3622 - 3445
Alignment:
Q  97 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcg 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| || | || || |||||||||||||||||||| |||    
T  3622 tgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttgatcg 3523  T
Q  196 tgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3522 tgattttgaaattgatttggtttgtctacctttgagtggtatggatgtaattcttggtatgaactggttagagtacaa 3445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6217 - 5961
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  |  | |||| |||||  |||||||||  | ||||  ||||||| |||    
T  6217 tactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcgaatatgaaagga 6118  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| ||||    
T  6117 gagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtgtgtttaagatgtcctttgtcaatgtttggtcgagatgttgaaattgatt 6018  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    | |||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  6017 tggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatcctgggtatgaactggttagagt 5961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15140 - 14970
Alignment:
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgat 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || | | | |  ||||| |||||||||||| || | |||    
T  15140 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttcgtagagat 15041  T
Q  200 ttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || ||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  15040 tttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgatgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 14970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8527 - 8329
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  8527 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 8428  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtga 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8427 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttgagatgtcctttgtctatgtttgatcgtga 8329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 18 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4683 - 4427
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||   | || |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  4683 cctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 4584  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagt 216  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | || || | |||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||    
T  4583 tggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgtgtgtttaagaagtcctttgtctatgtttgatcatgattttgaaattgatttggt 4484  T
Q  217 ttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  4483 ttgtttacctttgtgtggtatggatgtaattcttgtcatgaactggttagagtacaa 4427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 264
Target Start/End: Original strand, 17538 - 17799
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| ||| | |  || |||| | |||  |||||||||    || |||    
T  17538 tatattaataatacacctttagttgctattattgatacaggtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttatcatgcctg 17637  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || | || || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17638 atatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggctcgctgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctt-gtctatgtttgatcgtgattt 17736  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggtt 264  Q
     || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  17737 tgagatggatttagtttgcttacctttgagtggtatggatgtgattattggtatgaactggtt 17799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 40077 - 39905
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  40077 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgtctgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 39978  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| |   | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| | | | || |||||||||||||||||    
T  39977 attttgtggtcgacttagtgtgtctaccgttgacaggtatggatgttagttttggaatgaattggttagagta 39905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 216635 - 216880
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | || |||  ||| |  || ||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  216635 tattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttcaaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaa 216734  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  || | |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  216735 actccagctaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttcagatgtcctttgtctatgattggtcgagattttaaaattgatttggtttgtttacctt 216834  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  216835 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 216880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 269
Target Start/End: Original strand, 9551 - 9807
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||    ||||  |||||||||||    
T  9551 tactcctttagttgatattattgatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatgga 9650  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | | ||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||    
T  9651 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaagatgtcctttatctatgtttggtagagattttgagattgatt 9750  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagt 269  Q
    | |||||| | ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9751 tggtttgtttgcctttgagtagaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagt 9807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 23498 - 23755
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||  | ||  ||| |||||  |||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  23498 tactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgatagtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatgga 23597  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | || || ||||| ||| |||||||||||| | ||||| || || ||||    
T  23598 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcatttatctatgtttggtagagattttgagattgatt 23697  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | |||||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  23698 tggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagta 23755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 129
Target Start/End: Original strand, 15768 - 15894
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768 tatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtgctacgcattgtttaattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 15867  T
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  15868 atatgaatggagagatggttgtcgaaa 15894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 270
Target Start/End: Original strand, 15179 - 15436
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| |||||  |||||||||  | ||||  |||||||||||    
T  15179 tactcctttagttgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatgga 15278  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatt 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || || || |||||| |||||||||||| |  |||| || || ||||    
T  15279 gaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctttagtgtgtttaagatatcctttatctatgtttggtagatattttgagattgatt 15378  T
Q  213 tagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | |||||| | |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15379 tggtttgtttgcctttgagtggaatggatgtaattcttggtatgaactggttggagta 15436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 15437 - 15266
Alignment:
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgattt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | || || |||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  15437 atatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctacgattggtcgagattt 15338  T
Q  202 cgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
     ||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  15337 tgaaattgatttggtttgtttacctttgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttagagtacaa 15266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 48782 - 48651
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  48782 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtc 48683  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48682 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactc 48651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Original strand, 83824 - 83901
Alignment:
Q  117 atggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  83824 atggttatcgaaaccccggctaaggattcggtgactacttctctagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 83901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15028 - 14873
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |  || |||| | |||  ||||||||||   ||||    
T  15028 gctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtc 14929  T
Q  101 tgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14928 tgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5177 - 4935
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||   | || |||| |||||  |||||||||| | |||   ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5177 tattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttctaagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaa 5078  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||||| |  |||    
T  5077 actccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctaaggtgtcctttgtcgatgtttggtcgagactttgaaattgatttagtttgtttgtctt 4978  T
Q  228 tgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| ||||| |||||    
T  4977 tgagtggaatggatgtaatccttggtatgaactggttggagta 4935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 2979 - 2861
Alignment:
Q  3 tatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctg 102  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2979 tatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctg 2880  T
Q  103 atatgaatggagagatggt 121  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2879 atatgaatggagagatggt 2861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 7943 - 8117
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  | || |||| | |||   ||||||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  7943 cctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgggtcttgctatgtctaatattaatggagaga 8042  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || | || || ||||||||||||||||||||    
T  8043 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgtgtgtttaagatgtcctttgtctatgtttg 8117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 198 - 273
Target Start/End: Original strand, 15379 - 15454
Alignment:
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15379 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctaggtatgaattggttagagtacaa 15454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11920 - 11656
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  11920 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 11821  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  11820 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 11721  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11720 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgtgatttttggtatgaattggttagagta 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 5042 - 5306
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  5042 ttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 5140  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||| ||  ||||| ||||||||||||||| | ||||| |     
T  5141 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtctctttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgt 5240  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  5241 ggtcgacttagtgtgtctaccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 5306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 17769 - 17830
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  17769 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctct 17830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3651 - 3521
Alignment:
Q  18 ccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaga 117  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  3651 cctttagttgctatcattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaga 3552  T
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3551 tggttgtcgaaactctagctaagggttcggt 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 1426 - 1286
Alignment:
Q  144 tcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 242  Q
    ||||||||||||||||| |  | || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| || || ||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  1426 tcggtgactacttctcttgcgtgtttaagatgtcctttgtctatgcttgatcgtgattttgagattgatttggtttgtttacctttgagtggtacggatg 1327  T
Q  243 tgattctgggtatgaattggttagagtacaatgatgtccat 283  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  1326 tgattcttggcatgaactggttagagtacaaccatgtccat 1286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2111 - 1923
Alignment:
Q  6 attaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgata 105  Q
    ||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||     || |||| | |||  |||||||||  | ||||  |||    
T  2111 attaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttattatgtcatata 2012  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2011 tgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttctttagtatgcttgaagtgtcctttgtcgatgtttggt 1923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 572 - 308
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  572 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 473  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  472 gaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 373  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || |||||||||||||||||    
T  372 gttgatttagtttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttggaatgaattggttagagta 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 53708 - 53880
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | |    
T  53708 tctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagag 53807  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||    
T  53808 actttgaagtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattagttagagta 53880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 1168 - 1340
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  1168 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 1267  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  1268 actttgaagtggacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 1340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 251733 - 251469
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||| ||| | ||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  251733 ttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatctgatat 251634  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||| |||||| ||||||||||||||| | || || | |    
T  251633 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgagatgtccattgtctatgtttggtagagactttgta 251534  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| |||||||| | || |||   ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  251533 gtcgatctagtttgtttgccgttgtcgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 251469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 230039 - 230093
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattg 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  230039 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 965 - 864
Alignment:
Q  172 atgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtac 271  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  965 atgtcatttgtctatgtttgatagtgattttgagatggatttggtttgtctacatttgagtggtatggatgtgattcttggtatgaattggttggaatac 866  T
Q  272 aa 273  Q
    ||    
T  865 aa 864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41846 - 41585
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  41846 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatat 41747  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | | ||   |||||  | || ||||||||| | ||||| |      
T  41746 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctgcggtgtcccatatccatgtttggtagggattttgtg 41647  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
    || |||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  41646 attgatttagtttgtctgccgttgacgggtatggatgttatctttggtatgaattggttaga 41585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 267
Target Start/End: Original strand, 94087 - 94348
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||  | ||  ||||||||   | | ||||||||    
T  94087 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatat 94186  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||| |||    
T  94187 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctggtgtgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagattttgaa 94286  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttaga 267  Q
     | |||||||| |||||||| |||   || |||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  94287 gtcgatttagtgtgtctaccgttgttggggatggatgttattttcgggatgaattggttaga 94348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 115581 - 115409
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||| | |||||||||||| | |    
T  115581 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgatatgtcctatatctatgtttggtaggg 115482  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||| | |||||||||||  ||||  |||  || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||    
T  115481 attttgaagtagatttagtttgcttaccactgacggggatggatgttatatttgggatgaattggttagagta 115409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 694 - 430
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  694 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 595  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  594 gaaaggggaaatggttgttgaaactccatctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 495  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  494 gtcgacttagtttgtttaccgttgacaggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 1504 - 1768
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||  | ||  |||||||| | | | |||||||     
T  1504 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatac 1603  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  1604 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 1703  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  1704 gtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 1768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 266
Target Start/End: Original strand, 48 - 308
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  48 ttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatat 147  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||| | ||||||||||||||| | || || |||    
T  148 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtataagatgtacgttgtctatgtttggtagagactttgaa 247  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttag 266  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  248 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttag 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 7855 - 7591
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | |||||||  | ||  |||||||| | | | |||||||     
T  7855 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatac 7756  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  7755 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 7656  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  7655 gtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 7591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 60850 - 60586
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| || ||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  60850 ttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatat 60751  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  60750 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 60651  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  60650 gtcgatctagtatgtttgccgttgtcgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 60586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 70219 - 70081
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| || ||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  70219 ttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatatctgatat 70120  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 145  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70119 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 70081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29638 - 29451
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||  |||||| |||||||| |||||| | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  29638 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 29539  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  29538 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 29451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12071 - 11884
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  12071 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 11972  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  11971 gaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 11884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 104 - 241
Target Start/End: Original strand, 21475 - 21613
Alignment:
Q  104 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttc 202  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| ||||| || || ||||||||||| || ||     
T  21475 tatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtctgaagtgtccgttctcgatgtttggtcgagacttt 21574  T
Q  203 gaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggat 241  Q
    ||| | |||||||||||| | |||||||| || ||||||    
T  21575 gaagttgatttagtttgtttgcctttgagtggaatggat 21613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 158
Target Start/End: Original strand, 41323 - 41452
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    || |||||||| |  |||||||||| | ||||   ||||||||| || ||||||||||||    
T  41323 tattatagatactggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaa 41422  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttct 158  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  41423 acttcggctaagggttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5824 - 5692
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  5824 tctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 5725  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttga 230  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  5724 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 5692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5687 - 5598
Alignment:
Q  181 gtctatgtttggtcgtgatttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    ||||||||||||| | || || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  5687 gtctatgtttggtagagactttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 5598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 5338 - 5602
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  5338 ttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtatggatgtatctgatat 5437  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | |||||  ||||| |||| |||||||||| | ||||| |      
T  5438 gaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgcttgaggtgtccattgtttatgtttggtagagattttgtg 5537  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||| | || |||    |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  5538 gttgatttagtttgtttgccgttgtcgcgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 5602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 772 - 944
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  || |||||||| |||||||||||| || | |    
T  772 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtttaaaatgtccgttgtctatgtttagtagag 871  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | || |||||| || | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  872 actttgaagtcgacttagttggttttccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20925 - 20661
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| |   | ||||||||    
T  20925 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggtcgtatctgatat 20826  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  20825 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 20726  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| | |||||||||    
T  20725 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactagttagagta 20661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26131 - 25959
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  26131 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 26032  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  26031 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatggatgttattttcgggatgaattggttagagta 25959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 3455 - 3627
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |  |||| ||||||| | |||||||||||| | |    
T  3455 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgagatgtcctatatctatgtttggtaggg 3554  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||| | || ||||||||  ||||  |||  || |||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  3555 attttgaagtagacttagtttgcttaccactgacagggatggatgtgatatttgggatgaattggttagagta 3627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 218 - 273
Target Start/End: Original strand, 8146 - 8201
Alignment:
Q  218 tgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8146 tgtctacctttgagtggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 8201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12838 - 12651
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  12838 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatat 12739  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| |||||||||||||||    
T  12738 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaagttgtccattgtctatgtttggt 12651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 67301 - 67454
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | || ||||    
T  67301 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatccgata 67399  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  67400 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 67454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 1465 - 1652
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||   |  | ||||  | ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  1465 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtct-gattatgtctgata 1563  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  1564 tgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 1231 - 967
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  1231 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 1132  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||  ||||||||||||||| | || || |||    
T  1131 gaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaa 1032  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  1031 gtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 28478 - 28665
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||   |  | ||||  | ||  |||||||| |||| |||||||||    
T  28478 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttgggtct-gattatgtctgata 28576  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  28577 tgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 28665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 30045 - 29781
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  | || ||||  | ||  |||||| | ||| | ||||||||    
T  30045 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatat 29946  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||    || |||||||| || | | ||   |||||| | |||||||||||| | ||||| |      
T  29945 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctggggtgtcctatatctatgtttggtagagattttgtg 29846  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | |||||||||||||| || |||   ||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||    
T  29845 gttgatttagtttgtctgccgttgttgggtatggatgtgatttttggaatgaattggtcagagta 29781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 29735 - 29471
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  29735 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtatctgatat 29636  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  29635 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagactttgaa 29536  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||  ||| |||| |||| ||||  |||||||| |||||| | || ||||| |||||||||||    
T  29535 gtcgacctagcttgtttaccgttgacgggtatggaggtgatttttgggatgaactggttagagta 29471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 49465 - 49637
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  49465 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 49564  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  49565 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 49637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 58499 - 58671
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  58499 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 58598  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  58599 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 58671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 64887 - 65059
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  64887 tctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 64986  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  ||||||||||  ||| | || |||||||||||||||||    
T  64987 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccattgacgggtatggatgctatttttggaatgaattggttagagta 65059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 63804 - 63976
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  63804 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggtagag 63903  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | ||| |||| ||| | || |||   ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||    
T  63904 actttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgttgggtatggatgtgatttttgggatgaactggttagagta 63976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 65583 - 65755
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | || ||  |||||| | || ||||||||| | |    
T  65583 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttaaggtgtcctatatccatgtttggtagag 65682  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||| | || ||||| ||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  65683 attttgaagttgacttagtatgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 65755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Original strand, 98776 - 99040
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||| ||||    
T  98776 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatat 98875  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||| | ||||||||||||||| | || || |||    
T  98876 gaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtctaaggtgttcgttgtctatgtttggtagagactttgaa 98975  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  98976 gtcgacttagtttgtttgccgttgacgggtatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 99040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 176092 - 175912
Alignment:
Q  14 tactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgga 113  Q
    |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | |||||||||||||||    
T  176092 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaatgga 175993  T
Q  114 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  175992 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 175912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 325818 - 325554
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  325818 ttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatat 325719  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||  ||||||||||||||| | || || |||    
T  325718 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagatgtctgttgtctatgtttggtagagactttgaa 325619  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||| ||| |||| ||||  || |||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  325618 gtcgacttagtgtgtttaccgttgacgggaatggatgttatttttgggatgaactggttagagta 325554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 243
Target Start/End: Original strand, 200661 - 200898
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||   |||    
T  200661 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtcaagtat 200760  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||  ||||||||||||||| | ||||| |||    
T  200761 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgatttgtctgttgtctatgtttggtagagattttgaa 200860  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgt 243  Q
     | ||| |||| ||| | || ||||  |||||||||||    
T  200861 gttgatctagtatgtttgccgttgacgggtatggatgt 200898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1832 - 1681
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  1832 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 1733  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 158  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1732 gaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 43612 - 43799
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  43612 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 43711  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  43712 gaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggt 43799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 25216 - 25176
Alignment:
Q  118 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  25216 tggttgtcgaaactcgagctaagggttcgataactacttct 25176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 165
Target Start/End: Original strand, 4589 - 4655
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  4589 tctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtat 4655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 6451 - 6603
Alignment:
Q  8 taataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgatat 106  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  ||| || ||  |||||| |||||| | ||||||||    
T  6451 taatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttgggt-ttgattgtatctgatat 6549  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6550 gaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctct 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 1047 - 1200
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | | ||||||    
T  1047 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatat 1146  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1147 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 263337 - 263073
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  263337 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 263239  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcga 204  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  |||||| | |||||||||||| | ||||| ||    
T  263238 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgaggtgtcctatatctatgtttggtagagattttga 263139  T
Q  205 aatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
      | || ||||||||| | || ||||  || ||||| || ||| | || |||||||||||||||||    
T  263138 ggtagacttagtttgtttgccgttgacgggaatggacgttatttttggaatgaattggttagagta 263073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Original strand, 1100 - 1232
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | | |||||| ||||||||||||||| | |    
T  1100 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttttctaagatgtccgttgtctatgtttggtagag 1199  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttga 230  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||    
T  1200 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttga 1232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2890 - 2718
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  2890 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccattgtctatgtttggtagag 2791  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || ||| | ||| |||| ||| | || ||||  ||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  2790 actttgaagtcgatctagtatgtttgccgttgacgggtatagatgtaatttttgggatgaactggttagagta 2718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8725 - 8461
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  8725 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgtatctgatat 8626  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
     || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||     
T  8625 aaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagagattttgag 8526  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | || ||||| ||| | || ||||   |||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  8525 gtcgacttagtatgtttgccgttgacgtgtatggatgttatttttgggatgaattggttagagta 8461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 5636 - 5560
Alignment:
Q  84 ttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5636 ttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctct 5560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 50216 - 49952
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  ||||| || | | | ||||||||    
T  50216 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgtatctgatat 50117  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  50116 gaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 50017  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| | |||||  |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  50016 gtcgatcttgtttgcttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaaatggttagagta 49952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 110721 - 110457
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| | |||| ||||||| |||||| |||||||| ||||   | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  110721 ttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtctgatat 110622  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | || || |||    
T  110621 gaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagagactttgaa 110522  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     |  |  |||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  110521 gtcaacctagtttgtttacctttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 4282 - 4469
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  ||||||||   | ||||   |||    
T  4282 ttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtat 4381  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| | || |  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  4382 gagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 7149 - 6996
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  7149 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtttctgatat 7050  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7049 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 6996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 8747 - 8808
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8747 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 18961 - 19022
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18961 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 19022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 726 - 673
Alignment:
Q  220 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  726 tctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaactggttggaatacaa 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21870 - 21809
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21870 tctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 21809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 2145 - 2298
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| || ||||| | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || |||  || ||  |||||||| | | | ||||||||    
T  2145 ttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtctggttgtatctgatat 2244  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2245 gaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 2298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 70391 - 70219
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaa-atgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| || | || ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  70391 tctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgtttaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 70292  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | || ||||| |||||||| ||||  || ||| |||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  70291 attttgaggtcgacttagtgtgtctaccgttgatgggaatgtatgttatttttgggatgaattggttagagta 70219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5292 - 5028
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| ||||| || | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | ||||||||||    
T  5292 ttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttatgtctgatat 5193  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtgatttcgaa 205  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| || |||| |||||| || | | | |  ||||| ||||| ||||||||| | || || |||    
T  5192 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtctaagttgtccgttgtcaatgtttggtagagactttgaa 5093  T
Q  206 atggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
     | ||| | |||||| |||| ||||  ||||||||||| ||| | || ||||| |||||||||||    
T  5092 gtcgatcttgtttgtttaccgttgacgggtatggatgtaatttttgggatgaactggttagagta 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36958 - 36814
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatct-tgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || | | | |  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  36958 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctaaggtgtccgttgtctatgtttggtagag 36859  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatg 242  Q
    | || ||| | || ||||||||| |||| ||||  ||||||||||    
T  36858 actttgaagtcgacttagtttgtttaccgttgacgggtatggatg 36814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22141 - 21969
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtatcttgaaa-tgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||||||||| || | |  ||  ||||| ||||||||||||||| | |    
T  22141 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtctaaggtgtccattgtctatgtttggtagag 22042  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    |||| ||  | |||||||||||| | ||  |||  ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||    
T  22041 attttgaggtcgatttagtttgtttgccgctgacgggtatggatgttatttttggaatgaattggttagagta 21969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Original strand, 20743 - 20874
Alignment:
Q  29 tattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaa 128  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||  | || ||||  | ||  |||||||| | | | ||||||||||| || || |||||||| |||    
T  20743 tattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaa 20842  T
Q  129 actccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20843 actccagctaagggttcagtaactacttctct 20874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Original strand, 12637 - 12694
Alignment:
Q  103 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  12637 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11844 - 11754
Alignment:
Q  104 tatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  11844 tatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtttgagttgtcctttgtctatgtttggt 11754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 9979 - 10132
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatt-tgtctgata 105  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| ||||| || ||  |||  | ||  |||||| |||||| | |||||||    
T  9979 ttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggt-ttgattgtatctgata 10077  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  10078 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctct 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 160
Target Start/End: Original strand, 5402 - 5555
Alignment:
Q  7 ttaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatat 106  Q
    |||||| |||||||| | ||| |||||| ||  ||| |||||| |||||||| |||||  | || |||| || ||  |||||||| | | | ||| ||||    
T  5402 ttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctaatat 5501  T
Q  107 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5502 gaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 5555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 54066 - 54005
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  54066 tctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctct 54005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 270
Target Start/End: Original strand, 119 - 291
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggtcgtg 197  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||| || |  |||   |||||| | |||||||||| | | |    
T  119 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgtttggggtgtcctatatctatgtttgttaggg 218  T
Q  198 atttcgaaatggatttagtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagta 270  Q
    | || |   |||||||||||||| | || |||   |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  219 actttgtggtggatttagtttgtttgccgttgtcgggtatgaatgtgatttttggtatgaattggttagagta 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 30611 - 30706
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctcgtat-cttgaaatgtcctttgtctatgtttggt 193  Q
    ||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  30611 tctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtttgagttgtccgttgtctatgtttggt 30706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 171235 - 171188
Alignment:
Q  1 gctatattaataatactccttgagttgatattattgatactgttgcta 48  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  171235 gctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 160
Target Start/End: Original strand, 9419 - 9573
Alignment:
Q  6 attaataatactccttgagttgatattattgatactgttgctacacattgttttattgcattcgactgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgata 105  Q
    ||||||| |||||||| | ||| |||||| || |||| |||||| |||||||| |||||  | || |||  || ||  |||||||| | | | |||||||    
T  9419 attaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgata 9518  T
Q  106 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9519 tgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 9573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Original strand, 49162 - 49223
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  49162 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctct 49223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 273
Target Start/End: Original strand, 6489 - 6547
Alignment:
Q  215 gtttgtctacctttgagcggtatggatgtgattctgggtatgaattggttagagtacaa 273  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||| |||||||    
T  6489 gtttgtttacctttgagtggtatggatgtaatccttggtatgaactggttatagtacaa 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10996 - 10935
Alignment:
Q  99 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  10996 tctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctct 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University