View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9913A_low_64 (Length: 386)

Name: NF9913A_low_64
Description: NF9913A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9913A_low_64
NF9913A_low_64
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (5-370)||(25528543-25528907)
chr5 (78-369)||(22956578-22956869)
chr5 (75-349)||(29895468-29895743)
chr5 (43-369)||(20097063-20097381)
chr5 (92-369)||(7259585-7259847)
chr5 (19-349)||(36450620-36450945)
chr5 (92-327)||(1800520-1800752)
chr5 (91-327)||(12393073-12393305)
chr5 (92-327)||(7789215-7789448)
chr5 (192-327)||(21690963-21691099)
chr5 (137-369)||(24962787-24963024)
chr5 (276-369)||(26871391-26871485)
chr5 (225-369)||(12178682-12178831)
chr5 (5-175)||(21691131-21691293)
chr5 (225-369)||(33842946-33843095)
chr5 (107-178)||(11811389-11811460)
chr5 (107-178)||(26087312-26087383)
chr5 (107-178)||(27231617-27231688)
chr5 (107-178)||(33842813-33842884)
chr5 (225-369)||(11811535-11811684)
chr5 (225-369)||(26087451-26087600)
chr5 (228-369)||(20378842-20378986)
chr5 (228-362)||(28846291-28846421)
chr5 (228-340)||(23638463-23638576)
chr5 (228-340)||(23834313-23834426)
chr5 (312-369)||(21994030-21994087)
chr5 (283-369)||(27231798-27231887)
chr5 (127-178)||(12178564-12178616)
chr5 (193-249)||(16565522-16565578)
chr5 (86-174)||(21993808-21993896)
chr5 (327-365)||(16565408-16565446)
chr5 (141-183)||(34464027-34464069)
chr5 (132-177)||(21865933-21865978)
chr5 (309-369)||(21866118-21866180)
chr5 (91-176)||(20667243-20667328)
[»] chr3 (37 HSPs)
chr3 (5-370)||(15622802-15623166)
chr3 (38-370)||(70493-70823)
chr3 (5-369)||(14885176-14885541)
chr3 (19-369)||(30093231-30093584)
chr3 (19-369)||(8608528-8608883)
chr3 (7-369)||(12476895-12477256)
chr3 (5-370)||(14420644-14421013)
chr3 (19-349)||(23285513-23285846)
chr3 (92-370)||(6196758-6197033)
chr3 (91-369)||(8806687-8806973)
chr3 (5-349)||(13109158-13109495)
chr3 (19-349)||(33568231-33568557)
chr3 (78-369)||(21610136-21610416)
chr3 (192-349)||(12557421-12557579)
chr3 (92-327)||(8618849-8619080)
chr3 (92-327)||(46398135-46398366)
chr3 (104-369)||(3242808-3243076)
chr3 (92-327)||(15534698-15534928)
chr3 (259-368)||(11183793-11183903)
chr3 (107-369)||(25265886-25266150)
chr3 (149-369)||(9552558-9552783)
chr3 (137-369)||(41000633-41000871)
chr3 (137-369)||(41009415-41009653)
chr3 (225-369)||(17928167-17928315)
chr3 (224-369)||(8203137-8203286)
chr3 (225-369)||(10720317-10720466)
chr3 (107-178)||(10720188-10720259)
chr3 (118-176)||(8203024-8203082)
chr3 (91-149)||(12557600-12557658)
chr3 (107-176)||(15682640-15682709)
chr3 (292-362)||(15682801-15682874)
chr3 (137-175)||(17928360-17928398)
chr3 (141-183)||(20438479-20438521)
chr3 (141-183)||(41435644-41435686)
chr3 (116-176)||(26384213-26384271)
chr3 (19-124)||(11184019-11184125)
chr3 (329-365)||(14396290-14396326)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (5-369)||(25145-25511)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (77-369)||(31224-31518)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (5-349)||(35071947-35072292)
chr1 (78-370)||(6202597-6202891)
chr1 (17-369)||(1958176-1958533)
chr1 (83-369)||(22430276-22430561)
chr1 (5-369)||(14817636-14818000)
chr1 (75-369)||(2341129-2341416)
chr1 (5-183)||(19371332-19371513)
chr1 (137-369)||(31542293-31542531)
chr1 (284-369)||(19371149-19371235)
chr1 (240-369)||(2387506-2387632)
chr1 (107-369)||(13471075-13471339)
chr1 (127-177)||(2387702-2387752)
chr1 (292-369)||(31554497-31554577)
chr1 (107-176)||(31554677-31554746)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (78-369)||(37022-37316)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (5-362)||(20456798-20457160)
chr6 (5-378)||(19716003-19716369)
chr6 (19-369)||(27071638-27071995)
chr6 (19-349)||(22776574-22776905)
chr6 (5-369)||(22326239-22326604)
chr6 (78-369)||(27512313-27512595)
chr6 (192-369)||(620879-621057)
chr6 (78-367)||(20055748-20056019)
chr6 (92-327)||(16822650-16822881)
chr6 (95-327)||(20045525-20045745)
chr6 (107-369)||(16636498-16636764)
chr6 (137-369)||(25503995-25504236)
chr6 (38-208)||(18946824-18946993)
chr6 (107-178)||(27056256-27056327)
chr6 (228-369)||(28270202-28270347)
chr6 (228-369)||(28305171-28305316)
chr6 (228-369)||(28348952-28349097)
chr6 (225-369)||(27056407-27056556)
chr6 (116-183)||(18911647-18911713)
chr6 (199-250)||(18911575-18911626)
chr6 (92-130)||(620794-620832)
[»] chr4 (21 HSPs)
chr4 (38-349)||(9187208-9187524)
chr4 (5-349)||(20556283-20556629)
chr4 (5-369)||(14883893-14884259)
chr4 (78-368)||(16725633-16725921)
chr4 (78-369)||(18038627-18038909)
chr4 (78-349)||(3385977-3386249)
chr4 (78-369)||(15900380-15900660)
chr4 (192-369)||(15077265-15077444)
chr4 (192-369)||(15079571-15079750)
chr4 (103-369)||(3841554-3841817)
chr4 (78-270)||(14919804-14919998)
chr4 (78-303)||(18385901-18386116)
chr4 (5-183)||(8660031-8660209)
chr4 (103-323)||(22706380-22706595)
chr4 (192-368)||(3359581-3359761)
chr4 (228-362)||(8100672-8100802)
chr4 (292-369)||(26218329-26218408)
chr4 (107-176)||(26218170-26218239)
chr4 (118-174)||(21529133-21529189)
chr4 (325-369)||(21529329-21529373)
chr4 (117-175)||(3359781-3359838)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (5-362)||(20736083-20736443)
chr8 (5-362)||(20744641-20745001)
chr8 (5-349)||(25856633-25856977)
chr8 (46-342)||(32002142-32002440)
chr8 (19-349)||(22160509-22160831)
chr8 (120-359)||(20741128-20741370)
chr8 (225-369)||(24709092-24709238)
chr8 (285-379)||(6666072-6666167)
chr8 (228-362)||(17680528-17680658)
chr8 (125-362)||(39843078-39843313)
chr8 (107-175)||(6666284-6666352)
chr8 (115-175)||(24708975-24709033)
[»] scaffold0551 (2 HSPs)
scaffold0551 (78-369)||(4875-5170)
scaffold0551 (78-267)||(10989-11180)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (7-369)||(17390-17759)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (19-362)||(34136485-34136830)
chr7 (192-369)||(8812807-8812985)
chr7 (19-349)||(13268127-13268454)
chr7 (78-369)||(23884401-23884681)
chr7 (141-362)||(12586733-12586955)
chr7 (225-369)||(27436351-27436496)
chr7 (237-369)||(840516-840649)
chr7 (237-369)||(847692-847825)
chr7 (237-369)||(1205696-1205829)
chr7 (193-362)||(4829916-4830089)
chr7 (239-369)||(4949803-4949935)
chr7 (276-365)||(1959619-1959709)
chr7 (225-369)||(27974327-27974476)
chr7 (225-369)||(5207212-5207361)
chr7 (305-362)||(16270432-16270489)
chr7 (107-178)||(567157-567228)
chr7 (107-178)||(5207079-5207150)
chr7 (107-178)||(27974198-27974269)
chr7 (228-369)||(29024483-29024632)
chr7 (240-369)||(13833836-13833962)
chr7 (132-178)||(13834033-13834079)
chr7 (225-369)||(567284-567426)
chr7 (91-178)||(4949650-4949738)
chr7 (310-365)||(9096300-9096355)
chr7 (141-183)||(803203-803245)
chr7 (141-183)||(16292070-16292112)
chr7 (136-177)||(2551793-2551835)
chr7 (92-130)||(8813032-8813070)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (19-362)||(8678-9028)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (38-369)||(3745-4079)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (46-369)||(98966-99290)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (5-367)||(31401-31767)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (17-342)||(8361-8690)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (38-349)||(18012-18314)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (5-349)||(20335-20674)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (192-369)||(3837-4016)
[»] scaffold0435 (1 HSPs)
scaffold0435 (78-369)||(14217-14501)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (5-369)||(33660-34018)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (192-369)||(192249-192427)
[»] scaffold0441 (1 HSPs)
scaffold0441 (78-369)||(9395-9682)
[»] scaffold0478 (1 HSPs)
scaffold0478 (136-362)||(1-232)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (19-331)||(20278460-20278763)
chr2 (91-379)||(24692462-24692748)
chr2 (5-369)||(24701312-24701674)
chr2 (137-369)||(35140961-35141199)
chr2 (228-369)||(25494191-25494336)
chr2 (228-369)||(42572122-42572266)
chr2 (225-369)||(3764053-3764202)
chr2 (225-369)||(16275777-16275926)
chr2 (107-178)||(3763920-3763991)
chr2 (228-369)||(30691495-30691640)
chr2 (112-178)||(16275984-16276050)
chr2 (225-369)||(21112356-21112505)
chr2 (228-361)||(15950637-15950767)
chr2 (312-369)||(21857782-21857839)
chr2 (38-176)||(19990255-19990391)
chr2 (118-178)||(24288122-24288182)
chr2 (322-369)||(24287951-24287998)
chr2 (107-176)||(21113799-21113869)
chr2 (109-175)||(21857576-21857642)
chr2 (313-365)||(45025456-45025508)
chr2 (125-176)||(25494393-25494445)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (146-349)||(1-207)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (78-248)||(18427-18596)
scaffold0019 (243-369)||(19390-19517)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (78-362)||(16886-17159)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (192-348)||(301326-301483)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (78-369)||(30785-31070)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (192-327)||(22811-22947)
scaffold0068 (5-175)||(22617-22779)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (107-378)||(2051-2324)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (247-365)||(10507-10626)
scaffold0138 (192-236)||(10621-10665)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (192-369)||(74177-74358)
scaffold0044 (127-176)||(74106-74156)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (117-362)||(4805-5055)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (117-369)||(1565-1803)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (91-369)||(144270-144549)
[»] scaffold2162 (2 HSPs)
scaffold2162 (107-178)||(452-523)
scaffold2162 (225-369)||(223-372)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (127-369)||(6748-7005)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (193-369)||(12314-12491)
scaffold0056 (107-149)||(12520-12562)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (309-365)||(152054-152110)
scaffold0009 (120-174)||(152236-152288)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (141-270)||(11643-11774)
[»] scaffold0782 (1 HSPs)
scaffold0782 (141-183)||(5896-5938)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (141-183)||(184177-184219)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (192-250)||(29273-29331)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25528907 - 25528543
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||| | |||||||| | | | |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  25528907 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctctggacgaggacaatcggaccactttcgaaatggattgacctttagtag 25528808  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  25528807 aaaagacacagtgtaagactcagacttgaaattatgaatgcaatatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagccacattttttt-gaaggacttgtca 25528709  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag 304  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25528708 aagtaattgtaaacttgataaagaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaa 25528609  T
Q  305 gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 370  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25528608 gttcttagcaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 25528543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Original strand, 22956578 - 22956869
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22956578 cttttgagatgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatacaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaata 22956677  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||     
T  22956678 gacacattttctt-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaaaatgttgcaattggttccctttc 22956776  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22956777 caagggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 22956869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 75 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29895743 - 29895468
Alignment:
Q  75 ccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29895743 ccacttttgaaatggattgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaa 29895644  T
Q  175 ataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcct 274  Q
    |||| ||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29895643 atagacacattttttttgaaggatttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatctgaaaattgtgaagatgttgcaattggttccct 29895544  T
Q  275 tttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29895543 tttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 29895468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 369
Target Start/End: Original strand, 20097063 - 20097381
Alignment:
Q  43 gtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaa 142  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  20097063 gtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgtaagacttagacttgaaattatgta 20097162  T
Q  143 tgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-taggcacannnnnnnn---gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtttt 238  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||           ||||||||||||||||||||||||||||||             ||||    
T  20097163 tgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaaatagacacatttttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttg-------------tttt 20097249  T
Q  239 atttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20097250 atttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 20097349  T
Q  338 tttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20097350 tttgaagttgtatttcttggtgttctttctta 20097381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 369
Target Start/End: Original strand, 7259585 - 7259847
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||             
T  7259585 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacac----ttttt 7259680  T
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||        
T  7259681 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacaatattttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttccctattcgaaagtaag---- 7259776  T
Q  292 aaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
           | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7259777 -------gaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 7259847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36450945 - 36450620
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36450945 tttttgtttgcccgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgt 36450846  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn----gaaggacttgtcaaagtaattgt 214  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||          || ||||||||||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||||||    
T  36450845 aagactcagacttgaaattatgtatgca----------tgctatgcttatgcaaaaatagacacatttgttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgt 36450756  T
Q  215 aaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  36450755 aaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccatttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaac 36450656  T
Q  314 aaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36450655 aaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 36450620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1800752 - 1800520
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||             
T  1800752 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttctttt 1800659  T
Q  192 ---gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaaga 288  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1800658 tttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaagacgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaaga 1800560  T
Q  289 atgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
    | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1800559 acgaaactaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 1800520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 91 - 327
Target Start/End: Original strand, 12393073 - 12393305
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnn 190  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||            
T  12393073 ttgacctctagcagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttcttt 12393166  T
Q  191 n--gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaaga 288  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12393167 tttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaagacgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaaga 12393265  T
Q  289 atgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
    | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12393266 acgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 12393305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7789448 - 7789215
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||     |||||||||||| || |||             
T  7789448 tgacctttagtagaaaagacacaatgtaagactctgacttgaaactatgaatgcgaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttctttt 7789355  T
Q  192 ----gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaag 287  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7789354 ttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaagacgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaag 7789256  T
Q  288 aatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
    || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7789255 aacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 7789215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21691099 - 21690963
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  21691099 gaaggacttgtcaaagtaattgtgaacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatattgctattggttcctttttcaaaagtaagaacg 21691000  T
Q  292 aaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21690999 aaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 21690963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 24962787 - 24963024
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||| |    
T  24962787 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatag 24962886  T
Q  235 ttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaagg-ttcttaacaaaagctaaagcttagtta 332  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24962887 tttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagtta 24962985  T
Q  333 aga--tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||  ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  24962986 agatttttttgaagttgtatctcttggtgatcattctta 24963024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26871485 - 26871391
Alignment:
Q  276 ttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26871485 ttcaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaataaaagttgaagcttagttaagatttttgaagttttatttcttggtgttccttctta 26871391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 12178682 - 12178831
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  12178682 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 12178781  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12178782 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 12178831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21691293 - 21691131
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||      ||||| || | || ||||||||||| ||    
T  21691293 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtagatgcgagttggctttggacgaggatagtcaggatactttggagatggattgacctttagcag 21691194  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21691193 aaaagacacagtgtaagactcagact--------tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 21691131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 33842946 - 33843095
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  33842946 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 33843045  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33843046 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 33843095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 11811389 - 11811460
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11811389 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 11811460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 26087312 - 26087383
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26087312 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 26087383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 27231617 - 27231688
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27231617 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27231688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 33842813 - 33842884
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33842813 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 33842884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 11811535 - 11811684
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  11811535 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 11811634  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11811635 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 11811684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 26087451 - 26087600
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  26087451 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 26087550  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  26087551 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 26087600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20378986 - 20378842
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||| | ||||| |||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  20378986 aacatggtttcatttgaaaattatgaagatattgcaaaaggtt-ctttttcgaaaggtaagatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagt 20378888  T
Q  326 ttagttaagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20378887 ttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 20378842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 28846421 - 28846291
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagct 326  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||   |    |||||||||||||||    
T  28846421 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtc-ctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagt----acaaaagctaaagct 28846327  T
Q  327 tagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttc 362  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28846326 cagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttc 28846291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23638576 - 23638463
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  23638576 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtc-ctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagc 23638478  T
Q  326 ttagttaagattttt 340  Q
    |||||||||||||||    
T  23638477 ttagttaagattttt 23638463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 228 - 340
Target Start/End: Original strand, 23834313 - 23834426
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  23834313 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtc-ctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagc 23834411  T
Q  326 ttagttaagattttt 340  Q
    |||||||||||||||    
T  23834412 ttagttaagattttt 23834426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 21994030 - 21994087
Alignment:
Q  312 acaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21994030 acaaaagctaaagctcagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 21994087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 369
Target Start/End: Original strand, 27231798 - 27231887
Alignment:
Q  283 gtaagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagctaaag-cttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  27231798 gtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacagaagctaaaaacttagttaagattttggaagttgtatttcttgatgttcattctta 27231887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 178
Target Start/End: Original strand, 12178564 - 12178616
Alignment:
Q  127 gacttgaaattatgaatgcaaa-atgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12178564 gactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 12178616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16565578 - 16565522
Alignment:
Q  193 aaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaatt 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16565578 aaggacttgtcaaagtaattgtagacatcataaggaacattgtttcatttgataatt 16565522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 174
Target Start/End: Original strand, 21993808 - 21993896
Alignment:
Q  86 acgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 174  Q
    |||| |||||||||  | || |||||||| ||| |||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21993808 acggattgaccttttatggagaagacacaatgtaagacacggactagaaactatgaatacaaaatgatgcatgatatgcttatgaaaaa 21993896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16565446 - 16565408
Alignment:
Q  327 tagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16565446 tagttaagacttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 16565408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34464069 - 34464027
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34464069 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 34464027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 177
Target Start/End: Original strand, 21865933 - 21865978
Alignment:
Q  132 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21865933 gaaactatgaacgcaaaatgatgcatgatatgcttacgcaaaaata 21865978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 369
Target Start/End: Original strand, 21866118 - 21866180
Alignment:
Q  309 ttaacaaaagct-aaagcttagttaagatttttg-aagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21866118 ttaacaaaagccgaaagcttagttaagatttttttaagttgtatctcttggtgttcattctta 21866180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 176
Target Start/End: Original strand, 20667243 - 20667328
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    |||||||||  | ||||||| | |||||||||| || ||| | ||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20667243 ttgaccttttattgaaaagataaagtgtgagacacaaactaggaaccaagaatgcaaagtgacgcatgatatgcttatgcaaaaat 20667328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 37)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 5 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15623166 - 15622802
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   || |  |||||||||||||| ||||||||||||      ||||| || | || ||||||| | ||||    
T  15623166 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgaagatgcgagttggctttggacgaggatagtcaggatactttggagatggattgacctgttgtag 15623067  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtc 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||    
T  15623066 aaaagaca--gtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtc 15622969  T
Q  204 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15622968 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaa 15622869  T
Q  304 ggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 370  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15622868 agttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 15622802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 38 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 70823 - 70493
Alignment:
Q  38 tgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaatt 137  Q
    |||| |||||||||  |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  70823 tgtaggtgcgagttaactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagagtaagactcggacttgaaatt 70724  T
Q  138 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttt 237  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  70723 atgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttt--gaaggacttgtcaaagtcattgtaaacttgataaggaacattgttt 70626  T
Q  238 tatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  70625 tatttgaaaattgtgaaaatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaagttcttaacaaaagctaaagcttggttaagatt 70526  T
Q  338 tttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70525 tttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 70493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 14885176 - 14885541
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||  |||||||||||||| |||||||| |||     ||||||||| | || ||||||||| ||||    
T  14885176 tgatatgttctttccttttgtttgcacgagtgttgtagatgcgagttggctttggacgaggacagtcaggacacttttgagatggattgaccttttgtag 14885275  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||    
T  14885276 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtc 14885375  T
Q  204 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttc-aaaagtaagaatgaaaccaagg-a 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  14885376 aaagtaattgtaaacttgataaggaacaatgctttacttgaaaattgtgaagatgttgcaattgg-ttccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggaa 14885474  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14885475 aaagttcttaacaaaagataaa-cttagttaagatttttgaaattgcatttcttggtgttccttctta 14885541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 30093231 - 30093584
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  30093231 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacttttagtagaaaagacacaatgt 30093330  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 218  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  30093331 aagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatcctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 30093430  T
Q  219 ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||    
T  30093431 ttgataaggaacattgttttatctttaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaagaaa 30093530  T
Q  317 agctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  30093531 agctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttctttctta 30093584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8608883 - 8608528
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8608883 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagatacagtgt 8608784  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--gaaggacttgtcaaagtaattgtaa 216  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||          || |||||  |||||||||||||||    
T  8608783 aagactcagacttgaaattatgtatgtaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttttgagggactcatcaaagtaattgtaa 8608684  T
Q  217 acttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaaca 314  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  8608683 acttgatgaggaacattgttttgtttgaaacttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggataaaagttcttaaca 8608584  T
Q  315 aaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8608583 aaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 8608528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Original strand, 12476895 - 12477256
Alignment:
Q  7 atatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaa 106  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||   ||||  | |||||||||||| || ||||| ||| | ||| ||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  12476895 atatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtagatacgagttggctttggatgaggacagtcggacccctttcaaaatggattgacctttagtagaa 12476994  T
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaa 206  Q
    |||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||    
T  12476995 aagacatagagtaagactcggacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttggaaggacttgtcaaa 12477094  T
Q  207 gtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaagg 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  12477095 gtcattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgctgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgagaccaaggaaaaag 12477194  T
Q  306 ttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12477195 ttcttaa-gaaagctaaagcttagttaaga-ttttgaagttttattttttggtgttccttctta 12477256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14421013 - 14420644
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |||     |||||  ||   || ||||||||||||||    
T  14421013 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctttggacgaggacagtcaggacacttaagat--ggattgacctttagtag 14420916  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn---gaaggacttg 201  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||            ||||||||||    
T  14420915 gaaagacacagagtaagactcagacttgaaattatgaatgaaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaataaacactcttttttttttgaaggacttg 14420816  T
Q  202 tcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttc-aaaagtaagaatgaaaccaagg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14420815 tcaaagtaattgtaaacttgataagtaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgctattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaagg 14420716  T
Q  301 --aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 370  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14420715 aaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 14420644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 23285513 - 23285846
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23285513 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagacatagtgt 23285612  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnng--aaggacttgtcaaagtaattgtaa 216  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||           ||||||||||||||||||||||||    
T  23285613 aagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaataaacacatttttttttttaaggacttgtcaaagtaattgtaa 23285712  T
Q  217 acttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaa 315  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||    
T  23285713 acttgataaggaaccttgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaaaattctttacaa 23285812  T
Q  316 aagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23285813 aagctaaaacttagttaaggtttttgaagttgta 23285846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 92 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6197033 - 6196758
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||     |||||||||||||||| || |||             
T  6197033 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-taatg-----tatgcttatgcaaaaacagacacgtttctttt 6196940  T
Q  192 --gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaa 289  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6196939 ttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaa 6196840  T
Q  290 tgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 370  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6196839 cgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 6196758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 91 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8806973 - 8806687
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnn 190  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||           
T  8806973 ttgacctctagcagaaaagacacagtgtaagactcagactggaaattatgaatgcaaaatgatgcatgtcatgcttatgcaaaaatagacacattttttt 8806874  T
Q  191 ngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaat 290  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  8806873 -gaaggacttgttaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaagtaagaac 8806775  T
Q  291 gaaaccaagg---------aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||         ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8806774 gaaaccaagggagaaaaaaaaaagttcttaacaaaagcaaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttgatgttccttctta 8806687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 13109158 - 13109495
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| || | ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  13109158 tgatatgttctctttttttgtttgcccgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtag 13109257  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--gaaggacttgt 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||          || ||||||||||||||||||| ||||          |||||||||||    
T  13109258 aaaagacacagtgtaagactcagacttgaaattatgtatgca----------tgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttttgaaggacttgt 13109347  T
Q  203 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-a 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| |    
T  13109348 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaaaaacaaaaccaaggaa 13109447  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13109448 aaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 13109495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33568557 - 33568231
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33568557 tttttgtttgcccgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacaactttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgt 33568458  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-----gaaggacttgtcaaagtaattg 213  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||          || ||||||||||||||||||| |||              ||||||||||||||||||||||    
T  33568457 aagactaagacttgaaattatgtatgca----------tgctatgcttatgcaaaaatagacacttttttttttttttgaaggacttgtcaaagtaattg 33568368  T
Q  214 taaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  33568367 taaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaa 33568268  T
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33568267 caaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 33568231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21610416 - 21610136
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||              
T  21610416 cttttgagatggattgacctttagcagaaaagacacagtgtaagacttagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttag--------- 21610326  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
       |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  21610325 ---acacgttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaagaacattgtttt--ttgcaatttgtgaaaatgttgcaattggttccctttt 21610231  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaaggaaag---gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21610230 caaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgagtttgtatttcttggtgttccttctta 21610136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 192 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12557579 - 12557421
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  12557579 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtttaatttgaaaattgtgaagatattgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacg 12557480  T
Q  292 aaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12557479 aaactaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 12557421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8619080 - 8618849
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||             
T  8619080 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttctttt 8618987  T
Q  192 --gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaa 289  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  8618986 ttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaagacgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaagaa 8618888  T
Q  290 tgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8618887 cgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 8618849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Original strand, 46398135 - 46398366
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||             
T  46398135 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttctttt 46398228  T
Q  192 --gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaa 289  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  46398229 ttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaagttgtaaagacgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaagaa 46398327  T
Q  290 tgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46398328 cgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 46398366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 104 - 369
Target Start/End: Original strand, 3242808 - 3243076
Alignment:
Q  104 gaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaat-gatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgt 202  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||| | || |        ||||| |||||    
T  3242808 gaaaagacacagtgtgagacacggactagaaactatgaatgaaaaaacgatgcatgatatgtttatgcaaaaatggaca-attttttttgaagggcttgt 3242906  T
Q  203 caaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg 300  Q
     ||||| |||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  3242907 taaagttaattgtaaacattgcataggaacatggttttatttgaaaattgtaaagatattgcaatcggttccattttcaaaagcaagaaagaagccaagg 3243006  T
Q  301 aa-aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3243007 aagaagttcttaacaaaagcaaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 3243076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Original strand, 15534698 - 15534928
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||             
T  15534698 tgacttttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttctttt 15534791  T
Q  192 --gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaa 289  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15534792 ttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataagg-acattgttttatttaaaaattgtaaagatgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaagaa 15534889  T
Q  290 tgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15534890 cgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 15534928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11183903 - 11183793
Alignment:
Q  259 ttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttgg 357  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11183903 ttgcaaatggttacctcttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttag 11183804  T
Q  358 tgttccttctt 368  Q
    |||||||||||    
T  11183803 tgttccttctt 11183793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 107 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25266150 - 25265886
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaa 206  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||| |||    
T  25266150 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag-----atttttttgaaggacttgttaaa 25266056  T
Q  207 gt-aattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagat-gttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaatgaaaccaaggaa 302  Q
    || || ||||||| ||  | ||||| || |||| ||||||||||||| |||||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25266055 gtgaaatgtaaacatggcagaggaatatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaa 25265956  T
Q  303 -aggttc-ttaacaaaagct-aaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     | |||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25265955 gaagttctttaacataagctaaaagcttagttaaaattttggaagttgtatttcttggtgttcattctta 25265886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 369
Target Start/End: Original strand, 9552558 - 9552783
Alignment:
Q  149 atgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaa 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || |||||||| |||| ||||||||    
T  9552558 atgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaacatagtttcatttgaaa 9552657  T
Q  247 attgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaag--atttttga 342  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9552658 attgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaactaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatatttttga 9552756  T
Q  343 agttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||    
T  9552757 agttgtatctcttggtgatcattctta 9552783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41000871 - 41000633
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacatt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |           ||||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||||||     
T  41000871 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacata 41000772  T
Q  234 gttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaagg-ttcttaacaaaagctaaagcttagtt 331  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41000771 gtttcatttgaaaattgtaaagatattggaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagtt 41000673  T
Q  332 aagatttt--tgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  41000672 aagatttttatgaagttgtatctcttggtgatcattctta 41000633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41009653 - 41009415
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacatt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |           ||||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||||||     
T  41009653 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacata 41009554  T
Q  234 gttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaagg-ttcttaacaaaagctaaagcttagtt 331  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41009553 gtttcatttgaaaattgtaaagatattggaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagtt 41009455  T
Q  332 aagatttt--tgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  41009454 aagatttttatgaagttgtatctcttggtgatcattctta 41009415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17928315 - 17928167
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag---gttcttaacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    || |||||| |||||     
T  17928315 aggaacatggtttcatttgaaaattgtaaagatattgcaatatgtttccttttcacaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaaaagtacttaacgaaagcg 17928216  T
Q  321 aaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  17928215 aaagcttaattaagatttttgaagttctatctcttggtgttcattctta 17928167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 224 - 369
Target Start/End: Original strand, 8203137 - 8203286
Alignment:
Q  224 aaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaa-caaaagct 320  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  8203137 aaggaacatggattcattttaaaattgtaaagatattgcaataggttcttttttcaaaaggtaagaatgaaaccaaggaaaaagttcttaatcaaaagct 8203236  T
Q  321 aaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  8203237 aaagcttagttaagattttttgaagttgtatctcttgatgttcattctta 8203286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 10720317 - 10720466
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  10720317 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 10720416  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  10720417 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 10720466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 10720188 - 10720259
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10720188 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 10720259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 176
Target Start/End: Original strand, 8203024 - 8203082
Alignment:
Q  118 tgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8203024 tgagacacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 8203082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12557658 - 12557600
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaa 149  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12557658 ttgacctttagtagaaaagacacaatgtaagactcagacttgaaattatgtatgcaaaa 12557600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 15682640 - 15682709
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  15682640 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatatgtatgcaaaaat 15682709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Original strand, 15682801 - 15682874
Alignment:
Q  292 aaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga--tttttgaagttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15682801 aaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttc 15682874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 137 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 17928398 - 17928360
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928398 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 17928360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20438521 - 20438479
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20438521 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 20438479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 41435686 - 41435644
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41435686 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 41435644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Original strand, 26384213 - 26384271
Alignment:
Q  116 tgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  26384213 tgtgagactcggaattgaaattatgaacgcaaaatgatgcatg--attcttatgcaaaaat 26384271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11184125 - 11184019
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgg-gttgacctttagtagaaaagacacagtg 117  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11184125 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcaagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggatttgacctttagtagaaaagacacagtg 11184026  T
Q  118 tgagact 124  Q
    | |||||    
T  11184025 taagact 11184019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 365
Target Start/End: Original strand, 14396290 - 14396326
Alignment:
Q  329 gttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14396290 gttaagacttttgaagttgtatttctcggtgttcctt 14396326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 25145 - 25511
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||| || | || ||||||||||||||    
T  25145 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctttggacgaggatagtcgggacactttggagatggattgacctttagtag 25244  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtc 203  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||    
T  25245 aaaagacacagtgtaagactctgacttgaaattatgaatgcaaa-tgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtc 25343  T
Q  204 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--a 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  25344 aaagtaattgtaaacttgataagaaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaa 25443  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25444 aaatttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 77 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31518 - 31224
Alignment:
Q  77 acttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31518 acttttgaaactggttgaccttttgtagaaaagacacagtgtgagactcaaacttgaaattatgaatgtaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 31419  T
Q  177 aggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    || ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31418 agacacattttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttt 31319  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttc-ttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||| |||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31318 tcaaaagtgagaacgaaaccaaggaaaaagttctttaacaaaagttgaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 31224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 35072292 - 35071947
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||| ||| |||| |  || || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35072292 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaagtgtgagttgactttggacaaggacaactggacaacttttgaaactggttgacctttagtag 35072193  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||||||||||||    
T  35072192 aaaagacacggtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacttttttttttaaggacttgtca 35072093  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  35072092 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgagaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaa 35071993  T
Q  304 ggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35071992 aattcttaacaaaagctaaaacttagttaaggtttttgaagttgta 35071947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 78 - 370
Target Start/End: Original strand, 6202597 - 6202891
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6202597 cttttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 6202696  T
Q  178 ggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    | ||           |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6202697 gacatttttttatttgaaggacttgtcaaagtaattgtagaattgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatgttgctattggttcccttt 6202796  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6202797 tcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttatgatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttat 6202891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1958533 - 1958176
Alignment:
Q  17 tctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagt 116  Q
    ||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | || |||||| ||  ||||| |||||||||    
T  1958533 tctttttgtttacacgagtgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggatagtcgaggcacttttgagatggattgaccctttttagaagagacacagt 1958434  T
Q  117 gtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-taggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgt 214  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||         |||||||||||||||||||||||    
T  1958433 gtgagactaaaacttgaaattatgaatgctaaatgatgcatgatatgctaatgcaaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgt 1958334  T
Q  215 aaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  1958333 aaacttgaaaaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaa 1958234  T
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  1958233 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttctttctta 1958176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22430561 - 22430276
Alignment:
Q  83 gaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcac 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22430561 gaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactcatacttgaaattatgaatacaaaatgatgcatggtatgcttatgcaaaaatagacac 22430462  T
Q  183 annnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa 282  Q
             ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22430461 tttttttttgaaggacttgtcaaagtaactgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaa 22430362  T
Q  283 gtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    | ||||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22430361 gcaagaacgaaatcaaggaaaaagttcttaa-gaaagctaaagcttagttaaga-ttttgaagttgtatattttggtgttccttctta 22430276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 14817636 - 14818000
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||  ||||||||||| |||||||| |||     ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  14817636 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaggtatgagttggctttagacgaggacagtcaggacacttttgagatggattgacctttagtag 14817735  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn---gaaggacttg 201  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||           ||| ||||||    
T  14817736 aaaagatacagtgtaagactcatacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagccacatttttttttctgaacgacttg 14817835  T
Q  202 tcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg- 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     ||||||||||     
T  14817836 tcaaagtaattgtaaacttgataatgaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaatttgttcccttttcaaaagta-----gaaaccaagga 14817930  T
Q  301 aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14817931 aaaagttcataacaaaagctaaagcttagttaagattttttgaagttgtatttcttggtgtttcttctta 14818000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 369
Target Start/End: Original strand, 2341129 - 2341416
Alignment:
Q  75 ccacttttgaaacgggtt-gacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaa 173  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  2341129 ccacttttgaaatggatttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaca 2341228  T
Q  174 aataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcc 273  Q
      |               |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2341229 ttt-----------ttttgaaggatttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggatccc 2341317  T
Q  274 ttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  2341318 ttttcataagtaagaatgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttctttctta 2341416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19371513 - 19371332
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  19371513 tgatatgttctttatttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctttggacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttcaccttttatag 19371414  T
Q  105 aaaagacaca--gtgtgagactcagacttgaaattatg-aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    |||||| | |   |||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19371413 aaaagaaaaattttgtgagactcggacttgagactatgaaatgcaaaatggtgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 19371332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31542531 - 31542293
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacatt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |           ||||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||||||     
T  31542531 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataattttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacata 31542432  T
Q  234 gttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaagg-ttcttaacaaaagctaaagcttagtt 331  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31542431 gtttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagtt 31542333  T
Q  332 aagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  31542332 aagatttttttgaagttgtatctcttggtgatcattctta 31542293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 284 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19371235 - 19371149
Alignment:
Q  284 taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19371235 taagaacgaaatcaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 19371149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 240 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2387632 - 2387506
Alignment:
Q  240 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattt 338  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  2387632 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaagctaagaacgaaaccaaggaaagagt----acaaaagcttaagcttagttaagattt 2387537  T
Q  339 ttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2387536 ttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 2387506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13471339 - 13471075
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggca--cannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||    
T  13471339 aagacacggtgtgagacactgactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacatttttttttttttaaggacttgtca 13471240  T
Q  205 aagt-aattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaa-gtaagaatgaaaccaagg 300  Q
    |||| || ||||||| ||  |  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13471239 aagtgaaatgtaaacatggcagcggaacatggtttcatttgaaaattgtaaagatattgacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaagg 13471140  T
Q  301 aa-aggttc-ttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    || | |||| |||||| ||| ||||||||||       ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13471139 aagaagttctttaacagaagttaaagcttag------attttgcagttgtatctcttggtgttcattctta 13471075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2387752 - 2387702
Alignment:
Q  127 gacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2387752 gactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 2387702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 292 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31554577 - 31554497
Alignment:
Q  292 aaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  31554577 aaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 31554497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 31554746 - 31554677
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  31554746 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatgtatgtatgcaaaaat 31554677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Original strand, 37022 - 37316
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37022 cttttgagatgggttgacctttagtagaaaagacaaagtgtgagactcagactggaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 37121  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataa-ggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    | ||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37122 gacattttttatttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatgttgcaattagttcccttt 37221  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag--gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37222 tcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 37316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 362
Target Start/End: Original strand, 20456798 - 20457160
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| || |||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | || ||||||  |  |||    
T  20456798 tgatatgttctctctttttgtttgcaagagtgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggatagtcgaggcacttttgagatggattgacccgttttag 20456897  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-taggcacannnnnnnn-gaaggacttgt 202  Q
    || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||         |||||||||||    
T  20456898 aagagacacagtgtgagactaaaacttgaaattatgaatgctaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgt 20456997  T
Q  203 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-- 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||      
T  20456998 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggat 20457097  T
Q  301 aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20457098 aaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttc 20457160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19716369 - 19716003
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || |||||| |||||||    
T  19716369 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacccttagtag 19716270  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||        |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  19716269 aaaagacacagtgtaacactcagacctgaa--------tgcaaagtgatgcattctatgcttatgcaaaaatagacacattttttt-gaaggacttgtca 19716179  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  19716178 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgtaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaa 19716079  T
Q  303 aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttatgatgtcca 378  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  19716078 aagttcttaacaaaacctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttctttcttacgaggtcca 19716003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 27071638 - 27071995
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||| |||||  ||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  27071638 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcaagttgattttggacgaggacagttgggacacctttgagatggatcgacctttagtagaaaagacacagtgt 27071737  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnng-----aaggacttgtcaaagtaattg 213  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |     |||||||||||||||||||||    
T  27071738 aagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgttttgaaggacttgtcaaagtaattg 27071837  T
Q  214 taaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggt-tcttaa 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||    
T  27071838 taaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaaatcttaa 27071937  T
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttt-tgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27071938 caaaagctaaagcttagttaaggttttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 27071995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 22776574 - 22776905
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22776574 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaaggcacagtgt 22776673  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 218  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  22776674 aagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatcctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 22776773  T
Q  219 ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  22776774 ttgataaggaacattgttttatctagaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaa 22776873  T
Q  318 gctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22776874 gctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 22776905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22326604 - 22326239
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    ||| ||||| | || |||||| |||||||    
T  22326604 tgatatgttctctctttttgtttgcacaagtgttgtaagtgcgagttggctttagacgatgatagttaggacacctttgagatggattgacccttagtag 22326505  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaa-tgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgt 202  Q
    |||||| |   |||||||||| |  |||| | |||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||           |||||||||||    
T  22326504 aaaagaaaatttgtgagactcgggattgagactatgaaattcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaaaatagacattttttaatttgaaggacttgt 22326407  T
Q  203 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-a 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22326406 caaagtaattgtagacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaa 22326307  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22326306 aaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttctttctta 22326239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27512595 - 27512313
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27512595 cttttgagacggattgacctttagcagaaaagacacagtgtaagactcaaacttgaa--------tgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa-a 27512505  T
Q  178 ggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
      ||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  27512504 tacacacgtttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaaggtgttgcaattggttcccttt 27512405  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27512404 -caaaagtaagaacgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 27512313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 620879 - 621057
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  620879 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaagtaagaacg 620978  T
Q  292 aaacc-aaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  620979 aaaccaaaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagttttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 621057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 78 - 367
Target Start/End: Original strand, 20055748 - 20056019
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgc-aaaaat 176  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20055748 cttttgagatggattgacctttagcagaaaagacaaagtgtaagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgtttatgctaaaaat 20055847  T
Q  177 aggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    ||  |||        |||||||||||||||||||||||| |||||||         |||||||||||||| |||||         ||||||||| |||||    
T  20055848 ag--acacgttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgat---------tgttttatttgaaatttgtg---------caattggttcccttt 20055927  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag--gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttct 367  Q
     |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20055928 -caaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaaacttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttct 20056019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 92 - 327
Target Start/End: Original strand, 16822650 - 16822881
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||             
T  16822650 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttctttt 16822743  T
Q  192 --gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaa 289  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  16822744 ttgaaggacttgtcaaagtatttgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaagacgttgcaatt-gattccctttcaaaagtaagaa 16822842  T
Q  290 tgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16822843 cgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 16822881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 327
Target Start/End: Original strand, 20045525 - 20045745
Alignment:
Q  95 cctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--g 192  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||     |||||||||||| || |||           |    
T  20045525 cctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgacttgaaactatgaatgcaaa-tgatgcatg-----cttatgcaaaaacagacacgtttcttttttg 20045618  T
Q  193 aaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatga 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  20045619 aaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtttt--------attgtaaagacgttgcaattgg-ttccctttcaaaagtaagaacga 20045709  T
Q  293 aaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20045710 aaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 20045745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 107 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16636764 - 16636498
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaa 206  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||| |||    
T  16636764 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag---atttttttttgaaggacttgttaaa 16636668  T
Q  207 gt-aattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagat-gttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaatgaaaccaaggaa 302  Q
    || || ||||||| ||  | |||||||| |||| || |||||||||| |||||  || |||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  16636667 gtgaaatgtaaacatggcagaggaacatggtttcatatgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaa 16636568  T
Q  303 -aggttc-ttaacaaaagct-aaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     | |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16636567 gaagttctttaacagaagctaaaagcttagttaagattttggaagttgtatttcttggtgttcattctta 16636498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Original strand, 25503995 - 25504236
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn----gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-aggaac 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |            ||||||||| ||||||| |||||||||| |  || ||||||    
T  25503995 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataaaaaaataaaatttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtagaggaac 25504094  T
Q  231 attgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagctta 328  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25504095 atagtttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-ctttttcaaaagttaagaactaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctta 25504193  T
Q  329 gttaag--atttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  25504194 gttaagatatttttgaagttgtatctcttggtgatcattctta 25504236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 18946824 - 18946993
Alignment:
Q  38 tgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaatt 137  Q
    |||| |||| ||||| |||| |||||||| |||||    || ||||| | |||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18946824 tgtaggtgcaagttgactttggacgaggacagttgggaaacctttgagatgggttgacctttagtaaaaaaaa-acagtgtaagactcagacttgaaatt 18946922  T
Q  138 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagt 208  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||    
T  18946923 atgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagt 18946993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 27056256 - 27056327
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27056256 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27056327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28270347 - 28270202
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||   |||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  28270347 aacatggtttcatttgaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaagatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagt 28270248  T
Q  326 ttagttaagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28270247 ttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 28270202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28305316 - 28305171
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||   |||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  28305316 aacatggtttcatttgaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaagatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagt 28305217  T
Q  326 ttagttaagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28305216 ttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 28305171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28349097 - 28348952
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||   |||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  28349097 aacatggtttcatttgaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaagatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagt 28348998  T
Q  326 ttagttaagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28348997 ttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 28348952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 27056407 - 27056556
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  27056407 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 27056506  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27056507 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 27056556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18911713 - 18911647
Alignment:
Q  116 tgtgagactcagacttgaaattatg-aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18911713 tgtgagactcagacttgaaactatgaaatgtaaaatgatacatg--atgcttatgcaaaaatagacaca 18911647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 199 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18911626 - 18911575
Alignment:
Q  199 ttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattg 250  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18911626 ttgtcaaagtaatcgtaaacatcataaggaacattgtttcatttgataattg 18911575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 130
Target Start/End: Original strand, 620794 - 620832
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagact 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  620794 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgact 620832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 21)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9187524 - 9187208
Alignment:
Q  38 tgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaatt 137  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9187524 tgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacatttgagatgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactcagacttgaaatt 9187425  T
Q  138 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtt 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9187424 atgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtt 9187325  T
Q  237 ttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaa----ggttcttaacaaaagctaaagcttagtta 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9187324 ttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaatagttcttaacaaaagctaaagcttcgtta 9187225  T
Q  333 agatttttgaagttgta 349  Q
    || ||||||||||||||    
T  9187224 aggtttttgaagttgta 9187208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20556629 - 20556283
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||||||||    
T  20556629 tgatatgttctatctttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtag 20556530  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtc 203  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||         ||||||||||||    
T  20556529 aaaagacatagtgtaagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatatacacatttttttttgaaggacttgtc 20556430  T
Q  204 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aa 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  20556429 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaa 20556330  T
Q  303 aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20556329 aaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 20556283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14884259 - 14883893
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||| |||| | || |||||||||  | |    
T  14884259 tgatatgttttttctttttgtttgcacgagtgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggatagtcgggacactgttgagatggattgaccttttatgg 14884160  T
Q  105 aaaagacacagt-gtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--gaaggacttg 201  Q
    |||||| | | | || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||          ||||||||||    
T  14884159 aaaagaaaaaattgttagacttggacttgaaattatgaatgcaaa-tgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttttgaaggacttg 14884061  T
Q  202 tcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagga 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  14884060 tcaaagtaattgtaaacttgataaggaactttgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaggaa 14883961  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14883960 aaagctattaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 14883893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 78 - 368
Target Start/End: Original strand, 16725633 - 16725921
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-t 176  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16725633 cttttgagatggattgacctttagcagaaaagacacaatgtaagactcaaactcgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaaat 16725732  T
Q  177 aggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    || |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16725733 agacac---ttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacatttttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttccattt 16725829  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctt 368  Q
    ||||||||||||| | || ||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16725830 tcaaaagtaagaacggaagcagaaaaaagttcttaaccaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctt 16725921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18038909 - 18038627
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-t 176  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18038909 cttttgagacggattgacctttagcagaaaagacacagtgtaagactcaaacttgaa--------tgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaaat 18038818  T
Q  177 aggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    || |||         |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  18038817 agacac-gtttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaggaacattgttttatttaaaaattgtaaaggtgttgcaattggttcccttt 18038719  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038718 -caaaagtaagaacgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 18038627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 78 - 349
Target Start/End: Original strand, 3385977 - 3386249
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3385977 cttttgagatggattgacctttagtagaaa-gacacggagtaagactcggacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaata 3386075  T
Q  178 ggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    | ||||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3386076 gacacatttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtttaatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttaccttt 3386175  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  3386176 tcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaatattcttaacaaaagctaaaacttagttaaggtttttgaagttgta 3386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Original strand, 15900380 - 15900660
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  15900380 cttttgagatgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattacgaatgcaaaatcatacatgatatggttatgcaaaaata 15900479  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
    | ||||         ||||||||||||||||||||||||||            |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15900480 gacacatttttttttaaggacttgtcaaagtaattgtaaac------------attgtggtatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggctccctttt 15900567  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15900568 caaaagtaagaacgaaaccgaggaaaaagttcttaataaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttagtgttccttctta 15900660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 15077265 - 15077444
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15077265 gaaggacttatgaaagtaattttaaacttgataaggaacattgttttatttgaaagttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacg 15077364  T
Q  292 aaaccaaggaaag--gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15077365 aaaccaaggaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 15077444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 15079571 - 15079750
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  15079571 gaaggacttatgaaagtaattttaaacttaataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacg 15079670  T
Q  292 aaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15079671 aaaccaaggaaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 15079750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 369
Target Start/End: Original strand, 3841554 - 3841817
Alignment:
Q  103 agaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-taggcacannnnnnnn-gaaggactt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||          |||||||||    
T  3841554 agaaaagacacagtgtaagactcagacttgaa--------tgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaaatagacacgtttttttttgaaggactt 3841645  T
Q  201 gtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3841646 gtcaaagtaattgtgaacttgataaggaa-attgttttatttgaaaattgtgaagatgttctaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaagg 3841744  T
Q  301 aa-----aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||     | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3841745 aaaaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga-ttttgaagttgtatttcttgatgttccttctta 3841817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 14919998 - 14919804
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14919998 cttttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 14919899  T
Q  178 ggca--cannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtt 270  Q
    | ||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  14919898 gacattttttttatttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatattgctattggtt 14919804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 78 - 303
Target Start/End: Original strand, 18385901 - 18386116
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||    
T  18385901 cttttgagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgata---------aaaaata 18385991  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
    | ||          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||    
T  18385992 gacattttttattcgaaggacttgtcaaagtaatggtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtaaagatgttgcaatt-gattcccttt 18386090  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaaggaaa 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  18386091 caaaagtaagaacgaaaccaaggaaa 18386116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8660209 - 8660031
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||| | |||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  8660209 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctctagacgaggacagtcggaccactttcgaaatggattgacctttagtag 8660110  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  8660109 aaaagacacagcgtaagactcaaacttgaaattatgaatgcaatatgatgcatgctatgcttatgcgaaaatagccaca 8660031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 103 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 22706595 - 22706380
Alignment:
Q  103 agaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-taggcacannnnnnnn-gaaggactt 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||          |||||||||    
T  22706595 agaaaagacacagtgtaagactcagacttgaa--------tgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaaatagacacgtttttttttgaaggactt 22706504  T
Q  201 gtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22706503 gtcaaagtaattgtgaacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatattgctattggttcctttttcaaaagtaagaacgaaaccaagg 22706404  T
Q  301 -aaaggttcttaacaaaagctaaa 323  Q
     ||| ||||||| |||||||||||    
T  22706403 aaaaagttcttagcaaaagctaaa 22706380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 192 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3359761 - 3359581
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa--gtaaga 288  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||| |||  ||||||    
T  3359761 gaaggatttgtcaaagtgattggaaacattatagaagaacattgtttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggtttttttttccaaaaggtaaga 3359662  T
Q  289 atgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctt 368  Q
      ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  3359661 gcgaacccaagggaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggcgttctttctt 3359581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 228 - 362
Target Start/End: Original strand, 8100672 - 8100802
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagct 326  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||   |    |||||||||||||||    
T  8100672 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtc-ctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagt----acaaaagctaaagct 8100766  T
Q  327 tagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttc 362  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8100767 cagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttc 8100802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 369
Target Start/End: Original strand, 26218329 - 26218408
Alignment:
Q  292 aaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26218329 aaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaaacttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 26218408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Original strand, 26218170 - 26218239
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||    
T  26218170 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatatgtatgcaaaaat 26218239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 174
Target Start/End: Original strand, 21529133 - 21529189
Alignment:
Q  118 tgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 174  Q
    |||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529133 tgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 21529189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 369
Target Start/End: Original strand, 21529329 - 21529373
Alignment:
Q  325 cttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21529329 cttagttaagatttttgaagttgtatatcttggtgttcattctta 21529373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3359838 - 3359781
Alignment:
Q  117 gtgagactcagacttgaaattatgaa-tgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  3359838 gtgagactcggactcgaaactatgaaatgcaaaatgatgcatg--atgcttatgcaaaaa 3359781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20736443 - 20736083
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20736443 tgatatgttctctctttttgtttgcacgattgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggatagtcggaacacttttgagatggattgacctttagtag 20736344  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  20736343 aaaagacaaagtgtaagactcatatttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgtttattcaaaaatagacacattttttt-gaaggacttgtca 20736245  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttc-aaaagtaagaatgaaaccaagg--a 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  20736244 aagtcattgtaaacttgataaggaacattattttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggata 20736145  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20736144 aaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttc 20736083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 20745001 - 20744641
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  20745001 tgatatgttctctctttttgtttgcacgattgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggatagtcggaacacttttgagatggattgacctttagtag 20744902  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  20744901 aaaagacaaagtgtaagactcatatttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgtttattcaaaaatagacacattttttt-gaaggacttgtca 20744803  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttc-aaaagtaagaatgaaaccaagg--a 301  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  |    
T  20744802 aagtcattgtaaacttgataaggaacattattttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggata 20744703  T
Q  302 aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20744702 aaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttc 20744641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 25856633 - 25856977
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||| |||| ||| |||| |  || || ||||| || | || ||||||||||||||    
T  25856633 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaagtgtgagttgactttagacaaggacaactggacaacttt-gagatggattgacctttagtag 25856731  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||    
T  25856732 aaaagacacagtgtaagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttcgaaggacttgtca 25856831  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaa 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  25856832 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatctgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaa 25856931  T
Q  304 ggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25856932 aattcttagcaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 25856977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 46 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32002440 - 32002142
Alignment:
Q  46 cgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaatt-atgaatg 144  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   ||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||    
T  32002440 cgagttggctttggacgaggacagtcagacccctttcgaaatggattgacctttagtagaaatgacacagagtaagactcggacttgaaatttatgaatg 32002341  T
Q  145 caaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttga 244  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32002340 caaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttaaggacttgtcaaagtcattgtaaacataataaggaacattgttttatttga 32002241  T
Q  245 aaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32002240 aaattgtgaagatgttgcaattgg-ttccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttaattaagatttttga 32002142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 22160509 - 22160831
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22160509 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgaccttttgtagaaaagacacagtgt 22160608  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaa 217  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||          || ||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  22160609 aagactcagacttgaaattatgtatgca----------tgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaa 22160698  T
Q  218 cttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaa 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||||||    
T  22160699 cttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcataacaaa 22160798  T
Q  317 agctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22160799 agctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 22160831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20741370 - 20741128
Alignment:
Q  120 agactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaact 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| ||||        ||||||||||||||||| |||||||||     
T  20741370 agactcagatttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgtttattcgaaaatagacacattttttt-gaaggacttgtcaaagtcattgtaaaca 20741272  T
Q  220 tgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttc-aaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaa 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||    
T  20741271 tgataaggaacattattttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttctaaacaaa 20741172  T
Q  317 agctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20741171 agctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtg 20741128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 24709092 - 24709238
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaa-aggttcttaacaaaagctaa 322  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||   ||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24709092 aggaacatggttttaattgaaaattgtaaagatattgcaatcggttcccttttcaaaaaacaagaacgaagccaaggaagaaattcttaacaaaagctaa 24709191  T
Q  323 agcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709192 agcttagttaagacttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 24709238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6666167 - 6666072
Alignment:
Q  285 aagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttatgatgtccat 379  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6666167 aagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaatttgcatctcttggtgttccttcttacaatgtccat 6666072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 362
Target Start/End: Original strand, 17680528 - 17680658
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagct 326  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    |||||||||||||||    
T  17680528 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtc-ctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt----acaaaagctaaagct 17680622  T
Q  327 tagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17680623 tagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttc 17680658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 362
Target Start/End: Original strand, 39843078 - 39843313
Alignment:
Q  125 cagacttgaaattatgaatgcaaa-atgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaa--ttgtaaacttg 221  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||  | |||        ||||||||| ||||||| |  || ||||| ||    
T  39843078 cagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcaaaaat--gtacaatttttttgaaggacttatcaaagttaatttttaaacatg 39843175  T
Q  222 ata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagc 319  Q
     || || ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||   | |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    |||||||     
T  39843176 gtagagaaacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggcc-ctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagt----acaaaagg 39843270  T
Q  320 taaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39843271 taaagcttagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttc 39843313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 107 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 6666352 - 6666284
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6666352 aagacacggtgtgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 6666284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 24708975 - 24709033
Alignment:
Q  115 gtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  24708975 gtgtgagacactgacttgaagctatgaatgcaaaatgatgcatg--atgcttatgtaaaaa 24709033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Original strand, 4875 - 5170
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4875 cttttgagatgggttgacctttagtagaaaagacaaagtgtgagactcagactggaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 4974  T
Q  178 ggcacannnnnnnn--gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctt 275  Q
    | ||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  4975 gacattttttttatttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatgttgcaattgattccctt 5074  T
Q  276 ttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5075 ttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaagttcttaacaaaagctaaagtttagttaagatttttaaagttgtatttcttggtgttccttctta 5170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 267
Target Start/End: Original strand, 10989 - 11180
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989 cttttgagatgggttgacctttagtagaaaagacaaagtgtgagactcagactggaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 11088  T
Q  178 ggca--cannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattg 267  Q
    | ||            |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11089 gacattttttttatttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatgttgcaattg 11180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17759 - 17390
Alignment:
Q  7 atatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaa 106  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  17759 atatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaagtgcgagttagctttggatgtggatagttaaaccacttttgaaacgggttgaccttttatggaa 17660  T
Q  107 aagacacagt--gtgagactcagacttgaaattatgaa-tgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn---gaaggactt 200  Q
    |||| | | |  ||||||||| ||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           |||||||||    
T  17659 aagaaaaaatttgtgagactcggacttgagactatgaaatgtaaaatgatgcatgatatgcttatggaaaaaaaggcacatttttttttttgaaggactt 17560  T
Q  201 gtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17559 gtcaaagtaattgtaaacttcataaggaacattgttttatttgaaaaatgtgaagatgttgcaattggttccctttccaaaagtaagaacgaaaccaagg 17460  T
Q  301 -aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17459 aaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttatgatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 17390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Original strand, 34136485 - 34136830
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34136485 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagacatagtgt 34136584  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 218  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  34136585 aagactcagacttgaaattatgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatatacacattttttt-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 34136683  T
Q  219 ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaa 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  34136684 ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttccctttttaaaagtgagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaa 34136783  T
Q  317 agctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  34136784 agataaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcctggtgttc 34136830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8812985 - 8812807
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  8812985 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttccaattggttcccttttcaaaagtaagaacg 8812886  T
Q  292 aaacc-aaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8812885 aaaccaaaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 8812807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 349
Target Start/End: Original strand, 13268127 - 13268454
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||   ||| ||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13268127 tttttgtttgcccgagtgttgtaggtgcgagttgactttggacgaggatagttgggacacctttgagatggattgacttttagtagaaaagacacagtgt 13268226  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnng------aaggacttgtcaaagtaatt 212  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||          || ||||||||||||||||||| ||||               ||| ||||| ||||||||||    
T  13268227 aagactcagacttgaaattatgtatgca----------tgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttttttttaaagaacttggcaaagtaatt 13268316  T
Q  213 gtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaag-gaaaggttctta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||    
T  13268317 gtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaagaaaaaaattctta 13268416  T
Q  312 acaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13268417 acaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 13268454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Original strand, 23884401 - 23884681
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||              
T  23884401 cttttgagatggattgacctttagcagaaaagacacagtgtaagacttagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttag--------- 23884491  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
       |||        |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23884492 ---acacgttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataaagaacattgtttt--ttgcaatttgcgaaaatgttgcaattggttccctttt 23884586  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaaggaaag---gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23884587 caaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgagtttgtatttcttggtgttccttctta 23884681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12586955 - 12586733
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgata-aggaacattgtttta 239  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||        |||||| ||||||||||| ||| |||| | ||| |||||||| |||| |    
T  12586955 aatgcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaaaatagacacatttttt--gaaggatttgtcaaagtatttggaaacattatagaggaacatggtttca 12586860  T
Q  240 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt-caaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 336  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||||| |||| | |||| |||||| |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12586859 tttaaaaattgtaaagatattgcaataggttccttttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 12586760  T
Q  337 ttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12586759 ttttgaagtttgaatttcttggtgttc 12586733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27436496 - 27436351
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaa 322  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27436496 aggaacatggtttcatttgaaaattttaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagttcttaacaaaagttaa 27436397  T
Q  323 agcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  27436396 agcttagttaaga-ttttgaagctgtatctcttggtgttcattctta 27436351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 840649 - 840516
Alignment:
Q  237 ttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga 335  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||  |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  840649 ttatttgaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaaga 840550  T
Q  336 tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  840549 tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 840516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 847825 - 847692
Alignment:
Q  237 ttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga 335  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||  |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  847825 ttatttgaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaaga 847726  T
Q  336 tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  847725 tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 847692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 237 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1205829 - 1205696
Alignment:
Q  237 ttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaaga 335  Q
    ||||||||||||| | ||| | ||||||  |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||    
T  1205829 ttatttgaaaattataaaggtattgcaaacggttccctcttcaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttgaaacttagttaaga 1205730  T
Q  336 tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205729 tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 1205696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 193 - 362
Target Start/End: Original strand, 4829916 - 4830089
Alignment:
Q  193 aaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaat 290  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||||| |  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||| ||||||     
T  4829916 aaggatttgtcaaagtaattggaaacattatagaggaacgtgatttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaac 4830015  T
Q  291 gaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  4830016 gaaaccaaggaaaaagttcttaataaaagctaaggcttagttaagatttttgaagtttgaatttcttggtgttc 4830089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 369
Target Start/End: Original strand, 4949803 - 4949935
Alignment:
Q  239 atttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 336  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| | || | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4949803 atttgaaaattgtaaagatattgcaatagattcctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagttctaaacaaaagttaaagcttagttaagat 4949902  T
Q  337 ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4949903 ttttaaagttgtatctcttggtgttcattctta 4949935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 276 - 365
Target Start/End: Original strand, 1959619 - 1959709
Alignment:
Q  276 ttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaa-aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1959619 ttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaagaagttcttaacaaaagctaaagtttaattaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 1959709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 27974327 - 27974476
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttctt-aacaaaagct 320  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  27974327 aggaacattgtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttctttaacataagct 27974426  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27974427 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttcttggtgttcattctta 27974476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 5207212 - 5207361
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  5207212 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 5207311  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5207312 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 5207361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 362
Target Start/End: Original strand, 16270432 - 16270489
Alignment:
Q  305 gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270432 gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttc 16270489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 567157 - 567228
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  567157 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 567228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 5207079 - 5207150
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5207079 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 5207150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 27974198 - 27974269
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27974198 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 27974269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29024632 - 29024483
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  29024632 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtc-ctttttcaaatgataagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaaac 29024534  T
Q  326 ttagttaaga-------tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||       ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29024533 ttagttaagagattttttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 29024483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 240 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13833962 - 13833836
Alignment:
Q  240 tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagattt 338  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||  |||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||  |    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  13833962 tttgaacattgtaaagacgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaaagagt----acaaaagctaaagcttagttaaaattt 13833867  T
Q  339 ttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  13833866 ttgaagttgtatctctttgtgttcattctta 13833836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13834079 - 13834033
Alignment:
Q  132 gaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13834079 gaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 13834033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 567284 - 567426
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||     
T  567284 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagc- 567382  T
Q  321 aaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
         |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  567383 -----ttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 567426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Original strand, 4949650 - 4949738
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtaga-aaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||   | |||| || ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4949650 ttgaccttttgtagataaagacacatgataagacacatactagaaactatgaatgcaaaatgaggcatgatatgcttatgcaaaaatag 4949738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 365
Target Start/End: Original strand, 9096300 - 9096355
Alignment:
Q  310 taacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  9096300 taacaaaagctaaagtctagttaagacttttgaagatgtatttcttggtgctcctt 9096355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 803203 - 803245
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  803203 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 803245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 16292070 - 16292112
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16292070 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 16292112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2551835 - 2551793
Alignment:
Q  136 ttatgaatgcaaaatgatgcatgatatgct-tatgcaaaaata 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2551835 ttatgaatgcaatatgatgcatgatatgctatatgcaaaaata 2551793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8813070 - 8813032
Alignment:
Q  92 tgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagact 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8813070 tgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactctgact 8813032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 9028 - 8678
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||| |   ||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9028 tttttgtttgcccgagtgttgtaagtgcgagttggctttggatgaggatagtcgggacacttttgagatggattgacatttagtagaaaagacacagagt 8929  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn---gaaggacttgtcaaagtaattgta 215  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||           |||| |||| ||||||||||||||    
T  8928 aagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttttgaagaacttctcaaagtaattgta 8829  T
Q  216 aacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttc-aaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaa 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  8828 aacttgataaggaatattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaa 8729  T
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  8728 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttctgggtgttc 8678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 3745 - 4079
Alignment:
Q  38 tgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaatt 137  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3745 tgtaggtgtgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttgagattgattgacctttagtagaaaagacacaatgtaagactcagacttgaaatt 3844  T
Q  138 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttt 237  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |        |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3845 atgtatgcaaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacatattttttttgaagcacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaagaacattgttt 3944  T
Q  238 tatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttctt-aacaaaagctaaagcttagttaaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| || |||||||| || ||||||||||    
T  3945 tatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaaaaaaaagctacagtttagttaaga 4044  T
Q  336 tttttgaag-ttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4045 tttttgaagtttggatttcttggtgttccttctta 4079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 99290 - 98966
Alignment:
Q  46 cgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgc 145  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  99290 cgagttggctttggacgaggacagtcggacccctttcgaaatggattgacctttagtagaaatgacacagagtaagactcagacttgaaattatgaatga 99191  T
Q  146 aaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttga 244  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  99190 aaaatgatgcatgctatgct-atgcaaaaatagacacttttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttattcaa 99092  T
Q  245 aaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  99091 aaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaactaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagttaaagattagttaagatttttgaa 98992  T
Q  344 gttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     |||||||||||||| ||||||||||    
T  98991 attgtatttcttggtattccttctta 98966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 367
Target Start/End: Original strand, 31401 - 31767
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| ||| |||||||||||| |||    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |||| |||| || ||||||||||||||    
T  31401 tgatatgttcttcctttttgtttgcacgaatgttgtaggtgcgagttggctttggacgaggacagtcggacccctttcgaaatggattgacctttagtag 31500  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaa-aaataggcacannnnnnnngaaggacttgtc 203  Q
    |||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||        ||||||||||||    
T  31501 aaaagacgtagtgtaagactcaaacttgaaatgatgaatgcaaaatgatgcatgctttgcttatgcaacaaatagacacatttcatt-gaaggacttgtc 31599  T
Q  204 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--a 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  31600 aaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatctgaaaattatgaagatgttgcaattagttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaa 31699  T
Q  302 aaggttc-ttaacaaaagctaaagc-ttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttct 367  Q
    || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31700 aaagttctttaacaaaagctaaagctttggttaagatttttgaaattgtatttcttggtgttccttct 31767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8690 - 8361
Alignment:
Q  17 tctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagt 116  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||| | || |||||| ||  ||||||||||||| |    
T  8690 tctttttgtttgcacgagtgttgtaagtgcgagttggctttggacgaggatagtcgaggcacttttgagatggattgaccctttttagaaaagacacaat 8591  T
Q  117 gtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnng--aaggacttgtcaaagtaattgt 214  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||           |||||||||||||||| |||||    
T  8590 gttagactcagacttgaaattattaatgcaaaatgatgcatgctatgcttatggaaaaatagacacatttttttttttaaggacttgtcaaagtcattgt 8491  T
Q  215 aaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaa 312  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||    
T  8490 aaacataataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggataaaagttctcaa 8391  T
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttttga 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8390 caaaagctaaagcttaattaagatttttga 8361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 38 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18314 - 18012
Alignment:
Q  38 tgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaatt 137  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||| | | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18314 tgtaggtgtgagttgactttggacgaggacagttgggacacctttcagatggattgacctttagtagaaaagacacagtgtaagactcagacttgaaatt 18215  T
Q  138 atgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttt 237  Q
    ||| |||||          || ||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18214 atgtatgca----------tgctatgcttatgcaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttt 18125  T
Q  238 tatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18124 tatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaagcttagttaaggt 18025  T
Q  337 ttttgaagttgta 349  Q
    |||||||||||||    
T  18024 ttttgaagttgta 18012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 349
Target Start/End: Original strand, 20335 - 20674
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||||||| |||   ||| |||| |||| ||  |||||||||||||    
T  20335 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctttggacgaggacagtcagacccctttcgaaatggactgacctttagtag 20434  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||  |||        |||||||||||||    
T  20435 aaaagacgcagtgtaagactcagacttgaaattatgaatgcaaa---atgcatgctatgcatatgcaaaaatag--acacgttttttgaaggacttgtca 20529  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aa 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || || |||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  20530 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttaaaaatt-tgaa-atattacaaacagtttccatttcaaaagtaagaaagaaaccaaggaaaa 20627  T
Q  303 aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgta 349  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20628 aagttcttaacaaaagctaaagcttagttaaggtttttgaagttgta 20674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4016 - 3837
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  4016 gaaggacttatgaaagtaattttaaacttaataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacg 3917  T
Q  292 aaaccaaggaaag--gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3916 aaaccaaggaaagaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 3837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Original strand, 14217 - 14501
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14217 cttttgagatggattgacctttagtggacaagacacagtgtgagactcagattcgaaatgatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 14316  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
    | ||||        |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14317 gacacattttt---gaaggacttgtcaaagtaattgtaaatttgatcaggaacattgttttgtttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttccctttt 14413  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||| || ||||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||    
T  14414 caaaagtaaaaacgaaaccaaggataaaagctctt------agctaaagcttagttaagattttgaaatttagatttcttggtgttccttctta 14501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Original strand, 33660 - 34018
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||| | || ||||||||||||||    
T  33660 tgatatgttctttatttttgtttgcacgagtgttgtaggtgcgagttggctttggacgaggatagtcgggacacttttgagaaggattgacctttagtag 33759  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--gaaggacttgt 202  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||      |||||||| ||||          |||||||||||    
T  33760 aaaa-acacagtgtaagactctaacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcaagctatgc------aaaaatagacacattttttttttgaaggacttgt 33852  T
Q  203 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-a 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  33853 caaagtaattgtaaacttgataaggaacattgt----tttgaaaatcgtgaaaacgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaaggaaaccaaggaa 33948  T
Q  302 aaggttc-ttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  33949 aaagttctttaacaaaagctatagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttctttctta 34018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 192249 - 192427
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  192249 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaatattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaatttgttcccttttcaaaagtaagaacg 192348  T
Q  292 aaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  192349 aaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgcatttcttggtgttctttctta 192427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0441
Description:

Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 9682 - 9395
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  9682 cttttgagatggattgacctttagtagaaaagacacattgtaagactcatacttgaaatgatgaatgcaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaaaa 9583  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt 277  Q
       |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9582 tagacacgtcttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttctatttgaaaattgtcaagatgttgcaattggttccctttt 9483  T
Q  278 caaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||||  ||| | ||||      |||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||    
T  9482 caagagtaagaacgaaaccaaggataaaagctctt------agctaaagcttagttaagattttgaaattttgatttcttggtgttccttctta 9395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0478
Description:

Target: scaffold0478; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 362
Target Start/End: Original strand, 1 - 232
Alignment:
Q  136 ttatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacatt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1 ttatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacacattttttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtagacttgataagggacatt 100  T
Q  234 gttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagtt 331  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  101 gttttgtttgaaacttgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcataacaaaagctaaagcttagtt 200  T
Q  332 aagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  201 aagatttttgaagtttggatttcttggtgttc 232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 331
Target Start/End: Original strand, 20278460 - 20278763
Alignment:
Q  19 tttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgt 118  Q
    ||||||||||| ||||   |||| ||| |||||| |||| |||||||| |||||   ||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20278460 tttttgtttgcacgagtgttgtaggtgtgagttgactttagacgaggacagttgggacacctttgagatggattgacctttagtagaaaagacacggtgt 20278559  T
Q  119 gagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 218  Q
     |||  |||||||||||||||| |||||          || ||||||||| ||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  20278560 tagagacagacttgaaattatgcatgca----------tgctatgcttatacaaaaatagacacattttttttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaac 20278649  T
Q  219 ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggt-tcttaacaaaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    |||||||||||    
T  20278650 ttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaactaaggaaaaaaatcttaacaaaa 20278749  T
Q  318 gctaaagcttagtt 331  Q
    ||||||||||||||    
T  20278750 gctaaagcttagtt 20278763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 91 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24692748 - 24692462
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnn 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||             
T  24692748 ttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcacgatatgcttatgcaaaaatagacattttttatt 24692649  T
Q  191 ngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaat 290  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||| |||||| |||  |||| || || |||    ||||||||| |||||  ||||     
T  24692648 tgaaggacttgtcaaagtgattgtaaagatcataaggaactttgtttcatttgataat--tgaaaatattacaaacaatttcctttttaaaag-cagaag 24692552  T
Q  291 gaaa--ccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttatgatgtccat 379  Q
     |||    ||||||| || | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24692551 caaagttaaaggaaaagtccctaac-aaagctaaagtctagttaagacttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttataaggtccat 24692462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24701674 - 24701312
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||   ||||  || ||||||||||| ||| |||| |||  |  ||||||| | |  | ||||||||||||||    
T  24701674 tgatatgttatttctttttgtttgcacgagtgttgtagatgtgagttggctttggaccaggacagtcaagacacttttaagatagattgacctttagtag 24701575  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |          |||||||||||||    
T  24701574 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcacgatatgtttatgcaaaaatagatattttttatttgaaggacttgtca 24701475  T
Q  205 aagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaa--ccaaggaa 302  Q
    |||| ||||||||  | ||||||||| |||||| |||||| |||  |||| || || |||    ||||||||| |||||  ||||  |||    ||||||    
T  24701474 aagtgattgtaaagatcataaggaactttgtttcatttgataat--tgaaaatattacaaacaatttcctttttaaaag-cagaagcaaagttaaaggaa 24701378  T
Q  303 aggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    | || | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24701377 aagtccctaac-aaagctaaagtctagttaagacttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 24701312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35141199 - 35140961
Alignment:
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacattg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |          ||||||||| ||||||| |||||||||| |||   |||||||| |    
T  35141199 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagataatttttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacattgtcgaggaacatag 35141100  T
Q  235 ttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagt-aagaatgaaaccaaggaaagg-ttcttaacaaaagctaaagcttagtta 332  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||| |||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  35141099 tttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt-cttttttaaaagttaagaacgaaaccaaggaaaaacttcttaacaaaagctaaggcttagtta 35141001  T
Q  333 agat---ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||   |||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  35141000 agattttttttgaagttgtatctcttggtgatcattctta 35140961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25494336 - 25494191
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||    |||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25494336 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggtccttttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagc 25494237  T
Q  326 ttagttaagat--ttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25494236 ttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 25494191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Original strand, 42572122 - 42572266
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaat-gaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||   ||||||||||  | ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  42572122 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaaaatcgaaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagc 42572221  T
Q  326 ttagttaaga-tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42572222 ttagttaagattttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 42572266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Original strand, 3764053 - 3764202
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  3764053 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 3764152  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  3764153 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 3764202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16275926 - 16275777
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  16275926 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttcaaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 16275827  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16275826 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 16275777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Original strand, 3763920 - 3763991
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3763920 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 3763991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 228 - 369
Target Start/End: Original strand, 30691495 - 30691640
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagctaaagc 325  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||   |||||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||     
T  30691495 aacatggtttcatttgaaaattatgaagatattgcaaaaggttcttttttcaaaaggtaagatcgaaaccaaagaaaaagttcttaacaaaagctaaagt 30691594  T
Q  326 ttagttaaga--tttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30691595 ttagttaagatttttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 30691640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 112 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16276050 - 16275984
Alignment:
Q  112 acagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16276050 acagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 16275984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21112505 - 21112356
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaag-gttcttaacaaaagcta 321  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  | || | ||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||| |    
T  21112505 aggaacatggttttattttgaaaattgtaaagatgtcgcaaacgattcctttttcaacaggtaagaacgaaaccaaggaaaaagttcttaatgaaagcga 21112406  T
Q  322 aagcttagttaagatttttgaagttgtatttc--ttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||    
T  21112405 aagcttagttaagatttttgaagttgtatctcttttggtgttcattctta 21112356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 361
Target Start/End: Original strand, 15950637 - 15950767
Alignment:
Q  228 aacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagct 326  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||  |    |||||||||||||||    
T  15950637 aacatggtttcatttgaaaattgtgaagatattgcaaacggttcctttttcaaaaggtaagaacgaaatcaaggaaagagt----acaaaagctaaagct 15950732  T
Q  327 tagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgtt 361  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  15950733 tagttaaattttttgaagttgtatctctttgtgtt 15950767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 21857782 - 21857839
Alignment:
Q  312 acaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21857782 acaaaagctaaagctcagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 21857839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19990391 - 19990255
Alignment:
Q  38 tgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttag-tagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaat 136  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||  || |  |||||||||| |||| ||||||||| | | | ||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  19990391 tgtaagtgcgagttggcttcgaacgaggac-gtcgggccacttttgagacggattgacctttggattggaaaaacaatgtgtgagactcagacttgaaac 19990293  T
Q  137 tatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  19990292 tatgaatgcaaaatgatgcatg--acgcttatgcaaaaat 19990255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24288182 - 24288122
Alignment:
Q  118 tgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24288182 tgagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatgtgcttatgcaaaaatag 24288122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24287998 - 24287951
Alignment:
Q  322 aagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24287998 aagcttagttaagatttttgaagttgtatatcttggtgttcattctta 24287951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21113869 - 21113799
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaa-tgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  21113869 aagacacagtatgagacacagactataaactatgaatgcaaaaatgatgcatgatatatttatgcaaaaat 21113799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 175
Target Start/End: Original strand, 21857576 - 21857642
Alignment:
Q  109 gacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    |||||| ||| |||| | |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21857576 gacacaatgtaagacacggactagaaactatgaatacaaaatgatgcatgatatgcttatgaaaaaa 21857642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 365
Target Start/End: Original strand, 45025456 - 45025508
Alignment:
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45025456 caaaagctaaagtctagttaagacttttgaagatgtatttcttggtgctcctt 45025508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25494445 - 25494393
Alignment:
Q  125 cagacttgaaattatgaatgcaaa-atgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25494445 cagactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatatttatgcaaaaat 25494393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Original strand, 1 - 207
Alignment:
Q  146 aaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaa-ggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttga 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||         || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aaaatgatgcatgctatgcttatgcaaaaatagacacatttttttttaaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttga 100  T
Q  245 aaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagc-ttagttaagatttttga 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  101 aaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaaattcttaacaaaagctaaaactttagttaaggtttttga 200  T
Q  343 agttgta 349  Q
    |||||||    
T  201 agttgta 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 78 - 248
Target Start/End: Original strand, 18427 - 18596
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaata 177  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18427 cttttgagatgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatacaaaatgatgcatgttatgcttatgcaaaaata 18526  T
Q  178 ggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaat 248  Q
    | ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18527 gacaca-ttttcttgaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaat 18596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 243 - 369
Target Start/End: Original strand, 19390 - 19517
Alignment:
Q  243 gaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaaggaaaggtt-cttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttg 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19390 gaaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaggtaagaacaaaaccaaggaaaaatttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttg 19489  T
Q  342 aagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  19490 gagttgtatttcttggtgttccttctta 19517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 78 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 17159 - 16886
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-t 176  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17159 cttttgagatggattgacctttagcagaaaagacacagtgtaagacttagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaaat 17060  T
Q  177 aggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttt 276  Q
    ||  |||        ||||| |||||||||||||||||||             ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  17059 ag--acacgttttttgaagggcttgtcaaagtaattgtaa-------------cattgtggtatttgaaaattgtgaagatgttgcaatttgttctcttt 16975  T
Q  277 tcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16974 tcaaaagtaagaatgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaaacttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttc 16886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 301483 - 301326
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  301483 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttcataaggaacattgtcttatttgaaaattgtgaagatgctgcaattgcttcccttttcaaaagtaagagtg 301384  T
Q  292 aaaccaagga-aaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgt 348  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  301383 aaaccaaggagaaagttcttaacaaaagttaaagcttagttaagatttttgaagttgt 301326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 78 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 31070 - 30785
Alignment:
Q  78 cttttgaaacgggttgacctttagtagaaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgca-aaaat 176  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||          ||  ||||||||||| |||||    
T  31070 cttttgagatgggttgacctttagtagtaaagacacagtgttagacacagacttgaaattatgaatgca----------tgtcatgcttatgcagaaaat 30981  T
Q  177 aggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcc-tt 275  Q
    || |||          | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||| ||| || ||    
T  30980 agacacttttttttt-agggagttgtcaaagtaattgtaaacttgatggggaacattgtgttgtttgaaacttgtgaagatgttgtaattcgttcccttt 30882  T
Q  276 ttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30881 ttcaaaagtaagaacgaaaccaaggataaaagttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagtttggatttcttggtgttccttctta 30785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 192 - 327
Target Start/End: Original strand, 22811 - 22947
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |    
T  22811 gaaggacttgtcaaagtaattgtgaacttgataaggaacattgttttatttgaaatttgtgaagatattgctattggttcctttttcaaaagtaagaacg 22910  T
Q  292 aaaccaagg-aaaggttcttaacaaaagctaaagctt 327  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22911 aaaccaaggaaaaagttcttaacaaaagctaaagctt 22947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 175
Target Start/End: Original strand, 22617 - 22779
Alignment:
Q  5 tgatatgtgctttctttttgtttgctcgagacatgtaagtgcgagttggcttttgacgaggatagttgaaccacttttgaaacgggttgacctttagtag 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||   ||||  |||||||||||||| ||||||||||||      ||||| || | || ||||||||||| ||    
T  22617 tgatatgttctttctttttgtttgcacgagtgttgtagatgcgagttggctttggacgaggatagtcaggatactttggagatggattgacctttagcag 22716  T
Q  105 aaaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa 175  Q
    |||||||||||||| |||||||||||        |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22717 aaaagacacagtgtaagactcagact--------tgaatgcaaaatgatgtatgatatgcttatgcaaaaa 22779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 107 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2324 - 2051
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaa 206  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |         ||||||||||||||    
T  2324 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagaca-atttttttttaaggacttgtcaaa 2226  T
Q  207 gt-aattgtaaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaatgaaaccaaggaaa 303  Q
    || || |||||||    || |||||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||  ||||||| ||||    
T  2225 gtgaaatgtaaacacagtagaggaacatggtttcatttgaaaattttaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaagaacaaaaccaacgaaa 2126  T
Q  304 g-gttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttcttatgatgtcca 378  Q
    | ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||    
T  2125 gagttcttaacaacagttaaaacttagttaaga-ttttgaagttgtatctcttggtgttcattcttacaatgtcca 2051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 247 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10626 - 10507
Alignment:
Q  247 attgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa-gtaagaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagt 345  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10626 attgttaagatgttgtaattggttcccttttcaaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaagttcttaacaaaaggtaaagcttagttaagatttttgaagt 10527  T
Q  346 tgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10526 tgtatttcttggtgttcctt 10507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10665 - 10621
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgtt 236  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10665 gaagggcttgtcaaagtaattgtaaacctcataaggaacattgtt 10621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 369
Target Start/End: Original strand, 74177 - 74358
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgataa-ggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taaga 288  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||| ||  || ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||| | |||||||||| |||||    
T  74177 gaaggacttatcaaagtgaattgtaaacatggcaaaggaacatggtttcatttgaaaattgtaaagatattgcaataggttcctttttcaaaaggtaaga 74276  T
Q  289 atgaaacc-aaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  74277 acgaaaccgaaaaaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 74358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 176
Target Start/End: Original strand, 74106 - 74156
Alignment:
Q  127 gacttgaaattatgaatgcaaa-atgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 176  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  74106 gactagaaactatgaatgcaaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaat 74156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 362
Target Start/End: Original strand, 4805 - 5055
Alignment:
Q  117 gtgagactcagacttgaaattatgaa-tgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn--gaaggacttgtcaaagtaattg 213  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||          |||||| |||||||||||||||    
T  4805 gtgagactcggactcgaaactatgaaatgcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaagatagacacatgtttttttggaaggatttgtcaaagtaattg 4902  T
Q  214 taaacttgata-aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttcctttt-caaaagtaagaatgaaaccaaggaaag-gttctt 310  Q
     |||| | ||| ||||| || |||| |||||||| |||| || || |||| || |||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  4903 gaaacattatagaggaatatggtttcatttgaaagttgtaaatatattgcgataggttccttttttcaaaagtaagaacgaaaccaaggaaaaagttctt 5002  T
Q  311 aacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaag-ttgtatttcttggtgttc 362  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5003 aacaaaacctaaagcttagttaagatttttgaagtttgaatttcttggtgttc 5055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 369
Target Start/End: Original strand, 1565 - 1803
Alignment:
Q  117 gtgagactcagacttgaaattatgaa-tgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnn-gaaggacttgtcaaagtaattgt 214  Q
    ||||||||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |         |||||||||||||||||||||||    
T  1565 gtgagacttggatttgaaactatgaaatgcaaaatgatgcatgat--gcttatgcaaaaatagacatatttttatttgaaggacttgtcaaagtaattgt 1662  T
Q  215 aaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaagtaagaatgaaaccaagg--aaaggttcttaa 312  Q
    |||| | ||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| ||||||      
T  1663 aaacatcataaggaacatt----------aaaattgtgaagatgttgcaattggttcccttttcaaaagtaagaacgaaaccatggataaaagttctt-- 1750  T
Q  313 caaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
        |||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||||||||||||    
T  1751 ----agctaaagcttagttaagatttttaaatttagatttcttattgttccttctta 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 91 - 369
Target Start/End: Original strand, 144270 - 144549
Alignment:
Q  91 ttgacctttagtaga-aaagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnn 189  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  | |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |          
T  144270 ttgaccttttgtagagaaagacacaggataagacacggactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagaattatatttt 144369  T
Q  190 nngaaggacttgtcaaagt-aattgtaaac-ttgataaggaacattgtttta-tttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaa-gta 285  Q
       |||||||  ||||||| |||||||||| |||    ||||||| | || | |||| | ||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||| |||    
T  144370 ttcaaggactaatcaaagtgaattgtaaacattgtagtggaacatggcttcattttggacattgtaaagacgttgcaaacggtttctttttcaaaaggta 144469  T
Q  286 agaatgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    |||| ||||||||||||||  |    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  144470 agaacgaaaccaaggaaagagt----actaaagctaaagcttagttaagatttttaaagttgtatctcttggtgttcattctta 144549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold2162
Description:

Target: scaffold2162; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 452
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 178  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  523 aagacacagtgtgagatacagactagaaactatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatag 452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 372 - 223
Alignment:
Q  225 aggaacattgttttatttgaaaattgtgaagatgttg-caattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaa-aggttctt-aacaaaagct 320  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  372 aggaacatggtttcatttgaaaattgtcaagatatttacaataggtttctttttccaaaggtaagaacgaaaccaaggaagaagttctttaacataagct 273  T
Q  321 aaa-gcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  272 aaaagcttagttaagattttggaagttgtatttctcggtgttcattctta 223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 369
Target Start/End: Original strand, 6748 - 7005
Alignment:
Q  127 gacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata- 224  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |        ||||||||| ||||||| |||||||||| |  ||     
T  6748 gactagaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgtaaaaatagaca-attttttttgaaggacttatcaaagtgaattgtaaacgttgtag 6846  T
Q  225 aggaacattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taagaatgaaaccaaggaaagg-------------ttct 309  Q
    ||| |||| |||| |||| ||| ||||| |||| |||||||  |||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||              || |    
T  6847 agggacatggtttcattttgaacattgtaaagacgttgcaac-ggttccctttttgaaaggtaagaacgaaaccaaggaaagagtttttttttttttttt 6945  T
Q  310 taacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6946 taacaaaagctaaagcttagttacgatttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 7005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12314
Alignment:
Q  193 aaggacttgtcaaagt-aattgtaaacttgata-aggaacattgttttattt-gaaaattgtgaagatgttgcaattggtttccttttcaaaag-taaga 288  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    || |||||||| |||| |||| ||| ||||| |||  |||||||  |||| | |||||||||| |||||    
T  12491 aaggacttgtcaaagtgaattgtaaacacagtagaggaacatggtttcattttgaatattgtaaagtcgttgcaaacggttcctttttcaaaaggtaaga 12392  T
Q  289 atgaaaccaaggaaaggttcttaacaaaagctaaagctt-agttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttccttctta 369  Q
    | ||||||||||||||  |    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12391 acgaaaccaaggaaagagt----acaaaagctaaagctttagttaagatttttgaagttgtatctcttggtgttcattctta 12314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12562 - 12520
Alignment:
Q  107 aagacacagtgtgagactcagacttgaaattatgaatgcaaaa 149  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  12562 aagacacagtgtgagacacatacttgaaactatgaatgcaaaa 12520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 152110 - 152054
Alignment:
Q  309 ttaacaaaagctaaagcttagttaagatttttgaagttgtatttcttggtgttcctt 365  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  152110 ttaacaaaagctaaagtttagttaagacttttgaagttgtatttcttggtgctcctt 152054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 152288 - 152236
Alignment:
Q  120 agactcagacttgaaattatgaatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaa 174  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  152288 agactcggacttgaaactatgaatgtaaaatgatgcatg--atgcttatgcaaaa 152236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 11774 - 11643
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaa-taggcacannnnnnnngaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgata-aggaacattgtttt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||         ||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||||| | ||||     
T  11774 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaaatagacacatttttttttaaggatttgtcaaagtaattggaaacattatagaggaacctggtttc 11675  T
Q  239 atttgaaaattgtgaagatgttgcaattggtt 270  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  11674 atttgaaaattgtaaagatattgcaataggtt 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0782 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0782
Description:

Target: scaffold0782; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5938 - 5896
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5938 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 5896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 183
Target Start/End: Original strand, 184177 - 184219
Alignment:
Q  141 aatgcaaaatgatgcatgatatgcttatgcaaaaataggcaca 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  184177 aatgcaagatgatgcatgatatgcttatgcaaaaatagacaca 184219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 29273 - 29331
Alignment:
Q  192 gaaggacttgtcaaagtaattgtaaacttgataaggaacattgttttatttgaaaattg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  29273 gaaggacttgtcaaagtaactgtaaatatcataaggaacactgtttcatttgataattg 29331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University