View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_3 (Length: 677)

Name: NF9913A_low_3
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_3
NF9913A_low_3
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (351-677)||(19456335-19456661)
chr2 (351-676)||(21703079-21703404)
chr2 (351-674)||(3784655-3784978)
chr2 (351-675)||(27118689-27119013)
chr2 (351-674)||(16163600-16163923)
chr2 (351-674)||(34157012-34157334)
chr2 (351-677)||(34303217-34303543)
chr2 (2-311)||(27392642-27392951)
chr2 (351-674)||(31891245-31891568)
chr2 (16-311)||(19456701-19456996)
chr2 (354-649)||(27392973-27393268)
chr2 (16-311)||(21703444-21703739)
chr2 (351-677)||(23128480-23128806)
chr2 (351-677)||(27434358-27434684)
chr2 (18-292)||(27434746-27435020)
chr2 (351-677)||(28882215-28882541)
chr2 (351-677)||(12655543-12655869)
chr2 (354-677)||(40233515-40233838)
chr2 (351-677)||(20837919-20838245)
chr2 (351-677)||(22925942-22926268)
chr2 (173-311)||(27118511-27118649)
chr2 (354-671)||(9349902-9350219)
chr2 (173-301)||(3784477-3784605)
chr2 (173-301)||(34156834-34156962)
chr2 (173-292)||(34303602-34303721)
chr2 (173-311)||(31891608-31891746)
chr2 (173-301)||(16163422-16163550)
chr2 (42-292)||(23128868-23129118)
chr2 (18-292)||(28881879-28882153)
chr2 (42-292)||(12655231-12655481)
chr2 (351-677)||(11635100-11635426)
chr2 (42-292)||(20837607-20837857)
chr2 (351-677)||(21677096-21677422)
chr2 (354-677)||(13936458-13936781)
chr2 (351-677)||(11641289-11641615)
chr2 (351-649)||(34286355-34286653)
chr2 (351-649)||(34291415-34291713)
chr2 (351-676)||(34861681-34862006)
chr2 (354-677)||(12586814-12587137)
chr2 (351-565)||(34279450-34279664)
chr2 (351-677)||(37685823-37686149)
chr2 (351-677)||(37701088-37701414)
chr2 (351-677)||(37925494-37925820)
chr2 (352-677)||(37375163-37375488)
chr2 (42-289)||(13936849-13937096)
chr2 (354-677)||(27777226-27777549)
chr2 (354-677)||(27816984-27817307)
chr2 (42-289)||(34279138-34279385)
chr2 (42-289)||(261070-261317)
chr2 (354-677)||(12716516-12716839)
chr2 (426-677)||(16829252-16829503)
chr2 (426-677)||(16891978-16892229)
chr2 (42-289)||(21677487-21677734)
chr2 (354-677)||(27803711-27804034)
chr2 (354-677)||(39051736-39052059)
chr2 (351-677)||(31876282-31876608)
chr2 (351-677)||(32049799-32050125)
chr2 (414-649)||(260695-260930)
chr2 (42-289)||(11635494-11635741)
chr2 (42-289)||(11641683-11641930)
chr2 (42-289)||(34286043-34286290)
chr2 (42-289)||(34291103-34291350)
chr2 (42-289)||(37925182-37925429)
chr2 (42-256)||(12716943-12717157)
chr2 (42-256)||(16829676-16829890)
chr2 (42-256)||(16891591-16891805)
chr2 (42-283)||(37374850-37375091)
chr2 (42-289)||(32049487-32049734)
chr2 (42-289)||(40233188-40233435)
chr2 (42-256)||(39889751-39889965)
chr2 (426-677)||(39890150-39890401)
chr2 (45-256)||(19416837-19417048)
chr2 (42-256)||(22926366-22926580)
chr2 (42-256)||(31875970-31876184)
chr2 (42-256)||(34861369-34861583)
chr2 (42-256)||(37686247-37686461)
chr2 (42-256)||(37701512-37701726)
chr2 (42-181)||(12586490-12586629)
chr2 (42-289)||(27803381-27803628)
chr2 (21-295)||(39052127-39052401)
chr2 (42-181)||(9350407-9350546)
chr2 (426-677)||(19416413-19416664)
chr2 (42-181)||(27776896-27777035)
chr2 (42-181)||(27816663-27816802)
[»] chr4 (51 HSPs)
chr4 (351-677)||(15284853-15285179)
chr4 (351-677)||(15227890-15228216)
chr4 (351-676)||(1900277-1900602)
chr4 (351-674)||(24460533-24460856)
chr4 (351-673)||(14235454-14235776)
chr4 (354-649)||(15391291-15391586)
chr4 (18-311)||(1899944-1900237)
chr4 (16-311)||(15227555-15227850)
chr4 (16-311)||(15285219-15285514)
chr4 (2-287)||(15391650-15391936)
chr4 (2-311)||(14235819-14236128)
chr4 (351-677)||(17014020-17014346)
chr4 (351-677)||(24592239-24592565)
chr4 (42-292)||(14664726-14664976)
chr4 (351-677)||(14665038-14665364)
chr4 (173-301)||(24460906-24461034)
chr4 (42-292)||(17013708-17013958)
chr4 (351-677)||(5005893-5006219)
chr4 (351-677)||(14763229-14763555)
chr4 (2-292)||(24592624-24592914)
chr4 (351-677)||(6569873-6570199)
chr4 (352-677)||(18800538-18800863)
chr4 (352-677)||(36344440-36344765)
chr4 (351-677)||(14098561-14098887)
chr4 (351-677)||(31126443-31126769)
chr4 (42-292)||(6569561-6569811)
chr4 (351-653)||(34188909-34189211)
chr4 (351-677)||(40105563-40105889)
chr4 (42-283)||(54833098-54833339)
chr4 (42-289)||(5005578-5005825)
chr4 (42-273)||(19372969-19373200)
chr4 (354-677)||(33673723-33674046)
chr4 (351-653)||(24112682-24112984)
chr4 (351-677)||(27163242-27163568)
chr4 (42-289)||(27163633-27163880)
chr4 (354-677)||(30753777-30754100)
chr4 (42-256)||(14098249-14098463)
chr4 (42-300)||(14763609-14763867)
chr4 (42-256)||(31126867-31127081)
chr4 (42-300)||(36344817-36345075)
chr4 (42-289)||(30753450-30753697)
chr4 (352-677)||(54833408-54833733)
chr4 (42-289)||(21969409-21969656)
chr4 (354-677)||(39850661-39850984)
chr4 (45-289)||(33674126-33674370)
chr4 (45-256)||(18800971-18801182)
chr4 (351-677)||(21969721-21970047)
chr4 (42-289)||(39850331-39850578)
chr4 (42-256)||(40105987-40106201)
chr4 (87-300)||(24112418-24112631)
chr4 (87-300)||(34189262-34189475)
[»] chr3 (120 HSPs)
chr3 (351-677)||(16626472-16626798)
chr3 (351-677)||(18530354-18530680)
chr3 (351-674)||(4625910-4626233)
chr3 (351-674)||(17993753-17994076)
chr3 (351-677)||(31034083-31034409)
chr3 (351-677)||(32292718-32293044)
chr3 (351-675)||(5652353-5652677)
chr3 (16-311)||(16626838-16627132)
chr3 (16-311)||(18530025-18530320)
chr3 (354-674)||(5713196-5713516)
chr3 (354-674)||(5724106-5724426)
chr3 (354-674)||(5757051-5757371)
chr3 (354-674)||(5767942-5768262)
chr3 (351-677)||(8295938-8296264)
chr3 (351-677)||(15892672-15892998)
chr3 (351-677)||(18330635-18330961)
chr3 (351-677)||(15741060-15741386)
chr3 (18-292)||(15893060-15893334)
chr3 (351-677)||(18051228-18051554)
chr3 (351-677)||(22387544-22387870)
chr3 (351-677)||(4796619-4796945)
chr3 (351-677)||(8301233-8301559)
chr3 (351-677)||(6192282-6192608)
chr3 (351-677)||(29148721-29149047)
chr3 (351-676)||(4721597-4721922)
chr3 (173-301)||(17994126-17994254)
chr3 (173-292)||(4625732-4625851)
chr3 (351-677)||(7073178-7073504)
chr3 (42-292)||(8295629-8295879)
chr3 (42-292)||(8301618-8301868)
chr3 (42-292)||(18050916-18051166)
chr3 (351-677)||(35880732-35881058)
chr3 (173-301)||(5652175-5652303)
chr3 (351-677)||(4416885-4417211)
chr3 (42-292)||(4797007-4797257)
chr3 (351-677)||(10396099-10396425)
chr3 (351-677)||(28115920-28116246)
chr3 (42-292)||(35880420-35880670)
chr3 (42-292)||(15741436-15741686)
chr3 (173-289)||(5713012-5713128)
chr3 (173-289)||(5723922-5724038)
chr3 (173-289)||(5757439-5757555)
chr3 (173-289)||(5768330-5768446)
chr3 (42-289)||(4721285-4721532)
chr3 (351-677)||(18277018-18277344)
chr3 (351-677)||(18292319-18292645)
chr3 (351-677)||(18307620-18307946)
chr3 (414-677)||(11110315-11110578)
chr3 (42-300)||(8211395-8211653)
chr3 (414-677)||(5467014-5467277)
chr3 (42-289)||(7072866-7073113)
chr3 (351-677)||(21674659-21674985)
chr3 (354-677)||(29664936-29665259)
chr3 (354-677)||(36997043-36997366)
chr3 (351-677)||(17984922-17985248)
chr3 (42-292)||(18330328-18330573)
chr3 (351-677)||(31964439-31964765)
chr3 (351-677)||(50134037-50134363)
chr3 (352-677)||(6542428-6542753)
chr3 (351-670)||(5609295-5609614)
chr3 (42-289)||(6191970-6192217)
chr3 (414-677)||(48465956-48466219)
chr3 (351-677)||(4346653-4346979)
chr3 (351-677)||(28021241-28021567)
chr3 (39-289)||(28116314-28116564)
chr3 (351-677)||(28339268-28339594)
chr3 (42-292)||(29149109-29149359)
chr3 (354-677)||(20576813-20577136)
chr3 (414-677)||(51782052-51782315)
chr3 (39-289)||(7996213-7996463)
chr3 (39-289)||(10642721-10642971)
chr3 (42-256)||(22871264-22871478)
chr3 (42-256)||(22886323-22886537)
chr3 (360-677)||(8211713-8212030)
chr3 (39-300)||(10395787-10396048)
chr3 (42-289)||(47023107-47023354)
chr3 (42-256)||(5466639-5466853)
chr3 (42-300)||(18277398-18277656)
chr3 (42-300)||(18292699-18292957)
chr3 (42-300)||(18308000-18308258)
chr3 (351-677)||(22870822-22871148)
chr3 (351-677)||(22885881-22886207)
chr3 (351-653)||(32439120-32439422)
chr3 (351-677)||(47023419-47023745)
chr3 (352-653)||(20066010-20066311)
chr3 (414-677)||(51797141-51797405)
chr3 (45-256)||(5596756-5596967)
chr3 (42-256)||(17985346-17985560)
chr3 (42-280)||(21674347-21674585)
chr3 (27-256)||(6542864-6543093)
chr3 (426-677)||(5596323-5596574)
chr3 (351-670)||(7996528-7996847)
chr3 (351-670)||(10643036-10643355)
chr3 (42-256)||(5013366-5013580)
chr3 (42-256)||(18224845-18225059)
chr3 (42-256)||(18242381-18242595)
chr3 (86-300)||(20065744-20065958)
chr3 (352-677)||(18242706-18243031)
chr3 (45-289)||(36997446-36997690)
chr3 (414-677)||(5013741-5014004)
chr3 (42-289)||(11110718-11110965)
chr3 (87-300)||(22387921-22388134)
chr3 (39-256)||(28338953-28339170)
chr3 (45-289)||(51781668-51781912)
chr3 (351-550)||(4893176-4893375)
chr3 (42-289)||(20577219-20577466)
chr3 (45-256)||(24327816-24328027)
chr3 (42-168)||(4347162-4347288)
chr3 (42-256)||(31964863-31965077)
chr3 (42-256)||(50134461-50134675)
chr3 (426-670)||(18225232-18225476)
chr3 (426-677)||(24328200-24328451)
chr3 (42-289)||(29665342-29665589)
chr3 (42-289)||(48465569-48465816)
chr3 (42-256)||(5609712-5609926)
chr3 (42-256)||(28020932-28021146)
chr3 (87-300)||(4892912-4893125)
chr3 (45-289)||(51796756-51797001)
chr3 (42-254)||(4416570-4416782)
chr3 (36-300)||(32438805-32439069)
[»] scaffold0260 (2 HSPs)
scaffold0260 (351-677)||(2583-2909)
scaffold0260 (173-311)||(2949-3087)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (351-677)||(20340260-20340586)
chr1 (351-677)||(20461085-20461411)
chr1 (351-677)||(16207956-16208282)
chr1 (351-677)||(28151866-28152192)
chr1 (16-311)||(20460774-20461069)
chr1 (16-311)||(16208319-16208614)
chr1 (173-311)||(20340626-20340764)
chr1 (351-649)||(10962674-10962972)
chr1 (351-677)||(41793233-41793559)
chr1 (351-677)||(28584985-28585311)
chr1 (42-256)||(10962362-10962576)
chr1 (351-677)||(51638222-51638548)
chr1 (42-289)||(41793624-41793871)
chr1 (42-256)||(51637910-51638124)
chr1 (45-256)||(28584676-28584887)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (351-676)||(16449810-16450135)
chr7 (351-676)||(16041329-16041654)
chr7 (351-674)||(31088278-31088601)
chr7 (351-677)||(26484700-26485026)
chr7 (351-676)||(2108817-2109142)
chr7 (351-677)||(2775365-2775691)
chr7 (351-677)||(39210834-39211160)
chr7 (351-674)||(45733466-45733789)
chr7 (16-311)||(16040994-16041289)
chr7 (16-308)||(16450178-16450470)
chr7 (480-677)||(26682811-26683008)
chr7 (480-677)||(4200682-4200879)
chr7 (351-677)||(5127998-5128324)
chr7 (351-653)||(18540805-18541107)
chr7 (351-677)||(11424587-11424913)
chr7 (351-677)||(16518227-16518553)
chr7 (18-292)||(16518615-16518889)
chr7 (351-677)||(10916679-10917005)
chr7 (351-677)||(16503191-16503517)
chr7 (18-292)||(16503579-16503853)
chr7 (351-677)||(2154579-2154905)
chr7 (173-301)||(31088651-31088779)
chr7 (173-301)||(45733288-45733416)
chr7 (42-292)||(10917064-10917314)
chr7 (42-292)||(5127686-5127936)
chr7 (42-292)||(2154267-2154517)
chr7 (351-677)||(5147151-5147477)
chr7 (351-677)||(26274905-26275231)
chr7 (354-677)||(3445315-3445638)
chr7 (351-677)||(4144934-4145260)
chr7 (351-677)||(26435263-26435589)
chr7 (42-292)||(11424975-11425225)
chr7 (351-677)||(26319680-26320006)
chr7 (39-289)||(45387034-45387284)
chr7 (352-677)||(31564201-31564526)
chr7 (42-289)||(5147542-5147789)
chr7 (414-677)||(11441641-11441904)
chr7 (351-670)||(45387349-45387668)
chr7 (351-677)||(9618657-9618983)
chr7 (351-677)||(26669725-26670051)
chr7 (351-670)||(16736278-16736597)
chr7 (351-670)||(16751332-16751651)
chr7 (351-670)||(17523538-17523857)
chr7 (351-670)||(17529358-17529677)
chr7 (354-677)||(26537681-26538004)
chr7 (426-677)||(24592352-24592603)
chr7 (42-256)||(31124605-31124819)
chr7 (42-289)||(16736662-16736909)
chr7 (42-289)||(16751716-16751963)
chr7 (42-289)||(17523226-17523473)
chr7 (42-289)||(17529742-17529989)
chr7 (42-300)||(4145314-4145572)
chr7 (2-256)||(9618305-9618559)
chr7 (42-256)||(24592776-24592990)
chr7 (45-289)||(11441257-11441501)
chr7 (42-289)||(26434951-26435198)
chr7 (351-653)||(5159525-5159827)
chr7 (42-289)||(3444988-3445235)
chr7 (42-289)||(26485946-26486193)
chr7 (42-256)||(26275329-26275543)
chr7 (87-300)||(5159261-5159474)
chr7 (352-677)||(31124927-31125252)
chr7 (42-289)||(26538075-26538322)
chr7 (42-256)||(26320104-26320318)
chr7 (42-256)||(26670149-26670363)
chr7 (42-256)||(31564634-31564848)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (351-676)||(20393-20717)
scaffold0124 (16-311)||(20079-20374)
scaffold0124 (42-292)||(30146-30396)
scaffold0124 (426-677)||(30532-30783)
[»] chr6 (88 HSPs)
chr6 (351-677)||(22456802-22457128)
chr6 (351-674)||(33374127-33374450)
chr6 (351-677)||(14143153-14143479)
chr6 (351-677)||(26787946-26788272)
chr6 (351-677)||(27196319-27196645)
chr6 (351-677)||(27252595-27252921)
chr6 (351-674)||(8892182-8892504)
chr6 (351-674)||(8903417-8903739)
chr6 (351-674)||(28162659-28162982)
chr6 (351-677)||(13521941-13522267)
chr6 (351-677)||(27290238-27290564)
chr6 (351-577)||(22477241-22477467)
chr6 (352-677)||(20160704-20161029)
chr6 (352-677)||(22171802-22172127)
chr6 (351-677)||(22934748-22935074)
chr6 (351-677)||(23857193-23857519)
chr6 (354-677)||(27272448-27272771)
chr6 (351-677)||(26918382-26918708)
chr6 (351-677)||(16749856-16750182)
chr6 (351-677)||(26989003-26989329)
chr6 (351-677)||(13298819-13299145)
chr6 (351-677)||(24304486-24304812)
chr6 (351-670)||(27000075-27000394)
chr6 (351-677)||(24863719-24864045)
chr6 (173-301)||(13522317-13522445)
chr6 (173-301)||(33374500-33374628)
chr6 (137-292)||(22477529-22477684)
chr6 (42-292)||(24863407-24863657)
chr6 (173-311)||(8892544-8892682)
chr6 (173-311)||(8903779-8903917)
chr6 (42-292)||(13299207-13299457)
chr6 (351-677)||(15424185-15424511)
chr6 (42-292)||(24304874-24305124)
chr6 (173-311)||(28162481-28162619)
chr6 (351-670)||(29549477-29549796)
chr6 (42-292)||(15424573-15424823)
chr6 (42-292)||(26999763-27000013)
chr6 (42-289)||(26918070-26918317)
chr6 (2-298)||(20160357-20160650)
chr6 (2-298)||(22172181-22172474)
chr6 (42-292)||(26988691-26988941)
chr6 (42-289)||(22935136-22935383)
chr6 (42-289)||(23857581-23857828)
chr6 (42-292)||(16749544-16749794)
chr6 (352-677)||(4773009-4773334)
chr6 (351-677)||(29573015-29573341)
chr6 (352-677)||(4525289-4525614)
chr6 (352-677)||(4757767-4758092)
chr6 (354-677)||(16674144-16674467)
chr6 (42-300)||(29549168-29549426)
chr6 (360-677)||(4545643-4545960)
chr6 (352-677)||(27007730-27008055)
chr6 (354-649)||(3696086-3696381)
chr6 (354-677)||(34463214-34463537)
chr6 (360-677)||(4724002-4724319)
chr6 (352-677)||(27359860-27360185)
chr6 (352-677)||(27450203-27450528)
chr6 (360-677)||(28207465-28207782)
chr6 (426-677)||(30557884-30558135)
chr6 (42-256)||(30558308-30558522)
chr6 (42-260)||(4524979-4525197)
chr6 (352-677)||(17025280-17025605)
chr6 (42-289)||(3695753-3696000)
chr6 (426-677)||(29501492-29501743)
chr6 (42-300)||(27044080-27044338)
chr6 (352-677)||(27044390-27044716)
chr6 (42-256)||(29501096-29501310)
chr6 (432-677)||(26116278-26116523)
chr6 (426-677)||(16943895-16944146)
chr6 (426-649)||(26777511-26777734)
chr6 (42-256)||(4757451-4757665)
chr6 (42-256)||(4772687-4772901)
chr6 (42-256)||(27007402-27007616)
chr6 (45-256)||(16944319-16944530)
chr6 (558-677)||(17092308-17092427)
chr6 (42-289)||(34463620-34463867)
chr6 (42-256)||(17024952-17025166)
chr6 (42-256)||(27484807-27485021)
chr6 (352-670)||(27485132-27485450)
chr6 (42-256)||(29572703-29572917)
chr6 (27-256)||(4546076-4546305)
chr6 (27-256)||(28207117-28207346)
chr6 (42-289)||(16673817-16674064)
chr6 (42-256)||(27360302-27360516)
chr6 (42-256)||(27450645-27450859)
chr6 (27-256)||(4724435-4724664)
chr6 (42-256)||(26116711-26116925)
chr6 (42-168)||(26778007-26778133)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (351-676)||(22888484-22888809)
chr5 (351-677)||(25199043-25199369)
chr5 (351-674)||(13184473-13184796)
chr5 (351-674)||(13440319-13440642)
chr5 (351-677)||(33877261-33877587)
chr5 (351-674)||(11325808-11326131)
chr5 (351-677)||(23892220-23892546)
chr5 (351-677)||(29888904-29889230)
chr5 (18-311)||(23891884-23892177)
chr5 (18-311)||(25198710-25199003)
chr5 (351-677)||(24687979-24688305)
chr5 (351-677)||(23752272-23752598)
chr5 (351-677)||(33777501-33777827)
chr5 (351-677)||(11549368-11549694)
chr5 (351-677)||(23717810-23718136)
chr5 (18-292)||(24688367-24688641)
chr5 (351-677)||(30934647-30934973)
chr5 (351-677)||(9548365-9548691)
chr5 (351-677)||(24970032-24970358)
chr5 (173-301)||(13184846-13184974)
chr5 (173-301)||(13440692-13440820)
chr5 (173-301)||(33877083-33877211)
chr5 (351-677)||(22998936-22999262)
chr5 (154-311)||(22888287-22888444)
chr5 (173-311)||(11325630-11325768)
chr5 (351-677)||(15658582-15658908)
chr5 (42-292)||(30934338-30934588)
chr5 (42-292)||(11549056-11549306)
chr5 (42-292)||(23718198-23718448)
chr5 (42-292)||(23752660-23752910)
chr5 (42-292)||(33777189-33777439)
chr5 (352-677)||(37671305-37671630)
chr5 (352-677)||(28649250-28649575)
chr5 (352-676)||(18500553-18500877)
chr5 (351-677)||(8665297-8665623)
chr5 (351-677)||(9317465-9317791)
chr5 (351-677)||(12132169-12132495)
chr5 (351-677)||(15758679-15759005)
chr5 (42-292)||(22999324-22999574)
chr5 (351-677)||(30152032-30152358)
chr5 (360-677)||(31431463-31431780)
chr5 (351-670)||(2511065-2511384)
chr5 (354-677)||(31826229-31826552)
chr5 (351-677)||(26480406-26480732)
chr5 (42-289)||(30168171-30168418)
chr5 (351-677)||(6874319-6874645)
chr5 (351-677)||(18375234-18375560)
chr5 (18-184)||(24951788-24951954)
chr5 (351-653)||(41674723-41675025)
chr5 (352-677)||(37358465-37358790)
chr5 (42-289)||(31431130-31431377)
chr5 (351-677)||(30168483-30168809)
chr5 (351-677)||(32599294-32599620)
chr5 (42-289)||(9548756-9549003)
chr5 (354-677)||(24681457-24681780)
chr5 (354-677)||(24723984-24724307)
chr5 (426-677)||(33516445-33516696)
chr5 (354-677)||(40473371-40473694)
chr5 (354-677)||(43078269-43078592)
chr5 (351-677)||(5637924-5638250)
chr5 (42-256)||(9317153-9317367)
chr5 (351-653)||(33292539-33292841)
chr5 (42-256)||(33516058-33516272)
chr5 (351-677)||(34616532-34616858)
chr5 (352-677)||(13324651-13324976)
chr5 (352-677)||(37770809-37771134)
chr5 (45-289)||(41674414-41674658)
chr5 (42-289)||(8665688-8665935)
chr5 (42-289)||(15658973-15659220)
chr5 (42-256)||(2510753-2510967)
chr5 (42-256)||(18375658-18375872)
chr5 (42-256)||(24681139-24681353)
chr5 (42-256)||(24723666-24723880)
chr5 (42-256)||(37771245-37771459)
chr5 (352-677)||(3789556-3789881)
chr5 (39-256)||(15759103-15759320)
chr5 (352-677)||(37754995-37755320)
chr5 (42-289)||(3789228-3789475)
chr5 (42-289)||(18500961-18501208)
chr5 (426-677)||(29966888-29967139)
chr5 (426-677)||(30029504-30029755)
chr5 (42-289)||(43077951-43078198)
chr5 (42-256)||(5637612-5637826)
chr5 (42-256)||(6874004-6874218)
chr5 (2-256)||(26480054-26480308)
chr5 (42-256)||(30151720-30151934)
chr5 (42-256)||(31826665-31826879)
chr5 (42-256)||(37671738-37671952)
chr5 (192-292)||(24969876-24969976)
chr5 (351-547)||(28959738-28959934)
chr5 (42-256)||(12131857-12132071)
chr5 (42-256)||(37754670-37754884)
chr5 (27-256)||(37358901-37359130)
chr5 (42-256)||(34616223-34616437)
chr5 (42-256)||(40473798-40474012)
chr5 (87-300)||(33292275-33292488)
chr5 (45-256)||(29967312-29967523)
chr5 (45-256)||(30029120-30029331)
chr5 (42-256)||(13325090-13325304)
chr5 (42-256)||(32599715-32599929)
chr5 (45-256)||(28648931-28649142)
chr5 (42-256)||(28960044-28960258)
[»] chr8 (45 HSPs)
chr8 (351-675)||(19658926-19659249)
chr8 (351-674)||(44563106-44563427)
chr8 (351-675)||(33244670-33244994)
chr8 (2-311)||(22081125-22081434)
chr8 (354-649)||(22080790-22081085)
chr8 (351-677)||(9354627-9354954)
chr8 (351-677)||(16283454-16283780)
chr8 (351-677)||(18710591-18710917)
chr8 (351-677)||(19688103-19688429)
chr8 (351-677)||(27608789-27609115)
chr8 (351-677)||(16277559-16277885)
chr8 (173-301)||(19659299-19659427)
chr8 (18-292)||(16283118-16283392)
chr8 (173-301)||(9354449-9354577)
chr8 (2-292)||(19687751-19688041)
chr8 (173-292)||(44562928-44563047)
chr8 (351-677)||(2137143-2137469)
chr8 (351-677)||(14557629-14557955)
chr8 (42-292)||(16277247-16277497)
chr8 (42-292)||(2137531-2137781)
chr8 (42-292)||(14557320-14557570)
chr8 (351-677)||(31354529-31354855)
chr8 (42-292)||(27609177-27609427)
chr8 (351-677)||(31489634-31489960)
chr8 (351-677)||(19208244-19208570)
chr8 (351-677)||(19674446-19674772)
chr8 (352-677)||(3329391-3329716)
chr8 (351-677)||(28361839-28362165)
chr8 (352-677)||(12092608-12092933)
chr8 (42-283)||(19286158-19286399)
chr8 (414-677)||(29829390-29829653)
chr8 (39-289)||(19674128-19674378)
chr8 (45-289)||(31490025-31490269)
chr8 (42-289)||(18710279-18710526)
chr8 (2-256)||(28362263-28362517)
chr8 (352-677)||(19286468-19286793)
chr8 (42-256)||(19208668-19208882)
chr8 (508-677)||(189256-189425)
chr8 (27-256)||(29828991-29829220)
chr8 (426-677)||(33258803-33259054)
chr8 (42-256)||(3329827-3330041)
chr8 (42-300)||(31354217-31354475)
chr8 (45-256)||(33258419-33258630)
chr8 (42-256)||(19518451-19518665)
chr8 (27-256)||(12093041-12093270)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (351-629)||(1-279)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (2-311)||(21220-21529)
scaffold0109 (354-649)||(21569-21864)
[»] scaffold0415 (3 HSPs)
scaffold0415 (416-676)||(1844-2103)
scaffold0415 (414-676)||(6080-6344)
scaffold0415 (42-289)||(5682-5930)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (351-677)||(27297-27623)
scaffold0143 (42-292)||(26985-27235)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (351-677)||(39994-40320)
scaffold0089 (351-677)||(46910-47236)
scaffold0089 (42-292)||(29456-29706)
scaffold0089 (42-289)||(40385-40632)
scaffold0089 (351-669)||(29768-30086)
scaffold0089 (2-292)||(47298-47588)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (351-677)||(54-381)
scaffold0029 (2-292)||(443-733)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (492-649)||(571-728)
[»] scaffold0336 (2 HSPs)
scaffold0336 (351-677)||(9571-9897)
scaffold0336 (42-260)||(7925-8143)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (351-670)||(8998-9317)
scaffold0159 (351-670)||(20020-20339)
scaffold0159 (87-256)||(9415-9584)
[»] scaffold0350 (2 HSPs)
scaffold0350 (351-677)||(7164-7490)
scaffold0350 (42-256)||(7588-7802)
[»] scaffold0144 (2 HSPs)
scaffold0144 (351-649)||(26154-26453)
scaffold0144 (42-256)||(26551-26765)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (351-677)||(14855-15181)
scaffold0237 (42-256)||(15279-15493)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (360-677)||(7963-8280)
scaffold0038 (27-256)||(7615-7844)
[»] scaffold0099 (3 HSPs)
scaffold0099 (603-640)||(46764-46801)
scaffold0099 (432-516)||(46894-46981)
scaffold0099 (18-128)||(48630-48742)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19456661 - 19456335
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19456661 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 19456562  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19456561 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacat 19456462  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19456461 tgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatt 19456362  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19456361 gaggtatgtgaggaagctcccagactt 19456335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 21703404 - 21703079
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21703404 gctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccac 21703305  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21703304 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacat 21703205  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21703204 tgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 21703105  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21703104 gaggtatatgaggaagctcccagact 21703079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 3784655 - 3784978
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784655 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 3784754  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  3784755 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 3784854  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3784855 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 3784954  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3784955 gaggtatatgaggaagctcccaga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 351 - 675
Target Start/End: Original strand, 27118689 - 27119013
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118689 gctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 27118788  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  27118789 ctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 27118888  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27118889 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgatt 27118988  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagac 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27118989 gaggtatatgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 16163600 - 16163923
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163600 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16163699  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||    
T  16163700 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 16163799  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16163800 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 16163899  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16163900 gaggtatatgaggaagctcccaga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 34157012 - 34157334
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34157012 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34157111  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  34157112 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34157211  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34157212 tgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 34157310  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34157311 gaggtatatgaggaagctcccaga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 34303543 - 34303217
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303543 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 34303444  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  34303443 ctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 34303344  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||    
T  34303343 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgatt 34303244  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34303243 gaggtatatgaggaagctcccagactt 34303217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 27392642 - 27392951
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27392642 catgggaacccgcttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 27392741  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||   ||    
T  27392742 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatctgtggctactgttgcccccatcgatgctgctcagctacctccaccgt 27392841  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    ||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |     
T  27392842 accagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 27392941  T
Q  302 ttagcaaatg 311  Q
    | ||||||||    
T  27392942 tcagcaaatg 27392951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 31891568 - 31891245
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31891568 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31891469  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||    
T  31891468 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacat 31891369  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31891368 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 31891269  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31891268 gaggtatatgaggaagctcccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19456996 - 19456701
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19456996 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctccgcaaatgcatcaaagaggtacggtaacggtcatcataagaagaaaga 19456897  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  19456896 aacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcaa 19456797  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19456796 tactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgtttagcaaatg 19456701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 354 - 649
Target Start/End: Original strand, 27392973 - 27393268
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27392973 agacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 27393072  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27393073 acccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 27393172  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    ||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27393173 aaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgat 27393268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21703739 - 21703444
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21703739 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctctgtaaatgcatcaaagagatacggtaacggtcatcataagaagaaaga 21703640  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||  || ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  21703639 aacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgtcgtacccatatgcgcca 21703540  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  21703539 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcaacaaatg 21703444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23128806 - 23128480
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23128806 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23128707  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  23128706 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23128607  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  23128606 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 23128507  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  23128506 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 23128480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27434684 - 27434358
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || ||| || |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27434684 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27434585  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  27434584 ctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 27434485  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  27434484 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 27434385  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  27434384 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 27434358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27435020 - 27434746
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  27435020 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtgttcgaaaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaa 27434921  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  ||    
T  27434920 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgta 27434821  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  27434820 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 27434746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 28882215 - 28882541
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  28882215 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 28882314  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  28882315 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 28882414  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  28882415 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 28882514  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  28882515 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 28882541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 12655543 - 12655869
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  12655543 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 12655642  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  12655643 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 12655742  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||     
T  12655743 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatc 12655842  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  12655843 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 12655869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233838
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 40233714  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40233715 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaa 40233814  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  40233815 gtgtgtgaggaagctcctagactt 40233838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 20837919 - 20838245
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20837919 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 20838018  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| ||||||||||||||||   || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  20838019 ctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 20838118  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||     
T  20838119 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatc 20838218  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  20838219 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 20838245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22926268 - 22925942
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  22926268 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 22926169  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  22926168 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22926069  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  22926068 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 22925969  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22925968 gaggtatatgaggaagctcccggactt 22925942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Original strand, 27118511 - 27118649
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27118511 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 27118610  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  27118611 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 27118649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 354 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 9350219 - 9349902
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||      
T  9350219 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcaaggcaagcctccaccgg 9350120  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  9350119 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9350020  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9350019 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 9349920  T
Q  654 gtatatgaggaagctccc 671  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9349919 gtatatgaggaagctccc 9349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 3784477 - 3784605
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3784477 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 3784576  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3784577 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 3784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 34156834 - 34156962
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34156834 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 34156933  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34156934 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 34156962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 34303721 - 34303602
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34303721 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 34303622  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  34303621 caacctcaggtacccgttaa 34303602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31891746 - 31891608
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  31891746 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 31891647  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  31891646 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 31891608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 16163422 - 16163550
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16163422 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggt 16163521  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16163522 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 16163550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23129118 - 23128868
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  23129118 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 23129019  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  23129018 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 23128919  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  23128918 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 23128868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 28881879 - 28882153
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  28881879 gaagaagctgtcagggatggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaa 28881978  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  ||    
T  28881979 cggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgta 28882078  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  28882079 ttctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 28882153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 12655231 - 12655481
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  | ||    
T  12655231 attgtgttcgagaaagctgaaccctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtaggaatggtgtcagtcg 12655330  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  12655331 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 12655430  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| || || ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  12655431 attttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 12655481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11635426 - 11635100
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11635426 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 11635327  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  11635326 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacat 11635227  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  11635226 cgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 11635127  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || |  ||||||||||| ||||||    
T  11635126 gaagtgtgcgaggaagctcctagactt 11635100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 20837607 - 20837857
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |  | ||    
T  20837607 attgtgttcgagaaagctgaatccactgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtaggaatggtgtcagtcg 20837706  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | | |||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  20837707 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcatccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 20837806  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| || || ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  20837807 attttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 20837857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 21677422 - 21677096
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  21677422 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 21677323  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  21677322 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 21677223  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  21677222 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 21677123  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||    
T  21677122 gaagtgtgtgaggaagttcctagactt 21677096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13936781 - 13936458
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  13936781 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 13936682  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||||| ||    
T  13936681 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgt 13936582  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  13936581 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 13936482  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  13936481 gtgtgtgaggaagctcctagactt 13936458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11641615 - 11641289
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  11641615 gctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 11641516  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  11641515 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacat 11641416  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  11641415 cgtgaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 11641316  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || |  ||||||||||| ||||||    
T  11641315 gaagtgtgcgaggaagctcctagactt 11641289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 649
Target Start/End: Original strand, 34286355 - 34286653
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34286355 gctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34286454  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  34286455 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34286554  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34286555 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 649
Target Start/End: Original strand, 34291415 - 34291713
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34291415 gctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34291514  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  34291515 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34291614  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||    || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34291615 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Original strand, 34861681 - 34862006
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34861681 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34861780  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  34861781 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34861880  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  34861881 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34861980  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    || || | ||| |||||||| |||||    
T  34861981 gaagtgtgtgaagaagctccgagact 34862006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 12586814 - 12587137
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||  || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  12586814 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagtcgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12586913  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  12586914 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 12587013  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  12587014 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 12587113  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  12587114 gtgtgtgaggaagctcctagactt 12587137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 565
Target Start/End: Original strand, 34279450 - 34279664
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34279450 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 34279549  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  34279550 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34279649  T
Q  551 tgtaaaaaagctcat 565  Q
     || || ||||||||    
T  34279650 cgtgaagaagctcat 34279664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 37686149 - 37685823
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37686149 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 37686050  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  37686049 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 37685950  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||     
T  37685949 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 37685850  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  37685849 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 37685823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 37701414 - 37701088
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37701414 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 37701315  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  37701314 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 37701215  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |||||     
T  37701214 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 37701115  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  37701114 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 37701088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 37925494 - 37925820
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37925494 gctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 37925593  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  37925594 ccgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 37925693  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||     
T  37925694 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 37925793  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  37925794 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 37925820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375488
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37375362  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37375363 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37375462  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | || ||||||||| ||||||    
T  37375463 aagtgtgtggggaagctcctagactt 37375488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13937096 - 13936849
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  13937096 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 13936997  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  13936996 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 13936897  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  13936896 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 13936849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777549
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27777325  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27777326 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27777425  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27777426 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27777525  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  27777526 gtgtgtgaggaagctcctagactt 27777549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817307
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27817083  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27817084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27817183  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27817184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27817283  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  27817284 gtgtgtgaggaagctcctagactt 27817307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 34279138 - 34279385
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  34279138 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatacgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 34279237  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  34279238 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 34279337  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  34279338 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 34279385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 261317 - 261070
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  261317 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 261218  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  261217 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 261118  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  261117 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 261070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12716839 - 12716516
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  12716839 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 12716740  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  12716739 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 12716640  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  12716639 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 12716540  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  12716539 gtatgtgaggaagctcctagactt 12716516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16829503 - 16829252
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  16829503 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 16829404  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  16829403 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 16829304  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  16829303 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagactt 16829252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 16891978 - 16892229
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  16891978 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 16892077  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  16892078 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 16892177  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  16892178 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagactt 16892229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21677734 - 21677487
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  21677734 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 21677635  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  21677634 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 21677535  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  21677534 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 21677487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27804034
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 27803810  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27803811 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27803910  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27803911 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27804010  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  27804011 gtgtgtgaggaagctcctagactt 27804034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051736
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39051960  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  39051959 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39051860  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  39051859 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39051760  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  39051759 gtgtgtgaggaagctcctagactt 39051736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 31876282 - 31876608
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | || || ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  31876282 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 31876381  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  31876382 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31876481  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  31876482 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31876581  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  31876582 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 31876608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 32049799 - 32050125
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||    
T  32049799 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaaacccccac 32049898  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  32049899 cggacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32049998  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  32049999 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatt 32050098  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||    
T  32050099 gaagtgtgtgaggaagttcctagactt 32050125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 414 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 260930 - 260695
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  260930 agaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 260831  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||| |    
T  260830 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaa 260731  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  260730 caatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 260695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11635741 - 11635494
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |  | || |||||||||||| || || |||||||||||  | ||||| |||||||| |  || |    
T  11635741 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgttgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaagcggaagtggggatggtgtcagcag 11635642  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  11635641 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 11635542  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  11635541 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 11635494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11641930 - 11641683
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| |  | || |||||||||||| || || |||||||||||  | ||||| |||||||| |  || |    
T  11641930 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgttgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaagcggaagtggggatggtgtcagcag 11641831  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  11641830 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 11641731  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  11641730 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 11641683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 34286043 - 34286290
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  |  |    
T  34286043 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaggtg 34286142  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || || |||||||| |||||||| ||    
T  34286143 gagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgcc 34286242  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||  ||||||||    
T  34286243 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgt 34286290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 34291103 - 34291350
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  |  |    
T  34291103 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaggtg 34291202  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || || |||||||| |||||||| ||    
T  34291203 gagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttccgcc 34291302  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||  ||||||||    
T  34291303 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgt 34291350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 37925182 - 37925429
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  37925182 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 37925281  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37925282 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 37925381  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| || |||||    
T  37925382 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 37925429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12717157 - 12716943
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  12717157 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 12717058  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  12717057 gagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 12716958  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
    ||| |||||||||||    
T  12716957 attttatcatcagta 12716943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16829890 - 16829676
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  16829890 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctg 16829791  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16829790 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 16829691  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  16829690 gttttatcatcagta 16829676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 16891591 - 16891805
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  16891591 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctg 16891690  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  16891691 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 16891790  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  16891791 gttttatcatcagta 16891805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 37374850 - 37375091
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  37374850 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 37374949  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || ||||| ||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| || ||    
T  37374950 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaacgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccgcc 37375049  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggt 283  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | |||||||||    
T  37375050 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggt 37375091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 32049487 - 32049734
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | ||| || | || |||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  32049487 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcctcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 32049586  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  32049587 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 32049686  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  32049687 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 32049734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 40233188 - 40233435
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  40233188 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 40233287  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  40233288 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 40233387  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  40233388 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 40233435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 39889751 - 39889965
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  39889751 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 39889850  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  39889851 gagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 39889950  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  39889951 gttttatcatcagta 39889965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 39890150 - 39890401
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  39890150 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 39890249  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||| ||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| ||||||||||||||    
T  39890250 aggggtgttatgctctgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttcc 39890349  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  39890350 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 39890401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19417048 - 19416837
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  19417048 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 19416949  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  19416948 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 19416849  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  19416848 ttatcatcagta 19416837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22926580 - 22926366
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  22926580 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 22926481  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  22926480 gagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 22926381  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  22926380 gttttatcatcagta 22926366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 31875970 - 31876184
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  31875970 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 31876069  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  31876070 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 31876169  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  31876170 gttttatcatcagta 31876184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 34861369 - 34861583
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  34861369 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 34861468  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  34861469 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 34861568  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  34861569 gttttatcatcagta 34861583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37686461 - 37686247
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  37686461 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 37686362  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37686361 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 37686262  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  37686261 gttttatcatcagta 37686247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37701726 - 37701512
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  37701726 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 37701627  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37701626 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 37701527  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  37701526 gttttatcatcagta 37701512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Original strand, 12586490 - 12586629
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  12586490 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 12586589  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgc 181  Q
    || || ||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  12586590 gagccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgc 12586629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 27803381 - 27803628
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27803381 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27803480  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  27803481 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 27803580  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  27803581 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 27803628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 39052401 - 39052127
Alignment:
Q  21 gaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacag 120  Q
    |||||||| || || || || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || |    
T  39052401 gaggctgtaagggatggaatcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacgg 39052302  T
Q  121 aagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactc 220  Q
    |||| || ||||| |  || ||| || ||||||| || || || ||||  || | |||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||    
T  39052301 aagtgggaatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagcaaccgttgctcctaccaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactc 39052202  T
Q  221 tcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgc 295  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || ||||| |||||    
T  39052201 tcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaacgc 39052127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 9350546 - 9350407
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  9350546 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 9350447  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgc 181  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  9350446 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgc 9350407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19416664 - 19416413
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  19416664 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 19416565  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || |||||||| || || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || ||    
T  19416564 aggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctacc 19416465  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  19416464 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 19416413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Original strand, 27776896 - 27777035
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27776896 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27776995  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgc 181  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  27776996 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgc 27777035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 181
Target Start/End: Original strand, 27816663 - 27816802
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27816663 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27816762  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgc 181  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||    
T  27816763 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgc 27816802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 51)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15285179 - 15284853
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285179 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 15285080  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285079 ctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 15284980  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15284979 tgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgatt 15284880  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15284879 gaggtatgtgaggaagctcccagactt 15284853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 15227890 - 15228216
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15227890 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccac 15227989  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227990 ctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 15228089  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15228090 tgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 15228189  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||    
T  15228190 ggggtatatgagatagctcccagactt 15228216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Original strand, 1900277 - 1900602
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1900277 gctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccac 1900376  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1900377 ctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacat 1900476  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1900477 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 1900576  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1900577 gaggtatatgaggaagctcccagact 1900602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 24460856 - 24460533
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24460856 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 24460757  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24460756 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 24460657  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24460656 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 24460557  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24460556 gaagtatatgaggaagctcccaga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 351 - 673
Target Start/End: Complemental strand, 14235776 - 14235454
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14235776 gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctgctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccac 14235677  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |||| || |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    
T  14235676 ctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcat 14235577  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14235576 tgtaaagaagctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 14235477  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccag 673  Q
    |||   ||||| |||||||||||    
T  14235476 gagacctatgaagaagctcccag 14235454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 354 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 15391586 - 15391291
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15391586 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccaccta 15391487  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15391486 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 15391387  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    ||| ||||||||  || | ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15391386 aaagaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 1899944 - 1900237
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  1899944 gaagaagctgtcagagaaggcattattgtatttgagaaagttgaatcctctgtaaatgcatcaaagaggtacggtaacgatcatcataagaagaaagaaa 1900043  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  1900044 cagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccata 1900143  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  1900144 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatg 1900237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 15227555 - 15227850
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227555 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagatgaatcctccgcaaatgcatcaaagaggcatggtaacggtcatcataagaagaaaga 15227654  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15227655 aacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcgcaa 15227754  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  15227755 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgtcgttcagcaaatg 15227850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15285514 - 15285219
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15285514 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctccgcaaatgcatcaaagaggaacggtaacggtcatcataagaagaaaga 15285415  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  15285414 aacagaagtatggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccattgtacccatatgcgcaa 15285315  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15285314 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatcgttcagcaaatg 15285219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15391936 - 15391650
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15391936 catgggaacccgcttagaagaggctgtcagagatggcattattgtgtttgggaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggcaatggtcat 15391837  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactg-ttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  15391836 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgctggaaccagtcaatccatggctactgtttgcccccatcaatgttgctcagctacctccgccg 15391737  T
Q  201 tacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtaccc 287  Q
    || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | |  |||||| |||||||||||||    
T  15391736 tatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtaccc 15391650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 14236128 - 14235819
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||    
T  14236128 catgggaacccgcttagaagaggctgtcagagaagacattattgtgttcgagaaaggggaatcctctgcaagcacatcaaagaagtacggtaatggtcat 14236029  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||| |||||| |  ||    
T  14236028 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggccactgttacccctattaatgctgctcagttacctctgccgt 14235929  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||||| |     
T  14235928 accagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaatgccattgc 14235829  T
Q  302 ttagcaaatg 311  Q
    | ||||||||    
T  14235828 tcagcaaatg 14235819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 17014020 - 17014346
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  17014020 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 17014119  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  17014120 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 17014219  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  17014220 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 17014319  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  17014320 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 17014346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24592565 - 24592239
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24592565 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24592466  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  24592465 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 24592366  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  24592365 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatc 24592266  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  24592265 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 24592239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 14664726 - 14664976
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  14664726 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccg 14664825  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  | |||||||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  14664826 gagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcaccgtattctcagcatcctttctttccgcc 14664925  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  14664926 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 14664976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 14665038 - 14665364
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  14665038 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 14665137  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  14665138 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 14665237  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  14665238 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 14665337  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  14665338 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 14665364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 24461034 - 24460906
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  24461034 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggt 24460935  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24460934 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 24460906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 17013708 - 17013958
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||    
T  17013708 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccg 17013807  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | ||||| |  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  17013808 gagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccttcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 17013907  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  17013908 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 17013958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 5005893 - 5006219
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5005893 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacaaggcaagcccccac 5005992  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  5005993 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 5006092  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| || || || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||     
T  5006093 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatc 5006192  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  5006193 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 5006219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 14763555 - 14763229
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14763555 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 14763456  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  14763455 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 14763356  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  14763355 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 14763256  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  14763255 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 14763229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24592914 - 24592624
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    |||||||||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||     
T  24592914 catgggaacccgtctggaagaagccgtcagggatggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacac 24592815  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  |    
T  24592814 cacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 24592715  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  24592714 acccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 24592624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 6569873 - 6570199
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  6569873 gctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 6569972  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  6569973 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 6570072  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||     
T  6570073 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 6570172  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  6570173 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 6570199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800538
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18800664  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  18800663 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18800564  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  18800563 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 18800538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36344765 - 36344440
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  36344765 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 36344666  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  36344665 tgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 36344566  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  36344565 gtgaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 36344466  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  36344465 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 36344440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 14098561 - 14098887
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14098561 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 14098660  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  14098661 ctgatccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 14098760  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  14098761 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 14098860  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  14098861 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 14098887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31126769 - 31126443
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  31126769 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 31126670  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  31126669 ctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31126570  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  31126569 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31126470  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  31126469 gaggtgtgtgaagaagctccgagactt 31126443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 6569561 - 6569811
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  6569561 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgcgaatgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 6569660  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  6569661 gagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 6569760  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  6569761 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 6569811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 34189211 - 34188909
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  34189211 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 34189112  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  34189111 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 34189012  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  34189011 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 34188912  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  34188911 gag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 40105889 - 40105563
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  40105889 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccac 40105790  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  40105789 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 40105690  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  40105689 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 40105590  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  40105589 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 40105563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 54833098 - 54833339
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  54833098 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 54833197  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  54833198 gagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 54833297  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggt 283  Q
     || ||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||    
T  54833298 gttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggt 54833339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 5005578 - 5005825
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | | | || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  5005578 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtacgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 5005677  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  5005678 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 5005777  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  5005778 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 5005825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 273
Target Start/End: Original strand, 19372969 - 19373200
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  19372969 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 19373068  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  19373069 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 19373168  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtc 273  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  19373169 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggtc 19373200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673723
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33673847  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  33673846 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 33673747  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||| ||| ||||||    
T  33673746 gtgtgtgaggaagttcctagactt 33673723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Original strand, 24112682 - 24112984
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  24112682 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 24112781  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  24112782 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 24112881  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  24112882 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 24112981  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  24112982 gag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27163568 - 27163242
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  27163568 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 27163469  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || ||    
T  27163468 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatat 27163369  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  27163368 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27163269  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  27163268 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 27163242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27163880 - 27163633
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  27163880 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 27163781  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  27163780 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 27163681  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  27163680 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 27163633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30754100
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30753976  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  30753977 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30754076  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  30754077 gtgtgtgaggaagctcctagactt 30754100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 14098249 - 14098463
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  14098249 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 14098348  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  14098349 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 14098448  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  14098449 gttttatcatcagta 14098463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14763867 - 14763609
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  14763867 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 14763768  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  14763767 gagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 14763668  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  14763667 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 14763609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31127081 - 31126867
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  31127081 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 31126982  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  31126981 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 31126882  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  31126881 gttttatcatcagta 31126867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36345075 - 36344817
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  36345075 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 36344976  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| | |||    
T  36344975 gagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcctacc 36344876  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  36344875 gttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 36344817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 30753450 - 30753697
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||| | |  || |    
T  30753450 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatgatgtcagctg 30753549  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  30753550 gagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 30753649  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||| || |||||    
T  30753650 attttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgt 30753697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 54833408 - 54833733
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  54833408 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 54833507  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  54833508 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 54833607  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  54833608 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 54833707  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  54833708 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 54833733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 21969409 - 21969656
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  21969409 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaaaaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 21969508  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  21969509 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 21969608  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  21969609 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 21969656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850984
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 39850760  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  39850761 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 39850860  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  39850861 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39850960  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  39850961 gtgtgtgaggaagctcctagactt 39850984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 33674370 - 33674126
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  33674370 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 33674271  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  33674270 ccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccatt 33674171  T
Q  245 ctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || |||||||| || || ||  |||||| |||||| || |||||    
T  33674170 ttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgt 33674126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18801182 - 18800971
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| |||||||| |  || |||     
T  18801182 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacagaagtggggatggtgtcagctggag 18801083  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||| | |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  18801082 ccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccatt 18800983  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  18800982 ttatcatcagta 18800971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 21969721 - 21970047
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || || || || || |||||||||||||    
T  21969721 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacgactaggcaaggcaagcctccac 21969820  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  21969821 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 21969920  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  21969921 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatt 21970020  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||  | | |||||||| ||| ||||||    
T  21970021 gaaatgtgtgaggaagttcctagactt 21970047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 39850331 - 39850578
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |  || |    
T  39850331 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatacgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctg 39850430  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  39850431 gagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 39850530  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||  |||||| |||||| || |||||    
T  39850531 gttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgt 39850578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40106201 - 40105987
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||| | || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  40106201 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatagacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 40106102  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  40106101 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 40106002  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  40106001 gttttatcatcagta 40105987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Original strand, 24112418 - 24112631
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||   || ||||| | || ||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||    
T  24112418 tatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctgtcaatgctgctc 24112517  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacc 286  Q
    || | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| ||    
T  24112518 agtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccc 24112617  T
Q  287 cgttaacgccatcg 300  Q
     || || |||||||    
T  24112618 tgtcaatgccatcg 24112631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34189475 - 34189262
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||   || ||||| | || ||||| ||||||||| |  || |||||||||||||    
T  34189475 tatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgtcgctcctatcaatgctgctc 34189376  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacc 286  Q
    || | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| ||    
T  34189375 agtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccc 34189276  T
Q  287 cgttaacgccatcg 300  Q
     || || |||||||    
T  34189275 tgtcaatgccatcg 34189262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 120)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16626798 - 16626472
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626798 gctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagttactccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16626699  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626698 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 16626599  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16626598 tgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgatt 16626499  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16626498 gaggtatatgaggaagctcccagactt 16626472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 18530354 - 18530680
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530354 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttactcctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 18530453  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530454 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 18530553  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530554 tgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 18530653  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18530654 gaggtatatgagggagctcccagactt 18530680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 4625910 - 4626233
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4625910 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 4626009  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  4626010 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 4626109  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4626110 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 4626209  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  4626210 gaggtatatgagaaagctcccaga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 17994076 - 17993753
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994076 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 17993977  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  17993976 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 17993877  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17993876 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 17993777  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17993776 gaggtatatgaggaagctcccaga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31034409 - 31034083
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31034409 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 31034310  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  31034309 ctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 31034210  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31034209 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 31034110  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31034109 gaggtatatgaggaagctcccggactt 31034083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 32292718 - 32293044
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  32292718 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagtctccac 32292817  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  32292818 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 32292917  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32292918 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 32293017  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  32293018 gaggtatatgaggaagctcccggactt 32293044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 351 - 675
Target Start/End: Original strand, 5652353 - 5652677
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5652353 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcac 5652452  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || | |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  5652453 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 5652552  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5652553 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgatt 5652652  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagac 675  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  5652653 gaggtatgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16627132 - 16626838
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16627132 tagaagaagctatcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctccgcaaatgcatcaaagaggtacggtaacggtcatcataagaagaa-ga 16627034  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  16627033 aacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgcacaa 16626934  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16626933 tactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatg 16626838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 7e-97
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 18530025 - 18530320
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18530025 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctctgtaaatgcatcaaagagatacggtaacggtcatcataagaagaaaga 18530124  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  18530125 aacagaagtagggatggtatctgccggaactagtcaatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccatcgtacccgtatgcgcaa 18530224  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  18530225 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgccgtcgttcagcaaatg 18530320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 674
Target Start/End: Original strand, 5713196 - 5713516
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  5713196 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 5713295  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5713296 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5713395  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5713396 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5713495  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5713496 gtatatgaggaagctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 674
Target Start/End: Original strand, 5724106 - 5724426
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  5724106 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 5724205  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5724206 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5724305  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5724306 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5724405  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5724406 gtatatgaggaagctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 5757371 - 5757051
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  5757371 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 5757272  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5757271 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5757172  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5757171 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5757072  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5757071 gtatatgaggaagctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 5768262 - 5767942
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||     
T  5768262 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctg 5768163  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5768162 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5768063  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5768062 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5767963  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5767962 gtatatgaggaagctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 8295938 - 8296264
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||    
T  8295938 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctac 8296037  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| ||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  8296038 ctgatctgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 8296137  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  8296138 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 8296237  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  8296238 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 8296264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15892998 - 15892672
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15892998 gctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 15892899  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| |||||||||||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  15892898 ctgatcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 15892799  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  15892798 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 15892699  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  15892698 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 15892672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 18330635 - 18330961
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18330635 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 18330734  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  18330735 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 18330834  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  18330835 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 18330934  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  18330935 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 18330961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15741386 - 15741060
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  15741386 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 15741287  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || || |||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  15741286 ctgattcgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatat 15741187  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  15741186 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 15741087  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  15741086 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 15741060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15893334 - 15893060
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||| |||| || || || ||||||||||| |    
T  15893334 gaagaagctgtcagagaaggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatagtaacggacaccacaagaagaaagaaa 15893235  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  ||    
T  15893234 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgta 15893135  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15893134 ctctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 15893060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 18051228 - 18051554
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  18051228 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 18051327  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||| ||||||||||||||   || || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  18051328 ctgatccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 18051427  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  18051428 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatt 18051527  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||| ||||||| ||||||    
T  18051528 gaagtatgtgagaaagctcctagactt 18051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22387870 - 22387544
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22387870 gctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22387771  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  22387770 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22387671  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  22387670 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22387571  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  22387570 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 22387544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4796945 - 4796619
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4796945 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 4796846  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  4796845 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 4796746  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  4796745 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4796646  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  4796645 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 4796619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8301559 - 8301233
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8301559 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 8301460  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  8301459 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatat 8301360  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  8301359 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 8301260  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  8301259 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 8301233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 6192282 - 6192608
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  6192282 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 6192381  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| | ||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  6192382 ctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 6192481  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  6192482 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 6192581  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  6192582 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 6192608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29149047 - 29148721
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29149047 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 29148948  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  29148947 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 29148848  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  29148847 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 29148748  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  29148747 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 29148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Original strand, 4721597 - 4721922
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  4721597 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 4721696  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||| ||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||    
T  4721697 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatat 4721796  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || ||||| |||||  | ||||||||  | || ||| |||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||     
T  4721797 cgtgaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatc 4721896  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    || |||| |||||||||||| |||||    
T  4721897 gaagtatgtgaggaagctcctagact 4721922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17994254 - 17994126
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17994254 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 17994155  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17994154 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 17994126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 4625732 - 4625851
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  4625732 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggt 4625831  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  4625832 caacctcaggtacccgttaa 4625851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 7073178 - 7073504
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || ||||| || ||||| || |    
T  7073178 gctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacaaggtaagcccccgc 7073277  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  7073278 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 7073377  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  7073378 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 7073477  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  7073478 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 7073504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 8295629 - 8295879
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  8295629 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccg 8295728  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  8295729 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 8295828  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| |||||  || |||||| |||||| ||||| |||||    
T  8295829 attttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaa 8295879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8301868 - 8301618
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||    
T  8301868 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtatggatggtgtctgccg 8301769  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||  | ||||||| |||| | |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  8301768 gagccggtcaatccatggctattgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 8301669  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  8301668 attctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 8301618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 18050916 - 18051166
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  18050916 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 18051015  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||    
T  18051016 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcctttctttccgcc 18051115  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  18051116 attctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 18051166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 35880732 - 35881058
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  35880732 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccaaacagggcaagcccccac 35880831  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||| ||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  35880832 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 35880931  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  35880932 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 35881031  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| ||||||| |||| ||||||    
T  35881032 gaagtatgtgaggaaactcctagactt 35881058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 5652175 - 5652303
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||    
T  5652175 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggt 5652274  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5652275 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 5652303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 4416885 - 4417211
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  4416885 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccac 4416984  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  4416985 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4417084  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  4417085 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4417184  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  4417185 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 4417211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 4797257 - 4797007
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  4797257 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 4797158  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  4797157 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 4797058  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  4797057 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 4797007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 10396099 - 10396425
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  10396099 gctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggtaagcccccac 10396198  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  10396199 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 10396298  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  10396299 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 10396398  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  10396399 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 10396425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 28116246 - 28115920
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28116246 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 28116147  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
     | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  28116146 ttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28116047  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  28116046 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28115947  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || |  ||||||||||| ||||||    
T  28115946 gaagtgtgcgaggaagctcctagactt 28115920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 35880420 - 35880670
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  35880420 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 35880519  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  35880520 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 35880619  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  35880620 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 35880670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15741686 - 15741436
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  15741686 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggcaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 15741587  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  15741586 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 15741487  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15741486 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 15741436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Original strand, 5713012 - 5713128
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5713012 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggt 5713111  T
Q  273 ctacctcaggtacccgt 289  Q
    | |||||| || |||||    
T  5713112 caacctcaagtgcccgt 5713128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Original strand, 5723922 - 5724038
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5723922 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggt 5724021  T
Q  273 ctacctcaggtacccgt 289  Q
    | |||||| || |||||    
T  5724022 caacctcaagtgcccgt 5724038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5757555 - 5757439
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5757555 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggt 5757456  T
Q  273 ctacctcaggtacccgt 289  Q
    | |||||| || |||||    
T  5757455 caacctcaagtgcccgt 5757439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5768446 - 5768330
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  5768446 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggt 5768347  T
Q  273 ctacctcaggtacccgt 289  Q
    | |||||| || |||||    
T  5768346 caacctcaagtgcccgt 5768330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 4721285 - 4721532
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  4721285 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 4721384  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||  |||||||| ||    
T  4721385 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcttttctttccgcc 4721484  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  4721485 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 4721532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18277344 - 18277018
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18277344 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 18277245  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  18277244 ctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18277145  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  18277144 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 18277045  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  18277044 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 18277018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18292645 - 18292319
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18292645 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 18292546  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  18292545 ctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18292446  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  18292445 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 18292346  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  18292345 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 18292319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18307946 - 18307620
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  18307946 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 18307847  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  18307846 ctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18307747  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  18307746 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 18307647  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  18307646 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 18307620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11110578 - 11110315
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  11110578 agaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 11110479  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| |||||||||||    
T  11110478 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcga 11110379  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  11110378 caatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagtgtgtgaggaagctccaagactt 11110315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Original strand, 8211395 - 8211653
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  8211395 attgtgtttgagaaagctgagtcctctgcgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 8211494  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  8211495 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 8211594  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  8211595 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 8211653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 5467014 - 5467277
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |    
T  5467014 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttag 5467113  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||   ||| || ||||||||    
T  5467114 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcga 5467213  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  5467214 caatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 5467277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 7072866 - 7073113
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  7072866 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 7072965  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  7072966 gagccagtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 7073065  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  7073066 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 7073113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 21674659 - 21674985
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  21674659 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccac 21674758  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  21674759 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 21674858  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgc-cctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||    
T  21674859 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataa-tgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgat 21674957  T
Q  650 tgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     || || | |||||||||||| ||||||    
T  21674958 cgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 21674985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29664936
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 29665160  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  29665159 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29665060  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  29665059 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaa 29664960  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  29664959 gtgtgtgaggaagctcctagactt 29664936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997043
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 36997167  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   |||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  36997166 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 36997067  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||    
T  36997066 gtatgtgaggaaactcctagactt 36997043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 17985248 - 17984922
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17985248 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 17985149  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| ||    
T  17985148 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 17985049  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  17985048 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 17984949  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  17984948 gaagtgtgtgaagaagctcctagactt 17984922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 18330328 - 18330573
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  18330328 attgtgctcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 18330427  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  18330428 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccacc 18330527  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| |||||||     ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  18330528 attttatcatc-----cctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 18330573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31964765 - 31964439
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31964765 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 31964666  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  31964665 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31964566  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  31964565 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31964466  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  31964465 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 31964439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 50134363 - 50134037
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  50134363 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 50134264  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  50134263 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 50134164  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  50134163 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 50134064  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  50134063 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 50134037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542428
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 6542554  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6542553 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6542454  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | | |||||||||| ||||||    
T  6542453 aagtgtgtaaggaagctcctagactt 6542428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 5609614 - 5609295
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5609614 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 5609515  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||    
T  5609514 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatat 5609415  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  5609414 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 5609315  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  5609314 gaagtgtgtgaggaagctcc 5609295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 6191970 - 6192217
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||| ||||||| |  |  |    
T  6191970 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtatggatggtgtcagttg 6192069  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||| | ||    
T  6192070 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgcc 6192169  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| |||||| |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  6192170 attttatcattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 6192217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 48465956 - 48466219
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |    
T  48465956 agaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 48466055  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||    
T  48466056 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcga 48466155  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  48466156 caatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 48466219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4346979 - 4346653
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  4346979 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 4346880  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  4346879 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4346780  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  4346779 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4346680  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  4346679 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 4346653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 28021241 - 28021567
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28021241 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28021340  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| || ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  28021341 ctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28021440  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  28021441 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28021540  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  28021541 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 28021567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28116564 - 28116314
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |    
T  28116564 attattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 28116465  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  28116464 ctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 28116365  T
Q  239 accattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  28116364 gccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 28116314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 28339268 - 28339594
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28339268 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28339367  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  28339368 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28339467  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  28339468 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28339567  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  28339568 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 28339594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 29149359 - 29149109
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  29149359 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 29149260  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||||||| |||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29149259 gagccggtcaatccatggctactattgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 29149160  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  29149159 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaa 29149109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20576813
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 20577037  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  20577036 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 20576937  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  20576936 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 20576837  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  20576836 gtgtgtgaggaagctcctagactt 20576813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 51782052 - 51782315
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |    
T  51782052 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttag 51782151  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| ||    
T  51782152 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttga 51782251  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  51782252 caatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 51782315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 7996213 - 7996463
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |    
T  7996213 attattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcctcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 7996312  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  7996313 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 7996412  T
Q  239 accattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  7996413 gccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 7996463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 10642721 - 10642971
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |    
T  10642721 attattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcctcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 10642820  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  10642821 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 10642920  T
Q  239 accattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  10642921 gccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 10642971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22871478 - 22871264
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  22871478 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgcgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 22871379  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  22871378 gagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 22871279  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  22871278 gttttatcatcagta 22871264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22886537 - 22886323
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  22886537 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgcgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 22886438  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||| | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  22886437 gagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 22886338  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  22886337 gttttatcatcagta 22886323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 677
Target Start/End: Original strand, 8211713 - 8212030
Alignment:
Q  360 acttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 459  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  8211713 acttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgt 8211812  T
Q  460 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 559  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||    
T  8211813 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 8211912  T
Q  560 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 659  Q
    ||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  8211913 gctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8212012  T
Q  660 gaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  8212013 gaggaagctcctagactt 8212030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 300
Target Start/End: Original strand, 10395787 - 10396048
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |    
T  10395787 attattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 10395886  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || || |||||||| ||||||||    
T  10395887 ctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattcccagcatcctttctttcc 10395986  T
Q  239 accattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  10395987 gccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 10396048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 47023107 - 47023354
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  47023107 attgtgtttgagaaagccgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 47023206  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  47023207 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 47023306  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  47023307 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgt 47023354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 5466639 - 5466853
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||    
T  5466639 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccg 5466738  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  5466739 gagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 5466838  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
    ||| |||||||||||    
T  5466839 attttatcatcagta 5466853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18277656 - 18277398
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  18277656 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 18277557  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18277556 gagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 18277457  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  18277456 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 18277398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18292957 - 18292699
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  18292957 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 18292858  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18292857 gagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 18292758  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  18292757 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 18292699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18308258 - 18308000
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  18308258 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 18308159  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||| |||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18308158 gagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 18308059  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  18308058 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 18308000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22870822
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22870949  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  22870948 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22870849  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||    
T  22870848 gaagtgtgtgaggaagttcctagactt 22870822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22885881
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 22886008  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  22886007 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 22885908  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||    
T  22885907 gaagtgtgtgaggaagttcctagactt 22885881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Original strand, 32439120 - 32439422
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  32439120 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 32439219  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  32439220 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 32439319  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  32439320 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 32439419  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  32439420 gag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 47023419 - 47023745
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  47023419 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 47023518  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  47023519 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 47023618  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| |||||     
T  47023619 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatc 47023718  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  47023719 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 47023745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 653
Target Start/End: Original strand, 20066010 - 20066311
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20066010 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20066109  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
        || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||     
T  20066110 gggccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatc 20066209  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20066210 gtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattg 20066309  T
Q  652 ag 653  Q
    ||    
T  20066310 ag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 51797141 - 51797405
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctc-ccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctg 512  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |     
T  51797141 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctcacaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgcctta 51797240  T
Q  513 ggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcg 612  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |    
T  51797241 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttg 51797340  T
Q  613 acaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  51797341 acaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 51797405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5596967 - 5596756
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  5596967 gtgtttgagaaagttgaatcctctgcgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 5596868  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  5596867 ccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccaccgtt 5596768  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  5596767 ttatcatcagta 5596756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17985560 - 17985346
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||||||  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  17985560 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcaaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 17985461  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  17985460 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 17985361  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  17985360 gttttatcatcagta 17985346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 280
Target Start/End: Original strand, 21674347 - 21674585
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  21674347 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 21674446  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||| |||||||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  21674447 gagccggtcaacccatggctaccgtggctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatccgttctttccgcc 21674546  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctca 280  Q
    ||| || |||||||| || || ||| |||||| ||||||    
T  21674547 attttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctca 21674585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6543093 - 6542864
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  6543093 gtcagagatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 6542994  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    ||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  6542993 ggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 6542894  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  6542893 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 6542864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5596574 - 5596323
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  5596574 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 5596475  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || ||    
T  5596474 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 5596375  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  5596374 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 5596323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 7996528 - 7996847
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7996528 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 7996627  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || ||    
T  7996628 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatat 7996727  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  7996728 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 7996827  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||| ||||||||    
T  7996828 gaagtgtgtgaagaagctcc 7996847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 10643036 - 10643355
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  10643036 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 10643135  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || ||    
T  10643136 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatat 10643235  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  10643236 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 10643335  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||| ||||||||    
T  10643336 gaagtgtgtgaagaagctcc 10643355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 5013366 - 5013580
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  5013366 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 5013465  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  5013466 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 5013565  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  5013566 gttttatcatcagta 5013580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 18224845 - 18225059
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  18224845 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 18224944  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18224945 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 18225044  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  18225045 gttttatcatcagta 18225059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 18242381 - 18242595
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||    
T  18242381 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccg 18242480  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  18242481 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 18242580  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  18242581 gttttatcatcagta 18242595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 86 - 300
Target Start/End: Original strand, 20065744 - 20065958
Alignment:
Q  86 gtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgct 185  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||     
T  20065744 gtatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagcc 20065843  T
Q  186 cagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtac 285  Q
    ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| |    
T  20065844 caaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttc 20065943  T
Q  286 ccgttaacgccatcg 300  Q
    | || || |||||||    
T  20065944 ctgtcaatgccatcg 20065958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18243031
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18242905  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  18242906 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18243005  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  18243006 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 18243031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 36997690 - 36997446
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  36997690 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 36997591  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  36997590 ccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgtt 36997491  T
Q  245 ctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||||||||| ||||| ||| | || | ||||||||| |||||    
T  36997490 ttatcatcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgt 36997446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 5013741 - 5014004
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |    
T  5013741 agagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctag 5013840  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| ||    
T  5013841 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttga 5013940  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  5013941 caatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 5014004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 11110965 - 11110718
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| |  || |    
T  11110965 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctg 11110866  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  11110865 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 11110766  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  11110765 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 11110718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22388134 - 22387921
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||   || ||||| | || |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  22388134 tatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaatgctgctc 22388035  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacc 286  Q
    || | || ||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| ||    
T  22388034 agtttcccccgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccc 22387935  T
Q  287 cgttaacgccatcg 300  Q
     || || |||||||    
T  22387934 tgtcaatgccatcg 22387921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 28338953 - 28339170
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |    
T  28338953 attattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcag 28339052  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| || |||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  28339053 cgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 28339152  T
Q  239 accattctatcatcagta 256  Q
    ||| || |||||||||||    
T  28339153 accgttttatcatcagta 28339170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 51781668 - 51781912
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  51781668 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 51781767  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  51781768 ccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgtt 51781867  T
Q  245 ctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || |||||||| || || ||  |||||| |||||| || |||||    
T  51781868 ttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgt 51781912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 351 - 550
Target Start/End: Original strand, 4893176 - 4893375
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||    
T  4893176 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaaacctccac 4893275  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  4893276 cggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20577466 - 20577219
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  20577466 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 20577367  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  20577366 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 20577267  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  20577266 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 20577219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 24327816 - 24328027
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  24327816 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 24327915  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  24327916 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 24328015  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  24328016 ttatcatcagta 24328027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4347288 - 4347162
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  4347288 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 4347189  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttg 168  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  4347188 gagccggtcaatccatggctactgttg 4347162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31965077 - 31964863
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  31965077 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 31964978  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  31964977 gagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 31964878  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  31964877 gttttatcatcagta 31964863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 50134675 - 50134461
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  50134675 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 50134576  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  50134575 gagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 50134476  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  50134475 gttttatcatcagta 50134461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 426 - 670
Target Start/End: Original strand, 18225232 - 18225476
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || |    
T  18225232 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcg 18225331  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  18225332 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 18225431  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcc 670  Q
     ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| ||||||||    
T  18225432 aaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctcc 18225476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 24328200 - 24328451
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| |    
T  24328200 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcg 24328299  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || |||||||| || || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || ||    
T  24328300 aggggtgttatgctttgaaatatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctacc 24328399  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  24328400 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 24328451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 29665589 - 29665342
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| | | |||| | | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  29665589 attgtgtttgagaaaactgaatcttctacgagtgcaccgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 29665490  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  29665489 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 29665390  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| || |||||    
T  29665389 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 29665342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 48465569 - 48465816
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |  || |    
T  48465569 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctg 48465668  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  48465669 gagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 48465768  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || |  ||| |||||| |||||| || |||||    
T  48465769 gttttaccatcagtaccccccgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 48465816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5609926 - 5609712
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | ||| |||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  5609926 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcgtcaaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 5609827  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| || |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  |   || ||||||||||| ||||| |||||    
T  5609826 gagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgacgtattctcagcatccgttcttcccacc 5609727  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  5609726 gttttatcatcagta 5609712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 28020932 - 28021146
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||||| || ||||||||| || || || |||||||| || || ||||| |||||||| |  || |    
T  28020932 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctg 28021031  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || | |||||||||||||||||||  || |||||| | || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  28021032 gagccgggcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 28021131  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  28021132 gttttatcatcagta 28021146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Original strand, 4892912 - 4893125
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||| || || || || ||| ||   || ||||| | || ||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  4892912 tatggtaatggacatcacaaaaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctatcaatgctgctc 4893011  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacc 286  Q
    || | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| ||    
T  4893012 agtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccc 4893111  T
Q  287 cgttaacgccatcg 300  Q
     || || |||||||    
T  4893112 tgtcaatgccatcg 4893125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 51796756 - 51797001
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatgg-tcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccgga 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  |||||||||||  || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||    
T  51796756 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggcacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctgga 51796855  T
Q  144 accagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccat 243  Q
     || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  51796856 gccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgt 51796955  T
Q  244 tctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    | || |||||||| || || ||  |||||| |||||| || |||||    
T  51796956 tttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgt 51797001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 254
Target Start/End: Original strand, 4416570 - 4416782
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  4416570 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 4416669  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  4416670 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 4416769  T
Q  242 attctatcatcag 254  Q
     || |||||||||    
T  4416770 gttttatcatcag 4416782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 300
Target Start/End: Original strand, 32438805 - 32439069
Alignment:
Q  36 ggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtat 135  Q
    ||||| ||||||||||||||   ||| || |||||||||||  | | ||  || |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||     
T  32438805 ggcatcattgtgtttgagaagattgagtcatctgcaaatgctgcgaagagatacggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatag 32438904  T
Q  136 atgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctt 235  Q
      || ||||| | || ||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  32438905 ccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctgtcaatgctgctcagtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttctt 32439004  T
Q  236 tccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  32439005 cccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcg 32439069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 2909 - 2583
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2909 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccac 2810  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2809 ctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 2710  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2709 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 2610  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2609 gaggtatatgaggaagctcccagactt 2583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3087 - 2949
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3087 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 2988  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | ||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||    
T  2987 caacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatg 2949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 20340586 - 20340260
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20340586 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctactcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccac 20340487  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20340486 ctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 20340387  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340386 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 20340287  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20340286 gaggtatatgaggaagctcccagactt 20340260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 20461085 - 20461411
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461085 gctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 20461184  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20461185 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 20461284  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20461285 tgtaaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatt 20461384  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||    
T  20461385 gaggtatatgagcaagctcgcagactt 20461411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16208282 - 16207956
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16208282 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccac 16208183  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16208182 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 16208083  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16208082 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 16207983  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16207982 gaggtatatgagaaagctcccagactt 16207956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 28151866 - 28152192
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28151866 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 28151965  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  28151966 ctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 28152065  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28152066 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 28152165  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28152166 gagatatatgaggaagctcccggactt 28152192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 20460774 - 20461069
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| ||||||||| || |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20460774 tagaagaagctgtcagagaaggcattattatattcgagaaagttgaatcctccgccaatgcatcaaagaggtacggtaacggtcatcataagaagaaaga 20460873  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  20460874 aatagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtacccgtatgcgcaa 20460973  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20460974 tactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatg 20461069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16208614 - 16208319
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16208614 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtatttgagaaagttgaatcctctgtaaatgcatcaaagagttacggtaacggtcatcataagaagaaaga 16208515  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||  ||| | |||   ||||    
T  16208514 aacagaagtagagatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgccgtatcagtacatgcaa 16208415  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  16208414 tactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatg 16208319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20340764 - 20340626
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20340764 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 20340665  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | ||||||||||||||| || ||| ||||| | ||||||    
T  20340664 caacctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatg 20340626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 649
Target Start/End: Original strand, 10962674 - 10962972
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| | || |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  10962674 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 10962773  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  10962774 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 10962873  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  10962874 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 10962972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 41793559 - 41793233
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  41793559 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 41793460  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  41793459 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 41793360  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  41793359 cgtgaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 41793260  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  41793259 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 41793233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 28584985 - 28585311
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  28584985 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 28585084  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  28585085 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28585184  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  28585185 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28585284  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  28585285 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 28585311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 10962362 - 10962576
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  10962362 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 10962461  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  10962462 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 10962561  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  10962562 gttttatcatcagta 10962576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 51638222 - 51638548
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  51638222 gctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 51638321  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  51638322 ctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 51638421  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  51638422 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 51638521  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  51638522 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 51638548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 41793871 - 41793624
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||  || |    
T  41793871 attgtgtttgagaaagctgaaacctctgtgagtgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctg 41793772  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| || ||    
T  41793771 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatcctttcttcccgcc 41793672  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  41793671 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 41793624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 51637910 - 51638124
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  51637910 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 51638009  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  51638010 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 51638109  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  51638110 gttttatcatcagta 51638124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 28584676 - 28584887
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  28584676 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 28584775  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  |||||||||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  28584776 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 28584875  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  28584876 ttatcatcagta 28584887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 16450135 - 16449810
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450135 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16450036  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16450035 ctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 16449936  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449935 tgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 16449836  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16449835 gaggtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Original strand, 16041329 - 16041654
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041329 gctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 16041428  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16041429 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacat 16041528  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| |||||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041529 tgtgaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 16041628  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  16041629 gaggtatacgaggaagctcccagact 16041654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 31088601 - 31088278
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088601 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 31088502  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31088501 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 31088402  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31088401 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 31088302  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31088301 gaggtatatgaggaagctcccaga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 26484700 - 26485026
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26484700 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 26484799  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26484800 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 26484899  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26484900 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 26484999  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26485000 gaggtatatgaggaagctcccggactt 26485026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 2109142 - 2108817
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2109142 gctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2109043  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  2109042 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 2108943  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2108942 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2108843  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2108842 gaggtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 2775365 - 2775691
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2775365 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 2775464  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  2775465 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 2775564  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2775565 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 2775664  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2775665 gaggtatatgaggaagctcccggactt 2775691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 39211160 - 39210834
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  39211160 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcttccac 39211061  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  39211060 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 39210961  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39210960 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 39210861  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  39210860 gaggtatatgaggaagctcccggactt 39210834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 45733466 - 45733789
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733466 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 45733565  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  45733566 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 45733665  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45733666 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 45733765  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45733766 gaggtatatgaggaagctcccaga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 16040994 - 16041289
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16040994 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctccgtaaatgcatcaaagaggtatggtaacggtcatcataagaagaaaga 16041093  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  16041094 aacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcca 16041193  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||    
T  16041194 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattccgtcgttcagcaaatg 16041289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16450470 - 16450178
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||||||  |  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16450470 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtattcgagaaagttgaatcctctgtaaatgcatcaaaaagatacggtaacggtcatcataagaagaaaga 16450371  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||     
T  16450370 aacaaaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtacgcgcag 16450271  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaa 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  16450270 tactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccgtcgttcagcaa 16450178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 480 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682811
Alignment:
Q  480 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 579  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  580 taacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactt 26682811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 5e-67
Query Start/End: Original strand, 480 - 677
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200879
Alignment:
Q  480 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 579  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  580 taacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggactt 4200879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 5127998 - 5128324
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5127998 gctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccac 5128097  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  5128098 ctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatat 5128197  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||     
T  5128198 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 5128297  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  5128298 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 5128324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Original strand, 18540805 - 18541107
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18540805 gctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagcctccac 18540904  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  18540905 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 18541004  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  18541005 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 18541104  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  18541105 gag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 11424913 - 11424587
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11424913 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaaccagacagggcaagcccccac 11424814  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  11424813 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 11424714  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  11424713 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 11424614  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| ||||||| |||| ||||||    
T  11424613 gaagtatgtgaggaaactcctagactt 11424587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16518553 - 16518227
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16518553 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16518454  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| ||    
T  16518453 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatat 16518354  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  16518353 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 16518254  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16518253 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 16518227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16518889 - 16518615
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  16518889 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtgttcgaaaaagctgaatcctctgtaaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaa 16518790  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  | |||||||  ||||| |||||||  ||    
T  16518789 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgta 16518690  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16518689 ctctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaa 16518615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10917005 - 10916679
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  10917005 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 10916906  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  10916905 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 10916806  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  10916805 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 10916706  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  10916705 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 10916679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16503517 - 16503191
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16503517 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16503418  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| ||    
T  16503417 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatat 16503318  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  16503317 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 16503218  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16503217 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 16503191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16503853 - 16503579
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  16503853 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtgttcgaaaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaa 16503754  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  | |||||||  ||||| |||||||  ||    
T  16503753 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgta 16503654  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16503653 ctctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaa 16503579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 2154579 - 2154905
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||| |||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  2154579 gctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 2154678  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  2154679 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatat 2154778  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  2154779 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 2154878  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  2154879 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 2154905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 31088779 - 31088651
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  31088779 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 31088680  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31088679 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 31088651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 45733288 - 45733416
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  45733288 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 45733387  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45733388 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 45733416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 10917314 - 10917064
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  10917314 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 10917215  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | ||| |||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  10917214 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgccttcgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgcc 10917115  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  10917114 attttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaa 10917064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 5127686 - 5127936
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  5127686 attgtgttcgagaaagctgagtcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 5127785  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  5127786 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 5127885  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5127886 attttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 5127936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 2154267 - 2154517
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  2154267 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 2154366  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  2154367 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 2154466  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||| |||||||    
T  2154467 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaa 2154517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 5147477 - 5147151
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5147477 gctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 5147378  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  5147377 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 5147278  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  5147277 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 5147178  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || |  ||||||||||| ||||||    
T  5147177 gaagtgtgcgaggaagctcctagactt 5147151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26275231 - 26274905
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26275231 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26275132  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  26275131 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 26275032  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  26275031 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26274932  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  26274931 gaggtgtgtgaagaagctccgagactt 26274905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445638
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 3445514  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3445515 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 3445614  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||    
T  3445615 gtatgtgaggaaactcctagactt 3445638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4145260 - 4144934
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  4145260 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 4145161  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  4145160 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 4145061  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  4145060 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 4144961  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  4144960 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 4144934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 26435263 - 26435589
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26435263 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26435362  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  26435363 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26435462  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  26435463 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26435562  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  26435563 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 26435589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 11425225 - 11424975
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  11425225 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 11425126  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||  || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  11425125 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 11425026  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  11425025 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 11424975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26320006 - 26319680
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26320006 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26319907  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  26319906 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26319807  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||     
T  26319806 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatc 26319707  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  26319706 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 26319680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 45387034 - 45387284
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  |    
T  45387034 attattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcag 45387133  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  45387134 ctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttccc 45387233  T
Q  239 accattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  45387234 gccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 45387284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564201
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31564327  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  31564326 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31564227  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  31564226 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 31564201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 5147789 - 5147542
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  5147789 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 5147690  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||||||  |||  || |||||||| |||||  | |||||||  || || |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  5147689 gagccggtcaatccatggctaccattgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 5147590  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  5147589 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 5147542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 11441641 - 11441904
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |    
T  11441641 agagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttag 11441740  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| |||||||||||    
T  11441741 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcga 11441840  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  11441841 caatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactt 11441904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 45387349 - 45387668
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  45387349 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 45387448  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  45387449 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 45387548  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  45387549 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 45387648  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||| ||||||||    
T  45387649 gaagtgtgtgaagaagctcc 45387668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 9618657 - 9618983
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9618657 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 9618756  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  9618757 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9618856  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  9618857 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9618956  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  9618957 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 9618983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26670051 - 26669725
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26670051 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26669952  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  26669951 ctgatccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26669852  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  26669851 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26669752  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  26669751 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 26669725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 16736597 - 16736278
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16736597 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 16736498  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  16736497 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 16736398  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  16736397 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatc 16736298  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  16736297 gaagtgtgtgaggaagctcc 16736278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 16751651 - 16751332
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16751651 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 16751552  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  16751551 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 16751452  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  16751451 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatc 16751352  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  16751351 gaagtgtgtgaggaagctcc 16751332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 17523538 - 17523857
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17523538 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 17523637  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  17523638 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 17523737  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  17523738 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatc 17523837  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  17523838 gaagtgtgtgaggaagctcc 17523857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 17529677 - 17529358
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  17529677 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 17529578  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  17529577 ctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 17529478  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||     
T  17529477 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatc 17529378  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  17529377 gaagtgtgtgaggaagctcc 17529358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26538004 - 26537681
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||     
T  26538004 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctg 26537905  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26537805  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26537804 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26537705  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  26537704 gtgtgtgaggaagctcctagactt 26537681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24592603 - 24592352
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || |    
T  24592603 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcg 24592504  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  24592503 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 24592404  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     |||||||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  24592403 aaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 24592352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 31124605 - 31124819
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  31124605 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgcgaatgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 31124704  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  31124705 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 31124804  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  31124805 gttttatcatcagta 31124819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16736909 - 16736662
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  16736909 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 16736810  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  16736809 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 16736710  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  16736709 attttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 16736662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16751963 - 16751716
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  16751963 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 16751864  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  16751863 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 16751764  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  16751763 attttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 16751716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 17523226 - 17523473
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  17523226 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 17523325  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  17523326 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 17523425  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  17523426 attttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 17523473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17529989 - 17529742
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  17529989 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 17529890  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  |  ||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  17529889 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 17529790  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  17529789 attttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 17529742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4145572 - 4145314
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  4145572 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 4145473  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  4145472 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 4145373  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  4145372 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 4145314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 9618305 - 9618559
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| | | || || || ||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| ||     
T  9618305 catgggaacccgcctcgaggaagccgtcagggatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacac 9618404  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  |    
T  9618405 cacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 9618504  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    |||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  9618505 acccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 9618559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24592990 - 24592776
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  24592990 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 24592891  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  24592890 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 24592791  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  24592790 gttttatcatcagta 24592776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 11441257 - 11441501
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  11441257 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 11441356  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  11441357 ccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgtt 11441456  T
Q  245 ctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  11441457 ttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 11441501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 26434951 - 26435198
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||| | | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26434951 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcaccgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcag 26435050  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||| |||||||| |||||||  || |||| ||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26435051 gagccggtcagtccatggccactgttgctcctatcagtgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 26435150  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  26435151 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 26435198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Original strand, 5159525 - 5159827
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  5159525 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 5159624  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| | || ||||| ||| | ||||||||    
T  5159625 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacat 5159724  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||| || |||    
T  5159725 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataatt 5159824  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  5159825 gag 5159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 3444988 - 3445235
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  3444988 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 3445087  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  3445088 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 3445187  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||  |||||| |||||| || |||||    
T  3445188 gttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgt 3445235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26486193 - 26485946
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26486193 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26486094  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26486093 gagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 26485994  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  26485993 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 26485946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26275543 - 26275329
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26275543 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26275444  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  26275443 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 26275344  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  26275343 gttttatcatcagta 26275329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Original strand, 5159261 - 5159474
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||   || ||||| | || |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  5159261 tatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccatggctactgttgctcctatcaatgctgctc 5159360  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacc 286  Q
    || | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| ||    
T  5159361 agtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccc 5159460  T
Q  287 cgttaacgccatcg 300  Q
     || || |||||||    
T  5159461 tgtcaatgccatcg 5159474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125252
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 31125126  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  31125127 gtgaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 31125226  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  31125227 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 31125252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 26538322 - 26538075
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |  || |    
T  26538322 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctg 26538223  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  26538222 gagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 26538123  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  26538122 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 26538075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26320318 - 26320104
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | | |||| | || ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26320318 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtacatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26320219  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  26320218 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 26320119  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  26320118 gttttatcatcagta 26320104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26670363 - 26670149
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26670363 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26670264  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  26670263 gagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 26670164  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  26670163 gttttatcatcagta 26670149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31564848 - 31564634
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  31564848 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 31564749  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  31564748 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccacc 31564649  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  31564648 gttttatcatcagta 31564634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Original strand, 20393 - 20717
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20393 gctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 20492  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20493 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 20592  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20593 tgtgaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 20691  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20692 gaggtatatgaagaagctcccagact 20717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 311
Target Start/End: Original strand, 20079 - 20374
Alignment:
Q  16 tagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20079 tagaagaagctgtcagagaaggcattattgtgttcgagaaagttgaatcctccgcaaatgcatcaaagaggtacggtaacggtcatcataagaagaaaga 20178  T
Q  116 gacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaa 215  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |    
T  20179 aacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgcca 20278  T
Q  216 tactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  20279 tactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcaaatg 20374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 30146 - 30396
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| || || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || |    
T  30146 attgtgttcgagaaagccgaatcctctgtgaatgcatcgaggaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctg 30245  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  30246 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgcc 30345  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  30346 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 30396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 30532 - 30783
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  30532 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 30631  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  30632 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 30731  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  30732 aaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactt 30783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 88)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22457128 - 22456802
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22457128 gctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 22457029  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22457028 ctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacat 22456929  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22456928 tgtgaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgatt 22456829  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22456828 gaggtatatgaggaagctcccagactt 22456802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 33374450 - 33374127
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374450 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33374351  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  33374350 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33374251  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33374250 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33374151  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33374150 gaggtatatgaggaagctcccaga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 14143479 - 14143153
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  14143479 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccac 14143380  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14143379 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 14143280  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14143279 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 14143180  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14143179 gaggtatatgaggaagctcccggactt 14143153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 26787946 - 26788272
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  26787946 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccac 26788045  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26788046 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 26788145  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26788146 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 26788245  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26788246 gaggtatatgaggaagctcccggactt 26788272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 27196319 - 27196645
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  27196319 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccac 27196418  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27196419 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 27196518  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27196519 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 27196618  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27196619 gaggtatatgaggaagctcccggactt 27196645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27252921 - 27252595
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  27252921 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagcctccac 27252822  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27252821 ctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 27252722  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27252721 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 27252622  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27252621 gaggtatatgaggaagctcccggactt 27252595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 8892504 - 8892182
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892504 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8892405  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  8892404 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8892305  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8892304 tgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8892206  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  8892205 gaagtatatgaggaagctcccaga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 8903739 - 8903417
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903739 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 8903640  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  8903639 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 8903540  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8903539 tgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 8903441  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  8903440 gaagtatatgaggaagctcccaga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 28162659 - 28162982
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28162659 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 28162758  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
     | |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  28162759 ttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacat 28162858  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28162859 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 28162958  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28162959 gaggtatatgaggaagctcccaga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13522267 - 13521941
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522267 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13522168  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  13522167 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 13522068  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13522067 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 13521968  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13521967 gaggtatatgaggaagctcccggactt 13521941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27290564 - 27290238
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27290564 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccac 27290465  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27290464 ctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacat 27290365  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||    
T  27290364 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgatt 27290265  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||    
T  27290264 gaggtatatgaggaagctcctagactt 27290238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 351 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 22477467 - 22477241
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22477467 gctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 22477368  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22477367 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacat 22477268  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaa 577  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||    
T  22477267 tgtgaagaagctcatagaccaaggaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 20160704 - 20161029
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20160704 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 20160803  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  20160804 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 20160903  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |    
T  20160904 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 20161003  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  20161004 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 20161029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22172127 - 22171802
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22172127 ctagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggcaaggcaagcctccacc 22172028  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  22172027 tgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatatt 22171928  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| |||  ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |    
T  22171927 gtgaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcg 22171828  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  22171827 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 22171802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22935074 - 22934748
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22935074 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22934975  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  22934974 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22934875  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  22934874 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 22934775  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  22934774 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 22934748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23857519 - 23857193
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23857519 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23857420  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  23857419 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23857320  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  23857319 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 23857220  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  23857219 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 23857193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27272771 - 27272448
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||     
T  27272771 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctg 27272672  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    |||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27272671 atccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 27272572  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     |||||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||    || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  27272571 gaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 27272472  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||    
T  27272471 gtatgtgaggtagctcctagactt 27272448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 26918382 - 26918708
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26918382 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 26918481  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  26918482 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 26918581  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  26918582 cgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26918681  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  26918682 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 26918708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 16749856 - 16750182
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  16749856 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 16749955  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  16749956 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 16750055  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  16750056 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 16750155  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16750156 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 16750182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 26989003 - 26989329
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  26989003 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 26989102  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  26989103 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 26989202  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     ||||| ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  26989203 cgtaaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 26989302  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  26989303 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 26989329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13299145 - 13298819
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  13299145 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 13299046  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||    
T  13299045 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatat 13298946  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  13298945 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 13298846  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  13298845 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 13298819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24304812 - 24304486
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24304812 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24304713  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| ||    
T  24304712 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatat 24304613  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  24304612 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 24304513  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  24304512 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 24304486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 27000075 - 27000394
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27000075 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27000174  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  27000175 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 27000274  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  27000275 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27000374  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || |||| ||||||||||||    
T  27000375 gaagtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 24863719 - 24864045
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24863719 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24863818  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  24863819 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 24863918  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  24863919 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 24864018  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  24864019 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 24864045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13522445 - 13522317
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13522445 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 13522346  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13522345 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 13522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 33374628 - 33374500
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33374628 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 33374529  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33374528 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 33374500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22477684 - 22477529
Alignment:
Q  137 tgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttcttt 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22477684 tgccggaactagtcaatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttcttt 22477585  T
Q  237 ccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22477584 ccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaa 22477529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 24863407 - 24863657
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  ||||    
T  24863407 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccg 24863506  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  24863507 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 24863606  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| || |||||||||||    
T  24863607 attctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaa 24863657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8892682 - 8892544
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||    
T  8892682 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggt 8892583  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  8892582 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 8892544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8903917 - 8903779
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  8903917 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggt 8903818  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  8903817 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 8903779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13299457 - 13299207
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  13299457 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccg 13299358  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  13299357 gagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 13299258  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  13299257 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 13299207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15424511 - 15424185
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15424511 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 15424412  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  15424411 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 15424312  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  15424311 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 15424212  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     | |||| |||||||||||| ||||||    
T  15424211 aaagtatgtgaggaagctcctagactt 15424185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24305124 - 24304874
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  24305124 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 24305025  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  24305024 gagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgcc 24304925  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  24304924 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 24304874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Original strand, 28162481 - 28162619
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  28162481 catcaatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 28162580  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  28162581 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 28162619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 29549477 - 29549796
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  29549477 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 29549576  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  29549577 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29549676  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  29549677 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatc 29549776  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  29549777 gaagtgtgtgaggaagctcc 29549796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 15424823 - 15424573
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  15424823 attgtgttcgagaaagctgaatcttctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 15424724  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  15424723 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 15424624  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  15424623 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 15424573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 26999763 - 27000013
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  26999763 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 26999862  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  26999863 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 26999962  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  26999963 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 27000013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 26918070 - 26918317
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  26918070 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 26918169  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  26918170 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 26918269  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  26918270 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 26918317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 298
Target Start/End: Original strand, 20160357 - 20160650
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||| |||  | ||| ||||| ||||||    
T  20160357 catgggaacccgtctagaagaagctgtcagggaaggaatcattgtgtttgataaaggtgaatcctccgtgagcgcaccaaaaaggtacggtaacggtcat 20160456  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |   || ||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||  |||||||    |    
T  20160457 cataagaagaaggaaacagaagtagggatggaatttgctg---ccggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccat 20160553  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccat 298  Q
    ||| || ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20160554 acctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 20160650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 22172474 - 22172181
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    |||||||||||   ||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||||||||| |  |  ||| |||  | ||| ||||| ||||||    
T  22172474 catgggaacccgtctagaagaagctgtcagggaaggaatcattgtgtttgataaaggtgaatcctccgtgagcgcaccaaaaaggtacggtaacggtcat 22172375  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| || ||| |   || ||||||||||||||||||||| |||  | |||||| ||||  |||||||    |    
T  22172374 cataagaagaaggaaacagaagtagggatggaatttgctg---ccggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccaccat 22172278  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccat 298  Q
    ||| || ||| || |||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22172277 acctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 22172181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 26988691 - 26988941
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  26988691 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 26988790  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  26988791 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 26988890  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  26988891 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 26988941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22935383 - 22935136
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||    
T  22935383 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagccg 22935284  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    |  || ||||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||    
T  22935283 gggccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgcc 22935184  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  22935183 attctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgt 22935136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23857828 - 23857581
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  ||||    
T  23857828 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagccg 23857729  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    |  || ||||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||    
T  23857728 gggccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgcc 23857629  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  23857628 attctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgt 23857581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 16749544 - 16749794
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  16749544 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 16749643  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || ||||| || |||||  |  ||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  16749644 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaacgcagctcaaatgtctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 16749743  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  16749744 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 16749794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773334
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 4773208  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  4773209 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4773308  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  4773309 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 4773334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 29573015 - 29573341
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  29573015 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggtaagcccccac 29573114  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  29573115 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 29573214  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  29573215 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 29573314  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  29573315 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 29573341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 4525289 - 4525614
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4525289 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagacagggcaagccaccacc 4525388  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||    
T  4525389 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 4525488  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  4525489 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4525588  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  4525589 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 4525614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4758092
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 4757966  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  4757967 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 4758066  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  4758067 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 4758092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674467
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16674343  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  16674344 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 16674443  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  16674444 gtgtgtgaggaagctcctagactt 16674467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Original strand, 29549168 - 29549426
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  29549168 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacatcacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 29549267  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  29549268 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 29549367  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  29549368 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 29549426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 360 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4545960 - 4545643
Alignment:
Q  360 acttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 459  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  4545960 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgt 4545861  T
Q  460 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 559  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||    
T  4545860 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4545761  T
Q  560 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 659  Q
    ||||||  | || |||||  | || |||||||||||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  4545760 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4545661  T
Q  660 gaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  4545660 gaggaagctcctagactt 4545643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27008055
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27007929  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  |||| |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  27007930 gtgaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27008029  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | | |||||||||| ||||||    
T  27008030 aagtgtgtaaggaagctcctagactt 27008055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 649
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696381
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||     
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3696285  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  3696286 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 3696381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463214
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34463338  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  34463337 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 34463238  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  34463237 gtgtgtgaggaagctcctagactt 34463214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 4724319 - 4724002
Alignment:
Q  360 acttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 459  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  4724319 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 4724220  T
Q  460 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 559  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||    
T  4724219 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 4724120  T
Q  560 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 659  Q
     |||||  | || |||||  | || |||||||||||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  4724119 actcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 4724020  T
Q  660 gaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  4724019 gaggaagctcctagactt 4724002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27359860
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27359986  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  27359985 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27359886  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  27359885 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 27359860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450203
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||     
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatc 27450329  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  27450328 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27450229  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  27450228 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 27450203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 677
Target Start/End: Original strand, 28207465 - 28207782
Alignment:
Q  360 acttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 459  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  28207465 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 28207564  T
Q  460 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 559  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||    
T  28207565 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 28207664  T
Q  560 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 659  Q
     |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  28207665 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 28207764  T
Q  660 gaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  28207765 gaggaagctcctagactt 28207782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 30558135 - 30557884
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  30558135 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 30558036  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  30558035 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 30557936  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  30557935 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagactt 30557884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30558522 - 30558308
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  30558522 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctg 30558423  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  30558422 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 30558323  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  30558322 gttttatcatcagta 30558308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 260
Target Start/End: Original strand, 4524979 - 4525197
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  4524979 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 4525078  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  4525079 gagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 4525178  T
Q  242 attctatcatcagtatcct 260  Q
     || |||||||||||||||    
T  4525179 gttttatcatcagtatcct 4525197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025605
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
      | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  17025380 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 17025479  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  17025480 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 17025579  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  17025580 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 17025605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 3695753 - 3696000
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  3695753 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 3695852  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  3695853 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 3695952  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  3695953 gttttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 3696000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 29501492 - 29501743
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  29501492 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 29501591  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || ||    
T  29501592 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctacc 29501691  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  29501692 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 29501743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Original strand, 27044080 - 27044338
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27044080 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27044179  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  27044180 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 27044279  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  27044280 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 27044338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 27044390 - 27044716
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27044390 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacc 27044489  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat-gctacgctttgaagtacat 550  Q
    | | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || | | || ||||||||||| ||    
T  27044490 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatat 27044589  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  27044590 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27044689  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  27044690 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 27044716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 29501096 - 29501310
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  29501096 attgtgtttgagaaagctgaatcctttgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 29501195  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | ||||||| |||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29501196 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccacc 29501295  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  29501296 gttttatcatcagta 29501310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 432 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 26116523 - 26116278
Alignment:
Q  432 agacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggat 531  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || |    
T  26116523 agacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggt 26116424  T
Q  532 gctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatca 631  Q
    | || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || |||||    
T  26116423 gttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatca 26116324  T
Q  632 cgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  26116323 tgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 26116278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 16944146 - 16943895
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  16944146 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 16944047  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  16944046 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 16943947  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| ||  ||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  16943946 aaatcatgccactgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 16943895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26777734 - 26777511
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  26777734 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 26777635  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  26777634 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 26777535  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
     ||||| || |||||||| |||||    
T  26777534 aaatcatgccgctgtgaatatgat 26777511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 4757451 - 4757665
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||    
T  4757451 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccg 4757550  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||||||||| |  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4757551 gagccggtcaatcaatggctactgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccacc 4757650  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  4757651 gttttatcatcagta 4757665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 4772687 - 4772901
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||    
T  4772687 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccg 4772786  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  4772787 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccacc 4772886  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  4772887 gttttatcatcagta 4772901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 27007402 - 27007616
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27007402 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27007501  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||  |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  27007502 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacctatatatgccgtattctcagcatccattcttcccacc 27007601  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  27007602 gttttatcatcagta 27007616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16944530 - 16944319
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  16944530 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 16944431  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  16944430 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 16944331  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  16944330 ttatcatcagta 16944319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 558 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092308
Alignment:
Q  558 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 657  Q
    ||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  658 atgaggaagctcccagactt 677  Q
     |||||||||| ||| ||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaactt 17092308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34463867 - 34463620
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  34463867 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 34463768  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  34463767 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 34463668  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  34463667 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 34463620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 17024952 - 17025166
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |  || |    
T  17024952 attgtgtttgagaaagccgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctg 17025051  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||| | |||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  17025052 gagccggtcaagctatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 17025151  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  17025152 gttttatcatcagta 17025166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 27484807 - 27485021
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27484807 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27484906  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  27484907 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 27485006  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  27485007 gttttatcatcagta 27485021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 352 - 670
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485450
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 27485331  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  27485332 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 27485431  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcc 670  Q
    | || | ||||||||||||    
T  27485432 aagtgtgtgaggaagctcc 27485450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 29572703 - 29572917
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  29572703 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 29572802  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29572803 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 29572902  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  29572903 gttttatcatcagta 29572917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4546305 - 4546076
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  4546305 gtcagagatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 4546206  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    | ||||| |  || | | || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  4546205 gaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 4546106  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  4546105 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 4546076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 28207117 - 28207346
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  28207117 gtcagagatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 28207216  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    | ||||| |  || | | || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  28207217 gaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 28207316  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  28207317 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 28207346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 16673817 - 16674064
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |  || |    
T  16673817 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctg 16673916  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  || || |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  16673917 gagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 16674016  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| || || ||| |||||| |||||| || |||||    
T  16674017 gttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 16674064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27360516 - 27360302
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27360516 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27360417  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27360416 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccacc 27360317  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  27360316 gttttatcatcagta 27360302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27450859 - 27450645
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  27450859 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 27450760  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  27450759 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccacc 27450660  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  27450659 gttttatcatcagta 27450645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4724664 - 4724435
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  4724664 gtcagagatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 4724565  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    | ||||| |  || | | || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  4724564 gaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 4724465  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  4724464 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 4724435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26116925 - 26116711
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26116925 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgggtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26116826  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||  || |||||| | |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||| | ||||| |||||    
T  26116825 gagccggtcaatctatagctaccgttgctcctatcaatacagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcattcgttcttcccacc 26116726  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  26116725 gttttatcatcagta 26116711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 26778133 - 26778007
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26778133 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26778034  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttg 168  Q
    || || | ||||| |||||||||||||    
T  26778033 gagccgggcaatcaatggctactgttg 26778007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 351 - 676
Target Start/End: Original strand, 22888484 - 22888809
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888484 gctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagttactcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 22888583  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22888584 ctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacat 22888683  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22888684 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 22888783  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  22888784 gaggtatatgaggaagctcctagact 22888809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 25199043 - 25199369
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25199043 gctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 25199142  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25199143 ctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacat 25199242  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25199243 tgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 25199342  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||    
T  25199343 gaggtatatgagaaagcccccagactt 25199369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 13184796 - 13184473
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184796 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13184697  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  13184696 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13184597  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13184596 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13184497  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13184496 gaggtatatgaggaagctcccaga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 13440642 - 13440319
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440642 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 13440543  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  13440542 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 13440443  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13440442 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgatt 13440343  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13440342 gaggtatatgaggaagctcccaga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 33877261 - 33877587
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877261 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 33877360  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  33877361 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacat 33877460  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33877461 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 33877560  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  33877561 gaggtatatgaggaagctcccggactt 33877587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 11325808 - 11326131
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11325808 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 11325907  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  11325908 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacat 11326007  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11326008 tgtgaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgatt 11326107  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11326108 gaggtatatgaggaagctcccaga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 23892220 - 23892546
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892220 gctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgagttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 23892319  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  23892320 ctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacat 23892419  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  23892420 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgatt 23892519  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23892520 gaggtatatgaggaagctcccagactt 23892546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29889230 - 29888904
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29889230 gctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagcctccac 29889131  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29889130 ctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacat 29889031  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | |||||||| || || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889030 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 29888931  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29888930 gaggtgtatgaggaagctcccagactt 29888904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 23891884 - 23892177
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||| |  |||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| |    
T  23891884 gaagaagctgtcagagaaggaattattgtattcgagaaagttgaatcctccgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacatcataagaagaaagaaa 23891983  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  ||    
T  23891984 cagaagtagggatggtatctgccggagccgatcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgta 23892083  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  23892084 ctctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccatcgttcagcaaatg 23892177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 311
Target Start/End: Original strand, 25198710 - 25199003
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||||| |  |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||| || |    
T  25198710 gaagaagctgtcagagaaggaattattgtattcgagaaagttgaatcctccgtgaatgcatcaaagaggtacggtaacggacatcataagaagaaggaaa 25198809  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||  || || |||||| | ||  | ||||||| |||||| |||||||  ||    
T  25198810 cagaagtagggatggtatccgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgcttcccaattgcctccgtcgtacccatatgcgccgta 25198909  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  25198910 ctctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgttaacgccgtcgttcagcaaatg 25199003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 24688305 - 24687979
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||  | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24688305 gctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24688206  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  24688205 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 24688106  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  24688105 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 24688006  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  24688005 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 24687979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23752598 - 23752272
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23752598 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23752499  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  23752498 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23752399  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  23752398 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 23752299  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  23752298 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 23752272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 33777501 - 33777827
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  33777501 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 33777600  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  33777601 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 33777700  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||     
T  33777701 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatc 33777800  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  33777801 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 33777827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 11549368 - 11549694
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  11549368 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 11549467  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  11549468 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 11549567  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  11549568 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 11549667  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||    
T  11549668 gaagtatgcgaggaagctcctagactt 11549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 23718136 - 23717810
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  23718136 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 23718037  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  23718036 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 23717937  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  23717936 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 23717837  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  23717836 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 23717810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 24688641 - 24688367
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| |    
T  24688641 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaa 24688542  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  ||    
T  24688541 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgta 24688442  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
     ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  24688441 ttctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 24688367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 30934647 - 30934973
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  30934647 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 30934746  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  30934747 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 30934846  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | |||||     
T  30934847 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatc 30934946  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  30934947 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 30934973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 9548691 - 9548365
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9548691 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 9548592  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  9548591 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 9548492  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  9548491 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9548392  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  9548391 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 9548365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 24970032 - 24970358
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  24970032 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 24970131  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  24970132 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 24970231  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||    || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||     
T  24970232 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatc 24970331  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     | |||  |||||||||||| ||||||    
T  24970332 aaagtacgtgaggaagctcctagactt 24970358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13184974 - 13184846
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13184974 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 13184875  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13184874 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 13184846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 13440820 - 13440692
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13440820 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 13440721  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13440720 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 13440692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 33877083 - 33877211
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  33877083 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 33877182  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33877183 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 33877211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 22999262 - 22998936
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  22999262 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 22999163  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  22999162 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 22999063  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||     
T  22999062 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatc 22998963  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  22998962 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 22998936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 22888287 - 22888444
Alignment:
Q  154 ccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 253  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888287 ccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 22888386  T
Q  254 gtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  22888387 gtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatg 22888444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 311
Target Start/End: Original strand, 11325630 - 11325768
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||     
T  11325630 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattggga 11325729  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgtttagcaaatg 311  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  11325730 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 11325768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15658908 - 15658582
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15658908 gctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 15658809  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  15658808 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 15658709  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  15658708 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 15658609  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||  | | |||||||||||| ||||||    
T  15658608 gaaatgtgtgaggaagctcctagactt 15658582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 30934338 - 30934588
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| | | |||    
T  30934338 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctaccg 30934437  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || | ||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  30934438 gagccggccaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgcc 30934537  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  30934538 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 30934588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 11549056 - 11549306
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  11549056 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 11549155  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || || |||||||| |||||||||||    
T  11549156 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattcacagcatcctttctttccacc 11549255  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  11549256 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 11549306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23718448 - 23718198
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  23718448 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 23718349  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  23718348 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 23718249  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  23718248 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 23718198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23752910 - 23752660
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  23752910 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 23752811  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  23752810 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 23752711  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  23752710 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 23752660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 33777189 - 33777439
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  33777189 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 33777288  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || |  |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  33777289 gagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 33777388  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  33777389 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 33777439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 9e-41
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671305
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37671431  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37671430 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37671331  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  37671330 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 37671305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649575
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 28649449  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  28649450 gtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 28649549  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  28649550 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 28649575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 352 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500553
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 18500678  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  18500677 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 18500578  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    | || | |||||||||||| |||||    
T  18500577 aagtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 8665623 - 8665297
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  8665623 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 8665524  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  8665523 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 8665424  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  8665423 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 8665324  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||    
T  8665323 gaagtgtgtgaggaagttcctagactt 8665297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 9317465 - 9317791
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9317465 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 9317564  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  9317565 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9317664  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  9317665 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9317764  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  9317765 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 9317791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 12132169 - 12132495
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12132169 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 12132268  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  12132269 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 12132368  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  12132369 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 12132468  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  12132469 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 12132495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15759005 - 15758679
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  15759005 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 15758906  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  15758905 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 15758806  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  15758805 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 15758706  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  15758705 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 15758679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22999574 - 22999324
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || |    
T  22999574 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctg 22999475  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  22999474 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 22999375  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||    
T  22999374 attttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaa 22999324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 30152032 - 30152358
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  30152032 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 30152131  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  30152132 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 30152231  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  30152232 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 30152331  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  30152332 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 30152358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 360 - 677
Target Start/End: Original strand, 31431463 - 31431780
Alignment:
Q  360 acttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 459  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31431463 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgt 31431562  T
Q  460 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 559  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || ||    
T  31431563 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaa 31431662  T
Q  560 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 659  Q
    ||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  31431663 gctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 31431762  T
Q  660 gaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  31431763 gaggaagctcctagactt 31431780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 2511065 - 2511384
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  2511065 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 2511164  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  2511165 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 2511264  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  2511265 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 2511364  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  2511365 gaagtgtgtgaggaagctcc 2511384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826229
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 31826353  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31826352 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31826253  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||    
T  31826252 gtatgtgaggaaactcctagactt 31826229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 26480406 - 26480732
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26480406 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 26480505  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  26480506 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 26480605  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  26480606 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 26480705  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  26480706 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 26480732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 30168171 - 30168418
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  30168171 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 30168270  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  30168271 gagccggtcaatccatggctactattgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 30168370  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| || |||||    
T  30168371 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 30168418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 6874319 - 6874645
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  6874319 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 6874418  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  6874419 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 6874518  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  6874519 cgtgaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 6874618  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  6874619 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 6874645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 18375560 - 18375234
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  18375560 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 18375461  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  18375460 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 18375361  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||    
T  18375360 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatt 18375261  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  18375260 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 18375234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 184
Target Start/End: Original strand, 24951788 - 24951954
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  24951788 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaa 24951887  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgc 184  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  24951888 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgc 24951954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Original strand, 41674723 - 41675025
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  41674723 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 41674822  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  41674823 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 41674922  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  41674923 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgatt 41675022  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  41675023 gag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358465
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| |||    
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatt 37358591  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37358590 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37358491  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  37358490 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 37358465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 31431130 - 31431377
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  31431130 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 31431229  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||  ||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  31431230 gagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 31431329  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  31431330 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 31431377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 30168483 - 30168809
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  30168483 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccac 30168582  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  30168583 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 30168682  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  30168683 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 30168782  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| ||| ||| |||| ||||||    
T  30168783 gaagtatgtgaagaaactcctagactt 30168809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 32599620 - 32599294
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  32599620 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccac 32599521  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  32599520 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 32599421  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| |||||     
T  32599420 cgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatc 32599321  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||||||||| || ||||||    
T  32599320 gaagtgtgtgaggaagcccctagactt 32599294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9549003 - 9548756
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  9549003 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 9548904  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| |||||||  || |||||| | || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  9548903 gagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 9548804  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  9548803 attttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgt 9548756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681780
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24681556  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  24681557 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24681656  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  24681657 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24681756  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  24681757 gtatgtgaggaagctcctagactt 24681780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724307
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 24724083  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  24724084 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24724183  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  24724184 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24724283  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  24724284 gtatgtgaggaagctcctagactt 24724307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 33516445 - 33516696
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  33516445 acaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcg 33516544  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||||||    
T  33516545 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttcc 33516644  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||||    
T  33516645 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggtgtgtgaagaagctccgagactt 33516696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473371
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 40473595  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | || || ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  40473594 accctttacctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 40473495  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40473494 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 40473395  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  40473394 gtgtgtgaggaagctcctagactt 40473371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 354 - 677
Target Start/End: Original strand, 43078269 - 43078592
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||     
T  43078269 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctg 43078368  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 43078468  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 653  Q
     || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  43078469 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 43078568  T
Q  654 gtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | |||||||||||| ||||||    
T  43078569 gtgtgtgaggaagctcctagactt 43078592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 5637924 - 5638250
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  5637924 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 5638023  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  5638024 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 5638123  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||| || ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||     
T  5638124 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatc 5638223  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  5638224 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 5638250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 9317153 - 9317367
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  9317153 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 9317252  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  9317253 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 9317352  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  9317353 gttttatcatcagta 9317367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 653
Target Start/End: Original strand, 33292539 - 33292841
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  33292539 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccac 33292638  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    |  | || || ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  33292639 cggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 33292738  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||||    || ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| ||||| ||||||    
T  33292739 cgtcaagaagcttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgatt 33292838  T
Q  651 gag 653  Q
    |||    
T  33292839 gag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 33516058 - 33516272
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  33516058 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctg 33516157  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  33516158 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 33516257  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  33516258 gttttatcatcagta 33516272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 34616532 - 34616858
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  34616532 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccac 34616631  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  34616632 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 34616731  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  34616732 cgtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 34616831  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||| ||| ||||||    
T  34616832 gaagtgtgtgaggaagttcctagactt 34616858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324651
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
      | || || ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 13324777  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  13324776 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 13324677  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  13324676 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 13324651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770809
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37770935  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
     | || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37770934 atgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37770835  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||| | ||||||    
T  37770834 aagtgtgtgaggaagcttctagactt 37770809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 41674414 - 41674658
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  ||||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  41674414 gtgtttgagaaagccgaatcctctgtgaatgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 41674513  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || |||||||||||||||||||||  || |||||| | || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  ||  |||||||||| |||||||| |||||    
T  41674514 ccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtatgctcagcatcctttctttccgccatt 41674613  T
Q  245 ctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||    
T  41674614 ttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgt 41674658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8665935 - 8665688
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  8665935 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctg 8665836  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | ||||||   ||||| |||  ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  8665835 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 8665736  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||| ||||||||||| |||||  || |||||| |||||| || |||||    
T  8665735 attttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgt 8665688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15659220 - 15658973
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  15659220 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 15659121  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  || || |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  15659120 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 15659021  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || || |||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  15659020 gttttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 15658973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 2510753 - 2510967
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || |||||||  || |    
T  2510753 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctg 2510852  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||| ||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  2510853 gagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 2510952  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  2510953 gttttatcatcagta 2510967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18375872 - 18375658
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  18375872 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 18375773  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  18375772 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 18375673  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  18375672 gttttatcatcagta 18375658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 24681139 - 24681353
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  24681139 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 24681238  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  24681239 gagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 24681338  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
    ||| |||||||||||    
T  24681339 attttatcatcagta 24681353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 24723666 - 24723880
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  24723666 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 24723765  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  24723766 gagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 24723865  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
    ||| |||||||||||    
T  24723866 attttatcatcagta 24723880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37771459 - 37771245
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  37771459 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 37771360  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | ||||||| ||| || |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37771359 gagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 37771260  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  37771259 gttttatcatcagta 37771245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789881
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3789755  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  3789756 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 3789855  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  3789856 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 3789881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15759320 - 15759103
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  |    
T  15759320 attattgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcag 15759221  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| |  ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  15759220 ctggagcaggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttccc 15759121  T
Q  239 accattctatcatcagta 256  Q
    ||| || |||||||||||    
T  15759120 accgttttatcatcagta 15759103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755320
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| || || || || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 37755194  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  37755195 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 37755294  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  37755295 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 37755320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 3789228 - 3789475
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  3789228 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 3789327  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  3789328 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 3789427  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| |  |||||||| |||||    
T  3789428 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgt 3789475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18501208 - 18500961
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  18501208 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 18501109  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  18501108 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 18501009  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  18501008 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 18500961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 29967139 - 29966888
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  29967139 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 29967040  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  29967039 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 29966940  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  29966939 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 29966888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 30029504 - 30029755
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  30029504 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 30029603  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  30029604 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 30029703  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || |||||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  30029704 aaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 30029755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 7e-23
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 43077951 - 43078198
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |   | |    
T  43077951 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcaactg 43078050  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||| | |||||||||||||  || |||||||| |||||  | ||||||| |||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  43078051 gagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccacc 43078150  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  43078151 gttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 43078198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 5637612 - 5637826
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  5637612 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 5637711  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  5637712 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 5637811  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  5637812 gttttatcatcagta 5637826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 6874004 - 6874218
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  6874004 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 6874103  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  6874104 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 6874203  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  6874204 gttttatcatcagta 6874218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 26480054 - 26480308
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| | | || || || ||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| ||     
T  26480054 catgggaacccgccttgaggaagccgtcagggatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacac 26480153  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  |    
T  26480154 cacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 26480253  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    |||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  26480254 acccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 26480308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 30151720 - 30151934
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  30151720 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 30151819  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  30151820 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 30151919  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  30151920 gttttatcatcagta 30151934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31826879 - 31826665
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  31826879 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 31826780  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  31826779 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 31826680  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  31826679 gttttatcatcagta 31826665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37671952 - 37671738
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||    
T  37671952 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccg 37671853  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37671852 gagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 37671753  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  37671752 gttttatcatcagta 37671738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 292
Target Start/End: Original strand, 24969876 - 24969976
Alignment:
Q  192 cctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgtta 291  Q
    ||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  24969876 cctccgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtta 24969975  T
Q  292 a 292  Q
    |    
T  24969976 a 24969976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959738
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagta 547  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagta 28959738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 12131857 - 12132071
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  12131857 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 12131956  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  12131957 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 12132056  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  12132057 gttttatcatcagta 12132071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 37754670 - 37754884
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  37754670 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcaagtgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 37754769  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  || || |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  37754770 gagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 37754869  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  37754870 gttttatcatcagta 37754884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37359130 - 37358901
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || ||||| |||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  37359130 gtcagagatgggatcattgtatttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 37359031  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    ||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  37359030 ggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 37358931  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  37358930 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 37358901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Original strand, 34616223 - 34616437
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  34616223 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 34616322  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||| | |||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  34616323 gagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 34616422  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  34616423 gttttatcatcagta 34616437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40474012 - 40473798
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  40474012 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 40473913  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||  | |||||||  |||||  |   ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  40473912 gagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccacacatgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 40473813  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || || ||||||||    
T  40473812 gttttaccatcagta 40473798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 300
Target Start/End: Original strand, 33292275 - 33292488
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||| ||   || ||||| | || ||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  33292275 tatggtaatggacatcacaagaagaaagatacggaggtgggaatgatagccgctggaactaatccatccaaggctactgttgctcctatcaatgctgctc 33292374  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacc 286  Q
    || | || ||||  ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| ||    
T  33292375 agtttcccccgtcctacccttatgcaccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccc 33292474  T
Q  287 cgttaacgccatcg 300  Q
     || || |||||||    
T  33292475 tgtcaatgccatcg 33292488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29967523 - 29967312
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  29967523 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaaaaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 29967424  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  29967423 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 29967324  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  29967323 ttatcatcagta 29967312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 30029120 - 30029331
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || || |||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  30029120 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaaaaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 30029219  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  30029220 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 30029319  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  30029320 ttatcatcagta 30029331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13325304 - 13325090
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  13325304 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 13325205  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || |  ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||| ||||| ||||| |||||    
T  13325204 gagctggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcaacatccgttcttcccacc 13325105  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  13325104 gttttatcatcagta 13325090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32599929 - 32599715
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| |  || |    
T  32599929 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaggaaacggaagtggggatggtgtcagctg 32599830  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  32599829 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 32599730  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  32599729 gttttatcatcagta 32599715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 28648931 - 28649142
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  28648931 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 28649030  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||| | |||||||||||||   | |||||| | |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  28649031 ccggtcaagctatggctactgttgcaactatcaatacagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccatt 28649130  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  28649131 ttatcatcagta 28649142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28960258 - 28960044
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  28960258 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 28960159  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || | ||||| | |||||||||||  || |||||||  || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  28960158 gagccgggcaatcaacggctactgttgcacctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 28960059  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  28960058 gttttatcatcagta 28960044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 45)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 351 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 19659249 - 19658926
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659249 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 19659150  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || | |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  19659149 ctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 19659050  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19659049 tgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgatt 19658951  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagac 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19658950 gaggtatatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 351 - 674
Target Start/End: Original strand, 44563106 - 44563427
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44563106 gctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 44563205  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  44563206 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 44563305  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| || || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44563306 tgtaaaaaa-ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgatt 44563403  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccaga 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  44563404 gaggtatatgaggaagctcccaga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 351 - 675
Target Start/End: Original strand, 33244670 - 33244994
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33244670 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccac 33244769  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || | |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  33244770 ctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 33244869  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  33244870 tgtaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgatt 33244969  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagac 675  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  33244970 gaggtatatgaggaagctctcagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 22081434 - 22081125
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22081434 catgggaacccgcttagaagaggctgtcagagatggcattattgtgtttgaaaaatgtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggcaatggtcat 22081335  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22081334 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccatcaatgctgctcagctacctccgccgt 22081235  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| | | |  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |     
T  22081234 atcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 22081135  T
Q  302 ttagcaaatg 311  Q
    | ||||||||    
T  22081134 tcagcaaatg 22081125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 354 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 22081085 - 22080790
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22081085 agacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccaccta 22080986  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22080985 acccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgt 22080886  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080885 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 9354627 - 9354954
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354627 gctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattactcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 9354726  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||    
T  9354727 ctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacat 9354826  T
Q  551 tgt-aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  9354827 tgtaaaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 9354926  T
Q  650 tgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     || || | |||||||| ||| ||||||    
T  9354927 cgaagtgtgtgaggaagttcctagactt 9354954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 16283454 - 16283780
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16283454 gctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16283553  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  16283554 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatat 16283653  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16283654 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatt 16283753  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16283754 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 16283780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 18710591 - 18710917
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||  |||    
T  18710591 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcac 18710690  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||| ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||    
T  18710691 ctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatat 18710790  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18710791 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgatt 18710890  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18710891 gaggtatatgaggaagctcccggactt 18710917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 19688103 - 19688429
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  19688103 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 19688202  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  19688203 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 19688302  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  19688303 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 19688402  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || ||||  ||||||||||| ||||||    
T  19688403 gaagtatgcgaggaagctcctagactt 19688429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 27609115 - 27608789
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27609115 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27609016  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||    
T  27609015 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatat 27608916  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  27608915 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 27608816  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  27608815 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 27608789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 16277559 - 16277885
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16277559 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 16277658  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  16277659 ctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 16277758  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||     
T  16277759 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatc 16277858  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  16277859 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 16277885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 19659427 - 19659299
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19659427 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 19659328  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19659327 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 19659299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 292
Target Start/End: Original strand, 16283118 - 16283392
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagaga 117  Q
    ||||| || |||||||| || || ||||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| |    
T  16283118 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtattcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaa 16283217  T
Q  118 cagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaata 217  Q
    | |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||  ||    
T  16283218 cggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatatgcgccgta 16283317  T
Q  218 ctctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  16283318 ctctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaa 16283392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 173 - 301
Target Start/End: Original strand, 9354449 - 9354577
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9354449 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggt 9354548  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  9354549 caacctcaggtacccgttaatgccgtcgt 9354577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Original strand, 19687751 - 19688041
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    |||||||||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| ||     
T  19687751 catgggaacccgtctggaagaagccgtcagggaaggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacac 19687850  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||  | |||||||  |    
T  19687851 cacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcat 19687950  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||| |||||||  || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  19687951 acccatatgcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 19688041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 292
Target Start/End: Original strand, 44562928 - 44563047
Alignment:
Q  173 catcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  44562928 catcaatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcggga 44563027  T
Q  273 ctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  44563028 caacctcaggtacccgttaa 44563047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 2137469 - 2137143
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  2137469 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 2137370  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  2137369 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 2137270  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  2137269 cgtgaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 2137170  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || | || |||| ||||||| ||||||    
T  2137169 gaagcatgtgagaaagctcctagactt 2137143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 14557629 - 14557955
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||  | |    
T  14557629 gctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccctcgc 14557728  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  14557729 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 14557828  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||     
T  14557829 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatc 14557928  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  14557929 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 14557955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 16277247 - 16277497
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  16277247 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 16277346  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  16277347 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 16277446  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  16277447 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 16277497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 2137781 - 2137531
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  2137781 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 2137682  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| ||||||||  |    
T  2137681 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtc 2137582  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  2137581 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 2137531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 14557320 - 14557570
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  14557320 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 14557419  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| ||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  14557420 gagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcccttctttccgcc 14557519  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  14557520 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaa 14557570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 31354529 - 31354855
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  31354529 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcctccac 31354628  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||| |||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  31354629 ctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31354728  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  31354729 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31354828  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||||||||||    
T  31354829 gaagtgtgtgaggaagctcccagactt 31354855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 27609427 - 27609177
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || |    
T  27609427 attgtgttcgagaaagccgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctg 27609328  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||| |   || ||||||||||| |||||||| ||    
T  27609327 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgtgtcgtattctcagcatcctttctttccgcc 27609228  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  27609227 attttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 27609177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 31489960 - 31489634
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  31489960 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 31489861  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  31489860 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 31489761  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  31489760 cgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 31489661  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  31489660 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 31489634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19208570 - 19208244
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  19208570 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccac 19208471  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  19208470 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 19208371  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  19208370 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 19208271  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  19208270 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 19208244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 19674446 - 19674772
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  19674446 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaaacccccac 19674545  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||  | || || ||||||||||| ||    
T  19674546 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatat 19674645  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| |||||     
T  19674646 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 19674745  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  19674746 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 19674772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329391
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 3329517  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||||||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| |    
T  3329516 gtgaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcg 3329417  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  3329416 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 3329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 28362165 - 28361839
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  28362165 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 28362066  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  28362065 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 28361966  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  28361965 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 28361866  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  28361865 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 28361839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092608
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 12092734  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  12092733 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 12092634  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  12092633 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 12092608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 283
Target Start/End: Original strand, 19286158 - 19286399
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| | ||| || | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  19286158 attgtgtttgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgg 19286257  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  19286258 gagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 19286357  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggt 283  Q
     || ||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||    
T  19286358 gttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggt 19286399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 414 - 677
Target Start/End: Original strand, 29829390 - 29829653
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgg 513  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | |    
T  29829390 agagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttag 29829489  T
Q  514 gtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcga 613  Q
    |||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||    || |||||||| ||    
T  29829490 gtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttga 29829589  T
Q  614 caatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| ||||||    
T  29829590 caatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagactt 29829653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 289
Target Start/End: Original strand, 19674128 - 19674378
Alignment:
Q  39 attattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatg 138  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||| || | || |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||||| |  |    
T  19674128 attattgtgttcgagaaagctgaatcttctgcgagtgcgtcgaagaggtatggtaatggacatcacaagaagaaagaaacggacgtggggatggtgtcag 19674227  T
Q  139 ccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttcc 238  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||||||    
T  19674228 ctggagccagtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttcc 19674327  T
Q  239 accattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  19674328 gccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 19674378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31490269 - 31490025
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  31490269 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggag 31490170  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  31490169 ccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccaccgtt 31490070  T
Q  245 ctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     ||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| || |||||    
T  31490069 ttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 31490025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 18710279 - 18710526
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| |  || |    
T  18710279 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgggaatggtgtcagctg 18710378  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18710379 gagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtactctcagcatccgttcttcccacc 18710478  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| |||||    
T  18710479 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgt 18710526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28362517 - 28362263
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| | | || || || ||||| || || || |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||| | ||  ||||||||||| ||     
T  28362517 catgggaacccgccttgaggaagccgtcagggatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgagtgcatcgaagagatatggtaatggacac 28362418  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  |    
T  28362417 cacaagaagaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 28362318  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    |||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  28362317 acccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 28362263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 352 - 677
Target Start/End: Original strand, 19286468 - 19286793
Alignment:
Q  352 ctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 451  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||    
T  19286468 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacc 19286567  T
Q  452 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacatt 551  Q
    | | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||     
T  19286568 tgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatc 19286667  T
Q  552 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 651  Q
    || || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| |    
T  19286668 gtgaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 19286767  T
Q  652 aggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    | || | |||||||||||| ||||||    
T  19286768 aagtgtgtgaggaagctcctagactt 19286793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19208882 - 19208668
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | |||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  19208882 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaagtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 19208783  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  19208782 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 19208683  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  19208682 gttttatcatcagta 19208668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 508 - 677
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189425
Alignment:
Q  508 ctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgt 607  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  608 cctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagactt 189425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 29828991 - 29829220
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  29828991 gtcagagatggaatcattgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 29829090  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    ||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  29829091 ggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 29829190  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  29829191 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 29829220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 426 - 677
Target Start/End: Original strand, 33258803 - 33259054
Alignment:
Q  426 acaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttg 525  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || |    
T  33258803 acaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcg 33258902  T
Q  526 aaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttcc 625  Q
    | || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||| || ||    
T  33258903 aggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctacc 33259002  T
Q  626 gaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     ||||| || | |||||| ||||| || || | ||| |||||||| ||||||    
T  33259003 aaatcatgccgttgtgaatatgatcgaagtgtgtgaagaagctccgagactt 33259054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3330041 - 3329827
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  3330041 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 3329942  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||  ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  3329941 gagccggtcaatccatggctatcgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccattcttcccacc 3329842  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  3329841 gttttatcatcagta 3329827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 300
Target Start/End: Original strand, 31354217 - 31354475
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | |  ||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  31354217 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagcgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 31354316  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||||||||| || ||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  31354317 gagccggtcaatccatggccaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 31354416  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcg 300  Q
     || ||||||||||| ||| | ||| |||| | ||||||||| || || || |||||||    
T  31354417 gttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcg 31354475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Original strand, 33258419 - 33258630
Alignment:
Q  45 gtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaa 144  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||     
T  33258419 gtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatgggcaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggag 33258518  T
Q  145 ccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccatt 244  Q
    || | ||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  33258519 ccgggcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtt 33258618  T
Q  245 ctatcatcagta 256  Q
     |||||||||||    
T  33258619 ttatcatcagta 33258630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19518665 - 19518451
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  19518665 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 19518566  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| || ||    
T  19518565 gagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgcc 19518466  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
    ||| |||||||||||    
T  19518465 attttatcatcagta 19518451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12093270 - 12093041
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  12093270 gtcagagatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 12093171  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    | ||||| |  || | | || | ||||| ||||||||| |||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  12093170 gaatggtgtcagctgcagccggccaatctatggctactattgctcctatcaatgcagctcaagtgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 12093071  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  12093070 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 12093041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 279 - 1
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  279 gctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgctcaaccagacatggcaagcctccac 180  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  179 ctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 80  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 629  Q
    ||| || ||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79 tgtgaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Original strand, 21220 - 21529
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21220 catgggaacccgcttagaagaggctgtcagagacggaattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 21319  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  21320 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccgtggctactgttgcccccatcaatgcttctcagctacctccgccgt 21419  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaacgccatcgt 301  Q
    ||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||| || ||||| |     
T  21420 accagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 21519  T
Q  302 ttagcaaatg 311  Q
    | ||||||||    
T  21520 tcagcaaatg 21529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 354 - 649
Target Start/End: Original strand, 21569 - 21864
Alignment:
Q  354 agacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 453  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21569 agacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccaccta 21668  T
Q  454 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 553  Q
    | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21669 acctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgt 21768  T
Q  554 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    ||| ||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21769 aaagaagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 416 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1844
Alignment:
Q  416 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggt 2004  T
Q  516 catgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgaca 615  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2003 catgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgtgaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgaca 1905  T
Q  616 atcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1904 atcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatgaagaagctcccagact 1844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 414 - 676
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6344
Alignment:
Q  414 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga-tttccatcaaggtgctctg 512  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||  |     
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgcctta 6179  T
Q  513 ggtcatgatgttgaaggatgctacgc-tttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctc 611  Q
    ||||||||||| || || || || || ||||||||| || || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||    
T  6180 ggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctc 6279  T
Q  612 gacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 676  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  6280 gacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5930
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  5682 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagt-gggatggtgtcagctg 5780  T
Q  142 gaaccagtcaatc-catggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccac 240  Q
    || || |||||||  |||||||||||||  || ||||||||  ||||  | |||||||  ||||| ||   ||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  5781 gagccggtcaatcaaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccac 5880  T
Q  241 c-attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    |  || ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||    
T  5881 cgtttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgt 5930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 27297 - 27623
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  27297 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 27396  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  27397 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 27496  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  27497 cgtgaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 27596  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  27597 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 27623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 26985 - 27235
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |  || |    
T  26985 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctg 27084  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | |||||||  ||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  27085 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 27184  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  27185 attttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 27235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 40320 - 39994
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  40320 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 40221  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || |||||||||| |||||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  40220 ctgatccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 40121  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || ||  |||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  40120 cgtgaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 40021  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  40020 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 39994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 47236 - 46910
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  47236 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccac 47137  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  47136 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatat 47037  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||     
T  47036 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatc 46937  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||    
T  46936 gaagtatgtgaggaagctcctagactt 46910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 292
Target Start/End: Original strand, 29456 - 29706
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  29456 attgtgttcgaaaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccg 29555  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || || |||||||| ||  | ||||| | ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||    
T  29556 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccatcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgcc 29655  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  29656 attctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 29706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 40632 - 40385
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||| | |||||    
T  40632 attgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaagaggtatggtaacggacaccacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccg 40533  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||  | ||||||  |||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||  ||    
T  40532 gagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgccgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgcc 40433  T
Q  242 attctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgt 289  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  40432 attctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgt 40385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 669
Target Start/End: Original strand, 29768 - 30086
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| | ||||| ||||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  29768 gctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccac 29867  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| ||    
T  29868 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatat 29967  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || |||||     
T  29968 cgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatc 30067  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctc 669  Q
    || |||| |||||||||||    
T  30068 gaagtatgtgaggaagctc 30086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47588 - 47298
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    |||||||||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||| ||||||||| |  |||||||||| || |||||||||||| ||     
T  47588 catgggaacccgtctggaagaagccgtcagggatggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctccgtgaatgcatcaaagaggtatggtaatggacac 47489  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || ||||| |||||||||||||||  |  |||||||| || ||  | ||||| |  |    
T  47488 cacaagaagaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaacccatggctactgttgctcttatcaatgcagcccaaatgcctccatcat 47389  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  47388 acccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 47298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 381 - 54
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccg-agttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctcca 449  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||   |||| || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  381 gctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagccccca 282  T
Q  450 cctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtaca 549  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |    
T  281 ccggatccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtata 182  T
Q  550 ttgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    | || || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||    
T  181 tcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgat 82  T
Q  650 tgaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
     || |||| |||||||||||| ||||||    
T  81 cgaagtatgtgaggaagctcctagactt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 443
Alignment:
Q  2 catgggaacccacttagaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcat 101  Q
    |||||||||||   | ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| ||     
T  733 catgggaacccgtctggaagaagccgtcagggatggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacac 634  T
Q  102 cataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgt 201  Q
    || ||||||||||| || |||||||||||||| |   | ||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  |    
T  633 cacaagaagaaagaaacggaagtagggatggtgtcaactggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcat 534  T
Q  202 acccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtctacctcaggtacccgttaa 292  Q
    |||| |||| ||  || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  533 acccatatgtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaa 443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 492 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 571
Alignment:
Q  492 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 591  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  592 acaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    | ||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Original strand, 9571 - 9897
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  9571 gctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagcccccac 9670  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  9671 ctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9770  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
    ||| || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||     
T  9771 tgtgaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9870  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  9871 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 260
Target Start/End: Original strand, 7925 - 8143
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  7925 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 8024  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || |||||||  ||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  8025 gagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 8124  T
Q  242 attctatcatcagtatcct 260  Q
     || |||||||||||||||    
T  8125 gttttatcatcagtatcct 8143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 9317 - 8998
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  9317 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 9218  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  9217 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 9118  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||     
T  9117 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 9018  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  9017 gaagtgtgtgaggaagctcc 8998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Original strand, 20020 - 20339
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  20020 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccac 20119  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  20120 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 20219  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||     
T  20220 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatc 20319  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcc 670  Q
    || || | ||||||||||||    
T  20320 gaagtgtgtgaggaagctcc 20339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9584 - 9415
Alignment:
Q  87 tatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctc 186  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| || |  || |||||||| ||||    
T  9584 tatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctc 9485  T
Q  187 agctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    |  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  9484 aaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 9415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 7490 - 7164
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  7490 gctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 7391  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||    
T  7390 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 7291  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||     
T  7290 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatc 7191  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | ||| |||||||| ||||||    
T  7190 gaagtgtgtgaagaagctccgagactt 7164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7802 - 7588
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  7802 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 7703  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  7702 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 7603  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  7602 gttttatcatcagta 7588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 351 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 26453 - 26154
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  26453 gctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 26354  T
Q  451 ctaatccgttgcctcc-caggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtaca 549  Q
    || |||||||||||||  ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| |    
T  26353 ctgatccgttgcctccaaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtata 26254  T
Q  550 ttgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 649  Q
    | || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  26253 tcgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgat 26154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26765 - 26551
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||  ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |    
T  26765 attgtgtttgagaaagctgaatcctctgtaaatgcgtcgaagagatatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctg 26666  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||||| ||||| |||||    
T  26665 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccacc 26566  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  26565 gttttatcatcagta 26551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 351 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15181 - 14855
Alignment:
Q  351 gctagacctacttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 450  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  15181 gctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccac 15082  T
Q  451 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 550  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| ||    
T  15081 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatat 14982  T
Q  551 tgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatt 650  Q
     || || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||   ||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  ||||     
T  14981 cgtgaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatc 14882  T
Q  651 gaggtatatgaggaagctcccagactt 677  Q
    || || | |||||||||||| ||||||    
T  14881 gaagtgtgtgaggaagctcctagactt 14855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15493 - 15279
Alignment:
Q  42 attgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatatgccg 141  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| |  | ||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||  || |    
T  15493 attgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaaaaggtacggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtggggatggtatcagctg 15394  T
Q  142 gaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccacc 241  Q
    || || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  || ||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  15393 gagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccatattctcagcatccgttcttcccacc 15294  T
Q  242 attctatcatcagta 256  Q
     || |||||||||||    
T  15293 gttttatcatcagta 15279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 66; Significance: 8e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 360 - 677
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8280
Alignment:
Q  360 acttttcccccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgt 459  Q
    |||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  7963 acttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgt 8062  T
Q  460 tgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaa 559  Q
    ||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| || ||    
T  8063 tgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtgaagaa 8162  T
Q  560 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaactgccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 659  Q
     |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  8163 actcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 8262  T
Q  660 gaggaagctcccagactt 677  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  8263 gaggaagctcctagactt 8280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 256
Target Start/End: Original strand, 7615 - 7844
Alignment:
Q  27 gtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatcaaggaagtatggtaatggtcatcataagaagaaagagacagaagtag 126  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||| | | |||||| | || |||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |    
T  7615 gtcagagatgggatcattgtgtttgagaaagctgaatcttctacgagtgcatcgaagaggtatggtaatggacaccacaagaagaaagaaacggaagtgg 7714  T
Q  127 ggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgtccccatcaatgctgctcagctacctccgttgtacccgtatgcgcaatactctcagca 226  Q
    | ||||| |  || | | || ||||||| |||||||| ||||  || |||||||| |||||  | |||||||  ||||| |||  ||  || ||||||||    
T  7715 gaatggtgtcagctgcagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagca 7814  T
Q  227 tcccttctttccaccattctatcatcagta 256  Q
    ||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  7815 tccgttcttcccaccgttttatcatcagta 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 603 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 46801 - 46764
Alignment:
Q  603 catgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 640  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46801 catgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgt 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 432 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 46981 - 46894
Alignment:
Q  432 agacagggcaa--gcctccacctaatccgttgcctcccaggttccat-tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtc 516  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |||||| |  || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  46981 agacagggcaaacgcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtc 46894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 48742 - 48630
Alignment:
Q  18 gaagaggctgtcagagacggcattattgtgtttgagaaaggtgaatcctctgcaaatgcatc-aaggaagtatggtaa-tggtcatcataagaagaaaga 115  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| || || |||||||||  || || || |||||||||||    
T  48742 gaagaagccgtcagagaaggaatcattgtgttcgagaaagctgaatcctctgtgaatgcatcaaaagaggtatggtaacgggacaccacaagaagaaaga 48643  T
Q  116 gacagaagtaggg 128  Q
     || |||||||||    
T  48642 aacggaagtaggg 48630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University