View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_227 (Length: 251)

Name: NF9913A_low_227
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_227
NF9913A_low_227
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (3-236)||(6499864-6500097)
chr3 (3-236)||(9992794-9993028)
chr3 (60-236)||(13382153-13382329)
chr3 (60-236)||(13392747-13392923)
chr3 (57-236)||(4744895-4745074)
chr3 (57-236)||(5511851-5512030)
chr3 (57-236)||(5546505-5546684)
chr3 (57-236)||(24661072-24661251)
chr3 (57-236)||(5626861-5627040)
chr3 (57-236)||(5875146-5875325)
chr3 (57-236)||(12295704-12295883)
chr3 (3-234)||(16390427-16390658)
chr3 (57-236)||(16477436-16477615)
chr3 (57-236)||(24392956-24393135)
chr3 (57-236)||(41684831-41685010)
chr3 (32-236)||(8775839-8776040)
chr3 (32-236)||(18485172-18485373)
chr3 (62-236)||(37867664-37867838)
chr3 (62-236)||(37876182-37876356)
chr3 (32-236)||(38195906-38196107)
chr3 (32-236)||(39373236-39373437)
chr3 (60-236)||(23758440-23758616)
chr3 (32-236)||(28323701-28323902)
chr3 (63-236)||(19779600-19779773)
chr3 (64-236)||(6219538-6219710)
chr3 (60-236)||(12248329-12248505)
chr3 (66-236)||(20682617-20682787)
chr3 (66-236)||(14466815-14466985)
chr3 (66-236)||(13122889-13123059)
chr3 (61-229)||(29470675-29470843)
chr3 (32-146)||(10654248-10654359)
chr3 (142-236)||(10635920-10636014)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (32-236)||(1988702-1988903)
chr7 (57-236)||(8011635-8011814)
chr7 (57-236)||(24735909-24736088)
chr7 (60-236)||(2715185-2715361)
chr7 (57-236)||(9086413-9086592)
chr7 (3-234)||(19992966-19993196)
chr7 (57-236)||(26399644-26399823)
chr7 (57-236)||(40051652-40051831)
chr7 (57-236)||(11097196-11097376)
chr7 (44-236)||(21001956-21002148)
chr7 (57-236)||(26698677-26698856)
chr7 (62-236)||(5686723-5686897)
chr7 (62-236)||(9434427-9434601)
chr7 (32-236)||(466541-466742)
chr7 (62-236)||(6876791-6876965)
chr7 (32-236)||(11006351-11006552)
chr7 (32-236)||(42866992-42867193)
chr7 (64-236)||(22090372-22090544)
chr7 (66-236)||(17959623-17959793)
chr7 (68-236)||(8618587-8618755)
chr7 (66-236)||(168090-168260)
chr7 (66-236)||(4213219-4213389)
chr7 (65-227)||(15887203-15887365)
chr7 (64-229)||(9160951-9161116)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (57-236)||(17616641-17616820)
chr5 (57-236)||(17728498-17728677)
chr5 (57-236)||(31358115-31358294)
chr5 (57-236)||(15768362-15768541)
chr5 (57-236)||(37731055-37731234)
chr5 (3-232)||(31447510-31447739)
chr5 (57-236)||(6985320-6985499)
chr5 (57-236)||(14039619-14039798)
chr5 (57-236)||(14448129-14448308)
chr5 (57-236)||(14559161-14559340)
chr5 (57-236)||(22685025-22685204)
chr5 (57-236)||(23305868-23306047)
chr5 (57-236)||(23371531-23371710)
chr5 (57-236)||(23706378-23706557)
chr5 (57-236)||(27469583-27469762)
chr5 (57-236)||(36583602-36583781)
chr5 (57-236)||(42052390-42052569)
chr5 (58-236)||(27043313-27043491)
chr5 (57-236)||(9345562-9345741)
chr5 (57-236)||(24589157-24589336)
chr5 (57-236)||(30228549-30228728)
chr5 (57-236)||(39491990-39492169)
chr5 (57-236)||(24817944-24818123)
chr5 (62-236)||(27604554-27604728)
chr5 (32-236)||(35225084-35225285)
chr5 (62-236)||(5291675-5291849)
chr5 (60-236)||(15994389-15994565)
chr5 (64-236)||(40399989-40400161)
chr5 (63-236)||(39361270-39361443)
chr5 (60-236)||(31842987-31843163)
chr5 (66-236)||(22156074-22156244)
chr5 (61-229)||(20796650-20796818)
chr5 (61-207)||(1110295-1110441)
chr5 (32-150)||(36697303-36697418)
chr5 (122-236)||(36697196-36697310)
chr5 (64-226)||(23405403-23405565)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (60-236)||(12856097-12856273)
chr6 (3-236)||(27373874-27374107)
chr6 (3-236)||(27464227-27464460)
chr6 (60-236)||(26865940-26866116)
chr6 (57-236)||(3662489-3662668)
chr6 (57-236)||(12726317-12726496)
chr6 (57-236)||(17983618-17983797)
chr6 (57-236)||(25788873-25789052)
chr6 (57-236)||(26026564-26026743)
chr6 (57-236)||(27342872-27343051)
chr6 (57-236)||(27403612-27403791)
chr6 (44-236)||(9122013-9122205)
chr6 (57-236)||(16931539-16931718)
chr6 (62-234)||(25590360-25590532)
chr6 (66-236)||(34816655-34816825)
chr6 (68-236)||(32971358-32971526)
chr6 (62-153)||(7669375-7669466)
chr6 (65-227)||(12359298-12359460)
chr6 (32-150)||(27385538-27385653)
chr6 (32-150)||(27475951-27476066)
chr6 (32-150)||(4632012-4632127)
chr6 (32-150)||(32310650-32310765)
chr6 (122-236)||(27385646-27385760)
chr6 (122-236)||(27476059-27476173)
chr6 (122-236)||(4632120-4632234)
chr6 (122-236)||(32310543-32310657)
chr6 (64-229)||(32780124-32780289)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (60-236)||(40223475-40223651)
chr2 (57-236)||(11404345-11404524)
chr2 (57-236)||(43346538-43346717)
chr2 (57-236)||(10268121-10268300)
chr2 (57-236)||(10278698-10278877)
chr2 (32-236)||(35254150-35254351)
chr2 (32-236)||(35264759-35264960)
chr2 (32-236)||(27222537-27222738)
chr2 (62-236)||(29245393-29245567)
chr2 (62-236)||(43083835-43084009)
chr2 (60-236)||(9907060-9907236)
chr2 (64-236)||(24337264-24337436)
chr2 (60-236)||(9772231-9772407)
chr2 (60-206)||(34803301-34803447)
chr2 (67-236)||(4211085-4211254)
chr2 (66-236)||(22959203-22959373)
chr2 (64-229)||(21171305-21171470)
chr2 (64-229)||(28730751-28730916)
chr2 (202-236)||(34799692-34799726)
chr2 (203-236)||(35759242-35759275)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (57-236)||(36294106-36294285)
chr8 (57-236)||(209087-209266)
chr8 (57-236)||(242989-243168)
chr8 (57-236)||(722710-722889)
chr8 (57-236)||(796359-796538)
chr8 (57-236)||(3358139-3358318)
chr8 (57-236)||(9342311-9342490)
chr8 (57-236)||(15766081-15766260)
chr8 (57-236)||(15790218-15790397)
chr8 (57-236)||(29077887-29078066)
chr8 (57-236)||(32087203-32087382)
chr8 (32-236)||(13687498-13687699)
chr8 (32-236)||(36079089-36079290)
chr8 (62-236)||(26112468-26112642)
chr8 (62-236)||(19129938-19130112)
chr8 (66-236)||(6152292-6152462)
chr8 (65-227)||(19226134-19226296)
chr8 (65-227)||(30324171-30324333)
chr8 (32-150)||(44482281-44482396)
chr8 (122-236)||(44482389-44482503)
chr8 (64-204)||(19419604-19419744)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (57-236)||(55754716-55754895)
chr4 (57-236)||(10750056-10750235)
chr4 (57-236)||(10963825-10964004)
chr4 (57-236)||(36019508-36019687)
chr4 (32-236)||(24641466-24641667)
chr4 (62-236)||(24026926-24027100)
chr4 (32-236)||(27657799-27658000)
chr4 (60-236)||(451752-451928)
chr4 (64-236)||(17919294-17919466)
chr4 (60-236)||(30935979-30936155)
chr4 (60-236)||(21997592-21997768)
chr4 (40-236)||(18761969-18762162)
chr4 (62-234)||(40469482-40469654)
chr4 (62-236)||(19953843-19954017)
chr4 (66-236)||(16257112-16257282)
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (57-236)||(38096204-38096383)
chr1 (57-236)||(51655375-51655554)
chr1 (57-236)||(7508418-7508597)
chr1 (57-236)||(36245931-36246110)
chr1 (62-236)||(4168401-4168575)
chr1 (32-236)||(35400043-35400244)
chr1 (32-236)||(35647568-35647769)
chr1 (32-236)||(5834323-5834524)
chr1 (57-236)||(47617437-47617616)
chr1 (32-236)||(3172719-3172920)
chr1 (62-236)||(19180085-19180259)
chr1 (64-236)||(5649257-5649429)
chr1 (60-236)||(12731631-12731807)
chr1 (60-236)||(12742224-12742400)
chr1 (64-236)||(21864824-21864996)
chr1 (66-236)||(12622677-12622847)
chr1 (61-229)||(153158-153326)
chr1 (62-229)||(7680401-7680568)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (57-236)||(32310-32489)
scaffold0133 (64-229)||(41763-41928)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (32-236)||(46482-46683)
[»] scaffold1216 (1 HSPs)
scaffold1216 (62-234)||(267-439)
[»] scaffold0906 (1 HSPs)
scaffold0906 (61-236)||(3424-3599)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (61-229)||(52481-52649)
[»] scaffold0398 (2 HSPs)
scaffold0398 (61-227)||(3250-3416)
scaffold0398 (61-227)||(11505-11671)
[»] scaffold0454 (2 HSPs)
scaffold0454 (32-150)||(2420-2535)
scaffold0454 (122-236)||(2528-2642)
[»] scaffold1002 (2 HSPs)
scaffold1002 (61-150)||(2863-2952)
scaffold1002 (122-229)||(2763-2870)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (161-234)||(3556-3629)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (65-186)||(23758-23879)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (61-150)||(23803-23892)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6500097 - 6499864
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 102  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500097 agatacaaaggaaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 6499998  T
Q  103 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6499997 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaagcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatg 6499898  T
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6499897 tactcttcttcttgatagaaaggagtgatgtcca 6499864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9993028 - 9992794
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataa-tttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgtt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9993028 agatacagaggcaaagctactgataaatttagaaccaaagtaaaaacaagctaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgtt 9992929  T
Q  102 ccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgat 201  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9992928 ctaagagatacttgatatgatcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgat 9992829  T
Q  202 gtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9992828 gtactcttcttcgggatagaaaggagtgatgtcca 9992794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13382329 - 13382153
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13382329 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 13382230  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13382229 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtgatgtcca 13382153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13392923 - 13392747
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13392923 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 13392824  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13392823 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcctctggatagaaaggagtgatgtcca 13392747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 4744895 - 4745074
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4744895 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 4744994  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4744995 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4745074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 5511851 - 5512030
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5511851 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 5511950  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5511951 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5512030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5546684 - 5546505
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5546684 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 5546585  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5546584 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5546505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 24661072 - 24661251
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24661072 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 24661171  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24661172 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24661251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5627040 - 5626861
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5627040 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 5626941  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5626940 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5626861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5875325 - 5875146
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5875325 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 5875226  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||  ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5875225 cattctttgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5875146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12295883 - 12295704
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12295883 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 12295784  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12295783 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12295704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16390658 - 16390427
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || ||||| || || | ||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16390658 agatacaaaggcaaagctactaacaacttagagcaaaaattaaaacaagcaaagaatgtcgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 16390559  T
Q  103 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatg 202  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  16390558 caagagatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattctggctgcccttgtgatg 16390459  T
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16390458 tactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 16390427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 16477436 - 16477615
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16477436 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 16477535  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16477536 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 16477615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24393135 - 24392956
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24393135 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 24393036  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24393035 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctgaatagaaaggagtgatgtcca 24392956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 41684831 - 41685010
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41684831 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 41684930  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41684931 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 41685010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 8775839 - 8776040
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  8775839 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 8775935  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8775936 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 8776035  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  8776036 gtcca 8776040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 18485172 - 18485373
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  18485172 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 18485268  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18485269 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 18485368  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  18485369 gtcca 18485373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 37867664 - 37867838
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37867664 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 37867763  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37867764 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 37867838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 37876182 - 37876356
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37876182 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctattccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 37876281  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37876282 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 37876356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 38195906 - 38196107
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  38195906 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 38196002  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38196003 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 38196102  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  38196103 gtcca 38196107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 39373236 - 39373437
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  39373236 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 39373332  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39373333 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 39373432  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  39373433 gtcca 39373437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 23758440 - 23758616
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  23758440 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 23758539  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23758540 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 23758616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28323902 - 28323701
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28323902 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 28323806  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28323805 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgagatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 28323706  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  28323705 gtcca 28323701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Original strand, 19779600 - 19779773
Alignment:
Q  63 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattct 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19779600 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattct 19779699  T
Q  163 tcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||   |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19779700 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttatgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 19779773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6219710 - 6219538
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6219710 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaagagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattctt 6219611  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6219610 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 6219538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12248505 - 12248329
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  12248505 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttaaacaactgttctaagagatgcttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12248406  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12248405 tttccttttatgcccagcatgaattctagcagcccttgtgatgtattcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 12248329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20682787 - 20682617
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20682787 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattcttct 20682688  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20682687 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtgatgtactcttcttctgtatagaaaggagtgatgtcca 20682617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 14466815 - 14466985
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14466815 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 14466914  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14466915 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14466985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 13122889 - 13123059
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13122889 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 13122988  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||  |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13122989 tttgtacccagaatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 13123059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 29470843 - 29470675
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  29470843 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 29470744  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  29470743 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtcctcatcttctggatagaaaggagtg 29470675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 10654359 - 10654248
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10654359 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatttgatcatctttct 10654263  T
Q  132 tctgaagtagctcat 146  Q
    |||||||||||||||    
T  10654262 tctgaagtagctcat 10654248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10636014 - 10635920
Alignment:
Q  142 ctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10636014 ctcatccttttctctcattttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 10635920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 1988702 - 1988903
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  1988702 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttct 1988798  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1988799 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgat 1988898  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  1988899 gtcca 1988903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8011814 - 8011635
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8011814 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 8011715  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8011714 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 8011635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 24735909 - 24736088
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24735909 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 24736008  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24736009 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24736088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2715361 - 2715185
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2715361 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccctcat 2715262  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2715261 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 2715185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 9086413 - 9086592
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9086413 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 9086512  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9086513 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9086592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19993196 - 19992966
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || |||||||| || | ||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19993196 agatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaattaaa-caagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 19993098  T
Q  103 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatg 202  Q
    ||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19993097 caagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtaactcatccttttctctcattcttcttttgaatccagcatgaattctagcagcccttgtgatg 19992998  T
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtc 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19992997 tactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 19992966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26399823 - 26399644
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26399823 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaacagttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 26399724  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26399723 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26399644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40051831 - 40051652
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40051831 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 40051732  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||| |||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40051731 cattattcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 40051652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 11097196 - 11097376
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11097196 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 11097295  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcc-cttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11097296 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccactagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 11097376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21002148 - 21001956
Alignment:
Q  44 aaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagct 143  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  21002148 aaaacaagcaaagaaaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 21002049  T
Q  144 catccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21002048 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 21001956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26698856 - 26698677
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26698856 agagttggatgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 26698757  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26698756 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26698677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 5686723 - 5686897
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5686723 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 5686822  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5686823 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5686897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 9434427 - 9434601
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9434427 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 9434526  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9434527 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9434601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 466742 - 466541
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  466742 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttct 466646  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||| || | | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  466645 tctgaagtagctcatccttttcccttaatttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagat 466546  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  466545 gtcca 466541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6876965 - 6876791
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6876965 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 6876866  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6876865 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 6876791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 11006351 - 11006552
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  11006351 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 11006447  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11006448 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 11006547  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  11006548 gtcca 11006552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 42866992 - 42867193
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  42866992 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 42867088  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42867089 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 42867188  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  42867189 gtcca 42867193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 22090372 - 22090544
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22090372 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 22090471  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22090472 cttttatacccagcatgaattctggttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22090544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17959793 - 17959623
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17959793 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 17959694  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17959693 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17959623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Original strand, 8618587 - 8618755
Alignment:
Q  68 tgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttt 167  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  8618587 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttattt 8618686  T
Q  168 tgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8618687 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 8618755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 168090 - 168260
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  168090 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 168189  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  168190 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 168260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 4213219 - 4213389
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4213219 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgattttctcatccttcttcttgagtagctcatcattttccctcattcttct 4213318  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||   |||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4213319 tttatacccagcatgaattcttgatgcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4213389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15887365 - 15887203
Alignment:
Q  65 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttc 164  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || | ||| ||||| |||||||||||| | || | || | |||||| |||||    
T  15887365 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaacctgctcatcattcttctgaagttgttctttctgtgctctcagtcttc 15887266  T
Q  165 ttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggag 227  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||   |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  15887265 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataaaaaggag 15887203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Original strand, 9160951 - 9161116
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || |||||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  9160951 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttgatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 9161050  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  9161051 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaaacagcttcaggatagaaaggagtg 9161116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17616820 - 17616641
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17616820 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 17616721  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17616720 cattcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17616641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17728677 - 17728498
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17728677 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 17728578  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17728577 cattcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17728498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31358294 - 31358115
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358294 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 31358195  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31358194 cattcttcttttgtatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 31358115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15768541 - 15768362
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15768541 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 15768442  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15768441 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 15768362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 37731055 - 37731234
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37731055 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 37731154  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37731155 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 37731234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31447739 - 31447510
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| | || |||||||| || | ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31447739 agatacaaaggcaaagctactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagaatgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 31447640  T
Q  103 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatg 202  Q
    ||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  31447639 caaaatatacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattctagcagcccttgtaatg 31447540  T
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatg 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31447539 tactcttcttctggatagaaaggagtgatg 31447510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6985499 - 6985320
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6985499 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 6985400  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6985399 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 6985320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14039798 - 14039619
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14039798 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 14039699  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14039698 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14039619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 14448129 - 14448308
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14448129 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 14448228  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14448229 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14448308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 14559161 - 14559340
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14559161 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 14559260  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14559261 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 14559340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22685204 - 22685025
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22685204 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 22685105  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22685104 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22685025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23306047 - 23305868
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23306047 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 23305948  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23305947 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 23305868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23371710 - 23371531
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23371710 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 23371611  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23371610 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 23371531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23706557 - 23706378
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23706557 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 23706458  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23706457 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 23706378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27469762 - 27469583
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27469762 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 27469663  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27469662 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27469583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 36583602 - 36583781
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36583602 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 36583701  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36583702 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 36583781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 42052569 - 42052390
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42052569 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 42052470  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42052469 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 42052390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 58 - 236
Target Start/End: Original strand, 27043313 - 27043491
Alignment:
Q  58 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctc 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27043313 gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctc 27043412  T
Q  158 attcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27043413 attcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27043491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9345741 - 9345562
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9345741 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccct 9345642  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9345641 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9345562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 24589157 - 24589336
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24589157 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttacct 24589256  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24589257 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24589336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 30228549 - 30228728
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30228549 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 30228648  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30228649 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtaatgtcca 30228728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 39491990 - 39492169
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  39491990 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctttttcct 39492089  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39492090 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 39492169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 24817944 - 24818123
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24817944 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 24818043  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24818044 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggattgatgtcca 24818123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 27604554 - 27604728
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27604554 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 27604653  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27604654 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagtccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27604728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35225285 - 35225084
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35225285 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 35225189  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35225188 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 35225089  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  35225088 gtcca 35225084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 5291675 - 5291849
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5291675 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctattccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 5291774  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5291775 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttataatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 5291849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 15994389 - 15994565
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |     
T  15994389 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatcattttcccttaa 15994488  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  15994489 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 15994565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40400161 - 40399989
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40400161 ggtgtgcaactagggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattctt 40400062  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40400061 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtattcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 40399989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 63 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39361443 - 39361270
Alignment:
Q  63 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattct 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  39361443 gggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatcattcttcttgagtagctcatccttttccctcattct 39361344  T
Q  163 tcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39361343 tcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtgatgtcca 39361270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31843163 - 31842987
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  31843163 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactattctaagaaatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 31843064  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  31843063 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 31842987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22156244 - 22156074
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22156244 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22156145  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22156144 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22156074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20796818 - 20796650
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  20796818 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 20796719  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||  |||  ||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20796718 cttcttttcaacccggcttgaattctaacagttcttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 20796650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 1110295 - 1110441
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  1110295 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 1110394  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactc 207  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||  ||||||||    
T  1110395 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactc 1110441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 36697418 - 36697303
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  36697418 agaacaaaagtaagaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 36697322  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  36697321 tctgaagtagctcatcctt 36697303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36697310 - 36697196
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  36697310 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 36697211  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  36697210 aaggagtgatgtcca 36697196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23405565 - 23405403
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || || ||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  23405565 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 23405466  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaagga 226  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  23405465 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaagga 23405403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 12856097 - 12856273
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12856097 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 12856196  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12856197 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12856273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 27373874 - 27374107
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 102  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27373874 agatacaaaggcaaaactactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 27373973  T
Q  103 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatg 202  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  27373974 caaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgata 27374073  T
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27374074 tactcttcttctagatagaaaggagtgatgtcca 27374107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 236
Target Start/End: Original strand, 27464227 - 27464460
Alignment:
Q  3 agatacagaggcaaagctactgataatttagaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttc 102  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27464227 agatacaaaggcaaaactactaacaacttagaacaaaaattaaaacaagcaaagagtgttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttc 27464326  T
Q  103 caaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatg 202  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  27464327 caaaaggtacttaatttgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgata 27464426  T
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27464427 tactcttcttctagatagaaaggagtgatgtcca 27464460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 26865940 - 26866116
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26865940 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 26866039  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26866040 tcttcttttatatccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26866116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 3662489 - 3662668
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3662489 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 3662588  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3662589 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 3662668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12726496 - 12726317
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12726496 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 12726397  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12726396 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12726317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17983797 - 17983618
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17983797 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 17983698  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17983697 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17983618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 25788873 - 25789052
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25788873 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 25788972  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25788973 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 25789052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 26026564 - 26026743
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26026564 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 26026663  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26026664 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26026743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 27342872 - 27343051
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27342872 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 27342971  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27342972 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27343051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 27403612 - 27403791
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27403612 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 27403711  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27403712 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 27403791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 44 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9122205 - 9122013
Alignment:
Q  44 aaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagct 143  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||    
T  9122205 aaaacaagcaaagaaaattgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagct 9122106  T
Q  144 catccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9122105 catccttttctctcattcttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9122013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 16931539 - 16931718
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16931539 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacnactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 16931638  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16931639 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 16931718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Original strand, 25590360 - 25590532
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |    
T  25590360 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttctaagaggtacttaatttgctcatccttcttcttaagaagttcatccttctctctcatcc 25590459  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtc 234  Q
    ||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25590460 ttcttttaaacccagcatgtattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 25590532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34816825 - 34816655
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  34816825 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 34816726  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34816725 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 34816655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32971526 - 32971358
Alignment:
Q  68 tgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttt 167  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  32971526 tgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatcattttccctcaatcttcttt 32971427  T
Q  168 tgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32971426 tgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 32971358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7669466 - 7669375
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7669466 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttc 7669375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Original strand, 12359298 - 12359460
Alignment:
Q  65 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttc 164  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||| ||| |    
T  12359298 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaatctgatcatccttcttctgaagttcttcattctttgctctcaatctgc 12359397  T
Q  165 ttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggag 227  Q
    |||| ||||| || ||||||||  |||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||    
T  12359398 ttttcagccctgcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggatagaaaggag 12359460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 27385538 - 27385653
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  27385538 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 27385634  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27385635 tctgaagtagctcatcctt 27385653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 27475951 - 27476066
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  27475951 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 27476047  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27476048 tctgaagtagctcatcctt 27476066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 4632012 - 4632127
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  4632012 agaacaaaagtaagaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 4632108  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4632109 tctgaagtagctcatcctt 4632127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32310765 - 32310650
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  32310765 agaacaaaagtaagaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 32310669  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32310668 tctgaagtagctcatcctt 32310650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 27385646 - 27385760
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  27385646 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 27385745  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  27385746 aaggagtgatgtcca 27385760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 27476059 - 27476173
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  27476059 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 27476158  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  27476159 aaggagtgatgtcca 27476173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 4632120 - 4632234
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  4632120 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 4632219  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  4632220 aaggagtgatgtcca 4632234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32310657 - 32310543
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  32310657 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 32310558  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  32310557 aaggagtgatgtcca 32310543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32780289 - 32780124
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    |||||| |||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || || ||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  32780289 ggtgtgaaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 32780190  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  32780189 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 32780124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 40223475 - 40223651
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40223475 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccctcat 40223574  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40223575 tcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 40223651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11404524 - 11404345
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11404524 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 11404425  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11404424 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 11404345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 43346538 - 43346717
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43346538 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 43346637  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43346638 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 43346717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 10268121 - 10268300
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10268121 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccct 10268220  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10268221 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10268300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 10278698 - 10278877
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10278698 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatcctttttctgaagtagctcatccttttccct 10278797  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10278798 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10278877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 35254150 - 35254351
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35254150 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 35254246  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35254247 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 35254346  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  35254347 gtcca 35254351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 35264759 - 35264960
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35264759 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 35264855  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35264856 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 35264955  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  35264956 gtcca 35264960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 27222537 - 27222738
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27222537 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 27222633  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27222634 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 27222733  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  27222734 gtcca 27222738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 29245393 - 29245567
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29245393 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 29245492  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29245493 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 29245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 43083835 - 43084009
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43083835 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 43083934  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43083935 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 43084009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9907236 - 9907060
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  9907236 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttacttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 9907137  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9907136 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 9907060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24337436 - 24337264
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24337436 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttctctcattctt 24337337  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24337336 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24337264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9772407 - 9772231
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  9772407 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 9772308  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9772307 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagtgatgtcca 9772231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 60 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34803447 - 34803301
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34803447 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagttcatccttttccctcat 34803348  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtact 206  Q
    |||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34803347 tcttcttttatacccagcctgaattctagcaacccttgtgatgtact 34803301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 236
Target Start/End: Original strand, 4211085 - 4211254
Alignment:
Q  67 gtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttctt 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211085 gtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttctctcattcttctt 4211184  T
Q  167 ttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||   ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4211185 ttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4211254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22959373 - 22959203
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  22959373 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 22959274  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22959273 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 22959203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21171470 - 21171305
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || || ||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  21171470 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 21171371  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  21171370 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 21171305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28730916 - 28730751
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || || ||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  28730916 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttaatctgctcagactacttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 28730817  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| |||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  28730816 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatcagcttctggatagaaaggagtg 28730751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34799726 - 34799692
Alignment:
Q  202 gtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34799726 gtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 34799692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35759275 - 35759242
Alignment:
Q  203 tactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35759275 tactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 35759242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 36294106 - 36294285
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36294106 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 36294205  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36294206 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 36294285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 209266 - 209087
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  209266 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 209167  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  209166 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 209087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 242989 - 243168
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  242989 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 243088  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  243089 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 243168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 722889 - 722710
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  722889 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 722790  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  722789 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 722710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 796359 - 796538
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  796359 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 796458  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  796459 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 796538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3358318 - 3358139
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3358318 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 3358219  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3358218 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 3358139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 9342311 - 9342490
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9342311 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 9342410  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9342411 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 9342490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15766260 - 15766081
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  15766260 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctaaagtagctcattcttttccct 15766161  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15766160 cattcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 15766081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15790397 - 15790218
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  15790397 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatccgatcatccttcttctaaagtagctcatccttttccct 15790298  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15790297 cattcttcttttatacccagcctgaattctagcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 15790218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 29077887 - 29078066
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29077887 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 29077986  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29077987 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 29078066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32087382 - 32087203
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32087382 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 32087283  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32087282 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 32087203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13687699 - 13687498
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  13687699 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 13687603  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13687602 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 13687503  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  13687502 gtcca 13687498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 36079089 - 36079290
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  36079089 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 36079185  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36079186 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 36079285  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  36079286 gtcca 36079290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 26112468 - 26112642
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26112468 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgttcatccttctgcttaagtagctcatccttttctctcattc 26112567  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26112568 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 26112642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 19129938 - 19130112
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19129938 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctgatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 19130037  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19130038 ttcttttaaacccaacatgaattcttgcagcccttgtaatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 19130112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 6152292 - 6152462
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6152292 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcattcttctttttgagtagctcatccttttccctcaatcttct 6152391  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6152392 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctcgatagaaaggagtgatgtcca 6152462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Original strand, 19226134 - 19226296
Alignment:
Q  65 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttc 164  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || | || | |||||| |||||    
T  19226134 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttctttctgtgctctcagtcttc 19226233  T
Q  165 ttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggag 227  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||    
T  19226234 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggatagaaaggag 19226296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30324333 - 30324171
Alignment:
Q  65 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttc 164  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||  || | |||||| |||||    
T  30324333 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcagtctgtgctctcactcttc 30324234  T
Q  165 ttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggag 227  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||   |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  30324233 ttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataaaaaggag 30324171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 44482281 - 44482396
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  44482281 agaacaaaagtaagaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcagctgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 44482377  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44482378 tctgaagtagctcatcctt 44482396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 44482389 - 44482503
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  44482389 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 44482488  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  44482489 aaggagtgatgtcca 44482503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 204
Target Start/End: Original strand, 19419604 - 19419744
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || |||||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  19419604 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacacttgttccaataagtatttgatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 19419703  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgta 204  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19419704 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgta 19419744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55754895 - 55754716
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55754895 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 55754796  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55754795 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 55754716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10750235 - 10750056
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10750235 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 10750136  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10750135 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10750056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10964004 - 10963825
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10964004 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttagacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 10963905  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10963904 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 10963825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 36019508 - 36019687
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36019508 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaattgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 36019607  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36019608 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 36019687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 24641466 - 24641667
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  24641466 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 24641562  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641563 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 24641662  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  24641663 gtcca 24641667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24027100 - 24026926
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24027100 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattc 24027001  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24027000 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 24026926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 27657799 - 27658000
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  27657799 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 27657895  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27657896 ttttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 27657995  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  27657996 gtcca 27658000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 451752 - 451928
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  451752 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 451851  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  451852 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 451928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 17919294 - 17919466
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17919294 ggtgtgcaactaaggttgggctttcttgtacatctgttccaaaagatacttgatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttccctcattctt 17919393  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17919394 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 17919466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30936155 - 30935979
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  30936155 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 30936056  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  30936055 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 30935979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 21997592 - 21997768
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  21997592 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 21997691  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  21997692 tttccttttatgcccaacatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 21997768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18762162 - 18761969
Alignment:
Q  40 agtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagt 139  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  18762162 agtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatttgttcatctttcttcttaagt 18762066  T
Q  140 agctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18762065 agctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagcccatgtgatgtattcctcttctggatagaaaggagtgatgtcca 18761969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40469654 - 40469482
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40469654 tgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacatttgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 40469555  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtc 234  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  40469554 ttcttttaaatccagcatgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttctagatagaagggagtgttgtc 40469482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19954017 - 19953843
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||    
T  19954017 tgggtgtgcaactaaggttggacttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttgagtagctcatccttttcccttattc 19953918  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  19953917 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactattcttctgggtagaaaggagtgatgtcca 19953843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Original strand, 16257112 - 16257282
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  16257112 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatctttttccctcaatcttct 16257211  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||  |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16257212 tttgtacccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 16257282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 38096204 - 38096383
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38096204 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttctct 38096303  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38096304 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 38096383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51655554 - 51655375
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51655554 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 51655455  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51655454 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 51655375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 7508418 - 7508597
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7508418 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 7508517  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| |||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7508518 cattcttcgtttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 7508597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36246110 - 36245931
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36246110 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttccct 36246011  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36246010 cattcttcttttatatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttatggatagaaaggagtgatgtcca 36245931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 4168401 - 4168575
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4168401 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 4168500  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4168501 ttcttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 4168575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35400244 - 35400043
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35400244 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 35400148  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35400147 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 35400048  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  35400047 gtcca 35400043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35647769 - 35647568
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  35647769 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 35647673  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35647672 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 35647573  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  35647572 gtcca 35647568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 5834323 - 5834524
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5834323 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 5834419  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5834420 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 5834519  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  5834520 gtcca 5834524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47617616 - 47617437
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  47617616 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttcttcttaagtagctcatccttttccct 47617517  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47617516 cattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 47617437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 3172719 - 3172920
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  3172719 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 3172815  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172816 ttttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaatccttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 3172915  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  3172916 gtcca 3172920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 236
Target Start/End: Original strand, 19180085 - 19180259
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19180085 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacatctgttccaagagatacttaatttgctcatccttcttcttaagtagctcatccttttctctcattc 19180184  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19180185 ttcttttaaacccagcatgaattcttgcagcccttgtaatatactcttcttctagatagaaaggagtgatgtcca 19180259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5649429 - 5649257
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5649429 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttgtacatctgttccaaaagatacttaatctgctcatccttcttattgagtagctcatccttttctctcattctt 5649330  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  5649329 cttttatacccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctgggtagaaaggagtgatgtcca 5649257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 12731631 - 12731807
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  12731631 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12731730  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12731731 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 12731807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 60 - 236
Target Start/End: Original strand, 12742224 - 12742400
Alignment:
Q  60 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcat 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  12742224 gttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatctttcttctgaagtagctcatccttttcccttaa 12742323  T
Q  160 tcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    | | |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12742324 tttccttttatgcccagcatgaattcttgcagcccttgtgatgtactcttcttctggatagtaaggagagatgtcca 12742400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 64 - 236
Target Start/End: Original strand, 21864824 - 21864996
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21864824 ggtgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcatccttctttttgagtagctcatccttttccctcattctt 21864923  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21864924 cttttatacccagcatgaattcttgttgcccttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 21864996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12622847 - 12622677
Alignment:
Q  66 tgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttct 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12622847 tgtgcaactaaggttgggtttgcttgtacatctgttccaatagatacttgatttgctcgtccttctttttgagtagctcatccttttccctcattcttct 12622748  T
Q  166 tttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    ||||   ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12622747 tttgtatccagcatgaattcttgttgcccttgagatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 12622677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 153326 - 153158
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| |    
T  153326 ttgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacaactgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcattctttgctctcagt 153227  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  153226 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 153158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 229
Target Start/End: Original strand, 7680401 - 7680568
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||| || | |  || |||  |||||||  | ||| || ||||| |||  |||||||||||||   ||||||||  |||||| ||    
T  7680401 tgggtgtgcaactaaggtttggatagtctaaacacttgttccagtaaatatttaatctgctcagacttcttctgaagttattcatccttggctctcagtc 7680500  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    ||||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||||    
T  7680501 ttcttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaatctgcttctggatagaagggagtg 7680568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 57 - 236
Target Start/End: Original strand, 32310 - 32489
Alignment:
Q  57 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctct 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  32310 agagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttctaagagatacttgatctgatcatccttcttttgaagtagctcatccttttccct 32409  T
Q  157 cattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32410 cattcttcgtttaaatccagcctgaattctagcagccctagtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtcca 32489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41928 - 41763
Alignment:
Q  64 ggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattctt 163  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||  |||||||| |  || |||||||| |||  || ||||||||||   ||||||||  |||||| ||||    
T  41928 ggtgtgcaactaaggtttggatagcttagacatttgttccaataagtatttgatctgctcagactgcttctgaagttcttcatccttggctctcagtctt 41829  T
Q  164 cttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    ||| | |||||  | ||||||||  ||||||||| ||||||  |  |||| ||||| |||||||||    
T  41828 cttctcagcccttcttgaattctatcagcccttgagatgtaaacagcttctggataaaaaggagtg 41763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 46683 - 46482
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  46683 agaacaaaagtaaaaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacagctgttctaagagatacttgatctgttcatctttct 46587  T
Q  132 tctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46586 tcttaagtagctcatccttttccctcattcttcttacatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatatactcttcttcaggatagaaaggagtgat 46487  T
Q  232 gtcca 236  Q
    |||||    
T  46486 gtcca 46482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1216 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold1216
Description:

Target: scaffold1216; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 234
Target Start/End: Original strand, 267 - 439
Alignment:
Q  62 tgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267 tgggtgtgcaactaaggtttggcttgcttatacatttgttccaaaaggtacttaatttgctcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattc 366  T
Q  162 ttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtc 234  Q
    ||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  367 ttcttttaaatccagcatgaattctagcagcccttgtaatgtactcttcttatggatagaaaggagtgttgtc 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0906 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0906
Description:

Target: scaffold0906; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 61 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3599 - 3424
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  3599 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgctctaagagatatctgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttcccttaat 3500  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtcca 236  Q
     |||| ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||    
T  3499 tttctcttatgcccagcatgaattcttgcagctcttgtgatgtattcttcctctgggtagaagggagtgatatcca 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52649 - 52481
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |    
T  52649 ttgggtgtgcaactaaggtttgacttgcttatacatctgttccaatagatacttaatttgctcatccttcttctgaagttgttcatcctttgctctcagt 52550  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtg 229  Q
    || ||||| | |||||| |||||||| |||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52549 ctacttttcaacccagcatgaattctagcagtccttgaaatgtactcatcttctggatagaaaggagtg 52481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3416 - 3250
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | |||| || | |||| | |    
T  3416 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcattctgtgctcttagt 3317  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggag 227  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||  ||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  3316 cttcttttcagcccagcttgaattctatcagctcttgaaatgtaatcatcttctggataaaaaggag 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11671 - 11505
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcatt 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | || |  | | |||| | |    
T  11671 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttatacatctgttccaatagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttctttttgtgctcttagt 11572  T
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggag 227  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||   |||| || ||||| ||||| |||||||    
T  11571 cttcttttcagcccagcttgaattctatcagctcttgaattgtaatcatcttctggataaaaaggag 11505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 150
Target Start/End: Original strand, 2420 - 2535
Alignment:
Q  32 agaacacaagtaaaaacaagctaaaagagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttct 131  Q
    |||||| |||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||    | ||||| ||||||||||    
T  2420 agaacaaaagtaagaacaagcta---gagttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttcttcaactgttctaagagaagtctaatctgttcatccttct 2516  T
Q  132 tctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2517 tctgaagtagctcatcctt 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 236
Target Start/End: Original strand, 2528 - 2642
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |   | || ||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||    
T  2528 tcatccttcttctgaagtagttcttccttctctcttaacttcctcttatgcccagcataaattcttgcagctcttgtgatgtattctgcctctggataga 2627  T
Q  222 aaggagtgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||    
T  2628 aaggagtgatgtcca 2642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2952 - 2863
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctt 150  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2952 ttgggtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccagtagatatttaatctgctcatccttcttctgaagttgttcatcctt 2863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2870 - 2763
Alignment:
Q  122 tcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggataga 221  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||| || ||| ||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||   |||| || ||||| |||||||    
T  2870 tcatccttcttctgaagttgatcattctttgctttcagtcttcttttcagcccagcttgaattctatcagcccttgaagtgtaatcatcttctggataga 2771  T
Q  222 aaggagtg 229  Q
    ||||||||    
T  2770 aaggagtg 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Original strand, 3556 - 3629
Alignment:
Q  161 cttcttttgagcccagcctgaattctcgcagcccttgtgatgtactcttcttcaggatagaaaggagtgatgtc 234  Q
    |||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3556 cttcttttaaacccagcatgtattcttgcagctcttgtgatgtactcttcttctggatagaaaggagtgatgtc 3629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 186
Target Start/End: Original strand, 23758 - 23879
Alignment:
Q  65 gtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatccttttctctcattcttc 164  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | |||  || | || ||| |||||    
T  23758 gtgtgcaactaaggtttggctagcttagacatctgttccaaaagatatttaatctgctcatccttcttttgaagttgttcagtctgtgctgtcactcttc 23857  T
Q  165 ttttgagcccagcctgaattct 186  Q
    |||| |||||| | ||||||||    
T  23858 ttttcagcccatcttgaattct 23879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 61 - 150
Target Start/End: Original strand, 23803 - 23892
Alignment:
Q  61 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgcttatacaactgttccaaaagatacttgatctgatcatccttcttctgaagtagctcatcctt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || || ||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803 ttgggtgtgcaactaaggttgggcttgtttctttaactgctctaagagatgtctaatctgttcatccttcttctgaagtagctcatcctt 23892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University