View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9916_high_4 (Length: 506)

Name: NF9916_high_4
Description: NF9916
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9916_high_4
NF9916_high_4
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (13-486)||(22373857-22374330)
chr8 (21-486)||(19985168-19985633)
chr8 (10-486)||(21928416-21928892)
chr8 (8-485)||(31413847-31414324)
chr8 (8-486)||(22027595-22028073)
chr8 (21-489)||(16268552-16269020)
chr8 (8-490)||(22053847-22054329)
chr8 (17-486)||(20391074-20391543)
chr8 (21-489)||(28983896-28984364)
chr8 (17-490)||(29300750-29301223)
chr8 (253-489)||(28989115-28989351)
chr8 (345-489)||(27357521-27357665)
chr8 (307-482)||(22421506-22421681)
chr8 (200-482)||(22245522-22245804)
chr8 (200-482)||(22245940-22246222)
chr8 (269-479)||(19980962-19981172)
chr8 (265-482)||(21253937-21254154)
chr8 (329-482)||(22523538-22523691)
chr8 (310-478)||(22375071-22375239)
chr8 (224-482)||(21391392-21391650)
chr8 (224-482)||(21780718-21780976)
chr8 (265-482)||(22990037-22990254)
chr8 (268-479)||(21164113-21164324)
chr8 (265-479)||(17671594-17671808)
chr8 (337-482)||(21785999-21786144)
chr8 (265-479)||(19115395-19115609)
chr8 (265-479)||(20015835-20016049)
chr8 (265-479)||(22126531-22126745)
chr8 (307-479)||(32603140-32603312)
chr8 (265-479)||(22117747-22117961)
chr8 (8-281)||(6606784-6607057)
chr8 (307-479)||(18859572-18859744)
chr8 (307-479)||(22031098-22031270)
chr8 (307-479)||(22042822-22042994)
chr8 (307-479)||(30310758-30310930)
chr8 (265-464)||(19481644-19481843)
chr8 (307-479)||(15536378-15536550)
chr8 (307-479)||(22129231-22129403)
chr8 (202-284)||(21982451-21982533)
chr8 (202-284)||(21998937-21999019)
chr8 (189-284)||(21329761-21329856)
chr8 (328-373)||(20649990-20650035)
chr8 (19-65)||(22523919-22523965)
chr8 (46-103)||(21163883-21163940)
chr8 (328-373)||(21847972-21848017)
chr8 (11-68)||(22990451-22990508)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (10-486)||(175939-176414)
scaffold0020 (19-488)||(98469-98938)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (10-482)||(15073285-15073757)
chr4 (8-488)||(14993239-14993719)
chr4 (17-488)||(16150556-16151027)
chr4 (17-488)||(16154702-16155173)
chr4 (17-486)||(20892953-20893422)
chr4 (23-489)||(44658753-44659219)
chr4 (21-489)||(3261679-3262147)
chr4 (21-489)||(29450422-29450890)
chr4 (17-489)||(11204113-11204585)
chr4 (8-485)||(51603664-51604141)
chr4 (8-481)||(53750342-53750815)
chr4 (19-448)||(15266736-15267165)
chr4 (17-486)||(27903307-27903776)
chr4 (21-395)||(7357280-7357654)
chr4 (200-482)||(14697027-14697309)
chr4 (265-482)||(14162396-14162613)
chr4 (265-482)||(15904-16121)
chr4 (397-488)||(15354301-15354392)
chr4 (19-174)||(18259675-18259830)
chr4 (265-479)||(17092018-17092232)
chr4 (265-479)||(8050492-8050706)
chr4 (265-479)||(12479529-12479743)
chr4 (265-479)||(14300848-14301062)
chr4 (265-479)||(19635065-19635279)
chr4 (307-479)||(14683496-14683668)
chr4 (307-479)||(16233903-16234075)
chr4 (307-479)||(23958676-23958848)
chr4 (265-476)||(8389344-8389555)
chr4 (6-281)||(13879236-13879511)
chr4 (265-479)||(16350423-16350637)
chr4 (265-479)||(27714265-27714479)
chr4 (265-479)||(40475969-40476183)
chr4 (307-479)||(19775704-19775876)
chr4 (8-247)||(8708838-8709077)
chr4 (333-479)||(15144829-15144975)
chr4 (294-351)||(15354234-15354291)
chr4 (326-479)||(18224376-18224529)
chr4 (307-473)||(13513285-13513451)
chr4 (265-408)||(16219188-16219331)
chr4 (265-408)||(16222508-16222651)
chr4 (418-479)||(16250872-16250933)
chr4 (444-488)||(15258847-15258891)
chr4 (328-373)||(14999681-14999726)
chr4 (310-374)||(18604733-18604797)
chr4 (21-103)||(15661-15743)
chr4 (430-479)||(14188435-14188484)
chr4 (328-373)||(15290350-15290395)
chr4 (8-104)||(13513654-13513750)
chr4 (337-373)||(18546820-18546856)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (8-486)||(29478-29956)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-486)||(43296-43772)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (10-486)||(14290634-14291110)
chr3 (14-486)||(12857602-12858073)
chr3 (11-488)||(16825382-16825861)
chr3 (11-488)||(12357630-12358107)
chr3 (10-488)||(18131449-18131926)
chr3 (17-488)||(31941452-31941923)
chr3 (19-488)||(17494195-17494664)
chr3 (17-488)||(31692294-31692765)
chr3 (19-487)||(12180894-12181362)
chr3 (21-488)||(28756868-28757335)
chr3 (8-486)||(16831628-16832106)
chr3 (10-379)||(35982839-35983208)
chr3 (19-486)||(15230154-15230621)
chr3 (19-486)||(15236022-15236489)
chr3 (21-489)||(47126492-47126960)
chr3 (17-486)||(16326816-16327287)
chr3 (10-486)||(11958283-11958759)
chr3 (21-486)||(10408519-10408984)
chr3 (8-486)||(17188925-17189403)
chr3 (8-485)||(8744490-8744967)
chr3 (8-485)||(13944576-13945053)
chr3 (115-483)||(11949132-11949500)
chr3 (8-486)||(24189855-24190333)
chr3 (259-485)||(16378285-16378511)
chr3 (253-460)||(13317879-13318086)
chr3 (292-486)||(12509867-12510061)
chr3 (265-488)||(10417402-10417625)
chr3 (328-488)||(12272887-12273047)
chr3 (391-488)||(14575535-14575632)
chr3 (10-482)||(12843216-12843688)
chr3 (265-482)||(15262175-15262392)
chr3 (10-244)||(2037014-2037248)
chr3 (10-244)||(2040755-2040989)
chr3 (10-244)||(14039539-14039773)
chr3 (265-479)||(15345613-15345827)
chr3 (8-206)||(16384472-16384670)
chr3 (265-479)||(16638321-16638535)
chr3 (265-479)||(43165223-43165437)
chr3 (265-479)||(48427995-48428209)
chr3 (254-479)||(15013115-15013340)
chr3 (265-486)||(15065612-15065833)
chr3 (265-479)||(10008148-10008362)
chr3 (265-479)||(10908758-10908972)
chr3 (265-479)||(12889257-12889471)
chr3 (265-479)||(13255238-13255452)
chr3 (265-479)||(15358631-15358845)
chr3 (265-479)||(15713424-15713638)
chr3 (265-479)||(24185738-24185952)
chr3 (265-477)||(14578776-14578988)
chr3 (265-479)||(3688491-3688705)
chr3 (265-479)||(15586760-15586974)
chr3 (19-211)||(13317680-13317872)
chr3 (268-479)||(14873939-14874150)
chr3 (8-281)||(15008684-15008954)
chr3 (265-479)||(15399885-15400099)
chr3 (265-479)||(20059422-20059636)
chr3 (307-479)||(16754111-16754283)
chr3 (189-284)||(2247135-2247230)
chr3 (265-479)||(26790781-26790995)
chr3 (265-479)||(53382386-53382600)
chr3 (307-479)||(6603283-6603455)
chr3 (307-479)||(16694712-16694884)
chr3 (307-479)||(16804357-16804529)
chr3 (326-479)||(5422359-5422512)
chr3 (399-482)||(17492396-17492479)
chr3 (307-368)||(11861033-11861094)
chr3 (268-384)||(23079388-23079504)
chr3 (213-272)||(13028661-13028720)
chr3 (17-68)||(15262589-15262640)
chr3 (328-373)||(8271830-8271875)
chr3 (328-373)||(13964786-13964831)
chr3 (328-373)||(30150021-30150066)
chr3 (328-373)||(15944026-15944071)
chr3 (328-373)||(22150168-22150213)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (8-486)||(1147-1625)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (8-486)||(28160-28638)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (16-486)||(21474386-21474856)
chr6 (10-486)||(25770630-25771106)
chr6 (16-488)||(19455807-19456279)
chr6 (19-488)||(19437786-19438255)
chr6 (16-469)||(19465971-19466424)
chr6 (17-488)||(14376942-14377413)
chr6 (10-488)||(24515433-24515911)
chr6 (8-482)||(10465865-10466339)
chr6 (8-486)||(19486311-19486789)
chr6 (8-486)||(18797476-18797954)
chr6 (21-489)||(24367183-24367651)
chr6 (14-486)||(21567014-21567486)
chr6 (10-488)||(15462120-15462598)
chr6 (253-486)||(34642848-34643081)
chr6 (200-490)||(30678233-30678523)
chr6 (265-482)||(23081213-23081430)
chr6 (358-482)||(20010821-20010945)
chr6 (265-473)||(5836502-5836710)
chr6 (307-482)||(18405260-18405435)
chr6 (310-486)||(18182686-18182862)
chr6 (268-479)||(22436662-22436873)
chr6 (10-244)||(16813668-16813902)
chr6 (265-479)||(29589713-29589927)
chr6 (262-479)||(23085096-23085313)
chr6 (265-479)||(2872076-2872290)
chr6 (307-479)||(16574683-16574855)
chr6 (307-479)||(16620525-16620697)
chr6 (307-479)||(16924956-16925128)
chr6 (17-179)||(8720731-8720893)
chr6 (265-479)||(28312423-28312637)
chr6 (265-479)||(24293056-24293270)
chr6 (307-479)||(27559285-27559457)
chr6 (333-479)||(19867480-19867626)
chr6 (307-479)||(28260513-28260685)
chr6 (307-479)||(28285231-28285403)
chr6 (307-479)||(28339262-28339434)
chr6 (310-479)||(27190229-27190398)
chr6 (310-479)||(27258842-27259011)
chr6 (19-103)||(23081592-23081676)
chr6 (307-479)||(25115345-25115517)
chr6 (8-102)||(25958770-25958864)
chr6 (307-374)||(22829702-22829769)
chr6 (328-373)||(16379710-16379755)
chr6 (328-373)||(16647306-16647351)
chr6 (17-104)||(30678050-30678137)
chr6 (58-104)||(21764980-21765026)
chr6 (328-373)||(16100914-16100959)
chr6 (59-103)||(18405012-18405056)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (18-488)||(50054-50524)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (8-486)||(21742496-21742974)
chr1 (8-486)||(21738980-21739458)
chr1 (17-485)||(24096568-24097036)
chr1 (19-488)||(22015700-22016169)
chr1 (8-485)||(19857243-19857720)
chr1 (17-489)||(52988706-52989178)
chr1 (21-489)||(48425838-48426306)
chr1 (8-488)||(20832844-20833324)
chr1 (21-489)||(37680014-37680482)
chr1 (21-489)||(38909783-38910251)
chr1 (21-481)||(20074666-20075126)
chr1 (8-489)||(31536941-31537422)
chr1 (253-488)||(18710351-18710586)
chr1 (292-489)||(20297346-20297543)
chr1 (17-482)||(20853713-20854178)
chr1 (17-346)||(21961135-21961464)
chr1 (262-486)||(16379031-16379255)
chr1 (307-482)||(21751988-21752163)
chr1 (268-479)||(22496460-22496671)
chr1 (265-479)||(24785058-24785272)
chr1 (265-479)||(16347796-16348010)
chr1 (265-479)||(51330693-51330907)
chr1 (416-489)||(12200483-12200556)
chr1 (307-479)||(20081619-20081791)
chr1 (326-479)||(33388291-33388444)
chr1 (265-479)||(21833246-21833460)
chr1 (265-479)||(21842156-21842370)
chr1 (307-479)||(17042258-17042430)
chr1 (262-368)||(21045322-21045428)
chr1 (265-479)||(19109312-19109526)
chr1 (8-104)||(18273117-18273213)
chr1 (265-464)||(41350869-41351068)
chr1 (21-174)||(20297663-20297816)
chr1 (265-455)||(21228757-21228947)
chr1 (265-384)||(22401631-22401750)
chr1 (328-373)||(20828656-20828701)
chr1 (328-373)||(20928104-20928149)
chr1 (307-362)||(22435976-22436031)
chr1 (328-373)||(20528103-20528148)
[»] scaffold1056 (1 HSPs)
scaffold1056 (10-486)||(1672-2147)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (8-486)||(63394-63872)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (8-488)||(5130-5609)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (10-466)||(70079-70535)
scaffold0046 (319-486)||(60690-60857)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (17-488)||(42647-43118)
scaffold0102 (292-479)||(50504-50691)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (16-486)||(5553-6023)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (17-479)||(4188-4650)
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (8-488)||(12798363-12798840)
chr7 (8-486)||(19149923-19150401)
chr7 (8-486)||(20749322-20749800)
chr7 (11-486)||(14261108-14261583)
chr7 (19-488)||(15099473-15099942)
chr7 (8-485)||(16947331-16947808)
chr7 (17-488)||(13676361-13676832)
chr7 (8-486)||(14283233-14283711)
chr7 (21-490)||(21755320-21755789)
chr7 (21-489)||(26091670-26092138)
chr7 (21-489)||(26115462-26115930)
chr7 (14-486)||(11385294-11385766)
chr7 (21-489)||(40924689-40925157)
chr7 (8-482)||(12459544-12460018)
chr7 (17-486)||(12203668-12204137)
chr7 (28-489)||(49155210-49155671)
chr7 (21-489)||(13965540-13966008)
chr7 (8-485)||(13024258-13024734)
chr7 (8-485)||(18050812-18051289)
chr7 (253-486)||(14140591-14140824)
chr7 (262-486)||(15343343-15343567)
chr7 (200-477)||(15627444-15627721)
chr7 (265-479)||(15146061-15146275)
chr7 (265-479)||(44788489-44788703)
chr7 (307-479)||(14957472-14957644)
chr7 (265-479)||(8710523-8710737)
chr7 (265-479)||(11550240-11550454)
chr7 (265-479)||(14335314-14335528)
chr7 (307-482)||(14042610-14042785)
chr7 (307-482)||(14352640-14352815)
chr7 (265-479)||(11234351-11234565)
chr7 (265-479)||(13688959-13689173)
chr7 (265-479)||(18587309-18587523)
chr7 (265-482)||(18180658-18180875)
chr7 (307-479)||(9591282-9591454)
chr7 (265-479)||(15158195-15158409)
chr7 (265-479)||(17703593-17703807)
chr7 (189-282)||(15114317-15114410)
chr7 (8-182)||(14144877-14145051)
chr7 (265-479)||(12690420-12690633)
chr7 (418-479)||(8200966-8201027)
chr7 (14-180)||(12712528-12712694)
chr7 (265-384)||(16726579-16726698)
chr7 (425-479)||(10873608-10873662)
chr7 (328-373)||(4442951-4442996)
chr7 (328-373)||(7826924-7826969)
chr7 (328-373)||(13459057-13459102)
chr7 (328-373)||(27104975-27105020)
chr7 (328-373)||(27173305-27173350)
chr7 (302-333)||(12712816-12712847)
chr7 (328-373)||(14207343-14207388)
chr7 (328-373)||(14216033-14216078)
chr7 (337-373)||(38356-38392)
chr7 (8-104)||(9591657-9591753)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (85-486)||(12678-13079)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (8-485)||(19716429-19716906)
chr2 (19-488)||(23274144-23274613)
chr2 (39-489)||(20848139-20848588)
chr2 (14-486)||(23097436-23097908)
chr2 (8-485)||(12576907-12577384)
chr2 (8-381)||(19720992-19721365)
chr2 (193-486)||(23113276-23113568)
chr2 (8-281)||(28350633-28350906)
chr2 (307-479)||(11351422-11351594)
chr2 (292-479)||(21322962-21323149)
chr2 (307-482)||(22733485-22733660)
chr2 (268-479)||(22742638-22742849)
chr2 (307-482)||(23074420-23074595)
chr2 (265-479)||(9338142-9338356)
chr2 (265-479)||(9486776-9486990)
chr2 (265-479)||(16983800-16984014)
chr2 (265-479)||(17001560-17001774)
chr2 (265-479)||(24705151-24705365)
chr2 (262-488)||(24817506-24817732)
chr2 (265-482)||(23105397-23105614)
chr2 (307-479)||(23064973-23065145)
chr2 (265-479)||(22323011-22323225)
chr2 (265-479)||(24712594-24712808)
chr2 (265-479)||(44383239-44383453)
chr2 (268-479)||(24678047-24678258)
chr2 (292-479)||(45673708-45673895)
chr2 (265-479)||(10871410-10871624)
chr2 (265-479)||(27373829-27374043)
chr2 (310-479)||(27220576-27220745)
chr2 (268-479)||(23029133-23029344)
chr2 (10-210)||(21901366-21901566)
chr2 (265-479)||(24264930-24265144)
chr2 (265-479)||(24874419-24874633)
chr2 (254-384)||(30208578-30208708)
chr2 (307-479)||(24657369-24657541)
chr2 (326-479)||(21142771-21142924)
chr2 (292-384)||(19817502-19817594)
chr2 (307-479)||(23204874-23205046)
chr2 (305-373)||(22739363-22739431)
chr2 (304-373)||(22280771-22280840)
chr2 (307-374)||(23676583-23676650)
chr2 (58-104)||(11351173-11351219)
chr2 (58-104)||(22462943-22462989)
chr2 (328-373)||(25131275-25131320)
chr2 (418-479)||(41606209-41606269)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (8-488)||(6987-7467)
[»] scaffold1433 (1 HSPs)
scaffold1433 (10-488)||(1188-1666)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (10-488)||(7693-8171)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (96-486)||(11911-12301)
scaffold0165 (10-55)||(12326-12371)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (19-488)||(34286-34755)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (19-488)||(29573-30042)
scaffold0067 (8-486)||(64477-64955)
scaffold0067 (8-486)||(49055-49533)
scaffold0067 (8-486)||(58089-58567)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (8-489)||(39208-39689)
scaffold0010 (362-488)||(44656-44782)
scaffold0010 (200-482)||(4870-5152)
scaffold0010 (307-479)||(14382-14554)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (23-488)||(23563237-23563702)
chr5 (17-485)||(23077968-23078436)
chr5 (8-486)||(21983231-21983709)
chr5 (21-489)||(14884058-14884526)
chr5 (21-489)||(20345115-20345583)
chr5 (17-489)||(22505512-22505984)
chr5 (21-489)||(25850905-25851373)
chr5 (17-486)||(21561088-21561557)
chr5 (8-485)||(17266388-17266865)
chr5 (268-488)||(28892256-28892476)
chr5 (259-482)||(20778753-20778976)
chr5 (265-479)||(20824296-20824510)
chr5 (17-482)||(22464790-22465255)
chr5 (200-479)||(21631645-21631924)
chr5 (307-482)||(25429279-25429454)
chr5 (265-482)||(26736038-26736255)
chr5 (8-284)||(23669670-23669946)
chr5 (265-479)||(14997050-14997264)
chr5 (10-244)||(16258092-16258326)
chr5 (265-479)||(16359363-16359577)
chr5 (265-479)||(22330198-22330412)
chr5 (265-479)||(29473384-29473598)
chr5 (265-479)||(34569355-34569569)
chr5 (265-479)||(40711641-40711855)
chr5 (265-482)||(23474053-23474270)
chr5 (307-479)||(21882635-21882807)
chr5 (10-244)||(22591811-22592045)
chr5 (10-244)||(22595366-22595600)
chr5 (265-479)||(27521267-27521481)
chr5 (265-479)||(37288807-37289021)
chr5 (265-479)||(41773703-41773917)
chr5 (8-113)||(21870332-21870437)
chr5 (8-113)||(21874612-21874717)
chr5 (307-479)||(18781975-18782147)
chr5 (265-479)||(27613217-27613431)
chr5 (265-479)||(27682711-27682925)
chr5 (307-479)||(19772821-19772993)
chr5 (265-408)||(21332297-21332440)
chr5 (265-479)||(23460832-23461046)
chr5 (307-475)||(22350784-22350952)
chr5 (307-479)||(27665843-27666015)
chr5 (257-384)||(21410090-21410217)
chr5 (265-479)||(22137529-22137743)
chr5 (326-479)||(20803458-20803611)
chr5 (268-439)||(23525952-23526123)
chr5 (418-479)||(21342878-21342939)
chr5 (8-281)||(43122508-43122781)
chr5 (328-373)||(23508633-23508678)
chr5 (328-373)||(24584159-24584204)
chr5 (19-103)||(26735793-26735877)
chr5 (46-103)||(23526288-23526345)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (8-488)||(325656-326135)
scaffold0004 (17-491)||(200361-200826)
scaffold0004 (8-173)||(319507-319672)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (16-488)||(8563-9035)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (19-488)||(769-1238)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (16-488)||(5092-5564)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (10-372)||(51716-52078)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (19-484)||(701-1166)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (8-488)||(36888-37368)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (13-488)||(22071-22546)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (10-488)||(20763-21241)
scaffold0222 (8-482)||(362-836)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (10-488)||(1829-2307)
scaffold0034 (17-486)||(70323-70792)
scaffold0034 (8-179)||(11781-11952)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (43-486)||(3999-4442)
scaffold0585 (11-48)||(738-775)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (17-485)||(251574-252039)
scaffold0009 (307-374)||(230026-230093)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (19-488)||(5754-6223)
scaffold0035 (261-477)||(41236-41452)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (8-488)||(8337-8817)
scaffold0235 (8-488)||(18551-19031)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (17-488)||(9656-10127)
scaffold0243 (307-482)||(24119-24294)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (17-486)||(10928-11397)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (43-488)||(764-1209)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (17-489)||(514237-514709)
scaffold0001 (265-482)||(495975-496192)
scaffold0001 (265-488)||(441602-441824)
scaffold0001 (163-242)||(168131-168210)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (21-489)||(41683-42151)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (17-484)||(164285-164752)
scaffold0023 (265-482)||(47115-47331)
scaffold0023 (268-479)||(30709-30920)
scaffold0023 (418-482)||(152036-152100)
scaffold0023 (46-103)||(30487-30544)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (8-486)||(203332-203810)
scaffold0003 (307-479)||(424266-424438)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (21-489)||(409-877)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (8-486)||(263177-263655)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (17-486)||(30210-30679)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (8-485)||(53298-53775)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (253-489)||(11757-11993)
scaffold0443 (58-174)||(12060-12176)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (8-488)||(53996-54476)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (16-486)||(428-898)
scaffold0476 (307-479)||(10744-10916)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (8-485)||(5020-5497)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (51-486)||(11781-12214)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (8-445)||(8896-9333)
[»] scaffold0348 (2 HSPs)
scaffold0348 (13-482)||(17364-17833)
scaffold0348 (8-482)||(4724-5198)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (46-486)||(65211-65651)
scaffold0053 (8-311)||(62647-62950)
[»] scaffold1530 (2 HSPs)
scaffold1530 (253-488)||(532-767)
scaffold1530 (8-140)||(801-933)
[»] scaffold0765 (1 HSPs)
scaffold0765 (8-482)||(6132-6606)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (8-482)||(40013-40487)
scaffold0114 (262-482)||(17478-17698)
[»] scaffold0011 (7 HSPs)
scaffold0011 (253-488)||(151516-151751)
scaffold0011 (8-174)||(153755-153921)
scaffold0011 (265-482)||(23665-23882)
scaffold0011 (328-377)||(73792-73841)
scaffold0011 (328-377)||(78173-78222)
scaffold0011 (328-380)||(175708-175760)
scaffold0011 (328-373)||(182054-182099)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (17-486)||(3776-4242)
scaffold0130 (326-479)||(7972-8125)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (12-486)||(9666-10139)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (17-486)||(66992-67461)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (253-489)||(29882-30118)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (262-488)||(9356-9582)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (291-486)||(13-208)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (265-488)||(94026-94249)
scaffold0029 (14-491)||(115508-115985)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (291-488)||(15072-15269)
scaffold0074 (200-479)||(6071-6350)
scaffold0074 (19-182)||(15327-15490)
[»] scaffold0167 (2 HSPs)
scaffold0167 (304-488)||(1069-1253)
scaffold0167 (17-173)||(5317-5473)
[»] scaffold0523 (3 HSPs)
scaffold0523 (8-315)||(5562-5869)
scaffold0523 (310-486)||(2822-2998)
scaffold0523 (21-358)||(11631-11968)
[»] scaffold0261 (6 HSPs)
scaffold0261 (292-488)||(20687-20883)
scaffold0261 (292-488)||(12507-12703)
scaffold0261 (70-174)||(12349-12453)
scaffold0261 (70-174)||(20529-20633)
scaffold0261 (8-49)||(12289-12330)
scaffold0261 (8-49)||(20469-20510)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (8-313)||(16761-17066)
scaffold0266 (328-369)||(7057-7098)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (300-486)||(1-187)
[»] scaffold2062 (1 HSPs)
scaffold2062 (8-381)||(747-1125)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (14-410)||(1729-2125)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (320-488)||(110559-110727)
scaffold0031 (11-127)||(115934-116050)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (253-426)||(19089-19262)
[»] scaffold1517 (1 HSPs)
scaffold1517 (17-353)||(1371-1707)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (200-488)||(5037-5325)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (342-486)||(49086-49230)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (21-358)||(1495-1832)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (342-486)||(21802-21946)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (200-482)||(13546-13828)
[»] scaffold2165 (1 HSPs)
scaffold2165 (17-350)||(687-1020)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (200-482)||(216487-216769)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (200-482)||(15377-15647)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (19-293)||(170-444)
[»] scaffold0017 (4 HSPs)
scaffold0017 (19-181)||(4339-4501)
scaffold0017 (307-479)||(17240-17412)
scaffold0017 (292-479)||(194997-195184)
scaffold0017 (310-479)||(24264-24433)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (265-482)||(14398-14615)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (265-477)||(15111-15323)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (17-173)||(2895-3051)
scaffold0317 (253-314)||(2754-2815)
[»] scaffold0100 (3 HSPs)
scaffold0100 (200-364)||(16676-16840)
scaffold0100 (361-490)||(21413-21542)
scaffold0100 (17-103)||(16493-16579)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (271-482)||(4389-4600)
scaffold0621 (271-453)||(1-183)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (265-482)||(2395-2612)
[»] scaffold0270 (4 HSPs)
scaffold0270 (265-482)||(6828-7045)
scaffold0270 (265-482)||(13958-14175)
scaffold0270 (8-103)||(7207-7302)
scaffold0270 (8-103)||(14337-14432)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (265-482)||(55602-55819)
scaffold0075 (21-103)||(48064-48146)
scaffold0075 (21-103)||(55359-55441)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (262-482)||(8365-8585)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (200-488)||(26301-26589)
scaffold0042 (333-479)||(37020-37166)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (292-482)||(23457-23647)
scaffold0018 (262-488)||(9480-9706)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (292-477)||(1959-2144)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (265-482)||(57746-57963)
scaffold0077 (8-65)||(57489-57546)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (307-479)||(36456-36628)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (310-482)||(17833-18005)
scaffold0040 (220-482)||(110994-111256)
scaffold0040 (8-103)||(110782-110877)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (8-119)||(5777-5888)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (307-482)||(40681-40856)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (328-482)||(14039-14193)
scaffold0120 (307-408)||(11293-11394)
scaffold0120 (328-373)||(25242-25287)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (389-486)||(26063-26160)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (265-482)||(104182-104399)
scaffold0006 (10-102)||(104561-104653)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (307-479)||(10332-10504)
scaffold0550 (46-104)||(10071-10129)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (307-482)||(552-727)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (307-482)||(1944-2119)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (265-464)||(3524-3723)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (19-166)||(428-575)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (265-475)||(14873-15083)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (265-479)||(22205-22419)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (265-479)||(7194-7408)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (413-486)||(3450-3523)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (265-482)||(8178-8395)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (265-477)||(942-1154)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (307-479)||(29102-29274)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (220-479)||(41590-41849)
scaffold0022 (220-479)||(75310-75569)
scaffold0022 (333-479)||(34915-35061)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (307-482)||(11054-11229)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (200-387)||(11078-11265)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (307-482)||(7913-8088)
scaffold0207 (21-103)||(4443-4525)
[»] scaffold0609 (2 HSPs)
scaffold0609 (8-281)||(1095-1368)
scaffold0609 (8-83)||(7911-7986)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (21-174)||(23811-23964)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (265-482)||(11424-11641)
scaffold0028 (309-482)||(17892-18065)
scaffold0028 (265-383)||(55058-55176)
scaffold0028 (445-482)||(53682-53719)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (268-476)||(1-209)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (265-482)||(8905-9119)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (308-479)||(31841-32012)
scaffold0080 (307-482)||(54592-54767)
scaffold0080 (308-479)||(37307-37478)
scaffold0080 (307-479)||(10412-10584)
scaffold0080 (307-479)||(13067-13239)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (265-479)||(10326-10540)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (265-479)||(3382-3596)
scaffold0044 (307-479)||(17118-17290)
scaffold0044 (58-104)||(17493-17539)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (329-482)||(4538-4691)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (337-482)||(24916-25061)
scaffold0218 (328-373)||(1147-1192)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (17-98)||(33256-33337)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (389-463)||(1185-1259)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (265-479)||(18608-18822)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (265-475)||(21566-21776)
scaffold0081 (265-475)||(36990-37200)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (266-479)||(8216-8429)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (307-479)||(1206-1378)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (307-479)||(13298-13470)
scaffold0109 (265-479)||(41113-41327)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (214-353)||(1364-1503)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (189-283)||(1079-1173)
[»] scaffold2059 (2 HSPs)
scaffold2059 (307-479)||(943-1115)
scaffold2059 (22-104)||(658-740)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (310-479)||(99-268)
[»] scaffold0177 (3 HSPs)
scaffold0177 (310-475)||(11533-11698)
scaffold0177 (46-104)||(11269-11327)
scaffold0177 (46-104)||(14954-15012)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (327-479)||(674-826)
[»] scaffold1845 (1 HSPs)
scaffold1845 (17-109)||(1188-1280)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (8-80)||(3222-3294)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (265-384)||(15711-15830)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (307-383)||(48719-48795)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (307-377)||(2924-2994)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (422-479)||(12621-12678)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (304-373)||(13502-13571)
scaffold0467 (328-373)||(816-861)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (418-482)||(3556-3620)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (20-104)||(36161-36245)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (17-128)||(30897-31008)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (189-280)||(25629-25720)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (202-284)||(5068-5150)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (328-373)||(5499-5544)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (328-373)||(26460-26505)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (328-373)||(35149-35194)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (328-373)||(24027-24072)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (328-373)||(8221-8266)
scaffold0021 (328-373)||(90566-90611)
scaffold0021 (328-373)||(21071-21116)
scaffold0021 (328-373)||(30647-30692)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (328-380)||(3556-3608)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (19-65)||(1750-1796)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (19-65)||(4614-4660)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (58-104)||(121-167)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (328-373)||(2635-2680)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (47-104)||(447-504)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (328-373)||(4097-4142)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (328-373)||(5000-5045)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (326-367)||(171188-171229)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 22374330 - 22373857
Alignment:
Q  13 agactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgacc 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374330 agacttaatgaggagaggaggcctaggaggagagattctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgacc 22374231  T
Q  113 gtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtct 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||     
T  22374230 gtgatgaaaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtca 22374131  T
Q  213 tattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcaga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22374130 tattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacccaaactgttaatgaggaccgacttatcaga 22374031  T
Q  313 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttag 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||||| |||    
T  22374030 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatagtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctag 22373931  T
Q  413 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22373930 ttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 22373857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 21 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19985633 - 19985168
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985633 tgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggcgaaaaaagccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 19985534  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||| |||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  19985533 aagaagtatttcagatgtggacagaaatgacacacattagctgattgcaagagtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggggcatattagct 19985434  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | ||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19985433 cacagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcattgactagtacgcagactgtgaataaggaccgacttatcagaggtacttg 19985334  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  19985333 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtttggttatatct 19985234  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19985233 gatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 19985168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21928892 - 21928416
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||    
T  21928892 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagattctttgtttcaagtgtggcgaaaagggccacgagagtaatgtaagtg 21928793  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  21928792 accgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacactttgggtgattgcaagcgtggtgatgtcgtttgctataattgtgatgaagaggg 21928693  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     | ||||||||| || |||| |||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21928692 gcatattagctcacaatgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactagtaagcaaactgtgaatgaagaccgacttatc 21928593  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||     
T  21928592 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 21928493  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21928492 tggttatatctgatatgaatggcgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 21928416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 31413847 - 31414324
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||    
T  31413847 agcagagaatgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccataagagcaatgcttg 31413946  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||  |  ||| ||| || ||  | ||||||    
T  31413947 tggtagagatgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaa 31414046  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || || ||||| |   || | |||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||    
T  31414047 ggtcatatcagttcacagtgtactcagtcgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtatgcagactactaatgaggaccgactta 31414146  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31414147 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctaatgaatgtgcttataagttggg 31414246  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31414247 tttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 31414324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 22027595 - 22028073
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  22027595 agcaaagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgataaaggccacaagagtaatgtttg 22027694  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| |  | || ||  ||| |||||| |   |||||||     
T  22027695 taccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgtaagaggggagacgttgtttgctataactacaatgaagag 22027794  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || || |||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  22027795 ggccatatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgaccggtacgcagactactaatgaggaccgactta 22027894  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22027895 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttggg 22027994  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22027995 tttggttttatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 22028073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 16268552 - 16269020
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     ||||||    
T  16268552 tgatgacaggaggcctaagaagagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgag 16268651  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || || |   ||||||| ||||||||| | ||| |  | | ||| |||||  ||| ||| |||| ||| || |    
T  16268652 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcatagcctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagtt 16268751  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||||||  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16268752 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 16268851  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  16268852 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 16268951  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16268952 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgcttgtctg 16269020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 8 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 22054329 - 22053847
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||  |||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  22054329 agcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgcttctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 22054230  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||   ||||| |||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | |||||     
T  22054229 taccaaggatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagag 22054130  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| ||  | |||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  22054129 ggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggatagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtctta 22054030  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||    
T  22054029 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttggg 22053930  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 490  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22053929 tctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 22053847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20391543 - 20391074
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| |   |  ||||    
T  20391543 tgaatgatgagaggagacctaagagtagagatgttccttctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttccaatggtga 20391444  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||| ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  |||| || ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| |||||||||| | ||    
T  20391443 tgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatactatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctt 20391344  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391343 agttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggta 20391244  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||| | ||| |    
T  20391243 cttgtttctttaatagtactcctttaatttctattattgatactggtgctacacattgattcattgctgttaattgtgaatataagttgggtctggttat 20391144  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     ||   ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20391143 gtcaagtattagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 20391074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28984364 - 28983896
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  28984364 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagttgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 28984265  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  28984264 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 28984165  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28984164 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 28984065  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  28984064 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatct 28983965  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28983964 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 28983896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 17 - 490
Target Start/End: Original strand, 29300750 - 29301223
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| |||||| |||   ||| ||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||  ||||   | ||    
T  29300750 tgaatgatgataggaggcccaagaggggagatgttcccgctgaaattgtttgttttaagtgtggtgaaagaggccacaagagcaatgcttgtggtagaga 29300849  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| || |||||| | ||  |  | | |||||| ||  |||||||||||| |||     
T  29300850 tgaaaggaagtgttttaggtgtggtcagagaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctactataactgcaatgaagaaggtcatatc 29300949  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || ||||| |   |||| |||||||||   |  ||||| || |||||| | ||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29300950 agttctcagtgtactcagccgaagaaggctaggatcggtgggaaagtgttttcattgacgggtacgcagactacaaatgaggaccgacttatcagaggta 29301049  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  29301050 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgt 29301149  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29301150 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 29301223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 253 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28989351 - 28989115
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28989351 ggtggaaaggtgtttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 28989252  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28989251 ttgatactggtgctactcactgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgatactcc 28989152  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28989151 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 28989115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 345 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 27357665 - 27357521
Alignment:
Q  345 tgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgtt 444  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27357665 tgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgtt 27357566  T
Q  445 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27357565 gaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 27357521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 22421506 - 22421681
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22421506 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgg 22421605  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22421606 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22421681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Original strand, 22245522 - 22245804
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | || || |||| ||| ||||||||| ||| |||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22245522 atgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcaaactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgagga 22245621  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  22245622 tcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttct 22245721  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22245722 aagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22245804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Original strand, 22245940 - 22246222
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | || || |||| ||| ||||||||| ||| |||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22245940 atgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcaaactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgagga 22246039  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||  ||||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  22246040 tcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttct 22246139  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22246140 aagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggatagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22246222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 269 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19981172 - 19980962
Alignment:
Q  269 ctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 368  Q
    ||||||||||||| || || |  |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19981172 ctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 19981073  T
Q  369 tcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagta 468  Q
     |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  19981072 gcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtg 19980973  T
Q  469 actacttctct 479  Q
    |||||||||||    
T  19980972 actacttctct 19980962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21254154 - 21253937
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21254154 tttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 21254055  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| ||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21254054 ctacgcattattttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21253955  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  21253954 ggtgactacttctcttgt 21253937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 329 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22523691 - 22523538
Alignment:
Q  329 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  |||||||    
T  22523691 atagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaa 22523592  T
Q  429 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22523591 tggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 22523538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 310 - 478
Target Start/End: Original strand, 22375071 - 22375239
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||     
T  22375071 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgatattgattgtgcttctaagttgggtc 22375170  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctc 478  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  22375171 ttgctatgtcgaatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctc 22375239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 482
Target Start/End: Original strand, 21391392 - 21391650
Alignment:
Q  224 agtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgttt 323  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||   ||| | ||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |     
T  21391392 agtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgcta 21391491  T
Q  324 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgat 423  Q
      || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||    
T  21391492 tattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgat 21391591  T
Q  424 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21391592 atgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21391650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 224 - 482
Target Start/End: Original strand, 21780718 - 21780976
Alignment:
Q  224 agtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgttt 323  Q
    |||||| ||||||||||||||| |  ||   ||| | ||| ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |     
T  21780718 agtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgcta 21780817  T
Q  324 ctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgat 423  Q
      || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||    
T  21780818 tattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgat 21780917  T
Q  424 atgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21780918 atgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21780976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22990254 - 22990037
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  22990254 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgatactagtg 22990155  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||  |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22990154 ctaaacattgttttattgctattgattgtgcttcaaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagggttc 22990055  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  22990054 ggtgactacttctcttgt 22990037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Original strand, 21164113 - 21164324
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   || ||  |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  21164113 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgatactgatgcta 21164212  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| | || ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21164213 cgcattgttttattgctttcaattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagt 21164312  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  21164313 gactacttctct 21164324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 17671594 - 17671808
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17671594 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 17671693  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17671694 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17671793  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  17671794 ggtgactacttctct 17671808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 337 - 482
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786144
Alignment:
Q  337 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 436  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 21786098  T
Q  437 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  21786099 tggttgttgaaactccagctaagggttcggtgaccacttctcttgt 21786144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19115609 - 19115395
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19115609 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 19115510  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19115509 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttc 19115410  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
    ||| |||||||||||    
T  19115409 agtgactacttctct 19115395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 20015835 - 20016049
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20015835 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 20015934  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20015935 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 20016034  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  20016035 ggtgactacttctct 20016049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 22126531 - 22126745
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22126531 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22126630  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22126631 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22126730  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || | |||||||||    
T  22126731 ggtgattacttctct 22126745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 32603312 - 32603140
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  32603312 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 32603213  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32603212 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 32603140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 22117747 - 22117961
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| |   | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22117747 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22117846  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  |  ||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22117847 ctacgcattgttttattgctttcgatcgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22117946  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  22117947 ggtgactacttctct 22117961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Original strand, 6606784 - 6607057
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  6606784 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 6606883  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| || || ||  ||||||| ||||||||| | ||| |  ||| ||  |||||||||||||||    
T  6606884 caatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggggatattgtttgcttcaattgtgatgaagaa 6606983  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 281  Q
    || | | | || || ||||| |   |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6606984 ggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttagctggtac 6607057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18859744 - 18859572
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18859744 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18859645  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18859644 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18859572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22031270 - 22031098
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22031270 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22031171  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  22031170 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctct 22031098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22042994 - 22042822
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || || | |||| || |   ||||    
T  22042994 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttatttcttttgattgtgtttctgctttgg 22042895  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22042894 gtcttgatttttctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 30310758 - 30310930
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  30310758 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 30310857  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30310858 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttcggtgactacttctct 30310930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 464
Target Start/End: Original strand, 19481644 - 19481843
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19481644 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 19481743  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19481744 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19481843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15536550 - 15536378
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | | || || |   ||||    
T  15536550 atcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattatgtttctgccttgg 15536451  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15536450 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 15536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 22129231 - 22129403
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  22129231 atcagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtgttacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 22129330  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22129331 gtcttgatttgtctgatatgaatggacagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 22129403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 284
Target Start/End: Original strand, 21982451 - 21982533
Alignment:
Q  202 gaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21982451 gaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcccagactggtgtgaaggtttttgctttgactggtacgca 21982533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 284
Target Start/End: Original strand, 21998937 - 21999019
Alignment:
Q  202 gaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21998937 gaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcccagactggtgtgaaggtttttgctttgactggtacgca 21999019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21329856 - 21329761
Alignment:
Q  189 ctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  21329856 ctataactgtaaggaagaaggtcatattagttcgtagtgcaagaagcctaataaggcccagactggtgggaaggtttttgctttgactagtacgca 21329761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 20649990 - 20650035
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20649990 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20650035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 22523965 - 22523919
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgt 65  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  22523965 aatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgt 22523919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 103
Target Start/End: Original strand, 21163883 - 21163940
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21163883 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggcgagaaagaccacaagagcaatg 21163940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 21847972 - 21848017
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21847972 aatagtactcttttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 21848017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22990508 - 22990451
Alignment:
Q  11 agagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctg 68  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||    
T  22990508 agagaatgattgatgagaggcggcctaggaagaaagacgctcctgttgagattgtctg 22990451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 176414 - 175939
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  176414 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctacagagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtg 176315  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  176314 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaagg 176215  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  176214 tcatattagctcgcagtgcaggaagctttagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaataaagaccgacttatc 176115  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||     
T  176114 agaggtacttatttcttt-atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 176016  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  176015 tggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgt 175939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 98469 - 98938
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||      ||||    
T  98469 aatgatgagaggaggcccaagtggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatg 98568  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | ||||| || | ||| ||    
T  98569 agaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagggccatatcag 98668  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     ||||||||||   |||| ||||||| |   || ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||   || ||||||||||||||||| |||||||    
T  98669 ttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacacaaaccactagtgaggaccgacttatcaaaggtact 98768  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  98769 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattactattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtat 98868  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  98869 ctaatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 98938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15073757 - 15073285
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15073757 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtg 15073658  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  15073657 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagctttgtgatgttgtttgctataattgtgatgaagaagg 15073558  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15073557 tcatataagctcacagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgttttctttgactggtacacaaactgttaatgaggaccgacttatc 15073458  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| |     
T  15073457 agaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcacataagttggctc 15073358  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15073357 tggttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 15073285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Original strand, 14993239 - 14993719
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  14993239 agcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 14993338  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||  ||| ||| || ||  |||| |||    
T  14993339 tgaccgtgagaagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcatggggatgttgtttgctacaactgcaatgaggaa 14993438  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| | | | |||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14993439 ggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgaatggtacgcaaacagtgaatgaggaccgactta 14993538  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  14993539 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctcttcattatttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 14993638  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14993639 tctagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcactaactacttctcttgtttgtct 14993719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 16151027 - 16150556
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||      ||    
T  16151027 tgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaga 16150928  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| || | ||||    
T  16150927 tgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatatt 16150828  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||   || |||||| |||||||||||| |||    
T  16150827 agctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgta 16150728  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16150727 cttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgt 16150628  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16150627 ttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 16150556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 16155173 - 16154702
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| || |  |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||      ||    
T  16155173 tgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaga 16155074  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| || | ||||    
T  16155073 tgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgtgatgaagaggggcatatt 16154974  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||| | ||   || |||||| |||||||||||| |||    
T  16154973 agctcgcaatgcaagaaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgtagaccactagtgaggatcgacttatcagatgta 16154874  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16154873 cttgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttgt 16154774  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16154773 gtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 16154702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20893422 - 20892953
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||   | ||    
T  20893422 tgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggcaacaagagcaatgtttgtggtagaga 20893323  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | ||| |  | | ||| || ||  ||||||| || | |||     
T  20893322 tgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctactacaactgcaatgaagaggggcatatc 20893223  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||| |   |||| ||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  20893222 agttcgcagtgtactgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggta 20893123  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||    
T  20893122 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgt 20893023  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20893022 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20892953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 23 - 489
Target Start/End: Original strand, 44658753 - 44659219
Alignment:
Q  23 atgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaa 122  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | ||||| |     
T  44658753 atgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgatag 44658852  T
Q  123 gaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcg 222  Q
    |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||| |  | |  || |||||  ||| |||| ||| |||||| ||     
T  44658853 gaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgttacaattgcaatggagaatgtcatattagttca 44658952  T
Q  223 cagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgt 321  Q
    ||||| |  ||| || |||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658953 cagtgtcctgaa-ccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgaatggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgt 44659051  T
Q  322 ttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctg 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  44659052 ttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctg 44659151  T
Q  422 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44659152 atatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 44659219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 3261679 - 3262147
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  3261679 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 3261778  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  3261779 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 3261878  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3261879 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 3261978  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3261979 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 3262078  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3262079 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 3262147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 29450422 - 29450890
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  29450422 tgatgataggaggcctaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaggagatgat 29450521  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  |||||||  || || |    
T  29450522 aggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcacatcagtt 29450621  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29450622 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 29450721  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  29450722 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 29450821  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29450822 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 29450890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 11204113 - 11204585
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||   | ||    
T  11204113 tgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagaga 11204212  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||| |  || || || |||||||| ||||| || ||||   ||||| | ||||||||| | ||| |  | | ||| |||||  ||| ||| |||| |||     
T  11204213 tgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagcttaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatc 11204312  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || |||||     |||| || ||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  11204313 agttcacagtgtcctgagccgaaaaaggctagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcanactaccaatgaggaccgacttatcagaggta 11204412  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||    
T  11204413 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttaggtttggatgt 11204512  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11204513 atctggtatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 11204585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 51603664 - 51604141
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  51603664 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 51603763  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | | |||||||||| |||||||     
T  51603764 taccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtgtgctataattgtaatgaagag 51603863  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || ||  | |||||||   |||| ||||||| |  |   ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |    
T  51603864 ggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctca 51603963  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  51603964 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactggg 51604063  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51604064 tttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 51604141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 481
Target Start/End: Original strand, 53750342 - 53750815
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  53750342 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 53750441  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | | |||||||||| |||||||     
T  53750442 taccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagag 53750541  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || ||  | |||||||   |||| ||||||| |  |   ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |    
T  53750542 ggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctca 53750641  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  53750642 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactggg 53750741  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 481  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53750742 tttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttg 53750815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 15267165 - 15266736
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   | ||||| || |||||||||| ||| || | ||| ||||||||||| |||||| | ||||    
T  15267165 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctacgaatattgtttgcttcaagtgtgatgagaagggccataagagtaatgtttgtgacagagatg 15267066  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| | | ||  |  ||| |||||| ||  | |||||||||| ||| ||    
T  15267065 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcatggagacattgtttgctataactgcaacgaagaaggtcatatcag 15266966  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     ||| |||| | | |||| ||||||| |   || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   || ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  15266965 ttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttaaccagtacgcaaacaactagtgaagacagacttatcagaggtagt 15266866  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| | |||||||    
T  15266865 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgatgttgattgtgcttataagttgggtctggttgtat 15266766  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266765 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaa 15266736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 27903776 - 27903307
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||   |   ||    
T  27903776 tgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgcaccaaaga 27903677  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||    || ||||| ||||||||| | ||| |  |||  ||||| ||| |||| || ||    |||    
T  27903676 tgagaagaagtgtttcagatgtggtcagaaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggcaacatt 27903577  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || ||||||| | | ||||||||||    |||  | || || || |||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  27903576 agttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgaggaaaagtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggta 27903477  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  || |    
T  27903476 catgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattat 27903377  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27903376 atctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgt 27903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 7357654 - 7357280
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| | ||     ||||||    
T  7357654 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagagtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttatggtaaagatgag 7357555  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| |||||| |    
T  7357554 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgcaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagtt 7357455  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||||||  |||  |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7357454 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactagtgggaaggtgtttgcattgactggtacacagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 7357355  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7357354 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgc 7357280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14697309 - 14697027
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | || || |||| ||| ||||||||| |||  ||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  14697309 atgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcagactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgagga 14697210  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||  | || | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  14697209 tcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgcttct 14697110  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14697109 aagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14697027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14162613 - 14162396
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||  || ||||| || || |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  14162613 tttgcattgacgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtg 14162514  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||| |||| |||||| || | ||||||| |||||||| | | | | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14162513 ctacgcatagttttattgctcttgattgtgcttctaagttggatcttgctatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14162414  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     |||||||||||||||||    
T  14162413 ggtaactacttctcttgt 14162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 15904 - 16121
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15904 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 16003  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16004 ctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16103  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  16104 ggtgactacttctcttgt 16121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 397 - 488
Target Start/End: Original strand, 15354301 - 15354392
Alignment:
Q  397 tataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15354301 tataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctacgggttcagtaactacttctcttgtttgtct 15354392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18259830 - 18259675
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| | | ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  18259830 aatgatgagaggaggcccaagaggacagatgctcctactaatattgtttgctttaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatg 18259731  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgt 174  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  18259730 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgtaagcgt 18259675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 17092018 - 17092232
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17092018 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 17092117  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17092118 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17092217  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  17092218 ggtgactacttctct 17092232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 8050492 - 8050706
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8050492 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8050591  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8050592 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8050691  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  8050692 ggtgactacttctct 8050706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12479743 - 12479529
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12479743 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 12479644  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12479643 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 12479544  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  12479543 ggtgactacttctct 12479529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 14300848 - 14301062
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14300848 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14300947  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14300948 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14301047  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  14301048 ggtgactacttctct 14301062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19635279 - 19635065
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19635279 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 19635180  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19635179 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19635080  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  19635079 ggtgactacttctct 19635065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14683668 - 14683496
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14683668 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14683569  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14683568 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14683496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 16233903 - 16234075
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16233903 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16234002  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16234003 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16234075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23958848 - 23958676
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  23958848 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 23958749  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23958748 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23958676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8389555 - 8389344
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8389555 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8389456  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8389455 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8389356  T
Q  465 agtaactacttc 476  Q
     || ||||||||    
T  8389355 ggtgactacttc 8389344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 13879511 - 13879236
Alignment:
Q  6 gtagcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgta 105  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  13879511 gtagcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgtttctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgta 13879412  T
Q  106 tgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaag 205  Q
    ||  |   ||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| || || ||  ||||||| ||||||||| || || |  ||| ||  |||||||| ||||    
T  13879411 tgcaatgatgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaagggccatacgatagctgaatgcaagcgtggtcatattgtttgcttcaattgtgacgaag 13879312  T
Q  206 aaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 281  Q
    |||||| | | || || ||||| | ||||||||||||| ||| | || |||| | ||||||||||||  |||||||    
T  13879311 aaggtcatctcagttcacagtgtaagaagcctaagaagactcaagcaagtggaagggtgtttgctttagctggtac 13879236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 16350423 - 16350637
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||| ||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  16350423 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 16350522  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||  |||||||| |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16350523 ctatgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16350622  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  16350623 ggtgactacttctct 16350637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27714479 - 27714265
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27714479 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27714380  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27714379 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 27714280  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  27714279 ggtgactacttctct 27714265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40476183 - 40475969
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40476183 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 40476084  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  40476083 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtggtcgaaactccagctaagggttc 40475984  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  40475983 ggtgactacttctct 40475969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 19775704 - 19775876
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19775704 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19775803  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19775804 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19775876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8709077 - 8708838
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  8709077 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaatagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 8708978  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  ||||||| |||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  |||| || ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  8708977 caatggtgatgaaaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaa 8708878  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctc 247  Q
    || | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8708877 ggccatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctc 8708838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 479
Target Start/End: Original strand, 15144829 - 15144975
Alignment:
Q  333 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 432  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  15144829 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 15144928  T
Q  433 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  15144929 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctct 15144975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 351
Target Start/End: Original strand, 15354234 - 15354291
Alignment:
Q  294 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatt 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15354234 tgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgatatt 15354291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 326 - 479
Target Start/End: Original strand, 18224376 - 18224529
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  18224376 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 18224475  T
Q  426 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18224476 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 18224529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 307 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13513451 - 13513285
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  13513451 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 13513352  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactac 473  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  13513351 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactac 13513285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16219331 - 16219188
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||  | || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16219331 tttgctttgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtg 16219232  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 408  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16219231 ctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 16219188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16222651 - 16222508
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||  | || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  16222651 tttgctttgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtg 16222552  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 408  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  16222551 ctacacactgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 16222508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 479
Target Start/End: Original strand, 16250872 - 16250933
Alignment:
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16250872 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16250933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 444 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 15258891 - 15258847
Alignment:
Q  444 tgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15258891 tgaaactccagctaagagttcagtaactacttctcttgtttgtct 15258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14999726 - 14999681
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14999726 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 14999681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 374
Target Start/End: Original strand, 18604733 - 18604797
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 374  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18604733 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 18604797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Original strand, 15661 - 15743
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15661 tgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 15743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 430 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14188484 - 14188435
Alignment:
Q  430 ggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  14188484 ggagagatggttgtcgaaactccagctaaaggttcggttactacttctct 14188435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 15290350 - 15290395
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15290350 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 15290395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13513750 - 13513654
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    |||||||| ||  |||||| ||| |||||| || ||  |||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  13513750 agcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgt 13513654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 373
Target Start/End: Original strand, 18546820 - 18546856
Alignment:
Q  337 cctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18546820 cctttaattgctattatagatactggagctacgcatt 18546856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 29956 - 29478
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  29956 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagatagtctatttcaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttg 29857  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    | ||| ||||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  29856 taaccatgatgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacacaatagctgagtgcaagcgtggtgatgttgtttgctacaattgtgatgaagaa 29757  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29756 ggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctctgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 29657  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||| |||||||||||    
T  29656 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgcagttgattgtgcatataagttggg 29557  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29556 tctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcacttgtttgt 29478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Original strand, 43296 - 43772
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  43296 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctaatgagattgtctgtttcaagtgtcgtgaaaagggccacaagagtaatgtgtgtg 43395  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| |||||||||||||||||| ||    
T  43396 atcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctataattgtgatgaagaggg 43495  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43496 tcatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatc 43595  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||     
T  43596 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtc 43695  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43696 tggttatgtctgatatgaatggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 43772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Original strand, 14290634 - 14291110
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  14290634 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtg 14290733  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  14290734 attgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttatttgctataattgtgatgaagaggg 14290833  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14290834 acatattagctcgcagtgcaagaagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccgtgaatgaggaccgacttatc 14290933  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||     
T  14290934 agaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 14291033  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291034 tggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 14291110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Original strand, 12857602 - 12858073
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |    
T  12857602 gactgaatgatgagaggaggcctaaaaggagagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaagggccacatgagtaatgtatgtgactg 12857701  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctt 213  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  12857702 tgatgagaagaagtgtttccgatgtggaaagaaaggacacataatagctgagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcat 12857801  T
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12857802 attagctcgtagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga-cgacttatcagag 12857900  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |    ||||| |||||||||| | | ||    
T  12857901 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctagttattgtttcattgctgtggtttgtgcatataagttggttctggt 12858000  T
Q  414 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12858001 tatatctgatatgaatggagaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 12858073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 488
Target Start/End: Original strand, 16825382 - 16825861
Alignment:
Q  11 agagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtga 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16825382 agagattgaaagatgagaggaggcccaagatgagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtga 16825481  T
Q  111 ccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggt 210  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||  |  ||| ||| || |   |||| ||||||    
T  16825482 ccgtgatgagaagaagtgcttcaggtgtggtaaaaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggacattgtttgctacaacttcaatgaggaaggt 16825581  T
Q  211 cttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatca 310  Q
    | ||| || | |||||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  16825582 catatcagtttgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggactgacttatca 16825681  T
Q  311 gaggtacttgtttctttaata--gtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 408  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||    
T  16825682 gaggtacttgtttctttaatatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggt 16825781  T
Q  409 ttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
     | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825782 ctggttgtatctgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 16825861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 488
Target Start/End: Original strand, 12357630 - 12358107
Alignment:
Q  11 agagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtga 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  12357630 agaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatactcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtga 12357729  T
Q  111 ccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggt 210  Q
        |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||  ||| |||||| ||  |||| ||||||    
T  12357730 taaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaaggt 12357829  T
Q  211 cttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatca 310  Q
    | ||| || |||||||| |   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||    
T  12357830 catatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatca 12357929  T
Q  311 gaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  12357930 gaggtacttgtttctttaatagtacacctttaattgctattatagacactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtct 12358029  T
Q  411 agttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358030 ggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12358107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Original strand, 18131449 - 18131926
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||    
T  18131449 cagagactgaataatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgattgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtg 18131548  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||  | | |||||| ||  |||| ||| |    
T  18131549 ataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacgcattagctaattgtaagcgtggggatgtagtgtgctataactgcaatgaggaaag 18131648  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || |||||| |||||||| |   | |  ||||||| |  ||| ||||| || |||||| || ||||||||||||||||   || |||||| |||||||||    
T  18131649 tcatattagttcgcagtgtactcaactgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttactctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatc 18131748  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  18131749 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagac-ctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 18131847  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18131848 tggttgtatctgatatgaaaggggaaacggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 18131926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 31941923 - 31941452
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||  |   ||    
T  31941923 tgaatgatgagaggaggcccaataggagaaatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaaga 31941824  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||  |||  ||||||||  |||| || || | |||     
T  31941823 tgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgactgcaagcgtggtgatgttgtttgttataattgcaatgaggagggccatatc 31941724  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||  |||| | | |||| ||||||| |   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  31941723 agttcatagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggta 31941624  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  31941623 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactcattttttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgt 31941524  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  31941523 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtctagtaactacttctcttgtgtgtct 31941452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 17494664 - 17494195
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  17494664 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcatactgagattgtttgcttcaaatgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatg 17494565  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| || | ||  |  ||| |||||| ||  | || ||||||| ||||||    
T  17494564 agaagaagtgctc-aggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagtgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatattag 17494466  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     |||||||| |   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||   |||||||||||||||    
T  17494465 ttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccattagtgaggacatgcttatcagaggtact 17494366  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  17494365 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataaattgggtctggttgtat 17494266  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttg-aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17494265 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaaactccagctaagggttcagtaactaattctcttgtttgtct 17494195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Original strand, 31692294 - 31692765
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||  |||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  |   ||    
T  31692294 tgaatgatgagaggaggcccaataggagaaatgcttctgctgagatcgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaaga 31692393  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| |||||| || |||||||  |||  ||||| ||  |||| || || | |||     
T  31692394 tgagaagaagtgtttcaggtgtggttagaagggacacactctagctgactgcaagagtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaggagggccatatc 31692493  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || ||||| | | |||| ||||||| |   || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  31692494 agttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggta 31692593  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||    
T  31692594 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagtcgggtctggttgt 31692693  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31692694 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 31692765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 12181362 - 12180894
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||||    
T  12181362 aatgatgagaggaggaccaagaggagagatgctcctactgacattttttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaaagtctgtgatagagatg 12181263  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || || ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | | ||  |  |||  ||||||||  |  | ||||||| ||| ||    
T  12181262 agaagaagtgcttcagttgtggtcggaaaggacacacactagctgattgtaagcttggggacattgtttgttataattgcaacaaggaaggtcatatcag 12181163  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     ||| |||| | | | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  12181162 ttcgtagtgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgtaaaccactagtgaggaccgacttatcagaggtact 12181063  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  12181062 tgtttctttaatagtactcctttagttgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctgtttgtat 12180963  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtc 487  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12180962 ctaatatgaaaggagaaatggttgttgacactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtc 12180894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 21 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 28757335 - 28756868
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  28757335 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 28757236  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || |||||  ||| |||||||| |||||| |    
T  28757235 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtt 28757136  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28757135 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 28757036  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  28757035 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 28756936  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28756935 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtct 28756868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 16831628 - 16832106
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  16831628 agcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 16831727  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||   ||||| || ||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | |||||     
T  16831728 taccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgttagcggactgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagag 16831827  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| ||  | |||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  16831828 ggccatatcagtacacagtgcacacagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtctta 16831927  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||    
T  16831928 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttggg 16832027  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16832028 tttgattgtatctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 16832106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 10 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35983208 - 35982839
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  35983208 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgtgattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtg 35983109  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| |||| |||||    
T  35983108 accgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaagg 35983009  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     | |||||| ||||| || | | |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35983008 acatattagttcgcattgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactgttacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatc 35982909  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttca 379  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35982908 agagatacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtactactcattgtttca 35982839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15230621 - 15230154
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  15230621 aatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatg 15230522  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||| ||||||||  | |||||  ||||||| || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  15230521 agaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttag 15230422  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  15230421 ctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtact 15230322  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||| | ||| | |    
T  15230321 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgt 15230222  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15230221 caagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgt 15230154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15236489 - 15236022
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |  ||||||    
T  15236489 aatgatgagaggaggcctaagagaaaagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatg 15236390  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||| ||||||||  | |||||  ||||||| || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||    
T  15236389 agaaaaagtgtttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttag 15236290  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  || |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  15236289 ctcgcaatgcaggaagcctaagaaggatcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacggacggttaatgaggattgacttatcataggtact 15236190  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || | | ||| |||||||||||| | ||| | |    
T  15236189 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctgttgattttgcatataagttgggtctggttatgt 15236090  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15236089 caagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtttgt 15236022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 47126960 - 47126492
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  47126960 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 47126861  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  47126860 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 47126761  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47126760 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaacgaggaccgacttatcagaggtacttg 47126661  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  47126660 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatct 47126561  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47126560 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 47126492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Original strand, 16326816 - 16327287
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagaga-tgctcctattgaga-ttgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgt 114  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||| |||||||  ||||| |||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   |     
T  16326816 tgaatgatgataggagacccaagaggagagactgctcctgctgagacttgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaga 16326915  T
Q  115 gatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctta 214  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| ||    
T  16326916 gatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaagggacacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcata 16327015  T
Q  215 ttagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagagg 314  Q
    | || |||||||| |  ||||| ||||||| |  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||    
T  16327016 tcagttcgcagtgtactaagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttattagagg 16327115  T
Q  315 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||    
T  16327116 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgatt 16327215  T
Q  415 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327216 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 16327287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Original strand, 11958283 - 11958759
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||    
T  11958283 cagagaatgaatgatgataggaggcttaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtg 11958382  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
       | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||   ||  |  | | ||| || ||  | |||||| |    
T  11958383 gtagagatgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacatacactagctgaatgtaagcgtgaggacattgtctgctacaactgcaacgaagaaag 11958482  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||| || ||  |||| |   |||| |||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  11958483 tcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatc 11958582  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||||    
T  11958583 agaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtt 11958682  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11958683 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 11958759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 21 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 10408984 - 10408519
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  10408984 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaaatgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 10408885  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  10408884 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 10408785  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10408784 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccaacttatcagaggtacttg 10408685  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  10408684 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 10408585  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10408584 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgt 10408519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 17189403 - 17188925
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| || ||    
T  17189403 agcagagatttaatgatgagaggaggtccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttg 17189304  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |  |||||||  |||  |||||||||||||| ||     
T  17189303 taccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggag 17189204  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || || || ||||| |   |||| ||||||  |  ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||    
T  17189203 ggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaactactaatgaggacaggctta 17189104  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||    
T  17189103 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacgggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattggg 17189004  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17189003 tttgattgtatctgatatggagggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctcgtttgt 17188925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 8744490 - 8744967
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  8744490 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 8744589  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | | |||||||||| |||||||     
T  8744590 taccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagag 8744689  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || ||  | |||||||   | || ||||||| |  |   ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |    
T  8744690 ggccacatcagtactcagtgcacacaaccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctca 8744789  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| ||||||    
T  8744790 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttggg 8744889  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8744890 tttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 8744967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13945053 - 13944576
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  13945053 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 13944954  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | | |||||||||| |||||||     
T  13944953 taccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagag 13944854  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || ||  | |||||||   |||| ||||||| |  |   ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |    
T  13944853 ggccacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctca 13944754  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||    
T  13944753 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcttataaactggg 13944654  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  13944653 tttgattgtgtctgatatggaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctagtttg 13944576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 115 - 483
Target Start/End: Original strand, 11949132 - 11949500
Alignment:
Q  115 gatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctta 214  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||  |||| |||||||  |    
T  11949132 gatgagaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacatattagctgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaaggtcaca 11949231  T
Q  215 ttagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagagg 314  Q
    | || | |||||| | | || | ||||||| |   |  ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| | ||||||||||||    
T  11949232 tcagtttgcagtgtacgtagacgaagaaggttaggatcggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcaacttatcagagg 11949331  T
Q  315 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagtt 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||    
T  11949332 tacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtggttataagttgggtctggtt 11949431  T
Q  415 gtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtt 483  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11949432 gtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtt 11949500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 24190333 - 24189855
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| || ||    
T  24190333 agcagagattgaatgatgagaggaggtacaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaacgtttg 24190234  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |  |||||||  |||  |||||||||||||| ||     
T  24190233 taccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacgttggctaactgcaagtggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggag 24190134  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || || || ||||| |   |||| ||||||  |  ||| ||||| || | |||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| | ||||    
T  24190133 ggccacatcagttcacagtgtactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagagtttgcgttgactggtacgcagactactaacgaggacaggctta 24190034  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||    
T  24190033 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataaattggg 24189934  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  24189933 tttgattgtatctgatatgaagggagagatggttgttgagactccagctaagggttcagtgactacttttctcgtttgt 24189855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 259 - 485
Target Start/End: Original strand, 16378285 - 16378511
Alignment:
Q  259 aaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 358  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16378285 aaggtatttgcttggactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattgctatcatagaca 16378384  T
Q  359 ctggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaa 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16378385 ctggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatattaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaa 16378484  T
Q  459 gggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16378485 gggttcagtaactacttctcttgtttg 16378511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 253 - 460
Target Start/End: Original strand, 13317879 - 13318086
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317879 ggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaccgtcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 13317978  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13317979 tagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 13318078  T
Q  453 agctaagg 460  Q
    ||||||||    
T  13318079 agctaagg 13318086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 292 - 486
Target Start/End: Original strand, 12509867 - 12510061
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12509867 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 12509966  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  12509967 gtgcctataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagatttcagcaaccacttctctggtttgt 12510061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 265 - 488
Target Start/End: Original strand, 10417402 - 10417625
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  10417402 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtg 10417501  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10417502 ctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttc 10417601  T
Q  465 agtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||| ||||||||||| || |||||    
T  10417602 agtgactacttctctggtgtgtct 10417625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 328 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 12273047 - 12272887
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | | ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12273047 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgactatgcatttaagttgggtctggttgtatctgatatga 12272948  T
Q  428 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12272947 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12272887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 391 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 14575632 - 14575535
Alignment:
Q  391 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14575632 tgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 14575535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 482
Target Start/End: Original strand, 12843216 - 12843688
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||| |||| ||||||||||||||  |||     
T  12843216 cagagaatgattgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtc 12843315  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
       | |||| |||   ||||||  | |||||  ||||||| || ||| | ||||| || ||   |  ||||||  | |||| ||||||  ||||||||||    
T  12843316 ctggagatgtgaaacggtgtttccgttgtggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaaagatgatgatgttgtgttctttaattgcaatgaagaagg 12843415  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || |||| | ||||| |||| ||| ||||||||| | | |||   ||| |  || || |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||    
T  12843416 tcatattggttcgcaatgcaagaatcctaagaagtcgcaaactactgggagagttttagctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatc 12843515  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| |     
T  12843516 agaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttggatc 12843615  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12843616 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatgattgttgaaactccagctaatggttcagtgactacttctcttgt 12843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15262392 - 15262175
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15262392 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 15262293  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15262292 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaatggttc 15262193  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  15262192 ggtgactacttctcttgt 15262175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 2037014 - 2037248
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  2037014 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 2037113  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||||||| |||||    
T  2037114 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 2037213  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2037214 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2037248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 2040755 - 2040989
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  2040755 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 2040854  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||||||| |||||    
T  2040855 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 2040954  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2040955 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2040989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 14039773 - 14039539
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  14039773 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 14039674  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||||||| |||||    
T  14039673 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 14039574  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14039573 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 14039539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 15345613 - 15345827
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15345613 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15345712  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15345713 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15345812  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15345813 ggtgactacttctct 15345827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 8 - 206
Target Start/End: Original strand, 16384472 - 16384670
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||    
T  16384472 agcagagacttaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaagtccacaagagtaacgtttg 16384571  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaaga 206  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  16384572 taccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacatgttggctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 16384670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16638535 - 16638321
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16638535 tttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16638436  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| || | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16638435 ctacgcattgctttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16638336  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  16638335 ggtgactacttctct 16638321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 43165437 - 43165223
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43165437 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 43165338  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43165337 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 43165238  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  43165237 ggtgactacttctct 43165223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 48428209 - 48427995
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48428209 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 48428110  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48428109 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 48428010  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  48428009 ggtgactacttctct 48427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 479
Target Start/End: Original strand, 15013115 - 15013340
Alignment:
Q  254 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 353  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| || || |  |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15013115 gtgggaaggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagcactcctttaattactattat 15013214  T
Q  354 agatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 453  Q
    ||||||| ||| ||| |||| ||| |||| |  | | ||||||  |||||||||| | ||| | ||   |||||| || ||||||||||| ||||| |||    
T  15013215 agatactagtgttacacatttttttattgttgctgattgtgctactaagttgggtcttgttatgtcgtctatgaatggggaaatggttgtcgaaacccca 15013314  T
Q  454 gctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||||| || |||||||||||    
T  15013315 gctaagggttcggtgactacttctct 15013340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15065833 - 15065612
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||| ||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  15065833 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtg 15065734  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15065733 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttcttctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaatctccagctaagggttc 15065634  T
Q  465 agtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     || ||||||||||| ||||||    
T  15065633 ggtgactacttctctcgtttgt 15065612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10008362 - 10008148
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10008362 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10008263  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10008262 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 10008163  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  10008162 ggtgactacttctct 10008148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10908972 - 10908758
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10908972 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10908873  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10908872 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 10908773  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  10908772 ggtgactacttctct 10908758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12889471 - 12889257
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12889471 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 12889372  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12889371 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 12889272  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  12889271 ggtgactacttctct 12889257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13255452 - 13255238
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13255452 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 13255353  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13255352 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13255253  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  13255252 ggtgactacttctct 13255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 15358845 - 15358631
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  || ||||| |   | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15358845 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15358746  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15358745 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15358646  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15358645 ggtgactacttctct 15358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 15713424 - 15713638
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15713424 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15713523  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15713524 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15713623  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15713624 ggtgactacttctct 15713638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24185952 - 24185738
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |   ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24185952 tttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24185853  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||||||||| || |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  24185852 ctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttt 24185753  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  24185752 ggtgactacttctct 24185738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 477
Target Start/End: Original strand, 14578776 - 14578988
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||| |   | ||||||| ||| |||||  || ||| ||| |||||| || ||||||| ||| || |||    
T  14578776 tttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtg 14578875  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14578876 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttcccatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14578975  T
Q  465 agtaactacttct 477  Q
    |||||||||||||    
T  14578976 agtaactacttct 14578988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3688705 - 3688491
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3688705 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 3688606  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||    | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  3688605 ctacgcattgttttattgcttccgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 3688506  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  3688505 ggtgactacttctct 3688491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 15586760 - 15586974
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15586760 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15586859  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15586860 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 15586959  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15586960 ggtgactacttctct 15586974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Original strand, 13317680 - 13317872
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||   |   ||||    
T  13317680 aatgatgagaggaggcctagggggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcaaaaggccacaaaagtaatgtttgcaccaaagatg 13317779  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtc 211  Q
    ||||||||||||| || ||||| || ||||| ||    ||||| |||||||||||| | |||||  |||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  13317780 agaagaagtgtttcagatgtggtcaaaaaggtcatgttttagcggattgcaagcgtggggatgtggtttgttataactgtaatgaagaaggtc 13317872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Original strand, 14873939 - 14874150
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||| |||||| ||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |    
T  14873939 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcataggtacatgttatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgcaa 14874038  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  14874039 cacattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 14874138  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  14874139 gactacttctct 14874150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Original strand, 15008684 - 15008954
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| | || ||||||||||||||| ||    
T  15008684 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagagaggccacaagagtaatgtttg 15008783  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
       |  || |||| ||||||| ||  | |||||| |||| || || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  || ||||||||||||    
T  15008784 ---caatggtgaggagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaaatgtgatgaagaa 15008880  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 281  Q
    || | | |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||  |||||||    
T  15008881 ggccatcttagttcgcagtgcaagaatcctaagaaggctcaagcaagtggaagggtgtttgctttagctggtac 15008954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 15399885 - 15400099
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||| | || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  15399885 tttgctttgactggtacgtagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtg 15399984  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15399985 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcttagggttc 15400084  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15400085 ggtgactacttctct 15400099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 20059422 - 20059636
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20059422 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 20059521  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20059522 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 20059621  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  20059622 ggtgactacttctct 20059636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 16754111 - 16754283
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16754111 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16754210  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16754211 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16754283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 284
Target Start/End: Original strand, 2247135 - 2247230
Alignment:
Q  189 ctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2247135 ctataactgtaatgaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcccagactggtgggaaggtttttgctttgactggtacgca 2247230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 26790781 - 26790995
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26790781 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 26790880  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||| | |  | |||| ||     |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  26790881 ctacgcattgttttattgttttcgattgtgtttccgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 26790980  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  26790981 ggtgactacttctct 26790995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 53382386 - 53382600
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  53382386 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 53382485  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  53382486 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttc 53382585  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  53382586 ggtgactacttctct 53382600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6603455 - 6603283
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  6603455 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacccattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 6603356  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6603355 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 6603283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16694884 - 16694712
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |  |||||    
T  16694884 atcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcgttgg 16694785  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16694784 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgagactccagctaagggttctgtgactacttctct 16694712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 16804357 - 16804529
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16804357 atcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16804456  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  16804457 gtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 16804529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 479
Target Start/End: Original strand, 5422359 - 5422512
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  5422359 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgcgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 5422458  T
Q  426 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  5422459 gaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 5422512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 399 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 17492479 - 17492396
Alignment:
Q  399 taagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||    
T  17492479 taagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagcgaagagttcggtgactacttctcttgt 17492396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 307 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11861094 - 11861033
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctac 368  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  11861094 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11861033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 384
Target Start/End: Original strand, 23079388 - 23079504
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||| |    
T  23079388 gctttgactggtactcagaccgaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgcaa 23079487  T
Q  368 ctcattgtttcattgct 384  Q
    | |||||||| ||||||    
T  23079488 cacattgttttattgct 23079504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 213 - 272
Target Start/End: Original strand, 13028661 - 13028720
Alignment:
Q  213 tattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgcttt 272  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  13028661 tattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaaggtgtttgcttt 13028720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 15262640 - 15262589
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctg 68  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15262640 tgaatgatgagaggaggcgtagaaggaaagatgctcctgttgagattgtctg 15262589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 8271830 - 8271875
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8271830 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8271875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 13964786 - 13964831
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13964786 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13964831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30150066 - 30150021
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30150066 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 30150021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 15944026 - 15944071
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  15944026 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 15944071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 22150168 - 22150213
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22150168 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22150213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1625
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1147 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatg 1246  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |  | | ||| ||||||||||||||     
T  1247 tgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagag 1346  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  1347 ggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgactta 1446  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  1447 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttggg 1546  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1547 tctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgt 1625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 28160 - 28638
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28160 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactaagattgtctgttttaaatgtggtgaaaaaggccacaagggtaatgtatg 28259  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| |  | | ||| ||||||||||||||     
T  28260 tgaccgtgatgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgtaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagag 28359  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  28360 ggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgaaaactactaatgaggaccgactta 28459  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||    
T  28460 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgttgttaattgtgcatataagttggg 28559  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | |  || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28560 tctgattatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttgt 28638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21474856 - 21474386
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21474856 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 21474757  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    ||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  | | ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  21474756 atgagaagaagtgtttccgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatat 21474657  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21474656 tagttctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacttctaatgaggaccgacttatcagaggt 21474557  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||| |||||||||||| | |||     
T  21474556 atttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttgattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggtta 21474457  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21474456 tgtctgatatgaatagaaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcatgtttgt 21474386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 25771106 - 25770630
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  25771106 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagaataatttatgtg 25771007  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  | | ||| |||||||||||||||||    
T  25771006 accgtgatgagaagaagtgttttcgatgtgggacgaaaggacacacattatctgattgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaagg 25770907  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25770906 tcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaaggctctgacaggtggcaaggtgtttcctttgactagtaagcaaactgttaataaggaccgacttatc 25770807  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||     
T  25770806 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatattggtgctattcattgtttcattgttgttgattgtgcttataagttgggtc 25770707  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25770706 tggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaatctccagcaaagggttcaatcactacttctcttgtttgt 25770630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 16 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19456279 - 19455807
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |    
T  19456279 ctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatactcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagag 19456180  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    ||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||  |  ||| |||||| ||  | || ||||||| |||    
T  19456179 atgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatat 19456080  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    ||| ||| |||| |   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||    ||||||||||||    
T  19456079 tagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggt 19455980  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19455979 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttg 19455880  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19455879 tatctgatatgaaaggtgaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 19455807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 19438255 - 19437786
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||      ||||    
T  19438255 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagatcgttcgttacaagtgtggtgagaaaggccacttgagtaatgtttgtactaaagatg 19438156  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | |||||  | | ||| ||    
T  19438155 agaataagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagcgccatatcag 19438056  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     ||||||||||   |||| ||||||| |   ||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||   || | |||| ||||||||||||||||||    
T  19438055 ttcgcagtgcacacagccgaagaaggttaggactagtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtact 19437956  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  19437955 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgagtctagttgtat 19437856  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19437855 ctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 19437786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 16 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19466424 - 19465971
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | |    
T  19466424 ctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatactcctactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagag 19466325  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    ||||||||||||| || |||||  | ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | ||  |  ||| |||||| ||  | || ||||||| |||    
T  19466324 atgagaagaagtgcttcaggtggtgtcagaaaggacacacactagatgattgtaagcgtggagacattgtttgctataactgcaacgaggaaggtcatat 19466225  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    ||| ||| |||| |   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||    ||||||||||||    
T  19466224 tagttcgtagtgtactcaaccaaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggattttcttatcagaggt 19466125  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  19466124 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttg 19466025  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19466024 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaa 19465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Original strand, 14376942 - 14377413
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||  |||| || | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||      ||    
T  14376942 tgaatgatgagaggagacccaataggagagatgctcctgttgatgttgtttgctacaagtgcggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaaga 14377041  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||  |||  ||||| ||  ||||||| || |  ||     
T  14377042 tgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctaattgtaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagagggccacatc 14377141  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||||| || |   |||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  14377142 agttcgcaatgtacacagccgaagaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgacttatcagaggta 14377241  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14377242 cttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgt 14377341  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14377342 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcaaagggtttagtagctacttctcttgtttgtct 14377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Original strand, 24515433 - 24515911
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||     
T  24515433 cagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgta 24515532  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
         ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||| |  | |||||  |||  ||||| ||  |||| |||||    
T  24515533 ctaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaagacacacactagctgattggaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaagg 24515632  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    ||  || || |||||||| | | | || | || || |   || ||||| || |||||| || ||||||||||||||||   || |||||| |||||||||    
T  24515633 tcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggacggttaggaccggtggtaacgtgttttctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatc 24515732  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||     
T  24515733 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttgggtc 24515832  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24515833 tggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagttaagtgttcattaactacttctcttgtttgtct 24515911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Original strand, 10465865 - 10466339
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  10465865 agcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttg 10465964  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || |||||| | ||  |  | | |||||| ||  ||||||||    
T  10465965 tggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaa 10466064  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| |||||| || ||||| |   |||| |||||||     || || || || |||||||  ||||  |||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  10466065 ggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgtattgatcggtacgcagactaccaatgaggaccgactta 10466164  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  10466165 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgttgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttggg 10466264  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10466265 tttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 10466339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 19486311 - 19486789
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  19486311 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 19486410  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||||||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  |||| || ||||||| | ||||| |  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  19486411 caatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcatggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaa 19486510  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19486511 ggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaagttgtttgcattgactggtacgcaaacatttaatgaggaccgactta 19486610  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  19486611 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgttattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 19486710  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | ||  | ||   |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19486711 tctggtcatgtcaagtatgagtagagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 19486789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18797954 - 18797476
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | || ||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  18797954 agcaaagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagggatgctcctgtggatattgtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 18797855  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
           |||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| ||  |||| |||    
T  18797854 cactaaagatgagcagaaatgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgctataactgcaatgatgaa 18797755  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || || |||||||   | || ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| |||||||    
T  18797754 ggccatatcagttcacagtgcactcaaccaaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgactta 18797655  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||    
T  18797654 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttggg 18797555  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18797554 tttgattgtatctgacatgaaaggagagatggttgttgaaactctagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 18797476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24367651 - 24367183
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  24367651 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcatgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 24367552  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||  | ||  |  | |  || |||||  ||| |||||||| |||||| |    
T  24367551 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcggggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtt 24367452  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | ||||||    | || |||||  ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367451 cacagtgccctgaaccgaagaaaactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 24367352  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||   | | |||||    
T  24367351 tttctttaatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatatcagttgggtccggatatatct 24367252  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24367251 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaggattcagtaaccacttctcttgtttgtctg 24367183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Original strand, 21567014 - 21567486
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| || || || || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||         
T  21567014 gactgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactaa 21567113  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctt 213  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||  |||  |||||||||||| | || || |      
T  21567114 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgataaggagggccac 21567213  T
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    || || || |||||||   |||| ||||||  |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||   ||||||||||    
T  21567214 atcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaataaggacatgcttatcagag 21567313  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagt 413  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||  |    
T  21567314 gtacttgtttctttaatagtacttattcaattgctattatagacactggtactactcattgtttcattgctttagaatgtgcatattagttgggtttgat 21567413  T
Q  414 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21567414 tgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 21567486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 15462598 - 15462120
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||  ||||| ||||  |||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||      
T  15462598 cagagattgaatgatgagaggcagcctagagggagagagactcctgttgatgttgtgtgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagagtaatgtctgca 15462499  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
     | | ||||||||||| ||||| || || || |||||||| ||    || ||||| ||||||||  | ||| || | |  ||||| |||| ||| || ||    
T  15462498 ccagagatgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaaaggtcatgtgttggctgagtgcaagcggggagatatcgtgtgttataactgtggtgaggaggg 15462399  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     |  ||||| |||||||||| | | ||||||||||    ||| || || || || ||||| |||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||    
T  15462398 ccacattagttcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgccttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatc 15462299  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||     
T  15462298 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtc 15462199  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15462198 tgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctggtgtgtct 15462120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 253 - 486
Target Start/End: Original strand, 34642848 - 34643081
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  34642848 ggtgggaaagtgtttgccttggctggtacgcaaaccgcgaatgaagatagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtatccctttaatcgctatta 34642947  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34642948 tagacactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcttataaactgggtttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactcc 34643047  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34643048 ggctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 34643081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 490
Target Start/End: Original strand, 30678233 - 30678523
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||||||||   |  |||| ||   |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  30678233 atgaagaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaggctagtgggaaaacgtttgctttgactggtacacaaacagtgaatgagga 30678332  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||  | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||| | |||||| ||||||| | | ||||||| |    
T  30678333 tcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtgctacgcgttgttttattgctactgattgtgcttct 30678432  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 490  Q
    ||||||||| | ||| | ||   |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||    
T  30678433 aagttgggtcttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggttactacttctctagtgtgtctga 30678523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23081430 - 23081213
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||| ||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23081430 tttgctttgactgatactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 23081331  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23081330 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggttttgctatgtcaaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23081231  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  23081230 agtgactacttctcttgt 23081213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 358 - 482
Target Start/End: Original strand, 20010821 - 20010945
Alignment:
Q  358 actggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagcta 457  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20010821 actggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcttataagttgggcctaatcgtatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagcca 20010920  T
Q  458 agggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20010921 agggttcagtaactacttctcttgt 20010945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 265 - 473
Target Start/End: Original strand, 5836502 - 5836710
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || ||   ||||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  5836502 tttgctttgactggtactcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 5836601  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||||||  |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5836602 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgcttatactttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 5836701  T
Q  465 agtaactac 473  Q
     ||||||||    
T  5836702 ggtaactac 5836710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 18405260 - 18405435
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  18405260 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctatgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 18405359  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18405360 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 18405435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Original strand, 18182686 - 18182862
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||   | ||||||||| | ||||||| ||||||||||     
T  18182686 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacacatttccttattgctattgattgtgcttctaagttgggtc 18182785  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | | | ||  ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18182786 ttgctatgtcaaatatgaatggagagatggtagtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgtttgt 18182862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22436873 - 22436662
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  22436873 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactagtgcta 22436774  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22436773 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22436674  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  22436673 gactacttctct 22436662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16813902 - 16813668
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||      
T  16813902 cagagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgca 16813803  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||| | |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  |||||||||||||||||    
T  16813802 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaatggcacacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaagaagg 16813703  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  16813702 tcatcttacttcacagtgcaagaagcctaagaagg 16813668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 29589713 - 29589927
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29589713 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 29589812  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29589813 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 29589912  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  29589913 ggtgactacttctct 29589927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 479
Target Start/End: Original strand, 23085096 - 23085313
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || |  |||||||||||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| || ||||||| || ||||    
T  23085096 gtgtttgctttgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactg 23085195  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||| |||||||| |||| | || | | ||||| |||||||||| |   | | ||   |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23085196 gtgctacacattgttttattgttgttgattatgcttctaagttgggtcttactatgtcaagtatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 23085295  T
Q  462 ttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| || |||||||||||    
T  23085296 ttcggtgactacttctct 23085313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 2872076 - 2872290
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2872076 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 2872175  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2872176 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 2872275  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  2872276 ggtgactacttctct 2872290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16574855 - 16574683
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16574855 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16574756  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16574755 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16574683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 16620525 - 16620697
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  16620525 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 16620624  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16620625 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 16620697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 16924956 - 16925128
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  16924956 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 16925055  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16925056 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaactccagctaagggatcggtgactacttctct 16925128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Original strand, 8720731 - 8720893
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  |  ||||    
T  8720731 tgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgatcctgatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgcaatggtga 8720830  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtga 179  Q
     ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  8720831 ggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtga 8720893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28312637 - 28312423
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28312637 tttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 28312538  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| | || |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28312537 ctacgcattgctttattgctttcaattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 28312438  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  28312437 ggtgactacttctct 28312423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 24293056 - 24293270
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24293056 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24293155  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||  |||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24293156 ctacgcacggttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 24293255  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  24293256 ggtgactacttctct 24293270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 27559285 - 27559457
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27559285 atcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27559384  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27559385 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27559457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19867626 - 19867480
Alignment:
Q  333 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 432  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||  | ||| | ||| ||||||| | |    
T  19867626 tactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctaccttgggccttgttatgtcttatatgaatgaa 19867527  T
Q  433 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19867526 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 19867480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 28260513 - 28260685
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28260513 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28260612  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28260613 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28260685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 28285403 - 28285231
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28285403 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28285304  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28285303 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28285231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 28339262 - 28339434
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  28339262 atcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 28339361  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  28339362 gtcttgagttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 28339434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190229
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27190299  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27190298 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27190229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 479
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27259011
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtc 27258941  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | |   | || |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27258942 ttgagttgtcagatatgaatggggagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27259011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23081676 - 23081592
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||  |  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  23081676 aatgatgagaggcggcctaggaagaaagatgctcctgttgagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 23081592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 25115517 - 25115345
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   | ||    
T  25115517 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgcttcgg 25115418  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25115417 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 25115345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Original strand, 25958770 - 25958864
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaat 102  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || | || ||||||| | |||| ||||| |||||||    
T  25958770 agcaaagactggatgatgagaggagacctaagagtagagatgctcctactgagattgtttgctacaggtgtggtaagaaaggccacaggagtaat 25958864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 374
Target Start/End: Original strand, 22829702 - 22829769
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 374  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22829702 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 22829769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 16379710 - 16379755
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16379710 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16379755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 16647306 - 16647351
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16647306 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 16647351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 104
Target Start/End: Original strand, 30678050 - 30678137
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||  |||| |||| || | |||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  30678050 tgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaagtgtggtgagaagagccacaagagtaatgt 30678137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21765026 - 21764980
Alignment:
Q  58 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21765026 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 21764980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16100959 - 16100914
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16100959 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcatt 16100914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 103
Target Start/End: Original strand, 18405012 - 18405056
Alignment:
Q  59 agattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18405012 agattgtctgtttcacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 18405056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 18 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 50524 - 50054
Alignment:
Q  18 gaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgat 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  50524 gaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtttgtgaccgagat 50425  T
Q  118 gagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatta 217  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||| |  ||| ||| || ||  |||| ||||||| ||| |    
T  50424 gagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccttagctgattgtaagcgtggggatattgtttgctacaactgcaatgaggaaggtcatatca 50325  T
Q  218 gctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtac 317  Q
    | ||| |||| |   |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50324 gttcgtagtgtacccagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttattagaggtac 50225  T
Q  318 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgta 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  50224 ttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggggctagttgta 50125  T
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50124 tctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 50054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 21742496 - 21742974
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  21742496 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatg 21742595  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||  ||| ||| || ||| |||| |||    
T  21742596 tgaccgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaggaa 21742695  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| |||||||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  21742696 ggacatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgactta 21742795  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||    
T  21742796 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttggg 21742895  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21742896 tctgattgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaactacgtctcttgtttgt 21742974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 21738980 - 21739458
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  21738980 agcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagaggtgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttg 21739079  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||  ||| ||| || | | ||||||||    
T  21739080 tgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacaccttagttgattgtaagcgtggggatgttttttgctacaactataatgaagaa 21739179  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| | | |||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21739180 ggtcatatcagttcgcagtgtacggagcctaagaaggttaggacaggtggcaagctgttttctttgactggtacgcaaacggttaatgaggaccgactta 21739279  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  21739280 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 21739379  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21739380 tcttgttttatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttttcttgtttgt 21739458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 24096568 - 24097036
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||   | ||    
T  24096568 tgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtggtagaga 24096667  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||  |  ||| ||| || ||  | |||||||||| |||     
T  24096668 tgagaggaagtgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggggacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatc 24096767  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || ||||| |   |||| |||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  24096768 agttcacagtgtactcagccgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggactgacttatcagaggta 24096867  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  24096868 cttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgt 24096967  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24096968 atctaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaattacttctcttgtttg 24097036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 22015700 - 22016169
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||   | ||||| || ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |||||  | ||||    
T  22015700 aatgatgagaggaggccaaagaagagagatgctcctacaaatattgtttgattcaagtgtggagaaaaaggccaaaaaagtaatgtttgtgatagagatg 22015799  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||| ||  | || |||| || ||||||    
T  22015800 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataactgcaacgaggaagatcatattag 22015899  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     | |||||| | | |||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22015900 tttgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggtact 22015999  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  22016000 tgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtat 22016099  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22016100 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 22016169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 19857720 - 19857243
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  19857720 agcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgcttctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctg 19857621  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||  | ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||  |  |||  ||||| |   |||| |||    
T  19857620 tgatagagatgagaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcggggagacattgtttgttataactacaatgaggaa 19857521  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| |||||| |||||||| |   | || ||||||| | | ||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||    
T  19857520 ggtcatattagttcgcagtgtactcaaccgaagaaggttatgaccagtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactta 19857421  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19857420 ttagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgtgcttataagttggg 19857321  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857320 tatggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 19857243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 52989178 - 52988706
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     ||    
T  52989178 tgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaaga 52989079  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||  |||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| |||     
T  52989078 tgagaggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatc 52988979  T
Q  217 agctcgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    || || || || |  ||| || ||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  52988978 agttcacaatgtcctgaa-ccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggt 52988880  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  52988879 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatg 52988780  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52988779 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 52988706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 48426306 - 48425838
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  48426306 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 48426207  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  48426206 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 48426107  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48426106 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 48426007  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48426006 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 48425907  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48425906 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 48425838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Original strand, 20832844 - 20833324
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||| || | ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  20832844 agcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgctcctgttgatattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 20832943  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||  |||  ||||| ||  |||| |||    
T  20832944 tactaaagatgagaagaattgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagaggggagatgttgtttgttataactgcaatgaggaa 20833043  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    ||||  || || |||||||| | | | || | ||||| |   || ||| | || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||    
T  20833044 ggtcacatcagttcgcagtgtacgcaaccgaggaaggttaggaccggtagtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactta 20833143  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||    
T  20833144 tcagaggtacttgtttctttaatattattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgttattgaatgttcttataagttggg 20833243  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20833244 tctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagataagggttcattaactacttctcttgtttgtct 20833324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 37680482 - 37680014
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  37680482 tgatgataggaggcccaagaggagagatactcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 37680383  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || |||||  ||| |||||||| |||||| |    
T  37680382 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagtt 37680283  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| | |||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37680282 cacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggacagacttatcagaggtacttg 37680183  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||    
T  37680182 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctattcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatct 37680083  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37680082 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 37680014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 38909783 - 38910251
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  38909783 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 38909882  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  38909883 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 38909982  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38909983 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtttttgccttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 38910082  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  38910083 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 38910182  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38910183 gatatgaaagggaaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 38910251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 21 - 481
Target Start/End: Original strand, 20074666 - 20075126
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||      ||||||    
T  20074666 tgatgacaggaggcttaagaggagagatgctcccactgagattgtgtgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtagtaaagatgag 20074765  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||| | ||| |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| ||| |  |    
T  20074766 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagcttggctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatcaatt 20074865  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    |||||||     |||| ||||||| |  ||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20074866 cgcagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaagatgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 20074965  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20074966 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 20075065  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 481  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20075066 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttg 20075126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 489
Target Start/End: Original strand, 31536941 - 31537422
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  31536941 agcagaggatgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttataagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttg 31537040  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   | ||||| |  || || || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  |||    
T  31537041 tggtagagatgatagaaaatgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaa 31537140  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| || |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  31537141 ggccatattagttcacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctctgactggtacgcagactcctaatgaagaccgactta 31537240  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31537241 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttggg 31537340  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31537341 tttggatgtgtctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 31537422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 253 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 18710586 - 18710351
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710586 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 18710487  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18710486 taaacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgcgtctggttgtatctgatatgagaggggaaatggttgttgaaactcc 18710387  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710386 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 18710351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 292 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20297543 - 20297346
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20297543 aatgaggaccgacttatcagaggtactggtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaat 20297444  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297443 gtgcttataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 20297346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 482
Target Start/End: Original strand, 20853713 - 20854178
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||| ||||  |||| |||| ||| |||||||  || | ||||||||||||||  ||   ||  ||    
T  20853713 tgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttgtttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcacccaaga 20853812  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| || || |  || ||||| ||||||||| | ||| || |||  | ||||||||  || || || |  |||    
T  20853813 tgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggccacatt 20853912  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||    |||  | || ||||| || |||||||||||||| || |||   || ||||| ||||||||||||||||    
T  20853913 agctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggta 20854012  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  20854013 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgt 20854112  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20854113 atctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 20854178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 21961464 - 21961135
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     ||    
T  21961464 tgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaaga 21961365  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||| | ||| |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| |||     
T  21961364 tgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatc 21961265  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||||    |||| ||||||| |  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21961264 agttcgcagtgccctgagccgaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggta 21961165  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattg 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961164 cttgtttctttaatagtactcctttaattg 21961135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 262 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 16379255 - 16379031
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  16379255 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattg 16379156  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||   | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16379155 gtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcatgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggg 16379056  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||| || ||||||||||||||||||    
T  16379055 ttcggtgactacttctcttgtttgt 16379031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 21752163 - 21751988
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  21752163 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgg 21752064  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||| ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  21752063 gtcttgctatgtctaatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 21751988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Original strand, 22496460 - 22496671
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22496460 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 22496559  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22496560 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctacattgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22496659  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  22496660 gactacttctct 22496671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 24785058 - 24785272
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  24785058 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtg 24785157  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24785158 ctacacattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttatctgatatgaatggagagatggtcgttgaaattccagctaagggttc 24785257  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  24785258 ggtgactacttctct 24785272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 16347796 - 16348010
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16347796 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16347895  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16347896 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16347995  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  16347996 ggtgactacttctct 16348010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 51330693 - 51330907
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51330693 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 51330792  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51330793 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 51330892  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  51330893 ggtgactacttctct 51330907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 416 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 12200556 - 12200483
Alignment:
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12200556 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 12200483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 20081619 - 20081791
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  20081619 atcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtactacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 20081718  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20081719 gtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 20081791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 479
Target Start/End: Original strand, 33388291 - 33388444
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||    
T  33388291 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatat 33388390  T
Q  426 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  33388391 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 33388444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21833460 - 21833246
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21833460 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 21833361  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| || ||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21833360 ctacgcattgttttatggctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21833261  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  21833260 ggtgactacttctct 21833246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21842370 - 21842156
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  21842370 tttgctttgactggtacgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 21842271  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | |||| || |   || ||| | | | | ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21842270 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttaggtcttgatttgtctgatatgaatggagagattgttgtcgaaactccagctaagggttc 21842171  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  21842170 ggtgactacttctct 21842156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 17042258 - 17042430
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17042258 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17042357  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    |  | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17042358 gccttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17042430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 262 - 368
Target Start/End: Original strand, 21045322 - 21045428
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||  | || | |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21045322 gtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactg 21045421  T
Q  362 gtgctac 368  Q
    |||||||    
T  21045422 gtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19109526 - 19109312
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  19109526 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtg 19109427  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||  |||||||| |||||   | | ||||||| |   ||| || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19109426 ctatgcattgttttattgcctatgattgtgcttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 19109327  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  19109326 ggtgactacttctct 19109312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 18273213 - 18273117
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  18273213 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgt 18273117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 265 - 464
Target Start/End: Original strand, 41350869 - 41351068
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41350869 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 41350968  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41350969 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41351068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20297816 - 20297663
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||     ||||||    
T  20297816 tgatgacaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaatgccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgag 20297717  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgt 174  Q
    | |||||| || ||||||||  |||| || ||||   ||||||| |||||||||    
T  20297716 aggaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacagcctagctgaatgcaagcgt 20297663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 455
Target Start/End: Original strand, 21228757 - 21228947
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||| ||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21228757 tttgctttggctggtactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtg 21228856  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagc 455  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  21228857 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagc 21228947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22401750 - 22401631
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | ||||||| ||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22401750 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 22401651  T
Q  365 ctactcattgtttcattgct 384  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  22401650 ctacgcattgttttattgct 22401631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 20828656 - 20828701
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20828656 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20928149 - 20928104
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20928149 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 20928104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 362
Target Start/End: Original strand, 22435976 - 22436031
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgg 362  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22435976 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20528148 - 20528103
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  20528148 aatagtactcctttgattgcaattattgatcctggtgctactcatt 20528103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1056 (Bit Score: 285; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold1056
Description:

Target: scaffold1056; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 10 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2147 - 1672
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||| | || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  2147 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggtgagatgctcctactgaaattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtg 2048  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | |||||  | | |||||||||||||||||| ||    
T  2047 accgagatgagaagaagtgctttaggtgtggacagaaaggacatactttagctgattgtaagcgtgg-gatgttgtatgctataattgtgatgaagaggg 1949  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     | ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1948 acatattagctcgcagtgcaagaagcccaagaagtttcggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatc 1849  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| ||||||||||||     
T  1848 aaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtc 1749  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1748 tggttatgtctgatatgaatggagaaatggttcttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttctttgt 1672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 63394 - 63872
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  63394 agcaaagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgataaaggccacaagagtaatgtttg 63493  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| | | ||| |  ||| ||| || | | |||| |||    
T  63494 tgaccgagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcatggggatattgtttgctacaactataatgaggaa 63593  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| | | |||||||||||| |   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  63594 ggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaagtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgactta 63693  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||    
T  63694 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcttttaattgctattatagatactggtgttactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttggg 63793  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  63794 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 63872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5609 - 5130
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5609 agcagagattgaatgatgagaggaggccaag-aggagagatgctcctactgatattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 5511  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| ||| || ||| ||||||||    
T  5510 tgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaa 5411  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| | | ||||||||||| ||    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5410 ggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaagtctaggtcaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgactta 5311  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  5310 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 5211  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5210 tctggttatgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctgaggtttcagtaactatttctcttgtttgtct 5130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 10 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 70535 - 70079
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  70535 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattatttgctttaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtg 70436  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| |||| |||||    
T  70435 accgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaagg 70336  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     | |||||| |||||||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70335 acatattagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgacttatc 70236  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||     
T  70235 agaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtc 70136  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 466  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70135 tagttatatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcag 70079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 319 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 60857 - 60690
Alignment:
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  60857 tgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttatat 60758  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60757 ctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 60690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 43118 - 42647
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43118 tgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgttgtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtgaccgaga 43019  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  |||||| | |||||  ||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  43018 tgagaagaagtgctttaggtgtagtcagaaaggacacactttagcggattttaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgcagaaggtcatatt 42919  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||| | | | |||||||||  |   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42918 agttcgcagtgtacgcaacctaagaagattaggacaggtggcaaggtgtttgctttcactggtgcgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggta 42819  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||| |||||||||||| | |||||    
T  42818 cttgtttctttaatagtactcctttatttgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgtagttgattgtgcatataagttgggtctggttgt 42719  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42718 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 42647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 292 - 479
Target Start/End: Original strand, 50504 - 50691
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |    
T  50504 aatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 50603  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50604 gtgcttctaccttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 50691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 6023 - 5553
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | |    
T  6023 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgcccctaatgagactgtctatttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgtgtgattgag 5924  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||||||||||||||| || |  ||    
T  5923 ataagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggggatgttgtttgttataattgtgatgaagagggacacat 5824  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  5823 tagctcgtagtgcaagaaacctaagaaggttcgaaccggtggcatggtgtttgctctaattggtacgcaaacagtgaatgaggaccgacttatcagaggt 5724  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   | ||| |||||||||||| | |||     
T  5723 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgtttatgcatataagttgggtctggtta 5624  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  5623 tgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttatttgt 5553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 17 - 479
Target Start/End: Original strand, 4188 - 4650
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||| || ||    
T  4188 tgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaagactacaaaagtaatgtgtgtgatcgaga 4287  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| |||| ||||| | ||||    
T  4288 tgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaaggacatatt 4387  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||| | | |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  4388 agttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcagacggtgaatgaggaccgacttatcagaggta 4487  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||   ||| |    
T  4488 cttgtttctttaatagtactcatttaatttctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtcgggttat 4587  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4588 atctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 4650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Original strand, 12798363 - 12798840
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||    
T  12798363 agcagagattgaatgatgagaggaggctcaagaggagagatgctcatactgatattgtttgtttcaagtgtgg---aaaaggccacaagagtaatgtttg 12798459  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||||  ||| ||| || ||| ||||||||    
T  12798460 tgaccgagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtgagcgtggggatgttgtttgctacaactgtaatgaagaa 12798559  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| |   ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  12798560 ggtcatatcagttcgcagtgtacacagcctaagaaggctaggacaggtggcaaggtttttgcgttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgactta 12798659  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||    
T  12798660 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttggg 12798759  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12798760 tctggttgtatctgatatgaaaggaaaaatggttgttgaaactcaagctaagggttcagtaactacttctcttatttgtct 12798840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 19150401 - 19149923
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  19150401 agcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtg 19150302  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| ||||||||    
T  19150301 tgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaa 19150202  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| |||||||| | | | ||||||||||||   | |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19150201 ggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgactta 19150102  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||| ||    
T  19150101 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttagg 19150002  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19150001 tctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 19149923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 20749800 - 20749322
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||    
T  20749800 agcagaggttgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaacagtaatgtgtg 20749701  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||| || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| ||||||||    
T  20749700 tgatcgagatcagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggagatattgtttgctacaactgtaatgaagaa 20749601  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| |||||||| | | | ||||||||||||   | |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20749600 ggacatattagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggctaggataggtggtaaagtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatgaggaccgactta 20749501  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||| ||    
T  20749500 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggttctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttagg 20749401  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20749400 tctggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 20749322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 486
Target Start/End: Original strand, 14261108 - 14261583
Alignment:
Q  11 agagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  || |    
T  14261108 agagactgaatgatgagaggaggcctaaggggagatatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtgcgtca 14261207  T
Q  111 ccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggt 210  Q
     || |||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| |||| |||||     
T  14261208 tcgagatgagaagaagtactttaggtgtagtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaagga 14261307  T
Q  211 cttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatca 310  Q
    | |||||| |||||||  | | |||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14261308 catattagttcgcagtttatgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactatgaatgaggaccgacttatca 14261407  T
Q  311 gaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | || || |||||||||||| |    
T  14261408 gaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgagcatataagttgggtct 14261507  T
Q  411 agttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14261508 ggttgtatctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 14261583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 15099473 - 15099942
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||  | ||||    
T  15099473 aatgatgggaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatg 15099572  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||| |||||| | ||  || |||  ||||| ||  |||| ||||||| ||| ||    
T  15099573 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactctagatgattgtaagcgtggggacatcgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatatcag 15099672  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     |||||||| | | |||| ||||||| |   |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15099673 ttcgcagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttaactggtatgcagacagttaatgaggaccgacttatcagatgtact 15099772  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15099773 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgatactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtat 15099872  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15099873 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 15099942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 16947331 - 16947808
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  16947331 agcagagaatgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgctccagttgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttg 16947430  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||  |  ||| ||| || ||  | |||||     
T  16947431 tggtagagatgagaggaagtgtgttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagag 16947530  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || || ||||| |   |||  |||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  16947531 ggtcatatcagttcacagtgtattcagctgaagaaggctagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaatggtacgcagactactaatgaggaccgactta 16947630  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16947631 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttggg 16947730  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16947731 tttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 16947808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 13676832 - 13676361
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||    ||    
T  13676832 tgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaaga 13676733  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||  |  ||| |||||| ||  |||| || || | |||     
T  13676732 tgagaagaagtacttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatc 13676633  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || |||||     | || ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  13676632 agttcacagtgtgcacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggta 13676533  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  13676532 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgt 13676433  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13676432 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 13676361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 14283233 - 14283711
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  14283233 agcagagactcaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 14283332  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | |||||     
T  14283333 taccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacacattagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagag 14283432  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| ||| | ||||||    |||| ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||    
T  14283433 ggtcatatcagcacacagtgcccacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggactgtctta 14283532  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  14283533 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttcattgctattatagacattggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttggg 14283632  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14283633 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 14283711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 21 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 21755789 - 21755320
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| | |||||||| |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     ||||||    
T  21755789 tgatgacatgaggcctaagaggagagatgctccctctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgag 21755690  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||| | ||| |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| ||||||||    
T  21755689 aggaagtgtttcaggtgtggtcagaagggtcacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagct 21755590  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| ||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21755589 cacagtgtcctgagccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 21755490  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21755489 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatct 21755390  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctga 490  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21755389 gatatggaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctga 21755320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 26091670 - 26092138
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  26091670 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 26091769  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  26091770 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 26091869  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26091870 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 26091969  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  26091970 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatct 26092069  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26092070 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 26092138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 26115462 - 26115930
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  26115462 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctccggctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 26115561  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || |||||  ||| |||||||| ||||||      
T  26115562 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaattgcaatggagaaggtcatattagta 26115661  T
Q  221 cgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtactt 319  Q
    | ||||| |  ||| || |||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26115662 cacagtgtcctgaa-ccgaagaagactagaactggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcacactcctaatgaggaccgactcatcagaggtactt 26115760  T
Q  320 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  26115761 gtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatc 26115860  T
Q  420 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26115861 tgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 26115930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Original strand, 11385294 - 11385766
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||| || || |  |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |      
T  11385294 gactgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgctcctgctgagatagtttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaa 11385393  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctt 213  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||  |||  |||||||||||||| || || |      
T  11385394 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccac 11385493  T
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    || || || |||||||   | || ||||||  |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||    
T  11385494 atcagttcacagtgcactcaaccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacagacttatcagag 11385593  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  |    
T  11385594 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactgatgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgat 11385693  T
Q  414 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11385694 tgtatttgatatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcaggaactacttctcttgtttgt 11385766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 40924689 - 40925157
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  40924689 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 40924788  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  40924789 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 40924888  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40924889 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 40924988  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  40924989 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatct 40925088  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40925089 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 40925157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 12460018 - 12459544
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  12460018 agcagaaaatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgttcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttg 12459919  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   | ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| || |||||| | ||  |  | | |||||| ||  ||||||||    
T  12459918 tggtagagatgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaagggacacaccctagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgcaatgaagaa 12459819  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| |||||| || ||||| |   |||| |||||||     || || || || |||||||  ||||  |||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  12459818 ggtcatattagttcacagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgaattgaaaggtacgcagactacaaatgaggaccgactta 12459719  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12459718 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactgatgctactaattgttttattgctattgaatgtgcctataagttggg 12459619  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12459618 tttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 12459544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Original strand, 12203668 - 12204137
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  || |||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||| |  ||||    
T  12203668 tgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgtgattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtga 12203767  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||| ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  ||||||| |||||||||  |||| |  ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||    
T  12203768 tgagaaaaagtgcttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtgatgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatctt 12203867  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12203868 agctcgcaatgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacatagacggttaatgaggatcgacttatcagaggta 12203967  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| |    
T  12203968 cttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttat 12204067  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     ||   |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12204068 gtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactctagctaagggttcaataactacttctcttgtttgt 12204137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 49155671 - 49155210
Alignment:
Q  28 aggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagt 127  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | ||||| | |||||    
T  49155671 aggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagt 49155572  T
Q  128 gttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtg 227  Q
    | || |||||||| ||||| || || |  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || || |||||    
T  49155571 gcttcaggtgtggtcagaagggtcatagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtg 49155472  T
Q  228 caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttt 327  Q
         |||| |||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49155471 tcctgagccgaagaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttcttt 49155372  T
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  49155371 aatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatatatctgatatga 49155272  T
Q  428 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49155271 aaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 49155210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 13965540 - 13966008
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||  || | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     |||||     
T  13965540 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgattgctacaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgat 13965639  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    |  || || || |||||||| ||||| || ||||   ||||||| ||||||||| | ||| |  | | ||| |||||  ||| ||| |||| ||| || |    
T  13965640 agaaaatgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatgcaagcgtggggatattgtctgctacaattgcaatggagagggtcatatcagtt 13965739  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13965740 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 13965839  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  13965840 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 13965939  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13965940 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctg 13966008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13024734 - 13024258
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||  |     
T  13024734 agcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgctta 13024635  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   |  |||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  | ||||||    
T  13024634 tggtagatatgagaggaaatgtttcaggtgtggttagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaa 13024535  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || || ||||| |   |||| |||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  13024534 ggtcatatcagttctcagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgactta 13024435  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  13024434 tcagaggtacttgtttctttaatag-actcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttggg 13024336  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13024335 tttggatgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 13024258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 18050812 - 18051289
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  18050812 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 18050911  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | |  ||||||||| |||||||     
T  18050912 taccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgttataattgtaatgaagag 18051011  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    ||||  || ||  | |||||||   |||| ||||||| |  |   ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |    
T  18051012 ggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgtctca 18051111  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| ||||||    
T  18051112 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttggg 18051211  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18051212 tttgattgtgtctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctctggtttg 18051289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 253 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 14140824 - 14140591
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140824 ggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactactaatgaggaaagacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 14140725  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14140724 tagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgagtgtatctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactcc 14140625  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14140624 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 14140591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 262 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 15343567 - 15343343
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15343567 gtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactg 15343468  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343467 gtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 15343368  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |  ||||||||||||||||||||||    
T  15343367 taaagtaactacttctcttgtttgt 15343343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 15627721 - 15627444
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    ||||||| |||| |||| | |||||||| | | ||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15627721 atgaagagggtcatattggttcgcagtgaaagtagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgagga 15627622  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
    |||  | || | |||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||  || | ||||||  |    
T  15627621 ccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtgatacgcattgttttattgccgttgattgtgctcct 15627522  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 477  Q
    | ||||||| | | | | ||   |||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  15627521 atgttgggtcttgatatgtcgagtatgaatgaggaaatggttttcgaaactccagctaagggttcggtgactacttct 15627444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 15146061 - 15146275
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||  | | ||||||||| ||||   ||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15146061 tttgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtg 15146160  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| | | | | || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15146161 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttgctttgtcggatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15146260  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15146261 ggtgactacttctct 15146275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 44788489 - 44788703
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44788489 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 44788588  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44788589 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 44788688  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  44788689 ggtgactacttctct 44788703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14957644 - 14957472
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  14957644 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 14957545  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14957544 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctct 14957472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8710737 - 8710523
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8710737 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 8710638  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8710637 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8710538  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  8710537 ggtgactacttctct 8710523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 11550240 - 11550454
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |   ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11550240 tttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 11550339  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||||||||| || |||||| || | ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11550340 ctactcattgctttattgcttttgattgtgtatctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 11550439  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  11550440 ggtgactacttctct 11550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14335528 - 14335314
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14335528 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14335429  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14335428 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14335329  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  14335328 ggtgactacttctct 14335314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14042785 - 14042610
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  14042785 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14042686  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14042685 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14042610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14352815 - 14352640
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  ||||||||    
T  14352815 atcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctattaagttgg 14352716  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||  |||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  14352715 gtcttgctatgtcaaatataaatggagagatggttgtcgaaactcaagctaagggttttgtgactacttctcttgt 14352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 11234351 - 11234565
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11234351 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtg 11234450  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11234451 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 11234550  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  11234551 ggtgactacttctct 11234565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 13689173 - 13688959
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13689173 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 13689074  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | ||||  | |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13689073 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtgtctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 13688974  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  13688973 ggtgactacttctct 13688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 18587309 - 18587523
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  18587309 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtg 18587408  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18587409 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18587508  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  18587509 ggtgactacttctct 18587523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18180875 - 18180658
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  18180875 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtg 18180776  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18180775 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18180676  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  18180675 ggtgactacttctcttgt 18180658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9591454 - 9591282
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || |||| || |   | ||    
T  9591454 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcaattgtgtttctgcttcgg 9591355  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  9591354 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 9591282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 15158195 - 15158409
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15158195 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 15158294  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15158295 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 15158394  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  15158395 ggtgactacttctct 15158409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 17703593 - 17703807
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||| ||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  17703593 tttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 17703692  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17703693 ctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagttaagggttc 17703792  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  17703793 ggtgactacttctct 17703807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15114410 - 15114317
Alignment:
Q  189 ctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacg 282  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15114410 ctataactgtaaggaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcccaaactggtgggaaggtttttgctttgactggtacg 15114317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14145051 - 14144877
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||| ||| || |||| |||||||||||| || ||    
T  14145051 agcagagacttaatgatgagaggaggccatataggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtatggcgagaaaggccacaagagtaacgtttg 14144952  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgt 182  Q
    |  |   || ||||||||||| || |||||||| || || || |||   |||||||||||||||||| |||||||    
T  14144951 taccaaggaggagaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatgt 14144877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12690633 - 12690420
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |   ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||    
T  12690633 tttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtg 12690535  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||||||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12690534 ctactcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagttgagagatggtcgttgaaactccagctaagggttc 12690435  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  12690434 ggtgactacttctct 12690420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8201027 - 8200966
Alignment:
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  8201027 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 8200966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Original strand, 12712528 - 12712694
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    |||||||||||||||| || || | | | |||||  ||||| ||||||| || || || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |      
T  12712528 gactgaatgatgagagaagacccaagggaagagacactcctgttgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaa 12712627  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgat 180  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||| |||||    
T  12712628 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaaacgtggtgat 12712694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Original strand, 16726579 - 16726698
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||| ||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  16726579 tttgctttggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtg 16726678  T
Q  365 ctactcattgtttcattgct 384  Q
    |||| ||||| || ||||||    
T  16726679 ctacacattgctttattgct 16726698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 425 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10873662 - 10873608
Alignment:
Q  425 tgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10873662 tgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10873608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4442996 - 4442951
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4442996 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 4442951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7826969 - 7826924
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7826969 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 7826924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13459102 - 13459057
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13459102 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13459057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 27104975 - 27105020
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27104975 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27105020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27173350 - 27173305
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27173350 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 27173305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 333
Target Start/End: Original strand, 12712816 - 12712847
Alignment:
Q  302 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712816 gacttatcagaggtacttgtttctttaatagt 12712847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14207388 - 14207343
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14207388 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14207343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14216078 - 14216033
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  14216078 aatagtactcctttaattgcaattattaatactggcgctactcatt 14216033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 337 - 373
Target Start/End: Original strand, 38356 - 38392
Alignment:
Q  337 cctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38356 cctttaattgctattatagatactggagctacgcatt 38392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 9591753 - 9591657
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    |||||||| ||  |||||| ||| |||||| || ||  |||||||||   ||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  9591753 agcagagaatggttgatgataggcggcctaagaagaaggatgctcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgt 9591657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 85 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 13079 - 12678
Alignment:
Q  85 aaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtca 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||      
T  13079 aaaggccacaagagtaatgtatgtgaccgtgacgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttg 12980  T
Q  185 ttttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    ||| ||| || ||| |||||||||||| ||| || |||||||| | | |||||||||||| |   |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12979 tttgctacaactgtaatgaagaaggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgcgttaactggtacgca 12880  T
Q  285 aactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 384  Q
    ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12879 aacggtgaatgaggaccaacttatcaggggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 12780  T
Q  385 attaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 484  Q
     || | ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12779 gttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 12680  T
Q  485 gt 486  Q
    ||    
T  12679 gt 12678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 19716429 - 19716906
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  19716429 agcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 19716528  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||  ||||| ||  |  ||||     
T  19716529 tactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagag 19716628  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || ||||||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  19716629 ggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgactta 19716728  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19716729 tcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttggg 19716828  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19716829 tttagttgtatctgatttgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 19716906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 23274613 - 23274144
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||   |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||      ||||    
T  23274613 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgaaattgtttgcaacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaagatg 23274514  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  | ||  |  ||| |||||| ||  |||| || || | ||| ||    
T  23274513 agaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcggggagacatagtttgctataactgcaatgaggagggccatatcag 23274414  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     || |||||||   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||||||||    
T  23274413 ttcacagtgcacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaagtgtttgctctgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtact 23274314  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23274313 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacaccggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtat 23274214  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23274213 ctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 23274144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 39 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20848588 - 20848139
Alignment:
Q  39 gaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgt 138  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | ||||| | |||||| || ||||||    
T  20848588 gaggagagatgctcctgttgagattgt-tgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgt 20848490  T
Q  139 ggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagccta 238  Q
    || ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || || |||||     |||| |    
T  20848489 ggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagttcacagtgtcctgagccga 20848390  T
Q  239 agaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 338  Q
    ||||| ||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20848389 agaagactagaattggtggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcc 20848290  T
Q  339 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatg 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  20848289 tttaattgctattatagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatg 20848190  T
Q  439 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20848189 gttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 20848139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 486
Target Start/End: Original strand, 23097436 - 23097908
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| || || || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |      
T  23097436 gactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaa 23097535  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctt 213  Q
     ||| |||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||  |||  |||||||||||||| || || |      
T  23097536 agatcagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccac 23097635  T
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    || || || |||||||   |||| ||||||  |  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||| ||||    
T  23097636 atcagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggcttataagag 23097735  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagt 413  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| | ||    
T  23097736 gtacttgattctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcatttaagttgggtctggt 23097835  T
Q  414 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23097836 tgtaactgacatgaaaggagagatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 23097908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 12577384 - 12576907
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || || || |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  12577384 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgctttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 12577285  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | | |||||||||| |||||||     
T  12577284 taccaaggatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaagag 12577185  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    ||||  || ||  | |||||||   |||| ||||||| |  |   ||||| || || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| || |    
T  12577184 ggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacacagactgctaatgaggaccgcctca 12577085  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||  ||||    
T  12577084 tcagaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcctataaactggg 12576985  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  12576984 tttgattgtgtctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaatgactacttctctggtttg 12576907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 381
Target Start/End: Original strand, 19720992 - 19721365
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  19720992 agcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 19721091  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||  ||||| ||  |  ||||     
T  19721092 tactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtagtgatgttgtttgttataactgcaacaaagag 19721191  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || ||||||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||    
T  19721192 ggccatatcagttcgcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggaccgactta 19721291  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 381  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19721292 tcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 19721365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 193 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 23113568 - 23113276
Alignment:
Q  193 aattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgtta 292  Q
    |||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||  | ||||    
T  23113568 aattgtgacgaataaggtcatcttagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgactggaacacaggcagtta 23113469  T
Q  293 atgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatg 392  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | || | ||    
T  23113468 ttgaggac-gacttatcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgttgttgattg 23113370  T
Q  393 tgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23113369 tgcatataaattgggtctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 23113276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 28350906 - 28350633
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  28350906 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttg 28350807  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||||||||| ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  28350806 caatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaa 28350707  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 281  Q
    |||| | | || |||||||||| |||||||||||||||||   || |||| | ||||||||||||  |||||||    
T  28350706 ggtcatctcagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaggcaagtggaagggtgtttgctttatctggtac 28350633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 11351422 - 11351594
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  11351422 atcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 11351521  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11351522 gtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 11351594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 292 - 479
Target Start/End: Original strand, 21322962 - 21323149
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |    
T  21322962 aatgaggatcgcctaatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 21323061  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21323062 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21323149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 22733485 - 22733660
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  22733485 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcgttgatttattgcttttgattgtgctactaagttgg 22733584  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  22733585 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 22733660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Original strand, 22742638 - 22742849
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  22742638 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattggtactggtgcta 22742737  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  22742738 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 22742837  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  22742838 gactacttctct 22742849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23074595 - 23074420
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  23074595 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23074496  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23074495 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 23074420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9338356 - 9338142
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9338356 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 9338257  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9338256 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 9338157  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  9338156 ggtgactacttctct 9338142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9486990 - 9486776
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9486990 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 9486891  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9486890 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 9486791  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  9486790 ggtgactacttctct 9486776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16984014 - 16983800
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16984014 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16983915  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16983914 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16983815  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  16983814 ggtgactacttctct 16983800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17001774 - 17001560
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17001774 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 17001675  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17001674 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 17001575  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  17001574 ggtgactacttctct 17001560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 24705151 - 24705365
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24705151 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtg 24705250  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  24705251 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgcagagatggttgtcgaaactccagctaagggttt 24705350  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     ||||||||||||||    
T  24705351 ggtaactacttctct 24705365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 488
Target Start/End: Original strand, 24817506 - 24817732
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |  |||||||| ||| | || |||||||| |||   ||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  24817506 gtgtttgctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactg 24817605  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24817606 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 24817705  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||    
T  24817706 ttcggtgactacttctctagtgtgtct 24817732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 23105397 - 23105614
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | | |||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23105397 tttgctttgactggtacacagactgagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtg 23105496  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23105497 ctacgcattgttttatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23105596  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  23105597 ggtgactacttctcttgt 23105614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23065145 - 23064973
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  23065145 atcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctattaagttgg 23065046  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23065045 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttatcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 23064973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 22323011 - 22323225
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22323011 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22323110  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22323111 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22323210  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  22323211 ggtgactacttctct 22323225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24712808 - 24712594
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24712808 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24712709  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24712708 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 24712609  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  24712608 ggtgactacttctct 24712594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 44383239 - 44383453
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44383239 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 44383338  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44383339 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 44383438  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  44383439 ggtgactacttctct 44383453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24678258 - 24678047
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   | |||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  24678258 gctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgatactggtgcta 24678159  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
      |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  24678158 ggcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtctagatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaacttcagctaagggttcggt 24678059  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  24678058 gactacttctct 24678047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 479
Target Start/End: Original strand, 45673708 - 45673895
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||| |  | |    
T  45673708 aatgaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgcattgttttattgctttcgatt 45673807  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  45673808 gtgattctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 45673895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10871624 - 10871410
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10871624 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10871525  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  10871524 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 10871425  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  10871424 ggtgactacttctct 10871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27374043 - 27373829
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||| ||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27374043 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27373944  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27373943 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 27373844  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  27373843 ggtgactacttctct 27373829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220576
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 27220646  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27220645 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 27220576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Original strand, 23029133 - 23029344
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| |||||    |||||||| ||  | ||||||||||| | ||   |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23029133 gctttgactggtactcaaaccaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatcttatattaataatactcccttagttgctattattgatactggtgcta 23029232  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  23029233 cgcattgttttattgctttcgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagtgatggttgtcgaaaatccagctaagggttcggt 23029332  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  23029333 gactacttctct 23029344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21901566 - 21901366
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  21901566 cagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 21901467  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||||||||| ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| ||||||||    
T  21901466 atggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaagg 21901367  T
Q  210 t 210  Q
    |    
T  21901366 t 21901366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24265144 - 24264930
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24265144 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 24265045  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||  ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  24265044 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgagtggatagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 24264945  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  24264944 ggtgactacttctct 24264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 24874419 - 24874633
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  24874419 tttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtg 24874518  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  24874519 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaggtttc 24874618  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  24874619 ggtgactacttctct 24874633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 254 - 384
Target Start/End: Original strand, 30208578 - 30208708
Alignment:
Q  254 gtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 353  Q
    |||| |||||| | |||||  ||||||| || || || |||||||| |  || |||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30208578 gtgggaaggtgatcgctttagctggtactcagacagtgaatgaggatcatctgatcaaaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattat 30208677  T
Q  354 agatactggtgctactcattgtttcattgct 384  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30208678 agatactggtgctacacattgttttattgct 30208708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 24657369 - 24657541
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  24657369 atcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgg 24657468  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
     | | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24657469 atcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 24657541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 479
Target Start/End: Original strand, 21142771 - 21142924
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  21142771 ttaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgttttgggtcttgatttgtctgatat 21142870  T
Q  426 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  21142871 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 21142924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19817594 - 19817502
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgct 384  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19817594 aatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactactacagatactggtgctacacattgctttattgct 19817502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23205046 - 23204874
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||  |  ||||| |  | |||| || |   ||||    
T  23205046 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgcatttttgctttccattgtgtttctgctttgg 23204947  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | ||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23204946 gtcttgatgtgtctgatatgaatggagagatggttgtcgatactccagctaagggttcggtgactacttctct 23204874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 373
Target Start/End: Original strand, 22739363 - 22739431
Alignment:
Q  305 ttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    ||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22739363 ttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 22739431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22280840 - 22280771
Alignment:
Q  304 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22280840 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctagtcatt 22280771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 307 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23676650 - 23676583
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 374  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  23676650 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattg 23676583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Original strand, 11351173 - 11351219
Alignment:
Q  58 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11351173 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 11351219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Original strand, 22462943 - 22462989
Alignment:
Q  58 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22462943 gagattgtttgtttcaactgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 22462989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25131320 - 25131275
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25131320 aatagtactcatttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 25131275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 479
Target Start/End: Original strand, 41606209 - 41606269
Alignment:
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  41606209 tctgatatgaatggagagatggt-gtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 41606269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 7467 - 6987
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  7467 agcagaggttgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 7368  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||  ||||| | |||||||||     
T  7367 tactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactatgatgaagag 7268  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||||||||| |||| |||||| ||||||  |   || ||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||   || |||||| |||||||    
T  7267 gggcatattagctcgcaatgcaagaagcccaagaagattaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactggcacgcaaaccactagtgaggatcgactta 7168  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7167 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttggg 7068  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7067 tttggttgtttctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 6987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1433 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1433
Description:

Target: scaffold1433; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Original strand, 1188 - 1666
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  1188 cagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtg 1287  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||| |  ||| ||| | |||  |||| |||||    
T  1288 atagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaagg 1387  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||| || |||||||| |   |||||||||||| |   |||||||| || ||||| || |||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||||    
T  1388 tcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatc 1487  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||     
T  1488 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtc 1587  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1588 tggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtct 1666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 8171 - 7693
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  8171 cagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgagataatttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtg 8072  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||| |  ||| ||| | |||  |||| |||||    
T  8071 atagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgaatgtaagcgtggggatattgtttgctacacttgcaatgaggaagg 7972  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||| || |||||||| |   |||||||||||| |   |||||||| || ||||| || |||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||||    
T  7971 tcatatcagttcgcagtgtactcagcctaagaaggttaggacaggtggtaaagtgttcgcgttgactggcatgcagactactagtgaggaccgacttatc 7872  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||     
T  7871 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgactgtgcatataagttgggtc 7772  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7771 tggttgtatctgatacgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcggtaattacttctcttgtttgtct 7693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 96 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12301 - 11911
Alignment:
Q  96 gagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataat 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||| |  ||| ||| ||     
T  12301 gagtaatgtatgtgaccgagatgagaagaagtgtttcagatgtggacagaaaggacacacattggctgattgcaagtgtggggatattgtttgctacaac 12202  T
Q  196 tgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatg 295  Q
    ||| |||||||||| | |||||| || ||||| | | |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12201 tgtaatgaagaaggacatattagttcacagtgtacgcagcctaagaaggttcggacaggtggcaaggtatttgcgttgactggtacgcaaactgtgaatg 12102  T
Q  296 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgc 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  12101 aggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggcgctactcattgtttcattgctgttgattgtgc 12002  T
Q  396 ttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     |||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12001 atataagttgggtctggttatgtctgatatgaatggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 11911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 10 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 12371 - 12326
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctccta 55  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12371 cagaggctgaatgatgagaggaggccttagaggagagatgctccta 12326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34286
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  34755 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacattgtttgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatg 34656  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| | || ||  |||  ||||| ||  |||| ||||||| ||||||    
T  34655 agaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagttgattgtaagcgtggggacgttgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattag 34556  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     ||| |||| | | |||| ||||||| |   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34555 ttcgtagtgtacgcagccgaagaaggttaggacaggtggaaaggtgtttgccttgactggtacgcaaacagttaatgaggaccgacttattagaggtact 34456  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||||||   |||||||    
T  34455 tgtttctttaatagtactcctttaactgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgaatatgtatataagttgggtccggttgtat 34356  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34355 ctgatatgaaagtggaaatggttgttgaaattccagctaagggttcagtagctatttctcttgtttgtct 34286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 30042 - 29573
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||| || || || |||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||  | ||||    
T  30042 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgttcctactgacatagtttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatg 29943  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||| || || ||||||||  |||||||||| ||| || | ||  || |||  |||| |||  |||| ||||||| ||| ||    
T  29942 agaagaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacactctagctgattgtaagtgtggggacatcgtttgttatatttgcaatgaggaaggtcatatcag 29843  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     |||||||| | | | || ||||||| |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29842 ttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggacaggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcagacagttaatgaggaccgacttatcagaggtact 29743  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29742 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcaatgtttgattgctgttgattgtgcatataagttgggtctagttgtat 29643  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29642 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 29573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 64477 - 64955
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  64477 agcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 64576  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  64577 taccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagag 64676  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| || |||||||   | || ||||||| |  ||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  64677 ggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtctta 64776  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||      
T  64777 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaa 64876  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64877 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagcaaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 64955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 49055 - 49533
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
T  49055 agcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttg 49154  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  49155 taccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagag 49254  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| || |||||||   | || ||||||| |  ||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  49255 ggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtctta 49354  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||      
T  49355 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaa 49454  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49455 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 49533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 58089 - 58567
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||| |||||||||  |||||| || |||| ||||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
T  58089 agcagagactgaatgatgaaaggaggccgaataggagggatgctcctgctgagatagtttgttacaagtgtggcgagaagggccacaagagtaatgtttg 58188  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  58189 taccaaggatgagaagaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctaattgcaagcgtggtgatgtagtttgctataattgtgatgaagag 58288  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| || |||||||   | || ||||||| |  ||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  58289 ggccatattagttcacagtgcacacaaccgaagaaggttagaactggtaggaaagtgtttgctttggctggtacgcagactactaatgaggaccgtctta 58388  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||      
T  58389 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagaatgtgcgtataagttgaa 58488  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58489 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggctgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 58567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 489
Target Start/End: Original strand, 39208 - 39689
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  39208 agcagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttg 39307  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||  |||| |||    
T  39308 tgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaa 39407  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| |   |  | ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||    
T  39408 ggtcgtatcagttcgcagtgtacacaatcgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactta 39507  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  39508 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttggg 39607  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39608 tttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 39689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 362 - 488
Target Start/End: Original strand, 44656 - 44782
Alignment:
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44656 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccaactaaggg 44755  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  44756 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 44782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 5152 - 4870
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||| ||| ||||||||| |||   |  |||| |  || ||| |||||||||||||||| || |  ||||||||    
T  5152 atgaagaaggtcatattgggtcgcaatgcaagaaacctaagaagactcagtctagtggaagagttttttctttgactggtacgcagacagagaatgagga 5053  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||| | || |||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| |    
T  5052 tcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttatttctattgattgtgcttct 4953  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4952 aagttgggttttgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtttagtaactacttctcttgt 4870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 14554 - 14382
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | || | || |   ||||    
T  14554 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgctttattgctttcgattgcgtttctgctttgg 14455  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  14454 gtcttgatttgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 14382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 23 - 488
Target Start/End: Original strand, 23563237 - 23563702
Alignment:
Q  23 atgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaa 122  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  23563237 atgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatgagaa 23563336  T
Q  123 gaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcg 222  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||| || | ||     |||  ||||| ||  |||| ||||||| |||||| |||    
T  23563337 gaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgactgtaagggtggagacaatgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattagttcg 23563436  T
Q  223 cagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 322  Q
    ||||| | | |||| ||||||| |   || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563437 cagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtt 23563536  T
Q  323 tctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctga 422  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| | | | |||||||    
T  23563537 tctttaatagtactcctttaattgatattatagaaactggtgctactcaatgtttaattgctattgaatgtgcatataagttgggtatggatatatctga 23563636  T
Q  423 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23563637 tatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 23563702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Original strand, 23077968 - 23078436
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  ||||   | ||    
T  23077968 tgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtatgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagcaatgcttgtggtagaga 23078067  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||  |  ||| ||| || ||  | |||||||||| |||     
T  23078068 tgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggtcatatc 23078167  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||  |||| |   |||| |||||||||   || ||||| || |||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23078168 agttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactagtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggta 23078267  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  23078268 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgcaattgaatgtgcttataagttgggtttggatgt 23078367  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23078368 atctgatatgaagggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 23078436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Original strand, 21983231 - 21983709
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| || |  | ||||||||| || | |||||||||||||||  |    
T  21983231 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgctataggtgtggtgagaagggccacaagagtaatgttcg 21983330  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||||||||| ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  |||| || ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  21983331 caatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaa 21983430  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  21983431 ggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaggcaggtggaaaggtgtttgcattgactgttacgcagacagttaatgaggaccgactta 21983530  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||    
T  21983531 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattactattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttggg 21983630  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | | ||| | ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21983631 tctggttatgtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 21983709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Original strand, 14884058 - 14884526
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  14884058 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctccagctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgggagagatgat 14884157  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  || ||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| |||||| |    
T  14884158 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttggctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatattagtt 14884257  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| | |||| ||  ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14884258 cacagtgtcctgagccgaggaagactagaattggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 14884357  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| |||    
T  14884358 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttagatgtgtct 14884457  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14884458 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 14884526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20345583 - 20345115
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     |||||     
T  20345583 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaagcccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgat 20345484  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||   ||| ||| ||||||||| | ||  |  | | ||| || ||  |||  ||||||| |||||| |    
T  20345483 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagttgaatgcaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggggaaggtcatattagtt 20345384  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20345383 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttaactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 20345284  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20345283 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 20345184  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20345183 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataaccacttctcttgtttgtctg 20345115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 22505984 - 22505512
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||     ||    
T  22505984 tgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaaga 22505885  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
     |||| |||||| || |||||||| ||||  ||||| |  |||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| ||||  ||     
T  22505884 cgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagatgggacatagcttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcacatc 22505785  T
Q  217 agctcgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    || || ||||| |  ||| || ||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  22505784 agttcacagtgtcctgaa-ccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcaaaggt 22505686  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  22505685 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatg 22505586  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22505585 tatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtctg 22505512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 25851373 - 25850905
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||     |||||     
T  25851373 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcttgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggtaaagatgat 25851274  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||   ||||||| | ||||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| |||||| |    
T  25851273 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtctagctgaatacaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatattagtt 25851174  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25851173 cacagtgtcctgagccgaagaaggctagaactggtgggaaggtatttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtcttatcagaggtacttg 25851074  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  25851073 tttctttaatagtactcatttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcctataagttgggtttggatgtatct 25850974  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25850973 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaaaggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 25850905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Original strand, 21561088 - 21561557
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| || |||||||||||| | || | |||||||||||||||  |  |  |||     
T  21561088 tgaatgatgagaggagacctaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgcttcaagtgtggtaagaagggccacaagagtaatgttagcaatggtgt 21561187  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||| ||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  ||||  | |||||| || ||||| |  ||| ||  |||||||| |||||||||| | ||    
T  21561188 tgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcgaaatgcaagtgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctt 21561287  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21561288 agttcgcagtgcaggaagcataagaaggcttaggcaggtggaaaggtgtttgcattgactggtatgcaaacagttaatgaggaccgacttatcagaggta 21561387  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||| | ||| |    
T  21561388 cttgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatactggtgctacacattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttaggtatggttat 21561487  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21561488 gtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgt 21561557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 17266388 - 17266865
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || | ||| |||||||||  |||||| || ||||| |||||||| || ||||  ||||||||||| || ||    
T  17266388 agcagagacttaatgatgagaggaggccgagtaagagggatgctcctgctgagatagtgtgttttaagtgtggcgagaaaggtcacaagagtaacgtttg 17266487  T
Q  108 tgaccgtg-atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaaga 206  Q
    | |||| | ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||   |||| |||||||||||  |||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  17266488 t-accgaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgctagccgattgcaagcgcggtgatgttgtatgctataattgtaatgaaga 17266586  T
Q  207 aggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactt 306  Q
     ||||  || ||  | |||||||   |||| ||||||| |  |   ||||| || || |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| ||     
T  17266587 gggtcacatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagagttggtggaaaagtttttgctttgactggtacctagactgctaatgaggaccgtctc 17266686  T
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||| |||||    
T  17266687 atcaaaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataggttgg 17266786  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    ||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17266787 gtttgtttgtgtctaacatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 17266865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 268 - 488
Target Start/End: Original strand, 28892256 - 28892476
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28892256 gctttgactggtactcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatggtactcctttaattgctattatagacactggtgcta 28892355  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28892356 cgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagt 28892455  T
Q  468 aactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  28892456 aactacttctctggtgtgtct 28892476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 259 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 20778976 - 20778753
Alignment:
Q  259 aaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 358  Q
    ||||| || |||||||||||||  || |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20778976 aaggtattcgctttgactggtaatcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaca 20778877  T
Q  359 ctggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaa 458  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20778876 ctggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaa 20778777  T
Q  459 gggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  20778776 gggttcagtgactacttctcttgt 20778753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20824510 - 20824296
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20824510 tttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 20824411  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20824410 ctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggtctgattatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttc 20824311  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
    |||||||||||||||    
T  20824310 agtaactacttctct 20824296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 17 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 22465255 - 22464790
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||| ||||  || | |||| ||| |||||||  || | ||||||||||||||  ||   ||  ||    
T  22465255 tgaatgatgagaggcagcctaaggggagaaatgctcctgttgatgttatttgttacaaatgtggtgtgaagggccacaagagtaatgcttgcatccaaga 22465156  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| || || |  || ||||| ||||||||| | ||| || |||  | ||||||||  || || || |  |||    
T  22465155 tgagaagaaatgtttcagatgcggtcagaagggtcatatgttggctgaatgcaagcgtggagatatcgtttgttttaattgtggcgatgagggccacatt 22465056  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||    ||  || || ||||| || |||||||||||||| || |||   || ||||| ||||||||||||||||    
T  22465055 agctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaattggagggaaggttttcgctttgactggtacccagactaccaacgaggatcgacttatcagaggta 22464956  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  || ||||    
T  22464955 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggcctaattgt 22464856  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22464855 atctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 22464790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 200 - 479
Target Start/End: Original strand, 21631645 - 21631924
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  21631645 atgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcagactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacacagacagtgaatgagga 21631744  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
    |||  | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |    
T  21631745 ccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgcattgttttattgctgttgattgtgcttct 21631844  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||| | ||| | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21631845 aagttgggtcttgttatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21631924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 25429454 - 25429279
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | | ||||  ||||||||    
T  25429454 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattttgctactaagttgg 25429355  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25429354 gtcttgttatgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 25429279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 26736038 - 26736255
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26736038 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 26736137  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| || ||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  26736138 ctacacattgttttatttctattgattgtgcttctatgttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttt 26736237  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  26736238 ggtgactacttctcttgt 26736255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 23669946 - 23669670
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |  | | |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||    
T  23669946 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgctcctgctgagattgtttcctaccagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttg 23669847  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| || || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  || ||||| ||||||    
T  23669846 caatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaaatgtgacgaagaa 23669747  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    ||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   || |||| | ||||||||||||  ||||||||||    
T  23669746 ggtcaccttagctcgcagtgcaagaatcctaagaaggctcagtcaagtggaagggtgtttgctttagctggtacgca 23669670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 14997050 - 14997264
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14997050 tttgctttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 14997149  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14997150 ctacacattgttttattgcttttgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 14997249  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  14997250 ggtgactacttctct 14997264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 16258092 - 16258326
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  16258092 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 16258191  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||||||| |||||    
T  16258192 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 16258291  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  16258292 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 16258326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 16359577 - 16359363
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16359577 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 16359478  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16359477 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 16359378  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  16359377 ggtgactacttctct 16359363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 22330198 - 22330412
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || | ||| ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22330198 tttgctttgactggtactcagacagataacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22330297  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22330298 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22330397  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  22330398 ggtgactacttctct 22330412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 29473384 - 29473598
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29473384 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 29473483  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29473484 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 29473583  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  29473584 ggtgactacttctct 29473598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 34569569 - 34569355
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34569569 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 34569470  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34569469 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 34569370  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  34569369 ggtgactacttctct 34569355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 40711855 - 40711641
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40711855 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 40711756  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40711755 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 40711656  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  40711655 ggtgactacttctct 40711641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 23474270 - 23474053
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| |||||||||| ||| || |  |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  23474270 tttgcattgactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtg 23474171  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| | | | |  |  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23474170 ctacacattgttttattgctattgattgtacttctaagttgggtctggctatgacgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23474071  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  23474070 ggtgactacttctcttgt 23474053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 21882807 - 21882635
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  21882807 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 21882708  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21882707 gtcttgctatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21882635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 22591811 - 22592045
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  22591811 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 22591910  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | || ||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||||||| |||||    
T  22591911 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgggggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 22592010  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22592011 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 22592045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 244
Target Start/End: Original strand, 22595366 - 22595600
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||      
T  22595366 cagagattgactgatgagaggagacctaagaggagagatgatcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgca 22595465  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |  |||| ||||||||||| ||  | || ||  ||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||||| |  |||  |  ||||||||||| |||||    
T  22595466 atggtgaggagaagaagtgcttccgatgggggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaagg 22595565  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaagg 244  Q
    || | |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  22595566 tcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 22595600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27521481 - 27521267
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27521481 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27521382  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27521381 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttggtttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 27521282  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  27521281 ggtgactacttctct 27521267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 37288807 - 37289021
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37288807 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 37288906  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37288907 ctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 37289006  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  37289007 ggtgactacttctct 37289021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41773917 - 41773703
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41773917 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 41773818  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41773817 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41773718  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  41773717 ggtgactacttctct 41773703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 21870332 - 21870437
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21870332 agcagaaattgaatgatgggaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttg 21870431  T
Q  108 tgaccg 113  Q
    ||||||    
T  21870432 tgaccg 21870437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 113
Target Start/End: Original strand, 21874612 - 21874717
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21874612 agcagaaattgaatgatgggaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaagaccacaagagtaatgtttg 21874711  T
Q  108 tgaccg 113  Q
    ||||||    
T  21874712 tgaccg 21874717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18782147 - 18781975
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  18782147 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 18782048  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18782047 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgttgaaactccagctaagggttccgtgactacttctct 18781975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 27613431 - 27613217
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27613431 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27613332  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  27613331 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttc 27613232  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  27613231 ggtgactacttctct 27613217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Original strand, 27682711 - 27682925
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27682711 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 27682810  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27682811 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 27682910  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  27682911 ggtgactacttctct 27682925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 19772993 - 19772821
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  19772993 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 19772894  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  19772893 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccggctaagggttcggtgactacttctct 19772821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 265 - 408
Target Start/End: Original strand, 21332297 - 21332440
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || |  |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21332297 tttgctttgactggtactcagatagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 21332396  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 408  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  21332397 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggt 21332440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 23461046 - 23460832
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||  | || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  23461046 tttgctttgactggtacttagaccgagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtg 23460947  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||  ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23460946 ctacccatgtttttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23460847  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  23460846 ggtgactacttctct 23460832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 22350952 - 22350784
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  22350952 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 22350853  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 475  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22350852 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactactt 22350784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 27665843 - 27666015
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  27665843 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 27665942  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||    
T  27665943 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccgactaagggttcggtgactacttctct 27666015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 257 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21410217 - 21410090
Alignment:
Q  257 gcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattataga 356  Q
    ||||||||||||||||  |||||||  | || |  |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21410217 gcaaggtgtttgctttagctggtacttagacagagaatgaggatcgtctgatcagaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactatcataga 21410118  T
Q  357 tactggtgctactcattgtttcattgct 384  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21410117 tactggtgctacatattgttttattgct 21410090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22137743 - 22137529
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  22137743 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtg 22137644  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
     ||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22137643 atacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22137544  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  22137543 ggtgactacttctct 22137529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 20803611 - 20803458
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || ||  |||||| | | | | ||||||||    
T  20803611 ttaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctactttgggtctcgctttgtctgatat 20803512  T
Q  426 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  20803511 gaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctct 20803458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23526123 - 23525952
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    ||||||| |||||| ||||| |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  23526123 gctttgattggtactcaaaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcaa 23526024  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 439  Q
    | |||||||| |||||| |  | ||||||| || ||||||| | | | | ||||||||||| ||||| ||||    
T  23526023 cacattgttttattgctttcgattgtgcttctacgttgggtcttgatatgtctgatatgaatggagagatgg 23525952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 479
Target Start/End: Original strand, 21342878 - 21342939
Alignment:
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21342878 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 21342939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 43122781 - 43122508
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |   |||||||| || | ||||||||| || |  | ||||||||||||||| ||    
T  43122781 agcaaagattgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgttcatgcagagattgtttgctacaagtgtggcgagaggggccacaagagtaatgtctg 43122682  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| || ||  |  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  43122681 caatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaa 43122582  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 281  Q
    || | | | || || ||||| |   |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43122581 ggacatctcagttcacagtgtacacagcctaagaaggttaggacaggtggcaaggtgtttgctttagctggtac 43122508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23508678 - 23508633
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23508678 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 23508633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24584204 - 24584159
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24584204 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24584159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 103
Target Start/End: Original strand, 26735793 - 26735877
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| || | ||  ||| |||| |||| ||| ||||||||||    
T  26735793 aatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctacacttgttgtgagaaaggccataagagtaatg 26735877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23526345 - 23526288
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  23526345 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatg 23526288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 326135 - 325656
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  326135 agcagaggctgaatgatgagaggaggccaat-aggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgagaaagaccacaagagtaatgtctg 326037  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||    |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||  |||  ||||| ||  |||||||     
T  326036 tgataaagatgagaagaagtgcttcaagtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgttataactgcaatgaagag 325937  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || || |||||||   | || ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||    
T  325936 ggccatatcagttcacagtgcacacaaccaaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactta 325837  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  325836 tcagaggtacttgtttctttaatattactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttggg 325737  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  325736 tctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 325656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 491
Target Start/End: Original strand, 200361 - 200826
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| | ||||| ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||  |  ||||    
T  200361 tgaatgatgagaggagacctaagagaagagaagttcctaatgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtga 200460  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| ||  | |||||  ||||||| || ||  |||| || ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| |||||||||| | ||    
T  200461 tgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctt 200560  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||||| ||||||||||| || ||   ||||||| ||||||         ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  200561 agttcgcagtgcaagaagcctaagagggttcaggcaggtggaaaggtg---------actggtacgcagacggttaatgaggaccgacttatcagaggta 200651  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||| |    
T  200652 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactagtgctacacattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttat 200751  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgat 491  Q
     ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  200752 gtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctcgtttgtttgat 200826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 8 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 319672 - 319507
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  || |||||| || | ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  319672 agcagaggctgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgggattgtttgctacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctg 319573  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcg 173  Q
    |||    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  319572 tgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcg 319507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 16 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 9035 - 8563
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||| || || | ||||||||||||||| |||      |    
T  9035 ctgaatgatgagagaagacccaagaggagagatgctcctgatgagattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttgtactaaag 8936  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||| || ||  | |||||||| | |||    
T  8935 atgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacattgtttgctacaactgcaacgaagaaggccatat 8836  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
     || ||||||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||    
T  8835 cagttcgcagtgcactcaaccgaagaaggttagtaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcatactactagtgaggatcgacttatcagaggt 8736  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  8735 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggttg 8636  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8635 tatctgatataaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 8563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Original strand, 769 - 1238
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||  | ||||    
T  769 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctaccgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaacgtttgtgatagagatg 868  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||| | ||  |  |||  ||||| ||  |||| ||||||| ||| ||    
T  869 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggatacactctagctgattgtaagcgtggggacattgtttattataactgcaatgaggaaggtcatatcag 968  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     |||||||| | | | || ||||||| |   || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  969 ttcgcagtgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcagaggtact 1068  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || | |||||  ||||||||||| |  ||||||    
T  1069 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagctactggtgctactcattatttcattgttgttgattgtgcgcataagttgggtctgattgtat 1168  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1169 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 1238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 16 - 488
Target Start/End: Original strand, 5092 - 5564
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    |    
T  5092 ctgaataatgagaggtggcctaggaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggcgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgataagg 5191  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||  |||| || || | |||    
T  5192 atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacactttagctgattgtaagcggagagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatat 5291  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
     || ||  |||| |   | || ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||    
T  5292 cagttcatagtgtacataaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactactgaggatcgacttatcagaggt 5391  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||    
T  5392 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacgctggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttg 5491  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5492 tatctaatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 5564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52078 - 51716
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52078 cagaggctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctactgagattatctgtttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtg 51979  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    | || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  51978 atcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtaagaaaggacacactttagcttattgcaagcatggtgatgttgttttctataactgtgatgaagaagg 51879  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    |  |||||| || ||||| | | |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||    
T  51878 taatattagttcacagtgtacgcagccaaagaaggttcggacaggtggcaaggtgtttactttgactggtacgcagattgtgaatgaggactgacttatc 51779  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcat 372  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51778 agaggtacttatttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactcgtgctactcat 51716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 484
Target Start/End: Original strand, 701 - 1166
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  701 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctacggacattgattgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtgatagagatg 800  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| | ||  |  |||  ||||| ||  | || ||||| | ||| ||    
T  801 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatatcag 900  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     |||||||| | | |||| ||||||| |   || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  901 ttcgcagtgtacgcagccaaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgaccggtacgcaaacaactaatgaggacagacttatcaaaggtact 1000  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| | | |||||    
T  1001 tgtttctttaatagtactcccttaattgctattatagacactagtgctactcattgttttattgctattgattgtgcatataagttgggtctggctgtat 1100  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 484  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1101 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 1166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 37368 - 36888
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||| ||| ||| | || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  37368 agcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagacactcctactgatattttttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 37269  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||    |||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||| || | ||| |  ||| |||||| ||  |||| |||    
T  37268 tgataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacacactagctgattgtaagtgtggggatattgtttgctataactgcaatgaggaa 37169  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || || ||||| | | |||| ||||||| |   || ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||| ||| ||||||    
T  37168 ggtcatatcagttcacagtgtacgcagccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgttttctttgaccggtacgcaaacaactaatgaagacagactta 37069  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| || ||||||||    
T  37068 tcataggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatacaagttggg 36969  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36968 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgtct 36888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 22546 - 22071
Alignment:
Q  13 agactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |        
T  22546 agactgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgttgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttacta 22447  T
Q  113 gtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtct 212  Q
      ||||||||||| || || | |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||  ||||||| || |     
T  22446 aggatgagaagaaatgcttcaagtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagagggcca 22347  T
Q  213 tattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcaga 312  Q
    ||| || || |||||||   |||| ||||||| |  ||| | ||| |  |||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||    
T  22346 tatcagttctcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgttggtatagtgtttgcattgactggtactcagactactaatgaggaccgacttatcaga 22247  T
Q  313 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttag 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |    
T  22246 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattggtattatagatactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcatatatgttgggtttgg 22147  T
Q  413 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactttagctaagtgttcagtaactacttctcttgtttgtct 22071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 21241 - 20763
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||     
T  21241 cagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgcttctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgta 21142  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
         | |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||  | ||  | |||| |||||| ||  |||| || ||    
T  21141 ctaaaggtgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggacacacattagttgattgtaagcggggagacataatttgctataactgcaatgaggaggg 21042  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
     | ||| || || ||||| |   | || ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| | |||||||    
T  21041 ccgtatcagttcacagtgtacacaaccgaagaaggttagaaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactattgaggatctacttatc 20942  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20941 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtc 20842  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841 tggtcgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Original strand, 362 - 836
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || |||| ||| |||||    |||| |||||||||| |||| ||    
T  362 agcagatattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagatcgtttgttacaaatgtggcaggaaaggccacaagagtgatgtttg 461  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| ||  |||||||     
T  462 taccaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacagcctagctgattgcaagcgtggtgatgttgtttgctataactgcaatgaagag 561  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || || |||||||   |||| ||||||| |  ||| | ||| || |||||||| ||||||||||| || |||  |||||||||||||||||    
T  562 ggccatatcagttcacagtgcacacagccgaagaaggttagaaccgatgggaaagtgtttgcattgactggtacacagactactaatgaggaccgactta 661  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  662 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctacacaatgtttaattgctatagaatgtgcatataagatggg 761  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    | ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  762 tataaaaatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 10 - 488
Target Start/End: Original strand, 1829 - 2307
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||  ||| ||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  1829 cagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggatagatgctcctgctgaaattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtg 1928  T
Q  110 accgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaagg 209  Q
    |    |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||  ||| |||||| ||  |||| |||||    
T  1929 ataaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcggggagacgttgtttgctataactgcaatgaggaagg 2028  T
Q  210 tcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatc 309  Q
    || ||| || |||||||| |   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |   || |||| |    ||||||    
T  2029 tcatatcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaacccactagtgagaagatgcttatc 2128  T
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  2129 agaggtacttgtttctttaatagtattcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgttcttataagttgggtc 2228  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2229 tggttgtatctgatatgaaaggggatatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 2307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 70792 - 70323
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||   |   ||    
T  70792 tgaatgatgagaggcggcctagggggagagatgctcctgttgatgttgtttgttacaagtgtggtgcgaaaggccacaagggtaatgtctgcaccaaaga 70693  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||||||||| || || || || ||||| ||    || ||||| ||||||||| | ||| |  |||  ||||| ||| |||| || || |  |||    
T  70692 tgagaagaagtgtttcagatgcggtcataaaggtcatgtgttggctgaatgcaagcgtggagatattgtttgttataactgtaatgaggagggccacatt 70593  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || ||||||| | | ||||||||||    ||| || || || || |||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||    
T  70592 agttcacagtgcacgcaacctaagaaggtcagaactggaggaaaagtatttgttttgactggtacgcagactaccaatgaggatcgacttatcagaggta 70493  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  70492 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttctttgctttagaatgtgcatataagttgggtctgattgt 70393  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  70392 atctgatatgaaaggagaaattgttgttgaaactctagccaagggttcagtaactacttctctagtttgt 70323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Original strand, 11781 - 11952
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  11781 agcagagacttaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 11880  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtga 179  Q
    |      |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  11881 tactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtga 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 43 - 486
Target Start/End: Original strand, 3999 - 4442
Alignment:
Q  43 agagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggac 142  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||      
T  3999 agagatgctcctactgagattgtctgtttcaagtttggtgaaaagggaaacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagatgtgtttcctgtgtggga 4098  T
Q  143 agaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctat---aattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaa 239  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | | ||   |||| ||| |   ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||    
T  4099 agaaaagacacacaatagctgagtgcaaacatggaga---cattgtctgtttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatccaggaagcctaa 4195  T
Q  240 gaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 339  Q
    ||||||||  ||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4196 gaaggctcagacaagtggaaaggtgttttcattgaccggtacatggacggttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcct 4295  T
Q  340 ttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatgg 439  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| || || | ||   |||||  ||||||||||    
T  4296 ttaattgctattattgatactggtgctactcattgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctacttatgtcaagtatgagtggagaaatgg 4395  T
Q  440 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4396 ttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttcttttgtttgt 4442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 738 - 775
Alignment:
Q  11 agagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagat 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  738 agagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagagat 775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 252039 - 251574
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||  ||||   | ||    
T  252039 tgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcttgttgagattgtgtgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaaaagctatgcttgtggtagaga 251940  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||  |  ||| ||| || ||  | |||||||||| |||     
T  251939 tgagaggaaatgttttaggtgtggtcagaaaggacacacactagctgaatgtaagcgtggagacattgtttgctaaaactgcaacgaagaaggtcatatc 251840  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || ||||| |   ||||   |||||||   || |||||  | |||||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  251839 agttcacagtgtactcagcc---gaaggctaggaccggtggggaagtgtttgcatggactggtacgcagactactaatgaggaccggcttatcagaggta 251743  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  251742 cttgtttctttaatagtacttctttaattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgt 251643  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  251642 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 251574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 374
Target Start/End: Original strand, 230026 - 230093
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattg 374  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  230026 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattg 230093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 6223 - 5754
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  6223 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcttactgacattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatg 6124  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  |  |||  ||||| ||  | || ||||| | ||||||    
T  6123 agaagaagtgcttcagatgtggtcagaaaggacacacactagctgattgcaagcgtggggacattgtttgttataactgcaacgaggaaggacatattag 6024  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtact 318  Q
     || ||||| |   | || ||||||| |   || ||||| || ||||||||| | |||| |||||||||   ||  |||||| | |||||||||||||||    
T  6023 ttcacagtgtacacaaccgaagaaggttaggaccggtggtaaagtgtttgctctaactgatacgcaaaccactagcgaggacaggcttatcagaggtact 5924  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  5923 tgtttctttaatagtactcctttaattgttattatagatactagtgctactcattgtttcattgctatttaatgtgcatataagttgggtctggttgtat 5824  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5823 ctgatatgaaagaagaaatggttgttgaaactccagctatgggttcagtaactacttctcttgtttgtct 5754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 261 - 477
Target Start/End: Original strand, 41236 - 41452
Alignment:
Q  261 ggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatact 360  Q
    ||||||||||||  ||||||| || || |  |||||||| |  || ||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41236 ggtgtttgctttagctggtactcagacagcgaatgaggatcatctgatcagaggtacatgttacattaatagtactcccttaattactattatagatact 41335  T
Q  361 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 460  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | | |||| ||  || |||||| | ||| | ||   |||||| || ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  41336 ggtgctacacattgttttattgctgctgattgtgtttcgaaattgggtcttgttatgtcatctatgaatggggaaatggttgtcgaaacttcggctaagg 41435  T
Q  461 gttcagtaactacttct 477  Q
    |||| || |||||||||    
T  41436 gttcggtgactacttct 41452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Original strand, 8337 - 8817
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||| ||||| ||||  |||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
T  8337 agcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgctcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttg 8436  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||| ||  ||||| |     
T  8437 tactaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatag 8536  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || ||||||||||   | || ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| |||||||    
T  8537 ggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgactta 8636  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  8637 tcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttagg 8736  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8737 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 8817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Original strand, 18551 - 19031
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||| ||||| ||||  |||||||| || || | ||||||||||||||| ||    
T  18551 agcagaggctgaatgatgagaggagacccaagaggagagatgctcatgttgatattgtttgttataagtgtggcgagaatggccacaagagtaatgtttg 18650  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||| ||  ||||| |     
T  18651 tactaaggatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagctgattgcaagcgtggtgacgttgtttgttataactgcaatgaatag 18750  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || ||||||||||   | || ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  || |||||| |||||||    
T  18751 ggccatatcagttcgcagtgcaatcaaccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactagtgaggatcgactta 18850  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  18851 tcagaggtacttgtttctttaatagtaatcctttaattgctattatagacactagtgctactcaatgtttcattgctatcgaatgtgcttataagttagg 18950  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18951 tctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 19031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 17 - 488
Target Start/End: Original strand, 9656 - 10127
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||| ||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    ||    
T  9656 tgaatgatgagaggaggccaaacaggagagatgctcctgctgatattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtctgtgataagga 9755  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||  |||| || || | |||     
T  9756 tgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagttgattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggagggccatata 9855  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || || || || | | | || ||||||| |   || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||||| |||||    
T  9856 agttcacaatgtacgcaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcaaaggta 9955  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||    
T  9956 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatttgcttataagttgggtctggttgt 10055  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10056 atctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttgtct 10127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 24119 - 24294
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||| |    
T  24119 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactagtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttag 24218  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24219 gtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 24294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 11397 - 10928
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||   | ||    
T  11397 tgaatgatgataggagtcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagaga 11298  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||| || ||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||||||| |||| |||     
T  11297 tgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacgcactagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatgaagagggtcatatc 11198  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    ||||| ||||| |   |||| |||||||||   || || || ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11197 agctcacagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggagggaaggtgtttgcgttgactggtacgcagactattaatgaggaccgacttatcagaggta 11098  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |  || |||| ||||||||||||||  ||||    
T  11097 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatttttttagaaagtgcatataagttgggtttgattgt 10998  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10997 atctgatatgaaaggagaaatacttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 10928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 43 - 488
Target Start/End: Original strand, 764 - 1209
Alignment:
Q  43 agagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggac 142  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||  | |||| ||| ||||||||||| |||      |||||||||||||| || |||||||| |    
T  764 agagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggcaagaaaggccataagagtaatgtttgtactaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtc 863  T
Q  143 agaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaa 242  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |  |||  ||||| ||  ||||||| |||| ||| || || ||||| | | | || | |||    
T  864 agaaaggacacactctagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgttataactgcaatgaagagggtcatatcagttcacagtgtacgcaaccgaggaa 963  T
Q  243 ggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 342  Q
    || |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||   || |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  964 ggttagaaccggtggtaaagtgtttgctttgactggtatgcaaaccactagtgaggatcgaattatcagaggtacttgtttctttaatagtactccttta 1063  T
Q  343 attgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttg 442  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1064 attgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatatgatatgaaaggagaaatggttg 1163  T
Q  443 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1164 ttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtgtgtct 1209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 17 - 489
Target Start/End: Original strand, 514237 - 514709
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||     ||    
T  514237 tgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaaga 514336  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
     |||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||  ||| |||| || ||| || | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| |||     
T  514337 cgagaggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagcttaactgaatgtaagtgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatatc 514436  T
Q  217 agctcgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    || || ||||| |  ||| || ||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||    
T  514437 agttcacagtgtcctgaa-ccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggt 514535  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  514536 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatg 514635  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  514636 tatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 514709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 496192 - 495975
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  496192 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtg 496093  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  496092 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttcgaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 495993  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  495992 ggtgactacttctcttgt 495975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 441824 - 441602
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||| | || ||| |||| ||||  ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  441824 tttgctttgactggtac-catacagagaatgaggatcgattgattagaagtacatgttattttgacagtactcctttagttgctattattgatactggtg 441726  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    ||||  ||||||| |||||| || | ||||||| ||| |||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  441725 ctacggattgttttattgctcttgattgtgcttctaaattgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 441626  T
Q  465 agtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
     || ||||||||||| || |||||    
T  441625 ggtgactacttctctagtgtgtct 441602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 242
Target Start/End: Original strand, 168131 - 168210
Alignment:
Q  163 gattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaa 242  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| |||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  168131 gattgcaatcgtcatgatgtagtttgctataactgtaaggaagaaggtcatattagttcgcagtgaaagaagcctaagaa 168210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 42151 - 41683
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | |||||     
T  42151 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgat 42052  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| ||||||||| | ||  |  | |  || || ||  |||  ||||||| ||| || |    
T  42051 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggggaaggtcatatcagtt 41952  T
Q  221 cgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 320  Q
    | |||||     |||| |||||| ||  ||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41951 cacagtgtcctgagccgaagaagactagaattgggggaaaggtgtttgctttgactggtacgcagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttg 41852  T
Q  321 tttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatct 420  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||    
T  41851 tttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatatatct 41752  T
Q  421 gatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41751 gatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 41683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 484
Target Start/End: Original strand, 164285 - 164752
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||      ||    
T  164285 tgaatgatgagaggaggcccaataggagagacgctcctgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgttctaagga 164384  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||  |||  ||||| ||  |||||||||| | |||     
T  164385 tgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaaaggacacactttagttgattgcaagcgtggtaatgttgtttgttataactgcaatgaagaaggccatatc 164484  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||||| |  |   |||| ||||||| |  ||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | |||  || |||||||||||||||||||||||    
T  164485 agttcgcattatactcagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgcattgaccggtacgtagactactagtgaggaccgacttatcagaggta 164584  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |    
T  164585 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgccattgaatgtgcttataagttgggtctggttat 164684  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgttt 484  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  164685 atctgataagaaaggggaaatggttgttgaaactccagcaaatggttcaataactacttctcttgttt 164752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 47115 - 47331
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  47115 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactattattgattctggtg 47214  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  47215 ctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaa-ggttc 47313  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  47314 ggtgactacttctcttgt 47331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 268 - 479
Target Start/End: Original strand, 30709 - 30920
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || ||||  |||||||| ||  | ||||||||  | ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30709 gctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggagcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 30808  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| || | ||||||| |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  30809 cgcattgttttattgcttttgattgtgcttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 30908  T
Q  468 aactacttctct 479  Q
     |||||||||||    
T  30909 gactacttctct 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 152100 - 152036
Alignment:
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  152100 tctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 152036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 103
Target Start/End: Original strand, 30487 - 30544
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  30487 gatgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatg 30544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 203810 - 203332
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  203810 agcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctggtgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 203711  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||   ||||| |||||||||  | |||||||  | |  ||||| ||| | |||||     
T  203710 taccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaagag 203611  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| ||  | |||||||   || | ||||||| |  |||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||    
T  203610 ggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggctta 203511  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  203510 ttagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttggg 203411  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203410 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 203332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 424438 - 424266
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||     | |||| || |   |||     
T  424438 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcctacgattgtgtttctgctttga 424339  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  424338 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 424266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 21 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 877 - 409
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||     ||||||    
T  877 tgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaagatgag 778  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || ||||| || ||||| || ||||  |||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  ||| ||| |||| ||| || |    
T  777 aggaagtgcttcaggtgcggtcagaagggtcacaatttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctacaactgcaatggagagggtcatataagtt 678  T
Q  221 cgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtactt 319  Q
    | ||||| |  ||| || ||||||| |  ||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  677 cacagtgtcctgaa-ccgaagaaggttagaactgggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactt 579  T
Q  320 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  578 gtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctagtcattgttttattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggatgtatc 479  T
Q  420 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  478 tgatatgaaaggggaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 8 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 263655 - 263177
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  263655 agcagagactgaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 263556  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||   ||||| |||||||||  | |||||||  | |  ||||| ||| | |||||     
T  263555 taccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcaccttttagcggattgcaaggatggtgatgttgtatgttataactgtaacgaagag 263456  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| ||  | |||||||   || | ||||||| |  |||  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||    
T  263455 ggccatatcagtacacagtgcacacagtcgaagaaggttagaactagtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggacaggctta 263356  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||    
T  263355 ttagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttggg 263256  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  263255 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 263177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Original strand, 30210 - 30679
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||   | ||    
T  30210 tgaatgatgacaggaggcccaagaggaaagatgctcctgctgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagaga 30309  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| || |||  | | ||  |  | | ||| || ||  | |||||||||| |||     
T  30310 taagaggaaatgttttaggtgtggtaagaaaggacacaaactagctgaatgtaagaatggggacattgtatgctacaactgcaaagaagaaggtcatatc 30409  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||| |||| |   |||| |||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  30410 agttcgaagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagacaacaaatgaggaccgacttatcagaggta 30509  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30510 cttgtttctttaaaagtactcctttaattgctattatagatattggtgctactcattgtttcattgatattgaatgtgcatataagttgggtttggttgt 30609  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30610 atctgatatgaaaggggtaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 30679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 53298 - 53775
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  || ||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  53298 agcagagattgaatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcttgctgggatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 53397  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| ||  | |  ||||| ||| |||||||     
T  53398 tactaaggatgagaagaaatgattcaggtgtggtcaaaaaggacacatcctagttgattgcaagcgtggtgacgtggtatgttataactgtaatgaagag 53497  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| || || || ||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||    
T  53498 ggccatatcagttcacaatgcacatagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtatttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccaactta 53597  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||||||| ||    
T  53598 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagaaactggtgctactcattgtttcaatgctatagaaagtgcatataagttagg 53697  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  53698 tttaattgtatctgaaatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttg 53775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 253 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 11993 - 11757
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11993 ggtggaaaggtgtttgctttgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 11894  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11893 tagatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 11794  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11793 agctaagggttcagtaaccacttctcttgtttgtctg 11757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 12060
Alignment:
Q  58 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacat 157  Q
    |||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||   | ||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |    
T  12176 gagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtggaagagatgataggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtt 12077  T
Q  158 tagctgattgcaagcgt 174  Q
    ||||||| |||||||||    
T  12076 tagctgaatgcaagcgt 12060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 54476 - 53996
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||  || |||||| |  |||||| || |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  54476 agcagaggttgaatgatgagaggaggcccaatagatgaaatgctcttgctgagatcgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 54377  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |      ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||  |||  ||||| ||  |||||||     
T  54376 tactaaagatgagaagaagtgtttcaggtgtggtcagaagggacacactctagcttattgcaagcgtggtgatgttgtttgttataactgcaatgaagag 54277  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| ||||| | |||||   | || || |||| |   ||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||   || |||||| |||||||    
T  54276 ggtcatatcagctcacggtgcacacaaccgaaaaaggttaggaccagtggtaaagtgtttgctttcactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactta 54177  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  54176 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgttactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgtg 54077  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54076 tctggttgtatctgatatgaatgtagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcattaactacttctcttgtgtgtct 53996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 486
Target Start/End: Original strand, 428 - 898
Alignment:
Q  16 ctgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtg 115  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |   |    
T  428 ctgaatgatgagagaagacccaagaggagagatgctcctactgagatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaaag 527  T
Q  116 atgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttat 215  Q
    ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |   ||||||  |||  |||||||||||||| || || |  ||    
T  528 atgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggaatgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccacat 627  T
Q  216 tagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
     || || |||||||   |||| ||||||  |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||   ||||||||||||    
T  628 cagttcacagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgcgttgactggtacgcagactactaatgaggacaagcttatcagaggt 727  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||    
T  728 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattg 827  T
Q  416 tatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  828 tatctgatatgaaaggagagatggttgttgaaacttcagctaagggttcagtgactacttcccttgtttgt 898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10916 - 10744
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||  ||||||||    
T  10916 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgg 10817  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10816 gtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 485
Target Start/End: Original strand, 5020 - 5497
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||  |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||| ||||| ||||  ||| ||| |||||||| |||||| |  ||||  ||    
T  5020 agcagaggatgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgaaattgtttgttaaaagagtgatgaaaaaggccacaaaaacaatgcttg 5119  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||   |  |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||  |  | | ||| || ||  | ||||||    
T  5120 tggtagaaatgagaggaaatgtttcaggtgtggtcagaaaggacacaccctagctgaatgtaagcgtggagacattgtctgctacaactgcaacgaagaa 5219  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || ||  |||| |   |||| |||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||    
T  5220 ggtcatatcagttcatagtgtactcagccgaagaaggctaggaccggtgggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactacaaatgaggaccgactta 5319  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5320 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcatttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttggg 5419  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttg 485  Q
    | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5420 tatggatgtatctgatatgaaaagagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctctagtttg 5497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 51 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 12214 - 11781
Alignment:
Q  51 tcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaagga 150  Q
    ||||| ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||  ||  |  |||||||||| ||||| ||| | |||||  |||||||     
T  12214 tcctactgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggtgatgagaaaaagtgctttcgatgtgggaagaaaggg 12115  T
Q  151 cacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaa 250  Q
    || ||  |||| || ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12114 catacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggctcaga 12015  T
Q  251 caggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 350  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12014 caggtggaaaggtgtttgcattgactggtacgcagacaattaatgaggaccgacttattagagatacttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 11915  T
Q  351 tatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaact 450  Q
    ||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |  |||  || | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  11914 tatagaccatggtgctacacattgtttcattgctattgattgtgcatataagttgggtctgattg--tcaggtatgagtggagaaatggttgttgaaact 11817  T
Q  451 ccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11816 ccagctaagggttcaataactacttctcttgtttgt 11781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 445
Target Start/End: Original strand, 8896 - 9333
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  | ||||||| || | |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||    
T  8896 agcagaggctgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgcttctgctaagattgtttgctacaagtgtggtgagaaaagccacaagagtaatgtctg 8995  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||    |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||  ||| |||||| ||  |||| |||    
T  8996 tgataaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctaattgtaagcggggagatgttgtttgctataactgcaatgaggaa 9095  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    ||||  || |  |||||||| |   |  | ||||||| |   || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||    
T  9096 ggtcaaatcaattcgcagtgtacacaaacgaagaaggttaggaccggtggtaatgtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgactta 9195  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9196 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttggg 9295  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 445  Q
    |   |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9296 tcaggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttg 9333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 2)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 482
Target Start/End: Original strand, 17364 - 17833
Alignment:
Q  13 agactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgacc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||  |     
T  17364 agactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtttgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtacca 17463  T
Q  113 gtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtct 212  Q
      |||||||||||||| ||||||||||  || || || ||||||||||| |||| || |||| |||||||  | |  || |||||  | ||||| || |     
T  17464 aggatgagaagaagtgctttaggtgtgatcaaaagggtcacacattagcggattacatgcgtggtgatgttgtatgttacaattgcaacgaagagggcca 17563  T
Q  213 tattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcaga 312  Q
    ||| ||  | ||||| |   |||| ||||||| |  ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||    
T  17564 tatcagtactcagtgtacacagccgaagaaggttagaactggtgggaaaatgtttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgtcttatcaga 17663  T
Q  313 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttag 412  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||      
T  17664 ggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacattggtgctacttattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttga 17763  T
Q  413 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17764 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Original strand, 4724 - 5198
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||    
T  4724 agcaaagactgaatgatgagaggaggccaaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggccagaaaggccacaagagtaatgtttg 4823  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | || ||     
T  4824 taccaaagatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacatgttagctgattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaggag 4923  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| ||  | ||||| |   |||| | ||||| |  ||| ||||| || |||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  4924 ggccatatcagtactcagtgtacacagccgaggaaggttagaaccggtggaaaagtgtttgctttgactatgacgcagactactaatgaggaccgtctta 5023  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  || |||| |||||||||||    
T  5024 tcagaggtacttgtttctttaatactactcctttaattgatattatagacactggtgctacacattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttggg 5123  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5124 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctcttgt 5198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 181; Significance: 1e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 46 - 486
Target Start/End: Original strand, 65211 - 65651
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacaga 145  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||  |   |||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  65211 gatgctcctgctgaggttgtttgttacaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtaccaaagatgagaaaaagtgcttcaggtgtggtcaga 65310  T
Q  146 aaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 245  Q
    |||||||||| || ||| |||| ||| |  | |||||  |||  |||||||||||||| ||||| |  || || || |||||||   |||| |||||||     
T  65311 aaggacacacgttggctaattgtaagagaggagatgttgtttgttataattgtgatgaggaaggccacatcagttcacagtgcacccagccaaagaaggt 65410  T
Q  246 tctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaatt 345  Q
    |   || ||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||   ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  65411 taggaccggtggaaaagtgtatgcattgactggtacgcagactaccaatgaggacaggcttatcagaggtacttgtttctttaatagtacacctttaatt 65510  T
Q  346 gctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 445  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65511 gctattatagacactggtgctactcattgtttccttgctttagaatgtgcatataagttgggtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttg 65610  T
Q  446 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65611 aaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 65651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 8 - 311
Target Start/End: Original strand, 62647 - 62950
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  62647 agcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgatattgtttaattcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatg 62746  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||||||| || ||| ||||| ||    
T  62747 tgaccatgatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaagtacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgttttctacaactgtaatgaataa 62846  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| | | |||||||||| | |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  62847 ggtcatatcagttcgcagtgtacgcagcctaagaaagttaggacaggtggcaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccgactta 62946  T
Q  308 tcag 311  Q
    ||||    
T  62947 tcag 62950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530 (Bit Score: 180; Significance: 5e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold1530
Description:

Target: scaffold1530; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 253 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 532
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  767 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtaaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 668  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  667 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 568  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  567 atctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1530; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 933 - 801
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||||||  | |||| ||||||||||||||| ||    
T  933 agcagagattgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgtggctagaaaggccacaagagtaatgtctg 834  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtgg 140  Q
    |||    |||||||||||||  || ||||||||    
T  833 tgataaagatgagaagaagtacttcaggtgtgg 801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0765 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0765
Description:

Target: scaffold0765; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Original strand, 6132 - 6606
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || |||| |||||||||||| || ||    
T  6132 agcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgtcgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaacgtttg 6231  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   |||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||    |||||||||| |||||| | ||| |  | | |||||||||| | ||| |     
T  6232 taccaaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacgtgctagctgattgtaagcgtggcgatattgtatgctataattgtaacgaatag 6331  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || |  || ||  | |||||||   | |  ||||||| |  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||    
T  6332 ggccacatcagtactcagtgcacacaacagaagaaggttagaactggtggaaaggtatttgctttgactggtacacagactactaatgaggaccgtctta 6431  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  6432 tcagaggtacttgtttctataatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcttataagttggg 6531  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6532 tttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccggctaagggttcagtgactacttctcttgt 6606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 8 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 40487 - 40013
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  40487 agcaaagactgaatgatgagaggaggccgaataggagagatgctcctgctgagatagtctgttataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttg 40388  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |  |   ||||| |||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||||| |||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | |||||     
T  40387 taccaaagatgataagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcacatgttagcggattgcaagcgttgtgatgttgtatgttataactgcaacgaagag 40288  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | ||| ||  | |||||||   |||| ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||    
T  40287 ggccatatcagtactcagtgcacacagccgaagaaggttagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagactaccaatgaggaccgtctta 40188  T
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |  || |||| |||||||||||    
T  40187 ttagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacacaggtgctactcattgttttattgctttagaaagtgcatataagttggg 40088  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
     ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40087 gttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggtttagtaactacttctcttgt 40013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 482
Target Start/End: Original strand, 17478 - 17698
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |    
T  17478 gtgtttgctttaactggtacacagacagaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattgatacag 17577  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  | | ||||||  |||||||||| |  |  |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17578 gtgctacgcattgtttcatttcttatgattgtgctactaagttgggtcttatcatgcctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 17677  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgt 482  Q
     ||  | ||||||||||||||    
T  17678 ctcgctgactacttctcttgt 17698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 7)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 253 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 151751 - 151516
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151751 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttattagaggtatttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 151652  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151651 tagatactagtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatcttatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 151552  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151551 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 151516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 153921 - 153755
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||    
T  153921 agcagcgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcccactgagattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaagccataagagtaatgtctg 153822  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgt 174  Q
    |||  | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  153821 tgatagagatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgt 153755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 23665 - 23882
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| |   | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23665 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 23764  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23765 ctacacattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 23864  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  23865 ggtgactacttctcttgt 23882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 377
Target Start/End: Original strand, 73792 - 73841
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 377  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73792 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 73841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 377
Target Start/End: Original strand, 78173 - 78222
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 377  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78173 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattgttt 78222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 380
Target Start/End: Original strand, 175708 - 175760
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 380  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  175708 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcattctttcat 175760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 182099 - 182054
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  182099 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 182054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Original strand, 3776 - 4242
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||| || |  | ||||||||||||||| ||  |  ||||    
T  3776 tgaatgatgagaggagacctaagaggagagatgtttctgttgagattgtttgctacaagtgtggcgagaggggccacaagagtaatgtctgcaatggtga 3875  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
     ||||||||||| ||  | |||||| |||| || ||  |  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  ||||||||| ||||||||| | ||    
T  3876 ggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttacttcaattgtgataaagaaggtcatctt 3975  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    | |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3976 aactcgcaatgcatgaagcctaagaaggctcagacaggtggaaaggtgtttgcattgaccggtacacagacggttaatgaggaccgacttataagaggta 4075  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| || | ||||| |||||||||||| | ||| |    
T  4076 cttgtttctttaatagtactc---taattgctattattgacactggtgctacactttgtttcattgctgttgattgtgcatataagttgggtctggttat 4172  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     ||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4173 gtcaagtatgagtggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttatcttgtttgt 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 479
Target Start/End: Original strand, 7972 - 8125
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatat 425  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || | || | || |   |||||| | | | | ||||||||    
T  7972 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgcttttgattgggtttctgctttgggtcttgatttgtctgatat 8071  T
Q  426 gaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||    
T  8072 gaatggagagatggttgtcgaaactccagctaaacgttcggtgactacttctct 8125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 486
Target Start/End: Original strand, 9666 - 10139
Alignment:
Q  12 gagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgac 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||  |    
T  9666 gagacttaatgatgagaggaggcccgttaggagagatgctcctgctgagatagtttgttttaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtacc 9765  T
Q  112 cgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtc 211  Q
       |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||   ||||| |||||||||||| |||||||  | |  ||||| ||  | |||||  | |    
T  9766 aaggatgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaagggtcaccttttagcggattgcaagcgtggtgatgttgtatgttataactgcaacgaagagtgcc 9865  T
Q  212 ttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcag 311  Q
     ||| ||  | |||||||    ||| ||||||| |  ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  |  | ||||||||    
T  9866 atatcagtacacagtgcacactgccgaagaaggttagaactggtggaaaagtgtttgctttgactggtacgcagactactaatgat-ataggcttatcag 9964  T
Q  312 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttta 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||     
T  9965 aggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagaaagtgcatataagttgggtttg 10064  T
Q  412 gttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10065 attgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtacagtaactacttctcttgtttgt 10139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 486
Target Start/End: Original strand, 66992 - 67461
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||   |||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   |  |    
T  66992 tgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctccttccgagattgtttgttataagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgtttgtggtagaca 67091  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||   ||||||| || |||| | | ||  |  | | ||| || ||  ||| |||||||| ||||    
T  67092 tgagaggaaatgtttcaggtgtggtcaaaagggacacaacctagctgaatgtaagcttggggacattgtctgctacaactgcaatggagaaggtcatatt 67191  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || ||||| || ||  |||| |||| || |  ||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||| |||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  67192 agttcgcaatgtagtgagccgaagagggttagaactggtggaaaagtgtttgcattgactggtatgcagactaccaatgaggaccgactcatcagaggta 67291  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgt 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |  || |||| ||||||||||||||  ||||    
T  67292 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgttttattgccttagaaagtgcatataagttgggtttgattgt 67391  T
Q  417 atctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67392 atccgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 67461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 253 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 30118 - 29882
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30118 ggtggaaaggtgtttgcattgattggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 30019  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcc 452  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30018 ttgatactggtgctactcattgttttattgctattgaatgtgcatataagttgggtttggatgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactcc 29919  T
Q  453 agctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctg 489  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  29918 agctaagggttcaagaaccacttctcttgtttgtctg 29882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 262 - 488
Target Start/End: Original strand, 9356 - 9582
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9356 gtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcattaatagtactcctttaattgctattatagacactg 9455  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9456 gtgctactcattgtttcattgctattgaatgtacttataagttgggtctggttgtatctgatatgaaacgggaaatagttgttgaaactccagctaaggg 9555  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  9556 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 9582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 291 - 486
Target Start/End: Original strand, 13 - 208
Alignment:
Q  291 taatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaa 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |     
T  13 taatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatacgggtgctactcattgtttcattgctgttgat 112  T
Q  391 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113 tgtgcatataagttgggtctggttatatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 265 - 488
Target Start/End: Original strand, 94026 - 94249
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  94026 tttgctttgactggtacgcagactactaatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtg 94125  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94126 ctacgcattgtttcattgctttagaatgtgcatataagttgggtctgcttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 94225  T
Q  465 agtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||| || |||||    
T  94226 agtaactacttctctggtgtgtct 94249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 115985 - 115508
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | | |||||  |||||  ||| || || || || |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |      
T  115985 gactgaatgatgagagaaggcccaagggaagagacactcctgctgaaatagtttgctttaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaa 115886  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctt 213  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| ||||| |  | | |||||||||  |||  || |||| |    
T  115885 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggacagaagggtcacgtgttagctgattgcaagcgtggtgatatagtatgctataattgcaatggggagggtcat 115786  T
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    || || || |||||||   | || ||||||| |   || ||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||    ||||| ||  ||||||||||||    
T  115785 atcagttctcagtgcactcaaccgaagaaggttaggaccggtgggaaagtgtttgccttggctggtatgcaaaccacaaatgaagatagacttatcagag 115686  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagt 413  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||||| |||||  | |||||  |    
T  115685 gtacttgtttctttaatagtatccctttaattgctattatagatactggtgctacacattgtttcattgctttagagtgtgcatataaactaggtttgat 115586  T
Q  414 tgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtctgat 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  115585 tgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgtttgat 115508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 291 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 15269 - 15072
Alignment:
Q  291 taatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaa 390  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15269 taatgaggatcgacttatcagaggtacttgtttcttttatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaa 15170  T
Q  391 tgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15169 tgtgcatataagttgggtttgattgtatttgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagcaactacttctctagtttgtct 15072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 6350 - 6071
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||| ||| ||||||||| |||  ||  |||| |  ||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  6350 atgaagaaggtcatattgggtcgcaatgcaagaaacctaagaagactcagactagtggaagagtgtttggtttgactggtacgcaaacagagaatgagga 6251  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||||| | ||||||| |    
T  6250 tcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgcattgttttaatgctatttattgtgcttct 6151  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||||| |   | | ||  ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6150 aagttgggtcttactatgtcgaatatgaaaggagagatgattgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 6071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 15490 - 15327
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||| |||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||      || |    
T  15490 aatgatgagaggaggcccaataggagagatgctcctgctgagattttctgctataagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttgtactaaggacg 15391  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgt 182  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  15390 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaatgacacactctagctgattgcaagcgtggtgatgt 15327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 304 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 1253 - 1069
Alignment:
Q  304 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagt 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1253 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagt 1154  T
Q  404 tgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153 tgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaattgttgttgaaactccagttaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5473 - 5317
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| || || |||| ||||| ||||||||| |||||    ||    
T  5473 tgaatgatgagaggaggcccacgaggagagatgctcctgctgagattgtttgctacaagtgcggcgagaaaggccacaggagtaatgtctgtgataaaga 5374  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcg 173  Q
    |||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5373 tgagaagaagtgcttcaggtgtggttagaaaggacacacattagctaattgtaagcg 5317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 148; Significance: 7e-78; HSPs: 3)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 8 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 5869 - 5562
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||    
T  5869 agcagagattgaatgatgagaggaggcttaagaggagagatgctcctactgagataatttgcttcaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaacgtgtg 5770  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||  ||| ||| |||||| ||||||||    
T  5769 tgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacactttagctgattgtaagcgtggggatgttgtttgctacaattgtaatgaagaa 5670  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    |||| ||| || |||||||| | | | |||||||||| |   ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5669 ggtcatatcagttcgcagtgtacgcaacctaagaaggttaggacaggtggcaaagtgtttgcgttgactggtacgcaaacggtgaatgaggaccgactta 5570  T
Q  308 tcagaggt 315  Q
    ||||||||    
T  5569 tcagaggt 5562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 310 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2822
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||   ||||| ||||||||||||     
T  2998 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggggctactcattgtttcattgttgttgcttgtgcatataagttgggtc 2899  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2898 tggttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 2822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Original strand, 11631 - 11968
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||| ||   ||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||   | |||||     
T  11631 tgatgataggaagcccaagaggagagatgcaccagatgagattgtatgatacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgat 11730  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  ||||||||  |||||||| | ||  |  | |  || || ||  ||| |||||||| ||||||      
T  11731 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaaagcaagcgtggggacattgtctgttacaactgcaatggagaaggtcatattagta 11830  T
Q  221 cgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtactt 319  Q
    | ||||| |  ||| || |||||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||    
T  11831 cacagtgtcctgaa-ccgaagaagactagaactggtgggaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactaccagtgaggaccgacttatcagaggtactt 11929  T
Q  320 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11930 gtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 11968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 6)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 292 - 488
Target Start/End: Original strand, 20687 - 20883
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  20687 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 20786  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20787 gtgcatataaattgggtctggttgtatctgatatgaaaggggaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 20883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 292 - 488
Target Start/End: Original strand, 12507 - 12703
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  12507 aatgaggaccgacttatcaaagctacttgtttctttcatagtactcctttaaatgttattatagatactggtgctactcattgtttcattgctgttgatt 12606  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    |||| ||||| |||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12607 gtgcatataaattggatctggttgtatcaaatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 12703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 12349 - 12453
Alignment:
Q  70 ttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgca 169  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |      |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  12349 ttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgta 12448  T
Q  170 agcgt 174  Q
    |||||    
T  12449 agcgt 12453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 70 - 174
Target Start/End: Original strand, 20529 - 20633
Alignment:
Q  70 ttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgca 169  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | |      |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20529 ttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtttttcgtaaagatgagaagaagtgctttaggtgtgctcagaaaggacacacattagatgattgta 20628  T
Q  170 agcgt 174  Q
    |||||    
T  20629 agcgt 20633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 12289 - 12330
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatg 49  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  12289 agcagagactgaatgatgagagtaggcccaagaggagagatg 12330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Original strand, 20469 - 20510
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatg 49  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  20469 agcagagactgaatgatgagagtaggcccaagaggagagatg 20510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17066 - 16761
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||    
T  17066 agcagaaactgaatgatgagaggaggcctaagaggagagatgctcctactgagattatttgtttcaagtgtggagagaaaggccacaagagtaatgtgtg 16967  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |  ||| ||| || ||| |||| |||    
T  16966 tgatcgagatgagaagaagtgctttaggtgtggtcagaaaggacacacattggctgattgcaagcgtggggatattgtttgctacaactgtaatgaggaa 16867  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactta 307  Q
    || | |||||| |||||||| | | || ||||||||| |   |||||||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16866 ggacatattagttcgcagtgtacgcagactaagaaggttaggacaggtggcaaggtattttcgttgtctggtatgcaaactgtgaatgaggaccgactta 16767  T
Q  308 tcagag 313  Q
    ||||||    
T  16766 tcagag 16761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 7057 - 7098
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctact 369  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  7057 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctact 7098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 300 - 486
Target Start/End: Original strand, 1 - 187
Alignment:
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |  || |||| |||    
T  1 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactagtgctattcattgtttcattgctttagaaagtgcatat 100  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  101 aagttgagtttgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccaactaagggtttagtaactacttctcttgtttgt 187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2062 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold2062
Description:

Target: scaffold2062; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 381
Target Start/End: Original strand, 747 - 1125
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  747 agcagcgactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctatggatattgtttgcttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtctg 846  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
    |||  | |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  |  ||| |||||| ||  | || |||    
T  847 tgatagagatgagaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaggacacacactagctgattgtaagcgtggtgacattgtttgctataactgcaacgaggaa 946  T
Q  208 ggtctta-----ttagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccg 302  Q
    ||||  |     | || |||||||| |   | || ||||||| |   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || | ||||| |    
T  947 ggtcacatcagttcagttcgcagtgtacacaaccgaagaaggttaggactggtggtaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacaactagtaaggacag 1046  T
Q  303 acttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcatt 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  1047 acttatcagaggtacttgtttctttaataatacgcctttaattgctattatagacactagtgttactcattgtttcatt 1125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 410
Target Start/End: Original strand, 1729 - 2125
Alignment:
Q  14 gactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||  ||| ||  | || |  |||||||| || |||| |||||| |||||||| |||  |      
T  1729 gactgaatgatgagagaaggcccaagaggagagatgctactgctgaaataatttgctataagtgtggcgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtaccaa 1828  T
Q  114 tgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtctt 213  Q
     |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||| |  |||||||  |||  |||||||||||||| || || |      
T  1829 agatgagaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattggctaactgcaagaggggtgatgttgtttgttataattgtgatgaggagggccac 1928  T
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    || || || |||||||   |||| ||||||  |  ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||    
T  1929 atcagttcccagtgcactcagccaaagaagattagaaccggtgggaaagtgtttgctttgactagtacgcagactgctattgaggacaggcttatcagag 2028  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggttt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||||||    
T  2029 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagacactggtgctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataagttgggttt 2125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 320 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 110727 - 110559
Alignment:
Q  320 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  110727 gtttctttaatagtactcctttaattgctgttatagatactggtgctactcattgtttcattgttgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtgtc 110628  T
Q  420 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  110627 tgatatgaaaggagaaatggttgttaaaactccggctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 110559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 116050 - 115934
Alignment:
Q  11 agagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtga 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  116050 agagactgaatgatgagaggaggcctaagaggagggatgctcctactgatattgtttgtttcatgtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttgtga 115951  T
Q  111 ccgtgatgagaagaagt 127  Q
      | |||||||||||||    
T  115950 tagagatgagaagaagt 115934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 426
Target Start/End: Original strand, 19089 - 19262
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctatta 352  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19089 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggacaggcttatcagaggtgcttgtttctttaatagtactcctttaattactatta 19188  T
Q  353 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19189 tagatactggtgctactcattgtttcattgctattgaatgtgcttataagttgggtttggttgtatctgttatg 19262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1517 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1517
Description:

Target: scaffold1517; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 17 - 353
Target Start/End: Original strand, 1371 - 1707
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||   | ||    
T  1371 tgaatgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgctgagattgtctgttacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagcaatgcttgtggtagaga 1470  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
    || || ||| ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || ||| || | ||  |  ||| ||| || ||  |||||||||||| |||     
T  1471 tgtgaggaaatgttttaggtgtggttagaagggacacaccctagctgaatgtaagtgtggggacattgtttgctacaactgcaatgaagaaggtcatatc 1570  T
Q  217 agctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggta 316  Q
    || |||||||| |   |||| |||||||     || || || || |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1571 agttcgcagtgtactcagccgaagaaggtcaggaccggagggaaagtgtttgcattgactggtacgcagactactaatgaggaccgacttatcagaggta 1670  T
Q  317 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1671 cttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 1707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 200 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 5325 - 5037
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||    
T  5325 atgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcagacattgaataagga 5226  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
    |||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | || | ||||||| |    
T  5225 ccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgcattgttttattggtgttgattgtgcttct 5126  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||| | ||| | |   ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  5125 aagttgggtcttgttatgttaaatatgaatggagatatggtcgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 342 - 486
Target Start/End: Original strand, 49086 - 49230
Alignment:
Q  342 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 441  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49086 aattgctattatagatactagtgctactcattgtttcattgatgttgattgtgcatataagttgggtctggttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 49185  T
Q  442 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49186 gttgaaaatcaagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 49230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 358
Target Start/End: Original strand, 1495 - 1832
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||     ||||||    
T  1495 tgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggacacaagagtaatgtttgtggtaaagatgag 1594  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattagct 220  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||| | ||  | || | ||| || ||  ||| ||| |||| ||| || |    
T  1595 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggacacagtttagctgaatgcaagcgtggggacattatctgctacaactgcaatggagagggtcatatcagtt 1694  T
Q  221 cgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtactt 319  Q
    | ||||| |  ||| || ||||||| |  ||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1695 cacagtgtcccgaa-ccgaagaaggttagaactgggggcaaagtgtttgcattgactggtacgcagactaccaatgaggaccgacttatcagaggtactt 1793  T
Q  320 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagata 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1794 gtttctttaatagtactcctttaattgctattattgata 1832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 342 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21946 - 21802
Alignment:
Q  342 aattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggtt 441  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||     
T  21946 aattgctattatagacactggagctactcattgtttcattgctttagagtgtgcatataaattgggtttgattatatctgatatgaaaggagaaatggtc 21847  T
Q  442 gttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21846 gttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 21802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Original strand, 13546 - 13828
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | || || |||| ||| ||||||||| |||  ||  |||| |  |||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||    
T  13546 atgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcagactagtggtagagtgtttgctttgactggtacacaaacagagaatgagga 13645  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||  ||||||||| | ||||||| |    
T  13646 tcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctacacattgttctattgctattgattgtgcttct 13745  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13746 aagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagagttcggtgactacttctcttgt 13828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2165 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold2165
Description:

Target: scaffold2165; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 350
Target Start/End: Original strand, 687 - 1020
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||||| ||||     ||    
T  687 tgaatgatgataggaggcctaagaggagagatgctccttctgagattgtttgttacaagtttggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtggtaaaga 786  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttatt 216  Q
     |||| |||||| || |||||||| || || |||||||  |||||||| || |||||| | ||  |  | | |||||| ||  ||| ||| |||| ||||    
T  787 cgagaggaagtgcttcaggtgtggtcaaaagggacacagtttagctgaatgtaagcgtggggacattgtctgctataactgaaatggagagggtcatatt 886  T
Q  217 agctcgcagtg-caggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggt 315  Q
    || |||||||| |  ||| || ||||||| |  |||  | |||||||||||||| ||||||||||||||  ||   |||||||||| |||||||||||||    
T  887 agttcgcagtgtcctgaa-ccgaagaaggttagaactaggggcaaggtgtttgcattgactggtacgcagtctaccaatgaggaccaacttatcagaggt 985  T
Q  316 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 acttgtttctttaatagtactcctttaattgctat 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Original strand, 216487 - 216769
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |  ||   ||| |  || |||||||||||||||||||| || |  ||||||||    
T  216487 atgaagaaggtcatattgggtcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgagga 216586  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     | | | ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||| | ||| |||      
T  216587 tcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgttattgattgtacttca 216686  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||| ||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  216687 aagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtagaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 216769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 86; Significance: 7e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 15647 - 15377
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| | ||| | || | |||||||||||||||||  ||   ||| |  || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  15647 atgaagaaggtcatattggttcgtaatgtaagaagcctaagaaggctcagactactggaagagtttttgctttgactggtacgcaaacagagaatgagga 15548  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  15547 tcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgcttct 15448  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||            ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  15447 aagttg------------tcaaatatgaaaggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 15377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 293
Target Start/End: Original strand, 170 - 444
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  170 aatgatgagaggaggcccaagagcagagaggctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccacaagagtaatgtctgtgatagagatg 269  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaaggtcttattag 218  Q
    |||||||||| || | |||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||| | ||  |  |||  ||||| ||  |||| ||||||| ||||||    
T  270 agaagaagtgcttcatgtgtggtcagaaaagacacacactagctgattgtaagcgtggggacattgtttgttataactgcaatgaggaaggtcatattag 369  T
Q  219 ctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaa 293  Q
     ||||| || | | | || ||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  370 ttcgcaatgtacgcaaccgaagaaggttaggaccggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaacagttaa 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 4)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 181
Target Start/End: Original strand, 4339 - 4501
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||  | ||||    
T  4339 aatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttgcttcaagtgtggcgagaaaggccaaaagagtaatgtttgtgatagagatg 4438  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatg 181  Q
    ||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4439 agaagaaatgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagctgattgtaagcgtggtgatg 4501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 17240 - 17412
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  17240 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctttcgattgtgtttctactttgg 17339  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17340 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 17412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 479
Target Start/End: Original strand, 194997 - 195184
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||| || || || |||||||| ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |    
T  194997 aatgaggatcgcctgattagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgatt 195096  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    |||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  195097 gtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgattggagagatagttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 195184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 310 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 24433 - 24264
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| | || | |||| ||  || |||| |     
T  24433 agaggtacatgtttcattaatagtactcccttaattactattatagatactagggctacacattgttttattgttgttgattgtgtttcgaaattggatc 24334  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | ||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  24333 ttgttatgtcatatatgaatggagaaatggttgtcgaaaccccggctaagggttcagtgactacttctct 24264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 14398 - 14615
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||  | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  14398 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtg 14497  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14498 ctacacattgttttatttctattgattgtgctcctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14597  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  14598 ggtgactacttctcttgt 14615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 265 - 477
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15323
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||| | || |||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  15111 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtg 15210  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15211 ctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttactatgtcaaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 15310  T
Q  465 agtaactacttct 477  Q
     || |||||||||    
T  15311 ggtgactacttct 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3051 - 2895
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||    ||    
T  3051 tgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgctacaagtgtggtaagaaaggccacaagagtaatgtttgtgataaaga 2952  T
Q  117 tgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcg 173  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2951 tgagaagaagttcttcaggtgtggacagaagggacacacattagctgattgtaagcg 2895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2815 - 2754
Alignment:
Q  253 ggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagagg 314  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||    
T  2815 ggtggtaaagtgtttgctctgactggtacgcaaaccactagtgaggatcgacttatcagagg 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 364
Target Start/End: Original strand, 16676 - 16840
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||| |||   |  |||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16676 atgaagaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaagactcaggccagtgggaaagtgtttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgagga 16775  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||  | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16776 ccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 490
Target Start/End: Original strand, 21413 - 21542
Alignment:
Q  361 ggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagg 460  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||  | ||| | ||   |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21413 ggtgctacgcattgttttattgctactgattgtgcttctaagttgggccttgttatgtcatgtatggatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagg 21512  T
Q  461 gttcagtaactacttctcttgtttgtctga 490  Q
    |||| || ||||||||||| || |||||||    
T  21513 gttcggtgactacttctctagtgtgtctga 21542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Original strand, 16493 - 16579
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| |||||  |||| |||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  16493 tgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatactcctgctgaggttgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatg 16579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4600 - 4389
Alignment:
Q  271 ttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 370  Q
    ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  4600 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgc 4501  T
Q  371 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaac 470  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||    
T  4500 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccatctaagggttcggtgac 4401  T
Q  471 tacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||||    
T  4400 tacttctcttgt 4389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 271 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 183 - 1
Alignment:
Q  271 ttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactc 370  Q
    ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  183 ttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgc 84  T
Q  371 attgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactcca 453  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  83 attgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactcca 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 2395 - 2612
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||| |||||||||| || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2395 tttgctctgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctattattgatactggtg 2494  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| ||| ||||||  | ||||||||  |||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2495 ctacgcattcttttattgcttatgaatgtgctactaagttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagacatggttgtcgaaactccagctaagggttc 2594  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  2595 ggtgactacttctcttgt 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 7045 - 6828
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  7045 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtg 6946  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  6945 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttt 6846  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  6845 ggtgactacttctcttgt 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14175 - 13958
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||  | | || |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  14175 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtg 14076  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  14075 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaagttgggtcttgctatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttt 13976  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  13975 ggtgactacttctcttgt 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 7302 - 7207
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| || |  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  7302 agcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatg 7207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 14432 - 14337
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| || |  |  |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  14432 agcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccataagagtaatg 14337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 55602 - 55819
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55602 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 55701  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55702 ctacgcatttttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttactatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 55801  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  55802 ggtgactacttctcttgt 55819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 48146 - 48064
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48146 tgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 48064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Original strand, 55359 - 55441
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  55359 tgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 55441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 262 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8365
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    |||||||||||||||||||| || || |  || |||||  |  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  8585 gtgtttgctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactg 8486  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  8485 gtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagttaaggg 8386  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  8385 ttcggtgactacttctcttgt 8365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 26589 - 26301
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| |  ||  |||| |  ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  26589 atgaagaaggtcatattggctcgctgtgcaagaagcataagaaggcgccgacgagtgggagagtgtttgcttttactggtacgcagacagagaatgagga 26490  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttat 399  Q
     ||| | || |||||||  ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||| |||| | || | ||||||| |    
T  26489 tcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgcaatgttttattgttgttgattgtgcttct 26390  T
Q  400 aagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||||||||| |   | | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  26389 aagttgggtcttactatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctctagtgtgtct 26301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 333 - 479
Target Start/End: Original strand, 37020 - 37166
Alignment:
Q  333 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 432  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | ||||||||||||| |||    
T  37020 tactcctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttatctgatatgaatgga 37119  T
Q  433 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37120 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 37166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 292 - 482
Target Start/End: Original strand, 23457 - 23647
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||| || |      
T  23457 aatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgcattgttttattgctcttgata 23556  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||||| |||||||||| | | | | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  23557 gtgcttctaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggcgactacttctcttgt 23647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 262 - 488
Target Start/End: Original strand, 9480 - 9706
Alignment:
Q  262 gtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactg 361  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |  |||||||| ||| | || |||||||| |||   ||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  9480 gtgtttgctttgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactg 9579  T
Q  362 gtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaaggg 461  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| |||||||||| |     | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9580 gtgctacgcattgttttattgctcttgattgtgcttctaagttgggtcttacaatgtcgaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaaggg 9679  T
Q  462 ttcagtaactacttctcttgtttgtct 488  Q
    ||| || ||||||||||| || |||||    
T  9680 ttcggtgactacttctctagtgtgtct 9706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 292 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 2144 - 1959
Alignment:
Q  292 aatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaat 391  Q
    |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  | | |    
T  2144 aatgaggatcgtctaatcagaggtacatgtttcattaatagtactcctttaattactattatagatactggtgctacgcattgttttattgttgctgatt 2045  T
Q  392 gtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttct 477  Q
    |||||  |||||||||| |  || | ||  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2044 gtgctactaagttgggtcttattatgtcatatatgaatggggaaatggttgtcgaaaccccagctaagggttcggtgactacttct 1959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Original strand, 57746 - 57963
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||||||  ||  | ||||||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  57746 tttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 57845  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||| ||| | | | | ||  ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  57846 ctacacattgttttattgttattgattgtgcttctaagttaggtcttgctatgtcgaatatgaatggaaagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 57945  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  57946 ggtgactacttctcttgt 57963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 65
Target Start/End: Original strand, 57489 - 57546
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgt 65  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||    
T  57489 agcaaagaatgaatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgt 57546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 36628 - 36456
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  36628 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttcattgctttcgattgtgtttctactttgg 36529  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  36528 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 36456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 310 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18005 - 17833
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| | ||||||||||     
T  18005 agaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctgttgattgtgcgtctaagttgggtc 17906  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |   | | ||  ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  17905 ttactatgtcgaatatgaatggggaaatggttgtcgaaactccagctaagggtttggtgactacttctcttgt 17833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 220 - 482
Target Start/End: Original strand, 110994 - 111256
Alignment:
Q  220 tcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtactt 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||   ||| |  || |||||||||||||  || || ||||  |||||||| ||  | ||||||||||| |    
T  110994 tcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactgaaactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacat 111093  T
Q  320 gtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatc 419  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||    
T  111094 gttattttaatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtc 111193  T
Q  420 tgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
      ||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||    
T  111194 aaatatgaatggagtgatggttgtcgaaactccagctaagggtttgttgactacttctcttgt 111256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 103
Target Start/End: Original strand, 110782 - 110877
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||||| ||  |||||||||| | ||||| | || |||||||||| ||||||||||||| |  |  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  110782 agcagagaatggttgatgagaggcgccctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatg 110877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 8 - 119
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5888
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5777 agcagagactgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgatattgtttattacaagtgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgtttg 5876  T
Q  108 tgaccgtgatga 119  Q
    |||||| |||||    
T  5877 tgaccgagatga 5888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 40681 - 40856
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  40681 atcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 40780  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | ||| | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  40781 gtcttgttatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccaactaagggttcggtgactacttctcttgt 40856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 328 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 14193 - 14039
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatga 427  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  |||||||||| | | | | ||||||||||    
T  14193 aatagtacacctttagttgctattattgatagtggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctgatatga 14094  T
Q  428 aaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14093 atggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 14039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11293
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  11394 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 11295  T
Q  407 gt 408  Q
    ||    
T  11294 gt 11293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25287 - 25242
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25287 aatagtactcctttaattgcaattattgatactggtgctactcatt 25242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 389 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 26160 - 26063
Alignment:
Q  389 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    ||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26160 aatgtgcatataagttgggcctgattgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagccaagggttcagtaactacttctctagtttgt 26063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 104399 - 104182
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | || |||||||| ||||  ||| ||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||    
T  104399 tttgctttgactggtactcagactgggaacgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtg 104300  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||| ||||||   ||| | ||  ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||     
T  104299 ctacgcattgttttattgctattgattgtgcttctaatttgggtcctgttatgtcaaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggtta 104200  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     |||||||||||||||||    
T  104199 ggtaactacttctcttgt 104182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 104653 - 104561
Alignment:
Q  10 cagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaat 102  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||| || |  |  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  104653 cagagaatgattgatgagaggcggcctagaaagaaagatgctcctgttgagattgtttgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaat 104561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 10332 - 10504
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||| |  | ||||||| ||  ||||    
T  10332 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgccacgcattgttttattgctttcgattgtgcttctactttgg 10431  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || ||  | | |||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10432 gtctacatatgtctggtatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 10504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Original strand, 10071 - 10129
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  10071 gatgctcctacggagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 10129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 552 - 727
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||| ||||    
T  552 atcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaaattgg 651  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  652 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttctgtgactacttcacttgt 727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 2119 - 1944
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||| || | ||||||  ||||||||    
T  2119 atcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgcatttttttattgcttttgattgtgctactaagttgg 2020  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || |   | | ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2019 gtctttctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 265 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 3723 - 3524
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  3723 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtg 3624  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3623 ctacgcattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttc 3524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 428 - 575
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatg 118  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||| |||||| |||| ||| |||||    ||||    
T  428 aatgatgagagaaggcccaagaggagagatgctcctatagatattgtttgtttcaagtgtggcgagaaaggccacaaaagtagtgtttgtgatacagatg 527  T
Q  119 agaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgatt 166  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  528 agaagaagtgcttcaggtgtggtcagaaaggacacacattagcagatt 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 15083 - 14873
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15083 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 14984  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14983 ctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttc 14884  T
Q  465 agtaactactt 475  Q
     || |||||||    
T  14883 ggtgactactt 14873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 22419 - 22205
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22419 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 22320  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22319 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 22220  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  22219 ggtgactacttctct 22205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 7408 - 7194
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7408 tttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 7309  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7308 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 7209  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  7208 ggtgactacttctct 7194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 413 - 486
Target Start/End: Original strand, 3450 - 3523
Alignment:
Q  413 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgtttgt 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3450 ttgtatctgatatgaaaggagaaatggtcgttgaaactccagctaagggttcagtgactacttctcttgtttgt 3523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 8395 - 8178
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||    
T  8395 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgatactagtg 8296  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | ||||||  | ||| |||  | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8295 ctacacattgttttattgcttttgattgtgctacttagtcgggacttgatatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 8196  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  8195 ggtgactacttctcttgt 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 265 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 942
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | || |||| ||| ||||   |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1154 tttgctttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgattagagatacatgttatattaatagtacacctttagttgctattattgatactggtg 1055  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| || | |||| || |   |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1054 ctacgcattgttttattgcttttgattgtgtttcttttttgggtcttgttttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 955  T
Q  465 agtaactacttct 477  Q
     || |||||||||    
T  954 ggtgactacttct 942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 29102 - 29274
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || ||  ||||    
T  29102 atcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgctacgcattgatttattgctttcgattgtgtttctactttgg 29201  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29202 gtcttgatttatctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 29274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41849 - 41590
Alignment:
Q  220 tcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactt-atcagaggtact 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||   ||| |  || ||||||||||||| ||| || ||||  |||||||| | |||| |||||||||||     
T  41849 tcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactgctactcagactgagaatgaggatc-acttgatcagaggtaca 41751  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | |    
T  41750 tgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgt 41651  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
       |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41650 aaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 41590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 75569 - 75310
Alignment:
Q  220 tcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgactt-atcagaggtact 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  ||   ||| |  || ||||||||||||| ||| || ||||  |||||||| | |||| |||||||||||     
T  75569 tcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttgactgctactcagactgagaatgaggatc-acttgatcagaggtaca 75471  T
Q  319 tgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtat 418  Q
    ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||| | | | | |    
T  75470 tgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgttttattgctattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgt 75371  T
Q  419 ctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
       |||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  75370 aaaatatgaatagagagatggttgtcaaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 75310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 333 - 479
Target Start/End: Original strand, 34915 - 35061
Alignment:
Q  333 tactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaagga 432  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| | |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| |||    
T  34915 tactcctttagttgctattattgatactggtgctaagcattgttttattgttttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatgga 35014  T
Q  433 gaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  35015 gagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacgtctct 35061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11229
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| || ||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  11054 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattgatactagtgctacacattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 11153  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  11154 gtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 11229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 11265 - 11078
Alignment:
Q  200 atgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgagga 299  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| |||| ||| |||||||||||||  |    ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  11265 atgaagaaggtcatatcagttcgcaatgcaagaaacctaagaaggctcagaatactggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagagaatgagga 11166  T
Q  300 ccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctatt 387  Q
     ||  | || |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11165 tcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactggtactactcattgttttattgctatt 11078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Original strand, 7913 - 8088
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||  |||| |||    
T  7913 atcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacacattgctttattgctattgattgtgctactaaggtgg 8012  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || | | | | ||| |||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  8013 gtcttgctatgtctaatattaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgaaaacttctcttgt 8088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Original strand, 4443 - 4525
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatg 103  Q
    |||||| ||| |||||| || || |||||||||| | ||||||||||| |  |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4443 tgatgataggcggcctaagaagaaagatgctcctgtggagattgtctgctatacttgtggtgaaaaaggccacaagagtaatg 4525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 1368 - 1095
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatg 107  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||| ||    
T  1368 agcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttg 1269  T
Q  108 tgaccgtgatgagaagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtcgtgatgtcattttctataattgtgatgaagaa 207  Q
      |  |||| ||||||||||| ||  | |||||| |||| || || ||  ||||||| ||||||||| ||||| |  ||| ||  |||||||| ||| ||    
T  1268 caatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaataa 1169  T
Q  208 ggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtac 281  Q
    |||| | | || || ||||| | |||||||||||||||||   || |||| | ||||||||||||  |||||||    
T  1168 ggtcatctcagttcacagtgtaagaagcctaagaaggctcaggcaagtggaagggtgtttgctttagctggtac 1095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 7986 - 7911
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtga 83  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| || |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7986 agcagagattgaatgatgagaggagacctaagagaagggatgttcctactgagattgtttgttacaagtgtggtga 7911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 174
Target Start/End: Original strand, 23811 - 23964
Alignment:
Q  21 tgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtgatgag 120  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   | |||||     
T  23811 tgatgataggaggcccaagaggagagatgctcctgttgagattgtttgatacaagtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtatgtggaagagatgat 23910  T
Q  121 aagaagtgttttaggtgtggacagaaaggacacacattagctgattgcaagcgt 174  Q
    | |||||| || |||||||| ||||| || ||||  |||||||| |||||||||    
T  23911 aggaagtgcttcaggtgtggtcagaagggtcacagtttagctgaatgcaagcgt 23964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 11641 - 11424
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||| ||||||||| || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11641 tttgctttgaatggtacgcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 11542  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||||||||| || |||||   | | |||| || |   ||| || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11541 ctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 11442  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
     || ||||||||||||||    
T  11441 ggtgactacttctcttgt 11424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 17892
Alignment:
Q  309 cagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggt 408  Q
    |||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||   | | |||| || |   ||| ||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctactcattgctttattgcctatgattgtgtttctgctttgagt 17966  T
Q  409 ttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
     | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  17965 cttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 17892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 55176 - 55058
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||||||||||||| || || || |  |||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55176 tttgctttgactggaactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 55077  T
Q  365 ctactcattgtttcattgc 383  Q
    |||||||||| || |||||    
T  55076 ctactcattgctttattgc 55058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 53719 - 53682
Alignment:
Q  445 gaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53719 gaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 53682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 209 - 1
Alignment:
Q  268 gctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||| | ||||   || ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  209 gctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggttcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 110  T
Q  368 ctcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagt 467  Q
    | |||||||| |||||| |  | | ||||| ||  |||||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  109 cgcattgttttattgctttcgattatgcttctactttgggtcttgttatgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggt 10  T
Q  468 aactacttc 476  Q
     ||||||||    
T  9 gactacttc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 9119 - 8905
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9119 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 9020  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| |   ||||||  | | ||||||  |||||||||| | ||  | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9019 ctacacatttt---attgcttattattgtgctactaagttgggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagccaagggttc 8923  T
Q  465 agtaactacttctcttgt 482  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  8922 agtgactacttctcttgt 8905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 308 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31841
Alignment:
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||    
T  32012 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 31913  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31912 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtaactacttctct 31841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 307 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 54767 - 54592
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  ||||||||    
T  54767 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagttgg 54668  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    || |  |  | ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54667 gtcttttcatgtctaatatgaatggagaaatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctcttgt 54592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 308 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 37478 - 37307
Alignment:
Q  308 tcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttggg 407  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| |   |||||    
T  37478 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgttacgcattattttattgctttcgattgtgcttctgctttggg 37379  T
Q  408 tttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | | ||| | | ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  37378 tcttgttttgtttgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttctgttactacttctct 37307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 10412 - 10584
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||| || |  | |||| || |   ||||    
T  10412 atcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattactttcgattgtgtttctgctttgg 10511  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10512 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 10584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 13067 - 13239
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   ||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||   |||  | |||| || |   ||||    
T  13067 atcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgatttataaatatcgattgtgtttctgctttgg 13166  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13167 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 10540 - 10326
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    |||| ||||||||||||||| || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10540 tttgttttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 10441  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10440 ctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 10341  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  10340 ggtgactacttctct 10326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3382
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3596 tttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 3497  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3496 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgccttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 3397  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
      | |||||||||||    
T  3396 gatgactacttctct 3382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 17290 - 17118
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    ||||||||||||||||   ||||||  ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  17290 atcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 17191  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17190 gtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcgatgactacttctct 17118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 17539 - 17493
Alignment:
Q  58 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17539 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 17493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 329 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 4691 - 4538
Alignment:
Q  329 atagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaa 428  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||  |||||||||| | | | | ||| |||||||    
T  4691 atagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgcattgttttattgttattgattgtgctactaagttgggtcttgctatgtctaatatgaa 4592  T
Q  429 aggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||    
T  4591 tggagagatggttgtcgaaactccagctgagggttcggtgactacttcccttgt 4538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 337 - 482
Target Start/End: Original strand, 24916 - 25061
Alignment:
Q  337 cctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaa 436  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||  |||||  ||| | ||  | ||||||||||| |||||||    
T  24916 cctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgttttattgcttatgattgtgctactaagtcaggtcttgtcatgtctgatatgaatggagaaa 25015  T
Q  437 tggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  25016 tggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacatctcttgt 25061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 1147 - 1192
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1147 aatagtactcctttgattgcaattatagatactggtgctactcatt 1192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 33256 - 33337
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagag 98  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33256 tgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctgttgaaattgtttgtttcaagtgtggtgaaaaaggccacaagag 33337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 389 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 1259 - 1185
Alignment:
Q  389 aatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggtt 463  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1259 aatgtgcatataagttgggtctggttgtatccgatatgaaaggataaatggttgttgaaactccagctaagggtt 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 18822 - 18608
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || ||||| ||  | ||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| |||    
T  18822 tttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtg 18723  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||||||| |||||| |  | |||| || |   |||||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18722 ctacgcattgttttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgagttgtctgatatgaacggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 18623  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  18622 ggtgactacttctct 18608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21776 - 21566
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  ||||    
T  21776 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtg 21677  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21676 ctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 21577  T
Q  465 agtaactactt 475  Q
     || |||||||    
T  21576 ggtgactactt 21566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 37200 - 36990
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||| ||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||  ||||    
T  37200 tttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgatatcggtg 37101  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| |||| ||| |||||| |  | ||||||| ||  |||||| | ||| | |||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37100 ctacgcattattttattgctttcgattgtgcttctactttgggtcttgttatgtctgatttgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 37001  T
Q  465 agtaactactt 475  Q
     || |||||||    
T  37000 ggtgactactt 36990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 266 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8429 - 8216
Alignment:
Q  266 ttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgc 365  Q
    |||||||||||||||| || ||||   ||||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  8429 ttgctttgactggtactcagactgaggatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgc 8330  T
Q  366 tactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttca 465  Q
    ||||||||| || |||||| |  | ||||  | |   || ||| | |   | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  8329 tactcattgctttattgctttcgattgtgtatctgctttaggtcttgaattgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcg 8230  T
Q  466 gtaactacttctct 479  Q
    || |||||||||||    
T  8229 gtgactacttctct 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 1206 - 1378
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||| |  | | || || ||  ||||    
T  1206 atcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgtattgctttattgctttcgactttgtttctactttgg 1305  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1306 gtcttgatttttctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 1378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 13298 - 13470
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  13298 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctggtttgg 13397  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13398 gtcttgatttgtctgatatgaatgaagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 13470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 265 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41113
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||||||||||| || || |  || ||||| ||  | |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |    
T  41327 tttgctttgactggtactcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactgggg 41228  T
Q  365 ctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttc 464  Q
    |||| ||||| || |||||| |  | | || || |   |||||| | | | | ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41227 ctacgcattgctttattgctttggattatgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttc 41128  T
Q  465 agtaactacttctct 479  Q
     || |||||||||||    
T  41127 ggtgactacttctct 41113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1503 - 1364
Alignment:
Q  214 attagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagag 313  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||    |||  | || ||||| || |||||||||||||| || |||   || ||||| |||||||||||||    
T  1503 attagctcgcagtgcacgcaacctaagaaggtcagaacttgagggaaggtattcgctttgactggtacacagactaccaacgaggatcgacttatcagag 1404  T
Q  314 gtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattat 353  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1403 gtacttgtttcttgaatagtactcctttaatagctattat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 189 - 283
Target Start/End: Original strand, 1079 - 1173
Alignment:
Q  189 ctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgc 283  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1079 ctataactgtaaggaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcccaaactggtgggaaggtttttgctttgactggtacgc 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 307 - 479
Target Start/End: Original strand, 943 - 1115
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgg 406  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||    
T  943 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgg 1042  T
Q  407 gtttagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || | | | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1043 gtcttgatttgtctgacatgaatggagagatggttgtcgaaactctagctaagggttcggtgactacttctct 1115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 658 - 740
Alignment:
Q  22 gatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||| ||| |||||| || ||| ||||||||   |||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  658 gatgataggcggcctaagaagagggatgctccagctgagattacttgtttcaattgtggtgagaaagaccacaagagtaatgt 740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 99
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  268 agaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgcattgtttttttgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 169  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||  || |||||||||||    
T  168 ttgatttgtctgatatgaatggagagatggtcgtcgaaacttcagctaagggtttggtgactacttctct 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 310 - 475
Target Start/End: Original strand, 11533 - 11698
Alignment:
Q  310 agaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtt 409  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   ||||||     
T  11533 agaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtc 11632  T
Q  410 tagttgtatctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactactt 475  Q
    | | | | ||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11633 ttgatttgtctgatatgaatggagatatggttttttaaactccagctaagggttcggtgactactt 11698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Original strand, 11269 - 11327
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  11269 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 11327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 104
Target Start/End: Original strand, 14954 - 15012
Alignment:
Q  46 gatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14954 gatgctcctacggagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 15012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 327 - 479
Target Start/End: Original strand, 674 - 826
Alignment:
Q  327 taatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgctattaaatgtgcttataagttgggtttagttgtatctgatatg 426  Q
    ||||| ||||| || | |||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| |  | |||| || |   |||||| | | | | |||||||||    
T  674 taataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgcattgctttattgctttcgattgtgtttctgctttgggtcttgatttgtctgatatg 773  T
Q  427 aaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  774 aatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttaggtaactacttctct 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1845 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1845
Description:

Target: scaffold1845; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 109
Target Start/End: Original strand, 1188 - 1280
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtg 109  Q
    |||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  1188 tgaatgatgataggagacccaagaggagagatgctcctgctgagattgtttgttacaagtgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtg 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 3294 - 3222
Alignment:
Q  8 agcagagactgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtgg 80  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||    
T  3294 agcagagattgaatgatgagaggaggcccaagaggagagatgctcctactgagattatttgcttcaagtgtgg 3222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 265 - 384
Target Start/End: Original strand, 15711 - 15830
Alignment:
Q  265 tttgctttgactggtacgcaaactgttaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtg 364  Q
    ||||||||| ||||||| || || |  |||||||| ||  | ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  15711 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtg 15810  T
Q  365 ctactcattgtttcattgct 384  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  15811 ctacgcattgtttaattgct 15830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 307 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 48795 - 48719
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcattgc 383  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  48795 atcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctactcattgctttattgc 48719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 307 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2994 - 2924
Alignment:
Q  307 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgttt 377  Q
    ||||||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2994 atcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgcattgttt 2924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 422 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12678 - 12621
Alignment:
Q  422 atatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctct 479  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12678 atatgaatggagagatggttgtcgaaactccagctaagggttcggtgactacttctct 12621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 13502 - 13571
Alignment:
Q  304 cttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||  |||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  13502 cttatcagaggtatgtgttttatcaatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 816 - 861
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  816 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 418 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3556
Alignment:
Q  418 tctgatatgaaaggagaaatggttgttgaaactccagctaagggttcagtaactacttctcttgt 482  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3620 tctgatatgaatggagagatggttgtcgaaactgcagctaaggtttcggtaactatttctcttgt 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36245 - 36161
Alignment:
Q  20 atgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||| | ||||||| || | || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36245 atgatgagaggagacctaagagaagagatgcccctactaagattgtttgctacaggtgtggtgagaaaggccacaagagtaatgt 36161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Original strand, 30897 - 31008
Alignment:
Q  17 tgaatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgtatgtgaccgtga 116  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| || | |||||||||||| || | ||||||||||||||  ||  |  ||||    
T  30897 tgaatgatgagaggagaactaagagaagagatgttcctgctgagattgtttgctacaagtgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggtga 30996  T
Q  117 tgagaagaagtg 128  Q
    ||||||||||||    
T  30997 tgagaagaagtg 31008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 25720 - 25629
Alignment:
Q  189 ctataattgtgatgaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggta 280  Q
    |||||| ||| | ||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  25720 ctataactgtaaggaaaaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcccagactggtgggaaggtttttgctttaactggta 25629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 284
Target Start/End: Original strand, 5068 - 5150
Alignment:
Q  202 gaagaaggtcttattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggctctaacaggtggcaaggtgtttgctttgactggtacgca 284  Q
    |||||| ||| |||||| ||  |||||| ||||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5068 gaagaaagtcatattagttcaaagtgcaagaagcctaagaaggcccagactggtgggaaggtttttgctttgactggtacgca 5150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 5499 - 5544
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5499 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 5544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26505 - 26460
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26505 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 26460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35194 - 35149
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35194 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 35149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24072 - 24027
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24072 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 24027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8266 - 8221
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  8266 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 90611 - 90566
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  90611 aatagtactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 21071 - 21116
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21071 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 21116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 30647 - 30692
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  30647 aatagtactcctttgattgcaattattgatagtggtgctactcatt 30692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3608 - 3556
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcattgtttcat 380  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  3608 aatagtactcctttgattgcaattattgatattggtgctactcattctttcat 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Original strand, 1750 - 1796
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgt 65  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  1750 aatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctaatgagattgt 1796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Original strand, 4614 - 4660
Alignment:
Q  19 aatgatgagaggaggcctaggaggagagatgctcctattgagattgt 65  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  4614 aatgatgagaggaggcctagaaagaaagatgctcctaatgagattgt 4660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 167 - 121
Alignment:
Q  58 gagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  167 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2680 - 2635
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2680 aataatactcctttgattgcaattattgatactggtgctactcatt 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 504 - 447
Alignment:
Q  47 atgctcctattgagattgtctgtttcaagtgtggtgaaaaagaccacaagagtaatgt 104  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  504 atgctcctgctgagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgt 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 4097 - 4142
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  4097 aatagtactccgttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 4142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Original strand, 5000 - 5045
Alignment:
Q  328 aatagtactcctttaattgctattatagatactggtgctactcatt 373  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5000 aataatactcctttgattgcaattatcgatactggtgctactcatt 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 171229 - 171188
Alignment:
Q  326 ttaatagtactcctttaattgctattatagatactggtgcta 367  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  171229 ttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University