View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_409 (Length: 225)

Name: NF9913A_low_409
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_409
NF9913A_low_409
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (1-224)||(26999823-27000046)
chr6 (1-224)||(26918130-26918353)
chr6 (1-224)||(26988751-26988974)
chr6 (1-224)||(15424540-15424763)
chr6 (1-224)||(16749604-16749827)
chr6 (4-224)||(24304844-24305064)
chr6 (1-224)||(13299174-13299397)
chr6 (1-224)||(24863467-24863690)
chr6 (1-224)||(3695813-3696036)
chr6 (1-224)||(34463584-34463807)
chr6 (1-224)||(17025012-17025235)
chr6 (1-224)||(22935100-22935323)
chr6 (1-224)||(23857545-23857768)
chr6 (1-224)||(27007462-27007685)
chr6 (1-224)||(26777850-26778073)
chr6 (1-224)||(27360233-27360456)
chr6 (1-224)||(27450576-27450799)
chr6 (1-224)||(29572763-29572986)
chr6 (1-224)||(4546007-4546230)
chr6 (1-224)||(4724366-4724589)
chr6 (1-224)||(4757511-4757734)
chr6 (1-224)||(4772747-4772970)
chr6 (1-224)||(16944250-16944473)
chr6 (1-224)||(27484867-27485090)
chr6 (1-224)||(28207192-28207415)
chr6 (1-224)||(30558239-30558462)
chr6 (1-224)||(16673877-16674100)
chr6 (1-224)||(26116642-26116865)
chr6 (18-224)||(27044140-27044346)
chr6 (18-225)||(29549227-29549434)
chr6 (31-224)||(29501156-29501349)
chr6 (18-224)||(4525039-4525245)
chr6 (5-177)||(22477500-22477672)
chr6 (25-107)||(20160571-20160653)
chr6 (25-107)||(22172178-22172260)
chr6 (31-107)||(13522323-13522399)
chr6 (31-107)||(28162527-28162603)
chr6 (31-107)||(33374506-33374582)
chr6 (31-107)||(8892560-8892636)
chr6 (31-107)||(8903795-8903871)
chr6 (17-110)||(27629948-27630041)
[»] chr3 (59 HSPs)
chr3 (1-224)||(4796974-4797197)
chr3 (1-224)||(4721345-4721568)
chr3 (1-224)||(35880480-35880703)
chr3 (1-224)||(6192030-6192253)
chr3 (1-224)||(18050976-18051199)
chr3 (1-224)||(28116278-28116501)
chr3 (1-224)||(7072926-7073149)
chr3 (18-224)||(15741420-15741626)
chr3 (1-224)||(8295689-8295912)
chr3 (1-224)||(18330388-18330606)
chr3 (1-224)||(29149076-29149299)
chr3 (1-224)||(7996276-7996499)
chr3 (1-224)||(10642784-10643007)
chr3 (1-224)||(11110682-11110905)
chr3 (1-224)||(15893027-15893250)
chr3 (1-224)||(8301585-8301808)
chr3 (1-224)||(20577183-20577406)
chr3 (1-224)||(21674407-21674630)
chr3 (1-224)||(47023167-47023390)
chr3 (1-224)||(6542795-6543018)
chr3 (1-224)||(29665306-29665529)
chr3 (1-224)||(36997410-36997633)
chr3 (1-224)||(17985277-17985500)
chr3 (1-224)||(4416630-4416853)
chr3 (18-225)||(20065759-20065966)
chr3 (1-224)||(22871195-22871418)
chr3 (1-224)||(22886254-22886477)
chr3 (1-224)||(24327873-24328096)
chr3 (1-224)||(51781725-51781948)
chr3 (1-224)||(51796814-51797037)
chr3 (1-224)||(28339016-28339239)
chr3 (1-224)||(31964794-31965017)
chr3 (1-224)||(48465629-48465852)
chr3 (1-224)||(50134392-50134615)
chr3 (1-224)||(5013426-5013649)
chr3 (1-224)||(5609643-5609866)
chr3 (1-224)||(18224905-18225128)
chr3 (1-224)||(18242441-18242664)
chr3 (18-224)||(10395850-10396056)
chr3 (18-224)||(8211455-8211661)
chr3 (18-224)||(4347022-4347228)
chr3 (18-224)||(5466699-5466905)
chr3 (18-224)||(18277390-18277596)
chr3 (18-224)||(18292691-18292897)
chr3 (18-224)||(18307992-18308198)
chr3 (18-224)||(28020992-28021198)
chr3 (31-224)||(5596717-5596910)
chr3 (1-107)||(5713058-5713164)
chr3 (1-107)||(5723968-5724074)
chr3 (1-107)||(5757403-5757509)
chr3 (1-107)||(5768294-5768400)
chr3 (31-221)||(18530114-18530304)
chr3 (31-214)||(16626854-16627037)
chr3 (18-174)||(4892977-4893133)
chr3 (18-225)||(22387913-22388120)
chr3 (18-225)||(32438870-32439077)
chr3 (31-107)||(17994132-17994208)
chr3 (32-107)||(4625778-4625853)
chr3 (31-107)||(5652221-5652297)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (1-224)||(23718165-23718388)
chr5 (1-224)||(23752627-23752850)
chr5 (1-224)||(11549116-11549339)
chr5 (1-224)||(22999291-22999514)
chr5 (1-224)||(33777249-33777472)
chr5 (1-224)||(41674471-41674694)
chr5 (1-224)||(9548720-9548943)
chr5 (1-224)||(24688334-24688557)
chr5 (1-224)||(15658937-15659160)
chr5 (1-224)||(30934398-30934621)
chr5 (1-224)||(18500925-18501148)
chr5 (1-224)||(24681199-24681422)
chr5 (1-224)||(24723726-24723949)
chr5 (1-224)||(31431190-31431413)
chr5 (1-224)||(8665652-8665875)
chr5 (1-224)||(31826596-31826819)
chr5 (1-224)||(37358832-37359055)
chr5 (1-224)||(43078011-43078234)
chr5 (4-224)||(28648988-28649208)
chr5 (1-224)||(5637672-5637895)
chr5 (1-224)||(6874064-6874287)
chr5 (1-224)||(9317213-9317436)
chr5 (1-224)||(30168231-30168454)
chr5 (1-224)||(37671669-37671892)
chr5 (6-224)||(12131917-12132135)
chr5 (1-224)||(3789288-3789511)
chr5 (1-224)||(13325021-13325244)
chr5 (1-224)||(18375589-18375812)
chr5 (1-224)||(26480154-26480377)
chr5 (1-224)||(37754730-37754953)
chr5 (1-224)||(2510813-2511036)
chr5 (1-224)||(28959975-28960198)
chr5 (1-224)||(29967243-29967466)
chr5 (1-224)||(30029177-30029400)
chr5 (1-224)||(33516118-33516341)
chr5 (1-224)||(15759034-15759257)
chr5 (1-224)||(30151780-30152003)
chr5 (1-224)||(37771176-37771399)
chr5 (1-224)||(40473729-40473952)
chr5 (31-224)||(32599676-32599869)
chr5 (31-221)||(23891971-23892161)
chr5 (18-224)||(34616283-34616489)
chr5 (41-221)||(25198797-25198977)
chr5 (1-143)||(24969867-24970009)
chr5 (145-224)||(24951872-24951951)
chr5 (31-172)||(22888287-22888428)
chr5 (18-225)||(33292289-33292496)
chr5 (31-107)||(13184852-13184928)
chr5 (31-107)||(13440698-13440774)
chr5 (31-107)||(33877129-33877205)
chr5 (31-107)||(11325676-11325752)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-224)||(410-633)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-224)||(16277307-16277530)
chr8 (1-224)||(2137498-2137721)
chr8 (1-224)||(27609144-27609367)
chr8 (1-224)||(14557380-14557603)
chr8 (1-225)||(19674190-19674414)
chr8 (3-224)||(19687851-19688072)
chr8 (1-224)||(19518382-19518605)
chr8 (1-224)||(3329758-3329981)
chr8 (3-224)||(29829066-29829287)
chr8 (1-224)||(19208599-19208822)
chr8 (1-224)||(33258476-33258699)
chr8 (1-224)||(16283202-16283425)
chr8 (1-224)||(18710339-18710562)
chr8 (1-224)||(31489989-31490212)
chr8 (1-224)||(28362194-28362417)
chr8 (1-224)||(12092972-12093195)
chr8 (18-224)||(19286218-19286424)
chr8 (18-224)||(31354277-31354483)
chr8 (25-221)||(22081135-22081331)
chr8 (31-133)||(19659305-19659407)
chr8 (31-133)||(44562948-44563050)
chr8 (31-107)||(9354495-9354571)
[»] chr7 (30 HSPs)
chr7 (1-224)||(5127746-5127969)
chr7 (2-224)||(2154327-2154549)
chr7 (1-224)||(11424942-11425165)
chr7 (1-224)||(16736626-16736849)
chr7 (1-224)||(16751680-16751903)
chr7 (1-224)||(17523286-17523509)
chr7 (1-224)||(17529706-17529929)
chr7 (1-224)||(10917031-10917254)
chr7 (1-224)||(45387097-45387320)
chr7 (1-224)||(11441314-11441537)
chr7 (1-224)||(5147506-5147729)
chr7 (1-224)||(26435011-26435234)
chr7 (1-224)||(31124665-31124888)
chr7 (1-224)||(3445048-3445271)
chr7 (1-224)||(16503546-16503769)
chr7 (1-224)||(16518582-16518805)
chr7 (1-224)||(24592707-24592930)
chr7 (1-224)||(26275260-26275483)
chr7 (1-224)||(26485910-26486133)
chr7 (1-224)||(31564565-31564788)
chr7 (6-224)||(26320040-26320258)
chr7 (1-224)||(26538039-26538262)
chr7 (1-224)||(9618405-9618628)
chr7 (1-224)||(26670080-26670303)
chr7 (18-224)||(4145306-4145512)
chr7 (37-221)||(16041083-16041267)
chr7 (39-221)||(16450199-16450381)
chr7 (18-225)||(5159275-5159482)
chr7 (31-107)||(31088657-31088733)
chr7 (31-107)||(45733334-45733410)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-224)||(23128835-23129058)
chr2 (1-224)||(28881963-28882186)
chr2 (1-224)||(13936813-13937036)
chr2 (1-224)||(34279198-34279421)
chr2 (1-224)||(11635458-11635681)
chr2 (1-224)||(11641647-11641870)
chr2 (1-224)||(12655291-12655514)
chr2 (1-224)||(261034-261257)
chr2 (1-224)||(12716874-12717097)
chr2 (1-224)||(20837667-20837890)
chr2 (1-224)||(21677451-21677674)
chr2 (1-224)||(32049547-32049770)
chr2 (1-224)||(34286103-34286326)
chr2 (1-224)||(34291163-34291386)
chr2 (1-224)||(27434713-27434936)
chr2 (1-224)||(37925242-37925465)
chr2 (1-224)||(12586550-12586773)
chr2 (1-224)||(27803441-27803664)
chr2 (1-224)||(39889811-39890034)
chr2 (1-224)||(40233248-40233471)
chr2 (1-224)||(27776956-27777179)
chr2 (1-224)||(27816723-27816946)
chr2 (1-224)||(9350263-9350486)
chr2 (1-224)||(31876030-31876253)
chr2 (1-224)||(34861429-34861652)
chr2 (1-224)||(37686178-37686401)
chr2 (1-224)||(37701443-37701666)
chr2 (1-224)||(16829607-16829830)
chr2 (1-224)||(16891651-16891874)
chr2 (1-224)||(19416768-19416991)
chr2 (1-224)||(22926297-22926520)
chr2 (1-224)||(39052097-39052320)
chr2 (32-224)||(37374910-37375102)
chr2 (31-221)||(21703460-21703650)
chr2 (31-221)||(19456717-19456907)
chr2 (31-133)||(31891624-31891726)
chr2 (31-107)||(3784523-3784599)
chr2 (31-107)||(27118557-27118633)
chr2 (31-107)||(34156880-34156956)
chr2 (32-107)||(34303600-34303675)
chr2 (6-107)||(27392859-27392960)
chr2 (31-107)||(16163468-16163544)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-224)||(27045-27268)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (1-224)||(24592591-24592814)
chr4 (1-224)||(17013768-17013991)
chr4 (1-224)||(5005638-5005861)
chr4 (1-224)||(30753510-30753733)
chr4 (1-224)||(6569621-6569844)
chr4 (1-224)||(14664786-14665009)
chr4 (1-224)||(27163597-27163820)
chr4 (1-224)||(21969469-21969692)
chr4 (1-224)||(18800902-18801125)
chr4 (1-224)||(14098309-14098532)
chr4 (1-224)||(33674090-33674313)
chr4 (1-224)||(31126798-31127021)
chr4 (1-224)||(39850391-39850614)
chr4 (1-224)||(40105918-40106141)
chr4 (18-224)||(54833158-54833364)
chr4 (18-224)||(14763601-14763807)
chr4 (51-224)||(19373029-19373202)
chr4 (18-224)||(36344809-36345015)
chr4 (31-221)||(1900031-1900221)
chr4 (31-221)||(15227644-15227834)
chr4 (31-221)||(15285235-15285425)
chr4 (18-225)||(24112432-24112639)
chr4 (18-225)||(34189254-34189461)
chr4 (6-221)||(14235810-14236025)
chr4 (31-107)||(24460912-24460988)
chr4 (159-221)||(15391771-15391833)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-224)||(30206-30429)
scaffold0124 (31-221)||(20168-20358)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-224)||(47265-47488)
scaffold0089 (1-224)||(40349-40572)
scaffold0089 (1-224)||(29516-29739)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (1-224)||(41793588-41793811)
chr1 (1-224)||(10962422-10962645)
chr1 (1-224)||(51637970-51638193)
chr1 (1-224)||(28584733-28584956)
chr1 (31-221)||(20460863-20461053)
chr1 (139-221)||(16208443-16208525)
chr1 (31-107)||(20340642-20340718)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (6-224)||(7524-7742)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-224)||(15210-15433)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-224)||(26482-26705)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-224)||(7690-7913)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-224)||(9346-9569)
scaffold0159 (1-185)||(19807-19991)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-224)||(5742-5967)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (1-192)||(13-204)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (18-224)||(7985-8191)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (31-107)||(2965-3041)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (6-221)||(21323-21538)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27000046 - 26999823
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000046 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 26999947  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26999946 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 26999847  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26999846 tacttccgtttctttcttcttgtg 26999823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26918353 - 26918130
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26918353 ggcaactgttgtttcgtctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 26918254  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26918253 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 26918154  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26918153 tacttccgtttctttcttcttgtg 26918130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26988974 - 26988751
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26988974 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 26988875  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26988874 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 26988775  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26988774 tacttccgtttctttcttcttgtg 26988751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15424540 - 15424763
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424540 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 15424639  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424640 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 15424739  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15424740 tacttccgtttctttcttcttgtg 15424763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16749827 - 16749604
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749827 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 16749728  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16749727 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgagctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 16749628  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16749627 tacttccgtttctttcttcttgtg 16749604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 24304844 - 24305064
Alignment:
Q  4 aactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgct 103  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24304844 aactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggatgct 24304943  T
Q  104 gagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctac 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24304944 gagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctac 24305043  T
Q  204 ttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24305044 ttccgtttctttcttcttgtg 24305064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13299174 - 13299397
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299174 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 13299273  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  13299274 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccc 13299373  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  13299374 tacttccgtttctttcttcttgtg 13299397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24863690 - 24863467
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24863690 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttggggttgactcggtggtagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 24863591  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24863590 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatccc 24863491  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24863490 tacttccgtttctttcttcttgtg 24863467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3696036 - 3695813
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  3696036 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 3695937  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3695936 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 3695837  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  3695836 cacttccgtttctttcttcttgtg 3695813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 34463584 - 34463807
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  34463584 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 34463683  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34463684 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 34463783  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  34463784 cacttccgtttctttcttcttgtg 34463807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17025235 - 17025012
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  17025235 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 17025136  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17025135 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccattcc 17025036  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  17025035 cacttccgtttctttcttcttgtg 17025012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22935100 - 22935323
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22935100 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggat 22935199  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  22935200 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccc 22935299  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  22935300 tatttccgtttctttcttcttgtg 22935323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23857545 - 23857768
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23857545 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaagggat 23857644  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  23857645 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggccccggctgacaccatccc 23857744  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  23857745 tatttccgtttctttcttcttgtg 23857768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27007685 - 27007462
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27007685 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggat 27007586  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27007585 gctgagaatacggcatatataggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 27007486  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27007485 cacttccgtttctttcttcttgtg 27007462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26777850 - 26778073
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  26777850 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 26777949  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26777950 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggtgcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 26778049  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26778050 cacttccgtttctttcttcttgtg 26778073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27360233 - 27360456
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27360233 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 27360332  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27360333 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 27360432  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27360433 cacttccgtttctttcttcttgtg 27360456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27450576 - 27450799
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27450576 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 27450675  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27450676 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 27450775  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27450776 cacttccgtttctttcttcttgtg 27450799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29572986 - 29572763
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29572986 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 29572887  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29572886 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 29572787  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  29572786 cacttccgtttctttcttcttgtg 29572763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 4546007 - 4546230
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4546007 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 4546106  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  4546107 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcc 4546206  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  4546207 cacttccgtttctttcttcttgtg 4546230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 4724366 - 4724589
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4724366 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 4724465  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  4724466 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcc 4724565  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  4724566 cacttccgtttctttcttcttgtg 4724589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4757734 - 4757511
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4757734 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 4757635  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4757634 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacagtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccc 4757535  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  4757534 cacttccgtttctttcttcttgtg 4757511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4772970 - 4772747
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4772970 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 4772871  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4772870 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccc 4772771  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  4772770 cacttccgtttctttcttcttgtg 4772747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16944250 - 16944473
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16944250 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 16944349  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16944350 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 16944449  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16944450 cacttccgtttctttcttcttgtg 16944473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27485090 - 27484867
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  27485090 ggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 27484991  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27484990 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 27484891  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27484890 cacttccgtttctttcttcttgtg 27484867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28207415 - 28207192
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28207415 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28207316  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  28207315 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcc 28207216  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  28207215 cacttccgtttctttcttcttgtg 28207192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 30558239 - 30558462
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  30558239 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 30558338  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30558339 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 30558438  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  30558439 cacttcagtttctttcttcttgtg 30558462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16674100 - 16673877
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  16674100 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 16674001  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  16674000 gctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcc 16673901  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16673900 cacttccgtttctttcttcttgtg 16673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26116642 - 26116865
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| | ||    
T  26116642 ggcaactgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacgaat 26116741  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26116742 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgataggagcaacggtagctatagattgaccggctccagctgacaccatccc 26116841  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26116842 cacttccgtttctttcttcttgtg 26116865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27044346 - 27044140
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27044346 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 27044247  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27044246 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 27044147  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  27044146 tcttgtg 27044140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29549434 - 29549227
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29549434 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 29549335  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29549334 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 29549235  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  29549234 tcttgtga 29549227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29501349 - 29501156
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29501349 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacg 29501250  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29501249 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 29501156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4525245 - 4525039
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4525245 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4525146  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4525145 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4525046  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  4525045 tcttgtg 4525039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Original strand, 22477500 - 22477672
Alignment:
Q  5 actgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctg 104  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22477500 actgttgttgcatttgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactaatgatagaatggtggaaagaagggatgctg 22477599  T
Q  105 agaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattga 177  Q
    ||| ||| || |||| ||||| ||| |||  | |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22477600 agagtactgcgcatacgggtacgacagaggtaattgggcagcattaattggggcaacagtagccatggattga 22477672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 20160653 - 20160571
Alignment:
Q  25 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20160653 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 20160571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Original strand, 22172178 - 22172260
Alignment:
Q  25 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  22172178 gcaatggcattaacgggtacctgaggttgacccggtggtagaggatactgatggtaaaatggtggatagaaaggatgttgaga 22172260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 13522323 - 13522399
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13522323 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13522399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28162603 - 28162527
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28162603 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaga 28162527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 33374506 - 33374582
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33374506 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33374582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 8892560 - 8892636
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  8892560 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 8892636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 8903795 - 8903871
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  8903795 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagagatgctgaga 8903871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 17 - 110
Target Start/End: Original strand, 27629948 - 27630041
Alignment:
Q  17 tctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaata 110  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||| |||||| | || | ||||| ||| |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||    
T  27629948 tctgttgcacaatagcattcacgggtacctgaggtggtcctgatggcaaaggatattgatggtaaaacggtgggaagaatggatgctgagaata 27630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 59)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 4796974 - 4797197
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4796974 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 4797073  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4797074 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 4797173  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4797174 tacttccgtttctttcttcttgtg 4797197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4721568 - 4721345
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4721568 ggcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaagat 4721469  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4721468 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 4721369  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4721368 tacttccgtttctttcttcttgtg 4721345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35880703 - 35880480
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35880703 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 35880604  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35880603 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 35880504  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  35880503 tacttccgtttctttcttcttgtg 35880480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6192253 - 6192030
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6192253 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactaatgataaaatggcgaaaagaaaggat 6192154  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  6192153 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccaactgacaccatcca 6192054  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  6192053 tacttccgtttctttcttcttgtg 6192030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18051199 - 18050976
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18051199 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 18051100  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18051099 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 18051000  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18050999 tacttccgtttctttcttcttgtg 18050976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28116278 - 28116501
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28116278 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 28116377  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28116378 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 28116477  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  28116478 cacttccgtttctttcttcttgtg 28116501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7073149 - 7072926
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7073149 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 7073050  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7073049 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgactggctccagctgacaccatccc 7072950  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  7072949 cacttccgtttctttcttcttgtg 7072926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 15741420 - 15741626
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741420 ctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 15741519  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15741520 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 15741619  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  15741620 tcttgtg 15741626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8295912 - 8295689
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8295912 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 8295813  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  8295812 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 8295713  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8295712 tacttccgtttctttcttcttgtg 8295689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18330606 - 18330388
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||    
T  18330606 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggg-----atgataaaatggtggaaagaaaggat 18330512  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18330511 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 18330412  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18330411 tacttccgtttctttcttcttgtg 18330388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29149076 - 29149299
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  29149076 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 29149175  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29149176 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 29149275  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29149276 tacttccgtttctttcttcttgtg 29149299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7996499 - 7996276
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7996499 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 7996400  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7996399 gctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 7996300  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  7996299 cacttccgtttctttcttcttgtg 7996276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10643007 - 10642784
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10643007 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 10642908  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10642907 gctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 10642808  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  10642807 cacttccgtttctttcttcttgtg 10642784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11110682 - 11110905
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  11110682 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 11110781  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11110782 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11110881  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  11110882 cacttccgtttccttcttcttgtg 11110905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15893027 - 15893250
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  15893027 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaagggcggaaagaaaggat 15893126  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  15893127 gctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 15893226  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15893227 tacttccgtttctttcttcttgtg 15893250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8301585 - 8301808
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  8301585 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 8301684  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||     
T  8301685 gctgagaatacggcgcatatgagtacgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacaatagccatggattgaccggctccggcagacaccatcca 8301784  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8301785 tacttccgtttctttcttcttgtg 8301808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 20577183 - 20577406
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  20577183 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 20577282  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20577283 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 20577382  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20577383 cacttccgtttctttcttcttgtg 20577406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21674630 - 21674407
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21674630 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgatgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaatggcggaaagaacggat 21674531  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21674530 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagccacggtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccc 21674431  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21674430 cacttccgtttctttcttcttgtg 21674407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 47023390 - 47023167
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  47023390 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 47023291  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47023290 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 47023191  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  47023190 cacttccgtttctttcttcttgtg 47023167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 6542795 - 6543018
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  6542795 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 6542894  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6542895 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 6542994  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  6542995 cacttccgtttctttcttcttgtg 6543018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29665306 - 29665529
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29665306 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 29665405  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29665406 gctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 29665505  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  29665506 cacttccgtttctttcttcttgtg 29665529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 36997410 - 36997633
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  36997410 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggttggccgggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 36997509  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36997510 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 36997609  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  36997610 cacttccgtttctttcttcttgtg 36997633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 17985277 - 17985500
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  17985277 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 17985376  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17985377 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 17985476  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  17985477 cacttccgtttctttcttcttgtg 17985500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4416853 - 4416630
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||  ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4416853 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtgctgatgataaaacggtgggaagaacggat 4416754  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4416753 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 4416654  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  4416653 cacttccgtttctttcttcttgtg 4416630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20065966 - 20065759
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20065966 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 20065867  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  20065866 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtatctttct 20065767  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  20065766 tcttgtga 20065759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22871195 - 22871418
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  22871195 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 22871294  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22871295 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 22871394  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  22871395 cacttccgtttctttcttcttgtg 22871418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22886254 - 22886477
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  22886254 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcctggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 22886353  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22886354 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatctgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 22886453  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  22886454 cacttccgtttctttcttcttgtg 22886477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24328096 - 24327873
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24328096 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 24327997  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  24327996 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 24327897  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24327896 cacttccgtttctttcttcttgtg 24327873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51781948 - 51781725
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  51781948 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 51781849  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51781848 gctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 51781749  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  51781748 cacttccgtttctttcttcttgtg 51781725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51797037 - 51796814
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  51797037 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 51796938  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51796937 gctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 51796838  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  51796837 cacttccgtttctttcttcttgtg 51796814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28339239 - 28339016
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28339239 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28339140  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  28339139 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 28339040  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  28339039 cacttccgtttctttcttcttgtg 28339016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31964794 - 31965017
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31964794 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31964893  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31964894 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 31964993  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31964994 cacttccgtttctttcttcttgtg 31965017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48465852 - 48465629
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  48465852 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcggggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 48465753  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  48465752 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcc 48465653  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  48465652 cacttccgtttctttcttcttgtg 48465629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 50134392 - 50134615
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  50134392 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 50134491  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50134492 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 50134591  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  50134592 cacttccgtttctttcttcttgtg 50134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5013649 - 5013426
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  5013649 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 5013550  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5013549 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 5013450  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5013449 cacttccgtttctttcttcttgtg 5013426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5609643 - 5609866
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  5609643 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 5609742  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5609743 gctgagaatacgtcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 5609842  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5609843 cacttccgtttctttcttcttgtg 5609866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18225128 - 18224905
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  18225128 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 18225029  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18225028 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 18224929  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18224928 cacttccgtttctttcttcttgtg 18224905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18242664 - 18242441
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| || ||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  18242664 ggcaactgttgtttcatctgctgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagagtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 18242565  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18242564 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccggctgacaccatccc 18242465  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18242464 cacttccgtttctttcttcttgtg 18242441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10396056 - 10395850
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  10396056 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgggaatacggcata 10395957  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10395956 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 10395857  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  10395856 tcttgtg 10395850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8211661 - 8211455
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  8211661 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcgca 8211562  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8211561 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 8211462  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  8211461 tcttgtg 8211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 4347022 - 4347228
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4347022 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4347121  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4347122 catgggtatgacggaggcatttgggctgcgttgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 4347221  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  4347222 tcttgtg 4347228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5466905 - 5466699
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5466905 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaatggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 5466806  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5466805 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccccacttccgtttctttct 5466706  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  5466705 tcttgtg 5466699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 18277390 - 18277596
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18277390 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18277489  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18277490 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18277589  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  18277590 tcttgtg 18277596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 18292691 - 18292897
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18292691 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18292790  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18292791 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18292890  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  18292891 tcttgtg 18292897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 18307992 - 18308198
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18307992 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 18308091  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18308092 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 18308191  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  18308192 tcttgtg 18308198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28021198 - 28020992
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28021198 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 28021099  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28021098 tatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgcccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttct 28020999  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  28020998 tcttgtg 28020992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 5596717 - 5596910
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5596717 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggatgctgagaatacggcatatatgggtacgacg 5596816  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5596817 gaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 5596910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5713164 - 5713058
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5713164 ggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggat 5713065  T
Q  101 gctgaga 107  Q
    |||||||    
T  5713064 gctgaga 5713058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5724074 - 5723968
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5724074 ggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggat 5723975  T
Q  101 gctgaga 107  Q
    |||||||    
T  5723974 gctgaga 5723968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 5757403 - 5757509
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5757403 ggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggat 5757502  T
Q  101 gctgaga 107  Q
    |||||||    
T  5757503 gctgaga 5757509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 5768294 - 5768400
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  5768294 ggcaactgttgtttcatctgttgggcgattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggtggaaagaagggat 5768393  T
Q  101 gctgaga 107  Q
    |||||||    
T  5768394 gctgaga 5768400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18530304 - 18530114
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| || |    
T  18530304 gcattaacgggcacttgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgatg 18530205  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||   | ||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18530204 gaggtaactgggcagcattaataggggtaacagtagccatggattgactagttccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 18530114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 16626854 - 16627037
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||  |  |||| ||||| ||||    
T  16626854 gcattaacgggtaccggaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaacggtggaaagaagggatgctgagagtattgtgcatacgggtacgacg 16626953  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctt 214  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  16626954 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctt 16627037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4893133 - 4892977
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  4893133 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 4893034  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggat 174  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4893033 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggat 4892977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 22387913 - 22388120
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |  || ||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  22387913 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacgatgggaagaacggatgctgagagtatggtgca 22388012  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  22388013 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 22388112  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  22388113 tcttgtga 22388120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32439077 - 32438870
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  32439077 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 32438978  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  32438977 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 32438878  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  32438877 tcttgtga 32438870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 17994132 - 17994208
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  17994132 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 17994208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 4625853 - 4625778
Alignment:
Q  32 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  4625853 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatataatggtggaaagaagggatgctgaga 4625778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 5652297 - 5652221
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| | | || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  5652297 gcattaacgggtacctgaggttgacccgattgcaaacgatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 5652221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23718165 - 23718388
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23718165 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23718264  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23718265 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23718364  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23718365 tacttccgtttctttcttcttgtg 23718388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23752627 - 23752850
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23752627 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23752726  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23752727 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23752826  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23752827 tacttccgtttctttcttcttgtg 23752850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11549339 - 11549116
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  11549339 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggtggaaagaaaggat 11549240  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11549239 gctgtgaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11549140  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11549139 tacttccgtttctttcttcttgtg 11549116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22999291 - 22999514
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22999291 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 22999390  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22999391 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 22999490  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  22999491 tatttccgtttctttcttcttgtg 22999514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33777472 - 33777249
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33777472 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 33777373  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33777372 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccagctgacaccatccc 33777273  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33777272 tacttccgtttctttcttcttgtg 33777249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 41674694 - 41674471
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41674694 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggtggacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 41674595  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41674594 gctgagcatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 41674495  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  41674494 cacttccgtttctttcttcttgtg 41674471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9548720 - 9548943
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9548720 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 9548819  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9548820 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgtattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 9548919  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9548920 cacttccgtttctttcttcttgtg 9548943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24688334 - 24688557
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24688334 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgtattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 24688433  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  24688434 gttgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 24688533  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24688534 tacttccgtttctttcttcttgtg 24688557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15658937 - 15659160
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15658937 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaacggcggaaagaaaggat 15659036  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15659037 gctgagaatacggcacatatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 15659136  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15659137 cacttccgtttctttcttcttgtg 15659160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30934621 - 30934398
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30934621 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 30934522  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  |||||||||||    
T  30934521 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcatggattggccggctccggtagacaccatccc 30934422  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30934421 tacttccgtttctttcttcttgtg 30934398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18500925 - 18501148
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  18500925 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 18501024  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18501025 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 18501124  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18501125 cacttccgtttctttcttcttgtg 18501148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24681422 - 24681199
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24681422 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 24681323  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24681322 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 24681223  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24681222 cacttccgtttctttcttcttgtg 24681199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24723949 - 24723726
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24723949 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 24723850  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24723849 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 24723750  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24723749 cacttccgtttctttcttcttgtg 24723726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31431413 - 31431190
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31431413 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31431314  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31431313 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccc 31431214  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31431213 cacttccgtttctttcttcttgtg 31431190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8665652 - 8665875
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8665652 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtgacagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 8665751  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  8665752 gctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 8665851  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  8665852 cacttcagtttctttcttcttgtg 8665875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31826596 - 31826819
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31826596 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31826695  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31826696 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 31826795  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31826796 cacttccgtttctttcttcttgtg 31826819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37358832 - 37359055
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37358832 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37358931  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37358932 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 37359031  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37359032 cacttccgtttctttcttcttgtg 37359055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43078234 - 43078011
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  43078234 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 43078135  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43078134 gctgagaatacggcatgtatgggtacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagttgacaccatccc 43078035  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  43078034 cacttccgtttctttcttcttgtg 43078011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28649208 - 28648988
Alignment:
Q  4 aactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgct 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28649208 aactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggatgct 28649109  T
Q  104 gagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctac 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28649108 gagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgtattgatagttgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccac 28649009  T
Q  204 ttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28649008 ttccgtttctttcttcttgtg 28648988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5637895 - 5637672
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  5637895 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 5637796  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5637795 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 5637696  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5637695 cacttccgtttctttcttcttgtg 5637672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6874287 - 6874064
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  6874287 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 6874188  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6874187 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 6874088  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  6874087 cacttccgtttctttcttcttgtg 6874064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9317436 - 9317213
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  9317436 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 9317337  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9317336 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 9317237  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9317236 cacttccgtttctttcttcttgtg 9317213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30168454 - 30168231
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  30168454 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 30168355  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30168354 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaatagtagccatggattgaccggctccagctgataccatccc 30168255  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  30168254 cacttcagtttctttcttcttgtg 30168231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37671669 - 37671892
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37671669 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37671768  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37671769 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccggctgacaccatccc 37671868  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37671869 cacttccgtttctttcttcttgtg 37671892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12132135 - 12131917
Alignment:
Q  6 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  12132135 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctga 12132036  T
Q  106 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12132035 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccactt 12131936  T
Q  206 ccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12131935 ccgtttctttcttcttgtg 12131917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3789511 - 3789288
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  3789511 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacctgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 3789412  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3789411 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 3789312  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  3789311 cacttccgtttctttcttcttgtg 3789288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13325021 - 13325244
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  13325021 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 13325120  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13325121 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccagctccagctgacaccatccc 13325220  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13325221 cacttccgtttctttcttcttgtg 13325244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18375589 - 18375812
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  18375589 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 18375688  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18375689 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 18375788  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18375789 cacttccgtttctttcttcttgtg 18375812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26480377 - 26480154
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26480377 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26480278  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26480277 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26480178  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  26480177 cacttcagtttctttcttcttgtg 26480154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37754953 - 37754730
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37754953 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37754854  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37754853 gctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 37754754  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37754753 cacttccgtttctttcttcttgtg 37754730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2511036 - 2510813
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  2511036 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacggacacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 2510937  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  2510936 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcc 2510837  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  2510836 cacttccgtttctttcttcttgtg 2510813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28959975 - 28960198
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28959975 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28960074  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28960075 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggtgcaacagtagccgttgattgcccggctccagctgacaccatccc 28960174  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  28960175 cacttccgtttctttcttcttgtg 28960198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 29967243 - 29967466
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  29967243 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 29967342  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  29967343 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 29967442  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  29967443 cacttccgtttctttctttttgtg 29967466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30029400 - 30029177
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  30029400 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 30029301  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  30029300 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 30029201  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||||||||||||||| |||||    
T  30029200 cacttccgtttctttctttttgtg 30029177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33516341 - 33516118
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  33516341 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 33516242  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33516241 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 33516142  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  33516141 cacttcagtttctttcttcttgtg 33516118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15759034 - 15759257
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  15759034 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 15759133  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  15759134 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgacctgctccagctgacaccatccc 15759233  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  15759234 cacttcagtttctttcttcttgtg 15759257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30152003 - 30151780
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  30152003 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 30151904  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  30151903 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 30151804  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  30151803 cacttccgtttctttcttcttgtg 30151780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37771176 - 37771399
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37771176 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37771275  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  37771276 gctgagaatacggcatatatggatacgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 37771375  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37771376 cacttccgtttctttcttcttgtg 37771399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 40473729 - 40473952
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  40473729 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 40473828  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40473829 gctgagagtacggcatgtgtgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 40473928  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  40473929 cacttccgtttctttcttcttgtg 40473952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Original strand, 32599676 - 32599869
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    |||||||| || || |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32599676 gcattgacaggaacctgaggttggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcatatatgggtatgacg 32599775  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  32599776 gaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttccttcttcttgtg 32599869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23892161 - 23891971
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  23892161 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgttggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacg 23892062  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23892061 gaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgatcggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 23891971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34616489 - 34616283
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34616489 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttagccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 34616390  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34616389 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 34616290  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  34616289 tcttgtg 34616283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25198977 - 25198797
Alignment:
Q  41 gtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttg 140  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || |||    
T  25198977 gtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcaattg 25198878  T
Q  141 ggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25198877 ggaagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcggataccatccctacttctgtttccttcttctt 25198797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24970009 - 24969867
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24970009 ggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 24969910  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggc 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24969909 gctgagaatacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggc 24969867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 24951951 - 24951872
Alignment:
Q  145 gcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24951951 gcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 24951872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22888428 - 22888287
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  22888428 gcattaacggttacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 22888329  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatgg 172  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22888328 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatgg 22888287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33292496 - 33292289
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  33292496 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 33292397  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  33292396 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 33292297  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  33292296 tcttgtga 33292289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 13184852 - 13184928
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13184852 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13184928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 13440698 - 13440774
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  13440698 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 13440774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 33877205 - 33877129
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  33877205 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 33877129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 11325752 - 11325676
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  11325752 gcattaacgggtacctgaggttgtcccaatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 11325676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 410 - 633
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  410 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 509  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  510 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagttgacaccatccc 609  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  610 tacttccgtttctttcttcttgtg 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16277530 - 16277307
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277530 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 16277431  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16277430 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 16277331  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16277330 tacttccgtttctttcttcttgtg 16277307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 2137498 - 2137721
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137498 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatgacggaaagaaaggat 2137597  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2137598 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 2137697  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2137698 tacttccgtttctttcttcttgtg 2137721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27609144 - 27609367
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27609144 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 27609243  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27609244 gctgagaatacgacacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27609343  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  27609344 tatttccgtttctttcttcttgtg 27609367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14557603 - 14557380
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14557603 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 14557504  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14557503 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcgacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 14557404  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14557403 tacttccgtttctttcttcttgtg 14557380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19674414 - 19674190
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19674414 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 19674315  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19674314 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgactggctccagctgacaccatccc 19674215  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtga 225  Q
     || |||||||||||||||||||||    
T  19674214 cacgtccgtttctttcttcttgtga 19674190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19688072 - 19687851
Alignment:
Q  3 caactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19688072 caactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactggtgatagaatggcggaaagaaaggatgc 19687973  T
Q  103 tgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatcccta 202  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19687972 tgggaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggctgacaccatcccta 19687873  T
Q  203 cttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19687872 cttccgtttctttcttcttgtg 19687851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19518382 - 19518605
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19518382 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 19518481  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19518482 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 19518581  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19518582 cacttccgtttctttcttcttgtg 19518605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 3329758 - 3329981
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  3329758 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaatggat 3329857  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3329858 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacgatagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 3329957  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  3329958 cacttccgtttctttcttcttgtg 3329981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29829287 - 29829066
Alignment:
Q  3 caactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||    
T  29829287 caactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgc 29829188  T
Q  103 tgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatcccta 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  29829187 tgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatcccca 29829088  T
Q  203 cttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29829087 cttccgtttctttcttcttgtg 29829066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19208599 - 19208822
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19208599 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 19208698  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19208699 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 19208798  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19208799 cacttccgtttctttcttcttgtg 19208822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33258699 - 33258476
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  33258699 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 33258600  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33258599 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 33258500  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  33258499 cacttccgtttctttcttcttgtg 33258476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16283425 - 16283202
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | |||||| |||||||||||||||||||    
T  16283425 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaatgggtacctgaggttgacctggtggcaaaggatactaatgatagaatggcggaaagaaaggat 16283326  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16283325 gctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 16283226  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16283225 tacttccgtttctttcttcttgtg 16283202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18710562 - 18710339
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  18710562 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 18710463  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18710462 gctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcc 18710363  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18710362 cacttccgtttctttcttcttgtg 18710339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31489989 - 31490212
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31489989 ggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31490088  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31490089 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggggcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 31490188  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  31490189 cacttcagtttctttcttcttgtg 31490212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 28362194 - 28362417
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28362194 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28362293  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28362294 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccc 28362393  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  28362394 cacttcagtttctttcttcttgtg 28362417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12092972 - 12093195
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12092972 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 12093071  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| ||    
T  12093072 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcacttgagctgcattgataggagcaatagtagccatagattggccggctgcagctgacaccattcc 12093171  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  12093172 cacttccgtttctttcttcttgtg 12093195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19286424 - 19286218
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19286424 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 19286325  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19286324 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 19286225  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  19286224 tcttgtg 19286218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31354483 - 31354277
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31354483 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 31354384  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  31354383 tatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtggccatggattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 31354284  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  31354283 tcttgtg 31354277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Original strand, 22081135 - 22081331
Alignment:
Q  25 gcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggt 124  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   | || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||  ||  | |    
T  22081135 gcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcgatggcggatactggtgataaaatggtgggaagaaaggatgctgagagtattgcatgtactgat 22081234  T
Q  125 atgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    | | |||||  |  || || |||||||| || |||||||||||||||||||||  || ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  22081235 acggcggaggtagctgagcagcattgatgggggcaacagtagccatggattgactggttccggcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 22081331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Original strand, 19659305 - 19659407
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  19659305 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 19659404  T
Q  131 gag 133  Q
    |||    
T  19659405 gag 19659407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44563050 - 44562948
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  44563050 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 44562951  T
Q  131 gag 133  Q
    |||    
T  44562950 gag 44562948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9354571 - 9354495
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  9354571 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 9354495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 30)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5127969 - 5127746
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5127969 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 5127870  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5127869 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 5127770  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5127769 tacttccgtttctttcttcttgtg 5127746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2154549 - 2154327
Alignment:
Q  2 gcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatg 101  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154549 gcaactgttgttttatctgttgagcaattgcattaacggatacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggatg 2154450  T
Q  102 ctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccct 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2154449 ctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccct 2154350  T
Q  202 acttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2154349 acttccgtttctttcttcttgtg 2154327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11424942 - 11425165
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11424942 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 11425041  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11425042 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctacattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 11425141  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11425142 tacttccgtttctttcttcttgtg 11425165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16736626 - 16736849
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16736626 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 16736725  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16736726 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccc 16736825  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  16736826 cacttcagtttctttcttcttgtg 16736849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16751680 - 16751903
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16751680 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 16751779  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16751780 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccc 16751879  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  16751880 cacttcagtttctttcttcttgtg 16751903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17523509 - 17523286
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17523509 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 17523410  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17523409 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccc 17523310  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  17523309 cacttcagtttctttcttcttgtg 17523286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 17529706 - 17529929
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17529706 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 17529805  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17529806 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggagacatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccatccc 17529905  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  17529906 cacttcagtttctttcttcttgtg 17529929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 10917031 - 10917254
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10917031 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacaggtacttgaggttgacccggtggcagaggatactgatgataaaatggcggaaagaagggat 10917130  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10917131 gctgagaatacggcacatatgggtatgacgaaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 10917230  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10917231 tacttccgtttctttcttcttgtg 10917254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 45387320 - 45387097
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45387320 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 45387221  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45387220 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 45387121  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  45387120 cacttcagtttctttcttcttgtg 45387097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11441537 - 11441314
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  11441537 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 11441438  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11441437 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 11441338  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  11441337 cacttccgtttctttcttcttgtg 11441314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 5147506 - 5147729
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  5147506 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 5147605  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5147606 gctgagagtacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaatggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 5147705  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5147706 cacttccgtttctttcttcttgtg 5147729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26435234 - 26435011
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26435234 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26435135  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26435134 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcactgataggagcaacagtggccatggactgaccggctcctgctgacaccatccc 26435035  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26435034 cacttccgtttctttcttcttgtg 26435011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31124888 - 31124665
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31124888 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggttgcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31124789  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31124788 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 31124689  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31124688 tacttccgtttctttcttcttgtg 31124665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 3445271 - 3445048
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  3445271 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 3445172  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3445171 gctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 3445072  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  3445071 cacttccgtttctttcttcttgtg 3445048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16503546 - 16503769
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16503546 ggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 16503645  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16503646 gctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 16503745  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16503746 tacttccgtttctttcttcttgtg 16503769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16518582 - 16518805
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  16518582 ggcagctgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacctgaggttgacccggtggcaagggatactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 16518681  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16518682 gctgagagtacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 16518781  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16518782 tacttccgtttctttcttcttgtg 16518805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24592707 - 24592930
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24592707 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 24592806  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24592807 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 24592906  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24592907 cacttccgtttctttcttcttgtg 24592930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26275260 - 26275483
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26275260 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26275359  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26275360 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26275459  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26275460 cacttccgtttctttcttcttgtg 26275483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26485910 - 26486133
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  26485910 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 26486009  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26486010 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26486109  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26486110 cacttccgtttctttcttcttgtg 26486133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31564565 - 31564788
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31564565 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31564664  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31564665 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccc 31564764  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31564765 cacttccgtttctttcttcttgtg 31564788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 26320040 - 26320258
Alignment:
Q  6 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  26320040 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctga 26320139  T
Q  106 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26320140 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccactt 26320239  T
Q  206 ccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26320240 ccgtttctttcttcttgtg 26320258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26538039 - 26538262
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  26538039 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 26538138  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26538139 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccattcc 26538238  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26538239 cacttccgtttctttcttcttgtg 26538262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9618628 - 9618405
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  9618628 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 9618529  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9618528 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 9618429  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  9618428 cacttcagtttctttcttcttgtg 9618405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26670080 - 26670303
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26670080 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26670179  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26670180 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagctattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26670279  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26670280 cacttccgtttctttcttcttgtg 26670303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 4145306 - 4145512
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4145306 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 4145405  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  4145406 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccccacttcagtttctttct 4145505  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  4145506 tcttgtg 4145512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16041267 - 16041083
Alignment:
Q  37 acgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagaca 136  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||  |    
T  16041267 acgggtacctgaggttgacccgatgacaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacggaggta 16041168  T
Q  137 tttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
      ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16041167 actgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 16041083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 221
Target Start/End: Original strand, 16450199 - 16450381
Alignment:
Q  39 gggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatt 138  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || | || ||||| |||||||  |      
T  16450199 gggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgataaaatggtggaaagaagggatgctgagagtactgcgcgtacgggtacgacggaggtaac 16450298  T
Q  139 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16450299 tgggcagcattaataggggcaacagtagctatggattgaccggctccggcagataccatccctacttttgtttctttcttctt 16450381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5159482 - 5159275
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  5159482 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 5159383  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  5159382 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcaacagtagccatggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 5159283  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  5159282 tcttgtga 5159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 31088657 - 31088733
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  31088657 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 31088733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 45733410 - 45733334
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  45733410 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 45733334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 23128835 - 23129058
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23128835 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 23128934  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23128935 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 23129034  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  23129035 tacttccgtttctttcttcttgtg 23129058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28882186 - 28881963
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882186 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 28882087  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28882086 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 28881987  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  28881986 tatttccgtttctttcttcttgtg 28881963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 13936813 - 13937036
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13936813 ggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 13936912  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13936913 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 13937012  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13937013 cacttccgtttctttcttcttgtg 13937036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34279421 - 34279198
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34279421 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 34279322  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34279321 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 34279222  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  34279221 cacttccgtttctttcttcttgtg 34279198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11635458 - 11635681
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11635458 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 11635557  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11635558 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccc 11635657  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  11635658 cacttccgcttctttcttcttgtg 11635681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 11641647 - 11641870
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11641647 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 11641746  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11641747 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctcctgctgacaccatccc 11641846  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  11641847 cacttccgcttctttcttcttgtg 11641870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12655514 - 12655291
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12655514 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 12655415  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  12655414 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcc 12655315  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12655314 tacttccgtttctttcttcttgtg 12655291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 261034 - 261257
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  261034 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggtgggaagaaaggat 261133  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  261134 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 261233  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  261234 cacttccgtttctttcttcttgtg 261257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 12716874 - 12717097
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12716874 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 12716973  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12716974 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 12717073  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  12717074 cacttccgtttctttcttcttgtg 12717097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20837890 - 20837667
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20837890 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 20837791  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||    
T  20837790 gctgagaatacggcgcatatgggtaggacggatgcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccgactgacaccattcc 20837691  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20837690 tacttccgtttctttcttcttgtg 20837667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 21677451 - 21677674
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677451 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 21677550  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21677551 gctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 21677650  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  21677651 cacttcagtttctttcttcttgtg 21677674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 32049770 - 32049547
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32049770 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 32049671  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32049670 gctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 32049571  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  32049570 cacttccgtttcttttttcttgtg 32049547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34286326 - 34286103
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34286326 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 34286227  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34286226 gctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccc 34286127  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34286126 tacttccgtttctttcttcttgtg 34286103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34291386 - 34291163
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34291386 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaactgcattgacgggtactggaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 34291287  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34291286 gctgggaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccacctgacaccatccc 34291187  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34291186 tacttccgtttctttcttcttgtg 34291163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27434713 - 27434936
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27434713 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggtggaaagaaaggat 27434812  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  27434813 gctgagagtacggcgcatatgggtacgacggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 27434912  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27434913 tacttccgtttctttcttcttgtg 27434936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37925465 - 37925242
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37925465 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37925366  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37925365 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 37925266  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37925265 cacttccgtttctttcttcttgtg 37925242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12586773 - 12586550
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  12586773 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 12586674  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12586673 gctgagaatacggcatgtatggatatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcatggattgaccggctccagctgacaccatccc 12586574  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  12586573 cacttccgtttctttcttcttgtg 12586550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27803664 - 27803441
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  27803664 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 27803565  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27803564 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 27803465  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27803464 cacttccgtttctttcttcttgtg 27803441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39890034 - 39889811
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  39890034 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccctgtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 39889935  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39889934 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 39889835  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  39889834 cacttccgtttctttcttcttgtg 39889811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 40233471 - 40233248
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  40233471 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 40233372  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40233371 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 40233272  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  40233271 cacttccgtttctttcttcttgtg 40233248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27777179 - 27776956
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  27777179 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 27777080  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27777079 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 27776980  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27776979 cacttccgtttctttcttcttgtg 27776956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27816946 - 27816723
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  27816946 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacctggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 27816847  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27816846 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 27816747  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27816746 cacttccgtttctttcttcttgtg 27816723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9350263 - 9350486
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  9350263 ggcagctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtagcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaaaggat 9350362  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9350363 gctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagtcattgattgaccggctccagctgacaccatccc 9350462  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9350463 cacttccgtttctttcttcttgtg 9350486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31876253 - 31876030
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31876253 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31876154  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31876153 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 31876054  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31876053 cacttccgtttctttcttcttgtg 31876030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34861652 - 34861429
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  34861652 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 34861553  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34861552 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 34861453  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  34861452 cacttccgtttctttcttcttgtg 34861429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37686178 - 37686401
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37686178 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37686277  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37686278 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 37686377  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37686378 cacttccgtttctttcttcttgtg 37686401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 37701443 - 37701666
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  37701443 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 37701542  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37701543 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 37701642  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  37701643 cacttccgtttctttcttcttgtg 37701666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 16829607 - 16829830
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16829607 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 16829706  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16829707 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 16829806  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  16829807 cacttcagtttctttcttcttgtg 16829830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16891874 - 16891651
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16891874 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 16891775  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16891774 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 16891675  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  16891674 cacttcagtttctttcttcttgtg 16891651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 19416768 - 19416991
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19416768 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 19416867  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19416868 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagccgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 19416967  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19416968 cacttccgtttctttcttcttgtg 19416991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 22926297 - 22926520
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  22926297 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 22926396  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22926397 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 22926496  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  22926497 cacttccgtttctttcttcttgtg 22926520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39052097 - 39052320
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  39052097 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcgttgacgggcacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 39052196  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39052197 gctgagagtacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattggtaggagcaacggttgctattgattgaccggctccagctgacaccattcc 39052296  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  39052297 cacttccgtttctttcttcttgtg 39052320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 37375102 - 37374910
Alignment:
Q  32 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacgg 131  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375102 cattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggcgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacgg 37375003  T
Q  132 agacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37375002 aggcatttgagttgcgttgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 37374910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 21703460 - 21703650
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  21703460 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 21703559  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21703560 gaggtaactaggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 21703650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 19456717 - 19456907
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||||||| ||||    
T  19456717 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgaaagtattgcgcatatgggtacgacg 19456816  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19456817 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 19456907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 133
Target Start/End: Original strand, 31891624 - 31891726
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  31891624 gcattaacgggtacctgaggttgtcccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 31891723  T
Q  131 gag 133  Q
    |||    
T  31891724 gag 31891726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3784599 - 3784523
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  3784599 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3784523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27118633 - 27118557
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  27118633 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 27118557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34156956 - 34156880
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34156956 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34156880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Original strand, 34303600 - 34303675
Alignment:
Q  32 cattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  34303600 cattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 34303675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27392960 - 27392859
Alignment:
Q  6 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 105  Q
    |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  27392960 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggcggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 27392861  T
Q  106 ga 107  Q
    ||    
T  27392860 ga 27392859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16163544 - 16163468
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16163544 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 16163468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27045
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27268 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggtagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 27169  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27168 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 27069  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  27068 tacttccgtttctttcttcttgtg 27045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 24592591 - 24592814
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24592591 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 24592690  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24592691 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 24592790  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  24592791 tatttccgtttctttcttcttgtg 24592814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17013991 - 17013768
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17013991 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 17013892  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  17013891 gctgagaatacggcgcatatgggtatgaaggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggctgacaccatccc 17013792  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  17013791 tacttccgtttctttcttcttgtg 17013768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5005861 - 5005638
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5005861 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 5005762  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5005761 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 5005662  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5005661 cacttccgtttctttcttcttgtg 5005638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30753733 - 30753510
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30753733 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 30753634  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  30753633 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacatcatccc 30753534  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  30753533 cacttccgtttctttcttcttgtg 30753510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6569844 - 6569621
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6569844 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatggtaaaatggcggaaagaaaggat 6569745  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6569744 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 6569645  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  6569644 cacttccgtttctttcttcttgtg 6569621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14665009 - 14664786
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665009 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 14664910  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  14664909 gctgagaatacggtgcatatgggtatgacggaggcatttgggcagcattgataggagcaacagtagccatggattgaccagctccggcagacaccatccc 14664810  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14664809 tacttccgtttctttcttcttgtg 14664786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 27163597 - 27163820
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27163597 ggcatctgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 27163696  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27163697 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 27163796  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27163797 cacttccgtttctttcttcttgtg 27163820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21969692 - 21969469
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21969692 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaacggcgggaagaaaggat 21969593  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21969592 gctgagaatacggcatatatgggtatggcggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 21969493  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||| ||||||||    
T  21969492 cacttccgtttcttttttcttgtg 21969469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 18800902 - 18801125
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18800902 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 18801001  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18801002 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccatagcttgaccggctccagctgacaccatccc 18801101  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  18801102 cacttctgtttctttcttcttgtg 18801125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14098532 - 14098309
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  14098532 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 14098433  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14098432 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 14098333  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  14098332 cacttccgtttctttcttcttgtg 14098309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 33674090 - 33674313
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  33674090 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaatggtgggaagaacggat 33674189  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33674190 gctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 33674289  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  33674290 cacttccgtttctttcttcttgtg 33674313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 31126798 - 31127021
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  31126798 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 31126897  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  31126898 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 31126997  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  31126998 cacttcagtttctttcttcttgtg 31127021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39850614 - 39850391
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||    
T  39850614 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggcggcagggggtactgatggtaaaacggtgggaagaacggat 39850515  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  39850514 gctgagagtacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccattcc 39850415  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  39850414 cacttccgtttctttcttcttgtg 39850391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 40105918 - 40106141
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  40105918 ggcatctgctgtttcatctgttgggcaatcgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 40106017  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40106018 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 40106117  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  40106118 cacttccgtttctttcttcttgtg 40106141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54833364 - 54833158
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  54833364 ctgttgagcaatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggtaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 54833265  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54833264 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtggccatggattgaccggctcccgctgacaccatccccacttccgtttctttct 54833165  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  54833164 tcttgtg 54833158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 14763601 - 14763807
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14763601 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcaca 14763700  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14763701 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 14763800  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  14763801 tcttgtg 14763807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 51 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19373202 - 19373029
Alignment:
Q  51 ttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattg 150  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19373202 ttgacccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggcacatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattg 19373103  T
Q  151 ataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19373102 ataggagcaacggtagccatagattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttcttcttgtg 19373029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Original strand, 36344809 - 36345015
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36344809 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcccggtggcaaaggatactgatgataaaacggtaggaagaacggatgctgagagtacggcaca 36344908  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36344909 tatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtggccattgattgaccggctccagctgacaccatccccacttccgtttctttct 36345008  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  36345009 tcttgtg 36345015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1900221 - 1900031
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  1900221 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 1900122  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1900121 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 1900031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15227834 - 15227644
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  || |||| ||||| ||||    
T  15227834 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatattgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgagagtattgcgcatacgggtacgacg 15227735  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15227734 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 15227644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 15285235 - 15285425
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  | |    
T  15285235 gcattaacgggcacctgaggttgacccgatggtagaggatactgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatatgggtacaatg 15285334  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15285335 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccagctccggcagataccatccatacttctgtttctttcttctt 15285425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24112639 - 24112432
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  24112639 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 24112540  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  24112539 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgacaggagcaacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 24112440  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  24112439 tcttgtga 24112432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 225
Target Start/End: Original strand, 34189254 - 34189461
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||  ||    
T  34189254 ctgttgagcgatggcattgacagggacctgaggttggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagagtacggtgca 34189353  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    || ||||| ||||| |  |  || || |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  | |||||| |  | ||| || || ||||| |||||||    
T  34189354 taagggtaggacgggggaaactgagcagcattgataggagcgacagtagccttggatggattagttccagcggctatcattcccacctccgtatctttct 34189453  T
Q  218 tcttgtga 225  Q
    ||||||||    
T  34189454 tcttgtga 34189461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 14235810 - 14236025
Alignment:
Q  6 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 105  Q
    |||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||||| |  || ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14235810 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattaacgggtacctatgggtgacccgatggtagagggtactgatgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 14235909  T
Q  106 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 205  Q
    || ||  ||| |||  |||| | | |||  |  || || ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||  || ||| || || |||||||||||||    
T  14235910 gagtattgcatatactggtacggcagaggtaactgagcagcattaataggggtaacagtggccatggattgactggttccggcagataccatccctactt 14236009  T
Q  206 ccgtttctttcttctt 221  Q
    | || |||||||||||    
T  14236010 ctgtctctttcttctt 14236025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 24460912 - 24460988
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24460912 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaagaatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 24460988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Original strand, 15391771 - 15391833
Alignment:
Q  159 aacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  15391771 aacagtagccatggattgactggttccagcagataccatccctacttctgtctctttcttctt 15391833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30429 - 30206
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30429 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcggaaagaagggat 30330  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30329 gctgagaatacggcgcatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccagctgacaccatccc 30230  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  30229 tatttccgtttctttcttcttgtg 30206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20358 - 20168
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| ||||    
T  20358 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatgatggaaagaagggatgctgagagtatggcgcatatgggtacgacg 20259  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20258 gaggtaactgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctgtttctttcttctt 20168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 47265 - 47488
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47265 ggcaactgttgtttcatctgttgagcgattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcagggggtactgatgataaaatggcggaaagaaaggat 47364  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  47365 gctgagaatacggcacatatgggtatgatggaggcatttgggctgcattgataagagcaacagtagccatgggttgaccggctccagctgacaccatccc 47464  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  47465 tatttccgtttctttcttcttgtg 47488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 40349 - 40572
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  40349 ggcaactgttgtttcatctgttgagcaattgcatttacgggtacctgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcagaaagaaaggat 40448  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  40449 gctgagaatacggcgcatatgggtacggcggaggcatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 40548  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  40549 tacttccgtttctttcttcttgtg 40572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29739 - 29516
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29739 ggcaactgttgtttcatctgttgagctattgcattaacgggtacttgaggttgacccggtggcaaagggtactgatgatagaatggcggaaagaaaggat 29640  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  29639 gctgagaatacggcgcatacgggtacgatggaggcatttgggcagcattaataggagcaacagtagccatggattgaccggctccggcagacaccatccc 29540  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29539 tacttccgtttctttcttcttgtg 29516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 41793588 - 41793811
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41793588 ggcatctgttgtttcatctgtggagcaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaatggcgggaagaaaggat 41793687  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  41793688 gttgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgggctgcattgataggagcaacggtagccatggattgaccggctccagctgataccattcc 41793787  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  41793788 cacttccgtttctttcttcttgtg 41793811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 10962645 - 10962422
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  10962645 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 10962546  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10962545 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 10962446  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  10962445 cacttccgtttctttcttcttgtg 10962422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 51638193 - 51637970
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  51638193 ggcatctgttgttttatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggccgggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 51638094  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51638093 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 51637994  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  51637993 cacttccgtttctttcttcttgtg 51637970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 28584956 - 28584733
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  28584956 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 28584857  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  28584856 gctgagaatacggcatatacgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgcccggctccagctgacaccatccc 28584757  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  28584756 cacttccgtttctttcttcttgtg 28584733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20461053 - 20460863
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcacatatgggtatgacg 130  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||| ||||| | ||    
T  20461053 gcattaacgggtacctgaggttgacccgatggtagaggatattgatgatagaatggtggaaagaaaggatgctgagagtattgcgcatacgggtacggcg 20460954  T
Q  131 gagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    |||  |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20460953 gaggtaactgggcagcattaataggggcaatagtagccatggattgaccggctccggcagataccatccctacttctatttctttcttctt 20460863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 221
Target Start/End: Original strand, 16208443 - 16208525
Alignment:
Q  139 tgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttcttctt 221  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16208443 tgggcagcattaataggggcaacagtagccatggattgaccggctccggcagataccatctctacttctgtttctttcttctt 16208525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 20340642 - 20340718
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  20340642 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 20340718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 7524 - 7742
Alignment:
Q  6 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||||    
T  7524 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctga 7623  T
Q  106 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7624 gaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccccactt 7723  T
Q  206 ccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7724 ccgtttctttcttcttgtg 7742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 15210 - 15433
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  15210 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 15309  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15310 gctgagaatatggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgatgggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgataccatccc 15409  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15410 cacttccgtttctttcttcttgtg 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 26482 - 26705
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  26482 ggcaactgttgtttcctctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaacgggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 26581  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26582 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccattgattgaccggctccagctgacaccatccc 26681  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  26682 cacttccgtttctttcttcttgtg 26705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7913 - 7690
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  7913 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggtggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 7814  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  7813 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacggtagccatagattgaccggctgcagctgacaccattcc 7714  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  7713 cacttccgtttctttcttcttgtg 7690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 9346 - 9569
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  9346 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 9445  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9446 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcccgctgacaccatccc 9545  T
Q  201 tacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9546 cacttccgtttctttcttcttgtg 9569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19991 - 19807
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  19991 ggcatctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 19892  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctcc 185  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  19891 gctgagaatacggcatatatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcgacggtagccatggattgaccggctcc 19807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5967 - 5742
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaa-ttgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaat-ggcggaaagaaagg 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || || ||||||||    
T  5967 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaaattgcattgacgggcacttgaggttgacccggtggcagagggtactgatgataaaaacggtgggaagaaagg 5868  T
Q  99 atgctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagcca-tggattgatcggctccagctgacaccat 197  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  5867 atgctgagaatacggcatgtatgggtatgacggaggcatttgagttgcattgataggagcaacagtagccatttgattgaccggctccagctgacaccat 5768  T
Q  198 ccctacttccgtttctttcttcttgtg 224  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5767 ccc-acttccgtttctttcttcttgtg 5742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0496 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 13 - 204
Alignment:
Q  1 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  13 ggcaactgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggcacttgaggctggcccggcggcaaagggtactgatgataaaacggtgggaagaacggat 112  T
Q  101 gctgagaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgac 192  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  113 gctgagaatacggcatatatggatatgacggaggcatttgagctgcattgataggtgcaacagtagccattgattgaccggctccagctgac 204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8191 - 7985
Alignment:
Q  18 ctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgagaatacggcaca 117  Q
    |||||| || || |||||||| || || |||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8191 ctgttgagcgatggcattgacaggaacctgaggttggcctggtggcaaaggatactgatgataaaacggtgggaagaacggatgctgagaatacggcata 8092  T
Q  118 tatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctacttccgtttctttct 217  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  8091 tatgggtatgacggaggcatttgagctgcattgataggagcaacagtagccacagattgaccggctccagctgataccatccccacttccgtttctttct 7992  T
Q  218 tcttgtg 224  Q
    |||||||    
T  7991 tcttgtg 7985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3041
Alignment:
Q  31 gcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctgaga 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2965 gcattgacgggtacctgaggttgacccgatggcaaaggatactgatgatagaatggtggaaagaagggatgctgaga 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21538 - 21323
Alignment:
Q  6 ctgttgtttcatctgttgggcaattgcattgacgggtacttgaggttgacccggtggcagagggtattgatgataaaatggcggaaagaaaggatgctga 105  Q
    |||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || || || ||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  21538 ctgttgttgcatttgctgagcaatggcattgacgggtacctgaggttgacccggcggtggtggatactggtgatagaatggtgggaagaaaggatgctga 21439  T
Q  106 gaatacggcacatatgggtatgacggagacatttgggctgcattgataggagcaacagtagccatggattgatcggctccagctgacaccatccctactt 205  Q
    || ||  |||  ||  |||| | |||||  |  || |  |||||||| || ||||||||||||| |||||||  || ||| || || |||||||||||||    
T  21438 gagtattgcatgtactggtacggcggaggtagctgagaagcattgatgggggcaacagtagccacggattgactggttccggcagataccatccctactt 21339  T
Q  206 ccgtttctttcttctt 221  Q
    | || |||||||||||    
T  21338 ctgtctctttcttctt 21323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University