View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_279 (Length: 245)

Name: NF9913A_low_279
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_279
NF9913A_low_279
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (18-234)||(8274734-8274950)
chr3 (18-234)||(13975380-13975596)
chr3 (18-234)||(15576339-15576555)
chr3 (18-225)||(16743047-16743254)
chr3 (18-225)||(6153183-6153390)
chr3 (25-234)||(17192690-17192899)
chr3 (19-177)||(6712792-6712950)
chr3 (17-234)||(18748258-18748470)
chr3 (19-234)||(267593-267808)
chr3 (128-225)||(21686644-21686741)
chr3 (23-93)||(21686569-21686639)
chr3 (152-222)||(10383692-10383762)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (18-234)||(16233033-16233249)
chr6 (18-234)||(16382614-16382830)
chr6 (18-234)||(1649025-1649241)
chr6 (18-234)||(23996072-23996288)
chr6 (18-234)||(18838149-18838365)
chr6 (17-234)||(18571474-18571691)
chr6 (18-238)||(15078601-15078821)
chr6 (18-234)||(25743328-25743544)
chr6 (55-234)||(16097912-16098090)
chr6 (17-183)||(14129283-14129449)
chr6 (18-234)||(25655307-25655523)
chr6 (18-148)||(21413330-21413458)
chr6 (26-170)||(23124019-23124163)
chr6 (44-225)||(17813573-17813759)
chr6 (152-234)||(21413179-21413261)
chr6 (152-219)||(14131435-14131502)
chr6 (152-222)||(10469102-10469172)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (18-234)||(40249-40465)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (18-234)||(21850876-21851092)
chr8 (18-234)||(16877634-16877850)
chr8 (33-222)||(21197053-21197242)
chr8 (18-234)||(20652872-20653088)
chr8 (20-234)||(22982464-22982678)
chr8 (50-234)||(22315249-22315433)
chr8 (18-198)||(23150974-23151154)
chr8 (17-237)||(25282155-25282376)
chr8 (47-219)||(24818170-24818342)
chr8 (60-177)||(24094210-24094327)
chr8 (152-222)||(804224-804294)
chr8 (152-222)||(6679271-6679341)
chr8 (152-222)||(14565302-14565372)
chr8 (152-222)||(6603818-6603888)
chr8 (152-222)||(16265169-16265239)
chr8 (152-216)||(20388259-20388323)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (18-234)||(7823849-7824065)
chr7 (18-234)||(27107879-27108095)
chr7 (18-234)||(14936296-14936512)
chr7 (18-234)||(15363889-15364105)
chr7 (26-234)||(13378655-13378863)
chr7 (18-225)||(12368690-12368896)
chr7 (18-225)||(21674647-21674854)
chr7 (18-234)||(17923629-17923846)
chr7 (18-225)||(12193505-12193712)
chr7 (18-225)||(45146505-45146711)
chr7 (17-234)||(4439876-4440093)
chr7 (18-224)||(13353100-13353306)
chr7 (33-234)||(17145363-17145564)
chr7 (61-218)||(23641509-23641666)
chr7 (25-192)||(20466738-20466905)
chr7 (152-222)||(8212223-8212293)
chr7 (152-222)||(11306358-11306428)
chr7 (152-222)||(26118700-26118770)
chr7 (152-222)||(49152385-49152455)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (18-234)||(14997276-14997492)
chr4 (18-234)||(15293253-15293469)
chr4 (18-234)||(16445308-16445524)
chr4 (18-234)||(13247605-13247821)
chr4 (18-234)||(55375454-55375670)
chr4 (18-234)||(9290795-9291011)
chr4 (25-234)||(12132505-12132714)
chr4 (18-122)||(37955999-37956102)
chr4 (25-225)||(16685221-16685421)
chr4 (43-105)||(12343061-12343123)
chr4 (152-222)||(3264902-3264972)
chr4 (149-234)||(12342959-12343044)
chr4 (152-222)||(20891076-20891146)
chr4 (152-222)||(29453645-29453715)
chr4 (149-222)||(33223009-33223082)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (18-234)||(20831560-20831776)
chr1 (41-234)||(46518719-46518912)
chr1 (18-234)||(20914185-20914401)
chr1 (19-211)||(22142232-22142424)
chr1 (17-234)||(21202455-21202672)
chr1 (128-181)||(20184266-20184319)
chr1 (152-222)||(20294521-20294591)
chr1 (152-222)||(31550361-31550431)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (18-234)||(21937466-21937682)
chr5 (18-234)||(24581085-24581301)
chr5 (18-234)||(27010959-27011174)
chr5 (18-234)||(11210972-11211188)
chr5 (18-224)||(23503317-23503523)
chr5 (44-234)||(24516460-24516649)
chr5 (152-222)||(22502687-22502757)
chr5 (152-222)||(14887281-14887351)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (18-234)||(46145-46361)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (18-234)||(98006-98222)
scaffold0037 (17-234)||(23565-23782)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (18-234)||(1009-1225)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (18-234)||(23385-23601)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (18-234)||(12640555-12640771)
chr2 (18-234)||(22275870-22276086)
chr2 (19-234)||(24831823-24832038)
chr2 (26-234)||(23817729-23817937)
chr2 (18-234)||(24570304-24570520)
chr2 (18-225)||(28144554-28144761)
chr2 (18-234)||(22762205-22762421)
chr2 (18-234)||(25128238-25128454)
chr2 (92-225)||(21908936-21909069)
chr2 (152-222)||(1063476-1063546)
chr2 (152-222)||(11358522-11358592)
chr2 (152-222)||(20832710-20832780)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (21-234)||(106672-106885)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (22-234)||(8090-8302)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (18-234)||(14648-14864)
scaffold0132 (18-224)||(43529-43735)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (17-234)||(485-702)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (18-222)||(28377-28581)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (18-201)||(44578-44761)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (19-234)||(122049-122264)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (18-234)||(7909-8126)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (18-234)||(8990-9206)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (41-237)||(3173-3369)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (18-234)||(23871-24087)
scaffold0008 (18-234)||(231549-231765)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (26-234)||(78728-78936)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (18-234)||(12899-13115)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (41-234)||(3974-4167)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (18-234)||(14514-14730)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (18-234)||(1153-1369)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (18-234)||(4043-4259)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (26-234)||(33094-33301)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (55-234)||(10383-10562)
scaffold0447 (55-225)||(5769-5939)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (22-217)||(10425-10620)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (55-225)||(8378-8548)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (55-225)||(14845-15014)
scaffold0310 (18-123)||(5370-5475)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (18-234)||(22692-22901)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (18-234)||(432-648)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (18-225)||(16279-16485)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (25-234)||(8985-9194)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (18-234)||(14121-14337)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (26-234)||(10655-10863)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (18-234)||(13242-13458)
scaffold0021 (50-234)||(6333-6517)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (41-171)||(5189-5319)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (17-234)||(73891-74107)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (18-110)||(1177-1269)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (55-183)||(13988-14116)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (41-234)||(370239-370431)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (137-225)||(7278-7366)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (17-93)||(78339-78415)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (37-99)||(1001-1063)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (152-222)||(26386-26456)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (152-219)||(7150-7217)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (152-222)||(43630-43700)
scaffold0114 (152-222)||(44642-44712)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (152-222)||(16801-16871)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (152-222)||(16824-16894)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (152-222)||(49318-49388)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (152-217)||(6030-6095)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8274950 - 8274734
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8274950 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 8274851  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8274850 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 8274751  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  8274750 tcaccaacttgaaactc 8274734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13975596 - 13975380
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13975596 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 13975497  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13975496 ctcaatgacatcaaacggcccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 13975397  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  13975396 tcaccaacttgaaactc 13975380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 15576339 - 15576555
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15576339 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtatgctacaaccccaacctt 15576438  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15576439 ctcaatcacatcaaacagcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 15576538  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  15576539 tcaccaacctgaaactc 15576555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16743254 - 16743047
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16743254 catcatgcacatacttcctcaactaagacacatgaaaaacattatgaagattggacaaagacagtggtaacacaatccaatacgctacaaccccaacctt 16743155  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16743154 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 16743055  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  16743054 tcaccaac 16743047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6153390 - 6153183
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||    
T  6153390 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgaaaaagatggtggcaatgcaatccgatacgctacaacctcgacctt 6153291  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6153290 ctcaataacatcaaacggtccgacaaaacgaggagtcaactttctgcacttcaaagcacgaccgacaccggtcacatgattcactctcagaaacacatga 6153191  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  6153190 tcaccaac 6153183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 17192690 - 17192899
Alignment:
Q  25 cacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatg 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  17192690 cacatacttcctcaattgagacacatgaaacacatcatgaagatttgacaaagacagtggtagcgcaatccggtacgctacaaccccaaccttctcaaca 17192789  T
Q  125 acatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaa 224  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||  |||||   ||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  17192790 acatcaaaaggcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcagagaacatccaacattggttacaagattcactctaaaaaacacatgatcaccaa 17192889  T
Q  225 cacgaaactc 234  Q
    |  |||||||    
T  17192890 cctgaaactc 17192899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6712950 - 6712792
Alignment:
Q  19 atcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 118  Q
    ||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6712950 atcatacacatacttccgcaactgagtcacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatctgatacgctacaaccccaaccttc 6712851  T
Q  119 tcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacg 177  Q
    ||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  6712850 tcaataatctcaaacggaccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacg 6712792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 18748258 - 18748470
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    ||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     ||||| |||||    
T  18748258 acatcatacacatactttcgcaactgagacacatgaaacacaccatgcagattcgacaaagacggtgctaacgcaatccgatac-----aaccctaacct 18748352  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    ||| ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || | |||||||||    
T  18748353 tcttaataatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatg 18748452  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||  |||||||    
T  18748453 atcaccaacttgaaactc 18748470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 267808 - 267593
Alignment:
Q  19 atcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||  | ||||||||||| || || ||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||    | |||||||    
T  267808 atcatacacatacttcctcagcttagacacatgaaacaaataatgaagattcggcaacgacggcggtagcgcaatccgatacgctactgatctaaccttc 267709  T
Q  119 tcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgat 218  Q
    ||||| |  |||||||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| || |  |||| ||| | || ||||| ||||||| |||||||||||    
T  267708 tcaataatctcaaacggtccaacaaaacacggtgttaacctcctacacttcaaatcatgttcaacaccgattactggattaaccctcaaaaacacatgat 267609  T
Q  219 caccaacacgaaactc 234  Q
    | |||||  |||||||    
T  267608 ctccaacttgaaactc 267593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 225
Target Start/End: Original strand, 21686644 - 21686741
Alignment:
Q  128 tcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||    
T  21686644 tcaaacagtccaacaaaacaaggtgtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacatcggttacatgattcactctaaaaaatacatgatcaccaac 21686741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Original strand, 21686569 - 21686639
Alignment:
Q  23 tgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaat 93  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  21686569 tgcacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagattagacaacgacgacggtaacgcaat 21686639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 10383692 - 10383762
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  10383692 gtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 10383762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 16233033 - 16233249
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233033 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 16233132  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16233133 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatga 16233232  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  16233233 tcaccaacttgaaactc 16233249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16382830 - 16382614
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16382830 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 16382731  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16382730 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 16382631  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  16382630 tcaccaacttgaaactc 16382614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1649241 - 1649025
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1649241 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 1649142  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1649141 ctcaatcacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcccacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 1649042  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  1649041 tcaccaacttgaaactc 1649025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 23996072 - 23996288
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996072 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 23996171  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||    
T  23996172 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtga 23996271  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  23996272 tcaccaacttgaaactc 23996288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18838365 - 18838149
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18838365 catcatgcacatacttcctcaacttaggcacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 18838266  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  18838265 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatga 18838166  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  18838165 tcaccaacttgaaactc 18838149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 18571474 - 18571691
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18571474 acatcatgcacatacttcctcaactgagacacattaaatacattatgaagattctacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 18571573  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  18571574 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtctacttcctatacttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatg 18571673  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||  |||||||    
T  18571674 atcaccaacttgaaactc 18571691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15078821 - 15078601
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15078821 catcatacacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagatttgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 15078722  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |||| ||| ||||||    
T  15078721 ctcaacaacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatga 15078622  T
Q  218 tcaccaacacgaaactcgata 238  Q
    ||||||||  |||||||||||    
T  15078621 tcaccaacctgaaactcgata 15078601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25743544 - 25743328
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25743544 catcatgtacatacttcctcaactgagacacatgaaacatatgatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatatgctacaaccccaacctt 25743445  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||    
T  25743444 ctcaataacatcaaatggtgcaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttga 25743345  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  25743344 tcaccaacttgaaactc 25743328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Original strand, 16097912 - 16098090
Alignment:
Q  55 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtc 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||    
T  16097912 cacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatcacatcaaacgtcc-aacaaaacgaggagtc 16098010  T
Q  155 aacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  16098011 aacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactc 16098090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 183
Target Start/End: Original strand, 14129283 - 14129449
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14129283 acatcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 14129382  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaac 183  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14129383 tctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgaccaac 14129449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 25655307 - 25655523
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25655307 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 25655406  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |  ||||| || ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |   ||||||| |||| ||||||||||    
T  25655407 ctcaataatctcaaatggtccaacaaaacggggagttaacttccgacagttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatga 25655506  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  25655507 tcaccaacctgaaactc 25655523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21413458 - 21413330
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21413458 catcatacacatacttcctcaactgagaca--tgaaacacatcatgaagattcgacaaatatggtggcaacgcaatgcgatacgctacaaccccaacctt 21413361  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacga 148  Q
    |||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  21413360 ctcaacaacatcaaacggtctaacaaaacga 21413330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 170
Target Start/End: Original strand, 23124019 - 23124163
Alignment:
Q  26 acatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatga 125  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |  |    
T  23124019 acatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatggagattcgataacgacggaggtaatacaatccgatacgctacaactcccaccttctctacta 23124118  T
Q  126 catcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttca 170  Q
      |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23124119 tctcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttcttacacttca 23124163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 44 - 225
Target Start/End: Original strand, 17813573 - 17813759
Alignment:
Q  44 gacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaa-----tgacatcaaacggccc 138  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||     | | || |||  | ||    
T  17813573 gacacatgaaacacatcatgaagattcgacaacgacggtagtaatgcaatccgatacgctaccactccaaccttctcaacaatttcaaattaaatagtcc 17813672  T
Q  139 aacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  || ||||| ||||| ||| ||||||| || |  | |||||||||||||||    
T  17813673 aacaaaacgaggtgttaacttctgacatttcaaagtgcgtccaacaccggttacatgattcactcttaagatcacatgatcaccaac 17813759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21413261 - 21413179
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||  |||||||    
T  21413261 gtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactc 21413179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14131502 - 14131435
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatc 219  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  14131502 gtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatgatc 14131435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10469172 - 10469102
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  10469172 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 10469102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 40249 - 40465
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40249 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 40348  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40349 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 40448  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  40449 tcaccaacttgaaactc 40465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21851092 - 21850876
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21851092 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 21850993  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21850992 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 21850893  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  21850892 tcaccaacttgaaactc 21850876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16877850 - 16877634
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16877850 catcatgcacatacttcctcaactaagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 16877751  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  16877750 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatga 16877651  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    || |||||  |||||||    
T  16877650 tctccaacctgaaactc 16877634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21197242 - 21197053
Alignment:
Q  33 tcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaa 132  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  21197242 tcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacgatggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccgtctcaacaacatcaaa 21197143  T
Q  133 cggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21197142 cggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacc 21197053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20653088 - 20652872
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20653088 catcatacacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagattcgacaacgatggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 20652989  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  20652988 ctcaaccacatcaaacggtccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatga 20652889  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  20652888 tcaccaacttgaaactc 20652872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 20 - 234
Target Start/End: Original strand, 22982464 - 22982678
Alignment:
Q  20 tcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttct 119  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  22982464 tcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcggcaaagatggtggcaacgcaatccgatacgctacaaccccaatttcct 22982563  T
Q  120 caatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatc 219  Q
    |||  ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| || | |||| |||||||    
T  22982564 caacaacatcaaacggtccgacaaaacgaggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatc 22982663  T
Q  220 accaacacgaaactc 234  Q
    ||||||  |||||||    
T  22982664 accaacctgaaactc 22982678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Original strand, 22315249 - 22315433
Alignment:
Q  50 tgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgag 149  Q
    |||| ||||| ||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| || |||||||||||||    
T  22315249 tgaaacacatcatgtaaattcgacaacgatggtggtaacgcaatccgatatgctacaaccccaaccttctcaataatctcaaatggtccaacaaaacgag 22315348  T
Q  150 gtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  22315349 gagtcaacttccgacacttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactc 22315433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 23150974 - 23151154
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23150974 catcatacacatacttccgcaattgagacacatgaaacatatcatgaagattcgacaaagacgatggtaacgcattctgatacgctacaaccccaacctt 23151073  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggatt 198  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||||    
T  23151074 ctcaacaacatcaaaaggaccaacaaaatgaggagtcgacttcctacactttaaagcacgcccaacaccagttacaggatt 23151154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 237
Target Start/End: Original strand, 25282155 - 25282376
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaa-gacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacc 115  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||| |  ||||||||| |||| |||||| | |||||     
T  25282155 acatcatacacatacttcctcaattgagatacatgaaacacatcatgaaaattcgaaaaacgacggcgaaaacgcaatctgatatgctacatctccaaca 25282254  T
Q  116 ttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacat 215  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||||||||  | ||||||||||  |||| |||||| ||| ||||| | ||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  25282255 ttctcaataaactcaaacagcccaacaaaacacgctgtcaacttctaacacatcaaagtacgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacat 25282354  T
Q  216 gatcaccaacacgaaactcgat 237  Q
    ||||||||||  ||||||||||    
T  25282355 gatcaccaacttgaaactcgat 25282376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24818342 - 24818170
Alignment:
Q  47 acatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaac 146  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||||  ||||| || |||| ||||     
T  24818342 acatgaaatacactatgaagattcgacaacaacggcggcaacgcaatccgatacgctactgctcccactttctcaatgatctcaaatggaccaataaaat 24818243  T
Q  147 gaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatc 219  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||  | ||||| || | ||||||||||||    
T  24818242 atggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgttcgacaccggtcacgaggttcactcttaaaaacacatgatc 24818170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 24094210 - 24094327
Alignment:
Q  60 tatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaactt 159  Q
    |||||||||||||||| |||||  | || | ||||||||||| |||||| ||||||||||  || |  | |||| | ||||  ||||| |||||||||||    
T  24094210 tatgaagattcgacaacgacggaagcaatgaaatccgatacggtacaactccaaccttcttgataatcttaaacagaccaagtaaacgtggtgtcaactt 24094309  T
Q  160 cctacacttcaaagcacg 177  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24094310 cctacacttcaaagcacg 24094327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 804294 - 804224
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  804294 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 804224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 6679271 - 6679341
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  6679271 gtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 6679341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 14565302 - 14565372
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  14565302 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 14565372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 6603818 - 6603888
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  6603818 gtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 6603888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16265239 - 16265169
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  16265239 gtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaagacatgatcacc 16265169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 20388259 - 20388323
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||  || | || ||||||||||||||    
T  20388259 gtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatg 20388323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 7823849 - 7824065
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7823849 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 7823948  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7823949 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 7824048  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  7824049 tcaccaacttgaaactc 7824065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27108095 - 27107879
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27108095 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 27107996  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27107995 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 27107896  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  27107895 tcaccaacttgaaactc 27107879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 14936296 - 14936512
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14936296 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgataaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14936395  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  14936396 ctcaataacctcaaacggtcccacaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatga 14936495  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  14936496 tcaccaacctgaaactc 14936512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 15363889 - 15364105
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15363889 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattctataaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 15363988  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| || |||||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  15363989 ctcaataacctcaaacggtcccacaaaacaaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatga 15364088  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  15364089 tcaccaacctgaaactc 15364105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 13378655 - 13378863
Alignment:
Q  26 acatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatga 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  13378655 acatacttcctcaattgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgaaatccgatacactacaaccccaaccgtctcaacaa 13378754  T
Q  126 catcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13378755 catcaaacggtccaacaaaacaaggagtcaacttccgacaattcaaagcacgaccaactcaagttataggattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 13378854  T
Q  226 acgaaactc 234  Q
      |||||||    
T  13378855 ctgaaactc 13378863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12368896 - 12368690
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12368896 catcatgcacatacttcctcaactaagacacatgaaacacatcatgaagatttgacaaagacggtggcaatgtaatccgatacgctacaaccccaacctt 12368797  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  12368796 atcaataacatcaaacggtccaac-aaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtga 12368698  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  12368697 tcaccaac 12368690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21674854 - 21674647
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21674854 catcatacacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctgcaaccccaacctt 21674755  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||  ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  21674754 ctcaataatctcaaaaggtccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatga 21674655  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  21674654 tcaccaac 21674647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 17923629 - 17923846
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17923629 catcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgtaaattcgacaaaggcggtggtaacgcaatccgatacgctgcaaccccaacctt 17923728  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcac-cctcagaaacacatg 216  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| | | | |||||||||    
T  17923729 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatg 17923828  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||  |||||||    
T  17923829 atcaccaacctgaaactc 17923846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 12193505 - 12193712
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12193505 catcatacacatatttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaatatcgtggtaacgtaatccgatatgctacaaccccaacctt 12193604  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12193605 ctcaacaatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccggcatttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatga 12193704  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  12193705 tcaccaac 12193712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 45146505 - 45146711
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45146505 catcatacacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaatgtaatccgatacgctaaaaccccaacctt 45146604  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||  |||| ||||||||||    
T  45146605 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatga 45146703  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  45146704 tcaccaac 45146711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 4439876 - 4440093
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  4439876 acatcatacacatacttcctcaactcagacacatgaaacacatcatgtaaatttgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaactgcaacct 4439975  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    ||||||| |  ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || |||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  4439976 tctcaataatctcaaatggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatg 4440075  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||  |||||||    
T  4440076 atcaccaacctgaaactc 4440093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 13353100 - 13353306
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13353100 catcatacacatacttcctcaactgagacacgtgaaacacgtcatgtaagttcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccccaacctt 13353199  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |  | ||| || |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  13353200 ctcaataagcttaaatggtccaacaaaacgaggagtcaactttcaacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaaga 13353299  T
Q  218 tcaccaa 224  Q
    |||||||    
T  13353300 tcaccaa 13353306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17145564 - 17145363
Alignment:
Q  33 tcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaa 132  Q
    ||||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |  |||||    
T  17145564 tcctcaattggaatacatgaaacacatcatgaagatttgacaacgatggcggtaacacaatccgatacgctacaactccaacattctaaataatctcaaa 17145465  T
Q  133 cggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaac 232  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||| |||  |||||| || | |||||||||| | |||||  |||||    
T  17145464 cggtccaataaaacagggtgtcaacttccgacactccaaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaac 17145365  T
Q  233 tc 234  Q
    ||    
T  17145364 tc 17145363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 61 - 218
Target Start/End: Original strand, 23641509 - 23641666
Alignment:
Q  61 atgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttc 160  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |  |||||||| |||| ||||||  ||||||||||     
T  23641509 atgaagattcgacaatgatggcggcaacgcaatccgatacgctacagctccaaccttctctataatctcaaacggtccaataaaacgcagtgtcaacttt 23641608  T
Q  161 ctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgat 218  Q
    | |||||| |||| ||| ||||| ||||| | | ||||||| || | ||||| |||||    
T  23641609 cgacacttaaaagaacgtccaacaccggttatatgattcactctgaaaaacatatgat 23641666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 192
Target Start/End: Original strand, 20466738 - 20466905
Alignment:
Q  25 cacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatg 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||  | |||||  |||| ||     
T  20466738 cacatacttccgcaattgagacacatgatacacactatgaagattcgacaacgatagtggtaacgcaatctgatatgctactgctccaactctctctata 20466837  T
Q  125 acatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcac 192  Q
    |  ||| | |  |||||||||| ||| || || ||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20466838 atttcatatgatccaacaaaactaggcgttaatttcatcgacttcaaagcacgaccaacaccggtcac 20466905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8212293 - 8212223
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  8212293 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 8212223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11306428 - 11306358
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  11306428 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 11306358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26118770 - 26118700
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  26118770 gtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26118700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 49152385 - 49152455
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  |||||||||| || ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  49152385 gtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 49152455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 14997276 - 14997492
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997276 catcattcacatacttcctcaactgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14997375  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14997376 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatga 14997475  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  14997476 tcaccaacttgaaactc 14997492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15293469 - 15293253
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15293469 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 15293370  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15293369 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatga 15293270  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  15293269 tcaccaacttgaaactc 15293253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16445524 - 16445308
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445524 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 16445425  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16445424 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatga 16445325  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  16445324 tcaccaacttgaaactc 16445308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 13247605 - 13247821
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13247605 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 13247704  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  13247705 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatga 13247804  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  13247805 tcaccaacttgaaactc 13247821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 55375670 - 55375454
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55375670 catcatgcacgtacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 55375571  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  55375570 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgagaagtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatga 55375471  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  55375470 tcaccaacttgaaactc 55375454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 9290795 - 9291011
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9290795 catcatgtacatactttctcaattgagacacatgaaacacattatgaagattctacaaagatggtggtaacgcaatttgatacgctacaaccccaacctt 9290894  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| || |||    
T  9290895 ctcaataacatcaaacggtccaacgaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctga 9290994  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  9290995 tcaccaacctgaaactc 9291011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12132714 - 12132505
Alignment:
Q  25 cacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatg 124  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12132714 cacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaggattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctccata 12132615  T
Q  125 acatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaa 224  Q
    |  || ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12132614 atctccaacggtccaacaaaacgaggagtcaactttcgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaa 12132515  T
Q  225 cacgaaactc 234  Q
    |  |||||||    
T  12132514 cttgaaactc 12132505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37956102 - 37955999
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37956102 catcatacacatacttcctcaattgagacacataaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaa-cccaacctt 37956004  T
Q  118 ctcaa 122  Q
    |||||    
T  37956003 ctcaa 37955999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 225
Target Start/End: Original strand, 16685221 - 16685421
Alignment:
Q  25 cacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatg 124  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||| || |||||  || | |  |||||||||| ||     
T  16685221 cacatacttcctcaactgagatacataaaacacatcatgaagattcaacgacgacggcggtaacgcagtctgatacaatatagcttcaaccttctctata 16685320  T
Q  125 acatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaa 224  Q
    |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  16685321 atctcaaacggcccaacaaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaa 16685420  T
Q  225 c 225  Q
    |    
T  16685421 c 16685421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12343123 - 12343061
Alignment:
Q  43 agacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctac 105  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12343123 agacacatgaaacacatcttgaagatttgacaaagacggtggtaacgcaattcgatacgctac 12343061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3264972 - 3264902
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  3264972 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 3264902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12343044 - 12342959
Alignment:
Q  149 ggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||| ||||||| ||| || | ||| ||||||||||||||  |||||||    
T  12343044 ggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgtctaacatcggttacaggatacactctaaaaaatacatgatcaccaacctgaaactc 12342959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 20891076 - 20891146
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  20891076 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 20891146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29453715 - 29453645
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  29453715 gtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 29453645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 149 - 222
Target Start/End: Original strand, 33223009 - 33223082
Alignment:
Q  149 ggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| || || || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  33223009 ggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 33223082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20831776 - 20831560
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20831776 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 20831677  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20831676 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 20831577  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  20831576 tcaccaacttgaaactc 20831560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Original strand, 46518719 - 46518912
Alignment:
Q  41 tgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46518719 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 46518818  T
Q  141 caaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  46518819 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 46518912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 20914185 - 20914401
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20914185 catcatgcacatacttcctcaactgagacgcatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaattcgatacgctacaaccccaacctt 20914284  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20914285 cacaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatga 20914384  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  20914385 tcaccaacttgaaactc 20914401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22142424 - 22142232
Alignment:
Q  19 atcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22142424 atcatacacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacagtggtaacacaatctgatacgctacaaccccaaccttc 22142325  T
Q  119 tcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaac 211  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  22142324 tcaataacctcaaatggtccaacaaaatgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21202672 - 21202455
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21202672 acatcatacacatacttccgcaagtgagacacatgaaacacaacaagaagattcgacaacgatggcggtaacgcaatccgatacgctacaactccaactt 21202573  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    |||| |  |  ||||| || | ||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||| |||    
T  21202572 tctcgacaatctcaaaaggtctaacaaaatgcaatgtcaacttccgacacttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatg 21202473  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||  |||||||    
T  21202472 atcaccaacctgaaactc 21202455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 181
Target Start/End: Original strand, 20184266 - 20184319
Alignment:
Q  128 tcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgacca 181  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20184266 tcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgacca 20184319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 20294521 - 20294591
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  20294521 gtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 20294591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31550431 - 31550361
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  31550431 gtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 31550361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21937682 - 21937466
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21937682 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaacctt 21937583  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21937582 ctcaatgacatcaaacagcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatga 21937483  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  21937482 tcaccaacttgaaactc 21937466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 24581085 - 24581301
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24581085 catcatgcacatacttcctcaactcagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 24581184  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  24581185 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtga 24581284  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  24581285 tcaccaacttgaaactc 24581301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 27010959 - 27011174
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27010959 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagatttgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaacctt 27011058  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27011059 ctcaatgacatcaaacgg-ccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatga 27011157  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  27011158 tcaccaacttgaaactc 27011174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11211188 - 11210972
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11211188 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattgtgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgccacaaccccaacctt 11211089  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11211088 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 11210989  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  11210988 tcaccaacttgaaactc 11210972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 23503317 - 23503523
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23503317 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccctaacctt 23503416  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  23503417 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggattcaacttcctacacttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatga 23503516  T
Q  218 tcaccaa 224  Q
    |||||||    
T  23503517 tcaccaa 23503523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 234
Target Start/End: Original strand, 24516460 - 24516649
Alignment:
Q  44 gacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaa 143  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||| || ||  | | |||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||  |  |||||||| | |||||    
T  24516460 gacacaagaaacgcatcatgaagattcgataacgatagcgataacgcaa-ccgacacgttacaactccaaccttctcaacaatctcaaacggtcaaacaa 24516558  T
Q  144 aacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    || | ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| || || |  | |||||||||||||||  |||||||    
T  24516559 aatgtggtgtcaacttccgatacttcaaagcacgtccaacaccggttacatgatttactctaaagagcacatgatcaccaacctgaaactc 24516649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 22502687 - 22502757
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  22502687 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 22502757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14887351 - 14887281
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  14887351 gtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 14887281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 46145 - 46361
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46145 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacagccccaacctt 46244  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  46245 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatga 46344  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  46345 tcaccaacttgaaactc 46361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 98006 - 98222
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98006 catcatgcacataattcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 98105  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||    
T  98106 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtga 98205  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  98206 tcaccaacttgaaactc 98222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23782 - 23565
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23782 acatcatgcacaaacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaatcccaacct 23683  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23682 tctcaataacatcaaacggtccaataaaatggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatg 23583  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||| |||||||    
T  23582 atcaccaacatgaaactc 23565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1009
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225 catcatgcacttacttcctcaactgagatacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 1126  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1125 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatga 1026  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  1025 tcaccaacttgaaactc 1009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 23385 - 23601
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23385 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagaaggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 23484  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||    
T  23485 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgagcagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtga 23584  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||| |||  |||||||    
T  23585 tcactaacttgaaactc 23601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12640771 - 12640555
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12640771 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 12640672  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  12640671 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatga 12640572  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    || |||||  |||||||    
T  12640571 tctccaacctgaaactc 12640555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 22275870 - 22276086
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22275870 catcatgtacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 22275969  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22275970 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatga 22276069  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  22276070 tcaccaacctgaaactc 22276086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24832038 - 24831823
Alignment:
Q  19 atcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 118  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24832038 atcatgcacatgcttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaatccggtacgctacaaccccaaccttc 24831939  T
Q  119 tcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgat 218  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24831938 ttaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgat 24831839  T
Q  219 caccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||  |||||||    
T  24831838 caccaacttgaaactc 24831823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23817937 - 23817729
Alignment:
Q  26 acatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatga 125  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23817937 acatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcggcaaagttggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataa 23817838  T
Q  126 catcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    | ||||| || || ||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23817837 cctcaaatggtcctacaaaactaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 23817738  T
Q  226 acgaaactc 234  Q
      |||||||    
T  23817737 ctgaaactc 23817729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24570520 - 24570304
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24570520 catcgtgcacgtacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccaatacgctacaaccccaacctt 24570421  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||  || ||||||    
T  24570420 ctcaacaacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatga 24570321  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  24570320 tcaccaacctgaaactc 24570304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 28144554 - 28144761
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| |||  || ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28144554 catcatacacatacttccgtaactgagaaacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 28144653  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  28144654 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaacgatgagttaacttcctacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaagattcactctcaaaaacacatga 28144753  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    ||||||||    
T  28144754 tcaccaac 28144761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22762421 - 22762205
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22762421 catcatacacaaacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattggacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 22762322  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  ||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| | |||||||||| |||||| ||| || || ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22762321 ctcaacaacatcaaacggtccaccaaaatgaggagtcaactttcgacacttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatga 22762222  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  22762221 tcaccaacctgaaactc 22762205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 25128238 - 25128454
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25128238 catcatacacatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgataaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 25128337  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |  |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||| || |||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  25128338 ctcaataatctcaaacggtccaacaaaaagaggagtaaactttcgacaattcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatga 25128437  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  25128438 tcaccaacttgaaactc 25128454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21909069 - 21908936
Alignment:
Q  92 atccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtca 191  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| || || |    
T  21909069 atccaatacgctacaactccgactttctctataatctcaaatggtccaacaaaatgcggtgtcaacttccggcacttcaaatcacgtccaacaccagtta 21908970  T
Q  192 caggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    |  ||||||| || | ||||||||||||| ||||    
T  21908969 cgtgattcactctaaaaaacacatgatcatcaac 21908936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 1063476 - 1063546
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  1063476 gtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 1063546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11358592 - 11358522
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| |||| | || |||||||| |||||||||||    
T  11358592 gtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcacc 11358522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 20832710 - 20832780
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||| |||||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  20832710 gtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 20832780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 106885 - 106672
Alignment:
Q  21 catgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctc 120  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  106885 catgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctacaaccccaaccttctc 106786  T
Q  121 aatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatca 220  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  106785 aataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatca 106686  T
Q  221 ccaacacgaaactc 234  Q
    |||||  |||||||    
T  106685 ccaacttgaaactc 106672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 234
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8302
Alignment:
Q  22 atgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctca 121  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8090 atgcatatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctca 8189  T
Q  122 atgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcac 221  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  8190 ataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcac 8289  T
Q  222 caacacgaaactc 234  Q
    ||||  |||||||    
T  8290 caacttgaaactc 8302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 14648 - 14864
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14648 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagatgatggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14747  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14748 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatga 14847  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  14848 tcaccaacttgaaactc 14864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 43529 - 43735
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  43529 catcatgcacgtacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacactacaaccctaacctt 43628  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43629 ctcaataacatcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaatttcctacactttaaagcacgaccaactacggttacaggattcaccgtcaaaaacacatga 43728  T
Q  218 tcaccaa 224  Q
    |||||||    
T  43729 tcaccaa 43735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 702 - 485
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  702 acatcatgaacatacttccttaactgagacacatgaaatacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 603  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  602 tctcaatgacatcaaacgttccaacaaaacgaggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatg 503  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    | |||||||  |||||||    
T  502 agcaccaacttgaaactc 485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28581 - 28377
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    ||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28581 catcatgtacttacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatcctatacgctacaaccccaacctt 28482  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28481 ctcaataacatcaaacggtccaacaaatcgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatga 28382  T
Q  218 tcacc 222  Q
    |||||    
T  28381 tcacc 28377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 44761 - 44578
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  44761 catcatgcacatacttcctcaattgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaacctcaacctg 44662  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcac 201  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44661 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcac 44578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 122264 - 122049
Alignment:
Q  19 atcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttc 118  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  122264 atcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatcctatacgctacatccccaaccttc 122165  T
Q  119 tcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgat 218  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  122164 tcaattacattaaatggtccaacaaaatgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgat 122065  T
Q  219 caccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||  |||||||    
T  122064 caccaacttgaaactc 122049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8126 - 7909
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8126 catcatgcacatacttcctcaactaagacccatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggcaacgcaattcggtacgctacaaccccaacctt 8027  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggc-ccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
     ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8026 ttcaatcacatcaaacggtaccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatg 7927  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||||||||  |||||||    
T  7926 atcaccaacttgaaactc 7909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9206 - 8990
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9206 catcatacacatacttcctcaattgagatacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccccaacctt 9107  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  9106 ctcaataacctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatga 9007  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  9006 tcaccaacctgaaactc 8990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 3173 - 3369
Alignment:
Q  41 tgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 140  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3173 tgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaacgacatcaaacggtccaa 3272  T
Q  141 caaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactcgat 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3273 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgat 3369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 23871 - 24087
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871 catcatgaacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 23970  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || | ||||||||||    
T  23971 ctcaataacatcaaacggtctaacaaaacaaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatga 24070  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  24071 tcaccaacctgaaactc 24087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 231549 - 231765
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | || | ||||||    
T  231549 catcatacacatacttccgcaactgaaacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcattctgatacgctgccactctaacctt 231648  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
     | ||  |  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||||||| || | ||||||||||    
T  231649 tttaacaatctcatacggtccaacaaaacgaggtgtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacacatgttacatgattcactctaaaaaacacatga 231748  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  231749 tcaccaacctgaaactc 231765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78936 - 78728
Alignment:
Q  26 acatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatga 125  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  78936 acatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagatttgacatagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctctataa 78837  T
Q  126 catcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  78836 catcaaaccgtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 78737  T
Q  226 acgaaactc 234  Q
      |||||||    
T  78736 ttgaaactc 78728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 12899 - 13115
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  12899 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgaaatccgatacgctacaacacaaaccat 12998  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||||    
T  12999 ctcaatgacataaaaaggaccaaaaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatga 13098  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  13099 tcaccaacctgaaactc 13115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4167 - 3974
Alignment:
Q  41 tgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 140  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4167 tgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaatgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaa 4068  T
Q  141 caaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||  |||||||    
T  4067 ctaaacgaggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactc 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 14514 - 14730
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| || |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14514 catcatacatatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 14613  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  14614 ctcaataacctcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatga 14713  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    || |||||  |||||||    
T  14714 tccccaacctgaaactc 14730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1369 - 1153
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1369 catcatacacatacttcctcaactgagatacattaatcacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 1270  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || | ||| ||||||    
T  1269 ctcaataacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatga 1170  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    || |||||  |||||||    
T  1169 tcgccaaccagaaactc 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4259 - 4043
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  4259 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattctacaaagacggtggcaacgcaatccgacactctacaaccctaacctt 4160  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||| |||| ||||||||||    
T  4159 ctcaataacatcaaatggtccaacaaaacgaggagtcaaattcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatga 4060  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  4059 tcaccaacctgaaactc 4043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33301 - 33094
Alignment:
Q  26 acatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatga 125  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  33301 acatacttcctcaactgagacacatgatacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgata-gctacaaccccaaccttctcagtta 33203  T
Q  126 catcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    ||||||||   |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33202 catcaaacaatccaacaaaacgaggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 33103  T
Q  226 acgaaactc 234  Q
      |||||||    
T  33102 ttgaaactc 33094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Original strand, 10383 - 10562
Alignment:
Q  55 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtc 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  10383 cacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacaaggagtc 10482  T
Q  155 aacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  10483 gacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactc 10562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Original strand, 5769 - 5939
Alignment:
Q  55 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtc 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  5769 cacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacaaggagtc 5868  T
Q  155 aacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5869 gacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 5939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10620 - 10425
Alignment:
Q  22 atgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctca 121  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  10620 atgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacatcatgaatattcgacaaagatggtggtaacgcaattcgatacgctacaaccccaactttctca 10521  T
Q  122 atgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  10520 ataacatcaaatggcccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacccatga 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Original strand, 8378 - 8548
Alignment:
Q  55 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtc 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  8378 cacatcatgaagattcgacaaagatggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacggtccaacaaaacaaggagtc 8477  T
Q  155 aacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8478 gacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 55 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15014 - 14845
Alignment:
Q  55 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtc 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||    
T  15014 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaataacatcaaacagtccaac-aaacgaggagtc 14916  T
Q  155 aacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14915 aacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaac 14845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 5475 - 5370
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5475 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 5376  T
Q  118 ctcaat 123  Q
    ||||||    
T  5375 ctcaat 5370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 22692 - 22901
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||       |||||||||||||||    
T  22692 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacagagatggtggtaatgcaatcc-------tacaaccccaacctt 22784  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  22785 ctcaatgacatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatga 22884  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  22885 tcaccaacttgaaactc 22901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 432
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  648 catcatacacatacttcctcaactgaaacacatgaaatacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacgaccccaacctt 549  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  548 ctcaacaacatcaaacggtccaacaaaacggggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatga 449  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  448 tcaccaacctgaaactc 432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16485 - 16279
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16485 catcatgcacatacttcctcaactaagacacacgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacacactccgatacgctacaacccca-cctt 16387  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
     ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16386 ttcaataacatcaaacggtccaataaaacgaggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatga 16287  T
Q  218 tcaccaac 225  Q
    || |||||    
T  16286 tccccaac 16279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 234
Target Start/End: Original strand, 8985 - 9194
Alignment:
Q  25 cacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatg 124  Q
    ||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  8985 cacatacttcctcaactaagacacgtgaaacacatcatgaagattcaacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctctacg 9084  T
Q  125 acatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaa 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  9085 acatcaaacggtccaacaaaacgaggagtcaaattccaacacttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaa 9184  T
Q  225 cacgaaactc 234  Q
    |  |||||||    
T  9185 cctgaaactc 9194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 14121 - 14337
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| || |||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14121 catcatacacatacttcttcaactaagacacatgaaacacatcatgaagatttgccaaagactgtggtaacgcaacccgatacgctacaaccccaacctt 14220  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||  |||| ||| ||||||    
T  14221 ctcgatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggagtcaacttccgacacttcaaagcacgactgactccagttataggattcagtctcaaaaatacatga 14320  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  14321 tcaccaacttgaaactc 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Original strand, 10655 - 10863
Alignment:
Q  26 acatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatga 125  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  10655 acatacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatccgatacgctacaactccaaccttctcaacaa 10754  T
Q  126 catcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10755 tctcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaac 10854  T
Q  226 acgaaactc 234  Q
      |||||||    
T  10855 ctgaaactc 10863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 234
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13458
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacctt 117  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13242 catcatacacatacttcctcaactgagatacatgaaacacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacacaatctgatacgctacaaccccaaccct 13341  T
Q  118 ctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||| || ||||  || || |||    
T  13342 ctcaacaacatcaaacaacccaacaaaacgaggagtcaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtga 13441  T
Q  218 tcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||||  |||||||    
T  13442 tcaccaacctgaaactc 13458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Original strand, 6333 - 6517
Alignment:
Q  50 tgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgag 149  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  6333 tgaaacacatcatgaagattcgacaaagacagtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccctctcaacaacatcaaacggcccaacaaaacgtg 6432  T
Q  150 gtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    | || ||||||| |||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||  || || |||||||||||  |||||||    
T  6433 gagttaacttccgacactttaacgcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactc 6517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 41 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 5319 - 5189
Alignment:
Q  41 tgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 140  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5319 tgagaaacatgaaacacatcatgaagattctacaaagacggtggtaacgcaatccgatacactacaaccccaaccttctcaataacatcaaatggcccaa 5220  T
Q  141 caaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaa 171  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5219 caaaacgaggagtcaacttcctacacttcaa 5189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Original strand, 73891 - 74107
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaacct 116  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||  ||| ||| |   ||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  73891 acatcatacacatacttcctcaactgagacacataaa-cacatcatgaagattctgcaacgacagcaataacgcaatccgatatgctacatctccaacct 73989  T
Q  117 tctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatg 216  Q
    | | |   |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  73990 tataacctatctcaaacggtccaacaaaacgtggtgtcaacttccaacacttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatg 74089  T
Q  217 atcaccaacacgaaactc 234  Q
    |||| ||||  |||||||    
T  74090 atcatcaacctgaaactc 74107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 110
Target Start/End: Original strand, 1177 - 1269
Alignment:
Q  18 catcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccc 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1177 catcatgcacatacttcctcaactgagacacatgaaacacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccc 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 183
Target Start/End: Original strand, 13988 - 14116
Alignment:
Q  55 cacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaacaaaacgaggtgtc 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||    
T  13988 cacatcatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatctgatacgctataaccccaaccttttcaataatctcaaacggtccaacaaaacgaggagtc 14087  T
Q  155 aacttcctacacttcaaagcacgaccaac 183  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  14088 aactttcgacacttcaaagcacgtccaac 14116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 370431 - 370239
Alignment:
Q  41 tgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgatacgctacaaccccaaccttctcaatgacatcaaacggcccaa 140  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |  ||||| || ||||    
T  370431 tgagacaaatgaaacacatcatgaagattcgacaatgacgg-ggtaacacaatccaatacgctacaactccaaccttatcaacaatctcaaatggtccaa 370333  T
Q  141 caaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaacacgaaactc 234  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||    
T  370332 caaaacgcggtgtcaacttccaacacttcaaagctcatccaacaccggttacagaattcactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactc 370239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7366
Alignment:
Q  137 ccaacaaaacgaggtgtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcaccaac 225  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  7278 ccaacaaaacggggagtcaacttcctacgcttcagagcacgaccaacaccggtcacatgattcgctctcaagaacacatgatcaccaac 7366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 93
Target Start/End: Original strand, 78339 - 78415
Alignment:
Q  17 acatcatgcacatacgtcctcaattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaat 93  Q
    ||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  78339 acatcatacacgtacttccgcaactgagacacatgaaacacatcatgaagattcgacaacgacggcggtaacgcaat 78415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1063 - 1001
Alignment:
Q  37 caattgagacacatgaagcacattatgaagattcgacaaagacggtggtaacgcaatccgata 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  1063 caattgagacacatgaaacacattatgcaggttcgacaacgtcggtggtaacgcaattcgata 1001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 26386 - 26456
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  26386 gtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 26456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 7150
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatc 219  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  7217 gtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatc 7150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 43630 - 43700
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  43630 gtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcacc 43700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 44642 - 44712
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  | ||||| ||||| || || ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44642 gtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcacc 44712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 16801 - 16871
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  16801 gtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 16871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16894 - 16824
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||||| || || |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  16894 gtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcacc 16824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 49388 - 49318
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatgatcacc 222  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||| || || || |||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49388 gtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcagaaacacatgatcacc 49318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6095 - 6030
Alignment:
Q  152 gtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcagaaacacatga 217  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||| || || |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  6095 gtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatga 6030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University