View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9929_5 (Length: 504)

Name: NF9929_5
Description: NF9929
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9929_5
NF9929_5
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (14-355)||(26793350-26793695)
chr1 (19-502)||(27799705-27800193)
chr1 (143-502)||(19262088-19262455)
chr1 (143-502)||(39899578-39899924)
chr1 (195-495)||(11788830-11789133)
chr1 (352-464)||(26798866-26798977)
chr1 (98-499)||(48706586-48706997)
chr1 (214-410)||(27800199-27800397)
chr1 (95-275)||(21760294-21760479)
chr1 (397-494)||(21760071-21760168)
chr1 (314-391)||(27259845-27259925)
chr1 (344-392)||(15471903-15471951)
chr1 (424-494)||(27574918-27574988)
chr1 (67-116)||(12026629-12026678)
chr1 (314-375)||(16279015-16279079)
chr1 (452-502)||(16279121-16279171)
chr1 (330-391)||(15471989-15472050)
chr1 (326-390)||(26089138-26089202)
chr1 (399-502)||(42460409-42460512)
chr1 (214-410)||(19261881-19262082)
chr1 (314-391)||(27574804-27574884)
chr1 (329-391)||(48706495-48706557)
chr1 (355-392)||(22923427-22923464)
chr1 (452-501)||(52076217-52076266)
chr1 (344-411)||(11788750-11788818)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (11-502)||(20409446-20409937)
chr3 (67-500)||(29787921-29788357)
chr3 (67-502)||(29634598-29635027)
chr3 (191-502)||(17266965-17267280)
chr3 (203-494)||(50342308-50342602)
chr3 (96-502)||(17370924-17371338)
chr3 (48-252)||(4812229-4812428)
chr3 (96-264)||(1638524-1638697)
chr3 (269-413)||(20409293-20409443)
chr3 (314-413)||(17266859-17266962)
chr3 (314-389)||(1886342-1886420)
chr3 (240-391)||(29634416-29634572)
chr3 (377-495)||(55390615-55390732)
chr3 (371-490)||(1638296-1638412)
chr3 (189-279)||(3162494-3162584)
chr3 (328-389)||(29787830-29787891)
chr3 (329-375)||(14265732-14265778)
chr3 (67-164)||(55390799-55390897)
chr3 (326-390)||(1886235-1886299)
chr3 (326-391)||(29516661-29516726)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (14-502)||(12227162-12227652)
chr4 (19-502)||(44100530-44101019)
chr4 (199-494)||(25144752-25145050)
chr4 (214-391)||(23124246-23124426)
chr4 (214-400)||(44101035-44101228)
chr4 (145-285)||(3510305-3510442)
chr4 (227-485)||(24075341-24075601)
chr4 (95-275)||(31931688-31931874)
chr4 (269-389)||(12227011-12227134)
chr4 (344-438)||(31293276-31293369)
chr4 (329-413)||(23620570-23620655)
chr4 (135-266)||(20759051-20759187)
chr4 (135-266)||(20765442-20765578)
chr4 (425-494)||(24075670-24075739)
chr4 (329-396)||(3393914-3393981)
chr4 (329-396)||(13851076-13851143)
chr4 (389-495)||(20758854-20758960)
chr4 (389-495)||(20765245-20765351)
chr4 (326-411)||(20758627-20758713)
chr4 (326-411)||(20765018-20765104)
chr4 (329-391)||(31324595-31324657)
chr4 (362-502)||(3510086-3510226)
chr4 (409-501)||(35049340-35049432)
chr4 (329-373)||(13866704-13866748)
chr4 (214-411)||(24075752-24075955)
chr4 (329-374)||(9718021-9718066)
chr4 (202-254)||(17292287-17292340)
chr4 (442-494)||(20758726-20758779)
chr4 (442-494)||(20765117-20765170)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (67-502)||(22842990-22843431)
chr8 (143-495)||(12784862-12785218)
chr8 (67-498)||(32108573-32109018)
chr8 (91-499)||(26140265-26140680)
chr8 (191-495)||(10204790-10205102)
chr8 (314-437)||(29370509-29370635)
chr8 (97-499)||(24629606-24630015)
chr8 (96-493)||(27783566-27783967)
chr8 (191-392)||(12504541-12504744)
chr8 (242-391)||(22842810-22842964)
chr8 (385-502)||(32123686-32123803)
chr8 (326-391)||(12504446-12504511)
chr8 (241-388)||(32108391-32108540)
chr8 (289-391)||(12784723-12784830)
chr8 (333-386)||(10205140-10205193)
chr8 (326-375)||(24629512-24629561)
chr8 (214-278)||(12504330-12504394)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (19-438)||(5306211-5306633)
chr2 (269-502)||(23282593-23282826)
chr2 (208-499)||(11718991-11719286)
chr2 (207-502)||(20529434-20529731)
chr2 (220-494)||(18878753-18879029)
chr2 (208-493)||(28276586-28276874)
chr2 (143-292)||(37059057-37059203)
chr2 (214-391)||(20529228-20529408)
chr2 (112-359)||(28746780-28747034)
chr2 (269-393)||(12763805-12763932)
chr2 (96-277)||(18332676-18332862)
chr2 (191-392)||(20988732-20988935)
chr2 (67-392)||(26617255-26617592)
chr2 (399-499)||(12763966-12764066)
chr2 (443-502)||(5305334-5305394)
chr2 (403-502)||(18332986-18333085)
chr2 (445-502)||(37059358-37059416)
chr2 (326-391)||(20988973-20989038)
chr2 (326-411)||(28276356-28276442)
chr2 (329-395)||(31991668-31991734)
chr2 (452-493)||(18879116-18879157)
chr2 (326-375)||(31991574-31991623)
chr2 (258-375)||(5305171-5305292)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (43-502)||(37396775-37397237)
chr5 (67-502)||(7575777-7576216)
chr5 (143-502)||(26604281-26604651)
chr5 (91-499)||(16417781-16418197)
chr5 (40-392)||(19748127-19748485)
chr5 (143-499)||(31488146-31488508)
chr5 (190-502)||(11477578-11477892)
chr5 (96-502)||(10975925-10976339)
chr5 (202-409)||(25360247-25360458)
chr5 (329-494)||(23228373-23228538)
chr5 (344-502)||(34595584-34595743)
chr5 (130-494)||(28718215-28718587)
chr5 (240-391)||(11477396-11477552)
chr5 (397-502)||(19575564-19575669)
chr5 (252-438)||(26604113-26604302)
chr5 (425-494)||(15797848-15797917)
chr5 (40-255)||(15798007-15798228)
chr5 (216-391)||(19748523-19748701)
chr5 (269-391)||(16417625-16417752)
chr5 (127-255)||(23228598-23228731)
chr5 (332-391)||(34595768-34595827)
chr5 (326-411)||(36311490-36311576)
chr5 (240-391)||(6998515-6998671)
chr5 (191-246)||(22858233-22858288)
chr5 (329-487)||(36311596-36311749)
chr5 (252-360)||(37397294-37397405)
chr5 (329-373)||(31238526-31238570)
chr5 (289-392)||(7575647-7575752)
chr5 (216-373)||(25360048-25360208)
chr5 (343-396)||(10398390-10398443)
chr5 (203-255)||(13130905-13130958)
chr5 (191-280)||(12067522-12067613)
chr5 (329-397)||(13130817-13130885)
[»] chr6 (31 HSPs)
chr6 (191-502)||(24560030-24560345)
chr6 (107-499)||(19242924-19243321)
chr6 (329-499)||(20244538-20244709)
chr6 (329-499)||(22138522-22138693)
chr6 (191-438)||(2402414-2402663)
chr6 (146-502)||(22962116-22962483)
chr6 (146-502)||(23825910-23826277)
chr6 (96-495)||(8711002-8711407)
chr6 (69-255)||(23607878-23608066)
chr6 (208-419)||(21864657-21864869)
chr6 (96-277)||(5972935-5973120)
chr6 (69-277)||(14095729-14095942)
chr6 (203-487)||(33200341-33200628)
chr6 (131-409)||(3097284-3097568)
chr6 (425-494)||(33200822-33200891)
chr6 (191-279)||(18743878-18743967)
chr6 (220-331)||(20244410-20244521)
chr6 (220-331)||(22138394-22138505)
chr6 (332-393)||(23607794-23607855)
chr6 (329-383)||(14482544-14482598)
chr6 (371-467)||(5972743-5972839)
chr6 (329-396)||(30764866-30764933)
chr6 (203-277)||(30764987-30765062)
chr6 (452-493)||(21864454-21864495)
chr6 (202-277)||(17465145-17465221)
chr6 (354-465)||(18743691-18743802)
chr6 (452-495)||(14096110-14096153)
chr6 (329-396)||(17465024-17465091)
chr6 (329-395)||(14482635-14482701)
chr6 (345-383)||(23911477-23911515)
chr6 (425-494)||(30764644-30764713)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (171-436)||(16651087-16651354)
chr7 (171-436)||(17625447-17625714)
chr7 (145-436)||(44110051-44110344)
chr7 (191-409)||(28066472-28066694)
chr7 (191-502)||(29656167-29656481)
chr7 (191-488)||(31267293-31267593)
chr7 (189-502)||(1321323-1321634)
chr7 (69-393)||(13304052-13304364)
chr7 (96-470)||(16886209-16886592)
chr7 (344-502)||(26926738-26926896)
chr7 (91-495)||(12083044-12083456)
chr7 (371-502)||(27317496-27317627)
chr7 (329-494)||(7413897-7414062)
chr7 (314-499)||(10546007-10546193)
chr7 (69-246)||(28008860-28009038)
chr7 (67-502)||(7066746-7067189)
chr7 (344-499)||(23553755-23553910)
chr7 (214-411)||(12083596-12083797)
chr7 (344-495)||(5282022-5282173)
chr7 (131-266)||(7414115-7414255)
chr7 (314-419)||(41935116-41935224)
chr7 (96-303)||(12309482-12309694)
chr7 (314-391)||(41934913-41934995)
chr7 (191-294)||(3924961-3925065)
chr7 (326-411)||(5281790-5281876)
chr7 (344-499)||(3925096-3925251)
chr7 (74-137)||(41935406-41935469)
chr7 (314-374)||(3925297-3925359)
chr7 (106-165)||(26926629-26926689)
chr7 (220-266)||(5282464-5282510)
chr7 (329-395)||(11825055-11825121)
chr7 (326-375)||(150680-150729)
chr7 (326-375)||(3380343-3380392)
chr7 (442-494)||(7413768-7413821)
chr7 (452-485)||(12083541-12083574)
chr7 (326-391)||(23553939-23554004)
chr7 (191-255)||(27317745-27317810)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (67-502)||(5438-5881)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (277-501)||(22333-22559)
scaffold0015 (293-391)||(22203-22306)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (143-279)||(1191-1328)
[»] scaffold0591 (1 HSPs)
scaffold0591 (189-330)||(2828-2968)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (314-392)||(37009-37090)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (252-389)||(45911-46051)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 355
Target Start/End: Original strand, 26793350 - 26793695
Alignment:
Q  14 agggtagattgacgttcagtcgaccggaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcga 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26793350 aggggagattgacgttcagtcggccggagttaacgaacgatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccgaggatcga 26793449  T
Q  114 gatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattatt 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26793450 gatggattctacattgctgagatcgccagaagatattctcaagagtttgattcggccaaatgaagatgtttatgtagtattattatgttgtgtcattatt 26793549  T
Q  213 ttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagctta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |    
T  26793550 ttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggtattgcagtgtcttatacttaacgtaaaggtttgcaagtctctttcaaagttca 26793649  T
Q  313 caagaatgaagag---aacacatgtattctgccgaatcaactatat 355  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||    
T  26793650 caagaatgaagagaataaaacatgtattctgccgaatcaactatat 26793695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 502
Target Start/End: Original strand, 27799705 - 27800193
Alignment:
Q  19 agattgacgttcagtcgaccggaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatgg 118  Q
    ||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||| | || ||||||   |||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  27799705 agattgatgtttaatcggccggagttaacgaacgacgatgacgtgatgagcatgttctcaatatttggccagcacaacatgtttccgtggatcgagatgg 27799804  T
Q  119 attctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattatttt-gt 216  Q
    || |||| ||| ||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  27799805 atgctacgttgctggaatctcctgaagatattctcaagagtttgattcggttagatgaagaagtttgggtagtattattattttgtctcattatttttgt 27799904  T
Q  217 tggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||| || |||| || |||||    
T  27799905 tggattttagtttaattcttgttagtttgttgaagatgtcggcattgaagtgtcttatacttattgtaaaggtttgcaagtctattgcaaaactcacaag 27800004  T
Q  317 aatgaagagaacac---atgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttc 413  Q
    ||||||||||| ||   ||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27800005 aatgaagagaatacataatgtattatgttgaatgaactatataagttttcacatcgaattcctttatattggatgagtgtcacaaaagggaatgcatttc 27800104  T
Q  414 taagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  27800105 taagatgttgtttcgagcttgatc-atgttcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggaagtatgattgagttcaaaagaatata 27800193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 143 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 19262455 - 19262088
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgt 238  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  || ||  ||| |||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19262455 agatattctcaacagtttgattccgcctgaagattatgattaggtagcatcattattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttgt 19262356  T
Q  239 tagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgta 335  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||   |||||||    
T  19262355 tagtttgctaaagatgttggtattgaagtgtcttatacttagggtaaaggtttgcaagtttgtttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacaacatgta 19262256  T
Q  336 ttctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac-ataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttg 434  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||     | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19262255 ttctgcagaatcaactatataggttttcacatcaaattcattcgtttaggatgagtgtcacggggtgcgaatgcacttctaagatgttgttttgagcttg 19262156  T
Q  435 atcaattctcctctg-tcattgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    | | || |||||||| | ||||||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  19262155 agc-atgctcctctgttaattgaaacttgtcagtttgtcgggcagtaggattaagttctaaagaatata 19262088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 143 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 39899924 - 39899578
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagt 242  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||             |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39899924 agatattctcaaaagtttgattcggctagatgaagatgtttaggt-------------tgtgtccttattttgttggattttagtttaattcttgttagt 39899838  T
Q  243 ttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacat---gtattct 339  Q
    ||  ||||||||| |  |||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||   ||||| |    
T  39899837 ttattgaagatgttgatattgaagtgttttatacttagtgtaaaggtttgcaagtctctttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacattttgtattat 39899738  T
Q  340 gccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaa 439  Q
     |  ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |   |||||||| |||||||   |||||| | ||||||  |    
T  39899737 acaaaatcaactatattgattctcacatcgaattccttcgtataagatgagtgtgacaaacaagaatgcatctctaaga---tgtttttaacttgat-ga 39899642  T
Q  440 ttctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    | || ||||||| |||||||||||| |||||||| |  | || |||||||||||||||||||||    
T  39899641 tgcttctctgtcaattgaaacttgttagttggcatgacaatatgattaagttcaaaagaatata 39899578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 195 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 11789133 - 11788830
Alignment:
Q  195 ttatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgc 293  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||| |  |||  | |||||    
T  11789133 ttatgtagagtctttattttgttggaattaaagtttaattcttgttagtttactgaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtagtgatttgc 11789034  T
Q  294 aagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgag 390  Q
    ||| |||||| |||  | | |||| | ||||| |||||   ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  11789033 aagcctctttgaaaagtcaaaagatt-aagagcacacaacatgtattctgccaaatcatctatataggttaccacattgaattccttcatataggatgag 11788935  T
Q  391 tgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagt 489  Q
    ||| ||| ||| |||||||  |||||||  || |||||||||||||  || |||||| ||| |||||||||| ||| |||||| || ||||| |||||||    
T  11788934 tgtaacagaagagaatgcacctctaagaggttcttttgagcttgat-tatgctcctccgtcaattgaaacttatcatttggcaaggcagtaaaattaagt 11788836  T
Q  490 tcaaaa 495  Q
    ||||||    
T  11788835 tcaaaa 11788830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 352 - 464
Target Start/End: Original strand, 26798866 - 26798977
Alignment:
Q  352 atatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc 451  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  26798866 atataggttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcaaacaaaggaatgcatttctaagatgttgttttgagcttgatc-atgctccttggtc 26798964  T
Q  452 attgaaacttgtc 464  Q
    ||||||| |||||    
T  26798965 attgaaatttgtc 26798977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 98 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 48706997 - 48706586
Alignment:
Q  98 tgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagat---gaagat---gtttaggtagt 190  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||  ||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||    ||||||   ||||||||  |    
T  48706997 tgttcccatggatcgatatgtatgttacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaagagtttgattctgctagaaccagaagattatgtttaggtttt 48706898  T
Q  191 --attattatgttgtgtcattatttt-gttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaag 286  Q
      ||||||||||  |||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||  |||||||||||| |||      
T  48706897 tcattattatgtaatgtctttatttttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgttgaatatgttggcaatgaagtgtcttatacttagtgtaga 48706798  T
Q  287 ggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtata 383  Q
    | ||| ||||  ||||| |||  | | || |||||||||||||||   |||||| | | |||  || ||||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  48706797 gatttccaagattctttgaaaagtca-aataatgaagagaacacaacatgtattttactgaa--aagtatatatattttcacattgaatccctt-gtata 48706702  T
Q  384 ggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaag 482  Q
     ||||||||  || ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| | |||| |    
T  48706701 agatgagtgagacgtaagggaatgcacatctaagatgttgttttgtgcttaatca-tgctcctctatcaattgaaacttgttagttggcagtgcagtagg 48706603  T
Q  483 attaagttcaaaagaat 499  Q
    | |||||||||||||||    
T  48706602 agtaagttcaaaagaat 48706586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27800397 - 27800199
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttac 313  Q
    |||||||||| | || ||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||  | |     
T  27800397 tgttggatttaaattaaattcttgaaagtttgcggaa-atgtcggcattgaagtgtcttatacttagtataa---tttgcaagtctctttcaaaattcaa 27800302  T
Q  314 aagaatgaagagaa-----cacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatg 407  Q
    ||||||||||||||     |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||| || ||||||    
T  27800301 aagaatgaagagaatacaacacatgtattctaccgaatcaactatatatgttattacatccaatcccttcatataggatcagtagtcacagaaaggaatg 27800202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21760479 - 21760294
Alignment:
Q  95 acatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat- 192  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  | || ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||  | | || |  |||||||||||| ||     
T  21760479 acatgttcccgaggattgagatggaaaccacgttgatgagatcgtctgaagatattctcaacagtttgattctaccatataattatgtttaggtagcatc 21760380  T
Q  193 --tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttata 275  Q
      |||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||  |||||||    
T  21760379 attattatgtagtgtctttattttattggaatttaagtttaattcttattagtttgttgaagatgttggtattgaagtgtcttata 21760294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 21760168 - 21760071
Alignment:
Q  397 ataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21760168 ataagggaatgcacctctaagatgttgttttgtacttgatca-tgcccctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcaataagattaagttcaaa 21760071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27259925 - 27259845
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacac---atgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27259925 aagaatgaagagaacaacaaatgtattctacataatcaactatatatgttttcacatcgaatcccttcatataggatgagt 27259845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 344 - 392
Target Start/End: Original strand, 15471903 - 15471951
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtg 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15471903 aatcaactatatatattttcacatcgaattcctttgtataggatgagtg 15471951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 27574988 - 27574918
Alignment:
Q  424 ttttgagcttgatcaattctcctctgtcatt-gaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27574988 ttttgagtttgatca-tgctcctctgtcatttgaaagttgtcagttggcaggggagtaagattaagttcaaa 27574918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 116
Target Start/End: Original strand, 12026629 - 12026678
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12026629 agcatgttctcgatatttggtcagcacaacatgttcctaaggatcgagat 12026678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Original strand, 16279015 - 16279079
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacacatgt---attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    ||||||||||||||||||| |   ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16279015 aagaatgaagagaacacattttatattctaccaaatcaactatataggttttcacatcgaattcc 16279079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 16279171 - 16279121
Alignment:
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16279171 attgaaacttgtcagttgacagggcagtagaattaagttcaaaagaatata 16279121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15472050 - 15471989
Alignment:
Q  330 catgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15472050 catgtattctagcaaattaactatataagttttcacatcgaatcccttcatataggatgagt 15471989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26089202 - 26089138
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgag 390  Q
    |||||| |||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26089202 aacacaggtattctagcaaatcaactatataagttctcacatcgaatcccttcatataggatgag 26089138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 399 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 42460512 - 42460409
Alignment:
Q  399 aagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaaga 497  Q
    ||||||||||||||| || || |||||| |||||||||| ||  | ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||    
T  42460512 aagggaatgcatttccaatatgttgtttcgagcttgatc-atgtttctctgtcaattaaaacatgtcagttggcagggcaacatgatgaagttcaaaaga 42460414  T
Q  498 atata 502  Q
    |||||    
T  42460413 atata 42460409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 410
Target Start/End: Original strand, 19261881 - 19262082
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttac 313  Q
    |||||||||| | |||| |||| |  ||||||| ||| ||||||| |||||||  || ||||||||  |||    ||||||||||| ||| ||| || |     
T  19261881 tgttggatttaaatttatttctggaaagtttgccgaaaatgtcggaattgaagtgtcgtatacttaatgtagaaatttgcaagtctgtttgaaaactcaa 19261980  T
Q  314 aagaatgaagagaa---cacatgtattctgccgaatcaactatatatgtttt-cacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgc 408  Q
    || ||| |||||||   |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  19261981 aataataaagagaaaaacacatgtattctacaaaatcatctatataggtttttcacatctaatcccttcatataggatgagtcatcacataaaggaatgc 19262080  T
Q  409 at 410  Q
    ||    
T  19262081 at 19262082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Original strand, 27574804 - 27574884
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaaca---catgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  27574804 aagaatgaagagaacaacacatgtattctagcaaatcaactttataggttttcacatcgaattctctcatataagatgagt 27574884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 391
Target Start/End: Original strand, 48706495 - 48706557
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||    
T  48706495 acatgtattctaccgaatcaaatatataggttataacatcgaattccctcatataagatgagt 48706557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22923464 - 22923427
Alignment:
Q  355 tatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtg 392  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22923464 tatgttttcacattgaattcctttgtataggatgagtg 22923427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 52076266 - 52076217
Alignment:
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatat 501  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  52076266 attgaaacgtgtcagttgacatggtagtatgataaagttcaaaagaatat 52076217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 344 - 411
Target Start/End: Original strand, 11788750 - 11788818
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatt 411  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||    
T  11788750 aatcaactatgtatgttatcacatcgaatcccttcatataagatgagtcatcacagaaaggaatgcatt 11788818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20409937 - 20409446
Alignment:
Q  11 catagggtagattgacgttcagtcgaccggaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggat 110  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||   ||||| |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20409937 cataggggagattgacgttcaatcggcagcagttaacgaac---gacgatgtgaggagcatgttctcgatatttggtcaacacaacatgttcccgaggat 20409841  T
Q  111 cgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcatt 209  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  || ||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20409840 tgagatcgatgctacattgttgagatcgccttaagatattttcaagagtttgattatgccagatgattaagtttaggtagtattattatgttgtgccatt 20409741  T
Q  210 attttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagc 309  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  20409740 attttgttggattttagtttaactcttgttagctttttgaagatgttggcattgaagtgtgtgatagttagcgtaaaggtttgcaagtctctttcaaaac 20409641  T
Q  310 ttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaat 406  Q
    | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  20409640 tcacaagaatgaagagaacacaacatgtattctgccgaatcaactatataagttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtaagaaaagggaat 20409541  T
Q  407 gcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||||| | | ||| ||||| || |||||||| ||||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  20409540 gcatttctaagatgttgttt-gtgtttgatca-tgcccctttgtcaattaaaacttgttagttgacagagcagtaggattaagttcaaaataatata 20409446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 67 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 29788357 - 29787921
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    | ||||||||||||| || | ||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  29788357 agcatgttcttgatatttggtcagcacaacatgtttgtgacgatcgagatggatacttcgttgctgagatcacttgaagaaattctcaagagtttgattc 29788258  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaa 265  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  29788257 ggtcagatgaagatgtttaggtagtattattatgtagtgtctttattttgtttgattttagtttaattcatggtagtttgctgaagatgttgacattgaa 29788158  T
Q  266 gcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacac--atgtattctgccgaatcaactatatatgttttc 363  Q
    |  |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29788157 gtgtcttatacttagcgtaaaaatttgcaagtctctttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacgtttgtattctaccgaatcaactatataagttttc 29788058  T
Q  364 acatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttg 462  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||  |   |||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||||||||    
T  29788057 acatcgaattccttcgtataatttgagtgtgacgaacaagaatgcatttataagatgttgttttgagtttgatc-atgctcctatgtcaattgaaacttg 29787959  T
Q  463 tcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaata 500  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||    
T  29787958 tcagttggtagggaaatgagattaagttcaaaaaaata 29787921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29635027 - 29634598
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| ||| |||||||| | | |||||| ||||||| |  |||||||| ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  29635027 agcatgttcttgatatttgattagcacaacttgttcccgacaatcgagatagatgctccgttgctgagatcgcctgaagatattctcaagagtttgaatc 29634928  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaa 265  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  29634927 ggtcagatgaaggtgtgtaggtagtattattatgttgtgtccttattttgttgaattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttgacattgaa 29634828  T
Q  266 gcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgtttt 362  Q
    |  |||| ||| |||| ||| ||||||   |||||||| |||  ||  ||| ||||| |||||   ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |    
T  29634827 gtgtcttttacatagcataaaggtttggtggtctcttttaaattttgaaagcatgaatagaacacaacatgtaatctaccgaatcaactatataagttct 29634728  T
Q  363 cacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaactt 461  Q
    |||||| |          ||| ||||||||  ||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  29634727 cacatcaa----------ataagatgagtgggacaaaagggattgcacttctaagatgttgttttgtgtttgatc-atgttcctttgtcaattgaaactt 29634639  T
Q  462 gtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||||| | |  |||| |||||||||||||||||||||    
T  29634638 gtcagttggtatgacagtaggattaagttcaaaagaatata 29634598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 191 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 17267280 - 17266965
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||  |||||||||||| |||  | |    
T  17267280 attattatgtaatgtctttattttgttgtaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaatatgttggtaatgaagtgtcttatacttagtgtacagat 17267181  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctg-ccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagg 385  Q
    |||||||  ||||| |||    | |||||||||||||||   |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17267180 ttgcaagattctttgaaaagaca-aagaatgaagagaactcaacatgtttttttaccgaatcaactatatatgttttcacatcgtattcctttgtatagg 17267082  T
Q  386 atgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagat 484  Q
    |||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  17267081 atgagtgtgacgtaagggaaagcacctctaagatattgttttgtgcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggaagtgcagtaagat 17266983  T
Q  485 taagttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  17266982 taagttcaatagaatata 17266965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 203 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 50342602 - 50342308
Alignment:
Q  203 tgtcattattttgttggattttagttt-aattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctct 301  Q
    |||| |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |  |||  | ||| |||  ||||    
T  50342602 tgtctttattttgttggaaattaattttaattcttgttagtttgctgaagttgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtagtgatttacaaacctct 50342503  T
Q  302 ttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacat 398  Q
    || |||  | | ||| || |||| |||   ||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||     
T  50342502 ttgaaaagtcaaaag-attaagaaaacacaacatgtattctgcagaatcaactatataggttaccacatcgaattccttcgtatagaatgagtgttccag 50342404  T
Q  399 aagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    |||||||||||  |||||||  || |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  50342403 aagggaatgcacctctaagaggttcttttgagcttgatc-atgctcctttgtcatttgaaacttgtcagttggtagcgaagtaagattaagttcaaa 50342308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 502
Target Start/End: Original strand, 17370924 - 17371338
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat-- 192  Q
    ||||||||| | ||| ||||||| | | || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  | | | ||  |||| ||||||| ||      
T  17370924 catgttcccgatgattgagatggttgcaacgttgttgaggtcgcctgaagatattctcaagagtttgattcttccacaagattatgtataggtagcataa 17371023  T
Q  193 -tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||  |||||| |||  | || || ||| |||  |||||||||||| |||| ||||    
T  17371024 ttattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattaatggaagtttgatgagaaagttggtattaaagtgtcttatacttagggtaaaggtt 17371123  T
Q  291 tgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacac-----atgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagg 385  Q
    |||| | || ||| ||| || | |||||| ||||||||||     |||||||||    |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17371124 tgcacggctatttgaaaactcaaaagaataaagagaacacggcacatgtattctaaa-aatcaactttataggttt-cacattgaattccttcatatagg 17371221  T
Q  386 atgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagat 484  Q
    |||||||| ||  | | ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| | |||| |||    
T  17371222 atgagtgtgacgaacgagaatgcaattctaagatgttgttttgtgcttgatc-atgctcctttgtcaattgaaacttgttagttggcagtgcagtaggat 17371320  T
Q  485 taagttcaaaagaatata 502  Q
    |||| |||||||||||||    
T  17371321 taagctcaaaagaatata 17371338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 48 - 252
Target Start/End: Original strand, 4812229 - 4812428
Alignment:
Q  48 gaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gat 146  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | | |||| || |||||  |   ||| |||||||  |||| |||    
T  4812229 gaacaatgacgacgtgaggagcatgttc--gatatttggtcagcacaacatgttctcgacgatcaagttggatgttttgttggtgagatcttctgaagat 4812326  T
Q  147 attctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgc 246  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||    | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4812327 attctcatgactttgattcggccagatga----gattaggttgtattattatattgtgtcattatttggttggattttagtttaattcttgttagtttgg 4812422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 96 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1638697 - 1638524
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtatta 194  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| | ||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| || | |  |  |||||||||||| ||||    
T  1638697 catgttcccgaggattgagatggaagatacattgctcagatcacctggagatattcttaagagtttgtttctgccataaaattatgtttaggtagcatta 1638598  T
Q  195 ttat---gttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattga 264  Q
    ||||   || ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1638597 ttattacgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttgttattttgctgaagatgttggtattga 1638524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 413
Target Start/End: Original strand, 20409293 - 20409443
Alignment:
Q  269 tcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaaca-----catgtattctgccgaatcaactatatatgttttc 363  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| |  | ||||||||||||||||     |||||||||| | |||||||||||||| ||| ||    
T  20409293 tcttatacttagtgtaaaaatttgctagtctctttcaaaacacaaaagaatgaagagaacacaacacatgtattctactgaatcaactatataagttatc 20409392  T
Q  364 acatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatttc 413  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||| ||||||||    
T  20409393 acattgaatcccttcatataggatgagtcgtcacaaaaaggattgcatttc 20409443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 413
Target Start/End: Original strand, 17266859 - 17266962
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaaca---catgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtc-acataagggaatgca 409  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||  | |||||| ||||||||    
T  17266859 aagaatgaagagaacaacacatgtattccaccaaatcaactatatatgttttcacatcgaatccttttatataggatgagtaacgacataaaggaatgca 17266958  T
Q  410 tttc 413  Q
    ||||    
T  17266959 tttc 17266962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 314 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1886420 - 1886342
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatga 389  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  1886420 aagaatgaagagaacacaacatgtattttaccaaatcaactatatatgttttcacatcgaattccgttgtataagatga 1886342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 240 - 391
Target Start/End: Original strand, 29634416 - 29634572
Alignment:
Q  240 agtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaa-----cacatgt 334  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||   ||||  ||||||||| ||| || | ||||||||||||||     |||||||    
T  29634416 agtttgttgaaaatgtcagcattgaaatgtcttatacttagtgtaaaaatttggtagtctctttaaaaactcaaaagaatgaagagaatgcaacacatgt 29634515  T
Q  335 attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  29634516 attctaccaaatcaactttatatgttatcacatcgaatattttcatataggatgagt 29634572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 55390732 - 55390615
Alignment:
Q  377 tcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcaggg 475  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||| |  |||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  55390732 tcgtataagatgagtgtcacaaaagagaatgcacttcta-gatgtagtttcgtacttgatca-tgctcatctgtcaattgaaacttgtcagttggcaagg 55390635  T
Q  476 tagtaagattaagttcaaaa 495  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  55390634 cagtaggattaagttcaaaa 55390615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 371 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 1638412 - 1638296
Alignment:
Q  371 attccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttg 469  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||   ||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  1638412 attccttcatataagatgagtgggacataagggaatgcacctctaagat---gttttgtacttcatca-tgctcctctgtcaattgaaacttgttagttg 1638317  T
Q  470 gcagggtagtaagattaagtt 490  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  1638316 gcagggcagtatgattaagtt 1638296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 189 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3162584 - 3162494
Alignment:
Q  189 gtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatactta 279  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||| || ||||||| |||||||||   | ||||||  |||||||||||    
T  3162584 gtattattatgtagtgtcattattttattggaattaagtttaattcatggtagtttgttgaagatgttttctttgaagtgtcttatactta 3162494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 389
Target Start/End: Original strand, 29787830 - 29787891
Alignment:
Q  328 cacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatga 389  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  29787830 cacatgtattctaccgaatcaactatataggttctcacatcaaattccttcatataagatga 29787891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14265778 - 14265732
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14265778 acatgtattatgcagaatcaactatatatgttatcacatcgaattcc 14265732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 55390897 - 55390799
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgatt 164  Q
    |||||| ||||  ||||| ||||||||   |||||| | ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  55390897 agcatgttctcagtatttcgtcaacaccgtatgttcgcgaggattgagatggatgctacattgttgatatcacctgaagatattctcaaaagtttgatt 55390799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 390
Target Start/End: Original strand, 1886235 - 1886299
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgag 390  Q
    ||||||||||||||  | |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  1886235 aacacatgtattctagcaaatcaactgtataagttctcacatcgaatcccttcatataggatgag 1886299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 391
Target Start/End: Original strand, 29516661 - 29516726
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    |||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||| ||||| | || |||| |||||||    
T  29516661 aacacatgtattctaccaaatcaactttataggttttcacattgaatttcctcatataagatgagt 29516726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12227652 - 12227162
Alignment:
Q  14 agggtagattgacgttcagtcgaccggaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcga 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||   |||||| ||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||    
T  12227652 aggggagattgacgttcagtcggccggaggtaacgaatgacgacgacgtgaggagcatgttctcgatatttggtttgcacaacatgttctcgaggatcga 12227553  T
Q  114 gatggattctacattgttgagatcgcctgag-atattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattatt 212  Q
    ||||||| |||  ||| |||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||  || ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12227552 gatggatgctatgttgctgagattgcttgagtatattttcatgagtttgattatgctagatgattatgtttaggtaatattattatgttgtgtcaatatt 12227453  T
Q  213 ttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagctta 312  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  | ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||| || |    
T  12227452 ttgctcgattttagtttaattcttgttaatttgctgaagatgttgacattgaagtgtgttatagttagcgtaaaggtttgcaagtct--ttcaaaactca 12227355  T
Q  313 caagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgca 409  Q
    ||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||    
T  12227354 caagaataaagagtacacaacttgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataagatgagtgtcacaaaaggaaatgca 12227255  T
Q  410 tttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||| |||||| |||||||| |||||||| ||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||    
T  12227254 tttttaagatgttgttttgtgcttgatc-atgttcctgtgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcactatgattaagttcaaaataatata 12227162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 19 - 502
Target Start/End: Original strand, 44100530 - 44101019
Alignment:
Q  19 agattgacgttcagtcgaccggaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatgg 118  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||| ||| | ||||| |||   |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  44100530 agattgacgttcagtcagccagagttaacaaactacgacgatgtgaggagcatgttatcgacatttggtcagcacaacatgtttccgaggatcgagatgg 44100629  T
Q  119 attctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatg-ttgtgtcattattttgt 216  Q
    || |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||| |    
T  44100630 atgctacattgctgagatcacctgaagatattctcaagaatttgattcggtcagaggaagatgtttaggtattattattattattatgtcattgtttttt 44100729  T
Q  217 t-ggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaa 315  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||||||||   ||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  44100730 ttggattttagtttaattcttgttagtttgttgaagatgttggcattgaattgtcttatacttagttcaaaagtttgcaagtctatttcaaaacttacaa 44100829  T
Q  316 gaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcattt 412  Q
    |||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44100830 gaatgaagagaaaacaatatgtattatgccgaatcaactatataagttctcacatcgaattccttcgtataagatgagtgtcacaaaaggaaatgcattt 44100929  T
Q  413 ctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
     |||||| |||||||| | |||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44100930 ataagatgttgttttgtgtttgatc-atgctcctctatcaattgaaacttgtcagttggcaaggtagtaagattaagttcaatagaatata 44101019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 494
Target Start/End: Original strand, 25144752 - 25145050
Alignment:
Q  199 gttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagt 297  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |  |||  |  |||||||     
T  25144752 gttgtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtagtgacttgcaagc 25144851  T
Q  298 ctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtc 394  Q
    ||| || |||  | | |||| |||||||||||||   |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  25144852 ctcattgaaaagtcaaaaga-tgaagagaacacaacatgtattctgcagaatcagttatataagttatcatatggaattccattgtataggatgagtgtc 25144950  T
Q  395 acataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaa 493  Q
    ||| |||||||||||  |||||||  || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25144951 acagaagggaatgcacctctaagaagttcttttgagcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgttagttggcagggcagtaagattaacttcaa 25145049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 214 - 391
Target Start/End: Original strand, 23124246 - 23124426
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttac 313  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||| |||| |||||| |||||| ||| ||| ||||     
T  23124246 tgttggatttaaattaaattcttgttagattgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatgcttagggtaaaggtttgtaagtctgtttgaaaacttaa 23124345  T
Q  314 aagaatgaagag---aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    || |||||||||   |||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || |||| |||||||    
T  23124346 aataatgaagagaacaacacatgtattctacaaaatcatctatataggttttcacatcgaattctctcatataagatgagt 23124426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44101228 - 44101035
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaaggg-tttgcaagtctctttcaaagctta 312  Q
    |||||||||| | || ||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||| || |    
T  44101228 tgttggatttaaattaaattcttgaaagtttgcggaatatgtcgacattgaagtgtcttatacttagtgtaaaaaatttgcaagtctctttcaaaactca 44101129  T
Q  313 caagaatgaagagaacaca-----tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataa 400  Q
     ||||||||||||||||||     |||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  44101128 aaagaatgaagagaacacaacacatgtattataccgaatcaactatataggttatcgcatcgaatccctttatataggatgagtagtcacataa 44101035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 3510442 - 3510305
Alignment:
Q  145 atattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagttt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||||   || || || ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||    
T  3510442 atattctcaaaagtttgattcggtctgatgaagat---taagttgttttattatgtagtgtcattattttgttggaattaagtttaattcatggtagttt 3510346  T
Q  245 gctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaa 285  Q
    | |||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  3510345 gttgaagatgtttgcattgaagtgtcttatacttagtgtaa 3510305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 227 - 485
Target Start/End: Original strand, 24075341 - 24075601
Alignment:
Q  227 tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagaga 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |  | |  | |||||||| |||||| |||  | | |||| | ||||||    
T  24075341 tttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgcagtgatttgcaagcctctttgaaaagtcaaaagatt-aagaga 24075439  T
Q  327 acaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattg 423  Q
    |||||   |||||||| | |||||| |||||||  |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  |||||||  ||     
T  24075440 acacaacatgtattctacagaatcagctatatagattttcacataaaattccttcttatatgatgagtgtcacggaagggaatgcacatctaagaggttc 24075539  T
Q  424 ttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatt 485  Q
     |||||  | ||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24075540 ctttgaattggatc-gtgctcctctatcaattgaaacttgtcagttggcaggacagtaagatt 24075601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 275
Target Start/End: Original strand, 31931688 - 31931874
Alignment:
Q  95 acatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagta-- 191  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||   ||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || | ||||  ||||||| || | |      
T  31931688 acatgttcccgaggattgagatggaagttacgttgctgagatcgcctgaagatattctgaagaatttgattctgccacatgattatgtttatgtggcacc 31931787  T
Q  192 -ttattatgttgtgtcattattttgttggattttag--tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttata 275  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||    
T  31931788 attattatgtagtgtctttattttgtcggaatttaagttttaattcttgttagtttgcggaagatgttggtattgaagtgtcttata 31931874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 389
Target Start/End: Original strand, 12227011 - 12227134
Alignment:
Q  269 tcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca-----tgtattctgccgaatcaactatatatgttttc 363  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||     |||||||| || ||||||||||||| ||| ||    
T  12227011 tcttatacttagtgtaaaaatttgcaagtctctttaaaaact--caagaatgaagagaacacaacatttgtattctaccaaatcaactatataagttctc 12227108  T
Q  364 acatcgaattccttcgtataggatga 389  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||    
T  12227109 acatcgaatctcttcatataggatga 12227134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31293369 - 31293276
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatca 438  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31293369 aatcaactatacatattctcacatcgaattccttcgtataagatgagtgtgaca-aacaaaatgcatttctaagatgtagttttgagtttgatca 31293276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 413
Target Start/End: Original strand, 23620570 - 23620655
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatttc 413  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23620570 acatgtattatgcagaatcaactatatatgttatcacatcgaattctctcatataagacgagtcgtcacataaaggaatgcatttc 23620655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20759187 - 20759051
Alignment:
Q  135 atcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgtt---gtgtcattattttgttggatttta-gttt 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||  | ||| ||  ||| ||||||||||| |||||  |   ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  20759187 atcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatgattaggtagtatcattataatctagtgtctttattttgttggaatttaagttt 20759088  T
Q  230 aattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaag 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  20759087 aattcttgttagtttgctgaaaatgttggtattgaag 20759051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 135 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20765578 - 20765442
Alignment:
Q  135 atcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgtt---gtgtcattattttgttggatttta-gttt 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||||||  | ||| ||  ||| ||||||||||| |||||  |   ||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  20765578 atcgcctgaagatattctcaacaatttgattccaccagaagattatgattaggtagtatcattataatctagtgtctttattttgttggaatttaagttt 20765479  T
Q  230 aattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaag 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  20765478 aattcttgttagtttgctgaaaatgttggtattgaag 20765442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 425 - 494
Target Start/End: Original strand, 24075670 - 24075739
Alignment:
Q  425 tttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24075670 tttgagcttgatca-tgctcctatgtcaattgaaacttgtcagttggcagagcagtaagattaagttcaaa 24075739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 3393914 - 3393981
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac 396  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3393914 acatgtattatgccgaatcaactatgtaagttatgatatcgaattccttcatataagatgagtgtcac 3393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Original strand, 13851076 - 13851143
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac 396  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13851076 acatgtattatgcagaatcaactatataagttatgatatcgaattccttcatataagatgagtgtcac 13851143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20758960 - 20758854
Alignment:
Q  389 agtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaa 487  Q
    ||||||||  |||||||| ||  |||||||  || |||||||||||| || | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  20758960 agtgtcacggaagggaatccacctctaagaggttcttttgagcttgacca-tgctcctctttcaattgaaatttgtcagttggcaggacagtaagattaa 20758862  T
Q  488 gttcaaaa 495  Q
    ||||||||    
T  20758861 gttcaaaa 20758854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 20765351 - 20765245
Alignment:
Q  389 agtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaa 487  Q
    ||||||||  |||||||| ||  |||||||  || |||||||||||| || | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  20765351 agtgtcacggaagggaatccacctctaagaggttcttttgagcttgacca-tgctcctctttcaattgaaatttgtcagttggcaggacagtaagattaa 20765253  T
Q  488 gttcaaaa 495  Q
    ||||||||    
T  20765252 gttcaaaa 20765245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 20758627 - 20758713
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatt 411  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20758627 aacacatgtattctacaaaatcaactctataagttatcacatcgaattccctcatataagatgagtcatcacataaaggaatgcatt 20758713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 20765018 - 20765104
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatt 411  Q
    |||||||||||||| |  |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||| ||||||||||    
T  20765018 aacacatgtattctacaaaatcaactctataagttatcacatcgaattccctcatataagatgagtcatcacataaaggaatgcatt 20765104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31324657 - 31324595
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  31324657 acatgtattatgcagaatcaactatatatgttatcatatcgaattctctcgtataagatgagt 31324595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 362 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 3510226 - 3510086
Alignment:
Q  362 tcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgt-cattgaaact 460  Q
    ||||||| || || |||||||| || ||| || ||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||     
T  3510226 tcacatcaaagtcattcgtataagaagagggtgacgaaagggaatgcatttccaagatgtctttttgagcttgatc-atgctcctctgtccattgaaaca 3510128  T
Q  461 tgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||||| |||| | || |||| ||| |||||| || |||||||    
T  3510127 tgtcaattggtatggcagtaggataaagttccaatgaatata 3510086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 409 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 35049432 - 35049340
Alignment:
Q  409 atttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatat 501  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| | | ||| ||||||||||||    
T  35049432 atttccaagatgttgttttgagcttgatca-tgctcctatgtcaattgaaacatgtcagttggcagagcagtagggtgaagctcaaaagaatat 35049340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13866748 - 13866704
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaatt 373  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13866748 acatgtattatgcagaatcaactatatatgttatcacatcgaatt 13866704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24075955 - 24075752
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttac 313  Q
    |||||||||| | |||||||||||  ||||| |  || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||   |||| | |||  | |     
T  24075955 tgttggatttaaatttaattcttgaaagttttccaaaaatgttggcattgaagtgtcttatacttagcgtagtgatttgcagcgctctctgaaaagtcaa 24075856  T
Q  314 aagaatgaagagaacaca-----tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatg 407  Q
    ||||||||||| ||||||     ||||||||    |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||    
T  24075855 aagaatgaagaaaacacaacacatgtattctaaaaaatcaactatataaattctcacatcgaattccttcttatacgatgagtcatcacaaaaaggaatg 24075756  T
Q  408 catt 411  Q
    ||||    
T  24075755 catt 24075752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9718066 - 9718021
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattc 374  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9718066 acatgtattatgcagaatcaactatatatgttatcacatcaaattc 9718021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 254
Target Start/End: Original strand, 17292287 - 17292340
Alignment:
Q  202 gtgtcattattttgttggattttagtttaa-ttcttgttagtttgctgaagatg 254  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17292287 gtgtctttattttgttggaatttaaattaaattcttgttagtttgctgaagatg 17292340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20758779 - 20758726
Alignment:
Q  442 ctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20758779 ctcctctgtcaattgagacttgttagttggcagggtagtaagattcaattcaaa 20758726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 20765170 - 20765117
Alignment:
Q  442 ctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20765170 ctcctctgtcaattgagacttgttagttggcagggtagtaagattcaattcaaa 20765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22843431 - 22842990
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||   || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22843431 agcatgttctcgatgtttggtcagcacaacatgtttccgacgatcgagatggatgctttgtttttgagatcgcctgaagttattctcaagagtttgattc 22843332  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaa 265  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22843331 ggccagacgaagatgtttaggtagtatta-tatgttgtgtcattattttgttgga-tttagtttaattcttcttagtttgctgaagatgttggcattgaa 22843234  T
Q  266 gcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgtttt 362  Q
       |  || | |||||| || ||||||||||||||||||| | || ||||||| ||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22843233 ttgttctacagttagcgcaaaggtttgcaagtctctttcataactcacaagaaagaagataacacaacttgtattctaccgaatcaactatataagtttt 22843134  T
Q  363 cacatcgaattccttcgta----taggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaa 457  Q
    |||||| ||||||||| ||    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  22843133 cacatcaaattccttcctatagctaggatgagcgtcacaaaagtgaatgcatttctaagatattgttttgagcttgctc-atgctcctctgtcaattgaa 22843035  T
Q  458 acttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||    
T  22843034 acttgttagttggcagggcagtagggttatgttcaaaagaatata 22842990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 143 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 12785218 - 12784862
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagt 242  Q
    |||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| || |||||||||| || ||||    
T  12785218 agatattaacaagagtttgattcgactagatgaagatgtttaggtaatattattatgtagtgtgtttattttgttggaattaagtttaattcatgatagt 12785119  T
Q  243 ttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaa-gaatgaagagaa---cacatgtattc 338  Q
    ||| |||| |||| ||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||    ||||||||||    
T  12785118 ttgatgaaaatgttggcattgaagtgtgttatacttagtgtaaaggtttgcaagtctctttcaaaactcaaaaggaatgaagagaatacaacatgtattc 12785019  T
Q  339 tgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatca 438  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12785018 taccgaatcaactatatacgttttcacatcaaatttcttcgtataagatgagtgtgacaaacgggaatgcatttctaagatgttgttttgagcttgatc- 12784920  T
Q  439 attctcctctg-tcattgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaa 495  Q
    || ||||| || | ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| |||||    
T  12784919 atgctcctttgttaattgaaacttgtcagttggcagaccagtatgattaagtccaaaa 12784862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 32109018 - 32108573
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| | | ||||||| |||||  | | ||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  32109018 agcatgttctcgatatttggtcagcacggcatgttctcgacgatcgagttggatgtttcgttgctgagatcttctgaagatattcgcaagagtttgattc 32108919  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtatta----------ttatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
    ||  ||||||| |||||||||| ||||||          | |||| ||||||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||| ||||| |||    
T  32108918 ggacagatgaaaatgtttaggttgtattaaattgtattataatgtagtgtcattattttgttggaattaagtttaatttatggtagtttgttgaagttgt 32108819  T
Q  256 cggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacatgt---attctgccgaatcaacta 352  Q
      |||||||||  |||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| ||| ||   ||||||| | | |||||||||   ||||| |||| |||||||    
T  32108818 ttgcattgaagtgtcttatacttagtgtaaagttttacaagtctctttgaaaactcgaaagaatggataaaacacatgttgtattctaccgagtcaacta 32108719  T
Q  353 tatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc- 451  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  32108718 tataggttctcacatcgaattcattcgtataagatgagtgtgacaaacgagaatgcatttctaagacgttgttttgagcttgatc-atgctcctctgtca 32108620  T
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaa 498  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32108619 attgaaacttgtcagttgccagggcagtaggattaagttcaaaagaa 32108573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 91 - 499
Target Start/End: Original strand, 26140265 - 26140680
Alignment:
Q  91 cacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    | |  |  ||||||||||||    
T  26140265 cacaacatgttcccatggatcgatatgtatgttacgttgttgagatcgcctgaagatattcttaagagtttgattctttcaaaaaattatgtttaggtag 26140364  T
Q  190 tat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaa 285  Q
     ||   ||||||||  |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||   |||||||||||| |||     
T  26140365 catcattattatgtattgtatttattttgttggaatttatgtttaattcttgttagtttactgaatatgttggcattgaaatgtcttatacttagtgtag 26140464  T
Q  286 gggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtat 382  Q
     | |||| |||  ||||| |||  | | | ||||||||||||||||   |||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26140465 agttttgtaagattctttgaaaagtca-atgaatgaagagaacacaacatgtattttaccgaattagctatatttgttttcacatcgaattcctttgtat 26140563  T
Q  383 aggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctct-gtcattgaaacttgtcagttggcagggtagtaa 481  Q
    | ||||||||| || ||||||||| ||  |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  | |||||||| |||||||| |||| | | ||     
T  26140564 aagatgagtgtgacgtaagggaatacacctctaagatgttgttttgtgcttgat-aatgctcctctattaattgaaacatgtcagtttgcagtgcaatat 26140662  T
Q  482 gattaagttcaaaagaat 499  Q
    ||||||||||||||||||    
T  26140663 gattaagttcaaaagaat 26140680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 191 - 495
Target Start/End: Original strand, 10204790 - 10205102
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||| |  |||  | |    
T  10204790 attatgatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattctagttagtttgctgaagatgttggcattgaattgtcttatactaaatgtagtgat 10204889  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatga-agagaaca-catgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    ||||||| |||||| |||  | | |||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||||    
T  10204890 ttgcaagcctctttgaaaagtcaaaagattaagagagcacaacatgtattctgccgaatcaactatataggttacaacatcgaattccattgtataggat 10204989  T
Q  388 gagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc------attgaaacttgtcagttggcagggtagtaa 481  Q
    |||||||||  |||||||||||  |||||||  || |||| ||||||||| || || || ||||      |||||||||||||||||||||| | ||||     
T  10204990 gagtgtcacggaagggaatgcacctctaagaggttattttaagcttgatc-atcctactttgtcaattatattgaaacttgtcagttggcagagcagtac 10205088  T
Q  482 gattaagttcaaaa 495  Q
     |||||||||||||    
T  10205089 aattaagttcaaaa 10205102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 314 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29370635 - 29370509
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcat 410  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |   ||||||||    
T  29370635 aagaatgaagagaacacattttgtattctaccaaatcaactatataggttttcacatcgaattgcttcgtataagatgagtgtgacaaacatgaatgcat 29370536  T
Q  411 ttctaagatattgttttgagcttgatc 437  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29370535 ttctaagatgttgttttgagcttgatc 29370509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 97 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 24630015 - 24629606
Alignment:
Q  97 atgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat--- 192  Q
    |||||||| ||||| |||| |||  |||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | | ||  |||||||||||| ||       
T  24630015 atgttcccgaggattgagacggaagctatgttgctgagatcgcctgaagatattctcaagagtttgattctgccacaagattatgtttaggtagcatcat 24629916  T
Q  193 tattatgttgtgtcattattttgttgg-attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggttt 291  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||| ||  | |||| ||||||||| || ||| |||  |||||| |||||||||| | |||    
T  24629915 tattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagttgaattcatgaaattttgttgaagatgttggtattaaagtgtcttatgcttagcgtaaagattt 24629816  T
Q  292 gcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatg 388  Q
    ||||| |||||| |||  | | |||||| |||| || |||   |||||| | || |||  ||||||||| |||| ||||||||||   | ||||| ||||    
T  24629815 gcaagactctttgaaaagtcaaaagaat-aagaaaaaacaacttgtattttaccaaatatactatatatatttttacatcgaattttcttgtataagatg 24629717  T
Q  389 agtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaa 487  Q
    ||||| |   |||| ||||||   | ||||| |||||||| | |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||||    
T  24629716 agtgtgatgaaaggcaatgcaccccaaagatgttgttttgtgtttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttagtagtgcagtaagattaa 24629618  T
Q  488 gttcaaaagaat 499  Q
    ||||||||||||    
T  24629617 gttcaaaagaat 24629606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 493
Target Start/End: Original strand, 27783566 - 27783967
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctgagatattctc-aagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat-- 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||   |||||||||  ||||||||||||| |  | | ||  |||||||||||| ||      
T  27783566 catgttcccaaggattgagatggaatctacgttgctgagatcgctgaagatattctttaagagtttgattctgtcacaagattatgtttaggtagcatca 27783665  T
Q  193 -tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||   ||||||||| |  |||| | ||    
T  27783666 ttattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagttcaattcttgttagtttgcggaagatgttggtattgaaatgtcttatactgaatgtaaagatt 27783765  T
Q  291 tgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacatgt---attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    |||||| |  ||| |||  | | ||||||| | | |||| ||||   ||||| || || |   | ||    ||||  ||||  ||||||||||||| |||    
T  27783766 tgcaagccaatttaaaaagtcaaaagaatggataaaacatatgttgtattctacctaa-cggttgtaccaattttttcatcagattccttcgtatatgat 27783864  T
Q  388 gagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatta 486  Q
    |||||  |||||||||||||||  ||||||||   ||||||  |||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27783865 gagtgggacataagggaatgcacctctaagat---gttttgtacttgatca-taatcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcaggtcagtaagatta 27783960  T
Q  487 agttcaa 493  Q
    |||||||    
T  27783961 agttcaa 27783967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12504744 - 12504541
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||  |||  ||||||  |||  | |    
T  12504744 attattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgccgactatgtaggcattgaagtgtctggtacttaaggtagagat 12504645  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    ||| |  | || ||||||  | | ||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  12504644 ttgtatat-tccttcaaaagtca-aagaatgaagagagcacaacatgtattcttgcgaatcaactatataagttttcacatcgacttcttttgtatagga 12504547  T
Q  387 tgagtg 392  Q
    ||||||    
T  12504546 tgagtg 12504541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 242 - 391
Target Start/End: Original strand, 22842810 - 22842964
Alignment:
Q  242 tttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacac-----atgtat 336  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||      |||||    
T  22842810 tttgccgaaaatgttggcattgaagtatcttatacttagtataaaaatttgcaagtctctttcaaaactcaaaagaatgaagtgaacacgacaattgtat 22842909  T
Q  337 tctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  22842910 tctaccaaatcaactatataagttctcacatcgaatcccttcatataagatgagt 22842964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 502
Target Start/End: Original strand, 32123686 - 32123803
Alignment:
Q  385 gatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaaga 483  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | || ||| ||||||| ||| | | || | |||| ||    
T  32123686 gatgagtgtgacaaaggggaatgcatttttaagatgttgttttgagcttgatc-atgctcctttatcaattcaaacttgacagatagtagagcagtagga 32123784  T
Q  484 ttaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32123785 ttaagttcaaaagaatata 32123803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 391
Target Start/End: Original strand, 12504446 - 12504511
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12504446 aacacatgtattctattaaatcaactatataagttttcacatcgaattccttcacataggatgagt 12504511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 241 - 388
Target Start/End: Original strand, 32108391 - 32108540
Alignment:
Q  241 gtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacat---gtatt 337  Q
    ||||||| || |||| |||||| |||  | |||||||||| ||||   ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||||   |||||    
T  32108391 gtttgctcaaaatgttggcattaaagtgttttatacttagtgtaaaaatttgcaagtctctttgaaa-cttaaaagaatgaagtgaacacattttgtatt 32108489  T
Q  338 ctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatg 388  Q
     | |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||    
T  32108490 atactaaatcaactatatatgttctctcatcgaattccctcatataagatg 32108540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 391
Target Start/End: Original strand, 12784723 - 12784830
Alignment:
Q  289 tttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaaca-----catgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtata 383  Q
    ||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||     |||||||||| || | |||  |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12784723 tttgcaagtctttttcaaaactcaaaagaatgaagagaacatgacacatgtattctaccaagtcagttatacatgttctcacatcgaattccttcatata 12784822  T
Q  384 ggatgagt 391  Q
     |||||||    
T  12784823 agatgagt 12784830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 333 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10205193 - 10205140
Alignment:
Q  333 gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  10205193 gtattctaccaaatcaactatatatgttttcacatcgaatctcttcatatagga 10205140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 24629512 - 24629561
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  24629512 aacacttgtattctaccaaatcaactatatatattttcacatggaattcc 24629561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 278
Target Start/End: Original strand, 12504330 - 12504394
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatactt 278  Q
    |||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||| |||| | |||||||| |||||||||||    
T  12504330 tgttggatttaagtttaattattggaagtttgcagaaaatgttgtcattgaagtctcttatactt 12504394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5306633 - 5306211
Alignment:
Q  19 agattgacgttcagtcgaccggaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatgg 118  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||| |   ||| |||   |||||| ||||||||||||||||  | | ||| ||||| | |||||||||||    
T  5306633 agattgacgttcagtcaactggagttaacgaacgacatcgatgtgaggagcatgttctcgatatttggtcaggatatcatcttcccgacgatcgagatgg 5306534  T
Q  119 attctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgtt 217  Q
    || |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5306533 atgctacattgttgagacctcctgaagatattctcaagagtttgactcggccagacgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttatt 5306434  T
Q  218 ggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgt-aagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaag 316  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||| ||| || |||||| |||||||||  ||| || | |||    
T  5306433 ggattttagtttaattcttgtaagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttataattaacgtaaaaggtttgtaagtctcttggaaa-ctcaaaag 5306335  T
Q  317 aatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttc 413  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||    
T  5306334 aatgaagagaacacaacatgtattctgccgaatcaactatata-gttttcacatcgaatttcttcgtataggatgaatgccacaaaagagagtgcatttc 5306236  T
Q  414 taagatattgttttgagcttgatca 438  Q
     ||||| ||||||||||||||||||    
T  5306235 caagatgttgttttgagcttgatca 5306211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 269 - 502
Target Start/End: Original strand, 23282593 - 23282826
Alignment:
Q  269 tcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcac 365  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||   |||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  23282593 tcttatacttagcgtaaaggtttgcaagtctctttgaaaactcacaagaatgaagagaacacaacatgtattttgtcgaatcatctatatatgttttcac 23282692  T
Q  366 atcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtc 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||| | |||||| || |||| ||||| |||||||||||||    
T  23282693 atcgaattccttcgtataggatgagtgtcactaaagggaatgcacttctaaga---tgttttgtgattgatc-atgctcccctgtcaattgaaacttgtc 23282788  T
Q  465 agttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23282789 agttggcagggtagtaaggttaagttcaaaaaaatata 23282826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 208 - 499
Target Start/End: Original strand, 11718991 - 11719286
Alignment:
Q  208 ttattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaa 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  11718991 ttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttgggattgaagtgtcttatacttagggtaaaggtttgcaagtctgtttcaa 11719090  T
Q  307 agcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataaggg 403  Q
    | || | |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||   || ||| |||||||||| | ||| | ||||||||  || ||| ||    
T  11719091 aactcaaaagaatgaagagaacacaacatgtattctgcaaaatcaactatatgaattctcaaatcgaattccattgtacaagatgagtgggacgtaaagg 11719190  T
Q  404 aatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
    ||||||  |||||||| || ||||  |||||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||    
T  11719191 aatgcacctctaagatgttattttatgcttgatc-atgcttctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagtgcagtagtattaagttcaaaagaat 11719286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 20529731 - 20529434
Alignment:
Q  207 attattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaa 306  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||   |||   ||| ||| ||||||| ||    
T  20529731 attattatgttggattttggtttcattcttgttagtttgctgaagatgtttgcattgaagtgtcttgtacttaat-taaacattttcaaatctctttgaa 20529633  T
Q  307 agcttacaagaatgaagagaacacatgta---ttctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataaggg 403  Q
    | |||  ||||||  |||||||||||||    |||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| |   |    
T  20529632 aacttgaaagaattgagagaacacatgttgttttctaccgaatcaactatatagatttttacatcgaatttctttgtataagatgagtgtgacaaacaag 20529533  T
Q  404 aatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  20529532 aatgtatttctaagatgttgttttgagcttgatc-atacttctctgtcaattgaaacttttcagttggcatgccagtacaattaagttcaaaagaatata 20529434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 220 - 494
Target Start/End: Original strand, 18878753 - 18879029
Alignment:
Q  220 attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaat 319  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |  |||  | |||||||| |||||| |||  | | || | |    
T  18878753 atttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtagtgatttgcaagcctctttaaaaagtcaaaatatt 18878852  T
Q  320 gaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaa 416  Q
     |||||||||||   |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||  | ||     
T  18878853 -aagagaacacaacatgtattctgcagaatctgctatataggttttcacatcgaattccttcatatatgatgagtgtcacggatgggaatgcacctatag 18878951  T
Q  417 gatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||  || ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  18878952 gaggtttttttgagcttgatc-gtgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcaaggccgtaagattaagttcaaa 18879029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 28276874 - 28276586
Alignment:
Q  208 ttattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaa 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |  |||  | |||||||| ||||||  |    
T  28276874 ttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtagtgatttgcaagcctctttgga 28276775  T
Q  307 agcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataaggg 403  Q
    |  | | |||| | |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28276774 aagtcaaaagatt-aagagaacacaacatgtattctgccgaattagctatataggttaccacatcgaattgattcgtataggatgagtgtcacagaaggg 28276676  T
Q  404 aatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaa 493  Q
    ||||||  |||||||  || |||||||||||||| ||  |||||| || |||||||||| |||||| |||| | |||| |||| |||||||    
T  28276675 aatgcacctctaagaggttattttgagcttgatc-atgatcctctctcaattgaaacttatcagttagcagcgcagtacgatttagttcaa 28276586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 292
Target Start/End: Original strand, 37059057 - 37059203
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37059057 agatattctcaagagtttgattcggccagataaagat---taggttgtatcattatgttgtgtcattattttgttggattttaatttaattcttgtttgt 37059153  T
Q  243 ttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttg 292  Q
    ||| |||| ||||   |||| |||  |||||||||||| |||| ||||||    
T  37059154 ttggtgaaaatgttaccattaaagtgtcttatacttagtgtaacggtttg 37059203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 391
Target Start/End: Original strand, 20529228 - 20529408
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttac 313  Q
    |||||||||| | || ||||| ||  |||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||   ||| ||||||||||| ||| || |     
T  20529228 tgttggatttaaattaaattcatgaaagtttgttgaaaatgttggcattgaagtgtcttatacttagtgtaaaaatttacaagtctctttgaaaactcaa 20529327  T
Q  314 aagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    || |||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20529328 aataatgtagagaacacattttgtattctaccgaatcaactatataggttctcacatcgaattccttcatataagatgagt 20529408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28747034 - 28746780
Alignment:
Q  112 gagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag---tattattatgttgtgtca 207  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |||  |  |||||| |||||    |||||||||| |||||     
T  28747034 gagatggaagctacgttgctgagatcgcctgaaaatattctcaacagtttgattctgccagaaaattatgtttcggtagcatcattattatgtggtgtct 28746935  T
Q  208 ttattttgttggatttta--gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttca 305  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||| |||| | ||||| ||  ||||| |    
T  28746934 ttattttgttggattttaagttttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcatatacttagggtaaagatttgc-agattctttga 28746836  T
Q  306 aagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgt 359  Q
    ||  | | |||||||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28746835 aaagtca-aagaatgaagagaacacaacatgtattctagcaaatcaactatatatgt 28746780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 269 - 393
Target Start/End: Original strand, 12763805 - 12763932
Alignment:
Q  269 tcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcac 365  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||  | | ||||||||||||||||||   |||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  12763805 tcttatacatagcgtaaagatttgcaagactctttgaaaagtcaaaagaatgaagagaacacaacatgtattttacaaaatcaactatatatgttttcac 12763904  T
Q  366 atcgaattccttcgtataggatgagtgt 393  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  12763905 atcgaattcccttgtataagatgagtgt 12763932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 277
Target Start/End: Original strand, 18332676 - 18332862
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag---ta 191  Q
    |||||| || ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||  || | ||||  ||||||| ||||    |    
T  18332676 catgtttccgaggattgagatggaagctacgttgttgagatcgcctgaagatattatgaagagtttgattatgccacatgattatgtttatgtagcatca 18332775  T
Q  192 ttattatgttgtgtcattattttgttgg-attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatact 277  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||||  |||||||||    
T  18332776 ttactatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttattagtttgcggaagatgttgatattgaagtgtcttatact 18332862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 191 - 392
Target Start/End: Original strand, 20988732 - 20988935
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  || || ||||||| |  |||||||||||| |||  | |    
T  20988732 attattatgtaatgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgttgactatatccgcattgacgtgtcttatacttagggtatagat 20988831  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    |||||||  ||||| |||  | | |||||| ||||||||   ||| ||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20988832 ttgcaagcttctttgaaaagtca-aagaataaagagaacataacaagtattttaccgaatcaact-tgaatgttttcacatcaaattcctttgtatagga 20988929  T
Q  387 tgagtg 392  Q
    ||||||    
T  20988930 tgagtg 20988935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26617592 - 26617255
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||  |   || ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26617592 agcatgttctcgattttttgtcaacacaacatgtccccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagatattcttaagagtttgattc 26617493  T
Q  166 ggcaaga---tgaag---atgtttaggtagt--attattatgttgtgtcattattttgttggatttta--gtttaattcttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
     || |||    ||||   ||| ||||||  |  |||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||   |||| |||||||| ||||||| |  ||||    
T  26617492 cgctagaaccagaagattatgattaggtttttcattactatgtagtgtctttattttgttgcaatttaagttttatttcttgtttgtttgctaattatgt 26617393  T
Q  256 cggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaacta 352  Q
     || |||||||  |||||||||||| |||  | ||||| ||  ||||| |||  | | |||||||||||||||   ||||||||| | || |||||||||    
T  26617392 tgggattgaagtgtcttatacttagggtagagatttgc-agattctttgaaaaatca-aagaatgaagagaacacaacatgtattttaccaaatcaacta 26617295  T
Q  353 tatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtg 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26617294 tatatgttttcacatcgaattcctttttataggatgagtg 26617255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 399 - 499
Target Start/End: Original strand, 12763966 - 12764066
Alignment:
Q  399 aagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaaga 497  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||| | ||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  12763966 aagggaatgcacctctaagatgttgttttgtgtttgatca-tgctcctttgtcaattgaaacttgtcagttgggagagcagtaagattaagttcaaaaga 12764064  T
Q  498 at 499  Q
    ||    
T  12764065 at 12764066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 443 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5305394 - 5305334
Alignment:
Q  443 tcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  5305394 tcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcaaggcagtaagattaagttaaaaagaatata 5305334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 403 - 502
Target Start/End: Original strand, 18332986 - 18333085
Alignment:
Q  403 gaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatat 501  Q
    |||||||  |||| ||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||    
T  18332986 gaatgcacctctatgatgttgttttgtgcttgatta-tgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcagtaatattgagttcaaaaaaatat 18333084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 445 - 502
Target Start/End: Original strand, 37059358 - 37059416
Alignment:
Q  445 ctctgtcatt-gaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37059358 ctctgtcatttgaaacttgtcagttgacagggtagtaggattaaattcaaaagaatata 37059416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 326 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20989038 - 20988973
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  20989038 aacacatgtattctaccgaatcaactttataggttatcacatcaaatcccttcatataggatgagt 20988973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 28276356 - 28276442
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgag-tgtcacataagggaatgcatt 411  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| | || |||||||||| ||||||| || |||| |||||| | |||||||| ||||||||||    
T  28276356 aacacatgtattctaccgaattaactctttaggttttcacattgaattccctcatataagatgagttatcacataaaggaatgcatt 28276442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31991734 - 31991668
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtca 395  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  31991734 acatgtattatgcagaatcaactatataagttatgatatcgaattccttcatataagatgagtgtca 31991668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 493
Target Start/End: Original strand, 18879116 - 18879157
Alignment:
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaa 493  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18879116 attgaaacatgtcagttggcagggcagtaagattaagttcaa 18879157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 31991574 - 31991623
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31991574 aacacatgtattctacaaaatcaactatatatgttatcacatcgaattcc 31991623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 258 - 375
Target Start/End: Original strand, 5305171 - 5305292
Alignment:
Q  258 gcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca-----tgtattctgccgaatcaacta 352  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||| ||||||     |||||| | | ||||| ||||    
T  5305171 gcattgaagtgtcttatacttagcgtaaaaatttgcaactctctttgaaaactcaaaagaatgaagaaaacacaacacttgtattatactgaatc-acta 5305269  T
Q  353 tatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    |||| ||| ||||||||||||||    
T  5305270 tataggttatcacatcgaattcc 5305292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 43 - 502
Target Start/End: Original strand, 37396775 - 37397237
Alignment:
Q  43 ttaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg 142  Q
    ||||||||| | ||||||||| | | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  37396775 ttaacgaacgaggacgacgtgaatatcatgttctcgatatttggtcagcacaacatgttcccaacgatcgagatggatgctacgttgctgagatcacctg 37396874  T
Q  143 a-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttag 241  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||||||||| || |||    
T  37396875 aagatattctcaagagtttgattcggctagataaagatgtttaggtagtattattatgtagtgtctttatttggttggaattaagtttaattcatggtag 37396974  T
Q  242 tttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattc 338  Q
    | || |||   ||| || ||| |||  ||||||||||||  ||| ||| ||||  | | |||||||  | |||||||||||||||||   |||| ||||     
T  37396975 tctgttgagagtgttgggattaaagtgtcttatacttagtataaaggtgtgcatatatgtttcaaaattcacaagaatgaagagaacataacatttattt 37397074  T
Q  339 tgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatca 438  Q
    ||  |||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  37397075 tgttgaatcaactatataggttctcacatcgaactctttggtataagatgagtgtcacaaacaggaatgcatttataagatgttgttttgagcttgat-- 37397172  T
Q  439 attctcctctg-tcattgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    || ||| |||| | |||||||||||||||||| || || |||| |||||| || |||||||||||    
T  37397173 atgctcatctgttaattgaaacttgtcagttgacatggcagtatgattaattttaaaagaatata 37397237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7576216 - 7575777
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| |||||||||||||| | || ||||||||| | | |||||||||| || || | ||  | ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  7576216 agcatgttctcgatatttggttagcataacatgttctcgacgatcgagatgtatacttcgttacttagatcacctaaagatattctcaagagtttaattc 7576117  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaa 265  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| || |||||||||  || ||||||| |||  || | | |||||||    
T  7576116 ggccatatgaagatgtttaggtagtattattatgcagcgtctttattttgttggaattaagtttaatttgtggtagtttgttgacaatattgacattgaa 7576017  T
Q  266 gcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgtttt 362  Q
    |  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||| || | ||||||||||||| ||| |    
T  7576016 gtgtgttatacttagtgtaaaggtttgcaagtctctttcaaaactcacaagaatgaagagaacacaacatgtattttgtcaaatcaactatataggttct 7575917  T
Q  363 cacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaactt 461  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||     | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  7575916 cacatcgaattccttcgcataagatgagcgtgttgaacgggaatgcatttttaagatgttgttttgtgcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaactt 7575818  T
Q  462 gtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7575817 gtcagttggcagggcagtatgattaagttcaaaagaatata 7575777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26604651 - 26604281
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgt-----ttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttg 237  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||     |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  26604651 agatattttcaagagtttgattcgtccagatgaagatgtgatgtttaggttgtat-attatgttgtgtcattatttttttgaattttagtttagttcttg 26604553  T
Q  238 ttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgt 334  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||   |||    
T  26604552 ttagtttgctgaagatgtttgcaatgaagtgtcttatacttagtgtaatggtttgtaagtctctttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacattttgt 26604453  T
Q  335 attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttg 434  Q
    ||| | | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||  | |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  26604452 attatactgaatcaactatacatgttctcaaatcgaattcattcgtataaaaagagtgggacataaggcaatgcatttctaagatgttgttttgagctgg 26604353  T
Q  435 atcaattctcc----tctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||| || ||||    |||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||    
T  26604352 atc-atgctcctagatctgtcaattgaaacttgtcagttggcagagcaatatgattaagttcaaaagaatata 26604281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 91 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 16418197 - 16417781
Alignment:
Q  91 cacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag 189  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||| ||    
T  16418197 cacaacatgttcccgaggattgagatggatgttacattgctgagatcacctgaagatattctcaagagtttgactctgccagaagattatgtttagggag 16418098  T
Q  190 tattattatgttg---tgtcattattttgttggattttag-tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaa 285  Q
     || |||||  ||   ||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||  |||||| |||  |||| || ||| |||  ||||||| |||| ||||    
T  16418097 catcattattatgcaatgtcattattttgtttgaatttaaatttaattcatggaagtttgttgacaatgttggtattaaagtgtcttatagttagtgtaa 16417998  T
Q  286 gggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtat 382  Q
      |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||   |||||| | || ||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  16417997 aagtttgcaagtctctttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacaacatgtattttaccaaattaactatataggtttttacattgaattccttcgtat 16417898  T
Q  383 aggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaa 481  Q
    | ||||||||| ||  | | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||     
T  16417897 aagatgagtgtgacgaacgtgaatgcatttctaagatgttgttttgtgcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagagcagtag 16417799  T
Q  482 gattaagttcaaaagaat 499  Q
    | ||||||| ||||||||    
T  16417798 gcttaagtttaaaagaat 16417781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 40 - 392
Target Start/End: Original strand, 19748127 - 19748485
Alignment:
Q  40 gaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgc 139  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | | |||| |||| || ||| | || ||||||||||| ||  ||||||| |||  || ||| ||| |||||||||    
T  19748127 gaattaacgaacgacgacgacgtgaagaacatgttctccattttttggcagcacaacatgtttccgtggatcgatatgt-ttgtacgttgctgagatcgc 19748225  T
Q  140 ctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagt---attattatgttgtgtcattattttgttggattttag-tttaattc 234  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||| || | | ||  ||| ||||||||    ||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  19748226 ctgaagatattctcaacaatttgattccgccataagattatgattaggtagcgtcattattatgtattgtctttattttgttggaatttaactttaattc 19748325  T
Q  235 ttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---aca 331  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||| || | |||||||||| ||||   |||    
T  19748326 ttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatacttagggtaaaggtttgcaagtctgttcaaaaactcaaaagaatgaag-gaacacaaca 19748424  T
Q  332 tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtg 392  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  19748425 tgtattctgcaaaatcagctatataggttttcacatcgaattcccttgtataagatgagtg 19748485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 499
Target Start/End: Original strand, 31488146 - 31488508
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgt 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | ||| ||  |||||||||||| ||   |||||| |  |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  31488146 agatattcttaagagtttgattctaccagaagattatgtttaggtagcatgattattatttaatgtctttattttgttgaaatttaagtttaattcttgt 31488245  T
Q  239 tagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgta 335  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |||| | ||| ||||  | ||| |||  | | || |||||||| ||||||   ||||    
T  31488246 tagtttgctgaatatgtcggcattaaagtgtcttatacttagtgtaaagatttacaagaatttttgaaaagtca-aataatgaagataacacaacatgta 31488344  T
Q  336 ttctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttga 435  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||| || | |||| |||||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||||    
T  31488345 ttttaccgaaacaactatatatgttttcacgttgaatttccttgtataagaagtgtgtgacataagggagtgcacctctaagatgttgttttgtgcttga 31488444  T
Q  436 tcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
    || || || ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31488445 tc-atgcttctctgtcaattgaaacttgttagttggcagtgcagtaggattaagttcaaaagaat 31488508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 190 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 11477892 - 11477578
Alignment:
Q  190 tattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||| ||||| || |||||||||||  |||| |||||||||   || ||||||||| |||| |||    
T  11477892 tattattatgttgtgtt-ttattttgttggaattaagttgaattcatggtagtttgctgagaatgttggcattgaattgtcatatacttagtgtaaaggt 11477794  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    ||||||||||| || ||| ||   ||||||  ||||||||||   |||||||  | |||||||| |||||  || |||||| |||||| |||||||| ||    
T  11477793 ttgcaagtctccttgaaaactcgaaagaattgagagaacacatgttgtattccactgaatcaacgatatagattctcacattgaattcattcgtataaga 11477694  T
Q  387 tgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatt 485  Q
    | ||||| ||| |   ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||  |||    
T  11477693 taagtgtgacaaacatgaatgcatttctaagatgttgttttgagttttatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgttagttggcagagcagtagaatt 11477595  T
Q  486 aagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||||||    
T  11477594 aagttcaaaagaatata 11477578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 96 - 502
Target Start/End: Original strand, 10975925 - 10976339
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctgag-atattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat-- 192  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || | | ||  ||||||| |||  ||      
T  10975925 catgttcccgaggattgagatggaagctatgttgctgagatcgtctgaatatattctcaagagtttgattctgccacaagattatgtttatgtaacatca 10976024  T
Q  193 -tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||| ||   ||||||||||||||||| | ||    
T  10976025 ttattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcatgaaagtttgctgaagatgttgttattaaaatgtcttatacttagcgtaaagatt 10976124  T
Q  291 tgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    ||||     |||| |||  | | ||||||||||||||||||   |||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||    
T  10976125 tgcagcatcctttgaaaagtcaaaagaatgaagagaacacaacttgtattttaccaaatcaactatatatgttttcgcatcgaattcccttgtataagat 10976224  T
Q  388 gagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatta 486  Q
    |||||| ||  |||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |||| |||||||||||| ||||||||| | ||||  ||||    
T  10976225 gagtgtgacgaaaggaaatgtacctctaagatgttattttgtgcttgatc-atgctcatatgtcaattgaaacttgttagttggcagtgcagtagaatta 10976323  T
Q  487 agttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||||||||||||    
T  10976324 agttcaaaagaatata 10976339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 202 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25360458 - 25360247
Alignment:
Q  202 gtgtcattattttgttggattttagtttaa-ttcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctc 300  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||||||||     
T  25360458 gtgtccttattctgttggaatttaaattaaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatacatagggtaaaagtttgcaagtctg 25360359  T
Q  301 tttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcaca 397  Q
    ||| ||| || | |||||||||||||||   |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |      
T  25360358 tttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacaacatgtattctgcaaaatcatctatataggttttcacatcgaattcccttgtataagatgagtgggatg 25360259  T
Q  398 taagggaatgca 409  Q
    ||||||||||||    
T  25360258 taagggaatgca 25360247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 329 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 23228538 - 23228373
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttg 428  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||  |||||||  || |||||    
T  23228538 acatgtattctatcaaatcaactatataaattctcatatcgaattccttcgtatagaatgagtgtcccggaagggaatgcacctctaagaggttcttttg 23228439  T
Q  429 agcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23228438 agcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtgagttggtagggcagtaagattaagttcaaa 23228373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 344 - 502
Target Start/End: Original strand, 34595584 - 34595743
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattct 443  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  34595584 aatcaactatataggttttcacaacaaattcctttgtataagatgagtgtgacgaaagggaatgcacctctaagatgttgttttgtgcttgatc-atgct 34595682  T
Q  444 cctctgtc-attgaaacttgtcagttggc-agggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||||||| ||||||    
T  34595683 cctttgtcaattgaaacttgtcagttggcaatgcaagtatgattaagttcaaaataatata 34595743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 494
Target Start/End: Original strand, 28718215 - 28718587
Alignment:
Q  130 ttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  || |||  |  |||||||||||| ||   |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||    
T  28718215 ttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgattatgccagaaaattatgtttaggtagcatcattattatgtagtgtttttattttgttggaattta 28718314  T
Q  226 g--tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaag 323  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |  || | | |||||||| || ||| |||  | | ||||||| |     
T  28718315 agttttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtgaagatttgcaagcctatttgaaaagtcaaaagaatggat 28718414  T
Q  324 agaacacatgt---attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagata 420  Q
    | |||| ||||   ||||| || |||    | || |  ||||  ||||  |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||  ||||||||     
T  28718415 aaaacatatgttgtattctacctaatggt-tgtacaaattttttcatcagattccttcgtataaaatgagtgggacataagggaatgcacctctaagatg 28718513  T
Q  421 ttgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    |||||||   |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  28718514 ttgttttatacttgatca-tgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcagtaagattcaattcaaa 28718587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 391
Target Start/End: Original strand, 11477396 - 11477552
Alignment:
Q  240 agtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca-----tgt 334  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||  | |||||||||| ||||   ||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||     |||    
T  11477396 agtttgccgaaaatgttggcattgaagtgtgttatacttagtgtaaaaatttgccagtctctttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacatcacatgt 11477495  T
Q  335 attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  11477496 attctaccgaatcaacaatataggttctcacattgaattcattcgtataagatgagt 11477552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 397 - 502
Target Start/End: Original strand, 19575564 - 19575669
Alignment:
Q  397 ataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaa 495  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||| |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  19575564 ataagggaatgcatttcttagatgttgttttgagcttgatc-atattccattgtcaattgaaacttatcagttgacagagtaataggattaagttcaaaa 19575662  T
Q  496 gaatata 502  Q
    |||||||    
T  19575663 gaatata 19575669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 26604113 - 26604302
Alignment:
Q  252 atgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatca 348  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||  ||||   ||||||||||||||| ||| || | || ||| ||||||||||||   ||||||| || |||||    
T  26604113 atgttggcattgaagtgtcttatacttaatgtaaaaatttgcaagtctctttgaaaactcaaaacaattaagagaacacattttgtattctaccaaatca 26604212  T
Q  349 actatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgt-cacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatca 438  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| |  |||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  26604213 attataaatgttctcacatcgaattccttcatataatatgagtatgaacataaaggaatgca-ttctaatatattcttttgaacttaatca 26604302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 425 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 15797917 - 15797848
Alignment:
Q  425 tttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15797917 tttgaacttgatca-tgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcagtaagattaagttcaaa 15797848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 15798228 - 15798007
Alignment:
Q  40 gaattaacgaacaatgacgacgtgcaaagcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgc 139  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||| ||  |||| || |||  |   || ||| |||||| ||    
T  15798228 gaattaacgaacgatgacgacgtgaggagcatgttctcgattttttggcagcacaacatgtttccgtggattgatatgtttgtcacgttgatgagattgc 15798129  T
Q  140 ctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgttgga--ttttagtttaatt 233  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || | | ||  ||| |||||||| ||   ||||||||  |||| |||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  15798128 ctgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagattatgattaggtagcatcgttattatgtattgtctttattttgttagaaatttaagtttaatt 15798029  T
Q  234 cttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  15798028 cttgttagtttgttgaagatgt 15798007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19748701 - 19748523
Alignment:
Q  216 ttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaa 315  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||| | ||| |||| ||||||||||  || ||||||||| ||||   ||||||||||| ||| ||| || | ||    
T  19748701 ttggatttaaatttaattcttgaaagttttccgaaaatgttggcattgaagtgtcgtatacttagtgtaaaaatttgcaagtctgtttgaaaactcaaaa 19748602  T
Q  316 gaatgaagag---aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||   |||||||||||||| |  ||||| |||||||  |||| ||||| |||||| || |||| |||||||    
T  19748601 gaatgaagagaacaacacatgtattctacaaaatcatctatatagatttttacatcaaattccctcatataagatgagt 19748523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 391
Target Start/End: Original strand, 16417625 - 16417752
Alignment:
Q  269 tcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaaca-----catgtattctgccgaatcaactatatatgttttc 363  Q
    |||||||||||| ||||   |||||||| |||||| ||| || | ||||||||||||||||     |||||||||| || ||||||| ||||| ||| ||    
T  16417625 tcttatacttagtgtaaaaatttgcaagcctctttaaaaactcaaaagaatgaagagaacacaacacatgtattctaccaaatcaacaatataagttctc 16417724  T
Q  364 acatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||    
T  16417725 acatcgaattccctcatataagatgagt 16417752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23228731 - 23228598
Alignment:
Q  127 ttgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattatta---tgttgtgtcattattttgttggatt 222  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| || |||||||||| || |||  |  ||| |||||||| |||||||   ||| ||||| ||||||||||||| |    
T  23228731 ttgttgagatcacttgaagatattctgaacagtttgattccgctagaaaattatgattaggtagcattattaatatgtagtgtctttattttgttggaat 23228632  T
Q  223 tta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23228631 ttaagtttaattcttgtttgtttgctgaagatgt 23228598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34595827 - 34595768
Alignment:
Q  332 tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  34595827 tgtattctaccaaatcaactatataagttttcacatcgaattccttcatataagatgagt 34595768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 36311490 - 36311576
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatt 411  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||| |||| |||||    
T  36311490 aacacatgtattctacaaaatcaactatatatgttatgacatcgaattccttcatataagatgagtcatcacataaaggaaagcatt 36311576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 240 - 391
Target Start/End: Original strand, 6998515 - 6998671
Alignment:
Q  240 agtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagag-----aacacatgt 334  Q
    ||||||| ||| |||  ||||||||||  |||||||||||  ||||   |||||||| || ||| ||| || | ||||||||||||     |||||||||    
T  6998515 agtttgccgaaaatgctggcattgaagtgtcttatacttatagtaaaaatttgcaagactatttgaaaactcaaaagaatgaagagcacataacacatgt 6998614  T
Q  335 attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||| ||| || |||| |||||||    
T  6998615 attctaccaaatcaactttataggttttcacatcgaactccatcatataagatgagt 6998671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22858288 - 22858233
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgc 246  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22858288 attattatgtattgtctttattttgttgaatttaagtttaattcttgttagtttgc 22858233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 487
Target Start/End: Complemental strand, 36311749 - 36311596
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttg 428  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||| ||| | | ||| |||||||||||||| ||| |||||||||     |||| ||  |||||||  ||  ||||    
T  36311749 acatgtattctgcataatcagttatataagttatgatatcaaattccttcgtataagattagtgtcaca-----gaattcacctctaagaggttcctttg 36311655  T
Q  429 agcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaa 487  Q
    || ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36311654 agtttgatcg-tgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcagtaagattaa 36311596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37397405 - 37397294
Alignment:
Q  252 atgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaa---cacatgtattctgccgaatca 348  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||   |||||||||||| || |||||    
T  37397405 atgttggcattgaagtgtcttatacttagtttaaaaatttgcaagtctctttcaaaactcaaaagaataaagagaacaccacatgtattctaccaaatca 37397306  T
Q  349 actatatatgtt 360  Q
    | |||| |||||    
T  37397305 attatacatgtt 37397294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31238570 - 31238526
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaatt 373  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31238570 acatgtattctaccgaatcaactttataggttttcacatcgaatt 31238526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 289 - 392
Target Start/End: Original strand, 7575647 - 7575752
Alignment:
Q  289 tttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatga--agagaacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||||||  | | |||||||||||||| || || |||||||| || || |  ||||||||||| || |||| ||    
T  7575647 tttgcaagtctctttcaaaactcaaaagaatgagaacacaacacatgtattctaccaaaccaactatacattttctagcatcgaattccctcatataaga 7575746  T
Q  387 tgagtg 392  Q
    ||||||    
T  7575747 tgagtg 7575752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 373
Target Start/End: Original strand, 25360048 - 25360208
Alignment:
Q  216 ttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaa 315  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||| ||| |||| ||||||||||  || |||| |||| ||||   ||||||||||| ||| |||  | | ||    
T  25360048 ttggatttaaatttaattcttgaaagtttgccgaaaatgttggcattgaagtgtcgtatatttagtgtaaaaatttgcaagtctgtttgaaaattcaaaa 25360147  T
Q  316 gaatgaagag---aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaatt 373  Q
     |||||||||   |||||||||||| | |  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  25360148 caatgaagagaacaacacatgtattatacaaaatcatctatataggttttcacaacgaatt 25360208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 396
Target Start/End: Original strand, 10398390 - 10398443
Alignment:
Q  343 gaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac 396  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10398390 gaatcaactatataagttatgatatcgaattccttcatataagatgagtgtcac 10398443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13130958 - 13130905
Alignment:
Q  203 tgtcattattttgttggattttagtttaa-ttcttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13130958 tgtctttattttgttggagtttaaattaaattcttgttagtttgctgaagatgt 13130905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 12067613 - 12067522
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggattttag--tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttag 280  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||   |||| | |||||||  ||||||||||||    
T  12067613 attaatatgtagtgtctttattttgttggaatttacgttttaattcttgttagtttgttgacagtgtcagtattgaagtgtcttatacttag 12067522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 329 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 13130885 - 13130817
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcaca 397  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  13130885 acatgtattatgcagaatcaactatataagttatgatatcaaattccttcatataagattagtgtcaca 13130817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 31)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 191 - 502
Target Start/End: Original strand, 24560030 - 24560345
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggattttag-tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||||  ||| |||    
T  24560030 attattatgcagtgtctttattttgttggaatttaaatttaattcttgttagtttgctgaatatgttggtattgaagtgtcttatacttaggataaaggt 24560129  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24560130 ttgcaagtctttttcaaaactcaaaagaatgaagagaacacaacatgtattttaccaaatcaactatataggttttcacatcgaattcctttttatagga 24560229  T
Q  387 tgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatt 485  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||| | |||||| || |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  24560230 tgagcgtcacagaagggaatgcacttctaaggtgttgttttgtgtttgatc-atgctccgctgtcaattgaaacttgttagttggtagggcagtaagatt 24560328  T
Q  486 aagttcaaaagaatata 502  Q
    |||| ||||||||||||    
T  24560329 aagtacaaaagaatata 24560345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 499
Target Start/End: Original strand, 19242924 - 19243321
Alignment:
Q  107 ggatcgagatggattctacattgttgagatcgcc-tgagatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgt 205  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||||||| | ||| |||  || ||||||  |||||||||||  ||||||||||  |||    
T  19242924 ggattgagatggatgctacattgttgagattaccataagatattctcaaaactttaattatgccagatgattatgtttaggtatcattattatgtattgt 19243023  T
Q  206 cattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttc 304  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||| | ||  |||||||| |  |||  || ||| |||  || ||||||||| |||| |||||||||| || |||     
T  19243024 ctttattttgttggaatttaagtttaatccatggaagtttgctaagaatgatggtattaaagtgtcatatacttagtgtaaaggtttgcaagactatttg 19243123  T
Q  305 aaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataag 401  Q
    ||| || | |||||| |||||||||||   |||||| | || |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||| | |    
T  19243124 aaaactcaaaagaataaagagaacacaacatgtattttaccaaatcaattatataggttttcacattcaattccttcgtataagatgaatgtgacaaacg 19243223  T
Q  402 ggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
      |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  19243224 aaaatgcatttctaagatgttgttttgtgcttgatc-atgctcatctgtcaattgaaacttgtcaattggcagggcagtaggattaaggtcaaaagaat 19243321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 329 - 499
Target Start/End: Original strand, 20244538 - 20244709
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac-ataagggaatgcatttctaagatattgtttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  20244538 acatgtattctgccgaatcaactgtatatgttttcacaccaaagtccttcgtataagatgagtgtcacaaaaagggaatgcaactctaagattttgtttt 20244637  T
Q  428 gagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
    | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20244638 gtgcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcaattggcagggttgtaggattaagttcaaaagaat 20244709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 329 - 499
Target Start/End: Original strand, 22138522 - 22138693
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac-ataagggaatgcatttctaagatattgtttt 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||||||| |||||||    
T  22138522 acatgtattctgccgaatcaactgtatatgttttcacaccaaagtccttcgtataagatgagtgtcacaaaaagggaatgcaactctaagattttgtttt 22138621  T
Q  428 gagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
    | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22138622 gtgcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcaattggcagggttgtaggattaagttcaaaagaat 22138693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 191 - 438
Target Start/End: Original strand, 2402414 - 2402663
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    ||||||||||  |||| ||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| ||||  ||    
T  2402414 attattatgtattgtctttgctttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatacttagggtaaaagt 2402513  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
     ||||||||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||   ||||| ||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  2402514 ctgcaagtctgtttgaaaact--caagaatgaagagaacacaacatgcattatgcaaaatcagctatataggttttcacatcgaatttccttgtataaga 2402611  T
Q  387 tgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatca 438  Q
    ||||||  || ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||    
T  2402612 tgagtgagacgtaagggaatgcacctctaagatgttgttttgtgcttgatca 2402663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22962483 - 22962116
Alignment:
Q  146 tattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtatta----------ttatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattct 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||     
T  22962483 tattctcaagattttgattcggctagatgaagatgtttaggttgtattaaattgtattattatgttgtgtc--tattttgttggaattaagtttaattca 22962386  T
Q  236 tgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---t 332  Q
    || || |||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| ||   ||||||| | ||||||||   |    
T  22962385 tggtattttgttgaagatgtttgcattaaagtgtcttatacttagtgtaaaggtttgcaagtcgttttgaaaactcgaaagaatggaaagaacacatgtt 22962286  T
Q  333 gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagct 432  Q
    ||||||| |  | |||| |||||||||| | ||||||||||| ||  |||| ||||||| | ||  | ||||||||||||||||  | |||||||||||     
T  22962285 gtattctacaaagtcaattatatatgttctaacatcgaattcttttatataagatgagtttgactaacgggaatgcatttctaatctgttgttttgagca 22962186  T
Q  433 tgatcaattctcctct-gtcattgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    || || || |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22962185 tgctc-atactcctctattaattgaaacttgttagttggcagggcagtaggattaagttcaaaaaaatata 22962116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 502
Target Start/End: Original strand, 23825910 - 23826277
Alignment:
Q  146 tattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtatta----------ttatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattct 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||     
T  23825910 tattctcaagattttgattcggctagatgaagatgtttaggttgtattaaattgtattattatgttgtgtc--tattttgttggaattaagtttaattca 23826007  T
Q  236 tgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---t 332  Q
    || || |||| |||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||| ||   ||||||| | ||||||||   |    
T  23826008 tggtattttgttgaagatgtttgcattaaagtgtcttatacttagtgtaaaggtttgcaagtcgttttgaaaactcgaaagaatggaaagaacacatgtt 23826107  T
Q  333 gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagct 432  Q
    ||||||| |  | |||| |||||||||| | ||||||||||| ||  |||| ||||||| | ||  | ||||||||||||||||  | |||||||||||     
T  23826108 gtattctacaaagtcaattatatatgttctaacatcgaattcttttatataagatgagtttgactaacgggaatgcatttctaatctgttgttttgagca 23826207  T
Q  433 tgatcaattctcctct-gtcattgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    || || || |||||||  | |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  23826208 tgctc-atactcctctattaattgaaacttgttagttggcagggcagtaggattaagttcaaaaaaatata 23826277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 495
Target Start/End: Original strand, 8711002 - 8711407
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat-- 192  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  | | | ||  |||||||||||| ||      
T  8711002 catgttcccgaggattgagatggaagctacattgctgagattgcctaaagatattctcaagagtttgattctaccataagattatgtttaggtagcatca 8711101  T
Q  193 -tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  ||||||||| |  |||||| ||    
T  8711102 ttattatgtagtgtc-ttattttgttggaatttaagtttaattcttgttaatttgcggaagatgttggtattgaagtgtcttatactgaatgtaaggatt 8711200  T
Q  291 tgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    |||||| || ||| |||  | | ||||||  | | |||| ||   ||||||| || |||    | || |  ||||  |||   |||||||| |||| |||    
T  8711201 tgcaagcctatttgaaaagtcaaaagaatagataaaacatatattgtattctacctaatggt-tgtacaaattttttcattagattccttcatataagat 8711299  T
Q  388 gagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatta 486  Q
    |||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8711300 gagtgtgacataagggaatgtacctctaagatattgttttgtacttgatc-atgctcctctgtcaattgaaatttgtcagttgacagggcagtaagatta 8711398  T
Q  487 agttcaaaa 495  Q
    |||||||||    
T  8711399 agttcaaaa 8711407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 69 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23608066 - 23607878
Alignment:
Q  69 catgctctcgatatttggtcaacacaa-catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcg 166  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||  |  ||| |||||||| || | |||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||      
T  23608066 catgttctcgacatttggtcaaaacaaacatgttcctgacaatctagatggatgcttcgttgcagagatcacctgaagatattctcaagagtttgattta 23607967  T
Q  167 gcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  23607966 gccagatgaagaagtttagatagtattattatgtaatgtcgttcttttattggattttagtttaattcttattagtttgctaaagatgt 23607878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 208 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21864869 - 21864657
Alignment:
Q  208 ttattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaa 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||| |||  | ||||||  | ||||| ||    
T  21864869 ttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcgtatacttagggtagagatttgcagat-tctttgaa 21864771  T
Q  307 agcttacaagaatgaagagaaca--catgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataaggga 404  Q
    |  | | ||||||||||||||||  ||||||||||  | |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21864770 aagtca-aagaatgaagagaacaaacatgtattctagcaaatcaagtttataggttttcacatcgaattccttcgtataagataaatgtcacataaggga 21864672  T
Q  405 atgcatttctaagat 419  Q
    | |||  ||||||||    
T  21864671 aagcacctctaagat 21864657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 96 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5973120 - 5972935
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag---ta 191  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | ||  ||||||||||||    |    
T  5973120 catgttcccgaggattgagatggaagctacattgctgagatcgcctgaagatattctcaagagtttgattctaccataagattatgtttaggtagcatca 5973021  T
Q  192 ttattatgttgtgtcattattttgttgg-attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatact 277  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||  |||||||||    
T  5973020 ttattatgtagtgtc-ttattttgttggaatttaagtttaattcttgttaatttgcggaagatgttggtattgaagtgtcttatact 5972935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 69 - 277
Target Start/End: Original strand, 14095729 - 14095942
Alignment:
Q  69 catgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctg-agatattctcaagagtttgattcgg 167  Q
    |||| |||| |||| | |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||  || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  14095729 catgttctccatatatcgtcagcaccacatgttcccgaggattgagatggaagcttcgttgctgagatcgcctgtagatattctcaagagtttgattatg 14095828  T
Q  168 caagatgaagatgtttaggtag---tattattatgttgtgtcattattttg-ttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattg 263  Q
    | | | ||  ||||||||||||    ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  14095829 ccacaagattatgtttaggtagcatcattattatgtaatgtctttattttgtttgaatttaagtttaattcttgttagtttgtggaagatgttggtattg 14095928  T
Q  264 aagcctcttatact 277  Q
    |||  |||||||||    
T  14095929 aagtgtcttatact 14095942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 203 - 487
Target Start/End: Original strand, 33200341 - 33200628
Alignment:
Q  203 tgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctt 302  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||| |  |||  | |||||||| ||||     
T  33200341 tgtctttattttgttggagtttaagttaattcttattagtttgctgaagatgttgctattgaagtgtcttatactgaatgtagcgatttgcaagcctctc 33200440  T
Q  303 tcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgtttt-cacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacat 398  Q
    | |||  | | |||| | || ||||||||   |||||||| ||  ||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||      
T  33200441 taaaaagtcaaaagatt-aatagaacacaacatgtattctaccatatcaactttataagtttttcacttcgaattccttcgtataagaggagtgtcaccg 33200539  T
Q  399 aagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaa 487  Q
    ||||||| |||  |||||||  || ||||||| ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  33200540 aagggaaagcacctctaagaggtttttttgagtttgatc-gtgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcatggcaataagattaa 33200628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 131 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 3097568 - 3097284
Alignment:
Q  131 tgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgt---gtcattattttgttggattttag 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||  |  |||||||||||| || ||||   |||   ||| ||||||||||||| ||||     
T  3097568 tgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgattctgctagaaaattatgtttaggtagcatcattaatatgtacagtctttattttgttggaatttaa 3097469  T
Q  227 -tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagag 325  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  || ||||||||| |||  | ||||||  | ||||| |||  | | ||||||||||||    
T  3097468 atttaattcttgttagtttgctgaagatgttgatattgaagtgtcgtatacttagggtagagatttgcagat-tctttgaaaagtca-aagaatgaagag 3097371  T
Q  326 aacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgca 409  Q
    || |||   || |||||  | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||    
T  3097370 aatacaacatgcattctagcaaatcaactttatagggtttcacatcgaattccttcgtatagaatgactgttacatatgggaatgca 3097284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 425 - 494
Target Start/End: Original strand, 33200822 - 33200891
Alignment:
Q  425 tttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33200822 tttgagcttgatca-tactcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcagtaagattaagttcaaa 33200891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 191 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18743967 - 18743878
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatactta 279  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||    
T  18743967 attattatgtagtgtctttattttcttggaatttaagtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgttttatactta 18743878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 331
Target Start/End: Original strand, 20244410 - 20244521
Alignment:
Q  220 attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaat 319  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  || ||   ||||||    
T  20244410 atttaagtttaattattgttagtttgttgaaaatgttggtattaaagtctcttatacttagcgtaaaggttttcacgtctctttggaaactcgtaagaat 20244509  T
Q  320 gaagagaacaca 331  Q
    ||||||||||||    
T  20244510 gaagagaacaca 20244521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 331
Target Start/End: Original strand, 22138394 - 22138505
Alignment:
Q  220 attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaat 319  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  || ||   ||||||    
T  22138394 atttaagtttaattattgttagtttgttgaaaatgttggtattaaagtctcttatacttagcgtaaaggttttcacgtctctttggaaactcgtaagaat 22138493  T
Q  320 gaagagaacaca 331  Q
    ||||||||||||    
T  22138494 gaagagaacaca 22138505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 23607855 - 23607794
Alignment:
Q  332 tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgt 393  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23607855 tgtattctactgaatcaactatataggttttcacatcgaattccttcatataagatgagtgt 23607794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 383
Target Start/End: Original strand, 14482544 - 14482598
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtata 383  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14482544 acatgtattatgcagaatcaactatatatgttttcacatcgaatttcttcatata 14482598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 371 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 5972839 - 5972743
Alignment:
Q  371 attccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagt 467  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  5972839 attcctttatataagatgagtgtgacataagggaatgcacctctaagatattgttttgtacttgatc-atgctcttctgtcaattgaaatttgtcagt 5972743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 30764933 - 30764866
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac 396  Q
    ||||||||||| |  ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30764933 acatgtattctccataattagctatataggttttcacatctaattcctttgtataggatgagtgtcac 30764866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 30765062 - 30764987
Alignment:
Q  203 tgtcattattttgttggattttagtttaa-ttcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatact 277  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  30765062 tgtctttattttgttggaatttaaattaaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatact 30764987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 452 - 493
Target Start/End: Complemental strand, 21864495 - 21864454
Alignment:
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaa 493  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21864495 attgaaacttgtcagttggtagggcagtaagattaagttcaa 21864454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17465221 - 17465145
Alignment:
Q  202 gtgtcattattttgttggattttagttt-aattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatact 277  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||    
T  17465221 gtgtctttattttgttggaatttaaattcaattcttattagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatact 17465145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18743802 - 18743691
Alignment:
Q  354 atatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-a 452  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||  ||||||| | |||||| || |||||||||| |    
T  18743802 atatgatttcacatcgaattcccttgtataaaatgagtgtgacgaaagggaatgtacttctaagatgctgttttgtgtttgatc-atgctcctctgtcaa 18743704  T
Q  453 ttgaaacttgtca 465  Q
    |||||| ||||||    
T  18743703 ttgaaaattgtca 18743691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 452 - 495
Target Start/End: Original strand, 14096110 - 14096153
Alignment:
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaa 495  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14096110 attgaaacttgtcagttggctgggcagtaagattaaattcaaaa 14096153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 17465091 - 17465024
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcac 396  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17465091 acatgtattatgcagaatcacctatataagttatgatatcgaattccttcatataagatgagtgtcac 17465024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14482701 - 14482635
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtca 395  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14482701 acatgtattatgccaaatcagctatataagttatgatatcgaattccttcatataagatgagtgtca 14482635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 345 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 23911515 - 23911477
Alignment:
Q  345 atcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtata 383  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23911515 atcaactatatatgttatcacatcaaattccttcgtata 23911477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 425 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 30764713 - 30764644
Alignment:
Q  425 tttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||    
T  30764713 tttgagcttgatca-tgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggtagggaaacaagattaggttcaaa 30764644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 16651354 - 16651087
Alignment:
Q  171 gatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctc 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  16651354 gatgaagatgtttaggttgtattattatgttgtgtcattattttgttgtaacttagtttaattat-gttagtttgctgaagatgttggcattgaactgtc 16651256  T
Q  271 ttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacat 367  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | || | ||||||||| | |||||||   ||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  16651255 ttatacttagtgtaaaggtttgcaagtctctttgataactcaaaagaatgaatataacacattttgtagtataccaaatcaactatataagttctcacat 16651156  T
Q  368 cgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgat 436  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16651155 cgaattccttcatataagacgagtgtgacaaacgagaatgcatttctaagatgttgttttgagcttgat 16651087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 171 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 17625714 - 17625447
Alignment:
Q  171 gatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctc 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  17625714 gatgaagatgtttaggttgtattattatgttgtgtcattattttgttgtaacttagtttaattat-gttagtttgctgaagatgttggcattgaactgtc 17625616  T
Q  271 ttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacat 367  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | || | ||||||||| | |||||||   ||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||    
T  17625615 ttatacttagtgtaaaggtttgcaagtctctttgataactcaaaagaatgaatataacacattttgtagtataccaaatcaactatataagttctcacat 17625516  T
Q  368 cgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgat 436  Q
    ||||||||||| |||| || |||||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17625515 cgaattccttcatataagacgagtgtgacaaacgagaatgcatttctaagatgttgttttgagcttgat 17625447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 145 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 44110344 - 44110051
Alignment:
Q  145 atattctcaagagtttgattcggc-aagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtt 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |     
T  44110344 atattctcacgagtttgattcggccaagatgaaaatgtttaggccgtattattatgttgtgtcgttgttttgttggatcttagtttaattgttgttactc 44110245  T
Q  244 tgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacac---atgtattctg 340  Q
    ||||||||||||  || ||||||  ||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||| | | ||  | |||||||||| |||||   |||||||||     
T  44110244 tgctgaagatgtatgcgttgaagtgtcttacacttagtgtaaaggtttgcaagtatctttgataact--cgagaatgaagaaaacacattatgtattcta 44110147  T
Q  341 ccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgat 436  Q
    || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44110146 ccaaatcaactataaatgttctcagatcgaattccttcgcataagaagtgtgggacataagggaatatacttctacgatgttgttttgagcttgat 44110051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 191 - 409
Target Start/End: Original strand, 28066472 - 28066694
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  |  ||||||||| |||| |||    
T  28066472 attattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttgttagtttactgaagatgtcggaattaaagtgtagtatacttagggtaaaggt 28066571  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    |||||||||| ||| ||| || | |||||| |||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  28066572 ttgcaagtctatttgaaaactcaaaagaataaagagaacacaacatgtattctgcaaaatcaactatataggttttcacattgaattccttcatatagga 28066671  T
Q  387 tgagtgtcacataagggaatgca 409  Q
    ||||||||||  |||||||||||    
T  28066672 tgagtgtcacggaagggaatgca 28066694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 29656481 - 29656167
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
    ||||| |||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||  || |||||| ||||||| ||  ||||| |||  |||||||||||| | || ||||    
T  29656481 attatcatgtagtgtccttatttttttggaattaagtttaatttatggtagttttctgaagaggtttgcatttaagtgtcttatacttagtgcaacggtt 29656382  T
Q  291 tgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacatgt---attctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    ||  ||||||||| ||| ||   ||||||  | ||| |||||||   ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  29656381 tgtcagtctctttgaaaactcgaaagaattgatagagcacatgttgtattctacctaatcaactatataggttctcacatcgaattccttcatataagat 29656282  T
Q  388 gagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatta 486  Q
    |||||| ||| |   ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29656281 gagtgtgacaaacatgaatgcatttctaagatgttcttttgagcttgatcaa-gctcccctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggaaataagatta 29656183  T
Q  487 agttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||||| ||||||    
T  29656182 agttcaaaataatata 29656167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 191 - 488
Target Start/End: Original strand, 31267293 - 31267593
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||  ||||||||| |  |||  | |    
T  31267293 attattatgtagtgtctttattttgtgggaatttaagtttaattcttgatagtttgctgaagatgatggtattgaagtttcttatactgattgtagtgat 31267392  T
Q  290 ttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtatagga 386  Q
    ||||||| |||||| |||  | | |||| | |||||||||||   |||||| |||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31267393 ttgcaagcctctttgaaaagtcaaaagatt-aagagaacacaacatgtattatgcataatcatctatatatgttatcacatcgaattccttcgtataaga 31267491  T
Q  387 tgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatt 485  Q
     |||||||||  |||||||||||  |||||||  || |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  31267492 cgagtgtcacgaaagggaatgcacctctaagaggttcttttgagcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgttagttggcaggacagtaagatt 31267590  T
Q  486 aag 488  Q
    |||    
T  31267591 aag 31267593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 189 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 1321634 - 1321323
Alignment:
Q  189 gtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaaggg 288  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||| |||  | |||||||||| |||| ||    
T  1321634 gtattattatgttgtgtcgttattttgttggaattaagtttaattcatggtagtttgctgaaggtgtttgcattaaagtgttttatacttagtgtaaagg 1321535  T
Q  289 tttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatg 388  Q
    |||  |||||||||| ||| ||   |||||||   | ||||| |||  | |     |  ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  1321534 ttttgaagtctctttgaaaactcgaaagaatgggtataacacgtgttgtattat--actaactatatatgttctcacaatgaatttcttcgtataagatg 1321437  T
Q  389 agtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaa 487  Q
    | ||| ||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  1321436 aatgtgacaaacatgaatgcatttctaagatgttgttttgagcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggtagggcagtaggattaa 1321338  T
Q  488 gttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||||    
T  1321337 gttcaaaagaatata 1321323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 13304364 - 13304052
Alignment:
Q  69 catgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcgg 167  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13304364 catgttctcgatatttggtcagcacagaatgttcccgacgatcgaaatggatgcttcgttgatgagatcgcctgaagatattatcaagagtttgattcgg 13304265  T
Q  168 caagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagc 267  Q
    | ||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||||||||       |||||||| || ||||||      
T  13304264 ccagatgaagatgtttaggtagta---ttatgttgtatcattattttgttggattttag-----ttcttgtta-------gaagatgttggtattgaaat 13304180  T
Q  268 ctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttca 364  Q
     ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  | | ||||||||||| || | |   |||||||| ||| |||||||||||| ||||||     
T  13304179 gtcttatacttagcgtaaaggtttggtagtctctttgaaaagtcaaaagaatgaagaaaagatattttgtattctaccgtatcaactatataggttttcc 13304080  T
Q  365 catcgaattccttcgtataggatgagtgt 393  Q
     ||| ||||| |||| ||| |||||||||    
T  13304079 aatc-aattcattcgaataagatgagtgt 13304052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16886592 - 16886209
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat-- 192  Q
    ||||||||  ||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||||| |||||| | |||||||||||   || | | ||  |||||||||||| ||      
T  16886592 catgttcctgaggattgagctggatgctacattgttaagttcgcctgaagatattataaagagtttgatcatgccacaagattatgtttaggtagcatca 16886493  T
Q  193 -tattatgttgtgtcattattttgttggattttag-tttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
     ||||||||  |||| ||||||| || || ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  16886492 ttattatgtactgtctttattttctttgaatttaaatttaattattgtcagtttgctgaagatgttggtattgaagtgtcttatacttagggtaaaggtt 16886393  T
Q  291 tgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    ||||||||| ||| ||| || | |||||| ||||||||   ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  16886392 tgcaagtctgtttgaaaactcaaaagaataaagagaacacaacatgtattttaccaaatcaactatataggttttcacatcgaattcctttgtataagat 16886293  T
Q  388 gagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgag-cttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttgg 470  Q
    |||||| ||  || ||||||||  | |||||| ||||| || |  |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16886292 gagtgtgacgaaacggaatgcacctttaagatcttgttatgtgaattgat-tatgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttgg 16886209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 344 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 26926896 - 26926738
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattct 443  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || || ||    
T  26926896 aatcaactacataggttttcacatcgaattctttcgtatatgatgagtgtcacatatgggaatgcacttctaagatgttgttttgagcttgctc-atgct 26926798  T
Q  444 cctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  26926797 cctctgtcaattgaaacttgtcagttggcatgacagtaggattaagtttaaaataatata 26926738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 495
Target Start/End: Original strand, 12083044 - 12083456
Alignment:
Q  91 cacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag 189  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||  |   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||  || ||  ||| ||||||||    
T  12083044 cacaacatgttcccatggatggatatgtttgtcacattgctgagatcgcctgaagatattctcaacagtttggttccgcctgaagattatgattaggtag 12083143  T
Q  190 tat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaa 285  Q
     ||   |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||  || ||||||||| ||||    
T  12083144 catcattattatgtagtgtctttattttgttcgaatttaagtttaattcttgtttgttttctgaagatgttggtattgaagtgtcgtatacttagggtaa 12083243  T
Q  286 gggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtat 382  Q
      |||| ||||||| ||| ||| |  | ||||||||||||||||||   ||| || |||  |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  12083244 atgttttcaagtctgtttgaaaacccaaaagaatgaagagaacacaacatgtgttttgcaaaatcagttatataggttttcacatcgaatttcttcgtat 12083343  T
Q  383 aggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaa 481  Q
    | ||||||||||||  | || ||||||  ||||||   || |||| |  | ||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12083344 aagatgagtgtcacggatggaaatgcacctctaaggggttctttttaattggatc-gtgctcctctgtcaattgaaactagtcagttggcagggcagtaa 12083442  T
Q  482 gattaagttcaaaa 495  Q
    |||| | |||||||    
T  12083443 gattcatttcaaaa 12083456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 371 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 27317627 - 27317496
Alignment:
Q  371 attccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttg 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27317627 attccttcgtataagatgagtgggacataagggaatgcacctctaagatgttgttttgtgcttgaaca-tgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttg 27317529  T
Q  470 gcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27317528 gcagggtagtaggattaagttcaaaagaatata 27317496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 329 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7414062 - 7413897
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttg 428  Q
    ||||||||||| | |||| | ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  |||||||| || |||||    
T  7414062 acatgtattctacagaattagctatataagttatcacatcaaattccttcgtatatgatgagtgtcacgacagggaatgcacctctaagatgttattttg 7413963  T
Q  429 agcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7413962 agcttgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtaagttggcagggcaataagattaagttcaaa 7413897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 314 - 499
Target Start/End: Original strand, 10546007 - 10546193
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcat 410  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||| |  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||     
T  10546007 aagaatgaagagaacgcaacatgcattttagcgaatcaactata--tgttttcacatcgaattcctttgtatatgatgagtatgacttaagggaatgcac 10546104  T
Q  411 ttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
     |||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  10546105 ctctaagatgttgttttgtgcatgatc-atgctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcattgcagtaaaattaagttcaaaagaat 10546193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 246
Target Start/End: Original strand, 28008860 - 28009038
Alignment:
Q  69 catgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcgg 167  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | | ||||||| | |||  |   ||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||| || ||    
T  28008860 catgttctcgatatttggtcagcacatcatgttctcgacgatcgagtttgatgttttgttgctgagatcttctgaagatactctcaagagtttgctttgg 28008959  T
Q  168 caagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgc 246  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28008960 ccagatgaagatgtttaggttgtattaaaatgttgtgtcattattttattggattttagcttaattcttgttagtttgc 28009038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Original strand, 7066746 - 7067189
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctgag-atattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| |||| |||| | |||| |||  ||||||||  ||||| ||||||||  |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  7066746 agcatgttctccatatatcgtcagcaccgcatgttcctgaggattgagatggaagctacgttgctgagatcgcctgaatatattcttaagagcttgattc 7066845  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcat 261  Q
     || | | ||  |||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||  |||||| || ||    
T  7066846 tgccacaagattatgtttaggtagcatcattattatgtagtgtctttattttgttggaatttaagtttaattcatgaaagtttgctacagatgttggtat 7066945  T
Q  262 tgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatg 358  Q
    | |||  | |||||||  |||||| | ||||||     |||| |||  | | ||||||||||||||||||   |||||| | || |||||||||||||||    
T  7066946 taaagtgtgttatactaggcgtaaagatttgcagcatcctttgaaaagtcaaaagaatgaagagaacacaacttgtattttaccaaatcaactatatatg 7067045  T
Q  359 ttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtca-ttgaa 457  Q
    ||||||||| | ||||| | |||||  |||||||| ||  ||||||||| |    |||||| ||||| || || |||||| | ||||||||||| |||||    
T  7067046 ttttcacatagtattcccttgtataatatgagtgtgacgaaagggaatgtaccattaagatgttgttatgtgcgtgatca-tgctcctctgtcaattgaa 7067144  T
Q  458 acttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    |||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||    
T  7067145 acttgtcagttggcagtgcaatagaattaagttcaaaagaatata 7067189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 344 - 499
Target Start/End: Original strand, 23553755 - 23553910
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattct 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  | |  |||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||    
T  23553755 aatcaactaaatatgttttcacatcgaattctttcgtataagatgagtgtgacgaacgaaaatgtatttctaagatgttgttttgtgcttgatc-atact 23553853  T
Q  444 cctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||    
T  23553854 cctctgtcaatagaaacttgtcagttggcagtgcaatatgattaagttcaaaagaat 23553910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12083797 - 12083596
Alignment:
Q  214 tgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttac 313  Q
    |||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||  || ||||||| | ||||   ||||||||||| ||| ||| || |     
T  12083797 tgttggatttaaatttaattcttgaaagtttgccgaaaatgtcggaattgaagtgtcgtatactttgtgtaaaaatttgcaagtctgtttgaaaactcaa 12083698  T
Q  314 aagaatgaagag---aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgca 409  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  12083697 aagaatgaagagaacaacacatgtattcttcaaaatcatctatatacgttttcacatcgaattccctcatataagatgagtcatcacagaaaggaatgca 12083598  T
Q  410 tt 411  Q
    ||    
T  12083597 tt 12083596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 344 - 495
Target Start/End: Complemental strand, 5282173 - 5282022
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattct 443  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||    || ||||||  | ||||  | ||    
T  5282173 aatcagctatataggttatcacatcgaattccttcgtataagatgagtgtcacataaaggaatgcacctctaatgggttattttgaattagatc-gtgct 5282075  T
Q  444 cctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaa 495  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  5282074 cctctgtcaattgaaactagtcagttggcagggcagtaagattcaattcaaaa 5282022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7414255 - 7414115
Alignment:
Q  131 tgagatcgcctgaga-tattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgt-tggatttta 225  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  || ||| ||  ||| |||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||| |    
T  7414255 tgagatcgcctgaaaatattctcaacagtttgatttcgccagaagattatgattaggtagcatcattattatgtagtgtctttattttgtgtgaatttaa 7414156  T
Q  226 gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  7414155 gtttaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaag 7414115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 41935224 - 41935116
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacacat---gtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcat 410  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |  ||||||||||||     
T  41935224 aagaatgaagagaacacatcttgtattcaaccaaatcaactatatatgttttcacatcgaattcccttgtataagatgagtgagatgtaagggaatgcac 41935125  T
Q  411 ttctaagat 419  Q
     ||||||||    
T  41935124 ctctaagat 41935116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12309694 - 12309482
Alignment:
Q  96 catgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattcggcaagatgaagatgtttaggtag---ta 191  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||  | |  ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | | ||  ||||||||||||    |    
T  12309694 catgttcccgaggattgagatggaagccaggttgctgagatcgcatgaagatattctcaagagtttgattctgccacaagattatgtttaggtagcatca 12309595  T
Q  192 ttattatgttgtgtcattattttgttgg-attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtt 290  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||  |||| || |||||||  |||||||||| | |||  | ||    
T  12309594 ttattatgtattgtctttattttgttggaatttaagtttaattcatggaagtttgctgagaatgttggtattgaagtgtcttatacttggtgtagagatt 12309495  T
Q  291 tgcaagtctcttt 303  Q
    |||||| ||||||    
T  12309494 tgcaagactcttt 12309482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 391
Target Start/End: Original strand, 41934913 - 41934995
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacaca-----tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||||||||||     || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41934913 aagaatgaagagaacacaacagttgcattctaccaaatcaactatatatgttttcacatcgaattccctcgtataagatgagt 41934995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 191 - 294
Target Start/End: Original strand, 3924961 - 3925065
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggt 289  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||| |||  || |||||||||||||| | |    
T  3924961 attattatgtattgtctttattttgttggaatttaagtttaattcttattagttcgctgaagatgttggtattaaagtgtcatatacttagcgtaaagat 3925060  T
Q  290 ttgca 294  Q
    |||||    
T  3925061 ttgca 3925065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 326 - 411
Target Start/End: Original strand, 5281790 - 5281876
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt-gtcacataagggaatgcatt 411  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||| || ||||||||||    
T  5281790 aacacatgtattctacaaaatcaactatatatgttatcacatcgaattccttcatataaaatgagtcatcacaaaaaggaatgcatt 5281876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 499
Target Start/End: Original strand, 3925096 - 3925251
Alignment:
Q  344 aatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattct 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||  |  |||| ||||||||  || ||||||| ||||  |||||||| || ||||| |||||||| ||  |    
T  3925096 aatcaactatatatgttttcacatcgatctctctgatataagatgagtgggacgtaagggattgcacctctaagatgttattttgtgcttgatc-atgtt 3925194  T
Q  444 cctctgtc-attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaat 499  Q
    | | |||| |||||||||||| ||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||    
T  3925195 cttatgtcaattgaaacttgttagttggcaatgcggtaggattaagttcaaaagaat 3925251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 41935469 - 41935406
Alignment:
Q  74 tctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatc 137  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  41935469 tctcgatattttgtcagcacaacatgctcccatgggtcgagatggatgctacgttgttgagatc 41935406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3925359 - 3925297
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattc 374  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3925359 aagaatgaagagaacacaatttgtattctaccaaatcaactatatatg-tttcacatcgaattc 3925297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 165
Target Start/End: Original strand, 26926629 - 26926689
Alignment:
Q  106 aggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    ||||| ||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26926629 aggattgagatggaagctgcattgatgagatcgcctgaagatattctcaagagtttgattc 26926689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5282510 - 5282464
Alignment:
Q  220 attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaag 266  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5282510 atttaagtctaattcttgttagtttgctgaagatgttggtattgaag 5282464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 395
Target Start/End: Original strand, 11825055 - 11825121
Alignment:
Q  329 acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtca 395  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  11825055 acatgtattatgcagaatcaactatataagttatgatatcgaatttcttcatataagatgagtgtca 11825121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 150729 - 150680
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    |||||||||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  150729 aacacatgtattctacaaaatcaattatatatgttatcacatcgaattcc 150680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 3380343 - 3380392
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattcc 375  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3380343 aacacatgtattctacaaaataaactatatatgttatcacatcgaattcc 3380392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 494
Target Start/End: Complemental strand, 7413821 - 7413768
Alignment:
Q  442 ctcctctgtca-ttgaaacttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaa 494  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  7413821 ctcctctgtcaattgaaacttgtcagttggcagggcagtaatattcaattcaaa 7413768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 452 - 485
Target Start/End: Original strand, 12083541 - 12083574
Alignment:
Q  452 attgaaacttgtcagttggcagggtagtaagatt 485  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12083541 attgaaacttgtcagttgacagggtagtaagatt 12083574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23554004 - 23553939
Alignment:
Q  326 aacacatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagt 391  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| |||||||    
T  23554004 aacacatgtattctagcaaatcaactatataggttatcacatcaaattccctcatataagatgagt 23553939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27317810 - 27317745
Alignment:
Q  191 attattatgttgtgtcattattttgttgg-attttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgt 255  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  27317810 attattatgtagtgtctttattttgttggaatttaaatttaaatcttgttagtttgcggaatatgt 27317745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 502
Target Start/End: Original strand, 5438 - 5881
Alignment:
Q  67 agcatgctctcgatatttggtcaacacaacatgttcccaaggatcgagatggattctacattgttgagatcgcctga-gatattctcaagagtttgattc 165  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| | |||  |   || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  5438 agcatgttctcgattttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgattt 5537  T
Q  166 ggcaagatgaagatgtttaggtagtat---tattatgttgtgtcattattttgttggatttta-gtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcat 261  Q
     || ||| ||    | |||||||| ||   |||||||| ||||| || | ||||  || |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||    
T  5538 cgccagaagatcgagattaggtagcatcattattatgtagtgtctttgtcttgtgcgaatttaagtttaattgttgttagtttgctaaagatgttggaat 5637  T
Q  262 tgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac---acatgtattctgccgaatcaactatatatg 358  Q
    |||||  || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||||||| |   ||||||||| |||  |||||||||||||      
T  5638 tgaagtgtcgtatacttagggtaaaggtttgcaagtctgtttgaaaactcaaaagaatgaagagagcacaacatgtattttgcaaaatcaactatataaa 5737  T
Q  359 ttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgt-cattgaa 457  Q
    || |||||||||||| | | ||||| ||||||||| ||  ||| |||||||  |||||||| |||||| | |||||||| || |||||||||  ||||||    
T  5738 ttctcacatcgaattaccttgtataagatgagtgtgacgaaagagaatgcacctctaagatgttgtttcgtgcttgatc-atgctcctctgtaaattgaa 5836  T
Q  458 acttgtcagttggcagggtagtaagattaagttcaaaagaatata 502  Q
    ||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  5837 acttgtctgttggcagtgcagtaggattaagttcaaaagaatata 5881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 22559 - 22333
Alignment:
Q  277 ttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaatt 373  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||||||||||||   |||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22559 ttagtgtaaaggtttgcaagtatctttcaaaaatcacaaga-tgaagagaacacaacatgtattatgtcgaatcaactatataagttctcacatcgaatt 22461  T
Q  374 ccttcgtataggatgagtgtcacataagggaatgcatttctaagatattgttttgagcttgatcaattctcctctgtc-attgaaacttgtcagttggca 472  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22460 ccttcgtataagatgagtgtgacaaacgagaatgcacttctaagatgttgttttaaacttgatc-atgctcttctgtcaattgaaacttgtcagttggga 22362  T
Q  473 gggtagtaagattaagttcaaaagaatat 501  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22361 aggcagtatgattaagttcaaaagaatat 22333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 391
Target Start/End: Original strand, 22203 - 22306
Alignment:
Q  293 caagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaac-----acatgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggat 387  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||     ||||||||||| || |||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  22203 caagtctctttcaaaactcaaaagaatgaagagaacgcaacacatgtattctaccaaatctactctacatgttctcacatcgaattccttcatataagat 22302  T
Q  388 gagt 391  Q
    ||||    
T  22303 gagt 22306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 279
Target Start/End: Original strand, 1191 - 1328
Alignment:
Q  143 agatattctcaagagtttgattcgg-caagatgaagatgtttaggtagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttag 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1191 agatattctcaagagtttgattcgggctagatgaagatgtttagaaagtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttag 1290  T
Q  242 tttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatactta 279  Q
    |||| ||||| ||   |||||||||  |||||||||||    
T  1291 tttgttgaagttgctagcattgaagtgtcttatactta 1328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0591 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0591
Description:

Target: scaffold0591; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 330
Target Start/End: Original strand, 2828 - 2968
Alignment:
Q  189 gtattattatgttgtgtcattattttgttggattttagtttaattcttgttagtttgctgaagatgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaaggg 288  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |   |||||||||||| || |  |    
T  2828 gtattattatgttatgtcattattttgttggattttaatttaattcttgttagtttgctgaagatgtttgcattgca-tgtcttatacttagtgttaaag 2926  T
Q  289 tttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacac 330  Q
    |||||  |||||||| ||| ||   |||||||||||||||||    
T  2927 tttgccggtctcttttaaaactcgaaagaatgaagagaacac 2968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 392
Target Start/End: Original strand, 37009 - 37090
Alignment:
Q  314 aagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatcaactatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatgagtg 392  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37009 aagaatgaagagaacacaacatgtattttaccaaatcaactatatatgttttcacatcgaattcctttatataggatgagtg 37090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 389
Target Start/End: Original strand, 45911 - 46051
Alignment:
Q  252 atgtcggcattgaagcctcttatacttagcgtaagggtttgcaagtctctttcaaagcttacaagaatgaagagaacaca---tgtattctgccgaatca 348  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||   ||| ||| ||||||| ||| || | ||||||||||||||||||   |||||||| |  |||||    
T  45911 atgttggcattgaagtgtcttatacttagtgtaaaaatttacaaatctctttgaaaactcaaaagaatgaagagaacacattttgtattctacaaaatca 46010  T
Q  349 actatatatgttttcacatcgaattccttcgtataggatga 389  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  46011 actacacatgttctcacatcgaattccttcatataagatga 46051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University