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 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
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Alignment Overview

Query: NF9930_high_19 (Length: 261)

Name: NF9930_high_19
Description: NF9930
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9930_high_19
NF9930_high_19
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (44-200)||(42923941-42924096)
chr2 (44-198)||(35216031-35216184)
chr2 (44-198)||(35218412-35218565)
chr2 (44-198)||(42452449-42452602)
chr2 (44-198)||(23452676-23452829)
chr2 (44-198)||(27583754-27583907)
chr2 (44-188)||(28568597-28568740)
chr2 (68-198)||(27136368-27136505)
chr2 (102-191)||(34575608-34575696)
chr2 (44-117)||(15693669-15693742)
chr2 (46-117)||(39286971-39287042)
chr2 (122-188)||(28568346-28568411)
chr2 (114-188)||(41303549-41303623)
chr2 (114-188)||(15693583-15693655)
chr2 (44-117)||(41303462-41303535)
chr2 (44-116)||(7502638-7502710)
chr2 (119-160)||(39286911-39286952)
chr2 (44-117)||(41304812-41304884)
[»] chr4 (26 HSPs)
chr4 (44-198)||(56030189-56030342)
chr4 (44-199)||(22135066-22135220)
chr4 (44-198)||(5100743-5100896)
chr4 (44-198)||(22132834-22132987)
chr4 (40-198)||(44600271-44600428)
chr4 (44-198)||(14787868-14788021)
chr4 (47-198)||(47211158-47211308)
chr4 (44-198)||(17662673-17662826)
chr4 (44-198)||(24347959-24348111)
chr4 (40-166)||(30136346-30136472)
chr4 (40-198)||(9022060-9022216)
chr4 (45-199)||(10112625-10112774)
chr4 (44-199)||(9863498-9863649)
chr4 (44-198)||(38890566-38890701)
chr4 (100-196)||(19322410-19322506)
chr4 (44-117)||(54929107-54929180)
chr4 (126-198)||(14789500-14789571)
chr4 (47-188)||(38209115-38209259)
chr4 (44-117)||(10979676-10979749)
chr4 (119-166)||(5516771-5516818)
chr4 (55-114)||(29609838-29609897)
chr4 (116-163)||(54929198-54929245)
chr4 (44-90)||(19322547-19322593)
chr4 (68-117)||(5516703-5516752)
chr4 (75-117)||(14647172-14647214)
chr4 (114-184)||(29609914-29609983)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (44-198)||(53915929-53916082)
chr3 (44-199)||(41848803-41848957)
chr3 (44-198)||(746422-746575)
chr3 (44-201)||(51943039-51943195)
chr3 (44-199)||(25533106-25533260)
chr3 (44-198)||(455573-455726)
chr3 (44-198)||(457950-458103)
chr3 (44-198)||(1313082-1313235)
chr3 (44-198)||(10621974-10622127)
chr3 (44-198)||(27636059-27636212)
chr3 (44-198)||(42991953-42992106)
chr3 (44-198)||(53918097-53918250)
chr3 (44-196)||(42989954-42990105)
chr3 (44-198)||(4104330-4104483)
chr3 (123-198)||(6561613-6561687)
chr3 (47-112)||(53974011-53974077)
chr3 (114-188)||(53974124-53974197)
chr3 (44-165)||(54287489-54287627)
chr3 (44-114)||(11066346-11066416)
chr3 (114-188)||(11072644-11072717)
chr3 (47-117)||(11072731-11072801)
chr3 (114-188)||(11066255-11066329)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (39-199)||(18345236-18345395)
chr7 (44-198)||(7094862-7095015)
chr7 (44-199)||(3035414-3035568)
chr7 (44-198)||(7092615-7092768)
chr7 (44-198)||(11756925-11757078)
chr7 (44-198)||(20299155-20299308)
chr7 (44-198)||(47865328-47865481)
chr7 (44-200)||(1606169-1606324)
chr7 (44-198)||(1849665-1849818)
chr7 (44-198)||(7470468-7470621)
chr7 (44-198)||(7472421-7472574)
chr7 (44-198)||(20625734-20625887)
chr7 (44-198)||(20629625-20629778)
chr7 (44-198)||(20642044-20642197)
chr7 (44-198)||(31156347-31156500)
chr7 (44-198)||(38395986-38396139)
chr7 (49-198)||(443326-443474)
chr7 (44-198)||(7349714-7349867)
chr7 (44-198)||(7352093-7352246)
chr7 (44-198)||(28485261-28485414)
chr7 (44-198)||(28487249-28487402)
chr7 (44-198)||(37412563-37412716)
chr7 (44-198)||(21989853-21990004)
chr7 (44-199)||(38393682-38393836)
chr7 (44-198)||(21470730-21470883)
chr7 (44-198)||(42331440-42331593)
chr7 (44-190)||(24258166-24258310)
chr7 (69-195)||(40281862-40281989)
chr7 (102-198)||(3676997-3677092)
chr7 (44-128)||(13099912-13099996)
chr7 (44-117)||(43253962-43254035)
chr7 (44-92)||(3677083-3677131)
chr7 (44-93)||(20297163-20297212)
chr7 (114-188)||(10690684-10690756)
chr7 (134-188)||(20297108-20297161)
chr7 (44-117)||(12310455-12310528)
chr7 (114-165)||(12310542-12310593)
chr7 (119-150)||(6628853-6628884)
chr7 (119-150)||(12657667-12657698)
chr7 (143-190)||(43254023-43254069)
chr7 (120-150)||(12485044-12485074)
chr7 (120-150)||(12506475-12506505)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (44-199)||(32339093-32339247)
chr8 (44-199)||(43529870-43530024)
chr8 (44-198)||(28283660-28283813)
chr8 (44-198)||(3873750-3873904)
chr8 (44-198)||(15808962-15809115)
chr8 (44-198)||(41384493-41384646)
chr8 (44-198)||(608470-608623)
chr8 (44-197)||(41382420-41382572)
chr8 (80-198)||(3265635-3265752)
chr8 (116-188)||(13986304-13986374)
chr8 (71-117)||(11701401-11701447)
chr8 (44-114)||(13986215-13986285)
chr8 (116-188)||(30679186-30679256)
chr8 (116-145)||(27820149-27820178)
[»] chr5 (23 HSPs)
chr5 (44-198)||(25803707-25803860)
chr5 (44-199)||(26097420-26097574)
chr5 (44-198)||(18468698-18468851)
chr5 (44-198)||(26098688-26098841)
chr5 (44-198)||(27912219-27912372)
chr5 (44-196)||(18511649-18511800)
chr5 (44-199)||(15551924-15552078)
chr5 (44-198)||(3373477-3373630)
chr5 (44-198)||(27910135-27910288)
chr5 (44-195)||(18509754-18509904)
chr5 (44-164)||(10586562-10586682)
chr5 (44-198)||(21288529-21288683)
chr5 (45-191)||(17415748-17415893)
chr5 (44-198)||(18596326-18596490)
chr5 (93-198)||(6661929-6662033)
chr5 (44-117)||(18466453-18466526)
chr5 (118-198)||(40221282-40221361)
chr5 (44-117)||(15143262-15143335)
chr5 (114-165)||(5779144-5779195)
chr5 (143-198)||(18466411-18466465)
chr5 (143-198)||(15143220-15143274)
chr5 (44-117)||(32520241-32520316)
chr5 (116-150)||(2532750-2532784)
[»] chr1 (33 HSPs)
chr1 (44-198)||(39931762-39931915)
chr1 (44-198)||(47905956-47906109)
chr1 (44-198)||(48664852-48665005)
chr1 (44-198)||(15295286-15295439)
chr1 (44-198)||(24325347-24325500)
chr1 (44-198)||(31735962-31736115)
chr1 (44-199)||(45693871-45694025)
chr1 (44-198)||(9459860-9460013)
chr1 (44-198)||(17325074-17325227)
chr1 (44-199)||(4131728-4131883)
chr1 (44-198)||(9463687-9463840)
chr1 (44-198)||(27337379-27337532)
chr1 (44-198)||(6115564-6115718)
chr1 (44-198)||(2949662-2949815)
chr1 (44-166)||(21948630-21948752)
chr1 (44-198)||(28998691-28998844)
chr1 (44-198)||(29004407-29004560)
chr1 (44-198)||(27339573-27339730)
chr1 (51-198)||(6997214-6997359)
chr1 (82-199)||(46432521-46432637)
chr1 (40-198)||(16561131-16561288)
chr1 (51-159)||(6996067-6996175)
chr1 (44-117)||(11693593-11693666)
chr1 (44-188)||(13785675-13785835)
chr1 (44-114)||(14352759-14352829)
chr1 (68-188)||(32260746-32260882)
chr1 (114-160)||(10115509-10115555)
chr1 (77-130)||(13112046-13112099)
chr1 (44-85)||(46432166-46432207)
chr1 (44-114)||(10115572-10115640)
chr1 (44-75)||(2510770-2510801)
chr1 (119-150)||(16855265-16855296)
chr1 (120-188)||(11693686-11693753)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (44-199)||(5275775-5275929)
chr6 (44-198)||(2629326-2629479)
chr6 (44-198)||(30035043-30035196)
chr6 (44-199)||(12195951-12196105)
chr6 (44-198)||(19705012-19705165)
chr6 (44-198)||(18317751-18317904)
chr6 (44-198)||(26933005-26933158)
chr6 (44-198)||(30966923-30967076)
chr6 (44-199)||(22858383-22858537)
chr6 (44-196)||(20526548-20526694)
chr6 (44-190)||(17852275-17852419)
chr6 (44-196)||(17011781-17011929)
chr6 (40-165)||(30445253-30445395)
chr6 (114-165)||(30443046-30443097)
chr6 (44-117)||(30443111-30443182)
chr6 (119-163)||(3833176-3833220)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (44-198)||(11908-12061)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (44-198)||(51709-51862)
scaffold0005 (126-198)||(50159-50230)
scaffold0005 (75-117)||(170076-170118)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (44-198)||(1735-1888)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (44-199)||(78882-79036)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (82-197)||(2070-2184)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (49-198)||(4546-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (103-198)||(1-95)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (44-114)||(57836-57905)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (119-160)||(2232-2273)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Original strand, 42923941 - 42924096
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923941 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 42924040  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacacg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42924041 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacacg 42924096  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 35216031 - 35216184
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216031 aaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 35216130  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216131 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 35216184  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 35218412 - 35218565
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218412 aaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 35218511  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218512 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 35218565  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42452602 - 42452449
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452602 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 42452503  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  42452502 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttaagtcatactacaaca 42452449  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 23452676 - 23452829
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23452676 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatttattttcagcataaaatatatttgaaacaaatctttt 23452775  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452776 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 23452829  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 27583754 - 27583907
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583754 aaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatatttattgttcataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 27583853  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27583854 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaaatttgagtcatactacaaca 27583907  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 28568597 - 28568740
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28568597 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttgaaacaaatctttt 28568696  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||| ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  28568697 atagttttagcaacaatattcttcat-ctatcaaattttgagtca 28568740  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 68 - 198
Target Start/End: Original strand, 27136368 - 27136505
Alignment:
Q  68 cttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatat--------attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||        ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27136368 cttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaccaa 27136467  T
Q  160 tattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27136468 tattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 27136505  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575696
Alignment:
Q  102 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatac 34575696  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15693742 - 15693669
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15693742 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagca 15693669  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286971
Alignment:
Q  46 aatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagca 39286971  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28568411 - 28568346
Alignment:
Q  122 atatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  28568411 atatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtca 28568346  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 41303549 - 41303623
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata-tttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||    
T  41303549 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatattttttagcaacaatcttcttcat-ccatcaaattctgagtca 41303623  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15693655 - 15693583
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| |||||    
T  15693655 agcacaaaatatatttgaaacaaatc-tttatatttttagcaacaatattattcat-ccatcaaattttaagtca 15693583  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 41303462 - 41303535
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41303462 aaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagca 41303535  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 7502710 - 7502638
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttct-tcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  7502710 aaaatatatttgcatcaaatc-ttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39286952 - 39286911
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 160  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39286952 aaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaat 39286911  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 41304812 - 41304884
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  41304812 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg-tacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

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Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 26)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 56030342 - 56030189
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030342 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 56030243  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030242 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 56030189  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 22135066 - 22135220
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135066 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 22135165  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135166 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 22135220  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5100896 - 5100743
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5100896 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatctttt 5100797  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100796 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 5100743  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 22132834 - 22132987
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132834 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 22132933  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22132934 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgaatcatactacaaca 22132987  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 198
Target Start/End: Original strand, 44600271 - 44600428
Alignment:
Q  40 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44600271 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatc 44600370  T
Q  140 ttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44600371 ttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaatttttgagtcatactacaaca 44600428  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 14787868 - 14788021
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787868 aaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatctttt 14787967  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787968 atatttttagcaacattattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 14788021  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 47 - 198
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211308
Alignment:
Q  47 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  147 tttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttaagtcatactacaaca 47211308  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 17662673 - 17662826
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17662673 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatctttt 17662772  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||    
T  17662773 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttgtagtcatactacaaca 17662826  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24348111 - 24347959
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348111 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc-gcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 24348013  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348012 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 24347959  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 30136472 - 30136346
Alignment:
Q  40 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatc 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30136472 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatc 30136373  T
Q  140 ttttatatttttagcaacaatattctc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30136372 ttttatatttttagcaacaatattctc 30136346  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9022216 - 9022060
Alignment:
Q  40 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9022216 ttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattgtc-ataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatc 9022118  T
Q  140 ttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
     |||||||||| | |||||||||| |||   |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9022117 atttatattttcaacaacaatatt-tctcatccataaaattttgaatcatactacaaca 9022060  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10112774 - 10112625
Alignment:
Q  45 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 144  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  10112774 aaatatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatagtttcagcacaaaatatatttgaaac----ctttta 10112679  T
Q  145 tatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  || |||||||| ||||||||||||||||    
T  10112678 tatttttagcaacaatattcttcat-tcaacaaattttaagtcatactacaacac 10112625  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9863649 - 9863498
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9863649 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc---acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcattt 9863553  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    |||||||||| ||||||||  |  || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9863552 atatttttagtaacaatatatttcat-ccaacaaattttgagtcatattacaacac 9863498  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 38890566 - 38890701
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||                  ||||||||||||||||||||    
T  38890566 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaat------------------atatttgaaacaaatctttt 38890647  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38890648 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatgctacaaca 38890701  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19322506 - 19322410
Alignment:
Q  100 ataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagc-aacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaa 196  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19322506 ataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaa 19322410  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 54929107 - 54929180
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  54929107 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattttcagca 54929180  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 198
Target Start/End: Original strand, 14789500 - 14789571
Alignment:
Q  126 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789500 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 14789571  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 188
Target Start/End: Original strand, 38209115 - 38209259
Alignment:
Q  47 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttat--tgtctataaatatattttc--agcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 142  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  | || | ||  || || |   |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38209115 atatatttgcatcaaatcttccttcatacagtacaaaaatatatttatattttcaacaacaatcttcttgaagcacaaaatatatttaaaacaaatcttt 38209214  T
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  38209215 tatatttttaacaacaatatttttcat-ccatcaaattttgagtca 38209259  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 10979749 - 10979676
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10979749 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Original strand, 5516771 - 5516818
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctc 166  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5516771 aaaatatatttgaaacaattcatttatatttttagcaacaatattctc 5516818  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 114
Target Start/End: Original strand, 29609838 - 29609897
Alignment:
Q  55 gcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca 114  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  29609838 gcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactcttcataaatatattttca 29609897  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 163
Target Start/End: Original strand, 54929198 - 54929245
Alignment:
Q  116 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 163  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54929198 cacaaaatacatttaaatcaaatcttttatatttttagcaacaatatt 54929245  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19322593 - 19322547
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatat 90  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  19322593 aaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaaaatatat 19322547  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 117
Target Start/End: Original strand, 5516703 - 5516752
Alignment:
Q  68 cttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5516703 cttcatacgataaaaaaatatatttattatctataaatatatttttagca 5516752  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 117
Target Start/End: Original strand, 14647172 - 14647214
Alignment:
Q  75 cggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14647172 cggtacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 29609914 - 29609983
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttga 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    ||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  29609914 agcacaaaatatatttgaaaaaaatcaagaatacttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttga 29609983  T

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Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 53915929 - 53916082
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53915929 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 53916028  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53916029 atatttttagcaacaatattctccatccc-tcaaattttgagtcatactacaaca 53916082  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41848957 - 41848803
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848957 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 41848858  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848857 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 41848803  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 746575 - 746422
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746575 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 746476  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  746475 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 746422  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 51943195 - 51943039
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943195 aaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 51943096  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacacga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943095 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaacacga 51943039  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25533260 - 25533106
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25533260 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttt 25533161  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533160 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 25533106  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 455726 - 455573
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455726 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 455627  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  455626 atatttttagcaacaatattccccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 455573  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 458103 - 457950
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458103 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccacaaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 458004  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  458003 atatttttagcaacaatattccccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 457950  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1313235 - 1313082
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1313235 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacagaaatatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcattt 1313136  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313135 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 1313082  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 10621974 - 10622127
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10621974 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 10622073  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622074 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 10622127  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 27636059 - 27636212
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27636059 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaactaatatttt 27636158  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||    
T  27636159 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttaaatcatactacaaca 27636212  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 42992106 - 42991953
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42992106 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaacctttt 42992007  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992006 atatttttaacaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 42991953  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 53918097 - 53918250
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53918097 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaaaatatatttattgtccataaatatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatctttt 53918196  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53918197 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactataaca 53918250  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42990105 - 42989954
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42990105 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatactttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatttttt 42990006  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42990005 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaa 42989954  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 4104330 - 4104483
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4104330 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcataaagtatatttgaaacaaatctttt 4104429  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104430 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 4104483  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6561687 - 6561613
Alignment:
Q  123 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6561687 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaatttcgagtcatactacaaca 6561613  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 112
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  47 atatatttgcatcaaatcgttctt-catacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 112  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Original strand, 53974124 - 53974197
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  || ||||||||||||||||||    
T  53974124 agcacaaaatataattgaaacaaatcttttatatttttaacaacaacattcttcat-ccatcaaattttgagtca 53974197  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 165
Target Start/End: Original strand, 54287489 - 54287627
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca-----------------gcacaaaatata 126  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||                 |||| |||||||    
T  54287489 aaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttcaacagcaatcttttggaagcacgaaatata 54287588  T
Q  127 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54287589 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatcttct 54287627  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11066416 - 11066346
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca 114  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11066416 aaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttca 11066346  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11072717 - 11072644
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  11072717 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatattttttgcaacaatcttcttcat-ccatcaaattttgagtca 11072644  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072731
Alignment:
Q  47 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    |||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagca 11072731  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11066329 - 11066255
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttat-atttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||    
T  11066329 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatcttttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattatgagtca 11066255  T

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Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 39 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18345395 - 18345236
Alignment:
Q  39 attttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18345395 atttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtcaataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaat 18345296  T
Q  139 cttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345295 cttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 18345236  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 7094862 - 7095015
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094862 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 7094961  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094962 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 7095015  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3035568 - 3035414
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035568 aaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 3035469  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035468 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 3035414  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 7092615 - 7092768
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092615 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 7092714  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092715 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 7092768  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 11757078 - 11756925
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757078 aaaatatatttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 11756979  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11756978 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 11756925  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20299308 - 20299155
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20299308 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatctttt 20299209  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299208 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 20299155  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47865481 - 47865328
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865481 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 47865382  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47865381 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttggagtcatactacaaca 47865328  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1606324 - 1606169
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1606324 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 1606225  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacacg 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606224 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcatactacaacacg 1606169  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1849818 - 1849665
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849818 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 1849719  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849718 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 1849665  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 7470468 - 7470621
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7470468 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgtttt 7470567  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470568 atatttttagcaataatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 7470621  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 7472421 - 7472574
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472421 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgatacaataatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 7472520  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472521 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 7472574  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20625887 - 20625734
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625887 aaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 20625788  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20625787 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactagaaca 20625734  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20629778 - 20629625
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629778 aaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 20629679  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20629678 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactagaaca 20629625  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20642197 - 20642044
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642197 aaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 20642098  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20642097 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactagaaca 20642044  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 31156347 - 31156500
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31156347 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 31156446  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31156447 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaatttttgagtcatactacaaca 31156500  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 38396139 - 38395986
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396139 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtacataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 38396040  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38396039 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttggagtcatactacaaca 38395986  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443326
Alignment:
Q  49 atatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  149 tttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 443326  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 7349714 - 7349867
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7349714 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 7349813  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7349814 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaatttttgagtcatactacaaca 7349867  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 7352093 - 7352246
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7352093 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 7352192  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7352193 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaatttttgagtcatactacaaca 7352246  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28485414 - 28485261
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28485414 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 28485315  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28485314 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgaatcatactacaaca 28485261  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 28487402 - 28487249
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28487402 aaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaattatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaagcaaatctttt 28487303  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487302 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 28487249  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 37412563 - 37412716
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412563 aaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttacataattatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 37412662  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412663 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 37412716  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21990004 - 21989853
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21990004 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca--acacaatatatttgaaacaaatctttt 21989907  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21989906 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgggtcatactacaaca 21989853  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38393836 - 38393682
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38393836 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaataaattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttat 38393737  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38393736 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttagaatcatactacaacac 38393682  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 21470730 - 21470883
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21470730 aaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 21470829  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21470830 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttggagtcaaactacaaca 21470883  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 42331440 - 42331593
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42331440 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatacttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatctttt 42331539  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42331540 atatttttagcaacaatattcttcat-tcatcaaattttaagtcatactacaaca 42331593  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24258310 - 24258166
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24258310 aaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcatactgtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 24258212  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcata 190  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24258211 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcata 24258166  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 69 - 195
Target Start/End: Original strand, 40281862 - 40281989
Alignment:
Q  69 ttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaa--tattctc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||     
T  40281862 ttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaaattcttctt 40281961  T
Q  167 tatcccatcaaattttgagtcatactaca 195  Q
     || |||||||||||||||||||||||||    
T  40281962 cat-ccatcaaattttgagtcatactaca 40281989  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3677092 - 3676997
Alignment:
Q  102 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3677092 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ctatcaaattttgagtcatactacaaca 3676997  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 128
Target Start/End: Original strand, 13099912 - 13099996
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13099912 aaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacgaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatt 13099996  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 43253962 - 43254035
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43253962 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagca 43254035  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3677131 - 3677083
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3677131 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattt 3677083  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 20297212 - 20297163
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatattta 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20297212 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattta 20297163  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10690756 - 10690684
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  10690756 agcacaaaatatatttgaaacata-cttttatatttttagcaacaatcttctccct-ccatcaaattttgagtca 10690684  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20297161 - 20297108
Alignment:
Q  134 caaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20297161 caaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtca 20297108  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 12310455 - 12310528
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||| ||||||||    
T  12310455 aaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 12310542 - 12310593
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  12310542 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatcagtagcaacaatcttct 12310593  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6628884 - 6628853
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6628884 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 6628853  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 150
Target Start/End: Original strand, 12657667 - 12657698
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657667 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12657698  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 190
Target Start/End: Original strand, 43254023 - 43254069
Alignment:
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcata 190  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  43254023 tatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagacata 43254069  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 150
Target Start/End: Original strand, 12485044 - 12485074
Alignment:
Q  120 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12485044 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12485074  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 150
Target Start/End: Original strand, 12506475 - 12506505
Alignment:
Q  120 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12506475 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 12506505  T

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Target: chr8 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32339247 - 32339093
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339247 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 32339148  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339147 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 32339093  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 43530024 - 43529870
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43530024 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 43529925  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529924 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 43529870  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 28283660 - 28283813
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283660 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 28283759  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283760 atatttttagcaaaaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 28283813  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3873904 - 3873750
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgtt-cttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873904 aaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 3873805  T
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873804 tatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 3873750  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15809115 - 15808962
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809115 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatctttt 15809016  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15809015 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactaaaaca 15808962  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41384646 - 41384493
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  41384646 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatctttt 41384547  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384546 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 41384493  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 608623 - 608470
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608623 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 608524  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  608523 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtgatactacaaca 608470  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41382572 - 41382420
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  41382572 aaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatctttt 41382473  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaac 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  41382472 atatttttaacaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaac 41382420  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 198
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265752
Alignment:
Q  80 caaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaat 179  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaat 3265733  T
Q  180 tttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3265734 tttgagtcatactacaaca 3265752  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 13986304 - 13986374
Alignment:
Q  116 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||||||    
T  13986304 cacaaaatatatttaaaacaaatc-tttatatttttagcaacaatcttcttcat-ccataaaattttgagtca 13986374  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 71 - 117
Target Start/End: Original strand, 11701401 - 11701447
Alignment:
Q  71 catacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  11701401 catacggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 13986215 - 13986285
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca 114  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| |||| | | || |||||||||||||||    
T  13986215 aaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 188
Target Start/End: Original strand, 30679186 - 30679256
Alignment:
Q  116 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  30679186 cacaaaatatatctaaaacaaatcttttttatttttaccaac-atattcttcat-ccatcaaattttgagtca 30679256  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 145
Target Start/End: Original strand, 27820149 - 27820178
Alignment:
Q  116 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27820149 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttat 27820178  T

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Target: chr5 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 23)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 25803860 - 25803707
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803860 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 25803761  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803760 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 25803707  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26097574 - 26097420
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26097574 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagtacaaaatatatttgaaacaaatttttt 26097475  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097474 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 26097420  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18468851 - 18468698
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468851 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 18468752  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468751 atatttttagcaaaaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 18468698  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 26098688 - 26098841
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098688 aaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 26098787  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098788 atatttttagcaataatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 26098841  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27912372 - 27912219
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912372 aaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 27912273  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912272 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 27912219  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 18511649 - 18511800
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18511649 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaacaaatctttt 18511748  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaa 196  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18511749 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaa 18511800  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15552078 - 15551924
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15552078 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 15551979  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551978 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 15551924  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 3373477 - 3373630
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3373477 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 3373576  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3373577 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattctgagtcatactacaaca 3373630  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 27910288 - 27910135
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910288 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 27910189  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910188 atatttttagcaataatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 27910135  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 195
Target Start/End: Original strand, 18509754 - 18509904
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18509754 aaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatctttt 18509853  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactaca 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18509854 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactaca 18509904  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10586682 - 10586562
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586682 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 10586583  T
Q  144 atatttttagcaacaatattc 164  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10586582 atatttttagcaacaatattc 10586562  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21288683 - 21288529
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaca-aaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 142  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21288683 aaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttt 21288584  T
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21288583 tttatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagttatactacaaca 21288529  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 191
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415893
Alignment:
Q  45 aaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttta 144  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  145 tatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatac 191  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatac 17415893  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18596490 - 18596326
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttat-----------tgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||           |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18596490 aaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatggtatatttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaa 18596391  T
Q  133 acaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18596390 acaaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatagtacaaca 18596326  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 93 - 198
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662033
Alignment:
Q  93 attgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatact 192  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||| |||||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcat-ccatcaagttttaagtcatact 6662027  T
Q  193 acaaca 198  Q
    ||||||    
T  6662028 acaaca 6662033  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 18466526 - 18466453
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18466526 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagca 18466453  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40221361 - 40221282
Alignment:
Q  118 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || |||||||||||||||||||||||    
T  40221361 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcat-caattaaattttgagtcatactacaaca 40221282  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15143335 - 15143262
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15143335 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatatttttagca 15143262  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Original strand, 5779144 - 5779195
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5779144 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatcttct 5779195  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18466465 - 18466411
Alignment:
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18466465 tatatttttagcaacaatattctccatcc-atcaaattttgagtcatactacaaca 18466411  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15143274 - 15143220
Alignment:
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15143274 tatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactataaca 15143220  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 32520316 - 32520241
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtct--ataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||    
T  32520316 aaaatatgtttgcatcaaatttttcttcgtacggtacaaaaatatatttttactctacataaatatattttcagca 32520241  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 150
Target Start/End: Original strand, 2532750 - 2532784
Alignment:
Q  116 cacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2532750 cacaagatatatttgaaacaaatcttttatatttt 2532784  T

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Target: chr1 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 33)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 39931915 - 39931762
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931915 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 39931816  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931815 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 39931762  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 47906109 - 47905956
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906109 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 47906010  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906009 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 47905956  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 48665005 - 48664852
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665005 aaaatatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 48664906  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664905 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 48664852  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 15295286 - 15295439
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295286 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 15295385  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295386 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 15295439  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24325500 - 24325347
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24325500 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 24325401  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325400 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 24325347  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 31735962 - 31736115
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735962 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 31736061  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736062 atatttttagcaacaatattctc-cttccatcaaattttgagtcatactacaaca 31736115  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 45693871 - 45694025
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693871 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 45693970  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45693971 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgaatcatagtacaacac 45694025  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 9459860 - 9460013
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459860 aaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 9459959  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459960 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 9460013  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 17325074 - 17325227
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17325074 aaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaactcaaaatatatttgaaacaaatctttt 17325173  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17325174 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 17325227  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 4131728 - 4131883
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatt-gtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4131728 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataaatatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttt 4131827  T
Q  143 tatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131828 tatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 4131883  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 9463687 - 9463840
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463687 aaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 9463786  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463787 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 9463840  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 27337379 - 27337532
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27337379 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttat 27337478  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27337479 atatttttagcaacaatattccccat-ccatcaaatttggagtcatactacaaca 27337532  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 6115564 - 6115718
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115564 aaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 6115663  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaa-ttttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6115664 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttttgagtcatcctacaaca 6115718  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 2949662 - 2949815
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2949662 aaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 2949761  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2949762 atatttttagcaacaatattcttcat-ccatgaaattttgagtcatactataaca 2949815  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 166
Target Start/End: Original strand, 21948630 - 21948752
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948630 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 21948729  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21948730 atatttttagcaacaatattctc 21948752  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 28998691 - 28998844
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28998691 aaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatctttt 28998790  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998791 atagttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 28998844  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 29004407 - 29004560
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29004407 aaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatctttt 29004506  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004507 atagttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 29004560  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 27339573 - 27339730
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatat----attttcagcacaaaatatatttgaaacaaatc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339573 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatc 27339672  T
Q  140 ttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||    
T  27339673 ttttatatttttagcaacaatattctccat-ccgtcaaatttggagtcatactacaaca 27339730  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 6997359 - 6997214
Alignment:
Q  51 atttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6997359 atttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 6997261  T
Q  151 tagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997260 tagcaataatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactataaca 6997214  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 82 - 199
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432637
Alignment:
Q  82 aaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattt 181  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattt 46432619  T
Q  182 tgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||    
T  46432620 tgagtcatactacaacac 46432637  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 16561288 - 16561131
Alignment:
Q  40 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatc 139  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16561288 ttttaaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaata 16561189  T
Q  140 ttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16561188 ttttatatttttagcaacaatattcttcat-ccaacaaattttgaatcatacaacaaca 16561131  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6996175 - 6996067
Alignment:
Q  51 atttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6996175 atttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttt 6996076  T
Q  151 tagcaacaa 159  Q
    |||||||||    
T  6996075 tagcaacaa 6996067  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Original strand, 11693593 - 11693666
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11693593 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 188
Target Start/End: Original strand, 13785675 - 13785835
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcag-----------------cacaaaatata 126  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||                 |||||||||||    
T  13785675 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagcaacaatattctagaaacacaaaatata 13785774  T
Q  127 tttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  13785775 tttgaaacaaatctttcatatttttagcgacaatattctccat-ccatcaatttttgagtca 13785835  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14352829 - 14352759
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca 114  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  14352829 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatattttca 14352759  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 32260882 - 32260746
Alignment:
Q  68 cttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca-----------------caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||                 |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32260882 cttcatacggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagcaacaatcttctgaaaacacaaaatatattttaaacaattcttttatatttt 32260783  T
Q  151 tagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  32260782 tagcaacaatcttcttcat-ccatcaaattttgagtca 32260746  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10115555 - 10115509
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10115555 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaat 10115509  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Original strand, 13112046 - 13112099
Alignment:
Q  77 gtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttg 130  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13112046 gtacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaatacatttg 13112099  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 85
Target Start/End: Original strand, 46432166 - 46432207
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaa 85  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46432166 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaa 46432207  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 10115640 - 10115572
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca 114  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10115640 aaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaa--atatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 44 - 75
Target Start/End: Original strand, 2510770 - 2510801
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatac 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510770 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatac 2510801  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 150
Target Start/End: Original strand, 16855265 - 16855296
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16855265 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttt 16855296  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 188
Target Start/End: Original strand, 11693686 - 11693753
Alignment:
Q  120 aaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtca 188  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  11693686 aaatatatttaaaacaaaatttttataattttagcaataatcttcttcatcc-atcaaattttgagtca 11693753  T

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Target: chr6 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 5275775 - 5275929
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5275775 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatctttt 5275874  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275875 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 5275929  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 2629326 - 2629479
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629326 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 2629425  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629426 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 2629479  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 30035043 - 30035196
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035043 aaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtctataaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 30035142  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035143 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 30035196  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 12195951 - 12196105
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12195951 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 12196050  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12196051 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaatttttgagtcatactacaacac 12196105  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 19705012 - 19705165
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19705012 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatctttt 19705111  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705112 atatttttagcaacaatattct-tcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 19705165  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18317904 - 18317751
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317904 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 18317805  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  18317804 atatttttagcaacaatattct-tcttccttcaaattttgagtcatactacaaca 18317751  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 26933005 - 26933158
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26933005 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataataatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatctttt 26933104  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26933105 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaatttttgagtcatactacaaca 26933158  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30967076 - 30966923
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30967076 aaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatctttt 30966977  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30966976 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaatttggagtcatactacaaca 30966923  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 22858383 - 22858537
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22858383 aaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaagtatatttaaaacaaatctttt 22858482  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    |||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858483 atatttttattaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaacac 22858537  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20526694 - 20526548
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20526694 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgtac-----ataaatatattttcagcataaaatatatttgaaacaaatctttt 20526600  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaa 196  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20526599 atatttttagcaacaatattct-tcacccatcaaattttgagtcatactacaa 20526548  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17852419 - 17852275
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17852419 aaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcataaa--atatttgaaacaaatctttt 17852322  T
Q  144 atatttttagca--acaatattctctatcccatcaaattttgagtcata 190  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  17852321 atatttttagcaacacaatattctccat--catcaaattttgagtcata 17852275  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17011929 - 17011781
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  17011929 aaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttctacacaaa--atatttaaaacaaa-ctttt 17011833  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaa 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||    
T  17011832 atatttttagcaataatattcttcat-ccatcaaattttaagtcatactacaa 17011781  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30445395 - 30445253
Alignment:
Q  40 ttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttc-----------------agcacaaaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||                 |||||||||    
T  30445395 ttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagcaacaatattctggaagcacaaaa 30445296  T
Q  123 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 165  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  30445295 tatatttgaaacaaatattttatatttctagcaacaatattct 30445253  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30443097 - 30443046
Alignment:
Q  114 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattct 165  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30443097 agcaaaaaatatatttgaaacaaatctcttatatttttaacaacaatattct 30443046  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 44 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 30443182 - 30443111
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  30443182 aaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatatt--ttgtccataaatatattttcagca 30443111  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3833220 - 3833176
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatatt 163  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  3833220 aaaatatatttaaaacaaatattttatgtttttagcaataatatt 3833176  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12061
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11908 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatttttt 12007  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  12008 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgaatcatactacaaca 12061  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51862 - 51709
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51862 aaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatctttt 51763  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51762 atatttttagcaacattattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 51709  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50159
Alignment:
Q  126 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50230 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 50159  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 170118 - 170076
Alignment:
Q  75 cggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagca 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  170118 cggtacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 44 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1888 - 1735
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1888 aaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 1789  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  1788 atatttttagcaacaatattct-tcttccttcaaattttgagtcatactacaaca 1735  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 79036 - 78882
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatctttt 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  79036 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttattatccataaatatatttttagcagaaaatatatttgagacaaatctttt 78937  T
Q  144 atatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaacac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78936 atatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttaagtcatactacaacac 78882  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 197
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2184
Alignment:
Q  82 aaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattt 181  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattt 2168  T
Q  182 tgagtcatactacaac 197  Q
    ||||||||||||||||    
T  2169 tgagtcatactacaac 2184  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4546
Alignment:
Q  49 atatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 148  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  149 tttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4594 tttagcaacaatattcttcat-ccatcaaattttgagttatactgcaaca 4546  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 198
Target Start/End: Original strand, 1 - 95
Alignment:
Q  103 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctctatcccatcaaattttgagtcatactacaaca 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccat-ccatcaaattttgagtcatactacaaca 95  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 114
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  44 aaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatattttca 114  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaatt-ttcttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 160
Target Start/End: Original strand, 2232 - 2273
Alignment:
Q  119 aaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaat 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2232 aaaatatatttgaaacaaatcttttatattttctgcaacaat 2273  T

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