View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_426 (Length: 222)

Name: NF9913A_low_426
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_426
NF9913A_low_426
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (17-197)||(631327-631506)
chr4 (17-202)||(17048678-17048862)
chr4 (49-194)||(20160448-20160593)
chr4 (49-194)||(20157772-20157917)
chr4 (49-191)||(20163229-20163371)
chr4 (55-194)||(14954769-14954908)
chr4 (54-194)||(10712244-10712384)
chr4 (54-194)||(10926014-10926154)
chr4 (49-194)||(15224426-15224571)
chr4 (55-194)||(5757507-5757647)
chr4 (55-194)||(9555919-9556059)
chr4 (55-194)||(12487074-12487214)
chr4 (55-194)||(14758004-14758144)
chr4 (55-194)||(33741769-33741909)
chr4 (55-194)||(4561902-4562042)
chr4 (54-190)||(37018300-37018436)
chr4 (114-190)||(3484804-3484880)
chr4 (114-194)||(17809723-17809803)
chr4 (55-141)||(25689292-25689378)
chr4 (104-190)||(14548469-14548555)
chr4 (54-190)||(35812632-35812776)
chr4 (136-190)||(15042323-15042377)
chr4 (136-190)||(15112047-15112101)
chr4 (136-190)||(25090443-25090497)
chr4 (114-190)||(13592535-13592611)
chr4 (114-189)||(16997294-16997369)
chr4 (55-134)||(27533400-27533479)
chr4 (145-194)||(25689349-25689398)
chr4 (145-194)||(27533457-27533506)
chr4 (136-174)||(3484793-3484831)
chr4 (137-190)||(42874589-42874642)
chr4 (55-102)||(17807517-17807564)
chr4 (136-174)||(13592584-13592622)
chr4 (134-190)||(14650409-14650465)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (17-202)||(16795864-16796048)
chr3 (40-197)||(12852884-12853041)
chr3 (49-194)||(14665037-14665182)
chr3 (49-194)||(14668193-14668338)
chr3 (49-193)||(15464486-15464630)
chr3 (49-194)||(12339088-12339232)
chr3 (49-193)||(16750919-16751063)
chr3 (55-194)||(15964337-15964476)
chr3 (55-194)||(15968261-15968400)
chr3 (55-194)||(15972185-15972324)
chr3 (55-194)||(37440214-37440353)
chr3 (49-194)||(8489764-8489906)
chr3 (49-194)||(19774954-19775099)
chr3 (49-194)||(4589490-4589635)
chr3 (55-194)||(11069460-11069600)
chr3 (55-194)||(14498717-14498857)
chr3 (55-194)||(22321056-22321196)
chr3 (55-194)||(22336111-22336251)
chr3 (55-194)||(27410221-27410361)
chr3 (55-194)||(28949114-28949254)
chr3 (55-194)||(55022257-55022397)
chr3 (49-194)||(17317705-17317850)
chr3 (55-194)||(7109088-7109228)
chr3 (55-194)||(7113023-7113163)
chr3 (55-194)||(15616766-15616906)
chr3 (55-185)||(4107985-4108116)
chr3 (55-185)||(4111837-4111968)
chr3 (55-194)||(11166106-11166246)
chr3 (114-194)||(5222774-5222854)
chr3 (49-202)||(14670449-14670610)
chr3 (49-202)||(14681971-14682132)
chr3 (119-190)||(46821903-46821974)
chr3 (114-198)||(2842654-2842737)
chr3 (114-190)||(18700869-18700945)
chr3 (54-190)||(10543014-10543158)
chr3 (136-186)||(13543678-13543728)
chr3 (143-200)||(12120163-12120220)
chr3 (143-200)||(38962281-38962338)
chr3 (136-190)||(35353360-35353414)
chr3 (114-190)||(14441077-14441153)
chr3 (138-190)||(42353679-42353731)
chr3 (44-174)||(14440973-14441104)
chr3 (136-190)||(10562478-10562532)
chr3 (137-190)||(5214723-5214776)
chr3 (113-174)||(13520978-13521039)
chr3 (55-134)||(30065372-30065452)
chr3 (114-190)||(43890179-43890255)
chr3 (147-194)||(30065432-30065479)
chr3 (136-181)||(19884816-19884861)
chr3 (145-190)||(44269408-44269453)
chr3 (55-91)||(5220536-5220572)
chr3 (122-174)||(15565319-15565371)
chr3 (136-174)||(15565300-15565338)
chr3 (136-174)||(18700918-18700956)
chr3 (97-153)||(14067289-14067345)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (17-197)||(25170-25348)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (28-202)||(48602845-48603018)
chr1 (28-202)||(22131449-22131622)
chr1 (49-202)||(41781867-41782020)
chr1 (55-194)||(1925731-1925870)
chr1 (55-194)||(20924745-20924884)
chr1 (50-193)||(41388597-41388740)
chr1 (57-190)||(33796911-33797044)
chr1 (49-194)||(39244496-39244641)
chr1 (49-194)||(39248051-39248196)
chr1 (54-194)||(16376035-16376176)
chr1 (49-194)||(20229584-20229729)
chr1 (49-194)||(21406740-21406885)
chr1 (55-194)||(1010112-1010252)
chr1 (55-194)||(52638930-52639070)
chr1 (43-186)||(23967332-23967483)
chr1 (114-190)||(42911818-42911894)
chr1 (114-190)||(14238695-14238775)
chr1 (136-190)||(19675542-19675596)
chr1 (114-184)||(48519948-48520018)
chr1 (136-190)||(20241618-20241672)
chr1 (136-174)||(14238748-14238786)
chr1 (136-174)||(42911807-42911845)
chr1 (114-174)||(48519915-48519975)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (17-202)||(3084-3268)
scaffold0165 (17-202)||(7147-7331)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (17-197)||(18301654-18301833)
chr7 (55-202)||(20487186-20487333)
chr7 (49-194)||(12705236-12705381)
chr7 (49-194)||(13919072-13919217)
chr7 (46-194)||(25927818-25927968)
chr7 (55-194)||(45170608-45170747)
chr7 (49-194)||(2530731-2530876)
chr7 (49-194)||(2832774-2832919)
chr7 (49-194)||(15083555-15083700)
chr7 (49-194)||(1859401-1859546)
chr7 (49-194)||(39721625-39721770)
chr7 (49-194)||(18425044-18425189)
chr7 (49-194)||(26291756-26291901)
chr7 (55-194)||(71344-71484)
chr7 (55-194)||(75453-75593)
chr7 (55-194)||(16907788-16907928)
chr7 (55-194)||(18282755-18282895)
chr7 (55-194)||(32498-32638)
chr7 (55-194)||(12718057-12718197)
chr7 (55-194)||(12722968-12723108)
chr7 (55-194)||(16113630-16113770)
chr7 (55-194)||(16116783-16116923)
chr7 (55-194)||(18278792-18278932)
chr7 (114-190)||(24274799-24274875)
chr7 (49-134)||(7519677-7519762)
chr7 (54-190)||(16585087-16585231)
chr7 (129-202)||(15605861-15605934)
chr7 (115-190)||(16579257-16579332)
chr7 (115-190)||(16586330-16586405)
chr7 (114-186)||(14257924-14257996)
chr7 (130-190)||(16461500-16461560)
chr7 (114-190)||(20585203-20585279)
chr7 (143-200)||(15082314-15082370)
chr7 (55-110)||(12714353-12714408)
chr7 (54-174)||(14257823-14257951)
chr7 (136-190)||(14183819-14183873)
chr7 (136-174)||(14933118-14933156)
chr7 (136-174)||(15356553-15356591)
chr7 (136-174)||(15360667-15360705)
chr7 (136-174)||(24274788-24274826)
chr7 (136-190)||(32300804-32300858)
chr7 (137-190)||(12466473-12466526)
chr7 (54-111)||(32300747-32300804)
chr7 (136-174)||(20585192-20585230)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (28-197)||(8164-8332)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (20-190)||(216-385)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (49-202)||(6460-6613)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (49-194)||(36688-36833)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (28-202)||(44385215-44385389)
chr8 (49-194)||(21828616-21828761)
chr8 (54-194)||(18863247-18863387)
chr8 (49-202)||(23913655-23913808)
chr8 (55-194)||(30940679-30940818)
chr8 (49-194)||(21386717-21386862)
chr8 (49-194)||(14398425-14398568)
chr8 (49-194)||(21410309-21410454)
chr8 (49-194)||(21804801-21804946)
chr8 (55-194)||(21973158-21973298)
chr8 (55-194)||(21977249-21977389)
chr8 (55-194)||(22111320-22111460)
chr8 (55-194)||(43251200-43251340)
chr8 (68-190)||(16413760-16413882)
chr8 (114-190)||(32121453-32121529)
chr8 (114-190)||(42819107-42819183)
chr8 (44-174)||(5760107-5760237)
chr8 (114-184)||(18833091-18833161)
chr8 (136-174)||(32121442-32121480)
chr8 (134-190)||(19929978-19930034)
chr8 (136-174)||(37515200-37515238)
chr8 (136-174)||(42819156-42819194)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (49-194)||(22074563-22074708)
chr6 (49-194)||(23414289-23414434)
chr6 (64-202)||(2076871-2077009)
chr6 (49-194)||(1643894-1644039)
chr6 (49-194)||(31478561-31478706)
chr6 (55-194)||(11566251-11566391)
chr6 (55-194)||(12619419-12619559)
chr6 (55-194)||(22862335-22862475)
chr6 (55-194)||(23394457-23394597)
chr6 (55-194)||(14471603-14471742)
chr6 (49-194)||(16623738-16623883)
chr6 (55-194)||(8243222-8243362)
chr6 (55-194)||(23989309-23989449)
chr6 (55-194)||(19869978-19870119)
chr6 (55-174)||(16759626-16759746)
chr6 (54-194)||(27556065-27556192)
chr6 (55-141)||(22948506-22948592)
chr6 (55-141)||(22952462-22952548)
chr6 (55-141)||(23870950-23871036)
chr6 (55-141)||(23874906-23874992)
chr6 (136-190)||(34963069-34963123)
chr6 (61-190)||(22805370-22805507)
chr6 (54-190)||(19774060-19774204)
chr6 (123-190)||(23538235-23538302)
chr6 (136-190)||(23992126-23992180)
chr6 (137-190)||(17105354-17105407)
chr6 (114-186)||(17742851-17742923)
chr6 (114-190)||(19656621-19656697)
chr6 (131-190)||(27126606-27126665)
chr6 (115-190)||(15705936-15706011)
chr6 (55-134)||(18918013-18918092)
chr6 (140-194)||(27416503-27416557)
chr6 (122-179)||(16759727-16759784)
chr6 (145-194)||(22948563-22948612)
chr6 (145-194)||(22952519-22952568)
chr6 (145-194)||(23871007-23871056)
chr6 (145-194)||(23874963-23875012)
chr6 (136-190)||(7825435-7825489)
chr6 (49-174)||(19656762-19656888)
chr6 (115-174)||(15705985-15706044)
chr6 (151-194)||(18917986-18918029)
chr6 (104-157)||(19656746-19656799)
chr6 (114-174)||(17742818-17742878)
chr6 (136-174)||(17742807-17742845)
chr6 (136-174)||(19656695-19656733)
chr6 (137-174)||(23538216-23538253)
chr6 (114-174)||(20182380-20182440)
chr6 (114-174)||(22153551-22153611)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (49-202)||(9784394-9784547)
chr2 (49-194)||(1282772-1282917)
chr2 (49-194)||(31344522-31344666)
chr2 (55-194)||(41531582-41531721)
chr2 (55-194)||(30345593-30345732)
chr2 (55-194)||(24629056-24629196)
chr2 (55-194)||(27380009-27380149)
chr2 (55-194)||(27384055-27384195)
chr2 (55-194)||(27601181-27601321)
chr2 (55-194)||(10102230-10102370)
chr2 (55-194)||(24648744-24648884)
chr2 (114-202)||(32215385-32215472)
chr2 (97-194)||(12902093-12902190)
chr2 (114-190)||(17306255-17306331)
chr2 (143-199)||(38967084-38967140)
chr2 (143-200)||(24367446-24367503)
chr2 (136-190)||(28653710-28653764)
chr2 (136-189)||(24514976-24515029)
chr2 (114-184)||(36838972-36839042)
chr2 (136-174)||(32215445-32215483)
chr2 (136-174)||(17306244-17306282)
[»] chr5 (19 HSPs)
chr5 (49-194)||(11230505-11230650)
chr5 (57-194)||(18355609-18355746)
chr5 (49-194)||(11220107-11220252)
chr5 (49-194)||(11224693-11224838)
chr5 (49-194)||(11228516-11228661)
chr5 (55-194)||(40724193-40724332)
chr5 (54-194)||(20295235-20295376)
chr5 (49-194)||(10752576-10752719)
chr5 (49-194)||(15237412-15237556)
chr5 (69-194)||(11226546-11226671)
chr5 (41-141)||(22108009-22108109)
chr5 (49-141)||(20911531-20911623)
chr5 (49-141)||(24767898-24767990)
chr5 (55-141)||(19473315-19473401)
chr5 (137-202)||(22107981-22108046)
chr5 (145-194)||(19473295-19473344)
chr5 (146-194)||(20911511-20911559)
chr5 (136-190)||(33896117-33896171)
chr5 (145-194)||(24767878-24767927)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (55-194)||(14689-14828)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (57-194)||(208190-208327)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (57-194)||(189979-190116)
[»] scaffold0601 (2 HSPs)
scaffold0601 (28-170)||(8090-8231)
scaffold0601 (114-190)||(8037-8113)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (54-194)||(93-234)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (49-194)||(11354-11499)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (49-194)||(36566-36711)
scaffold0109 (114-186)||(1063-1135)
scaffold0109 (136-174)||(1108-1146)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (54-194)||(73896-74036)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (46-194)||(20781-20933)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (55-194)||(5676-5816)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (55-194)||(11811-11951)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (55-194)||(33263-33403)
[»] scaffold0061 (3 HSPs)
scaffold0061 (55-194)||(67878-68018)
scaffold0061 (114-190)||(19613-19689)
scaffold0061 (136-173)||(19663-19700)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (55-194)||(66101-66240)
scaffold0029 (55-194)||(62185-62324)
scaffold0029 (49-194)||(79925-80071)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (55-194)||(59296-59436)
[»] scaffold0486 (2 HSPs)
scaffold0486 (49-194)||(9235-9381)
scaffold0486 (131-190)||(8201-8260)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (97-194)||(4446-4543)
[»] scaffold0205 (2 HSPs)
scaffold0205 (114-194)||(29261-29341)
scaffold0205 (136-174)||(29250-29288)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (114-190)||(12705-12781)
scaffold0494 (136-174)||(12754-12792)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (45-174)||(7137-7274)
scaffold0278 (114-187)||(7247-7317)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (114-190)||(18059-18135)
scaffold0023 (136-174)||(18108-18146)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (136-194)||(28798-28856)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (114-186)||(10666-10738)
scaffold0546 (136-174)||(10655-10693)
[»] scaffold0166 (2 HSPs)
scaffold0166 (49-141)||(10395-10487)
scaffold0166 (145-194)||(10375-10424)
[»] scaffold0207 (6 HSPs)
scaffold0207 (114-187)||(15544-15617)
scaffold0207 (122-174)||(15689-15741)
scaffold0207 (114-174)||(15590-15650)
scaffold0207 (114-174)||(15656-15716)
scaffold0207 (114-174)||(15623-15683)
scaffold0207 (122-174)||(15722-15774)
[»] scaffold1662 (2 HSPs)
scaffold1662 (114-190)||(629-705)
scaffold1662 (136-174)||(678-716)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (54-174)||(4329-4449)
scaffold0292 (114-190)||(4422-4498)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (114-190)||(19270-19346)
scaffold0203 (136-174)||(19319-19357)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (115-190)||(13913-13988)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (114-190)||(63450-63526)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (136-190)||(10706-10760)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (140-194)||(70804-70858)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (114-190)||(20010-20086)
scaffold0111 (145-186)||(7093-7134)
scaffold0111 (145-186)||(14212-14253)
scaffold0111 (136-174)||(20059-20097)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (114-186)||(832-904)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (115-198)||(37-119)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (136-190)||(102305-102359)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (136-190)||(116619-116673)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (150-194)||(6426-6470)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (49-110)||(51314-51375)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (134-190)||(56610-56666)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (134-187)||(15154-15207)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (115-159)||(20943-20987)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (134-190)||(166827-166883)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 631506 - 631327
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  631506 catagcaatcgtcataagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaac 631408  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  631407 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatgcaac 631327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17048862 - 17048678
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||    
T  17048862 catagcaatcgtcataagcaa-tttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtataatacaactcagcaac 17048764  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17048763 tcatagatgataattcgttaacaacttaacaactcgtggatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaaatgcgactccaa 17048678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20160593 - 20160448
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20160593 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaattcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 20160494  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20160493 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 20160448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20157917 - 20157772
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20157917 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttatttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 20157818  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20157817 ctcatggatgataattcatcaacaacgagtttgactcgacaaatgc 20157772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20163371 - 20163229
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20163371 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacataggtagaagacaacccgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 20163272  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaa 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20163271 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaa 20163229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14954908 - 14954769
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14954908 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaacttatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 14954809  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954808 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 14954769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Original strand, 10712244 - 10712384
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10712244 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtaaaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcgt 10712343  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10712344 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 10712384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Original strand, 10926014 - 10926154
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  10926014 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtaaaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcgt 10926113  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10926114 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 10926154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 15224426 - 15224571
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15224426 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 15224525  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15224526 ctcatggatgataattcatcaacagcgaccttgactcgacaaatgc 15224571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5757647 - 5757507
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5757647 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 5757548  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5757547 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 5757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 9555919 - 9556059
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9555919 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 9556018  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9556019 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 9556059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 12487074 - 12487214
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12487074 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12487173  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12487174 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 12487214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14758144 - 14758004
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14758144 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14758045  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14758044 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 14758004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 33741769 - 33741909
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33741769 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 33741868  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33741869 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 33741909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4562042 - 4561902
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  4562042 acatcgtataatcctcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttgacaactcat 4561943  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4561942 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 4561902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Original strand, 37018300 - 37018436
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||  ||  ||||| ||||||||  |||| || ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  37018300 aacatcatataatcttcataagtacttcatgaacaacacgtggatagaagacaactcaacaacttatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcat 37018399  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37018400 ggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 37018436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 3484804 - 3484880
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3484804 aactcatggatgataattcaacaacaacttaacagctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 3484880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 17809723 - 17809803
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17809723 aactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 17809803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 25689292 - 25689378
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25689292 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 25689378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 104 - 190
Target Start/End: Original strand, 14548469 - 14548555
Alignment:
Q  104 acaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| || ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14548469 acaacttagcaactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcaaggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 14548555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35812776 - 35812632
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaact--------catagatgataattcattaacaacttaa 145  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||  ||||| ||||||||  ||||        ||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  35812776 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactcaacaacttaacaattcatggatgacaactcatcaacaacttaa 35812677  T
Q  146 caactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35812676 caactcatggatgacgactcatcaacaacgactttgactcgacaa 35812632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15042377 - 15042323
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15042377 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 15042323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 15112047 - 15112101
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  15112047 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 15112101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 25090443 - 25090497
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  25090443 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 25090497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13592611 - 13592535
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13592611 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacgactcatcaacaacgactttgactcaacaa 13592535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 189
Target Start/End: Original strand, 16997294 - 16997369
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgaca 189  Q
    ||||||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  16997294 aactcatggatgtcaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcattaacaacgactttgactcgaca 16997369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 27533400 - 27533479
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||   ||||||| |||||||||||||    
T  27533400 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacgcaactcgacaactcatggatgataattcat 27533479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 25689349 - 25689398
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25689349 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 25689398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 27533457 - 27533506
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27533457 acaactcatggatgataattcatcgacaacgactttgactcgacgaatgc 27533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 3484793 - 3484831
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3484793 aacaacttaacaactcatggatgataattcaacaacaac 3484831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 42874589 - 42874642
Alignment:
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42874589 acaactcaacaactcatgaatgacaactcatcaacaacgactttgattcgacaa 42874642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 55 - 102
Target Start/End: Original strand, 17807517 - 17807564
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaa 102  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17807517 acatcgtaaaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaa 17807564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13592622 - 13592584
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13592622 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 13592584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 14650409 - 14650465
Alignment:
Q  134 ttaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  14650409 ttaacaacttgacaacgcatggataaaaacttatcgacaacgactttgactcgacaa 14650465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 16795864 - 16796048
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16795864 catagcaatcgtcataagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgagtagaatacaactcagcaac 16795962  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  16795963 tcatagatgataattcattaataacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacttcgactagacaaatgcgactccaa 16796048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12853041 - 12852884
Alignment:
Q  40 ttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaaca 139  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  12853041 ttgaccacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactaagaaactcaaagatgataattcattaaca 12852942  T
Q  140 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12852941 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaataactttgactcgacaaatgcaac 12852884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 14665037 - 14665182
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14665037 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 14665136  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665137 ctcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 14665182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 14668193 - 14668338
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14668193 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagataactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 14668292  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668293 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 14668338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Original strand, 15464486 - 15464630
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15464486 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcgtagatgataattcatcaacaacttaacaa 15464585  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464586 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg 15464630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 12339088 - 12339232
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12339088 tcataaacatcgtaaaatcttcataggtacttctttaacaacacatg-gtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 12339186  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12339187 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgagaaatgc 12339232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16751063 - 16750919
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16751063 tcatgaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaacttaacaactcatagatgataattcattgacaacttaacaa 16750964  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16750963 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatg 16750919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 15964337 - 15964476
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15964337 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 15964436  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964437 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 15964476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 15968261 - 15968400
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15968261 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 15968360  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968361 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 15968400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 15972185 - 15972324
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15972185 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 15972284  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972285 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 15972324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37440353 - 37440214
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37440353 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 37440254  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37440253 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 37440214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8489906 - 8489764
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  8489906 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcat---caacttaacaa 8489810  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8489809 ctcatggatgaaaattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 8489764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 19774954 - 19775099
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  19774954 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 19775053  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19775054 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 19775099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4589635 - 4589490
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4589635 tcataaacatcgtataaccttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 4589536  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4589535 ctcatagatgataattcatcaacaacaactttgactcgacaaatgc 4589490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 11069460 - 11069600
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11069460 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11069559  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11069560 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 11069600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 14498717 - 14498857
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14498717 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14498816  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14498817 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 14498857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 22321056 - 22321196
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22321056 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22321155  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22321156 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 22321196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 22336111 - 22336251
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22336111 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22336210  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22336211 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 22336251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27410361 - 27410221
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27410361 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27410262  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27410261 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 27410221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 28949114 - 28949254
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28949114 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 28949213  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28949214 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 28949254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 55022257 - 55022397
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  55022257 acatcgtacaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 55022356  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  55022357 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 55022397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17317850 - 17317705
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17317850 tcataaacatcgtataatattcgttggtacttctttaacaacatataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacgacttaacaa 17317751  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17317750 ttcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 17317705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 7109088 - 7109228
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7109088 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 7109187  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7109188 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 7109228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 7113023 - 7113163
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7113023 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 7113122  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7113123 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 7113163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 15616766 - 15616906
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15616766 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 15616865  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15616866 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 15616906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4108116 - 4107985
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4108116 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 4108017  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactc 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4108016 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactc 4107985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4111968 - 4111837
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4111968 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 4111869  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactc 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4111868 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactc 4111837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11166246 - 11166106
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11166246 acatcgtataatctttgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11166147  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  11166146 ggatgataattcatcaacaacgaccttgaatcgacatatgc 11166106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 5222774 - 5222854
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5222774 aactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataatttatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 5222854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 14670449 - 14670610
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactca--------tagatgataattcattaacaa 140  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  ||||||        | ||||| || || | |||||    
T  14670449 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggttgaagacaactcaacaactcaacaactcatggatgacaactcgtcaacaa 14670548  T
Q  141 cttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14670549 cttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 14670610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 14681971 - 14682132
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaact--------catagatgataattcattaacaa 140  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||        ||| ||||| || |  | |||||    
T  14681971 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaacttgtcaacaa 14682070  T
Q  141 cttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14682071 cttaacaactcatgcatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 14682132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 190
Target Start/End: Original strand, 46821903 - 46821974
Alignment:
Q  119 atagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46821903 atagaagataactcaataacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 46821974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 2842737 - 2842654
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaact 198  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2842737 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcga-aaatgcaact 2842654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18700945 - 18700869
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18700945 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 18700869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10543158 - 10543014
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcag-----taac---tcatagatgataattcattaacaacttaa 145  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||      ||||   || | ||||| || |||| ||||||||||    
T  10543158 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaatttaacgaatcgtggatgacaactcatcaacaacttaa 10543059  T
Q  146 caactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10543058 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 10543014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 186
Target Start/End: Original strand, 13543678 - 13543728
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543678 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 13543728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 12120220 - 12120163
Alignment:
Q  143 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactcc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  12120220 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcaacaaatgcgactcc 12120163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38962338 - 38962281
Alignment:
Q  143 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactcc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38962338 taacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactcc 38962281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 35353360 - 35353414
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  35353360 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 35353414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 14441077 - 14441153
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14441077 aactcatggatgacaattcatcaacaacttaacagctcatggataacaactcatcgacaacgactttgactcgacaa 14441153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42353731 - 42353679
Alignment:
Q  138 caacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42353731 caacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 42353679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 14440973 - 14441104
Alignment:
Q  44 caacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagat-gataattcattaacaact 142  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||| |||  ||||| ||||||||  ||||||| ||| ||  |   || |||||||    
T  14440973 caacatcataaacatcgtataatcttcataagcactttattaacaacacatggatagaagacaactcaacaactcatggatagaagacaaatcaacaact 14441072  T
Q  143 taacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14441073 taacaactcatggatgacaattcatcaacaac 14441104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 10562478 - 10562532
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10562478 aacaacttaataactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 10562532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 5214723 - 5214776
Alignment:
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5214723 acaacttaataactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 5214776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13521039 - 13520978
Alignment:
Q  113 taactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13521039 taactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgaaaattcatcaacaac 13520978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Original strand, 30065372 - 30065452
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  30065372 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacaccactcgacaaactcatggatgataattcat 30065452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43890255 - 43890179
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || || | |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43890255 aactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaatccatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 43890179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 194
Target Start/End: Original strand, 30065432 - 30065479
Alignment:
Q  147 aactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30065432 aactcatggatgataattcatcgacaacgaccttgactcgacaaatgc 30065479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 19884861 - 19884816
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19884861 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttg 19884816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 190
Target Start/End: Original strand, 44269408 - 44269453
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  44269408 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 44269453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 91
Target Start/End: Original strand, 5220536 - 5220572
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaaca 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5220536 acatcatataatcttcataggtacttctttaacaaca 5220572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Original strand, 15565319 - 15565371
Alignment:
Q  122 gatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15565319 gatgacaattcatcaacaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaac 15565371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 15565300 - 15565338
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15565300 aacaacttaacaactcgtggatgacaattcatcaacaac 15565338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18700956 - 18700918
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18700956 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 18700918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14067345 - 14067289
Alignment:
Q  97 gtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14067345 gtagaacacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 14067289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25348 - 25170
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  25348 catagcaatcgtcata-gcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaac 25251  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaac 197  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25250 tcgtagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatgcaac 25170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Original strand, 48602845 - 48603018
Alignment:
Q  28 tcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  48602845 tcataagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcagcaactcatagatgat 48602943  T
Q  128 aattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48602944 aattcattaacagcttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 48603018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22131622 - 22131449
Alignment:
Q  28 tcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||  ||||||||||||||    
T  22131622 tcataagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagatgacagctcaacaactcatagatgat 22131524  T
Q  128 aattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22131523 aattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 22131449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 41782020 - 41781867
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41782020 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 41781921  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  41781920 ctcatggatgataattcatcaacaacagctttgactcgacaaatgcgactccaa 41781867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1925870 - 1925731
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1925870 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 1925771  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1925770 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 1925731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20924884 - 20924745
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20924884 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 20924785  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20924784 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 20924745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41388740 - 41388597
Alignment:
Q  50 catgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaac 149  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41388740 catgaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaac 41388641  T
Q  150 tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41388640 tcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatg 41388597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 190
Target Start/End: Original strand, 33796911 - 33797044
Alignment:
Q  57 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatgga 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33796911 atcgtataatcttcataggtacttctttaataacacatgggtggaagacaactcgacaactcatagatgataatttatcaacaacttaacaactcatgga 33797010  T
Q  157 tgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33797011 tgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 33797044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39244641 - 39244496
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39244641 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 39244542  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39244541 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 39244496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 39248196 - 39248051
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39248196 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 39248097  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39248096 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 39248051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16376176 - 16376035
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactca 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16376176 aacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactca 16376077  T
Q  153 tggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16376076 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 16376035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20229729 - 20229584
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |  ||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20229729 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggcggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 20229630  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20229629 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 20229584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 21406740 - 21406885
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   | |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21406740 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacagctcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 21406839  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  21406840 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttaactcgacaaatgc 21406885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 1010112 - 1010252
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1010112 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 1010211  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1010212 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 1010252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 52638930 - 52639070
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52638930 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 52639029  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  52639030 ggatgataattcatcaacaacgacattgactcgacatatgc 52639070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 186
Target Start/End: Original strand, 23967332 - 23967483
Alignment:
Q  43 acaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagt--------aactcatagatgataattcat 134  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||          ||||||| ||||| ||||||     
T  23967332 acaacatcataaacatcgtataatcttcataagtacttcattaacaacacatatgtagaagacaactcaactacttaacaactcatggatgacaattcag 23967431  T
Q  135 taacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
     |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  23967432 caacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 23967483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 42911818 - 42911894
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  42911818 aactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 42911894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14238775 - 14238695
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatg----ataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238775 aactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgatatataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 14238695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 19675542 - 19675596
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19675542 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 19675596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 48519948 - 48520018
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgact 184  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  48519948 aactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaactttgact 48520018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 20241618 - 20241672
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  20241618 aacaacttaacaactcatggacgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 20241672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14238786 - 14238748
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14238786 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 14238748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 42911807 - 42911845
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42911807 aacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 42911845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Original strand, 48519915 - 48519975
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||| ||||| || || | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48519915 aactcatggatgacaactcgtcaacaacctaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 48519975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 3084 - 3268
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  3084 catagcaatcgtcctaagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaac 3182  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  3183 tcatagatgataattcgttaacaacttagcaacacatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgtgactccaa 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 202
Target Start/End: Original strand, 7147 - 7331
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  7147 catagcaatcgtcctaagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaac 7245  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7246 tcatagatgataattcgttaacaacttagcaacacatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgtgactccaa 7331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 18301654 - 18301833
Alignment:
Q  17 catagcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaac 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  18301654 catagcaatcatcataagcaactta-acaacgtcatgaacatcgtgtaatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaatacaactcagcaac 18301752  T
Q  117 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaac 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18301753 tcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatacaac 18301833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 202
Target Start/End: Original strand, 20487186 - 20487333
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20487186 acatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatg 20487285  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20487286 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaattcaactccaa 20487333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12705381 - 12705236
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12705381 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 12705282  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12705281 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 12705236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13919217 - 13919072
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13919217 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 13919118  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13919117 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacagatgc 13919072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25927968 - 25927818
Alignment:
Q  46 acgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcat--taacaactt 143  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||||    
T  25927968 acgtcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaaaaaaactt 25927869  T
Q  144 aacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927868 aacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 25927818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 45170747 - 45170608
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45170747 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 45170648  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45170647 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 45170608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2530876 - 2530731
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2530876 tcataaacatcgtataatcttcatgggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcttagatgataattcatcaacaacttaacaa 2530777  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530776 ttcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 2530731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2832919 - 2832774
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2832919 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 2832820  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2832819 atcatggatgataattcatcaacaacgactttgacttgacaaatgc 2832774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 15083555 - 15083700
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  15083555 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgatatttcatcgacaacttaacaa 15083654  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15083655 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 15083700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1859546 - 1859401
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1859546 tcataaacatcgtataaccttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcgtagatgataattcatcgacaacttaacaa 1859447  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1859446 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacagatgc 1859401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 39721625 - 39721770
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39721625 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaa 39721724  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  39721725 ctcatggatgataattcattaacaacgaccttgactcgacaaatgc 39721770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 18425044 - 18425189
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  18425044 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 18425143  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18425144 ctcatggatgataactcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 18425189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 26291756 - 26291901
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  26291756 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 26291855  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26291856 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 26291901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 71484 - 71344
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  71484 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 71385  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  71384 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 71344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 75593 - 75453
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  75593 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 75494  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  75493 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 75453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16907928 - 16907788
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16907928 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 16907829  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16907828 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 16907788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 18282755 - 18282895
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18282755 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 18282854  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18282855 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 18282895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 32498 - 32638
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32498 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 32597  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32598 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 32638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 12718057 - 12718197
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12718057 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaatacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12718156  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12718157 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 12718197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 12722968 - 12723108
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12722968 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaatacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12723067  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12723068 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 12723108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 16113630 - 16113770
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16113630 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 16113729  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16113730 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 16113770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 16116783 - 16116923
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16116783 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 16116882  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16116883 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 16116923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 18278792 - 18278932
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18278792 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 18278891  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  18278892 ggatgataattcatcaacaacgaccttgacttgacatatgc 18278932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 24274799 - 24274875
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24274799 aactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcctcaacaacgactttgactcgacaa 24274875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 7519762 - 7519677
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcat 134  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  7519762 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcat 7519677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Original strand, 16585087 - 16585231
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaact--------catagatgataattcattaacaacttaa 145  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||        ||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  16585087 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaa 16585186  T
Q  146 caactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16585187 caactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 16585231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 129 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15605934 - 15605861
Alignment:
Q  129 attcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15605934 attcatcaacaactcaaaaactcatggatgataattcatcaacaacgaatttgactcgacaaatgcgactccaa 15605861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Original strand, 16579257 - 16579332
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16579257 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 16579332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16586405 - 16586330
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16586405 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 16586330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 14257924 - 14257996
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14257924 aactcatggatgacaattcctcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 14257996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16461560 - 16461500
Alignment:
Q  130 ttcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16461560 ttcattaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcaacaa 16461500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 20585203 - 20585279
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  20585203 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgactttgactcgacaa 20585279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15082370 - 15082314
Alignment:
Q  143 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactcc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15082370 taacaactcatggatgataattcatc-acaacgactttgactcgacaagtgcgactcc 15082314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Original strand, 12714353 - 12714408
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  12714353 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactc 12714408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 14257823 - 14257951
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaact--------catagatgataattcattaacaacttaa 145  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||        ||| ||||| ||||| | ||||||||||    
T  14257823 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaattcgtcaacaacttaa 14257922  T
Q  146 caactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14257923 caactcatggatgacaattcctcaacaac 14257951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14183873 - 14183819
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||    
T  14183873 aacaacttaacaactcatggatgacaactaatcaaaaacgactttgactcgacaa 14183819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14933156 - 14933118
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14933156 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 14933118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15356591 - 15356553
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15356591 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15356553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15360705 - 15360667
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360705 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 15360667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 24274788 - 24274826
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24274788 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 24274826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 32300804 - 32300858
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  32300804 aacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcaacaa 32300858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12466526 - 12466473
Alignment:
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| |||||||    
T  12466526 acaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgactttgattcgacaa 12466473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 111
Target Start/End: Original strand, 32300747 - 32300804
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactca 111  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  32300747 aacatcgtataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactca 32300804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 20585192 - 20585230
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20585192 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 20585230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 8332 - 8164
Alignment:
Q  28 tcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  8332 tcataagcaactt-gacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaacttagcaactcaaagatgat 8234  T
Q  128 aattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaac 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8233 aattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcgacaaatgcaac 8164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 190
Target Start/End: Original strand, 216 - 385
Alignment:
Q  20 agcaatcgtcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactca 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  216 agcaatcgtcataagcaactt-gacaacatcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaataaaactcagcaactca 314  T
Q  120 tagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  315 tagatgataattcattaacaacttgacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgacttgacaa 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 6613 - 6460
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6613 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 6514  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6513 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 6460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36833 - 36688
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36833 tcataaacatcatataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 36734  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36733 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 36688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44385389 - 44385215
Alignment:
Q  28 tcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttc-tttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatga 126  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  44385389 tcataagcaactt-gacaacatcatgaacatcgtataatcttcataggtactccctttaataacacatgggtagaagacaactcaacaacacatagatga 44385291  T
Q  127 taattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  44385290 taattcattaacaacttaacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgacttgacaaatgcgactccaa 44385215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21828761 - 21828616
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21828761 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 21828662  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828661 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 21828616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18863387 - 18863247
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18863387 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcat 18863288  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863287 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 18863247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 23913655 - 23913808
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23913655 tcataaacatcatgtaatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaaattaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 23913754  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23913755 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 23913808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30940818 - 30940679
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30940818 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 30940719  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940718 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 30940679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 21386717 - 21386862
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  21386717 tcataaacatcgtataatctttataagtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcaaagatgataatttatcaacaacttaacaa 21386816  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386817 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 21386862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14398568 - 14398425
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14398568 tcataaacatcgtataatcttcatatgtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactca--gatgataattcatcaacaacttaacaa 14398471  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398470 ttcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 14398425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 21410309 - 21410454
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  21410309 tcataaacatcatataatcgtcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataaatcatcgacaacttaacaa 21410408  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21410409 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 21410454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 21804801 - 21804946
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  21804801 tcataaacatcatataatcgtcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataaatcatcgacaacttaacaa 21804900  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21804901 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 21804946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21973298 - 21973158
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21973298 acatcgtataatcttcataggtacttcttcaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 21973199  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21973198 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 21973158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21977389 - 21977249
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21977389 acatcgtataatcttcataggtacttcttcaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 21977290  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21977289 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 21977249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 22111320 - 22111460
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22111320 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22111419  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22111420 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 22111460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 43251200 - 43251340
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43251200 acatcgtacaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 43251299  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  43251300 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 43251340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16413882 - 16413760
Alignment:
Q  68 ttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcat 167  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||| |||  ||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16413882 ttcataagtacttcattaactacacatggatagaagacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacttaataactcatgtatgataattcat 16413783  T
Q  168 caacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16413782 caacaacgactttgactcgacaa 16413760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 32121453 - 32121529
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32121453 aactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcctcaacaacgactttgactcgacaa 32121529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42819183 - 42819107
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42819183 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaacttggactcgacaa 42819107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 5760107 - 5760237
Alignment:
Q  44 caacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagat----gataattcattaaca 139  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||  ||||| |||||| |  ||||||| |||    ||||| |||   |||    
T  5760107 caacatcataaacatcgtataatcttcataagcacttcattaacaacacatggatagaagacaactaac-aactcatggatagaagataactca---aca 5760202  T
Q  140 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5760203 acttaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 5760237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 18833091 - 18833161
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgact 184  Q
    ||||||| ||||| || || | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  18833091 aactcatggatgacaactcgtcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacaactttgact 18833161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 32121442 - 32121480
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121442 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 32121480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19930034 - 19929978
Alignment:
Q  134 ttaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || | || ||||||||||||||||||||||    
T  19930034 ttaacaacttgacaactcatggataacaacttattaacaacgactttgactcgacaa 19929978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 37515200 - 37515238
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37515200 aacaacttaacaactcatgaatgacaattcatcaacaac 37515238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 42819194 - 42819156
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42819194 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 42819156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22074708 - 22074563
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22074708 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagataactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 22074609  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22074608 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 22074563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 23414289 - 23414434
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23414289 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 23414388  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414389 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 23414434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 64 - 202
Target Start/End: Original strand, 2076871 - 2077009
Alignment:
Q  64 aatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataat 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2076871 aatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataat 2076970  T
Q  164 tcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2076971 tcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 2077009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 1643894 - 1644039
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  || ||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1643894 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtggaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 1643993  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1643994 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 1644039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 31478706 - 31478561
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31478706 tcataaacatcgtataatcttcgtatgtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 31478607  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31478606 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 31478561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 11566251 - 11566391
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11566251 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11566350  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11566351 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 11566391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12619559 - 12619419
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12619559 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 12619460  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  12619459 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 12619419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 22862335 - 22862475
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22862335 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 22862434  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22862435 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 22862475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 23394457 - 23394597
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23394457 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 23394556  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23394557 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 23394597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 14471603 - 14471742
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||     
T  14471603 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcata 14471702  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471703 gatgatagttcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 14471742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 16623738 - 16623883
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16623738 tcataaacatcgtataattttcgtaggtacttttttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 16623837  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16623838 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 16623883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 8243222 - 8243362
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8243222 acatcgtaaaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 8243321  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8243322 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 8243362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 23989309 - 23989449
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23989309 acatcgtataatcttcgcaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 23989408  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  23989409 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 23989449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 19869978 - 19870119
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagt-agaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactca 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || | || | ||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||     
T  19869978 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggttataacataactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcg 19870077  T
Q  153 tggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19870078 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 19870119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 55 - 174
Target Start/End: Original strand, 16759626 - 16759746
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  16759626 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactaat 16759725  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  16759726 ggatgataattcatcgacaac 16759746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Original strand, 27556065 - 27556192
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||          
T  27556065 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaaaacaactcgacaactcatagatgataattcatcatcaacttaaca------ 27556158  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556159 -------aattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 27556192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 22948506 - 22948592
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22948506 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 22948592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 22952462 - 22952548
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22952462 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 22952548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 23870950 - 23871036
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23870950 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 23871036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Original strand, 23874906 - 23874992
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23874906 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 23874992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 34963069 - 34963123
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963069 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 34963123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 190
Target Start/End: Original strand, 22805370 - 22805507
Alignment:
Q  61 tataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaact--------catagatgataattcattaacaacttaacaactca 152  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||        ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  22805370 tataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactca 22805469  T
Q  153 tggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22805470 tggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 22805507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19774204 - 19774060
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaact--------catagatgataattcattaacaacttaa 145  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||        ||| ||||| || || | ||||||||||    
T  19774204 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaactcaacaacttaacaactcatggatgacaactcgtcaacaacttaa 19774105  T
Q  146 caactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19774104 caactcatggatgacaagtcatcaacaacgactttgactcgacaa 19774060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 190
Target Start/End: Original strand, 23538235 - 23538302
Alignment:
Q  123 atgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23538235 atgataattcatcaacaacttaacaactcttggatgataattcatcaacaacgaatttgactagacaa 23538302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 23992126 - 23992180
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23992126 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaa 23992180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 190
Target Start/End: Original strand, 17105354 - 17105407
Alignment:
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17105354 acaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttgactcgacaa 17105407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 17742851 - 17742923
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  17742851 aactcatggatgtcaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 17742923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19656697 - 19656621
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19656697 aactcatggatgagaattcatcatcaacttaacaactcatggatgacaactcatcgacaacgactttgactcgacaa 19656621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27126665 - 27126606
Alignment:
Q  131 tcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27126665 tcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 27126606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15706011 - 15705936
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15706011 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgaatttgacttgacaa 15705936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 55 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18918092 - 18918013
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcat 134  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  | || ||| |||||||||||||    
T  18918092 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgatcacccatggatgataattcat 18918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27416557 - 27416503
Alignment:
Q  140 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27416557 acttaacaactcatagatgataattcatcaacaacgacttcgactcgacagatgc 27416503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 179
Target Start/End: Original strand, 16759727 - 16759784
Alignment:
Q  122 gatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactt 179  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759727 gatgataattcatcgacaacttaacagctaatggatgataattcatcaacaacgactt 16759784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 22948563 - 22948612
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22948563 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 22948612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 22952519 - 22952568
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22952519 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 22952568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 23871007 - 23871056
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23871007 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 23871056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Original strand, 23874963 - 23875012
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23874963 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 23875012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 7825435 - 7825489
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  7825435 aacaacttaacaactcgtggatgacaactcatcaacaacgactttgattcgacaa 7825489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19656888 - 19656762
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattca--ttaacaacttaac 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||   ||||| ||||||||  ||||||| ||| | ||  ||  | ||||||||| |    
T  19656888 tcataaacatcgtataatcttcataagcacttcattaacaacacatagatagaagacaactcaacaactcatggat-agaagacaactcaacaacttagc 19656790  T
Q  147 aactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19656789 aactcatggatgacaattcatcaacaac 19656762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15706044 - 15705985
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  15706044 actcatagatgacaactcatcaacaacttaaccactcatggatgacaactcatcaacaac 15705985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18918029 - 18917986
Alignment:
Q  151 catggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18918029 catggatgataattcatcaccaacgactttgactcaacaaatgc 18917986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19656799 - 19656746
Alignment:
Q  104 acaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggat 157  Q
    |||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19656799 acaacttagcaactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggat 19656746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Original strand, 17742818 - 17742878
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17742818 aactcatggaggacaattcatcaacaactttacaactcatggatgtcaattcatcaacaac 17742878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 17742807 - 17742845
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17742807 aacaacttaacaactcatggaggacaattcatcaacaac 17742845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19656733 - 19656695
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19656733 aacaacttaacaactcatggatgacaatttatcaacaac 19656695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 174
Target Start/End: Original strand, 23538216 - 23538253
Alignment:
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23538216 acaacttaacaactcttgaatgataattcatcaacaac 23538253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Original strand, 20182380 - 20182440
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||  |||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20182380 aactcatgtatgacaattcatcgacaactcaacaactcgtggatgacaattcatcaacaac 20182440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22153611 - 22153551
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||  |||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22153611 aactcatgtatgacaattcatcgacaactcaacaactcgtggatgacaattcatcaacaac 22153551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 1e-55; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 202
Target Start/End: Original strand, 9784394 - 9784547
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9784394 tcataaacatcatataaacttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagaaaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaa 9784493  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9784494 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 9784547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 1282772 - 1282917
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1282772 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaacttatagatgataattcatcgacaacttaacaa 1282871  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1282872 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 1282917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 31344522 - 31344666
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  31344522 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattca-tcacaacttaacaa 31344620  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344621 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 31344666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41531721 - 41531582
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41531721 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 41531622  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531621 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 41531582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30345732 - 30345593
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30345732 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 30345633  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30345632 gatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 30345593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24629196 - 24629056
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24629196 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 24629097  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24629096 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 24629056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27380149 - 27380009
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27380149 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27380050  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27380049 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 27380009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27384195 - 27384055
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27384195 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27384096  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27384095 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 27384055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 27601181 - 27601321
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27601181 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 27601280  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27601281 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 27601321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10102370 - 10102230
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10102370 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacgacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 10102271  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10102270 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 10102230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 24648744 - 24648884
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24648744 acatcgtacaatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 24648843  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24648844 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 24648884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32215472 - 32215385
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32215472 aactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgac-aatgcaactccaa 32215385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12902190 - 12902093
Alignment:
Q  97 gtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12902190 gtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 12902093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 17306255 - 17306331
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17306255 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 17306331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Original strand, 38967084 - 38967140
Alignment:
Q  143 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38967084 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactc 38967140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 24367446 - 24367503
Alignment:
Q  143 taacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactcc 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24367446 taacaactcatgaatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactcc 24367503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28653764 - 28653710
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28653764 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 28653710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 189
Target Start/End: Original strand, 24514976 - 24515029
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgaca 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  24514976 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgaca 24515029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 36838972 - 36839042
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgact 184  Q
    |||||||  |||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36838972 aactcatgaatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgact 36839042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 32215483 - 32215445
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215483 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 32215445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 17306244 - 17306282
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17306244 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 17306282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 19)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 11230505 - 11230650
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11230505 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11230604  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11230605 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 11230650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Original strand, 18355609 - 18355746
Alignment:
Q  57 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatgga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18355609 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 18355708  T
Q  157 tgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18355709 tgataattcatcaacaacgacttcgactcgacaaatgc 18355746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 11220107 - 11220252
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11220107 tcataaacatcgtataatcttcatagctacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11220206  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11220207 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 11220252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 11224693 - 11224838
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11224693 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11224792  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11224793 atcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 11224838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 11228516 - 11228661
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11228516 tcataaacatcgtataatcttcctaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 11228615  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11228616 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 11228661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 40724332 - 40724193
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40724332 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 40724233  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  40724232 gatgataattcatcaacaacgactttgacttgacagatgc 40724193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Original strand, 20295235 - 20295376
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactca 152  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20295235 aacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactca 20295334  T
Q  153 tggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20295335 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 20295376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 10752576 - 10752719
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   ||||||  |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10752576 tcataaacatcgtataatcttcgtatgtacttctttaacaacatataggtagaagacaactcgacaactca--gatgataattcatcgacaacttaacaa 10752673  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10752674 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 10752719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15237556 - 15237412
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15237556 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacgactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 15237457  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15237456 ctcatggatgataattcatc-acaacgaccttgactcgacaaatgc 15237412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 194
Target Start/End: Original strand, 11226546 - 11226671
Alignment:
Q  69 tcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatc 168  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226546 tcatagctacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatc 11226645  T
Q  169 aacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    
T  11226646 aacaacgatcttgactcgacaaatgc 11226671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22108109 - 22108009
Alignment:
Q  41 tgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22108109 tgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaa 22108010  T
Q  141 c 141  Q
    |    
T  22108009 c 22108009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20911623 - 20911531
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20911623 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgtcaactaatagatgataattcatcaacaac 20911531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24767990 - 24767898
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24767990 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcacagatgataattcatcaacaac 24767898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 55 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19473401 - 19473315
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19473401 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaac 19473315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22108046 - 22107981
Alignment:
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaactccaa 202  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22108046 acaactcaacaactcatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcgactccaa 22107981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19473344 - 19473295
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19473344 acaactcatagatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 19473295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20911559 - 20911511
Alignment:
Q  146 caactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20911559 caactaatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 20911511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 33896171 - 33896117
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  33896171 aacaatttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcaacaa 33896117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24767927 - 24767878
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24767927 acaactcacagatgataattcatcaacaacgactttgactcatcaaatgc 24767878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14828 - 14689
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14828 acatcgtaaaatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 14729  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14728 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 14689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 208327 - 208190
Alignment:
Q  57 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatgga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  208327 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaagtcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 208228  T
Q  157 tgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  208227 tgataattcatcaacaacgactttgacttgacaaatgc 208190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 190116 - 189979
Alignment:
Q  57 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatgga 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  190116 atcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggaagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcaacaacttaacaactcatgga 190017  T
Q  157 tgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  190016 ttataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 189979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 8231 - 8090
Alignment:
Q  28 tcataagcaactttgacaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgat 127  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||     
T  8231 tcataagcaactta-acaacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgac 8133  T
Q  128 aattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaa 170  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8132 aattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaa 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8113 - 8037
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8113 aactcatggatgataattcatcaaaaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 8037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 93
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactca 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  234 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactca 135  T
Q  153 tggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  134 tggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 93  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 11354 - 11499
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11354 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaagacatgggtagaagacaactcgacaactcgtagatgataattcatcaacaacttaacaa 11453  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11454 ctcatggatgataattcatcaacaatgactttgactcaacaaatgc 11499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36711 - 36566
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaa 148  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  36711 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaa 36612  T
Q  149 ctcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36611 ctcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 36566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1063
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1135 aactcatggatggtaattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgactcg 1063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 1146 - 1108
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1146 aacaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaac 1108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 54 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 74036 - 73896
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  74036 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacttaggtagaagacaactcgacaactcttagatgataattcatcaacaactgaacaactcat 73937  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73936 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 73896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20933 - 20781
Alignment:
Q  46 acgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttcttt--aacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaa--c 141  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||  |    
T  20933 acgtcataaacatcatataatcttcataggtacttctttttaacaacacatgggtagaagacaactcaacaactcatagatgataattcatcaaaaaaac 20834  T
Q  142 ttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20833 ttaacaactcatggatgataattcatcaacaacaactttgactcgacaaatgc 20781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5816 - 5676
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5816 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 5717  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5716 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 5676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Original strand, 11811 - 11951
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  11811 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 11910  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11911 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 11951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33403 - 33263
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33403 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 33304  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33303 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 33263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 68018 - 67878
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  68018 acatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 67919  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  67918 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 67878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19689 - 19613
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||    
T  19689 aactcatggatgacaactcatcaacaaattagcaactcatggatgacaactcattaacaacgactttaactcgacaa 19613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19700 - 19663
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaa 173  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19700 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaa 19663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 66240 - 66101
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  66240 acatcgtataatcttcgtagctacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 66141  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  66140 gatgataattcataaacaacgactttgactcgacaaatgc 66101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 62324 - 62185
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatg 154  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  62324 acatcgtataatcttcgtagctacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacgactcatgtatgataattcatcgacaacttaacaactcatg 62225  T
Q  155 gatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  62224 gatgataattcatcaacaacgactttgaatcgacaaatgc 62185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 79925 - 80071
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaaca 147  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  79925 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaataacacataggtagaagacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaaca 80024  T
Q  148 actcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  80025 acttatggatgataattcatcaacaacgaccttgacttgacatatgc 80071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 59436 - 59296
Alignment:
Q  55 acatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc-agtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  59436 acatcgtataatcatcgtaggtacttctttaacaacacatgggtagaacacaactcgacaaactcatggatgataattcatcgacaacttaacaactcat 59337  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  59336 ggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacatatgc 59296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Original strand, 9235 - 9381
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataat-cttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaaca 147  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  ||| || ||| |||   || || | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9235 tcataaacatcgtataattcttcataggtacttctttaacaacacttaggtataagacagctcgacaattcttggatgataattcatcaacaacttaaca 9334  T
Q  148 actcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9335 actcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 9381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 131 - 190
Target Start/End: Original strand, 8201 - 8260
Alignment:
Q  131 tcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  8201 tcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgacttagactcgacaa 8260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 97 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 4543 - 4446
Alignment:
Q  97 gtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4543 gtagaagacaactcgacaactcatagatgataattcatcgacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgaccttgactcgacaaatgc 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 194
Target Start/End: Original strand, 29261 - 29341
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29261 aactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcatggataataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 29341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 29250 - 29288
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29250 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 29288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12781 - 12705
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12781 aactcatggatgataatacatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 12705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12792 - 12754
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12792 aacaacttaacaactcatggatgataatacatcaacaac 12754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Original strand, 7137 - 7274
Alignment:
Q  45 aacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc--------agtaactcatagatgataattcatta 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| | |||||||        |  ||||||||||||| ||||||| |    
T  7137 aacgtcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacaggggtagcagacaactcaacaacttaacaactcatagatgacaattcatca 7236  T
Q  137 acaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7237 acaacttgacaactcatggatgacaattcatcaacaac 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Original strand, 7247 - 7317
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcga 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7247 aactcatggatgacaattcatcaacaacttaac---tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcga 7317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18135 - 18059
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18135 aactcatggatgataattcatcaacaacttaacaactcaaggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 18059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18146 - 18108
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18146 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 18108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 194
Target Start/End: Original strand, 28798 - 28856
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28798 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 28856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10738
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10666 aactcatggatggtaattcatcaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgacattgactcg 10738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Original strand, 10655 - 10693
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10655 aacaacttaacaactcatggatggtaattcatcaacaac 10693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10487 - 10395
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaac 141  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10487 tcataaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacacatgggtagaagacaactcgacaactcacagatgataattcatcaacaac 10395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10424 - 10375
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10424 acaactcacagatgataattcatcaacaacgactttgactcatcaaatgc 10375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 6)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15617 - 15544
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcga 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15617 aactcatggatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgactttaactcga 15544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15741 - 15689
Alignment:
Q  122 gatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15741 gatgacaattcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 15689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15650 - 15590
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15650 aactcatggacgacaattcatgaacaactaaacaactcatggatgacaattcatcaacaac 15590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15716 - 15656
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15716 aactcatggatgacaattcatcaacaactaaacaactcatggatcacaattcatcaacaac 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15683 - 15623
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  15683 aactcatggatcacaattcatcaacaacttaacaactcatggacgacaattcatgaacaac 15623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15774 - 15722
Alignment:
Q  122 gatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15774 gatgacaattcatcaacaacctaacaactcacggatgacaattcatcaacaac 15722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 629
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  705 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgagaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 716 - 678
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  716 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 174
Target Start/End: Original strand, 4329 - 4449
Alignment:
Q  54 aacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactcagtaactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcat 153  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |   |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  4329 aacatcatataatcttcataagcacttcattaacaacacatgggtagaagacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcat 4428  T
Q  154 ggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  4429 ggatgacaactcatcaacaac 4449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Original strand, 4422 - 4498
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||||||    
T  4422 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgattttgactcgacaa 4498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 19346 - 19270
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19346 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgattttgactcgacaa 19270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19357 - 19319
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19357 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 19319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13988 - 13913
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13988 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 13913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 63526 - 63450
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  63526 aactcatggttgacaattcatcaagaacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaacgaatttgactcgacaa 63450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 10706 - 10760
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10706 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 10760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 194
Target Start/End: Original strand, 70804 - 70858
Alignment:
Q  140 acttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70804 acttaacaactcatagatgataattcatcaacaacgacttagactcgacaaatgc 70858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20086 - 20010
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||    
T  20086 aactcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaatgactttcactcgacaa 20010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 7093 - 7134
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  7093 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 7134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 14212 - 14253
Alignment:
Q  145 acaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  14212 acaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcg 14253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20097 - 20059
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaac 174  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20097 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaac 20059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 904 - 832
Alignment:
Q  114 aactcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcg 186  Q
    ||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  904 aactcatggatgacaattcctcaataacttaacaactcatggatgacaattcatcaacaaagactttgactcg 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 198
Target Start/End: Original strand, 37 - 119
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgcaact 198  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatgacaactcatgaacaacgacattgactcga-aaatgcaact 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 102359 - 102305
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  102359 aacaacttaacaactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgacttgacaa 102305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 116619 - 116673
Alignment:
Q  136 aacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  116619 aacaacttaacgactcatggatgacaactcatcaacaacgactttgactcgacaa 116673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 194
Target Start/End: Original strand, 6426 - 6470
Alignment:
Q  150 tcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 194  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6426 tcatagatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaaatgc 6470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 51375 - 51314
Alignment:
Q  49 tcatgaacatcgtataatcttcataggtacttctttaacaacatatgagtagaatacaactc 110  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||    
T  51375 tcataaacatcgtataatcttcgtaggtacttctttaacaacacataggtagaagacaactc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Original strand, 56610 - 56666
Alignment:
Q  134 ttaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  56610 ttaacaacttgacaactcatggataataacttatcgacaacgactttgactcgacaa 56666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 187
Target Start/End: Original strand, 15154 - 15207
Alignment:
Q  134 ttaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcga 187  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||    
T  15154 ttaacaacttgacaactcatggataacaacttatcgacaacgactttgactcga 15207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 159
Target Start/End: Original strand, 20943 - 20987
Alignment:
Q  115 actcatagatgataattcattaacaacttaacaactcatggatga 159  Q
    |||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20943 actcatggatgacaactcatcaacaacttaacaactcatggatga 20987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 166883 - 166827
Alignment:
Q  134 ttaacaacttaacaactcatggatgataattcatcaacaacgactttgactcgacaa 190  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | || | ||| |||||||||||||||||||||    
T  166883 ttaacaacttgacaacgcatggataaaaacttatcgacaacgactttgactcgacaa 166827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University