View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_59 (Length: 393)

Name: NF9913A_low_59
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_59
NF9913A_low_59
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (7-393)||(5602-5988)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (7-393)||(47782-48168)
scaffold0053 (7-390)||(56595-56978)
[»] chr4 (45 HSPs)
chr4 (7-389)||(15002109-15002491)
chr4 (8-390)||(15247068-15247450)
chr4 (7-390)||(15357865-15358248)
chr4 (7-393)||(27901527-27901913)
chr4 (7-289)||(15071604-15071886)
chr4 (7-372)||(16148873-16149238)
chr4 (7-372)||(16153019-16153384)
chr4 (11-366)||(8707088-8707442)
chr4 (9-390)||(33224067-33224448)
chr4 (9-381)||(29452284-29452656)
chr4 (9-381)||(3263541-3263913)
chr4 (7-390)||(51605537-51605920)
chr4 (14-381)||(11205983-11206350)
chr4 (71-340)||(15320330-15320599)
chr4 (9-381)||(44660613-44660985)
chr4 (85-384)||(15413849-15414148)
chr4 (44-381)||(14849888-14850225)
chr4 (7-381)||(1648022-1648396)
chr4 (29-349)||(23956932-23957252)
chr4 (29-289)||(8387657-8387917)
chr4 (29-289)||(15146392-15146652)
chr4 (29-289)||(29037911-29038171)
chr4 (44-381)||(14695266-14695603)
chr4 (29-289)||(12477845-12478105)
chr4 (29-289)||(19777300-19777560)
chr4 (11-289)||(16353934-16354212)
chr4 (29-258)||(14302485-14302714)
chr4 (29-258)||(18298481-18298710)
chr4 (29-289)||(8052130-8052390)
chr4 (29-349)||(14160655-14160975)
chr4 (29-289)||(40474285-40474545)
chr4 (11-258)||(12524952-12525199)
chr4 (11-246)||(14681855-14682090)
chr4 (11-273)||(18614313-18614575)
chr4 (29-258)||(27712612-27712841)
chr4 (125-381)||(20892135-20892391)
chr4 (246-384)||(15078785-15078923)
chr4 (11-258)||(18225935-18226182)
chr4 (35-312)||(9292057-9292334)
chr4 (35-298)||(14998552-14998814)
chr4 (35-148)||(15291931-15292044)
chr4 (44-148)||(18548841-18548945)
chr4 (36-141)||(12341639-12341744)
chr4 (200-298)||(13248881-13248979)
chr4 (200-267)||(15292096-15292163)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (7-391)||(10967-11351)
scaffold0309 (11-102)||(16103-16194)
[»] scaffold0266 (3 HSPs)
scaffold0266 (7-390)||(15287-15670)
scaffold0266 (35-148)||(8637-8750)
scaffold0266 (200-286)||(8802-8888)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (7-393)||(4948-5334)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (7-389)||(721-1103)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (7-393)||(48276-48662)
[»] chr8 (63 HSPs)
chr8 (7-393)||(21841624-21842010)
chr8 (7-393)||(20984735-20985121)
chr8 (7-390)||(23656137-23656520)
chr8 (7-381)||(20009109-20009482)
chr8 (7-381)||(22372150-22372524)
chr8 (7-353)||(21324457-21324802)
chr8 (12-390)||(31415664-31416045)
chr8 (9-381)||(6604877-6605249)
chr8 (131-381)||(19852630-19852880)
chr8 (9-381)||(14566361-14566733)
chr8 (14-381)||(16270419-16270786)
chr8 (7-382)||(20389317-20389692)
chr8 (131-381)||(19858666-19858916)
chr8 (11-390)||(31570034-31570413)
chr8 (9-381)||(29302616-29302988)
chr8 (7-382)||(20974844-20975214)
chr8 (7-390)||(22052073-22052456)
chr8 (9-381)||(27355766-27356127)
chr8 (41-372)||(20395354-20395685)
chr8 (11-393)||(21165730-21166112)
chr8 (170-390)||(1267448-1267668)
chr8 (53-381)||(12305977-12306305)
chr8 (7-135)||(19860900-19861028)
chr8 (29-258)||(19114032-19114261)
chr8 (29-289)||(22128168-22128428)
chr8 (11-285)||(21393057-21393331)
chr8 (11-285)||(21787551-21787825)
chr8 (29-287)||(22119384-22119642)
chr8 (29-289)||(18857888-18858148)
chr8 (29-289)||(19979278-19979538)
chr8 (29-285)||(21043760-21044016)
chr8 (11-258)||(32601486-32601733)
chr8 (29-273)||(19483274-19483518)
chr8 (29-289)||(20017473-20017733)
chr8 (11-285)||(21252259-21252533)
chr8 (29-258)||(15534725-15534954)
chr8 (29-258)||(17673233-17673462)
chr8 (11-258)||(30312336-30312583)
chr8 (44-254)||(22247658-22247868)
chr8 (11-273)||(22041186-22041448)
chr8 (44-381)||(22376678-22377016)
chr8 (44-381)||(22382853-22383191)
chr8 (11-276)||(21920928-21921193)
chr8 (41-349)||(23886275-23886583)
chr8 (170-381)||(6680330-6680541)
chr8 (11-273)||(22132233-22132495)
chr8 (29-289)||(23651352-23651612)
chr8 (210-381)||(803064-803235)
chr8 (38-138)||(22623262-22623362)
chr8 (35-286)||(16876311-16876562)
chr8 (35-148)||(21195718-21195831)
chr8 (11-153)||(16407309-16407451)
chr8 (71-148)||(21849589-21849666)
chr8 (35-144)||(23156256-23156365)
chr8 (35-148)||(23901639-23901752)
chr8 (35-141)||(22316650-22316756)
chr8 (95-148)||(20651609-20651662)
chr8 (35-148)||(22435755-22435868)
chr8 (182-255)||(22623399-22623472)
chr8 (44-148)||(19869145-19869249)
chr8 (200-267)||(22435636-22435703)
chr8 (200-286)||(20651714-20651800)
chr8 (200-298)||(21849718-21849816)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (7-393)||(19148342-19148728)
chr7 (7-393)||(20747741-20748127)
chr7 (7-388)||(16071027-16071408)
chr7 (11-390)||(15101339-15101718)
chr7 (7-393)||(14262976-14263362)
chr7 (7-393)||(11387160-11387546)
chr7 (7-390)||(13666671-13667054)
chr7 (7-390)||(23504602-23504985)
chr7 (9-390)||(140-522)
chr7 (7-382)||(15341573-15341948)
chr7 (7-390)||(16949204-16949587)
chr7 (9-381)||(11304997-11305369)
chr7 (11-381)||(19613818-19614188)
chr7 (12-390)||(13022491-13022869)
chr7 (7-384)||(14285108-14285485)
chr7 (11-390)||(12457774-12458153)
chr7 (7-390)||(18052685-18053068)
chr7 (7-384)||(12205532-12205909)
chr7 (9-381)||(13967402-13967774)
chr7 (9-309)||(49153516-49153816)
chr7 (11-289)||(8708839-8709117)
chr7 (29-289)||(44790127-44790387)
chr7 (9-309)||(26117324-26117639)
chr7 (45-289)||(18550550-18550794)
chr7 (29-289)||(8199862-8200122)
chr7 (29-289)||(15159833-15160093)
chr7 (35-298)||(10872220-10872483)
chr7 (11-258)||(14955819-14956066)
chr7 (29-298)||(16094-16363)
chr7 (29-393)||(320813-321177)
chr7 (29-289)||(11235989-11236249)
chr7 (11-327)||(11770999-11771315)
chr7 (29-273)||(14212924-14213168)
chr7 (29-289)||(14333630-14333890)
chr7 (41-393)||(15204749-15205101)
chr7 (29-288)||(15147661-15147920)
chr7 (38-287)||(14040931-14041180)
chr7 (38-287)||(14350961-14351210)
chr7 (11-258)||(12688765-12689013)
chr7 (29-289)||(13687298-13687558)
chr7 (29-258)||(23202389-23202618)
chr7 (29-258)||(23508516-23508745)
chr7 (11-258)||(11551860-11552107)
chr7 (29-258)||(18179007-18179236)
chr7 (215-384)||(14434831-14435000)
chr7 (11-258)||(9597322-9597569)
chr7 (35-298)||(7825125-7825388)
chr7 (35-298)||(27106556-27106819)
chr7 (35-298)||(27171506-27171769)
chr7 (35-148)||(4441303-4441416)
chr7 (41-150)||(15625898-15626007)
chr7 (282-381)||(12456845-12456944)
chr7 (41-148)||(14937722-14937829)
chr7 (41-148)||(15365315-15365422)
chr7 (179-349)||(15625728-15625898)
chr7 (35-143)||(17925031-17925139)
chr7 (215-298)||(13455972-13456055)
chr7 (7-146)||(23642820-23642959)
chr7 (7-60)||(14139143-14139196)
chr7 (44-148)||(39937-40041)
chr7 (95-147)||(13354525-13354577)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (7-393)||(16827176-16827562)
chr3 (62-390)||(14574696-14575024)
chr3 (11-390)||(12359504-12359883)
chr3 (9-390)||(31939676-31940057)
chr3 (7-384)||(16379901-16380278)
chr3 (9-393)||(10419020-10419404)
chr3 (9-381)||(28755100-28755472)
chr3 (7-384)||(15228428-15228805)
chr3 (7-384)||(15234296-15234673)
chr3 (9-390)||(31694161-31694542)
chr3 (7-390)||(13942797-13943180)
chr3 (7-390)||(18133319-18133702)
chr3 (7-384)||(16835483-16835860)
chr3 (9-381)||(47124726-47125098)
chr3 (9-390)||(11960144-11960525)
chr3 (7-373)||(17187164-17187530)
chr3 (9-381)||(16328635-16329007)
chr3 (7-258)||(12179243-12179494)
chr3 (7-390)||(41178295-41178678)
chr3 (11-390)||(44778020-44778399)
chr3 (11-374)||(13971097-13971460)
chr3 (7-373)||(13319475-13319841)
chr3 (29-381)||(16337507-16337859)
chr3 (11-381)||(14087455-14087825)
chr3 (7-309)||(14579926-14580228)
chr3 (130-390)||(17493403-17493663)
chr3 (11-285)||(16491169-16491443)
chr3 (29-289)||(20061060-20061320)
chr3 (29-289)||(15588398-15588658)
chr3 (29-289)||(16636637-16636897)
chr3 (29-289)||(43163961-43164221)
chr3 (29-273)||(53384024-53384268)
chr3 (44-298)||(15260485-15260739)
chr3 (29-289)||(10907074-10907334)
chr3 (29-289)||(13253554-13253814)
chr3 (11-285)||(17490718-17490992)
chr3 (29-258)||(6601631-6601860)
chr3 (44-349)||(15347266-15347571)
chr3 (29-349)||(5423936-5424256)
chr3 (29-289)||(48426311-48426571)
chr3 (213-390)||(11302952-11303129)
chr3 (29-289)||(10006464-10006724)
chr3 (29-289)||(15340133-15340393)
chr3 (29-289)||(15723940-15724200)
chr3 (29-258)||(15401523-15401752)
chr3 (11-289)||(14875487-14875765)
chr3 (29-258)||(12499143-12499372)
chr3 (29-298)||(16693019-16693288)
chr3 (29-258)||(16411288-16411517)
chr3 (11-258)||(16805935-16806182)
chr3 (29-186)||(3686910-3687067)
chr3 (38-258)||(15014771-15014991)
chr3 (197-390)||(4679211-4679404)
chr3 (29-258)||(14125600-14125829)
chr3 (35-289)||(15062582-15062836)
chr3 (35-298)||(30138671-30138934)
chr3 (35-298)||(30148222-30148485)
chr3 (8-102)||(10384732-10384826)
chr3 (29-135)||(5109617-5109723)
chr3 (35-312)||(8273411-8273688)
chr3 (41-270)||(13966362-13966591)
chr3 (35-148)||(55514730-55514843)
chr3 (35-298)||(16741715-16741978)
chr3 (71-298)||(18750809-18751036)
chr3 (35-148)||(17194109-17194222)
chr3 (35-148)||(16258159-16258272)
chr3 (203-286)||(6711591-6711674)
chr3 (35-286)||(25767195-25767446)
chr3 (200-298)||(15610968-15611066)
chr3 (35-148)||(12793156-12793269)
chr3 (200-298)||(16258009-16258107)
chr3 (35-148)||(6151865-6151978)
chr3 (35-148)||(15611118-15611231)
chr3 (200-267)||(6152030-6152097)
chr3 (196-258)||(16755758-16755820)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (7-390)||(40873-41256)
scaffold0102 (35-136)||(47189-47289)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (7-393)||(1041-1427)
[»] scaffold2112 (1 HSPs)
scaffold2112 (7-393)||(150-536)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (7-393)||(1602-1988)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (7-393)||(50623-51009)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (7-393)||(3348-3734)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (7-384)||(2233-2610)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (11-393)||(5922-6304)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (7-393)||(18521-18907)
scaffold0244 (35-148)||(25553-25666)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (46-393)||(29229-29576)
scaffold0026 (7-207)||(50168-50368)
scaffold0026 (29-274)||(30236-30481)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (7-384)||(13381-13758)
scaffold0124 (35-148)||(6584-6697)
scaffold0124 (200-298)||(6749-6847)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (7-390)||(32586-32969)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (7-390)||(27800-28182)
scaffold0067 (7-390)||(59962-60345)
scaffold0067 (7-390)||(50928-51311)
scaffold0067 (7-390)||(66350-66733)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (7-338)||(108857-109188)
scaffold0031 (11-144)||(55743-55876)
scaffold0031 (173-289)||(62945-63061)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (7-390)||(23197064-23197446)
chr1 (7-390)||(19855464-19855847)
chr1 (9-390)||(24098422-24098803)
chr1 (7-384)||(19661953-19662331)
chr1 (7-384)||(20834717-20835094)
chr1 (7-264)||(21744369-21744626)
chr1 (9-381)||(37678248-37678620)
chr1 (7-390)||(20938880-20939263)
chr1 (9-349)||(21952109-21952449)
chr1 (7-393)||(20855577-20855963)
chr1 (9-381)||(31538816-31539188)
chr1 (7-381)||(20060769-20061143)
chr1 (9-381)||(20295580-20295952)
chr1 (29-393)||(51332332-51332696)
chr1 (11-285)||(430937-431211)
chr1 (29-349)||(33389868-33390188)
chr1 (29-258)||(16349435-16349664)
chr1 (44-381)||(22110190-22110527)
chr1 (44-381)||(22114039-22114376)
chr1 (29-289)||(21831563-21831823)
chr1 (29-258)||(19107659-19107888)
chr1 (29-273)||(41352501-41352745)
chr1 (29-258)||(21234570-21234799)
chr1 (29-289)||(21838210-21838471)
chr1 (105-372)||(16373707-16373974)
chr1 (11-258)||(17043836-17044083)
chr1 (11-298)||(22361065-22361352)
chr1 (44-289)||(21025433-21025678)
chr1 (11-298)||(21750191-21750478)
chr1 (9-114)||(52987206-52987311)
chr1 (70-384)||(19759753-19760067)
chr1 (35-298)||(20830237-20830500)
chr1 (29-238)||(24793456-24793665)
chr1 (35-148)||(41216702-41216815)
chr1 (173-327)||(16077639-16077793)
chr1 (35-148)||(20915002-20915115)
chr1 (35-144)||(22134402-22134511)
chr1 (200-258)||(22134567-22134625)
chr1 (38-106)||(50619232-50619300)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (7-381)||(5296096-5296470)
chr6 (7-381)||(21472618-21472992)
chr6 (7-393)||(21563022-21563408)
chr6 (7-393)||(21568881-21569267)
chr6 (27-390)||(19454428-19454791)
chr6 (9-390)||(10467741-10468122)
chr6 (7-381)||(18795707-18796081)
chr6 (7-393)||(15460341-15460727)
chr6 (7-390)||(14378807-14379190)
chr6 (7-390)||(14380357-14380740)
chr6 (11-381)||(19488166-19488536)
chr6 (11-390)||(28281707-28282086)
chr6 (9-381)||(24365429-24365801)
chr6 (10-390)||(19436010-19436390)
chr6 (11-393)||(19880303-19880685)
chr6 (11-381)||(34644480-34644850)
chr6 (11-327)||(23079540-23079856)
chr6 (11-384)||(22443281-22443654)
chr6 (11-384)||(22434883-22435256)
chr6 (29-393)||(1541996-1542360)
chr6 (29-289)||(29590832-29591092)
chr6 (29-271)||(27188563-27188805)
chr6 (29-271)||(27260435-27260677)
chr6 (11-276)||(22761349-22761614)
chr6 (29-289)||(2873715-2873975)
chr6 (29-289)||(19865796-19866056)
chr6 (125-379)||(8761941-8762195)
chr6 (44-349)||(28262124-28262429)
chr6 (44-349)||(28340873-28341178)
chr6 (29-289)||(24312080-24312340)
chr6 (29-258)||(25113692-25113921)
chr6 (41-393)||(15897099-15897450)
chr6 (11-298)||(18406838-18407125)
chr6 (51-298)||(20636235-20636482)
chr6 (29-258)||(27564733-27564962)
chr6 (11-393)||(5838113-5838495)
chr6 (38-276)||(18449632-18449870)
chr6 (41-234)||(18196657-18196850)
chr6 (29-289)||(16962357-16962617)
chr6 (41-349)||(18966219-18966524)
chr6 (235-381)||(25769208-25769354)
chr6 (35-298)||(16381291-16381554)
chr6 (29-289)||(16926550-16926812)
chr6 (29-135)||(16621992-16622098)
chr6 (29-298)||(25608773-25609042)
chr6 (173-289)||(16625773-16625889)
chr6 (196-298)||(22077769-22077871)
chr6 (35-148)||(14624275-14624388)
chr6 (11-135)||(21754481-21754605)
chr6 (35-298)||(23997348-23997611)
chr6 (35-148)||(16099259-16099372)
chr6 (35-148)||(16234278-16234391)
chr6 (70-286)||(16648922-16649138)
chr6 (35-298)||(21928305-21928568)
chr6 (35-141)||(1647732-1647838)
chr6 (200-298)||(18836991-18837089)
chr6 (35-148)||(14129719-14129832)
chr6 (35-148)||(35275004-35275117)
chr6 (36-148)||(23026635-23026747)
chr6 (200-298)||(1647897-1647995)
chr6 (95-148)||(18574439-18574492)
chr6 (200-298)||(18572751-18572851)
chr6 (221-276)||(27330537-27330592)
chr6 (221-276)||(27391277-27391332)
chr6 (200-298)||(16099150-16099248)
chr6 (35-148)||(18836826-18836939)
chr6 (197-298)||(23026796-23026897)
chr6 (95-147)||(19986400-19986452)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (7-390)||(3926-4307)
scaffold0035 (39-298)||(42887-43146)
scaffold0035 (44-148)||(11981-12085)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (7-390)||(300-683)
scaffold0120 (35-273)||(13350-13588)
scaffold0120 (11-298)||(7287-7574)
scaffold0120 (200-286)||(23455-23541)
scaffold0120 (95-148)||(23593-23646)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (7-390)||(436-817)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (7-390)||(23277551-23277934)
chr2 (7-393)||(23099303-23099689)
chr2 (7-381)||(23294719-23295093)
chr2 (11-384)||(24949371-24949744)
chr2 (7-393)||(27209457-27209843)
chr2 (7-390)||(19651335-19651718)
chr2 (9-381)||(20829043-20829415)
chr2 (7-384)||(23111517-23111894)
chr2 (9-381)||(1064535-1064907)
chr2 (9-373)||(31831450-31831814)
chr2 (7-390)||(12575128-12575511)
chr2 (7-390)||(27788516-27788898)
chr2 (7-190)||(25264029-25264212)
chr2 (29-289)||(10869726-10869986)
chr2 (29-289)||(27372145-27372405)
chr2 (35-349)||(24710850-24711164)
chr2 (29-258)||(22324163-22324392)
chr2 (29-289)||(16926236-16926496)
chr2 (29-289)||(16999876-17000136)
chr2 (29-289)||(16923765-16924025)
chr2 (29-289)||(16983028-16983288)
chr2 (29-289)||(44384876-44385136)
chr2 (11-327)||(45533183-45533499)
chr2 (11-273)||(23107019-23107281)
chr2 (11-374)||(30011473-30011834)
chr2 (29-289)||(41607692-41607952)
chr2 (29-258)||(27218923-27219152)
chr2 (29-289)||(24676365-24676625)
chr2 (29-256)||(24263279-24263506)
chr2 (29-258)||(21144348-21144577)
chr2 (68-289)||(17064593-17064814)
chr2 (29-258)||(24876056-24876285)
chr2 (25-327)||(30210221-30210522)
chr2 (11-289)||(24706771-24707049)
chr2 (29-289)||(21324573-21324833)
chr2 (196-298)||(23067258-23067360)
chr2 (35-148)||(22279122-22279235)
chr2 (35-267)||(12639546-12639778)
chr2 (44-144)||(23072884-23072984)
chr2 (35-148)||(24830501-24830614)
chr2 (35-144)||(25129630-25129739)
chr2 (35-148)||(22760882-22760995)
chr2 (200-298)||(24830666-24830764)
chr2 (110-147)||(17967152-17967189)
chr2 (203-267)||(24569149-24569213)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (33-390)||(2763-3120)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (13-381)||(27708-28076)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (7-390)||(34645-35028)
scaffold0139 (122-390)||(28392-28660)
scaffold0139 (195-381)||(94-271)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (7-384)||(3701-4078)
scaffold0034 (7-393)||(68542-68928)
scaffold0034 (7-390)||(12656-13032)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (7-384)||(149751-150127)
scaffold0011 (7-390)||(194452-194835)
scaffold0011 (44-327)||(25318-25601)
scaffold0011 (35-148)||(181341-181454)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (125-390)||(89311-89576)
scaffold0001 (125-390)||(89989-90254)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (9-381)||(55650-56022)
scaffold0076 (11-381)||(32429-32799)
scaffold0076 (35-298)||(41525-41788)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (7-390)||(10805-11188)
scaffold0298 (7-390)||(14575-14958)
scaffold0298 (7-390)||(21158-21541)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (7-393)||(6097-6464)
scaffold0149 (7-393)||(10528-10895)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (7-381)||(24619222-24619596)
chr5 (7-381)||(24715453-24715827)
chr5 (7-381)||(24748481-24748855)
chr5 (7-393)||(20822508-20822894)
chr5 (7-393)||(21562900-21563286)
chr5 (7-381)||(22234847-22235221)
chr5 (9-393)||(28893871-28894255)
chr5 (9-393)||(28915342-28915726)
chr5 (9-393)||(28922697-28923081)
chr5 (7-256)||(21871978-21872226)
chr5 (7-256)||(21876258-21876506)
chr5 (15-393)||(22463006-22463384)
chr5 (9-390)||(23079018-23079399)
chr5 (9-381)||(22503746-22504118)
chr5 (11-381)||(21679709-21680079)
chr5 (9-381)||(25849142-25849514)
chr5 (9-340)||(28930610-28930941)
chr5 (9-381)||(14885920-14886292)
chr5 (9-381)||(24797326-24797698)
chr5 (7-381)||(20343349-20343723)
chr5 (7-384)||(17268261-17268638)
chr5 (38-349)||(26737685-26737996)
chr5 (9-336)||(37542310-37542637)
chr5 (44-349)||(23472345-23472649)
chr5 (35-289)||(14998694-14998948)
chr5 (29-289)||(27519583-27519843)
chr5 (29-289)||(34567671-34567931)
chr5 (29-258)||(40709988-40710217)
chr5 (29-258)||(41772050-41772279)
chr5 (29-289)||(16357679-16357939)
chr5 (29-289)||(22331836-22332096)
chr5 (29-258)||(18777004-18777233)
chr5 (29-258)||(22135876-22136105)
chr5 (29-258)||(27611562-27611791)
chr5 (41-349)||(20467059-20467367)
chr5 (29-349)||(27667439-27667759)
chr5 (29-289)||(27684349-27684609)
chr5 (171-393)||(20774814-20775036)
chr5 (197-366)||(21830878-21831047)
chr5 (29-258)||(29475022-29475251)
chr5 (254-393)||(21889933-21890072)
chr5 (7-258)||(23441418-23441669)
chr5 (11-298)||(25427601-25427888)
chr5 (29-258)||(19771168-19771397)
chr5 (7-156)||(20777205-20777354)
chr5 (29-258)||(37290445-37290674)
chr5 (11-384)||(23574811-23575184)
chr5 (46-287)||(21338263-21338504)
chr5 (38-298)||(21408306-21408566)
chr5 (127-273)||(21497124-21497263)
chr5 (11-153)||(20800710-20800852)
chr5 (111-223)||(820-933)
chr5 (35-298)||(21936143-21936406)
chr5 (121-327)||(21882088-21882294)
chr5 (95-312)||(24582346-24582563)
chr5 (95-298)||(27012234-27012437)
chr5 (35-148)||(23504544-23504657)
chr5 (227-393)||(23517599-23517765)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (7-390)||(43958-44341)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (7-374)||(3020-3387)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (7-390)||(2103-2486)
scaffold0222 (7-381)||(8244-8618)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (7-374)||(30033-30400)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (7-374)||(5837-6206)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (7-390)||(23389-23772)
scaffold0104 (68-390)||(20569-20891)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (7-390)||(46147-46530)
scaffold0010 (9-381)||(41083-41455)
scaffold0010 (44-381)||(3098-3435)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (42-390)||(176-524)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (7-393)||(1055-1441)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (9-390)||(249788-250169)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (7-390)||(323879-324262)
scaffold0004 (11-366)||(202220-202575)
scaffold0004 (41-298)||(118493-118750)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (7-390)||(45692-46075)
scaffold0114 (7-312)||(21140-21445)
scaffold0114 (29-285)||(19111-19367)
scaffold0114 (332-390)||(21075-21133)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (7-384)||(9556-9933)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (9-390)||(20295-20676)
scaffold0058 (38-214)||(57970-58146)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (11-382)||(5990-6361)
scaffold0367 (51-138)||(1-88)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (7-390)||(42092-42475)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (7-390)||(80580-80963)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (9-390)||(100312-100693)
scaffold0020 (209-285)||(181479-181555)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (9-390)||(6895-7276)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (7-390)||(499-882)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (7-381)||(20033-20407)
scaffold0090 (7-381)||(24195-24569)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (12-381)||(49267-49636)
scaffold0028 (29-393)||(44323-44687)
scaffold0028 (29-258)||(16243-16472)
scaffold0028 (29-258)||(9781-10010)
scaffold0028 (200-298)||(105514-105612)
scaffold0028 (35-146)||(105349-105460)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (82-390)||(24699-25007)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (7-390)||(13047-13430)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (7-382)||(261491-261866)
scaffold0005 (29-349)||(277600-277920)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (7-393)||(39508-39893)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (7-390)||(6388-6771)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-382)||(177014-177385)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (7-381)||(10205-10579)
scaffold0235 (7-381)||(20419-20793)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (9-342)||(12277-12610)
scaffold0180 (11-298)||(31505-31792)
scaffold0180 (7-144)||(34499-34636)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (7-390)||(11534-11917)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (7-366)||(23827-24179)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (7-390)||(5084-5467)
[»] scaffold0117 (3 HSPs)
scaffold0117 (11-381)||(6437-6807)
scaffold0117 (200-286)||(365-451)
scaffold0117 (95-148)||(260-313)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (9-342)||(28156-28489)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (9-381)||(15463-15835)
scaffold0089 (170-381)||(10621-10832)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (29-381)||(142-498)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (15-393)||(1-367)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (9-349)||(1584-1924)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (44-374)||(18000-18330)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (11-381)||(113743-114113)
scaffold0029 (45-258)||(108597-108810)
scaffold0029 (323-393)||(95066-95136)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (9-378)||(32069-32438)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (198-385)||(1-188)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (7-256)||(35422-35671)
scaffold0156 (266-390)||(28400-28524)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (49-357)||(10177-10485)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (70-390)||(2141-2461)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (41-349)||(16093-16401)
scaffold0040 (45-309)||(112274-112538)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (41-381)||(13652-13992)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (25-327)||(3432-3734)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (11-276)||(7338-7603)
scaffold0358 (196-298)||(3546-3648)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (45-381)||(22971-23307)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (11-287)||(102511-102787)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (109-296)||(14150-14336)
scaffold0261 (109-296)||(22329-22515)
scaffold0261 (18-76)||(14098-14156)
scaffold0261 (18-76)||(22277-22335)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (25-381)||(218186-218539)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (29-289)||(29341-29601)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (122-390)||(4315-4583)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (7-234)||(10637-10864)
scaffold0348 (213-393)||(16452-16632)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-285)||(13963-14237)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (110-384)||(96345-96619)
[»] scaffold0319 (2 HSPs)
scaffold0319 (11-276)||(55-320)
scaffold0319 (11-276)||(2558-2823)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (29-289)||(8215-8475)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (11-285)||(7652-7926)
scaffold0403 (317-390)||(3966-4039)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (44-381)||(15266-15604)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (11-289)||(4105-4383)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (29-258)||(8704-8933)
scaffold0080 (11-150)||(49505-49644)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (13-285)||(50712-50984)
scaffold0081 (29-289)||(19878-20138)
scaffold0081 (29-289)||(35302-35562)
scaffold0081 (200-298)||(273-371)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (11-273)||(2728-2990)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (11-273)||(32325-32587)
scaffold0109 (29-258)||(9903-10132)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (29-258)||(8673-8902)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (41-297)||(6673-6929)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (41-273)||(4404-4636)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (11-298)||(7083-7370)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (35-270)||(16949-17184)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (44-327)||(5109-5392)
scaffold0270 (44-327)||(12239-12522)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (9-190)||(21-202)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (41-349)||(16759-17067)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (29-289)||(38590-38850)
scaffold0042 (29-258)||(66712-66941)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (7-158)||(1607-1758)
scaffold0509 (7-158)||(8035-8186)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (11-309)||(25697-25994)
scaffold0243 (111-148)||(899-936)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (38-327)||(85298-85587)
scaffold0007 (95-148)||(92834-92887)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (29-289)||(7290-7550)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (35-258)||(28144-28367)
scaffold0023 (11-222)||(60096-60307)
scaffold0023 (196-285)||(131386-131475)
scaffold0023 (11-105)||(3257-3351)
scaffold0023 (196-298)||(3393-3495)
scaffold0023 (35-148)||(54717-54830)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (11-285)||(38700-38974)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (7-141)||(20325-20459)
scaffold0077 (35-286)||(16340-16591)
scaffold0077 (285-390)||(20467-20572)
scaffold0077 (35-148)||(25658-25771)
scaffold0077 (35-148)||(27042-27155)
scaffold0077 (200-286)||(27207-27293)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (29-258)||(3175-3404)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (29-289)||(79264-79524)
scaffold0022 (38-102)||(55232-55296)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (11-298)||(7405-7692)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (179-390)||(11908-12119)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (35-285)||(39837-40087)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (41-327)||(115687-115973)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (41-384)||(2089-2425)
scaffold0647 (29-231)||(8429-8631)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (49-150)||(1-102)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (221-390)||(48168-48337)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (46-270)||(2188-2412)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-327)||(7839-8155)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (29-327)||(1656-1954)
scaffold0044 (29-327)||(15396-15694)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (29-246)||(57336-57553)
scaffold0017 (11-246)||(18819-19054)
scaffold0017 (77-327)||(196296-196546)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (35-298)||(6488-6751)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (41-222)||(340-521)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (41-312)||(13863-14134)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (29-240)||(12762-12973)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (26-144)||(473-591)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (179-381)||(5215-5417)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (35-298)||(2651-2914)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (29-240)||(23843-24054)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (35-298)||(24661-24924)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (35-298)||(14175-14438)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (86-258)||(39686-39858)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (35-298)||(6441-6704)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (35-298)||(729-992)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (35-145)||(15478-15588)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (41-298)||(8532-8789)
[»] scaffold0021 (9 HSPs)
scaffold0021 (36-148)||(72606-72718)
scaffold0021 (200-298)||(25229-25327)
scaffold0021 (200-298)||(72456-72554)
scaffold0021 (35-148)||(6628-6741)
scaffold0021 (71-148)||(15848-15925)
scaffold0021 (71-148)||(25379-25456)
scaffold0021 (35-144)||(32189-32298)
scaffold0021 (200-267)||(32354-32421)
scaffold0021 (200-286)||(15710-15796)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (11-161)||(2985-3135)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (35-148)||(11486-11599)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (35-144)||(2728-2837)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (35-148)||(19464-19577)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (173-258)||(26281-26366)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (173-289)||(24743-24859)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (44-327)||(852-1135)
[»] scaffold0567 (2 HSPs)
scaffold0567 (200-298)||(10561-10659)
scaffold0567 (41-148)||(10711-10818)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (212-298)||(963-1049)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (36-102)||(34677-34743)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (35-148)||(25243-25356)
scaffold0008 (35-148)||(133265-133378)
scaffold0008 (203-286)||(25105-25188)
scaffold0008 (200-258)||(133430-133488)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (281-381)||(27445-27545)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (235-298)||(17947-18010)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (38-80)||(9813-9855)
scaffold0083 (104-218)||(9861-9975)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (95-148)||(7726-7779)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (197-298)||(45612-45713)
scaffold0091 (110-148)||(45762-45800)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (200-303)||(8434-8537)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (95-148)||(3961-4014)


Alignment Details
Target: scaffold0165 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5988 - 5602
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5988 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 5889  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5888 ttgtttgataaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 5789  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5788 tggttgcagatgctttgagaaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttg 5689  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  5688 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaaaaagttga 5602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 47782 - 48168
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47782 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 47881  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47882 ttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 47981  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47982 tggtcgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgttagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 48081  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||| | || || || || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  48082 tgagttgtcacctcagagtgtatagttgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaacattatcagagaagcacagcaagttga 48168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 56595 - 56978
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || ||| | || |||    
T  56595 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgttcaatgatcaaaagagtctaaagtat 56694  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| | || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  56695 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaacg 56794  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||    
T  56795 tagttgctgatgcgttgagcaagaagacgctgcacatgtctgctatgatggtataggaacatgatttgctagaacagtttagagagttgagccttgtttg 56894  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  56895 tgagttgtcacctcagagtatacagttgggaatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagt 56978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 45)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 7 - 389
Target Start/End: Original strand, 15002109 - 15002491
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15002109 tttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 15002208  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15002209 ttatttgattagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 15002308  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  15002309 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaagagtttgagttgctatagcagtttagagactttagtcttgtctg 15002408  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaag 389  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15002409 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaag 15002491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 8 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15247450 - 15247068
Alignment:
Q  8 ttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatt 107  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  15247450 ttggagttagctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggtattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatt 15247351  T
Q  108 tatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgt 207  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15247350 tatttgatccgaaggaattgaatatggggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgactttggtttgaattaccattcgggtaaagctaatgt 15247251  T
Q  208 ggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgt 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15247250 ggttgcagatgttttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctat 15247151  T
Q  308 gagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||  | | |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15247150 gagttgacacttcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 15247068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 15357865 - 15358248
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  15357865 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 15357964  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  15357965 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggtgagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagccaatg 15358064  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15358065 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggaatttgatttaatatagcagcttagagacttgagtcttgtctg 15358164  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15358165 tgaattgacacctcatagtgtacagttagggatgctgaagattaatagtgacttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 15358248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 27901913 - 27901527
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  27901913 tttggaattggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 27901814  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27901813 atgtttgaacaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 27901714  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  27901713 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattacttgaacagtttagagacttgagtctcgtttg 27901614  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || ||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27901613 tgaattgtcacctcaaagtgtaaagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtataagagaagcacaacaagttga 27901527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15071886 - 15071604
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  15071886 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatat 15071787  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |  |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  15071786 ttttttgaccaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 15071687  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  15071686 tagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttaga 15071604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16149238 - 16148873
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |  ||||| ||||||    
T  16149238 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatat 16149139  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  16149138 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 16149039  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || || || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16149038 tggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctg 16148939  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtat 372  Q
    ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16148938 tgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16148873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16153384 - 16153019
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |  ||||| ||||||    
T  16153384 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacatgagtttaaaatat 16153285  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||| | |||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  16153284 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggtagaggagatggttagagttgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 16153185  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||||| || || || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16153184 tggttgcagatacgttgagcaggaagacattgcatatgtccgccttgatggtaaaagaattcgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctg 16153085  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtat 372  Q
    ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16153084 tgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtat 16153019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 8707442 - 8707088
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  8707442 gagttggctgctgtggtttttgcgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttatcgatcacaagagtttgaaatatttat 8707343  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  8707342 ttgatcaaaaggaattgaatatgag-cagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8707244  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  8707243 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgag 8707144  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaa 366  Q
    || |||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  8707143 ttgtcgcctcatagtgtgaagttgggtatgctgaagatcaacagtgagttcttgaa 8707088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 33224448 - 33224067
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  33224448 tggagttggctgctgtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatattt 33224349  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  33224348 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 33224249  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  33224248 gttgctgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagggacttgagccttgtttgtg 33224149  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||| | ||||||| || |||||    
T  33224148 agttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtacccgagaagctcagcaagt 33224067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 29452284 - 29452656
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  29452284 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 29452383  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  29452384 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 29452483  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  29452484 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 29452583  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  29452584 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 29452656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 3263541 - 3263913
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  3263541 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 3263640  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  3263641 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 3263740  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  3263741 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 3263840  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  3263841 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 3263913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 51605537 - 51605920
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  51605537 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 51605636  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  51605637 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 51605736  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  51605737 tagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtgtg 51605836  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  51605837 tgagttgtcgcctcaaagcatacagttggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagt 51605920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 381
Target Start/End: Original strand, 11205983 - 11206350
Alignment:
Q  14 ttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttg 113  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11205983 ttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattctttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttg 11206082  T
Q  114 atcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgc 213  Q
    | ||||| ||| |||| |||||| |||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||| |||||    
T  11206083 accagaaggaactgaacatgaggtagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgttgttgc 11206182  T
Q  214 agatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtta 313  Q
     ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||| ||     
T  11206183 tgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattg 11206282  T
Q  314 tcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||  |||||||| |||||||||| ||| | |||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  11206283 tcatctcagagtatacagttggggatgttgaagattgatagtgatttcttgaacagtatctgagaagc 11206350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 71 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 15320599 - 15320330
Alignment:
Q  71 tttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttggg 170  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||  |    
T  15320599 tttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggattatg 15320500  T
Q  171 attttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttga 270  Q
    |||||||| ||||||| ||  | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15320499 attttggtatgaattatcacccaggtaaagctaatgtgattgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatggtaaaggattttga 15320400  T
Q  271 gttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| || | |||||| || |||||||||||  |||||||||||    
T  15320399 gttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttatgagttgtcacctcagagtgtgtagttgggtatg 15320330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 44660613 - 44660985
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  44660613 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 44660712  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||| ||||| || ||| | |||||  |||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || || ||     
T  44660713 atttgaccagaaggaactgaacatgagacagaggaggtggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgtt 44660812  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  44660813 gttgctgatgctttgagcaagaaaactttgcatatgtctgctttaatggtaaaggaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 44660912  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || ||  |||||||| |||||||||| ||| | || ||| | ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  44660913 aattgtcatctcagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagcgacttcttgaacagtatccgagaagc 44660985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 85 - 384
Target Start/End: Original strand, 15413849 - 15414148
Alignment:
Q  85 tgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaat 184  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  |  |  |||||||||||||||    
T  15413849 tgatcacaaaagtttgaaatacctatttgataaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaat 15413948  T
Q  185 taccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagt 284  Q
    || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  15413949 tatcatccgggtaaagccaatgttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaatttgagttgctggagcatt 15414048  T
Q  285 ttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||| || || || |||||||||||||| | |||||||||    
T  15414049 ttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15414148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Original strand, 14849888 - 14850225
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  14849888 tggagacattatttgtacgattctagatttgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacagcgaa 14849987  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || ||  |||  |  |  |||||||| || ||||| ||| | | |||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  14849988 ggtggcttgaatttgtgaaagactatgattttgggtttaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgctttaagtaggaagacgttgcatat 14850087  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||  | ||||| ||||| || |||||||||||| |  || | ||||||    
T  14850088 gtccgctgtgatggtaaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatctgaggttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaaactgtgaatgcta 14850187  T
Q  344 aagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  14850188 aagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagc 14850225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 1648022 - 1648396
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||  |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||    
T  1648022 tttggagttggctgcagtggtttttgtcttgaagatttggaggcactacttgtatggttcacgatttgaagtatttagtgaccacaaaagtttgaaatat 1648121  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||  |||| |||||| |||| |||||| | ||| ||||||  |  |  || |||||||||||||||||  |  |||| |||||||    
T  1648122 ttatttgatcagaaggagctgaacatgaggtagaggagatggttagagctgttgaaagactatgactttggtttgaattaccaccctaataaggctaatg 1648221  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| || ||| ||||| |||| ||| | || ||    
T  1648222 ttgtggcggatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagcttagagacttaagtttagtttg 1648321  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| || ||||| ||| |  | || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1648322 tgagttgtcacctcaaagtattaaatttgggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 1648396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23957252 - 23956932
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  23957252 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 23957153  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  23957152 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 23957053  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||     
T  23957052 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 23956953  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagatt 349  Q
     |  |||||||||| ||||||    
T  23956952 aaactgggtatgctgaagatt 23956932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8387917 - 8387657
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  8387917 tttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 8387818  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  8387817 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 8387718  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  8387717 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 8387657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 15146392 - 15146652
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  | || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15146392 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacgagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattga 15146491  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| ||||  |||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||| | ||| ||    
T  15146492 atatgaggcagcgaaggcggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgcctcgagtag 15146591  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  15146592 gaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttaga 15146652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 29037911 - 29038171
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  29037911 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 29038010  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  29038011 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 29038110  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  29038111 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 29038171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14695603 - 14695266
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||    
T  14695603 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattggatatgagacaacgaa 14695504  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||    
T  14695503 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagaagttgcatat 14695404  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |  | |||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||  || |||| ||||||    
T  14695403 gtccgctatgatgttaaaagagtttgagttgcttaaaaaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgcta 14695304  T
Q  344 aagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  14695303 aagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagc 14695266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 12478105 - 12477845
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  12478105 tttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattga 12478006  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  12478005 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 12477906  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  12477905 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 12477845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 19777300 - 19777560
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  19777300 tttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattga 19777399  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19777400 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 19777499  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  19777500 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 19777560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 16353934 - 16354212
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16353934 gagttggcggctgtggtctttgttttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 16354033  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  16354034 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 16354133  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  16354134 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttaagcagtttaga 16354212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 14302485 - 14302714
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  14302485 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 14302584  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  14302585 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 14302684  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||  ||||| ||||| |||||||||||    
T  14302685 gaagatattgcatatgtccgctatgatggt 14302714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18298710 - 18298481
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  18298710 tttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattga 18298611  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  18298610 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 18298511  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  18298510 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 8052130 - 8052390
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  8052130 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 8052229  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  8052230 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 8052329  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  8052330 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 8052390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14160975 - 14160655
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  14160975 tttgtattgaagatatggagacattacttatatggttcgaggtttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattga 14160876  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||| ||| ||| |||||| ||||| || || ||||| || || ||    
T  14160875 acatgaggcagagaagatggcttgagttactgaaggattttgattttggcttgaattatcatccgggtaaagcgaatgtcgtagctgatgccttaagtag 14160776  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | |||||| | |||||| | ||||| || || ||| |||||||||||    
T  14160775 aaagaccttgcatatgtccgctatgatggttaaggagtttgaattgctagaataatttagagatttgagtttggtctgcgaattgtcgtctcagagtgta 14160676  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagatt 349  Q
     |||| || ||||| ||||||    
T  14160675 aagttaggaatgctgaagatt 14160655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 40474545 - 40474285
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  40474545 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 40474446  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||  |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| || || ||    
T  40474445 atatgaggcagcgtagatggctagacttactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgccttaagtag 40474346  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||    
T  40474345 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttaga 40474285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12525199 - 12524952
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||| | ||||| |    
T  12525199 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgcagtatttgt 12525100  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  12525099 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 12525000  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  12524999 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgttcgctatgatggt 12524952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14682090 - 14681855
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  14682090 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 14681991  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  14681990 tcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggatgtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14681891  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtc 246  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  14681890 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtc 14681855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 18614313 - 18614575
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| |    
T  18614313 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcataagagtttgaagtatttgt 18614412  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | ||  |||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  18614413 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggatagaactgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 18614512  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||||    
T  18614513 tgctgatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagtt 18614575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27712841 - 27712612
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27712841 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27712742  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  27712741 acatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtag 27712642  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  27712641 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27712612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 125 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20892391 - 20892135
Alignment:
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  20892391 ttgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattga 20892292  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||| ||| | || ||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  20892291 gcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtctggtctgtgaattgtcacctcagag 20892192  T
Q  325 tgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | |||||||||| ||||| ||||||   ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  20892191 tatacagttggggatgctgaagattgttagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20892135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 246 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15078923 - 15078785
Alignment:
Q  246 ctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaa 345  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  15078923 ctgntatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgtgagttgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaa 15078824  T
Q  346 gattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15078823 gatcaatagtgaattcttgaatagtatcagggaagcaca 15078785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 18225935 - 18226182
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  18225935 gagttggcggctgtggtctttgtatttaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaaatatttgt 18226034  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||  | ||  || | |||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  18226035 tcgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactatggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 18226134  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  18226135 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtcagctttgatggt 18226182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9292334 - 9292057
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  9292334 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 9292235  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagt-tgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 233  Q
    |||||||||||||| | || | | || | | |||  ||||||   |||| ||| ||| | |  |  |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  9292234 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggactt-tgattttcacttgagttatcatcctgggagggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaaga 9292136  T
Q  234 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtt 312  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || |||||||| ||||  |||||||    
T  9292135 ctttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattggttgagcagtttcgagacttgagttttgttagtgagtt 9292057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14998814 - 14998552
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  14998814 ttgaagatttggaggcactatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgacca-aagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 14998716  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  14998715 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 14998616  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||    
T  14998615 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgatacttgagt 14998552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 15291931 - 15292044
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15291931 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 15292030  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  15292031 ggcaaagaagatgg 15292044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 18548841 - 18548945
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | |    
T  18548841 tggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaagagttgaatatgagacagcgga 18548940  T
Q  144 gatgg 148  Q
    |||||    
T  18548941 gatgg 18548945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 141
Target Start/End: Original strand, 12341639 - 12341744
Alignment:
Q  36 tgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgag 135  Q
    |||| |||||||| |||||||||||   ||| |  ||||||||||  || || || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  12341639 tgaagatttggaggcattatttgtatcattctaagtttgaagtgttcagcgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagaattgaatatgag 12341738  T
Q  136 gcagag 141  Q
    ||||||    
T  12341739 gcagag 12341744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13248979 - 13248881
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||| ||||| || ||||||||    
T  13248979 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgtttgagtagtttcgagacttgagt 13248881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 15292096 - 15292163
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  15292096 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtt 15292163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 7 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11351 - 10967
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11351 tttggagttggctgtggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 11252  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11251 ctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaggatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 11152  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11151 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttg 11052  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagtt 391  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11051 tgagttgtcgcctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacataaagtt 10967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16194 - 16103
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaa 102  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  16194 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaa 16103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 3)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 15670 - 15287
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15670 tttggatttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 15571  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  15570 ctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatctgggtaaagctaatg 15471  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15470 tggttgcagatgctttgagcaggaagaggttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctg 15371  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15370 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagt 15287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 8637 - 8750
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||    
T  8637 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttaatcagaaagagttgaatatga 8736  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  8737 ggcacagaagatgg 8750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Original strand, 8802 - 8888
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||  || || ||||| |||||| | |||||||||    
T  8802 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgaatgttaaagagttagagttgattgagcagttt 8888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5334 - 4948
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5334 tttggagttggctgctgtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 5235  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  5234 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 5135  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5134 tggttgcagatgctttgagcaagaagacgttgcacatttctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctggagcagtttagagacttgagtcttgtttg 5035  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5034 tgagttgtcacctcaaagtgtacagttgagtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 4948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 7 - 389
Target Start/End: Original strand, 721 - 1103
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  721 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttaaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 820  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  821 ttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttaaattaccattcggttaaagctaatg 920  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  921 tggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacaagtctgctatgatggtaaatgactttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttg 1020  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaag 389  Q
    ||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1021 tgagttgaaacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaag 1103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 48662 - 48276
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  48662 tttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgagatat 48563  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | | || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  48562 ttgtttgatcaaaaagaattgaatatgagctagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 48463  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48462 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggattttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 48363  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48362 tgagttatcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacatcaggttga 48276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 63)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21842010 - 21841624
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  21842010 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaaggttgaaatat 21841911  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| || ||  |||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21841910 ttatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcaaagaagatggcttgagatgttgaaggattatgatttctgtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21841811  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  21841810 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttaaacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttaagtcttgtttg 21841711  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21841710 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttga 21841624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 20984735 - 20985121
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  20984735 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttctagatttgaggtgcttagtgatcataaaagtttgaaatat 20984834  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20984835 ctgtttgaccaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatg 20984934  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20984935 ttgttgcagatgctttgagcagaaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctatagcagtttagagacttgagtcttgtttg 20985034  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  20985035 tgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagaaagttga 20985121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23656520 - 23656137
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||    
T  23656520 tttggagtttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtattcagtgatcacaaaagcttgaaatat 23656421  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | || ||  |||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||    
T  23656420 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggtagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattactatccgggtaaagccaatg 23656321  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  23656320 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctg 23656221  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  23656220 tgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacaagt 23656137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 20009109 - 20009482
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20009109 tttggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttcctgatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 20009208  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||  | | |||| ||||||    
T  20009209 ttatttgatcaaaaggaattaaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactgtgattttggtttgaattatcaccccggtaaa-ctaatg 20009307  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||    
T  20009308 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctagtttg 20009407  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||| | |||||||| || ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  20009408 tgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcatagaagc 20009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22372524 - 22372150
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  22372524 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtat 22372425  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||  |  |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  22372424 ctatttgaccaaaaataattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattattgaaggactatgattttagtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 22372325  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||    
T  22372324 tagttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtcttgtttg 22372225  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |  ||| ||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||    
T  22372224 tttgttgtcatctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttaaacagtatcagagaagc 22372150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 353
Target Start/End: Original strand, 21324457 - 21324802
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21324457 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 21324556  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  21324557 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 21324656  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21324657 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatgtgtctgct-tgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagccttgtctg 21324755  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaaca 353  Q
    ||| ||  | |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  21324756 tgaattgacacctcagagtgtttagttggggatgctgaagattaaca 21324802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 390
Target Start/End: Original strand, 31415664 - 31416045
Alignment:
Q  12 agttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatt 111  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31415664 agttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtccagtgatcataaaagcttgaaatatttatt 31415763  T
Q  112 tgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggtt 211  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||| || ||  |||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  31415764 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccattctggtaaagccaatgtggtt 31415863  T
Q  212 gcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt---ctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    || || || |||||||||||||| ||||| ||||   ||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||    
T  31415864 gctgacgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtcagtg 31415963  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  31415964 agttgacacctcagagtgtgcagttggggatgctgaagattaatagtgaattcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 31416045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6605249 - 6604877
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  6605249 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 6605150  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  6605149 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 6605050  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  6605049 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcgagttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 6604950  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | |||||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  6604949 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 6604877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 131 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19852880 - 19852630
Alignment:
Q  131 atgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 230  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19852880 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19852781  T
Q  231 agacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtaca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  19852780 agacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtaca 19852681  T
Q  331 gttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19852680 attgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 19852630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14566733 - 14566361
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  14566733 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 14566634  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  14566633 atttgaacagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 14566534  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  14566533 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 14566434  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  14566433 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14566361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 381
Target Start/End: Original strand, 16270419 - 16270786
Alignment:
Q  14 ttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttg 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  16270419 ttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaaatatctgtttg 16270518  T
Q  114 atcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgc 213  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  | | || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || |||||||||||    
T  16270519 atcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgc 16270618  T
Q  214 agatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtta 313  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| || || |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |     
T  16270619 tgatgcattgagcaggaaaacattgcacatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactg 16270718  T
Q  314 tcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  16270719 tcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 16270786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 20389692 - 20389317
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||||    
T  20389692 tttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatat 20389593  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||  | ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  20389592 ttatttgatcaaaaggaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttcaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 20389493  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||  ||||||| || || ||    
T  20389492 ttgttgcagattctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagttttatttgcttgaacagtttagggacttgagcctagtttg 20389393  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagca 382  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||| || |||||||| | ||||| |||||||    
T  20389392 tgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacaatatcaaagaagca 20389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 131 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19858916 - 19858666
Alignment:
Q  131 atgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 230  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858916 atgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagga 19858817  T
Q  231 agacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtaca 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  19858816 agacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagttcagagacttgagtctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtaca 19858717  T
Q  331 gttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19858716 attgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagc 19858666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 31570034 - 31570413
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||| |    
T  31570034 gagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgt 31570133  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  31570134 ttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtagt 31570233  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
     || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| || || || ||||||||| || ||||| | || ||||||    
T  31570234 cgcggatgcgttgagtaggaagacacttcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgag 31570333  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31570334 ttgtcgcctcaaagcatacagttggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagt 31570413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 29302616 - 29302988
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| || ||| | ||||||||    
T  29302616 tggaattggctgctgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagattcgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaaatattt 29302715  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||    
T  29302716 gtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaggctaatgtg 29302815  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29302816 gttgcagatgcgttaagcaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtg 29302915  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||| | || |||||||| || |||||| |||||||    
T  29302916 aattgtcacctcagagtatacggttggggatgctgaagattgatagtgatttcttaaacagtatccgagaagc 29302988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 382
Target Start/End: Original strand, 20974844 - 20975214
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||    
T  20974844 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatat 20974943  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  20974944 ttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 20975043  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||     |||| || || ||  | || ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  20975044 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgc-----tggtgaaagaattccattttctagaacagtttagagagttgagccttgtctg 20975138  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagca 382  Q
    ||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20975139 tgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaaaagtgatttcttgaatagtataagagaagca 20975214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 22052456 - 22052073
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  || ||||| |  ||| |||| |||    
T  22052456 tttggagttggctgcagtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagcgatcacaggagtctgaagtat 22052357  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  22052356 ttatttgaccagaaggaattgaacatgagacagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacg 22052257  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| || ||    
T  22052256 tagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatg 22052157  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| ||  || ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  22052156 tgagttgtcgcctcaaagcatatagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagt 22052073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 27356127 - 27355766
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27356127 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 27356028  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  27356027 atttgaccagaaggaactaaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 27355928  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    |           ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||| || || || |||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  27355927 g-----------ttgagcaggaaaacattgcacatgtctgctttaatggtgaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacctgagtcttgtctgtg 27355839  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |  | || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  27355838 aactgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 27355766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 372
Target Start/End: Original strand, 20395354 - 20395685
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||     
T  20395354 atttggagacgttatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 20395453  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  20395454 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactttaca 20395553  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||| | ||||||||| || ||||| ||| |||| || ||||||||| || ||||| | || ||||| || || |||||||||||  ||||||| |||    
T  20395554 tatgtcagttatgatggttaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatg 20395653  T
Q  341 ctaaagattaacagcgatttcttgaatagtat 372  Q
     | |||||||| || || || |||||||||||    
T  20395654 ttgaagattaatagtgaatttttgaatagtat 20395685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Original strand, 21165730 - 21166112
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  21165730 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgt 21165829  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  21165830 tcgatcaaaaagagttgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 21165929  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||| |  ||||  | || ||||||    
T  21165930 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtgtgtgag 21166029  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |  || |||||||||||  |  |||| ||||| |||||| | || || ||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  21166030 tggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttga 21166112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 170 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 1267668 - 1267448
Alignment:
Q  170 gattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttg 269  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| || |||||||||||| |||| || ||||    
T  1267668 gattttggtttgaattaccatctgggtaaagtcaatgtggttgcagatgcgttgaggaggaagacactgcatatatctgctatgatgataaaagaatttg 1267569  T
Q  270 agttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatag 369  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||    
T  1267568 atttgctagagcagtttagagatttgagtctagtctgtgagttatcacctcaaagtatacaattagggatgctgaagattaacagtgatttcttgagcag 1267469  T
Q  370 tatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  1267468 tatccgagaagcacatcaagt 1267448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12306305 - 12305977
Alignment:
Q  53 tatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcg 152  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |      
T  12306305 tatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtttgaaatatctgtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttat 12306206  T
Q  153 agttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctat 252  Q
    ||||  | | || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || || ||||| ||||||||| |    
T  12306205 agttactaaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagctgtaaaacattgcatatgtctgcttt 12306106  T
Q  253 gatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaac 352  Q
     |||||||| || || |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||| | |||||| |     
T  12306105 aatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgaagattgat 12306006  T
Q  353 agcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  12306005 agtaatttcttgaacagtatccgagaagc 12305977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19861028 - 19860900
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19861028 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 19860929  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgag 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  19860928 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgag 19860900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19114261 - 19114032
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  19114261 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 19114162  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19114161 atatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 19114062  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  19114061 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 19114032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 22128168 - 22128428
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  22128168 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 22128267  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  22128268 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgtcttgagtag 22128367  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  22128368 gaagacgttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 22128428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 21393057 - 21393331
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  21393057 gagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21393156  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  21393157 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21393256  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  21393257 tgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtt 21393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 21787551 - 21787825
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  21787551 gagttggcggctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21787650  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  21787651 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattctgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21787750  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  21787751 tgcagatgctttgagtatgaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtt 21787825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 287
Target Start/End: Original strand, 22119384 - 22119642
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  22119384 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 22119483  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||    
T  22119484 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatggcttgagtag 22119583  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 287  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||    
T  22119584 gaagacgttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagttta 22119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18858148 - 18857888
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  18858148 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 18858049  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  18858048 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgccttgagtag 18857949  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  18857948 gaagactttgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 18857888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19979538 - 19979278
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  19979538 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataaaagcttgaaatatatgttcgatcagaaagaattga 19979439  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | | |||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |     
T  19979438 atatgaggcagcgtacatggctggaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtat 19979339  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
     ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||    
T  19979338 aaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagtttaga 19979278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21044016 - 21043760
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  21044016 tttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 21043917  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||    
T  21043916 atatgaggcagcgtagatggctcgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctctgagtag 21043817  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  21043816 gaagaccttgcatatgtctgctatgatggtgaaagagttcgagttgcttgaacagtt 21043760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 32601733 - 32601486
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  32601733 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttat 32601634  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||| | ||| | | |||||||||||| ||    
T  32601633 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaatcatcatccaggtaaagctaatgttgt 32601534  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  32601533 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 32601486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 19483274 - 19483518
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  19483274 tttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 19483373  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | |  | ||  || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19483374 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 19483473  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||||    
T  19483474 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagtt 19483518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 20017473 - 20017733
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  20017473 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 20017572  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  20017573 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 20017672  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  20017673 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 20017733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 21252533 - 21252259
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||| | ||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  21252533 gagttagctgctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcgagattcgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 21252434  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| ||| || ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  21252433 tcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcatagatagcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21252334  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  21252333 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtt 21252259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15534954 - 15534725
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  15534954 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaagaattga 15534855  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || ||||||||||||||  || | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15534854 atatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatgatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcag 15534755  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  15534754 gaagacattgcacatgtccgctttgatggt 15534725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 17673233 - 17673462
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  17673233 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 17673332  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  17673333 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 17673432  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  17673433 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 17673462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 30312336 - 30312583
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |    
T  30312336 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaattatttgt 30312435  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  30312436 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 30312535  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  30312536 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 30312583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 44 - 254
Target Start/End: Original strand, 22247658 - 22247868
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  22247658 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattaaatatgagacagcgaa 22247757  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || ||||||| || ||  |||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  22247758 ggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 22247857  T
Q  244 gtctgctatga 254  Q
    ||| |||||||    
T  22247858 gtccgctatga 22247868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22041448 - 22041186
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||| ||| ||||| |    
T  22041448 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttggaagtatttgt 22041349  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||| ||||| ||    
T  22041348 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagccaatgttgt 22041249  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||||    
T  22041248 tgcggatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagtt 22041186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Original strand, 22376678 - 22377016
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaa-gtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaga 142  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||  |  |||||||||| || |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||    
T  22376678 tggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcga 22376777  T
Q  143 agatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcaca 242  Q
    || ||||| || || ||||  | ||  |||||||| ||||||||  ||     |||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||| |    
T  22376778 aggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcata 22376877  T
Q  243 tgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgct 342  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |  ||||| | || ||||| || || |||||||||||  || || | |||||    
T  22376878 tgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgct 22376977  T
Q  343 aaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||| | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  22376978 aaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagc 22377016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Original strand, 22382853 - 22383191
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaa-gtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaga 142  Q
    ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||  |  |||||||||| || |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||    
T  22382853 tggagacattatttaaacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcga 22382952  T
Q  143 agatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcaca 242  Q
    || ||||| || || ||||  | ||  |||||||| ||||||||  ||     |||||||||||| ||||||||||| || || || |||| |||||| |    
T  22382953 aggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattattatctaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtagaaagatgttgcata 22383052  T
Q  243 tgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgct 342  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |  ||||| | || ||||| || || |||||||||||  || || | |||||    
T  22383053 tgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgtgaatgct 22383152  T
Q  343 aaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||| | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  22383153 aaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagc 22383191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 21920928 - 21921193
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||| ||| |      
T  21920928 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagattttgaagtatctgc 21921027  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| | |    ||  |||||||  ||||| || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  21921028 tcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaatattatgattttgagttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgt 21921127  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  21921128 tgcagatgctttgagtaggaagacttttcacatgtctgccatgatggtaaaggagttcaagttgct 21921193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23886583 - 23886275
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||      
T  23886583 atttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcggtgatcataaaagtcagaagtatttgtttgatctgaaggaattgaatatgagacaac 23886484  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| |||||  | |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  23886483 gaaggtggctttaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatcctggtaaaactaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 23886384  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
    |||||| || |||||| | || ||||| ||| |||| || || |||||| | |||||| | |||||||| || || |||||||||||  |||| || |||    
T  23886383 catgtccgccatgatgatcaaagagttggagctgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatg 23886284  T
Q  341 ctaaagatt 349  Q
    || ||||||    
T  23886283 ctgaagatt 23886275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 170 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 6680541 - 6680330
Alignment:
Q  170 gattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttg 269  Q
    |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  6680541 gattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagttcg 6680442  T
Q  270 agttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatag 369  Q
    ||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||| || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || || |||||||| ||    
T  6680441 agttgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtgaattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacag 6680342  T
Q  370 tatcagagaagc 381  Q
    |||| |||||||    
T  6680341 tatccgagaagc 6680330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 22132233 - 22132495
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  22132233 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattaattgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 22132332  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||  ||    
T  22132333 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagagttgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgatgt 22132432  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    |  |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |  |||||||||||    
T  22132433 tatagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttcatggttagagagtttgagtt 22132495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 23651612 - 23651352
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | || |||||| || ||| |||| ||| | || |||| ||| |||||||    
T  23651612 tttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttactgatcacaagagtctgaagtatctgttcgatctgaaggaattga 23651513  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || ||  | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  23651512 atatgaggcagcgaaggtggcttgaatttctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtag 23651413  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| | || |||||||||    
T  23651412 gaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgagttgttggaacagtttaga 23651352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 381
Target Start/End: Original strand, 803064 - 803235
Alignment:
Q  210 ttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtga 309  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  803064 ttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtga 803163  T
Q  310 gttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  803164 attgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 803235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 138
Target Start/End: Original strand, 22623262 - 22623362
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  22623262 aaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgattataaaagtatgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggc 22623361  T
Q  138 a 138  Q
    |    
T  22623362 a 22623362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 16876311 - 16876562
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16876311 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaaatttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16876410  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16876411 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16876510  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  16876511 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttt 16876562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 21195718 - 21195831
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||| |  ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21195718 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaaatttgaagttttcagtgaccataagagtttgaagtacttatttgatcagaaaaagttgaatatga 21195817  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  21195818 ggcaaagaagatgg 21195831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Original strand, 16407309 - 16407451
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||| |    
T  16407309 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 16407408  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcga 153  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16407409 tcgatcaaaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcga 16407451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 148
Target Start/End: Original strand, 21849589 - 21849666
Alignment:
Q  71 tttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21849589 tttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatgg 21849666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 23156256 - 23156365
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  23156256 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23156355  T
Q  135 ggcagagaag 144  Q
    |||| |||||    
T  23156356 ggcaaagaag 23156365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23901752 - 23901639
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23901752 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 23901653  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    | || |||||||||    
T  23901652 gacaaagaagatgg 23901639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22316756 - 22316650
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| || || |  |||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22316756 ttgaagatttggaggcattatctgtatggctctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 22316657  T
Q  135 ggcagag 141  Q
    |||||||    
T  22316656 ggcagag 22316650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 20651609 - 20651662
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20651609 agtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 20651662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22435868 - 22435755
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||  |||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  22435868 ttgaagatttggaggcattatatgtatagttctaactttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaggagttgaatatga 22435769  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  22435768 ggcaaagaagatgg 22435755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 255
Target Start/End: Original strand, 22623399 - 22623472
Alignment:
Q  182 aattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgat 255  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||    
T  22623399 aattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaacattacatatgtctgctatgat 22623472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19869249 - 19869145
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |||| ||| || ||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||||||||| ||| | |    
T  19869249 tggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatacttgtttgatcaaaatgagttgaatatgagacagcgga 19869150  T
Q  144 gatgg 148  Q
    |||||    
T  19869149 gatgg 19869145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22435703 - 22435636
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  22435703 gctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaaaactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtt 22435636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Original strand, 20651714 - 20651800
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  20651714 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttaatggttaaagagttggaattgattgagcagttt 20651800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 21849718 - 21849816
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  21849718 gctaatgttgttgcggatgctttgagtaggacgactttgcatatgtctgatttgatggttaaagagttggaattgattgagcaatttcgagacttgagt 21849816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19148728 - 19148342
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19148728 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 19148629  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  19148628 ttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatg 19148529  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  19148528 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttg 19148429  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19148428 tgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttga 19148342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20748127 - 20747741
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20748127 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 20748028  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20748027 ttgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttggattgaattatcatccgggtaaagctaatg 20747928  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  20747927 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgggtcttgtttg 20747828  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20747827 tgagttgtcacctcagagtgtacagatgggtatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttga 20747741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 388
Target Start/End: Original strand, 16071027 - 16071408
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16071027 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 16071126  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16071127 ctatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagctaatg 16071226  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16071227 tggttgtagatgctttgagcaggaagacattgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttactagaacagtttagagacttgagtcttgtttg 16071326  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaa 388  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16071327 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacgtcaa 16071408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 15101339 - 15101718
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15101339 gagttagctgcggtgatttttgttttataaatttggaggcattatttgtacgattccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatatttat 15101438  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15101439 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 15101538  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15101539 tgcagatgctctgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgag 15101638  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15101639 ttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 15101718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 14262976 - 14263362
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14262976 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgtaatat 14263075  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14263076 ctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggactatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatg 14263175  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  14263176 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactataatggtaaaggagtttgagttacttgaacagtttagagacttaagtcttgtttg 14263275  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14263276 tgagttgtcacctcagagtttacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatcagagaagcacaacaagttga 14263362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 11387160 - 11387546
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11387160 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcataaaagtttgaaatat 11387259  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11387260 ttgtttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagagaaggtggcttgaattattgaaggattatgattttggattgaattaccatccgggtaaagctaatg 11387359  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11387360 tagttgtagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttg 11387459  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || |||||||||||  ||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11387460 tgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcaacaagttga 11387546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13667054 - 13666671
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  13667054 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 13666955  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||||| |   |||||| || |    
T  13666954 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatcctagtaaagccaacg 13666855  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||  | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13666854 tggttgcaaatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagctttgtctg 13666755  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  13666754 tgaattgacacctcaaagtgttcagttggggatgctgaagattaacagttatttcttgaatagcatccgagaagcacaacaagt 13666671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 23504602 - 23504985
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  23504602 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 23504701  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  23504702 ttgtttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatg 23504801  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| || || || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  23504802 tagtcgctgatgcattgagtaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtatg 23504901  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23504902 tgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtatccgagaagcacaacaagt 23504985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 140 - 522
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  140 tggagttggctgcggtattgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttcctgattcgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 239  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||     
T  240 atttgattagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggttagaactgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtt 339  T
Q  209 gttgc-agatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgt 307  Q
    ||||| | |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  340 gttgctaaatgcgttgcgcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctat 439  T
Q  308 gagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||  | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  440 gagttgacacctcagagtattcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 15341948 - 15341573
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||  |||||||| || ||| |||| |||    
T  15341948 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatctgtatggttccaaatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctgaagtat 15341849  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||   |||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  15341848 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattattattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaatg 15341749  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||  || ||||||| || ||    
T  15341748 tagttgctgatgcattgagcaggaagacgctgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatg 15341649  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagca 382  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15341648 tgagttgtcgactcagagtatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagca 15341573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 16949204 - 16949587
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  16949204 tttggagttggctacggtggtgtttgttttaaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 16949303  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||| | ||||    
T  16949304 ttattttatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaaaccaatg 16949403  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  16949404 tggttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctctgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagggacttgagtcttgtctg 16949503  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| | |||||| || || |||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  16949504 tgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaggattaatagtgacttctagaatagtatctgagaagctcagcaagt 16949587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 11304997 - 11305369
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  11304997 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 11305096  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||    
T  11305097 atttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggctaatgtg 11305196  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  11305197 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 11305296  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  11305297 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 11305369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 19614188 - 19613818
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19614188 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 19614089  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| ||    
T  19614088 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 19613989  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  19613988 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaa 19613889  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || || || |||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  19613888 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 19613818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13022869 - 13022491
Alignment:
Q  12 agttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatt 111  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13022869 agttggcttcggtggtgtttgtttttaaaatttggaggcattatttgtacgtttccagatttgatgtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttgtt 13022770  T
Q  112 tgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggtt 211  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||  | | |||||| |||||||||    
T  13022769 tgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaagccaatgtggtt 13022670  T
Q  212 gcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagt 311  Q
    || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||| |||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |    
T  13022669 gctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaat 13022570  T
Q  312 tatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | || ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  13022569 tgtcacctcagagtatacaattggggatgctgaagattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 13022491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 14285108 - 14285485
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||| || ||| |||| |||    
T  14285108 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgtagtattcagtgatcacaagagtctgaagtat 14285207  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| | | ||||||||| |    
T  14285208 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagctaacg 14285307  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || |||| || || ||    
T  14285308 tagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagcctggtatg 14285407  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||  ||||||||||    
T  14285408 tgagttgtcgcctcagagtatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtattcgagaagcaca 14285485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12458153 - 12457774
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12458153 gagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttaaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgt 12458054  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||| ||    
T  12458053 ttgatcagaaggaattgaaaatgaggcaaaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtagt 12457954  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||     
T  12457953 tgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtccgtgaa 12457854  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    || || ||||||||| || ||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  12457853 ttgtcacctcagagtatatagttggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagctcagcaagt 12457774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 18052685 - 18053068
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  18052685 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 18052784  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  18052785 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatg 18052884  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  18052885 tagtcgcggatgctttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtttg 18052984  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  18052985 tgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagt 18053068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 12205532 - 12205909
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  12205532 tttggagttggctgcggtggtttttgtgttaaaaatttggagaccttatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtac 12205631  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||| ||  |  |||||| |||| ||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  12205632 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 12205731  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| || ||    
T  12205732 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatatcagctatgatggttaaagaatttgagttgcttggtcagtttagagacttgagtctagtttg 12205831  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| || ||||| |||||  | ||||||||| | ||||| ||||| || || ||||||||||| | |||||||||    
T  12205832 tgagttgtcacctcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagtttttgaatagtattaaagaagcaca 12205909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 13967402 - 13967774
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13967402 tggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgagatgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 13967501  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | ||||| |||| || ||  |||||||| || ||||||||| | | ||| || |||||     
T  13967502 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaggccaatgtt 13967601  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| |||||||| | | |||| || ||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  13967602 gttgctgatgctttaacccggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 13967701  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  13967702 aattgtcaccttagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 13967774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 49153816 - 49153516
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  49153816 tggagttagctgcggtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 49153717  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  |||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  49153716 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 49153617  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  49153616 gttgcggacgctttgagtaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggagttcgaattgctagaacagttcagagacatgagccttgtctgtg 49153517  T
Q  309 a 309  Q
    |    
T  49153516 a 49153516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8709117 - 8708839
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  8709117 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 8709018  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  8709017 tcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 8708918  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  8708917 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttaga 8708839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 44790127 - 44790387
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  44790127 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 44790226  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  44790227 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 44790326  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || |||||||||    
T  44790327 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttaga 44790387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 26117324 - 26117639
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctag---------------tgatcataa 93  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||               |||||||||    
T  26117324 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagatttgaggtgttcagtgatcataa 26117423  T
Q  94 aagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcg 193  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||    
T  26117424 aagtctgaagtatttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatccg 26117523  T
Q  194 gataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatact 293  Q
    | | |||| ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||| ||     
T  26117524 ggttaagccaatgttgtggctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacatttcagagaca 26117623  T
Q  294 tgagtcttgtctgtga 309  Q
    ||||||||||||||||    
T  26117624 tgagtcttgtctgtga 26117639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 289
Target Start/End: Original strand, 18550550 - 18550794
Alignment:
Q  45 ggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaag 144  Q
    |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  18550550 ggagacattacttgtatgattcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaag 18550649  T
Q  145 atggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatg 244  Q
    ||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  18550650 atggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatg 18550749  T
Q  245 tctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  18550750 tccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttaga 18550794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8200122 - 8199862
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  8200122 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 8200023  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  8200022 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 8199923  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  8199922 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 8199862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 15159833 - 15160093
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  15159833 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttattcgatcagaaggaattga 15159932  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15159933 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 15160032  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  15160033 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 15160093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10872483 - 10872220
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  10872483 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 10872384  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || ||||| ||| |||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10872383 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttgggttggattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 10872284  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| | ||||||    
T  10872283 attgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagt 10872220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 14956066 - 14955819
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  14956066 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatgggtcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 14955967  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  14955966 tcgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14955867  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14955866 tgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14955819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Original strand, 16094 - 16363
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  16094 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaacagtttgaagtatttgtttgatcagaagaaattga 16193  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16194 atatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcag 16293  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||| | ||||||    
T  16294 gaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagt 16363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 393
Target Start/End: Original strand, 320813 - 321177
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  320813 tttgtattgaagatatgaagacattacttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattga 320912  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||| ||| | || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  320913 atatgaggcagcgaaggtggttggaattgctaaaagattatgattttgaattgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttaagtag 321012  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||| | |||||| | || ||| | || ||  || |||||||     
T  321013 gaagactttgcatatgtccgctatgatggtgaaggagttcgagttgctggagtagttcagagatttgagtttggtatgttaattgtcatctaagagtgtg 321112  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
     |||| || ||||| |||||| | || ||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||    
T  321113 aagttagggatgctgaagattgatagtgatttcttgaagagtattaaagaagcacaaaaagttga 321177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 11235989 - 11236249
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  11235989 tttgtattgaagatatggaggcattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 11236088  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  11236089 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 11236188  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  11236189 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 11236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 11770999 - 11771315
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| || |||||||||||| |||    
T  11770999 gagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatctat 11771098  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||| || ||||  |  |  |||||||| ||||| || ||| | | |||||||||||| ||    
T  11771099 ttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggctcgaatttttgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgt 11771198  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || |||||| | |||||  | ||||| |||    
T  11771199 tgcagatgccttaagtaggaagatgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagaaattgaattgcttgaacaatttagagatttgagcttagtctgcgag 11771298  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgt 327  Q
    || || |||||||||||    
T  11771299 ttgtcacctcagagtgt 11771315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14213168 - 14212924
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  14213168 tttgtattgaagatatggagacattagttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 14213069  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14213068 aaatgaggcaaagaagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgctttgagcag 14212969  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||||    
T  14212968 gaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagtt 14212924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14333890 - 14333630
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  14333890 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 14333791  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  14333790 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 14333691  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  14333690 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 14333630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15205101 - 15204749
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||      
T  15205101 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgctcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaac 15205002  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| |||||||| ||| |||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | ||||||||| || ||||||||||| || || ||||| || || ||    
T  15205001 gaaggtggctcgaattgctgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttaca 15204902  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| || ||||| | ||||| ||  | |||||||| ||| || || | || |||    
T  15204901 tatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcgaatagtttagagacctgagtttagtctgcgaactgtcgcctcatagtataaagctaggaatg 15204802  T
Q  341 ctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    || |||||| | || || |||||||| ||||| | |||||| ||| |||||||    
T  15204801 ctgaagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagcgcataaagttga 15204749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 288
Target Start/End: Original strand, 15147661 - 15147920
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  15147661 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 15147760  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | || ||||| || ||| |||  |  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15147761 atatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaagaatttgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 15147860  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttag 288  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||||||    
T  15147861 gaagactttgcatatgtctgctatgatggttagggagttcgagttgcttgaacagtttag 15147920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14041180 - 14040931
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  14041180 aaaatatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagac 14041081  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    || |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||  || |  |  ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| ||    
T  14041080 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacatt 14040981  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 287  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||    
T  14040980 gcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagttta 14040931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 14351210 - 14350961
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| |    
T  14351210 aaaatatggagacattacttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagac 14351111  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    || |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||  || |  |  ||||||| |||||||||||| |||| |||||| || || |||||||| ||    
T  14351110 agcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttaagctgtcattcgggtaaagctaatgttgttgtagatgccttaagtaggaagacatt 14351011  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 287  Q
    ||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||||    
T  14351010 gcatatgcccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagttta 14350961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12689013 - 12688765
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  12689013 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtctgaagtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgt 12688914  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacgg-cttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtgg 209  Q
    |  ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| ||  ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  12688913 tcaatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggatttatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttg 12688814  T
Q  210 ttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  12688813 ttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 12688765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13687558 - 13687298
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  13687558 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 13687459  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||  |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  13687458 atatgagacaacgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcatatgccttgagtag 13687359  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  13687358 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 13687298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 23202389 - 23202618
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23202389 tttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattga 23202488  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  23202489 acatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtag 23202588  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23202589 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 23508516 - 23508745
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  23508516 tttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgagatttggggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttgttcgatcagaaggaattga 23508615  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||| | ||| ||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  23508616 acatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaatcatcatccgggtaaagctaatgatgttgcagatgccttgagtag 23508715  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  23508716 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 23508745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 11551860 - 11552107
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || |||| |||||| ||||| ||||  |||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  11551860 gagttggcggccgtggtctttgtattgaagatatggaaacattacttgtatggtttgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 11551959  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| || ||   | |||||||||||||| |||   | |||||||||||| ||    
T  11551960 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgctgaaggattataactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgt 11552059  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| ||||| |  ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11552060 tgcagatgccttgagtaaaaagacattgcatatgtccgctatgatggt 11552107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18179236 - 18179007
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||| | || |||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||    
T  18179236 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgattacaagagtttgaagtatttgttctatcagaaggaattga 18179137  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  18179136 acatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 18179037  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  18179036 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 18179007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 215 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14435000 - 14434831
Alignment:
Q  215 gatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttat 314  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||  |||||||| || ||||| | || |||||||| |    
T  14435000 gatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaatagtttagagacatgagtttggtatgtgagttgt 14434901  T
Q  315 cgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||||||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  14434900 cgcctcaaagcatacagttgggcatgctgaagattaacagtgatttcctgagtagtatccgagaagcaca 14434831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9597569 - 9597322
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || | ||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| ||| ||||| || || ||||  ||||| |    
T  9597569 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatattgagacattacttgtatagttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaggtatttgt 9597470  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |  |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  9597469 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaactactgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 9597370  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  9597369 tgcagatgccttgagcatgaagacattgcatatgtccgctttgatggt 9597322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7825388 - 7825125
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  7825388 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 7825289  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  7825288 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 7825189  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  7825188 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 7825125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Original strand, 27106556 - 27106819
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27106556 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27106655  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  27106656 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27106755  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  27106756 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 27106819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27171769 - 27171506
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27171769 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27171670  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  27171669 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 27171570  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  27171569 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 27171506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4441416 - 4441303
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  4441416 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 4441317  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||  |||||||||    
T  4441316 ggccaagaagatgg 4441303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 15626007 - 15625898
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| | || ||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||     
T  15626007 atttggagacattatttatatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaaaagtctaaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatacgaggcagg 15625908  T
Q  141 gaagatggct 150  Q
    |||| |||||    
T  15625907 gaaggtggct 15625898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12456944 - 12456845
Alignment:
Q  282 agtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||    
T  12456944 agtttagagacttgagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagc 12456845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14937829 - 14937722
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||  ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  14937829 atttggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 14937730  T
Q  141 gaagatgg 148  Q
    ||||||||    
T  14937729 gaagatgg 14937722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15365422 - 15365315
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||  ||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15365422 atttggaggcattatctttatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaaaagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 15365323  T
Q  141 gaagatgg 148  Q
    ||||||||    
T  15365322 gaagatgg 15365315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15625898 - 15625728
Alignment:
Q  179 ttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctag 278  Q
    |||||||| ||| | | ||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| |    
T  15625898 ttgaattatcatccaggtaaagataatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctacatatgtctgctatgatggttaaagagttggagctgctcg 15625799  T
Q  279 agcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagatt 349  Q
    | ||||||||| |  ||||||| |||||||| || || ||||||| |||  |||| || ||||| ||||||    
T  15625798 aacagtttagagatctgagtctagtctgtgaattgtcacctcagattgtgaagttaggaatgctgaagatt 15625728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17925139 - 17925031
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  17925139 ttgaagatttggaggcattatctgtttggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 17925040  T
Q  135 ggcagagaa 143  Q
    |||||||||    
T  17925039 ggcagagaa 17925031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13456055 - 13455972
Alignment:
Q  215 gatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  13456055 gatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgattgagcagtttagagatttgagt 13455972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23642959 - 23642820
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||| |  ||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||    
T  23642959 tttggaattggctgcagttgtgtttgtgttgaagatttgacggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgatcacacaagtttgaagtat 23642860  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagat 146  Q
    || |||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23642859 ttgtttgactagaaggagttgaatatgagacagagaagat 23642820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 14139196 - 14139143
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgta 60  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14139196 tttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgta 14139143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 39937 - 40041
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | |    
T  39937 tggagacattatttgtatgggtcaaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcgga 40036  T
Q  144 gatgg 148  Q
    |||||    
T  40037 gatgg 40041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 13354577 - 13354525
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatg 147  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  13354577 agtttgaagtatttgtttgatcataaatagttgaatatgaggcaaagaagatg 13354525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 16827176 - 16827562
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16827176 tttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 16827275  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  16827276 ttatttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgacttgttgaaggattatgattttagtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 16827375  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||    
T  16827376 tgtttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaccattttagagacttgagtcttatctg 16827475  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16827476 tgagttgtcacctcagggtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacatcaagttga 16827562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 62 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 14575024 - 14574696
Alignment:
Q  62 ggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttga 161  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  14575024 ggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaa 14574925  T
Q  162 cggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaa 261  Q
     || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14574924 aggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaa 14574825  T
Q  262 ggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttc 361  Q
     || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  14574824 tgaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtttgcgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagattaatagtgatttc 14574725  T
Q  362 ttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  14574724 ttgagtagtatccgagaagcacagcaagt 14574696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 12359504 - 12359883
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12359504 gagttagctgcggtggtttttactttgaaaatttggaggcattacttgtatggttccagatttgaagtatttagtaatcacaaaagtttgaaatatttat 12359603  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  12359604 ttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggatagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 12359703  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  12359704 tgcagattccttgagtagaaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctgtgaa 12359803  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  12359804 ttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 12359883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 31940057 - 31939676
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || ||| | ||||||||    
T  31940057 tggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcacaagagtctaaaatattt 31939958  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| || ||  || |||||||||||||||||| | | |||||| |||||     
T  31939957 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgta 31939858  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||    
T  31939857 gttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagactcgagccttgcctgtg 31939758  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31939757 aattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacagcaagt 31939676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 16379901 - 16380278
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||    
T  16379901 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 16380000  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| |    |||||||| |    
T  16380001 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagcaaagctaacg 16380100  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| ||||| || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  16380101 tagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatg 16380200  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  16380201 tgagttgtcgcctcaaagcatacagttgggcatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcaca 16380278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Original strand, 10419020 - 10419404
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  10419020 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 10419119  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||     
T  10419120 gtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgta 10419219  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  10419220 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtg 10419319  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    | |||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  10419320 aattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgacttcttgaatagtatcagagaagcacaacgagttga 10419404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28755472 - 28755100
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28755472 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 28755373  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  28755372 atttgaccagaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 28755273  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  28755272 gttgcggatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 28755173  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | |||||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  28755172 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 28755100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15228805 - 15228428
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  15228805 tttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtac 15228706  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||| ||  |  |||||| |||| ||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  15228705 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 15228606  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  15228605 ttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttg 15228506  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| ||  |||| |||||  | ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  15228505 tgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15228428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15234673 - 15234296
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  15234673 tttggagttggctgcggtggtttttgtgttgaaaatttggagacattatttatatggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaagtac 15234574  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||| ||  |  |||||| |||| ||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  15234573 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 15234474  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||    
T  15234473 ttgttgcagatgctttcagcaggaagactttgcatatgtcagctatgatagttaaagattttgagttgcttgagcaatttagagacttgagtctagtttg 15234374  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| ||  |||| |||||  | ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||| | |||||||||    
T  15234373 tgagttgtcaactcaaagtgtgaaattgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaatagtattaaagaagcaca 15234296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 31694161 - 31694542
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||||    
T  31694161 tggagttggctgcggtggtttttattttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatattt 31694260  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||| |||||     
T  31694261 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttggagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaacatcctggtaaagccaatgta 31694360  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  31694361 gttgcagatgctttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgaaccttgtctgtg 31694460  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  31694461 aattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacagcaagt 31694542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 13943180 - 13942797
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||     
T  13943180 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatac 13943081  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  13943080 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 13942981  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || || || ||||| || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  13942980 tagtcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatg 13942881  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||    
T  13942880 tgagttgtcgtctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcacaacaagt 13942797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 18133319 - 18133702
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  18133319 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggctttatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 18133418  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||| | ||| |||||| || ||  ||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18133419 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcaatggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggcatgaattaccatccgggtaaagctaatg 18133518  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||| || | || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  18133519 tggttgcatataccttaagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagccgtttagagacttgagcctcgtctg 18133618  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  18133619 tgaattgacacctcatagtgttcagttggcgatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagcgcagcaagt 18133702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 16835483 - 16835860
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||    
T  16835483 tttggagttagctgcagtggtttttgttttgaagatttagaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 16835582  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  16835583 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatg 16835682  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||  || ||||| ||||| || ||||||||| || |||||||||| ||    
T  16835683 tagttgcggatgcgttgagcagaaagactttgcacatgtctgcattaatggtaagagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtcttgtgtg 16835782  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||||||  | ||  ||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16835783 tgagttgacaccgaagagtgttcagttgggtatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatccgagaagcaca 16835860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 47125098 - 47124726
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  47125098 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 47124999  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  47124998 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 47124899  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  47124898 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 47124799  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  47124798 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 47124726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 11960144 - 11960525
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11960144 tggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtttgaaatattt 11960243  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | | ||  |  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| |   ||| || ||||||    
T  11960244 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagattgttagaactactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctagtaaggccaatgtg 11960343  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11960344 gttgctgatgcattgaggaggaaaacattgcatatgtctgctttgatggtaaaggaatttgagttgctagagcagtttagggacttgagtcttgtctgtg 11960443  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| ||| | | |||| | || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  11960444 aattgtcacctcagagtatacagttggggatgatgaggattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagctcagcaagt 11960525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 17187530 - 17187164
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||||    
T  17187530 tttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttgtaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 17187431  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||| ||||||| || ||  ||| |||||| ||||    
T  17187430 ttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttagtttgaactatcacccgggtaaagccaatg 17187331  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||    
T  17187330 tggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagttcagagacttgagtctggtttg 17187231  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatc 373  Q
    ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  17187230 tgaattaacacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaattaacagtgatttcttgagtagtatc 17187164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 16328635 - 16329007
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16328635 tggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgataataaaagtttgaaatattt 16328734  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  16328735 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcacaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 16328834  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||| | |||||||| || ||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16328835 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattacatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgagttgttggaacagtttagagacttgagtcttgtctgtg 16328934  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |  | ||  |||||||| |||||||||| ||  | |||||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  16328935 aactgtcatctcagagtatacagttggggataatgaagattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 16329007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12179494 - 12179243
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  12179494 tttgtagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatat 12179395  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||||    
T  12179394 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccagccgggcaaagccaatg 12179295  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12179294 tggttgcagatgcgttgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggt 12179243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41178678 - 41178295
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  41178678 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 41178579  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  41178578 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 41178479  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  41178478 tagtcgcggatgcgttgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtttg 41178379  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  41178378 tgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagt 41178295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44778399 - 44778020
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||| |    
T  44778399 gagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgt 44778300  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| ||    
T  44778299 ttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatgtagt 44778200  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
     || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| | || || ||||| || || || ||||||||| || ||||| | || ||||||    
T  44778199 cgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttactggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgag 44778100  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    || |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| || |||||    
T  44778099 ttgtcgcctcagagcatacagttggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagtatccgggaagcgcagcaagt 44778020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 13971097 - 13971460
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  13971097 gagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 13971196  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  || ||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| ||    
T  13971197 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgactttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 13971296  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  13971297 tgcagatgccttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaa 13971396  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatca 374  Q
    || || || |||||||| |||||||||||| |||| || || || || ||||||||||||||||    
T  13971397 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttaaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatca 13971460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 373
Target Start/End: Original strand, 13319475 - 13319841
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||    
T  13319475 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatatggaggcactatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaggtat 13319574  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  || |||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  13319575 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgactttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 13319674  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| | ||||||| ||||| ||    
T  13319675 tggttgcgaatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcactgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttaaagacttgagccttgtttg 13319774  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatc 373  Q
    ||| || || ||||| ||| | |||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13319775 tgaattgtcacctcaaagtattcagtcggggatgttgaagattaacagtgatttcttgaatagtatc 13319841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 381
Target Start/End: Original strand, 16337507 - 16337859
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16337507 tttgttttaaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattga 16337606  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| ||  |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16337607 acatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccgatgtggttgctgatgcattgagcag 16337706  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    ||| || || || ||||||||| ||||||| ||||| || || ||| |||| ||||||||| |||||||||| || ||||| || || ||||||||| ||    
T  16337707 gaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtctggtatgtgaattgtcacctcagagtata 16337806  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||||| ||| | | |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16337807 cagttgggaatgttgaggattgatagtgatttcttgaacagtatcagagaagc 16337859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14087825 - 14087455
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  14087825 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 14087726  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
     |||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| || || || ||| ||| |||||| ||||| ||    
T  14087725 ctgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttaaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 14087626  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  14087625 tgcagatgctttgagtaggaagacattacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaa 14087526  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || || || |||||||   ||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  14087525 ttgtcaccccagagtgagaagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 14087455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 309
Target Start/End: Original strand, 14579926 - 14580228
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||  | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  14579926 tttggagttagctgatgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatat 14580025  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  14580026 ttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 14580125  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||  || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | |||||| | |||||    
T  14580126 ttgttgcagatgccttgagtaggaagaatttacacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagtttagtctg 14580225  T
Q  307 tga 309  Q
    |||    
T  14580226 tga 14580228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 130 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17493663 - 17493403
Alignment:
Q  130 tatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcagg 229  Q
    ||||||||||||||||||| |  || |||||| || ||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17493663 tatgaggcagagaagatggttaaagctgttgaaggattatgattttggtttgagttaccatccgggtaaagccaacgtggttgcagatgccttgaggagg 17493564  T
Q  230 aagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtac 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  17493563 aagacgttgcatatgtctgctatgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcgtgtctgtgaattgacacctcagagtgtac 17493464  T
Q  330 agttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  17493463 atttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 17493403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 16491169 - 16491443
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  16491169 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 16491268  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||| || ||  |||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  16491269 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgggttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 16491368  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  16491369 tgaagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtt 16491443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 20061060 - 20061320
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  20061060 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 20061159  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  20061160 atatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 20061259  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  20061260 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 20061320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 15588398 - 15588658
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  15588398 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattga 15588497  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15588498 atatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 15588597  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  15588598 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 15588658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16636897 - 16636637
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16636897 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16636798  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16636797 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16636698  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  16636697 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 16636637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 43164221 - 43163961
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  43164221 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 43164122  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  43164121 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 43164022  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  43164021 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 43163961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 53384024 - 53384268
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  53384024 tttgtgttgaaaatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 53384123  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||    
T  53384124 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatgttattgcagatgccttgagtag 53384223  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||||    
T  53384224 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagtt 53384268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15260739 - 15260485
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  15260739 tggagacattacttgtatggttcgagatttaaagtgttcagcgaccacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 15260640  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||  | ||  |||||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| ||    
T  15260639 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatat 15260540  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  15260539 gtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagt 15260485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10907334 - 10907074
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  10907334 tttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtattttttcgatcagaaggaattga 10907235  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || || ||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  10907234 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 10907135  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || |||||||| |||||||||    
T  10907134 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgctagaacagtttaga 10907074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 13253814 - 13253554
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  13253814 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 13253715  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  13253714 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 13253615  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  13253614 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 13253554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 17490992 - 17490718
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  17490992 gagttggctgctgtagtctttgtattgaatatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 17490893  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||    
T  17490892 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgcttaatgattatgattttgagttgagctatcatcctggtaaagctaatgttgt 17490793  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  17490792 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaagtagttcgagttgcttgaacagtt 17490718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6601860 - 6601631
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| || |||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6601860 tttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattga 6601761  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  6601760 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 6601661  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  6601660 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 6601631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 349
Target Start/End: Original strand, 15347266 - 15347571
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  15347266 tggagacattacttgtttggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 15347365  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    ||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  ||||| ||    
T  15347366 gatggcttgagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagaaattgcatat 15347465  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    ||| || |||||||| |  ||||| ||||| || || ||||||||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||  |  ||||||||||     
T  15347466 gtccgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctg 15347565  T
Q  344 aagatt 349  Q
    ||||||    
T  15347566 aagatt 15347571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 5423936 - 5424256
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  5423936 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 5424035  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  5424036 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 5424135  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||| | || ||||| |   | |||||||||||     
T  5424136 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 5424235  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagatt 349  Q
     | ||||||||||| ||||||    
T  5424236 aaattgggtatgctgaagatt 5424256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 48426571 - 48426311
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  48426571 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 48426472  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  48426471 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 48426372  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  48426371 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 48426311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 213 - 390
Target Start/End: Original strand, 11302952 - 11303129
Alignment:
Q  213 cagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtt 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||| || || |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  11302952 cagatgcgttgagcagcaagacattgcatatctctgctttgatggtgaaagaatttgatctgctagagcagtttagagatttgagtcttgtctgtgaatt 11303051  T
Q  313 atcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
      | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11303052 gacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 11303129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10006724 - 10006464
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || ||||| |  ||||| || |||||||| |||||||    
T  10006724 tttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaggtatttgttcgatcagaaggaattga 10006625  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || || ||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  10006624 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 10006525  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  10006524 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 10006464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15340393 - 15340133
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  15340393 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 15340294  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||  ||||||||||| ||||| ||    
T  15340293 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgctgttgcagatgccttgagtag 15340194  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  15340193 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 15340133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 15723940 - 15724200
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  15723940 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 15724039  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||| ||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  15724040 atatgagacagcgaagatagcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtag 15724139  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  15724140 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 15724200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 15401523 - 15401752
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | || ||||||||| || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  15401523 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggagtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 15401622  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  15401623 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 15401722  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  15401723 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 15401752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 14875487 - 14875765
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| |    
T  14875487 gagttggcagctgtggtctttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgt 14875586  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||| ||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  14875587 tcgatcagaatgaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttgatttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 14875686  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||||||||| || || |||||||| ||||| |||||  ||||||| || |  ||||| |||||||| ||  ||||||||    
T  14875687 tgcagatgccttaagtaggaagacattgcatatgtccactatgatagttagagagttcgagttgcttgaatagtttaga 14875765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12499372 - 12499143
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    |||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  12499372 tttgatttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 12499273  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||| ||||  | ||  || |||||||||||||| |||   | ||||||||| || ||||||||||  ||||| ||    
T  12499272 atatgagtcaaagaaggtggctcgagttattgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaacgtcgttgcagatggcttgagtag 12499173  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  12499172 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 12499143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16693288 - 16693019
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||    
T  16693288 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttattgatcataagagtttgaagtatctgtttgaccagaaggaattga 16693189  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| | |||||| | || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16693188 atatgagacagcgtagatggatagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcgttgagcag 16693089  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||| |  ||||| ||||| || || ||||| ||| ||||||||    
T  16693088 gaagacattgcatatgtctgccttgatggttagagagttcgagttacttgaacagttcagagacttgagt 16693019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 16411288 - 16411517
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  16411288 tttgtattgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtctttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattga 16411387  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  16411388 atattaggcagagaagatggctagaattgctgaaagattacgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtag 16411487  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16411488 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 16411517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 16805935 - 16806182
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  16805935 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgt 16806034  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| | |||||| | || ||| |||  | ||  || |||| ||||||||| |||   | |||||||||||| ||    
T  16806035 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggatagaattgctgaaagattatgactttgctttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgt 16806134  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  16806135 tgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 16806182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3687067 - 3686910
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  3687067 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 3686968  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaatta 186  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || ||||||||||||||    
T  3686967 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaatta 3686910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Original strand, 15014771 - 15014991
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    ||||||||||| |||||| | || | ||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  15014771 aaaatttggaggcattatctatatgtttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgactagaaagaattgaatatgaggc 15014870  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    || |||| ||||| || ||| | | |  ||  |||||  | |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || ||||||| || ||||| || ||    
T  15014871 agcgaaggtggcttgaattgctaaagaattatgatttcaggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttacaaatgctttaagtaggaaaacatt 15014970  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggt 258  Q
     || |||||||||||||||||    
T  15014971 acatatgtctgctatgatggt 15014991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 197 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4679404 - 4679211
Alignment:
Q  197 aaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttga 296  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || |||    
T  4679404 aaagctaatgtagtcgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatga 4679305  T
Q  297 gtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    || | || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  4679304 gtttggtttgtgagttgtcgcctcaaagtgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcacagcaagt 4679211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 14125600 - 14125829
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| || |||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||||    
T  14125600 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttaatgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcaaaaggaattga 14125699  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14125700 atatgaggcagcttagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcag 14125799  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  14125800 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 14125829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 15062836 - 15062582
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||| ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15062836 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggttttaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatga 15062737  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| |||| ||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| |||   | |||||||||||| || | |||||| || || ||||||||    
T  15062736 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatcaagttaaagctaatgttgtggtagatgccttaagtaggaagac 15062637  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  15062636 attgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 15062582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30138934 - 30138671
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30138934 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 30138835  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  30138834 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 30138735  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  30138734 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 30138671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30148485 - 30148222
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30148485 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 30148386  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  30148385 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 30148286  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  30148285 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 30148222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 10384826 - 10384732
Alignment:
Q  8 ttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaa 102  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  10384826 ttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaa 10384732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 5109617 - 5109723
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  5109617 tttgtgttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattga 5109716  T
Q  129 atatgag 135  Q
    |||||||    
T  5109717 atatgag 5109723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 312
Target Start/End: Original strand, 8273411 - 8273688
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8273411 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 8273510  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  8273511 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 8273610  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtt 312  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || | |||||| | ||| |||||||    
T  8273611 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagatttgagtttggtcagtgagtt 8273688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 270
Target Start/End: Original strand, 13966362 - 13966591
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13966362 atttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaga 13966461  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  13966462 gaagatggttggaatatcttaaggattttgatttttagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgca 13966561  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttga 270  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  13966562 tatgtctgctttgatggttaaagagtttga 13966591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 55514730 - 55514843
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||  |||||||| || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  55514730 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaaatttaaagtgttaagtgatcacaagagtttgaagtatatgtttgatcagaaagagttgaatatga 55514829  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  55514830 ggcaaagaagatgg 55514843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Original strand, 16741715 - 16741978
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16741715 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16741814  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | ||||   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16741815 ggcagagaagatggttggagtatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16741914  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||| || || ||||||||    
T  16741915 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagcttcgagacttgagt 16741978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18751036 - 18750809
Alignment:
Q  71 tttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttggg 170  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||   | | || ||       
T  18751036 tttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttca 18750937  T
Q  171 attttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttga 270  Q
    |||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||    
T  18750936 attttcagttgagttatcatccagggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttgga 18750837  T
Q  271 gttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  18750836 attgattgagcagtttcgagacttgagt 18750809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 17194222 - 17194109
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || ||||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||    
T  17194222 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatacttgcttgatcaaaaagagttgaatatga 17194123  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  17194122 ggcagagaagatgg 17194109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16258272 - 16258159
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16258272 ttgaagatctggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16258173  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  16258172 ggcagaggagatgg 16258159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 286
Target Start/End: Original strand, 6711591 - 6711674
Alignment:
Q  203 aatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||||    
T  6711591 aatgtggtggcagatgctttgagtaggatgccgttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgattgagcagttt 6711674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25767446 - 25767195
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  25767446 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagcttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25767347  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | || ||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  25767346 gacaaagaagatggtttgaatatcttaaggatttcgattttcaattgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 25767247  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  25767246 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttt 25767195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15611066 - 15610968
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  15611066 gctaatgttgttgcggatgctttgagtaggaagattttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 15610968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12793269 - 12793156
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  12793269 ttgaaaatttggaggcactatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatacga 12793170  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  12793169 ggcagaggagatgg 12793156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16258107 - 16258009
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  16258107 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcaatttcgagacttgagt 16258009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 6151865 - 6151978
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||| |||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| |    
T  6151865 ttgaagattcggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatataa 6151964  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  6151965 ggcagaggagatgg 6151978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15611231 - 15611118
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  | ||| || || |||| ||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  15611231 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcaatgaccacaagagttcgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 15611132  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  15611131 ggcagaggagatgg 15611118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 6152030 - 6152097
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  6152030 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtt 6152097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 258
Target Start/End: Original strand, 16755758 - 16755820
Alignment:
Q  196 taaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  16755758 taaagcgaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16755820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 41256 - 40873
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41256 tttggagttggctgcggtgatttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatat 41157  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | || ||  |||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||    
T  41156 ttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagagaagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggttttgattatcatccgggtaaagctaatg 41057  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41056 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 40957  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40956 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacatcaagt 40873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 136
Target Start/End: Original strand, 47189 - 47289
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  47189 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtt-gaagtatttgtttgatcagaaatagttgaatatga 47287  T
Q  135 gg 136  Q
    ||    
T  47288 gg 47289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1041
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1427 tttggagttggctgcggtggtttttgtttcgaaaatttggagacattatttgtacggttccaggtttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 1328  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1327 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaaatggcttgagttgttaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 1228  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||| ||    
T  1227 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagtttctagaatagtaaagagacttgagtcttgtttg 1128  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1127 tgagttgtcgccttagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2112 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold2112
Description:

Target: scaffold2112; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 150
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  536 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggagatattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaattttgaaatat 437  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  436 ttatttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaata 337  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||| ||||||| ||||| ||    
T  336 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgtgttgcttgaatagttcagagacttgagccttgtttg 237  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  236 tgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttga 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 1602 - 1988
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||    
T  1602 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacagttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagcctgaaatat 1701  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  1702 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagcaaatg 1801  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1802 tggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctactatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 1901  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||||||  | |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  1902 tgagttgacacctcagagtgtaaagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacaacaagttga 1988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 50623 - 51009
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  50623 tttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtattcagtgatcataaaagtttgaaatat 50722  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  50723 ctgtttgataaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatggcttgaactgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatg 50822  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  50823 tggttgtagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctg 50922  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50923 tgagttgtcacctcagagtgtacagttggctatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagcacatcaagttga 51009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 3734 - 3348
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||  | ||| ||||    
T  3734 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaatatctgagatat 3635  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | | || ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  3634 ttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgctaaaggattatgattttggtttaaattaccatccgggtaaagctaatg 3535  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3534 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctattatggtaaaggagtttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtctg 3435  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3434 tgagttgtcacctaagagtgtatagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagcacagcaagttga 3348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 2233 - 2610
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  2233 tttggagttagctgcggtagtttttgttttgaaattttggaggcattatttgtacggctccagatttgaagtgtttagtgatcccaaaagtttgaaatat 2332  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  2333 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtgaagctaatg 2432  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2433 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 2532  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2533 tgagttctcaccttagagtgtacagttgggtatgttgaagattaattgtaatttcttgaatagtatccgagaagcaca 2610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 6304 - 5922
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6304 gagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggccttacttgtacggtttcagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaactatttat 6205  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | | || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6204 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgctaaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 6105  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6104 tgcagatgctttgagcaggaaaacgttgcacatgtttgttatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctatgag 6005  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    || || |||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6004 ttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttga 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18907 - 18521
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18907 tttggaattggttgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 18808  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  18807 ttattcgatctgaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttaaaggattatgattttggttttaattaccatccgggtaaagctaatg 18708  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||    
T  18707 tcgttgtagatgctttgagcaggaagacatttcacatctctgctatgatggtaaaagagtttgagttgctagaatattttagagacttgagtcttgtctg 18608  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18607 tgagttgtcacttcaaagtgtacagttgggtatgctgaaggttaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacagcaagttga 18521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 25553 - 25666
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| |||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  25553 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaatagtttgaagtaattgtttgatcagaaagagttgaatatga 25652  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  25653 ggcagagaagatgg 25666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 46 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 29576 - 29229
Alignment:
Q  46 gagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaga 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29576 gagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatatctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaaga 29477  T
Q  146 tggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 245  Q
    ||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29476 tggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 29377  T
Q  246 ctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaa 345  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29376 ctgctatgatggtaaagaagtttgagttgctagagcagtttagagagttgattcttgtttgtgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaa 29277  T
Q  346 gattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29276 gattaatagtgatttcttgaataatatcagagaagcacagcaagttga 29229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50368 - 50168
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  50368 tttggagttggctgcggcggtttttgtttttaaaagttggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcatacaagtttaaaatat 50269  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  50268 ctgtttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 50169  T
Q  207 t 207  Q
    |    
T  50168 t 50168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30481 - 30236
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  30481 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 30382  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  30381 atatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgtttttgcagatgctttgagtag 30282  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttg 274  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30281 gaagacattgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttg 30236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13758 - 13381
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  13758 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 13659  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  13658 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatg 13559  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13558 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 13459  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13458 tgagttgacaccttagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 13381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 6584 - 6697
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6584 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 6683  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  6684 ggcagagaagatgg 6697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 6749 - 6847
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  6749 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgactgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 6847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 32969 - 32586
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  32969 tttggagttggctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatctgtaccgttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatat 32870  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  32869 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 32770  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||    
T  32769 tggttgcggatactctgagcaggaaaacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagcgcggtttagagatttgagtcttgtctg 32670  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  32669 tgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcaacaagt 32586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28182 - 27800
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  28182 tttggattttgctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctgaaatat 28083  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  28082 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagagaagatggctagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatg 27983  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||    
T  27982 tggttgtagatgctctgagca-gaagacgttggatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttaaagacttgagtcttgtttg 27884  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
     ||||| || ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27883 cgagttgtcaccttagagtgtacagttgggtatgttgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 27800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 59962 - 60345
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| || ||| | || |||    
T  59962 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtat 60061  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| |   |||||  ||||    
T  60062 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatg 60161  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||||||||| || || ||||||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  60162 tggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttg 60261  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||| || |||||| |||||| |||| | |||||||| |||||    
T  60262 tgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagt 60345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 50928 - 51311
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| || ||| | ||||||    
T  50928 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatat 51027  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| |   |||||  ||||    
T  51028 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatg 51127  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||||||||| || || ||||||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  51128 tggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttg 51227  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||| || |||||| |||||| |||| | |||||||| |||||    
T  51228 tgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagt 51311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 66350 - 66733
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  || ||||| || ||| | ||||||    
T  66350 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatatagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagcgatcacaagagtctaaaatat 66449  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| |   |||||  ||||    
T  66450 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaaggcaatg 66549  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||| ||| ||||| |||| ||||||||| || || ||||||||  ||||||| |  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  66550 tggctgcggatgcgttgatcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtgagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttg 66649  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||| || |||||| |||||| |||| | |||||||| |||||    
T  66650 tgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcctgaataatatccgtgaagcacaacaagt 66733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 109188 - 108857
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  109188 tttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 109089  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  109088 ttatttgattagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaacatccgggtaaagctaatg 108989  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  108988 tggttgtagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaatgattttgagtttctagattagtttagagacttgagtcttgtctg 108889  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggta 338  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  108888 tgagttgtcacctcagagcgtacagttgggta 108857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 144
Target Start/End: Original strand, 55743 - 55876
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||| |||||| || || || |||||||||||||    
T  55743 gagttagctgccgtggtttttgtgttgaagatgtggagacattacttatatggttcgagttttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatatttat 55842  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaag 144  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55843 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaag 55876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Original strand, 62945 - 63061
Alignment:
Q  173 tttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagt 272  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| ||||    
T  62945 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctactgttgttgcagatgtcttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagtgttcgagt 63044  T
Q  273 tgctagagcagtttaga 289  Q
    |||| || |||||||||    
T  63045 tgcttgaacagtttaga 63061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 23197064 - 23197446
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  23197064 tttggagttggctgcagtggtttt-gttttgaaaatttgaaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatat 23197162  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23197163 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 23197262  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23197263 tggttgctgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 23197362  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  23197363 tgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgtgaagcacagcaagt 23197446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19855847 - 19855464
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  19855847 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 19855748  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  19855747 ttatttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatg 19855648  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19855647 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttactagagcagtttagagacttgagccttgtctg 19855548  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19855547 tgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 19855464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 24098422 - 24098803
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24098422 tggagttagttgcggtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 24098521  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||  | |||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  24098522 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagatcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 24098621  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24098622 gttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtg 24098721  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  24098722 agttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 24098803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 19661953 - 19662331
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttg-ttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaata 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| | |||||    
T  19661953 tttggagttggctgcggtggtttttggttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagattcgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaata 19662052  T
Q  106 tttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaat 205  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||    
T  19662053 tttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaat 19662152  T
Q  206 gtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtct 305  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  19662153 gtggttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagatttgagtcttgttt 19662252  T
Q  306 gtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||| ||  | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19662253 gtgaattgacaccccagagtgtacagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 19662331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 20834717 - 20835094
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20834717 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtttgaaatat 20834816  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  20834817 ctgtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagttgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 20834916  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| | ||||| || || || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20834917 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctg 20835016  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20835017 tgaattaacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 20835094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 21744369 - 21744626
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21744369 tttggagttggctacggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtaaggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 21744468  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21744469 ctgattgatcaaaaagaattgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatccgagtaaagctaatg 21744568  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaagga 264  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21744569 tggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaagga 21744626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 37678620 - 37678248
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  37678620 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 37678521  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  37678520 atttgaccaaaaagaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggtttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 37678421  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  37678420 gttgttgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 37678321  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| ||| | |||||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  37678320 aattgtcacctcagagtatacagttgggaatgttgaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 37678248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 20938880 - 20939263
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |  |||||| | |||||| | ||||||    
T  20938880 tttggggttggctggggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttctagatttgaggtattcagtgattacaaaagtctaaaatat 20938979  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| || ||||||||| | | |||||| ||||    
T  20938980 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttaaattaccatcctggtaaagccaatg 20939079  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20939080 tggttgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctg 20939179  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20939180 tgaattgacacctcagagtgtacaattggggatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 20939263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 21952449 - 21952109
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21952449 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactatttgtacggttcaagatttgaggtgttctgtgatcataaaagtttgaaatattt 21952350  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  21952349 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 21952250  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21952249 gttgctgatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtg 21952150  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagatt 349  Q
    |  | ||  |||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  21952149 aactgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagatt 21952109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 20855577 - 20855963
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  20855577 tttggagctggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtat 20855676  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  20855677 ctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaatgattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatg 20855776  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||| | ||||| || ||||||||  | || ||||| || ||    
T  20855777 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagttttaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtg 20855876  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  20855877 tgaattgtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttggatagtatcagagaagcgcaacaagttga 20855963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 31538816 - 31539188
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  31538816 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 31538915  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| || || ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  31538916 atttgaccaaaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 31539015  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  31539016 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacgtgtcagctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 31539115  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  31539116 aattgtcacctcagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 31539188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 20060769 - 20061143
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||    
T  20060769 tttggagttggccgcggtggtttttgtattaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatat 20060868  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||| || || || || | || ||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20060869 ctgtttgaccaaaacgaattgaacatgaggcagaggagatgacttgaattattaaaggattatgattttggcttgaactaccattcgggtaaagctaatg 20060968  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||    
T  20060969 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgagcattttagagatttgagccttgtttg 20061068  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| || |  || |||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  20061069 tgatttgttaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 20061143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20295952 - 20295580
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||    
T  20295952 tggaattggctgtggtggtttttgttttggaaatttggagacattatttgtacggttccagatctgaggtgttcaatgatcataaaagtttgaagtattt 20295853  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| |   |||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||  | | ||| || |||||     
T  20295852 atttgaccagaaggttctgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccaccctggtaaggccaatgta 20295753  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||  || || ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||| | |||||||    
T  20295752 gttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggcgaaagaatttgaattgttagaatagtttagagacttgagtttggtctgtg 20295653  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || ||||||||| | |||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  20295652 aattgtcacctcagagtattcagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 20295580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 29 - 393
Target Start/End: Original strand, 51332332 - 51332696
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  51332332 tttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 51332431  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  51332432 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgattag 51332531  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||| |  ||||| | || ||||| |  || |||||||||||     
T  51332532 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcaaagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 51332631  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
     | ||||||||||| |||||| | || || ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  51332632 aaattgggtatgctgaagattgatagtgaattcctgaaaagtatcaaggaagcacagaaagttga 51332696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 430937 - 431211
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  430937 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtacggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 431036  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||| || ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  431037 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 431136  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  431137 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcgagttgcttgaacagtt 431211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 33389868 - 33390188
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  33389868 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 33389967  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  33389968 atatgaggcagcgaagatgactagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 33390067  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||     
T  33390068 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 33390167  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagatt 349  Q
     |  |||||||||| ||||||    
T  33390168 aaactgggtatgctgaagatt 33390188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 16349435 - 16349664
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16349435 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16349534  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16349535 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16349634  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  16349635 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 16349664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22110527 - 22110190
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  22110527 tggagacattatttgtacggttttagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagcgaa 22110428  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  22110427 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 22110328  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| | || || ||  | || | |||||||||  || |||| ||||||    
T  22110327 gtcctctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgcta 22110228  T
Q  344 aagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| | || || |||||||| ||||| | ||||||    
T  22110227 aagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagc 22110190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22114376 - 22114039
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  22114376 tggagacattatttgtacggttgtagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatttgagacagcgaa 22114277  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||  | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  22114276 ggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaaatttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 22114177  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| | || || ||  | || | |||||||||  || |||| ||||||    
T  22114176 gtcctctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaatagtttagagatttgagtttagtatgcgaaatgtcacatcagagtgtgaagctgggaatgcta 22114077  T
Q  344 aagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| | || || |||||||| ||||| | ||||||    
T  22114076 aagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagc 22114039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21831823 - 21831563
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  21831823 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 21831724  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21831723 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 21831624  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  21831623 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 21831563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19107888 - 19107659
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  19107888 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgttcgaccagaaggaattga 19107789  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  19107788 atatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 19107689  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  19107688 gaagacattgtatatgtccgctatgatggt 19107659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 273
Target Start/End: Original strand, 41352501 - 41352745
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  41352501 tttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 41352600  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | |  | ||  || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  41352601 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaagattatgactttgggttgaattaccatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 41352700  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||||    
T  41352701 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgagtt 41352745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 21234570 - 21234799
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||  || ||||| || |||||||    
T  21234570 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatattagttcgatcaaaaggaattga 21234669  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21234670 atatgagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcag 21234769  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  21234770 gaagacgttgcatatgtccgctttgatggt 21234799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21838471 - 21838210
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaa-agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattg 127  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  21838471 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcagcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattg 21838372  T
Q  128 aatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagca 227  Q
    |||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  21838371 aatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagta 21838272  T
Q  228 ggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  21838271 ggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 21838210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16373974 - 16373707
Alignment:
Q  105 atttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaa 204  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||    
T  16373974 atttgtttgattagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaa 16373875  T
Q  205 tgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtc 304  Q
    ||| ||||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |  ||||| | ||     
T  16373874 tgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgcatatgtctgctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacagtttagagatctgagtttagtt 16373775  T
Q  305 tgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtat 372  Q
    ||||| |  || |||||||||||  || |||| ||||| |||||| | || || |||||||| |||||    
T  16373774 tgtgaatggtcacctcagagtgtgaagctgggaatgctgaagattgatagtgaattcttgaaaagtat 16373707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 258
Target Start/End: Original strand, 17043836 - 17044083
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  17043836 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagatattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgt 17043935  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | ||||||||| || ||    
T  17043936 tggatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgt 17044035  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  17044036 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgctttgatggt 17044083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 22361065 - 22361352
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22361065 gagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 22361164  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| || || ||| ||| ||  |  |||||||  || |  || ||||||| |||||||||||| ||    
T  22361165 tcgatcagaagtaattgaatatgaggcagcgtagatgacttgaattgctgaaggactatgattttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgt 22361264  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  22361265 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatatctgctatgatggtaaaatagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 22361352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 44 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21025678 - 21025433
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  21025678 tggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaa 21025579  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  21025578 ggtggcttgaattgttgaaagattatgaatttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatggtgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 21025479  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  21025478 gtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 21025433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21750478 - 21750191
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||| | |||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| | |    
T  21750478 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgt 21750379  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| | || ||||| || ||| ||| |   |  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  21750378 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 21750279  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  21750278 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 21750191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 52987311 - 52987206
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  52987311 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 52987212  T
Q  109 atttga 114  Q
    ||||||    
T  52987211 atttga 52987206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 70 - 384
Target Start/End: Original strand, 19759753 - 19760067
Alignment:
Q  70 atttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgg 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  | || ||||| || |||||||  | ||      
T  19759753 atttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaatgaattgaatatgagacaacggaggtggcttgaattgttgaaagattat 19759852  T
Q  170 gattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttg 269  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |  ||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||||||| |  | || || |    
T  19759853 gattttgggttgaattatcatccaggaaaagctaatgttgttgcagatgcgttaagtaggaaaactctacatatgtccgctatgatgatctaagaattgg 19759952  T
Q  270 agttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatag 369  Q
    || |||| || ||||||||| | |||||| | ||||||||  | || |||||||||||  |||| |  ||||| |||||| | || || ||  |||||||    
T  19759953 agctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttagaaatgctgaagattgatagtgaatttatgaatag 19760052  T
Q  370 tatcagagaagcaca 384  Q
    ||| | |||||||||    
T  19760053 tataaaagaagcaca 19760067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Original strand, 20830237 - 20830500
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  20830237 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 20830336  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20830337 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 20830436  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  20830437 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 20830500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 238
Target Start/End: Original strand, 24793456 - 24793665
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  24793456 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgttcgatcagaacgaattga 24793555  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||| ||  |||| ||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  24793556 acatgagacaacgaaggtggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtag 24793655  T
Q  229 gaagacgttg 238  Q
    ||| ||||||    
T  24793656 gaaaacgttg 24793665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 41216702 - 41216815
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41216702 ttgaagatttggaggcattatctatatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41216801  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  41216802 ggcagagaagatgg 41216815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 327
Target Start/End: Original strand, 16077639 - 16077793
Alignment:
Q  173 tttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagt 272  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||    
T  16077639 tttggtttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccttgaggaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagt 16077738  T
Q  273 tgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    | || || ||||| ||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||    
T  16077739 tacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgt 16077793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20915115 - 20915002
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20915115 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttaaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 20915016  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  20915015 ggcaaagaagatgg 20915002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 22134402 - 22134511
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  22134402 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 22134501  T
Q  135 ggcagagaag 144  Q
    |||| |||||    
T  22134502 ggcaaagaag 22134511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 22134567 - 22134625
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  22134567 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggt 22134625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 106
Target Start/End: Original strand, 50619232 - 50619300
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| || ||| ||||||||    
T  50619232 aaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtctgaaatat 50619300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 5296096 - 5296470
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||||||||    
T  5296096 tttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagtctgaaatat 5296195  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5296196 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 5296295  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  5296296 tggttgttgatgcgttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagccttgtttg 5296395  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5296396 tgagttatcacctcagagtatacaattggggatgctgagaattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 5296470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 21472992 - 21472618
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  21472992 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggctctagatttgaggtgtttagtgatcataagagattgaaatat 21472893  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21472892 ttatttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21472793  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||    
T  21472792 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagttccttgaacaatttagagacttgagtcttgtttg 21472693  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     |||||  | ||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  21472692 cgagttgccacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtattagggaagc 21472618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 21563022 - 21563408
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21563022 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatat 21563121  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21563122 ttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21563221  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21563222 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttg 21563321  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || ||||||||||| ||| |||||||| | || || || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  21563322 tgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttga 21563408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 21568881 - 21569267
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21568881 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcaaaaaagtttgaaatat 21568980  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| || |||||||||||||| || || || ||||| || ||||||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  21568981 ttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 21569080  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21569081 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttg 21569180  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || ||||||||||| ||| |||||||| | || || || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  21569181 tgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttga 21569267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 27 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19454791 - 19454428
Alignment:
Q  27 tttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaatt 126  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||    
T  19454791 tttttgttttgaagatttggaggcatgatttgtatggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatatttatttgatcaaaaggaatt 19454692  T
Q  127 gaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagc 226  Q
    ||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19454691 gaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagc 19454592  T
Q  227 aggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtg 326  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  19454591 aggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcaatttagagatttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtg 19454492  T
Q  327 tacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19454491 tgcagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaataatatcagagaagcacaacaagt 19454428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 10467741 - 10468122
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10467741 tggagttggctgcggtggtatttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatattt 10467840  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  |||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  10467841 gtttgatcaaaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 10467940  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  10467941 gttgctgatgctttgagcagaaaaacattgcatatgtctgctttgatgataaaagaatttgagttgctggagcaatttagagacttgagtcttgtctgag 10468040  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  10468041 aattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 10468122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18796081 - 18795707
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || || |||||||||    
T  18796081 tttggagttggctgcggtagtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttccaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaaatat 18795982  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    | ||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||    
T  18795981 tcatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagccaatg 18795882  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  18795881 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggctttaatggtaaaggaatttgagttgcttgaatagtttagagacttgagtcttgtttg 18795782  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| || || ||||||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  18795781 tgaattgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 18795707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15460727 - 15460341
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15460727 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 15460628  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || || | || ||  |||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  15460627 ctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagaattattaaaggattatgattttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatg 15460528  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  15460527 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagttcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctagtgtg 15460428  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || ||  | || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||    
T  15460427 tgaattgtcatcgcaaagtgtgcatttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgagtagtatccgagaagcacaacgagttga 15460341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 14378807 - 14379190
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  14378807 tttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatat 14378906  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  14378907 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 14379006  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||  | ||||| || || || || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||    
T  14379007 tggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctg 14379106  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14379107 tgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagcaagt 14379190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 14380357 - 14380740
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  14380357 tttggagttggctgcggtagtttttgtattgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataagagtctaaaatat 14380456  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  14380457 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggaggtggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 14380556  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||  | ||||| || || || || ||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||    
T  14380557 tggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgccttaatggtgaaagaattcgatttgctagagtagttcagagatttgagtcttgtctg 14380656  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14380657 tgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcgcagcaagt 14380740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Original strand, 19488166 - 19488536
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| |    
T  19488166 gagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggccccatatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatatttct 19488265  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||||| |  ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||| ||    
T  19488266 ttgataaaaaagaattgaatatgaggcaccgaaggtggcttggattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgt 19488365  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  19488366 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgaatatgtctgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgag 19488465  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || |||||||| |||||  |||| |||||| | ||||| | ||| || |||||||||||||| | ||||||    
T  19488466 ttgtcgcctcaaagtgtgaagttaggtatgttgaagatcagcagagagttcttgaatagtattaaagaagc 19488536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 390
Target Start/End: Original strand, 28281707 - 28282086
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| || || || ||||||||||| |    
T  28281707 gagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttgt 28281806  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||| ||    
T  28281807 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaggattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagcaaatgtagt 28281906  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
     || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || ||||| | || ||||||    
T  28281907 cgcggatgcattgagtaggaagacactccatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtgtgtgag 28282006  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    || |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  28282007 ttgtcgcctcaaagcatacagttggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagt 28282086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24365801 - 24365429
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  24365801 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 24365702  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || || ||     
T  24365701 gtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaacgtt 24365602  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||| || | |||||||||||||    
T  24365601 gttgctgatgctttgagcaggaaaaccttgcacatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacattagtcttgtctgtg 24365502  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || ||  |||||||| |||||||||| ||| | || ||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  24365501 aattgtcatctcagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 24365429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19436390 - 19436010
Alignment:
Q  10 ggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattta 109  Q
    |||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19436390 ggagttcgatgcggtggtgtttgttttgaaaacttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcggtgatcataaaagcttgaaatattta 19436291  T
Q  110 tttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtgg 209  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||    
T  19436290 tttgatcagaaggagttgaatatgaggtagaggatatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatgtgg 19436191  T
Q  210 ttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtga 309  Q
    ||||  |||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||  |||| || || |||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  19436190 ttgctaatgcgttgagccggaagacattgcatatgtctgctttgatggtggaggaattcgatttgctagagcagttcaaagatttgagtcttgtctgtga 19436091  T
Q  310 gttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
     ||  | ||||||||||| || ||  | ||||| || ||| | || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  19436090 attgacacctcagagtgttcaattcaggatgctgaaaattcatagtgatttcttgaatagtatctgagaagctcagcaagt 19436010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 19880685 - 19880303
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  19880685 gagttggctgcggtggtttttgtcttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttat 19880586  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| || || ||    
T  19880585 ttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaacgtagt 19880486  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| |||||     
T  19880485 tgcagatgctttgagtagaaagacgttgcacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagccttgtttgtgaa 19880386  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    || || || |||||||| |||||||| ||| | || || || |  || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  19880385 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgagtagtatcagagaagcacaacaggttga 19880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Original strand, 34644480 - 34644850
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  34644480 gagttggctgcggtggtctttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccaggttcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttat 34644579  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||  || ||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  34644580 ttgaccagaaggagttgaacatgagacagaggagatggctagagttattgaaggattatgagtttgggttgaactatcatccgggtaaagctaatgtagt 34644679  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || |||    
T  34644680 tgcagatgccttgagtagaaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgcgag 34644779  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || || || |||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||| ||||||| ||||||||    
T  34644780 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttggatagtattagagaagc 34644850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23079856 - 23079540
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| || |||||||||||||| |    
T  23079856 gagttggctgctgtggtttttgtattgaaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgt 23079757  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    || |||| || |||||||||||||  ||| |||| |||||| | ||||||| || ||  |||||| |||| || || ||| | | |||||||||||| ||    
T  23079756 tttatcataaggaattgaatatgaaacagcgaaggtggctcaaattgttgaaggattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgttgt 23079657  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | || || || ||||||||| | |||||| | ||||| |||    
T  23079656 tgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagtttaattttctggaacagtttagagatttgagtttagtctgcgag 23079557  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgt 327  Q
    || ||  ||||||||||    
T  23079556 ttgtcatctcagagtgt 23079540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22443654 - 22443281
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||| | |    
T  22443654 gagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgt 22443555  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||  | ||  || ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  22443554 ttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgt 22443455  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||  | || ||||||    
T  22443454 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgag 22443355  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |  || |||||||||||  |  |||||||||| |||||| | || || ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22443354 tggtcacctcagagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcaca 22443281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22435256 - 22434883
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||| | |    
T  22435256 gagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatctgt 22435157  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||  | ||  || ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  22435156 ttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaactatcatccgggtaaagctaatgttgt 22435057  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||  | || ||||||    
T  22435056 tgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatagttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgag 22434957  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |  || |||||||||||  |  |||| ||||| |||||| | || || ||  |||| ||||||| |||||||||    
T  22434956 tggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcaca 22434883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 393
Target Start/End: Original strand, 1541996 - 1542360
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  1541996 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 1542095  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||||| | || ||  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  1542096 atatgaggcagcgtagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcg 1542195  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || ||||||||| |  ||||| | || ||||| |  || |||||||||||     
T  1542196 gaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 1542295  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
     |  |||||||||| |||||| | || || ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  1542296 aaactgggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttga 1542360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 29590832 - 29591092
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  29590832 tttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 29590931  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  29590932 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 29591031  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  29591032 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 29591092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27188805 - 27188563
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27188805 tttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27188706  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27188705 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27188606  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgag 271  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||    
T  27188605 gaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgag 27188563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 271
Target Start/End: Original strand, 27260435 - 27260677
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27260435 tttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27260534  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27260535 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27260634  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgag 271  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||    
T  27260635 gaagacgttgcatatgtccgccatgatggtcagagagtttgag 27260677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 22761349 - 22761614
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | | |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  22761349 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgagatatttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 22761448  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| || ||||||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||    
T  22761449 ttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtatatggcttgaattgttgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 22761548  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22761549 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaggagttcgagttgct 22761614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 2873715 - 2873975
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  2873715 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 2873814  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  2873815 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtag 2873914  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  2873915 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 2873975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 19866056 - 19865796
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19866056 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttcaggtgtttagtgatcacaagagcctaaaatatttgtttgatcagaaagaattga 19865957  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || || ||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  19865956 atatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgctgatgccttgagtag 19865857  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || |||||||||    
T  19865856 gaaaacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagttcgagctgcttgaacagtttaga 19865796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 125 - 379
Target Start/End: Original strand, 8761941 - 8762195
Alignment:
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8761941 ttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgccttga 8762040  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    | ||||| ||| |||| ||||||||| | ||||| || || || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||    
T  8762041 gtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaattgacacctcagag 8762140  T
Q  325 tgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaa 379  Q
    ||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||| |||||    
T  8762141 tgttcagttggggatgctgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaa 8762195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 349
Target Start/End: Original strand, 28262124 - 28262429
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28262124 tggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 28262223  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    ||||||| |||||| | | || ||  || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28262224 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 28262323  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || ||||| ||| |  ||||| | || ||||| |  ||||||||||||||  |  ||||||||||     
T  28262324 gtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgctg 28262423  T
Q  344 aagatt 349  Q
    ||||||    
T  28262424 aagatt 28262429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 349
Target Start/End: Original strand, 28340873 - 28341178
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28340873 tggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaa 28340972  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    ||||||| |||||| | | || ||  || |||||||| ||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  28340973 gatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttaaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatat 28341072  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    |||||| |||||||| |  ||||| ||||| || || ||||| ||| |  ||||| | || ||||| |  ||||||||||||||  |  ||||||||||     
T  28341073 gtctgccatgatggtcagagagttcgagttacttgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcgcctcagagtgtgaaactgggtatgctg 28341172  T
Q  344 aagatt 349  Q
    ||||||    
T  28341173 aagatt 28341178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 24312080 - 24312340
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  24312080 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 24312179  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||| ||||| | ||||| ||    
T  24312180 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtttcagattccttgagtag 24312279  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||| || |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  24312280 gaagacattgcatatgtccgccatgattgttagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 24312340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25113921 - 25113692
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  25113921 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 25113822  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||| | |||||||| ||||||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  25113821 acatgaggcagcgtagatggctagagttgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 25113722  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25113721 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 25113692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15897450 - 15897099
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  15897450 atttggagacattacttgtatggttctagatt-gaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaatgaattgaatatgagacaac 15897352  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  15897351 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 15897252  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||| || |||||| | || || ||||||||||| || ||||||||| | |||||  | ||||||||  | || |||||||||||  |||| || |||    
T  15897251 tatgtccgcgatgatgatcaaagaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatg 15897152  T
Q  341 ctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    || |||||| | || || |||||||| ||||| | |||||||||  |||||||    
T  15897151 ctgaagattgatagtgaattcttgaacagtattaaagaagcacaaaaagttga 15897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 18406838 - 18407125
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  18406838 gagttggctgctgtggtctttgtattaaaaatatggagacgttacttgtatggttcgagatttgatgtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 18406937  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||| ||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| ||||||||| || ||    
T  18406938 tcgatcagaaggaatggaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaacgttgt 18407037  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    || ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  18407038 tgtagacgctttgagcaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 18407125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 51 - 298
Target Start/End: Original strand, 20636235 - 20636482
Alignment:
Q  51 attatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggct 150  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20636235 attacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 20636334  T
Q  151 cgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgct 250  Q
     || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||    
T  20636335 tgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttacatatgttcgct 20636434  T
Q  251 atgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  20636435 atgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 20636482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 27564733 - 27564962
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || || || || ||||| || |||||||| |||||||    
T  27564733 tttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27564832  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27564833 atatgaggcagcgaagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagcag 27564932  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  27564933 gaagacattgcatatgtccgctttgatggt 27564962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 393
Target Start/End: Original strand, 5838113 - 5838495
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| ||||  ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  5838113 gagttggccgcggtagttttcgtgttgaagatttggagacactacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 5838212  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | | | | ||  |  ||||| |  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||    
T  5838213 tcgaccagaaagaattgaatatgagacagagaaggtggctagaatcgctaaaggactatgatttcgaattgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 5838312  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || |||||||||||| |  ||||| | || |||||     
T  5838313 tgcagatgccttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgagcagtttagagatatgagtttggtttgtgaa 5838412  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |  || ||||| |||||  |  |||||||||| |||||| | || |||||  ||||||||||||  ||||||||  |||||||    
T  5838413 tggtcacctcatagtgtgaaactgggtatgctgaagattgatagtgattttctgaatagtatcaaggaagcacagaaagttga 5838495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18449870 - 18449632
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||     
T  18449870 aaaatttggaggagttatctgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaaatatttatttgacgagaaagaattaaatatgaggt 18449771  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    || |||| ||||| || ||| | | || ||   |||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||    
T  18449770 agtgaaggtggcttgaattgctaaaggattataatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcatatgctttaagtaggaaaacatt 18449671  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  18449670 acatatgtctgctatgatggttaaagagttggagttgct 18449632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 41 - 234
Target Start/End: Original strand, 18196657 - 18196850
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  18196657 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagc 18196756  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||| |||||||| |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||  |||||| || || ||||||||    
T  18196757 gaaggtggctcgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttatagatgccttaagtaggaagac 18196850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 16962357 - 16962617
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || | |||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  16962357 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 16962456  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| | | || ||  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  16962457 atatgaggcagcgtagatggcttgaattgctaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttggagatgcattgagtag 16962556  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  16962557 gaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttactggaacagtttaga 16962617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Original strand, 18966219 - 18966524
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18966219 atttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagc 18966318  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || || ||||  | ||  |||||| | |||||||| |||   | |||||||||    |||| ||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  18966319 gaaggtggcttgaattattgaaagattatgatttttggttgaattatcatctaggtaaagctaa---cgttgtagatgctttaagtaggaaaactctaca 18966415  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||||||||||||||  || ||||| ||| |||| || ||||||||| || ||||| | |||| ||| || || |||||||||||  |||| || |||    
T  18966416 tatgtctgctatgatggctaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctatgaattgtcacctcagagtgtgaagttaggaatg 18966515  T
Q  341 ctaaagatt 349  Q
    || ||||||    
T  18966516 ctgaagatt 18966524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 235 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25769354 - 25769208
Alignment:
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttg 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  25769354 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttctttgtgagttatcacctcagagtgtgcagtag 25769255  T
Q  335 ggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| | ||||| || || |||||||| || | |||||| |||||    
T  25769254 ggtatgttgaagatcaatagtgatttcttaaacaatatcagggaagc 25769208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Original strand, 16381291 - 16381554
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16381291 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16381390  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16381391 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 16381490  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  16381491 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 16381554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 16926550 - 16926812
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttcca-gatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattg 127  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| ||||||||| || | |||||| ||| | || |||||||| ||||||    
T  16926550 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaaggtttgaagtgtttagtgatcacaagactttgaagtatctgttcgatcagaaggaattg 16926649  T
Q  128 aatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgac-ggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagc 226  Q
    ||| ||||| || | |||||||| || ||| | |  || ||  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  16926650 aatgtgagggagcgtagatggcttgaattgctaaaaggattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgcattgagt 16926749  T
Q  227 aggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||    
T  16926750 aggaagtcattgcacatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttactggaacagtttaga 16926812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 16621992 - 16622098
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16621992 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16622091  T
Q  129 atatgag 135  Q
    |||||||    
T  16622092 atatgag 16622098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 298
Target Start/End: Original strand, 25608773 - 25609042
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| || ||| |||| ||| | || ||| |||| |||||||    
T  25608773 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtctgaagtatctgttcgattagaaggaattga 25608872  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| |||  ||| ||||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  25608873 atatgagacagcaaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagacgccttgagtag 25608972  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| | || ||||||||| | ||||||    
T  25608973 gaagactttgcatatgtctgctatgatggttagagagttcgagttgttggaacagtttagagatttgagt 25609042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Original strand, 16625773 - 16625889
Alignment:
Q  173 tttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagt 272  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||    
T  16625773 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagt 16625872  T
Q  273 tgctagagcagtttaga 289  Q
    |||| || |||||||||    
T  16625873 tgcttgaacagtttaga 16625889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 22077769 - 22077871
Alignment:
Q  196 taaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttg 295  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||    
T  22077769 taaagctaatgttgttgcagatactttgagtaggaagactttgcatatgtccgctataatgataaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 22077868  T
Q  296 agt 298  Q
    |||    
T  22077869 agt 22077871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 14624275 - 14624388
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14624275 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14624374  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  14624375 ggcagaggagatgg 14624388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21754605 - 21754481
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||| || || || || ||||| |    
T  21754605 gagttggcggctgaggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgt 21754506  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgag 135  Q
    | |||||||||||| ||||||||||    
T  21754505 tcgatcagaaagaactgaatatgag 21754481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23997611 - 23997348
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||| || |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  23997611 ttgaagatttgaaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 23997512  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    ||||||| |||||| | || |   | |||| ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  23997511 ggcagaggagatggttggaatatcttacggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 23997412  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  23997411 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcaatttcgagacttgagt 23997348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16099372 - 16099259
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| | ||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  16099372 ttgaagatttggaggcattatctgtatgattctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16099273  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  16099272 ggcagagaagatgg 16099259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16234391 - 16234278
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  16234391 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 16234292  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  16234291 ggcaaagaagatgg 16234278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 70 - 286
Target Start/End: Original strand, 16648922 - 16649138
Alignment:
Q  70 atttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgg 169  Q
    |||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |   | | || ||      
T  16648922 atttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggatttt 16649021  T
Q  170 gattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttg 269  Q
    ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |    
T  16649022 gattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttgg 16649121  T
Q  270 agttgctagagcagttt 286  Q
    | ||| | |||||||||    
T  16649122 aattgattgagcagttt 16649138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21928568 - 21928305
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| || || ||||||||||| || || |||||||    
T  21928568 ttgaagatttggaagcattatatgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaatgagttcaatatga 21928469  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||| ||| | ||||   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||    
T  21928468 ggcagagaaggtggttggagtatcttaaggatttcgattttcagttgagttatcatcccgggaaggcaaatgttgttgccgacgctttgagtagaaagac 21928369  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  21928368 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgaattgattgagcagtttcgagacttgagt 21928305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Original strand, 1647732 - 1647838
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  1647732 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 1647831  T
Q  135 ggcagag 141  Q
    |||||||    
T  1647832 ggcagag 1647838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 18836991 - 18837089
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  18836991 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 18837089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14129832 - 14129719
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||  ||||| |  ||| ||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  14129832 ttgaagatttggaggcattatatgtttggttctaagttttaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14129733  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  14129732 ggcaaagaagatgg 14129719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 35275004 - 35275117
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  35275004 ttgaagatttggagtcattatctgtatggttctaagtttgatgtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcaaaaagagttgaatatga 35275103  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||| ||||    
T  35275104 ggcaaagaacatgg 35275117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Original strand, 23026635 - 23026747
Alignment:
Q  36 tgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgag 135  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||     
T  23026635 tgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaa 23026734  T
Q  136 gcagagaagatgg 148  Q
    ||| |||||||||    
T  23026735 gcaaagaagatgg 23026747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 1647897 - 1647995
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  1647897 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatgtgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 1647995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 18574492 - 18574439
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18574492 agtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatgg 18574439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18572851 - 18572751
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatgg-taaag-gagtttgagttgctagagcagtttagatacttgag 297  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||| || |||||||    
T  18572851 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctttgatggttaaagagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgag 18572752  T
Q  298 t 298  Q
    |    
T  18572751 t 18572751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 276
Target Start/End: Original strand, 27330537 - 27330592
Alignment:
Q  221 ttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27330537 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgct 27330592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 276
Target Start/End: Original strand, 27391277 - 27391332
Alignment:
Q  221 ttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27391277 ttgagtaggaagacttttcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgct 27391332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16099248 - 16099150
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  16099248 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgaaggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 16099150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 18836826 - 18836939
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||| || |||| ||||||||||    
T  18836826 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatgaggaagagttgaatatga 18836925  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  18836926 ggcaaagaagatgg 18836939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Original strand, 23026796 - 23026897
Alignment:
Q  197 aaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttga 296  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||| |  ||||| ||||| |||| |||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||    
T  23026796 aaagctaatgttgttgttgatgctttgagtataaagactttgcatatgtttgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttga 23026895  T
Q  297 gt 298  Q
    ||    
T  23026896 gt 23026897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 147
Target Start/End: Original strand, 19986400 - 19986452
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatg 147  Q
    |||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19986400 agtttgaagtacttcttcgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatg 19986452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4307 - 3926
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  4307 tttggagttagctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccaaatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttgaactat 4208  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  4207 ttatttgatcagaaagaaatgaacatgaggcagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatg 4108  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4107 tggttgcagatgcgttgagcatgaaggcgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaattcaatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 4008  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  4007 tgagttgtcacctcaga--gtacagttgggaatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcacagcaagt 3926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 39 - 298
Target Start/End: Original strand, 42887 - 43146
Alignment:
Q  39 aaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggca 138  Q
    |||||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| || ||||| ||    
T  42887 aaatttggaggcattatctgtgcggttctagatttgaagtgttcagtaatcataaaagtttgaagtatttattctaccagaaagaattaaacatgagaca 42986  T
Q  139 gagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttg 238  Q
    | |||| ||||| || ||| | |  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||     
T  42987 gcgaaggtggctagaattgctaaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtcgttgcagatgctttaagtaggaaaacatta 43086  T
Q  239 cacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    || ||||||| ||||||||| || ||||| ||||| || || ||||| ||| ||||||||    
T  43087 catatgtctgttatgatggttaaagagttggagtttcttgaacagttcagagacttgagt 43146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 148
Target Start/End: Original strand, 11981 - 12085
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| | |    
T  11981 tggagacattatttgtatgggtcgaggtttgaggtgtttagcgaccataagagcttgaaatatttgtttgatcaaaaggagttgaatatgagacagcgga 12080  T
Q  144 gatgg 148  Q
    |||||    
T  12081 gatgg 12085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 300 - 683
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  300 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 399  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||  | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  400 ttatttgataagaaggaattgaacatgaggcagaggagatgcttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatg 499  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  500 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctg 599  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||    
T  600 tgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcacaacaagt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13588 - 13350
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  13588 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatctgtttgatcaaaaggaattgaatatga 13489  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    ||||| | |||||||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| ||| | |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13488 ggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtcaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 13389  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
     ||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13388 tttgcataagtctgccatgatggtaaaggagttcgagtt 13350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7574 - 7287
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||| || ||||| ||| | |    
T  7574 gagttggctgttgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagcttgaagtatctgt 7475  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||   |||||||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  7474 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcatagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7375  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  7374 tgcagacgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaatgagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 23541 - 23455
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| |||||| | |||||||||    
T  23541 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggagttgattgagcagttt 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23646 - 23593
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  23646 agtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 23593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 436 - 817
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||    
T  436 tttggagttggctgcagtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttatacggttccagatttgaagtatttagtgaccataaaagtttaaaatat 535  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  536 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggctagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattacca-tcgggtaaagcaaatg 634  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  635 tggttgcagatgccataagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 734  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  735 tgagttgacacctcagactgtacagttggggatgatgaagattaa-tgtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23277934 - 23277551
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||||    
T  23277934 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagttatcacaaaagtttaaaatat 23277835  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  23277834 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 23277735  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23277734 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatctgctatagcagtttagagacttgagtcttgtctg 23277635  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  23277634 tgagttgacacctcagagtgttcagttggggattctgaagattaacagtgacttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 23277551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 23099303 - 23099689
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  23099303 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggagacattatttgtacggttctcgatttgaggtgtttagcgatcacaaaagtttgaaatat 23099402  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||| | || |||||||||||||| || || || ||||| || ||| ||| || ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23099403 ttgtttgattaaaaggaattgaatatgagacaaaggaggtggcttgaattgatgaaggattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 23099502  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  23099503 tagttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttg 23099602  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || ||||||||||| ||| |||||||| | || || || || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  23099603 tgaattgtcacctcagagtgtgcagctgggtatgttgaaaatcaatagtgatttcttgaaaagtatcagagaagcgcaacaagttga 23099689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23295093 - 23294719
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||    
T  23295093 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatatggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctgaaatat 23294994  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||     
T  23294993 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatt 23294894  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| || ||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23294893 tggtggcagatgcgttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgatttgttatagcagtttagagacttgagccttgtctg 23294794  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| ||  | ||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23294793 tgaattgacacctcagagtattaagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 23294719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 24949744 - 24949371
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  24949744 gagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttat 24949645  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  24949644 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttggtttgaattaccattctggtaaagccaatgtggt 24949545  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  24949544 tgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagaacagtttagagacttgagccttgtctgtgaa 24949445  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||  | | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  24949444 ttgacacttcagagtgttcagttggggatgctgaagattatcagtgatttcttagatagtatccgagaagcaca 24949371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 27209457 - 27209843
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  27209457 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 27209556  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | ||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  27209557 ctgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcaaaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 27209656  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||  |||||||| |||||||||| || ||    
T  27209657 tagtcgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtccgccttgatggtaaaggaattcgaattgctcgaatagtttagagacttgagtctcgtatg 27209756  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27209757 tgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 27209843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 19651335 - 19651718
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  19651335 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 19651434  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| ||||||  |  |  ||||||||||||||||||||| |    ||||||||||    
T  19651435 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcctaggaaagctaatg 19651534  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||| |||| |||||||||   ||||| || || || || |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  19651535 tggttgcagatgccttaagtaggaaaacgctgcatatgtctgcttcaatggtgaaagaattcgatttgctatagcagttcagagatttgagtcttgtctg 19651634  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  19651635 tgaattgacacctcagagtgttcaattggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 19651718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20829415 - 20829043
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  20829415 tggagttagctgcggtggtttttgtcttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 20829316  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | | | || ||||||    
T  20829315 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagttactgaaagattttgattttggcttgaattaccatcctggtgaggccaatgtg 20829216  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  20829215 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 20829116  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  20829115 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 20829043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23111894 - 23111517
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||  | |||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  23111894 tttggagttggctgttgtggttttcgtgttgaaaattttgaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatat 23111795  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||  |  |||||| |||||||||| ||| |   |||||| ||||    
T  23111794 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagccaatg 23111695  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||| |  |||||||||| ||    
T  23111694 ttgttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttttagttgcttgaagagtttagagatctgagtcttgtttg 23111595  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| || ||||||| |||  ||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||| | |||||||||    
T  23111594 tgagttgtcacctcagattgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacagtattaaagaagcaca 23111517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1064907 - 1064535
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1064907 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 1064808  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  1064807 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 1064708  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  1064707 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 1064608  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||  |||||||    
T  1064607 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 1064535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31831814 - 31831450
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  31831814 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 31831715  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  31831714 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 31831615  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  31831614 gttgctgatgctttgagtaggaaaactttacacatgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 31831515  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatc 373  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| ||||||    
T  31831514 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatc 31831450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12575511 - 12575128
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  12575511 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttatatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 12575412  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12575411 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggcaaagctaatg 12575312  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  12575311 tagtcgcggatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtatg 12575212  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  12575211 tgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgatttcctgaatagaatccgagaagcacaacaagt 12575128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 27788898 - 27788516
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  27788898 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 27788799  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  27788798 ttgtttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 27788699  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | || || ||||| ||  | || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  27788698 tagtcgctgatgcattgagtaggaagacact-catatgtctgctatgatgatgaaagaatttgatttattggaacagtttagagacatgagtttggtgtg 27788600  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  27788599 tgagttgtcgcctcaaagcatacagttggggatgctaaagattaacagcgatttcctgaatagtattcgagaagcacagcaagt 27788516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25264212 - 25264029
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  25264212 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatat 25264113  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccat 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |  |  |||||||||||||||||||||    
T  25264112 ttatttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagactatgattttggtttgaattaccat 25264029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 10869986 - 10869726
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  10869986 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 10869887  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  10869886 atatgaggcagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtctgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 10869787  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  10869786 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 10869726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27372405 - 27372145
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27372405 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27372306  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27372305 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27372206  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  27372205 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgagttgcttgaacagtttaga 27372145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24711164 - 24710850
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  24711164 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatga 24711065  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24711064 gacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 24710965  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttg 334  Q
     ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||  |  ||    
T  24710964 attgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtgaaactg 24710865  T
Q  335 ggtatgctaaagatt 349  Q
    |||||||| ||||||    
T  24710864 ggtatgctgaagatt 24710850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 22324163 - 22324392
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  22324163 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 22324262  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  22324263 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 22324362  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  22324363 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 22324392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16926496 - 16926236
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16926496 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16926397  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16926396 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16926297  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  16926296 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 16926236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17000136 - 16999876
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  17000136 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 17000037  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  17000036 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16999937  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  16999936 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 16999876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16924025 - 16923765
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16924025 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16923926  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16923925 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16923826  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  16923825 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 16923765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16983288 - 16983028
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16983288 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16983189  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16983188 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16983089  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  16983088 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 16983028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 44384876 - 44385136
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  44384876 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 44384975  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  44384976 atatgaggcagcgaaggtggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 44385075  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  44385076 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 44385136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 45533499 - 45533183
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||    
T  45533499 gagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttat 45533400  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||  |||||||||| |||||||||||| |||| ||| | || ||| | | || ||  ||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||    
T  45533399 ttgacaagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggtttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgt 45533300  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||  |||| ||| |||||||| | || |||||     
T  45533299 tgcagatgctttaagtaggaaaacattaaatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaatagttcagagacttgagtttggtttgtgaa 45533200  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgt 327  Q
     | ||||| ||||||||    
T  45533199 gtgtcgccacagagtgt 45533183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 23107019 - 23107281
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  23107019 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctat 23107118  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||| | | || ||| |||  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||  |||||||||||| ||    
T  23107119 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagatagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgcgtaaagctaatgttgt 23107218  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  23107219 tacagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagtt 23107281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 374
Target Start/End: Original strand, 30011473 - 30011834
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |||||||    
T  30011473 gagttagctgcagtggtttttgtacttaaaatttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaattttgaagtatttat 30011572  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||| | | || ||  ||||| || || ||||||||| ||  ||| |||||||| ||    
T  30011573 ttgaccagaaagaattaaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttaaattaccatccgagtaaggctaatgttgt 30011672  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||||| ||| || ||||| || ||  ||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||| | || |||||     
T  30011673 tgcagatgttttaagtaggaaaacatt--acatgtctgctatgatggttagagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaa 30011770  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatca 374  Q
     | ||||| ||||||||  | ||||| ||| | ||||| |||| ||| || ||| |||||||||    
T  30011771 gtgtcgccacagagtgtgaaattggggatgttgaagatcaacaacgaatttttggatagtatca 30011834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 41607692 - 41607952
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||  || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  41607692 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcgcaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 41607791  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  41607792 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 41607891  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  41607892 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 41607952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27219152 - 27218923
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || |||||||| |||||||    
T  27219152 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaggtatttgttcgatcagaaggaattga 27219053  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27219052 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27218953  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  27218952 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27218923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24676625 - 24676365
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  24676625 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaaaagcttgaaatatttgttcgatcagaaagagttga 24676526  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || || |    ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24676525 atatgaggcagcgtagatggctcgaattatttaaaaattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 24676426  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||    
T  24676425 gaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttaga 24676365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24263506 - 24263279
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  24263506 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 24263407  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24263406 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 24263307  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatg 256  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24263306 gaagacattgcatatgtccgctatgatg 24263279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 21144348 - 21144577
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  21144348 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 21144447  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  21144448 atatgagacagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 21144547  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  21144548 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 21144577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 68 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 17064814 - 17064593
Alignment:
Q  68 agatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggctt 167  Q
    ||||| || |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  17064814 agattggaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggatt 17064715  T
Q  168 gggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
      || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  |||||    
T  17064714 atgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagtt 17064615  T
Q  268 tgagttgctagagcagtttaga 289  Q
     || ||||| || |||||||||    
T  17064614 cgaattgcttgaacagtttaga 17064593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 24876056 - 24876285
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  24876056 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgagatttgaggtgtttagtgatcacaggagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattga 24876155  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| |   |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  24876156 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 24876255  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  24876256 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 24876285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Original strand, 30210221 - 30210522
Alignment:
Q  25 ggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaa 124  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30210221 ggtttttgtacttaaaatttggagacattatctgtatggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaa 30210320  T
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    || |||| ||||||  |||| ||||| || ||| | | || ||  ||||| || |||||||||||| ||| ||  |||||||| ||| |||||||||| |    
T  30210321 ttaaatacgaggcatcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtatggctaatgttgttacagatgctttaa 30210420  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    | ||||| ||  | || ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||  | ||||| ||| |||||||| | || |||||  | ||||| |||||    
T  30210421 gtaggaaaac-atacatatgtctgctatgatggttagagagttggagttgctttaacagttcagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccacagag 30210519  T
Q  325 tgt 327  Q
    |||    
T  30210520 tgt 30210522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 24706771 - 24707049
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || || || || ||||| |    
T  24706771 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 24706870  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||  | ||  || ||||||||||||||  || |   ||| ||||||||  |    
T  24706871 tcgatcagacagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattattatccaagtaaggctaatgtttt 24706970  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||    
T  24706971 tgcagatgccttgagcaggaagacattgcatatgtccgcattgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttaga 24707049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 21324573 - 21324833
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  21324573 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgaccagaaggaattga 21324672  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| |  |  |  || |||||||||||||| ||| | | ||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||    
T  21324673 atatgaggcagcgaagatggcttgaattgttaaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgttgttgtagacgccttgagtag 21324772  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||    
T  21324773 gaagactttgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttaga 21324833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23067360 - 23067258
Alignment:
Q  196 taaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttg 295  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | |||    
T  23067360 taaagctaatgttgttgcagacgctttgagtagaaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttg 23067261  T
Q  296 agt 298  Q
    |||    
T  23067260 agt 23067258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22279235 - 22279122
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22279235 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatatatttgatcagaaagaattgaatatga 22279136  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  22279135 ggcagagaagatgg 22279122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 267
Target Start/End: Original strand, 12639546 - 12639778
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12639546 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 12639645  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  12639646 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcaattgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcagatgctttgagtagaaagac 12639745  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  12639746 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtt 12639778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 23072984 - 23072884
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  23072984 tggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 23072885  T
Q  144 g 144  Q
    |    
T  23072884 g 23072884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 24830501 - 24830614
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  24830501 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 24830600  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  24830601 ggcagaggagatgg 24830614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25129739 - 25129630
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  25129739 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgaccaaaaagagttgaatatga 25129640  T
Q  135 ggcagagaag 144  Q
    ||||||||||    
T  25129639 ggcagagaag 25129630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 22760882 - 22760995
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||  |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22760882 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttataagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcaaaaagagttgaatatga 22760981  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||||| |||||||    
T  22760982 ggcagaaaagatgg 22760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 24830666 - 24830764
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||| ||| || ||||||||    
T  24830666 gctaatgttgttacggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcaatttcgagacttgagt 24830764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 147
Target Start/End: Original strand, 17967152 - 17967189
Alignment:
Q  110 tttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatg 147  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17967152 tttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatg 17967189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 24569149 - 24569213
Alignment:
Q  203 aatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24569149 aatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggtgaaagagtt 24569213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 33 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 3120 - 2763
Alignment:
Q  33 ttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatat 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3120 ttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtttaaaatatttatttgatcagaaataattgaacat 3021  T
Q  133 gaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaag 232  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  3020 gaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatctgggtaaagccaatatggttgcagatgcgctgagcaggaag 2921  T
Q  233 acgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagt 332  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| || || || || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||    
T  2920 atgttgcatatgtctgctatgatggtgaaagaattcgatttgctagagtagtttagagacttgagtcttgtctgtgaattgacacctcagagtgtacagt 2821  T
Q  333 tgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2820 tggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 28076 - 27708
Alignment:
Q  13 gttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttattt 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28076 gttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtacggctccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctattt 27977  T
Q  113 gatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttg 212  Q
    || || || |||||||| |||||||| |||| |||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  27976 gaccaaaaggaattgaacatgaggcaaagaatatggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttg 27877  T
Q  213 cagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || || |||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  27876 cagatgctttgagcaggaagacgtttcacatgtctgctatgatggtaaaagagtttgagctacttgaacaatttagagacttcagtcttgtttgtgagtt 27777  T
Q  313 atcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27776 gtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatcagagaagc 27708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35028 - 34645
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  35028 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggagacattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 34929  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  34928 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatg 34829  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || | |||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||    
T  34828 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacactgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttg 34729  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  34728 tgaattgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 34645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 122 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28660 - 28392
Alignment:
Q  122 gaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctt 221  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  28660 gaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgt 28561  T
Q  222 tgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctca 321  Q
    |||||||||||||  |||| || | |||| ||||||| ||  | ||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||  | |||||    
T  28560 tgagcaggaagacactgcatatatgtgctttgatggtgaaataatttgatttgctagagtagtttagagatttgagtcttgtttgtgaattgacacctca 28461  T
Q  322 gagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  28460 gagtgtacagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 28392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 381
Target Start/End: Original strand, 94 - 271
Alignment:
Q  195 ataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatactt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | | | ||||    
T  94 ataaagctaatgtggttgcagatgctttaagcaggaagacgttgcacatgtttgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgaacaactcaaagactt 193  T
Q  295 gagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||||| |||||| |  | |||         ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  194 gagtcttgtttgtgagctgccacct---------cagttgggtatgctaaagattaatagtgatttcttgaatagtattagagaagc 271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 3701 - 4078
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  3701 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttgcagacttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 3800  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  3801 ttatttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccacccgggtaaagctaatg 3900  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  3901 tggttgcagatgccttgagtagcaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagcattttagagacttgagtcttgtttg 4000  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4001 tgaattgacaccttagagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 4078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 68928 - 68542
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||    
T  68928 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcatgatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaattat 68829  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  68828 ttgtttgatcataaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 68729  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  68728 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgaatttcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttg 68629  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  68628 tgaattgtcacctcagagtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 68542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 12656 - 13032
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  12656 tttggagttggctgtggtggttttcgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 12755  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||||||||||   | |||||| ||||    
T  12756 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaagccaatg 12855  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||| ||| | ||||| |||||||| | |||||       ||||||||||||    
T  12856 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctcctttgatggtgaagcaatttgaattgctagaactgttta-------gagtcttgtctg 12948  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  12949 tgagttgtcacctcagagtatacagttgggtatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatacgagaagcacaacaagt 13032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 150127 - 149751
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| | | | ||||| |||||| | ||||||    
T  150127 tttggaattggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattacttgtacggttcctgatttgaagtattttgggatcacaaaagtctaaaatat 150028  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  150027 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagc-aatg 149929  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  149928 tggttgcagatgcgttgagcaggaagacattgaatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 149829  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  149828 tgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcaca 149751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 194452 - 194835
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |   ||||||| |||||| | ||||||    
T  194452 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagattttaagtattcggtgatcacaaaagtctaaaatat 194551  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  194552 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggaggtgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 194651  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||   ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  194652 tggttattgatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgagttgctagagtagtttagatacttgagtcttgtttg 194751  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
     || ||  | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  194752 cgaattgacacctctgagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtattcgagaagcacaacaagt 194835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 327
Target Start/End: Original strand, 25318 - 25601
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  25318 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtttgaataatttatttgatcagaaagaattgaatatgagacaacgaa 25417  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||    ||  |||||||| |||||||| ||| | | ||||| |||||| |||||||||||  | || |||||||||||||| ||    
T  25418 ggtggcttgaattgttgaaatattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgttgttgcagatgccctaagtaggaagacgttgcatat 25517  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||| ||  | || |||||||||||    
T  25518 gtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgt 25601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 181454 - 181341
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || | |||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  181454 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagattttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 181355  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||  ||||||||    
T  181354 ggcaatgaagatgg 181341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 125 - 390
Target Start/End: Original strand, 89311 - 89576
Alignment:
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  89311 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 89410  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  89411 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaacgaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagag 89510  T
Q  325 tgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  89511 tgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 89576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 125 - 390
Target Start/End: Original strand, 89989 - 90254
Alignment:
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  89989 ttgaatatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggttgcagatgctttga 90088  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  90089 gcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgagttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttatcacctcagag 90188  T
Q  325 tgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  90189 tgtacagttgggtatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 90254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 55650 - 56022
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  55650 tggagttggctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgatcataagagtatgaaatattt 55749  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| || ||||||||| | | |||||| ||||||    
T  55750 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttcaattaccatcctggtaaagccaatgtg 55849  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  55850 gttgcagatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttgtg 55949  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  55950 agttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaaaattaatagtaatttcttgaatagtatccgagaagc 56022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Original strand, 32429 - 32799
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  32429 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttat 32528  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| ||    
T  32529 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 32628  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  32629 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaa 32728  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || || || |||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  32729 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 32799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 41788 - 41525
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41788 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 41689  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  41688 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 41589  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  41588 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 41525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 10805 - 11188
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  10805 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatat 10904  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  10905 ttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatg 11004  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11005 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctacgatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 11104  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  11105 tgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagcgcagcaagt 11188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 14575 - 14958
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  14575 tttggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaattttgaggcattacttgtacggatccagatttgaagtatttagtgatcacaaaaatttaaaatat 14674  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  14675 ttatttgattggaaagagttgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatg 14774  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14775 tggttgcagatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctaagatggtaaaagaatttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctg 14874  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || |||||    
T  14875 tgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtattcgagaagcgcagcaagt 14958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21158
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  21541 tttggagttggctgcggttgtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcataaaagtctaaaatat 21442  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||| || |    
T  21441 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatttggggaaagccaacg 21342  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||  || ||||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  21341 tggtgtcaaatgcgatgagcaagaggacgttgcatatgtctgctatgatggtgaaagaatttgatttgctagagccatttagagaattgagtcttgtctg 21242  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21241 tgagttgacacctcagagtgttcagttgggaatgctgaagattaacattgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 21158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 6097 - 6464
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  6097 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatat 6195  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || ||  ||| | |||                  ||||||||||    
T  6196 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatgatctgggt------------------aaagctaatg 6277  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6278 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagacttgagtcttgtctg 6377  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  6378 tgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttga 6464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 10528 - 10895
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  10528 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatgtggaggcattattta-acggttccagatttgaagtgtttagtgatcacaaaagtctgaaatat 10626  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || ||  ||| | |||                  ||||||||||    
T  10627 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgaagatggcttgagctgttgaaggattatgatctgggt------------------aaagctaatg 10708  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10709 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttcctagaacagtttagagacttgagtcttgtctg 10808  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10809 tgagttgtcacctcagagtgtccagttgggtatgttgaagaataatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagttga 10895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 24619222 - 24619596
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  24619222 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatat 24619321  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  24619322 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatg 24619421  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  24619422 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttg 24619521  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  24619522 tgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 24715453 - 24715827
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  24715453 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatat 24715552  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  24715553 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatg 24715652  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  24715653 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttg 24715752  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  24715753 tgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24715827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 24748481 - 24748855
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  24748481 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctagaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtctaaaatat 24748580  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  24748581 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttgacttgaattaccatccgggtaaagccaatg 24748680  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || || || ||||||||| ||||||| ||||  ||    
T  24748681 tggttgcagatgctttgagcaggaaaacgttacacatgtctgctatgatggtaaaggaattcgaattactggaacagtttagagacttgagccttggttg 24748780  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  24748781 tgagttggcacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24748855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20822894 - 20822508
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20822894 tttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 20822795  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20822794 ttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 20822695  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| || ||||||||| |||| ||||| || ||    
T  20822694 tagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttaagtctagtgtg 20822595  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20822594 tgagttatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 20822508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 21562900 - 21563286
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  21562900 tttggagttggctgctgtggtttttggtttgaaaatttggaggcattatttgtacgactccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaaatat 21562999  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||  |||||| ||  |  |||||| |||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  21563000 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaactgttgaaggactatgattttagtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 21563099  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| || ||    
T  21563100 ttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtatgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctgagtctcgtttg 21563199  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | ||||| ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  21563200 tgagttgtcgccttagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaacagtatcaaagaagcacagaaagttga 21563286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 22234847 - 22235221
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  22234847 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttagaggcattatttgtatggtttcagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 22234946  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||  |  || ||||| ||||||||||||   | |||||| ||||    
T  22234947 ttatttgatcagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggactatgaatttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatg 22235046  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22235047 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtgaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtctg 22235146  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| ||  | ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  22235147 tgaattgacacctcagagtattcagttggggatgctaaagattaacagtgatttcttgaataatatccgagaagc 22235221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Original strand, 28893871 - 28894255
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  28893871 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28893970  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||  |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  28893971 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28894070  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  28894071 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtg 28894170  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    | |||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| || || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28894171 aattatcatctcaaagtgtacagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttga 28894255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Original strand, 28915342 - 28915726
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  28915342 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28915441  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||  |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  28915442 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28915541  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  28915542 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtg 28915641  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    | |||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| || || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28915642 aattatcatctcaaagtgtacagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttga 28915726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 393
Target Start/End: Original strand, 28922697 - 28923081
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  28922697 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28922796  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||  |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  28922797 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28922896  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  28922897 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtg 28922996  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    | |||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||| || || | ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28922997 aattatcatctcaaagtgtacagttgggtatgttgaagatcaatagtggtttcttggatagtgtcagagaagcacaacaagttga 28923081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 21871978 - 21872226
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21871978 tttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 21872077  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21872078 ctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatg 21872176  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21872177 tggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21872226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Original strand, 21876258 - 21876506
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21876258 tttggagttggctgcggtggtttttcttttgaaaatttggagacattattagtacggtttcagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatat 21876357  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21876358 ctgtttgatca-aaagaattgaatatgaggcagagaagatgacttgagttgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgagtaaagctaatg 21876456  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21876457 tggttgcagatgctttgagctgaaagacgttgcacatgtctgctatgatg 21876506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 22463384 - 22463006
Alignment:
Q  15 tggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttga 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| | |||||    
T  22463384 tggctgcggtggtgtttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaagtatctgtttga 22463285  T
Q  115 tcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgca 214  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||    
T  22463284 ccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagttaatgtagttgca 22463185  T
Q  215 gatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttat 314  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||| || ||||| || |    
T  22463184 gatgcgttgagtaggaagacgttgcacatgtcggccttaatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggatttaagtctcgtgtgtgaattgt 22463085  T
Q  315 cgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |  |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22463084 catctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 22463006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 23079018 - 23079399
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23079018 tggagttggctgcggtggggtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 23079117  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| | ||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  23079118 atttgatcagaaggaattaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaatgattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 23079217  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    |||||  |||| ||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  23079218 gttgctaatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtg 23079317  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | || || | ||||||| || ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  23079318 aattgtcacttcagagtatatagttggggatgttgaagattaacagtaatttcttgaatagtatctgagaagctcaacaagt 23079399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 22504118 - 22503746
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  22504118 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 22504019  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  22504018 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcaaagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 22503919  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||| || || |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22503918 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaaaagaattcgagttgttagaacagtttagagacttgagtctagtctgtg 22503819  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  22503818 agttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaagc 22503746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Original strand, 21679709 - 21680079
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||    
T  21679709 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcagtacttgtatggttccagattcgaagtgtttagtgaccataagagcttgaaatatttat 21679808  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| ||    
T  21679809 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 21679908  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || ||     
T  21679909 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaa 21680008  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || || || |||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  21680009 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgatgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 21680079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25849514 - 25849142
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  25849514 tggagttggctgcagtggtttttgttttaaaaatttggaggcatgatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 25849415  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| | |||||  |||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  25849414 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggagatggttagagttactgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 25849315  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| || || ||||| ||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||    
T  25849314 gttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagaatttgaattgctagaatagttcagagacatgagtcttgtctgtg 25849215  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || ||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  25849214 aattgtcatctcagagtatacagttggggatgctaaagattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 25849142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 340
Target Start/End: Original strand, 28930610 - 28930941
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |    
T  28930610 tggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatatct 28930709  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||  |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||    
T  28930710 gtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaggattatgattttggtttgaactaccatccaggtaaagctaatgtg 28930809  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||    
T  28930810 gttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcgagttgcttgaacagtttagggacttgagtctagtgtgtg 28930909  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  28930910 aattatcatctcaaagtgtacagttgggtatg 28930941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 14885920 - 14886292
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  14885920 tggagttagctgcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 14886019  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  14886020 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 14886119  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  14886120 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 14886219  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  14886220 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgatttcttgaacagtatccgagaagc 14886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 24797326 - 24797698
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  24797326 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgaccataaaagtttgaagtattt 24797425  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  24797426 atttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 24797525  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  24797526 gtagctgatgctttgagtaggaagactttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 24797625  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || ||||||||||| |||||| |||||||    
T  24797626 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagggatttcttgaacagtatccgagaagc 24797698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20343723 - 20343349
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  20343723 tttggaattggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtat 20343624  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||    
T  20343623 ttatttgaccagaaggaactgaacatgaggcataggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatg 20343524  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | || || ||||| ||| |||| ||||| ||| || ||||||||||||     
T  20343523 tggttgctgatgctttgagcaggaaaactttgcacatgtctgctttgatgatgaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtcta 20343424  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| || ||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||||| |||||  |||||||    
T  20343423 tgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtgatttcttgaacagtattcgagaagc 20343349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 17268261 - 17268638
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||||    
T  17268261 tttggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatat 17268360  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |    ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17268361 ttgtttgatcagacggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaatattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatg 17268460  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || || || ||||| || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  17268461 tagtcgctgatgcattgagtaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaattcgatttgctggaacagtttagagacatgagtttggtatg 17268560  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  17268561 tgagttgtcgcctcaaagcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcaca 17268638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Original strand, 26737685 - 26737996
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26737685 aaaatatggagacactatttgtatggttccagatttgaagtgtttagtgaccataagagtttaaaatacttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggc 26737784  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    || |||| ||||| ||||||||||  |  |  |||||| |||||||||| ||| |   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26737785 agggaaggtggcttgagttgttgaaagactatgattttagtttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 26737884  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggt 337  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||  || ||||     
T  26737885 gcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgttggagcagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctggga 26737984  T
Q  338 atgctaaagatt 349  Q
    ||||| ||||||    
T  26737985 atgctgaagatt 26737996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 336
Target Start/End: Original strand, 37542310 - 37542637
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  37542310 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 37542409  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | ||||| |||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  37542410 gtttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttattgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 37542509  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  37542510 gttgctgacgctttaagtaggaaaactttgcacgtgtctgctttgatggtgaaggagtttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 37542609  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttggg 336  Q
    | || || || |||||| ||||||||||    
T  37542610 aattgtcaccccagagtatacagttggg 37542637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23472649 - 23472345
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  23472649 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaa-gtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 23472551  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || ||||||| || ||  |||||||| || ||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  23472550 ggtggcttgaattgttgaaggattatgattttgggttaaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 23472451  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||| ||  | || |||||||||||  || |||| ||||||    
T  23472450 gtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaaatgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgcta 23472351  T
Q  344 aagatt 349  Q
    ||||||    
T  23472350 aagatt 23472345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 35 - 289
Target Start/End: Original strand, 14998694 - 14998948
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14998694 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagaattgaatatga 14998793  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14998794 gacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagac 14998893  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
     ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  14998894 attgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 14998948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 27519843 - 27519583
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27519843 tttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27519744  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27519743 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27519644  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  27519643 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 27519583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 34567931 - 34567671
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  34567931 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 34567832  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  34567831 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 34567732  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  34567731 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 34567671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 40710217 - 40709988
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  40710217 tttgtattgaagatctggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 40710118  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  40710117 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 40710018  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  40710017 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 40709988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41772279 - 41772050
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  41772279 tttgtgttgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaagaattga 41772180  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  41772179 atatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 41772080  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  41772079 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 41772050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16357939 - 16357679
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| || ||||    
T  16357939 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggagttga 16357840  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  16357839 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 16357740  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  16357739 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 16357679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 22331836 - 22332096
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  22331836 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 22331935  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  22331936 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 22332035  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  22332036 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 22332096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18777233 - 18777004
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  18777233 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 18777134  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||| |||  | ||  ||||||||||||||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18777133 atatgaggcagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgattttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcag 18777034  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18777033 gaagacattgcatatgtctgctttgatggt 18777004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22136105 - 22135876
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  22136105 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 22136006  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  22136005 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 22135906  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  22135905 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 22135876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27611791 - 27611562
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27611791 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27611692  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27611691 atatgagacagcgaagatggctcgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27611592  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  27611591 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 27611562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Original strand, 20467059 - 20467367
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||      
T  20467059 atttggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgttgagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcaaaaggaattgaatatgagacaac 20467158  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||  | ||    
T  20467159 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtcggaaaactctaca 20467258  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||| ||||||||| | || ||||| ||| |||| || ||||||||| || ||||| | || |||||||| || |||||||| ||  |||| || |||    
T  20467259 tatgtccgctatgatgatcaaagagttagagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtttgtgagttgtcacctcagagcgtgaagttaggaatg 20467358  T
Q  341 ctaaagatt 349  Q
    |||||||||    
T  20467359 ctaaagatt 20467367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 27667439 - 27667759
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27667439 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27667538  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27667539 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27667638  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| | |||||| | || ||||| |   | |||||||||||     
T  27667639 gaagacattgcatatgtccgccatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatttgagtttggtttgtgaatggacacctcagagtgtg 27667738  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagatt 349  Q
     | ||||||||||| ||||||    
T  27667739 aaattgggtatgctgaagatt 27667759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 27684349 - 27684609
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  27684349 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 27684448  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  27684449 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggcttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 27684548  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  27684549 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 27684609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 171 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 20775036 - 20774814
Alignment:
Q  171 attttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttga 270  Q
    ||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||    
T  20775036 attttggcttgaactaccatccagataaagctaaagtagttgcagatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggaattcga 20774937  T
Q  271 gttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagt 370  Q
    |||||| || ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||| | ||||| || || |||||||||  ||||    
T  20774936 gttgcttgaacagtttagggacttgagtctcgtgtgtgaattatcatctcaaagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgggtagt 20774837  T
Q  371 atcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  20774836 atcagagaagcacaacaagttga 20774814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 197 - 366
Target Start/End: Original strand, 21830878 - 21831047
Alignment:
Q  197 aaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttga 296  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| || |||    
T  21830878 aaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtttgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacctga 21830977  T
Q  297 gtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaa 366  Q
    |||| || |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||    
T  21830978 gtctcgtttgtgagttgtcgcctaagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 21831047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 29475022 - 29475251
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  29475022 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaattatttgttcgatcagaaggaattga 29475121  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| ||||||| || || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  29475122 atatgagacagcgaagatgacttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 29475221  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  29475222 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 29475251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 393
Target Start/End: Original strand, 21889933 - 21890072
Alignment:
Q  254 atggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaaca 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||| || |    
T  21889933 atggtaaaggagtttgagttgctagagaagtttagagacttgagtcttgtttatgagttgtcacctcagagtgtacagttgggtatgttgaagatcaata 21890032  T
Q  354 gcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21890033 gtgatttcttgaacagtatcagagaagcacaacaagttga 21890072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23441669 - 23441418
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||| || | ||  ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| || || || || |||    
T  23441669 tttggagttggcggctgtggcctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgaggtttgaagtgtttagtgatcacaagagcttaaagtat 23441570  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||| ||||||    
T  23441569 ttgttcgatcagaaagaactgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaaactaatg 23441470  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  23441469 ttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 23441418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25427888 - 25427601
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||||||||| ||||| || ||||||| ||| || || |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  25427888 gagttggctgttgtggtttttgtattgaagatatggagactttacttttatggttccagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 25427789  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||  |||||||||||| ||    
T  25427788 tcgatcagaaggaattgaacatgagacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgtgtaaagctaatgttgt 25427689  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  25427688 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagaaatttgagt 25427601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19771397 - 19771168
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  19771397 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 19771298  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  19771297 acatgaggcagcgaagatggctagagttgctaaaggattacgactttggtttgaattatcatccgggtaaagctaatgttgttgcggatgccttgagtag 19771198  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  19771197 gaagacattgcatatgtccgccatgatggt 19771168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 20777354 - 20777205
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20777354 tttggagttggctgcagtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 20777255  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagtt 156  Q
    || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  20777254 ttgtttgaccaaaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagtt 20777205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 37290445 - 37290674
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| ||| |||    
T  37290445 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaactga 37290544  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||  | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  37290545 atatgaggcagcgcagatggctagaattgttgaaggattacgactttggtttgaattatcacccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 37290644  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  37290645 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 37290674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23575184 - 23574811
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||| |    
T  23575184 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgt 23575085  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  23575084 tcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgaaggtggctcgaattaatgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 23574985  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || ||||||||| |  ||||  | || ||||||    
T  23574984 tgcagatgccttgagtaggaaggcattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgaattgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgag 23574885  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |  || |||||||||||  |  |||| ||||| |||||| | || || ||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23574884 tggtcacctcagagtgtgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaattcctgaagagtatcaaagaagcaca 23574811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 287
Target Start/End: Original strand, 21338263 - 21338504
Alignment:
Q  46 gagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaga 145  Q
    ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||  || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||      
T  21338263 gagacattacttgtattgttcgagatttgaagtgttcagcgaacacaagagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaatg 21338362  T
Q  146 tggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 245  Q
    ||||| || ||| |||  |  |  |||||||| ||||| || ||| | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  21338363 tggcttgaattgctgaaagactatgattttgggttgaactatcatccaggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagcaggaagatgctgcatatgt 21338462  T
Q  246 ctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 287  Q
    | ||||||||||| || ||| | |||||||| || |||||||    
T  21338463 cagctatgatggttaaagagctcgagttgctggaacagttta 21338504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21408566 - 21408306
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||  || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  21408566 aaaatttggaggcattatctgtatggttctaaatttgacgtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatttatttgaccagaaataattaaatatgaggc 21408467  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    ||   || ||||| || ||| | | || ||  || || || |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| || ||    
T  21408466 agcataggtggcttgaattgctaaaggattatgaattcggattgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgcagatactttaagtaggaaaacatt 21408367  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||||||    
T  21408366 acatatgtctgctatgatggttaaagagttggagttgcttgaacagttcagagacttgagt 21408306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 21497263 - 21497124
Alignment:
Q  127 gaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagc 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  |  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21497263 gaatatgaggcaaagaagatggcttgagttgttggaggactatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtagttgcagatgctttgagc 21497164  T
Q  227 aggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    ||||||||||| || |       ||||||||||||||||||||||||    
T  21497163 aggaagacgttacata-------tatgatggtaaaggagtttgagtt 21497124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20800852 - 20800710
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  20800852 gagttggcggctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 20800753  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcga 153  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  20800752 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcaacgaaggtggctcga 20800710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 223
Target Start/End: Original strand, 820 - 933
Alignment:
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  820 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatgtggt 919  T
Q  211 tgc-agatgctttg 223  Q
    ||| ||||||||||    
T  920 tgcaagatgctttg 933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Original strand, 21936143 - 21936406
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  21936143 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 21936242  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    ||||||| |||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  21936243 ggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 21936342  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  21936343 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 21936406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21882294 - 21882088
Alignment:
Q  121 agaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgct 220  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| |||   | |||||||||||| ||||  |||||     
T  21882294 agaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgttgttgatgcc 21882195  T
Q  221 ttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctc 320  Q
    ||||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||| | |  |||| || || |||||||  || ||||    
T  21882194 ttgagtaggaagacattgaatatgtccgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagtttacagatatgagcctagtttgtgagtggtcacctc 21882095  T
Q  321 agagtgt 327  Q
    |||||||    
T  21882094 agagtgt 21882088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24582563 - 24582346
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcgg 194  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |    
T  24582563 agtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccg 24582464  T
Q  195 ataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatactt 294  Q
      || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || | ||    
T  24582463 gaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagattt 24582364  T
Q  295 gagtcttgtctgtgagtt 312  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  24582363 gagtttggtcagtgagtt 24582346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 27012437 - 27012234
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcgg 194  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |    
T  27012437 agtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagaggagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccg 27012338  T
Q  195 ataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatactt 294  Q
      || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||    
T  27012337 gaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagactt 27012238  T
Q  295 gagt 298  Q
    ||||    
T  27012237 gagt 27012234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 23504657 - 23504544
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||||||||| ||||||||||    
T  23504657 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccataagagtttgaagtacttgttaaatcagaaagagttgaatatga 23504558  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
     ||| |||||||||    
T  23504557 agcaaagaagatgg 23504544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23517765 - 23517599
Alignment:
Q  227 aggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtg 326  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || ||||||||| |  ||||  | || ||||||| ||| ||||||||||    
T  23517765 aggaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttagagatatgagcttagtttgtgagtgatcacctcagagtg 23517666  T
Q  327 tacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |  |  |||| ||||| |||||| | || || ||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  23517665 tgaaactgggaatgctgaagattgatagtgaatttctgaagagtatcaaagaagcacataaagttga 23517599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 44341 - 43958
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  44341 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtttgaattat 44242  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  44241 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagcttttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 44142  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||    
T  44141 tggttgctaatgcgttgagtaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacattttagagacttgagccttgtttg 44042  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  44041 tgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 43958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Original strand, 3020 - 3387
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3020 tttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 3119  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |  |||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  3120 ttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatg 3219  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||    
T  3220 tagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttg 3319  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatca 374  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  3320 tgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 3387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 2103 - 2486
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  2103 tttggagttggctgcagtagtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 2202  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| | ||| ||||||  | ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  2203 ttatttgatcagaaggaattgaacatgagacagaggagatggttagagctgttgaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 2302  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  2303 tagttgcagatgccttgcgtaggaaaacgttgcatatgtctactatgatggtaaaagaattcgatttgctagagcaatttagagacttgagtcttgtgtg 2402  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  2403 tgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagt 2486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8618 - 8244
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  8618 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatctggaggcactgtttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 8519  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| ||||||||||||   | |||||| ||||    
T  8518 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatg 8419  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||| || | ||||| || || || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8418 tggttgcagatgtcttgaataggaagacgttgcatatgtctactttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctg 8319  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||    
T  8318 tgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaacagtgacttcttgaatagtattcgagaagc 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Original strand, 30033 - 30400
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  30033 tttggagttggttgcggtggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtacggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaaaagtttgaaatat 30132  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |  |||||||||||||||||||||   | |||| ||||||    
T  30133 ttgtctgatcaaaaggaattgaacatgaggcagagaagatggcttgagttgttgaaagactatgattttggtttgaattaccatcttggtaaaactaatg 30232  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| ||    
T  30233 tagtcgcggatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctttgatagtgaaagagtttgagtttcttgaacaatttagagacttgagtcttgtttg 30332  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatca 374  Q
    |||||| || ||||||||||| || ||||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  30333 tgagttgtcacctcagagtgtgcaattgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 30400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 374
Target Start/End: Original strand, 5837 - 6206
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||| ||| ||| | || ||||||||||||    
T  5837 tttggagttggctgcggtggtttttgtattgaaaatttggagacattatttgtacgactctagatttgaggtgtttagcgataacaagagtttgaaatat 5936  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||  | | |||||||||||    
T  5937 ttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcaccccggtaaagctaatg 6036  T
Q  207 t--ggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtc 304  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||     
T  6037 tacggttgcagatgctttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagttggagttgcttgagcagtttagagacttgagtctagtt 6136  T
Q  305 tgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatca 374  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  6137 tgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacagtatca 6206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23772 - 23389
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  23772 tttggagttggctgcggtggtttttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 23673  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||  | ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  23672 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 23573  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||| ||    
T  23572 tggttgatgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttg 23473  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  23472 tgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaggattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 23389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 68 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20891 - 20569
Alignment:
Q  68 agatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggctt 167  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||  | ||    
T  20891 agatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaaggtggttcgagctgttgaaagatt 20792  T
Q  168 gggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
      |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  20791 atgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgttgatgcgttgagcaggaagacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatt 20692  T
Q  268 tgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaat 367  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| |||| || ||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| | |||||| || ||||||||||||    
T  20691 tgaattgttagaacagtttagagacttaagccttgtttgtgagttgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaggattaatagtgatttcttgaat 20592  T
Q  368 agtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| ||||||| || |||||    
T  20591 agtatccgagaagctcagcaagt 20569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 46147 - 46530
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  46147 tttggagttggctgtggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatat 46246  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  46247 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatg 46346  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||||| |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  46347 tagttgcacatgccttgagtaggaaaacgttgcatatgtctgctttgatggtaaaagaatttgatttgttagagcagtttagagacttgatccttgtctg 46446  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  46447 tgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcacagcaagt 46530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 41083 - 41455
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  41083 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 41182  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  41183 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattttgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 41282  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||||||||    
T  41283 gttgctgatgctttgagtaggaaaacgttgcacatgtctgctttgatggtgaaagagtttgagttgttagaacagttcagagatatgagtcttgtctgtg 41382  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || || |||||| |||||||||| ||| | || ||| | || || |||||||| |||||| |||||||    
T  41383 aattgtcaccccagagtatacagttgggaatgttgaaaattgatagtgacttcttgaacagtatccgagaagc 41455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 3435 - 3098
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  3435 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgtttagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatgtgagacagcgaa 3336  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||    ||  |||| ||| ||||||||  || | | |||||||||| | ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  3335 ggtggcttgaattgttgaaatattatgattgtgggttgaattattatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 3236  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    ||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  3235 gtccgcattgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgcta 3136  T
Q  344 aagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||| | || || ||||| |||||||||| ||||||    
T  3135 aagattgatagtgaattcttaaatagtatcaaagaagc 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 42 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 524 - 176
Alignment:
Q  42 tttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagag 141  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  524 tttggaggcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtttgaaatatttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagag 425  T
Q  142 aagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcac 241  Q
     |||||| | ||| |||||| || ||  |||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  424 gagatggttagagctgttgaaggattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagccaatgtggtagcagatgcgttgagcaggaagacgttgcat 325  T
Q  242 atgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgc 341  Q
    ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| || |||     
T  324 atgtctgctatgatggttaaagaattcgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgttcagtttgggatgt 225  T
Q  342 taaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | || ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  224 tgaaaattaatagtgatttcctgaatagtatccgagaagcacagcaagt 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1441 - 1055
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  1441 tttggagttggctgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggcactatttgtatggttcaagatttgaagtgtttagtgaccacaaaagtttgaaatat 1342  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || |  | ||  |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1341 ttgtttgaccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatgacttgagttattaaaagattatgattttggcttgaattaccatccgggtaaagctaatg 1242  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  1241 tagttgcagatgcgttgagtagaaagacattgcacatgtcggccatgatggtgaaggaattcgaattgcttgaacagtttagagacttgagtctcgtttg 1142  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    ||| || || ||||| ||||| |||||||||||  | ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1141 tgaattgtcacctcaaagtgtgcagttgggtatattgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 1055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 250169 - 249788
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  250169 tggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggtttcagatttgaagtgttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 250070  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  250069 atttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 249970  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  249969 gttgctgatgcgttgagcaggaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaatttgaattgctagaacagtttagagacttgagccttgtttgtg 249870  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  249869 agttgacacctcagagtgttcagttgcggatgctgaagattaataatgatttcttgaatagcatccgagaagctcagcaagt 249788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 324262 - 323879
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| | ||||||    
T  324262 tttggagttggctgcggtggtttttattttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtctcaaatat 324163  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||    
T  324162 ttatttgatcagaaggagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagccaatg 324063  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  324062 tggttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcacatgtctgctttaatggtgaaataatttgatttgttagagcagtttagagacttgagccttgtttg 323963  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  323962 tgaattgacacctcagagtgttcagttggggatgctgaagattaacaatgatttcttgaagagtatccgagaagcacaacaagt 323879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 366
Target Start/End: Original strand, 202220 - 202575
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| | |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  202220 gagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagattttaggtgtttagtgatcacaggagtttgaaatatttat 202319  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||| ||    
T  202320 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagcaaatgttgt 202419  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || ||||||    
T  202420 tgcagatgctttgagcaggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacattttagagacttgagtctagtttgtgag 202519  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaa 366  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||||    
T  202520 ttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 202575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 118750 - 118493
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  118750 atttggagacattatttgtatggttctagattattagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaac 118651  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  118650 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 118551  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| | ||||||| | || ||||| ||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  118550 tatgtccgttatgatgatcaaagagttggagctgctcgaacagtttagagacttgagt 118493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 46075 - 45692
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  46075 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtttggttctagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaacat 45976  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  45975 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 45876  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  | || ||||||||  |||||||||  || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  45875 tggttgcggatgcgttaagcaggaagaccctacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttg 45776  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  45775 tgaattgtcacctcagagtatacagttgggaatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 45692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21445 - 21140
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||  || ||||| || ||| | || |||    
T  21445 tttggagttgactacggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgtggtgttcagcgatcacaagagtctaaagtat 21346  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  21345 ttatttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaatg 21246  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||  || |||||  | ||||| ||||||||| ||||||| ||||| |     
T  21245 tggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaagagaatttgatcttctagaacagtttagagacttgagccttgtttc 21146  T
Q  307 tgagtt 312  Q
    ||||||    
T  21145 tgagtt 21140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 285
Target Start/End: Original strand, 19111 - 19367
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  19111 tttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatatgttcgatcagaaggaattga 19210  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19211 atatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggactatgattttgtgttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtag 19310  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| || |||||    
T  19311 gaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcaagttgcttgaacagtt 19367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 21133 - 21075
Alignment:
Q  332 ttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  21133 ttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagcgcaacaagt 21075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 384
Target Start/End: Original strand, 9556 - 9933
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||     
T  9556 tttggagttggctgcggtggcttttgtgttaaaaatttggagacattatttctacggttccagatttgaggtgtttagtgatcataaaagtctgaagtac 9655  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| || ||||||| || ||| |||||| |||| ||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  9656 ctatttgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttagtttaaattatcatccgggtaaagccaatg 9755  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||    
T  9756 ttgttgcagatgctttaagcaggaagacattgcatttgtcagctatgatggttaaagaatttgagttgcttgagcagtttaaagacttgagtctagtttg 9855  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    |||||| || ||||| |||||  ||||||||||| | ||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||    
T  9856 tgagttgtcacctcaaagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaacagtgagttcttggatagtattagagaagcaca 9933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 20676 - 20295
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| | || |||||    
T  20676 tggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcataagagtctaaagtattt 20577  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  20576 atttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 20477  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| || || || ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  20476 gttgcggatgcgttgagcaggaagacattgcatatgtctgcgttgatggtgaaggaattcgatttactagaacaatttagagacttgagtcttgtttgtg 20377  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | ||  | ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| || |||||    
T  20376 aattgacacctcagagtattcagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaacagtatccgagaagcgcaacaagt 20295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 214
Target Start/End: Original strand, 57970 - 58146
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  57970 aaaatttggagacattatctgtatggttttagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggc 58069  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgca 214  Q
    || |||| ||||| || ||| | | || ||  ||||| || |||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  58070 agcgaaggtggcttgaattgctaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaaggctaatgttgttgca 58146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6361
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||||||| |||||| | ||||||||||    
T  5990 gagttggctgcggtgatttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttaaagtattcagtgatcacaaaagtctaaaatatttat 6089  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||    
T  6090 ttgatcagaaggaattgaacatgaggcagagaagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggt 6189  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | ||||| || || ||| | ||| |||||||||||||| |||| || ||||| |||||     
T  6190 tgcagatgccttgagtaggaaaatgttgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattttatttgttagagcagtttagagacttaagccttgtatgtgaa 6289  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagca 382  Q
    ||  | |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6290 ttgacacctctgagtgtacagttggggatgctgaagattaacagtgatttcttgaatagtatccgagaagca 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 1
Alignment:
Q  51 attatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggca 138  Q
    |||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  88 attacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaagtatttgttcgatcagaaagatttgaatatgaggca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 42475 - 42092
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||    
T  42475 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgatgtttttagtgatcataagagtcttaaatat 42376  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||| |||| || || || ||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  42375 ttatttgattagaaggagtttaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatccaggtaaagccaatg 42276  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| | ||||| || || || || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  42275 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtctgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctg 42176  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  42175 tgaattgacacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 42092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 80580 - 80963
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| ||||||||    
T  80580 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcactacttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtatgaaatat 80679  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||    
T  80680 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatg 80779  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| || ||    
T  80780 tggttgctgatgcgttgagcaggaagacactacatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatg 80879  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| | |||||| ||  || ||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  80880 tgagttgtagcctcaaagaataaagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagt 80963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 100312 - 100693
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  100312 tggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcaatatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcattaaagcttgaaatattt 100411  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | ||| | |||| ||  |   ||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  100412 atttgatcagaaggagttgaatatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggactacaattttggtttgaattaccatcatggtaaagccaatgtg 100511  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  100512 gttgcagatgcattgagcaggaagacattgcatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgatttgctagagcagttcagagatttgagtcttgtctgtg 100611  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | ||  | ||| ||||| | || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  100612 aattgacaccttagagtattcaattggggatgctgaaaattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagctcagcaagt 100693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 181555 - 181479
Alignment:
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||    
T  181555 gttgcagatgccttgagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagtt 181479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 390
Target Start/End: Original strand, 6895 - 7276
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  6895 tggagttggctgcggtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaaaagcttgaaatattt 6994  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  6995 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttagagatgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 7094  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | |||||||  || || || |||||||| ||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  7095 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtaagagaattggatttgctagaacagtttagagacctgagccttgtttgtg 7194  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  7195 aattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgaagattaacagtaattttttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 7276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 882 - 499
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| || ||| | ||||||    
T  882 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaagcgttcagtgatcacaagagtctaaaatat 783  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||  | | |||||| ||||    
T  782 ttatttgaccagaaggaatggaatatgagacagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccaccctggtaaagccaatg 683  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  682 tggttgcggatgcgttgagcaggaagaccttacatatgtctgcgttgatggtaaaagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtttg 583  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  582 tgagttgtcacctcagagtatacagttggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccaagaagcgcagcaagt 499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 20407 - 20033
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||    
T  20407 tttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 20308  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||    
T  20307 ttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatg 20208  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  20207 tagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctggtttg 20108  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     || || || || |||||||| |||||||||||||| || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  20107 cgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgctgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 20033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24569 - 24195
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || || |||||||||    
T  24569 tttgaagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcactacttgtatggttctagattcgaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatat 24470  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||    
T  24469 ttatttgatcagaagcagttaaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatg 24370  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24369 tagttacagatgctttgagcaggaagacgttacacatgtcggctatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttg 24270  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
     || || || || |||||||| |||||||||||| | || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  24269 cgaattgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 24195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 381
Target Start/End: Original strand, 49267 - 49636
Alignment:
Q  12 agttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  49267 agttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttccagattcgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatttatt 49366  T
Q  112 tgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggtt 211  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||| |||    
T  49367 tgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcattcgggtaaagccaatgtagtt 49466  T
Q  212 gcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagt 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || || |    
T  49467 gcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtaaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtcttgtttgcgaat 49566  T
Q  312 tatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || || |||||||| ||||||||||||   || || || || || |||||||||||||||||||||||    
T  49567 tgtcaccccagagtgtgcagttgggtatgtagaaaatcaatagtgaattcttgaatagtatcagagaagc 49636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 44687 - 44323
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  44687 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 44588  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||||| | || ||  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  44587 atatgaggcagcatagatggcttgaattgttaaaggattacgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtcg 44488  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || ||||| ||| |  ||||| | || ||||| |  || |||||||||||     
T  44487 gaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttactcgaacagttcagagatatgagtttggtttgtgaatggtcacctcagagtgtg 44388  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
     |  |||||||||| |||||| | || || ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||    
T  44387 aaactgggtatgctgaagattgatagtgagttcctgaagagtatcaaggaagcacagaaagttga 44323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 16472 - 16243
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  16472 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttaaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 16373  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||  |    
T  16372 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagttg 16273  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  16272 gaagacattgcatatgtcttctatgatggt 16243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10010 - 9781
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  10010 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 9911  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
     |||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||| ||| ||||||||||| || || ||    
T  9910 ttatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctagtgttgttgcagatgccttaagtag 9811  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  9810 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 9781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 105514 - 105612
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  105514 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggatttggttgagcagtttcgagacttgagt 105612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Original strand, 105349 - 105460
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  105349 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttaatcagaaagagttgaatatga 105448  T
Q  135 ggcagagaagat 146  Q
    | || |||||||    
T  105449 gacaaagaagat 105460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 390
Target Start/End: Original strand, 24699 - 25007
Alignment:
Q  82 tagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttg 181  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  24699 tagtgatcataaaagtttaaaatatttatttcatctgaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagttgttgaaggattatgattttggtttg 24798  T
Q  182 aattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagc 281  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| || || || || ||||||||||    
T  24799 aattaccatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcagaaagacgttgcatatgtttgctttgatggtgaaagaattcgatttgctagagc 24898  T
Q  282 agtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||| ||  | ||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  24899 agtttagagatttgtgtcttgtctgtgaattgacacctgagagtgtacagttggggatgttgaagattaatagtgatttcttgaatagtatccgagaagc 24998  T
Q  382 acatcaagt 390  Q
    |||||||||    
T  24999 acatcaagt 25007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 13047 - 13430
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||    
T  13047 tttggagttggcttcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctaaaatat 13146  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  13147 ttatttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggactacgattttggtttgaattaccatcctgataaagccaatg 13246  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| |||| | ||||| || || || || |||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  13247 tggttgcagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtttgctttaatggtgaaagaattcgatttgctagaacaatttagagacttgagccttgtctg 13346  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| ||  | ||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13347 tgaattgacaccttagagtgttcagttggggatgctgaaaattaaaagtaatttcttgaatagtatccgagaagcacaacaagt 13430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 261866 - 261491
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| |||| ||     
T  261866 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtac 261767  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |  | ||  |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  261766 ttatttgaccaaaaggaattgaacatgaggtagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgatttttgtttgaattaccatccaggtaaagctaacg 261667  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  || ||||||| || ||    
T  261666 tagttgctgatgcgttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagggacatgagtctggtatg 261567  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagca 382  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  261566 tgagttgtcgactcagagtatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagca 261491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 29 - 349
Target Start/End: Original strand, 277600 - 277920
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||| || |||| |||||||||||    
T  277600 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcggaaagaattga 277699  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || ||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  277700 atatgaggcagcgaaggtggctcgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 277799  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgta 328  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| || || ||||||||| || ||||| | || |||||||  || ||||||||||||    
T  277800 gaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttacttgaacagtttagagacatgagtttggtttgtgagtggtcacctcagagtgta 277899  T
Q  329 cagttgggtatgctaaagatt 349  Q
     |  |||| ||||| ||||||    
T  277900 aaactgggaatgcttaagatt 277920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 7 - 393
Target Start/End: Original strand, 39508 - 39893
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||| ||||    
T  39508 tttggagttggctgttgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtacggctccagatttgaggtgtttagcgatcacaagagtttgagatat 39607  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| || | ||||| || ||||||| ||  |  |||||   ||| ||||| |||   | |||||||||||    
T  39608 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgacggtggcttgaattgttgaaggactatgatttattttt-aattatcatcaaggtaaagctaatg 39706  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || ||    
T  39707 ttgttgcagatgctttgagcatgaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaggagtttgagttgcttgaacaatttagagacttgagtctagtttg 39806  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| ||||  || |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  39807 tgagttgtcgcctcagagtatgaagttgggtatgttgaagatcaacaatgagttcttgaacagtatcaaagaagcacaaaaagttga 39893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 6771 - 6388
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| | || |||    
T  6771 tttggagttggctacggtggtgtttgttttgaaaatctggagccattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtat 6672  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | || |  | ||  ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |    
T  6671 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgaggttttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagctaacg 6572  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||| || ||||||| || ||    
T  6571 tagttgctgatgcattgagcaggaagacacttcatatgtatgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacagtttagagacatgagtctggtatg 6472  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  6471 tgagttgtcgcctcagagcatacagttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcacagcaagt 6388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 11 - 382
Target Start/End: Original strand, 177014 - 177385
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  177014 gagttggctgttgtggtttttctgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatatttat 177113  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  |  |  || |||||||||||||| ||| | | ||| |||||||| ||    
T  177114 ttgatcagaagaaattgaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgttgaaagactatgactttggtttgaattatcatccaggtaaggctaatgtcgt 177213  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  177214 tgcagaagctttaagcaggaagacgttacatatgtctgctatgatggttaaagaattagaattgctagaacagtttagagacttgagtctagtttgtgag 177313  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagca 382  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| || || || |||||||| ||||| | |||||||    
T  177314 ttgtcgcctcagagtgtgaagttgggtatgttgaagatcaatagtgaattcttgaacagtattaaagaagca 177385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 10205 - 10579
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  10205 tttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatat 10304  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  10305 taatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatg 10404  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| |  |||| || || ||  | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10405 tggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctg 10504  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| ||  | ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  10505 tgaattgacacctcagattgttcaattggggatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 10579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 381
Target Start/End: Original strand, 20419 - 20793
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  20419 tttggagttggttgcggtgatttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagagttgaagtatttcgtgatcataaaagtttgaaatat 20518  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||    
T  20519 taatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttggagctgttgaaggattatgattttgggttgaattaccatcctggtaaagccaatg 20618  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||| ||| |  |||| || || ||  | |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20619 tggttacagatgccttgagtaggaaaacgctgcatatgtccgctttagtggtgaaagaattcaatttgctagaacagtttagagacttgagccttgtctg 20718  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||| ||  | ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  20719 tgaattgacacctcagattgttcaattggggatgctgaagattaatagtgatttcttaaatagtatccgagaagc 20793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Original strand, 12277 - 12610
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  12277 tggagttggctgcagtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagttttcagtgatcataaaagcttgaaatattt 12376  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    ||||||| |||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||  |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  12377 atttgattagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagaactgttgaaggactatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtg 12476  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||   ||||| || || || || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12477 gttgcagatgccttgagtaggaagacgctgcatatgtctgcttgaatggtgaaagaattcgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtg 12576  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgct 342  Q
    | ||  | ||||||||| | |||||||| |||||    
T  12577 aattgacacctcagagtattcagttggggatgct 12610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 31505 - 31792
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| |    
T  31505 gagttggctgatgtggtttttgtgttgaaaatatggaaacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcacaagagtttgaagtatttgt 31604  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||| |||| || || ||| | | |||||||||||||||    
T  31605 tagatcagaaggaattgaatatgagccagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttagtttaaactatcatccaggtaaagctaatgtggt 31704  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  31705 tgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagt 31792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 34499 - 34636
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  34499 tttggagttggctgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaaatat 34598  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaag 144  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  34599 ttatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaag 34636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 11534 - 11917
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||| || ||| |||| |||    
T  11534 tttggagttgggtgcggtggtatttgttttgaaaatttggaggtattatttgtatggttcgagatttgaagtattcagtgatcacaagagtctgaagtat 11633  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |    
T  11634 ttatttgaccagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctagtaaagctaacg 11733  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||| || ||||||||| || ||||| | || ||    
T  11734 tagttgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatatgctggaacagtttagagacatgagtgtggtatg 11833  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||| | |||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  11834 tgagctgtcgcctcagagcatacggttgggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaagcatatcaagt 11917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 366
Target Start/End: Original strand, 23827 - 24179
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  23827 tttggagttggttgctgtggtttttgtgttgaaaatttggaggcattatttgtatggctccagatttgaagtgtttagtgaccacaagagtttgaaatat 23926  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||  |  ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  23927 ttattagatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaggactatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatg 24026  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||||       |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  24027 ttgttgca-------tgagtaggaagacgttgcatatgtctgctatgatggttaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttg 24119  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaa 366  Q
    |||| | | ||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||| || ||||||||    
T  24120 tgagatgtagcctcagagtgtgaagttgagtatgttgaagatcaacagtgagttcttgaa 24179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 390
Target Start/End: Original strand, 5084 - 5467
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| | || |||    
T  5084 tttggagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtat 5183  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |  | ||  |||||||||||| ||||||||   | |||||| ||||    
T  5184 ttatttgaccagaggtaattgaatatgaggcagaggagatgacttgagttgttaaaagattatgattttggtttggattaccatcttggtaaagccaatg 5283  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctg 306  Q
    | ||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||   |||||||   || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5284 tagttgcggatgcgttgaggaggaagaccttacatatgtctgcgtagatggtatgagaatttgatttgctagaacagtttagagacttgagtcttgtttg 5383  T
Q  307 tgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  5384 tgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgctgaagattaacagtaatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Original strand, 6437 - 6807
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||  ||||| || || || |||||||||||||    
T  6437 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcactacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgaccacaagagcttgaaatatttat 6536  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||| ||    
T  6537 ttgaacagaaggagttgaacatgagacagaggagatggttggagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaaagccaatgtagt 6636  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  6637 tgcggatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtcttgtttgtgag 6736  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| | || || || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  6737 ttgtcgccccagagtgtgcagttgggtatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 6807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Original strand, 365 - 451
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  365 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtccgctttgatggttaaagagttcgaattgattgagcagttt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 260 - 313
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  260 agtttgaagtatttgtttgatcataaggagttgaatatgaggcaaagaagatgg 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28489 - 28156
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  28489 tggagttagctgcagtggtttttgttttgaaaatttggagtcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaattattt 28390  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||  |||||||| ||||||||||||   | ||| || ||||||    
T  28389 atttgaccagaaggaacttaacatgaggcagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggcttgaattaccatcatggtaaggccaatgtg 28290  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||  ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||||| || || ||||| ||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28289 gttgttgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatggtgaaagaatttgaattgttagaaaagtttagagacttgagtcttgtctgtg 28190  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgct 342  Q
    | || || ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28189 aattgtcacctcagagtatacagttggggatgct 28156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 381
Target Start/End: Original strand, 15463 - 15835
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  15463 tggagttagctgcggtggtttttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaagtattt 15562  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || |||||     
T  15563 atttgaccagaaggaactgaacatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtt 15662  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  15663 gttgctgatgctttgagcaggaagactttgcatatgtctgctttaatggtaaaagaatttgaattgttagaacagttcagagacatgagtcttgtctgtg 15762  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | || ||  |||||||| || ||||||| | | | || ||| | |  || ||||||||||||||| |||||||    
T  15763 aattgtcatctcagagtatatagttgggaaggttgaaaattgataatgacttcttgaatagtatccgagaagc 15835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 170 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10832 - 10621
Alignment:
Q  170 gattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttg 269  Q
    ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  10832 gattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatattttgagcgggaagacattgcatatgtcagctatgatggttaaagaatttg 10733  T
Q  270 agttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatag 369  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  10732 agttgcttgaacagtttagagacttgagtctagtttgtgagttgtcgcctcagagtgtgaagttgtgtatgttgaagatcaacagtgaattcttgaacag 10633  T
Q  370 tatcagagaagc 381  Q
    ||| | ||||||    
T  10632 tattaaagaagc 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 498 - 142
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  498 tttgttttaaaaatttggagagattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattga 399  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||||||||| || ||| | |||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  398 acatgaggcagaggaggtggttagagttactgaaggattatgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtggttgctgatgcattgagcag 299  T
Q  229 gaagacgttgc----acatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    ||| || ||||    | ||||||||| ||||||| ||||| || || |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  | || ||||||||    
T  298 gaaaacattgcatatatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgctataacagtttagagacttgagtcttgtctgtgaactgtcacctcagag 199  T
Q  325 tgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    | |||||||||| ||||| |||||| |  | ||||||||||| |||||| |||||||    
T  198 tatacagttggggatgctgaagatttattgtgatttcttgaacagtatccgagaagc 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 393
Target Start/End: Original strand, 1 - 367
Alignment:
Q  15 tggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttga 114  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||            | |||||||||| |||| | |||||    
T  1 tggctgcggtggtatttgttttgaagatttggagacactatttgtatggttcaagatttggag------------acaaaagtttgagatatctgtttga 88  T
Q  115 tcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgca 214  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  89 ccagaaagaattgaacatgaggcagaggagatggcttgagttattaaaagattatgattttggcttgaaataccatccagataaagctaaagtagttgca 188  T
Q  215 gatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttat 314  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||||| || ||||| || |    
T  189 gatgcgttgagtaggaagacattgcacatgtcggccttgatggtaaaggagtttgaattgctcgaacagtttagggacttaagtctcgtgtgtgaattgt 288  T
Q  315 cgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  289 catctcagagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtatcagagaagcacaacaagttga 367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 349
Target Start/End: Original strand, 1584 - 1924
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  1584 tggagttggccgctgtggtgtttgttttaaaaatttggagacattatttgtacggatccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatct 1683  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||  ||| || ||  |||||||| |||||||||||| | | ||| || ||||||    
T  1684 gtttgatcagaaggaattgaacatgaggcagaggagatggttatagttactgaaggattacgattttggcttgaattaccatcctggtaaggccaatgtg 1783  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| | ||| |||| || || || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1784 gttgctgatgcattgagcaggaaaacattgcatatgtctgctttaatgataaaagaattcgaattgttagaacagtttagagacttgagtcttgtctgtg 1883  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagatt 349  Q
    |  | || ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  1884 aactgtcacctcagagtatatagttggggatgctgaagatt 1924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 374
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18330
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||  |  |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||    
T  18000 tggagacattatttgtaaggttctagattaaaagtgttcaaagatcataaaagtatgaagtatatgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaa 18099  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || ||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  18100 ggtggcttgaattgttgaaggattgtgattttgggttgaattatcattcaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 18199  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgcta 343  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||  || |||| ||||||    
T  18200 gtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctgggaatgcta 18299  T
Q  344 aagattaacagcgatttcttgaatagtatca 374  Q
    |||||| | || || ||||||||||||||||    
T  18300 aagattgatagtgaattcttgaatagtatca 18330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 114113 - 113743
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||| | |    
T  114113 gagttggctgcggtggtttttgttttaaagatttggaggcattacttgcatggttccaggtttgaagtgttcagtgaccataagagcttgaaatatctgt 114014  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| | |||| || ||  |||||||| ||||| || ||| ||| ||| || ||||| ||    
T  114013 ttgatcagaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctattgaaggattatgattttgggttgaactatcatccgggtaacgccaatgtagt 113914  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||| |||||     
T  113913 tgcagatgctttgagtaggaagacgttacacatgtcggccatgatggtgaaggaatttgagttgcttgaacagtttagagatttgagccttgtttgtgaa 113814  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || || || |||||||| |||||||| ||| | || || || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  113813 ttgtcaccccagagtgtgcagttgggcatgttgaaaatcaataatgaattcttgaatagtatcagagaagc 113743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 258
Target Start/End: Original strand, 108597 - 108810
Alignment:
Q  45 ggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaag 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| | ||    
T  108597 ggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattgaacatgaggcagcgtag 108696  T
Q  145 atggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatg 244  Q
    |||  | |||||| | | || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||    
T  108697 atgattagagttgctaaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatg 108796  T
Q  245 tctgctatgatggt 258  Q
    ||||||||||||||    
T  108797 tctgctatgatggt 108810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 323 - 393
Target Start/End: Original strand, 95066 - 95136
Alignment:
Q  323 agtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  95066 agtgtacagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagcatcagagaagcacaacaagttga 95136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 378
Target Start/End: Original strand, 32069 - 32438
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    ||||||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  32069 tggagttggctgttgtggtgtttgttttaaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcataaaagcttaaaatattt 32168  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||| || ||| || ||  |||||||| ||||||||||||   | |||||| ||||||    
T  32169 atttgatcagaaggaattgaacatgaggtagagaagatggttagagctgctgaaggattatgattttggcttgaattaccatcttggtaaagccaatgtg 32268  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtg 308  Q
    ||||| ||||| |||||||| || || || || ||||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||| ||||    
T  32269 gttgctgatgcgttgagcagcaaaacattacatatgtctgctttgatggtgaaggaattcgaattgttagaatagtctagagacttgagccttgtttgtg 32368  T
Q  309 agttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagaga 378  Q
    ||||  | ||||||||||| |||||||| ||| |   |||||| || ||||||||||| |||||| ||||    
T  32369 agttgacacctcagagtgttcagttggggatgttgcggattaatagtgatttcttgaacagtatccgaga 32438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 198 - 385
Target Start/End: Original strand, 1 - 188
Alignment:
Q  198 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgag 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||     
T  1 aagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgcttgagcagtttagagacgtgac 100  T
Q  298 tcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacat 385  Q
    ||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||| || || ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  101 tctagtttgtgagttgtcacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaagatcaatagtgatttcttgaacaatatcagagaagcacat 188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35671 - 35422
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||  || |||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  35671 tttggagtaagccgcggtggtctttgtttagaaaatttggaagcattatttgtacggttccagatttgaagtatttagtgatcacaaaagtctaaaatat 35572  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    || ||  |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| | ||| |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35571 tttttcaatcagaaagatttgaacatgaagtagagaagatggttagagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccgggtaaagctaatg 35472  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35471 tggttgcagatgcgttgagtaggaagatgttgcacatgtctgctatgatg 35422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 266 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 28524 - 28400
Alignment:
Q  266 tttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttga 365  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||    
T  28524 tttgatttgctagagcagtttagagacttgagtcttgtctgtgagttgacacctcagagtgtacagttggggatgctgaagattaatagtgatttcttga 28425  T
Q  366 atagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||||| |||||||||| |||||    
T  28424 atagtatccgagaagcacaacaagt 28400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10485 - 10177
Alignment:
Q  49 acattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||    
T  10485 acattacttgtatggttcgagatttcaagtgttcagcgatcataaaagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaagttgg 10386  T
Q  149 ctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctg 248  Q
    ||||| |||||||  | ||  ||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||    
T  10385 ctcgaattgttgaaagattatgattttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttacatatgtctg 10286  T
Q  249 ctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagat 348  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | |||||| | ||||||||| | || |||||||||||  || | || |||||||||||    
T  10285 ctatgatggttaaggagttcgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgtgaggtgtcacctcagagtgtgaagctagggatgctaaagat 10186  T
Q  349 taacagcga 357  Q
     || |||||    
T  10185 caatagcga 10177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 70 - 390
Target Start/End: Original strand, 2141 - 2461
Alignment:
Q  70 atttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgg 169  Q
    |||| ||||||  |||||||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||||| || ||      
T  2141 attttaagtgttcagtgatcacaagagcttgaaatatttatttgatcaaaaggagttgaacatgaggcagaggagatggttagagctgttgaaggattat 2240  T
Q  170 gattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttg 269  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||| || || ||||    
T  2241 gattttagtttgaactatcatccgggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagcaggaaggcattgcatatgtcggcgttgatggtgaaagaatttg 2340  T
Q  270 agttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatag 369  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| || ||||||| |||    
T  2341 agttgcttgagcagttcagagacttgagtctggtttgtgaattgacacctcagagtgtgcagttgggtatgttgaaaattaacagtgaattcttgagtag 2440  T
Q  370 tatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  2441 tatccgagaagcacagcaagt 2461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16401 - 16093
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||     
T  16401 atttggagacactatttgtatgattcgagatttgaagtgttcagtgatcataagagtctgaagtatttgtttgatcagaagcaattgaatatgagacagc 16302  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||| || | |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||    
T  16301 gaaggtggatcaaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagactttgca 16202  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| | |||||| | ||||| ||||| || |||||||||||| || |||| |||    
T  16201 tatgtctgctatgatggttaaggagtttgagctgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgagttgtcacctcagagtgtaaagctgggaatg 16102  T
Q  341 ctaaagatt 349  Q
    || ||||||    
T  16101 ctgaagatt 16093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 309
Target Start/End: Original strand, 112274 - 112538
Alignment:
Q  45 ggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaag 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |     
T  112274 ggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtatttagtgatcacaagagtttgaaatatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtaa 112373  T
Q  145 atggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatg 244  Q
     ||||| || ||| |||  |  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||    
T  112374 gtggcttgaattgctgaacgactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttaagtaggaagacattgcatatg 112473  T
Q  245 tctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtga 309  Q
    ||  | ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  112474 tcgaccatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtctgtga 112538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 41 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 13992 - 13652
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  13992 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcaacgatcataaaagtctgaagtatttatttgatcagaaggaattgaatatgagacagc 13893  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | |||| ||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||    
T  13892 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtaaaactaatgttgtcgcagatgccttaagcaggaaaactttgca 13793  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||  || | || |||    
T  13792 tatgtccgccatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgtgaagctaggaatg 13693  T
Q  341 ctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||||  | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13692 ctaaagatcgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagc 13652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3734 - 3432
Alignment:
Q  25 ggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaa 124  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||    
T  3734 ggtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaa 3635  T
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||    ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||| ||||||| | ||    
T  3634 ttgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgttgaaatattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttacagatgcctcga 3535  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| | |||||  | || |||||||| ||  |||||||    
T  3534 gtaggaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagtttagagatttgagcttagtttgtgagttgtcatctcagag 3435  T
Q  325 tgt 327  Q
    |||    
T  3434 tgt 3432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7603 - 7338
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  7603 gagttggctgttgtggtctttgtattgaagatatggagacattgcttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 7504  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||| || ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  7503 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7404  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7403 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgct 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 3546 - 3648
Alignment:
Q  196 taaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttg 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||| | |||    
T  3546 taaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagactttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagtttgaattgttagaacagttcagagatttg 3645  T
Q  296 agt 298  Q
    |||    
T  3646 agt 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 381
Target Start/End: Original strand, 22971 - 23307
Alignment:
Q  45 ggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaag 144  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22971 ggagacattatttgtatggttctagatttgaagtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgaag 23070  T
Q  145 atggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatg 244  Q
     ||||| || |||||||  |  |  |||||||| |||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||||||| || || ||||| |  || || |||    
T  23071 gtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagttaatgtggttgcagatgccttaagtaggaaaattttacatatg 23170  T
Q  245 tctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaa 344  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||| |||| ||  |||||||| |||||||| | || ||||| || || |||||||||||  ||||||| ||| | |    
T  23171 tctcctatgatggttaaagagttggagctgctcgaatagtttagacacttgagtttagtttgtgaattgtcacctcagagtgtgaagttgggaatgttga 23270  T
Q  345 agattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    ||||||| || || || || |||||||| | ||||||    
T  23271 agattaatagtgaattttttaatagtattaaagaagc 23307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 102787 - 102511
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| || |||||||||||||| |    
T  102787 gagttgggtgctgtggtttttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaaatatttgt 102688  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||||||||| || ||| | | |||||||||| | ||    
T  102687 ttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggtttgaactatcatccaggtaaagctaattttgt 102588  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttta 287  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  102587 tgcagatgcattgagtaggaagactttgcatatgcccgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttta 102511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Original strand, 14150 - 14336
Alignment:
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||    
T  14150 atttgaacagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtg 14248  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttga 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  14249 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagagacttga 14336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 109 - 296
Target Start/End: Original strand, 22329 - 22515
Alignment:
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtg 208  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||  ||||||    
T  22329 atttgaacagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctacagctgttgaaggattatgattttggtttgaattaccatccag-taaagacaatgtg 22427  T
Q  209 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttga 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  22428 gttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcatatgtctgctctgatggtaaaagaatttgagttgctagaccattttagagacttga 22515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 76
Target Start/End: Original strand, 14098 - 14156
Alignment:
Q  18 ctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaa 76  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14098 ctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaa 14156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 76
Target Start/End: Original strand, 22277 - 22335
Alignment:
Q  18 ctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaa 76  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22277 ctgcggtggtctttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaa 22335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 381
Target Start/End: Original strand, 218186 - 218539
Alignment:
Q  25 ggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaa 124  Q
    |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||  ||||||   || |||| ||||| ||||||||||| |||    
T  218186 ggtttttgtgcttaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcaatcata---gtctgaagtatttgtttgatcagaaggaa 218282  T
Q  125 ttgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttga 224  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| ||||| ||  || | | |||||||||| | ||||||||||| || |    
T  218283 ttgaatatgagacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaactataatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaa 218382  T
Q  225 gcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagag 324  Q
    | |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||  || || || ||||||||    
T  218383 gtaggaagacgttgcatatgtccactatgatggtaaaagagtttgagttgcttgagcagtttagagatttgagtttagtctacgaattgtcacctcagag 218482  T
Q  325 tgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    |||  ||||||| |||||||||||| | || || |||||||| | ||||| ||||||    
T  218483 tgtgaagttgggaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacaatatcaaagaagc 218539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 29341 - 29601
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||||| |    
T  29341 tttgtattgaacatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaggaattaa 29440  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | |||||| || |||| ||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  29441 acatgaggtagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtag 29540  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||    
T  29541 gaagacgttgcatatgtccgctatgatggttaaagagttcgagttgcttgaacagtttaga 29601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 122 - 390
Target Start/End: Original strand, 4315 - 4583
Alignment:
Q  122 gaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctt 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||| |    
T  4315 gaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcggatgcgt 4414  T
Q  222 tgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctca 321  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||| || ||||| || |||||  |||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  4415 tgagcaggaagaccttacatatgtctgcattgatggtaaaagaatttgatttactagaatagtttagagacttgagccttgtttgtgagttgtcacctca 4514  T
Q  322 gagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||| |||||||||| ||||| |  ||||| || ||||||||||||| |||  ||||||| || |||||    
T  4515 gagtatacagttggggatgctgagaattaatagtgatttcttgaataatattcgagaagcgcagcaagt 4583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Original strand, 10637 - 10864
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  10637 tttgcagttggctgcggtggtgtttgttttgaaaatctggaggcattatttgtatggttctagattggaggtgttcagtgatcataaaagcttgaaatat 10736  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatg 206  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| || |  | ||  |||||||||||||||||||||   | |||||| ||||    
T  10737 ttatttgatcagaaggaattgaacatgaggcagcggagatggcttgagttcttaaaagattatgattttggtttgaattaccatcttggtaaagccaatg 10836  T
Q  207 tggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||    
T  10837 tggttgcggatgcgttaagcaggaagac 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 16632 - 16452
Alignment:
Q  213 cagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtt 312  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||| || || ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||| ||    
T  16632 cagatgccttgagtagaaagacattgcacatgtcggccttgatggtaagggaattggaattgctcgaacagtttagagacttgagtctcgtgtgtgaatt 16533  T
Q  313 atcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagttga 393  Q
     ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16532 gtcatctcaaagtgtgcagttgggtatgctgaagatcaatagtgatttcttgaatagtctcagagaagcacaacaagttga 16452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 13963 - 14237
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  13963 gagttggctgatgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatgtgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgt 14062  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | || ||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||| || ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  14063 tcgaacagaaggaattgaatatgaggcagggtagatggctagaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 14162  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  14163 tgcagatgctttgagtaggaagaccatgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtt 14237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 96619 - 96345
Alignment:
Q  110 tttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtgg 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |  | ||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||| |    
T  96619 tttgatcagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagctgttaaaagattatgattttgggttgaattaccatccgggaaaagctaatgtag 96520  T
Q  210 ttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtga 309  Q
    | || ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| || ||||| || || || ||||||||| || ||||| | || |||||    
T  96519 tcgctgatgcattgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatgataaaagaatttgattttctggaacagtttagagacatgagtttggtttgtga 96420  T
Q  310 gttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||| ||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  96419 gttgtcgtctcaaatcgtacagttggggatgctaaagattaacagtgattttctgagtagtatccgagaagcaca 96345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 320 - 55
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  320 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 221  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  220 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagatagcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 121  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  120 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgct 55  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2823 - 2558
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||  |||  |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  2823 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtactgtttgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 2724  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| || ||| |||  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  2723 tcgatcagaaggaattgaatatgaggcagcgtagattgcttgaattgctgaatgattttgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 2624  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2623 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgct 2558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 8475 - 8215
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  8475 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 8376  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  8375 atatgagacagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 8276  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| || ||||| || |||||||||    
T  8275 gaagacattgcatatgtccgctatgatggtcagagagttcgaattgcttgaacagtttaga 8215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 7926 - 7652
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| | | | |    
T  7926 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggggacattatttgtacggttcaagatttgagctgtttagtgatcataagagtttgaagtctctgt 7827  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  7826 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7727  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  7726 tgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtt 7652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 317 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4039 - 3966
Alignment:
Q  317 cctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  4039 cctcagagtgtacaattgggtatgttgaagattaatagcgatttcttgaatagtatccgagaagcgcagcaagt 3966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 381
Target Start/End: Original strand, 15266 - 15604
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaa-gtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagaga 142  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |  |||||||||| || |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| ||| ||    
T  15266 tggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcaacgatcataaaaagtctgaagtatctatttgatcaaaaggaattgaatatgagacagcga 15365  T
Q  143 agatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcaca 242  Q
    || ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |    
T  15366 aggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccatgtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcata 15465  T
Q  243 tgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgct 342  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||| || || | ||||||| | |||||| | || || || || || |||||||||||  ||||||| |||||    
T  15466 tgtccactatgatggtaaaagagtttgagttacttgaacggtttagagatttgagtttagtttgcgatttgtcccctcagagtgtgaagttgggaatgct 15565  T
Q  343 aaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagc 381  Q
    || |||| | || || |||||||| ||||||| ||||||    
T  15566 aaggattgatagtgaattcttgaacagtatcaaagaagc 15604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 289
Target Start/End: Original strand, 4105 - 4383
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || |    
T  4105 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgt 4204  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || ||| ||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  4205 tcaatcagaaagaattgaatatgaggcagcgtaaatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 4304  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||| ||| ||||||| |  ||||| ||||||||  | |||||||||    
T  4305 tgcagatgccttgagtaggaagacattgaatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttaaacagtttaga 4383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8933 - 8704
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| || ||| |||| |||||||    
T  8933 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgattagaaggaattga 8834  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  8833 atatgagacagagaagatggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 8734  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  8733 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 49644 - 49505
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | |    
T  49644 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattatttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgt 49545  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggct 150  Q
    | |||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  49544 tcgatcagatggaattgaatatgaggcagcgtagatggct 49505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 50984 - 50712
Alignment:
Q  13 gttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttattt 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| || |||||| |||| ||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| |||    
T  50984 gttggctgcggtggtctttgtattgaagatatggagaaattacttgtatgattcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttt 50885  T
Q  113 gatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttg 212  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| | || ||||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||||    
T  50884 gattagaaggaattgcatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactacgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgttg 50785  T
Q  213 cagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  50784 cagatgctttgagtaggaagactttgcacatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtt 50712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 20138 - 19878
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20138 tttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattga 20039  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  20038 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtag 19939  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  19938 gaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttaga 19878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35562 - 35302
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||| || ||||| |||| |||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35562 tttgtattgaagatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgaccacaagagcttgaaatattttttcgatcagaaagaattga 35463  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||    
T  35462 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgccttgagtag 35363  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  35362 gaagacattgcatatgtccgctatgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttaga 35302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 371 - 273
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| |||||  ||| |||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  371 gctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagactttgcatttgtttgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 2990 - 2728
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  2990 gagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgattagtgatcataagagtttgaagtatttgt 2891  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| || | || ||||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||| | | ||||| |||||| ||    
T  2890 ttgatcagaaggaattgaatatgaggtagcgtaggtggcttgaattgctgaaggactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagttaatgttgt 2791  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2790 tgcggatgctttgagtaggaagactttacatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagtt 2728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 273
Target Start/End: Original strand, 32325 - 32587
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| || || || |||||||| ||||| |    
T  32325 gagttggcagctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagcgagcacaagagtttgaagtatttgt 32424  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  32425 tcgatcagaaagaattgaatatgaggcagtgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 32524  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  || ||||||| || ||||| |||||    
T  32525 tgcagatgctttgagcagaaagacgttgcatatgtccactttgatggtcaaagagttcgagtt 32587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10132 - 9903
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10132 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattga 10033  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| |||   |||||||| |||||| |||  | ||  || || ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10032 atatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcag 9933  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  9932 gaagacattgcatatgtccgctttgatggt 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8902 - 8673
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  8902 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtattttttcgatcagaaggaattga 8803  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  8802 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 8703  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  8702 gaagacattgcatatgtccgctatgatggt 8673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 297
Target Start/End: Original strand, 6673 - 6929
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||      
T  6673 atttggagacattacttgtatggttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaag 6772  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  |  |  |||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||    
T  6773 gaaggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgggttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgcagatgcattaagtaggaagactctaca 6872  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgag 297  Q
     ||||| ||||||||| | || ||||| ||| |||| || ||||||||| |||||||    
T  6873 tatgtccgctatgatgatcaaagagttggagctgcttgaacagtttagagacttgag 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4636 - 4404
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || || |||||| |||| |||||||||||||| |||     
T  4636 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaattaattgtttgattagaaggaattgaatatgagacagc 4537  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
     ||||||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||| ||||| ||| | || || |||||||| || ||    
T  4536 aaagatggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcaaacggttaaagctaatgttgttgcggataccttaagtaggaagactttaca 4437  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagtt 273  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4436 tatgtctgctatgatggttaaggagtttgagtt 4404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 7083 - 7370
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||| |||||| ||| | |||||||| ||| | |    
T  7083 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggagacattacttgtaaggttcgagatttaaggtgtttagtgaccattagagtttgaagtatctgt 7182  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| ||| || ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  7183 tcgatcagaaggaattgaatatgaggaagcgtagatggcttgaattgctgaaggattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7282  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  7283 tgcagacgctttgagtaggaagaccttgcatttgtctgctatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 7370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17184 - 16949
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17184 ttgaagatatggagacattacttgtatcgttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatttgtttgatcagaaggaattgaatatga 17085  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  17084 gacagcgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagac 16985  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttga 270  Q
     ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16984 attgcatatgtcggccatgatggtaaaagagtttga 16949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5392 - 5109
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  5392 tggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 5293  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  5292 ggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 5193  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||    
T  5192 gtccactatgatggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgt 5109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12522 - 12239
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  12522 tggagacattatttgtacaattctagatttgaagtgttcagcgatcataaaagtctgaagtatctgtttgatcagaaggaattgaatatgagacagcgaa 12423  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || || ||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| |   |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  12422 ggtggcttgaattattgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaagtaaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttgcatat 12323  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||| | |||||| | ||||| || || || |||||||||||    
T  12322 gtccactatgatggtaaaaaagtttgagttgcttgaacaatttagagatttgagtttagtctgcgaattgtcacctcagagtgt 12239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 21
Alignment:
Q  9 tggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatattt 108  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| || ||| | || |||||    
T  202 tggagttggcggcagtggtgtttgttttgaaaatttggaggcattatttgtacggttccagatttgaggtgttcagtgatcacaagagtctaaagtattt 103  T
Q  109 atttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccat 190  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | ||  |||||||||||||||||||||    
T  102 atttgaccagaaggaattgaatatgaggcagaggagatggcttgagttgttaaaagattatgattttggtttgaattaccat 21  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 41 - 349
Target Start/End: Original strand, 16759 - 17067
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||      
T  16759 atttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgattagaaggaattgaatatgagacaac 16858  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||  |||||||| ||  | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  16859 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgagttgaattatcaaccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 16958  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||| | |||||  | ||||||||  | || |||||||||||  |||| || |||    
T  16959 tatgtccgctatgatggtcaaggaatttgagttacttgaacagtttagagatttgagcttagtctgtgaagtgtcacctcagagtgtgaagttaggaatg 17058  T
Q  341 ctaaagatt 349  Q
    || ||||||    
T  17059 ctgaagatt 17067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 38590 - 38850
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  38590 tttgtattgaaaatatggagacattacctgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcagaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaattga 38689  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| |  ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||| | ||    
T  38690 atatgaggcagcgtagatggctggtattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgtgtag 38789  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||    
T  38790 gaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgcttgaacagtttaga 38850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 66941 - 66712
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||| ||||| || |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||    
T  66941 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcaaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagttcgaagtatttgttcgatcagaaggaattga 66842  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    |||| || ||| | |||||||| |||||| |||  | ||  || |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  66841 atattagacagcgtagatggctagagttgctgaaagattatgactttggtttgaattaccatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagcaa 66742  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  66741 gaagacattgcatatgtccgctttgatggt 66712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1607
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  1758 tttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatat 1659  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgt 158  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  1658 ttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgt 1607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 7 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8186 - 8035
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  8186 tttggagttggctacggtggtttttgtgttaaaaatttggagacattatttatacggttccagatttgaggtgtttagtgatcactaaagtttgaaatat 8087  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgt 158  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  8086 ttatttgatcaaaatgaattaaatatgaggcaacgaaggtggcttgagttgt 8035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 309
Target Start/End: Original strand, 25697 - 25994
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||  | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| || |||||||||||||| |    
T  25697 gagttggctgttgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttaatgatcacaagagtttgaaatatttgt 25796  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||| |||  ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||  ||| || || | ||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||    
T  25797 ttgattagagggaattgaatattaggcagcgtaggtggcttgaattactgaaggattag-attttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 25895  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtga 309  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||| | || ||||||||| | |||||| | ||||||||    
T  25896 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgttggaacagtttagagatttgagtttagtctgtga 25994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 899
Alignment:
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  936 ttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 327
Target Start/End: Original strand, 85298 - 85587
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggc 137  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  85298 aaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaattgttcagcgatcataaaagttttaagtatttatttgaccagaaagaattaaatatgaggc 85397  T
Q  138 agagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgtt 237  Q
    |  |||| ||||| || ||    | || ||  ||||| || |||||||||||| ||| |||  |||||||  ||||||||||||| || ||||| || ||    
T  85398 aacgaaggtggcttgaattaaaaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttattgcagatgctttaagtaggaaaacatt 85497  T
Q  238 gcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
     || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| | || |||||  | ||||| ||||||||    
T  85498 acatatgtctgctatgatggttagagagtttgagttgcttgaacagtttagagacttgagtttggtttgtgaagtgtcgccgcagagtgt 85587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 92887 - 92834
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  92887 agtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 92834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7550 - 7290
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| || ||||| |||| ||||||||| || || || || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  7550 tttgtattgaagatatggagacattatttttatggttctaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagcttaaagtatttgttcgatcagaaagatttga 7451  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  7450 atatgaggcagaggaggtggcttgaattgttgaaggattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 7351  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
     ||||| ||||| |||||  |||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||||    
T  7350 taagacattgcatatgtcctctatgatggttagagagttcgagttacttgatcagtttaga 7290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 258
Target Start/End: Original strand, 28144 - 28367
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  28144 ttgaagatatggagacactacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaaatacttgttcgaccagaaagaattgaatatga 28243  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    ||||| | |||||||| || ||| ||| || ||  || |||||||| ||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||| | |||||  |||||||    
T  28244 ggcagcgtagatggctagaattgctgaaggattatgactttggtttcaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagattccttgagttggaagac 28343  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
     ||||| ||||| |||||||||||    
T  28344 attgcatatgtccgctatgatggt 28367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 60307 - 60096
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||| ||||| | |||||||||  | ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||| | || |||||||    
T  60307 gagttagctgcagtggtttttgtactcaaaatttggaggcattatctgtatggttctagatttgaagttttcagtggtcataaaagtataaagtatttat 60208  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    |||| |||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| || ||| | | || ||  ||||| || |||||||||||| ||| ||| | |||||| ||    
T  60207 ttgaccagaagaaattgaatatgaggcagcaaaggtggctagaattgctaaaggattatgatttcggattgaattaccatccgggtaagggtaatgttgt 60108  T
Q  211 tgcagatgcttt 222  Q
    ||||||||||||    
T  60107 tgcagatgcttt 60096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 196 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 131475 - 131386
Alignment:
Q  196 taaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  131475 taaagctaatgttgttgcagatgctttgagtaggaagaccttgcatatgtctgccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagtt 131386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Original strand, 3257 - 3351
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaata 105  Q
    ||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||    
T  3257 gagttggctgctgtgatttttgtgttgaaaatatggagacattatttgtacggttctagatttgaagtgttcagcgatcataagagtctgaaata 3351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 3393 - 3495
Alignment:
Q  196 taaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttg 295  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||| |||||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||| | |||    
T  3393 taaagctaatgttgttgcagatgccttaagtaggaaaactttgcatatgtcttctatgatggttaaagagttttaattgcttgaacagtttagagatttg 3492  T
Q  296 agt 298  Q
    |||    
T  3493 agt 3495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 54717 - 54830
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || ||||| |  ||||| ||||  | ||| |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  54717 ttgaagatttggagtcattatctttatggttctatttttgaggtgttcattgaccataagtgtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 54816  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||| ||||||||    
T  54817 ggcagcgaagatgg 54830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 285
Target Start/End: Original strand, 38700 - 38974
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| || || || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||| |    
T  38700 gagttggctgctgtggtctttgtattaaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgagcataacagtttgaagtatttgt 38799  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| ||||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  38800 tcgatcagaaggaattgaacatgagacatcgaaggtggcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 38899  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  38900 tgcagacgctttgagtaggaagaccttggatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtt 38974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 20325 - 20459
Alignment:
Q  7 tttggagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatat 106  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||| | ||||||    
T  20325 tttggagttggctgcggtggtttttgttttgaagatttggaggcattatttgtatggttccagatttgaagtattcagtgatcaaaaaagtctaaaatat 20424  T
Q  107 ttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagag 141  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||    
T  20425 ttatttgatcataaggaattgaacatgaagcagag 20459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 286
Target Start/End: Original strand, 16340 - 16591
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | ||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16340 ttgaagatttggaggcattatttgtatggttctaagtttgaggcgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 16439  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||| ||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16440 ggcaaagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagac 16539  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  16540 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgagttgattgagcagttt 16591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 285 - 390
Target Start/End: Original strand, 20467 - 20572
Alignment:
Q  285 ttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20467 ttagagacttgagtcttgtctgcgaattgacacctcagagtgtacagttagggatgctgaagtttaacagtgatttcttgaatagtatccgggaagcaca 20566  T
Q  385 tcaagt 390  Q
     |||||    
T  20567 gcaagt 20572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 25658 - 25771
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| |||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25658 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25757  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  25758 ggcaaagaagatgg 25771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 27042 - 27155
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27042 ttgaagatttggaggcaatatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 27141  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||||||    
T  27142 ggcagagaagatgg 27155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27293
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  27207 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttt 27293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 258
Target Start/End: Original strand, 3175 - 3404
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  3175 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggattgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttatttgatcagaaggaattga 3274  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| |||   |||||||| |||||| |||  | ||  || || ||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3275 atatgagacagcttagatggctagagttgctgaaagattatgacttcggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgtggttgccgatgctttgagcag 3374  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  3375 gaagacattgcatatgtccgctttgatggt 3404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 289
Target Start/End: Original strand, 79264 - 79524
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | ||||| ||||| || || || |||| ||||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  79264 tttgtattgaagatatggagacatcacttgtatggttcgaggttcgaggtgtttagtgatcacaagagattgaagtatttgttcgatcagaaagaattga 79363  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| |||| ||||| || || ||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  79364 atatgaggcagcgaaggtggcttgaattattgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 79463  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttaga 289  Q
     ||||| ||||| ||||| || |||||||| |  ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  79464 aaagacattgcatatgtccgccatgatggttagagagttcgagttacttgagcagtttaga 79524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 55296 - 55232
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaa 102  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  || ||||| || ||||||||    
T  55296 aaaatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagcgatcacaagagtttgaa 55232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 298
Target Start/End: Original strand, 7405 - 7692
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||| | |||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||| | |    
T  7405 gagttggctgctgtggtctttgtattgaagatatggaaaaattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgaacataagagtttgaagtatctgt 7504  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| || |||||||||||||||||| | || ||||| || ||| ||| |   |  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||    
T  7505 tcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtaggtggcttgaattgctgaagaactatgattttgagttgagctatcatccgggtaaagctaatgttgt 7604  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  7605 tgcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgtcggccatgatggtaaaagagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 7692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 12119 - 11908
Alignment:
Q  179 ttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctag 278  Q
    |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||| |  |||||||||| || ||||| |||||||    
T  12119 ttgaattaccatcctggtaaagccaatgtggttgcagatgcgttgagtaggaagaccttacatatgtctacgttgatggtaaaagaatttgatttgctag 12020  T
Q  279 agcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagaga 378  Q
    | ||||||||  ||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||| ||| | |  ||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  12019 aacagtttagtgacttgagccttgtttgtgaattgtcacctcagagtatacagttggggatgttgagaattaatagtgatttcttgaatagtatccgaga 11920  T
Q  379 agcacatcaagt 390  Q
    ||| || |||||    
T  11919 agcgcaacaagt 11908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 40087 - 39837
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40087 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgatcataagagtttgaagtatctatttgatcagaaggaatggaatatga 39988  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| |||| | ||| || ||| | |  | ||  |||||||  ||||  || ||| ||| |||||||||||| ||||||||  || ||||  |||||||    
T  39987 gacagcgaaggtagcttgaattgctaaaagattatgattttgagttgagctatcatccggttaaagctaatgttgttgcagacactctgagtgggaagac 39888  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtt 285  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  39887 cttgcatatgtctgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagtt 39837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 327
Target Start/End: Original strand, 115687 - 115973
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |       
T  115687 atttggagacattatttgtatggttatagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttttttgatcagaaggaattaaatatgagaccac 115786  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | ||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  115787 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttggattgaattatcatccaggtaaggctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 115886  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
     ||||| ||||||||| | || ||| | ||| |||| || ||||||||| || ||||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  115887 tatgtccgctatgatgatcaaagagctggagctgctcgaacagtttagagacctgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgt 115973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2425 - 2089
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||       |||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||     
T  2425 atttggagacattatttctatggttctagatttgaagtgt-------tcataaaagtctgaagtattcatttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagc 2333  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  ||||| ||  ||||||| ||| | | ||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  2332 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatgatttcgggctgaattatcatccaggtaaagctaatgttcttgcagatgctttaagtaggaaaactttaca 2233  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatg 340  Q
     ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||  || |||||||   || ||||| |||| ||||| || || |||||||||||  ||||||| |||    
T  2232 tatgtctgctatgatggttaaaaagttggagctgcacgaacagtttattgacctgagttttgtttgtgaattgtcacctcagagtgtcaagttgggaatg 2133  T
Q  341 ctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcaca 384  Q
     | |||||||| || || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  2132 ttgaagattaatagtgaatttttgaacagtattaaagaagcaca 2089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 231
Target Start/End: Original strand, 8429 - 8631
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||    
T  8429 tttgtattgaagatatggagacattacttgtacggttcgagatttgaggtgtttagtgatcataagagtttgaagtatctgttcgatcagaaggaattga 8528  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    | ||||| ||| | |||||||| || ||| ||| ||  |  |||||||  ||||  || ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  8529 acatgagacagcgtagatggcttgaattgctgatggactatgattttgagttgagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcaaatgctttgagtag 8628  T
Q  229 gaa 231  Q
    |||    
T  8629 gaa 8631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 102 - 1
Alignment:
Q  49 acattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  102 acatgatttgtacggttccagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtttgaaatatctgtttgatcaaaaagagttgaatatgaggcagagaagatgg 3  T
Q  149 ct 150  Q
    ||    
T  2 ct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 390
Target Start/End: Original strand, 48168 - 48337
Alignment:
Q  221 ttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctc 320  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||    
T  48168 ttgagcaggaagacactgcatatgtctgctatgatggtaaaagaatttgatttgctggaacggtttagagacttgagtctggtatgtgagttgtcgcctc 48267  T
Q  321 agagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaagcacatcaagt 390  Q
    ||||| ||||||| || ||||| |||||||| || |||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||    
T  48268 agagtatacagttaggcatgctgaagattaatagtgatttcttgggtagtatccgagaggcacaacaagt 48337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2412 - 2188
Alignment:
Q  46 gagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaaga 145  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||||| | ||     
T  2412 gagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaaatatttgctttatcagaaggaaatgaatatgaggcagcgtagg 2313  T
Q  146 tggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgt 245  Q
    ||||| || ||| |||  | ||  |||||||  ||||  || |||   | |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2312 tggcttgaattgctgaaagattatgattttgagttgagctatcatctaggtaaagctaatgttgtagcagatgctttgagtaggaagacattgcatatgt 2213  T
Q  246 ctgctatgatggtaaaggagtttga 270  Q
    | || ||||||||||| ||||||||    
T  2212 cggccatgatggtaaaagagtttga 2188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 327
Target Start/End: Original strand, 7839 - 8155
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||| || |||||| || ||| |||||||||| |    
T  7839 gagttggctgctgtggtctttgtgttgaaaatatggagacattacttgtatggttctagattcgaggtgtttaatgatcacaagagtctgaaatatttgt 7938  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||  |  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||||| ||    
T  7939 ttgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgaaggtggcttgaattgctgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatgttgt 8038  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgag 310  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||| | || ||||||||| | |||||| | || |||||     
T  8039 tgcagatgccttaagtaggaaaacattgcatatgtcggccatgatggtaagagagttcgagttgtttgaacagtttagagatttgagtttagtatgtgaa 8138  T
Q  311 ttatcgcctcagagtgt 327  Q
    || ||  ||||||||||    
T  8139 ttgtcatctcagagtgt 8155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1954 - 1656
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  1954 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattga 1855  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  1854 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcag 1755  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||    
T  1754 gaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgt 1656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15694 - 15396
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||| |||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  15694 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggtttgaggtttgaggtgtttagcgatcacaagagcttgaagtatttgtttgatcaaaaggaattga 15595  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  15594 atatgaggcagcgtagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgccttgagcag 15495  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    |||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| || || ||||| ||| | |||||| | || ||||| |  || |||||||||||    
T  15494 gaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagtttgagttacttgaacagttcagagatttgagtttagtttgtgaatggtcacctcagagtgt 15396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 57553 - 57336
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||| || || ||||| ||||| |    
T  57553 tttgtattgaaaatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagttcgaagtatttgttcgaccagaaggaattaa 57454  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||| ||  | |||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  57453 atatgagacaacgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgtagatgctttgagcag 57354  T
Q  229 gaagacgttgcacatgtc 246  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  57353 gaagacattgcatatgtc 57336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 18819 - 19054
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    |||||||| || | ||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||| ||| ||||| || || || || ||||| |    
T  18819 gagttggcggctgtggtctttgtattgaatatatggagacattacttgtatggttcaaggtttcaggtgtttagcgatcacaagagcttaaagtatttgt 18918  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggt 210  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||  | ||  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  18919 tcgatcaaaaagaattgaatatgaggcagcatagatggctagaattgctgaaagattatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgt 19018  T
Q  211 tgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtc 246  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  19019 tgcagatgccttgagcaggaatacattgcatatgtc 19054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 327
Target Start/End: Original strand, 196296 - 196546
Alignment:
Q  77 gtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttg 176  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||  | || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  | ||  || ||||    
T  196296 gtgtttagtgatcataagagtttaaagtacctgttcgaccagaaagaattgaatatgaggcagcgaagatggcttgaattgttgaaagattatgactttg 196395  T
Q  177 gtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgct 276  Q
    |||||||||| ||| | | |||||||||||| || || || || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||| ||||||||    
T  196396 gtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgtcgcggacgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctttgatggttagagagttcgagttgct 196495  T
Q  277 agagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
     || || |||||| |  ||||| | || |||||||  || |||||||||||    
T  196496 tgaacaatttagagatatgagtttagtttgtgagtggtcacctcagagtgt 196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6751 - 6488
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | ||||||| |||  |||||||| ||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  6751 ttgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtatttagtgataatacgagtttgaagtatctattcgatcagaaggaatggaatatga 6652  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    | ||| |||| ||||| || ||| | |  | ||   | ||||  || |  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  6651 gacagcgaaggtggcttgaattgctaaaagattataactttgagttaagctatcattcgggtaaagctaatgttgttgcagatgctttgagtatgaagac 6552  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  6551 tttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttcagagatttgagt 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 521 - 340
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||     
T  521 atttggaggcattatctgtattgttctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtttgaagtatttatttgactagaaagaattaaatatgaggcagc 422  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgcttt 222  Q
    |||| ||||| || |||   | || ||  ||||| || |||||||||||| ||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  421 gaaggtggctggaattgccaaaggattatgatttcgggttgaattaccatccgggtaagactaatgttgttgcagatgcttt 340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 312
Target Start/End: Original strand, 13863 - 14134
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||      
T  13863 atttggagacattatttgtatggctctagatttgaagtgttcagtgatcataaaagtctgaagtatttgtttgatcagaaggaattaaatttgagacaac 13962  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    |||| ||||| || |||||||  | ||  | |||||| |||||||| ||| |   ||||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||  | ||    
T  13963 gaaggtggcttgaattgttgaaagattatggttttgggttgaattatcatcctagtaaagctaacgttgttgcagatgctttaagtaggaaaactctaca 14062  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagtt 312  Q
     ||||| ||||||||| | || ||||| ||| |||| || ||||||| | || ||||| | || ||||||||    
T  14063 tatgtccgctatgatgatcaaagagttggagctgctcgaacagtttaaagacctgagtttagtttgtgagtt 14134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 12762 - 12973
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  12762 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagtttaaagtatttgttcgatcagaaagaattga 12861  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    ||||||||||| | ||||||||  |  |  |||  |  |  || |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  12862 atatgaggcagcgtagatggctaaaaatactgaaagaatatgactttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtag 12961  T
Q  229 gaagacgttgca 240  Q
    |||||| |||||    
T  12962 gaagacattgca 12973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 473
Alignment:
Q  26 gtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaat 125  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  591 gtttttgtgttgaagatttggagacattacttatatggttcgagatttgaggtgtttagtgatcacaagagcttgaaatatttgttcgatcagaaagaat 492  T
Q  126 tgaatatgaggcagagaag 144  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  491 tgaatatgaggcagcgaag 473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 179 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 5417 - 5215
Alignment:
Q  179 ttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctag 278  Q
    |||||||| ||| | | |||||||||| | ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  5417 ttgaattatcatccaggtaaagctaattttgttgcagatgccttaagtaggaagacgttacatatgtccgctatgatggtaagagagtttgagttgcttg 5318  T
Q  279 agcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagaga 378  Q
    | ||||||||  | |||||| | |||||||| || || |||||||||||  || || | |||||||||||| | || || |||||||| ||||||| |||    
T  5317 aacagtttagggatttgagtttagtctgtgaattgtcacctcagagtgtgaagctgagaatgctaaagattgatagtgaattcttgaacagtatcaaaga 5218  T
Q  379 agc 381  Q
    |||    
T  5217 agc 5215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Original strand, 2651 - 2914
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2651 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 2750  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  2751 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 2850  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  2851 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 2914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 240
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24054
Alignment:
Q  29 tttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattga 128  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  23843 tttgtattgaagatatggagacattacttgtatggttcgaggtttgaggtgtttagtgatcacaagagtttgaagtatttgttcgaacagaaggaattga 23942  T
Q  129 atatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcag 228  Q
    |||||||||||||||| |||||  | |||||||  | ||  || ||| | |||||||| |||   | |||||||||||| || |||||||| ||||| ||    
T  23943 atatgaggcagagaaggtggcttaaattgttgaaagattatgactttaggttgaattatcatctaggtaaagctaatgttgtcgcagatgccttgagtag 24042  T
Q  229 gaagacgttgca 240  Q
    |||||| |||||    
T  24043 gaagacattgca 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24924 - 24661
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24924 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 24825  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  24824 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 24725  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  24724 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 24661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 14438 - 14175
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14438 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 14339  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  14338 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcccggaaaggctaatgttgttgcggatgctttgagtagaaagac 14239  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  14238 tttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 14175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39858 - 39686
Alignment:
Q  86 gatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaatt 185  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||  | ||  || |||||||||||||    
T  39858 gatcacaagagtttgaagtatttgttcgatcaaaaggaattgaatatgaggcagcgtagatggctagaattgttgaaagattatgactttggtttgaatt 39759  T
Q  186 accattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    | ||| | | |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  39758 atcatccaggtaaagctaatgttgttgttgatgctttgagcagtaagacattgcatatgtccgctttgatggt 39686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6704 - 6441
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  6704 ttgaaaatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatga 6605  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagac 234  Q
    |||||||||||||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |    
T  6604 ggcagagaagatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcatcctgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagtc 6505  T
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  6504 tttgcatatgtctgctttgatggttaatgagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 6441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 992 - 729
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  992 ttgaatatttggagtcattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagaattgaatatga 893  T
Q  135 ggcagagaagatggctcgagt-tgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaaga 233  Q
    |||||||||||||| |  | | | || | | |||  ||||||   |||| ||| ||| | |  || |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  892 ggcagagaagatggttgaaatatcttaaggactt-tgattttcagttgagttatcatcccgggaaggctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaaga 794  T
Q  234 cgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  793 ctttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtttgatttgtttgagcagtttcgagacttgagt 729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15588 - 15478
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  15588 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaaatatttatttgattagaaagagttgaatatta 15489  T
Q  135 ggcagagaaga 145  Q
    |||||||||||    
T  15488 ggcagagaaga 15478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 8789 - 8532
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| |||| |||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8789 attttgaggcattatttgtatggttctaagtttgaggtgtttagtgaccataagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaa 8690  T
Q  141 gaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgca 240  Q
    ||| |||| | || |   | | || ||  ||||||   |||| ||| ||  ||   || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  8689 gaatatggttggaatatcttaaggattttgattttcagttgagttatcacccgaggaaggctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgca 8590  T
Q  241 catgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
     ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  8589 tatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagt 8532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 9)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 72718 - 72606
Alignment:
Q  36 tgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgag 135  Q
    |||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | |||| |||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  72718 tgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagttttaggtgtttagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatgag 72619  T
Q  136 gcagagaagatgg 148  Q
    |||||||||||||    
T  72618 gcagagaagatgg 72606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25327 - 25229
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  25327 gctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaatgagtttgaattgattgagcagtttcgagacttgagt 25229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 72554 - 72456
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  72554 gctaatgttgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaggagttggaattgattgagcagtttcgagacttgagt 72456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 6741 - 6628
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| |  |||||  ||| |||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||     
T  6741 ttgaagatttggaggcattatctgtatggttctaagtttgatttgtttagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgc 6642  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  6641 ggcaaagaagatgg 6628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15925 - 15848
Alignment:
Q  71 tttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  15925 tttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatgg 15848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25456 - 25379
Alignment:
Q  71 tttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  25456 tttgaagtgttcagtgaccacaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaatagttgaatatgaggcaaagaagatgg 25379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 32189 - 32298
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||| ||||| |  |||||||||| |||||| || || | |||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32189 ttgaagatttggaagcattatctgtatggttctaagtttgaagtgtttagtgaccacaagaatttgaagtacttgtttaatcagaaagagttgaatatga 32288  T
Q  135 ggcagagaag 144  Q
    |||| |||||    
T  32289 ggcaaagaag 32298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 267
Target Start/End: Original strand, 32354 - 32421
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtt 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || |||||    
T  32354 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagtt 32421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15710
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  15796 gctaatgtcgttgttgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttt 15710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3135 - 2985
Alignment:
Q  11 gagttggctgcgggggtttttgttttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttat 110  Q
    ||||||||||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||||  |||||||| |  |||||||||||||| |    
T  3135 gagttggctgctgtggtttttatattgaaaatatggagacattacttgtatgattcgagatttgaggtgttcagtgatcacacgagtttgaaatatttgt 3036  T
Q  111 ttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttga 161  Q
    | ||| |||| || |||||||| ||||||  ||| ||||| || |||||||    
T  3035 tcgataagaaggagttgaatataaggcagcaaaggtggcttgaattgttga 2985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 11486 - 11599
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11486 ttgaagatttagaggcattatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgagcaaaagagtttgaagtatttatttgatcagaaagagttgaatatga 11585  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  11586 ggcagaggagatgg 11599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 2728 - 2837
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2728 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaagtttgaggtgttaagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 2827  T
Q  135 ggcagagaag 144  Q
    |||| |||||    
T  2828 ggcaaagaag 2837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 19577 - 19464
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19577 ttgaagatttggagacattatctgtatggttctaattttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaacagttgaatatga 19478  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  19477 ggcaaagaagatgg 19464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 173 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 26366 - 26281
Alignment:
Q  173 tttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  26366 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgccttgagtaggaagacattgcatatgtccgctatgatggt 26281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24859 - 24743
Alignment:
Q  173 tttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagt 272  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  | || ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||    
T  24859 tttggtttgaattatcatccaggtaaagctaatgttgttgcagatgctttaagtaggaagactctacatatgtccgctttgatggttaaagagttcgagt 24760  T
Q  273 tgctagagcagtttaga 289  Q
    |||| || |||||||||    
T  24759 tgcttgaacagtttaga 24743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 44 - 327
Target Start/End: Original strand, 852 - 1135
Alignment:
Q  44 tggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaa 143  Q
    |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||| | ||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| | |    
T  852 tggagaaattacttgtatggttcgagatttgaagtattcagcgatcacaagagtctaaaatatttatttgatccaaaggaattcaatatgaggcagcgta 951  T
Q  144 gatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacat 243  Q
    | ||||| || |||||||  |  |  |||||||  ||||  || ||| | | |||||||||| | || |||||||| ||||  |||||||| ||||| ||    
T  952 ggtggcttgaattgttgaaagactatgattttgagttgagctatcatccaggtaaagctaatcttgtagcagatgccttgaataggaagacattgcatat 1051  T
Q  244 gtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgt 327  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| || ||| | || ||||||||| | |||||| |  |||| ||||| ||  ||||||||||    
T  1052 gtcggccatgatggtaaaagagttcgaattgttcgaacagtttagagatttgagtttattctgagagttgtcatctcagagtgt 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10659 - 10561
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || ||||||||    
T  10659 gctaatgttgttgccgatgctttgagtaggaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttttgagacttgagt 10561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 10818 - 10711
Alignment:
Q  41 atttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcaga 140  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10818 atttggaggcataatttgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccaaaagagtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaggcata 10719  T
Q  141 gaagatgg 148  Q
    ||||||||    
T  10718 gaagatgg 10711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 1049 - 963
Alignment:
Q  212 gcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  1049 gcagatgctttaagtaggaagaccttgcatatgtccgctatgatggtaaaggagttcgagttgcttgaacagttaagagatttgagt 963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34743 - 34677
Alignment:
Q  36 tgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaa 102  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34743 tgaagatttggagacattacttgtatggttcgagatttgaagtgtttagtgatcataaaagtctgaa 34677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25356 - 25243
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| |||||| | || ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25356 ttgaagatttggaggcattatctttatggttcgaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatttgtttgatcagaaagagttgaatatga 25257  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    ||||||| ||||||    
T  25256 ggcagaggagatgg 25243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 148
Target Start/End: Original strand, 133265 - 133378
Alignment:
Q  35 ttgaaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgtctagtgatcataaaagtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatga 134  Q
    ||||| |||||||| || ||| |||| ||||| |  ||||| ||||  ||||| || || |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  133265 ttgaagatttggaggcactatctgtatggttctaagtttgaggtgttcagtgaccacaagagtttgaagtatctgtttgatcagaaagagttgaatatga 133364  T
Q  135 ggcagagaagatgg 148  Q
    |||| |||||||||    
T  133365 ggcaaagaagatgg 133378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25188 - 25105
Alignment:
Q  203 aatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagttt 286  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| || ||| | |||||||||    
T  25188 aatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagttt 25105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Original strand, 133430 - 133488
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggt 258  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  133430 gctaatgttgttgctgatgctttgagtagaaagactttgcatatgtctgctttgatggt 133488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 281 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 27545 - 27445
Alignment:
Q  281 cagtttagatacttgagtcttgtctgtgagttatcgcctcagagtgtacagttgggtatgctaaagattaacagcgatttcttgaatagtatcagagaag 380  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  27545 cagtttagagacctgagtcttgtctgtgaattgtcatctcagagtatacagttggggatgctgaagattgatagtaatttcttgaacagtatccgagaag 27446  T
Q  381 c 381  Q
    |    
T  27445 c 27445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 235 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 18010 - 17947
Alignment:
Q  235 gttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagt 298  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  18010 gttgcatatgtccgctatgatggtaaaagagtttgagttgcttgaacagtttagagatttgagt 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Original strand, 9813 - 9855
Alignment:
Q  38 aaaatttggagacattatttgtagggttccagatttgaagtgt 80  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9813 aaaatatggagacattatttgtacggttccagatttgaagtgt 9855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 218
Target Start/End: Original strand, 9861 - 9975
Alignment:
Q  104 tatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatggctcgagttgttgacggcttgggattttggtttgaattaccattcggataaagcta 203  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  | ||  |||||||| |||||||| ||| | | || ||| |    
T  9861 tatttgtttgatcagaaggaattgaatatgagacaacgaaggtggcttgaattgttgaaagattatgattttgggttgaattatcatccaggtatagcca 9960  T
Q  204 atgtggttgcagatg 218  Q
    |||| ||||||||||    
T  9961 atgttgttgcagatg 9975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Original strand, 7726 - 7779
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  7726 agtttgaagtacttgtttgatcagaaagagttgaatatgaagcagagaagatgg 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45713 - 45612
Alignment:
Q  197 aaagctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttga 296  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| || ||||||    
T  45713 aaagcgaatgtttttgctgatgctttgagtaaaaagactttgcatatgtctgctttgatggttaaggagttggaattgattgagcagtttcgagacttga 45614  T
Q  297 gt 298  Q
    ||    
T  45613 gt 45612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45800 - 45762
Alignment:
Q  110 tttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  45800 tttgatcagaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 45762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 200 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 8537 - 8434
Alignment:
Q  200 gctaatgtggttgcagatgctttgagcaggaagacgttgcacatgtctgctatgatggtaaaggagtttgagttgctagagcagtttagatacttgagtc 299  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||| |||||| || ||||||| || ||||| || ||| | ||||||||| || || |||||     
T  8537 gctaatgttgttgctgatgctttgagtatgaagactttgcatatgtctcctttgatggttaaagagttggaattgattgagcagtttcgagacctgagtt 8438  T
Q  300 ttgt 303  Q
    ||||    
T  8437 ttgt 8434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 4014 - 3961
Alignment:
Q  95 agtttgaaatatttatttgatcagaaagaattgaatatgaggcagagaagatgg 148  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4014 agtttgaagtatttgttttatcaaaaagagttgaatatgaggcaaagaagatgg 3961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University