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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF9917A_low_270 (Length: 235)
Name: NF9917A_low_270
Description: NF9917A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF9917A_low_270 |
 |  |
|
| [»] chr6 (58 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr4 (61 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr1 (52 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr8 (77 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr7 (65 HSPs) |
 |  |
|
| [»] chr3 (84 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0622 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0251 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0116 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0692 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0011 (5 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0044 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0034 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0032 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0078 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0673 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0480 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0037 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0359 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0023 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0021 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0001 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0395 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0234 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0103 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0028 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0383 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0190 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0302 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0124 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0162 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0315 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0025 (3 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0106 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0761 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0195 (4 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0003 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1140 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0031 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0597 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0138 (6 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0083 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1404 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0184 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0107 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0018 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0218 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0141 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0076 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0012 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0407 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0338 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0132 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold1753 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0610 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0465 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0434 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0447 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0213 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0068 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0026 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0396 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0009 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0022 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0467 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0462 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0104 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0039 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0498 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0051 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0266 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0215 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0750 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0269 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1560 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0589 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0413 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0225 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0120 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0183 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0483 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0109 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0342 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0150 (4 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0014 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0004 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0772 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0808 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0244 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0092 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0125 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0507 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0095 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0158 (1 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0521 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0058 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0243 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold2147 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0090 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold1734 (2 HSPs) |
 |  |
|
| [»] scaffold0327 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0066 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0016 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0456 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0346 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0053 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0013 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 65)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21652877 - 21652690
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21652877 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
21652778 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
21652777 |
aagaaaacatgttcatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
21652690 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 11582564 - 11582750
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11582564 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
11582663 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11582664 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11582750 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 21392874 - 21393064
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21392874 |
gtacaaggactccataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaaaacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
21392973 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21392974 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
21393064 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1170129 - 1169946
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1170129 |
gactcgataacgcgacaacaatccaaaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
1170030 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1170029 |
catgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
1169946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 20710823 - 20711012
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
20710823 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaacattcgcattatc |
20710922 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20710923 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
20711012 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 28258286 - 28258477
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
28258286 |
gtacaaggactcgataatgcgacgacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
28258384 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaac-aatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28258385 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaatcatgattatcattaatcaacaaatgtcattcaacatcaa |
28258477 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1221319 - 1221136
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1221319 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaacttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1221221 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1221220 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
1221136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17473360 - 17473177
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17473360 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
17473261 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17473260 |
aaacatgcttatacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattcaacat |
17473177 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22368072 - 22367889
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22368072 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22367974 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22367973 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22367889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 7424367 - 7424551
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7424367 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
7424464 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7424465 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
7424551 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 11341326 - 11341510
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11341326 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
11341423 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11341424 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11341510 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21075077 - 21074894
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21075077 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21074979 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
21074978 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcgttcaacatcaa |
21074894 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4201554 - 4201370
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4201554 |
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4201457 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
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4201456 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaa |
4201370 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 23513486 - 23513672
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
23513486 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattatcaaga |
23513584 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23513585 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtaatcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23513672 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
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Target Start/End: Complemental strand, 24184681 - 24184499
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24184681 |
gactcgataatgcgacaacaatacacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
24184582 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24184581 |
catgtccatacacaaccaaatcatggaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
24184499 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25192586 - 25192401
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
25192586 |
aaggactcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
25192488 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25192487 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
25192401 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
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Target Start/End: Original strand, 11044 - 11222
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53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
11044 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
11141 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11142 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11222 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9732252 - 9732071
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
9732252 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
9732155 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9732154 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
9732071 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 16534999 - 16535181
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16534999 |
gacttgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16535097 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16535098 |
catgcccatatacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16535181 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22884771 - 22884585
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
22884771 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
22884673 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22884672 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
22884585 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29192203 - 29192025
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| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
29192203 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
29192106 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29192105 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
29192025 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43445342 - 43445157
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
43445342 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
43445244 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43445243 |
aaacatgcccatacacaaataa-tcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgatattcaacatcaa |
43445157 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 110572 - 110387
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
110572 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
110474 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
110473 |
aaacatgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattattaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
110387 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10779767 - 10779584
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10779767 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatatatgataacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10779669 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
10779668 |
aaacatgccc--acacaaataaatcataatattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
10779584 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21234994 - 21234810
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21234994 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21234897 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
21234896 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
21234810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23510676 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttctacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
23510774 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23510775 |
aagaaaacatgcccacatgcaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgctattcaa |
23510857 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 53 - 235
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152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4863961 |
actcaataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4864059 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4864060 |
atgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18779583 |
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18779486 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18779485 |
aaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaatcatgattatcgataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
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| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23327643 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
|
||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23327741 |
aaacatgtccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
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| |
|
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|
|
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 |
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149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
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| T |
24595289 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
24595373 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #31
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49 |
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148 |
Q |
| |
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25425409 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|| ||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25425410 |
aa-catgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #32
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Q |
| |
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20615402 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
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| T |
20615403 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatg |
20615472 |
T |
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Target: chr5; HSP #33
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52 |
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151 |
Q |
| |
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| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21649621 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21649622 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacgatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #34
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151 |
Q |
| |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
35792621 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa |
219 |
Q |
| |
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||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
35792620 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaa |
35792553 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #35
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
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| T |
37051677 |
gactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaa |
37051774 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
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|
| T |
37051775 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacgtaattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatca |
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T |
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148 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19498490 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattatcaaga |
19498587 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
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|
| T |
19498588 |
aa-catgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
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T |
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148 |
Q |
| |
|
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|
| T |
21933748 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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| T |
21933650 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
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| T |
21939918 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
21939821 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
21939820 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 35580944 - 35581125
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49 |
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148 |
Q |
| |
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
35581041 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
35581042 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attagcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
35581125 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37010752 - 37010571
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37010752 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
37010655 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
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|
| T |
37010654 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcgtcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
37010571 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
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Q |
| |
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T |
 |
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gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
19404368 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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Target: chr5; HSP #42
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Q |
| |
|
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27185301 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27185203 |
T |
 |
| Q |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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27185202 |
catgtctatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #43
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Q |
| |
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| T |
23453638 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23453737 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
23453738 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaaaatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
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|
| T |
23465143 |
acaaggactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
23465242 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
23465243 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaaaaaccaacaatgtcattcaaaatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #45
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
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Q |
| |
|
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|
| T |
11338341 |
gtacaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaa-ttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
11338243 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
11338242 |
aagaaaacatgtccatacataatcaaatcataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcctcaacatt-gcattactaagaaaa |
25901814 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
| T |
25901813 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
11213183 |
gataatgcgaca-caatc-acaattttcaacacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcacaacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
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T |
 |
| Q |
157 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
|
| || ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11213085 |
ccgcacacaattagatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #48
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| |
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|
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T |
 |
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152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| |||| || ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
27008803 |
catgcccatatacagttaaatcatagtattcatcatcacacaacaatttgattatcaacaatcaa |
27008867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 133 - 209
Target Start/End: Original strand, 24474367 - 24474443
Alignment:
| Q |
133 |
atttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24474367 |
atttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaa |
24474443 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 7727296 - 7727369
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7727296 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccataacatttgcattatcaagaaa |
7727369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 3672685 - 3672780
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3672685 |
gactcgataatgcgatatcacatcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaagtatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
3672780 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 23492722 - 23492794
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23492722 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattt-cattatcaagaaa |
23492794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 32967608 - 32967547
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32967608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
32967547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 37189561 - 37189501
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
37189561 |
caatataaaggacaacctccaaatatattgatcatttccacaacatttgcatcatcaagaa |
37189501 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1169848 - 1169798
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1169848 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
1169798 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17473075 - 17473025
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17473075 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
17473025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 106
Target Start/End: Original strand, 24470996 - 24471049
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacat |
106 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24470996 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacat |
24471049 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 150
Target Start/End: Original strand, 431149 - 431221
Alignment:
| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
431149 |
aattttcacaacaatacaaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
431221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 28888649 - 28888709
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28888649 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatatccactacatttgcattatcaagaa |
28888709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 5452285 - 5452190
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
5452285 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaacatattgatcatctccagaacaattgcattaccaag |
5452190 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 43445060 - 43445013
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
43445060 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
43445013 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 21615735 - 21615804
Alignment:
| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21615735 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
21615804 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24226911 - 24226842
Alignment:
| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24226911 |
aattttcacgacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacaattgcattatcaag |
24226842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 19860967 - 19861025
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19860967 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
19861025 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35792456 - 35792420
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35792456 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
35792420 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 58)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 18431322 - 18431512
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18431322 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18431421 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18431422 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18431512 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18004448 - 18004258
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18004448 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
18004349 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18004348 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18004258 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25646302 - 25646112
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25646302 |
gtacaaggacttgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattttattgattatctccacaacatttgcattatc |
25646203 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25646202 |
aaggaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaa |
25646112 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35017152 - 35016966
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35017152 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
35017054 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
35017053 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
35016966 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15736656 - 15736466
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15736656 |
gtacacggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
15736557 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15736556 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15736466 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 18569280 - 18569465
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18569280 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
18569378 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18569379 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
18569465 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27655555 - 27655372
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
27655555 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaaga |
27655457 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27655456 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
27655372 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 31627134 - 31627317
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31627134 |
gactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatataggacaatccccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
31627233 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
31627234 |
catgtccatacacaaacaaatcatagtattcatcaccacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
31627317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 32897419 - 32897602
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
32897419 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactctcaattttattgatcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
32897518 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32897519 |
catgcccatacacaaataattcatggtattcatcatcacacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
32897602 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16827346 - 16827161
Alignment:
| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16827346 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaaga |
16827248 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16827247 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16827161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18088182 - 18088003
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18088182 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18088084 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18088083 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
18088003 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 53 - 231
Target Start/End: Original strand, 11214836 - 11215014
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53 |
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152 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11214836 |
actctataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatttccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
11214934 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaaca |
231 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
11214935 |
atgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaaca |
11215014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 16230278 - 16230459
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
16230278 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
16230375 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16230376 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16230459 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 23976263 - 23976446
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23976263 |
aaggactcgataatgcggcaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
23976361 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23976362 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcagcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23976446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33316050 - 33315867
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33316050 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
33315952 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
33315951 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatccacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacatcaa |
33315867 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 16105254 - 16105438
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16105254 |
gactcgataacgcgacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16105353 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16105354 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16105438 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 4989591 - 4989774
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4989591 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
4989689 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
4989690 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
4989774 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 25174253 - 25174431
Alignment:
| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25174253 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
25174350 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25174351 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
25174431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13622589 - 13622401
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13622589 |
gtacacggactcgataatgcaaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13622490 |
T |
 |
| Q |
145 |
aag-aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13622489 |
aagaaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattattactaatcaacaacatcattcaacat |
13622401 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 16239057 - 16239244
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| Q |
49 |
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147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16239057 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacaccaaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
16239155 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16239156 |
aaaacatgcccacacacaaatagatcatcgtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacatcaa |
16239244 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1659182 - 1658996
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1659182 |
aaggactcgataatgtgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1659084 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1659083 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatggtcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
1658996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 10487573 - 10487754
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10487573 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10487670 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
10487671 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
10487754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16377754 - 16377573
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16377754 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16377657 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16377656 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
16377573 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16385078 - 16384897
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16385078 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
16384981 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
16384980 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
16384897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 23151956 - 23152138
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23151956 |
gactcgataatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatactgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
23152054 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| | | |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23152055 |
catgctcattcacaattgaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23152138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
14628079 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagg |
14627982 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14627981 |
aaacatgcccatacacaattacatcataacattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
14627895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
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|
| T |
18128981 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
18129079 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatg |
201 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18129080 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatg |
18129129 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
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Target Start/End: Original strand, 18775907 - 18776087
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18775907 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
18776005 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18776006 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
18776087 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19984671 - 19984490
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19984671 |
gactagataattcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19984574 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19984573 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
19984490 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #30
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Target Start/End: Original strand, 15861425 - 15861592
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
15861425 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaggaaa |
15861521 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15861522 |
catgctcacacacaaataaatcatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatg |
15861592 |
T |
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Target: chr6; HSP #31
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Target Start/End: Complemental strand, 17343754 - 17343586
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17343754 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
17343656 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17343655 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaat |
17343586 |
T |
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Target: chr6; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13016260 - 13016071
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| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13016260 |
gtacaaggactcgataatgcgactacaatccataattttcacctcaatatataggtctatatccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatc |
13016162 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| || | ||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||| |
|
|
| T |
13016161 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcatgtcaacatgattctcaa-aatcaacaaatgtcactcaacatcaa |
13016071 |
T |
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Target: chr6; HSP #33
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16557483 - 16557301
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| Q |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16557483 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16557386 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16557385 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
16557301 |
T |
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Target: chr6; HSP #34
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16650713 - 16650531
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16650713 |
aaggactcgataatacgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaagtatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16650616 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16650615 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
16650531 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #35
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29870943 - 29870760
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
29870943 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
29870846 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
29870845 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
29870760 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 26088532 - 26088713
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
| T |
26088532 |
gactcgataatgcaacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaag |
26088629 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
26088630 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
26088713 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18825225 - 18825046
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| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
18825225 |
actcgataatgcgacaacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattattcatctccacatcatt-gcattatcaagaaa-c |
18825129 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18825128 |
atgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatcaa |
18825046 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18843286 - 18843106
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| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| || | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18843286 |
actcgataatgcgacgacaaac-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattataatgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
18843189 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18843188 |
atgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaaaaatcaacaattttattcaacatcaa |
18843106 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #39
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Target Start/End: Original strand, 18397622 - 18397803
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18397622 |
gactcgataatgcgacaacaatctacaattttcaccacaatatatagggcaactcccaattatattgattatccccacaacattttcattatcaagaaaa |
18397721 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| ||||| ||||| || ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18397722 |
catgtccatacacaatcaattcataatactcatcatcaccacatcaatatgatcatcaatactcaacaatgtcattcaacat |
18397803 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #40
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
23993858 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
23993955 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
23993956 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #41
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
1651420 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
1651323 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| || |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1651322 |
aaacatgtccacacacaattatatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
1651236 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #42
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22430944 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttaaaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
22431042 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
22431043 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattctacatcaa |
22431127 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #43
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554536 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaa |
1554633 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1554634 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaat |
1554703 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #44
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aatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
189 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| |||||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
25745763 |
aataaataggacaacacccaattatattgttcatctacacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatca |
25745664 |
T |
 |
| Q |
190 |
-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25745663 |
ccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
25745617 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #45
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Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
19609191 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
19609288 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataa |
170 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19609289 |
aaacatgcccatacacaaataa |
19609310 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22227111 - 22226926
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22227111 |
aaggactcgaaaatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22227013 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||| ||| |||| ||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
22227012 |
aaacatatccacacacaaataaatcaaagtactcatcatcacacgtcaacatatttatcagtaatcaacaatgtcatccaacatcaa |
22226926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 16084112 - 16084215
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16084112 |
gactcgataatgcgaaaacaattcacaattttctccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16084211 |
T |
 |
| Q |
152 |
catg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
16084212 |
catg |
16084215 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28196255 - 28196147
Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
28196255 |
acaaagactcgataatgcgacaacactccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaccaattgcattatcaa |
28196156 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
28196155 |
gaaatcatg |
28196147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 218
Target Start/End: Original strand, 22866864 - 22867031
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22866864 |
gactcaataatgcgaaatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaataaattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
22866963 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaaca |
218 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || | ||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
22866964 |
catgtccatacacaatcaaatgataagattcattatcaccacatcaacatgattatcaaaaatcaaca |
22867031 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25368827 - 25368728
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
25368827 |
gactcgataatgcgacatcactccacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
25368728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 15738945 - 15739043
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15738945 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaatttttaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
15739043 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 16084882 - 16084960
Alignment:
| Q |
158 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaa-catgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16084882 |
catacacaattaaatcgtagtattcatcaccacacatcaatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16084960 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 110
Target Start/End: Original strand, 18741146 - 18741203
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaa |
110 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18741146 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaa |
18741203 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 1554817 - 1554866
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1554817 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
1554866 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16889183 - 16889122
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16889183 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
16889122 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Original strand, 33323532 - 33323605
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
33323532 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
33323605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 35137399 - 35137326
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
35137399 |
caattttcacaacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
35137326 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 147
Target Start/End: Original strand, 22846867 - 22846923
Alignment:
| Q |
91 |
atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
22846867 |
atataaaggataacttccaaatatattgattatctccacaacaattgaattatcaag |
22846923 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 159; Significance: 8e-85; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 821646 - 821397
Alignment:
| Q |
1 |
ataataaggctattgaattaccnnnnnnntataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaat---------------ccacaattttca |
85 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
821646 |
ataataaggctattgaattaccaaaaaaagataataaaggactcgtacaaggactcgataatgcgacaacaattcataattttcacctccacaattttca |
821547 |
T |
 |
| Q |
86 |
cctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
185 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
821546 |
cctcaatatatacgacaacatccaattatattgattatcttcacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacc |
821447 |
T |
 |
| Q |
186 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
821446 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
821397 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 33738948 - 33739138
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33738948 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaaaacatttgcattatc |
33739047 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33739048 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcaccttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
33739138 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12901240 - 12901057
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12901240 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12901141 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
12901140 |
catgcccatacacaaataattcatagcattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatatcattaaacatcaa |
12901057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 44054612 - 44054795
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44054612 |
gactcgataatgcgacaacaattcccaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
44054711 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44054712 |
catgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
44054795 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 53909238 - 53909055
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53909238 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatacaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
53909139 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
53909138 |
catgcccacacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
53909055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 53706261 - 53706079
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53706261 |
aaggactcgataatgcaataataatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
53706162 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaaca |
231 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
53706161 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
53706079 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 44345510 - 44345701
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44345510 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatgggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
44345609 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44345610 |
aagaaatcatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcttcaccacattaacatgattattaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
44345701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 16521479 - 16521661
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16521479 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16521577 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16521578 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16521661 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 19999215 - 19999398
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19999215 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagc |
19999313 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19999314 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
19999398 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7133924 - 7133734
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Q |
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|
||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
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gtacaaggactcgataatgcgacaacatttcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
7133825 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7133824 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcgcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
7133734 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 45460432 - 45460244
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45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45460432 |
gtacaaggactcaataatgcgacgacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctctacaacatttgcattatc |
45460333 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45460332 |
aagaaaacatgtccgtacacaattaaatcataagattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
45460244 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8873961 - 8873779
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaaaatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8873862 |
catgcccatacacaattaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
8873779 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 10642874 - 10643060
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
10642972 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10642973 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
10643060 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 18167481 - 18167663
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| Q |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18167481 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18167578 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18167579 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15288479 - 15288295
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15288479 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15288382 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15288381 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15288295 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 110171 - 110353
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
110171 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
110269 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
110270 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
110353 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15274226 - 15274045
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
15274226 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
15274129 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15274128 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15274045 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21961036 - 21960853
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21961036 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcttgattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21960937 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
21960936 |
catgctcatacacaaataaatcatagtattcatcaccacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacatcaa |
21960853 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 9294212 - 9294396
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| Q |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9294212 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaaga |
9294309 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9294310 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
9294396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 10487358 - 10487542
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
10487358 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
10487455 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
10487456 |
aaacatgctcatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
10487542 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 13245139 - 13245323
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13245139 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgaaacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
13245236 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13245237 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaaatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattcaacatcaa |
13245323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22356033 - 22355849
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22356033 |
aaggactcgataatgcgacaacagttcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattggttatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22355936 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22355935 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaatattcaacaatgtcattcaacatcaa |
22355849 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 26338173 - 26338355
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
26338173 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
26338270 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26338271 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
26338355 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
15295589 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaaact-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattctcaaga |
15295492 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15295491 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacctatcaacatgattatgaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15295405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
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16329296 |
T |
 |
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149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
16329295 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
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| |
|
||||||||||||||||| || |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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| |
|
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|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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47356013 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatta-ttgcattatcaaga |
47356111 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
47356112 |
aaacattcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
47356199 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
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Target Start/End: Original strand, 14950707 - 14950891
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14950707 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaatatt-gcattatcaaga |
14950804 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || || ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14950805 |
aaacatgcccacacaaaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
14950891 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 54119732 - 54119579
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
54119732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
54119634 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgat |
203 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
54119633 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgat |
54119579 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
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50 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8373042 |
aggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagag |
8373140 |
T |
 |
| Q |
150 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8373141 |
aacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaccgcaacatgattatcaataaccaacaatgtcattcaacatcaa |
8373226 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
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152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14994888 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatatagattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
14994986 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14994987 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
14995068 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
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| Q |
52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25120589 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
25120491 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25120490 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcgtcaatgtcattcaacatcaa |
25120407 |
T |
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34393744 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
34393842 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34393843 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
34393927 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
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| Q |
66 |
acaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgca |
165 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
30233998 |
acaacaatccacaattttcacctcgatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaacatgtccatacaca |
30233899 |
T |
 |
| Q |
166 |
aataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
| || | ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
30233898 |
atcaaattataagattcatcatcaccacatcaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
30233831 |
T |
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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5684370 - 5684187
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5684370 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttgtccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5684272 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
5684271 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
5684187 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
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Target Start/End: Original strand, 15212032 - 15212215
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15212032 |
gactcgataatgcgacaacaatt-acaattttatccacaatatataggacaacatccgattatattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
15212130 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15212131 |
catgcccacacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15212215 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18495880 |
acaaagactcgataatgcgacatctttccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatcttcacaacatttgcattatcaa |
18495781 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaaca |
231 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18495780 |
gaaaacatgtccatacccaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaaca |
18495695 |
T |
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13049630 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13049533 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
193 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
13049532 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaca |
13049491 |
T |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
26678732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat-------- |
26678821 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| | | |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
26678822 |
--acatgcccatacacaatttaatcatgatattcaccatcacacttcaacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaa |
26678906 |
T |
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13811103 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgattatttccacaacaattccattatcaa |
13811004 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
13811003 |
gaaatcatg |
13810995 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
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caacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacat |
200 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||| || || ||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| |
|
|
| T |
23271342 |
caacattcaattatattaattatcttcacaacatt-gcattaacaagaaaacatgcccacacacaaataaatcgtagtattcatcatcgcacaacaacat |
23271244 |
T |
 |
| Q |
201 |
gattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
23271243 |
gattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaa |
23271209 |
T |
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Target: chr4; HSP #42
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgat |
120 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13751769 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataacacaactcccaattatattgat |
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T |
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150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43282855 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
52266938 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggataacttccaaatatattgatcatctctacaacaattgcattatcaagaaa |
52266840 |
T |
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102 |
aacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatg |
201 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
| T |
18294580 |
aacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcac-----cacatg |
18294486 |
T |
 |
| Q |
202 |
attatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18294485 |
atcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
18294452 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
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tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgcc |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||| | |||||||| || || ||||||||||| |
|
|
| T |
8044021 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacctcaacatgatcataaacaatcaacaatgtt |
8044120 |
T |
 |
| Q |
224 |
attcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
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attcaacatcaa |
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T |
 |
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| Q |
77 |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15852769 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
15852696 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5684088 - 5684038
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5684088 |
catcacacataaaaatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
5684038 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Original strand, 15043631 - 15043721
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15043631 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15043721 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15110793 - 15110703
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15110793 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcatta |
15110703 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18294354 - 18294304
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18294354 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18294304 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 19019390 - 19019439
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19019390 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
19019439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 27959759 - 27959820
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27959759 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccactacgtttgcattatcaagaaa |
27959820 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 34197605 - 34197544
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34197605 |
caatataaaggacaacttccaaatatattggtcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
34197544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Original strand, 8373431 - 8373478
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8373431 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
8373478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 232
Target Start/End: Original strand, 47356297 - 47356343
Alignment:
| Q |
186 |
atcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
47356297 |
atcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
47356343 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37958489 - 37958436
Alignment:
| Q |
97 |
aggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37958489 |
aggacaacttccaaatatattgatcatctctacaacatttgcattatcaagaaa |
37958436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41167375 - 41167314
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41167375 |
caatataaatgacaactttcaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
41167314 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 34394020 - 34394070
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
34394020 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
34394070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 41257797 - 41257728
Alignment:
| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||| || || || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41257797 |
aattttcacaacaatataaaggataacttccaattatattgatcatctcaaccacaattgcattatcaag |
41257728 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18110038 - 18110002
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18110038 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
18110002 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22407676 - 22407486
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22407676 |
gtacaaggactggataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
22407577 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22407576 |
aagaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22407486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 49966331 - 49966521
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
49966331 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
49966430 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
49966431 |
aagaaaacatgtccataaacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
49966521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2422445 - 2422262
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2422445 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaactttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
2422346 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2422345 |
catgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcgacaatgtcattcaacatcaa |
2422262 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 18506043 - 18506228
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18506043 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccgcaacattagcattatcaaga |
18506142 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| |||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18506143 |
aaa-atgcccacacacaagtaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18506228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 41210732 - 41210913
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41210732 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
41210831 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaac |
230 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
41210832 |
aaacatggccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaac |
41210913 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20826696 - 20826515
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
20826696 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
20826599 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20826598 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
20826515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44036373 - 44036191
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44036373 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatgtataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
44036275 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44036274 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
44036191 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15862908 - 15862724
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15862908 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgaatatctccacaacatt-gcattatcaagg |
15862811 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15862810 |
aaacatgcccacacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15862724 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35523894 - 35523713
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35523894 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35523795 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
35523794 |
catgtccatacgcaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcacccaacatca |
35523713 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 22034535 - 22034717
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22034535 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
22034632 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22034633 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22034717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
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Target Start/End: Complemental strand, 22250430 - 22250244
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22250430 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggactacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaga |
22250332 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22250331 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22250244 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #12
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37845939 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37845841 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37845840 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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aaggactcgataatgccacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacacaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
20895071 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20895070 |
aaacatgcccacacacaattaaataatagtattcatcatcacacatcaacatgattttcaataatcaacaat |
20894999 |
T |
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Target: chr1; HSP #14
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21858246 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgtttacctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
21858344 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21858345 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
21858428 |
T |
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Target: chr1; HSP #15
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22352814 |
aaggactcgataatgcgacaacaaacaacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22352912 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22352913 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcattacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
22353000 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22365441 |
aaggactcgataatgcgacaacaatacacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22365539 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22365540 |
aaacatgttcatacacaattaaatcatagcattcatcattatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
22365627 |
T |
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
17147468 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
17147565 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
|
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17147566 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Target: chr1; HSP #18
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
7642068 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatgatctccacaacatt-gtattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7641970 |
aaacatacccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
7641886 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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21651315 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
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caacatgcccatgcacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
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20444442 |
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20444540 |
T |
 |
| Q |
158 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
20444618 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
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| Q |
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ataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgct |
157 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20530207 |
ataatgcgacaacaatc-ataattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatgatttgcattatcaagaaaacatgcc |
20530305 |
T |
 |
| Q |
158 |
catacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20530306 |
cattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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catgtctatatacaatcaattcatagtatccaccttcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
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| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggactacacccaattatattgattatatccacaaca-ttgcattaccaagg |
18060988 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
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51451397 |
gaacatgcccataaacaattaaatcatagcattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35053532 |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
|
||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| || ||| |||||||| | || |||||| |||| |||||||||||| | |
|
|
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 |
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| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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Target: chr1; HSP #29
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Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
45050370 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
45050467 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45050468 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
45050554 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 52 - 216
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41218143 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacattatttgcattatcaagaaaa |
41218241 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41218242 |
catgctcatacacaattaaatcatagaattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaa |
41218307 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
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| Q |
49 |
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22029383 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
22029480 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22029481 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaatagtcaacaatgtcattcaacatcaa |
22029566 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22226667 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
22226765 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22226766 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaat |
22226838 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 20930163 - 20930327
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20930163 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20930261 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
20930262 |
catgctcatacacaattaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaa |
20930327 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
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Target Start/End: Original strand, 41393138 - 41393322
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41393138 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcagtatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
41393235 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41393236 |
aaacatgtctacacacagttacatcatagcattcatcatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
41393322 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #35
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9785707 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgttcctctccacatcatttgcattatcaagaaag |
9785609 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9785608 |
catgcacatacacaattaaatcatagtattcatcatcgcacatcaacatgattatcaa |
9785551 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18602518 - 18602351
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
18602518 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
18602421 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18602420 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
18602351 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5073775 - 5073608
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5073775 |
gactcgataatgcgacaccaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
5073678 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
5073677 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
5073608 |
T |
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Target: chr1; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51657805 - 51657605
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| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51657805 |
gtacaaagactcgataatgcaacatcacttcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
51657706 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagt---------attcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
| |||| |||| ||||| ||| || ||||| | ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
51657705 |
atgaaatcatgtccatacacaatcaaatcataattcaattaagattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
51657606 |
T |
 |
| Q |
235 |
a |
235 |
Q |
| |
|
| |
|
|
| T |
51657605 |
a |
51657605 |
T |
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Target: chr1; HSP #39
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| Q |
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ctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca |
186 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||||||||| || |
|
|
| T |
20122098 |
ctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgcccacacacagttaaatcatagtattcctca |
20122000 |
T |
 |
| Q |
187 |
tcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20121999 |
tcacaccaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
20121965 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr1; HSP #40
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| Q |
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caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38035070 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
38034997 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #41
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| Q |
164 |
caaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22031078 |
caaataaatcatagtattcctcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22031007 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
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147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
22836723 |
gactcgataatgcgacatcacctcataattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatttccacaacaattgcattaccaag |
22836628 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #43
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27673543 |
gactcgataatgcgacaccacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaaaacaattgtattatcaagaaa |
27673641 |
T |
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| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36357786 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
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T |
 |
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Target: chr1; HSP #45
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75 |
cacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20956416 |
cacaattttcacaacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
20956341 |
T |
 |
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caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
19601911 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatgatctccacaacatttgcattgtcaagaaa |
19601972 |
T |
 |
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Target: chr1; HSP #47
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| Q |
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catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20253246 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
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T |
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| Q |
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catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22353097 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatatcattcaacatcaa |
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T |
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78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37235405 |
aattttcacaacaatttaaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
37235336 |
T |
 |
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caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5471816 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcacctccaccacaattgcattatcaag |
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T |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||| | || ||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8539396 |
aattttcacgacaatataaatgataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
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T |
 |
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78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
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Q |
| |
|
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|
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| T |
8604635 |
aattttcacgacaatataaatgataacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
8604567 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 77)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24718887 - 24718701
Alignment:
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148 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
24718887 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
24718788 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24718787 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
24718701 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 25121227 - 25121417
Alignment:
| Q |
45 |
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144 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25121227 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacttccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
25121326 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
25121327 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacacattaacataattatcaataatcaacaaggtcattcaacatcaa |
25121417 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6775701 - 6775516
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6775701 |
aaggactcgataatgcaacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
6775603 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6775602 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6775516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 41245348 - 41245538
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41245348 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggactactcccaattatattgattatctccataacatttgcattatc |
41245447 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41245448 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcttcttcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
41245538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19994626 - 19994435
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
19994626 |
gtacaaggactcaataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacacaactatattgattatctccatttcatttacattatc |
19994527 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19994526 |
aagaaaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
19994435 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3433044 - 3432860
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3433044 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
3432947 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
3432946 |
aaacatgcccatacacaaataaatcataatattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
3432860 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22908956 - 22908769
Alignment:
| Q |
46 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
145 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22908956 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatca |
22908858 |
T |
 |
| Q |
146 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22908857 |
agaaaacatgcccata--caaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22908769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 43375051 - 43374867
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43375051 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
43374954 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
43374953 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
43374867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 224631 - 224445
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
224631 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
224533 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
224532 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
224445 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 701044 - 700858
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
701044 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
700946 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
700945 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
700858 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 738254 - 738068
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
738254 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
738156 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
738155 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
738068 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 862149 - 861963
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
862149 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
862051 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
862050 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
861963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13664105 - 13663920
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13664105 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13664007 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
13664006 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
13663920 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13723380 - 13723195
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13723380 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
13723282 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13723281 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
13723195 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20648906 - 20648723
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
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|
| T |
20648906 |
gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatatagaacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
20648807 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| | ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
20648806 |
catacccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcatccaacatcaa |
20648723 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22322909 - 22322719
Alignment:
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45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
22322909 |
gtacaaggacttgataatgcgacaataatccataattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattacctccacaaca-ttgcattatt |
22322811 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatc-aacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
| T |
22322810 |
aagaaaacatgcccatacacaattaattcatagtattcatcatctcacatcaacatgattatcaataatcaaaaaatgtcattcaacatcaa |
22322719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 5236883 - 5237067
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
5236883 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
5236980 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
5236981 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
5237067 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16874407 - 16874223
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Q |
| |
|
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|
| T |
16874407 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
16874310 |
T |
 |
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149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
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| T |
16874309 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16874223 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24662715 - 24662531
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24662715 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
24662618 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
24662617 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
24662531 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
43684342 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
43684439 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
43684440 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
43684526 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24930582 - 24930398
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
24930582 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttccacctcaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
24930483 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24930482 |
catgtccctacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
24930398 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20655491 - 20655308
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20655491 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
20655392 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
20655391 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcatcatcacacatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcatccaacatcaa |
20655308 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24387175 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgtattatcaagaaaa |
24387077 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24387076 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
24386993 |
T |
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Target: chr8; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
272671 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
272574 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
272573 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
272490 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
643178 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
643275 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
643276 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
643359 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
828984 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
829081 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
829082 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
829165 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 16416945 - 16417136
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16416945 |
gtacaaagactcgataatgtgacaattatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
16417044 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
16417045 |
aagaaaacatgtccacgcacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaatactcaacaatgttattccacatcaa |
16417136 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22089911 - 22089729
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22089911 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22089814 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
22089813 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
22089729 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
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| Q |
53 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
24108050 |
actcgataatgcgacaaca--ccacaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatt-gcattatcaagaaaac |
24107954 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24107953 |
atgcccgtacacaattaaatcatagtattcaccatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 37610059 - 37610242
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37610059 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
37610157 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
37610158 |
tatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
37610242 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15320527 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15320430 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15320429 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
15320345 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15500896 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattgtattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15500799 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15500798 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||| ||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29758984 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatgttgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
29759082 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
29759083 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
29759166 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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54 |
ctcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaaca |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16195202 |
ctcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaaca |
16195104 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgctcatacgcaa-ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16195103 |
tgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaatatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaa |
16195021 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20568734 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20568635 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20568634 |
catgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20568553 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #36
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Query Start/End: Original strand, 52 - 232
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20574927 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaag |
20574828 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| | ||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20574827 |
catgtccatacacaatcaaatcataacactcatcatcaccatatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
20574746 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #37
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Target Start/End: Original strand, 24547909 - 24548093
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
24547909 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
24548006 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
24548007 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
24548093 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 270429 - 270585
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270429 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
270527 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
270528 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
270585 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #39
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Query Start/End: Original strand, 52 - 209
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
645491 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcaacatcatttgcattatcaagaaaa |
645393 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
645335 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #40
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
831226 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacatcatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
831127 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaa |
831070 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #41
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22007948 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattatcaaga |
22007850 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
|||||| | ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
22007849 |
aaacattcccatacacaattaaatcatagaattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #42
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21696253 |
gactcgataatgcaacatcaatccacagtattcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || ||||| ||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21696353 |
tatgcccatacacaaacaaatcataagattcattatcgcaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #43
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146 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||| | || ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
21679889 |
acaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatagatgacaacttccaaatatattgttcatctccaccacatttgcattatcaa |
21679988 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21679989 |
gagaacatgtccatacacaatgaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
21680078 |
T |
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Target: chr8; HSP #44
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47 |
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146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
17730936 |
acaaagactcgataatgcgacatcaccccacaattttc-ccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattaacaa |
17730838 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17730837 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Target: chr8; HSP #45
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
16675694 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16675693 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
16675624 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #46
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28543628 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattatcaccacaatatagaggacaacttccacatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
28543727 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| |||||| ||| || ||||| || ||| |||||| | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
28543728 |
catgttcatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacat |
28543806 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #47
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119 |
attatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaaca |
218 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28836353 |
attatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaaca |
28836449 |
T |
 |
| Q |
219 |
atgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28836450 |
atgtcattcaacatcaa |
28836466 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #48
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
20480365 |
gactcgataatgcgacaacaatc-aca-ttttcaccacaatatataggacaacacctaattatattgttcatctccacaacatttgcattataaagaaaa |
20480462 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| ||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20480463 |
catgtctatacacaattaaatcataacattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
20480544 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21853361 |
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21853264 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21853263 |
catgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaacaaattgattatcaacaatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37605685 |
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37605783 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21845956 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcaacacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
21845859 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
21845858 |
catgcccacacacaattaaatcatagtatccatcatcacacaacaaattgattatcaacaatcaa |
21845794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #52
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150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| || || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18768233 |
gactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatatttatcatctccacaacaattgcattatcaagaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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230 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16040748 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaac |
16040649 |
T |
 |
| Q |
231 |
atcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
16040648 |
atcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #54
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132 |
catttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaac |
230 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16042424 |
catttgcattctcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaac |
16042325 |
T |
 |
| Q |
231 |
atcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
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atcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #55
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118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16203804 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #56
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77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39448271 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #57
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| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | |||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
38532336 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaatttctaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattatattatcaa |
38532435 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
38532436 |
gaaa |
38532439 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21199608 - 21199547
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21199608 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
21199547 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 31195719 - 31195658
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31195719 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccgcaacatttgcattatcaagaaa |
31195658 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Original strand, 18618138 - 18618187
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18618138 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
18618187 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #61
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Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 224348 - 224301
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
224348 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
224301 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 700761 - 700714
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
700761 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
700714 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 737971 - 737924
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
737971 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
737924 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #64
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Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 861866 - 861819
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
861866 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
861819 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17151335 - 17151288
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
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||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17151335 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17151288 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #66
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Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13663823 - 13663773
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13663823 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13663773 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13722358 - 13722308
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13722358 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13722308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13722506 - 13722456
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13722506 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13722456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13722654 - 13722604
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13722654 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13722604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13722802 - 13722752
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13722802 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13722752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13722950 - 13722900
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13722950 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13722900 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13723098 - 13723048
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13723098 |
catcatacataaacatgactatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13723048 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 23148624 - 23148682
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23148624 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcacctcaacaacatttgcattatcaag |
23148682 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21192181 - 21192120
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21192181 |
caatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgtattatcaagaaa |
21192120 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 38532490 - 38532534
Alignment:
| Q |
191 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38532490 |
acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
38532534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22737349 - 22737250
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaa-tccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| || || |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22737349 |
gactcgataatgtgacatcacctcaacaattttcaccaccatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccaccacaaatgcattaccaagaaa |
22737250 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Original strand, 23835950 - 23836008
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23835950 |
caatataaaggaaaacttccaaatatattgatcatttcctcaacaattgcattatcaag |
23836008 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 65)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13867552 - 13867362
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13867552 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacttcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
13867453 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
13867452 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaa |
13867362 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Original strand, 44863930 - 44864119
Alignment:
| Q |
46 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
145 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
44863930 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacagcatttgcattatca |
44864029 |
T |
 |
| Q |
146 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44864030 |
agaaaacatgcccatacacaaataattcatagtattcatcatcacacattagcatgattatcaatgatcaacaatgtcattcaacatcaa |
44864119 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 45453728 - 45453544
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcc-aattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45453728 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacttcccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaa |
45453629 |
T |
 |
| Q |
151 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
45453628 |
acatgcccatacacaaataattcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
45453544 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 7291540 - 7291729
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7291540 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
7291638 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7291639 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
7291729 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12545190 - 12545000
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12545190 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttccattatc |
12545091 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12545090 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
12545000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 47288461 - 47288651
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47288461 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattttcacctcaaaatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
47288560 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
47288561 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
47288651 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 369580 - 369763
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
369580 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
369679 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |
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| T |
369680 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcctttaacatcaa |
369763 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15952563 - 15952384
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53 |
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152 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15952563 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
15952465 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
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atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15952384 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26071743 - 26071557
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144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
26071644 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26071643 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26071557 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
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Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26095530 - 26095344
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| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
26095530 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggaccacgcccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
26095431 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26095430 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26095344 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
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Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15823888 - 15823694
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144 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gtacaaagactcgataatgcgacaacaattaacaatcttcacctcaatataaaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
15823789 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatag----tattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
15823788 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcatagtatatattcaccatcacatattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaa |
15823694 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
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Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 142313 - 142504
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
142313 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatc |
142412 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
142413 |
aagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacataatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
142504 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 18981379 - 18981201
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
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T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
|||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
18981281 |
aaacatgcccacatacaaataaatcatagtattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
18981201 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
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Target Start/End: Original strand, 2027250 - 2027433
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2027250 |
gactcgataatgcgacaacaatcacaaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2027349 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |
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|
| T |
2027350 |
cacgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattgaacatcaa |
2027433 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2192169 - 2191987
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
2192169 |
aaggactcgataatgcgacagcaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaaga |
2192071 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
2192070 |
aaacatgcccatacaaaaataaatcatagtattcaccatcacactccaacatgattatcaataatcaacaacatcattcaacat |
2191987 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
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Target Start/End: Original strand, 3058741 - 3058923
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3058741 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaatacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
3058839 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
3058840 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtatcattcaacatcaa |
3058923 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
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Target Start/End: Original strand, 16417162 - 16417340
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| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
16417162 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
16417259 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16417260 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16417340 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 13757270 - 13757454
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
13757270 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
13757367 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13757368 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattctcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13757454 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15443031 - 15442847
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| Q |
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15443031 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
15442934 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15442933 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
15442847 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 16210471 - 16210655
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16210471 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacctaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
16210568 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16210569 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccaacacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16210655 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 51 - 235
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ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
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|
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ggactcaataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccgattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaa |
13038479 |
T |
 |
| Q |
151 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13038478 |
acatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
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|
| T |
32496025 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32495927 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32495926 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
32495842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #23
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Q |
| |
|
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T |
 |
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152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
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112668 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacagtgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
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| |
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|
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gactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacactcaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaaa |
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T |
 |
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152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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|
| T |
11582213 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11582130 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 11285904 - 11286089
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| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
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11285904 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggagaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
11286003 |
T |
 |
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152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccat--cacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
|
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|
| T |
11286004 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11286089 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 36051355 - 36051539
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |
|
|
| T |
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36051452 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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36051453 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattttcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
36051539 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
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52 |
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Q |
| |
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|
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| T |
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13912485 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
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13912484 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacatttcaacataattatcaataatcaacaatgtcatgcaacatcaa |
13912401 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15525957 - 15525771
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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15525859 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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15525771 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
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Target Start/End: Complemental strand, 27103019 - 27102838
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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27102922 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27102921 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
27102838 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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27110367 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
27110270 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
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27110186 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
27175404 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
27175405 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
27175488 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38785111 |
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38785014 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
38785013 |
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38784930 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16480408 - 16480224
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16480408 |
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16480311 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16480310 |
aaacatgcccatatacaattacatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16480224 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| | || ||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1938142 |
catgctcattcataattaaatcataatattcatcattacacatcaacattattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #35
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151 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
125520 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
125618 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
125619 |
catgcccattcacgattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
125702 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #36
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
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7821712 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7821713 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7828926 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
7829023 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
7829024 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-aatatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
7829107 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaattcacaattt-caccacaatataaaggacatcttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12753673 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||| || | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
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12753674 |
catgtccatacacaaacaaattatagtactcatctccacacattaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaactaccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
12249485 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12249484 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
12249400 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15926058 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
15926155 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15926156 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15926240 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaataacttgattatcaacaatcaacaat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
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| |
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|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |
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|
| T |
11514914 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
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| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |
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|
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 |
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152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
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Q |
| |
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||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| |
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|
| T |
30263495 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaataattaacaatgtcaagcaacatcaa |
30263412 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26010663 - 26010479
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26010663 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
26010566 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || || || ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
26010565 |
aaacatgtccacacacagttacatcaaagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatccacaatgtcattcaacatcaa |
26010479 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 3893789 - 3893969
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3893789 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatatatgacaacacccatttatattgttcatctccacaacatttacattatcaagaaaa |
3893887 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3893888 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
3893969 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18255295 - 18255108
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
18255295 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatccccacaaca-ttacattatcaagc |
18255197 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| | |||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
18255196 |
aaaacatgcccacatacaaatagattatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagacattcaacttcaa |
18255108 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15761839 - 15761672
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761839 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattt-ctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctcctcatcatttgcattatcaagaaaa |
15761742 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15761741 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaat |
15761672 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Original strand, 2436315 - 2436456
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
2436315 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
2436413 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca |
191 |
Q |
| |
|
||| ||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2436414 |
aaaaatgtccacacacaattaattcatagtattcatcatcaca |
2436456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Original strand, 13571525 - 13571701
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
13571525 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataagacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
13571622 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
13571623 |
catgcccaaacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaataatatcattcaa |
13571701 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25293747 - 25293608
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
25293747 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
25293650 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
193 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
25293649 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaca |
25293608 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16571568 - 16571380
Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16571568 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16571469 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16571468 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16571380 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 232
Target Start/End: Original strand, 16594094 - 16594282
Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||| || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16594094 |
acaaagactcgataatgagacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaactttcatatatatattgatcatctcaacaacatttgcattatc |
16594193 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16594194 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
16594282 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 10988303 - 10988468
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10988303 |
aaggactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaag- |
10988399 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
10988400 |
gaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacaccaacaacttgattatcaacaatcaa |
10988468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39048042 - 39047979
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| Q |
172 |
tcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39048042 |
tcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
39047979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Original strand, 13273431 - 13273539
Alignment:
| Q |
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146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
13273431 |
acaaagactcgataatgcgacattacttcacaactttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaa |
13273530 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
13273531 |
gaaatcatg |
13273539 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Original strand, 15629459 - 15629567
Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
15629459 |
acaaagactcgataatgcgacgtcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaactttcaaatatattgatcatttccacaacaattgtattatcaa |
15629558 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
15629559 |
gaaatcatg |
15629567 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 49049277 - 49049169
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49049277 |
acaaagactcgataatgcgacatcaactcacaatttccaccacaatataaaggacaactttcaaatatgttgatcatctccaccacaattgcattatcaa |
49049178 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |||| |
|
|
| T |
49049177 |
gaaatcatg |
49049169 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
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| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
9058076 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
9058007 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
15761558 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
15761509 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #60
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| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccac-aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || |||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
10862326 |
actcgataatgcgacatcacctcacaaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatacattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
10862231 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #61
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| Q |
196 |
aacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15851163 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15851202 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #62
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89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15913874 |
caatataaatgacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
15913817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #63
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Query Start/End: Original strand, 191 - 235
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| Q |
191 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15629613 |
acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #64
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150 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13376423 |
tatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #65
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Query Start/End: Original strand, 185 - 221
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185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2191884 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
2191848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 84)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
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Target Start/End: Complemental strand, 6148315 - 6148126
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| Q |
46 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6148315 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatgtaggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttacattatca |
6148216 |
T |
 |
| Q |
146 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6148215 |
agaaaacaagcccatacacaaataaatcatagtattcaccattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6148126 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 13816200 - 13816386
Alignment:
| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13816200 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattctcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
13816299 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| | | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13816300 |
aaacatgcccacacacaattgaatcatagcattcaccatcacccatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13816386 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19572242 - 19572056
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19572242 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaaga |
19572143 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| | | |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
19572142 |
aaacatggccacacacaattgaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
19572056 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16183489 - 16183294
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| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaat----atataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
140 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16183489 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttacacctcaatcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcat |
16183390 |
T |
 |
| Q |
141 |
tatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16183389 |
tgtcaagaaaacatgctcatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16183294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15860617 - 15860432
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
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|
| T |
15860617 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
15860519 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15860518 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtatttatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
15860432 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 16819597 - 16819779
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
16819597 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16819694 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16819695 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
16819779 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17957802 - 17957620
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17957802 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17957704 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17957703 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgacattcaacatcaa |
17957620 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 18909378 - 18909560
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
18909378 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
18909475 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18909476 |
aaacatccacacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18909560 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22145740 - 22145559
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22145740 |
gactcgataatgcgataacaatccacaattttcacctcaatatataggaca-cacccaattatattgattatctccacaac-tttgcattatcaagaaaa |
22145643 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| | ||| | | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22145642 |
catgcccctacaccattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
22145559 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50113602 - 50113417
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| Q |
45 |
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144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
50113602 |
gtacaaggactcgataatgcaacaacaatccacaattt-cacctcaatatataggacaaca----attatattgattacctccacaacatttgcattatc |
50113508 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
50113507 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcactcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
50113417 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 17099397 - 17099585
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| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17099397 |
gtacaaggactcgataatgcgtcagcaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
17099496 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||| || | ||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17099497 |
aagaaaacatgtccataaacaatcaaattataagattcatcatcactacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
17099585 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8269870 - 8269688
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8269870 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8269773 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8269772 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
8269688 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8276981 - 8276799
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8276981 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
8276884 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8276883 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
8276799 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 8630538 - 8630720
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| Q |
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
8630538 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaga |
8630636 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
8630637 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaaagtcattcaacgtcaa |
8630720 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
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| Q |
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
22273737 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
22273834 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22273835 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
33340534 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
33340632 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
33340633 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
53769350 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
53769447 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
53769448 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35122377 |
gactcgataatgcgacaacaattcataattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
35122476 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
35122477 |
catgtccatacacaaccaaatcatagaattcatcatcacacatcaacatgattgtcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
35122559 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
17913717 |
gactagataatgcgaca-caatc-acaattgtcaacacaatatataggacgacatccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
17913619 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgcttatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
17913536 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 49230901 - 49231087
Alignment:
| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
49230901 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
49230999 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
49231000 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
49231087 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51159945 - 51159763
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51159945 |
gactcgataatgcgacaccaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
51159847 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
51159846 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
51159763 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 27839394 - 27839563
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
27839394 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
27839492 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaaca |
218 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
| T |
27839493 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacattaacatgatcatcaacaatcaaca |
27839563 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 319081 - 318898
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
319081 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggataacacccaattatattgttcatttccacatcatttgcattatcaagaaaa |
318983 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| | | ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
318982 |
catgcccatacacgattaaatcataacattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
318898 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 2048751 - 2048934
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2048751 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
2048849 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2048850 |
catgcccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2048934 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2450791 - 2450614
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| Q |
53 |
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152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2450791 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
2450694 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2450693 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattc-ccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2450614 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 7852499 - 7852681
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
7852499 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttacattatcaagaaaa |
7852597 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7852598 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcctcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
7852681 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 19230751 - 19230933
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19230751 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19230849 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
19230850 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcattatcacacatcaacataattatcaataatcaacaacgtcattcaacatcaa |
19230933 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 45 - 221
Target Start/End: Original strand, 25057531 - 25057706
Alignment:
| Q |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057531 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctctacaacatttgcattatc |
25057629 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25057630 |
aagaaaacatgcccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaatatgattatcaataatcaacaatg |
25057706 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1469121 - 1468940
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1469121 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
1469024 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
1469023 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
1468940 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 30152023 - 30152205
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
30152023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
30152120 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
30152121 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatattaatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
30152205 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 16259732 - 16259911
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16259732 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
16259830 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16259831 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacactccaacatgataatcaataatcaacaacatcattcaacat |
16259911 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19945317 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
19945415 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
19945416 |
catgctcatacacaattaaatcatatcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
19945500 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
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acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14294114 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14294213 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14294214 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
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53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |
|
|
| T |
15469931 |
actcgataatgcgacaataatc-acaattt-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaggaa-c |
15469836 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15469835 |
atgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
15469753 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaaccatc-acaatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
16745542 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaa |
219 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
16745541 |
aaacatgcccaaacacaattaaatcatagtattcaccaacacacttcaacatgattaacaataatcaacaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |
|
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30205137 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctgaatatattggacaacacccaattatattgattatctccacaac-tttgctttatc |
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T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattca |
183 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
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aagaaaacatgcacatacacaattaattcatagtattca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
14522775 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
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| |
|
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|
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catgcccatacacaatcaaatcataatactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
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Target: chr3; HSP #38
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Target Start/End: Original strand, 14297188 - 14297371
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14297188 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14297287 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14297288 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
14297371 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
14302914 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| || ||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14302915 |
catgtccatactcaatcaaatcataatactcattatcaccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
14302998 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
44228212 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| | | ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
44228213 |
aaacatgcccatacacgattaaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
44228300 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
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146 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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acaaagacttgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
11198946 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11198945 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
11198859 |
T |
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Target: chr3; HSP #42
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Target Start/End: Original strand, 14299741 - 14299927
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47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14299741 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatacaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
14299840 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
14299841 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacctcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
14299927 |
T |
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Target: chr3; HSP #43
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Target Start/End: Original strand, 15574730 - 15574914
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15574730 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
15574827 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15574828 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
15574914 |
T |
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Target: chr3; HSP #44
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52 |
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151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53899989 |
gactcaataatgcgacaacaattcacaattttcaccacattatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaaaa |
53899890 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
53899889 |
catgtccatatacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacataattatcaataatcaacaatatcattcaacatca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #45
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
15613749 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattaatcatctccacaacatt-gcattaccaagg |
15613846 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15613847 |
aaacatgtccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
15613933 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #46
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
11062504 |
gactcaataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa-aaaa |
11062406 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11062405 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11062321 |
T |
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Target: chr3; HSP #47
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Target Start/End: Original strand, 23491202 - 23491373
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57 |
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156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23491202 |
gataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgc |
23491300 |
T |
 |
| Q |
157 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
23491301 |
ccattcataattaaatcatagtattcatcattacacatcaacgtgattatcaataatcaacgatgtcattcaa |
23491373 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #48
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
12265960 |
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12265862 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || | ||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
12265861 |
aaacatgtccacagacaaataaatcatagtatttatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatctaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| | || | |||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10737247 |
gactcgataatgcgacaacaata-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattgtattgttcatcttcacatcatttgcattatcaagaaaa |
10737345 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac |
192 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10737346 |
catgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatgacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12351312 |
gactcgataattcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12351214 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | || ||| ||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
12351213 |
catgtccgcacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacaacaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacatcaa |
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T |
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144 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
17523884 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacggttttcaccccaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatgtgcattatc |
17523785 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||| ||| ||||| || ||| |||||| | | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
17523784 |
aagaaatcatgtccatacacaattaattcatactactcatcatcaccaa--atcatgatcatcaataatcaataatgtcattcaacat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14846131 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc |
188 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
47786314 |
caatatataggacaactcccaattatattgatcatctccaccacattttcattatcaagaaagcatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatc |
47786215 |
T |
 |
| Q |
189 |
acacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
47786214 |
acacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattcaacatcaa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5227406 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
5227504 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| | | | ||||||| ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
5227505 |
catgctcatatacaattca---aatgtattcatcattacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #55
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| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
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catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcaccacatcaacttgatcatcaacaatcaacaatgtcattcaacat |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| |
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 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacac-attaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
55315183 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
55315252 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 45859709 - 45859848
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
45859709 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacatccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
45859806 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
193 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
45859807 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacaca |
45859848 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 55 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12562944 - 12562762
Alignment:
| Q |
55 |
tcgataatgcgacaacaatccacaa-ttttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaaca |
153 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562944 |
tcgataatgcgacaacacttcacaaattttcaccacaatatagaggaaaaattccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaaaaca |
12562845 |
T |
 |
| Q |
154 |
tgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|| | ||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12562844 |
tgtccgtacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
12562762 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15939930 - 15939743
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag- |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
15939930 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatgtatatgacaacacccaattatattgattatccccataaca-ttgaattatcaagc |
15939832 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||||| |||| |
|
|
| T |
15939831 |
aaaacatgcccacatacaaatagatcatagtattcatcattcacaccataacttgattatcaacaatcaacaaagtcattcaacttcaa |
15939743 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8305790 - 8305693
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8305790 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
8305693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16935286 - 16935168
Alignment:
| Q |
112 |
tatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16935286 |
tatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaata |
16935190 |
T |
 |
| Q |
212 |
atcaacaatgccattcaacatc |
233 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||| |
|
|
| T |
16935189 |
atcaacaatgtcatccaacatc |
16935168 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18905267 - 18905171
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18905267 |
aaggactcaataatgcgaaaacaatc-acaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag |
18905171 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Original strand, 41268931 - 41269098
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| | | |||| | || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| || |
|
|
| T |
41268931 |
gactcgataatgcgacaacatttctcaatct-caactcaatacataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagagaa |
41269028 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca-ttaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||| | || || || ||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41269029 |
catacccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacacagacaacttgattatcaacaatcaacaat |
41269098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13977101 - 13976964
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13977101 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13977004 |
T |
 |
| Q |
150 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
189 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13977003 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca |
13976964 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 140 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12031364 - 12031268
Alignment:
| Q |
140 |
ttatcaagaaaacatgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||| | ||| | || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12031364 |
ttatcaagaaaacacgcccattcacaatttaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaataatgtcattcaacatcaa |
12031268 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13956269 - 13956132
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctca--atatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||| | |
|
|
| T |
13956269 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaa-tgtcaactcaatatatataggacaacacccaattattttgattatctccacaaca-ttgcattaccaagga |
13956172 |
T |
 |
| Q |
150 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca |
189 |
Q |
| |
|
||||||| || || || ||| |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13956171 |
aacatgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatca |
13956132 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 148
Target Start/End: Original strand, 17138157 - 17138253
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
17138157 |
gactcgataatgcgacatcactttacaattttcacctcaatataaaggacaactcccaactatattgatcatctccacaacaattgaattatcaaga |
17138253 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Original strand, 12951743 - 12951835
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12951743 |
gactcgataatgcgacatcatctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatc |
12951835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Original strand, 15874893 - 15874953
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15874893 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaa |
15874953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11330442 - 11330382
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11330442 |
caatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccaccacatttgcattatcaagaa |
11330382 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
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Target Start/End: Original strand, 15516426 - 15516521
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
15516426 |
gacttgataatgcgacatcaactcaaaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
15516521 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9303802 - 9303753
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
9303802 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
9303753 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
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| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38812436 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaag |
38812367 |
T |
 |
Back To:
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Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
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Target Start/End: Complemental strand, 12490177 - 12490105
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| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12490177 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacattttcattatcaagaaa |
12490105 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatata |
95 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
14287780 |
acaaagactcgataatgcgacatcaatccacaattttcaccacaatata |
14287828 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #76
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcat |
140 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
39654607 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcat |
39654695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #77
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
11883735 |
gactcgataatgcgacatcacctcacactttccacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacattagcatta |
11883645 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
82 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11813553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt |
11813586 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #79
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| Q |
198 |
catgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17937333 |
catgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
17937370 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
172 |
tcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
18898045 |
tcatagtattcatcatcccacatcaacgtatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
18897982 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| || || ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14060675 |
caatataaaggacaacttcaaactatattgatcatccccacaatatttgcattatcaagaaa |
14060614 |
T |
 |
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| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacat-ccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
55442218 |
caattttcacaacaatataaaggacatctttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattattaagaa |
55442145 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Original strand, 16260014 - 16260050
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16260014 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
16260050 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 47786339 - 47786311
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
80 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
47786339 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaat |
47786311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0622 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:
Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 8125 - 8308
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8125 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagaacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8224 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8225 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
8308 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 6232 - 6422
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6232 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
6331 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6332 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0251 (Bit Score: 144; Significance: 7e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:
Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15338 - 15151
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15338 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
15240 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15239 |
aagaaaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
15151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:
Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 28574 - 28759
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28574 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
28672 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28673 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
28759 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 28857 - 28907
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28857 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
28907 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0692 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:
Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 861 - 686
Alignment:
| Q |
55 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
154 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
861 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatttgcattatcaagaaatcat |
762 |
T |
 |
| Q |
155 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaac |
230 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
761 |
gcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatttacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 256384 - 256194
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
256384 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacattt-cattatc |
256286 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
256285 |
aagaaaacatgctcatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaacttcaa |
256194 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 60 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 262975 - 262800
Alignment:
| Q |
60 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
262975 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattacctccacaacatt-gcattatcaagaaaacatgctca |
262877 |
T |
 |
| Q |
160 |
tacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
262876 |
tacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaaatgtcattcaacttcaa |
262800 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 124762 - 124578
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
124762 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
124665 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
124664 |
aaacatgcccacacccaattaaatcatagtattcatcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaaaatcattcaacatcaa |
124578 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 193303 - 193487
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
193303 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattaacaaga |
193400 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
193401 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
193487 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 76163 - 75979
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
76163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggatgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
76066 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| || || ||| ||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
76065 |
aaacatgtccacactcaattaaatcatagtattcttcatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatcaa |
75979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:
Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 95006 - 95196
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
95006 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccttaatatatagaacaacactcaattatattgattatctccacaacatttgcattatc |
95105 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |
|
|
| T |
95106 |
aagaaaacatgcccatacacagttaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcatttaacatcaa |
95196 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 66907 - 66745
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
66907 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
66810 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
66809 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaatttgattatcaacaatcaa |
66745 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 95294 - 95344
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
95294 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
95344 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:
Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 78241 - 78427
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78241 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatcaaga |
78340 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
78341 |
aaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcactatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatcaa |
78427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 38903 - 39087
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38903 |
gactcgataatgcaacaacaattcacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
39002 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
39003 |
catgtccacacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
39087 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Original strand, 44513 - 44674
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| Q |
75 |
cacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactca |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||| ||| |
|
|
| T |
44513 |
cacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccacacacaattaaatca |
44612 |
T |
 |
| Q |
175 |
tagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
44613 |
taggattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaa |
44674 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:
Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 109553 - 109368
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
109553 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
109455 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
109454 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
109368 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Original strand, 54330 - 54486
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54330 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
54428 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54429 |
catgcacattcataattaaatcatagtattcatcattacacattaacatgattatcaa |
54486 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:
Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38807 - 38618
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
38807 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
38709 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
38708 |
aagaaaacatgcccatacacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
38618 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 40184 - 40366
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40184 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
40282 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40283 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacatcaa |
40366 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0673 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:
Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2317 - 2126
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2317 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccacttatattgattatctccacatcatttgcattatc |
2218 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || || ||| ||| | |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2217 |
aagaaaacatgcccacacacaattaaattatagcattcatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2126 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0480 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:
Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6837 - 6646
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6837 |
gtacaaggactcgataatgctacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatcatttgcattatc |
6738 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||| ||| |||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6737 |
aagaaaacatgcctatacacaattaaatcatagcatccatcatcaccacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:
Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26200 - 26014
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26200 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctaaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatc |
26102 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26101 |
aagaaaacatgtctatacacagataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
26014 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 70873 - 70683
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||| || || ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
70873 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaagtttctcctcaatatataggataacacccatttatattaatcatctccacaacatttgaattatc |
70774 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
70773 |
aagaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
70683 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 21351 - 21534
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21351 |
gactcgataatacgacaacaaaccacaattttcacttcagtatataggacaacaccgaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
21450 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21451 |
catgcacatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
21534 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 129668 - 129504
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
129668 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaacaaaa |
129570 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || ||||||||||| || | || || |||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
129569 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcgtcaccgcatatcaacatggttatcaacaatcaa |
129504 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:
Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13217 - 13027
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |
|
|
| T |
13217 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccataattttcacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaacatttgcattgtc |
13118 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13117 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcttcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13027 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 235
Target Start/End: Original strand, 161 - 200
Alignment:
| Q |
196 |
aacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
161 |
aacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36892185 - 36891998
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
36892185 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaactcccaattatattgattatctccacaacattttcattatc |
36892086 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
36892085 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacaca-tcacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatc |
36891998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5889765 - 5889582
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
5889765 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
5889667 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5889666 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
5889582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 34822886 - 34823070
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
34822886 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
34822983 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34822984 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
34823070 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3800581 - 3800398
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3800581 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3800483 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
3800482 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaaccatgtcatgcaacatcaa |
3800398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21275995 - 21275812
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21275995 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21275897 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
21275896 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
21275812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 25600652 - 25600835
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
25600652 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaatttttaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccgcaacatttgcattatcaagaaaa |
25600751 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25600752 |
catgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
25600835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 12726741 - 12726925
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
12726741 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
12726838 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12726839 |
aaacatgcccatacacaattaaatcttagtattcaccatcacacttcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
12726925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 51 - 232
Target Start/End: Original strand, 24966987 - 24967168
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51 |
ggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
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| T |
24966987 |
ggactcgataatgcgaccacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
24967086 |
T |
 |
| Q |
151 |
acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
24967087 |
acatgcccatacacgaataaatcatagtattcatcaccacacgttatcatgattatcaataatcaacaacatcattcaacat |
24967168 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
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Target Start/End: Original strand, 8942334 - 8942520
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148 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8942334 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacatca-ttgcattatcaaga |
8942432 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8942433 |
aaacatgctcatacacaaataaatcatagtattcaccatcatcacatcaacatgatcatcaataatccacaatgttattcaacatcaa |
8942520 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
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Q |
| |
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| T |
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gactcgataatgcgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaacttccaattatattgatcattttcgcaacatttgcattatcaagaaaa |
4449599 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
4449598 |
catgtccatacacaaccaa-tcatagaattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
4449517 |
T |
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Target: chr2; HSP #11
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151 |
Q |
| |
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gactcgataatgcgataacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
8886930 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8886931 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
8887014 |
T |
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Target: chr2; HSP #12
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152 |
Q |
| |
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| T |
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actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
19888146 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
19888145 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
19888065 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 21140569 - 21140747
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| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |
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| T |
21140569 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaa-c |
21140666 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
21140667 |
atgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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148 |
Q |
| |
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|
| T |
461426 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
461523 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
461524 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaacatca |
461609 |
T |
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Target: chr2; HSP #15
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151 |
Q |
| |
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| T |
12643491 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattaccaagaaaa |
12643394 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|
| T |
12643393 |
catggccacacacaattaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
12643310 |
T |
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Target: chr2; HSP #16
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
22862179 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacactcaattatattgtttatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
22862277 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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||||||||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
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|
| T |
22862278 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcaacaatttcattcaatatcaa |
22862361 |
T |
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Target Start/End: Complemental strand, 14907907 - 14907723
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
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|
| T |
14907907 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
14907810 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
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|
| T |
14907809 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
14907723 |
T |
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Target: chr2; HSP #18
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49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20013810 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
20013907 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
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| T |
20013908 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
20013994 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23818867 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatttcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
23818964 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
23818965 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
23819051 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
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actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
43644442 |
actcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
43644344 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|||| ||| | ||| ||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
43644343 |
atgcccattcacaattaaatcatagcattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacattgtcattcaacatcaa |
43644261 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
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aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggataacaccaccattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaag |
12637536 |
T |
 |
| Q |
148 |
aaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12637535 |
aaaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
12637450 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
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151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
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gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
22273675 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22273676 |
catgcacattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |
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|
| T |
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aatccacaattttcacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaacatggccatacacaattaa |
25877301 |
T |
 |
| Q |
171 |
ctcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaac-aatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
25877300 |
ttcatagtattcattatcacacatcaacatgattatcaataatcaacgaatgtcattcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
| |
|
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|
| T |
11232720 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
11232623 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
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|
| T |
11232622 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
11232539 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
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148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
22514567 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
22514470 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
22514469 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #26
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Q |
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|
| T |
23773225 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcgacaacatt-gcattatcaaga |
23773322 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23773323 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttataaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23773407 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24687136 - 24686954
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
24687136 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
24687039 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
24687038 |
aaacatg--cctacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttaccaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
24686954 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20628864 - 20628683
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| Q |
49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
20628864 |
aaggactcgataatgtgacaacaatccactatttcaacctcaatatataggacgatacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
20628767 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20628766 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacat---catgattatcaataatcaacaatgacattcaacatcaa |
20628683 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24828034 - 24827854
Alignment:
| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24828034 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatctcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
24827936 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
24827935 |
atgccc--acacaaataaatcatagcattcatcatcatcacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
24827854 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28777168 - 28776987
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
28777168 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
28777071 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
28777070 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagaattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
28776987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 234
Target Start/End: Original strand, 15632088 - 15632269
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15632088 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattctcaacacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcaattgcattatcaagaaaa |
15632186 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
15632187 |
catgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcccacattaacatgattatcaataatcaacgacatcattcaacatca |
15632269 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 22282810 - 22282992
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
22282810 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacagcacctaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
22282908 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22282909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcatcaatgtcattcaacatcaa |
22282992 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 235
Target Start/End: Original strand, 7320174 - 7320363
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7320174 |
acaaagactcgataatgcgacaccaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacatttgcattatcaa |
7320273 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
7320274 |
gaaaacatgtccatacaaaatcaaatcataagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
7320363 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22691426 - 22691316
Alignment:
| Q |
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gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22691426 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22691327 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22691326 |
aagaaaacatg |
22691316 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 45 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22696073 - 22695963
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22696073 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacagttttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
22695974 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
22695973 |
aagaaaacatg |
22695963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 27260274 - 27260415
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260274 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccataatatataggacaactcccaattatattgaccatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
27260373 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
193 |
Q |
| |
|
|||| |||| ||| || |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27260374 |
catgtccatatacaatcaattcatagtattcatcatcacaca |
27260415 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 6878134 - 6878317
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6878134 |
gactcgataatgcgaccacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcctttgcattatcaagaaaa |
6878232 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc-acacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6878233 |
catgtccatacataattaaatcatagcattcatcatcgccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
6878317 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #38
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22581402 - 22581218
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22581402 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacgtttgcattatcaagaaaa |
22581303 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| || || ||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22581302 |
catgtccatacataatcaaatcataagattcattctcacaacatcaacatgatcatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
22581218 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 269878 - 269981
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
269878 |
gactcgataatgcgaccacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
269977 |
T |
 |
| Q |
152 |
catg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
269978 |
catg |
269981 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24572865 - 24572678
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24572865 |
acaaagactcgataatgcgataacacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaa |
24572766 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatc |
233 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || ||| | ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
24572765 |
gaaaacatgtccatacacaatcaaatcacaagattcattatcacaacatcaacatgatcatcaaaaatcaacaatgtcattcgacatc |
24572678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9654296 - 9654140
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9654296 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatatagagcaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattaacaagaaaa |
9654198 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaa |
209 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |
|
|
| T |
9654197 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcatcatcacataacaacatgattatcaa |
9654140 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 235
Target Start/End: Original strand, 28972727 - 28972914
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| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||| || |
|
|
| T |
28972727 |
acaaagactcgataatgcgacaccaatccacaattttcaccacaatatagaggacaacatccatatatattgatcatctccac-acatttgcattactaa |
28972825 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
| ||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28972826 |
g-aaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcacaacatcgacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
28972914 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17398061 - 17397894
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
17398061 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctcaacaaca-ttgcattaccaagaaaa |
17397964 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
||||| || || || ||| |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
17397963 |
catgcccacacacagttaaatcatagtattcatcatcacagaaacaacttgattatcaacaatcaacaat |
17397894 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
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Q |
| |
|
||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
721162 |
gactcgataatgcgacatcactacacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaag |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #45
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Target Start/End: Complemental strand, 23822967 - 23822894
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77 |
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|
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23824911 - 23824838
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23824911 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23824838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23832046 - 23831973
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23832046 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
23831973 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22787506 - 22787408
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
22787506 |
gactcgataatgcgacatcaactcacagtcttcaccacaatatagaggacgacttccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattaccaagaaa |
22787408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19670576 - 19670515
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19670576 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
19670515 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Original strand, 22692978 - 22693028
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22692978 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22693028 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 99
Target Start/End: Original strand, 22697625 - 22697675
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagg |
99 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
22697625 |
aaggactcgataatgcaacaacaatccacaatttcaacctcaatatatagg |
22697675 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 24088810 - 24088752
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
24088810 |
caatataaaggacaacttccaattatattgattatctccacaacaattgcattaccaag |
24088752 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4663
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4735 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagaaa |
4663 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 22693040 - 22693125
Alignment:
| Q |
135 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22693040 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaat |
22693125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 220
Target Start/End: Original strand, 22697687 - 22697772
Alignment:
| Q |
135 |
ttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| || || ||| ||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22697687 |
ttgcattaccaaggaaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaat |
22697772 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 24296031 - 24295958
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24296031 |
caattttcacaacaatataaaggacaactttcaaatatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaa |
24295958 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 19658678 - 19658739
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19658678 |
caatataaaggacaacttccagatatgttgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
19658739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:
Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 155821 - 155642
Alignment:
| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
155821 |
actcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagaaaac |
155723 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
155722 |
atgccc--acacaaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
155642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 732
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
914 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
817 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
816 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 191
Target Start/End: Original strand, 35023 - 35163
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
35023 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
35120 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca |
191 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
35121 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagttttcatcatcaca |
35163 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:
Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 232
Target Start/End: Original strand, 87127 - 87311
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
87127 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggagaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcat--tc |
87223 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
87224 |
aagaaaacatgtccatacacaaataaatcgtagtattcatcatcacacattatcatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
87311 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 138286 - 138098
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
138286 |
gtacagggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-cacttcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaacatt-gtattatc |
138189 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
138188 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
138098 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 46 - 235
Target Start/End: Original strand, 10351 - 10541
Alignment:
| Q |
46 |
tacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatca |
145 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10351 |
tacaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatattgatcatctccacaacatttgcattatca |
10450 |
T |
 |
| Q |
146 |
agaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| || |||| ||||| |||| || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
10451 |
agaaaacatatccatacacaatcaaagcataagattcattatcaccatatcaacatgattatcaacaatcaacaatgtcattcaatatcaa |
10541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 100
Target Start/End: Original strand, 77069 - 77124
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
100 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
77069 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatatagga |
77124 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:
Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 71921 - 71741
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
71921 |
gactcgataatgcgacaacaattctcaattttcaccacaatatataggataactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
71822 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
71821 |
catgctcatacacaaataattcatagtattcatcatcgcacattaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
71741 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0395 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:
Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 14364 - 14555
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
14364 |
gtacaaggactcgacaatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaacacccaattatattgatcatctccacaatatttgcattatc |
14463 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataa-tcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14464 |
aagaaatcatgtctatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattatcaataattcaacaatgtcattcaacatcaa |
14555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:
Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19050 - 18864
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19050 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatgtccacatcatttgcattatcaaga |
18951 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
18950 |
aaacatgcacatgcacaaataaatcatagtattcacaattacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaa |
18864 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18767 - 18717
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18767 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18717 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0103 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:
Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 235
Target Start/End: Original strand, 32268 - 32458
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32268 |
gtacaaagactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatc |
32367 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32368 |
aagaaaacatgtacatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcgacaatgtcattcaacatcaa |
32458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 90353 - 90171
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49 |
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148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
90353 |
aaggactcgataatgcgacaa---tccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
90258 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
90257 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
90171 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 129075 - 129258
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
129075 |
aaggactcgataatgcgacaacaattaacaatctcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
129173 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
129174 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagcattcaccatcatgcctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
129258 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 78410 - 78471
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| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
78410 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
78471 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:
Target: scaffold0383; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 1057 - 1239
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1057 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
1155 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1156 |
catgcccatacacaatcaaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
1239 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 5926 - 6106
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5926 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
6024 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6025 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
6106 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
1336 |
catcatacataaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
1386 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0190 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:
Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 8771 - 8954
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8771 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8870 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8871 |
catgtccatacacaattaattcatagtattcatcatcacacatcatcatgttcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
8954 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0302 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:
Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 4530 - 4716
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |
|
|
| T |
4530 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-tagcattatcaaga |
4628 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4629 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
4716 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:
Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3045 - 2863
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3045 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
2948 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2947 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2863 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23168 - 22997
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
23168 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgctttatcaagaaaa |
23069 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattca |
228 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
23068 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
22997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0162 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:
Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27983 - 27799
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
27983 |
aaggactcgataatgggacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
27886 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27885 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
27799 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0315 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:
Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 17340 - 17522
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17340 |
gactcgataatgcgacaacaatcc-caattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
17438 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17439 |
catgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacaactcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
17522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:
Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 145223 - 145405
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
145223 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattattaagaaaa |
145321 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
145322 |
catgcccatacataaataaatcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgttatccaacatcaa |
145405 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 147482 - 147646
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
147482 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggaaaacacccaattatattgttcatctccacatcatatgcattatcaagaaaa |
147580 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaa-ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
147581 |
catgccaattcacaatttaaatcatagtattcatcaccacacatcaacatgattatcaacaatcaa |
147646 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 145502 - 145552
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |
|
|
| T |
145502 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaaggtcatttaacatcaa |
145552 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0106 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:
Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 40291 - 40468
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40291 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctacacaacatttgcattatcaagaaaa |
40389 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaac |
230 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
40390 |
catgctcattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaac |
40468 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0761 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:
Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3163 - 2980
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
3163 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacactcaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
3065 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3064 |
aaacatgcccacacacaaatagatcatagtatttaccattcacacattaacttgattatgaacaatcaacaatgtcattcaacat |
2980 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:
Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8123 - 7940
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8123 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
8024 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8023 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
7940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13512 - 13329
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13512 |
gactcaataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
13413 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
13412 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13329 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 18000 - 18182
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18000 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
18098 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18099 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
18182 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20266
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20084 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
20182 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|| || ||| | ||| ||| |||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20183 |
caagcacatccacaattaaatcatagtattcatcctcacacatcaagatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
20266 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:
Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 235
Target Start/End: Original strand, 5874 - 6052
Alignment:
| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5874 |
actcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaagaaaac |
5971 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5972 |
atgcccacac--aaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 217218 - 217035
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
217218 |
gactcgataatgcgacaacaatc-ataattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
217120 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
217119 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgtttatcaataatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
217035 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1140 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:
Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 1873 - 2057
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
1873 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccac-aca-ttgcattatcaaga |
1970 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1971 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcttcaacacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
2057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:
Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Original strand, 69456 - 69641
Alignment:
| Q |
50 |
aggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
69456 |
aggactcgatagtgcgacaacaattcacaattttaaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaa |
69555 |
T |
 |
| Q |
150 |
aacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || |||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
69556 |
aacatgtccatacacaatcaaatcataggattcatcatcacacatcatcatgataatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
69641 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 229
Target Start/End: Original strand, 30768 - 30946
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
30768 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
30867 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
30868 |
catgtccatacacaatcaaatcataacattcattatcaccacatgaacaagatcatcaataatcaacaatgtcattcaa |
30946 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0597 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:
Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 59 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2593 - 2418
Alignment:
| Q |
59 |
taatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctc |
158 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2593 |
taatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtcc |
2495 |
T |
 |
| Q |
159 |
atacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| || ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2494 |
atacacatttaaatcatagtattcaccatcacacatcaatatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2418 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 6)
Name: scaffold0138
Description:
Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14735 - 14565
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
14735 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacctaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaag- |
14638 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatg |
221 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14637 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatg |
14565 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 28261 - 28373
Alignment:
| Q |
125 |
tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgc |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28261 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
28360 |
T |
 |
| Q |
223 |
cattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
28361 |
tattcaacatcaa |
28373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Original strand, 40257 - 40369
Alignment:
| Q |
125 |
tccacaacatttgcattatcaagaaa-acatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgc |
222 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
40257 |
tccacatcatttgcattatcaagcaatacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgt |
40356 |
T |
 |
| Q |
223 |
cattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
40357 |
tattcaacatcaa |
40369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23862 - 23801
Alignment:
| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
23862 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccataacatttgcattatcaagaaa |
23801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 28472 - 28522
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28472 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
28522 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0138; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 40468 - 40518
Alignment:
| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
| T |
40468 |
catcatacatcaacatgattatcactaatcaacaatgtcattcaaaatcaa |
40518 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0083 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:
Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 12891 - 13074
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12891 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
12989 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
12990 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcacctcatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
13074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1404 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:
Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 244 - 430
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
244 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-taacattatcaaga |
342 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| | || || |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
343 |
aaacatacccacacacaaatagatcatagtattcaccattcacacaataacttgattatcaacaatcaataatgtcattcaacatcaa |
430 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:
Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32660 - 32478
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
32660 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacagccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
32562 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
32561 |
catgtccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacatatcaacatgattatcaataatcagcaatgtcattcaacatcaa |
32478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 45 - 156
Target Start/End: Original strand, 34037 - 34147
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34037 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccataatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatc |
34135 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
34136 |
aagaaaacatgc |
34147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0107 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:
Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 30041 - 30223
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
30041 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
30138 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
30139 |
aaacatgcccacac--aaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
30223 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:
Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 52743 - 52561
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
52743 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
52645 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
52644 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
52561 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56695 - 56513
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
56695 |
gactcgataatgtgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcattcgcattatcaagaaaa |
56597 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
56596 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacaacaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
56513 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0218 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:
Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6436
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcgataatgcgacaataatccacaatttcaacctcaatatataggacgacgcccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaaga |
6523 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6522 |
aaacatgcccacacacaattaaatcatagtattcatcaacacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6436 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:
Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 25591 - 25775
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
25591 |
aaggactcgataatgcgacaacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
25688 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
25689 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
25775 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 21336 - 21520
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| || || | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
21336 |
aaggactcgataatgcgataacaatc-accatgtcaaactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt-gcattatcaaga |
21433 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
21434 |
aaacatgcccatacacaattaaatcatagtattcaccatcacacttcaacataattatcaatagtcaacaatgtcatgcaacatcaa |
21520 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0076 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:
Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Original strand, 37977 - 38158
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49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37977 |
aaggactcgataatgcgacaacaaatcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaaga |
38074 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| | || ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
38075 |
aaacatgccc--acacaaataaatcatagtattcatcatcacacatcaacat-attatcaataatcaacaatgtcactcaacatcaa |
38158 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0012 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:
Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 249008 - 248826
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
249008 |
gactcgataatgcaacaaaaatc-acaattttctccacaatatataagacaacacccaattatattgttcattcccacatcatctgcattatcaagaaaa |
248910 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
248909 |
catgcccattcacaattaaatcatagtattcatcatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
248826 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0407 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:
Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 60 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6069 - 5902
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60 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
159 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
6069 |
aatgcgacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccaca-catt-gcattatcaagaaaacatgccca |
5972 |
T |
 |
| Q |
160 |
tacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaa |
229 |
Q |
| |
|
|| ||| ||| |||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
5971 |
cacacaattaaatcatagtatttatcatcacacctcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaa |
5902 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0338 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:
Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 232
Target Start/End: Original strand, 7485 - 7666
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7485 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatatataggaccactcccaattatattgatcatctccaaaacatttgcattatcaagaaaa |
7584 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
|||| ||| | ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
7585 |
catgtccatgcacaatcaaatcataagattcatcatcaccacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
7666 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:
Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 41399 - 41582
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41399 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
41497 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | ||| ||| |||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
41498 |
catgcccattcacaattaagtcatagcactcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
41582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1753 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:
Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 154 - 336
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
154 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaactcccagttatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
252 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
253 |
tatgtccatacataattaaatcatagtatccaccatcacacatcgacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0610 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:
Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1916
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52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2095 |
gactctataatgcgacaacaatccacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcgacaacatttgcattatcaagaaaa |
1996 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaaca |
231 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
1995 |
catgtccatacacaatcaaatcataggattcattatcacacatcaacacgattatcaataatcaacaatgtcactcaaca |
1916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0465 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:
Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11394 - 11212
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11394 |
gactcgataatgcgacaaaaatc-acaattttctccacaatatataggacaagacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
11296 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||| | || ||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11295 |
catgcccattcataattaaatcatagtattcaacattacacatcaacaagattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
11212 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0434 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:
Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 3352 - 3535
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3352 |
gactcgataatgcaacaacaatacaaaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatatccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3451 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||| ||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
3452 |
tatgtccatacacaatcaattcatagcattcctcatcacacatcaacatgattatcgataatcaacaatgtcattcagcatcaa |
3535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0447 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:
Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 3318 - 3498
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3318 |
gactcgataatgcgacaacaatct-caattttcaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacaacatttgcattatcaagaaaa |
3416 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
3417 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattcatca--ccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
3498 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0213 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:
Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 27714 - 27897
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27714 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
27812 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcacca-tcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27813 |
catgtccatacacaattaaatcatagtattcaccattcacaaaataacttatttatcaaaaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
27897 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:
Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
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Target Start/End: Original strand, 46819 - 47001
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gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
46819 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
46916 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
46917 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacatcaa |
47001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0068; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 60267 - 60449
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | || |||||| |||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
60267 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttcaccacaatatataggacaacacccaat-atattgttcatctccacatcatttgcattatgaagaaaa |
60364 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
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|||| ||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
60365 |
catgtccatacacaattaaatcatagcattaatcatcaccacattaacatgattatcaataattaacaatgtcattcaacatcaa |
60449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0026 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:
Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Original strand, 106689 - 106859
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
106689 |
aaggactcgataatgcgacaaaaatccacagtttcaacctcaatatataggacgacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
106787 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
106788 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttgattatcaacaatcaacaat |
106859 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:
Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Original strand, 16132 - 16303
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
16132 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatttcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatcttcacaaca-ttgcattaccaagg |
16230 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16231 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaat |
16303 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13660 - 13480
Alignment:
| Q |
55 |
tcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacat |
154 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
13660 |
tcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaatat |
13562 |
T |
 |
| Q |
155 |
gctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
| || || ||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
13561 |
gtccacacccaattaaatcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattccacatcaa |
13480 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:
Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 270813 - 270997
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
270813 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaaaacccaattatattgttcatctccatatcatttgcattatcaagaaaa |
270911 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
270912 |
catgcccatacacaattaaaaccatagtattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
270997 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Original strand, 236874 - 237057
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
236874 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaatttccaccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcttttgcattatcaagaaaa |
236972 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatc-acacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||| ||||| || ||| |||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
236973 |
tatgtccatacataattaaatcatagcattcatcatctccacatcaatatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
237057 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:
Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 6620 - 6449
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6620 |
aaggactcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
6522 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| ||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
6521 |
aaacatgcccacacacaaataaatcaaagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaacaat |
6449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 106370 - 106297
Alignment:
| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
106370 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
106297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 155
Target Start/End: Original strand, 108343 - 108446
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||| || || ||||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
108343 |
gactcgataatgcgacatcacctcacaatttccaccacaatataaaggacaatttctaaatatattgatcatctccagaacaattgcattattaagaaat |
108442 |
T |
 |
| Q |
152 |
catg |
155 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
108443 |
catg |
108446 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 113883 - 113844
Alignment:
| Q |
196 |
aacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
113883 |
aacatgattatcaattatcaacaatgtcattcaacatcaa |
113844 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0467 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:
Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11504 - 11322
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11504 |
gactcgataatgcaacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacgacacccaattatattgttaatctccacatcatttgcattatcaaggaaa |
11406 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| || | ||| ||| |||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
11405 |
catgcccacatacaattaaatcatagtattcatcatcacacctcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatccaacatcaa |
11322 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0462 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:
Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 200
Target Start/End: Original strand, 4823 - 4970
Alignment:
| Q |
53 |
actcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaac |
152 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4823 |
actcgataacacgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattatattgatcatctccacatcatttgcattatcaagaaaac |
4922 |
T |
 |
| Q |
153 |
atgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacat |
200 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4923 |
atgcccacacgcaatcaattcatagtattcatcatcacacatcaacat |
4970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0104 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:
Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 220
Target Start/End: Original strand, 51719 - 51889
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
51719 |
aaggaatcaataatgcgacaacaattcacaatatcaacctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
51817 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
51818 |
aaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataataacttggttatcaacaatcaacaat |
51889 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:
Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20692 - 20582
Alignment:
| Q |
125 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgcca |
224 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
20692 |
tccacaacacttgcattatcaagaaaacatgcccatacacaaataaattatagtattcaccatcacacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtca |
20593 |
T |
 |
| Q |
225 |
ttcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||||||| |
|
|
| T |
20592 |
ttcaacatcaa |
20582 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20716 - 20686
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
79 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20716 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaa |
20686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0498 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:
Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Original strand, 7673 - 7837
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| | | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7673 |
gactcgataatacgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatatagttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
7771 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaat-aactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
7772 |
catgcccatacacaattaaaatcatagtattcatcaccacacaacaacatgattatcaacaatcaa |
7837 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:
Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 58899 - 59016
Alignment:
| Q |
60 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctca |
159 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
58899 |
aatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataagacgacacccaattatattgatcatctccgcatcatttgcattatcaagaaaacatgccca |
58998 |
T |
 |
| Q |
160 |
tacgcaaataactcatag |
177 |
Q |
| |
|
||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
58999 |
tacacaaataattcatag |
59016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 173 - 220
Target Start/End: Original strand, 59375 - 59422
Alignment:
| Q |
173 |
catagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaat |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
59375 |
catagtattcaccatcacacatcatcatgatcatcaataatcatcaat |
59422 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0266 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:
Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 52 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5067 - 4902
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5067 |
gactcgacaatgcgacaataatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
4969 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaa--ataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaa |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| | || |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4968 |
catgcccatacacaattaaaaatcatagtattcatcaccgcacatcaacatgattatcaacaatcaa |
4902 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0215 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:
Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17561 - 17377
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17561 |
aaggactcgataatgcgacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacacccaatgatattgatcatctccacaaca-ttgcattatcaagg |
17464 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||||| | || || || ||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
17463 |
aaacatgtctacacacagttacatcacagcattcatcatcacacatcaacacgattatcagtaatcaacaatgtcattcaacatcaa |
17377 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0750 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:
Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6805 - 6634
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
6805 |
gactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaaaatttgcattatcatgaaaa |
6706 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattca |
228 |
Q |
| |
|
|||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
6705 |
catgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
6634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0269 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0269
Description:
Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Original strand, 771 - 880
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
771 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
869 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatac |
162 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
870 |
catgcccatac |
880 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 162
Target Start/End: Original strand, 15027 - 15136
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15027 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattatcaagaaaa |
15125 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatac |
162 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
15126 |
catgcccatac |
15136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1560 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:
Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1088
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattt-----tcac-ctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcatta |
142 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1263 |
aaggactcgataatgcgaccacaattcacaatttcaatctcaatctcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcatta |
1165 |
T |
 |
| Q |
143 |
tcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaaca |
218 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1164 |
ccaaggaaacatgcccacacacaaataaatcatagtattcatcatcacataaataacttgattatcaacaatcaaca |
1088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0589
Description:
Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 155
Target Start/End: Original strand, 6570 - 6678
Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6570 |
acaaagactcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttgaattatcaa |
6669 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaaacatg |
155 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
6670 |
gaaaacatg |
6678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 6724 - 6768
Alignment:
| Q |
191 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
6724 |
acatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
6768 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:
Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9397 - 9291
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaaga |
148 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
9397 |
aaggactcgataatgctacaacaatccacaatttcaacctcaatatataggacagcacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagg |
9299 |
T |
 |
| Q |
149 |
aaacatgc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
9298 |
aaacatgc |
9291 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0225 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:
Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 14987 - 15073
Alignment:
| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatt |
135 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14987 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaatttcaacttcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaacatt |
15073 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:
Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 235
Target Start/End: Original strand, 29942 - 30063
Alignment:
| Q |
115 |
attgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataa-t |
213 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
29942 |
attgatcatctccacaacatttgcattatcataaaatcatgtccatacacaaataaatcatagtattcatcatcacacattaacatgattaccaataatt |
30041 |
T |
 |
| Q |
214 |
caacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
30042 |
caacaatgtcattcaacatcaa |
30063 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 121
Target Start/End: Original strand, 27260 - 27336
Alignment:
| Q |
45 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgatt |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
27260 |
gtacaaggactcgataatgcgacaacaattcacaattttctcctcaatatataggacaaaacccaattatattgatt |
27336 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0183 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:
Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 235
Target Start/End: Original strand, 5700 - 5867
Alignment:
| Q |
65 |
gacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatc-caattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacg |
163 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || || |
|
|
| T |
5700 |
gacaacaattcacaatct-caactcaatatataggacaacaccaccattatattgattatctcaacaacatt-gcattatcaagaaaacatgcccacac- |
5796 |
T |
 |
| Q |
164 |
caaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
5797 |
-aaataaatcatagtattcatcctcacacatcaacatatttatcaataatcaacaatgtcatacaaaatcaa |
5867 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0483 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:
Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4218 - 4092
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4218 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
4120 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
179 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
4119 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
4092 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0109 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:
Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 52 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 49058 - 48932
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
49058 |
gactcgataatgcgacaagaatc-acaattttctcctcaatatatatgacaacacccgattatattgttcatctccacatcatttgcattaccaagaaaa |
48960 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaaataactcatagta |
179 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
48959 |
catgcgcatacacaattaaatcatagta |
48932 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0342 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:
Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 52 - 166
Target Start/End: Original strand, 4534 - 4648
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaa |
151 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
4534 |
gactcgataatgtgacaacaattcacaattttcaccacaatatataggacaactcccaattattttgatcatctccacaacatttgcatcatcaataaaa |
4633 |
T |
 |
| Q |
152 |
catgctcatacgcaa |
166 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |
|
|
| T |
4634 |
tatgtccatacgcaa |
4648 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:
Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 20391 - 20489
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
20391 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaa |
20489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 150
Target Start/End: Original strand, 27220 - 27318
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
27220 |
gactcgataatgcgacatcaactcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatatccacaacaattgcattatcaagaaa |
27318 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Original strand, 20527 - 20584
Alignment:
| Q |
179 |
attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
20527 |
attcactatcacatcatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaa |
20584 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 235
Target Start/End: Original strand, 27356 - 27413
Alignment:
| Q |
179 |
attcaccatcaca-cattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27356 |
attcactatcacatcatcaacatgatcatcaataatcaacaatatcattcaacatcaa |
27413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:
Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
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Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatcca-at-tatattgattatttccacaacatttgcattatc |
144 |
Q |
| |
|
|||| |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
145616 |
acaaagacttgataatgcgacatcaattcacgattttcaccacaatatagaggacaacttccatatatatattgatcatctccacaacattagcattatc |
145715 |
T |
 |
| Q |
145 |
aagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattca |
228 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
145716 |
aagaaaacatgtccatacacaatcaaatcataagattcattatcac-----aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattca |
145794 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:
Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 52 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 197572 - 197482
Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattat |
143 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
197572 |
gactcgataatgcgacaacaatc-acaattttctccacaatatataggacaacacccaattatattgttcatctccacatcatttgcattat |
197482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0772 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:
Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 193
Target Start/End: Original strand, 4469 - 4603
Alignment:
| Q |
57 |
gataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaaacatgc |
156 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | |||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4469 |
gataatgcgacaacaattctcaatctcgac-tcaatatataggacaacacccaattatattgattatctccacaaca-ttgcattaccaagaaaacatgc |
4566 |
T |
 |
| Q |
157 |
tcatacgcaaataactcatagtattcaccatcacaca |
193 |
Q |
| |
|
|| || || ||| ||| |||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
4567 |
ccacacacagttaaatcacagtatttatcatcacaca |
4603 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0808 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0808
Description:
Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 2942 - 2839
Alignment:
| Q |
47 |
acaaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaa |
146 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
2942 |
acaaagactcgataatgcgacatcacttcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacaattttattatcaa |
2843 |
T |
 |
| Q |
147 |
gaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
2842 |
gaaa |
2839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0808; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2744
Alignment:
| Q |
196 |
aacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2783 |
aacatgatcatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:
Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17797 - 17686
Alignment:
| Q |
125 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgcc |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | |
|
|
| T |
17797 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaaagtt |
17698 |
T |
 |
| Q |
224 |
attcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
17697 |
attcaacatcaa |
17686 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0244; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 24216 - 24121
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| Q |
125 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatca-cacattaacatgattatcaataatcaacaa |
219 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24216 |
tccacatcatttgcattatcaagaaaatatgtccatacacaattaaatcataacattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaa |
24121 |
T |
 |
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| Q |
55 |
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150 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||| |
|
|
| T |
2114 |
tcgataatgcgacatcaattcacaattttcaccacaatatagaggacaacttccaaatatattgatcatctccacaacatttttattattaagaaa |
2209 |
T |
 |
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191 |
acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2260 |
acatcaacatgatcatctataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
2304 |
T |
 |
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Target: scaffold0125; HSP #1
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| Q |
125 |
tccacaacatttgcattatcaagaaaacatgctcatacgcaaataactcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgcc |
223 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
34334 |
tccacatcatttgtattatcaagaaaacatgtccatacacaattaaatcatagcattcatcatcactacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgtt |
34433 |
T |
 |
| Q |
224 |
attcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
34434 |
attcaacat |
34442 |
T |
 |
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Target: scaffold0507; HSP #1
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| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4801 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
4728 |
T |
 |
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Target: scaffold0095 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
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Target: scaffold0095; HSP #1
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| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7114 |
caattttcacaacaatataaaggacaacttcaaattatattgatcatctccacaacatttgcattatcaagaaa |
7041 |
T |
 |
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Target: scaffold0158 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
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Target: scaffold0158; HSP #1
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
23898 |
catcatacattaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
23948 |
T |
 |
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Target: scaffold0521 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
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Target: scaffold0521; HSP #1
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| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
7290 |
gactcgataatgcgacatcaccccacaatttccacaacaatataaaggacaacatccaaatatattgatcacctctacaacaattacattatcaagaa |
7387 |
T |
 |
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| Q |
77 |
caattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
71728 |
caattttcacaacaatataaaggacaccttccaattatattgatcatctccacaacattcgcattatcaagaaa |
71655 |
T |
 |
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| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3739 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattatcaagaaa |
3667 |
T |
 |
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Target: scaffold2147; HSP #1
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| Q |
49 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
88 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
991 |
aaggactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacct |
1030 |
T |
 |
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Target: scaffold0090; HSP #1
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Alignment:
| Q |
52 |
gactcgataatgcgacaacaatccacaattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaag |
147 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
6116 |
gactcgataatgcaacatcacctcacaattttcacaacaatatagaggacaacttccaaatatattgataatctccacaacaatttcattatcaag |
6021 |
T |
 |
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Target: scaffold1734; HSP #1
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
164 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatcaa |
214 |
T |
 |
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| Q |
172 |
tcatagtattcaccatcac-acattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatcaa |
235 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
1 |
tcatagcattcatcatcaccacatcaacatgatcatcaataatcaacaatgttattcaacatcaa |
65 |
T |
 |
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Target: scaffold0327 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
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Target: scaffold0327; HSP #1
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| Q |
89 |
caatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
4759 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgattatctccacaacatctgcattctcaagaaa |
4820 |
T |
 |
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Target: scaffold0066; HSP #1
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| Q |
185 |
catcacacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacatca |
234 |
Q |
| |
|
||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
53279 |
catcatacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacatca |
53328 |
T |
 |
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Target: scaffold0016; HSP #1
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| Q |
78 |
aattttcacctcaatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
118049 |
aattttcacaacaatataaaggacaacttccaaatatattgatcacctccacaacatttgcattattaagaaa |
117977 |
T |
 |
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acaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaaa |
150 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12936 |
acaacttccaattatattgatcatctccacaacattagcattatcaagaaa |
12986 |
T |
 |
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190 |
cacattaacatgattatcaataatcaacaatgccattcaacat |
232 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3124 |
cacatcaacatgattatcaataatcaacaatgtcattcaacat |
3082 |
T |
 |
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90 |
aatatataggacaacatccaattatattgattatttccacaacatttgcattatcaagaa |
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Q |
| |
|
|||||| |||||| | ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
78265 |
aatataaaggacagcctccaaatatattgatcatctccacaacaattgcattatcaagaa |
78206 |
T |
 |
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Q |
| |
|
||||||| |||||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
34203 |
caatataaaggacaacttccaaatatattgatcatctcctcaacaattgcattatcaag |
34261 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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