View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF9931_1 (Length: 695)

Name: NF9931_1
Description: NF9931
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF9931_1
NF9931_1
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (27-620)||(18115594-18116178)
chr3 (60-620)||(19461161-19461712)
chr3 (27-677)||(19413759-19414397)
chr3 (30-620)||(19333638-19334219)
chr3 (27-678)||(19350965-19351606)
chr3 (27-620)||(19399337-19399921)
chr3 (27-676)||(18164720-18165369)
chr3 (27-469)||(17941725-17942167)
chr3 (214-678)||(18143804-18144255)
chr3 (27-616)||(18146454-18147043)
chr3 (27-620)||(17949447-17950045)
chr3 (26-620)||(19380522-19381107)
chr3 (30-678)||(14896180-14896834)
chr3 (27-620)||(19392769-19393362)
chr3 (27-612)||(18108067-18108652)
chr3 (160-620)||(17727601-17728060)
chr3 (160-620)||(19028830-19029289)
chr3 (54-623)||(16676836-16677405)
chr3 (244-620)||(18015723-18016090)
chr3 (27-620)||(25462670-25463263)
chr3 (233-678)||(18102998-18103425)
chr3 (262-620)||(19375314-19375672)
chr3 (220-539)||(19436731-19437050)
chr3 (27-270)||(17727324-17727567)
chr3 (295-678)||(18022364-18022747)
chr3 (27-270)||(19028553-19028796)
chr3 (217-620)||(19424236-19424639)
chr3 (379-677)||(19436437-19436729)
chr3 (260-620)||(17941367-17941715)
chr3 (27-201)||(18103385-18103559)
chr3 (27-225)||(19464371-19464569)
chr3 (333-678)||(24493511-24493862)
chr3 (27-193)||(18016069-18016235)
chr3 (27-164)||(19375698-19375835)
chr3 (27-201)||(19436997-19437171)
chr3 (56-173)||(18144258-18144374)
chr3 (542-678)||(19419551-19419684)
chr3 (27-164)||(19424763-19424900)
chr3 (639-678)||(19333553-19333592)
chr3 (635-678)||(19392693-19392736)
chr3 (160-199)||(19424585-19424624)
chr3 (639-678)||(19461088-19461127)
chr3 (639-678)||(25462606-25462645)
chr3 (638-676)||(16676771-16676809)
chr3 (260-293)||(19407112-19407145)
[»] scaffold0640 (2 HSPs)
scaffold0640 (30-620)||(5023-5613)
scaffold0640 (642-678)||(4956-4992)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (32-617)||(2710368-2710953)
chr4 (233-677)||(15531923-15532358)
chr4 (27-164)||(15535609-15535746)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (233-678)||(8459041-8459483)
chr8 (38-164)||(8459624-8459750)
chr8 (160-201)||(8459443-8459484)
[»] scaffold0648 (1 HSPs)
scaffold0648 (30-400)||(3893-4263)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (30-400)||(3363-3733)
[»] scaffold2156 (2 HSPs)
scaffold2156 (313-620)||(1-307)
scaffold2156 (639-678)||(335-374)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (273-678)||(13666911-13667318)
chr6 (55-196)||(13666765-13666906)
chr6 (507-613)||(2509634-2509746)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (367-620)||(16436016-16436269)
chr2 (528-619)||(16436704-16436795)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 334; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 27 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 18116178 - 18115594
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18116178 aaaatctgaattacgcaagtctagatgatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataag 18116079  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     |||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  18116078 taatttagggaagagagatttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaagttgttgaatatgggcaagttggcctattt 18115979  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    ||||| |||||| | | ||||||| |||||   |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18115978 cttctggaattgattcttgtagttggttataggagagataaaggtctctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatattact 18115879  T
Q  327 cagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaatt 426  Q
    | ||| |||||||||| | |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  18115878 ctgtgaaaggtcaagataagtgagatctttggtaagattaaaaaacccatcaggtaaatgagaggtgaagttgtttaaagaaagatcaagagttacaagt 18115779  T
Q  427 gaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcacta 526  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||         |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18115778 aaagacaaattcaaatactcaacagatgg---------gaagttgttcaggttacaatgactcaactgtaattctaatagtgaaggaagtgtattcacta 18115688  T
Q  527 tttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  18115687 tttgaagccaattggtttccttatgaagatgaattccactaaggtcgagatatttcaaggaagaatgtggagaaagccaaccaagattatccat 18115594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 60 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19461712 - 19461161
Alignment:
Q  60 actagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  19461712 actagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataagtaatttagggaagagaggtttcctagagttgaa 19461613  T
Q  160 ggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttcttctagaattggtccctgtagtttgttattat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| || | | ||||||| ||||| |     
T  19461612 ggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaagttgttgaatatgggcaagttggcctatttcttttggaactgattcttgtagttggttataag 19461513  T
Q  260 agagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggt 359  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||| |||    
T  19461512 agagataaaggtctctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccgtatatattactctgtgaaaggtcaagataagtgagatctttggt 19461413  T
Q  360 gagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactg 459  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||        
T  19461412 gagattaaaaaacccatcaggtaaatgagaggtgaaattgtttaaagaaagatcaagagttacaagtaaagacaaattcaaatactcaacagatgg---- 19461317  T
Q  460 atcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaa 559  Q
         ||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19461316 -----gaaattgttcaggttacaatgactcaactgtaattctaatagtgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagatgaa 19461222  T
Q  560 ttccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19461221 ttccactaaggtcgagatatttcaaggaagaatgtggagaaagccaaccaagattatccat 19461161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 27 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19414397 - 19413759
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19414397 aaaacttgaattactcaagtctagatgatttaaactagagagtttggaaaaatataaatttaaaatattaccagagaaattattcgaaccaatagataag 19414298  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     |||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || || |||||||     
T  19414297 taatttaaggatgggagatttcctagagttgaaagaatgaatccttgtagttggttttcagagagatcgaggtgttgaatatgtgctaatttgcctattc 19414198  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    | ||| ||| ||  || ||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  19414197 catctggaactgacccttgtagttggttatttgatagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatgtatattgct 19414098  T
Q  327 cagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaatt 426  Q
       || |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19414097 atatgaaaggtcaagagaggtgagatctttggtgagattaaaaaacccatcaggtatatgagaggtgaagttgttgtaagaaagatcaagagttacaatt 19413998  T
Q  427 gaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcacta 526  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||         |||||| || |||||||| | ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  19413997 gaagacaaattcaaatgctcaacagatgg---------gaagttatttaggttacaatgactcatctgtaattctaatagtgaaggaagtgtattcacta 19413907  T
Q  527 tttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatactagg 626  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| ||||||||   |  |||     
T  19413906 tttgaggccaattggtttccttatgaagatcaatccaactaagggtgagatatttcaacgaagaaagtggataaagccaatgaagattat---tgatagt 19413810  T
Q  627 aactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgat 677  Q
      ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19413809 gtctaagctgtaggataagtcaaggtaaacaagtttagatgaatgtgtgat 19413759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 30 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19334219 - 19333638
Alignment:
Q  30 atttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaa 129  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||| ||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  19334219 atttgaataactcatgtctagcaaacctaaagtatagagtttggaaaaagttaattttgaaatttcaccagagaaattattagagccaataaataagtaa 19334120  T
Q  130 tttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttctt 229  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19334119 tttaaggaagagaggtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaagttgttgaatatgggaaagttggcctatttctt 19334020  T
Q  230 ctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcag 329  Q
    || ||| || ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||      
T  19334019 ctggaactgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatattgttcca 19333920  T
Q  330 tgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaa 429  Q
     | |||||| ||| |  ||| ||||| ||  ||||| |||||||||||| ||| || |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19333919 agaaaggtcgagatacttgagatctttggaaagattaaaaaacccatcaagtaaatgagaggtaaagttgtttctagaaagatcaagagttacaattgaa 19333820  T
Q  430 gacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactattt 529  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||         |||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  19333819 gacaaattcaaatactcatcaaatgg---------gaagttgttcaatttacaatcactcaactgtaattctaatagtgaaggaagtgaattcactattt 19333729  T
Q  530 gaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  19333728 gaaacaaattggtttccttaggaagatcaatgttactaaggttgagatattttaaggaagaaagtgaagaaagccaatgaagactatccat 19333638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 27 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 19351606 - 19350965
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatt-tgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||  || ||||| |||||| ||||| |||||    
T  19351606 aaaatttgaattactcaagtctagccattctaaactagagagtttggaaaaaa--aaattgtgaaatttcaccagtgaaatgattagagccaatcgataa 19351509  T
Q  126 ggaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatt 225  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||    
T  19351508 ggaaattaaggatgagaggtttcctagagttgaaggaatgaaaccacttaacatgttccatgaaagatcaaggtattgaatatttggtagttggcttatt 19351409  T
Q  226 tcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattac 325  Q
     | ||| |||||| ||| ||||||| |||||  | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19351408 ccatctggaattgatccttgtagttggttatatttgagatcaaggtgtctcagtttttgaaggtttagtaagcttgaaggtatcttaccatatatattac 19351309  T
Q  326 tcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaat 425  Q
    |  ||| ||||| |||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || | || |||| || |||| | ||||||||||||||||||     
T  19351308 tttgtgaaaggtgaagataagtgagatctttggtgagattaaaaaacccatctggtaaattaaagttgaagttatttcgaaaaagatcaagagttacaag 19351209  T
Q  426 tgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcact 525  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||         |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  19351208 tgaagacaaattcaaatactcaacagatgg---------gaagttgttcaggttacattcacccaactgtaattttaacagtgaaggaagtgaattcact 19351118  T
Q  526 atttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatactag 625  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |     
T  19351117 atttgaagccaattggtttccttatgaagatcaattccaccgaggttgagatattttatggaagaaagtggagaaagccaatcaagattattcatatcat 19351018  T
Q  626 gaactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19351017 taactaagctgtaggataagtcaaggtagacaagtttagaggaatgtgtgatg 19350965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 27 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19399921 - 19399337
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19399921 aaaatttgaattactcaagtctagtgaatctaaactagagagtttggaaaaaagtaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataag 19399822  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||   ||    |||   ||  ||| |||| | || |||||| | |||||| |||||||    
T  19399821 taatttaaggaagagaggtttcctagagttgaaggaatgaaaccacttaacatgttccaagcaagaccaagatattcaatatgtgctagttgacctattt 19399722  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  19399721 catcttgaattggtccctgtagtttgttatcaacgagatcaaggtgtttcaaattttgaagggttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatatt-gt 19399623  T
Q  327 cagtg-caaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaat 425  Q
     | || |||||| |||| | |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    |||||||||||||||||||     
T  19399622 tattgtcaaggtaaagacaggtgagatctttggtgaaattaaaaaacccatcaggtatatgaaaggtgaagttgttgtttgaaagatcaagagttacaag 19399523  T
Q  426 tgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcact 525  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||         |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||    
T  19399522 tgaagacaaattcaaatactcaagagatgga---------aagttgttcaggttacatgcactcaactgtaattcaaacaatgacggaagtgtacttact 19399432  T
Q  526 atttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19399431 acttgaaaccagttggtttccttatgaagatcaatccaattaaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaagccaatcaagattatccat 19399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 27 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 18165369 - 18164720
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18165369 aaaatttgaattactcaagtctagtgaatctaaattggagagtttggcaaaatgtaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataag 18165270  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
      |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||   ||    |||  | || |||||||||  || |||||   ||||||||||||||     
T  18165269 tcatttaaggatgagaggtttcctagagtcgaagggataaaaccgcttaacatgttccctgaaagatcaaggcctttaatatttattagttggcctattc 18165170  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    | ||| |||||| ||| | || || | | |||   ||   ||||| |  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  18165169 catctggaattgatccttttaattgggttttagctagcaaaaggtattgcaaattttgaagttttagcaagcttgaaggtatctcaccatttatattgtt 18165070  T
Q  327 cagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaatt 426  Q
    |  || ||||  |||| |  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  | ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  18165069 ccctgaaaggctaagaaagttgatatctttggtgagattaaaaaatccatcaagtaagtgagaggtgaaatagttgtaagaaagatcaagagttacaatt 18164970  T
Q  427 gaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcacta 526  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  |  || ||||||||||||||||| || | ||  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||     
T  18164969 gaagacaaattcacatacttaaaagatgttccaattatgaagttgttcaggttgcaattactcaactgtaattctaatagtgaaggaagtgtactcactg 18164870  T
Q  527 tttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatactagg 626  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  18164869 cttgaatccaattggtttccttatgaagatcaataaaactaaggttgagatatttcaaggaagaaagtggagaaagccaatcaagattatccatactagt 18164770  T
Q  627 aactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtga 676  Q
    || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164769 aattaagctgttggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtga 18164720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 27 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17942167 - 17941725
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||     
T  17942167 aaaacttgaattactcaagtctagtgagtctaaactagagagtttgaaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagaaccaataaataac 17942068  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||||||||||     
T  17942067 caatttaatgatgagaggtttcctagagtcgtgggaattgatccttgtagttcgttttcagagagatcgaggtattgaatatttggtagttggcctattc 17941968  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    | | | ||||| |||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  17941967 catttggaattagtccttgtagttggttataagagagataaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatgtatattgct 17941868  T
Q  327 c-agtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaat 425  Q
    |  ||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  17941867 ctcgtg-aaggtcaagataagtgagatctttggtgagattaaaaaacccatcaggtatatgagaggtgaaattgtttccagaaagagaaagagttacaag 17941769  T
Q  426 tgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagt 469  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  17941768 tgaagacaaattcaaatactcaatagatgagctgatcatgaagt 17941725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 214 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18144255 - 18143804
Alignment:
Q  214 agttggcctatttcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcac 313  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||  | ||||| | |||||| ||||| |||| | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  18144255 agttggcctatttcttctggaactgatccttgtaactggttatgaaagagatcaaggtatctcgatttctgaaggtttagcaagcttgaaggtaagtcac 18144156  T
Q  314 catatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatc 413  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||        |||      |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||||||    
T  18144155 catatatattactctatgaaaggtcaa--------ataa-----gtgagattaaaaaacctatcaggtaaatgagaggtgaagttgtttaaagaaagatc 18144069  T
Q  414 aagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaagga 513  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||| | |||||||    
T  18144068 aagagttacaattgacgacaaattcaaatacttgatatatgggttgatcattaagttgttcaggttacaagaactcaactgtaattctaatagtgaagga 18143969  T
Q  514 agtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagat 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18143968 agtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagatcaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaagccaatcaagat 18143869  T
Q  614 tatccatactaggaactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18143868 tatccataccagtaacaaagctgtaggataagtcaaggtagacaagtttagaggaatgtgtgatg 18143804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 27 - 616
Target Start/End: Complemental strand, 18147043 - 18146454
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||    
T  18147043 aaaacttgaattactcatgtctagtgaatctaaactagagaggttggaaaaagttaattttgaaattgcaccagagaaattattagagccaatccataag 18146944  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||     
T  18146943 taatttaaggatgagaggtttcctagagttgaaggaatgaaaccacttaacatgttccatgaaagatcaaggtattgaatatgtgcaagttggcctattc 18146844  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    | | | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18146843 catttggaattgatccgtgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatattgct 18146744  T
Q  327 cagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaatt 426  Q
    |    |||||  |||| |  ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| || |    
T  18146743 ctcctcaaggctaagatagttgatatctttggtaagattaaaatacccatcaggtaaatgagaggttaaattatttcctgaaagatcaagagttataagt 18146644  T
Q  427 gaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcacta 526  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   | || |||||||||||||||||||| | |   |||| ||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||    
T  18146643 gaagacaaattcaaatacccaatagatgtgttaattatgaagttgttcaggttacaattaaacaactttaattttaatagtgaaggaagtgaatttacta 18146544  T
Q  527 tttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattat 616  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||  |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18146543 cttgaaaccagttggtttccttgtgaagatcaatctcactaagggagagatatttcaaggaagaaagtggagaaagccaatgaagattat 18146454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 27 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 17950045 - 17949447
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17950045 aaaatttgaattactcaagtctagttcatctaaactaaataatttggaaaaatgtaaatttgaaattttaccagagaaattattagagccaatagataag 17949946  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaat-agatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatt 225  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |     |  || ||  | || | |||||||| || || ||  | ||||||||| |||    
T  17949945 taatataaggatgagaggtttcctagagttgaaggaatgagaccaccaaacatg-ttcgcggaaatatcaaggtattcaaaatttggtagttggccaatt 17949847  T
Q  226 tcttctagaattggtccctgtagtt----tgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatata 321  Q
       |||| ||||| ||| |||||||    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17949846 ctatctataattgatccttgtagttaatttgttatttgagagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatata 17949747  T
Q  322 ttactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagtta 421  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||    
T  17949746 ttatttagtgcaaggtcaagagaggtgatatctttggtgagattgaaaaacccatttggtaaatgggaggtgaagttgttttcatcaagataaagagtta 17949647  T
Q  422 caattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtatt 521  Q
    ||| |||||| |||||||||||| | ||||| |  |  |||| |||||| ||||||||||| | |   |||| ||||||||| | ||||| ||||| |||    
T  17949646 caagtgaagataaattcaaatacctgatagacgttccaatcaagaagttattcaggttacagtgaaacaactttaattctaatagtgaagaaagtgaatt 17949547  T
Q  522 cactatttgaagccaattggtttcctta-tgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17949546 cactacttgaaaccaattattttccttattgaagatcaattccaccgaggttgagataatttaaggaagaaagtggagaaagccaatgaagattatccat 17949447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19381107 - 19380522
Alignment:
Q  26 aaaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19381107 aaaaatttgaattactcaagtctagcgaatctaaactagagagtttggaaaaagttaatttagaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataa 19381008  T
Q  126 ggaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatt 225  Q
      ||| ||||||||||| ||||||||||||| | || ||  | ||   ||    |||   ||  ||||| || | || |||||| | |||||||||||||    
T  19381007 caaatataaggatgagaggtttcctagagttaatggtatgaaaccacttaacatgttcctagcaagatccagatattcaatatgtgctagttggcctatt 19380908  T
Q  226 tcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattac 325  Q
    || ||| ||||| ||||||||| ||||||| || | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  19380907 tcatctggaattagtccctgtaatttgttactagaaagatcaaggagtttcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggcatctcaccatatatattgc 19380808  T
Q  326 tcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaat 425  Q
    |     |||    ||||||  |||||||||  |||||||| || |||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||     
T  19380807 taccctcaaatctaagagagttgatatctttcgtgagattaaacaacccatctggtaagtgagaggtgaagttgtttccagaaagatggagagttacaag 19380708  T
Q  426 tgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcact 525  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||         |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19380707 tgaagacaaattcaaatactcaacagatgg---------gaagttgttcaggttacaatgactcaactgtaattctaatagtgaaggaagtgtattcact 19380617  T
Q  526 atttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    | ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19380616 acttgaaaccaattattttccttatgaagataaattccatcgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaagccaatcaagattatccat 19380522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 30 - 678
Target Start/End: Original strand, 14896180 - 14896834
Alignment:
Q  30 atttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||   || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14896180 atttgaattactcatgtctagtgaaactaaactagagtgtttggaaaaagttaaatttgaaatttcagcagagaaattattagagccaatggataaggaa 14896279  T
Q  130 tttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttctt 229  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||   |    
T  14896280 attaaggatgagaggtttcctagagttgaaggaatgaaaccgcttaacatgttcattgaaagatcaaggtgttgaatatttggtagttgccctattctat 14896379  T
Q  230 ctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcag 329  Q
    || |||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||       
T  14896380 ctggaattgatccttgtaggttgtttttagagagatcaaggtgtcttaaaatttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatgtatattgctttc 14896479  T
Q  330 tgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaa 429  Q
       ||||| |||| | |||| || ||  |||||||| ||||||||||  || | || ||||||||| ||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  14896480 atgaaggtaaagataggtgagattttttgtgagattaaaaaacccatttggcaaatgagaggtgaagttgtttaaagaaagattaagaattacaattgaa 14896579  T
Q  430 gacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactattt 529  Q
    |||||||||||||||| || |||||   ||| ||||||||||||||| || || |||   || |||| |||||| | ||| ||||||||| |||||| ||    
T  14896580 gacaaattcaaatactcaaaagatgagttgaacatgaagttgttcagtttgcaatcagtcaattgtagttctaatagtgagggaagtgtactcactactt 14896679  T
Q  530 gaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat------act 623  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||      | |    
T  14896680 gaagccaattggattccttgtgaagatcaattccactaaggatgagatatttcaaggaagaatgtggagaaagccaatcaagattatccatgtgcagatt 14896779  T
Q  624 aggaactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    |||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  14896780 aggaccttcgttgaaggataagtcaaggtagaaaaggctagatgaatgtgtgatg 14896834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 27 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19393362 - 19392769
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||| ||||||||||||||| ||   || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||   | ||||||||||    
T  19393362 aaaaattgaattactcaagtttagtgaaactaaactatggagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcaccagagaaattgttatcgctaatagataag 19393263  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatcct-tgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatt 225  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||  |  |  || ||||| || | |||||||| ||||| |||    ||||||||||||    
T  19393262 taatttaaggatgagaggtttcctaaagttgaaggaataaaaccactcaacatgtttttc-gaaacatcaaggtattgaagatgttcaagttggcctatt 19393164  T
Q  226 tcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattac 325  Q
     | ||| |||||| ||| |||||||  || | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  19393163 ccatcttgaattgatccttgtagttgattttcaaagagattaaggtatctcaaattttgaaggtttagcaaacttgaaggtatctcaccatatatgttgc 19393064  T
Q  326 tcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaat 425  Q
    ||     ||||| |||  | |||  || |  |||  |||| |||||||||| ||||||||  |||||||| |||||   ||||||||||||||||||||     
T  19393063 tctccttaaggtgaaggtaggtggcatatgtggtacgattaaaaaacccattaggtatattggaggtgaagttgttgtaagaaagatcaagagttacaag 19392964  T
Q  426 tgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcact 525  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  19392963 tgaagacaaattcaaatactcaaaagatggcttgatcttgaagttttcgaggttacattcacttaattgtaattctaacagtgaagaaagtatactcact 19392864  T
Q  526 atttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19392863 gcttgaagccaattggtttccttatgaagatcaattccacttaggaagagatatttcaatgaagaaagtggagaaagccaatcaagactatccat 19392769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 27 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 18108652 - 18108067
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18108652 aaaatttgaattactcaagtctagtgaaaataaagtagagagattggaaaaatgtaaatttgaaatttcgccagagaaattattagagccaataaataag 18108553  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaat-agatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatt 225  Q
       |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |  |  |  || ||  | || | |||||||| ||||| ||  | |||||||   |||    
T  18108552 tgctttaaggaagagaggtttcctacagttgaaggaatgagaccactaaacatg-ttcgcggatatatcaaggtattgaaaatttggtagttgggaaatt 18108454  T
Q  226 tcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattac 325  Q
       |||| ||||| ||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18108453 ctatctataattgatccttgtagttggttatttgagagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatattat 18108354  T
Q  326 tcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaat 425  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||| |||||| ||  ||||| |||||||||||     
T  18108353 tcagcgcaaggtcaagagaggtgatatcattggtgagattgaaaaacccatttggtaaatgggaggtgaagttgttttcatcaagattaagagttacaag 18108254  T
Q  426 tgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcact 525  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||||  |  |||| |||||| || |||||| | |||   |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  18108253 tgaagacaaattcaaatatctgatagatgttccaatcaagaagttattaaggttatagtcaaacaactgtaattctaatagtgaagaaagtgaattcact 18108154  T
Q  526 atttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaaga 612  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  18108153 acttgaaaccagttggtttccttatgaagatcaactccaccaaggctgagatatttcaaggaagaatgtgaagaaagccaatgaaga 18108067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 160 - 620
Target Start/End: Original strand, 17727601 - 17728060
Alignment:
Q  160 ggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttcttctagaattggtccctgtagtttgttattat 259  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||| || | | ||| ||  || ||||||| ||| | |     
T  17727601 ggaattgatcctcgtagttggttttcagagagatcgaggtgttgaatatgtactagtctgcctatatcatatggaactgacccttgtagttggttttcag 17727700  T
Q  260 agagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactca-gtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcgg 358  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||| | | |||| ||||| ||    
T  17727701 agagaccaaggtgtgttaaattttgaaggtttaccaagctagaaggtatctcaccatgtatattgctctcgtg-aaggtcaacataggtgagatctttgg 17727799  T
Q  359 tgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggact 458  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| |  | ||||||||||| |||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17727800 tgagattaaaaaatccaccaggaag-tgagaggtgaaatcgttgtttgaaagataaagagttacaattgaagacaaattcaaatactcaatagatggatt 17727898  T
Q  459 gatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataa 558  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  17727899 gatcaggaagttgtttaggttgcacccactcaactgtaattctaacagtgaaggaagtgtattcaatacttgaagccaatttgtttccttatgaagatca 17727998  T
Q  559 attccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  17727999 attccattgaggttgagatattgtaaggaagaaagtggagaaagccaatgaagactatccat 17728060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 160 - 620
Target Start/End: Original strand, 19028830 - 19029289
Alignment:
Q  160 ggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttcttctagaattggtccctgtagtttgttattat 259  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||| || | | ||| ||  || ||||||| ||| | |     
T  19028830 ggaattgatcctcgtagttggttttcagagagatcgaggtgttgaatatgtactagtctgcctatatcatatggaactgacccttgtagttggttttcag 19028929  T
Q  260 agagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactca-gtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcgg 358  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| |||||||| | | |||| ||||| ||    
T  19028930 agagaccaaggtgtgttaaattttgaaggtttaccaagctagaaggtatctcaccatgtatattgctctcgtg-aaggtcaacataggtgagatctttgg 19029028  T
Q  359 tgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggact 458  Q
    ||||||| ||||| ||| |||| |  | ||||||||||| |||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  19029029 tgagattaaaaaatccaccaggaag-tgagaggtgaaatcgttgtttgaaagataaagagttacaattgaagacaaattcaaatactcaatagatggatt 19029127  T
Q  459 gatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataa 558  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19029128 gatcaggaagttgtttaggttgcacccactcaactgtaattctaacagtgaaggaagtgtattcaatacttgaagccaatttgtttccttatgaagatca 19029227  T
Q  559 attccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  19029228 attccattgaggttgagatattgtaaggaagaaagtggagaaagccaatgaagactatccat 19029289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 54 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 16677405 - 16676836
Alignment:
Q  54 atctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaatttaaggatgagatgtttcctaga 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16677405 atctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaacttcaccagagaaatcattattgccaatagataaggaatttaaagatgagaggtttcctaga 16677306  T
Q  154 gttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttcttctagaattggtccctgtagtttgt 253  Q
    |||||||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||| |   ||||||| ||    
T  16677305 gttgaaggaatgaaaccacttaacatgttcatggaaagatcaaggtcttgaatatgtgctagttgacctatttcatctggaattgatagttgtagttggt 16677206  T
Q  254 tattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatc 353  Q
    | | | ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||  || ||||||||||    |||||||    
T  16677205 tttgagagacatcaaggtgtctcaaatgttgaaggtttaacaagcttgaaggtatctcaccatgtatattattccatgaaaggtcaagatgcttgatatc 16677106  T
Q  354 ttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagat 453  Q
    || ||||||||| |||||||| |   |||  | | |||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||    
T  16677105 tttggtgagatttaaaaacccgtttagtaactgaaaggttaaattgttgtaagaaagatcaagagttacaattgaagaggaattcaaatacccaatagat 16677006  T
Q  454 ggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaa 553  Q
    |   ||| ||||||||||||||  |||||   ||  ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  16677005 gagttgagcatgaagttgttcaatttacaagaactcaaccgcaattctaatagtgaaggaagtgtattcactttctgaatccaattggtttccttatgaa 16676906  T
Q  554 gataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatact 623  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| || ||||||||||||  | ||| ||||| |||||||||||||||    
T  16676905 gatcaagtccactaaggtcgagatacttcaaggaagaaagtataaaaagccaatgaagattatccatact 16676836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 244 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 18016090 - 18015723
Alignment:
Q  244 tgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgcaaggtcaagag 343  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   || |||||||||||    
T  18016090 tgtagttggttattagagagatgaagttgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatgtatattgctatatgaaaggtcaagag 18015991  T
Q  344 atgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaata 443  Q
    | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18015990 aggtgagatctttggtgagattaaaaaacccatcaggtatatgagaggtgaagttgttgaaagaaagagaaagagttacaagtgaaggcaaattcaaata 18015891  T
Q  444 cttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtt 543  Q
    || || ||||||         ||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18015890 ctcaacagatgg---------gaagttgttcaggttgcacccactcaactctaattctaatagtgaaggaagtgaattcactatttgaagccaattggtt 18015800  T
Q  544 tccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| || || ||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  18015799 tccttatgaagatcaatccaactaaggttgagatatttcaacgacgaatgtggtgaaagccaatccagattatccat 18015723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 27 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 25463263 - 25462670
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||| |   |||||| |||||||| || |||||||||    
T  25463263 aaaagttgaattactcaagtctagtgaatctaaactaaagagtttggagaaagttaattttgaaattgccccagagaagttattagagccgatagataag 25463164  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||| ||  | ||   ||    |||    || |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||     
T  25463163 gaagttaaggatgagaggtttcctatagttaaagggattaaaccaattaacatgttaatggaaagatcaaggtattgaatatttggtagttggcctattc 25463064  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattact 326  Q
    | ||| ||||||||||||||| || ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |    
T  25463063 catctggaattggtccctgtaattggttatgagatagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatgtcaccatgtacattatt 25462964  T
Q  327 cagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaatt 426  Q
     | || |||||||||| |  ||| |||||  | |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||   ||||||||||||||||| ||      
T  25462963 aaatgaaaggtcaagatacatgaaatcttttgagagattaaaaaaaccatcaggtaaatgagaggtgaagttgttgtaagaaagatcaagagttaaaagc 25462864  T
Q  427 gaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcacta 526  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||   || |||||||||||||||  | |||  |  | || || || || || | ||||| ||| |||  ||||     
T  25462863 gaagacaaattcaaatacccaatagatgatttggtcatgaagttgttcaaatcacaagcttgcaagtgcaactcgaatagtgaagaaagagtagacactg 25462764  T
Q  527 tttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25462763 cttgaagccaattagtttccttatgaagatcaattgcattgaggttgagatattttaaggaagataatggagaaagccaatgaagattatccat 25462670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 233 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18103425 - 18102998
Alignment:
Q  233 gaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |  ||    
T  18103425 gaattgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatattgtt-atcgc 18103327  T
Q  333 -aaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaaga 431  Q
     ||||| |||| |            ||||||||| |||||||||||| ||| || | | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |    
T  18103326 gaaggtgaagata------------ggtgagattaaaaaacccatcatgtaaatgaaaagtgaaattgttttctgaaagatcaagggttacaattgaata 18103239  T
Q  432 caaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttga 531  Q
    |||||||||||||| ||  |||||         |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  18103238 caaattcaaatactcaactgatgg---------gaagttgttcaggttacaataactcaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtacttactacttga 18103148  T
Q  532 agccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat------actag 625  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||      | |||    
T  18103147 aaccagttggtttccttatgaagatcaatccaactaaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaagccagtgaagactatccatgtgcagaatag 18103048  T
Q  626 gaactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18103047 ga---tagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 18102998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 262 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19375672 - 19375314
Alignment:
Q  262 agattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtga 361  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  19375672 agatcaagttgtctcaaatttggaaggtttagcaagcttgaaggtatctcaccatatatattattcatcgcaaggtcaagataggtgatatctttggtga 19375573  T
Q  362 gattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgat 461  Q
    |||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||         
T  19375572 gattaaaaaacccatcaggtaaatgaaaggtgaaattgtttgaagaaagatcaagacttacaattgaagacaaattcaaaaactcaacagatgga----- 19375478  T
Q  462 catgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagat----- 556  Q
        |||||||||||||||||   ||  |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| || || |||||||||| ||||||||||||         
T  19375477 ----aagttgttcaggttacaccgactcaactgtaattctaatagtgaaggaagtgaagtcactacttcaaaccaattggttaccttatgaagatcaact 19375382  T
Q  557 ----aaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
        | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||    
T  19375381 ccaaagactccaccgaggttgagatatttcaaggaagaaagtgaagaaagccattgaagattatccat 19375314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 8e-66
Query Start/End: Original strand, 220 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19437050 - 19436731
Alignment:
Q  220 cctatttcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatata 319  Q
    |||||| | ||| |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |    
T  19437050 cctattccatctggaattgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctccccatgaa 19436951  T
Q  320 tattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagt 419  Q
    ||||  | |  | ||||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  19436950 tattgttaaacgaaaggtaaagagaggtgagatctttggtgagattaaaaaacccatccggtaagtgagaggtgaaatcgttatctgaaagataaagagt 19436851  T
Q  420 tacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgta 519  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||  |||  |||| ||||||||| | ||||||||||| |    
T  19436850 tacaagtgaagacaaatttaaatactgaatagatggattaatcacgaagttgttcaggctgcacccactcaactttaattctaatagtgaaggaagtgaa 19436751  T
Q  520 ttcactatttgaagccaatt 539  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19436750 ttcactatttgaagccaatt 19436731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 17727324 - 17727567
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17727324 aaaatttgaattactcaattgtagtgaatctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagaaccaatagataag 17727423  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||      
T  17727424 aaaattaaagatgagaggtttcctagagttgaaggaattgatccttgtagttggtttttagagagatcgaggtcttgaatatgtgcaagttggcctatcc 17727523  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaagg 270  Q
    | | | ||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||    
T  17727524 catatggaattggtccctgtaattggttatgagagagatcaagg 17727567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 295 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 18022747 - 18022364
Alignment:
Q  295 aagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtga 394  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||  |   ||| ||||| |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||    
T  18022747 aagcttgaaggtatctcaccatgtatattgctctctaagaggacaagatagttgatatctttggtgagattaaaaaacccatttggtaaatgagaggtga 18022648  T
Q  395 aattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactg 494  Q
    | |||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||  ||||| || |  |||||    
T  18022647 agttgttgaaagaaagatcaagagttacaagtgaagacaaattcaaatactcaatagatgggttgatcatgaagctattcaatttacaatcgctcaactg 18022548  T
Q  495 taattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagt 594  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18022547 taattgtaatagtgaaggaagtgaattgattacttgaaaccagttggtttccttatgaagatcaagtccactgaggtcgagatatttcaaggaagaaagt 18022448  T
Q  595 ggagaaatccaatcaagattatccatactaggaactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    | ||||| ||| ||||||||||| ||   | || |    ||  |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  18022447 gaagaaagccagtcaagattatctatgtgaagaccatcattaaaggataagtcaaggtagaaaaatttagatgagtgtgtgatg 18022364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 19028553 - 19028796
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19028553 aaaatttgaattactcaattgtagtgaatctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagaaccaatagataag 19028652  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctattt 226  Q
     || |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||      
T  19028653 aaaattaaagatgagaggtttcctagagttgaaggaattgatccttgtagttggtttttagagagatcgaggtcttgaatatgtgcaagttggcctatcc 19028752  T
Q  227 cttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaagg 270  Q
    | | | ||||||||||||||| || ||||| | |||||| ||||    
T  19028753 catatggaattggtccctgtaattggttatgagagagatcaagg 19028796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 217 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 19424639 - 19424236
Alignment:
Q  217 tggcctatttcttctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccat 316  Q
    ||||||||| | ||| |||||| ||| | ||||| ||| | | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19424639 tggcctattccatctggaattgatccttatagttggttttcagagagatcaaggtatgtcaaattttgaaggtttagcaagcttgaaggtatcccaccat 19424540  T
Q  317 atatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaag 416  Q
     |||||| ||| |   |||   |||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  19424539 gtatattgctctggtgaagtctaagataggtgagatctttggtgagattaaaaaacccatcaggtaaatgagaggcgaaattgttgaaagaaagatcaag 19424440  T
Q  417 agttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagt 516  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||  | || || |||| ||  ||||||| ||| | ||||||||||    
T  19424439 tgttacaattgaagacaaattcaaatactcaattgatgggttgatcatgaagttgtttggtttccaatcacttatttgtaattgtaatagtgaaggaagt 19424340  T
Q  517 gtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattat 616  Q
    ||| | |||  ||||| ||||||| |||| |||  ||||| ||||||||| ||||  ||||  |  || |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19424339 gtactgactccttgaatccaattgctttctttagaaagatcaattccactaaggtaaagattctccaacgaagaaagtgaagaaagccaatcaagattat 19424240  T
Q  617 ccat 620  Q
    ||||    
T  19424239 ccat 19424236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 379 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 19436729 - 19436437
Alignment:
Q  379 ggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggt 478  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||         ||| ||||||| ||    
T  19436729 ggtaaataagaggtgaatttgtttccagaaagatcaagagttacaagtgaagataaattgaaatactcaacagatgg---------gaatttgttcaagt 19436639  T
Q  479 tacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagata 578  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  19436638 tacattcacgcaactgtaattctaatagtgaagaaagtgaattcactgcttgaaaccagttggtttccttatgaagatcaatttcagtaaggttgagata 19436539  T
Q  579 ttttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat------actaggaactaagttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgt 672  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||      | |||||    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19436538 ttttaaggaagaaagggaagaaagccaatcaagattattcatgtgcagaatagga---tagttgtacgataagtcaaggtagagaagtttagatgaatgt 19436442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 260 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 17941715 - 17941367
Alignment:
Q  260 agagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggt 359  Q
    |||||| ||||  |||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |||   |||||||| |||     ||||| |||| | |||| || || |||    
T  17941715 agagatcaaggcatctcaatttctgaaggtttagtaagcttgaaggtatatca---tatatattgctcccccgaaggtaaagataagtgagatttttggt 17941619  T
Q  360 gagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactg 459  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||        
T  17941618 gagattaaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttctagaaagagaaagagttacaagtgaagacaaattcaaatattcaacagatgg---- 17941523  T
Q  460 atcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaa 559  Q
         ||||||||||||||||||      |||  |||| ||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  17941522 -----gaagttgttcaggttacaactttttaatcgtaactctaatagtgaaggaagtgtattcactgcttgaagccaattagtttcctcatgaagatcaa 17941428  T
Q  560 ttccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    | ||||| |||  ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17941427 tgccactaaggcggagatatttcaaggtagaaaatggagaaagccaatgaagattatccat 17941367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 18103559 - 18103385
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18103559 aaaatttgagttactcaagtctagttcatctaaactacagagtttggaaaaatgcaaatttgaaattttaccagagaaattattagagccaataaataag 18103460  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgt 201  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  18103459 taatttaaggatgagaggtttcctagagttgagggaattgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgt 18103385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19464569 - 19464371
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||| ||||| || |||||||||    
T  19464569 aaaatttgaattactcaagtctaaataatgtaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcacctgagaaattgttagagccgatagataag 19464470  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatt 225  Q
      |||||| ||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||    
T  19464469 tcatttaaagatgagaggtttcctagtgtcgacggaattgatccttgtagctggttttccgagagatcaagctcttgaatatgtgctagttggcctatt 19464371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 333 - 678
Target Start/End: Original strand, 24493511 - 24493862
Alignment:
Q  333 aaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagac 432  Q
    |||| ||||| | |||||||||| |||||| || |||||  |||  ||||  | |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24493511 aaggccaagataggtgatatctttggtgaggttaaaaaatgcatttggtaactgagagctgaagttgttttcagaaagatcaagagttacaagtgaagac 24493610  T
Q  433 aaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaa 532  Q
    |||||| |||||| || | |||   |||||||||||||||| |||||||| |||   |   |||||||||| | |||||||||||||  ||||  |||||    
T  24493611 aaattcgaatactcaaaaaatgagttgatcatgaagttgtttaggttacaatcaatcatacgtaattctaatagtgaaggaagtgtagccacttcttgaa 24493710  T
Q  533 gccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat---actaggaac 629  Q
    ||||||||||||||| | ||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||   |  || | |    
T  24493711 gccaattggtttcctcacgaagatcgattccactaaggttgagatatttcaacgaagaaagtggaggaagccaatgaagattatccatgtgaagagtacc 24493810  T
Q  630 taagtt---gtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
     ||| |   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493811 aaagctgaggggggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 24493862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18016235 - 18016069
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||   || | ||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  18016235 aaaatttgaattactcaagtctaaatgatttaaactagagagtttggaaaaaaaaaattgtgaaatttcaccagagaaattattagagccaatcgataag 18016136  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagat 193  Q
    ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18016135 gaaattaaggatgacaggtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttattagagagat 18016069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19375835 - 19375698
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||     
T  19375835 aaaatttgaattactcaagtctagtgaatctaaactagagagtttggaaaaagttaatttagaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataac 19375736  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaat 164  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19375735 aaatttaaggatgagaggtttcctagagttaaaggaat 19375698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 19437171 - 19436997
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19437171 aaaatttgaattgctcaagtcgagccaatctaaactagagagtttggaaaaagttaattttgaaatttcaccagagaaattattagaaccaatagatagg 19437072  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgt 201  Q
     || |||||||||||| ||||||||        ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19437071 taacttaaggatgagaggtttcctattccatctggaattgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgt 19436997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18144374 - 18144258
Alignment:
Q  56 ctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaatttaaggatgagatgtttcctagagt 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||| | ||||| ||||    
T  18144374 ctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcaccagagaaattgttagagccaatagataagtaaattaaggaagaga-ggttcctggagt 18144276  T
Q  156 tgaaggaatagatccttg 173  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18144275 tgaaggaatagatccttg 18144258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 8e-32
Query Start/End: Original strand, 542 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 19419684 - 19419551
Alignment:
Q  542 tttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatactaggaactaagttgtagga 641  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |  |||  |||||| ||||    
T  19419684 tttccttatgaagatcaattccaccgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaagccaatcaagattataca---tgtgaagaaagttgaagga 19419588  T
Q  642 taagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  19419587 taagtcaagtttcacaaggttagatgaatgtgtgatg 19419551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 19424900 - 19424763
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| |||||  |||||    
T  19424900 aaaagttgaattactcaagtctagttcttctaaactagagagtttggaaaaagttaattttgaaatttcacctgagaatttattagagccaatccataag 19424801  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaat 164  Q
      |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19424800 tgatttaatgatgagaggtttcctaaagttgaaggaat 19424763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 19333592 - 19333553
Alignment:
Q  639 ggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19333592 ggataagtcaaggtatacaagtttagatgaatgtgtgatg 19333553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 635 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 19392736 - 19392693
Alignment:
Q  635 tgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  19392736 tgtaggataagtcaaggtaggcaagtttagatgaatgcgtgatg 19392693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19424624 - 19424585
Alignment:
Q  160 ggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggt 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19424624 ggaattgatccttatagttggttttcagagagatcaaggt 19424585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 19461127 - 19461088
Alignment:
Q  639 ggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19461127 ggataagtcaaggtagaaaaggttagatgaatgtgtgatg 19461088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 25462645 - 25462606
Alignment:
Q  639 ggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25462645 ggataagtcaagatagtcaagtttagatgaatgtgtgatg 25462606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 638 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 16676809 - 16676771
Alignment:
Q  638 aggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtga 676  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16676809 aggataagtcaaggtagacaaggttagatgcatgtgtga 16676771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19407145 - 19407112
Alignment:
Q  260 agagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttag 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19407145 agagatcaaggtgtctcaaattttgaaggtttag 19407112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 30 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 5613 - 5023
Alignment:
Q  30 atttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaa 129  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5613 atttgaattactcaagtatagttcatctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccagtagataaggaa 5514  T
Q  130 tttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttctt 229  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||| | |    
T  5513 tgtaaggatgagaggtttcctagagttacaggaatgaaaccacctaacatgttgatggaaagatcaaggtgttgaatatttgctagttgacctattccat 5414  T
Q  230 ctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcag 329  Q
     |  || || ||| ||||||| ||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |  |    
T  5413 gtgaaactgatccttgtagttggttttcagagagatcaagatgtctcaaattttgaaggtttagcatgctagaaggtatctcgccatatatattattttg 5314  T
Q  330 tgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaa 429  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||  ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5313 cgcaaggtcaagagaggtgatatctttggttagattaaaaaacccatttggtaaattggaggtaaagttgtttccagaaagataaagagttacaagtgaa 5214  T
Q  430 gacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactattt 529  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||||| | ||  |  ||||||||||| | ||||||||| ||| | |||  ||    
T  5213 gacaaattgaaatactcaatagatggtttgatcatgaagttgtttagtttacagtaactcagttgtaattctaatagtgaaggaagggtacttactgctt 5114  T
Q  530 gaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  5113 gaagccagttggtttccttacgaagatcaatcccactaaggatgagatatttcaaggatgaaagtgaagaaagccaatgaagattatccat 5023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0640; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 642 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 4992 - 4956
Alignment:
Q  642 taagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4992 taagtcaaggtagacaagtttagatgaacgtgtgatg 4956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 617
Target Start/End: Original strand, 2710368 - 2710953
Alignment:
Q  32 ttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaatt 131  Q
    ||||| |||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||| |||||  ||||||  |||||| ||    
T  2710368 ttgaactactcacgtctagtgaatctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcaccagaaaaatgattagtgccaataagtaaggactt 2710467  T
Q  132 taaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttcttct 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||    
T  2710468 taaggatgagaggtttcctagagttgaaggaatgaaaccgcttaacatgttcatggaaagatcaaggtattgaatatatgctagttggcctatttcatct 2710567  T
Q  232 agaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtg 331  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||| | |||| ||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||   ||    
T  2710568 tgaattggtccttgtagttggttattagaaagataaagttgtctcaaatttcgaagctttaacaagctagaaggtatctcaccatgtatattgctatatg 2710667  T
Q  332 caaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaaga 431  Q
     |||||||||| |  |||| | || ||||||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| || ||||||    
T  2710668 aaaggtcaagatagttgatgtgtttggtgagattaaaaaacccatttggtaaaggagaggtgaagttgttccaagaaagttcaagagttataagtgaaga 2710767  T
Q  432 caaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttga 531  Q
    ||||||||||||   |||||| ||  |||||||||||||| | || |||||   |   || |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  2710768 caaattcaaatatgcaatagacgggttgatcatgaagttgcttagtttacaaaaagacaattgtacttctaatagtgaaggaagtgtattcactatttga 2710867  T
Q  532 agccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatc 617  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2710868 agccaattggtttctttatgaagatcaataccgctgaggttgagatatttcaaagaagaaagtggagaaagccaattaagattatc 2710953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 15532358 - 15531923
Alignment:
Q  233 gaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||  ||||||| |   ||     
T  15532358 gaattgatccttgtagttggttattagagagatcaaggattctcaaattttgaagatttagcaaacttgaaggtatctcatcaagtatattattttttga 15532259  T
Q  333 aaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagac 432  Q
    |||||||||| |  ||| || || ||  ||||| ||||||||||  |||| || |  | |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  15532258 aaggtcaagataattgagatatttggaaagattaaaaaacccatttggtaaatgatggctgaagttgttccaagaaagatcaagagttacaagtgaagac 15532159  T
Q  433 aaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaa 532  Q
    |||||||||||||  ||||||||         |||||||||||| ||||| ||||  |||  ||| ||||| | ||||||||||||| || ||  |||||    
T  15532158 aaattcaaatactcgatagatgg---------gaagttgttcagtttacagtcactcaaccttaaatctaatagtgaaggaagtgtactctctgcttgaa 15532068  T
Q  533 gccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatactaggaactaa 632  Q
     ||| ||||||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | || |       
T  15532067 tccagttggtttccttatgaagatcaatccaattaaggttgagatatttcaaggatgaaagtggagaaagccaatcaagattatccatgtgaagaccacc 15531968  T
Q  633 gttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgat 677  Q
     ||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  15531967 atttaaggataagtcaaggtacaaaaggttagatgaatgtgtgat 15531923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15535746 - 15535609
Alignment:
Q  27 aaaatttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataag 126  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| || ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15535746 aaaatttgaattactcaagtctagtgaatctaaaccagagagtttggaaaaagttaattttgaatttgcaccagataaattattagatccaatagataag 15535647  T
Q  127 gaatttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaat 164  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15535646 gaatttaaggatgagaggtttcctagagttgaaggaat 15535609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 9e-78; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 8459483 - 8459041
Alignment:
Q  233 gaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcagtgc 332  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||  |  |  |     
T  8459483 gaattgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgtctcaaatttggaaggtataacaagcttgaaggcatctcgccatatatatggcaaaccga 8459384  T
Q  333 aaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagac 432  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |  ||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  8459383 aaggtcaagataggtgatatctttggtcagattaaaaaacccattaggtaaaggagatgtgaagttgttccaagaaagatcaagagttacaagtgaagac 8459284  T
Q  433 aaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaa 532  Q
    ||||||||||||| || ||||||   | | || ||||||||||| ||||| | || ||| ||||| ||||| |  |||| |||||||  ||||  |||||    
T  8459283 aaattcaaatactcaagagatgg---gttgataaagttgttcagtttacacttacttaagtgtaactctaatagggaagaaagtgtagccactgcttgaa 8459187  T
Q  533 gccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccatactaggaactaa 632  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || |  || |||||     
T  8459186 gccaattagtttccttatgaagatcaattccattgaggttgagattttttaaggaagaaagtggagaaagccattgaagattattcaaagcagtaactac 8459087  T
Q  633 gttgtaggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    | ||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||||||    
T  8459086 ggtgtaggataagtcaaggtgcaaaaggttagatgcatgtgtgatg 8459041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8459750 - 8459624
Alignment:
Q  38 tactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaatttaagga 137  Q
    |||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||   |   |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  8459750 tacttaagtctagaaaacctagactatagagtttggaaaaggttctgtttgaaatttcactagagaagttatttgagccaatagataaggaatataagga 8459651  T
Q  138 tgagatgtttcctagagttgaaggaat 164  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  8459650 tgagaggtttccaagagtagaaggaat 8459624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8459484 - 8459443
Alignment:
Q  160 ggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgt 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  8459484 ggaattgatccttgtagttggttataagagagatcaaggtgt 8459443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0648 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0648
Description:

Target: scaffold0648; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 400
Target Start/End: Original strand, 3893 - 4263
Alignment:
Q  30 atttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaa 129  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3893 atttgaattactcaagtatagttcatctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataaggaa 3992  T
Q  130 tttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttctt 229  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||| | |    
T  3993 tgtaaggatgagaggtttcctagagttacaggaatgaaaccacttaacatgttgatggaaagatcaaggtgttgaatatttgctagttgacctattccat 4092  T
Q  230 ctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcag 329  Q
     |  || || ||| ||||||| ||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  4093 gtgaaactgatccttgtagttggttttcagagagatcaagatgtctcaaattttgaaggtttagcaagctacgaggtatctcaccatatatattattttg 4192  T
Q  330 tgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgt 400  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  4193 cgcaaggtcaagagaggtgatatctttggtgagattaaaaaacccatttggtaaattagaggtgaagttgt 4263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 127; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 400
Target Start/End: Original strand, 3363 - 3733
Alignment:
Q  30 atttgaattactcaagtctaaaaaatctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaa 129  Q
    ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3363 atttgaattactcaagtatagttcatctaaactagagagtttggaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagccaatagataaggaa 3462  T
Q  130 tttaaggatgagatgtttcctagagttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaaggtgttgaatatgggttagttggcctatttctt 229  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||  ||||||  | ||   ||    |||    || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||| | |    
T  3463 tgtaaggatgagaggtttcctagagttacaggaatgaaaccacttaacatgttgatggaaagatcaaggtgttgaatatttgctagttgacctattccat 3562  T
Q  230 ctagaattggtccctgtagtttgttattatagagattaaggtgtctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatatatattactcag 329  Q
     |  || || ||| ||||||| ||| | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |    
T  3563 gtgaaactgatccttgtagttggttttcagagagatcaagatgtctcaaattttgaaggtttagcaagctacgaggtatctcaccatatatattattttg 3662  T
Q  330 tgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgt 400  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  3663 cgcaaggtcaagagaggtgatatctttggtgagattaaaaaacccatttggtaaattagaggtgaagttgt 3733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2156 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold2156
Description:

Target: scaffold2156; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 313 - 620
Target Start/End: Original strand, 1 - 307
Alignment:
Q  313 ccatatatattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagat 412  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  1 ccatatatattattttgcgcaaggtcaagagaggtgatatctttggttagattaaaaaacccatttggtaaattggaggtaaagttgtttccagaaagat 100  T
Q  413 caagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaagg 512  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | ||  |  ||||||||||| | ||||||    
T  101 aaagagttacaagtgaagacaaattgaaatactcaatagatggattgatcatgaagttgtttagtttacagtaactcagttgtaattctaatagtgaagg 200  T
Q  513 aagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaaga 612  Q
    ||  ||| | |||  ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  201 aaaggtacttactgcttgaagccagttggtttccttacgaagatcaatcccaataaggatgagata-tttaaggatgaaagtgaagaaagccaatgaaga 299  T
Q  613 ttatccat 620  Q
    ||||||||    
T  300 ttatccat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2156; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 639 - 678
Target Start/End: Original strand, 335 - 374
Alignment:
Q  639 ggataagtcaaggtagacaagtttagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  335 ggataagtcaaggtagacaagtttagatgaacgtgtgatg 374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 4e-52; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 273 - 678
Target Start/End: Original strand, 13666911 - 13667318
Alignment:
Q  273 tctcaaattttgaaggtttagcaagctagaaggtatctcaccatat--atattactcagtgcaaggtcaagagatgtgatatcttcggtgagattgaaaa 370  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| | |||||||| | |||||||  ||||||||  ||| |||||||| ||  |||| || || ||||||||| ||||    
T  13666911 tctcaaagtttgaatgtttagcaaggttgaaggtattttaccatatatatattactatgtgaaaggtcaacagtggtgagatttttggtgagattaaaaa 13667010  T
Q  371 acccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatgaagtt 470  Q
    || ||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||         ||||||    
T  13667011 actcattaggtatatgagaggtgaagttgttttcagaaagatcaagagttaccagcgaagacaaattcaaatactcaagagatgg---------gaagtt 13667101  T
Q  471 gttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgagg 570  Q
    ||||||||||||  | |  ||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |      
T  13667102 gttcaggttacaacctctcaaccgtaattctaattgtgaaggaagtgtattcactacttggagccaattagtttccttatgaagatcaatgccattaaac 13667201  T
Q  571 ttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat------actaggaactaagttgta---ggataagtcaaggtagacaagtt 661  Q
      ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||      | ||  | | || |||||   |||||||||||||||||||||||    
T  13667202 cggagatatttcaaggaagaaaatggagaaaaccaatgaagattatcaatgtgaagaatattatcaaaattgtaggcggataagtcaaggtagacaagtt 13667301  T
Q  662 tagatgaatgtgtgatg 678  Q
    ||||||||| |||||||    
T  13667302 tagatgaatttgtgatg 13667318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 55 - 196
Target Start/End: Original strand, 13666765 - 13666906
Alignment:
Q  55 tctaaactagagagtttggaaaaatgtaaatttgaaatttcattagagaaattattagaaccaatagataaggaatttaaggatgagatgtttcctagag 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13666765 tctaaactagagagtttagaaaaagttaaatttgaaatttcaccagagaaattattagagctaatagataagtaatttaaggatgagaggtttcctagag 13666864  T
Q  155 ttgaaggaatagatccttgtagttggttttcagagagatcaa 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  13666865 ttgaaggaattgatccttgtaggttgttttcaaagagatcaa 13666906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 507 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 2509746 - 2509634
Alignment:
Q  507 tgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactga------ggttgagatattttaaggaagaaagtggagaa 600  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||| |||   |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2509746 tgaaggaagtgtactcactacttgtacccaattggttttcttatgaagatcaatggtactgaaaccaaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaa 2509647  T
Q  601 atccaatcaagat 613  Q
    | ||||| |||||    
T  2509646 agccaatgaagat 2509634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 367 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 16436269 - 16436016
Alignment:
Q  367 aaaaacccatcaggtatataagaggtgaaattgtttccagaaagatcaagagttacaattgaagacaaattcaaatacttaatagatggactgatcatga 466  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||  ||||  | ||||||||  || ||||| |||||| ||||  | ||||| |||  || ||||||    
T  16436269 aaaaactcatcaggtatagaagaagtgaagttcttttgagaagcaacaagagttttaagtgaaggcaaattaaaatgttcaataggtgggttggtcatga 16436170  T
Q  467 agttgttcaggttacattcacgtaactgtaattctaacaatgaaggaagtgtattcactatttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccact 566  Q
    ||||| |||| ||||| | |   || |||||||||||||  ||||||||  ||  || |  |||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  16436169 agttgctcagattacaataattcaattgtaattctaacagggaaggaagcttagccattgcttgaagccaattggttgccttgttaagatcaatcccact 16436070  T
Q  567 gaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatccat 620  Q
    |||||| ||||||||| |  |||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16436069 gaggtttagatattttcaacaagaaaatggagaaacccagtcaagattatccat 16436016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 528 - 619
Target Start/End: Original strand, 16436704 - 16436795
Alignment:
Q  528 ttgaagccaattggtttccttatgaagataaattccactgaggttgagatattttaaggaagaaagtggagaaatccaatcaagattatcca 619  Q
    |||||||||||||||| | ||   ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| |||||||||||||    
T  16436704 ttgaagccaattggttgctttgctaagatcaataccactgagattgagatattttaagcaagaaaatgtagaaacccagtcaagattatcca 16436795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University